View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7765_high_18 (Length: 383)

Name: NF7765_high_18
Description: NF7765
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7765_high_18
NF7765_high_18
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (15-363)||(25978116-25978459)
chr6 (15-366)||(21632341-21632692)
chr6 (29-366)||(14967573-14967910)
chr6 (19-303)||(23841386-23841671)
chr6 (19-308)||(18139794-18140084)
chr6 (19-308)||(22959003-22959293)
chr6 (19-308)||(23829099-23829389)
chr6 (40-308)||(23380733-23381001)
chr6 (19-286)||(32111124-32111393)
chr6 (19-303)||(12744806-12745090)
chr6 (19-178)||(7836174-7836333)
chr6 (38-330)||(28109499-28109792)
chr6 (40-291)||(24408395-24408648)
chr6 (19-151)||(12982054-12982188)
chr6 (19-132)||(11127461-11127576)
chr6 (67-138)||(25455672-25455743)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (15-310)||(22224170-22224465)
chr8 (15-310)||(22230512-22230807)
chr8 (19-363)||(31982906-31983254)
chr8 (19-308)||(33879132-33879420)
chr8 (50-298)||(39658599-39658845)
chr8 (32-287)||(38250238-38250493)
chr8 (40-306)||(12584306-12584571)
chr8 (40-308)||(23645123-23645392)
chr8 (25-287)||(25593442-25593704)
chr8 (19-290)||(17929130-17929404)
chr8 (192-304)||(23945856-23945968)
chr8 (40-151)||(23945727-23945837)
chr8 (14-66)||(39658541-39658593)
chr8 (312-366)||(22226452-22226506)
chr8 (312-366)||(22232794-22232848)
chr8 (15-80)||(7946080-7946145)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (19-363)||(26549600-26549947)
chr5 (19-363)||(28564185-28564532)
chr5 (19-366)||(2454788-2455138)
chr5 (19-366)||(19687542-19687892)
chr5 (29-366)||(30762785-30763123)
chr5 (60-366)||(35382437-35382745)
chr5 (40-305)||(22938970-22939236)
chr5 (19-308)||(21334241-21334533)
chr5 (20-188)||(2838532-2838705)
chr5 (19-291)||(34134762-34135037)
chr5 (15-64)||(18767319-18767368)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (35-358)||(8526-8850)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (19-363)||(225264-225612)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (17-256)||(22995433-22995672)
chr3 (19-363)||(9156303-9156649)
chr3 (15-287)||(18540711-18540983)
chr3 (40-308)||(2776865-2777132)
chr3 (15-303)||(19303211-19303503)
chr3 (40-308)||(24126870-24127137)
chr3 (19-308)||(10882859-10883148)
chr3 (19-178)||(10961423-10961583)
chr3 (19-178)||(10964932-10965092)
chr3 (40-287)||(13556506-13556752)
chr3 (40-307)||(47052809-47053077)
chr3 (19-308)||(55033515-55033805)
chr3 (19-288)||(15196985-15197255)
chr3 (40-290)||(7831660-7831914)
chr3 (40-287)||(28328751-28328999)
chr3 (20-275)||(36534568-36534825)
chr3 (19-291)||(22025657-22025931)
chr3 (40-150)||(12541941-12542050)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (19-366)||(3922-4275)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (20-330)||(49717649-49717961)
chr1 (19-308)||(21020236-21020526)
chr1 (19-207)||(22455125-22455314)
chr1 (263-307)||(28140857-28140901)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (19-308)||(27678846-27679134)
chr4 (19-307)||(19862049-19862339)
chr4 (19-308)||(5671858-5672146)
chr4 (40-308)||(19825616-19825885)
chr4 (19-310)||(49638354-49638647)
chr4 (19-308)||(56196825-56197116)
chr4 (19-261)||(39499775-39500016)
chr4 (15-203)||(15161297-15161484)
chr4 (19-216)||(3799681-3799878)
chr4 (19-120)||(15432885-15432986)
chr4 (15-150)||(22091645-22091780)
chr4 (170-303)||(15403781-15403914)
chr4 (192-286)||(22091818-22091913)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (19-308)||(31429307-31429595)
chr2 (19-308)||(16789296-16789584)
chr2 (25-308)||(25872044-25872326)
chr2 (19-287)||(24236394-24236661)
chr2 (40-308)||(25958276-25958543)
chr2 (19-308)||(1505191-1505481)
chr2 (19-306)||(13973691-13973977)
chr2 (40-308)||(45455140-45455409)
chr2 (160-308)||(9187345-9187492)
chr2 (40-117)||(9187245-9187323)
chr2 (263-307)||(35078222-35078266)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (42-307)||(20594726-20594991)
chr7 (40-308)||(45289041-45289309)
chr7 (17-287)||(9274882-9275155)
chr7 (19-291)||(26137631-26137904)
chr7 (19-308)||(22255280-22255573)
chr7 (40-287)||(22231187-22231438)
chr7 (19-241)||(4543836-4544059)
chr7 (19-69)||(16222354-16222404)
chr7 (19-71)||(13811197-13811249)
chr7 (263-307)||(1635696-1635740)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (40-287)||(1960-2207)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (19-308)||(21340-21628)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (19-308)||(4722-5014)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (40-308)||(10940-11209)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (40-305)||(12593-12859)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (19-308)||(27271-27559)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (60-303)||(294308-294553)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (19-290)||(111797-112070)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (19-208)||(1467-1655)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (19-277)||(97050-97305)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (25-291)||(13853-14123)
scaffold0048 (19-291)||(27109-27384)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (40-277)||(61123-61357)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (25-291)||(27337-27606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25978459 - 25978116
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25978459 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaactgaaaaataaaatttggttatgaacct 25978360  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25978359 tacagtgttagatatctgggagttgtgactacctatcacatatgtcgtacacttcgcctttgaatgtcaaatcactacctccttatgaacttttggaata 25978260  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgta 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||    
T  25978259 ccgcttgactacacaattgttactaaactggaaaaagtcaataaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcaaattcaattacgtaac-gggggta 25978161  T
Q  315 cactgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgaca 363  Q
    ||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25978160 cactgaattatt----aaaacaacaccacaattaaaaattcaactgaca 25978116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21632692 - 21632341
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21632692 agaccaatcaataataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacattctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacct 21632593  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  21632592 tacattgttagatttctgagagttgtgactacctatcacatatgtcgtacacttcgcctttgaatttcaagtcactgcctccttatgaacttctggaata 21632493  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgta 314  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||    
T  21632492 cctcttgactacacaattgttactaaactgtaaaaagtcaataaacaagcaaatccatcaataataaacaagtttagattcaattacctaacagggggta 21632393  T
Q  315 cactgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21632392 cactgagttatccaactaaataacacaacaattaaaagttcaactgacacaa 21632341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14967910 - 14967573
Alignment:
Q  29 taaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa-taaaatttggctatgaaccttacagtgttagat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14967910 taaagaaacaatgcaagttttagaaatgtaaatgcatggaacact--atataagtaaattgaaaaaataaaatttggccatgaaccttacagtgttagat 14967813  T
Q  128 ttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactaca 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |      
T  14967812 ttctgggagttgtgactacctatcacacatgtcgtacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaag 14967713  T
Q  228 caattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac-actgaattatt 326  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||     
T  14967712 caattgttactaaactggaaaaagtcaactaataaacaaattcgtcaataataaacaagttcatattcaattacataacatggggtacaactgagttatc 14967613  T
Q  327 caaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  14967612 caaataaacaacacaatgattaaaagttcaactgacacaa 14967573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 23841386 - 23841671
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23841386 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaacactctttataaataaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 23841485  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  23841486 ggtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgttgtacacttcgcctttgaaagacaagtcgct-cctccttttgaacttttggaatacc 23841584  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacat 303  Q
     ||| |  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23841585 acttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaacaatcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacat 23841671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 18139794 - 18140084
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18139794 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatgaaacactctttataaataaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 18139893  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  ||| ||||||||||||||   ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18139894 agtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgtagtatacttcgcctttgaaacacaagttact-cctccttttgaacttttggaatacc 18139992  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
     ||| |  | ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18139993 acttgaacaaacatttgttactaaattagaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 18140084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22959293 - 22959003
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  22959293 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaacactctttataaataaattggaaaaataaaatttggtcatgaaccttac 22959194  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatat-gccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||| |||||||||| ||||||   || |||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  22959193 aatgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgccatacacttcgcttttgaaacacaggtcact-cctccttttgaacctttggaatacc 22959095  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
     ||| |  | ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22959094 acttgaacaaacatttgttactaaactgaaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaaaaagttcagattcaatcacataacag 22959003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 23829099 - 23829389
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  23829099 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaacactctttataaataaattggaaaaataaaatttggtcatgaaccttac 23829198  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatat-gccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||| |||||||||| ||||||   || |||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  23829199 aatgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaattgccatacacttcgcttttgaaacacaggtcact-cctccttttgaacctttggaatacc 23829297  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
     ||| |  | ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23829298 acttgaacaaacatttgttactaaactgaaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaaaaagttcagattcaatcacataacag 23829389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 23380733 - 23381001
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaa-tttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23380733 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttaaaagtaaattggaaaataaaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagtt 23380831  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttac 237  Q
    | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| |||||||    
T  23380832 gagactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgttac 23380930  T
Q  238 taaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23380931 taaactggaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 23381001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32111393 - 32111124
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa----taaaatttggctatgaacct 114  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  32111393 caatcaacagtcaagaaataatgtaagttctagaaatttagttgcacggaacactctatataagtaa-ttgaaaaaaaaataaaatttggctatgaacct 32111295  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaactttt-ggaat 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  32111294 tacaatgttagatttctgggagttgtgattacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatacaagtcact-cctccttatgaactttttggaat 32111196  T
Q  214 accgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaag 286  Q
    | | ||| |  |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  32111195 atcacttgaacaagcaattgttactaaactggaaaaagtcaagaaacaagaaaattcattaat-ataaacaag 32111124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12745090 - 12744806
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12745090 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatatggccatgaaccttac 12744991  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaac-ttttggaata 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||  ||  || ||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  12744990 agtgttagatttctgggagttgtg---acctatctttaattgtcgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaactttttggaata 12744895  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacat 303  Q
    || ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  12744894 ccacttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaggtcaacaaagaagcaaattcattaataataaacaagtgcaagttcaattacat 12744806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7836333 - 7836174
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  7836333 caatcaacagtaaagaaacaatgaaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataacattcagccatgagccttaca 7836234  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaa 178  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7836233 gtgttagatttctggtatttgtggctacctatcacatatgcggtacacttcgcctttgaa 7836174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 330
Target Start/End: Original strand, 28109499 - 28109792
Alignment:
Q  38 aatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28109499 aatgcaagttctagaaatgtagattcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggcaatgaaccttacagtgttagatttctgggag 28109598  T
Q  137 ttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgctt-cactacacaattgt 234  Q
    |||||||||| ||||  ||  | |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||  || | | | ||||    
T  28109599 ttgtgactacatatctttaacttccgtacacttcgcctttgaatcacaagtca-cacctccttttgaactttaggtataccacttgaaccaga-atttgt 28109696  T
Q  235 tactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac-actgaattattcaaa 330  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  28109697 tactaaactgtaaaagatcaactaacaaaaaaattcatcaataataaacaagtggaaattcaa-tacataacagggggtacaaatgaattattcaaa 28109792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24408648 - 24408395
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||| ||||| ||||    
T  24408648 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacaatctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttatagt-tatgatatctgggagtt 24408550  T
Q  139 gtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
     ||||||||||||  ||  ||  |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||| |  | | | |||| |    
T  24408549 atgactacctatctttaactgtagtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaaaaccacttgaacaaatatttgtga 24408451  T
Q  237 ctaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24408450 ctaaactggaaaaagtcaagtaaacaagaaaattcattaataataaacaagttcag 24408395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 12982054 - 12982188
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12982054 caatcgacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtagatgcatagaacactctatataagtaaattgaaaaaataaaatttggccatgaaccttac 12982153  T
Q  118 agtg-ttagatttctggaagttgtgactacctatc 151  Q
    | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12982154 aatgtttagatttatgggagttgtgactatctatc 12982188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 11127461 - 11127576
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11127461 caatcgacagtaaagaaacaacgcaagttctagaaatataaaagcatggatcactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 11127560  T
Q  118 agtg-ttagatttctg 132  Q
    | || |||||||||||    
T  11127561 aatgtttagatttctg 11127576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25455743 - 25455672
Alignment:
Q  67 gaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25455743 gaacactctatataagtaaattgaaaaattaaatttggccatgaaccttgcagtgttacatttctgggagtt 25455672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 22224170 - 22224465
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22224170 agaccgatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttgactattaacct 22224269  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22224270 tacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgccgtaaacttcgccttgtaatttcaagtcactacctccttatgaacttttggaata 22224369  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagag 310  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22224370 ctacttgactacacaattgttactaaactggaaaaagtcaataaacaagaaaattcatcaataataaacaagttcagactcaattacataacagag 22224465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 22230512 - 22230807
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22230512 agaccgatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttgactattaacct 22230611  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22230612 tacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgccgtaaacttcgccttgtaatttcaagtcactacctccttatgaacttttggaata 22230711  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagag 310  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22230712 ctacttgactacacaattgttactaaactggaaaaagtcaataaacaagaaaattcatcaataataaacaagttcagactcaattacataacagag 22230807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31983254 - 31982906
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa---taaaatttggctatgaacctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  31983254 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaaactaaaatttggctatgaacctt 31983155  T
Q  116 acagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  31983154 acggtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatataagtcactacctccatatgaacttttggaatat 31983055  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac 315  Q
    | ||| |  |   | |||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31983054 cacttgaacaagtacttgttactaaactgaaaaaagtcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggtac 31982955  T
Q  316 -actgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgaca 363  Q
     | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  31982954 aaatgagttatccaaataaacaacacaacgattaaaagttcaactgaca 31982906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 33879132 - 33879420
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33879132 caatcaacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatgaaacactctttataagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttaca 33879231  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  33879232 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccatacacttcgccttagaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacca 33879329  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33879330 cttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 33879420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 298
Target Start/End: Original strand, 39658599 - 39658845
Alignment:
Q  50 agaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttgtgactaccta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||    
T  39658599 agaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-tatgattcctgggagttgtgactaccta 39658697  T
Q  150 tcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaa 249  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  || ||||||||||| || ||||    
T  39658698 tcacttatgccgaacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttatgaacttttggaataccacttgaataagcatttgttactaaattgtaaaa 39658796  T
Q  250 ggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaat 298  Q
    | ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39658797 gatcaactaacaaaaaaattcatcaataataaacaagtgcaaattcaat 39658845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 38250238 - 38250493
Alignment:
Q  32 agaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  38250238 agaaacaatgcaagttctagaaatgtaaaagcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttt 38250336  T
Q  131 tggaagttgtgactaccta-tcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacaca 229  Q
      | ||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||     
T  38250337 gtggagttgtgactacctatttttaactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cttccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacg 38250435  T
Q  230 attgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38250436 tttgttactaaactgaaaaaagtcaataaacaagcaaattcatcaaaaataaacaagt 38250493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12584571 - 12584306
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa-taaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||  | ||| | ||||||||    
T  12584571 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaatcgaaaaaataaaatttggccatgaacattacagttat-gatatttggaagtt 12584473  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttac 237  Q
    |||||| |||||| |  | |||||||||||||  |||| |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||    
T  12584472 gtgactgcctatctttaactgccgtacacttcatctttaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgttac 12584374  T
Q  238 taaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataac 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12584373 taaactggaaaag-tcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataac 12584306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23645392 - 23645123
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |  | ||| || || ||||    
T  23645392 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttataattat-gatatccgggagtt 23645294  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
    ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||    
T  23645293 gtgactacctatctttaactgccatacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttaaacttttggaataccacttgaacacatatttgtta 23645195  T
Q  237 ctaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23645194 ctaaactagaaaaagtcaacaaacaagaaaattcatcaataataaacaagttcatattcaatcacataacag 23645123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Original strand, 25593442 - 25593704
Alignment:
Q  25 acaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgtta 124  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |      
T  25593442 acaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggtcatgaaccttatagt-tat 25593540  T
Q  125 gatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgccttt-gaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttca 222  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||  |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  25593541 gatatctgggagttgtgactacctatctttaactgtcgtacacttcgcctttaaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttga 25593639  T
Q  223 ctacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25593640 aaacatatttgttactaaactagaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaatgataaacaagt 25593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17929404 - 17929130
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17929404 caatcgacagtagagaaacaatgcaacttctagaaatgtaaaaggatggaacactctttataagtaaattagaaaaataaaatttggccatgaaccttac 17929305  T
Q  118 agtg-ttagatttctggaagttgtgactacctat-catatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||   || |||| ||||||||||||||||||    |||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  17929304 agtgtttagatttctaggagttgtggctaactatatttaaatgcggtacacttcgcctttgaaacaaaagtcact-cctccttttgaacttttgaaatac 17929206  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttca 290  Q
    | ||| |  | | | || |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17929205 cacttgaacaaatattttttactaaaatggaaaaagtcaagtaaacaagcaaattcataaataataaacaagttca 17929130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 304
Target Start/End: Original strand, 23945856 - 23945968
Alignment:
Q  192 cctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23945856 cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcat 23945955  T
Q  292 attcaattacata 304  Q
    ||||||| |||||    
T  23945956 attcaatcacata 23945968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 151
Target Start/End: Original strand, 23945727 - 23945837
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23945727 tgcaagttctaaaaatgcaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttgaccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttg 23945825  T
Q  140 tgactacctatc 151  Q
    ||||||||||||    
T  23945826 tgactacctatc 23945837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Original strand, 39658541 - 39658593
Alignment:
Q  14 gagaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacg 66  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39658541 gagaccaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacg 39658593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 22226452 - 22226506
Alignment:
Q  312 gtacactgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22226452 gtacactaaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaactgacacaa 22226506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 22232794 - 22232848
Alignment:
Q  312 gtacactgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22232794 gtacactaaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaactgacacaa 22232848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 7946080 - 7946145
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatata 80  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  7946080 agaccaatcaataatagagaaacaacacaagttctagaaatgtagttgtatggaacaatctttata 7946145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26549947 - 26549600
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa--taaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26549947 caatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaaataaaatttggctatgaacctta 26549848  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26549847 cagtgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaatacc 26549748  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactg-gaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac 315  Q
     ||| |  | ||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26549747 acttgaacaaacaattgttactaaactgaaaaaaagtcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggagtac 26549648  T
Q  316 -actgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgaca 363  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26549647 aactgaattatccaaat-aacaacacaacaattaaaagttcaactgaca 26549600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 363
Target Start/End: Original strand, 28564185 - 28564532
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaa--ataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28564185 caatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaaataaaatttggctatgaacctta 28564284  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28564285 cagtgttagatttctgggagttgcgactacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaatacc 28564384  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactg-gaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac 315  Q
     ||| |  | ||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28564385 acttgaacaaacaattgttactaaactgaaaaaaaatcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggagtac 28564484  T
Q  316 -actgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgaca 363  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28564485 aactgaattatccaaat-aacaacacaacaattaaaatttcaactgaca 28564532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2455138 - 2454788
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaa---tttggctatgaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    
T  2455138 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaaacaaatatttggctatgaacctt 2455039  T
Q  116 acagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2455038 acgctgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaatac 2454939  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac 315  Q
    | ||| |  |  ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2454938 cacttgaacaagcaattgttactaaactgaaaaaagtcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggtac 2454839  T
Q  316 -actgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
     ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2454838 aactgagttatccaaat-aacaacacaacaattaaaagttcaactgacacaa 2454788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19687892 - 19687542
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattga--aaaataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  19687892 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatttagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaaataaaatttggctataaacctta 19687793  T
Q  117 cagtg-ttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    || || |||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19687792 caatgtttagatttctgggagttgagactacctataacacatgtcgtacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaatac 19687693  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac 315  Q
    | ||| |  |  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19687692 cacttgaacaagcaattgttactaaactggaaaaagtcaactaacaaacaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggtac 19687593  T
Q  316 -actgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19687592 aactgaattatccaaat-aacaacacaacaattaaaagttcaactgacacaa 19687542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30763123 - 30762785
Alignment:
Q  29 taaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa-taaaatttggctatgaaccttacagtgttagat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30763123 taaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattaaaaaaataaaatatggctatgaaccttacagtgttagat 30763024  T
Q  128 ttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactaca 227  Q
    ||| || | |||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |      
T  30763023 ttcagggaattgcaactacctatcacacatgccatacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaag 30762924  T
Q  228 caattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac-actgaattatt 326  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||     
T  30762923 caattgttactaaactggaaaaagtcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggtacaactgagttatc 30762824  T
Q  327 caaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30762823 caaat-aacaacacaacaattaaaagttcaactgacacaa 30762785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 366
Target Start/End: Original strand, 35382437 - 35382745
Alignment:
Q  60 ttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgc 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  35382437 ttgcacggaacactctatatatgtaaattgaaaaataaaatttgcctatgaaacttacagtgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgt 35382536  T
Q  160 cgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaa--ggtcaata 257  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    ||||||    
T  35382537 tgtacactttgcctttgaatttcaagttactccctccttatgaacttttggaataccacttgactacaaaattgttactaagctgaaaaaataatcaata 35382636  T
Q  258 aacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtacactgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaa 357  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35382637 aacaagcaaatccatcaataataaacaagtttagattcaattacctaacatggggtacactgagttatccaaataaataacacaacaattaaaagttcaa 35382736  T
Q  358 ccgacacaa 366  Q
    | |||||||    
T  35382737 ctgacacaa 35382745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 22938970 - 22939236
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||    
T  22938970 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggctatgaaccttacagttat-gatatctgggagtt 22939068  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||    
T  22939069 gtgactacctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgtta 22939167  T
Q  237 ctaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataa 305  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22939168 ataaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataa 22939236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 21334241 - 21334533
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21334241 caatcgacaatagagaaaaattgcaagttctaaaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttaca 21334340  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  21334341 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccatacacttcgcattagaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacct 21334438  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaa----caggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  | ||| |||||||||||||||||||  |||| |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21334439 cttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaaatcaacaaacaagcaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 21334533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 2838532 - 2838705
Alignment:
Q  20 aatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa----taaaatttggctatgaacctt 115  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  || | |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||    
T  2838532 aatcgacagtaaagaaacgatgcaagttctagaaatgcacatgaatggaacactctttataagtaaattgaaaaaaaaataaaaattggccatgaacctt 2838631  T
Q  116 acagtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtca 188  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||| |||  |||||||    
T  2838632 atagtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactgtcgtacacttcgcctttaaatcacaagtca 2838705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 34134762 - 34135037
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg---aaaaataaaatttggctatgaacctt 115  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| ||||| |||| ||||||||     
T  34134762 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatataaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaaaaaaaaaatatggccatgaacctg 34134861  T
Q  116 acagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||| |||||  |||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  34134862 acagttat-gatatctgggagttgtgactacctatctttcgctgccgtacactttgccttcaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaata 34134959  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    || ||| |  |   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34134960 ccacttgaacaactatttgttactaaactggaaaatgtcaagtaaacaagcaaattcattaataataaacaagttcag 34135037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 18767319 - 18767368
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgca 64  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  18767319 agaccaatcaacaataaagaaaaattgcaagttctacaaatatagttgca 18767368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8850 - 8526
Alignment:
Q  35 aacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa-taaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8850 aacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaataaaatttggctatgaaccttacggtgttagatttctgg 8751  T
Q  134 aagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattg 233  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |  ||||||    
T  8750 gagttgtgactacctatcacacatgccgtaaacttcgcctttcaaatacaagtcactacctccttatgaacttttggaataccacttgaacaagcaattg 8651  T
Q  234 ttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac-actgaattattcaaata 332  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||     
T  8650 ttactaaactggaaaaagtcaactaacaaacaaattcgttaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggtacaactgaattattcaaat- 8552  T
Q  333 aacaacacaacaattaaaaattcaac 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8551 aacaacacaacaattaaaatttcaac 8526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 225612 - 225264
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa---taaaatttggctatgaacctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  225612 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaaaactaatatttggctatgaacctt 225513  T
Q  116 acagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  225512 acgttgttagatttctgggagttgtgactacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatataagtcactacctccatatgaacttttggaatat 225413  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac 315  Q
    | ||| |  |   | |||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  225412 cacttgaacaagtacttgttactaaactgaaaaaagtcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggtac 225313  T
Q  316 -actgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgaca 363  Q
     | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  225312 aaatgagttatccaaataaacaacacaacgattaaaagttcaactgaca 225264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 22995433 - 22995672
Alignment:
Q  17 accaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22995433 accaatcaacattaaagaaacaatgcaagttcttgaaatgtagttgcacggaacacactatataagtaaattgaaaaataaaatctggctatgaacctta 22995532  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  22995533 caatgttagatttctgggagttgtgactacctatcacatatgccgtacactttgcctttgaatttcaagtcacttcctccttatgaacttttggaatatc 22995632  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat 256  Q
     ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22995633 acttaatcacacaattgttactaaactggaaaaagtcaat 22995672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9156649 - 9156303
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaa-taaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  9156649 caattaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatctagttgcagagaacactctatataagtattttgaaaaaataaaatttggctatgaaccttaa 9156550  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     
T  9156549 agtgttagatttatgggagttgcgactacctatcacacatgtcgtacgcttcgcctttgaaatacaagtcacgacctccttatgtacttttggaatacca 9156450  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac-a 316  Q
    ||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| |    
T  9156449 cttgaacaaacaattgttactaaactggaaaaagtcaactaacaaacaaattcgtcaataataaagaagttcagattcaattacataatatggggtacaa 9156350  T
Q  317 ctgaattattcaaataaacaacacaacaattaaaaattcaaccgaca 363  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9156349 ctgagttatccaaataaagaacacaacaattaaaagttcaactgaca 9156303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18540983 - 18540711
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18540983 agaccaatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaattaaaatttggctatgaacct 18540884  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    || |||  | ||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  18540883 tatagtcat-gatatctgggagttgtgactaccgatcacacatgccgtacacttcgcctttgagattcaagtcaatacttccatatgaacttttggaata 18540785  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
     |  || |   ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  18540784 tcaattaatcccacaattgttactaaactgaaaaaagtcaattaaacaaacaaattcttcaataataaacaagt 18540711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2777132 - 2776865
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2777132 tgcaagttctagaaatgtaagtgcatggaacactctttaaaagtaaatttgaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttg 2777034  T
Q  140 tgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttact 238  Q
     ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||    
T  2777033 agactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgttact 2776935  T
Q  239 aaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2776934 aaactggaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 2776865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 19303211 - 19303503
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagt-aaattg--aaaaataaaatttggctatgaa 111  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  19303211 agaccaatcaacagtagagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcatgaaacactttatataagtaaaattgaaaaaaataaaatttggccatgaa 19303310  T
Q  112 ccttacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttg 209  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    | | |||||||| || |||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  19303311 acttacagtgttagatttatgggagttgtgactacctatctcgcactaccgtacacctcacctttgaaatattaagtcact-cctccttatgaacttttg 19303409  T
Q  210 gaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacat 303  Q
    |||||||  || |  | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19303410 gaataccatttgaacaaatatttgttactagactggaaaaggtcaataaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcaagttcaattacat 19303503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24127137 - 24126870
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24127137 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactcttaagaagtaaatttgaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttg 24127039  T
Q  140 tgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttact 238  Q
    | |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||||    
T  24127038 ttactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgttact 24126940  T
Q  239 aaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  24126939 aaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagtgcaaattcaatcacataacag 24126870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10883148 - 10882859
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10883148 caatcgacaatagagaaaaattgcaagttccagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattgaaaaataaaatttggccatgaaccttaca 10883049  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | || |||||| ||||||||| |||  ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||     
T  10883048 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgtcgtacagttcgcctttcaatcacaagtcact-cctcattttgaaattttggaatacca 10882951  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat-aaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  10882950 cttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaagtcaataaaacaagaaaattcatcaataataaacaagtgcaagttcaattacatcacag 10882859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10961583 - 10961423
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10961583 caatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggtcatgaaccttaca 10961484  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaa 178  Q
    || |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10961483 gtattagatttttgtgagttgtgactacctatctttaattgccgtacatttcgcctttgaa 10961423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10965092 - 10964932
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10965092 caatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggtcatgaaccttaca 10964993  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaa 178  Q
    || |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10964992 gtattagatttttgtgagttgtgactacctatctttaattgccgtacatttcgcctttgaa 10964932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13556752 - 13556506
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13556752 tgcaagttatagaaatgtaaatgcatggaacactcttaagaagtaaatttgaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttg 13556654  T
Q  140 tgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttact 238  Q
    | |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||||    
T  13556653 ttactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgttact 13556555  T
Q  239 aaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13556554 aaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagt 13556506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47053077 - 47052809
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |  | ||| ||||| ||||    
T  47053077 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccataaaccttacaattat-gatatctgggagtt 47052979  T
Q  139 gtgactacctatcatata--tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtt 235  Q
    |||||||||||| || ||  ||  |||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||    
T  47052978 gtgactacctat-atttaactgttgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgagcacatatttgtt 47052881  T
Q  236 actaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataaca 307  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47052880 actaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataaca 47052809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 55033515 - 55033805
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  55033515 caatcgacattagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatacatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggtcatgaaccttac 55033614  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |  | || |||||||||| |||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  55033615 agttat-gatatctgggagttgtgactacctatctttaactgtcgtacacttcacctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatac 55033712  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    | ||| |  ||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55033713 cacttgaacacgtatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 55033805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 288
Target Start/End: Original strand, 15196985 - 15197255
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15196985 caatcaacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 15197084  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    ||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  15197085 agt-tatgatatctgg-agttgtgactacctatctttaaatgtcgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccgtttgaacttttggaatac 15197181  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagtt 288  Q
    | ||| |  | | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15197182 cacttgaacaaatatttgttactaaactggaaaaagtcaagtaaacaagcaaattcatcaataataaacaagtt 15197255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7831914 - 7831660
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7831914 tgcaagttctagaaatgtaaaaacatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccataaaccttacagttttagatttctgggagtt 7831815  T
Q  139 gtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttgga--ataccgcttcactacacaattgtt 235  Q
    |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |  | | | |||||    
T  7831814 gtgactacctatctttaactgtcgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatataccacttgaacaaatatttgtt 7831716  T
Q  236 actaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttca 290  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7831715 actaaactggaaaaagtcaagtaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttca 7831660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28328999 - 28328751
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt--gaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagt 137  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||| ||||| |||    
T  28328999 tgcaagttctagaattgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgacagttat-gatatctgggagt 28328901  T
Q  138 tgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
    |||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||   ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||    
T  28328900 tgtgactacctatctttcactgtcgtacacttcgcctttgaaacacaagtcgct-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgtta 28328802  T
Q  237 ctaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28328801 ctaaactggaaaaagtcaacaaacaagaaaattcatcaataataaacaagt 28328751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Original strand, 36534568 - 36534825
Alignment:
Q  20 aatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaa-tttggctatgaaccttaca 118  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||    
T  36534568 aatcgacaatagagaaacaatgcaagttatataaatgtaaacgcatggaacactctttataagtaaattgaaaaataaaattttggccatgaatcataca 36534667  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||     
T  36534668 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctcctttagaacttttggaatacca 36534765  T
Q  218 ctt-cactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaa 275  Q
    |||  |  | | | |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||    
T  36534766 cttgaaaaaaatatttgttactaaactggaaaaaatcaagtaaacaagcaaattcatcaa 36534825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22025931 - 22025657
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg--aaaaataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    |||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22025931 caatcaacagcagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaaattaaaatttggctatgaacctga 22025832  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||  |   ||| ||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22025831 cagt-tatgatatctgggagttgtgactacctatctttcgctgcagtatacttcgcccttgaatcacaagtcact-cctcctttagaacttttggaatac 22025734  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtc-aataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    | ||| |  |   | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22025733 cacttgaacaactatttgttactaaactggaaaatgtcaaataaacaagcaaattcattaataataaacaagttcag 22025657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 150
Target Start/End: Original strand, 12541941 - 12542050
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12541941 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggctatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttg 12542039  T
Q  140 tgactacctat 150  Q
     ||||||||||    
T  12542040 agactacctat 12542050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4275 - 3922
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattga----aaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  4275 caatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctataaatgtagttgcacggaacactctatataattaaattgaaaaaaaaataaaatttggctatgaacct 4176  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  4175 tacggtgtt-gatttctgagagttgagactacctatcacacatgccgtacacttcgcctttgaaatacaagtcactacctccttatgattttttggaata 4077  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgta 314  Q
    || ||| |  |  ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4076 ccacttgaacaagcaattgttactaaactgaaaaaaatcaactaacaaacaaattcgtcaataataaacaagttcagattcaattacataacagggggta 3977  T
Q  315 c-actgaattattcaaat--aaacaacacaacaattaaaaattcaaccgacacaa 366  Q
    | ||||| |||| |||||  ||| |||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  3976 caactgagttatccaaataaaaaaaacacagcaattaaaagtttaactgacacaa 3922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 49717961 - 49717649
Alignment:
Q  20 aatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctata--taagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  49717961 aatcaacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagatgcatggaacactctatacataagtaaattgaaaaagaaaatttggccatgaaccttac 49717862  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  49717861 agtgttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttatgaactcttggaatacc 49717763  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagagtgtac- 315  Q
     ||| |  |  || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||||     
T  49717762 acttgaagaagcatttgttactaaactgtaaaagatcaactaacaaacaaattcatcaataataaacaagtgcaaattcaa-tacataacagggggtaca 49717664  T
Q  316 actgaattattcaaa 330  Q
    ||||| |||||||||    
T  49717663 actgagttattcaaa 49717649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 21020236 - 21020526
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21020236 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatataaatgcatagaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttgc 21020335  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||    
T  21020336 agt-ttagatttatgggagttgtgactacctatctttcactgtcgtacacttcgcctttgaatcacaagtcagt-cttccttttgaacttttgaaatacc 21020433  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat-aaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
     ||| |  | ||| ||||||| |||||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  21020434 acttgaacaaacatttgttaccaaactgaaaaaaatcaataaaacaagaaaattcatcaataataaacaagtgtagaatcaatcacataacag 21020526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 22455125 - 22455314
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22455125 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgta-tcgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 22455223  T
Q  118 agtg-ttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttt 207  Q
    | || |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22455224 aatgtttagatttatgggagttgtgactacctatctttaattgtcgtacacttcgcctttgaagcacaagtcact-cctccttttgaacttt 22455314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 28140857 - 28140901
Alignment:
Q  263 gcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataaca 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28140857 gcaaattcattaataataaacaagtgcagatgcaattacaaaaca 28140901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 27678846 - 27679134
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27678846 caatcgacaatagagaaagattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttaca 27678945  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  27678946 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccatacacttcgccttcgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacca 27679043  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27679044 cttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaactaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 27679134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Original strand, 19862049 - 19862339
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19862049 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 19862148  T
Q  118 agtgtt-agatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | || |||| ||||||||||||||||    
T  19862149 aatgtttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcactccc-ccttttgaacttttggaatac 19862247  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataaca 307  Q
    | ||| |  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19862248 cactttaacaaacatttgttactaaattggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataaca 19862339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5672146 - 5671858
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5672146 caatcaacaaaagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattagaaaataaaatttggccatgaaccttaca 5672047  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||     
T  5672046 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-catccttttgaacttttggaatacca 5671949  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  | ||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5671948 cttgaacaaacatttgttattaaactggaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 5671858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19825885 - 19825616
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||| ||||| ||||    
T  19825885 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttgcagttat-gatatctgggagtt 19825787  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||    
T  19825786 gtgactacctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgtta 19825688  T
Q  237 ctaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19825687 ctaaactggaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 19825616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 49638354 - 49638647
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaa--ttgaaaaataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  49638354 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttttagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctga 49638453  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  49638454 cagt-tatgatatctgggagttgtgactacctatctttcattgccgtgcacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatac 49638551  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataa-acaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacagag 310  Q
    | ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  49638552 cacttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaataacacaagaaaattcatcgataataaacaagtgcaagttcaattacatcacagag 49638647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 56197116 - 56196825
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  56197116 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaatttggaaaataaaatttggccatgaaccttac 56197017  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  56197016 agt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatac 56196919  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat-aaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    | ||| |  | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||    
T  56196918 cacttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaagtcaataaaacaagaaagttcatcaataataaacaagtgcaagtacaattacatcacag 56196825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39500016 - 39499775
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39500016 caatcgacaacagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttaaaagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttaca 39499917  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  39499916 gt-ttagatttctgggagttgagactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacca 39499819  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaaca 261  Q
    ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39499818 cttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaaca 39499775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15161484 - 15161297
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagtt-gcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaac 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||    
T  15161484 agaccattcaacagtaaagaaacaatgcaagttgtagaaatgtaatttgcacgga-cactctatataagtaaattggaaaaataaaatttgaccataaac 15161386  T
Q  113 cttacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaa 203  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15161385 cttatagtgttaaatttctgagagttgtgactacctacctcacatgccgaacacttcgcctttgaat-ttaagtcatt-cctccttatgaa 15161297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 3799681 - 3799878
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  3799681 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcataaaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttagcaatgaactttac 3799780  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    ||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  3799781 agt-tatgatatctgggagttgtgactacctatctttaattgccgtacacttcgtctttgaatcataagtcact-cctccttttgaacttttggaatacc 3799878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 15432885 - 15432986
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15432885 caatcgacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaaaactctttagaagtaaattgaaaaataaaatttggccatgaaccttaca 15432984  T
Q  119 gt 120  Q
    ||    
T  15432985 gt 15432986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 22091645 - 22091780
Alignment:
Q  15 agaccaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaat-aaaatttggctatgaacc 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||    
T  22091645 agactaatcaacaatagagaaaaatcgcaagttctagaaatgtagttgcatggaacactctatataagtaaatcgaaagataaaaatttggcaatg-acc 22091743  T
Q  114 ttacagtgtta-gatttctggaagttgtgactacctat 150  Q
    |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  22091744 ttaca-agttatgacttctgggagttgtgactacctat 22091780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 303
Target Start/End: Original strand, 15403781 - 15403914
Alignment:
Q  170 gcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaa-caggcaaat 268  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | | | ||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||    
T  15403781 gcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaatatttggtactaaactggaaaaagtcaataaaacaagaaaat 15403879  T
Q  269 tcatcaataataaacaagttcagattcaattacat 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15403880 tcatcaataataaacaagtgcaagttcaattacat 15403914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Original strand, 22091818 - 22091913
Alignment:
Q  192 cctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaag 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||||||||||||||  || | ||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  22091818 cctccttatgaacttttgggataccacttgatcaaacaattgttactaaactataataagtcaattaaacaaacaaattcgttaataataaacaag 22091913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 31429307 - 31429595
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  31429307 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggacatgaacattaca 31429406  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  31429407 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacca 31429504  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31429505 cttgagcaaacatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 31429595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 16789296 - 16789584
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16789296 caatcgacagtagagaaaaaatgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggagaataaaatttggccatgaaccttaca 16789395  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  16789396 gt-ttagatttctaggagttgtgactacctatctttcactgccgtacactgcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacca 16789493  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||| |  | ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16789494 cttgagcaaacatttgttactaaactgaaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 16789584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25872326 - 25872044
Alignment:
Q  25 acaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgtta 124  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25872326 acaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaattgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-tta 25872228  T
Q  125 gatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||| |     
T  25872227 gatttctgggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggactaccacttgaa 25872129  T
Q  224 tacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
     | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  25872128 caaacatttgttactaaactagaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagtgcaagaacaattacataacag 25872044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24236661 - 24236394
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||   |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24236661 caatcgacaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtgaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttaca 24236562  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||| || |     
T  24236561 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatctttcactgtcgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggactagca 24236464  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
    ||| |  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24236463 cttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagt 24236394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 25958276 - 25958543
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25958276 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggctatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttg 25958374  T
Q  140 tgactaccta-tcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttact 238  Q
     |||| |||| || |   ||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | | |  | ||| | ||||||    
T  25958375 agacttcctattcttcactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacctgaacaaacattcgttact 25958473  T
Q  239 aaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  25958474 aaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagtgcaagaacaattacataacag 25958543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 1505191 - 1505481
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1505191 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattagaaaataaaatttggccatgaaccttaca 1505290  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctat-catatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  1505291 gt-ttagatttctgggagttgtgactacctatccttaactgcagtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacc 1505388  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat-aaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
     ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  1505389 acttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaataaaacaagaaaattcatcaataataaacaagtgcaagaacaattacataacag 1505481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 13973691 - 13973977
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||  || | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13973691 caatcgacaacagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgtatggaacactctttagaagtaaattggaaaataaaatttggccaagaaccttaca 13973790  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccg 217  Q
    || |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||     
T  13973791 gt-ttagttttcttggagttgtgactacctatctttcactgccgtacacttcacctttgaatcacaagtcact-ccttcttttgaacttttggaattcca 13973888  T
Q  218 cttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataac 306  Q
    ||| |  ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13973889 cttgaacacatatttgttactaaacaggaaaaagtcaacaaataagcaaattcatcaataatgaacaagttcagattcaatcacataac 13973977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45455409 - 45455140
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaag-tt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  45455409 tgcaagttctagaaatgtatatgcatggaacactctttggaagtaaattggaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagttt 45455311  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttac 237  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||| || |||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||| |  | | | |||||||    
T  45455310 gtgactacctatctttcactgccgtacactttgcatttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttgaaataccacttgaacaaatatttgttac 45455212  T
Q  238 taaactggaaaaggtcaat-aaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  45455211 taaactggaaaaagtcaataaaacaagaaaattcatcaataataagcaagtgcaagttcaattacatcacag 45455140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Original strand, 9187345 - 9187492
Alignment:
Q  160 cgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaa 259  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  9187345 cgtacatttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgttactaaattggaaaaagtcaacaaa 9187443  T
Q  260 caggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9187444 caagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 9187492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 9187245 - 9187323
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9187245 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggtcatgaaccttac 9187323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35078266 - 35078222
Alignment:
Q  263 gcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataaca 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35078266 gcaaattcattaataataaacaagtgcagatgcaattacaaaaca 35078222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20594991 - 20594726
Alignment:
Q  42 caagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttgt 140  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||    
T  20594991 caagttctagaaaagtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgtgagctgt 20594893  T
Q  141 gactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttacta 239  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||    
T  20594892 gactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaattacaattcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacaattgttacta 20594794  T
Q  240 aactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataaca 307  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20594793 aactggaaaaagtcaacaaacaagtaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataaca 20594726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 45289041 - 45289309
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  45289041 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttacatt-ttagatttctgggagtt 45289139  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttac 237  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||||||    
T  45289140 gtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacgtatttgttac 45289238  T
Q  238 taaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45289239 taaattggaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 45289309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 9274882 - 9275155
Alignment:
Q  17 accaatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagt-aaattg-aaaaataaaatttggctatgaacct 114  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  9274882 accactcaacagtagagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcatggaacactctatataagtaaaattgaaaaaataaaatttggtcatgaacct 9274981  T
Q  115 tacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgc-ctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    | || |||||||||| |  ||| ||  |||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  9274982 tacagtgttagatttctgggagttgtgacttcctatccggcactgtcgtacacttcactttttaaacatcaagtcact-cctccttgtgaactttcggaa 9275080  T
Q  213 taccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
    |||| ||| |  | | | ||||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9275081 taccacttgaacaaatatttgtttctagactgaaaaaggtcaataaacaagaaaattcatcaataataaacaagt 9275155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 26137631 - 26137904
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26137631 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaggaaaatttggccatgaaccttac 26137730  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatacc 216  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  26137731 agt-tatgatttctgggagttgtgactacctatctttcgctgccgtacacttcgcccttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatacc 26137828  T
Q  217 gcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
     ||| |  |   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26137829 acttgaacaactatttgttactaaactggaaaatgtcaagtaaacaagcaaattcattaataataaacaagttcag 26137904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22255573 - 22255280
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaa--ttgaaaaataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22255573 caatcgacaacaaagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctga 22255474  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||| ||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22255473 cagt-tatgatttctggaagttgtgactacctatctttcactgccatacacttcgcctttaaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatac 22255376  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactg---gaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    | ||| |  | ||| ||||||||||||||    ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  22255375 cacttgaacaaacatttgttactaaactgaaaaaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagtgcaagaacaattacataacag 22255280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Original strand, 22231187 - 22231438
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaa--ttgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagt 137  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  22231187 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgacagt-tatgatttctggaagt 22231285  T
Q  138 tgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
    |||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||| ||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||    
T  22231286 tgtgactacctatctttcactgccatacacttcgcctttaaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgtta 22231384  T
Q  237 ctaaactg---gaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
    ||||||||    ||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22231385 ctaaactgaaaaaaaaaatcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagt 22231438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4544059 - 4543836
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaa--ttgaaaaataaaatttggctatgaacctta 116  Q
    ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4544059 caatcgacaacaaagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctga 4543960  T
Q  117 cagtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  4543959 cagt-tatgatatctgggagttgtgactacctatctttctctgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-tctccttttgaacttttggaatac 4543862  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaa 241  Q
    | ||| |  | ||| |||||||||||    
T  4543861 cacttgaacaaacatttgttactaaa 4543836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16222404 - 16222354
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaa 69  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16222404 caatcaacagtaaagaaacaacgcaagttctagaaatgtagttgcacggaa 16222354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 13811197 - 13811249
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaaca 71  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13811197 caatcaacagtaaagaaacaatgtaagttctaaaaatgtagttgcatggaaca 13811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 1635696 - 1635740
Alignment:
Q  263 gcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataaca 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1635696 gcaaattcattaataataaacaagtgcagatgcaattacaaaaca 1635740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Original strand, 1960 - 2207
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1960 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttacagt-ttagatttctgggagtt 2058  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttac 237  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||    
T  2059 gtgactacctatctttcactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgttac 2157  T
Q  238 taaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagt 287  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2158 taaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagt 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21628 - 21340
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |   ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21628 caatcgacaatagagaaacaatgcaagttctagaactgaaaaagcatggaatactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 21529  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgt-caagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    ||||| |  | ||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  21528 tgtgttagatttctgggagttgtgat---ctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaaattacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatac 21433  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    | ||| |  | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  21432 cacttgaacaaacatttgttactaaactgtaaaaggtcaacaaacaagcaaattcatcaataataaacaagttcaagttcaattacatcacag 21340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 4722 - 5014
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4722 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 4821  T
Q  118 agtg-ttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  4822 agtgtttagatttctgggagttgtgactacctatctttaactaccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcact-cctccttttgaacttttgaaatac 4920  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    | ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  4921 cacttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaagtaaacaagcaaattcattaataataaacaagttcaagaacaattacataacag 5014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 10940 - 11209
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgtt-agatttctggaagtt 138  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||    
T  10940 tgcaagttctagaaatgaaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaatataaaatttggccatgaaccgtacagtgtttagatttatgagagtt 11039  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttac 237  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| |||||||    
T  11040 gtgactacctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaaacacaagtcgct-cctccttttgaacttttggaataccacttaaacaaacatttgttac 11138  T
Q  238 taaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11139 taaactggaaaaagtcaacaaacaagtagattcatcaataataaacaagttcagattcaatcacataacag 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12859 - 12593
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||||| ||||    
T  12859 tgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttacagctat-gatatctgggagtt 12761  T
Q  139 gtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaa-tgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgtta 236  Q
    ||||||||||||  |  | || ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||    
T  12760 gtgactacctatttttaactgtcgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgtta 12662  T
Q  237 ctaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataa 305  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12661 ctaaactggaaaaagtcaacaaacaagcaaattcatcaataatagacaagttcagattcaatcacataa 12593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27559 - 27271
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  27559 caatcgacagtaaagaaacaatgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgtcccttac 27460  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcg-cctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||   |||| ||  ||  | | |||||||||| ||||  |||  ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  27459 agtgttagatttcttggagttgtg---acctgtctttaacttctgtacacttcgtccttgaaatcacaagtcact-tctccttttgaacttttggaatac 27364  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaataaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacataacag 308  Q
    | ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||    
T  27363 cacttgaacaaacatttgttactaaactggaaaaggtcaacaaacaagtaaattcatcaataataaacaactacaagttcaattacatcacag 27271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 294553 - 294308
Alignment:
Q  60 ttgcacggaacactctatataagtaaatt--gaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata- 156  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||     
T  294553 ttgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaagtttggctatgaacctgacagttat-gatatctgggagttgtgactacctatcttttac 294455  T
Q  157 tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  294454 tgctgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccacttgaacacatatttgttactaaactggaaaaagtcaat 294356  T
Q  257 aa-acaggcaaattcatcaataataaacaagttcagattcaattacat 303  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  294355 aatacaagaaaattcatcaataataaacaagtgcaagttcaattacat 294308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 111797 - 112070
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaatt-gaaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  111797 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttatagaaatgtaaatgcatggaacactctatataagtaaattggaaaaataaaatttggccatgaaccttac 111896  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaatac 215  Q
    ||| |   || ||||| |||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  111897 agt-tatcatatctgggagttatgactacctatctttaactgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaatac 111994  T
Q  216 cgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaat-aaacaggcaaattcatcaataataaacaagttca 290  Q
    | ||| |  | ||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  111995 cacttgaacaaacatttgttactaaactgaaaagagtcaataaaacaagataattcatcagtaataaacaagttca 112070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 1467 - 1655
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg-aaaaataaaatttggctatgaaccttac 117  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  1467 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaattggaaaaataaaatttggtcatgaaccttac 1566  T
Q  118 agtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaactttt 208  Q
    | | |||||||||||| ||| ||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  1567 aatattagatttctgggagtcgtgtctacctatgaatcatgccgtacacttcgcctttgaat-tcaagtcact-cctccttatgaactttt 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 97050 - 97305
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttaca 118  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  97050 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactct-tagaagtaaattgaaaaa-aaaatatggccatgaaccttaca 97147  T
Q  119 gtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgc 218  Q
    ||  | ||| ||| | | |||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  97148 gttat-gatatcttggatttgtgattacctatcttgactgccgtacacttcgcctttgaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccac 97245  T
Q  219 ttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaata 277  Q
    || |  | ||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  97246 ttgaacaaacatttgttactaaactgataaaagtcaattaaacaggcaaattcatcaata 97305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14123 - 13853
Alignment:
Q  25 acaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaa--ttgaaaaataaa-atttggctatgaaccttacagtg 121  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||||| |||||||     
T  14123 acaatagagaaaaattgcaagttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaatttttggccatgaacgttacagt- 14025  T
Q  122 ttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgct 219  Q
    |  ||| ||||| |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14024 tatgatatctgggagttgtgacttcctatctttaattgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaataccact 13926  T
Q  220 tcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    | |  |   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13925 tgaacaactatttgttactaaactggaaaaagtcaagtaaacaagcaaattcattaataataaacaagttcag 13853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27384 - 27109
Alignment:
Q  19 caatcaacaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattg---aaaaataaaatttggctatgaacctt 115  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| || ||||||||||   ||||| ||||| |||| ||||||||     
T  27384 caatcgacagtagagaaaaattgcaagttctagaaatataaatgcatggaacactctttagaagtaaattggaaaaaaaaaaaatatggccatgaacctg 27285  T
Q  116 acagtgttagatttctggaagttgtgactacctatcatata-tgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaata 214  Q
    |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||| |||||  |||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  27284 acagttat-gatatctgggagttgtgactacctatctttcgctgccgtacactttgccttcaaatcacaagtcact-cctccttttgaacttttggaata 27187  T
Q  215 ccgcttcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    || ||| |  |   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27186 ccacttgaacaactatttgttactaaactggaaaatgtcaagtaaacaagcaaattcattaataataaacaagttcag 27109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 61357 - 61123
Alignment:
Q  40 tgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaattgaaaaataaaatttggctatgaaccttacagtgttagatttctggaagttg 139  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |  | ||| ||||| |||||    
T  61357 tgcaagttctataaatgtaaatgcatggaacactct-tagaagtaaattgaaaaataaa-tttcgccatgaaacttacaattat-gatatctgggagttg 61261  T
Q  140 tgactacctatcatatatgccgtacacttcgcctttgaatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgcttcactacacaattgttacta 239  Q
    |||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||| |||||||||    
T  61260 tgactacctatctttactaccgtacacttcgcctttgaataacaattca-cccctccttttgaacttttggaataccacttgaacaaacatttgttacta 61162  T
Q  240 aactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaata 277  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  61161 aactggaaaaagtcaattaaacaggaaaattcatcaata 61123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27606 - 27337
Alignment:
Q  25 acaataaagaaacaatgcaagttctagaaatgtagttgcacggaacactctatataagtaaa--ttgaaaaataaa-atttggctatgaaccttacagtg 121  Q
    |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||||||||||| |     
T  27606 acaatagagaaaaattgcatgttctagaaatgtaaatgcatggaacactctttataagtaaaattggaaaaataaatttttggccatgaaccttacaat- 27508  T
Q  122 ttagatttctggaagttgtgactacctatc-atatatgccgtacacttcgcctttg-aatgtcaagtcattacctccttatgaacttttggaataccgct 219  Q
    |  ||| ||||| |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27507 tatgatatctgggagttgtgacttcctatctttaattgccgtacacttcgcctttgaaatcacaagtcact-cctccttttgaac-tttggaataccact 27410  T
Q  220 tcactacacaattgttactaaactggaaaaggtcaa-taaacaggcaaattcatcaataataaacaagttcag 291  Q
    | |  |   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27409 tgaacaactatttgttactaaactggaaaaagtcaagtaaacaagcaaattcattaataataaacaagttcag 27337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University