View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7773_low_1 (Length: 560)

Name: NF7773_low_1
Description: NF7773
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7773_low_1
NF7773_low_1
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-544)||(50152-50695)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (1-544)||(16825218-16825763)
chr3 (5-543)||(12180992-12181530)
chr3 (1-533)||(35982839-35983371)
chr3 (1-544)||(14290471-14291014)
chr3 (5-543)||(17494295-17494836)
chr3 (11-543)||(12357476-12358008)
chr3 (5-543)||(31941551-31942089)
chr3 (5-543)||(31692128-31692666)
chr3 (17-540)||(12857451-12857973)
chr3 (2-538)||(16326647-16327185)
chr3 (2-538)||(11958121-11958657)
chr3 (1-538)||(17189027-17189564)
chr3 (5-543)||(18131290-18131827)
chr3 (18-538)||(16831484-16832004)
chr3 (1-538)||(24189957-24190493)
chr3 (2-543)||(10408616-10409157)
chr3 (2-543)||(47126592-47127133)
chr3 (2-543)||(28756967-28757508)
chr3 (5-544)||(15230250-15230789)
chr3 (5-544)||(15236118-15236657)
chr3 (244-543)||(11949107-11949406)
chr3 (32-330)||(16384342-16384640)
chr3 (50-538)||(13944677-13945165)
chr3 (50-538)||(8744378-8744866)
chr3 (392-538)||(13317864-13318010)
chr3 (446-543)||(12509867-12509964)
chr3 (384-538)||(10417367-10417521)
chr3 (446-538)||(16378318-16378410)
chr3 (5-333)||(13317512-13317840)
chr3 (5-102)||(2245615-2245712)
chr3 (162-261)||(15008684-15008783)
chr3 (5-255)||(12508508-12508758)
chr3 (482-543)||(12272986-12273047)
chr3 (167-286)||(2037017-2037136)
chr3 (167-286)||(2040758-2040877)
chr3 (167-286)||(14039651-14039770)
chr3 (5-262)||(12843057-12843314)
chr3 (461-538)||(3688586-3688663)
chr3 (461-538)||(10008243-10008320)
chr3 (461-538)||(10908853-10908930)
chr3 (461-538)||(12889352-12889429)
chr3 (461-538)||(13255333-13255410)
chr3 (461-538)||(15345655-15345732)
chr3 (461-538)||(15358726-15358803)
chr3 (461-538)||(15586802-15586879)
chr3 (461-538)||(15713466-15713543)
chr3 (461-538)||(24185833-24185910)
chr3 (461-538)||(43165318-43165395)
chr3 (461-538)||(48428090-48428167)
chr3 (461-544)||(16638410-16638493)
chr3 (461-536)||(26790823-26790898)
chr3 (480-538)||(5422359-5422417)
chr3 (461-538)||(6603378-6603455)
chr3 (461-522)||(11861033-11861094)
chr3 (461-538)||(15399927-15400004)
chr3 (461-538)||(16754111-16754188)
chr3 (461-538)||(16804357-16804434)
chr3 (461-538)||(20059464-20059541)
chr3 (461-538)||(53382428-53382505)
chr3 (408-536)||(15013115-15013243)
chr3 (461-544)||(12843513-12843596)
chr3 (461-544)||(15262267-15262350)
chr3 (480-538)||(15065714-15065772)
chr3 (56-262)||(16803952-16804158)
chr3 (53-162)||(3688959-3689068)
chr3 (5-262)||(15262549-15262806)
chr3 (461-538)||(23079427-23079504)
chr3 (53-153)||(10008625-10008725)
chr3 (53-153)||(10909235-10909335)
chr3 (53-153)||(15713061-15713161)
chr3 (50-156)||(6603757-6603863)
chr3 (480-538)||(14873997-14874055)
chr3 (200-262)||(23079166-23079228)
chr3 (11-96)||(10416994-10417079)
chr3 (461-538)||(16694807-16694884)
chr3 (53-156)||(6597077-6597180)
chr3 (131-262)||(11861272-11861403)
chr3 (53-156)||(13255712-13255815)
chr3 (53-156)||(16638795-16638898)
chr3 (131-262)||(23414870-23415001)
chr3 (53-156)||(43165697-43165800)
chr3 (200-262)||(15065990-15066052)
chr3 (46-88)||(23079012-23079054)
chr3 (482-527)||(8271830-8271875)
chr3 (482-527)||(13964786-13964831)
chr3 (482-527)||(30150021-30150066)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (11-544)||(14993088-14993621)
chr4 (5-544)||(15266794-15267333)
chr4 (17-544)||(15073377-15073904)
chr4 (2-538)||(20893055-20893591)
chr4 (1-371)||(18259632-18260002)
chr4 (5-543)||(16150655-16151193)
chr4 (5-543)||(16154801-16155339)
chr4 (2-543)||(3261506-3262047)
chr4 (2-543)||(11203944-11204485)
chr4 (2-543)||(7357286-7357827)
chr4 (1-543)||(29450248-29450790)
chr4 (5-543)||(44658581-44659119)
chr4 (11-538)||(27903409-27903936)
chr4 (50-538)||(51603552-51604040)
chr4 (50-538)||(53750230-53750718)
chr4 (5-286)||(8708953-8709234)
chr4 (29-258)||(13879413-13879642)
chr4 (416-544)||(14697119-14697247)
chr4 (64-262)||(14697401-14697599)
chr4 (461-538)||(8050534-8050611)
chr4 (461-538)||(8389436-8389513)
chr4 (461-538)||(12479624-12479701)
chr4 (461-538)||(14300890-14300967)
chr4 (461-538)||(14683591-14683668)
chr4 (448-505)||(15354234-15354291)
chr4 (461-538)||(16233903-16233980)
chr4 (461-538)||(17092060-17092137)
chr4 (461-538)||(19635160-19635237)
chr4 (461-538)||(19775704-19775781)
chr4 (461-538)||(23958771-23958848)
chr4 (461-538)||(27714360-27714437)
chr4 (461-538)||(13513374-13513451)
chr4 (461-538)||(16350465-16350542)
chr4 (461-538)||(40476064-40476141)
chr4 (53-153)||(14300485-14300585)
chr4 (461-544)||(15946-16029)
chr4 (461-544)||(14162488-14162571)
chr4 (480-538)||(18224376-18224434)
chr4 (464-528)||(18604733-18604797)
chr4 (131-262)||(13513650-13513781)
chr4 (28-262)||(8336-8570)
chr4 (200-262)||(18224123-18224185)
chr4 (33-262)||(18604302-18604531)
chr4 (47-153)||(19635542-19635648)
chr4 (5-90)||(14162942-14163027)
chr4 (483-536)||(15144825-15144878)
chr4 (461-544)||(16219206-16219289)
chr4 (461-544)||(16222526-16222609)
chr4 (465-544)||(18546794-18546873)
chr4 (200-262)||(16248326-16248388)
chr4 (28-257)||(15514-15743)
chr4 (482-527)||(14999681-14999726)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (1-544)||(12798202-12798742)
chr7 (1-544)||(19150019-19150562)
chr7 (1-544)||(20749418-20749961)
chr7 (65-544)||(15099365-15099844)
chr7 (1-544)||(14260944-14261487)
chr7 (5-543)||(16947174-16947712)
chr7 (2-538)||(13024359-13024894)
chr7 (5-543)||(13676460-13676992)
chr7 (32-543)||(14283103-14283614)
chr7 (5-538)||(11385131-11385664)
chr7 (2-543)||(21755421-21755962)
chr7 (1-543)||(12459637-12460179)
chr7 (2-543)||(26091497-26092038)
chr7 (59-543)||(40924573-40925057)
chr7 (59-543)||(49155310-49155794)
chr7 (5-543)||(26115292-26115830)
chr7 (2-543)||(13965367-13965908)
chr7 (5-544)||(12203502-12204041)
chr7 (50-538)||(18050700-18051188)
chr7 (48-296)||(14144917-14145165)
chr7 (77-485)||(12712437-12712845)
chr7 (386-538)||(14140693-14140845)
chr7 (416-538)||(15343445-15343567)
chr7 (5-255)||(15627820-15628070)
chr7 (5-234)||(13004783-13005012)
chr7 (416-544)||(15627531-15627659)
chr7 (461-544)||(11550282-11550365)
chr7 (461-538)||(8710618-8710695)
chr7 (461-538)||(13689054-13689131)
chr7 (461-538)||(14335409-14335486)
chr7 (461-538)||(14957567-14957644)
chr7 (461-538)||(44788531-44788608)
chr7 (50-262)||(17703224-17703436)
chr7 (461-538)||(9591377-9591454)
chr7 (461-538)||(11234393-11234470)
chr7 (461-538)||(15158237-15158314)
chr7 (461-538)||(17703635-17703712)
chr7 (461-538)||(18587351-18587428)
chr7 (53-153)||(15157832-15157932)
chr7 (50-262)||(16726210-16726422)
chr7 (33-262)||(11984281-11984510)
chr7 (29-162)||(14043084-14043217)
chr7 (29-162)||(14353114-14353247)
chr7 (461-538)||(16726621-16726698)
chr7 (461-538)||(18180756-18180833)
chr7 (53-153)||(13689436-13689536)
chr7 (131-262)||(9591653-9591784)
chr7 (461-544)||(14042702-14042785)
chr7 (461-544)||(14352732-14352815)
chr7 (461-538)||(12690515-12690591)
chr7 (491-544)||(15146133-15146186)
chr7 (53-153)||(11233988-11234088)
chr7 (53-153)||(18181138-18181238)
chr7 (465-544)||(38330-38409)
chr7 (482-527)||(4442951-4442996)
chr7 (482-527)||(7826924-7826969)
chr7 (482-527)||(13459057-13459102)
chr7 (482-527)||(27104975-27105020)
chr7 (482-527)||(27173305-27173350)
chr7 (5-153)||(15145647-15145795)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-544)||(5228-5770)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-544)||(63253-63776)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (1-544)||(70155-70698)
scaffold0046 (473-544)||(60786-60857)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (5-543)||(34385-34923)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (1-544)||(21738819-21739362)
chr1 (1-544)||(22015528-22016071)
chr1 (1-544)||(21742335-21742878)
chr1 (5-536)||(19857346-19857877)
chr1 (2-543)||(24096399-24096940)
chr1 (1-536)||(20832684-20833218)
chr1 (2-543)||(38909610-38910151)
chr1 (2-543)||(52988806-52989346)
chr1 (2-543)||(31536781-31537322)
chr1 (2-543)||(48425938-48426479)
chr1 (4-500)||(21961135-21961631)
chr1 (50-543)||(20074541-20075034)
chr1 (59-543)||(37680114-37680598)
chr1 (29-543)||(20297446-20297962)
chr1 (29-261)||(18273114-18273346)
chr1 (5-538)||(20853547-20854080)
chr1 (407-543)||(18710450-18710586)
chr1 (416-544)||(16379127-16379255)
chr1 (29-262)||(16379409-16379642)
chr1 (416-522)||(21045322-21045428)
chr1 (461-538)||(16347838-16347915)
chr1 (461-538)||(17042258-17042335)
chr1 (419-544)||(21842245-21842370)
chr1 (461-538)||(51330735-51330812)
chr1 (131-262)||(21228469-21228600)
chr1 (419-538)||(24785058-24785177)
chr1 (461-531)||(21833348-21833418)
chr1 (480-538)||(33388291-33388349)
chr1 (461-538)||(22496499-22496576)
chr1 (461-538)||(41350911-41350988)
chr1 (461-544)||(21752080-21752163)
chr1 (53-162)||(16347433-16347542)
chr1 (53-162)||(16354081-16354190)
chr1 (461-538)||(20081619-20081696)
chr1 (461-538)||(21228799-21228876)
chr1 (461-538)||(22401631-22401708)
chr1 (461-537)||(19109408-19109484)
chr1 (53-153)||(51330330-51330430)
chr1 (461-516)||(22435976-22436031)
chr1 (5-182)||(21044941-21045118)
chr1 (53-153)||(21833723-21833823)
chr1 (59-162)||(41350512-41350615)
chr1 (107-153)||(19109791-19109837)
chr1 (5-87)||(20921929-20922011)
chr1 (200-262)||(24784839-24784901)
chr1 (131-260)||(17041929-17042057)
chr1 (482-527)||(20828656-20828701)
chr1 (482-527)||(20928104-20928149)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (5-544)||(29671-30210)
scaffold0067 (32-538)||(64347-64853)
scaffold0067 (11-538)||(48904-49431)
scaffold0067 (11-538)||(57938-58465)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-544)||(4018-4561)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-543)||(1025-1567)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-543)||(7792-8334)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-536)||(42753-43288)
scaffold0102 (461-538)||(50519-50596)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (5-544)||(601-1140)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (2-544)||(36986-37528)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (5-544)||(533-1072)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (1-465)||(62486-62950)
scaffold0053 (200-538)||(65211-65549)
scaffold0053 (5-179)||(65040-65214)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-544)||(43133-43676)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (1-543)||(23274243-23274785)
chr2 (5-543)||(19716272-19716810)
chr2 (5-535)||(19720835-19721365)
chr2 (2-543)||(20848239-20848777)
chr2 (6-538)||(23097274-23097806)
chr2 (29-538)||(12577008-12577517)
chr2 (5-398)||(28350670-28351063)
chr2 (5-344)||(21901386-21901725)
chr2 (387-544)||(23113372-23113528)
chr2 (419-538)||(24705151-24705270)
chr2 (461-544)||(30208631-30208714)
chr2 (461-538)||(9338237-9338314)
chr2 (461-538)||(9486871-9486948)
chr2 (461-538)||(10871505-10871582)
chr2 (461-538)||(16983895-16983972)
chr2 (461-538)||(17001655-17001732)
chr2 (461-538)||(22323053-22323130)
chr2 (461-538)||(24265025-24265102)
chr2 (461-538)||(24712689-24712766)
chr2 (461-538)||(44383281-44383358)
chr2 (200-262)||(22462931-22462993)
chr2 (464-538)||(27220671-27220745)
chr2 (480-538)||(27373924-27373982)
chr2 (461-538)||(11351422-11351499)
chr2 (461-538)||(21322977-21323054)
chr2 (461-544)||(23065062-23065145)
chr2 (461-544)||(23074512-23074595)
chr2 (131-262)||(23116440-23116571)
chr2 (131-262)||(24817221-24817352)
chr2 (461-539)||(19817501-19817579)
chr2 (480-538)||(23029191-23029249)
chr2 (444-538)||(45673706-45673800)
chr2 (461-538)||(22742677-22742754)
chr2 (201-262)||(23205245-23205306)
chr2 (201-262)||(23676849-23676910)
chr2 (461-538)||(24874461-24874538)
chr2 (53-153)||(24265407-24265507)
chr2 (461-544)||(22733485-22733568)
chr2 (461-528)||(23204979-23205046)
chr2 (461-528)||(23676583-23676650)
chr2 (200-262)||(11351161-11351223)
chr2 (480-538)||(21142771-21142829)
chr2 (461-538)||(24657369-24657446)
chr2 (461-538)||(24678142-24678219)
chr2 (4-89)||(24817094-24817179)
chr2 (487-544)||(24817577-24817634)
chr2 (53-153)||(10871887-10871987)
chr2 (459-527)||(22739363-22739431)
chr2 (53-156)||(9338616-9338719)
chr2 (53-156)||(9487250-9487353)
chr2 (39-90)||(22742255-22742306)
chr2 (53-156)||(44382876-44382979)
chr2 (220-262)||(24657128-24657170)
chr2 (200-262)||(24704932-24704994)
chr2 (458-527)||(22280771-22280840)
chr2 (171-255)||(19647827-19647911)
chr2 (483-531)||(23105461-23105509)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (5-535)||(590-1125)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-544)||(21928512-21929055)
chr8 (5-544)||(19985264-19985803)
chr8 (17-544)||(22373953-22374480)
chr8 (2-538)||(31413687-31414223)
chr8 (32-543)||(22027465-22027976)
chr8 (28-543)||(28983996-28984511)
chr8 (2-538)||(29300581-29301117)
chr8 (48-538)||(22053953-22054443)
chr8 (1-543)||(16268378-16268920)
chr8 (29-541)||(20391173-20391685)
chr8 (29-426)||(6606651-6607048)
chr8 (446-543)||(28989215-28989312)
chr8 (419-538)||(22126531-22126650)
chr8 (461-538)||(17671636-17671713)
chr8 (461-538)||(19115490-19115567)
chr8 (461-538)||(20015877-20015954)
chr8 (461-538)||(22031193-22031270)
chr8 (53-262)||(22043193-22043402)
chr8 (461-538)||(22117789-22117866)
chr8 (5-262)||(22523876-22524133)
chr8 (461-538)||(32603235-32603312)
chr8 (5-89)||(21970709-21970793)
chr8 (5-89)||(22004239-22004323)
chr8 (464-536)||(22375071-22375143)
chr8 (200-262)||(30310497-30310559)
chr8 (461-538)||(18859667-18859744)
chr8 (461-538)||(19481686-19481763)
chr8 (461-538)||(19981057-19981134)
chr8 (461-538)||(30310758-30310835)
chr8 (50-153)||(18860049-18860152)
chr8 (461-528)||(22042927-22042994)
chr8 (461-544)||(22421506-22421589)
chr8 (131-262)||(32603511-32603642)
chr8 (53-153)||(22126168-22126268)
chr8 (419-538)||(21254035-21254154)
chr8 (461-531)||(21391475-21391545)
chr8 (461-531)||(21780801-21780871)
chr8 (461-538)||(15536473-15536550)
chr8 (461-538)||(21164152-21164229)
chr8 (461-538)||(22129231-22129308)
chr8 (491-544)||(22523630-22523683)
chr8 (419-544)||(22990129-22990254)
chr8 (416-544)||(22245584-22245712)
chr8 (416-544)||(22246002-22246130)
chr8 (5-153)||(22990520-22990668)
chr8 (499-543)||(27357621-27357665)
chr8 (131-262)||(15536749-15536880)
chr8 (59-162)||(19481287-19481390)
chr8 (200-262)||(21391214-21391276)
chr8 (200-262)||(21780540-21780602)
chr8 (53-147)||(22117384-22117478)
chr8 (482-527)||(20649990-20650035)
chr8 (5-162)||(21671981-21672138)
chr8 (491-531)||(21785999-21786039)
chr8 (5-89)||(21982112-21982196)
chr8 (5-89)||(21998598-21998682)
chr8 (44-88)||(22421090-22421134)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (5-543)||(23563065-23563603)
chr5 (2-537)||(23077799-23078334)
chr5 (2-543)||(20345215-20345756)
chr5 (2-543)||(22505612-22506153)
chr5 (1-268)||(21870171-21870438)
chr5 (1-268)||(21874451-21874718)
chr5 (1-543)||(14883884-14884426)
chr5 (5-544)||(21983074-21983613)
chr5 (56-543)||(25851005-25851492)
chr5 (5-544)||(21560922-21561461)
chr5 (32-538)||(17266258-17266764)
chr5 (17-426)||(43122517-43122926)
chr5 (17-286)||(23669822-23670091)
chr5 (201-538)||(20824391-20824728)
chr5 (446-538)||(20778851-20778943)
chr5 (456-538)||(22464888-22464970)
chr5 (446-538)||(28892280-28892372)
chr5 (346-544)||(21631637-21631835)
chr5 (167-286)||(16258095-16258214)
chr5 (167-286)||(22591814-22591933)
chr5 (167-286)||(22595369-22595488)
chr5 (5-262)||(23474426-23474683)
chr5 (461-544)||(14997092-14997175)
chr5 (461-538)||(16359458-16359535)
chr5 (461-538)||(19772916-19772993)
chr5 (411-544)||(21410084-21410217)
chr5 (461-538)||(22330240-22330317)
chr5 (461-538)||(27521362-27521439)
chr5 (461-538)||(27613312-27613389)
chr5 (461-538)||(27665843-27665920)
chr5 (461-538)||(27682753-27682830)
chr5 (461-538)||(29473426-29473503)
chr5 (461-538)||(34569450-34569527)
chr5 (461-538)||(37288849-37288926)
chr5 (461-538)||(40711736-40711813)
chr5 (461-538)||(41773798-41773875)
chr5 (461-544)||(25429371-25429454)
chr5 (461-538)||(18782070-18782147)
chr5 (461-538)||(21882730-21882807)
chr5 (461-538)||(23526007-23526084)
chr5 (53-153)||(22329835-22329935)
chr5 (461-544)||(21332339-21332422)
chr5 (461-544)||(26736080-26736163)
chr5 (200-262)||(18782346-18782408)
chr5 (480-538)||(20803553-20803611)
chr5 (461-538)||(22350875-22350952)
chr5 (11-100)||(28891845-28891934)
chr5 (53-153)||(14996687-14996787)
chr5 (53-153)||(19773298-19773398)
chr5 (53-153)||(27682348-27682448)
chr5 (53-156)||(27521741-27521844)
chr5 (62-153)||(27613694-27613785)
chr5 (28-262)||(26735648-26735882)
chr5 (5-86)||(21331886-21331967)
chr5 (5-90)||(21631296-21631381)
chr5 (461-538)||(22137624-22137701)
chr5 (167-300)||(22465126-22465259)
chr5 (461-522)||(23460943-23461004)
chr5 (59-262)||(23461203-23461406)
chr5 (53-153)||(29473021-29473121)
chr5 (53-156)||(16359837-16359940)
chr5 (5-100)||(20824829-20824924)
chr5 (56-255)||(21410373-21410572)
chr5 (29-88)||(25429826-25429885)
chr5 (53-156)||(34569829-34569932)
chr5 (200-262)||(23526283-23526345)
chr5 (59-153)||(37288450-37288544)
chr5 (11-96)||(20770518-20770603)
chr5 (11-96)||(20779293-20779378)
chr5 (200-261)||(20803830-20803891)
chr5 (482-527)||(23508633-23508678)
chr5 (482-527)||(24584159-24584204)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (5-538)||(5858-6390)
scaffold0035 (461-544)||(41282-41365)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (4-543)||(19455906-19456445)
chr6 (4-543)||(19466051-19466590)
chr6 (1-544)||(25770726-25771269)
chr6 (5-543)||(19437885-19438423)
chr6 (1-538)||(18797578-18798115)
chr6 (5-543)||(14376776-14377314)
chr6 (17-544)||(21474482-21474993)
chr6 (68-536)||(24515337-24515805)
chr6 (5-544)||(19486154-19486693)
chr6 (1-543)||(10465704-10466246)
chr6 (5-538)||(21566851-21567384)
chr6 (5-543)||(24367283-24367821)
chr6 (77-538)||(34642517-34642979)
chr6 (5-538)||(15462224-15462757)
chr6 (1-286)||(8720561-8720846)
chr6 (1-286)||(16813780-16814065)
chr6 (29-262)||(30677908-30678141)
chr6 (418-538)||(30678297-30678417)
chr6 (461-538)||(16924956-16925033)
chr6 (5-234)||(19881588-19881817)
chr6 (5-262)||(23081587-23081844)
chr6 (461-538)||(2872118-2872195)
chr6 (461-538)||(16574778-16574855)
chr6 (461-538)||(16620525-16620602)
chr6 (5-262)||(18660083-18660340)
chr6 (461-538)||(29589755-29589832)
chr6 (53-153)||(5836139-5836239)
chr6 (416-544)||(23085096-23085224)
chr6 (28-256)||(25958636-25958864)
chr6 (461-544)||(5836544-5836627)
chr6 (464-538)||(27190324-27190398)
chr6 (464-538)||(27258842-27258916)
chr6 (461-538)||(28312518-28312595)
chr6 (461-528)||(22829702-22829769)
chr6 (461-544)||(23081305-23081388)
chr6 (461-538)||(22436757-22436834)
chr6 (461-522)||(24293098-24293159)
chr6 (461-538)||(27559285-27559362)
chr6 (461-538)||(28260513-28260590)
chr6 (461-538)||(28285326-28285403)
chr6 (461-538)||(28339262-28339339)
chr6 (5-288)||(20010361-20010645)
chr6 (464-527)||(18182686-18182749)
chr6 (461-544)||(18405260-18405343)
chr6 (483-538)||(19867575-19867630)
chr6 (200-262)||(21764976-21765038)
chr6 (461-538)||(25115440-25115517)
chr6 (53-153)||(2871713-2871813)
chr6 (29-89)||(23084709-23084769)
chr6 (46-88)||(22437207-22437249)
chr6 (107-153)||(22829351-22829397)
chr6 (220-262)||(27559044-27559086)
chr6 (482-527)||(16379710-16379755)
chr6 (482-527)||(16647306-16647351)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (1-544)||(1768-2309)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (1-469)||(5562-6027)
scaffold0523 (28-512)||(11484-11968)
scaffold0523 (464-542)||(2920-2998)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-526)||(51716-52241)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-467)||(16761-17227)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (5-535)||(98301-98831)
scaffold0020 (17-544)||(176035-176561)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (5-543)||(1670-2208)
scaffold0034 (32-376)||(11651-11995)
scaffold0034 (5-538)||(70425-70958)
scaffold0034 (131-252)||(122020-122141)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (32-544)||(29574-30086)
[»] scaffold0010 (6 HSPs)
scaffold0010 (5-543)||(39053-39589)
scaffold0010 (131-262)||(14753-14884)
scaffold0010 (461-538)||(14477-14554)
scaffold0010 (423-544)||(4962-5083)
scaffold0010 (5-262)||(5244-5501)
scaffold0010 (11-96)||(180563-180648)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (5-543)||(20862-21400)
scaffold0222 (5-538)||(205-738)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (4-535)||(11033-11564)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (5-543)||(8662-9200)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (5-384)||(153699-154078)
scaffold0011 (392-543)||(151615-151766)
scaffold0011 (461-544)||(23707-23790)
scaffold0011 (482-531)||(73792-73841)
scaffold0011 (482-531)||(78173-78222)
scaffold0011 (482-534)||(175708-175760)
scaffold0011 (482-527)||(182054-182099)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (5-542)||(5651-6188)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (5-541)||(990-1526)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (11-543)||(7086-7618)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (5-541)||(28003-28539)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (239-544)||(12774-13079)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (5-330)||(4172-4496)
scaffold0017 (461-538)||(17240-17317)
scaffold0017 (464-544)||(24353-24433)
scaffold0017 (483-538)||(195034-195089)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (5-543)||(9492-10028)
scaffold0243 (461-544)||(24119-24202)
scaffold0243 (28-84)||(23686-23742)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (5-543)||(8739-9277)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (74-444)||(71-441)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (2-507)||(1202-1707)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (5-538)||(8180-8713)
scaffold0235 (5-538)||(18394-18927)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-273)||(5616-5888)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (5-543)||(4927-5465)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (2-543)||(514068-514609)
scaffold0001 (419-544)||(496067-496192)
scaffold0001 (487-544)||(441700-441757)
scaffold0001 (5-89)||(442154-442238)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (5-537)||(164119-164651)
scaffold0023 (483-544)||(30770-30831)
scaffold0023 (459-544)||(47155-47240)
scaffold0023 (200-262)||(30487-30549)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (11-543)||(509-1041)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (5-543)||(54095-54633)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (140-543)||(4998-5401)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (2-543)||(251670-252208)
scaffold0009 (461-528)||(230026-230093)
scaffold0009 (200-262)||(229765-229827)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (38-536)||(30077-30575)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (5-538)||(1566-2099)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-281)||(115934-116214)
scaffold0031 (474-544)||(110657-110727)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (32-538)||(263279-263785)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (32-538)||(203434-203940)
scaffold0003 (461-537)||(424362-424438)
scaffold0003 (59-153)||(424746-424840)
scaffold0003 (202-262)||(424637-424697)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (59-543)||(41783-42267)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (2-512)||(1322-1832)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (5-439)||(5205-5639)
scaffold0167 (458-543)||(1168-1253)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (250-544)||(12007-12301)
scaffold0165 (114-213)||(12322-12421)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (32-538)||(6002-6508)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (5-543)||(22170-22708)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (38-538)||(9538-10037)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (5-314)||(260-569)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (38-538)||(40111-40611)
scaffold0114 (461-535)||(17523-17597)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (5-538)||(263-796)
scaffold0476 (461-536)||(10841-10916)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (18-538)||(17215-17735)
scaffold0348 (59-538)||(4621-5100)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (5-381)||(12132-12506)
scaffold0261 (5-381)||(20312-20686)
scaffold0261 (441-544)||(12502-12605)
scaffold0261 (441-544)||(20682-20785)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-234)||(3222-3455)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (2-537)||(66823-67358)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (146-543)||(325755-326151)
scaffold0004 (5-327)||(319507-319829)
scaffold0004 (148-544)||(200338-200725)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (197-543)||(764-1110)
scaffold0203 (5-156)||(3769-3920)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (5-538)||(53141-53674)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (5-439)||(2783-3211)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (2-504)||(518-1020)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (215-543)||(29982-30310)
scaffold0088 (2-165)||(30336-30499)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (5-297)||(798-1090)
scaffold1530 (378-543)||(631-796)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (5-371)||(15292-15658)
scaffold0074 (446-543)||(15171-15268)
scaffold0074 (416-531)||(6173-6288)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (131-538)||(115615-116022)
scaffold0029 (389-538)||(93996-94145)
scaffold0029 (11-96)||(93618-93703)
scaffold0029 (53-153)||(107543-107643)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (2-252)||(33087-33337)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (2-371)||(23638-24007)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (215-543)||(11857-12173)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (2-288)||(1019-1305)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (341-543)||(19023-19225)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (197-544)||(3999-4346)
scaffold0585 (1-202)||(575-775)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (205-544)||(11875-12214)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (446-544)||(14-112)
[»] scaffold0130 (4 HSPs)
scaffold0130 (131-544)||(3736-4146)
scaffold0130 (480-544)||(7972-8036)
scaffold0130 (212-262)||(7704-7754)
scaffold0130 (50-90)||(7542-7582)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (29-262)||(16351-16584)
scaffold0100 (416-518)||(16738-16840)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (29-237)||(7911-8119)
scaffold0609 (162-286)||(1244-1368)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (456-543)||(9396-9483)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (456-538)||(3-85)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (59-224)||(2198-2363)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (5-102)||(753-850)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (419-544)||(15457-15582)
scaffold0293 (5-262)||(15739-15996)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (5-102)||(25949-26046)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (53-294)||(996-1237)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (8-156)||(1-149)
[»] scaffold0270 (4 HSPs)
scaffold0270 (5-262)||(7202-7459)
scaffold0270 (5-262)||(14332-14589)
scaffold0270 (487-544)||(6920-6977)
scaffold0270 (487-544)||(14050-14107)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (461-538)||(36551-36628)
scaffold0079 (131-262)||(36827-36958)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (5-262)||(57332-57589)
scaffold0077 (419-536)||(57746-57863)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (416-544)||(5135-5263)
scaffold0529 (5-90)||(5589-5674)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (416-544)||(11075-11203)
scaffold0507 (5-153)||(11466-11614)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (464-544)||(17925-18005)
scaffold0040 (461-544)||(111081-111164)
scaffold0040 (5-262)||(18174-18431)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (461-536)||(2054-2129)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (5-102)||(30746-30843)
scaffold0180 (169-285)||(30895-31011)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (419-536)||(216552-216669)
scaffold0012 (5-262)||(216138-216395)
[»] scaffold0282 (3 HSPs)
scaffold0282 (416-544)||(13608-13736)
scaffold0282 (26-262)||(13213-13449)
scaffold0282 (5-87)||(9840-9922)
[»] scaffold1881 (2 HSPs)
scaffold1881 (47-262)||(240-455)
scaffold1881 (481-538)||(674-731)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (416-538)||(8463-8585)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (463-537)||(17991-18065)
scaffold0028 (461-537)||(11523-11599)
scaffold0028 (461-537)||(55058-55134)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (461-538)||(10332-10409)
scaffold0550 (200-262)||(10071-10133)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (461-538)||(15753-15830)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (419-544)||(14398-14523)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (419-544)||(15111-15236)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (461-538)||(8311-8388)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (461-538)||(22300-22377)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (461-538)||(7289-7366)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (461-538)||(3477-3554)
scaffold0044 (131-262)||(17489-17620)
scaffold0044 (461-538)||(17213-17290)
scaffold0044 (59-153)||(3859-3953)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (6-262)||(1141-1397)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (461-537)||(48719-48795)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (461-544)||(64-147)
scaffold0621 (461-544)||(4481-4564)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (464-531)||(201-268)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (461-544)||(11311-11394)
scaffold0120 (482-527)||(25242-25287)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (29-256)||(104561-104788)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (461-531)||(2924-2994)
[»] scaffold2059 (2 HSPs)
scaffold2059 (461-538)||(943-1020)
scaffold2059 (131-262)||(613-744)
[»] scaffold1423 (2 HSPs)
scaffold1423 (461-538)||(552-629)
scaffold1423 (39-88)||(130-179)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (461-538)||(10421-10498)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (461-538)||(29102-29179)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (2-127)||(17703-17828)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (461-538)||(13298-13375)
scaffold0109 (200-262)||(13037-13099)
scaffold0109 (461-538)||(41208-41285)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (5-189)||(20-203)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (174-258)||(36161-36245)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (496-544)||(49086-49134)
[»] scaffold0605 (3 HSPs)
scaffold0605 (456-507)||(1364-1415)
scaffold0605 (167-288)||(1583-1704)
scaffold0605 (35-100)||(1771-1836)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (461-544)||(3598-3681)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (483-538)||(93-148)
scaffold0273 (200-262)||(369-431)
scaffold0273 (32-90)||(541-599)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (461-544)||(7913-7996)
scaffold0207 (230-262)||(4498-4530)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (461-544)||(55644-55727)
scaffold0075 (28-262)||(48059-48293)
scaffold0075 (28-257)||(55212-55441)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (461-544)||(41679-41762)
scaffold0022 (461-544)||(75399-75482)
scaffold0022 (483-536)||(34911-34964)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (131-262)||(9195-9326)
scaffold0018 (419-544)||(23430-23555)
scaffold0018 (4-89)||(9068-9153)
scaffold0018 (487-544)||(9551-9608)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (200-262)||(208-270)
[»] scaffold0177 (3 HSPs)
scaffold0177 (464-538)||(11533-11607)
scaffold0177 (200-262)||(11269-11331)
scaffold0177 (200-262)||(14954-15016)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (461-522)||(1206-1267)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (29-90)||(2252-2313)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (461-538)||(2437-2514)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (461-538)||(14964-15041)
scaffold0403 (39-153)||(15349-15463)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (461-538)||(36994-37071)
scaffold0042 (416-544)||(26399-26527)
scaffold0042 (29-90)||(26853-26914)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (480-544)||(1029-1093)
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (462-538)||(31936-32012)
scaffold0080 (462-538)||(37402-37478)
scaffold0080 (461-528)||(10412-10479)
scaffold0080 (461-528)||(13067-13134)
scaffold0080 (200-262)||(10152-10214)
scaffold0080 (200-262)||(12807-12869)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (461-544)||(2036-2119)
scaffold0324 (5-153)||(2427-2575)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (131-262)||(117-248)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (461-544)||(40681-40764)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (461-544)||(8270-8353)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (496-538)||(21904-21946)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (482-527)||(2635-2680)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (458-527)||(13502-13571)
scaffold0467 (482-527)||(816-861)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (461-538)||(18703-18780)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (482-527)||(1147-1192)
scaffold0218 (485-538)||(24910-24963)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (482-527)||(5000-5045)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (480-521)||(171188-171229)
scaffold0019 (220-262)||(171447-171489)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (5-189)||(468-652)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (201-260)||(445-504)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (461-528)||(1-68)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (2-165)||(13769-13932)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (59-262)||(5327-5530)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (131-262)||(139454-139585)
scaffold0008 (224-262)||(179-217)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (200-262)||(13945-14007)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (461-527)||(9011-9077)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (162-255)||(4874-4967)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (482-527)||(5499-5544)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (5-70)||(16241-16306)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (482-527)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (482-527)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (482-527)||(24027-24072)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (461-538)||(21657-21734)
scaffold0081 (461-538)||(37081-37158)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (482-527)||(8221-8266)
scaffold0021 (482-527)||(90566-90611)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (230-262)||(17920-17952)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (482-534)||(3556-3608)


Alignment Details
Target: scaffold0108 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 50695 - 50152
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50695 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 50596  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50595 cgtagaggcaagggacagcagagtggtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcatagatggaatgatgagaggaggcccaagaggagag 50496  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  50495 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaa 50396  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50395 aggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacccagcctaagaaggtt 50296  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50295 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 50196  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50195 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 50152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 16825218 - 16825763
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825218 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 16825317  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  16825318 cgcagaggcaagggacagctgagtcgtccgaagccgtatagtgcccctcctgacaagggtaagtagagattgaaagatgagaggaggcccaagatgagag 16825417  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16825418 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgatgagaagaagtgcttcaggtgtggtaaaaa 16825517  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  16825518 aggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggtcatatcagtttgcagtgtacgcagcctaagaaggtt 16825617  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttcttta--ataatactcctttaat 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16825618 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaat 16825717  T
Q  499 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825718 tgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgat 16825763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12181530 - 12180992
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12181530 attggctatcagaaaataaggaacttctctgaattggtaagcggctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 12181431  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12181430 gaggcaagggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagtagaggttaaatgatgagaggaggaccaagaggagagatgc 12181331  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12181330 tcctactgacattttttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaaagtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagttgtggtcggaaagga 12181231  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12181230 cacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcaaccgaagaaggttagga 12181131  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| ||||| || |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12181130 ccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctat 12181031  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12181030 tatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 12180992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 35983371 - 35982839
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  35983371 ggctattggttatcataagataagaaatttttctgaattggtaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgag 35983272  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     | ||||| |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35983271 tgcagaggtaagggacagcagagttgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 35983172  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  35983171 atgctcctactgtgattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaa 35983072  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  35983071 aggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcattgtacgcagcctaagaaggtt 35982972  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35982971 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattg 35982872  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttca 533  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35982871 ctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 14290471 - 14291014
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  14290471 ggctattggttatcaaaagataagaaatttttctgaattggaaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgag 14290570  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14290571 cgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 14290670  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  14290671 atgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaa 14290770  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| || |   | || || || ||||| |  ||| |||| | | ||||||||||||||    
T  14290771 aggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcctaagaaggtt 14290870  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14290871 cggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattg 14290970  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14290971 ctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgat 14291014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17494836 - 17494295
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17494836 attggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 17494737  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgac----aacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |    || |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17494736 gagccaagggacaacaaagtcgttcgaagccatatagtgctcctgctggctgagaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagag 17494637  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17494636 atgctcatactgagattgtttgcttcaaatgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgc-tcaggtgtggtcagaa 17494538  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||    
T  17494537 aggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggtt 17494438  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |  | | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17494437 aggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 17494338  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17494337 ctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 17494295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 543
Target Start/End: Original strand, 12357476 - 12358008
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12357476 tatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggta 12357575  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    ||||||| |||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || ||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12357576 agggacatcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagtagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatactcctgc 12357675  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 310  Q
    ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12357676 tgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaca 12357775  T
Q  311 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 410  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  12357776 ttagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtg 12357875  T
Q  411 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 510  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12357876 gtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattataga 12357975  T
Q  511 tactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12357976 cactagtgctactcattgtttcattgctattga 12358008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31942089 - 31941551
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  31942089 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaa 31941990  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |  |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  31941989 ggagcaaaggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaataggagaaatgc 31941890  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  31941889 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggga 31941790  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||| ||  ||||||| || || | ||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31941789 cacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacgcagccgaagaaggttagga 31941690  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31941689 ctggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 31941590  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31941589 tatagatactgatgctactcattttttcattgctattga 31941551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 31692128 - 31692666
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  31692128 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaa 31692227  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  31692228 ggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaataggagaaatgc 31692327  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    | || |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  31692328 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggttagaaggga 31692427  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| ||| || ||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| ||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31692428 cacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttagga 31692527  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31692528 ctggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 31692627  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31692628 tatagatattggtgctactcattgtttcattgctattga 31692666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 540
Target Start/End: Original strand, 12857451 - 12857973
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857451 aagataagaattttttttgatttggtgagtagctgtagaatctatgaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 12857550  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
    |  ||||||||   || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  12857551 agtagagtcgtccaaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacaaggactgaatgatgagaggaggcctaaaaggagagatgctcctactgagat 12857650  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||   ||| |    
T  12857651 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaagggccacatgagtaatgtatgtgactgtgatgagaagaagtgtttccgatgtggaaagaaaggacacataatagct 12857750  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    || || |||||| | || |||||||||||||| |   | || ||||||||||| |  |||||||| | | |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  12857751 gagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgtagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaagg 12857850  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857851 tgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggac-gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 12857949  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgctgt 540  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  12857950 tgctagttattgtttcattgctgt 12857973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 538
Target Start/End: Original strand, 16326647 - 16327185
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  16326647 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 16326746  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16326747 ggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctgacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaaaaggtgaatgatgataggagacccaagaggagaga 16326846  T
Q  202 -tgctcctactgata-ttgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 299  Q
     ||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||    
T  16326847 ctgctcctgctgagacttgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcaga 16326946  T
Q  300 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 399  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||    
T  16326947 agggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtactaagccgaagaaggt 16327046  T
Q  400 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaatt 499  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16327047 tagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 16327146  T
Q  500 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327147 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 16327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 538
Target Start/End: Original strand, 11958121 - 11958657
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||     
T  11958121 gctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcgggatttatgaggaagacacaaaagttcattacaaggtgatgagtgaga 11958220  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  11958221 ggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagaatgaatgatgataggaggcttaagaggagaga 11958320  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  11958321 tgctcctgctgaaattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaaa 11958420  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||    
T  11958421 ggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaagtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggcta 11958520  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11958521 ggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgc 11958620  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11958621 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 11958657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17189564 - 17189027
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  17189564 ggctattggataccagaagatcagaaacttctttgagttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgac 17189465  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17189464 cgcagaggcaagggccagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctaacaagggaaagcagagatttaatgatgagaggaggtccaagaggagag 17189365  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17189364 atgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 17189265  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||| |||  ||||||| ||||| |||||| ||    
T  17189264 aggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagatt 17189165  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || || ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17189164 agaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 17189065  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17189064 ctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgct 17189027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 18131290 - 18131827
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || |||||  |||| || || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  18131290 attgggtatcagaagataagaattttctctgatatggtgagtagctgtaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaagtgatgagtgaacgga 18131389  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| || ||||| |||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18131390 gaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagagactgaataatgagaggaggcccaagaggagagatgc 18131489  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  ||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18131490 tcctgttgagattgattgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 18131589  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||| | |||| | ||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||| |||||| ||||||| | |||| ||||||| || |  ||||||||||| |    
T  18131590 cacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtcatattagttcgcagtgtactcaactgaagaaggttagaa 18131689  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||| || ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18131690 ccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 18131789  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18131790 tataga-cctggtgctactcattgtttcattgctattga 18131827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 538
Target Start/End: Original strand, 16831484 - 16832004
Alignment:
Q  18 agataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggaca 117  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16831484 agataagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggaca 16831583  T
Q  118 acagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatatt 217  Q
     ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||     
T  16831584 gcagagtcatcctaagccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagata 16831683  T
Q  218 gtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   ||||      
T  16831684 gtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcg 16831782  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    || || |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || ||||||| | |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  16831783 gactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaagg 16831882  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16831883 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 16831982  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16831983 tgctactcattgtttcattgct 16832004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24190493 - 24189957
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24190493 ggctattggataccagaagatcagaaacttctctgatttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacgaaagctcattacaaggtgatgactgac 24190394  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||||||||  || |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24190393 cgcagaggcaaggc-cagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggtacaagaggagag 24190295  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24190294 atgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 24190195  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||| |||  ||||||| ||||| |||||| ||    
T  24190194 aggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagatt 24190095  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || || ||||| || | |||||| |||||| |||||||  |    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24190094 agaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 24189995  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24189994 ctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 24189957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10409157 - 10408616
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||   |||||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  10409157 gctattggatatcagcagatcagagttttttctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 10409058  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  10409057 ggaggggtaagggacaccagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 10408958  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  10408957 tgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 10408858  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  10408857 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 10408758  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10408757 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 10408658  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10408657 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 10408616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 47127133 - 47126592
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  47127133 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgaga 47127034  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  47127033 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 47126934  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  47126933 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 47126834  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  47126833 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 47126734  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47126733 gaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 47126634  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47126633 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 47126592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28757508 - 28756967
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  28757508 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 28757409  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  28757408 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 28757309  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  28757308 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 28757209  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| | |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  28757208 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 28757109  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28757108 gaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 28757009  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28757008 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 28756967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15230789 - 15230250
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   |    
T  15230789 attggttatcagaagatcagacaattttctgagttggggagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagaaga 15230690  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  15230689 ggaacaaaggccaacaaggtcgtcctaagccctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgt 15230590  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||     
T  15230589 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaaggg 15230490  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | |  ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  15230489 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcaga 15230390  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| |   | || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15230389 caggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 15230290  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15230289 tatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 15230250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15236657 - 15236118
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   |    
T  15236657 attggttatcagaagatcagacaattttctgagttggggagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagaaga 15236558  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  15236557 ggaacaaaggccaacaaggtcgtcctaagccctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgt 15236458  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||     
T  15236457 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaaggg 15236358  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | |  ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  15236357 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcaga 15236258  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| |   | || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15236257 caggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 15236158  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15236157 tatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 15236118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 244 - 543
Target Start/End: Original strand, 11949107 - 11949406
Alignment:
Q  244 ccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgc 343  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| || ||  ||||||||    
T  11949107 ccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgc 11949206  T
Q  344 tacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcag 443  Q
    || |||| ||| ||||||||||| |||| || | |||||||| || | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |      
T  11949207 tataactgcaatgaggaaggtcacatcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaacca 11949306  T
Q  444 tgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
      | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11949307 ctagtgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 11949406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Original strand, 16384342 - 16384640
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |    
T  16384342 tctgatttggtaagttgctgtaggatctatgaggaggacagcaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtccta 16384441  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  16384442 agccatacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtg 16384541  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | |||||| ||||||||    
T  16384542 tggcgagaaagtccacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtgg 16384640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13945165 - 13944677
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  13945165 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 13945066  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  13945065 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 13944966  T
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 348  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  13944965 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataa 13944867  T
Q  349 cttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 448  Q
     |  || || || || || |||| | |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  13944866 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 13944767  T
Q  449 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13944766 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 13944677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 538
Target Start/End: Original strand, 8744378 - 8744866
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  8744378 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 8744477  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  8744478 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 8744577  T
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 348  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  8744578 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataa 8744676  T
Q  349 cttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 448  Q
     |  || || || || || |||| | |  |||| || || || |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  8744677 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacaaccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 8744776  T
Q  449 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8744777 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 8744866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 392 - 538
Target Start/End: Original strand, 13317864 - 13318010
Alignment:
Q  392 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactc 491  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13317864 aagaaggtcagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 13317963  T
Q  492 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13317964 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 13318010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 446 - 543
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12509964
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 12509964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Original strand, 10417367 - 10417521
Alignment:
Q  384 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaa 483  Q
    |||| ||||||||||| || || || || || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10417367 cgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaa 10417466  T
Q  484 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  10417467 tagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgct 10417521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 446 - 538
Target Start/End: Original strand, 16378318 - 16378410
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16378318 aatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgct 16378410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 13317512 - 13317840
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||| |||   |    
T  13317512 attggatatcagaagatcataaatttctcggagttggtgagcagttgtaggatatatgaggaggatacaaaggctcactataaggcgatgagcgagaaga 13317611  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  13317612 ggaataagggccagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaatattaaatgatgagaggaggcctagggggagagatgc 13317711  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||     
T  13317712 tcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcaaaaggccacaaaagtaatgtttgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcaaaaaggt 13317811  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtgggga 333  Q
    ||   |||||  ||||| |||||||||||    
T  13317812 catgttttagcggattgcaagcgtgggga 13317840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 2245615 - 2245712
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2245615 attggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctttaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtgagcg 2245712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 261
Target Start/End: Original strand, 15008684 - 15008783
Alignment:
Q  162 agcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 261  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15008684 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagagaggccacaagagtaatgtttg 15008783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Original strand, 12508508 - 12508758
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  12508508 attggatatcagaagatctgtaacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgagaaggatacgaaagctcattacaaggctatgagtgagagga 12508607  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||| ||| | || || ||||||   ||||| || ||||| || ||||| || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  | ||  ||| |    
T  12508608 aaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctccggctgataagggtgagcagagggtgaatgatgagaagaggcccataaagaaggatac 12508707  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    |||||||||  ||||||||| |   ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12508708 tcctactgaagttgtttgttaccgatgtggagaaaaaggtcataagagtaa 12508758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 482 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272986
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttga 12272986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 2037017 - 2037136
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  2037017 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 2037116  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    | || |||||||||||||||    
T  2037117 gtgaggagaagaagtgcttc 2037136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 2040758 - 2040877
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  2040758 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 2040857  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    | || |||||||||||||||    
T  2040858 gtgaggagaagaagtgcttc 2040877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14039770 - 14039651
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  14039770 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 14039671  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    | || |||||||||||||||    
T  14039670 gtgaggagaagaagtgcttc 14039651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 12843057 - 12843314
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  12843057 attggttaccagaagattcgtaacttttccgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaa 12843156  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     || ||| || || |||||||||   ||||  |||||||| |||||||| || || || || ||| ||| |||||||| | |||| | || || ||||||    
T  12843157 aagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagctttatagtgctcctgctgataagggcaaacagagaatgattgatgagaggcggcctaggaagaaagatgc 12843256  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12843257 tcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 12843314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 3688663 - 3688586
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3688663 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 3688586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 10008320 - 10008243
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10008320 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 10008243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 10908930 - 10908853
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10908930 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 10908853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12889429 - 12889352
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12889429 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 12889352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13255410 - 13255333
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13255410 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 13255333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 15345655 - 15345732
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15345655 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 15345732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15358803 - 15358726
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15358803 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 15358726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 15586802 - 15586879
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15586802 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 15586879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 15713466 - 15713543
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15713466 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 15713543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24185910 - 24185833
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24185910 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgct 24185833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 43165395 - 43165318
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43165395 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 43165318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 48428167 - 48428090
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48428167 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 48428090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16638493 - 16638410
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  16638493 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgat 16638410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 536
Target Start/End: Original strand, 26790823 - 26790898
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26790823 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattg 26790898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422417
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 5422417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6603455 - 6603378
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  6603455 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgct 6603378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 522  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 15399927 - 15400004
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15399927 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 15400004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754188
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 16754188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804434
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 16804434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 20059464 - 20059541
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  20059464 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 20059541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 53382428 - 53382505
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  53382428 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 53382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 536
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013243
Alignment:
Q  408 gtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattat 507  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| ||  ||| |||||||||  | || ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  508 agatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| ||||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattg 15013243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843596
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 12843596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262267
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 15262267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065714
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 15065714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 262
Target Start/End: Original strand, 16803952 - 16804158
Alignment:
Q  56 atttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgaca 155  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16803952 atttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgata 16804051  T
Q  156 acggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    | || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  16804052 agggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 16804151  T
Q  256 tgtttgt 262  Q
    |||||||    
T  16804152 tgtttgt 16804158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3689068 - 3688959
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  3689068 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 3688969  T
Q  153 acaacggtaa 162  Q
    |||| |||||    
T  3688968 acaagggtaa 3688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15262806 - 15262549
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||  |||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  15262806 attggttactagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcgga 15262707  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     |||||| |  ||||| ||||||   ||||| || |  || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| |||||  |  |||| ||||||    
T  15262706 aaggcaaagatcaacaaagtcgtccaaagccttacaacgctcctgctgataagggtaaacaaagaatgaatgatgagaggaggcgtagaaggaaagatgc 15262607  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  |||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  15262606 tcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggctataagagtaatgcttgt 15262549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 23079427 - 23079504
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  23079427 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgct 23079504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10008725 - 10008625
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10008725 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 10008626  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  10008625 a 10008625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10909335 - 10909235
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10909335 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 10909236  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  10909235 a 10909235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 15713061 - 15713161
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  15713061 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 15713160  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  15713161 a 15713161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6603863 - 6603757
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  6603863 tgtaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 6603764  T
Q  150 ctgacaa 156  Q
    |||||||    
T  6603763 ctgacaa 6603757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874055
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgct 14874055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 23079166 - 23079228
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23079166 gatgctcctgctgtgattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 23079228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 10416994 - 10417079
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 96  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10416994 tatcagaagatcagaattttctcagaactggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 10417079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694807
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 16694807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6597180 - 6597077
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  6597180 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 6597081  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  6597080 acaa 6597077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11861403 - 11861272
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| | |||||| |    
T  11861403 aagccctatagtgcccctgctgataaaggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctatttcaatt 11861304  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11861303 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11861272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13255815 - 13255712
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  13255815 aggatctacgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 13255716  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  13255715 acaa 13255712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16638898 - 16638795
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16638898 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16638799  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  16638798 acaa 16638795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 23414870 - 23415001
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  23414870 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaact 23414969  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23414970 atggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23415001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43165800 - 43165697
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  43165800 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 43165701  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  43165700 acaa 43165697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15066052 - 15065990
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15066052 gatgctcctgctgcgattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 15065990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 88
Target Start/End: Original strand, 23079012 - 23079054
Alignment:
Q  46 cagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 88  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23079012 cagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaag 23079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 14993088 - 14993621
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993088 tatcagaagataagaaacttttctgatttggtaagtagttgcagaatttatgaagaggatatgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 14993187  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14993188 agggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctac 14993287  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14993288 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgagaagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacact 14993387  T
Q  311 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 410  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14993388 ttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtg 14993487  T
Q  411 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 510  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14993488 gcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 14993587  T
Q  511 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14993588 tactagtgctcttcattatttcattgctgttgat 14993621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15267333 - 15266794
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15267333 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttgataagtagctgcaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 15267234  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15267233 gaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 15267134  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15267133 tcctacgaatattgtttgcttcaagtgtgatgagaagggccataagagtaatgtttgtgacagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 15267034  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15267033 cacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttagga 15266934  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||   | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15266933 ccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 15266834  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15266833 tatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgat 15266794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15073904 - 15073377
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15073904 aagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggac 15073805  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
    | | |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  15073804 agctgagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagat 15073705  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |    
T  15073704 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 15073605  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    ||||| |||| | | ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| |  ||  |||| | | |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15073604 gattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatataagctcacagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaagg 15073505  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073504 tgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 15073405  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073404 tgctactcattgtttcattgctgttgat 15073377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20893591 - 20893055
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  20893591 gctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggtaaacagttgcaggatttacaaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 20893492  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  20893491 ggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 20893392  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  20893391 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 20893292  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || || || ||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  20893291 ggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcatatcagttcgcagtgtactgagccgaagaaggtta 20893192  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20893191 gaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 20893092  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893091 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 20893055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18260002 - 18259632
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18260002 ggctattggttactagaaaataagaaacttctctgatttagtaagtagctacaggatctatgaagaagatacaaaatctcattacaaggtgatgagtgag 18259903  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18259902 cgtaggggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggacag 18259803  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18259802 atgctcctactaatattgtttgctttaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 18259703  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 371  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18259702 aggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatca 18259632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16151193 - 16150655
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16151193 attgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 16151094  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16151093 ggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 16150994  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16150993 tcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 16150894  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||   | || || || ||||| |  ||| | || | | | || ||||||||||| |    
T  16150893 cacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaa 16150794  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgca-atcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| ||||| | | || | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16150793 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccact-agtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgcta 16150695  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16150694 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 16150655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16155339 - 16154801
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16155339 attgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 16155240  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16155239 ggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 16155140  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16155139 tcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 16155040  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||   | || || || ||||| |  ||| | || | | | || ||||||||||| |    
T  16155039 cacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaa 16154940  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgca-atcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| ||||| | | || | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16154939 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccact-agtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgcta 16154841  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16154840 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 16154801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 3261506 - 3262047
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  3261506 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 3261605  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3261606 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 3261705  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  3261706 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 3261805  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  3261806 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 3261905  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3261906 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 3262005  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3262006 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 3262047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 11203944 - 11204485
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  11203944 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 11204043  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  11204044 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 11204143  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  || |||||||||||||||| |||     
T  11204144 tgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaag 11204243  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| | ||| | | || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || |||||||||| |||  ||||| |  |||| || |||| ||    
T  11204244 ggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaaaaaggcta 11204343  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11204344 gaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 11204443  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11204444 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 11204485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7357827 - 7357286
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||| | |||||||||     
T  7357827 gctattgggtatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaggctcattacaagataatgagtgaga 7357728  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  7357727 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 7357628  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    |||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  7357627 tgctcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttatggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 7357528  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| | |||  ||||| |  |||| ||||||| ||    
T  7357527 ggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggcta 7357428  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | ||  |||| ||||||||||| |||||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7357427 gaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 7357328  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7357327 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 7357286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 29450248 - 29450790
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| |  || || |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  29450248 ggctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaataggtgcaaaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgag 29450347  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     | || || ||||||||||||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | |||||| ||||||||||    
T  29450348 aggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcctaagaggagag 29450447  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||    
T  29450448 atgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaggagatgataggaagtgtttcaggtgtggtcagaa 29450547  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| |||| |||  ||||| |  |||| ||||||  |    
T  29450548 gggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagact 29450647  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29450648 agaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 29450747  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29450748 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 29450790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 44658581 - 44659119
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  44658581 attggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 44658680  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |   ||  | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  44658681 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaaaggaaagcagaagatgggtcatgataggaggcccaagaggagagatgc 44658780  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  44658781 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 44658880  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |  ||| ||||||| | |||  ||||| |  | || ||||||  ||| |    
T  44658881 cacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttcacagtgtcctgaaccgaagaagactagaa 44658980  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||| | |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44658981 ctggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 44659080  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44659081 tatagatactggtgctactcattgttttattgctattga 44659119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27903936 - 27903409
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||   ||    |    
T  27903936 tatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtaagatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgagcgagaagaggaata 27903837  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    |||| ||    |||||   |||||| || | ||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||      
T  27903836 agggccagagtagtcgcccgaagccctacaatgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgctcctgt 27903737  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||        
T  27903736 tgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcagaaaggtcatgtg 27903637  T
Q  311 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 410  Q
    || | ||| || |||||||| || |||||||| || ||||  || ||||| ||  | || | |||  |||| ||||| ||||||||||| || ||  | |    
T  27903636 ttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggcaacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgag 27903537  T
Q  411 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 510  Q
    | || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27903536 gaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 27903437  T
Q  511 tactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  27903436 cactggtgctactcattgtttcattgct 27903409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 538
Target Start/End: Original strand, 51603552 - 51604040
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  51603552 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 51603651  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  51603652 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 51603751  T
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 348  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  51603752 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtgtgctataa 51603850  T
Q  349 cttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 448  Q
     |  || || || || || |||| | |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  51603851 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 51603950  T
Q  449 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51603951 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 51604040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 538
Target Start/End: Original strand, 53750230 - 53750718
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  53750230 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 53750329  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  53750330 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 53750429  T
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 348  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  53750430 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataa 53750528  T
Q  349 cttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 448  Q
     |  || || || || || |||| | |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  53750529 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 53750628  T
Q  449 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53750629 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 53750718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8709234 - 8708953
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8709234 attggttatcagaagattaggcaattttttgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggatatcaaagctcattacaaggttatgagtgagcgga 8709135  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || || ||  |||||  |||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||     
T  8709134 ggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagctctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaatagatgt 8709035  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||||||||    
T  8709034 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgaaaagaagtgcttc 8708953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13879642 - 13879413
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  13879642 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 13879543  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
     |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  13879542 cgaagccctacagtgctcctgatgacaaagggtagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgtttctactgagattgtttgttacaa 13879443  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13879442 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgt 13879413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14697247 - 14697119
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || | |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14697247 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 14697148  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14697147 gtgctacacattgttttattgctattgat 14697119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14697599 - 14697401
Alignment:
Q  64 agaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaag 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||||||    
T  14697599 agaggataccaaagctcattacaaagttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaag 14697500  T
Q  164 catagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |  | || ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14697499 caaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctactgctgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 14697401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 8050534 - 8050611
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8050534 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 8050611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8389513 - 8389436
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8389513 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 8389436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12479701 - 12479624
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12479701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 12479624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 14300890 - 14300967
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14300890 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 14300967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14683668 - 14683591
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14683668 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgct 14683591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 15354234 - 15354291
Alignment:
Q  448 tgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctatt 505  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15354234 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16233980
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 16233980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 17092060 - 17092137
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17092060 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 17092137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19635237 - 19635160
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19635237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 19635160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775781
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 19775781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958771
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 23958771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27714437 - 27714360
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27714437 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27714360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513374
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgct 13513374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350542
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgct 16350542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 40476141 - 40476064
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  40476141 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 40476064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 14300485 - 14300585
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  14300485 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 14300584  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  14300585 a 14300585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16029
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgat 16029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14162571 - 14162488
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  14162571 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgat 14162488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224434
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgct 18224434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 528
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13513781 - 13513650
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||| ||  |||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  13513781 aagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaact 13513682  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  13513681 gtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 13513650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8570 - 8336
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  8570 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgt 8471  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  8470 cctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctataaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 8371  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8370 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 18224123 - 18224185
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18224123 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagtgtaatgtttgt 18224185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 262
Target Start/End: Original strand, 18604302 - 18604531
Alignment:
Q  33 ctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggc-aagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  | | |||| | | || | ||||| || ||||||||    |    
T  18604302 ctgatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccatagctcattacaaggttgttaatgagagga-agactaagggccagcagagtcgcccta 18604400  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    |||| |||| |||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| ||||||| || ||    
T  18604401 agccttataatgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaactg 18604500  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18604501 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 18604531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19635648 - 19635542
Alignment:
Q  47 agttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgccc 146  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||| ||   |||||||| |||||||    
T  19635648 agttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagttgtcctaagccgtacagtgccc 19635549  T
Q  147 ctgctga 153  Q
    | |||||    
T  19635548 ccgctga 19635542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14163027 - 14162942
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  14163027 attggttaccagaagatccgaaatttttcagagctggtgagcagttgcaggatttatgaaaaggatactaaggctcactacaaggt 14162942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 483 - 536
Target Start/End: Original strand, 15144825 - 15144878
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  15144825 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattg 15144878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219206
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgat 16219206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222526
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgat 16222526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 544
Target Start/End: Original strand, 18546794 - 18546873
Alignment:
Q  465 gaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||||    
T  18546794 gaggtacttgtttcgtcaacaatttccctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgat 18546873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 16248326 - 16248388
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||| ||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16248326 gatgctccaactgagattacatgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 16248388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Original strand, 15514 - 15743
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  15514 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgt 15613  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||| | || ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  15614 cctaagacttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 15713  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 257  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15714 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 15743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 12798202 - 12798742
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12798202 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctctttacaaggtgatgagtgag 12798301  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12798302 cgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggctcaagaggagag 12798401  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12798402 atgctcatactgatattgtttgtttcaagtgtgg---aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 12798498  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  12798499 aggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacacagcctaagaaggct 12798598  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12798599 aggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 12798698  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12798699 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 12798742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19150562 - 19150019
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19150562 ggctattggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 19150463  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19150462 cgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 19150363  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19150362 atgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 19150263  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |    
T  19150262 aggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggct 19150163  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||| |||||| || || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19150162 aggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 19150063  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19150062 ctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgat 19150019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20749961 - 20749418
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20749961 ggctattggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 20749862  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20749861 cgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 20749762  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20749761 atgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 20749662  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |    
T  20749661 aggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggct 20749562  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||| |||||| || || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20749561 aggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 20749462  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20749461 ctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgat 20749418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 65 - 544
Target Start/End: Original strand, 15099365 - 15099844
Alignment:
Q  65 gaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagc 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15099365 gaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgacgccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagc 15099464  T
Q  165 atagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtga 264  Q
    | || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15099465 agaggttaaatgatgggaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtga 15099564  T
Q  265 ccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggt 364  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||    
T  15099565 tagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggt 15099664  T
Q  365 catatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatca 464  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  15099665 catatcagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatca 15099764  T
Q  465 gaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15099765 gatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgat 15099844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 14260944 - 14261487
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14260944 ggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatcagtgag 14261043  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||     
T  14261044 cgcaaaggtaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagtagagactgaatgatgagaggaggcctaaggggagat 14261143  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||    
T  14261144 atgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgcgtcatcgagatgagaagaagtactttaggtgtagtcagaa 14261243  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  14261244 aggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtttatgcagcctaagaaggtt 14261343  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14261344 aggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattg 14261443  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14261444 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 14261487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 16947174 - 16947712
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16947174 attgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcagaatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaa 16947273  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || |||||||| |||||||||   || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16947274 ggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 16947373  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||    
T  16947374 tccagttgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtgttaggtgtggtcagaaagga 16947473  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||  ||||||  ||||  ||||||| ||| |    
T  16947474 cacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagagggtcatatcagttcacagtgtattcagctgaagaaggctagaa 16947573  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||| | |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16947574 ccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctat 16947673  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16947674 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 16947712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13024894 - 13024359
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  13024894 gctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgaga 13024795  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||  ||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13024794 ggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 13024695  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||   || |||||| ||| || ||||||||||||  ||||    
T  13024694 tgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttatggtagatatgagaggaaatgtttcaggtgtggttagaaa 13024595  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  13024594 ggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggcta 13024495  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13024494 ggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaat-agactcctttaattgc 13024396  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13024395 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 13024359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13676992 - 13676460
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||      |    
T  13676992 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgtgt------a 13676899  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||  |||| ||||||| |   || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13676898 gaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 13676799  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  ||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  13676798 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtggacagaaggga 13676699  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||  ||||| | || || ||||||||||| |    
T  13676698 cacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaa 13676599  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13676598 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 13676499  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13676498 tatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattga 13676460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 543
Target Start/End: Original strand, 14283103 - 14283614
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||    |||||||| ||||||||   ||    
T  14283103 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataagggacagcagagtcgcccga 14283202  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  14283203 agccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagactcaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtg 14283302  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  14283303 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtgg 14283401  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     ||  |||| || || |||| |||||| || ||||||||||   |  ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  14283402 tgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgact 14283501  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14283502 ggtacgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtt 14283601  T
Q  531 tcattgctgttga 543  Q
    |||||||| ||||    
T  14283602 tcattgctattga 14283614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 11385131 - 11385664
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11385131 attggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaagatgatgagtgagcgga 11385230  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || |||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11385231 ggggtaagggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 11385330  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11385331 tcctgctgagatagtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 11385430  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||| |||  |||| || || || |||||| |||| |    
T  11385431 cacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcaaccaaagaagattagaa 11385530  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11385531 ctggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 11385630  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11385631 tatagacactgatgctactcattgtttcattgct 11385664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21755962 - 21755421
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||| | |||||||||     
T  21755962 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacatcaaagctcattacaagataatgagtgaga 21755863  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  21755862 ggaggggtaagggacaacaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaatatgagtgatgacatgaggcctaagaggagaga 21755763  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||     
T  21755762 tgctccctctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaag 21755663  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |  ||  ||||| |  |||| ||||||||||    
T  21755662 ggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagctcacagtgtcctgagccgaagaaggtta 21755563  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21755562 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 21755463  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21755462 tattattgatattggtgctactcattgttttattgctattga 21755421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12460179 - 12459637
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||   || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12460179 ggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgag 12460080  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     | || || |||||||| |||||||||   ||||| || | ||| | ||||||||| || ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12460079 aggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagag 12459980  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||| || || |||||||||| |||    
T  12459979 atgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaa 12459880  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||     
T  12459879 gggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggtc 12459780  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||| || || || |||||||  ||||   |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12459779 aggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 12459680  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12459679 ctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattga 12459637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 26091497 - 26092038
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  26091497 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 26091596  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  26091597 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 26091696  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  26091697 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 26091796  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  26091797 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 26091896  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26091897 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 26091996  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26091997 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 26092038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 543
Target Start/End: Original strand, 40924573 - 40925057
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  40924573 tatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaag 40924672  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    | ||||| |   ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40924673 gaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 40924772  T
Q  259 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 358  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |    
T  40924773 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggg 40924872  T
Q  359 gaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 458  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||    
T  40924873 gaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgac 40924972  T
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40924973 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 40925057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 49155794 - 49155310
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  49155794 tatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaag 49155695  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    | ||||| ||  ||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49155694 gaaagcagaggatgggtgaggataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 49155595  T
Q  259 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 358  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |    
T  49155594 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggg 49155495  T
Q  359 gaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 458  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||    
T  49155494 gaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgac 49155395  T
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49155394 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 49155310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 26115292 - 26115830
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  26115292 attggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 26115391  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || |||||| |||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26115392 ggggtaagggataacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcccaagaggagagatgc 26115491  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  26115492 tccggctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 26115591  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| | | |  ||||| |  | || ||||||  ||| |    
T  26115592 cacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaa 26115691  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26115692 ctggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 26115791  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26115792 tattgatattggtgctactcattgttttattgctattga 26115830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 13965367 - 13965908
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||| || | |||||||||     
T  13965367 gctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgttggatttatgaagaagacaccaaagctcattaccagataatgagtgaga 13965466  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13965467 ggaggggtaagggacaacataatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 13965566  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||| |  || |||||||||||||||| |||     
T  13965567 tgctcctgctgagattgattgctacaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaag 13965666  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| | ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || |||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||| ||    
T  13965667 ggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggcta 13965766  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13965767 gaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 13965866  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13965867 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 13965908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Original strand, 12203502 - 12204041
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||   |    
T  12203502 attggttatcagaagatcaaacaattttctgagttagtgagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagttcattataaggttatgagtgagaaga 12203601  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||  || || ||  |||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  12203602 ggaacagaggccagcaaggtcgtcctaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgt 12203701  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||  |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  12203702 tcctgctgtgattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgcttctgatgtgggaagaaaggg 12203801  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||  || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | |  ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  12203802 catacgatagctgaatgcaagcgtgatgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggctcaga 12203901  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  ||||  |  | || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12203902 caggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctat 12204001  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12204002 tatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgat 12204041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 538
Target Start/End: Original strand, 18050700 - 18051188
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||| ||      
T  18050700 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgctccga 18050799  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  18050800 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 18050899  T
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 348  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| || || ||    
T  18050900 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgttataa 18050998  T
Q  349 cttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 448  Q
     |  || || || ||||| |||| | |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  18050999 ttgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 18051098  T
Q  449 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18051099 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 18051188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14145165 - 14144917
Alignment:
Q  48 gttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccc 147  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  14145165 gttgcaggatctatgaggagggcaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 14145066  T
Q  148 tgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 247  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  14145065 tgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccatataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtatggcgagaaaggccac 14144966  T
Q  248 aagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 296  Q
    |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  14144965 aagagtaacgtttgt-accaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtggtc 14144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 485
Target Start/End: Original strand, 12712437 - 12712845
Alignment:
Q  77 gctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||  || || |||||  || ||||||    
T  12712437 gctcattccaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatg 12712536  T
Q  177 atgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaa 276  Q
    ||||||  || |||||| | |||||  |||||  ||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||    
T  12712537 atgagagaagacccaagggaagagacactcctgttgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaa 12712636  T
Q  277 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcg 376  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||     
T  12712637 gaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgatattgtatgctataactgcaatggggagggtcatatcaattct 12712736  T
Q  377 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtt 476  Q
     |||| || || |  ||||||||||||||  | || || |||||||| ||| |  |||||||| |    ||| | ||  |||||||||||||||||||||    
T  12712737 cagtgcactcaacggaagaaggttaggaccagcgggaaagtgtttgccttggcgggtacgcaaaccacaaatcaagatagacttatcagaggtacttgtt 12712836  T
Q  477 tctttaata 485  Q
    |||||||||    
T  12712837 tctttaata 12712845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 386 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14140845 - 14140693
Alignment:
Q  386 cagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaata 485  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140845 cagccgaagaaggttagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaata 14140746  T
Q  486 atactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14140745 gtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 14140693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 416 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15343567 - 15343445
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15343567 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 15343468  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15343467 gtgctactcattgtttcattgct 15343445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15628070 - 15627820
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||||||   |||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |    
T  15628070 attggatatcagaagatccaaaaaatttctgaattggtaagtagttgccggatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttatgaatgagagga 15627971  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     | | ||| | ||||| ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||| |  | || |||| |    
T  15627970 aaagtaagagtcaacaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacaaagggtgaatgatgagaagaggcctagaaagaaagatac 15627871  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    |||| ||||  ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15627870 tcctgctgaagttgtttgctacaactgtggtgagaaaggccacaagagtaa 15627820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13005012 - 13004783
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| || |   ||||||| ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  13005012 attggttatcagaagatcaggattctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgga 13004913  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||  || |||||| | |||||  |    
T  13004912 ggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggcaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaagggaagagacac 13004813  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 234  Q
    |||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  13004812 tcctgctgagatagtttgctttaagtgtgg 13004783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15627659 - 15627531
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  | || | |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15627659 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactg 15627560  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15627559 gtgatacgcattgttttattgccgttgat 15627531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 11550282 - 11550365
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  11550282 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgat 11550365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8710695 - 8710618
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8710695 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 8710618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13689131 - 13689054
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13689131 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 13689054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14335486 - 14335409
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14335486 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 14335409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957567
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgct 14957567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 44788531 - 44788608
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44788531 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 44788608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 262
Target Start/End: Original strand, 17703224 - 17703436
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    || || ||||||||||||     
T  17703224 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttatagtgccccta 17703323  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  17703324 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaa 17703423  T
Q  250 gagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||||||||    
T  17703424 gagtaatgtttgt 17703436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591377
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgct 9591377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 11234393 - 11234470
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11234393 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgct 11234470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 15158237 - 15158314
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15158237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 15158314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703712
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgct 17703712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 18587351 - 18587428
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18587351 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 18587428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 15157832 - 15157932
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  15157832 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 15157931  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  15157932 a 15157932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 262
Target Start/End: Original strand, 16726210 - 16726422
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    || || || |||||||||     
T  16726210 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcgaaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttaaagtgccccta 16726309  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    |||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  16726310 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaa 16726409  T
Q  250 gagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||||||||    
T  16726410 gagtaatgtttgt 16726422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11984510 - 11984281
Alignment:
Q  33 ctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaa 132  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||    
T  11984510 ctgatttggttaacagttgtaggatctacgaagaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaa 11984411  T
Q  133 gccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgt 232  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| |   |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||    
T  11984410 gccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgt 11984311  T
Q  233 ggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11984310 ggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11984281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14043217 - 14043084
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || ||||||||| ||     
T  14043217 ttttctgatctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtc 14043118  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaa 162  Q
      ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  14043117 caaagccttatagtgctcctgctgataagggtaa 14043084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14353247 - 14353114
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || ||||||||| ||     
T  14353247 ttttctgatctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtc 14353148  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaa 162  Q
      ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  14353147 caaagccttatagtgctcctgctgataagggtaa 14353114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16726621 - 16726698
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  16726621 atcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgct 16726698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18180833 - 18180756
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18180833 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 18180756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13689536 - 13689436
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| |||    
T  13689536 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacaccagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctactg 13689437  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  13689436 a 13689436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9591784 - 9591653
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||| ||  |||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  9591784 aagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaact 9591685  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  9591684 gtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 9591653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042702
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 14042702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352732
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 14352732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12690591 - 12690515
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  12690591 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattat-tatactagtgctactcattgctttattgct 12690515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 544
Target Start/End: Original strand, 15146133 - 15146186
Alignment:
Q  491 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  15146133 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgat 15146186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 11233988 - 11234088
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  11233988 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 11234087  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  11234088 a 11234088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18181238 - 18181138
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| ||||    
T  18181238 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcttcctaagccgtacagtgcccccgctg 18181139  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  18181138 a 18181138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 544
Target Start/End: Original strand, 38330 - 38409
Alignment:
Q  465 gaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||||    
T  38330 gaggtacttgtttcatcaacaatttccctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgat 38409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 15145647 - 15145795
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||| |||  |||| |||||||| ||||| | ||| || ||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  15145647 attggttaccagaagattcgaatcttttatgagctggtgagcagttgcaggatctttgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaa 15145746  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
      | |||||| ||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||    
T  15145747 aggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttatagtccccctgctga 15145795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5228
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5770 ggctattggttatcagaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctacaagatttatgaagaggataccaaagctcattacaaagtgatgagtgag 5671  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5670 catagagtcaagggacagcagagtcatcggaagccgtacagtgcccctactgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcc-aagaggagag 5572  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5571 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 5472  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5471 aggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaagtct 5372  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5371 aggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattg 5272  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5271 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 5228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 63253 - 63776
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63253 ggctattggttatgagaagataagaaacttttctgaattggtaagtagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 63352  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||                    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  63353 cgtagaggcaaggtacagcagagtc--------------------cctgctgacaagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagag 63432  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  63433 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgataaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaa 63532  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  63533 aggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggtt 63632  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  63633 aggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattg 63732  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  63733 ctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgat 63776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 70698 - 70155
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  70698 ggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgag 70599  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  70598 cgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 70499  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  70498 atgctcctactgagattatttgctttaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaa 70399  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  70398 aggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggtt 70299  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  70298 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattg 70199  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70198 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 70155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 473 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60786
Alignment:
Q  473 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 60786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34923 - 34385
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34923 attggttattagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 34824  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34823 gaggcaagggacagcagagtcgtccgaagctgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcaaaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 34724  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34723 tcctactgacattgtttgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaagga 34624  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34623 cacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttagga 34524  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34523 caggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctat 34424  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34423 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 34385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 21738819 - 21739362
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21738819 ggctattggctatcaaaaggtaaggaatttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgac 21738918  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21738919 cgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagcgcccatgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 21739018  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
     |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21739019 gtgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 21739118  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21739119 aggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacggagcctaagaaggtt 21739218  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21739219 aggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattt 21739318  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739319 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 21739362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 22015528 - 22016071
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22015528 ggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagttacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 22015627  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||    
T  22015628 cgtaggggaaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagaataaatgatgagaggaggccaaagaagagag 22015727  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22015728 atgctcctacaaatattgtttgattcaagtgtggagaaaaaggccaaaaaagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 22015827  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| |||||||||    
T  22015828 aggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcatattagtttgcagtgtacgcagccgaagaaggtt 22015927  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22015928 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattg 22016027  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22016028 ctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgat 22016071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 21742335 - 21742878
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742335 ggctattggttatgagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 21742434  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21742435 cgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctactgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 21742534  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21742535 atgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 21742634  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21742635 aggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggtt 21742734  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21742735 aggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattg 21742834  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21742835 ctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 21742878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 19857877 - 19857346
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19857877 attggctatcagaagattagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaagatctatgaagaggatactaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgca 19857778  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19857777 gaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 19857678  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19857677 ttctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 19857578  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||| ||    
T  19857577 cacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttatga 19857478  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    |  |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19857477 ccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctat 19857378  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857377 tatagatactggtgctactcattgtttcattg 19857346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 24096399 - 24096940
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24096399 gctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgacgagtgagc 24096498  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24096499 gaagaagtaagggacaacagagtcgtcctaaaccttatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 24096598  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  24096599 tgctcctgttgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaa 24096698  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  24096699 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagccgaagaaggcta 24096798  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24096799 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 24096898  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24096899 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattga 24096940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 536
Target Start/End: Original strand, 20832684 - 20833218
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20832684 ggctattggataccagaaaattagaaacttttcgaagttggtgagcagctgtagaatctatgaataagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgac 20832783  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   || |  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20832784 cgtagaggcaagggacagcagagtcgtcctaaaca-tatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagag 20832882  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||  |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  20832883 atgctcctgttgatattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaattgtttcaggtgtggtcagaa 20832982  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| || | |||||||    
T  20832983 aggacacacactagctgattgcaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggaaggtt 20833082  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||| ||| | || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20833083 aggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattg 20833182  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20833183 ctattatagacactggtgctactcattgtttcattg 20833218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 38909610 - 38910151
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||| |     
T  38909610 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtggga 38909709  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38909710 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 38909809  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  38909810 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 38909909  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  38909910 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 38910009  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38910010 gaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 38910109  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38910110 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 38910151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 52989346 - 52988806
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||     
T  52989346 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaa-taatgagtgaga 52989248  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| || | ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  52989247 ggaggggtaagggacagcaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 52989148  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||     
T  52989147 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaag 52989048  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||| |||  | ||| |  | || ||||||||||    
T  52989047 ggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacaatgtcctgaaccgaagaaggtta 52988948  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52988947 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 52988848  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52988847 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 52988806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 31536781 - 31537322
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  31536781 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 31536880  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  31536881 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 31536980  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  || |||||||||||||||| |||     
T  31536981 tgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaag 31537080  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| ||||| | |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  31537081 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 31537180  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31537181 gaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 31537280  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31537281 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 31537322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48426479 - 48425938
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  48426479 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 48426380  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  48426379 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 48426280  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  48426279 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 48426180  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  48426179 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 48426080  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48426079 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 48425980  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48425979 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 48425938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21961631 - 21961135
Alignment:
Q  4 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 103  Q
    |||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  21961631 tattgggtatcagcagatcagagtcttctctgaattggtaaacagatgcataatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagg 21961532  T
Q  104 agaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 203  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21961531 agaggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctccttctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatg 21961432  T
Q  204 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21961431 ctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggg 21961332  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||| |||| ||||  |  |||| |||||||||||     
T  21961331 acacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgccctgagccgaagaaggttaga 21961232  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21961231 actggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 543
Target Start/End: Original strand, 20074541 - 20075034
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || |||||  |||    
T  20074541 tgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgcttctg 20074640  T
Q  150 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 249  Q
    ||||||| || ||||| |   ||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20074641 ctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcttaagaggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaa 20074740  T
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaac 349  Q
    ||| |||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20074741 gagcaatgtttgtagtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaac 20074840  T
Q  350 ttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatg 449  Q
    | ||| |  || ||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||||  |    ||||    
T  20074841 tgcaatggagagggtcatatcaattcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatg 20074940  T
Q  450 aggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20074941 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 20075034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 59 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37680598 - 37680114
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||| ||||||| |    
T  37680598 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaag 37680499  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    | ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37680498 gaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatactcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 37680399  T
Q  259 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 358  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |      
T  37680398 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatgga 37680299  T
Q  359 gaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 458  Q
    ||||||||||| | |||  ||||| |  |||| | ||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||    
T  37680298 gaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagac 37680199  T
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  37680198 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattga 37680114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20297962 - 20297446
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||     
T  20297962 ttttctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacatcagaatcgtc 20297863  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
      ||||| || ||||| ||| ||||||| || || || |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  20297862 ctaagccttacagtgctcctactgacaagggaaaacagaagatgggtgatgacaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaa 20297763  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 328  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||   ||| ||| || ||||||    
T  20297762 gtgtggtgagaaatgccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgt 20297663  T
Q  329 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttga 428  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| | ||| |||||| |  || | ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  20297662 ggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcatagtgtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttga 20297563  T
Q  429 -ctcgtacgcaatcagt--gaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 525  Q
     || ||     | || |   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297562 gctggt-tattaccactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactca 20297464  T
Q  526 ttgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  20297463 ttgttttattgctattga 20297446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18273346 - 18273114
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  18273346 ttttctgaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 18273247  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
     |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  18273246 cgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgttacaa 18273147  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 261  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18273146 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 18273114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 20853547 - 20854080
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||   |    
T  20853547 attggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgagaaaa 20853646  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||| || |||| || || || |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||    
T  20853647 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgc 20853746  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||     
T  20853747 tcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggt 20853846  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || |  || | ||| || |||||||| || || ||||| |  || |    ||| || || || || |  ||| |||| ||||| ||||||||||| || |    
T  20853847 catatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggccacattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaa 20853946  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    |  | || ||||| || ||||||||| |||| ||  |    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20853947 cttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 20854046  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20854047 tatagacactggtgctacgcattgtttcattgct 20854080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18710586 - 18710450
Alignment:
Q  407 ggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctatta 506  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18710586 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 18710487  T
Q  507 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18710486 taaacactggtgctactcattgtttcattgctattga 18710450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16379255 - 16379127
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||  |  | ||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16379255 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattg 16379156  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16379155 gtgctacgcattgttttattgctattgat 16379127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16379642 - 16379409
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||     
T  16379642 ttttctgagctggtgagcagatgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagggtcaacagagtcgtc 16379543  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
      ||||| || |||||| ||||||| || || || || ||| | |||||||||| |||||| |  | || ||||| |  | |||| |||||||| |        
T  16379542 ctaagccttacagtgcctctgctgataagggcaaacagagagttaatgatgagaggaggccgagaaagaaagatgttgttgctgagattgtttgctatgc 16379443  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16379442 ttgtggtgagaaaggccacaaaagtaatgtttgt 16379409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 522
Target Start/End: Original strand, 21045322 - 21045428
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || | |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21045322 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 21045421  T
Q  516 gtgctac 522  Q
    |||||||    
T  21045422 gtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16347838 - 16347915
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16347838 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 16347915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042335
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgct 17042335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21842370 - 21842245
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||  |  | |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21842370 tttgctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 21842271  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||    
T  21842270 ctacgcattgttttattgcttttgat 21842245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 51330735 - 51330812
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51330735 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 51330812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 21228469 - 21228600
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  21228469 aagccctatagtgcccctgctgataagggtaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaact 21228568  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21228569 gtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 21228600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 538
Target Start/End: Original strand, 24785058 - 24785177
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  24785058 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtg 24785157  T
Q  519 ctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  24785158 ctacacattgttttattgct 24785177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21833418 - 21833348
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21833418 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 21833348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388349
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 33388349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 22496499 - 22496576
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22496499 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22496576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 41350911 - 41350988
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  41350911 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 41350988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21752080
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgat 21752080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 16347433 - 16347542
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16347433 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16347532  T
Q  153 acaacggtaa 162  Q
    |||| |||||    
T  16347533 acaagggtaa 16347542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 16354081 - 16354190
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16354081 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16354180  T
Q  153 acaacggtaa 162  Q
    |||| |||||    
T  16354181 acaagggtaa 16354190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081696
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgct 20081696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 21228799 - 21228876
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21228799 atcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 21228876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22401708 - 22401631
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| ||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22401708 atcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19109484 - 19109408
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  19109484 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgc 19109408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 51330330 - 51330430
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  51330330 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 51330429  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  51330430 a 51330430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 516
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 21044941 - 21045118
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| | || | |    
T  21044941 attggttaacagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaataagagga 21045040  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgaga 182  Q
     ||||||||| || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||    
T  21045041 aaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggcaagcaaagagttaatgatgaga 21045118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21833823 - 21833723
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  21833823 aggatctatggagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 21833724  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  21833723 a 21833723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Original strand, 41350512 - 41350615
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  41350512 tatgaagaggatacgaaggcttactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagg 41350611  T
Q  159 gtaa 162  Q
    ||||    
T  41350612 gtaa 41350615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19109837 - 19109791
Alignment:
Q  107 ggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  19109837 ggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 19109791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20922011 - 20921929
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaa 87  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20922011 attggatatcagaagatccgtaactttactgaactagtgagcagttgcagaatctatgaagaggataccaaagcacattacaa 20921929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 24784839 - 24784901
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24784839 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 24784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Original strand, 17041929 - 17042057
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| |||||||||| |    
T  17041929 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagatt-tttgtttcaact 17042027  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 260  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  17042028 gtggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 17042057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30210 - 29671
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30210 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 30111  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30110 gaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgt 30011  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  30010 tcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaaggga 29911  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |  | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  29910 cacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttagga 29811  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29810 caggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 29711  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29710 tatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgat 29671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 538
Target Start/End: Original strand, 64347 - 64853
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  64347 tctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 64446  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  64447 aaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtg 64546  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||||||    
T  64547 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtgg 64645  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| | |||  |||| || || || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||| ||    
T  64646 tgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggct 64745  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  64746 ggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 64845  T
Q  531 tcattgct 538  Q
    ||||||||    
T  64846 tcattgct 64853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 538
Target Start/End: Original strand, 48904 - 49431
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  48904 tatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggta 49003  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |    
T  49004 agggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgc 49103  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacac 309  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49104 tgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacac 49202  T
Q  310 tttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggt 409  Q
      ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| | |||  |||| || || || ||||||||||| || |||    
T  49203 actagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggt 49302  T
Q  410 ggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatag 509  Q
     | || |||||||||||| || |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49303 aggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 49402  T
Q  510 atactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49403 acactggagctactcattgtttcattgct 49431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 538
Target Start/End: Original strand, 57938 - 58465
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  57938 tatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggta 58037  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |    
T  58038 agggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgc 58137  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacac 309  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  58138 tgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacac 58236  T
Q  310 tttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggt 409  Q
      ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| | |||  |||| || || || ||||||||||| || |||    
T  58237 actagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggt 58336  T
Q  410 ggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatag 509  Q
     | || |||||||||||| || |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58337 aggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 58436  T
Q  510 atactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  58437 acactggagctactcattgtttcattgct 58465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 4018 - 4561
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  4018 ggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagttgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtgag 4117  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4118 cgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 4217  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4218 atgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaagactacaaaagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 4317  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4318 aggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggtt 4417  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  4418 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattt 4517  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4518 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1567
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1025 ggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 1124  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1125 cgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagag 1224  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1225 atgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 1324  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1325 aggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggtt 1424  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||| | | |||  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1425 aggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 1524  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1525 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 1567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8334 - 7792
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8334 ggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 8235  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8234 cgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagag 8135  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8134 atgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 8035  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8034 aggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggtt 7935  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||| | | |||  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7934 aggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 7835  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7834 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 7792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 43288 - 42753
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  43288 ggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaagatctatgatgaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtaag 43189  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||  |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43188 cgccgaggcaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 43089  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  43088 atgctcctactgagataatttgtttcaagtgttgtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtagtcagaa 42989  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  || |  ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  42988 aggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaagatt 42889  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42888 aggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttg 42789  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42788 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 42753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 50519 - 50596
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50519 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 50596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Original strand, 601 - 1140
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  601 attggttatcagaaaaaaagaaatttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacaacaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 700  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  701 gaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccgtataatgctcctgctgacaagggtaagaagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 800  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  801 tcctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 900  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  901 tacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttagga 1000  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1001 ctggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1100  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1101 tatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgat 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 37528 - 36986
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| |||  || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37528 gctattggatatcagaaaattagaaacttttatgagctgttaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaac 37429  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37428 gtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcttgccgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 37329  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
      |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37328 cactcctactgatattttttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaag 37229  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  37228 ggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggtta 37129  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||   ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37128 ggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 37029  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37028 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgat 36986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Original strand, 533 - 1072
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  533 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttctgaggaagataccaaagctcattacaaggtgatgagtgaacata 632  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  633 gaggcaagggacagcaaagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaaggggaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 732  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  733 tcctacggacattgattgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaggga 832  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  833 cacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatcagttcgcagtgtacgcagccaaagaaggttagga 932  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  933 ctggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctat 1032  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1033 tatagacactagtgctactcattgttttattgctattgat 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Original strand, 62486 - 62950
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62486 ggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 62585  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  62586 cgtagaggcaaggggcagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 62685  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  62686 atgctcctactgatattgtttaattcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccatgatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 62785  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  || ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  62786 agtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaagtt 62885  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcag 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  62886 aggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 538
Target Start/End: Original strand, 65211 - 65549
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 299  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  65211 gatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcaga 65310  T
Q  300 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 399  Q
    |||||||||| || | | |||||||| | || ||  ||||||| || || |   | |||||||| || |||| |||  |||| || ||||| ||||||||    
T  65311 aaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggt 65410  T
Q  400 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaatt 499  Q
    |||||| ||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  65411 taggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaatt 65510  T
Q  500 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  65511 gctattatagacactggtgctactcattgtttccttgct 65549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 65040 - 65214
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  65040 attggttatcagaaaatcagaaatttctctgagttggtgagtagctgcagaatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaa 65139  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatg 179  Q
    |    || ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||    
T  65140 ggaataatggacaacagagtcgcccgaagccatatagtgcccctgctgataagggcaagcagagactgaatgatg 65214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 43133 - 43676
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43133 ggctattggttatcaaaagataaggaatttctcagatttggtaagcagctgtaggatatattaagaggataccaaatgtcattacaaggtgatgagtgag 43232  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||||| ||| || |||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43233 cgcagaggtaagggacaacagagtcgtccaaaactgtatagtgctccttctaacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 43332  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  43333 atgctcctaatgagattgtctgtttcaagtgtcgtgaaaagggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaa 43432  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |   | || || |||||||| |  ||| |||| | | |||| |||||||||    
T  43433 aggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagagggtcatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaaggtt 43532  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43533 cggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 43632  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43633 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 43676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274243
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23274785 ggctattggttatcagaaaataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtgaa 23274686  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23274685 cgtaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagcagtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagag 23274586  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23274585 atgctcctactgaaattgtttgcaacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaa 23274486  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||  |||| || || || |||||||||    
T  23274485 gggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgcacacaaccgaagaaggtt 23274386  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||| |||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23274385 aggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 23274286  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23274285 ctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattga 23274243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 19716272 - 19716810
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19716272 attggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaa 19716371  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||   || || || ||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19716372 gaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 19716471  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19716472 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 19716571  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || ||||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  19716572 cacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaa 19716671  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19716672 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 19716771  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19716772 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 19716810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 535
Target Start/End: Original strand, 19720835 - 19721365
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19720835 attggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaa 19720934  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||   || || || ||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19720935 gaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 19721034  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19721035 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 19721134  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || ||||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  19721135 cacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaa 19721234  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19721235 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 19721334  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcatt 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721335 tatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20848777 - 20848239
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  20848777 gctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgaga 20848678  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||   |||||||||||||    
T  20848677 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggat--ccaagaggagaga 20848580  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  20848579 tgctcctgttgagattgtt-gctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 20848481  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  20848480 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 20848381  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20848380 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 20848281  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20848280 tattatagatactggtgctactcattgttttattgctattga 20848239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 538
Target Start/End: Original strand, 23097274 - 23097806
Alignment:
Q  6 ttggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtag 105  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || || || || || || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23097274 ttggctatcagaagatcagaactttttctgagtttgtaagtagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggag 23097373  T
Q  106 aggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgct 205  Q
    ||| || | ||| |||||||     |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23097374 aggtaaagcacatcagagtctccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgct 23097473  T
Q  206 cctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggac 305  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23097474 cctgctgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatcagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggac 23097573  T
Q  306 acactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggac 405  Q
    |||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||| |||  |||| || ||||| |||||| |||| ||    
T  23097574 acacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaac 23097673  T
Q  406 aggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctatt 505  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23097674 tggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctatt 23097773  T
Q  506 atagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23097774 atagacactggtgctactcattgtttcattgct 23097806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12577517 - 12577008
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||| ||||| ||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||     
T  12577517 ttttctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtc 12577418  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
      || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || ||    
T  12577417 ctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaa 12577318  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 327  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| |||||    
T  12577317 gtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcg 12577219  T
Q  328 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttg 427  Q
     || ||  |||| ||||| || |  || || || ||||| |||| | |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||    
T  12577218 cggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttg 12577119  T
Q  428 actcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    ||| |||| ||  | |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12577118 actggtacacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 12577019  T
Q  528 gtttcattgct 538  Q
    |||||||||||    
T  12577018 gtttcattgct 12577008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28351063 - 28350670
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |  | |||||| |    
T  28351063 attggctatcagaagatcagacaattttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagtggatacgatagctcactataaggttagtaatgagcgga 28350964  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   |||||| || ||  |||||  |||||| |||||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  28350963 ggaacaagggtcagcaaggtcgtccgaagccctatagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgt 28350864  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  28350863 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 28350764  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaagg 398  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| ||| |||| |||| | | ||||||||||||    
T  28350763 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctcagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 28350670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21901725 - 21901386
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   |    
T  21901725 attggttaccaaaagatcagacaattttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaatctcattataaggttatgagtgagaaga 21901626  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || || ||  ||| |  |||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||     
T  21901625 ggaacaaaggccatcaaggtcatccgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgt 21901526  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  21901525 tcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 21901426  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgct 344  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||    
T  21901425 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgct 21901386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 387 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23113528 - 23113372
Alignment:
Q  387 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataa 486  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||  |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23113528 agcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggaacacaggcagttattgaggacg-acttatcaaaggtacttgtttctttaatag 23113430  T
Q  487 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23113429 tactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgat 23113372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 538
Target Start/End: Original strand, 24705151 - 24705270
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24705151 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtg 24705250  T
Q  519 ctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  24705251 ctacgcattgttttattgct 24705270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 30208631 - 30208714
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  30208631 atcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgat 30208714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 9338314 - 9338237
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9338314 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 9338237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 9486948 - 9486871
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9486948 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 9486871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 10871582 - 10871505
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10871582 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 10871505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16983972 - 16983895
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16983972 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 16983895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17001732 - 17001655
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17001732 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 17001655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 22323053 - 22323130
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22323053 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22323130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24265102 - 24265025
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24265102 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 24265025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24712766 - 24712689
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24712766 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 24712689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 44383281 - 44383358
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44383281 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 44383358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 22462931 - 22462993
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22462931 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 22462993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220671
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27220671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373924
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27373924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351499
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 11351499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 21322977 - 21323054
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21322977 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 21323054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23065062
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 23065062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074512
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 23074512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 23116440 - 23116571
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  23116440 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcagagattgtttgtttcaact 23116539  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23116540 gtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 23116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 24817221 - 24817352
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |  | || |||| || ||||||| |||||||| |  |  |    
T  24817221 aagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactactgagattgtttgctatactt 24817320  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  24817321 gtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 24817352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19817579 - 19817501
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctg 539  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19817579 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgctg 19817501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029249
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 23029249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 538
Target Start/End: Original strand, 45673706 - 45673800
Alignment:
Q  444 tgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  45673706 tgaatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgct 45673800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 22742677 - 22742754
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22742677 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgct 22742754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23205306 - 23205245
Alignment:
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23205306 atgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23205245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23676910 - 23676849
Alignment:
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23676910 atgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23676849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 24874461 - 24874538
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24874461 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 24874538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24265507 - 24265407
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  24265507 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 24265408  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  24265407 a 24265407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733568
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgat 22733568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204979
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23204979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 11351161 - 11351223
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11351161 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11351223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142829
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgct 21142829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657446
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgct 24657446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24678219 - 24678142
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  24678219 atcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgct 24678142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 24817094 - 24817179
Alignment:
Q  4 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24817094 tattgggtatcagaagatccgttacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 24817179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 487 - 544
Target Start/End: Original strand, 24817577 - 24817634
Alignment:
Q  487 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  24817577 tactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgat 24817634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10871987 - 10871887
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10871987 aggatctacgaagaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 10871888  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  10871887 a 10871887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 527
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9338719 - 9338616
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  9338719 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 9338620  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  9338619 acaa 9338616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9487353 - 9487250
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  9487353 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 9487254  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  9487253 acaa 9487250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Original strand, 22742255 - 22742306
Alignment:
Q  39 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22742255 tggtgagcagttgcaggatttacgaagaggataccaaggctcattacaaggt 22742306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Original strand, 44382876 - 44382979
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  44382876 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 44382975  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  44382976 acaa 44382979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Original strand, 24657128 - 24657170
Alignment:
Q  220 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24657128 ttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgt 24657170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 24704932 - 24704994
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24704932 gatgttcctgctgagattatctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 24704994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  458 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19647911 - 19647827
Alignment:
Q  171 tgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || |||| ||||||| ||| |||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19647911 tgaatgatgagaggaggcccataaagaaagatactcctaccgatgttgtttgtttccgatgtggagagaaaggtcacaagagtaa 19647827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 483 - 531
Target Start/End: Original strand, 23105461 - 23105509
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  23105461 ataatacacctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttt 23105509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 535
Target Start/End: Original strand, 590 - 1125
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  590 attggctatcagagaataaggaacttctctaaattggtaaccagctgtaggatttatgaggaggacacgaaatctcattacaaggtgatgagtgaatgta 689  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  690 gaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtactcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 789  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  790 tcctatggatattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaagga 889  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcata-----tcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 399  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |     ||| |||| ||||||| || || ||||||||    
T  890 cacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcacatcagttcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggt 989  T
Q  400 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaatt 499  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  990 taggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaatt 1089  T
Q  500 gctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 535  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1090 gctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21929055 - 21928512
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21929055 ggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 21928956  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  21928955 cgtagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggagag 21928856  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  21928855 atgctcctactgagattctttgtttcaagtgtggcgaaaagggccacgagagtaatgtaagtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaa 21928756  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |  ||  | || | | |||| |||||||||    
T  21928755 aggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacaatgcaagaagcccaagaaggtt 21928656  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21928655 cggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21928556  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928555 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 21928512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19985803 - 19985264
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19985803 attggttatcaaaagataataaatttttctgatttggtaagcagttgtaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 19985704  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19985703 gtggcaagggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgcggacaagggtaaacagaggatgattgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 19985604  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | |||| ||    
T  19985603 tcctactgagattgtttgtttcaagtgtggcgaaaaaagccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtatttcagatgtggacagaaatga 19985504  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||| || |   | || || || ||||| |  ||  |||| | | |||||||||||||| |||    
T  19985503 cacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacagtgcaagaagcctaagaaggttcgga 19985404  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19985403 caggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 19985304  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19985303 tatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 19985264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 22374480 - 22373953
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22374480 aagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatcaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 22374381  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
    |  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | ||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||    
T  22374380 agtagagtcgtccgaaaccgtatagtgcccctgctgtcaaaggtaaacaaagacttaatgaggagaggaggcctaggaggagagattctcctactgagat 22374281  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |    
T  22374280 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 22374181  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || |   | || ||||||||||| |  ||| |||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  22374180 gattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaagg 22374081  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374080 tgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 22373981  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22373980 tgctactcatagtttcattgatgttgat 22373953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 538
Target Start/End: Original strand, 31413687 - 31414223
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | ||||||| ||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31413687 gctattgggtatcagaagattaaaattttctctaagttggtaaacagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaaatgatgagtgagc 31413786  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||||||||   || || || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31413787 gaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagcgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 31413886  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  31413887 tgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccataagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaa 31413986  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||| | ||||||| ||    
T  31413987 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagtcgaagaaggcta 31414086  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31414087 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 31414186  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31414187 tattatagatattggtgctactcattgtttcattgct 31414223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 543
Target Start/End: Original strand, 22027465 - 22027976
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   |    
T  22027465 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagatcattataaggtgatgagtgagcgaagtggtaagggacagcagagtcgtccta 22027564  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  22027565 aaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttacaagtg 22027664  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 331  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||| | ||     
T  22027665 tggcgataaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagagggga 22027764  T
Q  332 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactc 431  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| || || || ||||||| |||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||      
T  22027765 gacgttgtttgctataactacaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccg 22027864  T
Q  432 gtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027865 gtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 22027964  T
Q  532 cattgctgttga 543  Q
    ||||||| ||||    
T  22027965 cattgctattga 22027976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28984511 - 28983996
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||    
T  28984511 cttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgt 28984412  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  28984411 cctaagccttacagtgctcctgcggacaagggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagttgagattgtttgttaca 28984312  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || |||||    
T  28984311 agtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcg 28984212  T
Q  328 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttg 427  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| ||    
T  28984211 tggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctg 28984112  T
Q  428 actcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    ||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28984111 actggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcact 28984012  T
Q  528 gtttcattgctgttga 543  Q
    |||| |||||| ||||    
T  28984011 gttttattgctattga 28983996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 538
Target Start/End: Original strand, 29300581 - 29301117
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  29300581 gctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttagtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtaatgagtgaga 29300680  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||  ||||||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29300681 ggaggggtaagggacattagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaagaggggaga 29300780  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    || |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||   ||||||| | |||||| || |||||||||| || |    
T  29300781 tgttcccgctgaaattgtttgttttaagtgtggtgaaagaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgaaaggaagtgttttaggtgtggtcagaga 29300880  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  29300881 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctactataactgcaatgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggcta 29300980  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||  ||||| || |||||| | |||||  |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29300981 ggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 29301080  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29301081 tattatagacactggtgctacgcattgtttcattgct 29301117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 48 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22054443 - 22053953
Alignment:
Q  48 gttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccc 147  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  22054443 gttgcaggatctgtgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacggcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 22054344  T
Q  148 tgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 247  Q
    |||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22054343 tgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgcttctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccac 22054244  T
Q  248 aagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctac 346  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |||| || ||     
T  22054243 aagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttat 22054145  T
Q  347 aacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtga 446  Q
    |||| |||||| || || ||||||| | |  |||| || ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    |    
T  22054144 aactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactacta 22054045  T
Q  447 atgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22054044 atgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 22053953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 16268378 - 16268920
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||    
T  16268378 ggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaatagttgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaatataatgagtgag 16268477  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  16268478 aggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcctaagaagagag 16268577  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16268578 atgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaa 16268677  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     || || |   ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || |||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||| |    
T  16268678 gggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggct 16268777  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16268778 agaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 16268877  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16268878 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 16268920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 20391685 - 20391173
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||| || || ||  |||||     
T  20391685 ttttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaagaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtc 20391586  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  20391585 cgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagtagagatgttccttctgagattgtttgctacaa 20391486  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 328  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||   |  | |||||||| ||||||||| | |||||   |||||| || ||| |||  || || ||||||    
T  20391485 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttccaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatactatagcggaatgcaagcgt 20391386  T
Q  329 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttga 428  Q
    || || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | | |||| |||| | | |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20391385 ggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattga 20391286  T
Q  429 ctcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    || |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20391285 ctggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacattg 20391186  T
Q  529 tttcattgctgtt 541  Q
     ||||||||||||    
T  20391185 attcattgctgtt 20391173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 426
Target Start/End: Original strand, 6606651 - 6607048
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  | |||     
T  6606651 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggacgtc 6606750  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
     |||||| || ||||  |||  |||||  ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  6606751 cgaagccctacagtgttcctattgacagaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaa 6606850  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 328  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || || ||  ||| ||| || ||||||    
T  6606851 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgt 6606950  T
Q  329 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttt 426  Q
    ||||| |||||||||| ||| |   | || ||||| ||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6606951 ggggatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttt 6607048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 446 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28989312 - 28989215
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  28989312 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattga 28989215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 538
Target Start/End: Original strand, 22126531 - 22126650
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22126531 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22126630  T
Q  519 ctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  22126631 ctacgcattgttttattgct 22126650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 17671636 - 17671713
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17671636 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 17671713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19115567 - 19115490
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19115567 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 19115490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 20015877 - 20015954
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20015877 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 20015954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031193
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 22031193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22043402 - 22043193
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || |||||||     ||||| |||||||||||| |||    
T  22043402 aggatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcaccctaagccttatagtgcccctactg 22043303  T
Q  153 acaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 252  Q
    |||| || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  |||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22043302 acaagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccaactgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 22043203  T
Q  253 taatgtttgt 262  Q
    ||||||||||    
T  22043202 taatgtttgt 22043193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 22117789 - 22117866
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22117789 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22117866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22524133 - 22523876
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  22524133 attggttaccagaagatccgtaacttttccgagctggtgagcagttgcaggatttataaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaa 22524034  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     |||||| || || |||||||||   ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| | |||||||||| | |||| | || || ||||||    
T  22524033 aaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgcccctgctgataagggaaaacaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgc 22523934  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  ||||| || |||||||||| |||||||| ||||    
T  22523933 tcctgttgagattgtgtgctatacttgtggcgagaaaggccacaggagtaatgcttgt 22523876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603235
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 32603235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 21970709 - 21970793
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21970709 attggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21970793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 22004239 - 22004323
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22004239 attggttatcagaagattataaacttttctaagttggtgagtagctgtaggatttatgaagatgataccaaagctcattataagg 22004323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 536
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375143
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattg 22375143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 30310497 - 30310559
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30310497 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 30310559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859667
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 18859667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 19481686 - 19481763
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19481686 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 19481763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19981134 - 19981057
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19981134 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 19981057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310835
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgct 30310835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18860152 - 18860049
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  18860152 tgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 18860053  T
Q  150 ctga 153  Q
    ||||    
T  18860052 ctga 18860049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042927
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22042927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421589
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 22421589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32603642 - 32603511
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | | || |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  32603642 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcgacctaagaagaaggatgctccttcggaaattgtttgtttcaact 32603543  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32603542 gtggtgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 32603511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 22126168 - 22126268
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  22126168 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 22126267  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  22126268 a 22126268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21254154 - 21254035
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21254154 tttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21254055  T
Q  519 ctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||| |||| ||| ||||||    
T  21254054 ctacgcattattttattgct 21254035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 531
Target Start/End: Original strand, 21391475 - 21391545
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21391475 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 21391545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 531
Target Start/End: Original strand, 21780801 - 21780871
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21780801 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 21780871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536473
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 15536473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 21164152 - 21164229
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  21164152 atcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgct 21164229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 22129231 - 22129308
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  22129231 atcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgct 22129308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 22523683 - 22523630
Alignment:
Q  491 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22523683 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 22523630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 22990254 - 22990129
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  22990254 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtg 22990155  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||  |||||||| |||||| |||||    
T  22990154 ctaaacattgttttattgctattgat 22990129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Original strand, 22245584 - 22245712
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |     
T  22245584 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatta 22245683  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22245684 gtgctacacattgttttattgctattgat 22245712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Original strand, 22246002 - 22246130
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |     
T  22246002 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatta 22246101  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22246102 gtgctacacattgttttattgctattgat 22246130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22990668 - 22990520
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  22990668 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaagatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgga 22990569  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
     |||||| || || || ||||||   ||||| || ||||| ||||||||    
T  22990568 aaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctga 22990520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357621
Alignment:
Q  499 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 27357621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15536880 - 15536749
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| ||||||| || |    
T  15536880 aagccttatagtgcccctgccgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaatt 15536781  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15536780 gtggcgaagaaggccacaagagtaatgtttgt 15536749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Original strand, 19481287 - 19481390
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  19481287 tatgaagaggatacgaaggcttactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagg 19481386  T
Q  159 gtaa 162  Q
    ||||    
T  19481387 gtaa 19481390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 21391214 - 21391276
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21391214 gatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 21391276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 21780540 - 21780602
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21780540 gatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 21780602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 147
Target Start/End: Original strand, 22117384 - 22117478
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccc 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||||   |||||||| ||||||||    
T  22117384 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcaaagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 22117478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21672138 - 21671981
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  ||  |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  21672138 attggttaccagaagatccgagtcttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatgccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaa 21672039  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaa 162  Q
      | |||||| || |||||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  21672038 aggccaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaa 21671981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 531
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786039
Alignment:
Q  491 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 21786039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 21982112 - 21982196
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21982112 attggttatcagaagattataaacttttttaatttggtgagtagctgaaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21982196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 21998598 - 21998682
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21998598 attggttatcagaagattataaacttttttgagttggtgagtagctgaagaatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21998682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 22421090 - 22421134
Alignment:
Q  44 agcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 88  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  22421090 agcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaag 22421134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 23563065 - 23563603
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | | |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23563065 attggttatcagaagattagaaatttctttaatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacactaaagctcattacaagatgatgagtgaacgta 23563164  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23563165 gaggtaagggacagaagagttgtccgaagccgtatagtgctcctgctgaaaaggataagcagaggttaaataatgagaggaggcccaagaggagagatgc 23563264  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23563265 tcctactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 23563364  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| ||| |||||| |||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23563365 cacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttagga 23563464  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23563465 ctggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatat 23563564  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23563565 tatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattga 23563603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 537
Target Start/End: Original strand, 23077799 - 23078334
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  23077799 gctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtaatgagtgaga 23077898  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||||||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23077899 ggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 23077998  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  23077999 tgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaa 23078098  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||    
T  23078099 ggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggcta 23078198  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23078199 ggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 23078298  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078299 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 23078334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20345756 - 20345215
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||| |  || || || |||||||| || || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  20345756 gctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaataggtgcagaatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 20345657  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20345656 ggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 20345557  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  20345556 tgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaagcccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 20345457  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    || |||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| | |||  ||||| |  |||| ||||||| ||    
T  20345456 ggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggcta 20345357  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20345356 gaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 20345257  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20345256 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 20345215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22506153 - 22505612
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  22506153 gctattggatatcagcaaatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgaga 22506054  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  22506053 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 22505954  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||      
T  22505953 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagatg 22505854  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||| |||| |||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  22505853 ggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggtta 22505754  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22505753 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 22505654  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22505653 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 22505612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 21870171 - 21870438
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21870171 ggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 21870270  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  21870271 cgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaagaggagag 21870370  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 268  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21870371 atgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccga 21870438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 21874451 - 21874718
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21874451 ggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 21874550  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  21874551 cgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaagaggagag 21874650  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 268  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21874651 atgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccga 21874718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 14883884 - 14884426
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  14883884 ggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgag 14883983  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| ||  ||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  14883984 aggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagag 14884083  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  14884084 atgctccagctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgggagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaa 14884183  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     || |||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||| | |||  ||||| |  |||| | ||||  |    
T  14884184 gggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaggaagact 14884283  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14884284 agaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 14884383  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14884384 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 14884426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Original strand, 21983074 - 21983613
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  21983074 attggttatcaaaagatcagaaaattttctgaatttgtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagctcattataagtttatgagtgagcgga 21983173  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || || ||  |||||  |||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||     
T  21983174 ggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgttcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgt 21983273  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  21983274 tcctgctgagattgtttgctataggtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttcgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 21983373  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | | |||| |||| | | |||||||||||| |  |     
T  21983374 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagg 21983473  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21983474 caggtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactat 21983573  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21983574 tattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 21983613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 56 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25851492 - 25851005
Alignment:
Q  56 atttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgaca 155  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||    
T  25851492 atttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgaca 25851393  T
Q  156 acggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    | || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25851392 aaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaa 25851293  T
Q  256 tgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaac 355  Q
    ||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||| |  |||||||| |||||||| |||||||||| |||     
T  25851292 tgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaat 25851193  T
Q  356 gaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacg 455  Q
    |  || |||||||| | |||  ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    |||||||||     
T  25851192 ggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggacc 25851093  T
Q  456 gacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25851092 gtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 25851005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Original strand, 21560922 - 21561461
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| | |    
T  21560922 attggttatcaaaagatcaggtaattttctaaattggtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagcccgttataaggttatgagtgagagga 21561021  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || || ||  |||||  |||||| || |||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||     
T  21561022 ggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctactgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgt 21561121  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |  |  | | |||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  21561122 tcctgctgagattgtttgcttcaagtgtggtaagaagggccacaagagtaatgttagcaatggtgttgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 21561221  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaagg-ttagg 403  Q
    || ||  |||   | || ||| |||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | | |||| |||| | | ||| |||||||| |||||    
T  21561222 catacgatagcgaaatgcaagtgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcataagaaggcttagg 21561321  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21561322 -caggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgcta 21561420  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21561421 ttattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 21561461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 538
Target Start/End: Original strand, 17266258 - 17266764
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||   |    
T  17266258 tctgatttggtaagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaaagggcatcagagtcgtccta 17266357  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||    
T  17266358 aaccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgttttaagtg 17266457  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| ||    
T  17266458 tggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgt-accgaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcgg 17266556  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     ||  |||| ||||| || |  || || || ||||| |||| | |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || ||||||||||||    
T  17266557 tgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgact 17266656  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     ||||  |  | |  ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17266657 ggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 17266756  T
Q  531 tcattgct 538  Q
    ||||||||    
T  17266757 tcattgct 17266764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43122926 - 43122517
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||   |||||| |    
T  43122926 aagataagaaatttttctgaattggtgagcagctgtaggatttacgaggaggatacgaaagctcactataaggttaggaatgagcggaggaacaagggtc 43122827  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
    ||||   |||   |||||| || ||||| | || |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || | | || ||    
T  43122826 aacaagatcggccgaagccctacagtgctcatgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcatgcagagat 43122727  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    |||||| | ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || ||  |  ||| |    
T  43122726 tgtttgctacaagtgtggcgagaggggccacaagagtaatgtctgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagct 43122627  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||| ||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43122626 gaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 43122527  T
Q  417 tgtttgcttt 426  Q
    ||||||||||    
T  43122526 tgtttgcttt 43122517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23670091 - 23669822
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  | || |||||| ||   |||||| |    
T  23670091 aagataagaaatttttctgaattggtgagcagctgtaggatttacgaggaggatacgaaagctcactataaggctaggaatgagcggaggaacaagggtc 23669992  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
    ||||  ||||   |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  23669991 aacaaggtcgaccgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgctcctgctgagat 23669892  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    |||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  23669891 tgtttcctaccagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 23669822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20824728 - 20824391
Alignment:
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||    | |||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  20824728 atgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaa 20824629  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||| ||    || || || || |||||||| || |||||||| |  ||||     || |||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||     
T  20824628 aggtcatgtgttggtggactgcaagcgtggagatattgtttgttttaactgtggtgatgaaggtcacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtc 20824529  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||| || || || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20824528 aggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 20824429  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20824428 ctattatagacactggtgctacacattgtttcattgct 20824391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 446 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20778943 - 20778851
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20778943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgct 20778851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22464970 - 22464888
Alignment:
Q  456 gacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22464970 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgct 22464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 446 - 538
Target Start/End: Original strand, 28892280 - 28892372
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28892280 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgct 28892372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 544
Target Start/End: Original strand, 21631637 - 21631835
Alignment:
Q  346 caacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtg 445  Q
    ||||| ||| || |||||||||||   |||| |||| | | |||||||||||| |  |||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  21631637 caactgcaatgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcagactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtg 21631736  T
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||| |  | || |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21631737 aatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgat 21631835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 16258095 - 16258214
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  16258095 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 16258194  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    | || |||||||||||||||    
T  16258195 gtgaggagaagaagtgcttc 16258214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 22591814 - 22591933
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  22591814 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 22591913  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    | || |||||||||||||||    
T  22591914 gtgaggagaagaagtgcttc 22591933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 22595369 - 22595488
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  22595369 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 22595468  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    | || |||||||||||||||    
T  22595469 gtgaggagaagaagtgcttc 22595488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23474683 - 23474426
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| || || ||  |||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  23474683 attggttaccagaagatccgtaacttttctgagttggtgagcagctgcagaatacatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagga 23474584  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||||||||| || || ||||||   ||||| || | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | || ||| |     
T  23474583 aaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacattgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccagaaagaaagaagt 23474484  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  23474483 tgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 23474426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 14997092 - 14997175
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14997092 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgat 14997175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16359535 - 16359458
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16359535 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 16359458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772916
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 19772916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 411 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21410217 - 21410084
Alignment:
Q  411 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 510  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |  ||| |||||||||  | || ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  21410217 gcaaggtgtttgctttagctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcataga 21410118  T
Q  511 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  21410117 tactggtgctacatattgttttattgctgctgat 21410084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 22330240 - 22330317
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22330240 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22330317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27521439 - 27521362
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27521439 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27521362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27613389 - 27613312
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27613389 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27613312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27665920
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27665920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 27682753 - 27682830
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27682753 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27682830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 29473426 - 29473503
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29473426 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 29473503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 34569527 - 34569450
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34569527 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 34569450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 37288849 - 37288926
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37288849 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgct 37288926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 40711813 - 40711736
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40711813 atcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 40711736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 41773875 - 41773798
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41773875 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 41773798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429371
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 25429371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18782070
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 18782070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21882807 - 21882730
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21882807 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 21882730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23526007
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgct 23526007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 22329835 - 22329935
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  22329835 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 22329934  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  22329935 a 22329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332422
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 21332422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736163
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgat 26736163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18782408 - 18782346
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18782408 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 18782346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803553
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgct 20803553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350875
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgct 22350875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 28891845 - 28891934
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| ||  | || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28891845 tatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagttgctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtgag 28891934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 14996687 - 14996787
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  14996687 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 14996786  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  14996787 a 14996787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19773398 - 19773298
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  19773398 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 19773299  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  19773298 a 19773298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 27682348 - 27682448
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  27682348 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 27682447  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  27682448 a 27682448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27521844 - 27521741
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  27521844 aggatctatgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 27521745  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  27521744 acaa 27521741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27613785 - 27613694
Alignment:
Q  62 gaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | |  |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  27613785 gaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 27613694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26735648 - 26735882
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    |||||||||  |||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |  | | |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  26735648 cttttctgagctggtgagcagttgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtaaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgt 26735747  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||||| || ||||| ||| |||| || || || || ||| | |||||||||| |||||| |  | || ||||||||||  ||| |||||||| | ||    
T  26735748 ccaaagccttacagtgctcctactgataaaggaaaacaaagagttaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctaca 26735847  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
      ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  26735848 cttgttgtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 26735882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Original strand, 21331886 - 21331967
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattaca 86  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21331886 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattaca 21331967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 21631296 - 21631381
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    ||||| |||||||||||  | || |||| |||| |||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21631296 attggatatcagaagatccgtaaattttatgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggt 21631381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22137701 - 22137624
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || ||||||    
T  22137701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgct 22137624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22465259 - 22465126
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| || |||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   ||    
T  22465259 agattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttatttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcatcc 22465160  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
     |||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  22465159 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaa 22465126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23461004 - 23460943
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 522  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23461004 atcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctac 23460943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23461406 - 23461203
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggc-aagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaac 157  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||| | || | ||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  23461406 tatgaagaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagcgga-agactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataag 23461308  T
Q  158 ggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 257  Q
    || ||  | ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23461307 ggaaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggaaattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatg 23461208  T
Q  258 tttgt 262  Q
    |||||    
T  23461207 tttgt 23461203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 29473021 - 29473121
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||| ||| ||||    
T  29473021 aggatctatgaagaggatacgaatgctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctg 29473120  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  29473121 a 29473121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16359940 - 16359837
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16359940 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16359841  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  16359840 acaa 16359837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20824924 - 20824829
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20824924 attgggtatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttacgaggaggatacgaagactcattacaaggtgatgagcgag 20824829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21410572 - 21410373
Alignment:
Q  56 atttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgaca 155  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||| |||||| || || |||   ||||| ||||||   || || || ||||| || ||||| |    
T  21410572 atttatgaagatgacaccaaagctcattataagattatgaatgagcggaggggtaagcaccaacaaagtcgtggtaaaccttacagtgctccagctgata 21410473  T
Q  156 acggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    | |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||   ||||| || ||||| || ||||||||    
T  21410472 agggtaagcatagggtgaatgataagaggaggcccagaaagagagatactcctactgaagttgtgtgtttccgatgtggagagaaaggtcataagagtaa 21410373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25429885 - 25429826
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 88  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  25429885 ttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaag 25429826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34569932 - 34569829
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  34569932 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 34569833  T
Q  153 acaa 156  Q
    ||||    
T  34569832 acaa 34569829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23526345 - 23526283
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  23526345 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 23526283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 153
Target Start/End: Original strand, 37288450 - 37288544
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| || |||||    
T  37288450 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgctga 37288544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20770603 - 20770518
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 96  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20770603 tatcagaagatcagaattttctcggaattggtgaggagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgag 20770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20779378 - 20779293
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 96  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20779378 tatcagaagatcagaattttctcggaattgttgagcagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgag 20779293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20803891 - 20803830
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 261  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20803891 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagaaatgtttg 20803830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6390 - 5858
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6390 attggctatcagaaaataaggaacttctttgaattgggaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 6291  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6290 gaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaagggtaagca-aggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 6192  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6191 tcttactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaagga 6092  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| | |||  ||||||| || || |||||||||||||    
T  6091 cacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatattagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagga 5992  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| | |||  ||||||| |    |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5991 ccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttat 5892  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5891 tatagatactagtgctactcattgtttcattgct 5858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41365
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgat 41365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19456445 - 19455906
Alignment:
Q  4 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||     
T  19456445 tattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgc 19456346  T
Q  104 agaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19456345 agaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagata 19456246  T
Q  204 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19456245 ctcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaagg 19456146  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19456145 acacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttagg 19456046  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19456045 accggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 19455946  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19455945 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 19455906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19466590 - 19466051
Alignment:
Q  4 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||     
T  19466590 tattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgc 19466491  T
Q  104 agaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19466490 agaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagata 19466391  T
Q  204 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19466390 ctcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaagg 19466291  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19466290 acacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttagg 19466191  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19466190 accggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 19466091  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19466090 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 19466051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25771269 - 25770726
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25771269 ggctattggctaccaaaagataaggaatttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattatagagtgatgagtgag 25771170  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25771169 cgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgtaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 25771070  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||   |||    
T  25771069 atgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagaataatttatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttcgatgtgggacgaa 25770970  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||| |||||||| |   | || ||||||||||| |  ||  |||| | | | |||||||||| |    
T  25770969 aggacacacattatctgattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaaggct 25770870  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25770869 ctgacaggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 25770770  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25770769 ctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgat 25770726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19438423 - 19437885
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||  | |    
T  19438423 attgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggcttattacaaggtagtgagtgaaagga 19438324  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19438323 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 19438224  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||     ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19438223 tcctgctgagatcgttcgttacaagtgtggtgagaaaggccacttgagtaatgtttgtactaaagatgagaataagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 19438124  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| ||  | ||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  19438123 cacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagga 19438024  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    |  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19438023 ctagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 19437924  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19437923 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 19437885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18798115 - 18797578
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  18798115 ggctattggataccagaagatcagaaacttctctgagttggtaagtagctgcagaatctatgaagaggacacagaagctcattacaaggtgatgagtgac 18798016  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18798015 cgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaagaggaggg 18797916  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||   |||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||| |||| || ||||||||||||| |||    
T  18797915 atgctcctgtggatattgtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgcactaaagatgagcagaaatgtttcaggtgtggtcagaa 18797816  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||| |||  |||| || || || |||||||||    
T  18797815 gggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaaggccatatcagttcacagtgcactcaaccaaagaaggtt 18797716  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    || || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18797715 agaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 18797616  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797615 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 18797578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 14376776 - 14377314
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14376776 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggttagtagctgcaggatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 14376875  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  14376876 ggagcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggagacccaataggagagatgc 14376975  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14376976 tcctgttgatgttgtttgctacaagtgcggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 14377075  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || || |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14377076 cacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatcagttcgcaatgtacacagccgaagaaggttagaa 14377175  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14377176 ccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctat 14377275  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14377276 tatagacactggtgttactcattgtttcattgctattga 14377314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21474993 - 21474482
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                  
T  21474993 aagataaggaatttttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcg-------------- 21474908  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
      |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  21474907 --cagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagat 21474810  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||| || | |    
T  21474809 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggct 21474710  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    || || |||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| | |||  |||| | | | |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21474709 gagtgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagttctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaagg 21474610  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474609 tgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 21474510  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21474509 tgctactcattgtttgattgttgttgat 21474482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 536
Target Start/End: Original strand, 24515337 - 24515805
Alignment:
Q  68 gatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcata 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || |    
T  24515337 gatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggcaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaaacaga 24515436  T
Q  168 gattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccg 267  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  24515437 ggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaa 24515536  T
Q  268 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcat 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| |||||||||||     
T  24515537 agatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcac 24515636  T
Q  368 atcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagag 467  Q
    |||| |||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||| || |||||| || ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||    
T  24515637 atcagttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagag 24515736  T
Q  468 gtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24515737 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattg 24515805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Original strand, 19486154 - 19486693
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19486154 attggttatcagaagattaggcaattttctgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcgga 19486253  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |   ||| || || ||  |||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||     
T  19486254 ggaacaaaggccagcaaggtcgttcgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgt 19486353  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| | |||||   ||||||     
T  19486354 tcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 19486453  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || ||  |||  || || |||| ||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | | |||| |||| | | |||||||||||| |  |     
T  19486454 catacgatagcggaatgcaagcatggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagg 19486553  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19486554 caggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttat 19486653  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19486654 tattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 19486693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 10465704 - 10466246
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||   || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10465704 ggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgag 10465803  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     | || || |||||||| |||||||||   ||||| || | ||| | ||||||||| || ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10465804 aggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagag 10465903  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||| || || |||||||||| |||    
T  10465904 atgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaa 10466003  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
     ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||     
T  10466004 gggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggtc 10466103  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
    ||||| || || || |||||||  ||||   |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10466104 aggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 10466203  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10466204 ctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattga 10466246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 21566851 - 21567384
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21566851 attggctatcagaagatcaggactttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgga 21566950  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |  | ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21566951 ggagtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 21567050  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21567051 tcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 21567150  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   |  |||| || || |||| |||  |||| || ||||| |||||| |||| |    
T  21567151 cacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgataaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaa 21567250  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  21567251 ccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctat 21567350  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21567351 tatagacactggtactactcattgtttcattgct 21567384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 24367821 - 24367283
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||| |||| |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||| || ||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  24367821 attggatatcagcagatcagagtcttctatgagttggttaacaggtgtagaatctatcaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 24367722  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24367721 ggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgc 24367622  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    || |  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  24367621 tcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 24367522  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| | |||  ||||  |  | || |||||   ||| |    
T  24367521 cacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgccctgaaccgaagaaaactagaa 24367422  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24367421 ctggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 24367322  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24367321 tattaatactggtgctactcattgttttattgctattga 24367283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 538
Target Start/End: Original strand, 34642517 - 34642979
Alignment:
Q  77 gctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||  || || |||||  || ||||||    
T  34642517 gctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatg 34642616  T
Q  177 atgagaagaggccc-aagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgaga 275  Q
    |||| | ||| ||| ||| | |||||  ||||| | || || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||    
T  34642617 atgaaaggagaccccaagggaagagacactcctgcggagatagtttgctttaagtgtggcgagaagggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgaga 34642716  T
Q  276 agaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||    
T  34642717 agaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgatattgtatgctacaactgcaatggggagggtcatatcagttc 34642816  T
Q  376 gtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgt 475  Q
      |||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || |||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  34642817 tcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgt 34642916  T
Q  476 ttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34642917 ttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgct 34642979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15462757 - 15462224
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| || |  || || || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  15462757 attggatatcagaagatcaggattttctcggagttggtgagtagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagaaga 15462658  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||| |  ||| |   |||||||  |    
T  15462657 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctaacaaaggcaaacagagattgaatgatgagaggcagcctagagggagagagac 15462558  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||     
T  15462557 tcctgttgatgttgtgtgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccagagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggt 15462458  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||    || | ||| || ||||| || || || || || || ||||     ||||| || || || | |||| |||| ||||| ||||||||||| || |    
T  15462457 catgtgttggctgagtgcaagcggggagatatcgtgtgttataactgtggtgaggagggccacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaa 15462358  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | || || || || ||||| |||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15462357 ctggaggaaaagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 15462258  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15462257 tatagacactggtgctacacattgtttcattgct 15462224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 8720561 - 8720846
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | | ||  |||    
T  8720561 ggctattggttatcagaagataaggaacttttccgagttggtgagtagctgtaggatatatgaggaggataccaaagctcactacaagattaggaacgag 8720660  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||   |||||| |||||  |||||  ||| || || ||||| ||||   |||| ||  | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8720661 cggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacctagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 8720760  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    ||| ||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  8720761 atgatcctgatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 8720846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16814065 - 16813780
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | | || ||||    
T  16814065 ggctattggttatcagaagataagaaacttttccgagttggtgagtagctacatgatatatgaggaggataccaaagctcactataagattaggaatgag 16813966  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||   |||||| |||||  |||||  ||| || || ||||| ||||   |||| ||  | || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  16813965 cggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacagagattgaatgatgagaggagacctaagaggagag 16813866  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 286  Q
    ||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  16813865 atgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 16813780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Original strand, 30677908 - 30678141
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||| ||||     
T  30677908 ttttctgaattagtgagcagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctaattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagaatcgtc 30678007  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
      ||||| || |  || |||||||| ||  ||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  | || |||| ||||| ||||  ||||||| | |||    
T  30678008 caaagccttacaacgctcctgctgataaatgtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaa 30678107  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30678108 gtgtggtgagaagagccacaagagtaatgtttgt 30678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 538
Target Start/End: Original strand, 30678297 - 30678417
Alignment:
Q  418 gtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggt 517  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  30678297 gtttgctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgt 30678396  T
Q  518 gctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||| | |||||| ||||||    
T  30678397 gctacgcgttgttttattgct 30678417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925033
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgct 16925033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19881817 - 19881588
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||| || ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19881817 attggttatcagaagatcagaactctttccgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgga 19881718  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | ||||||| |||||| ||||||   |||||||| || ||||||||||  || || |||||  || ||||||||||||  || |||||| | |||||  |    
T  19881717 ggggcaaggaacaacaaagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaagggaagagacac 19881618  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 234  Q
    |||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  19881617 tcctgctgagatagtttgctttaagtgtgg 19881588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23081844 - 23081587
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | | |||||||||  | || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  23081844 attggttaccagaagattcgtaccttttctgagctagtgagcagttgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgga 23081745  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     || ||| || || |||||||||   ||||| || |||||  ||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| | |||| | || || ||||||    
T  23081744 aagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctgctgctgataaaggaaagcaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgc 23081645  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| ||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23081644 tcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 23081587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 2872118 - 2872195
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2872118 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 2872195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574778
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 16574778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620602
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 16620602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18660340 - 18660083
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |    
T  18660340 attggatattagaagatccgtaacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggctgtgagtgagagga 18660241  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||| ||| | || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| | | |||||||||| |||       
T  18660240 aaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtgagcagagggttaatgatgagaggggacccaagaggaaagagaa 18660141  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||||  ||||||||| |   ||||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  18660140 tcctactgaagttgtttgttaccgatgtggagagaaatgtcacaagagtaatgcttgt 18660083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 29589755 - 29589832
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29589755 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 29589832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 5836139 - 5836239
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  5836139 aggatttacgaagaggataccaaagctcactacaagactgtgaatgagcggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgcccctgctg 5836238  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  5836239 a 5836239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Original strand, 23085096 - 23085224
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||| || | || |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| || ||||||| || ||||    
T  23085096 gtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactg 23085195  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  23085196 gtgctacacattgttttattgttgttgat 23085224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Original strand, 25958636 - 25958864
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |  |||  |||   ||||| || || || || ||||||    
T  25958636 cttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactagagctcactacaagatagtgaaagagaagagaggaaaagggcagcaaagtcgt 25958735  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||||| |||||||| | || |||| | ||  |||| ||| || ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25958736 ccaaagccttatagtgctcttgttgacgaaggggagcaaagactggatgatgagaggagacctaagagtagagatgctcctactgagattgtttgctaca 25958835  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaat 256  Q
     ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  25958836 ggtgtggtaagaaaggccacaggagtaat 25958864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 5836544 - 5836627
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  5836544 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgat 5836627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190324
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27190324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 538
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27258916
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 27258916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28312595 - 28312518
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28312595 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 28312518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081305
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 23081305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22436834 - 22436757
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22436834 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgct 22436757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Original strand, 24293098 - 24293159
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 522  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24293098 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 24293159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559362
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgct 27559362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260590
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 28260590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285326
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 28285326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339339
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 28339339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Original strand, 20010361 - 20010645
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||   |    
T  20010361 attggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgagaaaa 20010460  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||| || |||| || || || |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||    
T  20010461 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgc 20010560  T
Q  205 tcctactgatattgt-ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 288  Q
    ||||  |||| |||| ||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || |||||    
T  20010561 tcctgttgatgttgtattgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcag 20010645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 527
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182749
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatt 18182749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405343
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgat 18405343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 483 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19867630 - 19867575
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19867630 ataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 19867575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21765038 - 21764976
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21765038 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 21764976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115440
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||| || ||||||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgct 25115440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 2871713 - 2871813
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |  ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||    
T  2871713 aggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgctg 2871812  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  2871813 a 2871813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 23084709 - 23084769
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23084709 ttttctgaactggtgagcagttgtagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 23084769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22437249 - 22437207
Alignment:
Q  46 cagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 88  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22437249 cagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaag 22437207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Original strand, 22829351 - 22829397
Alignment:
Q  107 ggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  22829351 ggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 22829397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Original strand, 27559044 - 27559086
Alignment:
Q  220 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27559044 ttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgt 27559086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2309 - 1768
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  2309 ggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattagtaagcagctgtagaatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtgag 2210  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| |||||| |  ||||||||  ||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  2209 cgcagaggtaagggatagtagagtcgtccgaaaccgt-tagtgcttctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggtgag 2111  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  2110 atgctcctactgaaattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaa 2011  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |   | || || || ||||| |  ||| |||| | | |||| |||||| ||    
T  2010 aggacatactttagctgattgtaagcgt-gggatgttgtatgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaagttt 1912  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1911 cggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 1812  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1811 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6027 - 5562
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6027 ggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagcttattacaaggtgatgagtgag 5928  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  5927 cgcagaggtaagggacaacatagtcgtccgaagccgtatag---ccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcttaagaggagag 5831  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5830 atgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 5731  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5730 aggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggtt 5631  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggt 469  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5630 aggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 512
Target Start/End: Original strand, 11484 - 11968
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||    
T  11484 cttttcggagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgt 11583  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||||| || | ||| | ||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | || |||||||||||||||||| ||   ||| ||||| || | ||    
T  11584 cctaagccttacattgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaagcccaagaggagagatgcaccagatgagattgtatgataca 11683  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 327  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||  | |||||    
T  11684 agtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcg 11783  T
Q  328 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttg 427  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||| | | |  ||||| |  | || ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11784 tggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttg 11883  T
Q  428 actcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagata 512  Q
    ||| |||||||| |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11884 actggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2920
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttg 542  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttg 2920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 52241 - 51716
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  52241 ggctattggttatcaaaagataaggaatatttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaggctcattataaagtgatgagtgag 52142  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  52141 cgcagaggtaagggacagcagagccgtccgaaactgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggagag 52042  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  52041 atgctcctactgagattatctgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtaagaa 51942  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| ||| ||||   | || |||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  51941 aggacacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaaggtaatattagttcacagtgtacgcagccaaagaaggtt 51842  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattg 500  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51841 cggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattg 51742  T
Q  501 ctattatagatactggtgctactcat 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  51741 ctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17227 - 16761
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17227 ggctattggctatcaatagataaggaatttttctgaattggtaagcagatgtagaatatatgaagagaataccaaagctcattacaaggtgatgagtgag 17128  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17127 cgcaaaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaagggtaagcagaaactgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 17028  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17027 atgctcctactgagattatttgtttcaagtgtggagagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaa 16928  T
Q  301 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 400  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16927 aggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagactaagaaggtt 16828  T
Q  401 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagag 467  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| || ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  16827 aggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtatgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 535
Target Start/End: Original strand, 98301 - 98831
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |    
T  98301 attgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatcaatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtaatgagtgaaagga 98400  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  98401 gaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtgctcatgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagtggagagatgc 98500  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  98501 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 98600  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || ||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  98601 cacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagga 98700  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  98701 ctggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 98800  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcatt 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98801 tatagatactggtgctactcattgtttcatt 98831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 176561 - 176035
Alignment:
Q  17 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 116  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  176561 aagataaggaacttttatgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggac 176462  T
Q  117 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 216  Q
    | |||||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||| | ||| || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || ||    
T  176461 agcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgccaacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctacagagat 176362  T
Q  217 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |    
T  176361 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 176262  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| |  ||| |||| | | ||| | |||||| |  ||||||||||||||    
T  176261 gattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagctttagaaggctctgacaggtggcaagg 176162  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176161 tgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatcagaggtacttatttcttt-atagtactcctttaattgctattatagatactgg 176063  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  176062 tgctactcattgtttcattgctgttgat 176035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 1670 - 2208
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||  | | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1670 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagcagcatgatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 1769  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1770 gaggtaagggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggatagatgc 1869  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1870 tcctgctgaaattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 1969  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  1970 cacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttagga 2069  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | |||| |    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2070 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctat 2169  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2170 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 2208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Original strand, 11651 - 11995
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  11651 tctgatttggtaagcagctgcaggatatatgaagaggacactaaggctcattataaggtgatgagtgagagaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 11750  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    | || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11751 aaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagagacttaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgagatcgtttgttacaagtg 11850  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 331  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||     
T  11851 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggt 11950  T
Q  332 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcg 376  Q
    ||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  11951 gacattgtttgttacatttggaacgaagaaggtcatatcagttcg 11995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 70958 - 70425
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||   |    
T  70958 attgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtatgatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgagcgagaaga 70859  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |    ||||| ||    |||||   |||||| || | ||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||    
T  70858 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacattgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgc 70759  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||     
T  70758 tcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagggtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgcggtcataaaggt 70659  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||    || | ||| || |||||||| || |||||||| || ||||  || ||||| || || || | |||  |||| ||||| ||||||||||| || |    
T  70658 catgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggccacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaa 70559  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | || || || || |||| ||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  70558 ctggaggaaaagtatttgttttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 70459  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  70458 tatagacactggtgttactcattgtttctttgct 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 252
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122141
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |    
T  122020 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaatt 122119  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagag 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  122120 gtggtgaaaaaggccacaagag 122141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30086 - 29574
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  30086 tctgatttggtgagtagttgtagaatctatgaagaggatacaaaggctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccga 29987  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  29986 aaccgtctagtgctcctgctgacaaaggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagatagtctatttcaagtg 29887  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||  ||| ||| || ||||||||     
T  29886 tggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaaccatgatgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagctgagtgcaagcgtggt 29787  T
Q  332 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactc 431  Q
    ||  ||||||||||||| |   | || ||||||||||| |  ||| |||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||     
T  29786 gatgttgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctctgactg 29687  T
Q  432 gtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29686 gtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgttt 29587  T
Q  532 cattgctgttgat 544  Q
    |||||| ||||||    
T  29586 cattgcagttgat 29574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 6)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 39053 - 39589
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  39053 attgggtaccagaagattagaa--ttttctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 39150  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39151 gaggtaagggacagcagagtcttcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 39250  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39251 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 39350  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  39351 cacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcgtatcagttcgcagtgtacacaatcgaagaaggttagga 39450  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39451 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 39550  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39551 tattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 39589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14753
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  14884 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatatgcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaagt 14785  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14784 gtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt 14753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14477
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgct 14477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 423 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4962
Alignment:
Q  423 ctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 522  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||||  || | || |||||||| ||||  ||| ||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5083 ctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T
Q  523 tcattgtttcattgctgttgat 544  Q
     |||||||| ||| || |||||    
T  4983 acattgttttatttctattgat 4962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5501 - 5244
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||  |||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  5501 attggttactagaagatccgtaacttttctgagttggtgagcaattgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagga 5402  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||||||||| || || ||||||   ||||| ||  |||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||| |||||| |  | || |||||     
T  5401 aaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacggtgctcctgctgataagggcaaacaaagagttaatgatgagatgaggcctagaaagaaagatgt 5302  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5301 tgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 5244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 180563 - 180648
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 96  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  180563 tatcagaagatcagaattttctcagaaatggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 180648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 20862
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || || || || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21400 attggctatcagaagataagaaatttctccgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaagataggaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 21301  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||||||||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21300 aaggcaagggacagtagagtcgtcctaaaccgtatagtgcccctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 21201  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    | || |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  21200 ttctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaaggga 21101  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||| ||||| || | ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||| |    
T  21100 cacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgaggagggccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaa 21001  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21000 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 20901  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20900 tatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 205 - 738
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  205 attggctatcagaagataagaatcttctctgatttggtgagtagttgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgaacgaa 304  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  305 gaggtaagggacaacagagtcaccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcagatattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 404  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    |||| |||| || ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  405 tcctgctgagatcgtttgttacaaatgtggcaggaaaggccacaagagtgatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagg 503  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    |||||   ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || ||||||| |||  |||| || ||||| |||||||||||     
T  504 acacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacagccgaagaaggttaga 603  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || | ||| || |||||||| |||||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  604 accgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 703  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  704 ttatagaaactggtgctacacaatgtttaattgct 738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11033
Alignment:
Q  4 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 103  Q
    |||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  11564 tattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagg 11465  T
Q  104 agaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 203  Q
    || || ||||| || |||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||    
T  11464 aggggtaagggtcagcagattcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagattttgaatgatgataggagtcctaagaggagagatg 11365  T
Q  204 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11364 ctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggg 11265  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    |||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  11264 acacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatcagctcacagtgtactcagccgaagaaggctagg 11165  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || || || ||||||||||| |||||| |||||||  |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11164 accggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 11065  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcatt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11064 ttatagatactggtgctactcattgtttcatt 11033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9200 - 8662
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||| || || |  || ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |    
T  9200 attgggtaccagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagtagctgcataatctatgaggaggacacgaaatctcattattaggtgatgagtgatcgaa 9101  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |   ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  9100 ggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagctgaatgatgagagaagacccaagaggagagatgc 9001  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  ||| ||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9000 tcctgatgagattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 8901  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||| || || || ||||||||||| |    
T  8900 cacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatatcagttcgcagtgcactcaaccgaagaaggttagta 8801  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8800 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 8701  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8700 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 8662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 154078 - 153699
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  154078 attggttatcagaagattagaaacttctctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggagacgaaagctcattacaaggtgatgggtgaacaaa 153979  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  153978 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 153879  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  153878 tcccactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaagccataagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 153779  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtac 384  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || | |||| |||||||    
T  153778 cacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcacattagttcgcagtgtac 153699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 151766 - 151615
Alignment:
Q  392 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactc 491  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  151766 aagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactc 151667  T
Q  492 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  151666 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattga 151615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23790
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 23790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 531
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 531
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 482 - 534
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 534  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6188 - 5651
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  6188 attggttatcaaaagataaggaatttctcggatttggtaagcagctttagaatatatgaagaggatacgaaagctcattataaagtgatgagtgagcgca 6089  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6088 gaggtaagggtcagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 5989  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  5988 ccctaatgagactgtctatttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagataagaagaagtgtttcagatgtggacagaaagga 5889  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || || |   | || || || || || |  |||||||| | | | |||||||||||| | |    
T  5888 cacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacacattagctcgtagtgcaagaaacctaagaaggttcgaa 5789  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||||| |||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5788 ccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 5689  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttg 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5688 tatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttg 5651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 541
Target Start/End: Original strand, 990 - 1526
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  990 attggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgca 1089  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1090 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 1189  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||    
T  1190 tcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaagga 1289  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |  ||  |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  1290 cacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctga 1389  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1390 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1489  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgtt 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1490 tatagatactggtgctacacattgtttcattgttgtt 1526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7618 - 7086
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  7618 tatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagca 7519  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7518 aaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgc 7419  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 310  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7418 tgagattgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacact 7319  T
Q  311 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 410  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||   | || || || ||||| |  ||| | || | | |||| |||||| ||||||| ||||    
T  7318 ctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtg 7219  T
Q  411 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 510  Q
    | || ||||||||| | ||| | |||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7218 gtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 7119  T
Q  511 tactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7118 cactggtgctactcattgtttcattgctattga 7086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 541
Target Start/End: Original strand, 28003 - 28539
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28003 attggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgca 28102  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28103 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 28202  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||    
T  28203 tcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaagga 28302  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |  ||  |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  28303 cacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctga 28402  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28403 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 28502  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgtt 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28503 tatagatactggtgctacacattgtttcattgttgtt 28539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 239 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13079 - 12774
Alignment:
Q  239 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattg 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  13079 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgacgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttg 12980  T
Q  339 tttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgca 438  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12979 tttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgca 12880  T
Q  439 atcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    | | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12879 aacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 12780  T
Q  539 gttgat 544  Q
    ||||||    
T  12779 gttgat 12774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 330
Target Start/End: Original strand, 4172 - 4496
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4172 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaa-ctcattacaaggtgatgagtgaacgta 4270  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4271 gaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtacactgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 4370  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4371 tcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccaaaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 4470  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  4471 cacacattagctgattgtaagcgtgg 4496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17317
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgct 17317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24353
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgat 24353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 538
Target Start/End: Original strand, 195034 - 195089
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  195034 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 195089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 9492 - 10028
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||  |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |    
T  9492 attgggtatcagaagataagaatcttctctgagttggtgagtagctgcaggat--atgaggaggatactaaggctctttacaaggtgatgagtgaacgaa 9589  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| || ||||| ||||||| |   || || |||||||| | |||||| || || ||||| ||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  9590 gaggtaaaggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcttgctgataagggaaagcaaaggatgaatgatgagaggaggccaaacaggagagatgc 9689  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9690 tcctgctgatattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 9789  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||  |||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| | |||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  9790 cacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatataagttcacaatgtacgcaaccgaagaaggttagga 9889  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9890 ctggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 9989  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9990 tatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 10028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24202
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgat 24202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Original strand, 23686 - 23742
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcatta 84  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23686 cttttctgagctggtaagcagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcatta 23742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 8739 - 9277
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||| | ||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |    
T  8739 attgggtatcagaaggttagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcatgacaaggttatgagtgaacgaa 8838  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| || ||| | |||||| || | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8839 gaggtaaaggatagcagagttgtcataaaccatatagtgctcctgcagacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 8938  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    | || || | |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8939 ttctgctaagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaagccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 9038  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  9039 cacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaatcaattcgcagtgtacacaaacgaagaaggttagga 9138  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9139 ccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 9238  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9239 tatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 74 - 444
Target Start/End: Original strand, 71 - 441
Alignment:
Q  74 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  71 aaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtaaaatgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaa 170  T
Q  174 atgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 273  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  171 atgatgagaggaggcccaagagcagagaggctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatga 270  T
Q  274 gaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| | |    
T  271 gaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagt 370  T
Q  374 tcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagt 444  Q
    ||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  371 tcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagt 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 507
Target Start/End: Original strand, 1202 - 1707
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  1202 gctatagggtatcagaagatcagagtcttctctgagttggtaagcagctgtaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgaga 1301  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || || || | | |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1302 ggagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggaaaacagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 1401  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||| || ||| || || |||||||||  |||     
T  1402 tgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgtgaggaaatgttttaggtgtggttagaag 1501  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  1502 ggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccgaagaaggtca 1601  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||| || || || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1602 ggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 1701  T
Q  502 tattat 507  Q
    ||||||    
T  1702 tattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8713
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8180 attgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgca 8279  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8280 ggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgc 8379  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    || |  ||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  8380 tcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggg 8478  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || ||||||| |||| |||| |  || || |||||||||||     
T  8479 acacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttaga 8578  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8579 accggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgcta 8678  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8679 ttatagacactagtgctactcaatgtttcattgct 8713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18927
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18394 attgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgca 18493  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18494 ggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgc 18593  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    || |  ||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  18594 tcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggg 18692  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || ||||||| |||| |||| |  || || |||||||||||     
T  18693 acacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttaga 18792  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18793 accggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgcta 18892  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18893 ttatagacactagtgctactcaatgtttcattgct 18927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 5616 - 5888
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616 ggctattggttatcagaaaataataaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 5715  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5716 cgtagaggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccaagaggagag 5815  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5816 atgctcctactgatattgtttattacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 5888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 4927 - 5465
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || || | ||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4927 attgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcatgatatatgaggaagacactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 5026  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| || ||| |  ||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||||| |||||| | |||| | ||||||||||||    
T  5027 gaggtaaaggaaagtagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaaggctgaataatgagaggtggcctaggaggagagatgc 5126  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5127 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaggga 5226  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||  | || ||||||||||| |    
T  5227 cacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacataaccgaagaaggttagaa 5326  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5327 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 5426  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5427 tatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattga 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 514068 - 514609
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  514068 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 514167  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  514168 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagaagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 514267  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||     
T  514268 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 514367  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    |||||||  |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||| |||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  514368 ggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggtta 514467  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  514468 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 514567  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  514568 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 514609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 496067
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgat 496067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 487 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 441757 - 441700
Alignment:
Q  487 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  441757 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgat 441700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 442238 - 442154
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  442238 attgggtatcataagattcgtaacttttctgaactggtgagcagctgtagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 442154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 537
Target Start/End: Original strand, 164119 - 164651
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  164119 attgggtatcagaagatcagaattttctccgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggagaacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 164218  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| || ||||| |||||||||   ||  | || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  164219 gaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaatcatacagtgcccctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagacgc 164318  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  164319 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgttctaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 164418  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| || |||| ||| || ||||| ||||||| |||| | | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  164419 cacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatcagttcgcattatactcagccgaagaaggttagaa 164518  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||||  ||||| |  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  164519 ccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 164618  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  164619 tatagacactggtgctactcattgtttcattgc 164651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 544
Target Start/End: Original strand, 30770 - 30831
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  30770 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 30831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 459 - 544
Target Start/End: Original strand, 47155 - 47240
Alignment:
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  47155 ttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgat 47240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 30487 - 30549
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  30487 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 30549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 509
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 110  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |    
T  1041 tatcagcagatcagaatcttctctgagttggttaacagatgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggta 942  T
Q  111 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 210  Q
    ||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | |  |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |    
T  941 agggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagttgattgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttc 842  T
Q  211 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 310  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |    
T  841 tgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaat 742  T
Q  311 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 410  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| | |||  ||||| |  | || ||||||||||| || || |    
T  741 ttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatataagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggg 642  T
Q  411 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 510  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  641 gcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattga 542  T
Q  511 tactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  541 tactggtgctagtcattgttttattgctattga 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 54633 - 54095
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  54633 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaa 54534  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |  |||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||    
T  54533 ggagcaaaggacatcagagtcgtccaaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaatagatgaaatgc 54434  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    || | |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  54433 tcttgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggga 54334  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || ||||||||||  ||   ||| || || || || ||||||||||    
T  54333 cacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagctcacggtgcacacaaccgaaaaaggttagga 54234  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    |  |||| || ||||||||||| ||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54233 ccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 54134  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54133 tatagacactggtgttactcattgtttcattgctattga 54095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 140 - 543
Target Start/End: Original strand, 4998 - 5401
Alignment:
Q  140 agtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaa 239  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||    
T  4998 agtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttaaaagagtgatgaaa 5097  T
Q  240 aaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgt 339  Q
    |||||||||| |  |||| |||||   || |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5098 aaggccacaaaaacaatgcttgtggtagaaatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgt 5197  T
Q  340 ttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaa 439  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||     
T  5198 ctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcag 5297  T
Q  440 tcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctg 539  Q
     |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5298 actacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcta 5397  T
Q  540 ttga 543  Q
    ||||    
T  5398 ttga 5401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 252208 - 251670
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  252208 gctattaggtatcagaagattagaattttctctgaattggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgaga 252109  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||| | ||||   || || || ||||| ||||||| ||  || || ||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  252108 ggaggggtaagggacaacataatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgccacaggaaaacataagatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 252009  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||   ||||||||| ||| || || |||||||||| ||||    
T  252008 tgctcttgttgagattgtgtgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagctatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaaa 251909  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||   ||||| ||    
T  251908 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagcc---gaaggcta 251812  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    |||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  251811 ggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgc 251712  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  251711 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattga 251670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 229765 - 229827
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  229765 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 229827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 536
Target Start/End: Original strand, 30077 - 30575
Alignment:
Q  38 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgt 137  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || | ||||||||| | || || |||||| |||||| ||||   || || |    
T  30077 ttggtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattactagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaaacctt 30176  T
Q  138 atagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 237  Q
    | ||||| ||||||||||| || || || |   |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  30177 acagtgctcctgctgacaaagggaaacagaagatgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtga 30276  T
Q  238 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacatt 337  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||   ||||| ||| ||| || || |||||||||  |||||||||||   ||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  30277 aaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagataagaggaaatgttttaggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacatt 30376  T
Q  338 gtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgc 437  Q
    || |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  30377 gtatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 30476  T
Q  438 aatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |  ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30477 agacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattg 30575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 1566 - 2099
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1566 attggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgga 1665  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1666 ggggtaagggaaaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 1765  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    | || |||| ||  |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1766 tactgctgaaataatttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 1865  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||| |||  |||| || ||||| |||||| |||| |    
T  1866 cacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaa 1965  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| |||||||  | |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1966 ccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 2065  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2066 tatagacactggtgctactcattgtttcattgct 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 116214 - 115934
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  116214 ggctattggttatcagaaaataagaaatttctctgatttggtaagcagctgtaggatctgtgaagaagatttgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 116115  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  116114 cgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggaggg 116015  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  116014 atgctcctactgatattgtttgtttcatgtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagt 115934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110657
Alignment:
Q  474 gtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 110657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 263785 - 263279
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  263785 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagttcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtctta 263686  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  263685 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtg 263586  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  |||    
T  263585 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatgg 263487  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     ||  |||| || || ||||  ||||| || || ||||||| | |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  263486 tgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgact 263387  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     |||||||  |    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  263386 ggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 263287  T
Q  531 tcattgct 538  Q
    ||||||||    
T  263286 tcattgct 263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 203940 - 203434
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  203940 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 203841  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  203840 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctggtgagatagtttgttttaagtg 203741  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  |||    
T  203740 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatgg 203642  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     ||  |||| || || ||||  ||||| || || ||||||| | |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  203641 tgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgact 203542  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     |||||||  |    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  203541 ggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 203442  T
Q  531 tcattgct 538  Q
    ||||||||    
T  203441 tcattgct 203434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424362
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgc 424362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 424840 - 424746
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| || ||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||    
T  424840 tatgaggaggataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacaatgcccctgctga 424746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 424697 - 424637
Alignment:
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  424697 tgctcctactgagattgtgtgcttcaactgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtttgt 424637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42267 - 41783
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  42267 tatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaag 42168  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    | ||||| |   ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42167 gaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 42068  T
Q  259 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 358  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |    
T  42067 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggg 41968  T
Q  359 gaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 458  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||    
T  41967 gaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgac 41868  T
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41867 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattga 41783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 512
Target Start/End: Original strand, 1322 - 1832
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||     
T  1322 gctattgggtatcagcagataagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaacataatgagtgaga 1421  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  1422 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcataagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcctaagaggagaga 1521  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  1522 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggacacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 1621  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |  || |||||||||| |||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  1622 ggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcccgaaccgaagaaggtta 1721  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || || ||||| |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1722 gaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 1821  T
Q  502 tattatagata 512  Q
    |||||| ||||    
T  1822 tattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5639 - 5205
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5639 attgggtatcagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 5540  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| || |||||||||||||||   || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5539 gaggtaaaggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgataagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccacgaggagagatgc 5440  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5439 tcctgctgagattgtttgctacaagtgcggcgagaaaggccacaggagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaagga 5340  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  5339 cacacattagctaattgtaagcggggagacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttagga 5240  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaa 439  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  5239 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 5205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 458 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1168
Alignment:
Q  458 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 250 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12301 - 12007
Alignment:
Q  250 gagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaac 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12301 gagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaac 12202  T
Q  350 ttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatg 449  Q
    |  || || ||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  12201 tgtaatgaagaaggacatattagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatg 12102  T
Q  450 aggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12101 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgat 12007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 12322
Alignment:
Q  114 gacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactga 213  Q
    |||| |||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12421 gacagcagagtcgtccgaaatcgtatagtgctcctgctgacaaagataaacagaggctgaatgatgagaggaggccttagaggagagatgctcctactga 12322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 538
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6508
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 131  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |    
T  6002 tctgatttggtaagtcattgcaggatttatgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgaacgaagaggtaagggacaacagagtcgtccta 6101  T
Q  132 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||   || || |||||||| |||||    
T  6102 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgtcgagatagtttgttttaagtg 6201  T
Q  232 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    ||| |||||||||||||||    
T  6202 tggcgagaaaggccacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtgg 6300  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     || ||||| ||||| || |  |||||  | || || |||| | |  |||| || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6301 cgatattgtatgctataattgtaacgaatagggccacatcagtactcagtgcacacaacagaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgact 6400  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     |||| ||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6401 ggtacacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 6500  T
Q  531 tcattgct 538  Q
    ||||||||    
T  6501 tcattgct 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22708 - 22170
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  22708 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattatatggtgatgagtgggcgaa 22609  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || ||||||||  |||||| |   || || || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22608 ggggtaagggacagtagagtcttcctaaaccatacagtgcccctgccgacaaaggaaatcaaagactgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 22509  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    ||||  ||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22508 tcctgttgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt-ttactaaggatgagaagaaatgcttcaagtgtggtcagaaagg 22410  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || ||||||| |||  |||| || ||||| |||||||||||     
T  22409 acacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttaga 22310  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || | ||| |  |||||||| |||||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22309 accgttggtatagtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggta 22210  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22209 ttatagatactggtgttactcattgtttcattgctattga 22170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 538
Target Start/End: Original strand, 9538 - 10037
Alignment:
Q  38 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgt 137  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  9538 ttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgt 9637  T
Q  138 atagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 237  Q
    | |||||||||||||| || |||||||  ||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||    
T  9638 acagtgcccctgctgataagggtaagctgagacttaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcga 9737  T
Q  238 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacat 336  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |    
T  9738 gaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgt 9836  T
Q  337 tgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacg 436  Q
    ||| || || |||| |||||| ||  | ||||||| | |  |||| || | ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  9837 tgtatgttataactgcaacgaagagtgccatatcagtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacg 9936  T
Q  437 caatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    ||  |    |||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9937 cagactactaatga-tataggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattg 10035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 314
Target Start/End: Original strand, 260 - 569
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  260 attggttatcagaagattaaaaacttctctgatttggtaagcagttgcaggatttatgaggaggacaggaaagctcattacaaggtgatgagtaaacgta 359  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  360 gaggtaagggacagcacagtcgtccgaagccgtatagtgctccttctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 459  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  460 tcctatagatattgtttgtttcaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtagtgtttgtgatacagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 559  T
Q  305 cacactttag 314  Q
    ||||| ||||    
T  560 cacacattag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 40611 - 40111
Alignment:
Q  38 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgt 137  Q
    ||||||||  |||| || || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||    
T  40611 ttggtaagtcgttgcagaatctataaagaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtatgggacaacagagtcgtcctaaaccgt 40512  T
Q  138 atagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 237  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||  |||||||| ||    
T  40511 acagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggcga 40412  T
Q  238 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacatt 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||  ||||| |||||| | ||  ||    
T  40411 gaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgtt 40312  T
Q  338 gtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgc 437  Q
    || || || |||| |||||| || || ||||||| | |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  40311 gtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgc 40212  T
Q  438 aatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |  |    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  40211 agactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgc 40112  T
Q  538 t 538  Q
    |    
T  40111 t 40111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 535
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17597
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 535  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatt 17597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 263 - 796
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || || || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  263 attggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgga 362  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | || ||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |  ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  363 ggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtccccctgctgacaagggaaagcaacggctgaatgatgagagaagacccaagaggagagatgc 462  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  463 tcctactgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 562  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| || | | | || ||| |    ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||| |||  |||| || ||||| |||||| |||| |    
T  563 cacacattggctaactgcaagaggaatgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaa 662  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  663 ccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 762  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  763 tatagacactggtgctacacattgtttcattgct 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10841
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattg 10841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 538
Target Start/End: Original strand, 17215 - 17735
Alignment:
Q  18 agataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggaca 117  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17215 agattagaatcttctctgatttggtaaatcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggaca 17314  T
Q  118 acagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatatt 217  Q
     |||||||||   || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||     
T  17315 gcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaaacaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagata 17414  T
Q  218 gtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 316  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||| ||||      
T  17415 gtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcg 17513  T
Q  317 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 416  Q
    ||||  | |||||| ||  |||| || ||||| | |||||| || || ||||||| | |  ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||      
T  17514 gattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaa 17613  T
Q  417 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||  |    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17614 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattgg 17713  T
Q  517 tgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  17714 tgctacttattgtttcattgct 17735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 538
Target Start/End: Original strand, 4621 - 5100
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||| |||||||||  |||||| |    
T  4621 tatgaggaggacacaaaacctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgccccttttgacaagg 4720  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    | ||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4721 gaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccaaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggccagaaaggccacaagagtaatgt 4820  T
Q  259 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 358  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||||    
T  4821 ttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgag 4920  T
Q  359 gaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 458  Q
    || || ||||||| | |  ||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||   |||||  |    ||||||||| | |    
T  4921 gagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtc 5020  T
Q  459 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5021 ttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgct 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 381
Target Start/End: Original strand, 12132 - 12506
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12132 attggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgatgagtgatcgta 12231  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    ||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  12232 gaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaagaggagagatga 12331  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
       ||    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  12332 gggta--agtagagattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaagga 12429  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtg 381  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  12430 cacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtg 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 381
Target Start/End: Original strand, 20312 - 20686
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20312 attggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgatgagtgatcgta 20411  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    ||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  20412 gaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaagaggagagatga 20511  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
       ||    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  20512 gggta--agtagagattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaagga 20609  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtg 381  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  20610 cacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtg 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 544
Target Start/End: Original strand, 12502 - 12605
Alignment:
Q  441 cagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12502 cagtgaatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 12601  T
Q  541 tgat 544  Q
    ||||    
T  12602 tgat 12605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 544
Target Start/End: Original strand, 20682 - 20785
Alignment:
Q  441 cagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20682 cagtgaatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 20781  T
Q  541 tgat 544  Q
    ||||    
T  20782 tgat 20785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3455 - 3222
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3455 ggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtacctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattataaggtgatgagtgag 3356  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3355 cgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagag 3256  T
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  3255 atgctcctactgagattatttgcttcaagtgtgg 3222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 537
Target Start/End: Original strand, 66823 - 67358
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||   || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  66823 gctattgggtatcagcagatcagagtgttctctgatttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 66922  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||| |||||| || ||| | |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  66923 ggaggggcaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgttgacaaaggaaagtagatgatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 67022  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| ||| || |||||||||||||  ||     
T  67023 tgctccttccgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagacatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcaaaag 67122  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| | |||| | ||||   |||| |||| |||||    
T  67123 ggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcgcaatgtagtgagccgaagagggtta 67222  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||  |    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  67223 gaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 67322  T
Q  502 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67323 tattattgatactggtgctactcattgttttattgc 67358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 326151 - 325755
Alignment:
Q  146 cctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcc 245  Q
    |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||| ||    
T  326151 cctgctaacaagggtaagcagaggctgaatgatgagaggaggcc-aataggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgagaaagacc 326053  T
Q  246 acaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgcta 345  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  ||||||| ||    
T  326052 acaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgtta 325953  T
Q  346 caacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtg 445  Q
     |||| ||| || || || ||||||| |||  |||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |        
T  325952 taactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccact 325853  T
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  325852 agtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 325755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 319829 - 319507
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  319829 attgggtatcagaagataaagaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgataagtgatcgaa 319730  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    | ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  319729 ggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaggataagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 319630  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    |||| |||  |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  319629 tcctgctgggattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 319530  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcg 327  Q
    ||||| |||| | ||||||||||    
T  319529 cacacattagctaattgtaagcg 319507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 544
Target Start/End: Original strand, 200338 - 200725
Alignment:
Q  148 tgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 247  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  200338 tgctgacaaagggaagtaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagaagttcctaatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccac 200437  T
Q  248 aagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctaca 347  Q
    ||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||    
T  200438 aagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttca 200537  T
Q  348 acttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaa 447  Q
    | |   |||| ||||||||| | | |||| |||| | | ||||||||| ||||  | ||||||| ||||||         ||| |||||||  | || ||    
T  200538 attgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagagggttcaggcaggtggaaaggtg---------actggtacgcagacggttaa 200628  T
Q  448 tgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  200629 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgat 200725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 197 - 543
Target Start/End: Original strand, 764 - 1110
Alignment:
Q  197 agagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 296  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  764 agagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggcaagaaaggccataagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 863  T
Q  297 ggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaa 396  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| || || |||||||||| |||  |||||||||| || | |||    
T  864 agaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaa 963  T
Q  397 ggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactccttta 496  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |    | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  964 ggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 1063  T
Q  497 attgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1064 attgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 3769 - 3920
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3769 attgggtatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 3868  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaa 156  Q
    |  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3869 ggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaa 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 538
Target Start/End: Original strand, 53141 - 53674
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  53141 attgggtatcaaaagattagaatcttctcggatttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagacaccaaggctcattataaggtgatgagtgagcgaa 53240  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||  |||||||| ||   ||||   || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53241 gagataagggacatcaagttcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 53340  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    || | |||  || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  53341 tcttgctgggatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgattcaggtgtggtcaaaaagg 53439  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 403  Q
    |||||   |||||||||| |||||||| ||| | || || || ||||  || || || || ||||||| |||  | || ||  |||| |||||||||||     
T  53440 acacatcctagttgattgcaagcgtggtgacgtggtatgttataactgtaatgaagagggccatatcagttcacaatgcacatagccgaagaaggttaga 53539  T
Q  404 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgcta 503  Q
    || ||||| || || ||||| |||||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53540 accggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 53639  T
Q  504 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53640 ttatagaaactggtgctactcattgtttcaatgct 53674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 3211 - 2783
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||      |    
T  3211 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgtgt------a 3118  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||  |||| ||||||| |   || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3117 gaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 3018  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||  ||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  3017 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagttcttcaggtgtggacagaaggga 2918  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||  ||||| | || || ||||||||||| |    
T  2917 cacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaa 2818  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaa 439  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  2817 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 504
Target Start/End: Original strand, 518 - 1020
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||| | |||||| ||     
T  518 gctattgggtatcagcagattagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagtttattacaagataatgagttaga 617  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||  |||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  618 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctattgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 717  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  718 tgctccttctgagattgtttgttacaagtttggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaag 817  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 401  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |  || |||||||| | |||| ||||| |  | || ||||||||||    
T  818 ggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtcatattagttcgcagtgtcctgaaccgaagaaggtta 917  T
Q  402 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgc 501  Q
    | ||  | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  918 gaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 1017  T
Q  502 tat 504  Q
    |||    
T  1018 tat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 215 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30310 - 29982
Alignment:
Q  215 attgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 314  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||   |||    
T  30310 attgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtttgtggtagagatgagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacctag 30211  T
Q  315 ttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaa 414  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  || |||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||| |  ||||| ||    
T  30210 ctgaatgtaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaa 30111  T
Q  415 ggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatact 514  Q
    ||||||||| |||| | |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30110 ggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatact 30011  T
Q  515 ggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30010 ggtgctactcattgttttattgctattga 29982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30499 - 30336
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||   |||||||||     
T  30499 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagacaatgagtgaga 30400  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagca 165  Q
    | || ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  30399 ggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagca 30336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1090 - 798
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1090 attgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggataataaggctcattacaaggtgatgagtgagcgca 991  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  990 gaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 891  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcg 297  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  890 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggctagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtggtcg 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 378 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 631
Alignment:
Q  378 agtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgttt 477  Q
    ||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  796 agtgtacacaaccgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgttt 697  T
Q  478 ctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  696 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15658 - 15292
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15658 attgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggaaacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 15559  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
       |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15558 tgagcaaaggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagcgaaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 15459  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 303  Q
    |||| |||| ||| | || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15458 tcctgctgagattttctgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggacgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaatg 15360  T
Q  304 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 371  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || |||||||    
T  15359 acacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatca 15292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 446 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15268 - 15171
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15268 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 15171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 416 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 6288 - 6173
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6288 gtgtttggtttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 6189  T
Q  516 gtgctactcattgttt 531  Q
     |||||| ||||||||    
T  6188 atgctacgcattgttt 6173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 116022 - 115615
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    |||||||| || ||||||||||  || || |||||  || ||||||||||||  ||||||||| | |||||  ||||| |||| || ||||| || ||||    
T  116022 aagccgtacagcgcccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagggaagagacactcctgctgaaatagtttgctttaagt 115923  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| |||||| ||||||||    
T  115922 gtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtgg 115823  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     || || || ||||| || | ||| | ||| |||||||||| |||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||    
T  115822 tgatatagtatgctataattgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggct 115723  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     ||| |||| |    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  115722 ggtatgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtt 115623  T
Q  531 tcattgct 538  Q
    ||||||||    
T  115622 tcattgct 115615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 538
Target Start/End: Original strand, 93996 - 94145
Alignment:
Q  389 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataata 488  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  93996 cctaagaaggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 94095  T
Q  489 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  94096 ctcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgct 94145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 93618 - 93703
Alignment:
Q  11 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 96  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  93618 tatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 93703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 107543 - 107643
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |  ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  107543 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgagatagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 107642  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  107643 a 107643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 252
Target Start/End: Original strand, 33087 - 33337
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33087 gctattgggtatcaaaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 33186  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || |||||||| |||||||||   || || || ||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33187 gaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 33286  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 252  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287 tgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 33337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 23638 - 24007
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||| ||||||| ||| | |||||||||     
T  23638 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaaactcattataagattatgagtgaga 23737  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||||||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23738 ggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 23837  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 301  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  23838 tgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 23937  T
Q  302 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 371  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  23938 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggggaaggtcatatca 24007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12173 - 11857
Alignment:
Q  215 attgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 314  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  12173 attgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttag 12074  T
Q  315 ttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaa 414  Q
     ||| || ||||||||||||||| | || ||||||| ||| | |            | |||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| ||    
T  12073 ctgaatgcaagcgtggggacattatctgttacaactgcaatggg------------agttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaa 11986  T
Q  415 ggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatact 514  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11985 ggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 11886  T
Q  515 ggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11885 ggtgctactcattgttttattgctattga 11857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 1019 - 1305
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  1019 gctattgggtatcagcagatcagattcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttacgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 1118  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 201  Q
    | || || ||||||||  ||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1119 ggaggggaaagggacagaagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 1218  T
Q  202 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 288  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  1219 tgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcag 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 341 - 543
Target Start/End: Original strand, 19023 - 19225
Alignment:
Q  341 tgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaat 440  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||     
T  19023 tgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaa 19122  T
Q  441 cagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 540  Q
    |    | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19123 ccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctat 19222  T
Q  541 tga 543  Q
    |||    
T  19223 tga 19225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 544
Target Start/End: Original strand, 3999 - 4346
Alignment:
Q  197 agagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||      
T  3999 agagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtttggtgaaaagggaaacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagatgtgtttcctgtgtggga 4098  T
Q  297 ggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaa 396  Q
     |||| |||||||  ||| ||| || || | ||| |||||||| || | ||| |   | || ||||||||| | |  ||| | |  | | ||||||||||    
T  4099 agaaaagacacacaatagctgagtgcaaacatggagacattgtctgtttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatccaggaagcctaagaa 4198  T
Q  397 ggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactccttta 496  Q
    || |  |||| |||| ||||||||| | |||||  ||||     | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4199 ggctcagacaagtggaaaggtgttttcattgaccggtacatggacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 4298  T
Q  497 attgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4299 attgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 575 - 775
Alignment:
Q  1 ggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    ||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  575 ggctattggctaccaaaagataaggaatttttcttaattagtgagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcac-ataaggtgatgagtgag 673  T
Q  101 cgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 200  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  674 tgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtacagtgctcctgctgacaaaggtaaatagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagag 773  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  774 at 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 205 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12214 - 11875
Alignment:
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 304  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |  | |||||||| ||||||||  | |||||   ||||||     
T  12214 tcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggtgatgagaaaaagtgctttcgatgtgggaagaaaggg 12115  T
Q  305 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 404  Q
    || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | | |||| |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  12114 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaga 12015  T
Q  405 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctat 504  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  || | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12014 caggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 11915  T
Q  505 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11914 tatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgat 11875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 446 - 544
Target Start/End: Original strand, 14 - 112
Alignment:
Q  446 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgat 112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 544
Target Start/End: Original strand, 3736 - 4146
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||  ||| |||||||| | |||||    
T  3736 aagccctatagtgctcctgctgacaaggggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgtttctgttgagattgtttgctacaagt 3835  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 330  Q
    |||| || |  ||||||||||||||||| ||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || ||  |  ||| ||| || ||||||||    
T  3836 gtggcgagaggggccacaagagtaatgtctgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtgg 3935  T
Q  331 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcaattcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 430  Q
     || ||||||| || ||| |   |  | ||||||||| | || ||| | || | | |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||     
T  3936 tgatattgtttacttcaattgtgataaagaaggtcatcttaactcgcaatgcatgaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgacc 4035  T
Q  431 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 530  Q
     |||| ||  | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  4036 ggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtt 4132  T
Q  531 tcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||    
T  4133 tcattgctgttgat 4146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 480 - 544
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8036
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgat 8036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7754
Alignment:
Q  212 gatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7704 gatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 7754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 90
Target Start/End: Original strand, 7542 - 7582
Alignment:
Q  50 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7542 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggt 7582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Original strand, 16351 - 16584
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||     
T  16351 ttttctgaattggtgagaagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagagtcgtc 16450  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
      ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  | || |||| ||||| ||||  ||||||| | |||    
T  16451 caaagccttatagtgctcctgctgataaaggtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaa 16550  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16551 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 16584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 416 - 518
Target Start/End: Original strand, 16738 - 16840
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16738 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactg 16837  T
Q  516 gtg 518  Q
    |||    
T  16838 gtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8119 - 7911
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  8119 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 8020  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
     |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  8019 cgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaa 7920  T
Q  229 gtgtggtga 237  Q
    |||||||||    
T  7919 gtgtggtga 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 1244
Alignment:
Q  162 agcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 261  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1368 agcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 1269  T
Q  262 tgaccgagatgagaagaagtgcttc 286  Q
      |  | || |||||||||||||||    
T  1268 caatggtgaggagaagaagtgcttc 1244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 543
Target Start/End: Original strand, 9396 - 9483
Alignment:
Q  456 gacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9396 gacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 9483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 538
Target Start/End: Original strand, 3 - 85
Alignment:
Q  456 gacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgct 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2363 - 2198
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2363 tatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctactgacaaag 2264  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtt 224  Q
    | ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  2263 gaaagcaaaggttgaatgatgagaggaggcggaataggagagatgctcctgctgagatagtttgtt 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 753 - 850
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  753 attggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtgagcg 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15457
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  || | ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgat 15457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15996 - 15739
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  15996 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagttggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagga 15897  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     |||||||   |  || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||| | ||||||  | || |||||     
T  15896 aaggcaagtttccgcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggcaaacaaagagttaatgatgagaggcggcccagcaagaaagatgt 15797  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15796 tgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 15739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26046 - 25949
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26046 attggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtgagcg 25949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 996 - 1237
Alignment:
Q  53 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 152  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || |||||||||||||| ||||    
T  996 aggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgaagagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccggctg 1095  T
Q  153 acaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 252  Q
    | || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||  | |||| || |||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  1096 ataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagaagggtgcttctgctgagatagtatgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagag 1195  T
Q  253 taatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 294  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1196 taacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 1
Alignment:
Q  8 ggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagag 107  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | || |||||| ||      
T  149 ggttatcagaagattagaaatttttctgaattggtaagcagcagtaggatttatgaagaggatacgagagctcactataaggttaggaatgagcggagga 50  T
Q  108 gcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaa 156  Q
     |||||| || ||  |||||  |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  49 acaagggtcagcaaggtcgtccgaagccctatagtgctcctgttgacaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7202
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  7459 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcgga 7360  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||||||| | || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  | || ||||||    
T  7359 aaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgc 7260  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  7259 tcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 7202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14589 - 14332
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  14589 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcgga 14490  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||||||| | || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  | || ||||||    
T  14489 aaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgc 14390  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14389 tcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 14332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 487 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6977 - 6920
Alignment:
Q  487 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  6977 tactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 487 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14107 - 14050
Alignment:
Q  487 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14107 tactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36551
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgct 36551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36958 - 36827
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || || || |||||||| |    
T  36958 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagatcgtctgtttcaatt 36859  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36858 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 36827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 57332 - 57589
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  57332 attggttaccagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgtagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcgga 57431  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     |||||| || || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  | || ||||||    
T  57432 aaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgc 57531  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||  ||| |||||||  |  |  ||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  57532 tcctgttgagattgtttactatacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgt 57589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 536
Target Start/End: Original strand, 57746 - 57863
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||   |  | ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  57746 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 57845  T
Q  519 ctactcattgtttcattg 536  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  57846 ctacacattgttttattg 57863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5263 - 5135
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||| |  | || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5263 gtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactg 5164  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  5163 gtgctacgcattgttttattggtgttgat 5135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5674 - 5589
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    ||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5674 attggatatcagaagatccgtgacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggt 5589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11203 - 11075
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11203 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactg 11104  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  11103 gtactactcattgttttattgctattgat 11075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11614 - 11466
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  11614 attggttaccagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagga 11515  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
     ||||||||| || || ||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  11514 aaggcaagggtcagcaaagtcgtcccaagccttatagtgcccctgctga 11466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17925
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgat 17925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111164
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 111164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18431 - 18174
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||| |||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||| |||| | |    
T  18431 attggttaccagaagatccgtaacttttttgagctggtgagtagttgcagaatttatgaagaagataccaaagctcattacaaggctgtgaatgagagga 18332  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||| || || ||  | ||||||   ||||| || | ||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | || ||||||    
T  18331 aaggtaaaggtcagaaaagtcgtccaaagccttacaatgctcctgctgataagggtaagcaaagagttaatgatgagaggaggccaagaaagaaagatgc 18232  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    | || |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18231 tactgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 18174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 461 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 2054
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2129 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattg 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 30746 - 30843
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcg 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30746 attggttatcagaggattaggcaattttctgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggataccaaagctcattacaaggttatgtgtgagcg 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 285
Target Start/End: Original strand, 30895 - 31011
Alignment:
Q  169 attgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 268  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |  |     
T  30895 attgaatgatgagaggagaactaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggt 30994  T
Q  269 gatgagaagaagtgctt 285  Q
    |||||||||||||||||    
T  30995 gatgagaagaagtgctt 31011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 536
Target Start/End: Original strand, 216552 - 216669
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||   | | ||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  216552 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtg 216651  T
Q  519 ctactcattgtttcattg 536  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  216652 ctacacattgttttattg 216669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 216138 - 216395
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||  || | |||||||| |  || |||||  ||||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  216138 attggttaccagaagatccgtaacttttctgagctgctgagcagttgcataatatatgagaaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagga 216237  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 204  Q
     ||||||||| || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||| |  | || |||||     
T  216238 aaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgataaaaggaggcctagaaagaaagatga 216337  T
Q  205 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  216338 tgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 216395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Original strand, 13608 - 13736
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||  |  | ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13608 gtgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattg 13707  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
     |||||| |||||||  |||||| |||||    
T  13708 atgctacacattgttctattgctattgat 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 13213 - 13449
Alignment:
Q  26 aacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtc 125  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||| |||| ||||  ||| |||| | | ||||||||| || || |||     
T  13213 aacttttctgagctggtgagcagttgtagaatatatgaggaagatactaaggctcgttacgaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtt 13312  T
Q  126 gttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgttt 225  Q
    ||   ||| | |  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |  | || ||||| |  |||||| |||||||| |     
T  13313 gtccaaagtcttgcagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgttgttactgagattgtttgcta 13412  T
Q  226 caagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  13413 cacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 13449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Original strand, 9840 - 9922
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaa 87  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9840 attggatatcagaagatccgtaactttactgaattagtgagcagttgcagaatctatgaagaggataccaaagcacattacaa 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 262
Target Start/End: Original strand, 240 - 455
Alignment:
Q  47 agttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgccc 146  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| |||| |||||    
T  240 agttgtagaatctatgaagaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatattgccc 339  T
Q  147 ctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 246  Q
    ||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  340 ctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctacggagattgtttgtttcaattgtggcgagaaaggcca 439  T
Q  247 caagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||| |||||||||    
T  440 caagagcaatgtttgt 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 538
Target Start/End: Original strand, 674 - 731
Alignment:
Q  481 taataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8463
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| |||||  |  | |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8585 gtgtttgctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 8486  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  8485 gtgctacgcattgttttattgct 8463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17991
Alignment:
Q  463 cagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 17991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11599 - 11523
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11599 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 11523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 55134 - 55058
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  55134 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10409
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgct 10409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 10071 - 10133
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10071 gatgctcctacggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 10133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15830
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgct 15830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14523
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  14398 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtg 14497  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||    
T  14498 ctacacattgttttatttctattgat 14523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15236
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || | || |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgat 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8311
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8388 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgct 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22377 - 22300
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22377 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 7366 - 7289
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7366 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 7289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 3554 - 3477
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17620 - 17489
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  17620 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacatagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaatt 17521  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17520 gtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 17489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17213
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 17213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3953 - 3859
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||    
T  3953 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 3859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1397
Alignment:
Q  6 ttggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtag 105  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| | |     
T  1141 ttggatatcagaagatcggtaacttttctaaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcatcacaaggctgtgagtgagaggaa 1240  T
Q  106 aggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgct 205  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||| || ||| |||| ||  |||||||||||| | | |||||||||| |||   |    
T  1241 aggtaagagtcaacagaatcgtccaaagccttacagtactcctgctgataagggtgagcagagggtgaatgatgagaggggacccaagaggaaagagaat 1340  T
Q  206 cctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||  ||||||||| |   || || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1341 cctactgaagttgtttgttaccgatgaggagagaaaggtcacaagagtaatggttgt 1397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 537  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 64
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 64  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4481
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 4481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 201
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11311
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 11311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 104788 - 104561
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 128  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||     
T  104788 ttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtc 104689  T
Q  129 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 228  Q
      ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| ||| |||||||| | |||| |  | || ||||||||||  ||| |||||||| |  |     
T  104688 caaagccttatagtgctcctgctgataagggaaaacagagaatgattgatgagaggcggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatac 104589  T
Q  229 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaat 256  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  104588 ttgtggtgagaaaggccacaagagtaat 104561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2924
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 531  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 943 - 1020
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 613 - 744
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||| ||||||||  |||| |||  ||||||||| |    
T  613 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatgctccagctgagattacttgtttcaatt 712  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  713 gtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 552 - 629
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 88
Target Start/End: Original strand, 130 - 179
Alignment:
Q  39 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 88  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  130 tggtgagcagttgcaggatttatgatgaggatactaaggctcattacaag 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 10498 - 10421
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  10498 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 10421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29179
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgct 29179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17828 - 17703
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  17828 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgaga 17729  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    | || || |||||||| |||||||||    
T  17728 ggaggggtaagggacagcagagtcgt 17703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13375
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 13375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 13037 - 13099
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13037 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 41285 - 41208
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  41285 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgct 41208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 203 - 20
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  |||| |||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  203 attggttaccagaaaatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcaaaatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttgtgaatgagagga 104  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 189  Q
     ||||||||  || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  103 aaggcaaggt-cagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcc 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36245 - 36161
Alignment:
Q  174 atgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    ||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36245 atgatgagaggagacctaagagaagagatgcccctactaagattgtttgctacaggtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 36161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 496 - 544
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49134
Alignment:
Q  496 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgat 49134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1364
Alignment:
Q  456 gacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattat 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1415 gacttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1704 - 1583
Alignment:
Q  167 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 266  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   ||    
T  1704 agattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgttaagggccacaagagtaatgcttgcaccc 1605  T
Q  267 gagatgagaagaagtgcttcag 288  Q
     |||||||||||| || |||||    
T  1604 aagatgagaagaaatgtttcag 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1771
Alignment:
Q  35 gaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 100  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  1836 gaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgag 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3598
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  3681 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgat 3598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 93
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  148 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 93  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 431 - 369
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  431 gatgttcctgctgagattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 541
Alignment:
Q  32 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  599 tctgagttggtgagcagttgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaaggt 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 7913 - 7996
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgat 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 262
Target Start/End: Original strand, 4498 - 4530
Alignment:
Q  230 tgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4498 tgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgt 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55727
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgat 55727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48293 - 48059
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  48293 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgt 48194  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  48193 cctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 48094  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48093 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 48059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Original strand, 55212 - 55441
Alignment:
Q  28 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  55212 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagacaaaggtcagcagagtcgt 55311  T
Q  128 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 227  Q
       ||| | || ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  55312 cctaagacttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 55411  T
Q  228 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 257  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||    
T  55412 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 55441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41679
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 41679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75399
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgat 75399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 483 - 536
Target Start/End: Original strand, 34911 - 34964
Alignment:
Q  483 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 536  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  34911 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattg 34964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9326
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |  | || |||| || ||||||| |||||||| |  |  |    
T  9195 aagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactactgagattgtttgctatactt 9294  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9295 gtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 9326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Original strand, 23430 - 23555
Alignment:
Q  419 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 518  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||  |||||||||  || | ||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||    
T  23430 tttgctttgactggtacgaaggcacagaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtg 23529  T
Q  519 ctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||    
T  23530 ctacgcattgttttattgctcttgat 23555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 9068 - 9153
Alignment:
Q  4 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 89  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  9068 tattgggtatcagaagatccgttacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 9153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 487 - 544
Target Start/End: Original strand, 9551 - 9608
Alignment:
Q  487 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  9551 tactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgat 9608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 208
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  270 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 538
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11607
Alignment:
Q  464 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 11607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 11269 - 11331
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11269 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 14954 - 15016
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14954 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 15016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1267
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 522  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 1267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2252
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2313 ttttctgaattggtgagtagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggt 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 2437 - 2514
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  2437 atcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgct 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14964
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15041 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 14964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15463 - 15349
Alignment:
Q  39 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgta 138  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||    ||||| ||    
T  15463 tggtgagcagttgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagcctta 15364  T
Q  139 tagtgcccctgctga 153  Q
    |||||||||||||||    
T  15363 tagtgcccctgctga 15349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Original strand, 36994 - 37071
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36994 atcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgct 37071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26527 - 26399
Alignment:
Q  416 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 515  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||  || | || |||||||  ||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  26527 gtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattg 26428  T
Q  516 gtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  26427 gtgctacgcaatgttttattgttgttgat 26399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26914 - 26853
Alignment:
Q  29 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 90  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26914 ttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaatatacgaaagctcattacaaggt 26853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 1029
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 1029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31936
Alignment:
Q  462 tcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgct 31936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37402
Alignment:
Q  462 tcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgct 37402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10479
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 10479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13134
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 13134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 10152 - 10214
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10152 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 10214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 12807 - 12869
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12807 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 12869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 2036
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgat 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2575 - 2427
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    |||||||| ||||||||  ||  |||||||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  2575 attggttaccagaagatccgagtcttttctgagctggtgagcagttgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaa 2476  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 153  Q
      | |||||| ||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||||    
T  2475 aggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcccttgctga 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 117
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  248 aagccctatagtgcccctgctgataagggaaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaatt 149  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  148 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40764
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgat 40764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8270
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 544  Q
    ||||||||||||||||  | | ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgat 8270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21904
Alignment:
Q  496 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgct 21904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 527
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  458 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18703
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  18780 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgct 18703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 538
Target Start/End: Original strand, 24910 - 24963
Alignment:
Q  485 aatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24910 aatacgcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 24963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5045
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  480 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgcta 521  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 171489 - 171447
Alignment:
Q  220 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  171489 ttgttacaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 171447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 468
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 104  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||| | |    
T  652 attggatatcaaaagatccgtaacttttctgaactggtgtgcagttgcagagtctatgaggaggatactaaagctcattacaaggctgtgagtgagagga 553  T
Q  105 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 189  Q
     ||| ||||| || || |||||    ||||| || || || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  552 aaggtaagggtcagcaaagtcgcccaaagccttacagcgctcctgctgataagggtaaacaaagagtgaatgatgagaggaggcc 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 504 - 445
Alignment:
Q  201 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 260  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  504 atgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 528  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  68 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 13769 - 13932
Alignment:
Q  2 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 101  Q
    |||||| | |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  13769 gctattagatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattaaaagataatgagtgaga 13868  T
Q  102 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagca 165  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  13869 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagca 13932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5530 - 5327
Alignment:
Q  59 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 158  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| |||||||||| |||||| || |    
T  5530 tatgatgaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttgctgataagg 5431  T
Q  159 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 258  Q
    | || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  5430 gcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaagggccataagagtaatgt 5331  T
Q  259 ttgt 262  Q
    ||||    
T  5330 ttgt 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 139454 - 139585
Alignment:
Q  131 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||| ||| ||||  |||| |||  ||| ||||| |    
T  139454 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatactccagctgagattacttgcttcaatt 139553  T
Q  231 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139554 gtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 139585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 179
Alignment:
Q  224 ttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  217 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 13945 - 14007
Alignment:
Q  200 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13945 gatgctcctgcggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 9077 - 9011
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9077 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatt 9011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 4874 - 4967
Alignment:
Q  162 agcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 255  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||  ||||| |||| || ||||||| || ||||||||| || || |||||||||||    
T  4874 agcataggttgaatgacgagaggaggcccaagaaggaagagactcctgctgaaatagtttgttacaggtgtggtgagaagggtcacaagagtaa 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 70
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16306
Alignment:
Q  5 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggat 70  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  16241 attggttaccagaagattcgaaacttttctgagctggtgagcagttgcaggatttacgaggaggat 16306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21734 - 21657
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||    
T  21734 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgct 21657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37158 - 37081
Alignment:
Q  461 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 538  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||    
T  37158 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgct 37081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 527  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 262
Target Start/End: Original strand, 17920 - 17952
Alignment:
Q  230 tgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17920 tgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  482 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 534  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University