View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7786_high_13 (Length: 217)

Name: NF7786_high_13
Description: NF7786
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7786_high_13
NF7786_high_13
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (14-204)||(5216-5406)
scaffold0079 (30-117)||(5377-5464)
scaffold0079 (14-93)||(5364-5443)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (14-204)||(21676050-21676240)
chr7 (30-204)||(28719355-28719529)
chr7 (30-157)||(45148443-45148570)
chr7 (30-204)||(4483628-4483802)
chr7 (14-201)||(16382432-16382619)
chr7 (14-204)||(39292876-39293065)
chr7 (54-196)||(8564726-8564868)
chr7 (30-158)||(46472865-46472992)
chr7 (14-201)||(44306318-44306506)
chr7 (14-163)||(16369574-16369723)
chr7 (30-114)||(16369660-16369744)
chr7 (100-170)||(21539365-21539435)
chr7 (30-113)||(16382411-16382494)
chr7 (30-113)||(44306444-44306527)
chr7 (14-76)||(28719376-28719438)
chr7 (96-201)||(13617699-13617804)
chr7 (30-113)||(39293003-39293086)
chr7 (31-93)||(21676235-21676297)
chr7 (14-113)||(21676178-21676277)
chr7 (32-113)||(28719320-28719401)
chr7 (30-76)||(8564809-8564855)
chr7 (14-76)||(45148464-45148526)
chr7 (31-89)||(9641790-9641850)
chr7 (128-192)||(15979209-15979273)
chr7 (66-114)||(16369697-16369745)
chr7 (100-133)||(15979303-15979336)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (16-204)||(14342859-14343046)
chr5 (30-204)||(20455189-20455363)
chr5 (30-202)||(21108409-21108581)
chr5 (30-204)||(11964850-11965024)
chr5 (96-204)||(20833202-20833309)
chr5 (14-76)||(20455280-20455342)
chr5 (118-204)||(24226678-24226764)
chr5 (96-201)||(23414099-23414204)
chr5 (115-196)||(33627605-33627686)
chr5 (14-78)||(21108430-21108494)
chr5 (25-86)||(11764773-11764833)
chr5 (15-76)||(11964872-11964933)
chr5 (58-93)||(11764802-11764837)
chr5 (14-76)||(14342950-14343012)
chr5 (32-113)||(20455317-20455397)
chr5 (51-85)||(14343051-14343085)
chr5 (32-113)||(11964816-11964896)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (14-204)||(25756873-25757063)
chr8 (34-204)||(25294873-25295043)
chr8 (30-175)||(11543414-11543559)
chr8 (30-204)||(45560310-45560484)
chr8 (30-175)||(22312569-22312714)
chr8 (14-195)||(25608941-25609111)
chr8 (31-192)||(3845250-3845409)
chr8 (14-201)||(20177079-20177267)
chr8 (14-201)||(20221806-20221994)
chr8 (14-93)||(19332802-19332881)
chr8 (14-113)||(19332819-19332918)
chr8 (30-93)||(19332876-19332939)
chr8 (30-113)||(20177205-20177288)
chr8 (30-113)||(20221932-20222015)
chr8 (30-93)||(24238445-24238508)
chr8 (30-93)||(25608920-25608983)
chr8 (31-113)||(16000904-16000986)
chr8 (30-83)||(16000940-16000993)
chr8 (34-113)||(25756856-25756935)
chr8 (14-76)||(11543435-11543497)
chr8 (14-72)||(24238466-24238524)
chr8 (14-76)||(25294890-25294952)
chr8 (104-204)||(7469137-7469238)
chr8 (14-76)||(22312590-22312652)
chr8 (14-76)||(45560401-45560463)
chr8 (32-113)||(11543379-11543460)
chr8 (120-157)||(19332756-19332793)
chr8 (14-71)||(19332787-19332844)
chr8 (30-113)||(22312532-22312615)
chr8 (107-158)||(22498526-22498577)
chr8 (30-80)||(17265756-17265806)
chr8 (98-155)||(18042772-18042830)
chr8 (69-117)||(11543379-11543427)
[»] scaffold0317 (3 HSPs)
scaffold0317 (16-204)||(14943-15131)
scaffold0317 (30-113)||(15071-15154)
scaffold0317 (14-76)||(15034-15096)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (14-196)||(1323-1505)
scaffold1204 (30-93)||(1463-1526)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (30-204)||(11401475-11401649)
chr3 (14-196)||(17759543-17759729)
chr3 (14-196)||(19060863-19061049)
chr3 (51-204)||(8603542-8603695)
chr3 (33-204)||(5229206-5229376)
chr3 (30-204)||(38376904-38377078)
chr3 (104-197)||(25105174-25105267)
chr3 (33-93)||(17759687-17759747)
chr3 (33-93)||(19061007-19061067)
chr3 (14-88)||(38376983-38377057)
chr3 (25-86)||(11516772-11516833)
chr3 (25-88)||(17392274-17392337)
chr3 (30-76)||(5229297-5229343)
chr3 (14-76)||(11401496-11401558)
chr3 (104-204)||(43428742-43428843)
chr3 (33-149)||(11516746-11516864)
chr3 (30-79)||(14181293-14181342)
chr3 (104-204)||(18968979-18969080)
chr3 (30-83)||(40040403-40040456)
chr3 (31-89)||(17392241-17392301)
chr3 (30-86)||(37917651-37917707)
chr3 (32-109)||(38377036-38377113)
chr3 (31-79)||(31413599-31413647)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (14-204)||(22331603-22331792)
chr2 (30-204)||(18534727-18534901)
chr2 (30-204)||(24561963-24562137)
chr2 (14-191)||(6093725-6093894)
chr2 (118-204)||(43641704-43641790)
chr2 (30-201)||(20272259-20272430)
chr2 (32-102)||(6093706-6093776)
chr2 (16-204)||(24840690-24840873)
chr2 (30-118)||(22331582-22331670)
chr2 (30-86)||(29113144-29113200)
chr2 (72-135)||(45618691-45618754)
chr2 (118-204)||(19434670-19434756)
chr2 (14-76)||(24562054-24562116)
chr2 (14-76)||(18534748-18534810)
chr2 (32-113)||(24562091-24562172)
chr2 (135-204)||(45618405-45618474)
chr2 (14-68)||(24840725-24840779)
chr2 (35-76)||(45618713-45618754)
chr2 (67-147)||(29113144-29113224)
chr2 (101-133)||(45619298-45619330)
[»] scaffold0090 (7 HSPs)
scaffold0090 (33-204)||(5736-5907)
scaffold0090 (49-204)||(1356-1511)
scaffold0090 (14-76)||(1447-1509)
scaffold0090 (14-76)||(5827-5889)
scaffold0090 (41-112)||(35993-36063)
scaffold0090 (30-86)||(35982-36038)
scaffold0090 (34-93)||(36048-36102)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (14-153)||(11374005-11374144)
chr6 (30-157)||(29161586-29161713)
chr6 (30-204)||(23220601-23220774)
chr6 (30-171)||(16135183-16135324)
chr6 (51-140)||(25650019-25650108)
chr6 (70-204)||(17084450-17084584)
chr6 (30-118)||(22594749-22594837)
chr6 (16-113)||(29161667-29161764)
chr6 (30-92)||(21930797-21930859)
chr6 (14-80)||(22594750-22594816)
chr6 (30-93)||(29161761-29161824)
chr6 (30-113)||(11374082-11374165)
chr6 (14-93)||(29161724-29161803)
chr6 (14-76)||(16135204-16135266)
chr6 (14-76)||(23220622-23220684)
chr6 (34-91)||(4172874-4172931)
chr6 (34-91)||(4228483-4228540)
chr6 (32-113)||(23220566-23220647)
chr6 (14-76)||(29161630-29161692)
chr6 (32-113)||(21930762-21930843)
chr6 (30-65)||(18104732-18104767)
chr6 (145-204)||(31162105-31162164)
chr6 (71-117)||(4172885-4172931)
chr6 (71-117)||(4228494-4228540)
chr6 (14-76)||(25650019-25650081)
chr6 (14-55)||(21930818-21930859)
chr6 (104-204)||(22463317-22463418)
chr6 (31-89)||(22594642-22594702)
chr6 (67-115)||(26505689-26505737)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (14-195)||(9695-9877)
scaffold0183 (30-110)||(9674-9754)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (30-204)||(5371791-5371964)
chr4 (16-204)||(12134844-12135029)
chr4 (30-204)||(19558232-19558406)
chr4 (30-204)||(54364664-54364838)
chr4 (30-196)||(17376660-17376823)
chr4 (30-171)||(14570156-14570297)
chr4 (14-88)||(54364743-54364817)
chr4 (14-86)||(14570177-14570249)
chr4 (14-76)||(5371881-5371943)
chr4 (120-204)||(12733052-12733136)
chr4 (30-83)||(12134999-12135052)
chr4 (96-201)||(49070703-49070808)
chr4 (69-190)||(19082289-19082410)
chr4 (104-204)||(38763665-38763766)
chr4 (32-113)||(5371918-5371998)
chr4 (31-89)||(13595395-13595455)
chr4 (32-113)||(14570122-14570202)
chr4 (32-88)||(19082354-19082410)
chr4 (145-204)||(17213063-17213122)
chr4 (120-204)||(16226366-16226449)
chr4 (96-204)||(24237765-24237873)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (30-200)||(33396200-33396371)
chr1 (30-155)||(77184-77309)
chr1 (14-204)||(20821876-20822062)
chr1 (30-113)||(20821855-20821938)
chr1 (14-76)||(77226-77288)
chr1 (32-113)||(20821820-20821901)
chr1 (104-204)||(46144659-46144760)
chr1 (69-175)||(21224122-21224229)
chr1 (104-204)||(40437479-40437579)
chr1 (127-202)||(49998526-49998602)
[»] scaffold0231 (3 HSPs)
scaffold0231 (15-188)||(14075-14248)
scaffold0231 (14-88)||(14138-14212)
scaffold0231 (30-93)||(14207-14270)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (14-175)||(21208-21369)
scaffold0174 (15-113)||(21307-21405)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (37-204)||(11488-11656)
scaffold0017 (30-76)||(11518-11564)
[»] scaffold0009 (6 HSPs)
scaffold0009 (16-93)||(255643-255720)
scaffold0009 (14-111)||(255551-255648)
scaffold0009 (14-93)||(255606-255685)
scaffold0009 (31-93)||(98348-98412)
scaffold0009 (53-113)||(255660-255720)
scaffold0009 (30-80)||(98324-98374)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (30-171)||(247079-247220)
scaffold0005 (14-86)||(247127-247199)
scaffold0005 (32-113)||(247174-247254)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (105-175)||(12214-12284)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (114-204)||(4839-4929)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (30-112)||(8429-8511)
scaffold0013 (19-75)||(8429-8485)
scaffold0013 (114-204)||(8322-8412)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (30-83)||(75912-75965)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (121-204)||(2197-2280)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (96-201)||(44793-44900)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (128-204)||(34645-34720)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (109-204)||(755-850)


Alignment Details
Target: scaffold0079 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5406 - 5216
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5406 aatatcacaaccaatcaacatatatgcattcaacaacaatatcacaatcaatccacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatata 5307  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5306 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaacttcataccatttctcacaattcaattaatggagaaaatacaacacattatgat 5216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5464 - 5377
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcatt 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  5464 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattgacatatatttattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgcatt 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5364
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5443 aatatcacaatcaattgacatatatttattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgcattcaacaacaatatc 5364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21676240 - 21676050
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676240 aatatcacaaccaacaaacatatatgcattcaccaacaatattgcaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 21676141  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21676140 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 21676050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 28719355 - 28719529
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28719355 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 28719454  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||    
T  28719455 ctctatcatatagttcaacaactccatacaatttctcaaaattcaagtaaaagagaaaatacaacacattatgat 28719529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Original strand, 45148443 - 45148570
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45148443 aacatatatgtattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgtattcaccagcaatatcctcatcaattaacatatatgcaatattcaacatcaa 45148542  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccata 157  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45148543 ttatatcttatagttcaacaactccata 45148570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 4483628 - 4483802
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483628 aacatatatgcattcaccgacaatattacaatccattaacatatatgtattcaacaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 4483727  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||  |||||||    
T  4483728 ctatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaaataaaggggaaaatacaacatattatgat 4483802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 16382432 - 16382619
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||  || ||||||||||    
T  16382432 aatatcacactcaattaacatatatgtatccaccaacaatatcacaatcaataaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatatatcaacatatatg 16382531  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttat 201  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16382532 taatattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcataatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttat 16382619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39293065 - 39292876
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  39293065 aatatcacaatcaatcaacatatatttattcatcaaaaatatcacaatcaatcaacatatatgtatttaccaacaatatcaccatcaattagcatacatg 39292966  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  39292965 cattaatcaacat-aactagatcatatggttcaacaactccatacaatttctcacaatacacgtaaaggagagaatacaacacattatgat 39292876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8564868 - 8564726
Alignment:
Q  54 atcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactc 153  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8564868 atcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgcattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactc 8564769  T
Q  154 cataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacac 196  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  8564768 catacgatttctcacaattcaagtaaaggagaacatacaacac 8564726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 46472865 - 46472992
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  46472865 aacatatatctattcaccaataatatcataatcaatcaacatatatgtattttc-aacaatatcaccatcaattaaaatatatgcattaatcaacataaa 46472963  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccatac 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46472964 ctatatcatatagttcaacaactccatac 46472992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44306506 - 44306318
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    || ||| ||||||||||    
T  44306506 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatccaccaataatataacaattaatcaacatatatg 44306407  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaa-ttcaattaatggaaaaaatacaacaccttat 201  Q
     |||   ||||||| |||  |||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  44306406 tattcaccaacatcgacttcatcatataattcaacaacatcatattatttctcacaatttcaagtaaaggagaaaatacaacaccttat 44306318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16369723 - 16369574
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  16369723 aatatcaccatcaattaacatatatgcgttcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatgccttcaccaacaatataaccatcaattaatatatatg 16369624  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccattt 163  Q
    | ||   ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16369623 cgttcaccaacatcaactaagtcatataattcaacaacttcctaccattt 16369574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16369744 - 16369660
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgc 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16369744 aacatatatgcattcaccgacaatatcaccatcaattaacatatatgcgttcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatgc 16369660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21539435 - 21539365
Alignment:
Q  100 aattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaa 170  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21539435 aattaacatgtatgcattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaa 21539365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 16382411 - 16382494
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  16382411 aacatatatgcattcaccgacaatatcacactcaattaacatatatgtatccaccaacaatatcacaatcaataaacatatatg 16382494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 44306527 - 44306444
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  44306527 aacatatatgtattcatcaataatatcacaatcaatcaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 44306444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 28719376 - 28719438
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28719376 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 28719438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 13617699 - 13617804
Alignment:
Q  96 catcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  13617699 catcaattgatatatatacattaatcaacatcaactatataatatagctcaacaactccatacactttctcacattccaagtaaaggagaaaatacaaca 13617798  T
Q  196 ccttat 201  Q
    ||||||    
T  13617799 ccttat 13617804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39293086 - 39293003
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||    
T  39293086 aacatatatgtattcaccaataatatcacaatcaatcaacatatatttattcatcaaaaatatcacaatcaatcaacatatatg 39293003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21676297 - 21676235
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21676297 acatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattgacatatatgtatccaccaacaatatc 21676235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21676277 - 21676178
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    |||||| ||||||||||    
T  21676277 aatatcacaatcaattgacatatatgtatccaccaacaatatcacaaccaacaaacatatatgcattcaccaacaatattgcaatcaatcaacatatatg 21676178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 28719320 - 28719401
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  28719320 catatatgcaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 28719401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8564855 - 8564809
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8564855 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 8564809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 45148464 - 45148526
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  45148464 aatatcacaaccaatcaacatatatgtattcaccagcaatatcctcatcaattaacatatatg 45148526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 9641790 - 9641850
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaat--atcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaa 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9641790 acatatatgcactcaccaacaattcaccacaatcattcaacatatatatattcaccaacaa 9641850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15979273 - 15979209
Alignment:
Q  128 aactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaataca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||| | | ||||||||    
T  15979273 aactatatcatatagttcaacaacttcatacaatttctcacaatccaagtaaagtagaaaataca 15979209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16369745 - 16369697
Alignment:
Q  66 caacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgc 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16369745 caacatatatgcattcaccgacaatatcaccatcaattaacatatatgc 16369697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15979336 - 15979303
Alignment:
Q  100 aattaacatatatgcattattcaacatcaactat 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15979336 aattaacatatatgcattactcaacatcaactat 15979303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14343046 - 14342859
Alignment:
Q  16 tatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgca 115  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14343046 tatcacaac-aatcaacgtatacgcgttcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgca 14342948  T
Q  116 ttattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14342947 ttattcaacatcaactatatcatattgttcaacaactccataccatttctcacaattcaattaatggagaaaatacaacacattatgat 14342859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20455363 - 20455189
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20455363 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 20455264  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  20455263 ctatatcatatagttcaacaactccattcagtttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 20455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 21108409 - 21108581
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  21108409 aacatatatgtattcaccgacaatatcacactcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtaatattcaacatcaa 21108508  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21108509 ctatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatg 21108581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 11964850 - 11965024
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11964850 aacatatatgcattcaccgacgatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccgacaatatcacactcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 11964949  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11964950 ctatattatttagttcaacaacttcatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 11965024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20833309 - 20833202
Alignment:
Q  96 catcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||  || |||||||| ||    
T  20833309 catcacttaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatattatttctcacaatacaagtaa-agagaaaatacatca 20833211  T
Q  196 ccttatgat 204  Q
     ||||||||    
T  20833210 tcttatgat 20833202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20455342 - 20455280
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455342 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 20455280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24226764 - 24226678
Alignment:
Q  118 attcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||||    
T  24226764 attcaacatcaactacatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaagtaaaacacattatgat 24226678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 23414099 - 23414204
Alignment:
Q  96 catcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||| ||| |||||||||||    
T  23414099 catcaattgatatatatacattaatcaacatcaactatataatatagctcaacaactccatacactttctcacattccaagtaaaggagaaaatacaaca 23414198  T
Q  196 ccttat 201  Q
    ||||||    
T  23414199 ccttat 23414204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33627686 - 33627605
Alignment:
Q  115 attattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacac 196  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  33627686 attaatcaacttcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttttcataatacaagtaaaggagaaaatacaacac 33627605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 21108430 - 21108494
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgta 78  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108430 aatatcacactcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgta 21108494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11764833 - 11764773
Alignment:
Q  25 caataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11764833 caatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatc-atcaatatatatgtattcaccaa 11764773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 11964872 - 11964933
Alignment:
Q  15 atatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11964872 atatcacaatcaattaacatatatgtattcaccgacaatatcacactcaatcaacatatatg 11964933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11764837 - 11764802
Alignment:
Q  58 caatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11764837 caatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 11764802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14343012 - 14342950
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  14343012 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 14342950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20455397 - 20455317
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20455397 catatatgaaatcaccaacac-atcaccatcacttaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaattaacatatatg 20455317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14343085 - 14343051
Alignment:
Q  51 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcacca 85  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14343085 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcacca 14343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 11964816 - 11964896
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||||||| || |||||   |||||||||||||||||    
T  11964816 catatatgcaatcaccaacac-atcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacgatatcacaatcaattaacatatatg 11964896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 25756873 - 25757063
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25756873 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaaaaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatg 25756972  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  25756973 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaagtcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 25757063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 25294873 - 25295043
Alignment:
Q  34 tatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactat 133  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25294873 tatatgaattcaccaaaaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatgcattaatcaacatcaactat 25294972  T
Q  134 atcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  25294973 atcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaagtcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 25295043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Original strand, 11543414 - 11543559
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11543414 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatataacaatcaaccaacatatatgcattaatcaacatcaa 11543513  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11543514 ctatatcatatagttcaacaactccatactatttctcacaattcaa 11543559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45560484 - 45560310
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||   |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45560484 aacaaatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaaaatatatgtattcacaaacaatatcacaatcaaacaacatatatgcattaatcaacatcaa 45560385  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  45560384 ctatatcatatagttcaacaactccatacaacttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacactttatgat 45560310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Original strand, 22312569 - 22312714
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22312569 aacatatatgcattcaccgacaatattacaatcaattgacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaaccaacatatatgcattaatcaacatcaa 22312668  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22312669 ctatatcatatagttcaacaactccatactatttctcacaattcaa 22312714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 25608941 - 25609111
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  25608941 aatatcacaaccaatcaacacatatgtattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgtattcaccaac-----------caatcaacatatatg 25609029  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  25609030 tattaatccacatcaactatatcatatagttcaacaacatcatactatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaaca 25609111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3845409 - 3845250
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaac 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||    
T  3845409 acatatatgcattcaccaacaatatcaacatcaattgacatatatgcattcacc--caatatcaccatcacttaacatatatgcactaatcattatcaac 3845312  T
Q  131 tatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaataca 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  3845311 tatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaatccaagtaaaggagaaaataca 3845250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20177267 - 20177079
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    || ||| ||||||||||    
T  20177267 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatccaccaataatataacaattaatcaacatatatg 20177168  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaa-ttcaattaatggaaaaaatacaacaccttat 201  Q
     |||   ||||||| |||  |||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  20177167 tattcaccaacatcgacttcatcatataattcaacaacatcatattatttctcacaatttcaagtaaaggagaaaatacaacaccttat 20177079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20221994 - 20221806
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    || ||| ||||||||||    
T  20221994 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatccaccaataatataacaattaatcaacatatatg 20221895  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaa-ttcaattaatggaaaaaatacaacaccttat 201  Q
     |||   ||||||| |||  |||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  20221894 tattcaccaacatcgacttcatcatataattcaacaacatcatattatttctcacaatttcaagtaaaggagaaaatacaacaccttat 20221806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19332881 - 19332802
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19332881 aatatcacaaccaatcaacatatatgtatttaccaacaatatctcaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 19332802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19332918 - 19332819
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  19332918 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcacccacaatatcacaaccaatcaacatatatgtatttaccaacaatatctcaatcaatcaacatatatg 19332819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19332939 - 19332876
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19332939 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcacccacaatatc 19332876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20177288 - 20177205
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  20177288 aacatatatgtattcatcaataatatcacaatcaatcaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 20177205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20222015 - 20221932
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  20222015 aacatatatgtattcatcaataatatcacaatcaatcaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 20221932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 24238445 - 24238508
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24238445 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacttatatgtattcaccaacaatatc 24238508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 25608920 - 25608983
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25608920 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaaccaatcaacacatatgtattcaccaacaatatc 25608983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 16000904 - 16000986
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  16000904 acatatatgcaatcaccaacaacatctcaatcactcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 16000986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 16000940 - 16000993
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcac 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16000940 aacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcac 16000993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 25756856 - 25756935
Alignment:
Q  34 tatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||    
T  25756856 tatatgcattcaccggcaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaaaaatatcacaatcaatcaacatatatg 25756935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 11543435 - 11543497
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11543435 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatataacaatcaaccaacatatatg 11543497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 24238466 - 24238524
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacata 72  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238466 aatatcacaatcaattaacttatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacata 24238524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 25294890 - 25294952
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25294890 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatg 25294952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 7469137 - 7469238
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  7469137 aacatgtattcattaatcagcttcaactatatcatatagttcaacaactccatacaacttctcataatacaagtaaaggaggaaaatacaacaccttatg 7469236  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  7469237 at 7469238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 22312590 - 22312652
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22312590 aatattacaatcaattgacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaaccaacatatatg 22312652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45560463 - 45560401
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45560463 aatatcacaatcaattaaaatatatgtattcacaaacaatatcacaatcaaacaacatatatg 45560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 11543379 - 11543460
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  11543379 catatatgtaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 11543460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19332793 - 19332756
Alignment:
Q  120 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccata 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19332793 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccata 19332756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19332844 - 19332787
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacat 71  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19332844 aatatctcaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaaccaatcaacat 19332787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 22312532 - 22312615
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||    ||||||| |||||||||    
T  22312532 aacatatatgcaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatattacaatcaattgacatatatg 22312615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22498577 - 22498526
Alignment:
Q  107 atatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatac 158  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22498577 atatatacattaatcaacatcaactatataatatagttcaaccactccatac 22498526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 17265756 - 17265806
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatt 80  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  17265756 aacatatatgcattcaccgaaaatatcacactcaattaacatatatatatt 17265806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18042830 - 18042772
Alignment:
Q  98 tcaattaacatatatgcatta-ttcaacatcaactatatcatatagttcaacaactcca 155  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18042830 tcaattgatatatatacattaattcaacatcaactatataatatagttcaaccactcca 18042772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Original strand, 11543379 - 11543427
Alignment:
Q  69 catatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcatt 117  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11543379 catatatgtaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcatt 11543427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 14943
Alignment:
Q  16 tatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgca 115  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15131 tatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatgca 15032  T
Q  116 ttattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  15031 ttaatcgacatcaactatatcatatagttcaacaactccatataatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 14943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15154 - 15071
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||||||  |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  15154 aacatatacacattcaccgaaattatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 15071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15096 - 15034
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15096 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatg 15034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1323
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1505 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgtattcaccaacaatattctcatcaattaacatatatg 1406  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacac 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1405 caatattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacac 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 1526 - 1463
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1526 aacatatacgcattcaccgataatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatc 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 11401475 - 11401649
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11401475 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatgcattaatcaacatcaa 11401574  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||    
T  11401575 ctttatcatatagttcaacaacttcatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaacacagcacattatgat 11401649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17759729 - 17759543
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17759729 aatatcacaatcaatgaacatatatgtattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgtattcaccaacaagatcctcatcaattaacatatatg 17759630  T
Q  114 cattattcaa----catcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacac 196  Q
    || |||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  17759629 caatattcaacatgcatcaactatatcatataatttaacaactccatatactttctcacaatccaattaaaagagaaaatacaacac 17759543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19061049 - 19060863
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19061049 aatatcacaatcaatgaacatatatgtattcaccaacaatatcacaaccaatcaacatatatgtattcaccaacaagatcctcatcaattaacatatatg 19060950  T
Q  114 cattattcaa----catcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacac 196  Q
    || |||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  19060949 caatattcaacatgcatcaactatatcatataatttaacaactccatatactttctcacaatccaattaaaagagaaaatacaacac 19060863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 8603542 - 8603695
Alignment:
Q  51 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaa 150  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603542 aatatcacaatcaattgatatatatgtattcaccaacaatatccttatcaattaacacatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaa 8603641  T
Q  151 ctccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |  ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8603642 catcatactatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 8603695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5229376 - 5229206
Alignment:
Q  33 atatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaacta 132  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5229376 atatatgcaatcaccaacac-atcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcgacatcaacta 5229278  T
Q  133 tatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  5229277 tatcatattgttcaacaactccatacgatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 5229206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38377078 - 38376904
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||   ||||||| |    
T  38377078 aacatatatgcattcactgacaatatcacaatcaattaacatacatgtattcaccaacaatatcataatcaatcaacatatacatattcaccaacatcga 38376979  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    || ||||||||  |||||||||  ||||  |||| ||| ||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  38376978 ctttatcatatgattcaacaacatcatattatttctcaaaatccaagtaaaggagaaaatataacaccttatgat 38376904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25105267 - 25105174
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacacc 197  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  25105267 aacatgtattcattaatcaacttcaactatatcatttagttcaacaactccatacaatttcccacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacc 25105174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17759747 - 17759687
Alignment:
Q  33 atatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17759747 atatatgcattctccgacaatatcacaatcaatgaacatatatgtattcaccaacaatatc 17759687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19061067 - 19061007
Alignment:
Q  33 atatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19061067 atatatgcattctccgacaatatcacaatcaatgaacatatatgtattcaccaacaatatc 19061007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 38377057 - 38376983
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaca 88  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38377057 aatatcacaatcaattaacatacatgtattcaccaacaatatcataatcaatcaacatatacatattcaccaaca 38376983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11516833 - 11516772
Alignment:
Q  25 caataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516833 caattaacatatatgtattcaccaacaacatctcaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 11516772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Original strand, 17392274 - 17392337
Alignment:
Q  25 caataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaca 88  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17392274 caattaacatatatgtattcaccaacaacatcacaataaatcaacatatatgtattcactaaca 17392337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5229343 - 5229297
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229343 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaatcaacatatatg 5229297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 11401496 - 11401558
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11401496 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatg 11401558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43428843 - 43428742
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  43428843 aacatgtattcattaatcaacttccactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcataatacaagtaatagaggaaaatacaataccttatg 43428744  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  43428743 at 43428742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11516864 - 11516746
Alignment:
Q  33 atatatgcattcaccaacaatat-cacaat-caatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaac 130  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||| |||   ||| ||||||    
T  11516864 atatatgcaatcaccaacaacattcacaattcaattaacatatatgtattcaccaacaacatctcaatcaatcaacatatatgtattcaccaatatcaac 11516765  T
Q  131 tatatcatatagttcaaca 149  Q
    | | ||| |||||||||||    
T  11516764 tttttcacatagttcaaca 11516746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14181342 - 14181293
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtat 79  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14181342 aacatatatgcattcaccgacattatcacaatcaattaacatatatgtat 14181293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 18968979 - 18969080
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  18968979 aacatgtattcattaatccacttcaactatatcatatagttcaacagctccattcaacttctcataatacaagtaaaggaggaaaatacaacaccttatg 18969078  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  18969079 at 18969080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 40040456 - 40040403
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcac 83  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  40040456 aacatatatgcattcaccgacattatcacaatcaattagcatatatttattcac 40040403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 17392241 - 17392301
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaatat-cacaat-caatcaacatatatgtattcaccaacaa 89  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17392241 acatatatgcaatcaccaacaacattcacaattcaattaacatatatgtattcaccaacaa 17392301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37917707 - 37917651
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  37917707 aacatatatgcattcaccgacattatcagaatcaattagcatatatttattcaccaa 37917651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 38377113 - 38377036
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacata 109  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||    
T  38377113 catatatgcaatcatcaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcactgacaatatcacaatcaattaacata 38377036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 31413647 - 31413599
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtat 79  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  31413647 acatatatgcactcaccaacaacatcataattaatcaatatatatgtat 31413599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 22331603 - 22331792
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  22331603 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatattacaatcaatcaacatatatgtatt-accaacaatatcaccatcaattaatatatatg 22331701  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  22331702 cattaatcaacataaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaatacaagtaaaggagaagatacaacacattatgat 22331792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 18534727 - 18534901
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18534727 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcatcaagaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 18534826  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  18534827 ctatatcatatagttcaacaactccatataatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 18534901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24562137 - 24561963
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  24562137 aacatatatgcattcaccgacaatatcaaaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcga 24562038  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24562037 ctttatcatataattcaacaacatcatactatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 24561963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 6093725 - 6093894
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||   ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093725 aatatcacaatcaatcagcatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaat--------atgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 6093816  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatac 191  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  6093817 caatattcaacaataactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatac 6093894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 43641704 - 43641790
Alignment:
Q  118 attcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  43641704 attcaacatcaactacatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 43641790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 20272259 - 20272430
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| | || | | |||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||   ||||||| |    
T  20272259 aacatatatgcaatcaccaacaaaatcaccaacacttagcatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacatcga 20272358  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttat 201  Q
    || ||||||||| ||||| |||  ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  20272359 ctttatcatataattcaataacatcatacaatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacacattat 20272430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 102
Target Start/End: Original strand, 6093706 - 6093776
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaat 102  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093706 catatatgcattcgtcgacaatatcacaatcaatcagcatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaat 6093776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 24840690 - 24840873
Alignment:
Q  16 tatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgca 115  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| |    |||| ||    
T  24840690 tatcacaatcaattaacatatatgttttcaccaacaatatctcaatcaatcaacatatatgcattcacaaaccatatcacaatcaatca----atataca 24840785  T
Q  116 ttattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||   ||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||    
T  24840786 ttcaccaacatcgactttatcatataattcaacaacatcatattatttctcacaattcaagtga-ggagaaaatacaacacattatgat 24840873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Original strand, 22331582 - 22331670
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcatta 118  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||||    
T  22331582 aacacatatgtattcatcaataatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatattacaatcaatcaacatatatgtatta 22331670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 29113144 - 29113200
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29113144 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaa 29113200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45618754 - 45618691
Alignment:
Q  72 atatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatat 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45618754 atatgcattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatgcattaatcaacatcaactatat 45618691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19434756 - 19434670
Alignment:
Q  118 attcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||    
T  19434756 attcaacatcaactacatcatatagttcaaaaactccttacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaatacattatgat 19434670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24562116 - 24562054
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24562116 aatatcaaaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 24562054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 18534748 - 18534810
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18534748 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcatcaagaatatcacaatcaatcaacatatatg 18534810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24562172 - 24562091
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  24562172 catatatgcaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcaaaatcaattaacatatatg 24562091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 45618405 - 45618474
Alignment:
Q  135 tcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||    
T  45618405 tcatatagttcaacaacttcatacaatttctcacaattcaagtaaaagagaaaatacaacacattatgat 45618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Original strand, 24840725 - 24840779
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaa 68  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24840725 aatatctcaatcaatcaacatatatgcattcacaaaccatatcacaatcaatcaa 24840779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45618754 - 45618713
Alignment:
Q  35 atatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45618754 atatgcattcaccaacaatatcaccatcaattaacatatatg 45618713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 29113144 - 29113224
Alignment:
Q  67 aacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaa 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||   ||| |||||||  |||||||| |||||    
T  29113144 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaatatcaacttcatcatataattcaa 29113224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45619330 - 45619298
Alignment:
Q  101 attaacatatatgcattattcaacatcaactat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45619330 attaacatatatgcattactcaacatcaactat 45619298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 7)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5907 - 5736
Alignment:
Q  33 atatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaacta 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5907 atatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattagcatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacgtcaacta 5808  T
Q  133 tatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  5807 tatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 5736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1511 - 1356
Alignment:
Q  49 acaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaac 148  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1511 acaatatcacaatcaattagcatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacgtcaactatatcatatagttcaac 1412  T
Q  149 aactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  1411 aactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 1356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1447
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1509 aatatcacaatcaattagcatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 1447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5827
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5889 aatatcacaatcaattagcatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 5827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 36063 - 35993
Alignment:
Q  41 attcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||    
T  36063 attcaccaacaatatcacaatca-tcaacatatatgtattcactaacaatatctcaatcaatcaacatatat 35993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36038 - 35982
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36038 aacatatatgtattcactaacaatatctcaatcaatcaacatatatattttcaccaa 35982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 36102 - 36048
Alignment:
Q  34 tatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||    
T  36102 tatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatgaacat-----tattcaccaacaatatc 36048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11374144 - 11374005
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||| | |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11374144 aatatcaccatcaattaacatatacatattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 11374045  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactc 153  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11374044 caatattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactc 11374005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29161713 - 29161586
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29161713 aacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcatcatcaattaacatatatgcaatattcaacatcaa 29161614  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccata 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29161613 ctatatcatatagttcgacaactccata 29161586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 23220601 - 23220774
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23220601 aacatatatgcattcaccgacaatatcataatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 23220700  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| |||||||    
T  23220701 ctatatcatatagttcaacaact-catataatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatgaaacacattatgat 23220774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Original strand, 16135183 - 16135324
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16135183 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacagtcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 16135282  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaat 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  16135283 ctatatcatatagttcaataactccatacaatttctcacaat 16135324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 140
Target Start/End: Original strand, 25650019 - 25650108
Alignment:
Q  51 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatat 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25650019 aatatcgcaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcactattcaacatcaactacatcatat 25650108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17084584 - 17084450
Alignment:
Q  70 atatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcaca 169  Q
    |||||| |||||||||| | ||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17084584 atatatatattcaccaatagtatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacataaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcaca 17084485  T
Q  170 attcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    || ||| |||  || |||||||||||| |||||||    
T  17084484 atacaagtaaatgagaaaatacaacacattatgat 17084450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22594837 - 22594749
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcatta 118  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||    
T  22594837 aacatatatgtattcaccaataatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatta 22594749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29161764 - 29161667
Alignment:
Q  16 tatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  29161764 tatcacaaccaatcaacatatatatattcaccgacaatatctcaatccatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 29161667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 92
Target Start/End: Original strand, 21930797 - 21930859
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatat 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21930797 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatat 21930859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22594816 - 22594750
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatt 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22594816 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatt 22594750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29161824 - 29161761
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29161824 aacatatatgcattcaccgacaatatcccaatcaatcaacatatatgtattcaccaacagtatc 29161761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11374165 - 11374082
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  11374165 aacatatatgcattcaccgacaatatcaccatcaattaacatatacatattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 11374082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29161803 - 29161724
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29161803 aatatcccaatcaatcaacatatatgtattcaccaacagtatcacaaccaatcaacatatatatattcaccgacaatatc 29161724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 16135204 - 16135266
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16135204 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacagtcaatcaacatatatg 16135266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 23220622 - 23220684
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23220622 aatatcataatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 23220684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4172931 - 4172874
Alignment:
Q  34 tatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaata 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  4172931 tatatgcattcaccaacaatatcaccatcatttaacatatatgcattcaccaacaata 4172874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4228540 - 4228483
Alignment:
Q  34 tatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaata 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  4228540 tatatgcattcaccaacaatatcaccatcatttaacatatatgcattcaccaacaata 4228483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 23220566 - 23220647
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  23220566 catatatgcaatcatcaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcataatcaattaacatatatg 23220647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 29161692 - 29161630
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  29161692 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcatcatcaattaacatatatg 29161630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 21930762 - 21930843
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21930762 catatatgcaatcaccaacaaaatcgccatcagttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 21930843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18104767 - 18104732
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaat 65  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18104767 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaat 18104732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31162164 - 31162105
Alignment:
Q  145 caacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31162164 caacaacttcatacagtttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 31162105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4172931 - 4172885
Alignment:
Q  71 tatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcatt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4172931 tatatgcattcaccaacaatatcaccatcatttaacatatatgcatt 4172885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4228540 - 4228494
Alignment:
Q  71 tatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcatt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4228540 tatatgcattcaccaacaatatcaccatcatttaacatatatgcatt 4228494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 25650019 - 25650081
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  25650019 aatatcgcaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 25650081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 21930818 - 21930859
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatat 55  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21930818 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatat 21930859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22463418 - 22463317
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | || |  || |||| ||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22463418 aacatgtattcattaatcaacttcaactatatcctatagttcaaaaccttcgcacaatttctcacaatccaagtaaaggaggaaaatacaacaccttatg 22463319  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  22463318 at 22463317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22594702 - 22594642
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaat--atcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaa 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22594702 acatatatgcactcaccaacaattcaccataatcattcaacatatatatattcaccaacaa 22594642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 26505689 - 26505737
Alignment:
Q  67 aacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgca 115  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  26505689 aacatatgtggattcaccaacaatatcaccattaattaacatatatgca 26505737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 9695 - 9877
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  9695 aatatgacaatcaattaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatatctatattcaccaacaatatcaccatcaattatcatatatg 9794  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttt-tcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  9795 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaattttctcacaattcaagtaaaagagaaaatacaaca 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Original strand, 9674 - 9754
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatat 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||    
T  9674 aacatatatgcactcaccgacaatatgacaatcaattaacatatatgtattgaccaacaatatcacaatcaatcaacatat 9754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5371964 - 5371791
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5371964 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaacatcaa 5371865  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||   || ||| |||||||||||| |||||||    
T  5371864 ctatatcatatag-tcaacaactccatacagtttctcacaattcaggcaaaggagaaaatacaacacattatgat 5371791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12135029 - 12134844
Alignment:
Q  16 tatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgca 115  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12135029 tatcacaatcaattaacatatatgtattcacaaa---tatcataaccaatcaacatatatgtattcaccaataatatcttcatcaattaacatagatgca 12134933  T
Q  116 ttattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| |||  || |||||||||||| |||||||    
T  12134932 ttattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaagagaaaatacaacactttatgat 12134844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 19558232 - 19558406
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  19558232 aacatatctgcattcatcgacaatataacaatccattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacagatatgtattaatcaacatcaa 19558331  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  19558332 ctatatcatatggttcaacaactcgatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 19558406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54364838 - 54364664
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||| |||   ||||||| |    
T  54364838 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaataaatcaacatatatgtattcaccaacatcga 54364739  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  54364738 ctttatcatataattcaacaacatcatactatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 54364664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17376823 - 17376660
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  17376823 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaatca---tatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaaccaacatcaa 17376727  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacac 196  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||  |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  17376726 ctaaatcatataatttaacaaccccatataatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacac 17376660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Original strand, 14570156 - 14570297
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||   ||| |||||    
T  14570156 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaaccatatcactatcaatcaacatatatgtattcaccaatatcaa 14570255  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaat 171  Q
    ||  |||||| | |||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  14570256 cttcatcataaaattcaacaacatcatactatttctcacaat 14570297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 54364817 - 54364743
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaca 88  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54364817 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaataaatcaacatatatgtattcaccaaca 54364743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 14570177 - 14570249
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14570177 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaaccatatcactatcaatcaacatatatgtattcaccaa 14570249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5371943 - 5371881
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5371943 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 5371881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Original strand, 12733052 - 12733136
Alignment:
Q  120 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12733052 tcaacttcaactatatcctatagttcaacaacttcgcaccatttctcacaatacaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 12733136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12135052 - 12134999
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcac 83  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12135052 aacatatatgcattcaccgacattatcacaatcaattaacatatatgtattcac 12134999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 49070703 - 49070808
Alignment:
Q  96 catcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
    |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||||||    
T  49070703 catcaattgatatacatacattaatcaacatcaactatataatatagctcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagagaatacaaca 49070802  T
Q  196 ccttat 201  Q
    ||||||    
T  49070803 ccttat 49070808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19082410 - 19082289
Alignment:
Q  69 catatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcac 168  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||| | |||| | ||    
T  19082410 catatatacattcaccaacaatatcaccatcaattaatatatatacattcaccaacatcgactacatcatataattcaataacttcatgcaatttcttac 19082311  T
Q  169 aattcaattaatggaaaaaata 190  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19082310 aattcaagtaaaggagaaaata 19082289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 38763665 - 38763766
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||| |||  |||||||||||||| |||    
T  38763665 aacatgtattcattaatccacttcaactatatcatatagttcaacaacttcatacaacttttcataatacaagtaaaggaggaaaatacaacacctaatg 38763764  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  38763765 at 38763766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5371998 - 5371918
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5371998 catatatgaaatcaccaacac-atcaccatcacttaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaattaacatatatg 5371918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13595455 - 13595395
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaat--atcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaa 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13595455 acatatatgcactcaccaacaattcaccacaatcattcaacatatatatattcaccaacaa 13595395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 14570122 - 14570202
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  14570122 catatatgcactcaccgacaa-atcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 14570202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19082410 - 19082354
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaca 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||    
T  19082410 catatatacattcaccaacaatatcaccatcaattaatatatatacattcaccaaca 19082354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17213122 - 17213063
Alignment:
Q  145 caacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17213122 caacaacttcatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 17213063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16226449 - 16226366
Alignment:
Q  120 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||  || |||||||||||| |||||||    
T  16226449 tcaacatcaatcatatcatataatccaacaactccatacaattcctcacaatccaagtaa-cgagaaaatacaacacattatgat 16226366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 24237765 - 24237873
Alignment:
Q  96 catcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaaca 195  Q
    |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || | | ||| ||| ||| ||| ||||||||| |    
T  24237765 catcaattgatatacatacattaatcaacatcaactatatattatatctcaacaactccatacacgttcttataatccaagtaaaggagaaaatacaaaa 24237864  T
Q  196 ccttatgat 204  Q
    |||||||||    
T  24237865 ccttatgat 24237873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Original strand, 33396200 - 33396371
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33396200 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcattcaacatatatgtattcaccgacaatatcctaatcaattaacatatatgcaacattcaacatcaa 33396299  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaatt-caattaatggaaaaaatacaacacctta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||    
T  33396300 ctatatcatatagttcaacaacatcatattatttctcacaattccaagtaaatgagaaaatacaacacctta 33396371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 77309 - 77184
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  77309 aacatatatgcattcacccacaatatcacaatcaattaacatatgtgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgcattaatcaccatcaa 77210  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactcca 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  77209 ctatatcatatagtttaacaactcca 77184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 20821876 - 20822062
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||| |||||||||     
T  20821876 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacattatcataatcaatcaacatatatgtactcaccaaccatatcacaatcaatcaacatatatt 20821975  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||     | ||||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||  ||| |||||||    
T  20821976 ca----cctacatcaactttatcatataattcaacaacatcacactatttctcacaatccaaataaaggagaaaatacttcacattatgat 20822062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 20821855 - 20821938
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  20821855 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacattatcataatcaatcaacatatatg 20821938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 77288 - 77226
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77288 aatatcacaatcaattaacatatgtgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 77226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 20821820 - 20821901
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  20821820 catatatgcaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 20821901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 46144659 - 46144760
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||| |||  || |||||||||||||||    
T  46144659 aacatgtattcattaatccacttcaactatatcatatagttcaacaactccatacaacttctcataatacaagtaaaggaggaacatacaacaccttatg 46144758  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  46144759 at 46144760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 175
Target Start/End: Original strand, 21224122 - 21224229
Alignment:
Q  69 catatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaactatatca-tatagttcaacaactccataccatttttca 167  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| | |||||| | || |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  21224122 catatatgcactcaccaacaatatcaccatcaattagcttatatgtaataatcaacaacaactacatcattacatctcaacaactccatacaatttctca 21224221  T
Q  168 caattcaa 175  Q
    ||||||||    
T  21224222 caattcaa 21224229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40437579 - 40437479
Alignment:
Q  104 aacatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatga 203  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||| ||| ||| |||  |||||||| |||||||||    
T  40437579 aacatgtattcattaatcaacttcaattatatcctatagttcaacaacttcgcacaatttctcacaatccaagtaaaggaggaaatacaataccttatga 40437480  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  40437479 t 40437479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49998602 - 49998526
Alignment:
Q  127 caactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatgga-aaaaatacaacaccttatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  49998602 caactatatcatatagttcaacaactacatacaacttctcataatacaagtaaaggaggaaaatacaacaccttatg 49998526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14248 - 14075
Alignment:
Q  15 atatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgc 114  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||     
T  14248 atatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatcacaatcgatcaacatatatgtattcaccaaccatatcacaatcaatcaacatatatgt 14149  T
Q  115 attattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaa 188  Q
    |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  14148 attcaccaacatcaactatatcatataattcaacaacatcacactatttctcacaatccaaataaaggagaaaa 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14212 - 14138
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaca 88  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14212 aatatcacaatcgatcaacatatatgtattcaccaaccatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaca 14138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14270 - 14207
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14270 aacatatatgcatgcaccgaatatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaacaatatc 14207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21369 - 21208
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||    
T  21369 aatatcgcaatcaatcaacatatatgtactcatcaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatttactaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 21270  T
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaa 175  Q
     |||  |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  21269 tattcatcaacatcgactttatcatataattccacaacatcatactatttctcacaattcaa 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21405 - 21307
Alignment:
Q  15 atatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  21405 atattacaatcaatcaacatatatgtactcaccaacaatatcgcaatcaatcaacatatatgtactcatcaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 21307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Original strand, 11488 - 11656
Alignment:
Q  37 atgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaaca-tcaactatat 135  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11488 atgcaatcaccaacaaaatcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcaccatcagtcaacatatatgcattaatcaacattcaactatat 11587  T
Q  136 catatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
     |||||  ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  11588 aatataactcaacaacttcatacactttctcacaatccaagtaaaggagaaaataaaacaccttatgat 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Original strand, 11518 - 11564
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11518 aacatatatgcattcaccgacaatatcaccatcagtcaacatatatg 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 255720 - 255643
Alignment:
Q  16 tatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  255720 tatcacaaccaattaagatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaaaatatc 255643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 255648 - 255551
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatata 111  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  255648 aatatcacaatcaatccacatatatttatttactaacaatatcacaatcaatccacatatatgtattcaccaacaatatcaaaatcaatcaacatata 255551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 255685 - 255606
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  255685 aatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaaaaatatcacaatcaatccacatatatttatttactaacaatatc 255606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 98412 - 98348
Alignment:
Q  31 acatatatgcattcaccaacaat--atcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatc 93  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  98412 acatatatgaactcaccaacaattcaccacaatcattcaacatatatatattcaccaacaatatc 98348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 255720 - 255660
Alignment:
Q  53 tatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  255720 tatcacaaccaattaagatatatgtattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatg 255660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 98374 - 98324
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtatt 80  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  98374 aacatatatatattcaccaacaatatcataattaatcaatatatatgtatt 98324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 247220 - 247079
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatgcattattcaacatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||   ||| |||||    
T  247220 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaaccatatcactatcaatcaacatatatgtattcaccaatatcaa 247121  T
Q  130 ctatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaat 171  Q
    ||  |||||| | |||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  247120 cttcatcataaaattcaacaacatcatactatttctcacaat 247079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 247199 - 247127
Alignment:
Q  14 aatatcacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaa 86  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  247199 aatatcacaatcaattaacatatatgtattcaccaaccatatcactatcaatcaacatatatgtattcaccaa 247127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 247254 - 247174
Alignment:
Q  32 catatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatatg 113  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  247254 catatatgcactcaccgacaa-atcaccatcacttaacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattaacatatatg 247174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12284 - 12214
Alignment:
Q  105 acatatatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  12284 acatatatgcattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaattccatacaatttctcacaattcaa 12214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 4839 - 4929
Alignment:
Q  114 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4839 cattaatcaatatcaactatataatatagctcaacaacttcatacactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 4929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8429
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcaccaacaatatcctcatcaattaacatatat 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||   |||||| |||||||||    
T  8511 aacatatatgcattcaccgacaatgccacaatcaattaacatatatgtatccatcaacaatatcacaatcaataaacatatat 8429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 8485 - 8429
Alignment:
Q  19 cacaaccaataaacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatat 75  Q
    ||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8485 cacaatcaattaacatatatgtatccatcaacaatatcacaatcaataaacatatat 8429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8412 - 8322
Alignment:
Q  114 cattattcaacat-caactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||  ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8412 cattaatcaacattcaactatataatatagct-aacaacttcatacactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 8322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 75912 - 75965
Alignment:
Q  30 aacatatatgcattcaccaacaatatcacaatcaatcaacatatatgtattcac 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  75912 aacatatatgcattcaccgacaatatcacaatcaattagcacatatgtattcac 75965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2280 - 2197
Alignment:
Q  121 caacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2280 caacatcgactttatcatataattcaacaacatcatattatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat 2197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44900 - 44793
Alignment:
Q  96 catcaattaacatatatgcattattcaacatcaact--atatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaa 193  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| | ||| ||  ||| |||||||||    
T  44900 catcaattgatatatatacattaatcaacatcaactatatataatatagctcaacaactctatacactttctcacattccaagtagaggagaaaatacaa 44801  T
Q  194 caccttat 201  Q
    ||||||||    
T  44800 caccttat 44793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34720 - 34645
Alignment:
Q  128 aactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34720 aactatataatatagctcaacaactccatacactttctcacattccaagtaa-ggagaaaatacaacaccttatgat 34645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 204
Target Start/End: Original strand, 755 - 850
Alignment:
Q  109 atatgcattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccataccatttttcacaattcaattaatggaaaaaatacaacaccttatgat 204  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||    ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  755 atatgcattaatcaacataaactatatcctatcgttcaacaacatcatgtactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacacattatgat 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University