View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7761_high_15 (Length: 278)

Name: NF7761_high_15
Description: NF7761
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7761_high_15
NF7761_high_15
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (1-266)||(7050498-7050763)
chr6 (1-266)||(10569141-10569404)
chr6 (1-266)||(20524126-20524391)
chr6 (1-266)||(11355948-11356204)
chr6 (1-266)||(32438200-32438465)
chr6 (1-266)||(7372103-7372367)
chr6 (1-247)||(18644031-18644277)
chr6 (1-204)||(32517672-32517875)
chr6 (1-156)||(6901999-6902154)
chr6 (150-266)||(6900225-6900341)
chr6 (1-165)||(33267998-33268155)
chr6 (212-266)||(21091574-21091628)
chr6 (112-196)||(24431587-24431671)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (1-266)||(48829944-48830209)
chr3 (1-266)||(42280246-42280512)
chr3 (1-266)||(51685350-51685615)
chr3 (1-266)||(610353-610618)
chr3 (1-266)||(46113226-46113491)
chr3 (1-266)||(27898234-27898499)
chr3 (1-266)||(17516069-17516333)
chr3 (1-266)||(43765880-43766145)
chr3 (1-266)||(30599328-30599592)
chr3 (1-266)||(23292289-23292554)
chr3 (52-266)||(2377755-2377969)
chr3 (1-266)||(21349453-21349718)
chr3 (1-266)||(44794958-44795223)
chr3 (1-266)||(2660973-2661238)
chr3 (83-266)||(41978487-41978670)
chr3 (5-266)||(35904849-35905113)
chr3 (1-266)||(2225292-2225555)
chr3 (1-266)||(44275338-44275601)
chr3 (1-266)||(46198479-46198743)
chr3 (102-266)||(7884114-7884278)
chr3 (1-208)||(54899250-54899457)
chr3 (83-266)||(38192475-38192657)
chr3 (83-254)||(46609740-46609911)
chr3 (5-220)||(24845666-24845884)
chr3 (83-254)||(46309762-46309933)
chr3 (83-254)||(53093215-53093386)
chr3 (140-266)||(53190118-53190247)
chr3 (1-144)||(53188820-53188963)
chr3 (208-266)||(54899172-54899230)
chr3 (112-196)||(35862691-35862775)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-266)||(48645867-48646130)
chr4 (1-266)||(54386880-54387145)
chr4 (1-266)||(2692406-2692671)
chr4 (1-266)||(35402788-35403053)
chr4 (1-266)||(49523871-49524136)
chr4 (1-266)||(41760847-41761112)
chr4 (1-266)||(42981359-42981624)
chr4 (1-266)||(11255050-11255315)
chr4 (1-265)||(43520178-43520442)
chr4 (1-266)||(51012666-51012931)
chr4 (1-217)||(11640838-11641059)
chr4 (83-266)||(41782261-41782444)
chr4 (121-266)||(11602416-11602561)
chr4 (83-254)||(319864-320035)
chr4 (83-254)||(4172704-4172875)
chr4 (83-254)||(33265336-33265507)
chr4 (83-240)||(43507993-43508150)
chr4 (129-266)||(52867416-52867542)
chr4 (1-254)||(834175-834427)
chr4 (1-254)||(5438536-5438784)
chr4 (112-196)||(7150221-7150305)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (1-261)||(38550390-38550650)
chr7 (1-266)||(37792154-37792419)
chr7 (1-266)||(45360076-45360341)
chr7 (1-266)||(6604264-6604529)
chr7 (1-266)||(23905372-23905637)
chr7 (1-266)||(22154639-22154904)
chr7 (1-266)||(22210554-22210819)
chr7 (5-266)||(37114652-37114913)
chr7 (1-266)||(35692470-35692735)
chr7 (1-266)||(38473244-38473508)
chr7 (1-266)||(39858362-39858627)
chr7 (1-266)||(13168822-13169087)
chr7 (1-266)||(27665166-27665431)
chr7 (7-266)||(48851450-48851708)
chr7 (1-266)||(47385335-47385595)
chr7 (1-266)||(34776081-34776346)
chr7 (52-266)||(29995687-29995901)
chr7 (5-266)||(46438634-46438895)
chr7 (3-266)||(24227543-24227806)
chr7 (84-254)||(35402563-35402733)
chr7 (56-220)||(48310748-48310914)
chr7 (170-240)||(66845-66915)
chr7 (83-174)||(69032-69123)
chr7 (219-266)||(30939747-30939794)
chr7 (112-196)||(13035621-13035705)
chr7 (83-165)||(20478921-20479003)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-255)||(26239562-26239816)
chr8 (1-266)||(7744251-7744516)
chr8 (1-266)||(9672295-9672562)
chr8 (1-255)||(41824791-41825045)
chr8 (1-266)||(42942533-42942798)
chr8 (1-266)||(27691905-27692170)
chr8 (1-266)||(33707930-33708195)
chr8 (1-266)||(40338800-40339065)
chr8 (1-266)||(41041705-41041969)
chr8 (1-266)||(22272998-22273263)
chr8 (102-266)||(38547966-38548130)
chr8 (83-266)||(8609009-8609192)
chr8 (83-266)||(13107575-13107758)
chr8 (1-206)||(5037235-5037440)
chr8 (83-266)||(13283135-13283313)
chr8 (2-205)||(3152660-3152863)
chr8 (1-254)||(29237945-29238198)
chr8 (83-254)||(35510167-35510338)
chr8 (83-254)||(33761661-33761832)
chr8 (102-254)||(600846-600998)
chr8 (121-266)||(13485353-13485493)
chr8 (1-254)||(15307044-15307296)
chr8 (1-254)||(15487413-15487665)
chr8 (1-254)||(27405263-27405515)
chr8 (1-201)||(11720496-11720697)
chr8 (222-266)||(5037198-5037242)
chr8 (1-30)||(13485257-13485286)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (1-266)||(15105185-15105450)
chr1 (1-266)||(52642756-52643019)
chr1 (5-266)||(26224677-26224938)
chr1 (1-266)||(31237626-31237891)
chr1 (1-266)||(6817836-6818101)
chr1 (1-266)||(51895285-51895550)
chr1 (4-266)||(3012576-3012838)
chr1 (1-266)||(27088026-27088290)
chr1 (1-266)||(46582708-46582973)
chr1 (1-266)||(2870338-2870603)
chr1 (83-266)||(34777339-34777522)
chr1 (1-266)||(50555222-50555488)
chr1 (83-266)||(4855168-4855351)
chr1 (1-266)||(33600272-33600536)
chr1 (1-204)||(25277495-25277698)
chr1 (1-204)||(45045623-45045826)
chr1 (1-204)||(37345137-37345340)
chr1 (83-254)||(8168533-8168704)
chr1 (83-165)||(9120844-9120926)
chr1 (112-196)||(3370338-3370422)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-266)||(107706-107970)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-270)||(32134954-32135223)
chr5 (1-266)||(30464757-30465022)
chr5 (1-266)||(2180514-2180778)
chr5 (1-266)||(8540410-8540675)
chr5 (1-266)||(12800667-12800932)
chr5 (1-266)||(21841740-21842005)
chr5 (53-266)||(28821119-28821332)
chr5 (1-266)||(12737844-12738109)
chr5 (1-266)||(2853388-2853653)
chr5 (83-266)||(7268584-7268767)
chr5 (115-266)||(24540425-24540576)
chr5 (1-180)||(41494562-41494741)
chr5 (1-254)||(42472603-42472855)
chr5 (83-165)||(40781430-40781512)
chr5 (1-30)||(28821369-28821398)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (1-266)||(9008-9273)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-266)||(6798264-6798529)
chr2 (1-266)||(14388222-14388487)
chr2 (1-271)||(40560978-40561248)
chr2 (1-255)||(2767683-2767937)
chr2 (1-266)||(16763704-16763969)
chr2 (1-266)||(19907399-19907664)
chr2 (1-266)||(39455918-39456182)
chr2 (102-266)||(39664002-39664166)
chr2 (4-266)||(17696965-17697227)
chr2 (129-266)||(44709005-44709142)
chr2 (172-266)||(42518524-42518618)
chr2 (1-254)||(6784408-6784662)
chr2 (1-254)||(24206659-24206914)
chr2 (157-202)||(37646238-37646283)
chr2 (1-43)||(44708942-44708984)
chr2 (112-196)||(161216-161300)
chr2 (1-30)||(34401303-34401332)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (1-266)||(301-557)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (52-266)||(4043-4257)
scaffold0058 (52-266)||(5215-5429)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (56-118)||(1690-1752)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7050763 - 7050498
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7050763 gtaatgaaaagaggttgtcaatggatgaatttaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 7050664  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050663 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 7050564  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7050563 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10569404 - 10569141
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10569404 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctatcaaaaaatttcaatcaaattgatccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 10569305  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10569304 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttca--acatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaa 10569207  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569206 aaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 10569141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20524391 - 20524126
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||        |||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||      
T  20524391 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtaaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcc 20524292  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524291 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 20524192  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20524191 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11356204 - 11355948
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||         |||||||||      
T  11356204 gtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaattggtccttgaattatatg---------catatcgatcc 11356114  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356113 tcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 11356014  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11356013 aagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatatttgatgt 11355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 32438200 - 32438465
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||      
T  32438200 gtaatgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcatattggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcc 32438299  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438300 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactatgatccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 32438399  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32438400 aagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 7372103 - 7372367
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||        ||||||||||||||||||  ||| |||   ||| ||||||||||||      
T  7372103 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatatcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcc 7372202  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7372203 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatcga-atcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaa 7372301  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7372302 aagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18644277 - 18644031
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||||| || |||||      
T  18644277 gtaatgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatca 18644178  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644177 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 18644078  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatca 247  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18644077 aagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32517875 - 32517672
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||      
T  32517875 gtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcc 32517776  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517775 tcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 32517676  T
Q  201 aaga 204  Q
    ||||    
T  32517675 aaga 32517672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6902154 - 6901999
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  6902154 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatcc 6902055  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcac 156  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6902054 ccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900225
Alignment:
Q  150 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcata 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  250 agtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgt 6900225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 33267998 - 33268155
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||       ||||||  |||||||||       |||||||||||||||||||||||      
T  33267998 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctctcaaaaaatttcaattgaattggtcc-------gtatgtctatccatcatatcgatcc 33268090  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatcct 165  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268091 ctaaattattgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 266
Target Start/End: Original strand, 21091574 - 21091628
Alignment:
Q  212 tttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21091574 tttgaatgtaaaaatacagacatttgcatattttcataagtcataaatttgatgt 21091628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Original strand, 24431587 - 24431671
Alignment:
Q  112 aaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| || |||  ||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  24431587 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacaaatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcagaattaagtaaaaa 24431671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 48829944 - 48830209
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48829944 gtaatgaaaagtggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatct 48830043  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48830044 ccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 48830143  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48830144 aagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatatcatcataagtcatatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42280512 - 42280246
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  42280512 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatcc 42280413  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagta 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42280412 ccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaaagta 42280313  T
Q  200 aaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42280312 aaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 42280246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51685615 - 51685350
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||      
T  51685615 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatcc 51685516  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51685515 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 51685416  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  51685415 aagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaaccatcataagtcatacatttgatgt 51685350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 610618 - 610353
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  610618 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatcc 610519  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  610518 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 610419  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  610418 aagacagacactttgattgtaaaaaagcagacatttgcatataatcataagtcatacatttgatgt 610353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46113491 - 46113226
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||      
T  46113491 gtaatgaaaagaggttgtcaaggaatgaatccaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatcc 46113392  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46113391 ctaaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacataaatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 46113292  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46113291 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatacatttgatgt 46113226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 27898234 - 27898499
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||       ||||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  27898234 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaagttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 27898333  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27898334 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 27898433  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27898434 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 27898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17516333 - 17516069
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||||     
T  17516333 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatca-tatccatcatatcgatac 17516235  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17516234 tcaaattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaa 17516135  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516134 aagacagatactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 17516069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43766145 - 43765880
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  43766145 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatca 43766046  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766045 tcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 43765946  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43765945 aagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 43765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 30599328 - 30599592
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||| |||||||| |||      
T  30599328 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcc 30599426  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30599427 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaa 30599526  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30599527 aagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 23292289 - 23292554
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||  || ||||       ||||||||||||| |||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  23292289 gtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacttttctgtcaaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 23292388  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23292389 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 23292488  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23292489 aagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2377969 - 2377755
Alignment:
Q  52 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacat 151  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2377969 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 2377870  T
Q  152 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  2377869 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaatatttgcatatcatcataaa 2377770  T
Q  252 tcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||    
T  2377769 tcatatatttgatgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21349718 - 21349453
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||         ||||||||||||||| ||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  21349718 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtaaaaaaaaatcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcc 21349619  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349618 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaattatcactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 21349519  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21349518 aagacaaacactttgattataaaaagatagacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44795223 - 44794958
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||       ||||||||||||||| |||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  44795223 gtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaaccaaaccattatgtcaaaatatttcaatcaaattggttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcc 44795124  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795123 tcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 44795024  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44795023 aagacagacactttgattataaaaagacggacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 44794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2661238 - 2660973
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       || ||||||||||||||||  ||| |||   ||| ||||||||||||      
T  2661238 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcc 2661139  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661138 tcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 2661039  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2661038 aagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41978670 - 41978487
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978670 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 41978571  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41978570 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 35904849 - 35905113
Alignment:
Q  5 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||   |||    
T  35904849 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaa 35904948  T
Q  105 attagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904949 attagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 35905048  T
Q  205 caaacactttgattgtaaaaagacagacatt---tgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35905049 cagacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcataagtcatatatttgatgt 35905113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 2225292 - 2225555
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||       |||| ||  ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  2225292 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtcaaaaaaattcattcgcattggtccttgaattatatacatatccatcatttcgatcc 2225391  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225392 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 2225491  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  2225492 aagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttgatgt 2225555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 44275338 - 44275601
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||         |||||||||||||||||||  ||| ||    ||||||||||||||||      
T  44275338 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctg--aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcc 44275435  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44275436 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggttcttgaattttcacaatagatatcattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaa 44275535  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44275536 aagacaaacactttgattataaaaagacagtcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46198743 - 46198479
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   |||| |||||||||||      
T  46198743 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcc 46198644  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198643 tcaaattagtaaaaataccatcaaataggtcctggattttt-acaacagatatcattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 46198545  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46198544 aagacagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Original strand, 7884114 - 7884278
Alignment:
Q  102 caaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884114 caaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 7884213  T
Q  202 agacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  7884214 agatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgt 7884278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 54899457 - 54899250
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||       |||||||| || |||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||      
T  54899457 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttccgtcaaaaaaattcaatcacatcggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcc 54899358  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899357 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 54899258  T
Q  201 aagacaaa 208  Q
    ||||||||    
T  54899257 aagacaaa 54899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 38192475 - 38192657
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38192475 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 38192574  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |   ||||||||||| |||||||||||    
T  38192575 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcgttatatcataagtca-atatttgatgt 38192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 46609740 - 46609911
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46609740 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 46609839  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  46609840 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 46609911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24845884 - 24845666
Alignment:
Q  5 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||       ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |  | ||    
T  24845884 tgaaaagaggttgtaaatgaatgaattcaacccttctatcaaaatctttccatcaaattggtccttctattgtttgtctatgcatcaaatcgttccctaa 24845785  T
Q  105 attagtgaaaa-taccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaa 201  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24845784 attagttaaaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaa 24845685  T
Q  202 agacaaacactttgattgt 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  24845684 agacatacactttgattgt 24845666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46309933 - 46309762
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  46309933 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcatttgtgcatacatttgct 46309834  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  46309833 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 46309762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 53093215 - 53093386
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  53093215 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 53093314  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  53093315 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 53093386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 266
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190247
Alignment:
Q  140 ttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta---aaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacattt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  237 gcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 53188820 - 53188963
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||      
T  53188820 gtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatgaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcc 53188919  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcac 144  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  53188920 tcaaattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54899230 - 54899172
Alignment:
Q  208 acactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  54899230 acactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 54899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  112 aaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| |   |||| || ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 48645867 - 48646130
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48645867 gtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 48645966  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48645967 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaa 48646066  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48646067 aagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54387145 - 54386880
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  54387145 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttcgattgtatgtctctccatcatatcgatcc 54387046  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387045 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 54386946  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54386945 aagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 54386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 2692406 - 2692671
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2692406 gtaattaaaagaggttgtcaacgaatgaattcaatccttctgtcaaaaaatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 2692505  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2692506 ccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggttcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaa 2692605  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2692606 aagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 2692671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 35402788 - 35403053
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  35402788 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 35402887  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402888 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 35402987  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35402988 acgacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49524136 - 49523871
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||       |||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  49524136 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 49524037  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524036 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatataactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 49523937  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49523936 aagacagacactttgattataaaaacacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 41760847 - 41761112
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||| ||||||||||||      
T  41760847 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctggcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcc 41760946  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760947 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataccagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 41761046  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41761047 aagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42981624 - 42981359
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   |||| |||||||||||      
T  42981624 gtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcc 42981525  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981524 ttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggtatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 42981425  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42981424 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 11255050 - 11255315
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||       ||||||||||||| || ||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  11255050 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaatttcaatcaaattgatcgttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 11255149  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11255150 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattagtgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaa 11255249  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11255250 aagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43520442 - 43520178
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  43520442 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 43520343  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520342 tcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 43520243  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatg 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43520242 aagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51012931 - 51012666
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| || ||      
T  51012931 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctatcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcc 51012832  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012831 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaattttcacaacagatattactgcgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 51012732  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51012731 aagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11641059 - 11640838
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatc----- 95  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  11641059 gtaaagaaaagatgttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcatatc 11640960  T
Q  96 gatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaa 195  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11640959 gatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaa 11640860  T
Q  196 agtaaaagacaaacactttgat 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||    
T  11640859 agtaaaaaacatacactttgat 11640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41782444 - 41782261
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41782444 tatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatccttggtgcatacatttgct 41782345  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  41782344 aaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttgatgt 41782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11602561 - 11602416
Alignment:
Q  121 tcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgt 220  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11602561 tcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgt 11602462  T
Q  221 aaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11602461 aaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgt 11602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 319864 - 320035
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  319864 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 319963  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  319964 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 320035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 4172704 - 4172875
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4172704 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 4172803  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  4172804 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 4172875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33265507 - 33265336
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33265507 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 33265408  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  33265407 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 33265336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43508150 - 43507993
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43508150 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 43508051  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcat 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43508050 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 43507993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 266
Target Start/End: Original strand, 52867416 - 52867542
Alignment:
Q  129 gtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagac 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||           |||    
T  52867416 gtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacacttt-----------gac 52867504  T
Q  229 agacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52867505 aaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 52867542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 834175 - 834427
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  834175 gtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 834274  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||| |||| | | ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  834275 ttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa-taa 834373  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||   |||||||||||    
T  834374 aagacaaacactttgaatataaaaagacaaacattttcattatatcataagtca 834427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5438784 - 5438536
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  5438784 gtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 5438685  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||| |||| | | ||||||    ||||||||| ||| |||| | |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5438684 ttaaattagtaaaaaaaacatcaaat----ccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa-taa 5438590  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||   |||||||||||    
T  5438589 aagacaaacactttgaatataaaaagacaaacattttcattatatcataagtca 5438536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  112 aaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |   |||| || ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 38550390 - 38550650
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38550390 gtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaacccttatgtaaaaaaaattcaatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 38550489  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38550490 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaaagtaa 38550589  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatattt 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38550590 aagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacattt 38550650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 37792154 - 37792419
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||       ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  37792154 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgcatgtctatccatcatattgatcc 37792253  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37792254 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgttgtacaaagtaaaaagtaa 37792353  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  37792354 aagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgt 37792419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45360341 - 45360076
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  45360341 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 45360242  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45360241 taaaattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 45360142  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45360141 aagataaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 45360076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6604529 - 6604264
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  6604529 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 6604430  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6604429 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacatatatcactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaa 6604330  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6604329 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 23905372 - 23905637
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||       || ||||||||||||| ||  ||| ||||  |||| |||||||||||      
T  23905372 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttaaatcaaattggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcc 23905471  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905472 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 23905571  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23905572 aagaaaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22154904 - 22154639
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  22154904 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 22154805  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22154804 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaa 22154705  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22154704 aagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22210819 - 22210554
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  22210819 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 22210720  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22210719 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaa 22210620  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22210619 aagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 37114652 - 37114913
Alignment:
Q  5 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||   |||    
T  37114652 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatctttttgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaa 37114751  T
Q  105 attagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114752 attagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37114851  T
Q  205 caaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37114852 aatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 35692470 - 35692735
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  35692470 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 35692569  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||    
T  35692570 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaa 35692669  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35692670 aagacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 38473244 - 38473508
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||  ||||||||||||      
T  38473244 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcc 38473343  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38473344 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaa 38473443  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38473444 aa-acatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38473508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 39858362 - 39858627
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  39858362 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 39858461  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39858462 tcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 39858561  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39858562 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 39858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13169087 - 13168822
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  13169087 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 13168988  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13168987 tcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacattcgctgaacaaaataaaaactaa 13168888  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13168887 aagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaatcatatatttgatgt 13168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 27665166 - 27665431
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       || ||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  27665166 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 27665265  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665266 tcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 27665365  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27665366 aagacagacactttgattataaaaaggcagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 27665431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 48851450 - 48851708
Alignment:
Q  7 aaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||       ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||    
T  48851450 aaaagaggttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtcaaaatctttccatcaaattggtccctctattgtatgtctacccatcatattgatc-caaaat 48851548  T
Q  107 tagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 206  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48851549 tagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgaccaaagtaaaaagtaaaagaca 48851648  T
Q  207 aacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  48851649 gacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgt 48851708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 47385335 - 47385595
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  47385335 gtaatgaacagtggttgtcaatgaatgaattcaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatcc 47385434  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47385435 ccaaattagtgaaattaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatacatca-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 47385529  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  47385530 aagacagacacattgattgtaaaaagacagacatttacataccatcataactgatacatttgatgt 47385595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 34776081 - 34776346
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||       || ||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  34776081 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaactcttctgtcaaatttttttaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 34776180  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  34776181 tcaaattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaa 34776280  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34776281 aagacagacactcagattataaaaagacaaacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 34776346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Original strand, 29995687 - 29995901
Alignment:
Q  52 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacat 151  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||   ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29995687 ttcaatcaaattgatccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaat 29995786  T
Q  152 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29995787 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataag 29995886  T
Q  252 tcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||    
T  29995887 tcatatatttgatgt 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 46438634 - 46438895
Alignment:
Q  5 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||   |||    
T  46438634 tgaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctatatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaa 46438733  T
Q  105 attagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 204  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  46438734 ataagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaaga 46438833  T
Q  205 caaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46438834 caaacactttgattatagaaagacggacatttgcataccatcataagtcatatatttaatgt 46438895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 24227543 - 24227806
Alignment:
Q  3 aatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatcc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||       |||||||||||  ||||||  ||| |||    |||||||||||| ||   |    
T  24227543 aatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccttgttgtcaaaaaatttcaatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctc 24227642  T
Q  103 aaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227643 aaattagtgaaaataccatcaaataggacatttaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 24227742  T
Q  203 gacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24227743 gacagacactttgattacaaaaagacagacatttgtataccatcataaatcatatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Original strand, 35402563 - 35402733
Alignment:
Q  84 atccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctg 183  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  35402563 atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgagcatatatttgctg 35402662  T
Q  184 aacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  35402663 aacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 35402733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48310914 - 48310748
Alignment:
Q  56 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaa-taccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatc 154  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  48310914 atcaaattggtcattctattgtttgtctatgcatcaaatcgattcctaaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatc 48310815  T
Q  155 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaaagacaaacactttgattgt 220  Q
    | | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  48310814 aatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaaaagacagacactttgattgt 48310748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66845
Alignment:
Q  170 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcat 66845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 69123 - 69032
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcata 174  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  69123 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgcata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 266
Target Start/End: Original strand, 30939747 - 30939794
Alignment:
Q  219 gtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939747 gtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 30939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  112 aaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| || ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20479003 - 20478921
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatcct 165  Q
    |||||||||| |||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||    
T  20479003 tatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 26239562 - 26239816
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26239562 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatccaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 26239661  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26239662 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaacaaagtaaaaagtaa 26239761  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcat 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26239762 aagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcataccatcataagtcat 26239816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 7744251 - 7744516
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7744251 gtaatgaaaagaggctgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 7744350  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744351 ccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttcacatcatatttcacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 7744450  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7744451 aagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 7744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 9672295 - 9672562
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  9672295 gtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatccaacccttctgtcgaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcgatcc 9672394  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9672395 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaagtaa 9672494  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacat---ttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9672495 aagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgttgcatatcatcataaat-atatatttgatgt 9672562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 41824791 - 41825045
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||      
T  41824791 gtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatattgatcc 41824890  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824891 ccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 41824990  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcat 255  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41824991 aagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcataccatcataaatcat 41825045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42942798 - 42942533
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  42942798 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 42942699  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42942698 tcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaa 42942599  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42942598 aagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27692170 - 27691905
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  27692170 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 27692071  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692070 tcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 27691971  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691970 aagacatacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 33707930 - 33708195
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       |||||||||||||||| ||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  33707930 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcc 33708029  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33708030 tcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgttccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 33708129  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33708130 aagatagacactttgattataaaaagacagacattttcatatcatcataagtcatatatttgatgt 33708195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 40338800 - 40339065
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||| |||| |||||||      
T  40338800 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgatcc 40338899  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338900 tcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 40338999  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40339000 aagacagacactttgattataaaaagacatacatttgcataccatcataactcatatatttgatgt 40339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 41041705 - 41041969
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||| ||||||||||||      
T  41041705 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtccaaaaa-ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcc 41041803  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041804 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagataccattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 41041903  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41041904 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatctgatgt 41041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22273263 - 22272998
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || | ||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||      
T  22273263 gtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatcaaacctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatca 22273164  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273163 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 22273064  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22273063 aagacatacactttgattataaagagacaggcaattgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22272998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38548130 - 38547966
Alignment:
Q  102 caaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548130 caaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 38548031  T
Q  202 agacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38548030 agacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 8609009 - 8609192
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609009 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 8609108  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8609109 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgt 8609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 13107575 - 13107758
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107575 tatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 13107674  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13107675 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgt 13107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5037440 - 5037235
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  5037440 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaagaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 5037341  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5037340 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaa 5037241  T
Q  201 aagaca 206  Q
    ||||||    
T  5037240 aagaca 5037235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13283313 - 13283135
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283313 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 13283219  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283218 caacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 13283135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 3152660 - 3152863
Alignment:
Q  2 taatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||  |    
T  3152660 taatgaaaagaagttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccc 3152759  T
Q  102 caaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3152760 caaattagtgaaattaccatcaaatcagttcttgaattttcacaacataaatcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaa 3152859  T
Q  202 agac 205  Q
    ||||    
T  3152860 agac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29238198 - 29237945
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   ||||| |||| |||||      
T  29238198 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcc 29238099  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238098 tcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 29237999  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  29237998 aagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 29237945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35510338 - 35510167
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  35510338 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtcctttgtgcatacatttgct 35510239  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  35510238 gaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 35510167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 33761661 - 33761832
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33761661 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 33761760  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||   |||||||||||    
T  33761761 aaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcattatatcataagtca 33761832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 600846 - 600998
Alignment:
Q  102 caaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  600846 caaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaa 600945  T
Q  202 agacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  600946 agagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 266
Target Start/End: Original strand, 13485353 - 13485493
Alignment:
Q  121 tcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgt 220  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13485353 tcaaataggtccttcaattttcacaacagatatcactgtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgattat 13485448  T
Q  221 aaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13485449 aaaaa-acagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 13485493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15307296 - 15307044
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  15307296 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 15307197  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15307196 ttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagtaaaa-gtaa 15307098  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  15307097 aagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 15307044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15487665 - 15487413
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  15487665 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 15487566  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15487565 ttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagtaaaa-gtaa 15487467  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  15487466 aagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 15487413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27405263 - 27405515
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  27405263 gtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 27405362  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||| |||| | | ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27405363 ttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa-taa 27405461  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  27405462 aagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 27405515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11720496 - 11720697
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||       ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||||      
T  11720496 gtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaatgcaaccattttgtcaaaatctttccatcaaattggtccttaaattgtttgtctatatatcaaatcgattc 11720595  T
Q  101 ccaaattagtgaaaa-taccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 199  Q
    | | ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||   || | ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  11720596 ctacattagtgaaaaatatcatcaaataagtccttgaagtttttaaaaatatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagta 11720695  T
Q  200 aa 201  Q
    ||    
T  11720696 aa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5037242 - 5037198
Alignment:
Q  222 aaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5037242 aaaagacagacatttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 5037198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 13485257 - 13485286
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaat 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485257 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaat 13485286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15105450 - 15105185
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15105450 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatccaaccattctgttaagaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 15105351  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105350 ccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 15105251  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15105250 aagacatacactttgattgcaaaaagacagacattcgcataccatcatgagtcatatatttgatgt 15105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 52642756 - 52643019
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  52642756 gtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtctttctattgcatgtctatccatcatatcgatcc 52642855  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52642856 ctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 52642955  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  52642956 aagac--acactttgattgtaaaaagacgaatatttgcaaaccatcataagtcatacatctgatgt 52643019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 26224677 - 26224938
Alignment:
Q  5 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||   |||    
T  26224677 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaa 26224776  T
Q  105 attagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 204  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224777 attagtgaaaagaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 26224876  T
Q  205 caaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224877 cagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 26224938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31237626 - 31237891
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||      
T  31237626 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcc 31237725  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237726 tcaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 31237825  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237826 aagacattcactttgactataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 31237891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 6817836 - 6818101
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  6817836 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 6817935  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6817936 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggtttttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtga 6818035  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6818036 aagacagacactttgattataaaaagacagacatgtgcataccatcataagtcatatatttgatgt 6818101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 51895285 - 51895550
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||       |||||||||||||| ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  51895285 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 51895384  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895385 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 51895484  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51895485 aagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatattttatgt 51895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 3012576 - 3012838
Alignment:
Q  4 atgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatcca 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||| |||   ||    
T  3012576 atgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctca 3012675  T
Q  104 aattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012676 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 3012775  T
Q  204 acaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3012776 acatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27088290 - 27088026
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||      
T  27088290 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaa--ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcc 27088193  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088192 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 27088093  T
Q  201 aagacaaacactttgattgt-aaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088092 aagacagacactttgattataaaaaagacacatatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 27088026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 46582708 - 46582973
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  46582708 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 46582807  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46582808 tcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaa 46582907  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46582908 aagacaaacactttgattataaaaagactgatattttcataccatcataagtaatatatttgatgt 46582973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2870603 - 2870338
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  2870603 gtaacgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 2870504  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870503 tcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 2870404  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2870403 aagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 34777339 - 34777522
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777339 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 34777438  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34777439 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 50555222 - 50555488
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  50555222 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatcattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 50555321  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagta 199  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  50555322 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaacta 50555421  T
Q  200 aaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  50555422 aaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatgccatcataaatcatatatttgatgt 50555488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 4855168 - 4855351
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4855168 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatttgct 4855267  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4855268 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 33600272 - 33600536
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnn-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||        ||||||||||| |||||||  ||| ||||  |||||||| | |||||     
T  33600272 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatc-aacctttctgtcaaaaaaaattcaatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatc 33600370  T
Q  100 tccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 199  Q
      |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600371 ctcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 33600470  T
Q  200 aaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  33600471 aaagacaaacaatttgattgtaaaaagacagacatttgcattatatcataagtca-atatttgatgt 33600536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25277495 - 25277698
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  25277495 gtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcc 25277594  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277595 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 25277694  T
Q  201 aaga 204  Q
    ||||    
T  25277695 aaga 25277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45045623 - 45045826
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |    
T  45045623 gtaatgaaaagaagttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatct 45045722  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45045723 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaa 45045822  T
Q  201 aaga 204  Q
    ||||    
T  45045823 aaga 45045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37345340 - 37345137
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||      
T  37345340 gtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcc 37345241  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345240 tcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 37345141  T
Q  201 aaga 204  Q
    ||||    
T  37345140 aaga 37345137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 8168533 - 8168704
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8168533 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgtgcatacatttgct 8168632  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  8168633 aaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 8168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 165
Target Start/End: Original strand, 9120844 - 9120926
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatcct 165  Q
    |||||||||| |||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||    
T  9120844 tatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  112 aaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 196  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |   |||| || ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 107706 - 107970
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  107706 gtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatc-aacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatatcgatcc 107804  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107805 ctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaattttcacaatataaatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 107904  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  107905 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 32134954 - 32135223
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  32134954 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 32135053  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135054 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacggagatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 32135153  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgtccat 270  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32135154 aagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataacatcctaagtcatatatttgatgtccat 32135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 30464757 - 30465022
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  30464757 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 30464856  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30464857 taaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 30464956  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30464957 aagacatgcactttgactataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2180778 - 2180514
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  2180778 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttgtgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 2180679  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2180678 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 2180579  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  2180578 aagacagacactttgattataaaaagacagac-tttgcataccatcataaatcatatctttgatgt 2180514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8540675 - 8540410
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       ||||||||||||| |||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  8540675 gtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 8540576  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8540575 tcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 8540476  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8540475 aagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12800932 - 12800667
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  12800932 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatca 12800833  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12800832 tcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 12800733  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12800732 aagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12800667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21842005 - 21841740
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||      
T  21842005 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcc 21841906  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21841905 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgattcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaa 21841806  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841805 aagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 21841740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28821332 - 28821119
Alignment:
Q  53 tcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacata 152  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28821332 tcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 28821233  T
Q  153 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagt 252  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28821232 tcactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagt 28821133  T
Q  253 catatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||||    
T  28821132 catatatttgatgt 28821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12738109 - 12737844
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  12738109 gtaataaaaagaggttgtcgatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatca 12738010  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12738009 tcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 12737910  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12737909 aagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12737844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 2853388 - 2853653
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||   |||| |||||||       |||||| ||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  2853388 gtaatgaaaatagattgtcaatgaatgaaccaaacctttatgtcaaaatatttcaatgaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 2853487  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||  ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853488 tcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 2853587  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2853588 aagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcatattatcataagtcatatatttgatgt 2853653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7268767 - 7268584
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 182  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268767 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 7268668  T
Q  183 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7268667 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgt 7268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 115 - 266
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540576
Alignment:
Q  115 ataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacacttt 214  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  215 gattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 24540576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 41494562 - 41494741
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  41494562 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttttatcaaaatctttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatattgatcc 41494661  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttg 180  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41494662 ccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaatccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 42472603 - 42472855
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  42472603 gtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 42472702  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
      |||||||| |||| | | ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42472703 ttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa-taa 42472801  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  42472802 aagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 42472855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40781512 - 40781430
Alignment:
Q  83 tatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatcct 165  Q
    |||||||||| |||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||    
T  40781512 tatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 28821398 - 28821369
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaat 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821398 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaat 28821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9273 - 9008
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  9273 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattagtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 9174  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9173 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaa 9074  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9073 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6798529 - 6798264
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||       |||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||| ||||||      
T  6798529 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgagtcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcc 6798430  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6798429 tcaaattagtgaaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaa 6798330  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6798329 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagttatatatttgatgt 6798264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 14388222 - 14388487
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||        |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  14388222 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtaaaaaaacttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 14388321  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388322 tcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 14388421  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14388422 aagatagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40561248 - 40560978
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||        |||||| ||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||      
T  40561248 gtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgttaaaaaatttcaattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcc 40561149  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561148 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 40561049  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgtccatc 271  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40561048 aagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataaatcatatatttgatgttcatc 40560978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2767937 - 2767683
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||       |||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||      
T  2767937 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaataaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcc 2767838  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2767837 tcaatttagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaa 2767738  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcat 255  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2767737 aagacaaactctttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcat 2767683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16763969 - 16763704
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||       |||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||      
T  16763969 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcc 16763870  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16763869 tcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaatttacacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaa 16763770  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16763769 aagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 16763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 19907399 - 19907664
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||      
T  19907399 gtaatgaaaagaggttatcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcc 19907498  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19907499 tcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaa 19907598  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  19907599 aagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 19907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39456182 - 39455918
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||       |||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||| |||||||| |||      
T  39456182 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattc 39456083  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456082 tcaaatgagtgaaaatatcatcaaataggtccttaaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 39455983  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39455982 aagacaga-actttgattataaaaagacagacatttgtataccatcataagtcatatacttgatgt 39455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Original strand, 39664002 - 39664166
Alignment:
Q  102 caaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39664002 caaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaa 39664101  T
Q  202 agacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39664102 agacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgt 39664166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17697227 - 17696965
Alignment:
Q  4 atgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatcca 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||       |||||||||| ||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||    |    
T  17697227 atgaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaa 17697128  T
Q  104 aattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17697127 aattggtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatacatcactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaag 17697028  T
Q  204 acaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17697027 acagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 266
Target Start/End: Original strand, 44709005 - 44709142
Alignment:
Q  129 gtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagac 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  44709005 gtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgattataaaaatgc 44709104  T
Q  229 agacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44709105 agacatttgcataccatcataagacatatatttgatgt 44709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518618
Alignment:
Q  172 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 6784408 - 6784662
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| ||||| |    
T  6784408 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatct 6784507  T
Q  101 ccaaattagtgaaaatac-cgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 199  Q
      |||||||| |||| |  | ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6784508 ttaaattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaattggatcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagta 6784607  T
Q  200 aaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  6784608 aaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 6784662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24206659 - 24206914
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||       |||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||      
T  24206659 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcc 24206758  T
Q  101 ccaaattagtgaaaatac--cgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt 198  Q
      |||||||| |||| |   | ||||||  ||||||||||| | | |||| | |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206759 ttaaattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagt 24206858  T
Q  199 aaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtca 254  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  24206859 aaaagacaaacaatttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 24206914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  157 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 202  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 44708942 - 44708984
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgt 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44708942 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgt 44708984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  112 aaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| || |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 34401303 - 34401332
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaat 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34401303 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaat 34401332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 301
Alignment:
Q  1 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttatgtcnnnnnnnttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||  ||| ||||         |||||||||      
T  557 gtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaattggtccttgaattatatg---------catatcgatcc 467  T
Q  101 ccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaa 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  466 tcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaagtaaaaagtaa 367  T
Q  201 aagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  366 aagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtcatatatttgatgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4043
Alignment:
Q  52 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacat 151  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||   ||| ||||||||||||   |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4257 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 4158  T
Q  152 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4157 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 4058  T
Q  252 tcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||    
T  4057 tcatatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5429 - 5215
Alignment:
Q  52 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaataccgtcaaataagtccttgaattttcacaacacat 151  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||   ||| ||||||||||||   |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5429 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 5330  T
Q  152 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  5329 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 5230  T
Q  252 tcatatatttgatgt 266  Q
    |||||||||||||||    
T  5229 tcatatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 1690 - 1752
Alignment:
Q  56 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatatccaaattagtgaaaatac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1690 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaatac 1752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University