View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7783_low_2 (Length: 554)

Name: NF7783_low_2
Description: NF7783
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7783_low_2
NF7783_low_2
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (15-540)||(29967588-29968113)
chr7 (15-540)||(11277254-11277780)
chr7 (15-540)||(47876596-47877121)
chr7 (15-540)||(37919157-37919682)
chr7 (15-540)||(235439-235966)
chr7 (15-540)||(4938130-4938655)
chr7 (15-540)||(17720257-17720773)
chr7 (15-420)||(31177427-31177832)
chr7 (17-125)||(38890137-38890245)
chr7 (228-507)||(25619285-25619564)
chr7 (229-507)||(37254585-37254863)
chr7 (427-507)||(18532653-18532733)
chr7 (15-74)||(48394517-48394576)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (15-536)||(32266177-32266698)
chr8 (15-540)||(13396001-13396526)
chr8 (15-540)||(41665371-41665896)
chr8 (15-540)||(7923999-7924524)
chr8 (15-540)||(9922214-9922739)
chr8 (16-540)||(171717-172241)
chr8 (15-540)||(8299416-8299941)
chr8 (15-327)||(32567480-32567791)
chr8 (15-370)||(20496697-20497052)
chr8 (14-507)||(5181281-5181775)
chr8 (244-540)||(20824138-20824434)
chr8 (325-540)||(13200046-13200261)
chr8 (229-540)||(2170167-2170480)
chr8 (229-507)||(43270277-43270555)
chr8 (325-494)||(34137011-34137180)
chr8 (229-540)||(37433959-37434270)
chr8 (325-474)||(2529809-2529958)
chr8 (324-509)||(13879520-13879705)
chr8 (427-507)||(17699507-17699587)
chr8 (15-74)||(34137431-34137490)
chr8 (27-93)||(29733399-29733465)
chr8 (15-73)||(12257920-12257978)
chr8 (15-73)||(12265312-12265370)
chr8 (229-377)||(17699309-17699457)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (15-526)||(8227639-8228150)
chr5 (15-539)||(23237996-23238521)
chr5 (15-540)||(35983793-35984317)
chr5 (15-540)||(27117163-27117688)
chr5 (15-540)||(12824812-12825337)
chr5 (15-540)||(28535677-28536202)
chr5 (15-540)||(30732316-30732841)
chr5 (15-540)||(42513333-42513858)
chr5 (15-540)||(42927744-42928269)
chr5 (15-456)||(12820035-12820476)
chr5 (27-507)||(19255157-19255638)
chr5 (19-370)||(3418400-3418751)
chr5 (15-306)||(25824624-25824915)
chr5 (15-157)||(31641370-31641512)
chr5 (229-507)||(25857459-25857737)
chr5 (403-540)||(31641513-31641649)
chr5 (229-540)||(33385376-33385687)
chr5 (229-540)||(8300184-8300495)
chr5 (324-507)||(10776686-10776869)
chr5 (301-540)||(27766941-27767180)
chr5 (27-250)||(32228429-32228652)
chr5 (324-509)||(27795405-27795590)
chr5 (216-540)||(18359094-18359416)
chr5 (427-505)||(18089798-18089876)
chr5 (467-540)||(24407993-24408066)
chr5 (35-107)||(27166387-27166459)
chr5 (15-74)||(26072506-26072565)
chr5 (380-507)||(33169636-33169763)
chr5 (427-505)||(26072917-26072995)
chr5 (29-107)||(29142427-29142505)
chr5 (462-538)||(27165956-27166032)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (15-540)||(34332817-34333342)
chr3 (15-540)||(40930530-40931055)
chr3 (15-540)||(2363890-2364415)
chr3 (15-540)||(19920231-19920756)
chr3 (15-540)||(7312390-7312914)
chr3 (15-540)||(10323573-10324098)
chr3 (15-505)||(7031931-7032421)
chr3 (294-507)||(26771024-26771237)
chr3 (229-504)||(7031055-7031330)
chr3 (427-540)||(29523747-29523860)
chr3 (324-540)||(11203741-11203957)
chr3 (229-507)||(35214406-35214684)
chr3 (427-507)||(33496572-33496652)
chr3 (229-540)||(12342228-12342538)
chr3 (15-85)||(10312991-10313061)
chr3 (375-540)||(17097878-17098043)
chr3 (25-85)||(15827334-15827394)
chr3 (15-74)||(15312195-15312254)
chr3 (382-540)||(2755822-2755980)
chr3 (229-383)||(36801234-36801388)
chr3 (15-62)||(926734-926781)
chr3 (463-503)||(16179009-16179049)
chr3 (410-533)||(963172-963295)
chr3 (457-507)||(19890733-19890783)
chr3 (448-505)||(15312629-15312686)
chr3 (427-507)||(36801110-36801190)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (15-540)||(15739834-15740359)
chr4 (15-540)||(19754876-19755405)
chr4 (15-540)||(19784401-19784930)
chr4 (15-540)||(47685897-47686422)
chr4 (15-540)||(23642593-23643118)
chr4 (15-540)||(7403525-7404051)
chr4 (15-540)||(13270893-13271418)
chr4 (15-540)||(47418418-47418942)
chr4 (259-540)||(1828542-1828823)
chr4 (15-370)||(159863-160218)
chr4 (15-321)||(20788501-20788807)
chr4 (229-500)||(12697640-12697911)
chr4 (15-157)||(17402071-17402213)
chr4 (294-507)||(11587233-11587446)
chr4 (283-507)||(20002599-20002830)
chr4 (427-507)||(45472744-45472824)
chr4 (427-507)||(55725721-55725801)
chr4 (15-77)||(8890636-8890698)
chr4 (15-64)||(43019554-43019603)
chr4 (27-107)||(11587633-11587713)
chr4 (448-507)||(8361146-8361205)
chr4 (15-86)||(23163087-23163158)
chr4 (15-85)||(16427162-16427232)
chr4 (324-509)||(54483192-54483377)
chr4 (17-157)||(19740425-19740565)
chr4 (229-383)||(8360927-8361081)
chr4 (27-97)||(2822482-2822552)
chr4 (427-507)||(2822072-2822152)
chr4 (463-503)||(5790131-5790171)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (15-540)||(51052093-51052618)
chr1 (15-540)||(11909107-11909632)
chr1 (15-540)||(35540662-35541187)
chr1 (15-540)||(6050215-6050741)
chr1 (15-343)||(6259430-6259758)
chr1 (15-337)||(4842012-4842339)
chr1 (15-266)||(26059504-26059755)
chr1 (15-227)||(12813519-12813731)
chr1 (325-540)||(47623079-47623292)
chr1 (17-257)||(13351929-13352169)
chr1 (283-507)||(37191245-37191469)
chr1 (229-507)||(16917844-16918122)
chr1 (427-507)||(43388392-43388472)
chr1 (15-89)||(24547519-24547593)
chr1 (15-107)||(47623500-47623592)
chr1 (448-500)||(22191823-22191875)
chr1 (464-540)||(28351776-28351852)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (15-517)||(12733738-12734240)
chr6 (15-540)||(24767426-24767951)
chr6 (15-540)||(18651236-18651761)
chr6 (15-373)||(21167838-21168196)
chr6 (253-540)||(2553488-2553775)
chr6 (15-344)||(5734439-5734768)
chr6 (16-162)||(18789259-18789405)
chr6 (324-507)||(14373026-14373209)
chr6 (398-540)||(21168194-21168337)
chr6 (294-540)||(15958815-15959061)
chr6 (229-507)||(17579116-17579394)
chr6 (229-540)||(20883035-20883346)
chr6 (229-507)||(17573690-17573968)
chr6 (229-540)||(21630109-21630422)
chr6 (442-507)||(17606369-17606434)
chr6 (324-540)||(10577251-10577467)
chr6 (15-155)||(15959201-15959341)
chr6 (15-145)||(32536508-32536638)
chr6 (15-106)||(14373427-14373518)
chr6 (410-533)||(13937708-13937831)
chr6 (324-368)||(11462334-11462378)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (209-540)||(3059-3390)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (15-540)||(105845-106370)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (15-540)||(11207-11732)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (28-540)||(4551795-4552307)
chr2 (27-540)||(41206631-41207154)
chr2 (15-503)||(15917266-15917755)
chr2 (324-507)||(28252642-28252825)
chr2 (325-507)||(17764997-17765179)
chr2 (325-507)||(12645459-12645641)
chr2 (229-507)||(10999986-11000263)
chr2 (229-507)||(14439580-14439857)
chr2 (329-540)||(38604376-38604587)
chr2 (27-86)||(17765418-17765477)
chr2 (15-107)||(28252334-28252426)
chr2 (324-540)||(40176591-40176806)
chr2 (15-74)||(12645149-12645208)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (16-162)||(5792-5938)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (28-74)||(6477-6523)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 29967588 - 29968113
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29967588 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatttgtggcagcgta 29967687  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967688 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattccgttcattccacagcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 29967787  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967788 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctaaggttgaatgagaatctactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 29967887  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29967888 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgcc 29967987  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967988 aaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcctcaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 29968087  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29968088 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 29968113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 11277780 - 11277254
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggtt-gatttcacattatctagcatatgtggcagcgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||   |    
T  11277780 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagtttgatttcactttatctagtatttgtggcaaaat 11277681  T
Q  114 actttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11277680 actttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccaaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaa 11277581  T
Q  214 caacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11277580 caacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcac 11277481  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11277480 taaaatttacacaagactaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 11277381  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11277380 caaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgg 11277281  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11277280 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 11277254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 47876596 - 47877121
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  | |    
T  47876596 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttttctagcatttgtggcaaagaa 47876695  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  47876696 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccatcgccctctcgaac 47876795  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| || | | ||||| |||||    
T  47876796 aacctgcataattaataaattgcaaaaaataatctgaagttgattaagagtcgacccctaccactcctagccatgcccgcatcaattgtcataatgcact 47876895  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47876896 aaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccgcatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 47876995  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |    
T  47876996 aaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccctattttgat 47877095  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  47877096 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 47877121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 37919157 - 37919682
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  37919157 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagta 37919256  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  37919257 ctttgtctatttctaaaaatcctatcatccatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgtcatcttctcaaac 37919356  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37919357 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcact 37919456  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37919457 aaaagttacacaagacaaaaataaatgattaacatcttcaacgttcccacaactagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgcc 37919556  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |    
T  37919557 aaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttataccaaattaacttcatatgatgat 37919656  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  37919657 gtaattggggctgctcctgtgatgtc 37919682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 235966 - 235439
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |      
T  235966 cgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagag 235867  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  235866 ctttgtctatttctaaaaatcatatcatttcgttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaacgtcgccctctcgaac 235767  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  235766 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaatttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccattggccataaggcact 235667  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235666 aaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcgcaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 235567  T
Q  415 aaat--tacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatg 512  Q
    ||||  |  |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  235566 aaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattttg 235467  T
Q  513 gtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  235466 atgtaactggggctgctcctgtgatgtc 235439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 4938655 - 4938130
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||  || ||||  |||    
T  4938655 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagttaacttcactttatcgagcaattgaggcactgta 4938556  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4938555 ctttgactatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 4938456  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| || |  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4938455 aacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 4938357  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  4938356 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 4938257  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  4938256 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatgg 4938157  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4938156 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 4938130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 17720257 - 17720773
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  17720257 cgaccaccactggtgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 17720356  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||         ||| |||| | |||  ||||| |||||| || || ||||| || |  || ||||||||||    
T  17720357 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcc---------acaacaccgaaacaacaagcagccaaatcaaatgaaagaaggaacatcgccctctcgaac 17720447  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  17720448 atcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgcttgcaccaatggccataaggcact 17720547  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17720548 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcttcattcccacaactagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgcc 17720647  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | || |    
T  17720648 aaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgat 17720747  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  17720748 gtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 17720773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31177832 - 31177427
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||  || ||||  |||    
T  31177832 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactaacctttagccaccacaacgaagttaacttcactttatctagcaattgaggcacagta 31177733  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  31177732 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgcccactcgaac 31177633  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31177632 aacctgcataatgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 31177534  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| ||||     
T  31177533 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgt 31177434  T
Q  414 caaatta 420  Q
    |||||||    
T  31177433 caaatta 31177427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 38890245 - 38890137
Alignment:
Q  17 accaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtact 116  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||    
T  38890245 accaccactgatgagtgccaaaattaaatacaacattactaacctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcaattgtggcaaagtact 38890146  T
Q  117 ttgtctatt 125  Q
    |||||||||    
T  38890145 ttgtctatt 38890137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 507
Target Start/End: Original strand, 25619285 - 25619564
Alignment:
Q  228 gataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaa 327  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || |||||| | |||||| | ||||| || ||||  ||| ||  ||||    
T  25619285 gataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctacaccttcaacaccaagccattcccgcaccttaggccacaatgcaccgaaaattggacaa 25619384  T
Q  328 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcg 427  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| || ||  |||||| || |  ||||||||| | |||||| ||   ||| |    
T  25619385 gacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcctgtgacacaaaatcggtcctccacagatgcaatgccacgatctgccaagttggatttag 25619484  T
Q  428 taggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25619485 taggtaatcgttccctcaacaaccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccatattaactccata 25619564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Original strand, 37254585 - 37254863
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||  || ||  | || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||| ||  |||||    
T  37254585 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatttaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaag 37254684  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |  |||||| | |  ||||| ||||| | ||||| || || ||||||||  | |||||| ||   ||| ||    
T  37254685 acaaaaacatatgattcacatcttcaaaatgtccacattccgtgacacaaaaccgagtctccacagatataatgccacaatctgccaagttggatttagt 37254784  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||| || || ||||| |  |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37254785 aggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgtttatgccagattaactccata 37254863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Original strand, 18532653 - 18532733
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18532653 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcgagattaactccata 18532733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 48394517 - 48394576
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaa 74  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  48394517 cgaccaccaattatgagtaccgaaattaaagacaacattactagctttcaaccaccacaa 48394576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 536
Target Start/End: Original strand, 32266177 - 32266698
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  32266177 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacatttctagtctttaaccaccacagagaagttgatttcacattatctagcatttgtggcaaagta 32266276  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32266277 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacacccaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaac 32266376  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32266377 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccacaatgcact 32266476  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32266477 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 32266576  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32266577 aaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccaaattatggt 32266676  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtga 536  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  32266677 gtaactgtggttgctcttgtga 32266698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 13396001 - 13396526
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  13396001 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagta 13396100  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  13396101 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaataccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaac 13396200  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13396201 aacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcact 13396300  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13396301 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 13396400  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  13396401 aaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaactccatatgatgat 13396500  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  13396501 gtaattggggctgctcctgtgatgtc 13396526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 41665896 - 41665371
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||    
T  41665896 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaaaatttgtggcagagta 41665797  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||| |||    
T  41665796 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagatcgtcgccttctcaaac 41665697  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41665696 aacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgagattcaacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcact 41665597  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41665596 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgcc 41665497  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  41665496 aaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgat 41665397  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  41665396 gtaattggggctgctcctgtgatgtc 41665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 7923999 - 7924524
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||    
T  7923999 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacagta 7924098  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  7924099 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgttgccctctcgaac 7924198  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7924199 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 7924297  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  7924298 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 7924397  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  7924398 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatgg 7924497  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7924498 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7924524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 9922214 - 9922739
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  9922214 cgaccaccactggtgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 9922313  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||    
T  9922314 ctttgtctatttctaaaaagcctttcattccgttcattccacaacaccgaaacaacaagcagccaaatcaaatgaaagaaggaacgtcgccctctcgaac 9922413  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9922414 atcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgctcgcaccaatggccataaggcact 9922513  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9922514 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgcc 9922613  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | || |    
T  9922614 aaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgat 9922713  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  9922714 gtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 9922739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 540
Target Start/End: Original strand, 171717 - 172241
Alignment:
Q  16 gaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtac 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||  ||||    
T  171717 gaccaccactgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccatcacaaagaagttgatttcactttatctagcaatagtggcaaagtac 171816  T
Q  116 tttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaaca 215  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  171817 tctgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaaca 171916  T
Q  216 acctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcacta 315  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || || |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||||||| |||||||| ||   |    
T  171917 accggcataattaataaattgcacaaaattatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcgtca 172016  T
Q  316 aaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcca 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||||| || || |||| |||||||| |||    
T  172017 aaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattaccacagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgtcacggtttacca 172116  T
Q  416 aattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtg 515  Q
    |||||  ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  172117 aattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccattttatggtg 172216  T
Q  516 taactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  172217 taactggttctgctcctgtgatgtc 172241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 8299416 - 8299941
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||    
T  8299416 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacagta 8299515  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8299516 ctatgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 8299615  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8299616 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 8299714  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||| || ||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  8299715 caaaagttgcacaggacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataatcgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 8299814  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  8299815 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccaaattatgg 8299914  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  8299915 tgtaattggggctactcctgtgatgtc 8299941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32567791 - 32567480
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  32567791 cgaccaccactgatgagtatcaaaactaaatacaacattgctagc-tttaaccaccacaaagaagttgatttcacattatctagcatttgtggcaaagta 32567693  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32567692 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacacccaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctcttgaac 32567593  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32567592 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctggcaccattggccataatgcact 32567493  T
Q  315 aaaagttacacaa 327  Q
    |||||||||||||    
T  32567492 aaaagttacacaa 32567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 20496697 - 20497052
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |  || ||||  |||    
T  20496697 cgaccaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagtaattgaggcacagta 20496796  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20496797 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 20496896  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20496897 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 20496995  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccag 370  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20496996 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 20497052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Original strand, 5181281 - 5181775
Alignment:
Q  14 acgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgt 113  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| || ||||||| ||||||||| |  |     
T  5181281 acgaccaccaagtatgagtactaaagctaaatacaacattactaacttttaaccaccacaaataagatgattttactttatctaacatatgtggtaaaga 5181380  T
Q  114 actttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaa 213  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||  ||| | |||||  | | |||||| ||||  || || || || ||   ||||||     
T  5181381 actttctctatttctaaatatcatatcatttcgttcgttccacaaaacctaaacacattgaagccaaatcaagtaaaaaaaggatcgtcgcgatctcgag 5181480  T
Q  214 caacctgcgtaattgataaa-ttgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagca 312  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||  ||||  ||||| ||||| || ||||| || ||||||||   ||||| |||||| || |||    
T  5181481 caacctgcgtaattaataaatttgcaaaaaatggtttgtagttgtctgagagtcgacccctaccacaccgagccatgcctacaccaatggccacaaggca 5181580  T
Q  313 ctaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttg 412  Q
    | |||||||   ||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||| |  |  | |||||||     
T  5181581 ccaaaagttgggcaagacaaaaacatatgattctcatcttcaacttgcccgcatctagtgatacacaaccgcgcctccaaaggaatgactcgacggttta 5181680  T
Q  413 ccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
     |||||||  ||| || |||||  | || ||||   | |||||| |||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5181681 tcaaattatcttttgttggtaaatgatccctcagccgccgccaaacaagaatatagacttttagaggcacctgtttatgccaaattatctccata 5181775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 540
Target Start/End: Original strand, 20824138 - 20824434
Alignment:
Q  244 tgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 343  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  20824138 tgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgat 20824237  T
Q  344 taacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctct 443  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| || || ||    
T  20824238 tcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccct 20824337  T
Q  444 caaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || ||||| ||||||||||||    
T  20824338 caacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtc 20824434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 325 - 540
Target Start/End: Original strand, 13200046 - 13200261
Alignment:
Q  325 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttt 424  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |  || | |||||||||   ||    
T  13200046 caagacaaaaacatatgagtcacatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaaccgagcctccataggtagaattctgcgctctgccaaattgtatt 13200145  T
Q  425 tcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactgggg 524  Q
    | |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || || |  || ||    
T  13200146 ttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgccaaactaactccatattttgatgaacatgagg 13200245  T
Q  525 ttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13200246 ttgttcctgtgatgtc 13200261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Original strand, 2170167 - 2170480
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  2170167 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaag 2170266  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcct--ccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttc 426  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||  ||  |  ||| || || ||| ||||| | | |||||||   |||     
T  2170267 acaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaccccgttacacaaaacaccgattttccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgattta 2170366  T
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggtt 526  Q
    |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |  || ||||    
T  2170367 gtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 2170466  T
Q  527 gctcctgtgatgtc 540  Q
    | ||||||||||||    
T  2170467 gttcctgtgatgtc 2170480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Original strand, 43270277 - 43270555
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || ||||| || |||||||| | ||| || |||| |||| ||  |||||    
T  43270277 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccatagaccacaatgcaccaaaaattggacaag 43270376  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| ||||| || |||| || || |||  |||| | | |||||||  |||| ||    
T  43270377 acaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaacccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatctcacgttctaccaaatttgttttagt 43270476  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||| || || ||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43270477 aggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagatgaactccata 43270555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 325 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 34137180 - 34137011
Alignment:
Q  325 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttt 424  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || ||||  |||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||| |  || || ||||||||||||||   ||    
T  34137180 caagacaaaaacaagtgattcacattttgaacgcacccacaaccagtagcacacaaccgcccctccacaggaatgataccgcggtttgccaaattttctt 34137081  T
Q  425 tcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 494  Q
    |||||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34137080 tcgtaggtaaacgatccatcataagccgccaagcaagaatagagactttgagaggtacctgtttatgcca 34137011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Original strand, 37433959 - 37434270
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||| ||  | || |  ||||| || |||||||  ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  37433959 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatcgaccccttcgacacaaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaag 37434058  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| ||||| |   |||||||   ||| ||    
T  37434059 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgttccaccaaatttgatttagt 37434158  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgc 528  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |  || |||||     
T  37434159 aggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggttgt 37434258  T
Q  529 tcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||    
T  37434259 tcctgtgatgtc 37434270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 474
Target Start/End: Original strand, 2529809 - 2529958
Alignment:
Q  325 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttt 424  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| || | |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| | | |||||||   ||    
T  2529809 caagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaagtagaattccacgatctaccaaattgtatt 2529908  T
Q  425 tcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttg 474  Q
    | |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  2529909 ttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaactttg 2529958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13879705 - 13879520
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |    
T  13879705 acaagacaaaaacagatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattggct 13879606  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    || |||||||| || || ||||| |  |||||||||| ||  |  ||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  13879605 ttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctatttgtgccagactaactccatact 13879520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Original strand, 17699507 - 17699587
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699507 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccata 17699587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 34137490 - 34137431
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaa 74  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34137490 cgaccaccaattatgagtaccaaagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaa 34137431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29733465 - 29733399
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacatta 93  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29733465 atgagtaccaaaagtaaagaccacattactagctttcaaccaccacaaagaatttgatttcacatta 29733399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12257978 - 12257920
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccaca 73  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12257978 cgaccaccagttatgagtaccaaaactagaaacaacgttactagctttcaaccaccaca 12257920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12265370 - 12265312
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccaca 73  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12265370 cgaccaccagttatgagtaccaaaactagaaacaacgttactagctttcaaccaccaca 12265312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 377
Target Start/End: Original strand, 17699309 - 17699457
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || ||||| || |||||||  || || || |||| |||| ||  |||||    
T  17699309 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggtcacaatgcaccaaaaattggacaag 17699408  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacaca 377  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||| || |||||    
T  17699409 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcctacatcccgatacaca 17699457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 8227639 - 8228150
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  8227639 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatcaagcatttatggcaacgta 8227738  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8227739 ctttgtttatttctaaaaatcatatcattcctttcattccacatcacccaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaac 8227838  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8227839 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcact 8227938  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8227939 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcacggtttgcc 8228038  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8228039 aaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaactccatattatggt 8228138  T
Q  515 gtaactggggtt 526  Q
    ||||||||||||    
T  8228139 gtaactggggtt 8228150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Original strand, 23237996 - 23238521
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  23237996 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcacattatctagcatctgtggcaaagta 23238095  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23238096 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccaaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaac 23238195  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactccc-accactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23238196 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatcagacgttgaatgagaatcgactccccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcac 23238295  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23238296 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagctaaaatgccacggtttgc 23238395  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23238396 caaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatgg 23238495  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23238496 tgtaactggggttgctcctgtgatgt 23238521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 35984317 - 35983793
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  35984317 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 35984218  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| || || |||||||| || || ||||||||||    
T  35984217 ctttgtctatttctaaaa-tcctatcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcgccctctcgaac 35984119  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35984118 aacctgcataattaataaattgcataaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagtcatgcccgcaccattggccataaggcact 35984019  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35984018 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacaacttctacattcccacaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgcc 35983919  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | || |    
T  35983918 aaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaactccatgttttgat 35983819  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  35983818 gtaactgaggctgctcctgtgatgtc 35983793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 27117688 - 27117163
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||    
T  27117688 cgaccaccactgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcaattgtggcaaagta 27117589  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27117588 ctctgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 27117489  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||  | ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||  | | |||||| |||||||| || |     
T  27117488 aaccgacataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccacaccatcggccataatgctcc 27117389  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||| ||    
T  27117388 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgccacggtttacc 27117289  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27117288 aaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggt 27117189  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||   |||||||||||||||    
T  27117188 gtaactggatctgctcctgtgatgtc 27117163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 12824812 - 12825337
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| |   ||    
T  12824812 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggtacaata 12824911  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12824912 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccggaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 12825011  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||     
T  12825012 aacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcacc 12825111  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  12825112 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgcc 12825211  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12825212 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatacatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaagtccatattatggt 12825311  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  12825312 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 12825337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 28536202 - 28535677
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  28536202 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagacgttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 28536103  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||  ||| | |||||| || || ||||| || || || ||||||||||    
T  28536102 cttcgtctatttctaaaaatcctatcatttcgttcattccacaacaccgaaacaacaagtagccaaatcaaatgaaagaaggaacgtcgccctctcgaac 28536003  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    |||| || ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28536002 aaccagcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggccataaggcact 28535903  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28535902 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatctgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 28535803  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |    
T  28535802 aaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttgat 28535703  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  28535702 gtaactgaggctgctcctgtgatgtc 28535677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 30732841 - 30732316
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||   ||    
T  30732841 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagtctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacaata 30732742  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30732741 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 30732642  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| ||| |||| ||||     
T  30732641 aacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggctataatgcacc 30732542  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  30732541 aaaagttgtacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgcc 30732442  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30732441 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaagatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggt 30732342  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  30732341 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 30732316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 42513333 - 42513858
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||||   ||    
T  42513333 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacaata 42513432  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42513433 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 42513532  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcca-tgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  42513533 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 42513631  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || |||| |||| |||||    
T  42513632 caaaagttgcacaagacaaaaaaaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgtcacgatttgc 42513731  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  42513732 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatgg 42513831  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42513832 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 42513858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 42927744 - 42928269
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||  |      
T  42927744 cgaccaccaattatgagtatcaaagctaaatacaacattacgagcttttaaccaccacaaagaagatgatttaactttatctagcatttgtggcaaagag 42927843  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||| |||||||| |||  | ||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||    
T  42927844 ctttgtcaatttctaagaatattgtcattccgttcattccacaaaaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaatgaacgtcgccctctcgaac 42927943  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  42927944 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcact 42928043  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  42928044 aaaagttggacatgacaagaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcacctccaagggtaaaatgccacagtttgtc 42928143  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| |||| |||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |    
T  42928144 aaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaaacaaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatttggat 42928243  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||    
T  42928244 gtaactggggctgttcctgcgatgtc 42928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12820476 - 12820035
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||   ||    
T  12820476 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattaccagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacaata 12820377  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  12820376 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 12820277  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||     
T  12820276 aacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcacc 12820177  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  12820176 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagagacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgcc 12820077  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaa 456  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  12820076 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcataagtcgccaa 12820035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19255638 - 19255157
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtactttgtctattt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||    
T  19255638 atgagtaccaaaactaaatacaacattatgaggttttaaccaccacaaagaagatgatttgactttatctaacatatgtggcaaagagctttttctattt 19255539  T
Q  127 ctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaacaacctgcgtaat 226  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  19255538 ctaaaaatattgtcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaatgatcgtcgcaatctcgaacaacctgcgtaat 19255439  T
Q  227 tgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacaca 326  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||  |||    
T  19255438 taataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtttgagaatcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatgtccataaggcaccaaaagttggaca 19255339  T
Q  327 agacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgc-ctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactttt 425  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||| || | ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  19255338 agacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcgctccaagggaataatgccacaatttgccaaattattttt 19255239  T
Q  426 cgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
     ||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19255238 tgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaagcaaggatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaattaactccata 19255157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Original strand, 3418400 - 3418751
Alignment:
Q  19 caccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtacttt 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |  || ||||  |||||||    
T  3418400 caccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagtaattgaggcacagtacttt 3418499  T
Q  119 gtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaacaacc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3418500 gtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacc 3418599  T
Q  219 tgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcactaaa 317  Q
    ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| |||| |||    
T  3418600 tgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcaccaaa 3418698  T
Q  318 agttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccag 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3418699 agttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 3418751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 25824624 - 25824915
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  | |    
T  25824624 cgaccaccaccgatgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgaggcaaagaa 25824723  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| || || |||||||| || || ||||||||||    
T  25824724 cattgtctatttctaaaaatcctatcattctgttcattccacaacaccgaaacacaaagcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcgccctctcgaac 25824823  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccat 306  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25824824 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggccat 25824915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 31641370 - 31641512
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  31641370 cgaccaccactggtgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 31641469  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31641470 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattccgttcattccaca 31641512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25857737 - 25857459
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||| |||||| | |||||    
T  25857737 ataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcaaacaag 25857638  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| || ||    |||| || || ||| || ||     ||||||||  ||| ||    
T  25857637 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaatcggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagt 25857538  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25857537 aggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 25857459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 403 - 540
Target Start/End: Original strand, 31641513 - 31641649
Alignment:
Q  403 ccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaact 502  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31641513 ccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaact 31641611  T
Q  503 ccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||  | || ||||| || || |||||||||||||||    
T  31641612 ccatgttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 31641649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33385687 - 33385376
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| ||||   | || || ||||| || | |||||  ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  33385687 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctactcattcgacaccaagccaagcccacaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaag 33385588  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    |||| || || ||| |||||     |||||||   ||| ||    
T  33385587 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataattccacgtgccaccaaatttgatttagt 33385488  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgc 528  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || |||||     
T  33385487 aggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaatatgaggttgt 33385388  T
Q  529 tcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||    
T  33385387 tcctgtgatgtc 33385376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 8300495 - 8300184
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||| ||  ||||| || |||| ||||||   |||||    
T  8300495 ataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcatcagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaag 8300396  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| || ||     ||||||||  ||| ||    
T  8300395 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagt 8300296  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgc 528  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || |||||     
T  8300295 aggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggttgt 8300196  T
Q  529 tcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||    
T  8300195 tcctgtgatgtc 8300184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 507
Target Start/End: Original strand, 10776686 - 10776869
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    |||| || || ||| |||||     |||||||   |    
T  10776686 acaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacttgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgtgccaccaaatttgat 10776785  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    || |||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10776786 ttagtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccata 10776869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 540
Target Start/End: Original strand, 27766941 - 27767180
Alignment:
Q  301 ggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaa 400  Q
    ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| |  || ||    
T  27766941 ggccacaaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacatatataa 27767040  T
Q  401 tgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 500  Q
    | ||||| |   |||||||   ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27767041 tcccacgttccaccaaatttgattttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 27767140  T
Q  501 ctccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||| | || || |  || ||||| ||||||||||||    
T  27767141 ctccatattttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtc 27767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 32228429 - 32228652
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtactttgtctattt 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||| || || |  |||||| |||||    
T  32228429 atgagtaccaaaactaaaaacaacattactagctttcaaccaccacaaaaaatatgattttactttatctaacatatgcggtagagagctttgtttattt 32228528  T
Q  127 ctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaacaacctgcgtaat 226  Q
    || ||||   |||||||||  ||| ||||||  | ||| ||||| || | ||||||||  ||||| || || || ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  32228529 ctgaaaactttatcattccgctcagtccacaaaatccaaacacacaggagccaaattagatggaaaaaggaacgtcgcgctctcaaacaacctgcataat 32228628  T
Q  227 tgataaattgcaaaagatgatctg 250  Q
    | ||||||||||| | ||||||||    
T  32228629 taataaattgcaagaaatgatctg 32228652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 509
Target Start/End: Original strand, 27795405 - 27795590
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||| || |  ||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |    
T  27795405 acaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacagcccgtgacacatagcctagcctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattggct 27795504  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    || ||||| || || || ||||| |  |||||||||| ||  |  ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27795505 ttagtaggcaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctgtttgtgccagactaactccatact 27795590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18359416 - 18359094
Alignment:
Q  216 acctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcacta 315  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || |||||||| ||| |||| ||||| || ||||      
T  18359416 acctgcgtatttaataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctac-ccttcgacaccaagccatgcccgccccataggccacaatgcaccg 18359318  T
Q  316 aaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcca 415  Q
    ||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||| |  ||||| |||||  |||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  18359317 aaaatcggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccagatcccgtgacacaaaaccgatcctccacatatataatgc-acgatctgcca 18359219  T
Q  416 aattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtg 515  Q
    | ||   ||| |||||||| || || ||||| |  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||    
T  18359218 agttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaaggaacctgtttatgctagattaactccatattttgatg 18359119  T
Q  516 taactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
     |  || ||||| ||||||||||||    
T  18359118 aacatgaggttgttcctgtgatgtc 18359094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18089876 - 18089798
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcca 505  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  18089876 gtaggtaaacgatctctcaatagtcgtcaagcaaagatagagactttcaacggtacctgtttgtgccaaattaactcca 18089798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 540
Target Start/End: Original strand, 24407993 - 24408066
Alignment:
Q  467 atactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  24407993 atactttcaaaggtacctgtttatgccaaatcaactccatactttgatgtaacatgggttgttcctgcgatgtc 24408066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27166459 - 27166387
Alignment:
Q  35 caaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtgg 107  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||    
T  27166459 caaaactaaagataacattactagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaacatatgtgg 27166387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 26072506 - 26072565
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaa 74  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26072506 cgaccaccaattatgagtatcgaaactaaagacaacattactagctttcaaccaccacaa 26072565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 507
Target Start/End: Original strand, 33169636 - 33169763
Alignment:
Q  380 accgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagg 479  Q
    ||||| ||||||||| ||| |  |||||  ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||  ||||| ||||| | |||    
T  33169636 accgctcctccaaagataagaccccacgacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaagg 33169735  T
Q  480 aacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||    
T  33169736 cacctgtttgtgccaaatcaactccata 33169763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 505
Target Start/End: Original strand, 26072917 - 26072995
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcca 505  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26072917 gtaggtaatcgatccctcaacagtcgccaaacaaagatagggactttcaaaggaacatatttatgccaaattaactcca 26072995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Original strand, 29142427 - 29142505
Alignment:
Q  29 gagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtgg 107  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||| |||||    
T  29142427 gagtaccagagctaaaaacaacattattagcttttaaccaccacaaagatgatgattttactttgtctaacatttgtgg 29142505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27166032 - 27165956
Alignment:
Q  462 gatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatg 538  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| | || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  27166032 gatagagacttttagaggtacctgttggtgccaaattaattccatattttgatgtaaattgggttgttcctgtgatg 27165956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 34333342 - 34332817
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||    
T  34333342 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgttagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaaata 34333243  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34333242 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 34333143  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34333142 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatttgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcact 34333043  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34333042 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 34332943  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34332942 aaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgat 34332843  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  34332842 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 34332817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 40931055 - 40930530
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  40931055 cgaccaccactgttgagtaccgaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 40930956  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  | |||||||||| |||||| || || |||||||| || |  ||||||||||    
T  40930955 ctttgtctatttctaaaaatcctatcatttcgttcattccacaacactgaaacacaaagcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcaccctctcgaac 40930856  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40930855 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatccgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggccataaggcact 40930756  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40930755 aaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcgacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaaggccacggtttgcc 40930656  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || |    
T  40930655 aaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactccatgttttgat 40930556  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  40930555 gcaactgaggttgctcctgtgatgtc 40930530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 2363890 - 2364415
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||    
T  2363890 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacagta 2363989  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2363990 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 2364089  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2364090 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 2364188  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  2364189 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 2364288  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2364289 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatgg 2364388  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2364389 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 2364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 19920756 - 19920231
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||    
T  19920756 cgaccaccactgatgggtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgcagttgatttcactttatctaacaattgtggcactgta 19920657  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19920656 ctttggctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgagacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 19920557  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | |||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||     
T  19920556 aacctgcataattgataaattgctcaaaatgatctgaagatgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcacc 19920457  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||| || ||| ||    
T  19920456 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgagaagcatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgcctcgatttacc 19920357  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  19920356 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatgatggt 19920257  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  19920256 gtaactggggcttctcctgtgatgtc 19920231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 7312390 - 7312914
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||    
T  7312390 cgaccaccactgacgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacagta 7312489  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  7312490 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacactgaaacacaaagcaaccaaatcaagtgcaagaaagatcgtcgccctctcgaac 7312589  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||  |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| || | ||| ||||     
T  7312590 aacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcgg-cttaatgcacc 7312688  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||  | ||||||||| ||||||    
T  7312689 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacaaagccgctcctccacagacagaatgccacgatttgcc 7312788  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7312789 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaagtccatattatggt 7312888  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  7312889 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 7312914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10324098 - 10323573
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||  || ||||  |||    
T  10324098 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagccttgagccaccacaacgaagttaacttcactttatcgagcaattgaggcactgta 10323999  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10323998 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 10323899  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcca-tgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| || |  |||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10323898 aacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatcagaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 10323800  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| | |||  || || |||||||||  ||||    
T  10323799 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcatccccagatagaatgccacgagttgc 10323700  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10323699 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatgg 10323600  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10323599 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 10323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 505
Target Start/End: Original strand, 7031931 - 7032421
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||||  ||| || |||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||  |      
T  7031931 cgaccaccaattctgagtaccaaagctaaacattacattatgagctttcaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatatgaggcaaagag 7032030  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  7032031 ctttgtcgattactaaaaatcttggcattccgctcattccacaacacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgccgccctctcgagc 7032130  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | ||||||||| ||    
T  7032131 accctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaagcgct 7032230  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
     |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  ||| || || || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||    
T  7032231 gaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacctgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacaattcgcc 7032330  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcca 505  Q
    | |||  |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  7032331 agattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaattttgagaggaacctgtttgtgccaaaccaactcca 7032421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26771237 - 26771024
Alignment:
Q  294 caccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaa 393  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||| || ||||||||    
T  26771237 caccaatggccataaggcactaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaaccagtgacacacaactgcacctccaaa 26771138  T
Q  394 ggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcc 493  Q
    || |  || |||||||||||||||||   |||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  26771137 ggaatgataccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgcc 26771038  T
Q  494 aaattaactccata 507  Q
    | ||||||||||||    
T  26771037 acattaactccata 26771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7031330 - 7031055
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||||||  | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||   |||||    
T  7031330 ataaattgcacaaagtgatctgacatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaag 7031231  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||||    |||| || |||||| || ||     ||||||||  ||| ||    
T  7031230 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctaaaatccctcgtgccaccaaattagatttagt 7031131  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcc 504  Q
    |||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031130 aggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcc 7031055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 427 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 29523860 - 29523747
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggtt 526  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || ||||    
T  29523860 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 29523761  T
Q  527 gctcctgtgatgtc 540  Q
    | ||||||||||||    
T  29523760 gttcctgtgatgtc 29523747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 540
Target Start/End: Original strand, 11203741 - 11203957
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| ||||| |   |||||||   |    
T  11203741 acaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgttccaccaaatttgat 11203840  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggg 523  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || |    
T  11203841 ttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgag 11203940  T
Q  524 gttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||||||||||    
T  11203941 gttgttcctgtgatgtc 11203957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 35214684 - 35214406
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || ||||| |||| | | ||||||||| || ||  | || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  35214684 ataaattgcacaaaatgatatgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaag 35214585  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |  ||||| ||| | || |||| |  || ||| ||||| | || ||||||   ||| ||    
T  35214584 acaagaacaaatgattcacatcttcaacatgccaacatcccgttacacaaaactgagcttccacatatagaatcccacgttctggcaaatttgatttagt 35214485  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||| || || || ||||| |  |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35214484 aggcaaacgatccctcaacatccgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccata 35214406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Original strand, 33496572 - 33496652
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33496572 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 33496652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12342538 - 12342228
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||  |  | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  12342538 ataaattgcacaaaatgatctgagatagtatgagaatcgacctcttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaag 12342439  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| ||||| |   |||||||   ||| ||    
T  12342438 agaagaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgttccaccaaatttgatttagt 12342339  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgc 528  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || |||||     
T  12342338 aggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaag-aacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggttgt 12342240  T
Q  529 tcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||    
T  12342239 tcctgtgatgtc 12342228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 10312991 - 10313061
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatt 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10312991 cgaccaccaatgatgagtaccaaaactaaatacaacgttacacgcttttaaccaccacaaagaagttgatt 10313061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 17098043 - 17097878
Alignment:
Q  375 acacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttg 474  Q
    ||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||  |||| |||||| |||||| |||||| |||||     
T  17098043 acacaaccgtgcctccatagaaataatcccacggtttgccaaattttctttagtaggtaaccgatccatcaacagtcgctaagcaaagatagagactttc 17097944  T
Q  475 agaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    | |    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||| || || ||||||    
T  17097943 acatatgcctgtttatgccaaattaactccacattttgatgtaaatggggttgttcatgcgatgtc 17097878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Original strand, 15827334 - 15827394
Alignment:
Q  25 tgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15827334 tgatgagtaccaaaactaaatacagcattgcaagcttttaaccaccacaaagaagttgatt 15827394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 15312195 - 15312254
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaa 74  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15312195 cgaccaccaaagatgagtaccgaaactaaatacaacattactagctttcaaccaccacaa 15312254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 382 - 540
Target Start/End: Original strand, 2755822 - 2755980
Alignment:
Q  382 cgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaa 481  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |    
T  2755822 cgcgcctccaaagataagaccccacgacttgccaaattttatttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggta 2755921  T
Q  482 cctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  2755922 cctgtttgtgccaaatcaactccatattttgatgtaacatgggttgttcctgcgatgtc 2755980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36801388 - 36801234
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  36801388 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaag 36801289  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccg 383  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    
T  36801288 acaaaaataaatgatttacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccg 36801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Original strand, 926734 - 926781
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctt 62  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  926734 cgaccaccaatgatgagtaccataactaaatacaacattacaagcctt 926781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 503
Target Start/End: Original strand, 16179009 - 16179049
Alignment:
Q  463 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactc 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16179009 atagatactttaagaggtacctgtttatgccaaattaactc 16179049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 963295 - 963172
Alignment:
Q  410 ttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  963295 ttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatatt 963196  T
Q  510 atggtgtaactggggttgctcctg 533  Q
     || ||||||  |||||| |||||    
T  963195 ttgatgtaacatgggttgttcctg 963172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 507
Target Start/End: Original strand, 19890733 - 19890783
Alignment:
Q  457 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19890733 gcaaggatggaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccata 19890783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 15312629 - 15312686
Alignment:
Q  448 agtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcca 505  Q
    |||| ||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15312629 agtcaccaagcaaatatatagacttttagaggtacctgtttatgccaaattaactcca 15312686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 36801190 - 36801110
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||  ||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36801190 gtaggtaaacgatccctcagcagttgccaagcaaggatataaacttttaagggaacctatttatgctaaattaactccata 36801110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 15739834 - 15740359
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  15739834 cgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagta 15739933  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15739934 ctttgtctatttctaaaaagccgattattcatttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtctccctctcgaac 15740033  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  15740034 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcacc 15740133  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15740134 aaaagttagacaagacaaaaacaaatgattaacatctttaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggcttgtc 15740233  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15740234 aaattattttttgtaggtaaccgatctcgcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggt 15740333  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||    
T  15740334 gtaactggggctgctcctatgatgtc 15740359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 19754876 - 19755405
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  19754876 cgaccaccactgatgagtacaaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagta 19754975  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  19754976 ccttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttc-ttccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaac 19755074  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactccca--ccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  19755075 aacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctataccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgca 19755174  T
Q  313 ctaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagg---taaaatgccacggt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  19755175 ctaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggt 19755274  T
Q  410 ttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19755275 ttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatg 19755374  T
Q  510 atggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  19755375 atgatgaaattggggctgctcttgtgatgtc 19755405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 19784930 - 19784401
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  19784930 cgaccaccactgatgagtacaaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagta 19784831  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  19784830 ccttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttc-ttccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaac 19784732  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactccca--ccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  19784731 aacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctataccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgca 19784632  T
Q  313 ctaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagg---taaaatgccacggt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  19784631 ctaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggt 19784532  T
Q  410 ttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19784531 ttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatg 19784432  T
Q  510 atggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  19784431 atgatgaaattggggctgctcttgtgatgtc 19784401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 47686422 - 47685897
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||    
T  47686422 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttgtctagcatttgtggcaaagta 47686323  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||    
T  47686322 cttagtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacactgaaacacaaagcaaccaaatcaagtgaaagaaagaccgtcaccctcttgaac 47686223  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  47686222 aacctgcataattaataaattgcaccaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcact 47686123  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  47686122 aaaagttgcacaagacaaaaacaaacgagaaacatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagataaaatgccacggtttgcc 47686023  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  47686022 aaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaagtccagattatggt 47685923  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  47685922 gtaacttgggctgctcttgtgatgtc 47685897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 23643118 - 23642593
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||    
T  23643118 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacggta 23643019  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23643018 ctttatctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 23642919  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23642918 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 23642820  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  23642819 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 23642720  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  23642719 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatgg 23642620  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23642619 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 23642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 7403525 - 7404051
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctag-catatgtggcagcgt 113  Q
    ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| |||||||  |     
T  7403525 cgaccaccaattatgaatatcaaagctaaatacaacattgcgagtttttaaccaccacaaagaatatgatttcactttatctaggcatttgtggcaaaga 7403624  T
Q  114 actttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaa 213  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  7403625 gctttgtctatttctaaaaatcttgtcattccgttcaatcgacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaaagaacgtcgccctctcgaa 7403724  T
Q  214 caacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  7403725 caacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccacaccaatggccataaggcac 7403824  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7403825 taaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccacggtttgc 7403924  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  7403925 caaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcatattttga 7404024  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7404025 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7404051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13271418 - 13270893
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  |||| ||   ||    
T  13271418 cgaccaccactgatgagtgccaaaaataaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgtgtcacttta 13271319  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13271318 ctttttctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 13271219  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcca-tgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13271218 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 13271120  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  13271119 caaaagttgcacaagacaaaaataaattagtaacatcttcgacaatcccacatccagtaactcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 13271020  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  13271019 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatgg 13270920  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13270919 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 13270893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 47418418 - 47418942
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||  || ||||  |||    
T  47418418 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagttaacttcactttatcgagcaattgaggcactgta 47418517  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47418518 ctttgactatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 47418617  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcca-tgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| || |  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  47418618 aacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctac-actcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 47418715  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| | ||| || |||||| |||||  || || |||||||||  ||||    
T  47418716 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatcctgcaacgcataaccgctcctccccagatagaatgccacgagttgc 47418815  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47418816 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatgg 47418915  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47418916 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 47418942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 259 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 1828823 - 1828542
Alignment:
Q  259 tgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgt 358  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1828823 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggtcataaagcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcaacatcttcaacat 1828724  T
Q  359 tcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagc 458  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  1828723 tcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctccaagc 1828624  T
Q  459 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1828623 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 1828542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 160218 - 159863
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |  |||||||  |||    
T  160218 cgaccaccactgatgtttgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagtaattgtggcacagta 160119  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  160118 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcatttcattccacaacaccgaaacacaaaacaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 160019  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  160018 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccacttctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 159920  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccag 370  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  159919 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 159863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20788807 - 20788501
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattact-agcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgt 113  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| |||||||  |     
T  20788807 cgaccaccaattctgagtaccaaagctaaacacaacatttatgagcttttaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatttgtggcaaaga 20788708  T
Q  114 actttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaa 213  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||    
T  20788707 gctttgtctatttctaaaaatcatgtcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaa-aaagatcgttgccctctcgaa 20788609  T
Q  214 caacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  20788608 caacctacataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgagagtcgaccccgaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcgc 20788509  T
Q  314 taaaagtt 321  Q
    ||||||||    
T  20788508 taaaagtt 20788501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 500
Target Start/End: Original strand, 12697640 - 12697911
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||| | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  |||||||| |||| |||| ||  |||||    
T  12697640 ataaattgcacaaagtgatcggagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccataatgcaccaaaaattggacaag 12697739  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| ||||| |   |||||||   ||| ||    
T  12697740 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgttccaccaaatttgatttagt 12697839  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 500  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12697840 aggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 12697911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17402213 - 17402071
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||| |  |      
T  17402213 cgaccaccaattatgagtaccaaagtgaactacaacattactagcctttaactaccacaaagaagatgattttactttatctaacatatgtggtaaagag 17402114  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccaca 157  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  17402113 ctttttctgtttctaaatagcctatcattccgttcattccaca 17402071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11587446 - 11587233
Alignment:
Q  294 caccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaa 393  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| ||   |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | | || |||| |  |||||||||| |||||| |    
T  11587446 caccaatggccacaaagcaccaaaatttgggcaagacaaaaacaagtgattcacattttcaacgtgctcgcaaccagtagtacacaaccgcccctccata 11587347  T
Q  394 ggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcc 493  Q
    || |   | |  ||||||||||||||   |||||||||||| || |  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  11587346 ggaatgttactgcggtttgccaaattttctttcgtaggtaaacgattcctcagaagccgccaagcaagaatagatactttgataggtatctatttatgcc 11587247  T
Q  494 aaattaactccata 507  Q
    ||||||||||||||    
T  11587246 aaattaactccata 11587233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 507
Target Start/End: Original strand, 20002599 - 20002830
Alignment:
Q  283 agccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaacc 382  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||  |||  |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||    
T  20002599 agccatgcccgcaccataggccacaatgcaccgaaaaatggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaacc 20002698  T
Q  383 gcgcctccaaaggtaa-------aatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttga 475  Q
    | ||||||| ||   |       ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |    
T  20002699 gagcctccacagtccacagatgtaatgccacggtctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaactttta 20002798  T
Q  476 gaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002799 aaagaacctgtttatgccaaattaactccata 20002830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472744
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 45472744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 55725801 - 55725721
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55725801 gtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactccata 55725721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 8890636 - 8890698
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaaga 77  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8890636 cgaccaccaattatgagtaccaaaactaaatacagcattacaagcttttaaccaccacaaaga 8890698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 43019554 - 43019603
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagccttta 64  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43019554 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaatattactagccttta 43019603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11587713 - 11587633
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtgg 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||| |||||    
T  11587713 atgagtaccaaagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 11587633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 8361146 - 8361205
Alignment:
Q  448 agtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8361146 agtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccata 8361205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23163158 - 23163087
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgattt 86  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  23163158 cgaccaccaattatgagtaccatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattt 23163087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 16427162 - 16427232
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatt 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16427162 cgaccaccaatgatgagtaccaaaactaaatacatctttacatgcttttaatcaccacaaagaagttgatt 16427232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54483377 - 54483192
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| | ||  |||||||  | ||||||||| || |||| ||||||  ||    
T  54483377 acaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcgataaaatgccgcgatttgtcaaattggtt 54483278  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    || |||||||| || || ||||| |  |||||||||| ||  |  ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  54483277 ttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatact 54483192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19740565 - 19740425
Alignment:
Q  17 accaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtact 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||   |||||| || ||||||| |||||| |  || |  ||    
T  19740565 accaccaattatgagtaccaaaagtaaaaacaacattactagctttcagccaccacaaggaatatgattttactttatctaacatatgcgatagagagct 19740466  T
Q  117 ttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccaca 157  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  19740465 ttgtttatttctgaaaactctatcattccgctcattccaca 19740425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 383
Target Start/End: Original strand, 8360927 - 8361081
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||| | || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  8360927 ataaattgaacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaag 8361026  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccg 383  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    
T  8361027 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccg 8361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2822552 - 2822482
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatcta 97  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  2822552 atgagtaccaaaagtaaagaacacattactagctttcaaccaccacagagaatttgatttcactttatcta 2822482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2822152 - 2822072
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||| | |||||||||| |||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2822152 gtaggtaagcgatccctcaacaatcgccaagcatggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagattaactccata 2822072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5790171 - 5790131
Alignment:
Q  463 atagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactc 503  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5790171 atagatactttaagaggtacttgtttatgccaaattaactc 5790131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 51052093 - 51052618
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||   ||    
T  51052093 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagtctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacaata 51052192  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51052193 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 51052292  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||     
T  51052293 aacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcacc 51052392  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  51052393 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgcc 51052492  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  51052493 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggt 51052592  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  51052593 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 51052618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 11909632 - 11909107
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||    
T  11909632 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacagta 11909533  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  11909532 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcaccctctcaaac 11909433  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||  |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  |  ||||||| |||||||| ||||     
T  11909432 aacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgcacc 11909333  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  11909332 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacatagccgctcctccacagatagaatgccacgatttgcc 11909233  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11909232 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaatgatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggt 11909133  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  11909132 gtaactggggctgctcctgtgatgtc 11909107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 35540662 - 35541187
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |  || ||||  |||    
T  35540662 cgaccaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagtaattgaggcacagta 35540761  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35540762 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 35540861  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcc-atgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  35540862 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 35540960  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || || ||  |||||| || || ||||||||| |||||    
T  35540961 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagatagaatgccacgatttgc 35541060  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| || |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35541061 caaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatgg 35541160  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35541161 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 35541187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Original strand, 6050215 - 6050741
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |  |  ||||   ||    
T  6050215 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagaaatttaggcacaata 6050314  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6050315 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 6050414  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatct-gaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcca-tgctcgcaccattggccataaagca 312  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  6050415 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatcttgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgca 6050513  T
Q  313 ctaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttg 412  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||  ||||    
T  6050514 ccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcagaaccgctcctccacagatagaatgccacaatttg 6050613  T
Q  413 ccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatg 512  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  6050614 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatg 6050713  T
Q  513 gtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6050714 gtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 6050741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 343
Target Start/End: Original strand, 6259430 - 6259758
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  6259430 cgaccaccagtgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagta 6259529  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  6259530 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaaaaaagaccgtctccctctcgaac 6259629  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6259630 aacctacgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaagcacc 6259729  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259730 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 6259758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 4842012 - 4842339
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggca----- 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||         
T  4842012 cgaccaccactgatgaataccaaaactaaatacaggattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaacatttgtcgcaaggag 4842111  T
Q  110 gcgtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctct 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||    
T  4842112 gagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttct 4842211  T
Q  210 cgaacaacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaa 309  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  4842212 caaacaacctgcgtaatgaataaattgctgacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccataggccataat 4842311  T
Q  310 gcactaaaagttacacaagacaaaaaca 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4842312 gcattaaaagttacacaagacaaaaaca 4842339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Original strand, 26059504 - 26059755
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  26059504 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagta 26059603  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  26059604 cattgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcaccctctcgaac 26059703  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatc 266  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  26059704 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatc 26059755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12813731 - 12813519
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  12813731 cgaccaccactgatgaatactaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagta 12813632  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  12813631 ctttgtctatttctaaaattcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaac 12813532  T
Q  215 aacctgcgtaatt 227  Q
    |||||||||||||    
T  12813531 aacctgcgtaatt 12813519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 325 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 47623292 - 47623079
Alignment:
Q  325 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttt 424  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |  |    
T  47623292 caagacagaaacaagtgattcacatcttcatcatgcccacaaccagaaacaca--accgcccctccataggaataatgtcacggtttgccaaatttccct 47623195  T
Q  425 tcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatg-gtgtaactggg 523  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |    
T  47623194 tcgtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaattccata-tatgaatgtaactgag 47623096  T
Q  524 gttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||||||||||    
T  47623095 gttgttcctgtgatgtc 47623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 13351929 - 13352169
Alignment:
Q  17 accaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtact 116  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | |||| || || |||||||| |||||||  |  ||    
T  13351929 accaccaattatgagtaccaaagctaaatacaacattacgagcttttaaccaccacaaagaaaattatttaactttgtctagcatttgtggcaaagagct 13352028  T
Q  117 ttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaacaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||||    
T  13352029 ttgtctatttctaaaaatcctatcattccatacactccacaaaactgaaacacaaagcaaccaaataaagtgaaaaaatgaacgtcgctctctcgaacaa 13352128  T
Q  217 cctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttga 257  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  13352129 cctgcataattaataaattacaaaaaatgatctgaagttga 13352169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 37191469 - 37191245
Alignment:
Q  283 agccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaacc 382  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| || |    
T  37191469 agccattcccgcaccataggccataatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatc 37191370  T
Q  383 gcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaac 482  Q
    |  |||||| || |  ||||||||| | |||||| ||   ||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| | ||||| | | ||||    
T  37191369 gatcctccacagatgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatctctcaacagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaac 37191270  T
Q  483 ctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  37191269 cagtttatgccagattaactccata 37191245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16918122 - 16917844
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||||||  | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||   |||||    
T  16918122 ataaattgcacaaagtgatctgacatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaag 16918023  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    ||||| |||||    |||  || || ||| || ||     ||||||||  ||| ||    
T  16918022 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccattacacaaaaccggttttccgcagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagt 16917923  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16917922 aggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 16917844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Original strand, 43388392 - 43388472
Alignment:
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43388392 gtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 43388472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24547593 - 24547519
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcac 89  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24547593 cgaccaccaattatgagtaccaaaactaaatacagcattacaagcttttaaccactacaaagaagttgatttcac 24547519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 47623592 - 47623500
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtgg 107  Q
    ||||||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||| |||||    
T  47623592 cgaccaccaattatgagtatcatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 47623500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22191875 - 22191823
Alignment:
Q  448 agtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 500  Q
    |||| ||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22191875 agtctccaagcaagaatagaaaccttcaaaggaacctgtttatgccaaattaa 22191823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 540
Target Start/End: Original strand, 28351776 - 28351852
Alignment:
Q  464 tagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||||| | |||| ||||||||    
T  28351776 tagagactttcagagggaccggtttatgccaaattaactccatattttgatgtgaatggggatactccagtgatgtc 28351852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 517
Target Start/End: Original strand, 12733738 - 12734240
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  12733738 cgaccaccgctgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcaattgtggcaacgta 12733837  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12733838 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 12733937  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    |||| || ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||  |  ||||||| |||||||| || |     
T  12733938 aaccggcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgctcc 12734037  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||| || ||    
T  12734038 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacatctagaaacacataaccgctcctccagagatagaatgccacgggttacc 12734137  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  12734138 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaaatccatattatgat 12734237  T
Q  515 gta 517  Q
    |||    
T  12734238 gta 12734240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 24767951 - 24767426
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |      
T  24767951 cgaccaccaattatgaatacccaaactaaatacagcattacaagcttttaaccaccacaaagaagatgatttcactttatctagcatttgtggcaaagag 24767852  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||||||||    
T  24767851 ctttgtctatttctaaaaattatgtcattacgttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaaagaatgtcgccctctcgaac 24767752  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  24767751 aacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcact 24767652  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24767651 aaaagttggacaagacaaaaacaaattattaacatcttcaacgttcccgcaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgatttgcc 24767552  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  24767551 aaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagcaaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccatattttgat 24767452  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24767451 gtaactagggctgctcctgtgatgtc 24767426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18651761 - 18651236
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| |||||||  |      
T  18651761 cgaccaccaattctgagtaccaaaactaaacacaacattatgagcttttaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatttgtggcaaagag 18651662  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  18651661 ctttgtctatttctaaaaattttgtcattccgttcattccacaacactgaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgtcgccctctcgaac 18651562  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  18651561 aacctgcataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgagagtcgaccccgaccactcctagccatgctcgcaccaatggcaataaggcgct 18651462  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaa-aacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
    |||||||  |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  18651461 aaaagttggacac-acaaagaacaagtgattgacatcttcaacggtcccgcatccagagacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatcccacggttttc 18651363  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  18651362 caaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttga 18651263  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18651262 tctaactggggctgctcctgtgatgtc 18651236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 21167838 - 21168196
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  21167838 cgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaaagaagttggtttcactttatctagcatttgtggcaaagta 21167937  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  21167938 ctttgtctattcctaaaaatcctatcattcttttcattctacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtctccctctcgaac 21168037  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  21168038 aacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccccaccactcctagccatgctcgcatcaatggccataaagcacc 21168137  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21168138 aaaagttacacaagacaaaaacatatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaa 21168196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 253 - 540
Target Start/End: Original strand, 2553488 - 2553775
Alignment:
Q  253 gttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatctt 352  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553488 gttgattgagaatcgacccctatcactcctagccatgcccgcaccattggtcataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatctt 2553587  T
Q  353 caacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2553588 caacgttcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctttcaaaagtcg 2553687  T
Q  453 ccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2553688 ccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 2553775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5734768 - 5734439
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  5734768 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaa 5734669  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||  ||| |||||||| || || ||||| || ||  | ||||||||||    
T  5734668 ctttgtctatttctaaaaatcttatcattccgttcattccacaccaccgaaacaacaagtaaccaaatcaaatgaaagaaggaacgttgccctctcgaac 5734569  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  5734568 aacctgcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccttaccactccaagccatgctcgcaccaatgatcataaagcact 5734469  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734468 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 5734439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18789405 - 18789259
Alignment:
Q  16 gaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtac 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||     
T  18789405 gaccaccagtgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaattag 18789306  T
Q  116 tttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacc 162  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18789305 tttttctatttctaaaaatcttatcattcctttcattccacaacacc 18789259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 324 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14373209 - 14373026
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | || ||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||| | |    
T  14373209 acaagacaaaaacaaatgatttacatcttcatcatgcccataaccggaaacacacaaccgcccctccatagaaataatgccacggtttgccaaatttcct 14373110  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14373109 ttcgtaggtaagccgttcctcaaaagctgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaaatccata 14373026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 540
Target Start/End: Original strand, 21168194 - 21168337
Alignment:
Q  398 aaatgccacggtttgccaaattacttttc-gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaa 496  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||| || |||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21168194 aaatgccacggtttgccaatttttttttttgtaggtaatcgatcttgcaaaagtctccaagctaggatagatactttgagaggaacctatttatgccaaa 21168293  T
Q  497 ttaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168294 ttaactccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 21168337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 15959061 - 15958815
Alignment:
Q  294 caccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaa 393  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||   ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||| || ||||||||    
T  15959061 caccaatggccataaggcaccaaaaattgggcaagataaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaatcagtgacacacaactgcacctccaaa 15958962  T
Q  394 ggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcc 493  Q
    || |  || ||| |||||||||||||   ||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15958961 ggaatgataccatggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgcc 15958862  T
Q  494 aaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    | ||||||| |||| |  | ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  15958861 atattaacttcatatttggatgtaactgaagttgttcctgtgatgtc 15958815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17579394 - 17579116
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||| ||||||   |||||    
T  17579394 ataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaag 17579295  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| || ||     ||||||||  ||| ||    
T  17579294 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagt 17579195  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17579194 aggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 17579116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 20883346 - 20883035
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || ||| |||||| | | ||||||||| || ||  | || || |||||||  |||||||| ||||| || ||||  ||| ||  |||||    
T  20883346 ataaattgcacaaaatggtctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccatgtccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaag 20883247  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||| || || ||||||||| | | |||| ||   ||| ||    
T  20883246 acaaaaacatatgattcatatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacagatataatgccacgatctaccaagttcgatttagt 20883147  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgc 528  Q
    |||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| | || || |  || |||||     
T  20883146 aggtaaacaatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctatttatgccagattaactccatattttgatgaacatgtggttgt 20883047  T
Q  529 tcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||||    
T  20883046 tcctgtgatgtc 20883035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17573968 - 17573690
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||| ||||||   |||||    
T  17573968 ataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaag 17573869  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| || ||     ||||||||  ||| ||    
T  17573868 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagt 17573769  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17573768 aggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 17573690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 21630422 - 21630109
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| |  |||||||||  | | |||||||||||| ||  | || || ||||| || |||||||  ||||| ||||||| |||| ||  |||||    
T  21630422 ataaattgcacacaatgatctgaaatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaaagcaccaaaaattggacaag 21630323  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattact--tttc 426  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| ||||| |   |||||||  |  |||     
T  21630322 acaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgttccaccaaatttttgatttt 21630223  T
Q  427 gtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggtt 526  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || |  || ||||    
T  21630222 gtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtt 21630123  T
Q  527 gctcctgtgatgtc 540  Q
    | ||||||||||||    
T  21630122 gttcctgtgatgtc 21630109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17606434 - 17606369
Alignment:
Q  442 ctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17606434 ctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccata 17606369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10577467 - 10577251
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||||    |||| || || ||| ||||| |   |||||||   |    
T  10577467 acaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagttataatcccacgttccaccaaatttgat 10577368  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggg 523  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |  || |    
T  10577367 ttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactctatattttgatgaacatgag 10577268  T
Q  524 gttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||||||||||    
T  10577267 gttgttcctgtgatgtc 10577251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15959341 - 15959201
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||| ||||| |  | |    
T  15959341 cgaccaccaattatgagtaccaaaactaaaaacaacattactaacttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtggtaaagaa 15959242  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattcca 155  Q
    || ||  | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15959241 ctctgcttgtttctaaaaattctatcattccgatcattcca 15959201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Original strand, 32536508 - 32536638
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||| || || |||| ||| ||||| |  |      
T  32536508 cgaccaccaattattagtaccaaaactaaaaacaacattaatagcttttaaccaccaaaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtggtaaagag 32536607  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcc 145  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  32536608 ctgtgcctgtttctaaaaattctatcattcc 32536638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14373518 - 14373427
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtg 106  Q
    ||||||||| | |||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||| ||||    
T  14373518 cgaccaccaattatgaataccatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtg 14373427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 533
Target Start/End: Original strand, 13937708 - 13937831
Alignment:
Q  410 ttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatact 509  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  13937708 ttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatatt 13937807  T
Q  510 atggtgtaactggggttgctcctg 533  Q
     || ||||||  |||||| |||||    
T  13937808 ttgatgtaacatgggttgttcctg 13937831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 368
Target Start/End: Original strand, 11462334 - 11462378
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatcc 368  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11462334 acaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcc 11462378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 209 - 540
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3390
Alignment:
Q  209 tcgaacaacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3059 tcgaacaacctgcgtaattgataaattgcaaaaaatgatctgagatagaatgagagtcgactcccaccactcctaaccatgctcgcaccattggccataa 3158  T
Q  309 agcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgg 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3159 tgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatgg 3258  T
Q  409 tttgccaaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatac 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3259 tttgccaaattgcttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatat 3358  T
Q  509 tatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3359 tatggtgtaactagggttgctcctgtgatgtc 3390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 106370 - 105845
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||||   ||    
T  106370 cgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacaata 106271  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  106270 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaac 106171  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagcca-tgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  106170 aacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataatgcac 106072  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  106071 caaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgc 105972  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatgg 513  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  105971 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatgg 105872  T
Q  514 tgtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  105871 tgtaactggggctgctcctgtgatgtc 105845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 11732 - 11207
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||    
T  11732 cgaccaccactgatgagtgacaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagaaattgtggcaaagta 11633  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11632 ctttgtctatttctaaaaagcctatcattcttttcattccacagcatcgaaacacaaagcagtcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccctctcgaac 11533  T
Q  215 aacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcact 314  Q
    |||| || ||||| |||||||||  || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||||||| |||||||| || |     
T  11532 aaccggcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgctcc 11433  T
Q  315 aaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgcc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||    
T  11432 aaaagttgcacaagacaaaaacaaatgaaaaacattttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacggtttgcc 11333  T
Q  415 aaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggt 514  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  11332 aaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccagattatggt 11233  T
Q  515 gtaactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||    
T  11232 gtagctgggtctgctcctgtgatgtc 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 28 - 540
Target Start/End: Original strand, 4551795 - 4552307
Alignment:
Q  28 tgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtactttgtctatttc 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||    
T  4551795 tgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagtaattgtggcacagtactttgtctatttc 4551894  T
Q  128 taaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaacaacctgcgtaatt 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  4551895 taaaaagcctatcatttctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatt 4551994  T
Q  228 gataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaa 327  Q
     |||||||||  || ||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||    
T  4551995 aataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggtcataatgcaccaaaagttgcacaa 4552094  T
Q  328 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcg 427  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  4552095 gacaaaaacaaatgagaaacattttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttg 4552194  T
Q  428 taggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttg 527  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  4552195 taggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctg 4552294  T
Q  528 ctcctgtgatgtc 540  Q
    |||||||||||||    
T  4552295 ctcctgtgatgtc 4552307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 540
Target Start/End: Original strand, 41206631 - 41207154
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtactttgtctattt 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| ||| ||||| |  |  ||||||||||||    
T  41206631 atgagtaccaaagctaaatacaacattacgagattttaaccaccataaagaagatgatttgactttatctaacatgtgtggtaaagagctttgtctattt 41206730  T
Q  127 ctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacg-----tcc-----tctcgaacaa 216  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||| ||  ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||     ||      ||||||||||    
T  41206731 ctaaaaatcatttcatttcgttcattcctcaaaaccgaaacacaaagcaatcaaatcaagtggaaaaatgatcgtcgcaatctcgaacaatctcgaacaa 41206830  T
Q  217 cctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaa 316  Q
    | |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||| ||    
T  41206831 cttgcgtagttaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtctgagagtcaacccctaccactccgagccatgcccgcatcaatggccataaggcaccaa 41206930  T
Q  317 aagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaa 416  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  41206931 aagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataatgccacgatttgccaa 41207030  T
Q  417 attacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgt 516  Q
    |||| |||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||    
T  41207031 attattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttggatgt 41207130  T
Q  517 aactggggttgctcctgtgatgtc 540  Q
    ||||| || || ||||| ||||||    
T  41207131 aactgaggatgttcctgcgatgtc 41207154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 503
Target Start/End: Original strand, 15917266 - 15917755
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgta 114  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||||||||| |  |      
T  15917266 cgaccaccaattatgagtaccaaaactaaagacaacattactagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaacatatgtggtatagag 15917365  T
Q  115 ctttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctct-cgaa 213  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||||| |||||||||||  ||||| |||||  | |  ||||  |||||||| ||||| || ||   | | |||     
T  15917366 ctttgtctattcctaaatagtctgtcattccgttcattccacaaaacccaaacacattgaagtcaaaccaagtggaaaaaagatcgtcgcgattttcgag 15917465  T
Q  214 caacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcac 313  Q
    | |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||  | |  |||||| |||| || || || |  ||||||||  |||||| |||||| || || |    
T  15917466 ccacctgcataatgaataaattgcaaaaaatggtctgaaatagcctgagaaccgacccctacaacactgagccatgcctgcaccaatggccacaacgcgc 15917565  T
Q  314 taaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgc 413  Q
     |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||| |||||    
T  15917566 caaaagttggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacaaccagtgacacacaaccgcacttccaaaggaataataccacgatttgc 15917665  T
Q  414 caaattacttttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactc 503  Q
    |||||||  ||| |||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15917666 caaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaattaactc 15917755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 324 - 507
Target Start/End: Original strand, 28252642 - 28252825
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||| || |||||||| |||||| |||||| | | | ||||||| ||||||||||||| |      
T  28252642 acaagacaaaaacaaatgattcacatcttcatcatgaccacaaccggaaacacataaccgcccctccatatgaataatgccatggtttgccaaatttccc 28252741  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28252742 ttcgtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaattccata 28252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 325 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17765179 - 17764997
Alignment:
Q  325 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttt 424  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||   ||    
T  17765179 caagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgaccacaaccagtgacacacaaccgcgcctccaaaggaatgataccacggtttgccaaatttgctt 17765080  T
Q  425 tcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17765079 tcgtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccatattaactccata 17764997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 325 - 507
Target Start/End: Original strand, 12645459 - 12645641
Alignment:
Q  325 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttt 424  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  || | || ||||||   ||    
T  12645459 caagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaggtagaattctgcgatctgtcaaattgtatt 12645558  T
Q  425 tcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    | |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12645559 ttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgccaaattaactccata 12645641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11000263 - 10999986
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || |||||||||| | | ||||||||| || ||  | || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| |||| ||  |||||    
T  11000263 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaag 11000164  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |  ||||| ||||| || |||| || || ||| ||||| | |||||||||   ||| ||    
T  11000163 ataagaacaaatgattcacatcttcaacatgcccacattccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgttctgccaaatttgatttagt 11000064  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    ||| || || || || || || | ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || ||||||||||||    
T  11000063 aggcaaacgatccct-aacagccaccaagcaaggatagaaacttttaaagaaacctgtttatggcagattaactccata 10999986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 507
Target Start/End: Original strand, 14439580 - 14439857
Alignment:
Q  229 ataaattgcaaaagatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaag 328  Q
    |||||||||| || ||||||| || | | ||||||||| || ||  | || || ||||| || |||||||| ||||| || |||  |||| ||  |||||    
T  14439580 ataaattgcacaaaatgatctaagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgcatcaaaaattggacaag 14439679  T
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgt 428  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||| | ||||| || |||| || || ||| ||||| | | |||||||   ||| ||    
T  14439680 acaaaa-caaatgattcacatcttcaacctacccacatcccgttacataaaaccgagcttccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagt 14439778  T
Q  429 aggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 507  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14439779 aggtaaacgatccctcaacagtcgtcaagccaagatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccata 14439857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 38604587 - 38604376
Alignment:
Q  329 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaatt-acttttcg 427  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| ||||| |||||||   | |  |||||||| | ||||||||| ||| || |    
T  38604587 acaaaaacacatgatttacatcttcaacatgcccacagcctgagacacataaccgagcctccatgagaaggatgccacgatatgccaaattgactatt-g 38604489  T
Q  428 taggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttg 527  Q
    ||||||| || ||||| || ||  |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || |  |||||    
T  38604488 taggtaaacgatctcttaacagcagccatgcaaggattgaaacttttagaggtacttgtttatgccagattaactccatattttgatgaaaattaggttg 38604389  T
Q  528 ctcctgtgatgtc 540  Q
     ||||||||||||    
T  38604388 ttcctgtgatgtc 38604376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17765477 - 17765418
Alignment:
Q  27 atgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgattt 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  17765477 atgagtaccaaaactaaaaacaacattactagcttttaacccccacaaagaagatgattt 17765418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 28252334 - 28252426
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtgg 107  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||| |||||    
T  28252334 cgaccaccaattatgagtaccatagctaaaaacaatattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 28252426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 540
Target Start/End: Original strand, 40176591 - 40176806
Alignment:
Q  324 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 423  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| | ||  |||||||  ||||||| ||| || |||| ||||||   |    
T  40176591 acaaaacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcggtaaaa-gccgcgatttgtcaaattgact 40176689  T
Q  424 ttcgtaggtaaccggtctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggg 523  Q
    || |||||||| || || ||||| |  |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| | || || |  || |    
T  40176690 ttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatattttgatgaatatgag 40176789  T
Q  524 gttgctcctgtgatgtc 540  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40176790 gttgttcctgtgatgtc 40176806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 12645149 - 12645208
Alignment:
Q  15 cgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaa 74  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12645149 cgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagaccacattactagcttttaaccaccacaa 12645208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5938 - 5792
Alignment:
Q  16 gaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctagcatatgtggcagcgtac 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||     
T  5938 gaccaccagtgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaattag 5839  T
Q  116 tttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacatcacc 162  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5838 tttatctatttctaaaaatcttatcattcctttcattccacaacacc 5792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6523 - 6477
Alignment:
Q  28 tgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6523 tgagtaccaaaactaaatacaacattactagctttcaaccaccacaa 6477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University