View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7745_low_19 (Length: 386)

Name: NF7745_low_19
Description: NF7745
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7745_low_19
NF7745_low_19
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-341)||(12-341)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (17-341)||(10547587-10547916)
chr3 (17-341)||(4369859-4370190)
chr3 (17-319)||(12160920-12161215)
chr3 (40-341)||(13689825-13690133)
chr3 (20-341)||(11865965-11866280)
chr3 (21-341)||(13089527-13089853)
chr3 (21-341)||(13096868-13097194)
chr3 (17-341)||(7599524-7599856)
chr3 (17-341)||(10603186-10603517)
chr3 (40-341)||(13694070-13694378)
chr3 (22-341)||(22165029-22165357)
chr3 (17-341)||(6814039-6814370)
chr3 (17-341)||(9361683-9362014)
chr3 (22-341)||(12187794-12188121)
chr3 (22-341)||(12194208-12194535)
chr3 (22-341)||(10146180-10146508)
chr3 (17-341)||(11946583-11946916)
chr3 (22-341)||(13188136-13188463)
chr3 (23-341)||(12777241-12777565)
chr3 (22-341)||(10160891-10161222)
chr3 (22-341)||(15644258-15644585)
chr3 (22-341)||(15557661-15557991)
chr3 (47-337)||(16449477-16449776)
chr3 (73-341)||(13505278-13505552)
chr3 (42-341)||(16654899-16655206)
chr3 (23-341)||(3246236-3246549)
chr3 (17-329)||(37941556-37941880)
chr3 (26-341)||(17386933-17387248)
chr3 (22-341)||(16374196-16374525)
chr3 (22-249)||(20157336-20157563)
chr3 (23-341)||(3339932-3340250)
chr3 (23-341)||(13136895-13137215)
chr3 (23-341)||(15945800-15946121)
chr3 (23-341)||(20560197-20560517)
chr3 (23-341)||(20562505-20562825)
chr3 (24-341)||(1991895-1992210)
chr3 (23-340)||(13064139-13064453)
chr3 (23-341)||(20564813-20565133)
chr3 (209-341)||(15629866-15630002)
chr3 (23-341)||(13196166-13196485)
chr3 (23-306)||(14446470-14446753)
chr3 (24-169)||(13600338-13600484)
chr3 (25-153)||(14349169-14349296)
chr3 (99-290)||(8687129-8687323)
chr3 (341-380)||(29346850-29346889)
chr3 (338-368)||(16893126-16893156)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (17-341)||(16466331-16466661)
chr7 (17-341)||(16531275-16531593)
chr7 (17-341)||(16634069-16634387)
chr7 (17-341)||(539479-539804)
chr7 (40-341)||(13657091-13657399)
chr7 (22-341)||(20107463-20107784)
chr7 (20-341)||(10432461-10432787)
chr7 (22-341)||(16150201-16150529)
chr7 (17-341)||(13355407-13355735)
chr7 (17-341)||(13673025-13673357)
chr7 (17-341)||(14550266-14550597)
chr7 (17-341)||(8717034-8717366)
chr7 (17-341)||(12566189-12566511)
chr7 (17-341)||(23514237-23514568)
chr7 (17-341)||(18593980-18594312)
chr7 (17-341)||(18617372-18617704)
chr7 (90-341)||(11927698-11927955)
chr7 (23-341)||(48802575-48802895)
chr7 (17-341)||(9582083-9582401)
chr7 (26-340)||(4311912-4312227)
chr7 (26-306)||(8782722-8783004)
chr7 (23-341)||(5396305-5396623)
chr7 (23-341)||(16326489-16326807)
chr7 (23-341)||(824815-825133)
chr7 (23-339)||(18286795-18287114)
chr7 (23-341)||(15917486-15917804)
chr7 (23-341)||(14222422-14222743)
chr7 (209-341)||(15207471-15207607)
chr7 (210-341)||(15064961-15065096)
chr7 (230-341)||(27290530-27290645)
chr7 (99-306)||(4792213-4792429)
chr7 (338-380)||(19407872-19407914)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (17-341)||(25624937-25625267)
chr6 (17-341)||(18011036-18011366)
chr6 (17-341)||(18447387-18447715)
chr6 (17-341)||(18853185-18853514)
chr6 (40-341)||(21561165-21561474)
chr6 (21-341)||(25632067-25632390)
chr6 (17-341)||(29594871-29595203)
chr6 (17-341)||(22166263-22166595)
chr6 (17-341)||(22242982-22243314)
chr6 (22-341)||(22062224-22062550)
chr6 (17-341)||(20016942-20017274)
chr6 (17-341)||(15698725-15699057)
chr6 (22-341)||(20169413-20169739)
chr6 (17-341)||(24855958-24856290)
chr6 (17-341)||(22767829-22768164)
chr6 (17-341)||(15850694-15851027)
chr6 (73-341)||(18188353-18188619)
chr6 (24-320)||(30672449-30672745)
chr6 (209-341)||(11218796-11218932)
chr6 (209-341)||(19966941-19967077)
chr6 (24-134)||(25962705-25962814)
chr6 (24-134)||(25967352-25967461)
chr6 (24-134)||(25962225-25962334)
chr6 (24-134)||(25966872-25966981)
chr6 (17-80)||(18185199-18185262)
chr6 (24-85)||(19586267-19586328)
chr6 (23-169)||(8724435-8724580)
chr6 (338-368)||(4263410-4263440)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (17-341)||(16419335-16419656)
chr8 (17-341)||(21942155-21942482)
chr8 (17-341)||(19365199-19365518)
chr8 (21-341)||(17619910-17620237)
chr8 (21-341)||(21854498-21854825)
chr8 (22-341)||(20039708-20040034)
chr8 (17-341)||(21381261-21381593)
chr8 (17-341)||(21955244-21955575)
chr8 (17-341)||(21099505-21099836)
chr8 (17-341)||(23910609-23910942)
chr8 (22-341)||(8313636-8313963)
chr8 (22-341)||(20711635-20711962)
chr8 (17-341)||(8323562-8323897)
chr8 (23-341)||(19766720-19767038)
chr8 (23-341)||(20001490-20001808)
chr8 (23-341)||(22101584-22101905)
chr8 (23-341)||(22369134-22369452)
chr8 (23-341)||(22100360-22100681)
chr8 (23-341)||(11347664-11347982)
chr8 (23-341)||(22034260-22034583)
chr8 (23-315)||(21830232-21830527)
chr8 (131-316)||(20375007-20375198)
chr8 (270-341)||(29333786-29333857)
chr8 (24-96)||(20375209-20375281)
chr8 (338-380)||(8831251-8831293)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (17-341)||(115816-116146)
scaffold0020 (17-341)||(120120-120450)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (23-341)||(10590-10911)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (17-323)||(38425930-38426242)
chr4 (19-341)||(18291185-18291511)
chr4 (19-341)||(3353818-3354147)
chr4 (19-339)||(15348532-15348857)
chr4 (17-341)||(11497328-11497659)
chr4 (21-341)||(10629915-10630242)
chr4 (17-341)||(13822083-13822415)
chr4 (17-341)||(18082174-18082509)
chr4 (17-341)||(15253517-15253849)
chr4 (22-341)||(42710452-42710778)
chr4 (23-341)||(17485623-17485940)
chr4 (17-341)||(22110128-22110460)
chr4 (22-341)||(45234950-45235272)
chr4 (23-341)||(15864678-15864996)
chr4 (146-341)||(15260938-15261134)
chr4 (23-341)||(14686497-14686813)
chr4 (210-341)||(10649581-10649717)
chr4 (338-380)||(19852533-19852575)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (17-341)||(24219003-24219332)
chr5 (21-341)||(23601362-23601689)
chr5 (17-341)||(15734703-15735035)
chr5 (17-341)||(20596543-20596875)
chr5 (17-341)||(20609120-20609452)
chr5 (17-341)||(20791430-20791761)
chr5 (17-336)||(20602829-20603156)
chr5 (17-341)||(21281633-21281957)
chr5 (22-341)||(23711396-23711722)
chr5 (17-341)||(24939698-24940029)
chr5 (23-341)||(20445550-20445876)
chr5 (17-341)||(20621331-20621663)
chr5 (22-341)||(23747219-23747546)
chr5 (22-341)||(18072069-18072396)
chr5 (17-341)||(24953887-24954220)
chr5 (24-306)||(20574668-20574950)
chr5 (23-341)||(22854748-22855067)
chr5 (23-341)||(25007508-25007829)
chr5 (23-341)||(30760357-30760667)
chr5 (24-306)||(22947644-22947928)
chr5 (23-341)||(25116872-25117189)
chr5 (23-341)||(25175963-25176280)
chr5 (23-337)||(22318222-22318532)
chr5 (23-341)||(26846842-26847163)
chr5 (252-340)||(18487020-18487108)
chr5 (23-248)||(18484916-18485137)
chr5 (146-251)||(20439156-20439258)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (19-341)||(252586-252914)
scaffold0004 (40-341)||(355241-355541)
scaffold0004 (209-341)||(18872-19008)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (19-341)||(282-599)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (21-341)||(25145483-25145810)
chr2 (17-341)||(12330-12660)
chr2 (17-341)||(25356680-25357012)
chr2 (17-341)||(22045374-22045706)
chr2 (22-341)||(116713-117039)
chr2 (17-341)||(17589576-17589909)
chr2 (17-341)||(24517035-24517367)
chr2 (32-341)||(24820750-24821068)
chr2 (22-341)||(24796003-24796330)
chr2 (47-337)||(22664259-22664558)
chr2 (22-341)||(27626762-27627082)
chr2 (17-341)||(16774819-16775152)
chr2 (26-306)||(24501305-24501583)
chr2 (127-341)||(23647106-23647321)
chr2 (23-306)||(25371682-25371965)
chr2 (23-341)||(27630687-27631008)
chr2 (148-341)||(23160218-23160412)
chr2 (148-341)||(23571475-23571669)
chr2 (23-341)||(27769521-27769841)
chr2 (26-335)||(26192348-26192657)
chr2 (23-341)||(24170504-24170821)
chr2 (23-277)||(25366476-25366735)
chr2 (232-341)||(23630559-23630672)
chr2 (52-171)||(25368433-25368551)
chr2 (192-306)||(25368551-25368669)
chr2 (338-380)||(8413846-8413888)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (17-306)||(59345-59632)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (17-341)||(4325-4652)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (90-341)||(90444-90700)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (21-341)||(17263-17590)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (17-341)||(3989265-3989595)
chr1 (17-341)||(27046044-27046375)
chr1 (17-341)||(20236637-20236968)
chr1 (22-341)||(21799382-21799709)
chr1 (17-183)||(52939332-52939498)
chr1 (22-341)||(17095320-17095648)
chr1 (23-341)||(8948280-8948598)
chr1 (23-341)||(21785177-21785501)
chr1 (23-230)||(8652333-8652537)
chr1 (23-277)||(19876395-19876653)
chr1 (230-341)||(8652192-8652307)
chr1 (282-341)||(20071902-20071961)
chr1 (338-380)||(13061991-13062033)
chr1 (338-380)||(49491909-49491951)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (62-341)||(9361-9648)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (22-341)||(12656-12982)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (17-341)||(7182-7511)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (17-341)||(9036-9362)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (53-341)||(44619-44914)
scaffold0037 (53-341)||(52008-52303)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-341)||(122539-122870)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (23-341)||(51213-51538)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (32-341)||(18916-19234)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (17-341)||(35817-36150)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (17-341)||(207-540)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (25-341)||(10329-10644)
scaffold0026 (269-341)||(17528-17599)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (17-183)||(2998-3164)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (24-341)||(964-1282)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (87-341)||(24756-25015)
[»] scaffold1941 (1 HSPs)
scaffold1941 (17-276)||(953-1220)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (26-306)||(32277-32558)
scaffold0117 (146-341)||(46053-46249)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (23-277)||(11626-11882)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (23-277)||(233516-233772)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (127-341)||(13-234)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (23-341)||(1786-2107)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (23-341)||(12165-12484)
scaffold0012 (209-341)||(8176-8312)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (23-341)||(29680-29997)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (24-277)||(7026-7287)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (23-341)||(9754-10070)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (213-341)||(23052-23184)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (187-341)||(7854-8013)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (209-341)||(38631-38769)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (146-339)||(5776-5970)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (24-254)||(13771-13998)
scaffold0278 (24-254)||(17105-17332)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (146-341)||(13206-13403)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (146-341)||(22049-22244)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (209-341)||(7917-8053)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (230-341)||(25308-25423)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (127-341)||(11705-11922)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (152-341)||(11767-11956)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (23-341)||(161015-161336)
scaffold0011 (92-169)||(171516-171593)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (209-290)||(1-86)
[»] scaffold2037 (1 HSPs)
scaffold2037 (287-341)||(1-55)
[»] scaffold0531 (1 HSPs)
scaffold0531 (338-380)||(10308-10350)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (210-290)||(840-925)


Alignment Details
Target: scaffold0156 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 12
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  341 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggta 242  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaa 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  241 tatcaggagaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaatgaccaataagaggagacaataaaaaaaattatgtcatgatttttcaataaaa 142  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac-----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  141 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctc 42  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41 tccccacacttaggagaagcattgtcctca 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 10547587 - 10547916
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10547587 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgcgggta 10547686  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagag-tttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10547687 tatcaggagaacttaaaacacaagagctttactttcatgtacaagaaacaactagtaagaggagac-aataaaaattttatgtcatgatttctcaataaa 10547785  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10547786 aacaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaatactacgactaaagacactttattaggct 10547885  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10547886 ccccccacacttaggagaagcattttcctca 10547916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4370190 - 4369859
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  4370190 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatttattcacgttaaaacaagatgtgggt 4370091  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaat 212  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  4370090 atatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaattaaccaattaagaggagacaa-taaaaattttgtgtcatgatatttttcaat 4369992  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  4369991 aaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 4369892  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4369891 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 4369859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 319
Target Start/End: Original strand, 12160920 - 12161215
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12160920 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgaattt-----------ttttattcactttaaaacaagaagtgggta 12161008  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaa 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12161009 tatcaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagac-aataaaaaatttatgtcatgatttttcaataaaa 12161107  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  12161108 acaagctacttagtcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaaggaagtttggaaacactacgactaaagaccctttattaggctc 12161207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13690133 - 13689825
Alignment:
Q  40 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  13690133 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgtatttctcattggagaatttattcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactaaaaatacaa 13690034  T
Q  140 gagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaataaaaacaagctacttaatcatgcc 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13690033 gagttcactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagacaa-taaaaattatatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcc 13689935  T
Q  237 tttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagc 331  Q
    ||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  13689934 ttttacaataaaacaaaacaaaaggaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacaattacgagaagc 13689835  T
Q  332 attgtcctca 341  Q
    ||||||||||    
T  13689834 attgtcctca 13689825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11866280 - 11865965
Alignment:
Q  20 catttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11866280 catttccttaaaatgcctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcattt-----------ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 11866192  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaaca 219  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||      
T  11866191 aaggagaacttaaaacacaagaatttacgttcatgtacaagaaacgaccaataaaaggagacaataaaaaaaattatttcatgatttttcaataaaaaag 11866092  T
Q  220 agctacttaatcatgcctttcacaataaaac-----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccc 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11866091 aggtacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccc 11865992  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11865991 ccacacttaggagaagcattatcctca 11865965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 13089527 - 13089853
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13089527 atttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 13089626  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  13089627 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatagttttcaataaaa 13089725  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13089726 acaagctacttaaccatgcctctcacaa-aaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 13089824  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13089825 ccccacacttaagagaagcattgtcctca 13089853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13097194 - 13096868
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13097194 atttccttaaaatacttattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 13097095  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  13097094 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaa 13096996  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13096995 aaaagctacttaaccatgcctctcacaa-aaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 13096897  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13096896 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 13096868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7599856 - 7599524
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7599856 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 7599757  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  7599756 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 7599657  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  7599656 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 7599557  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7599556 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 7599524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 10603186 - 10603517
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10603186 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 10603285  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10603286 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 10603384  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  10603385 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 10603484  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10603485 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 10603517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13694378 - 13694070
Alignment:
Q  40 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  13694378 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgtatttctcattggagaatttattcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactaaaaatataa 13694279  T
Q  140 gagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaataaaaacaagctacttaatcatgcc 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13694278 gagttcactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagac-aataaaaattttatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcc 13694180  T
Q  237 tttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacacttta-ttaaactccccccacacttacgagaagc 331  Q
    ||| |||||||||||    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  13694179 ttttacaataaaacaaaacaaaaaaataaagttcgagggagtttggaaacactacgactaaagacactttatttaggctccccccacacttaggagaagc 13694080  T
Q  332 attgtcctca 341  Q
    ||||||||||    
T  13694079 attgtcctca 13694070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 22165029 - 22165357
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt--gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaata 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22165029 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtata 22165128  T
Q  119 tcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaa 216  Q
    ||| || |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22165129 tcaagaaaacttagaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaa 22165228  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22165229 attagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 22165328  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22165329 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 22165357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6814370 - 6814039
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814370 acgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 6814271  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6814270 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 6814172  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  6814171 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 6814072  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6814071 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 6814039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 9361683 - 9362014
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361683 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 9361782  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9361783 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagac-aatgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 9361881  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  9361882 aaaaattagctacttaaccatgtcttttacaataaaactatacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 9361981  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9361982 ccccccccacacttaggagaagcattgtcctca 9362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 12187794 - 12188121
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12187794 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 12187893  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12187894 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatatttttaataaaaa 12187993  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12187994 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggcgtttagaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 12188093  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12188094 cccacacttaggagaagcattgtcctca 12188121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 12194208 - 12194535
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12194208 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 12194307  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12194308 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatatttttaataaaaa 12194407  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12194408 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggcgtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 12194507  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12194508 cccacacttaggagaagcattgtcctca 12194535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10146508 - 10146180
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10146508 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 10146409  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa--taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caataaaa 216  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10146408 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcttgattttttcaataaaa 10146309  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    |  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10146308 attagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 10146209  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10146208 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 10146180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11946916 - 11946583
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946916 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 11946817  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttacttt-catgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaa 211  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11946816 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttcatgtataagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaa 11946718  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa-----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11946717 taaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacattacgactaaagacactttatta 11946618  T
Q  307 aactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11946617 ggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 11946583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 13188136 - 13188463
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13188136 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 13188235  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13188236 caagaagacttaaaacacaagaatttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaaa 13188335  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      | ||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13188336 ttaactacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 13188435  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13188436 cccacacttaggagaagcattgtcctca 13188463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 12777241 - 12777565
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12777241 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggtatatta 12777340  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaac 218  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||     
T  12777341 agaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaagaattaaccaattaagatgagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaat 12777439  T
Q  219 aagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaa---aagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccc 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12777440 aagctacttaaccatgcttttcacaataaaaagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccc 12777539  T
Q  316 cacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  12777540 cacacttaggagaagcattgtcctca 12777565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 10160891 - 10161222
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10160891 tttccttaaaatacctattcattcatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 10160990  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-----caata 213  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||     |||||    
T  10160991 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcttgatttttttcttcaata 10161090  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10161091 aaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggc 10161190  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10161191 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 10161222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15644585 - 15644258
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggt-tttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15644585 tttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 15644486  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||   ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15644485 caagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcgtgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaa 15644386  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15644385 ttagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 15644286  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15644285 cccacacttaggagaagcattgccctca 15644258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 15557661 - 15557991
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggt-tttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15557661 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 15557760  T
Q  120 caggagaacttaaaata---caagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataa 214  Q
    || ||  ||| |||| |   ||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  15557761 caagaagactaaaaaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcacgatattttcaataa 15557860  T
Q  215 aaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15557861 aaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggct 15557960  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15557961 ccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15557991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 337
Target Start/End: Original strand, 16449477 - 16449776
Alignment:
Q  47 tttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  16449477 tttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtt 16449576  T
Q  145 ta-ctttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttca 241  Q
    |  |||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  16449577 ttgctttcatgtacaagaatcaatcgaataggaggagacaatgaaaatttttatgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttta 16449676  T
Q  242 caataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtc 337  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16449677 caataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtc 16449776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 341
Target Start/End: Original strand, 13505278 - 13505552
Alignment:
Q  73 tttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa- 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | |||     
T  13505278 tttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaatcaaa 13505377  T
Q  171 taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagtt 265  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||    
T  13505378 taagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagtt 13505476  T
Q  266 caagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13505477 caagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 13505552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16655206 - 16654899
Alignment:
Q  42 atacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||    
T  16655206 atacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaa 16655107  T
Q  140 gagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttc-aataaaaacaagctacttaatcatgcct 237  Q
    || ||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||||||    
T  16655106 gaatttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatttttttaataaaaattagctacttaactatgcct 16655007  T
Q  238 ttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcat 333  Q
    || ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||    
T  16655006 tttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaatcat 16654907  T
Q  334 tgtcctca 341  Q
    ||||||||    
T  16654906 tgtcctca 16654899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 3246236 - 3246549
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||  || ||||||     
T  3246236 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaaggggtgcaactagtgcttttctcattggagaatttattcacaataaaacttgatgcaggtatatcaa 3246335  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||   ||||| |||||  ||||||||||||    
T  3246336 gaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaac-aaaaattt---gtcataattttg-aataaaaacaag 3246430  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacact 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3246431 ctacttaatcatgcctttcgcaataaaacaaaaagaataaagttcaagagagtttg-gaacactacgactctagacactttattaggctccccccacact 3246529  T
Q  322 tacgagaagcattgtcctca 341  Q
    || |||||||||||||||||    
T  3246530 taggagaagcattgtcctca 3246549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37941880 - 37941556
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  37941880 acgcgttttcttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 37941781  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgac-caataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||| |||| |||    
T  37941780 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaattttttgtgtcatgatatttttaat 37941681  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagaca----ctttat 304  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  37941680 aaaaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttctttat 37941581  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaa 329  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||    
T  37941580 taggctccccccacacttaggagaa 37941556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17387248 - 17386933
Alignment:
Q  26 cttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggag 125  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||     
T  17387248 cttaaaatacctattcatacacttgcttaagggatgcaacttgtgcttttctcattggagaatt-attcacaataatacaagatgtgggtatatcaagaa 17387150  T
Q  126 aacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagcta 224  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||   |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17387149 aacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggatacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaagcta 17387053  T
Q  225 cttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacac 320  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  17387052 cttaatcatgtctttctcaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg-gaacactatgactaaagaaactttattaggctccccccacac 17386954  T
Q  321 ttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  17386953 ttaggaaaagcattgtcctca 17386933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 16374196 - 16374525
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16374196 tttccttaaaatacctattcatacattcactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 16374295  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgac-caataagaggagacaaataa-aaattttatgtcatga---tttttcaataa 214  Q
     | ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||  || |  |||| ||||||||   ||||| |||||    
T  16374296 taagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaataaacaaaataagaggagacaatgaagattttttttgtcatgatttttttttaataa 16374395  T
Q  215 aaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    |||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||    
T  16374396 aaattagctacttaactatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgact-atgacactttattaggct 16374494  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16374495 ccccccacacttaggagaagcattgtcctca 16374525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 20157336 - 20157563
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  20157336 tttccttaaagtacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcttttctcattggagaatttattcacattaaaacaagatgtaggtatatca 20157435  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaat-aaaaaca 219  Q
     || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  20157436 agaaaacttaaaacacaagagttcacttttatgtacaagaaacaactaattaagaggag-caaataaaaa-tttatgtcataattttttaataaaaaaca 20157533  T
Q  220 agctacttaatcatgcctttcacaataaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20157534 agctacttaatcatgcctttcgccataaaa 20157563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 3339932 - 3340250
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  3339932 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 3340029  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||||||    
T  3340030 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaag 3340126  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3340127 ctgcttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 3340226  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  3340227 cacttaggagaagcattgtcctca 3340250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 13136895 - 13137215
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  13136895 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 13136994  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||    ||||||||||||    
T  13136995 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaacaataaaaacaa 13137090  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13137091 gctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacagaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccc 13137190  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13137191 acacttaggagaagcattgtcctca 13137215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15946121 - 15945800
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  15946121 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 15946022  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| || ||||||| ||    ||||||||| ||    
T  15946021 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaaatt-atgtcataataaaacaataaaaataa 15945925  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaa----aagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15945924 gctgcttattcatgccttttacaataaaacaaagcaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccc 15945825  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  15945824 acacttaggagaagcattgtcctca 15945800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20560517 - 20560197
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  20560517 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20560418  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||    |||||||||| |    
T  20560417 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaacaataaaaacga 20560322  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20560321 gctgcttattcatgccttttacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacagtacgactaaagacactttattaggctcccccc 20560222  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  20560221 acacttaggagaagcattgtcctca 20560197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20562825 - 20562505
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  20562825 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20562726  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||    |||||||||| |    
T  20562725 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaacaataaaaacga 20562630  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20562629 gctgcttattcatgccttttacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacagtacgactaaagacactttattaggctcccccc 20562530  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  20562529 acacttaggagaagcattgtcctca 20562505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1992210 - 1991895
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||  | |    
T  1992210 tccttaaaatacctattcatacaattgctcaaaggatgcaacttgtgattttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatagaaag 1992112  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    || || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1992111 agtacataaac-acaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttt-caataaaaacaagc 1992016  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaa-taaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||    |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  1992015 tacttaatcatgcctttcgcaatttaaacaatacaaaagaataaagtttaagggagtatg-gaacgctacgactcaagacactttatt--aggcccccca 1991919  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  1991918 cacttgggagaagcattgtcctca 1991895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13064453 - 13064139
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||||||||||||   |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  13064453 ttccttaaaatacctactcatacatttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggataattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 13064356  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     || ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    |||||||||| ||     ||||||||||||    
T  13064355 agaaaacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaaaaaa----tttatgtcataataaaaaaataaaaacaag 13064262  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa-----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13064261 ctgcttactcatgcctttcacaataaaacaaaacaacaagaataaagttcaagggagtttggaa-cactaccactaaagacactttattaggctcccccc 13064163  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctc 340  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  13064162 tcacttaggagaagcattgtcctc 13064139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20565133 - 20564813
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  20565133 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20565034  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | | |||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||    |||||||||| |    
T  20565033 aagaatacttataacacaagaaatcattttcatgtacaagaaatgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaacaataaaaacga 20564938  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20564937 gctgcttattcatgccttttacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacagtacgactaaagacactttattaggctcccccc 20564838  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  20564837 acacttaggagaagcattgtcctca 20564813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 15629866 - 15630002
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15629866 caataaaaacgagctgcttaatcatgccttttacaatgaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttat 15629965  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15629966 taggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15630002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 13196166 - 13196485
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| ||||||||| |||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  13196166 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattagagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 13196263  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||  || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||     |||||||| |||    
T  13196264 agaacacttgcaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaataataaaaagaag 13196360  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacacttta-ttaaactcccccc 316  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  13196361 ctacttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactactactaaagacactttatttaggctcgcccc 13196460  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13196461 acacttaggagaagcattgtcctca 13196485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Original strand, 14446470 - 14446753
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| ||| |||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  14446470 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttgtcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 14446567  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||| ||||||||    
T  14446568 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaaggaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaatgaaaacaag 14446664  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  14446665 ctgcttattcatacctttcacaataaaacaaaataaaagaataaagttcaagggagtttggaaacattacgacacaagacactttatta 14446753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13600484 - 13600338
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||     
T  13600484 tccttaaaatacctattcatacacttgcttaagggatgcaactttgtgcttttctcattagagaatttattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaa 13600385  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacca 169  Q
    ||  |||||||| | || |  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  13600384 gaacacttaaaacataaaaaatcactttcatgtacaagaaacaacca 13600338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 14349169 - 14349296
Alignment:
Q  25 ccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagga 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||    
T  14349169 ccttaaaatacatatccatacaattgctcaagggatgcaactcatgcttttttcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaaga 14349267  T
Q  125 gaacttaaaatacaagagtttactttcat 153  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14349268 atacttaaaacacaagagttcactttcat 14349296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 290
Target Start/End: Original strand, 8687129 - 8687323
Alignment:
Q  99 taaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataag-aggagacaaataaaaattttatg 197  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||  | ||||| ||||||||||||| |||| |  | | |||||||  ||||| ||||||    
T  8687129 taaaacatgatgtgggtatatcaagaacactcaaaacacaagaaatcacttttatgtacaagaaacaaccattttggaagagacaacaaaaaaatttatg 8687228  T
Q  198 tcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaagaa----taaagttcaagggagtttgtaaacactacgac 290  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||  ||    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8687229 tcataattta-caataaaaacaagctgcttta-catgcctttcgcaacaaaacaaaacaaaaaattaaaattcaacggagtttggaaacactacgac 8687323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 380
Target Start/End: Original strand, 29346850 - 29346889
Alignment:
Q  341 agccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29346850 agccggaatgaggacccgtgcacaaaagagtacctccaaa 29346889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 368
Target Start/End: Original strand, 16893126 - 16893156
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16893126 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaag 16893156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 16466331 - 16466661
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgt-gcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16466331 acgcatttccttaaaatacctatttatacatttactcaagggaagcaactttttgcatatctcattggaggttctattcactttaaaacaagatgtgggt 16466430  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaata 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16466431 atattaggagaacttaaaacacaagagtttaatttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagac-aataaaaattttatgtcatgattgatttcatta 16466529  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16466530 aaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggc 16466629  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16466630 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 16466661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16531593 - 16531275
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16531593 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcattttt----------tttattcattttaaaacaagatgtgggta 16531504  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaa 216  Q
    ||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16531503 tacaaggagaacttaaaacactatagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataaaaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatttttcaataaaa 16531405  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa-----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  16531404 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaaaacactttattaggctc 16531305  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16531304 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 16531275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 16634069 - 16634387
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16634069 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcattttt----------tttattcattttaaaacaagatgtgggta 16634158  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaa 216  Q
    ||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16634159 tacaaggagaacttaaaacactatagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataaaaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatttttcaataaaa 16634257  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaa-----caaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  16634258 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaaaacactttattaggctc 16634357  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16634358 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 16634387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 539479 - 539804
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||     
T  539479 acgcgtttccttaaaatacctaatcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattg-----tttattcactttaaaacaagatgtgggt 539573  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaata 213  Q
    |||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  539574 atatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaaaaaacgaccaataagaggagacaa-taaaaattttatgtcatgattgatttcatta 539672  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  539673 aaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaggggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggc 539772  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  539773 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 539804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13657399 - 13657091
Alignment:
Q  40 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  13657399 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgtatttctcattggagaatttattcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactaaaaatacaa 13657300  T
Q  140 gagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaataaaaacaagctacttaatcatgcc 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13657299 gagttcactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagacaa-taaaaattatatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcc 13657201  T
Q  237 tttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagc 331  Q
    ||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  13657200 ttttacaataaaacaaaacaaaaggaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacaattacgagaagc 13657101  T
Q  332 attgtcctca 341  Q
    ||||||||||    
T  13657100 attgtcctca 13657091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20107784 - 20107463
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20107784 tttccttaaaatacttattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgcttttctcattggagaatttattcacattaaaacaagatgtgggtatatca 20107685  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20107684 agaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaacttagaggagacaa--caaaaatttatgtcataatttttcaatagaaacaa 20107587  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca---aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  20107586 gctacttaatcatgtctttcgcaataaaaaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactacgacacaagacactttattaggctcccccca 20107487  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  20107486 cacttaggagaaacattgtcctca 20107463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 341
Target Start/End: Original strand, 10432461 - 10432787
Alignment:
Q  20 catttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10432461 catttcgttaaaatacttattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttagtcactttaaaacaagatgtgggtatat 10432560  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10432561 caagaaaacttaaaacacaagagtatactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagac-aataaaaa-tttatgtcatgatacttttcaataaaa 10432658  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  10432659 ataagctacttaactatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctcc 10432758  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10432759 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 10432787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 16150201 - 16150529
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16150201 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 16150300  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  16150301 caagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatatttttcaataaaa 16150400  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16150401 acaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 16150500  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16150501 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 16150529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13355735 - 13355407
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13355735 acgcattttcttaaaatacctatttatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttattcactttaaaaaaagatgtgggta 13355636  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13355635 tatcaagaaaacttaaaacacaagtgtttaatttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcataatttttcaataaa 13355538  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  13355537 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtctggaaacactacgactcaagacactttattaggctc 13355438  T
Q  312 ccc-ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13355437 ccctccacacttaggagaagcattgtcctca 13355407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13673357 - 13673025
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  13673357 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtatttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 13673258  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  13673257 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaat 13673158  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  13673157 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 13673058  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13673057 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 13673025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14550597 - 14550266
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14550597 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagagttttattcactttaaaacaagatgtggg 14550498  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14550497 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataaaaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 14550399  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  14550398 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 14550299  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14550298 ctccccccacacttaggagaagcattgttctca 14550266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8717366 - 8717034
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggtttt-attcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8717366 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagatttttattcactttaaaacaagatgtggg 8717267  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8717266 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaataatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 8717167  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  8717166 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 8717067  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8717066 ctccccccacgcttaggagaagcattgtcctca 8717034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12566511 - 12566189
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||       ||||||||||||||| |    
T  12566511 acgcattttcttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttatg------aaaacaagatgtgggta 12566418  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12566417 tatcaagaaaacttaaaacataagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa-taaacattt-atgtcatgatttttcaataaa 12566320  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa-----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  12566319 aacaagttatttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggct 12566220  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12566219 ccccccacagttaggagaagcattgtcctca 12566189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23514568 - 23514237
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgt-gcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  23514568 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttttgtttttctcattggagaattgtattcactttaaaacaagatgtggg 23514469  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23514468 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 23514370  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  23514369 aaaaattagctacttaaccatgtcttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaatgacactttattagg 23514270  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23514269 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 23514237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 18593980 - 18594312
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  18593980 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 18594079  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18594080 tatatcaagaagacctaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaat 18594179  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||      
T  18594180 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaagcactacgactaaagacactttattagg 18594279  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18594280 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 18594312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18617704 - 18617372
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  18617704 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 18617605  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18617604 tatatcaagaagacctaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaat 18617505  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||      
T  18617504 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaagcactacgactaaagacactttattagg 18617405  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18617404 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 18617372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 341
Target Start/End: Original strand, 11927698 - 11927955
Alignment:
Q  90 tattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11927698 tattcactttaaaacaagatgtgggtatattaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggaga-taataaaa 11927796  T
Q  190 attttatgtcatgatt--tttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaaca 283  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11927797 attttatgtcatgattgatttcattaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaataaaagaataaagttcaatggagtttggaaaca 11927896  T
Q  284 ctacgactaaagacactttatta-aactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11927897 ctacgactaaagacactttattaggcccccccccacacttaggagaagcattgtcctca 11927955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 48802575 - 48802895
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||  |||||     
T  48802575 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgtaactagtgcttttctcattggagaatttattcacattaaaacatgatgcgggtttatcaa 48802674  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48802675 gaaaacttaaaacacaagatttcactttcatgtacaagaaacaatcaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttt-caataaaaacaag 48802771  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48802772 ctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgacacaagacactttattagactcccccca 48802871  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  48802872 cacttaggagaagcattgtcctca 48802895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9582401 - 9582083
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||          |||||||||||||||||||||||||  |    
T  9582401 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaaatt-tgtgtttttc----------ttattcactttaaaacaagatgtggata 9582313  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataa 214  Q
    ||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | | ||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9582312 tatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcttgtacaagaatcaatcaaataaaaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataa 9582214  T
Q  215 aaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9582213 aaaatagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggct 9582114  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9582113 ccccccacacttaggagaagcattgtcctca 9582083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4312227 - 4311912
Alignment:
Q  26 cttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggag 125  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||| | |||| |||    
T  4312227 cttaaaatacctattcatacaattactcaagggatgcaactcgtgcttttctcattggagaatt-attcataataaaacaagatgtgggtacatcaagag 4312129  T
Q  126 aacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagcta 224  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4312128 aacttaaaacaaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaagcta 4312032  T
Q  225 cttaatcatgcctttcacaa-taaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccaca 319  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| |||    
T  4312031 cttaatcatgcctttcacaatttaaacaaaacaaaagaataaagttcaaggtagtttg-gaacactatgactctagacactttattaggctcccccaaca 4311933  T
Q  320 cttacgagaagcattgtcctc 340  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  4311932 cttaggataagcattgtcctc 4311912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 8782722 - 8783004
Alignment:
Q  26 cttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggag 125  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||     
T  8782722 cttaaaatacttattcatacacttgctcaaggggtgcaacttgtgcttttctcattggagaatttattcacaataaaacaagatgtgggtatagcaagat 8782821  T
Q  126 aacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagcta 224  Q
     |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||   |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8782822 cacttaaaacacaagaattcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaagcta 8782918  T
Q  225 cttaatcatgcctttc--acaa--taaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8782919 cttaatcatgcctttccaacaaactataacaaaagaattaaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttatta 8783004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5396623 - 5396305
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  5396623 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactagatgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 5396526  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||||||||||| ||    ||||||||||||     
T  5396525 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaac-aaaaattttatgtcataataaaacaataaaaacaaa 5396429  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5396428 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaataataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 5396329  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  5396328 cacttaggagaaacattgtcctca 5396305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 16326489 - 16326807
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  16326489 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 16326586  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || |||| |  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    || ||||||||||    
T  16326587 agaacacttacaacacaaaaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacattaaaaacaag 16326683  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16326684 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 16326783  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  16326784 cacttaggagaagcattgtcctca 16326807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 825133 - 824815
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  825133 ttccttaaaatacctattcataaacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 825036  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  | ||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||||||    
T  825035 agaacaattacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaag 824939  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  824938 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 824839  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  824838 cacttagaagaagcattgtcctca 824815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18287114 - 18286795
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||  | ||  |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  18287114 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 18287015  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||    
T  18287014 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaatacaaacaa 18286918  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18286917 gctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactatgactaaagacactttattaggctcccccc 18286818  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcct 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18286817 acacttaggagaagcattgtcct 18286795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 15917486 - 15917804
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||| |   |||||||| ||| ||    
T  15917486 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataacaattgatgtgggtatagca 15917583  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || || |||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||||||    
T  15917584 agaacacttacaacacgagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcatcataaaacaataaaaacaag 15917680  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15917681 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaataataaagttcaagggattttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 15917780  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  15917781 cacttaggagaagcattgtcctca 15917804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 14222422 - 14222743
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  || ||||| ||| |    
T  14222422 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgacgtgggtatagc 14222521  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||    ||||||||||||    
T  14222522 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaacaataaaaacaa 14222617  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccc 315  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  14222618 gctgcttatttatgccttttacaataaaacaaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagatactttattaggctccccc 14222717  T
Q  316 cacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  14222718 cacacttaggagaagcattgtcctca 14222743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 15207471 - 15207607
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15207471 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaaaaataaagttgaagggagtttggaaacactatgactaaagacactttat 15207570  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15207571 taggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15207607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15065096 - 15064961
Alignment:
Q  210 aataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatt 305  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15065096 aataaaaatgagctgcttattcatgccttttacattaaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactacgactaaagacactttatt 15064997  T
Q  306 aaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15064996 aggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15064961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27290645 - 27290530
Alignment:
Q  230 tcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacg 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  27290645 tcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttagg 27290546  T
Q  326 agaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||||    
T  27290545 agaagcattgtcctca 27290530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 4792213 - 4792429
Alignment:
Q  99 taaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatg 197  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||  |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |  | | |||||||  |||||||| |||    
T  4792213 taaaacatgatgtgggtatagcaagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacaaccattttaaaagagacaacaaaaaattt-atg 4792311  T
Q  198 tcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaa-----------acaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacacta 286  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||           ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4792312 ttataatttt-caataaaaacaagctgcttaat-atgtctttcgcaataaataaaaaaaaaaacaaaagaaacaaagttcaagggagtttggaaacacta 4792409  T
Q  287 cgactaaagacactttatta 306  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  4792410 tgactcaagacactttatta 4792429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19407914 - 19407872
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19407914 ctcagccggaatgaggacccgtgcccaaaagggtacctccaaa 19407872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25625267 - 25624937
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25625267 acgcatttccttaaaatacctatccatacatttactcaagggaagaaacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggta 25625168  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaata 213  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  25625167 tatgaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagac-aataaaaaatttatgtcatgatatttttcaata 25625069  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25625068 aaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaagc 25624969  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25624968 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 25624937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18011366 - 18011036
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18011366 acgcatttccttaaaatacctatccatacatttactcaagggaag-aacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggta 18011268  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaata 213  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  18011267 tatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagacaataaaaaattttatgtcatgatttatttcatta 18011168  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18011167 aaaacaagatagttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcgagggagtttgaaaacactacgactaaagacactttattaggc 18011068  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18011067 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 18011036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18447715 - 18447387
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18447715 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttattcacgttaaaacaagatgtgggta 18447616  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18447615 tatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaataaaaagaaaaaaataaaaa-tttatgtcatgatttttcaataaaa 18447517  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaata-----aaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  18447516 acaagctacttaatcatgccttttacaataaaatgaaacaaaaataataaacttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctc 18447417  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18447416 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 18447387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18853514 - 18853185
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18853514 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttagtcactttaaaacaagatgtgggta 18853415  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaata 213  Q
    | ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18853414 tgtcaagaaaacttaagacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagac-aataaaaa-tttatgtcatgatatttttcaata 18853317  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  18853316 aaaacaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggc 18853217  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18853216 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 18853185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 341
Target Start/End: Original strand, 21561165 - 21561474
Alignment:
Q  40 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  21561165 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaatttattcattttgaaataagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaa 21561264  T
Q  140 gagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcc 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21561265 gagtttattttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgtc 21561364  T
Q  237 tttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagc 331  Q
    |||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  21561365 tttcacaataaaacaaaacaaaaagagtaaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagc 21561464  T
Q  332 attgtcctca 341  Q
    ||||||||||    
T  21561465 attgtcctca 21561474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 25632067 - 25632390
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  25632067 atttccttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgcttatctcattggagaatttattcacattaaaacaaaatgtgggtatatc 25632166  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaaca 219  Q
    | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25632167 aagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcataattttacaataaaaaca 25632264  T
Q  220 agctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccc 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  25632265 agttacttaatcatgcctttcacaataaaataaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctccccc 25632364  T
Q  316 cacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  25632365 cacacttgggagaagcattgtcctca 25632390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29595203 - 29594871
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggtttt-attcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||||||     
T  29595203 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttcattcatttggaaacaagatgtgggt 29595104  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaat 212  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||| |    
T  29595103 atatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactaagaggagacaaa-aaaaattttatgccatgctttatttcatt 29595005  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29595004 aaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaaacaaaagaataaagttcgagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 29594905  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29594904 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 29594871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 22166263 - 22166595
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22166263 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 22166362  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  22166363 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 22166462  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22166463 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 22166562  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22166563 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 22166595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22243314 - 22242982
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243314 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 22243215  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgac-caataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  22243214 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcacgatattttcaat 22243115  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22243114 aaaaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 22243015  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22243014 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 22242982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 22062224 - 22062550
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22062224 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 22062323  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22062324 caagaagacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagac-aatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaa 22062422  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| |||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  22062423 ttagctacttaaccatgccttttacaatagaactatacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactattgacactttattaggctccc 22062522  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22062523 cccacacttaggagaagcattgtcctca 22062550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 20016942 - 20017274
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  20016942 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggaagattttattcactttaaaacaagatgtggt 20017041  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20017042 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaat 20017141  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  20017142 aaaaagtagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 20017241  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20017242 ctccccccaaacttaggagaagcattgtcctca 20017274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15699057 - 15698725
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699057 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 15698958  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15698957 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttgatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 15698859  T
Q  213 aaaaaca-agctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    |||||   |||||||| | ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15698858 aaaaatttagctacttgaccatgccttttacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 15698759  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15698758 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15698725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20169739 - 20169413
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20169739 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 20169640  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa--taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caataaaa 216  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  20169639 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaaataagaggagacaa-tgaaaatttt-tgtcttgattttttcaataaaa 20169542  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    |  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20169541 attagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 20169442  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20169441 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 20169413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 24855958 - 24856290
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  24855958 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 24856057  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24856058 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatgttttcaat 24856157  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||      
T  24856158 aaaaattagctacttaactatgccttttaccataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactactgtcactttattagg 24856257  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24856258 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 24856290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 22767829 - 22768164
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcatttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     
T  22767829 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttgaaacaagatgtggt 22767928  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgac-caataagaggagacaaataaaaattttatgtcatga----tttttc 209  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    ||||||    
T  22767929 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagagtcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatttttttttc 22768028  T
Q  210 aataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatt 305  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22768029 aataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaatactacgactactgacactttatt 22768128  T
Q  306 aaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22768129 aggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 22768164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 15850694 - 15851027
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt--gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgg 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15850694 acgcgtttccttaaaatacctattcatacattcactcaagggaagccacttttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgg 15850793  T
Q  114 gaatatcaggagaactt-aaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaa 211  Q
    | |||||| ||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||   ||| |||| | ||||||| |||||||    
T  15850794 gtatatcaagaagactttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaataagaggagacaatggaaatttttgtatcatgatattttcaa 15850893  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    ||||||  ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||     
T  15850894 taaaaattagctatttaaccatgccttttgcaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactattgatactttattat 15850993  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15850994 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15851027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 341
Target Start/End: Original strand, 18188353 - 18188619
Alignment:
Q  73 tttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata 172  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||    |||||     
T  18188353 tttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacac--gagtttaatttcatgtacaacaa----ccaatt 18188446  T
Q  173 -agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttca 267  Q
     |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  18188447 tagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaacacaaaagaataaagttca 18188544  T
Q  268 agggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact-ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18188545 agggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctcccccccacacgtaggagaagcattgtcctca 18188619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Original strand, 30672449 - 30672745
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  || ||||||  ||||||||||| || | |||||| |    
T  30672449 tccttaaaatacctattcatacaatttctcaagggatgcaacttgtgtttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatatgtgtatatcaag 30672547  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  30672548 aaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaactaaaaa-tttatgtcat-aattctcaataaaaacaagc 30672645  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccac 318  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  30672646 tacttaatcatgtctttcgcaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg-gaacattacgactcaagacactttattagac-ccccccac 30672743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11218932 - 11218796
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11218932 caataaaaacaagctatttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgacaaaagacactttat 11218833  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11218832 taggcttcccccacacttaggagaagcattgtcctca 11218796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 19966941 - 19967077
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  19966941 caataaaaacaagctgcttattcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagctcaagggattttggaaacactacgacacacgacactttat 19967040  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19967041 taggctcccctcacacttaggagaagcattgtcctca 19967077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25962814 - 25962705
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  25962814 tccttaaaatacatattcatacatttgctcaagggatgcaactcgtgcttttctcattgga-gaattattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 25962716  T
Q  124 agaacttaaaa 134  Q
    |  ||||||||    
T  25962715 aatacttaaaa 25962705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25967461 - 25967352
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  25967461 tccttaaaatacatattcatacatttgctcaagggatgcaactcgtgcttttctcattgga-gaattattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 25967363  T
Q  124 agaacttaaaa 134  Q
    |  ||||||||    
T  25967362 aatacttaaaa 25967352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25962334 - 25962225
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  25962334 tccttaaaatacctattcatacatttgctcaagggatgcaactcgtgcttttctcattgga-gaattattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 25962236  T
Q  124 agaacttaaaa 134  Q
    |  ||||||||    
T  25962235 aatacttaaaa 25962225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25966981 - 25966872
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  25966981 tccttaaaatacctattcatacatttgctcaagggatgcaactcgtgcttttctcattgga-gaattattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 25966883  T
Q  124 agaacttaaaa 134  Q
    |  ||||||||    
T  25966882 aatacttaaaa 25966872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 18185199 - 18185262
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcat 80  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18185199 acgcatttccttaaaatacctatttatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcat 18185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Original strand, 19586267 - 19586328
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggag 85  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19586267 tccttaaaatacctattcatacaattgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattggag 19586328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 8724435 - 8724580
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  8724435 ttccttaaaatacctattcatacacttactaaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 8724532  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacca 169  Q
     ||  ||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  8724533 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgacca 8724580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4263440 - 4263410
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4263440 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaag 4263410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 16419335 - 16419656
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16419335 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcattttt----------tttattcactttaaaacaagatgtgggta 16419424  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagaca--aataaaaattttatgtcatgatttttcaataa 214  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16419425 tataaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaataaaaaaaaaattatgtcatgatttttcaataa 16419524  T
Q  215 aaacaagctacttaatcatgcctttcac-----aataaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16419525 aaacaagctacttaatcatgcctttcactatgaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggc 16419624  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16419625 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 16419656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 21942155 - 21942482
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21942155 acgcatttccttagaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatatctcattggaggttttattcgctttaaaacaagatgtgggta 21942254  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21942255 tattaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaattaacctattaagaggagac-aataaaaaatttatgtcataatttttcaataaa 21942353  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21942354 aacaagctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg-gaacactacgactaaagacactttattaggctc 21942452  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21942453 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 21942482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19365518 - 19365199
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19365518 acgcatttcgttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcattt-----------ttttattcactttaaaacaagatgtgggta 19365430  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaa-ataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19365429 tataaggagaacttgaaacacaatagtttattttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaataaaaaaaaattatgtcatgatttttcaataaa 19365330  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa-----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19365329 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagttaggaaacactacgactaaagacactttattaggct 19365230  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19365229 ccccccacacttaggagaagcattgtcctca 19365199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17620237 - 17619910
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  17620237 atttccttaaaatacttattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttatcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 17620138  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17620137 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaa 17620039  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17620038 acaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggaatttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 17619939  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17619938 ccacacacttaggagaagcattgtactca 17619910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 21854498 - 21854825
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| || || |||||||| ||||    
T  21854498 atttccttaaaatacctattcatatacttaatcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcatgatgtgggtatat 21854597  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  21854598 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagagtagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaa 21854696  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21854697 acaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 21854796  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21854797 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 21854825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 20039708 - 20040034
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || || ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  20039708 tttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcagcttgtgtttttctcattggagaattgtaatcactttgaagcaagatgtgggtatatc 20039807  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaa 217  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  20039808 aagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taagaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaa 20039906  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20039907 caagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagttgggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 20040006  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20040007 cccacacttaggagaagcattgtcctca 20040034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21381593 - 21381261
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381593 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 21381494  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21381493 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 21381394  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  21381393 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 21381294  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21381293 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 21381261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21955575 - 21955244
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955575 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 21955476  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21955475 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 21955377  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  21955376 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaatgaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 21955277  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21955276 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 21955244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 21099505 - 21099836
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099505 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 21099604  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  21099605 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcgtgatattttccat 21099703  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  21099704 aaaaattagctacttaaccatgccttttagaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 21099803  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21099804 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 21099836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23910942 - 23910609
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattc-actttaaaacaagatgtgg 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  23910942 acgcgtttccttaaaatacttattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattttactttaaaacaagatgtgg 23910843  T
Q  114 gaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaa 211  Q
    | |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  23910842 gtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaa 23910743  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23910742 taaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 23910643  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23910642 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 23910609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8313963 - 8313636
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggt-tttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8313963 tttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 8313864  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8313863 caagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaa 8313764  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8313763 ttagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 8313664  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8313663 cccacacttaggagaagcattgtcctca 8313636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20711962 - 20711635
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggtt-ttattcactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||  | ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  20711962 tttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaatttgtgtttatctcattggagaatattattcattttgaaacaagttgtgggtatatc 20711863  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaataaaaa 217  Q
      || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||  |||| ||||||    
T  20711862 gagaaaacttaaaataaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactgagaggagacaa-taaaatttttatgccatgctttatttcattaaaaa 20711764  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20711763 caagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 20711664  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20711663 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 20711635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 8323562 - 8323897
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  8323562 acgcgtttccttaaaatacccattcatacattcactcaagggaagcaactttgtgtttttcttattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 8323661  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt----c 209  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    |    
T  8323662 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatttttttttc 8323761  T
Q  210 aataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatt 305  Q
    ||||||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8323762 aataaaaattagctgcttaactatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaatgaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttatt 8323861  T
Q  306 aaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8323862 aggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 8323897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19767038 - 19766720
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  19767038 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 19766941  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||||||    
T  19766940 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaag 19766844  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19766843 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 19766744  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  19766743 cacttaggagaagcattgtcctca 19766720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20001808 - 20001490
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  20001808 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 20001711  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    || ||||||||||    
T  20001710 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacattaaaaacaag 20001614  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20001613 cttcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 20001514  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  20001513 cacttaggagaagcattgtcctca 20001490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22101905 - 22101584
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||  | ||  |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  22101905 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22101806  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    || ||||||| |    
T  22101805 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacattaaaaacga 22101709  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22101708 gctgcttaatcatgcctttcacaataaaacataacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccc 22101609  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22101608 acacttaggagaagcattgtcctca 22101584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22369452 - 22369134
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  22369452 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 22369355  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    ||||||||| |||    
T  22369354 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaataag 22369258  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22369257 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttgggaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 22369158  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  22369157 cacttaggagaagcattgtcctca 22369134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 22100360 - 22100681
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  22100360 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22100459  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||| |    
T  22100460 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacga 22100556  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| | || ||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  22100557 gctgcttatttattccttttacgataaaacacaataaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgaccaaagacactttattaggctcccccc 22100656  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22100657 acacttaggagaagcattgtcctca 22100681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11347664 - 11347982
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | |||  ||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  11347664 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgctattctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 11347761  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | ||||| |||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||  |||||||||| ||    || ||||||||||    
T  11347762 agaatacttacaacacaagaaatcactttaatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaa--tttatgtcataataaaacattaaaaacaag 11347857  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacacttta-ttaaactcccccc 316  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  11347858 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttatttaggctcccccc 11347957  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11347958 acacttaggagaaacattgtcctca 11347982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 22034260 - 22034583
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  22034260 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22034359  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaaca- 219  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||  |||||||| ||||||| ||    || ||||||       
T  22034360 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--ggagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacattaaaaaatg 22034456  T
Q  220 agctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccc 314  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22034457 agccgcttattcatgccttttacaataaaacaaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccc 22034556  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22034557 ccacacttagtagaagcattgtcctca 22034583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21830527 - 21830232
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  21830527 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 21830428  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    ||||||||||||    
T  21830427 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaa 21830331  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccc 315  Q
    ||  |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21830330 gccgcttattcgtgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactatgactaaagacactttattaggctccccc 21830232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20375198 - 20375007
Alignment:
Q  131 aaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctactta 228  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||    
T  20375198 aaaacacaagaattcaatttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggaaacaacaaaaaattt-atgtcataaaattttcaataaaaacaagccgctta 20375100  T
Q  229 atcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaat-aaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    |||||||||||| ||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  20375099 atcatgcctttcgcaataaatcataacaaaagaattaaagttcaagggagtatgggaacactacgactcaagacactttattagacccccccc 20375007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29333857 - 29333786
Alignment:
Q  270 ggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29333857 ggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 29333786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20375281 - 20375209
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcac 96  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  20375281 tccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattggagaatttattcac 20375209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8831293 - 8831251
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8831293 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagtgtaactccaaa 8831251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 116146 - 115816
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  116146 acgcatttcctaaaaatacctatccacacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaacttattcactttaaaacaagatgtgggta 116047  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaata 213  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  116046 tatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagac-aataaaaattttatgtcatgatttatttcttta 115948  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  115947 aaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcgagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggc 115848  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  115847 tccccccacacttaggagaaacattgtcctca 115816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 120450 - 120120
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  120450 acgcatttcctaaaaatacctatccacacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaacttattcactttaaaacaagatgtgggta 120351  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaata 213  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  120350 tatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagac-aataaaaattttatgtcatgatttatttcttta 120252  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  120251 aaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcgagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggc 120152  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  120151 tccccccacacttaggagaaacattgtcctca 120120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10911 - 10590
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||     
T  10911 ttccttaaaatatctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcttttctcattggagaatttattcactttgaaaaaagatgtgggtatatcaa 10812  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10811 gaaaacttaaattacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagac-aataaaaa-tttatgtcatgattttccaataaaaacaag 10714  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  10713 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactcaagacactttattaggctcccccca 10614  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  10613 cacttaggagaagcattgtcctca 10590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38426242 - 38425930
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38426242 acgcatttccttaaaatacatatccatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggta 38426143  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaata 213  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  38426142 tatcagaaaaacttaaaacacaagagtttactttcatatacaagaaataaccaattaagaggagac-aataaaaaatttatgtcatgatatttttcaata 38426044  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  38426043 aaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactacgactcaagacactttattaggc 38425944  T
Q  310 tccccccacactta 323  Q
    ||||||||||||||    
T  38425943 tccccccacactta 38425930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18291511 - 18291185
Alignment:
Q  19 gcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaata 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18291511 gcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttattcacgttaaaacaagatgtgggtata 18291412  T
Q  119 tcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaa 217  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18291411 tcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggaga-taataaaaa-tttatgtcatgatttttcaataaaaa 18291314  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  18291313 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctcc 18291214  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18291213 ccccacacttaggagaagcattttcctca 18291185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3354147 - 3353818
Alignment:
Q  19 gcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaata 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3354147 gcatttccttaaaatacctatccatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggataatttattcactttaaaacaagatgtgggtata 3354048  T
Q  119 tcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaataaa 215  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  3354047 tcaggaaaacttaaaacacaagagtttattttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacgataaaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaa 3353948  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  3353947 aacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacggaacaaaataataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctc 3353848  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3353847 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 3353818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348857
Alignment:
Q  19 gcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaata 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15348532 gcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttagtcactttaaaacaagatgtgggtata 15348631  T
Q  119 tcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaataaa 215  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||    
T  15348632 tcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagac-aataaaaa-tttatgtcatgatatttttcaacaaa 15348729  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  15348730 aagaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctc 15348829  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcct 339  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15348830 cccccacacttaggagaaacattgtcct 15348857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 11497328 - 11497659
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11497328 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 11497427  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11497428 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 11497526  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  11497527 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 11497626  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11497627 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 11497659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10630242 - 10629915
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10630242 atttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttatgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 10630143  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10630142 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatgtttttcaataaaa 10630044  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  10630043 acaagctacttaaccatgtctttcacaataaaacagaacaaaataataaagttcaagggagtttggaaacactatgactaaagacactttattaggctcc 10629944  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10629943 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 10629915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13822415 - 13822083
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822415 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 13822316  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  13822315 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 13822216  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  13822215 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 13822116  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13822115 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 13822083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 18082174 - 18082509
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18082174 acgcatttccttaaaatacctttccatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggta 18082273  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaata 213  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18082274 tatcaggaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaggaattaaccaattaagaggagac-aataaaaaatttatgtcatgatatttttcaata 18082372  T
Q  214 aaaac-aagctacttaatcatgcctttcacaat-------aaaacaaaaagaat-aaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||       ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18082373 aaaacaaagctacttaaccatgccttttacaataaaaacaaaaacaaaaggaataaaagttcgagggagtttggaaacactacgactcaagacactttat 18082472  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18082473 taggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 18082509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15253849 - 15253517
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcattt-ctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgg 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15253849 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgg 15253750  T
Q  114 gaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaa 211  Q
    | |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  15253749 gtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaattaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaa 15253651  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  15253650 taaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagatactttattag 15253551  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15253550 gctccccccacacttaagagacgcattgtcctca 15253517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 42710452 - 42710778
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42710452 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttcttattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 42710551  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  42710552 caagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgccatgatattttcaataaaaa 42710650  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42710651 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 42710750  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42710751 cccacacttaggagaagcattgtcctca 42710778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 17485623 - 17485940
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||     
T  17485623 ttccttaaaatacttattcatacaattactcaagggatgcaactcgtgcttttctcattggaaaatttattcacaataaaacatgatgtgggtatatcaa 17485722  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttac-tttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    || ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || || | |||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17485723 gaaaacttaaaacacaagagttcacttttcatgtacaagaaacaactaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcataatttttcaataaaaacaa 17485820  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacac 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17485821 gctatttaatcatgcctttcacaataaaac-aaaagaataaagttcaagatagtttggaaacactacgactcaagacactttattaagccccccccacac 17485919  T
Q  321 ttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  17485920 ttgggagaagcattgtcctca 17485940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22110460 - 22110128
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggtt-ttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||     
T  22110460 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatcttattcactttaaaacaagacgtggt 22110361  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||   ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  22110360 tatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaat 22110261  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22110260 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 22110161  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22110160 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 22110128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 45234950 - 45235272
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  45234950 tttccttaaaatacctattcatacacttacttaagggaaacaacttgtgcttttctcattggagaatttattcacattaaaacaaggtgtgggtatatca 45235049  T
Q  122 ggaga-acttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaat-aaaaac 218  Q
     || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||   |||| |||||||||| | |||||||| |||||     
T  45235050 agaaagacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaacaaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaaat 45235146  T
Q  219 aagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||    
T  45235147 aagatacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaccaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactatgactaaagacactttattaggct-ccc 45235245  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45235246 ccacacttaggagaaacattgtcctca 45235272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15864996 - 15864678
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  15864996 ttccttaaaatacctattcatacacttacttaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 15864899  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||    
T  15864898 agaacacttacaacacaagaaatcacttttatgtataagaaatgaccatt--gaagagacaactaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaag 15864802  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15864801 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttttaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 15864702  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  15864701 cacttagcagaagcattgtcctca 15864678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 15260938 - 15261134
Alignment:
Q  146 actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| |||||||  |    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  15260938 actttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcatagtaaaacaataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaat 15261034  T
Q  246 aaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15261035 aaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15261134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 14686497 - 14686813
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||||| | | | |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  14686497 ttccttaaaatacctattcatacacttacttaaggattgcaactaggttcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 14686594  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||| |||||||||| ||    |||| ||||||||    
T  14686595 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaactaaaaa-tttatgtcataataaaacaat-aaaacaag 14686690  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca---aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccac 318  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14686691 ctgcttattcatgccttttacaataaaaaaaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctccccccac 14686790  T
Q  319 acttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  14686791 acttaggagaagcattgtcctca 14686813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10649717 - 10649581
Alignment:
Q  210 aataaaaacaagctacttaatcatgcctttc-acaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  10649717 aataaaaacaagctgcttattcatgcctttttacaataaaacacaataaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactatgactaatgacactttat 10649618  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10649617 taggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 10649581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Original strand, 19852533 - 19852575
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19852533 ctcacccggaatgagaacccgtgcccaaaagagtaactccaaa 19852575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24219332 - 24219003
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24219332 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttagtcactttaaaacaagatgtgggta 24219233  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaata 213  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24219232 tatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagac-aataaaaa-tttatgtcatgatatttttcaata 24219135  T
Q  214 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  24219134 aaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggc 24219035  T
Q  310 tccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24219034 tccccccacacttaggagaagcattgtcctca 24219003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 23601362 - 23601689
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23601362 atttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 23601461  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  23601462 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaa 23601560  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23601561 tcaagctacttaaccatccctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 23601660  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23601661 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 23601689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15735035 - 15734703
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735035 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 15734936  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15734935 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaataatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 15734836  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  15734835 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 15734736  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15734735 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 15734703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 20596543 - 20596875
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596543 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 20596642  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20596643 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 20596742  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  20596743 aaaaattagctacttacccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 20596842  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20596843 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 20596875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 20609120 - 20609452
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20609120 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 20609219  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20609220 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 20609319  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  20609320 aaaaattagctacttacccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 20609419  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20609420 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 20609452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 20791430 - 20791761
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20791430 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 20791529  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20791530 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagac-aatgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 20791628  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  20791629 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaatagaactatacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 20791728  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20791729 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 20791761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 336
Target Start/End: Original strand, 20602829 - 20603156
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602829 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 20602928  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20602929 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaat 20603028  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  20603029 aaaaattagctacttacccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 20603128  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgt 336  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20603129 ctccccccacacttaggagaagcattgt 20603156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 21281633 - 21281957
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21281633 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactagtgtttttttcattggataatttattcacttcaaaacaagatgtgggta 21281732  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||    |||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  21281733 tatcaagaaaacttaaaacacaagagtttaacatcatgtacaacaa----ccaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttttcaataaa 21281826  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaa-----caaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21281827 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggct 21281926  T
Q  311 ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21281927 ccccccacacttaggagaagcattgtcctca 21281957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 23711396 - 23711722
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23711396 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 23711495  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23711496 caagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgccatgatattttcaataaaaa 23711594  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23711595 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 23711694  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23711695 cccacacttaggagaagcattgtcctca 23711722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24940029 - 24939698
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24940029 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 24939930  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgac-caataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  24939929 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagac-aatgaaagttttgtgtcatgatattttcaat 24939831  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      
T  24939830 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaactatacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacaactaaagacactttattagg 24939731  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24939730 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 24939698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 20445550 - 20445876
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20445550 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattgcagaatttattcactttaaaacaagatgtgcgtatatca 20445649  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaac 218  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||  |||||||||||||     
T  20445650 agaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaagaattaaccaattaagaggagacaataaaaaaaattatgtcatgatatttttcaataaaaat 20445749  T
Q  219 aagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccc 314  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20445750 aagctacttaaccatgcatttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccc 20445849  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20445850 ccacacttaggagaagcattgtcctca 20445876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20621663 - 20621331
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  20621663 acgcgttttcttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 20621564  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20621563 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaat 20621464  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  20621463 ataaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 20621364  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20621363 ctccccccaaacttaggagaagcattgtcctca 20621331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23747546 - 23747219
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23747546 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 23747447  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23747446 caagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgcacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaa 23747347  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      ||||||||||  |||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23747346 ttagctacttaactatgccttttaccataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 23747247  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23747246 cccacacttaggagaagcattgtcctca 23747219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18072396 - 18072069
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggt-tttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18072396 tttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 18072297  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18072296 caagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaattttttgtgtcatgatgttttcaataaaaa 18072197  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18072196 ttagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 18072097  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18072096 cccacacctaggagaagcattgtcctca 18072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 24953887 - 24954220
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  24953887 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcattttaaaacaagatgtggt 24953986  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24953987 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgcataagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaat 24954086  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttc-acaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24954087 aaaaattagctacttaactatgcctttttacaataaaacaaaacaaaagaatgaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 24954186  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24954187 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 24954220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20574950 - 20574668
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  20574950 tccttaaaatacctattcatacagttgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 20574852  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20574851 aatacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaagc 20574755  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20574754 tacttaatcatgtctttcgcaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg-ggacactacgactcaagacactttatta 20574668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22855067 - 22854748
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  |||| |||||||  |||||||| ||| ||    
T  22855067 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacattaaaacttgatgtgggtatagca 22854970  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| |||||||||| ||    |||||||||||||    
T  22854969 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaaatttatgtcataataaaacaataaaaacaag 22854872  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22854871 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 22854772  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  22854771 cgcttaggagaagcattgtcctca 22854748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 25007508 - 25007829
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||  | ||  |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  25007508 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtataac 25007607  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||| |    
T  25007608 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacga 25007704  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25007705 gctgcttaatcatgcctttcacaataaaatataacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccc 25007804  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  25007805 acacttaggagaagcattgtcctca 25007829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 30760357 - 30760667
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  30760357 ttccttaaaatacatattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 30760454  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||| || |  || |||||||  |||||||| |||||||        ||||||||||||    
T  30760455 agaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgatcatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcat--------aataaaaacaag 30760543  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30760544 ctgcttattcatgccttttacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 30760643  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  30760644 cacttaggagaagcattgtcctca 30760667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22947928 - 22947644
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||| || ||| || |    
T  22947928 tccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgaaacttgtgcttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtaggtatagcaag 22947830  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    |  |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||     
T  22947829 aacacttaaaacacgagaattcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaacaaaaa--tgtatgtcataatttt-caataaaaacaaga 22947733  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaat-aaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22947732 tacctaatcatgcctttcgcaacaaaacataacaaaagaattaaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttatta 22947644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 25116872 - 25117189
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  25116872 ttccttaaaatacttattcatacacttactcaagaattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacgataaaacttgatgtgggtatagca 25116969  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||  |||||||||| ||    |||||||||||||    
T  25116970 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaa--tttatgtcataataaaacaataaaaacaag 25117065  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25117066 ctgcttattcttgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacacaacgactaaagacactttattaggctcccccca 25117165  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  25117166 cacttaggagaagcattgtcctca 25117189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 25175963 - 25176280
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  25175963 ttccttaaaatacttattcatacacttactcaagaattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacgataaaacttgatgtgggtatagca 25176060  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||  |||||||||| ||    |||||||||||||    
T  25176061 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaa--tttatgtcataataaaacaataaaaacaag 25176156  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25176157 ctgcttattcttgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacacaacgactaaagacactttattaggctcccccca 25176256  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  25176257 cacttaggagaagcattgtcctca 25176280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 337
Target Start/End: Original strand, 22318222 - 22318532
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  22318222 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 22318319  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    | | | |||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    |||||||||| ||     ||||||||||||    
T  22318320 gaaca-cttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaaaaaa----tttatgtcataataaaataataaaaacaag 22318412  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22318413 ctgcttattcatgccttttacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 22318512  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtc 337  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22318513 cacttaggagaagcattgtc 22318532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26847163 - 26846842
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||||| |||  ||||||| |||||||| |||||    
T  26847163 ttccttaaaatacctacttatacacttactcaaggattgcaactgggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacatgatgtgggtatatc 26847064  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || |||||   | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||   |    ||||||||||||    
T  26847063 aagaatacttacaacacaagcaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcaaagtaaaacaataaaaacaa 26846967  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| | |||||| | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  26846966 gctgcttatttatgcctattacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccca 26846867  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26846866 acacttaggagaagcattgtcctca 26846842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 18487020 - 18487108
Alignment:
Q  252 aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18487020 aaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattagactccccccacacttaggagaagcattgtcctc 18487108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Original strand, 18484916 - 18485137
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaact-tgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||  |||| |||||||||||||  ||  |||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  18484916 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt--ttcacaataaaacttgatgtgggtatagca 18485013  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||||| ||    ||||||||| |||    
T  18485014 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagac-aacaaaaaatttatgtcataataaaacaataaaaataag 18485110  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaa 248  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||    
T  18485111 ctgcttattcatgccttttacaataaa 18485137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Original strand, 20439156 - 20439258
Alignment:
Q  146 actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  |||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  20439156 actttcatgtacaagaaacgaccattaaa--gagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaat 20439252  T
Q  246 aaaaca 251  Q
    ||||||    
T  20439253 aaaaca 20439258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 252586 - 252914
Alignment:
Q  19 gcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaata 118  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  252586 gcattttcttaaaatacctatccatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggtata 252685  T
Q  119 tcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaataaa 215  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  252686 tcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaacaactaagaggagac-aataaaaattttatgtcatgatttatttcattaaa 252784  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  252785 aacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaatggaataaagtttgagggagtttgaaaacactacgactaaagacactttattaggctc 252884  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  252885 cccccaaacttaggagaaacattgtcctca 252914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 341
Target Start/End: Original strand, 355241 - 355541
Alignment:
Q  40 tcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||        | |||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||    
T  355241 tcatacatttactcaagggaaacaacttgtgcatttctcattggagaattt--------tgaaacaagatgtgggtatatcgagaaaactaaaaatacaa 355332  T
Q  140 gagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcc 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  355333 gagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaaatttatgtcacgatatttttcaataaaaataagctacttaaccatgcc 355432  T
Q  237 tttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagca 332  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  355433 tttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagca 355532  T
Q  333 ttgtcctca 341  Q
    |||||||||    
T  355533 ttgtcctca 355541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 18872 - 19008
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18872 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagtttaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttat 18971  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18972 taggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 19008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 282
Alignment:
Q  19 gcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaata 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  599 gcatttccttaaaatatctattcatacatttactcaagggaaggaacttgtgcattt-----------ttttattcactttaaaacaagatgtgggtata 511  T
Q  119 tcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatga--tttttcaataaaa 216  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  510 taaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagac-aataaaaaatttatgtcatgatttttttcaataaaa 412  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  411 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttatttggctc 312  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  311 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 25145483 - 25145810
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  25145483 atttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 25145582  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25145583 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaa 25145681  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25145682 acaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagactcc 25145781  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25145782 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 25145810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 12330 - 12660
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12330 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 12429  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12430 tatatcaagaagacttaaaa-acaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 12527  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12528 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaga 12627  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12628 ctccccccacacttaggagaagcactgtcctca 12660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25357012 - 25356680
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  25357012 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 25356913  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  25356912 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaat 25356813  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  25356812 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 25356713  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25356712 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 25356680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 22045374 - 22045706
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  22045374 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 22045473  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22045474 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaat 22045573  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22045574 aaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 22045673  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22045674 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 22045706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 117039 - 116713
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  117039 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaaacaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaataagatgtgggtatat 116940  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  116939 caagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaataatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttatgtcatgatattttcaataaaaa 116841  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  116840 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacgaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 116741  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  116740 cccacacttaggagaagcattgtcctca 116713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17589909 - 17589576
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     
T  17589909 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttgaaacaagatgtggt 17589810  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt--caa 211  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||  |||    
T  17589809 tatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttgctttcatgcacaagaatcaacaaattaagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatttttttcaa 17589710  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17589709 taaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 17589610  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17589609 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 17589576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 24517035 - 24517367
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggtt-ttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  24517035 acgcttttccttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaatttgtgtttttctcattggagaatattattcattttgaaacaaggtgtgggt 24517134  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaat 212  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||  |||| |    
T  24517135 atatcgagaaaacttaaaataaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactgagaggagacaa-taaaatttttatgccatgctttatttcatt 24517233  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||     
T  24517234 aaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaaacaaaagaataaagttcaagggagttttgaaacactacgactaaagatactttattag 24517333  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24517334 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 24517367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 341
Target Start/End: Original strand, 24820750 - 24821068
Alignment:
Q  32 atacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaactta 131  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  24820750 atacctatccatacatttacttaagggaagcaacttgtgtatttctcattggagaatttattcagtttaaaacaagatgtgagtatatcaggaaaattta 24820849  T
Q  132 aaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaa-ataaaaattttatgtcat--gatttttcaataaaaacaagctactt 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||  |||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  24820850 aaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaaaaattatgtaataatattttccaataaaaacaagctactt 24820949  T
Q  228 aatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact-ccccccacactt 322  Q
    || ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  24820950 aaccatgcctttcacaataaaatagaacaaaagaataaagttcaagggagttgggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccccacactt 24821049  T
Q  323 acgagaagcattgtcctca 341  Q
    | |||||||||||||||||    
T  24821050 aggagaagcattgtcctca 24821068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 24796003 - 24796330
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  24796003 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttgaaacaagatgtggttatat 24796102  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||     
T  24796103 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaag 24796202  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      ||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  24796203 ttagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactactgacactttattaggctccc 24796302  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24796303 cccacacttaggagaagcattgtcctca 24796330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22664558 - 22664259
Alignment:
Q  47 tttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  22664558 tttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtt 22664459  T
Q  145 ta-ctttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttca 241  Q
    |  |||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  22664458 ttgctttcatgtacaagaatcaatcgaataggaggagacaatgaaaatttttatgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttta 22664359  T
Q  242 caataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtc 337  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22664358 caataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtc 22664259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27627082 - 27626762
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggt-tttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27627082 tttccttaaattacctattcatacacgtactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaaaaactttattcactttaaaacaagatgtaggtatat 27626983  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaac 218  Q
    || ||   ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||      ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||     
T  27626982 caagaaggcttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaaa------ataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaat 27626889  T
Q  219 aagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccc 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27626888 tagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccc 27626789  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27626788 ccacacttaggagaagcattgtcctca 27626762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16775152 - 16774819
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||     
T  16775152 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatcctattcactttaaaacaagatgtggt 16775053  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caat 212  Q
     |||||| ||   ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| || | ||||||||||||| ||||    
T  16775052 tatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttgtgtgtcatgattttttcaat 16774953  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttc-acaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16774952 aaaaattagctacttaactatgcctttttacaataaaacaaaacaaaagaatgaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 16774853  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16774852 gctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 16774819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24501583 - 24501305
Alignment:
Q  26 cttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggag 125  Q
    |||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||     
T  24501583 cttaaactacctattcatacaattgctcaagggatgcaacttgggcttttctcattggagaatttattcacattaaaacaagatgtgagtatatcaagaa 24501484  T
Q  126 aacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagcta 224  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  24501483 tacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataattct-caataaaaacaagcta 24501387  T
Q  225 cttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24501386 cttaatcatgcctttcacaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagttttgaaacactaccacacaagacactttatta 24501305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 127 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23647321 - 23647106
Alignment:
Q  127 acttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctact 226  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| || ||||||| ||    ||||||||||||||| ||    
T  23647321 acttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaaatt-atgtcataataaaacaataaaaacaagctgct 23647225  T
Q  227 taatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacactt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23647224 taatcatgcctttcacaataaaacataacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggatccccccacactt 23647125  T
Q  323 acgagaagcattgtcctca 341  Q
    | |||||||||||||||||    
T  23647124 aggagaagcattgtcctca 23647106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Original strand, 25371682 - 25371965
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||  ||||||||||||||||  |||||     
T  25371682 ttccttaaagtacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattgga-gaattatccacaataaaacaagatgtgggtttatcaa 25371780  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacca-ataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||   |||| |||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  25371781 gaaaacttaaaacacaagtgttcactttcatgtagaagaaacaaccagcttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaatagg 25371877  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25371878 ctacttaatcatgcctttcacaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg-gaacactacgactcaagacactttatta 25371965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27631008 - 27630687
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||  | ||  |||||||||||||  || ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  27631008 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 27630909  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||| |    
T  27630908 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacga 27630812  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27630811 gctgcttaatcatgcctttcacaataaaacataacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccc 27630712  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  27630711 acacttaggagaagcattgtcctca 27630687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 341
Target Start/End: Original strand, 23160218 - 23160412
Alignment:
Q  148 tttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataa 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23160218 tttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacgagctgcttaatcgtgcctttcacaataa 23160314  T
Q  248 aaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23160315 aacataacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 23160412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 341
Target Start/End: Original strand, 23571475 - 23571669
Alignment:
Q  148 tttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataa 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23571475 tttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacgagctgcttaatcgtgcctttcacaataa 23571571  T
Q  248 aaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23571572 aacataacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 23571669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 27769521 - 27769841
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  |||||| |||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  27769521 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 27769620  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
    | ||  | ||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||| ||| ||    |||||||||| |    
T  27769621 aagaatatttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgccataataaaacaataaaaacga 27769716  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27769717 gctgcttattcatgccttttacaataaaacacaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccc 27769816  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  27769817 acacttaggagaagcattgtcctca 27769841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Original strand, 26192348 - 26192657
Alignment:
Q  26 cttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| || ||    
T  26192348 cttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagcaaga 26192445  T
Q  125 gaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagcta 224  Q
      ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| || ||||||| ||    |||||||||||||||     
T  26192446 acacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaaatt-atgtcataataaaacaataaaaacaagctg 26192542  T
Q  225 cttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacac 320  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26192543 ctttttcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactacgactaaaaacactttattaggctccccccacac 26192642  T
Q  321 ttacgagaagcattg 335  Q
    ||| |||||||||||    
T  26192643 ttaggagaagcattg 26192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24170821 - 24170504
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  24170821 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 24170724  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  | |||||| ||||||| ||    |||||||||||||    
T  24170723 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaatgaccatt--gaagagacaacaagaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaag 24170627  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||    
T  24170626 ttgcttattcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgacacaagacactttattaggct-ccccca 24170528  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  24170527 cacttaggagaagcattgtcctca 24170504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 25366476 - 25366735
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttatt-cactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||  |||||||||||||  ||  || |||  |||||   |||||||| ||| |    
T  25366476 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaattagtttcacaataaaaattgatgtgggtatagc 25366575  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaaca 219  Q
    | ||  ||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25366576 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttt-caataaaaaca 25366672  T
Q  220 agctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttc-aagggagtttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25366673 agctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacaaaacaaaagaataaagttcaaagggagtttg 25366735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23630672 - 23630559
Alignment:
Q  232 atgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgag 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||    
T  23630672 atgcctttcacaataatacaaaacaaaagaataaagttcaacggagtttggaaacactatgacacaagacactttattaggctcccccaacactcaggag 23630573  T
Q  328 aagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  23630572 aagcattgtcctca 23630559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 171
Target Start/End: Original strand, 25368433 - 25368551
Alignment:
Q  52 tcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttc 151  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  | || ||| |||||| || ||||||    
T  25368433 tcaagggatgcaacttgtgtttttctcattgaagaatttattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaatagtt-aaacacaagaattcactttc 25368531  T
Q  152 atgtacaagaaacgaccaat 171  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  25368532 atgtacaagaaacaaccaat 25368551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 306
Target Start/End: Original strand, 25368551 - 25368669
Alignment:
Q  192 tttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaa-taaagttcaagggagtttgtaaacacta 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    ||||||| | ||||||||  ||||||  ||||| ||    
T  25368551 tttatgtcataatttt-caataaaaacaagctacttaatcattcctttcgcaacaaaacataacaaaagaattcaagttcaaaagagtttcaaaacatta 25368649  T
Q  287 cgactaaagacactttatta 306  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  25368650 cgactcaaaacactttatta 25368669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8413888 - 8413846
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8413888 ctcaaccggaatgaggacccgtgctcaaaagggtacctccaaa 8413846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 59345 - 59632
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  59345 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcattttt---------ttttattcactttaaaacaagatgtgggta 59435  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagaca--aataaaaattttatgtcatgatttttcaataa 214  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  59436 tataaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaataagaggagacaataaaaaaaaaattatgtcatgatttttcaataa 59535  T
Q  215 aaacaagctacttaatcatgcctttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  59536 aaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttatta 59632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 4325 - 4652
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggtttt-attcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  4325 acgcatttccttaaaatacctatt-atacacttacttaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttcattcattttgaaacaagatgtgggt 4423  T
Q  116 atatcaggagaactt-aaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaa 211  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||     
T  4424 atatcaagaaaactttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaactaagaggagacaa-taaaaaatttatgtcatgatttatttcat 4522  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  4523 taaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttataaggctc 4622  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4623 cccccacacttaggagaagcattgtcctca 4652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 90 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 90700 - 90444
Alignment:
Q  90 tattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagttt-actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaa 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  90700 tattcactttaaaataagatgtggttatatcaggagaacttaaaacacaagagttttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaattaaa 90601  T
Q  189 aattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa-----agaataaagttcaagggagtttgtaaaca 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  90600 aattt-atgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaaggtcaagggagtttggaaaca 90502  T
Q  284 ctacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  90501 ctacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 90444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 17263 - 17590
Alignment:
Q  21 atttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttt-tattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || || ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  17263 atttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcagcttgtgtttttctcattggagaattgtaatcactttgaagcaagatgtgggtatat 17362  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17363 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagagcagacaa-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaa 17461  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17462 acaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaaaagaataaagttcaagggagttgggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 17561  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17562 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 17590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3989595 - 3989265
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  3989595 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactttgtatttttctcattggagaatttattcacgttaaaacaagatgtgggt 3989496  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatg--atttttcaat 212  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  3989495 atatcaagaaaacttaaaacacaagagtttacttttatgtacaagaattaaccaattaagaggagac-aataaaaaatttatgtcatgatatttttcaat 3989397  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      
T  3989396 aaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagttt-tgaacactacgactaaagacactttattagg 3989298  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3989297 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 3989265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27046375 - 27046044
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046375 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 27046276  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||    
T  27046275 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgccatgatattttcaat 27046177  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  27046176 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 27046077  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27046076 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 27046044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20236968 - 20236637
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20236968 acgcgtttccttaaaatacctatttatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggg 20236869  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20236868 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggaga-taatgaaaattttgtgtcatgatattttcaat 20236770  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    || ||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      
T  20236769 aagaattagctacttgaccatgccttttacaataaaactatacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacaactaaagacactttattagg 20236670  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20236669 ctccccccacactcaagagaagcattgtcctca 20236637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 21799382 - 21799709
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggt-tttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21799382 tttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 21799481  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21799482 caagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaa 21799581  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21799582 ttagctacttaatcatgcctttttcaataaaacaaaacaaaagagtaaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccc 21799681  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21799682 cccacacttaggagaagcattgtcctca 21799709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 52939332 - 52939498
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52939332 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaatggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggta 52939431  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaa 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52939432 tatcaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaa 52939498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 17095320 - 17095648
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcatttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17095320 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatatgggtatat 17095419  T
Q  120 caggagaact-taaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgac-caataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaa 216  Q
    || ||  |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||  |||||||||||    
T  17095420 caagaagactaaaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcacgatactttcaataaaa 17095519  T
Q  217 acaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcc 312  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17095520 attagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcc 17095619  T
Q  313 ccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17095620 ccccacacttaggagaagcattgtcctca 17095648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 8948280 - 8948598
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||   ||||||  |||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||| |||||||| ||| ||    
T  8948280 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaaggattgcaactaagtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacatgatgtgggtataaca 8948377  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
     ||  |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8948378 agaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccattttagaagagacaacaaaaaattt-atgtcataatttt-caataaaaacaa 8948475  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8948476 gctgcttaatcatgtctttcgcaataaaacaaaacaaaagaataaagttcgagggagtttggaaac--tacgactaaagacactttattaggctcccccc 8948573  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  8948574 acacttaggagaagcattgttctca 8948598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 21785177 - 21785501
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||||||    
T  21785177 ttccttaaaatacctactcatacatttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatatca 21785274  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||  |||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  21785275 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccattgaagagacaacaataaaaaaaattatgtcataataatacaataaaaacaa 21785374  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaa-----caaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaac-tcccc 314  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  21785375 gctgcttattcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagagtaaagttcaagggagtttggaaacactaggactaaagacactttattaagcttcccc 21785474  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21785475 ccatacttaggagaagcattgtcctca 21785501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8652537 - 8652333
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||  |||||     
T  8652537 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattggagaatt-attcacgataaaacaagatgtgggtttatcaa 8652439  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||   |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8652438 gaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggatacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaag 8652342  T
Q  222 ctacttaat 230  Q
    |||||||||    
T  8652341 ctacttaat 8652333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 19876395 - 19876653
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaact-tgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||  ||||| |||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||| ||| ||| ||    
T  19876395 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaaggctgcaaccatgtgcttttctcattggagaattt-ttcacaataaaacaagatgcgggtatagca 19876493  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacca-ataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
     ||  |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  |  || ||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |    
T  19876494 agaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacaaccattttggaagagac-aacaaaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacga 19876591  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaa-taaagttcaagggagtttg 277  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19876592 gccgcttaatcatgcctttcacaacaaaacataacaaaagaattaaagttcaagggagtttg 19876653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8652307 - 8652192
Alignment:
Q  230 tcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacg 325  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  8652307 tcatgcctttcgcaattaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgacacaagacactttatttggctccccccacacttagg 8652208  T
Q  326 agaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||||    
T  8652207 agaagcattgtcctca 8652192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Original strand, 20071902 - 20071961
Alignment:
Q  282 cactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20071902 cactacgactaaagacactttattaggctcccctcacacttaggagaagcattgtcctca 20071961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13062033 - 13061991
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13062033 ctcagccgaaatgaggacccgtgctgaaaagagtacctccaaa 13061991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 49491951 - 49491909
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  49491951 ctcagccggaatgaggacccgtgcccaaaagggtacctccaaa 49491909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 62 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9361
Alignment:
Q  62 caacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaaga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9648 caacttgtgcatttctcattggagaatttattcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaaga 9549  T
Q  162 aacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaac-aagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aa 253  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||    
T  9548 aataaccaattaagagaagacaaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 9449  T
Q  254 aagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9448 aagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 9361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12982 - 12656
Alignment:
Q  22 tttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12982 tttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatat 12883  T
Q  120 caggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaa 217  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  12882 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaaccaaataagaggagacaa-tgaaaattttgtgtcatgatattttccataaaaa 12784  T
Q  218 caagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccc 313  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12783 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggtaacactacgactaaagacactttattaggctccc 12684  T
Q  314 cccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12683 cccacacttaggagaagcattatcctca 12656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7511 - 7182
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||| ||| || |||||||||||     
T  7511 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttcattcattttgaatcaagatgtgggt 7412  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaat 212  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  7411 atatcaagaaaacttaagatacaagagttcactttcatgtacaagaaacaatcaactaagaggagacaa--taaaattttatgtcatgatttatttcatt 7314  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  7313 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactactactaaagacactttatt-ag 7215  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7214 gttcccccacacttaggagaaacattgtcctca 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 9036 - 9362
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9036 acgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtgtttttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggta 9135  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaa 215  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9136 tatcaagaaaacttaaaacacaagagtttaatttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcataatttttcaataaa 9233  T
Q  216 aacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactc 311  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |   || |||||||  ||     
T  9234 aagaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaacactaagacgcatttcattttattaggct- 9332  T
Q  312 cccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9333 cccccacacttaggagaagcattttcctca 9362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44914 - 44619
Alignment:
Q  53 caagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaactt-aaaatacaagagtttactttc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44914 caagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaactttaaaacacaagagtttactttc 44815  T
Q  152 atgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaa 248  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44814 atgtacaagaattaaccaattaagaggagacga-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacctaaccatgcctttcacaataaa 44716  T
Q  249 aca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    | |    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44715 aaagaacaaaataataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctccccccacactgaggagaagcattgtcctca 44619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 52303 - 52008
Alignment:
Q  53 caagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaactt-aaaatacaagagtttactttc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  52303 caagggaagcaacttgtgcatttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaactttaaaacacaagagtttactttc 52204  T
Q  152 atgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaa 248  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  52203 atgtacaagaattaaccaattaagaggagacga-taaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacctaaccatgcctttcacaataaa 52105  T
Q  249 aca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    | |    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  52104 aaagaacaaaataataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctccccccacactgaggagaagcattgtcctca 52008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 122870 - 122539
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  122870 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagacgtggg 122771  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat-ttttcaat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| | | ||| |||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||    
T  122770 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacatgaatcaatcaaataagtggagacaa-tgaaaattttgtgccatgatattttcaat 122672  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  122671 aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 122572  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  122571 ctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 122539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 51213 - 51538
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  51213 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatttattcactttaaaacaagatgtgggtatataa 51312  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgat--ttttcaataaaaac 218  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  51313 agaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaagaattaactaattaagaggagacaa-taagaattttatgtcatgatatttttcaataaaaat 51411  T
Q  219 aagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccc 314  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  51412 aagctacttaaccatgtctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggtaacactacgactcaagacactttattaggctcccc 51511  T
Q  315 ccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51512 ccacacttaggagaagcattgtcctca 51538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 341
Target Start/End: Original strand, 18916 - 19234
Alignment:
Q  32 atacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaactta 131  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  18916 atacctatccatacatttacttaagggaagcaacttgtgtatttctcattggagaatttattcagtttaaaacaagatgtgagtatatcaggaaaattta 19015  T
Q  132 aaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaa-ataaaaattttatgtcat--gatttttcaataaaaacaagctactt 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||  |||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  19016 aaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaaaaattatgtaataatattttccaataaaaacaagctactt 19115  T
Q  228 aatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaact-ccccccacactt 322  Q
    || ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19116 aaccatgcctttcacaataaaaaagaacaaaagaataaagttcaagggagttaggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccccacactt 19215  T
Q  323 acgagaagcattgtcctca 341  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19216 aggagaagcattgtcctca 19234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 35817 - 36150
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggaggtttt-attcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  35817 acgcattttcttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatttcattcattttgaaacaagatgtggg 35916  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattt--ttcaa 211  Q
     |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||     
T  35917 tatatcaagaaaacttaaaatgaaagagttcactttcatgtacaagaaatacccaactaagaggagacaa-taaaaattttatgccatgctttatttcat 36015  T
Q  212 taaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa-----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36016 taaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaaacaaaagaataaagttcgagcgagtttggaaatactacgacaaaagacactttatta 36115  T
Q  307 aactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36116 ggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 36150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 540 - 207
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtggg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  540 acgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactctagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggt 441  T
Q  115 aatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt-caat 212  Q
     |||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| | || || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  440 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgcacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaat 341  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttc-acaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaa 307  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  340 aaaaattagctacttaactatgcctttttacaataaaacaaaacaaaagaatgaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattag 241  T
Q  308 actccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  240 gctcccccaacacttaggagaagcattgtcctca 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10644 - 10329
Alignment:
Q  25 ccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttct-cattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  10644 ccttgaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtttttttttacattgtagaattaattcactttaaaataagatgtgggtatatcaag 10545  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10544 aaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaacaa----ccaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttttcaataaaaacaagc 10451  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccac 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||    
T  10450 tacttaatcatgcctttcacaaaaaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggct-cccccac 10352  T
Q  319 acttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||| |||||||||| ||||||    
T  10351 acttaggagaagcattctcctca 10329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17599 - 17528
Alignment:
Q  269 gggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17599 gggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggct-cccccacacttaggagaagcattctcctca 17528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 2998 - 3164
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2998 acgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatatctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggta 3097  T
Q  117 tatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaa 183  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3098 tattatgagaacttaaaacacaagattttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaa 3164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Original strand, 964 - 1282
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  964 tccttaaaatacctattcatacgcttgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcacg 1062  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1063 aaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacca--caaaaatttatgtcataatttttcaataaaaacaagc 1160  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccac 318  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  |  |||||||    
T  1161 tacttaatcatgccttttgcaattaaacaaaacaaaagaataaagttgaagggagtttg-gaacacaacgactcaagacactttattacgcctcccccac 1259  T
Q  319 acttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  1260 acttgggagaagcattgtcctca 1282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 87 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25015 - 24756
Alignment:
Q  87 ttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaata 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||  |    
T  25015 ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatgtcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaacaaataagaggagacaatga 24916  T
Q  187 aaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaa 281  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24915 aaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttcacaataaaacgaatcaaaagaataaagttcacgggagtttggaaa 24816  T
Q  282 cactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24815 cactacgactaaagacactttattaggctccccccatacttaggagaagcattgtcctca 24756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1941 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1941
Description:

Target: scaffold1941; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 953 - 1220
Alignment:
Q  17 acgcatttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtggga 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  953 acgcttttccttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaatttgtgtttttctcattggagaatattattcattttgaaacaaggtgtgggt 1052  T
Q  116 atatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatt--tttcaat 212  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||  ||||| |    
T  1053 atatcgagaaaacttaaaataaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactgagaggagac-aataaaatttttatgccatgctttatttcatt 1151  T
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca-----aaaagaataaagttcaagggagttt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  1152 aaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaaacaaaagaataaagttcaagggagttt 1220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 32277 - 32558
Alignment:
Q  26 cttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggag 125  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||     
T  32277 cttaaaatacctattcatacacatgctcaagggatgcaacttgtgcttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaa 32375  T
Q  126 aacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagcta 224  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||  |  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32376 aacttaaaacacaagagttcactttcgtgtacaagaaacaaccaatttagaggagac--agcaaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaagcta 32472  T
Q  225 cttaatcatgcctttcacaat-----aaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttatta 306  Q
    |||||||||||||||| ||||     |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  32473 cttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaaaaaaaagaataaagttcaagggtgtttg-gaatattacgactaaagacactttatta 32558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 46053 - 46249
Alignment:
Q  146 actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaat 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||    
T  46053 acttttatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaagctgcttattcatgacattaacaat 46149  T
Q  246 aaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46150 aaaacaaaacaaaagaataaagttcatgggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccaaacttaggagaagcattgtcctca 46249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11882 - 11626
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| ||||||     
T  11882 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttttgcttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaa 11784  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||   |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11783 gaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaag 11687  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttc-aagggagtttg 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11686 ctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacaaaacaaaagaataaagttcaaagggagtttg 11626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 233516 - 233772
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| ||||||     
T  233516 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttttgcttttctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaa 233614  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacc-aataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||   |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  233615 gaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa--caaaaatttatgtcat-aattttcaataaaaacaag 233711  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttc-aagggagtttg 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  233712 ctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacaaaacaaaagaataaagttcaaagggagtttg 233772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 341
Target Start/End: Original strand, 13 - 234
Alignment:
Q  127 acttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaaataaaaattttatgtcatgattttt--caataaaaacaagct 223  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||  ||||| |||  ||||    
T  13 acttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggcgacaatgaaaatttttgtgtcatgatttttttcaatagaaattagct 112  T
Q  224 acttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccaca 319  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  113 acttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggactttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccaca 212  T
Q  320 cttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  213 cttaggagaagcattttcctca 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 1786
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||||||    
T  2107 ttccttaaaatacttattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatatca 2010  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaat-aagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaa 220  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| ||||| || ||||||| ||    ||||||||| ||    
T  2009 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccattgaagagacaacaaaaaaaaaatt-atgtcataataaaacaataaaaataa 1911  T
Q  221 gctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccc 316  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1910 gctccttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactcaagacactttattaggctcccccc 1811  T
Q  317 acacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  1810 acacttaggataagcattgtcctca 1786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 12165 - 12484
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||| |||||||| ||| ||    
T  12165 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacatgatgtgggtatagca 12262  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| |||||| ||| ||    |||||||||||||    
T  12263 agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaaatttatgccataataaaacaataaaaacaag 12360  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  12361 ctgcttattcatgctttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagattggaaacactacaactaaagacactttattaggctcctccca 12460  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  12461 cacttaggagaagcattgtcctca 12484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 8176 - 8312
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8176 caataaaaacaagctgcttattcatgctttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagattggaaacactacaactaaagacactttat 8275  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8276 taggctcctcccacacttaggagaagcattgtcctca 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29997 - 29680
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  29997 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 29900  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     ||  ||||| || ||||||  | | |||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||    |||||||||||||    
T  29899 agaacacttacaacacaagaaatcattttcatgtacaagaaatgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaacaataaaaacaag 29804  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaaa----gaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29803 ctgcttattcatgccttttacagtaaaacaaaacaaaggaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctcccccca 29704  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  29703 cacttaggagaagcattgtcctca 29680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7026
Alignment:
Q  24 tccttaaaa-tacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcag 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||  |||||||||||||| | ||||||     
T  7287 tccttaaaagtacatattcatacaattcctcaagggatgcaacttgtgctttcctcattgcagaatt-attcacaataaaacaagatgtgtgtatatcaa 7189  T
Q  123 gagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
    |  ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7188 ggaaacttaaaacacaagaattctctttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa-taaaaaatttatgtcataatttt-caataaaaacaag 7091  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaaca---------aaaagaataaagttcaagggagtttg 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  7090 ctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacataacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg 7026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10070 - 9754
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttg-tgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||| ||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| ||    
T  10070 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctctttggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagca 9973  T
Q  122 ggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaag 221  Q
     |   ||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  | |||||  ||||||| ||    |||||||||||||    
T  9972 agcatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaataaatt--atgtcataataaaacaataaaaacaag 9877  T
Q  222 ctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactcccccca 317  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  9876 ctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggct-ccccca 9778  T
Q  318 cacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  9777 cacttaggagaagcattgtcctca 9754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 341
Target Start/End: Original strand, 23052 - 23184
Alignment:
Q  213 aaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaa 308  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  23052 aaaaacaagctgcttattcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattagg 23151  T
Q  309 ctccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23152 ctccccccacacttaggagaaacattgtcctca 23184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 341
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8013
Alignment:
Q  187 aaaattttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaa 281  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7854 aaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaactatacaaaagaataaagttcaagggagtttgaaaa 7953  T
Q  282 cactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7954 caatacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaaacattgtcctca 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 38631 - 38769
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaa-----caaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacacttta 303  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38631 caataaaaacaagctgcttattcatgcctttcacaataaaacaaaacaaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacacttta 38730  T
Q  304 ttaaact-ccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38731 ttaggctcccccccacacttaggagaagcattgtcctca 38769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5970 - 5776
Alignment:
Q  146 actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| ||||||| ||    || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  5970 actttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacattaaaaacaagctgcttattcatgccttttacaat 5874  T
Q  246 aaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcct 339  Q
    |||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5873 aaaacaaaacataagaataaatttcaagggagtttgaaaacactacgactaaagacactttattaggctccccctacacttaggagaagcattgtcct 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 254
Target Start/End: Original strand, 13771 - 13998
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| |||  ||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  13771 tcctaaaaatacatattcatacaattgatgaagggatgcaacttctgctattctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 13869  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    |   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13870 aatccttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaactaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttt-caataaaaacaagc 13966  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa 254  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13967 tacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaa 13998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 254
Target Start/End: Original strand, 17105 - 17332
Alignment:
Q  24 tccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaacttgtgcatttctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatcagg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| |||  ||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  17105 tcctaaaaatacatattcatacaattgatgaagggatgcaacttctgctattctcattggagaatt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaag 17203  T
Q  124 agaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagc 222  Q
    |   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17204 aatccttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaactaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcaaaatttt-caataaaaacaagc 17300  T
Q  223 tacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa 254  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17301 tacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaa 17332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13403 - 13206
Alignment:
Q  146 actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||| ||||||||||  |    ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||    
T  13403 actttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaaatttatgtcatattaaaacaataaaaacaagttgtttattcatgccttttacaat 13306  T
Q  246 aaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13305 aaaacaaaacaaaagtataaggtttaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 13206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22244 - 22049
Alignment:
Q  146 actttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||||||| ||     |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||    
T  22244 actttcatgtacaagaaacgaccatt--gaagagacaacaaaaaatt--atgtcataataaaataataaaaacaagttgcttattcatgccttttacaat 22149  T
Q  246 aaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22148 aaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaaaactacgactaaagacactttattaggctccccccaaacttaggagaagcattgtcctca 22049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8053 - 7917
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttat 304  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8053 caataaaaacatgctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaaaaaaataaagttcaagggagtttagaaacactacgactaaagacactttat 7954  T
Q  305 taaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7953 taggctccccccacccttaggagaagcattgtcctca 7917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Original strand, 25308 - 25423
Alignment:
Q  230 tcatgcctttcacaataaaacaaaa----agaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacg 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  25308 tcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcaagggagtttggaaacactacgactaaagacactttattaggctccccccacacttagg 25407  T
Q  326 agaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||||| |||||    
T  25408 agaagcattgccctca 25423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11922 - 11705
Alignment:
Q  127 acttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctac 225  Q
    |||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||| |    
T  11922 acttaaaacacaagaaatcattttcatgtacaagaaacgaccattttagaagagacaacaaaaaattt-atgtcataataaaacaataaaaacaagctgc 11824  T
Q  226 ttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacact 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  11823 ttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaaaagaataaagttcatgggagtttg-ggacactacgacacaagacactttattaggcttcccgcacact 11725  T
Q  322 tacgagaagcattgtcctca 341  Q
    || |||||||||||||||||    
T  11724 taggagaagcattgtcctca 11705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11956 - 11767
Alignment:
Q  152 atgtacaagaaacgaccaata-agaggagacaaataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaa-taaaa 249  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  11956 atgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaacaaaaa--tttatgtcataatttt-caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaatttaaa 11860  T
Q  250 ca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||    |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11859 caaaacaaaagaataaagttcaagagagtttg-gaagactacgactcaagacactttatt--aggccccccatacttaggagaagcattgtcctca 11767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 161336 - 161015
Alignment:
Q  23 ttccttaaaatacatattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcattt-ctcattggaggttttattcactttaaaacaagatgtgggaatatc 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   ||||||  |||| ||| ||||||||||  |||  ||||  ||||||  |||||||| ||| |    
T  161336 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaagtgctttttctcattggagaattt--tcacaataaaacttgatgtgggtatagc 161239  T
Q  121 aggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaataagaggagaca-aataaaaattttatgtcatgatttttcaataaaaaca 219  Q
    | ||  |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |   || ||| | || ||||| | |||||||| ||    |||||||| ||    
T  161238 aagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccatttttagaagagataacaaaaaatctatgtcataataaaacaataaaagca 161139  T
Q  220 agctacttaatcatgcctttcacaataaaac----aaaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgactaaagacactttattaaactccccc 315  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  161138 -gctgcttaatcaggcctttcacaataaaacgaaacaaaagaataaagttcaagggagtttg-ggacactacgacacaagacactttattaggctccccc 161041  T
Q  316 cacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  161040 cacacttaggggaagcattgtcctca 161015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 171593 - 171516
Alignment:
Q  92 ttcactttaaaacaagatgtgggaatatcaggagaacttaaaatacaagagtttactttcatgtacaagaaacgacca 169  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||    
T  171593 ttcacattaaaaaaagatgtgggtatagcaagaacacttaaaatacaagaaatcactttcatgtacaacaaacaacca 171516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 1
Alignment:
Q  209 caataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaataaagttcaagggagtttgtaaacactacgac 290  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  86 caataaaaacaagctgcttattcatgcctttcacagtaaaacaaaacaaaagaatcaagttcaagggagtttagaaacactacgac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2037
Description:

Target: scaffold2037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 341
Target Start/End: Original strand, 1 - 55
Alignment:
Q  287 cgactaaagacactttattaaactccccccacacttacgagaagcattgtcctca 341  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1 cgactaaagacactttattaggctccccccacacttaggagaagcattgtcctca 55  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0531 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0531
Description:

Target: scaffold0531; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Original strand, 10308 - 10350
Alignment:
Q  338 ctcagccggaatgaggacccgtgctcaaaagagtaactccaaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10308 ctcagccggaatgaggacccgtgcctaaaagagtaactccaaa 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 840
Alignment:
Q  210 aataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaaca----aaaagaa-taaagttcaagggagtttgtaaacactacgac 290  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  925 aataaaaacaagccgcttaatcatgcctttcgcaacaaaacataacaaaagaattaaatttcaagggtgtttggaaacacgacgac 840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University