View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7787_high_5 (Length: 203)

Name: NF7787_high_5
Description: NF7787
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7787_high_5
NF7787_high_5
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (4-202)||(15284673-15284871)
chr4 (1-202)||(15228195-15228396)
chr4 (1-201)||(1900582-1900782)
chr4 (1-194)||(24460358-24460551)
chr4 (3-195)||(15391090-15391282)
chr4 (2-202)||(14235270-14235470)
chr4 (4-202)||(24592059-24592257)
chr4 (4-202)||(14665346-14665544)
chr4 (4-202)||(17014328-17014526)
chr4 (4-201)||(18800359-18800556)
chr4 (4-201)||(36344261-36344458)
chr4 (4-201)||(14763050-14763247)
chr4 (4-201)||(6570181-6570378)
chr4 (4-201)||(33673544-33673741)
chr4 (4-201)||(39850966-39851163)
chr4 (4-201)||(21970029-21970226)
chr4 (4-201)||(30754082-30754279)
chr4 (4-201)||(5006201-5006398)
chr4 (8-201)||(40105384-40105577)
chr4 (4-201)||(54833715-54833912)
chr4 (36-201)||(24113022-24113187)
chr4 (8-201)||(31126264-31126457)
chr4 (8-201)||(14098873-14099066)
chr4 (4-201)||(27163063-27163260)
chr4 (36-201)||(34188706-34188871)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-202)||(16626292-16626493)
chr3 (1-202)||(18530659-18530860)
chr3 (4-194)||(5652661-5652851)
chr3 (1-195)||(31033910-31034104)
chr3 (1-195)||(32293023-32293217)
chr3 (1-194)||(5713498-5713691)
chr3 (1-194)||(5724408-5724601)
chr3 (1-194)||(5767767-5767960)
chr3 (1-194)||(4626215-4626408)
chr3 (4-202)||(6192590-6192788)
chr3 (4-202)||(4721905-4722103)
chr3 (4-202)||(18051536-18051734)
chr3 (4-202)||(29148541-29148739)
chr3 (1-194)||(17993578-17993771)
chr3 (4-199)||(15740883-15741078)
chr3 (4-202)||(4796439-4796637)
chr3 (4-202)||(8296246-8296444)
chr3 (4-202)||(8301053-8301251)
chr3 (4-201)||(7073486-7073683)
chr3 (4-202)||(15892492-15892690)
chr3 (4-198)||(18330943-18331137)
chr3 (4-201)||(10396407-10396604)
chr3 (4-198)||(35881040-35881234)
chr3 (4-201)||(8212012-8212209)
chr3 (4-201)||(20576634-20576831)
chr3 (4-201)||(51782297-51782494)
chr3 (1-164)||(5756907-5757069)
chr3 (4-201)||(11110136-11110333)
chr3 (4-201)||(18276839-18277036)
chr3 (4-201)||(18307441-18307638)
chr3 (4-201)||(28021549-28021746)
chr3 (4-201)||(48466201-48466398)
chr3 (4-201)||(18292140-18292337)
chr3 (4-201)||(21674967-21675164)
chr3 (4-201)||(29664757-29664954)
chr3 (5-201)||(28115741-28115937)
chr3 (4-198)||(22387368-22387562)
chr3 (4-201)||(4417193-4417390)
chr3 (4-201)||(5609109-5609306)
chr3 (4-201)||(18243013-18243210)
chr3 (8-201)||(24328437-24328630)
chr3 (6-201)||(6542249-6542444)
chr3 (8-201)||(28339580-28339773)
chr3 (4-201)||(36996864-36997061)
chr3 (8-201)||(5013990-5014183)
chr3 (4-201)||(5467259-5467456)
chr3 (4-201)||(5596144-5596341)
chr3 (8-201)||(47023731-47023924)
chr3 (4-201)||(31964260-31964457)
chr3 (36-201)||(32439460-32439625)
chr3 (4-201)||(4346474-4346671)
chr3 (8-201)||(18225469-18225662)
chr3 (4-201)||(22870643-22870840)
chr3 (4-201)||(22885702-22885899)
chr3 (38-201)||(7996870-7997033)
chr3 (38-201)||(10643378-10643541)
chr3 (36-201)||(20066349-20066514)
chr3 (8-172)||(17984772-17984936)
chr3 (4-78)||(51797387-51797461)
chr3 (4-69)||(50133990-50134055)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (4-202)||(19456155-19456353)
chr2 (1-202)||(21702898-21703099)
chr2 (1-194)||(27118994-27119187)
chr2 (1-195)||(22925769-22925963)
chr2 (1-194)||(3784960-3785153)
chr2 (1-194)||(31891070-31891263)
chr2 (1-194)||(34157316-34157509)
chr2 (1-194)||(34303045-34303238)
chr2 (1-195)||(16163905-16164102)
chr2 (4-202)||(20838227-20838425)
chr2 (4-202)||(28882523-28882721)
chr2 (4-202)||(12655851-12656049)
chr2 (4-202)||(27434178-27434376)
chr2 (4-202)||(23128300-23128498)
chr2 (4-201)||(27777531-27777728)
chr2 (4-201)||(27817289-27817486)
chr2 (36-201)||(34286695-34286860)
chr2 (36-201)||(34291755-34291920)
chr2 (4-201)||(12587119-12587316)
chr2 (4-201)||(13936279-13936476)
chr2 (4-201)||(27804016-27804213)
chr2 (7-201)||(37375473-37375667)
chr2 (4-201)||(39890383-39890580)
chr2 (1-201)||(9349717-9349917)
chr2 (4-201)||(32050107-32050304)
chr2 (4-201)||(39051557-39051754)
chr2 (4-201)||(12716337-12716534)
chr2 (8-201)||(19416234-19416427)
chr2 (5-201)||(11634921-11635117)
chr2 (5-201)||(11641110-11641306)
chr2 (8-201)||(16829073-16829266)
chr2 (8-201)||(16892215-16892408)
chr2 (4-201)||(21676917-21677114)
chr2 (8-201)||(37685644-37685837)
chr2 (8-201)||(37700909-37701102)
chr2 (8-201)||(37925806-37925999)
chr2 (5-201)||(260488-260684)
chr2 (8-201)||(34861993-34862186)
chr2 (4-201)||(40233820-40234017)
chr2 (8-202)||(31876594-31876788)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-202)||(16449629-16449830)
chr7 (5-202)||(16041638-16041835)
chr7 (1-195)||(26485005-26485199)
chr7 (1-195)||(26682638-26682832)
chr7 (1-195)||(39210661-39210855)
chr7 (1-194)||(4200858-4201051)
chr7 (1-195)||(2775670-2775864)
chr7 (1-194)||(2108644-2108837)
chr7 (1-194)||(31088103-31088296)
chr7 (1-194)||(45733771-45733964)
chr7 (4-202)||(10916499-10916697)
chr7 (4-202)||(2154887-2155085)
chr7 (4-202)||(16503011-16503209)
chr7 (4-202)||(16518047-16518245)
chr7 (4-198)||(5128306-5128500)
chr7 (4-198)||(11424412-11424605)
chr7 (4-201)||(26435571-26435768)
chr7 (4-201)||(26537502-26537699)
chr7 (4-201)||(31125234-31125431)
chr7 (5-201)||(5146972-5147168)
chr7 (4-201)||(16736092-16736289)
chr7 (4-201)||(16751146-16751343)
chr7 (4-201)||(17523846-17524043)
chr7 (4-201)||(17529172-17529369)
chr7 (4-201)||(24592173-24592370)
chr7 (4-201)||(31564022-31564219)
chr7 (39-201)||(26513130-26513292)
chr7 (4-201)||(3445620-3445817)
chr7 (8-201)||(26319501-26319694)
chr7 (8-201)||(4144755-4144948)
chr7 (8-201)||(9618969-9619162)
chr7 (8-201)||(26274726-26274919)
chr7 (8-201)||(26669546-26669739)
chr7 (4-139)||(11441886-11442021)
chr7 (36-199)||(18541145-18541308)
chr7 (36-201)||(5159865-5160030)
chr7 (38-201)||(45387691-45387854)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-202)||(22888789-22888990)
chr5 (1-202)||(25199348-25199549)
chr5 (2-194)||(29888732-29888924)
chr5 (1-195)||(33877566-33877760)
chr5 (1-194)||(11326113-11326306)
chr5 (1-194)||(13184299-13184491)
chr5 (1-194)||(13440144-13440337)
chr5 (4-194)||(9548193-9548383)
chr5 (1-201)||(23892525-23892725)
chr5 (4-202)||(24687799-24687997)
chr5 (4-202)||(22998756-22998954)
chr5 (4-202)||(23717630-23717828)
chr5 (4-199)||(33777809-33778004)
chr5 (4-202)||(30934955-30935153)
chr5 (4-199)||(23752095-23752290)
chr5 (4-202)||(24970340-24970538)
chr5 (5-191)||(11549677-11549863)
chr5 (4-202)||(15658402-15658600)
chr5 (4-201)||(18500373-18500570)
chr5 (4-201)||(6874627-6874824)
chr5 (4-201)||(43078574-43078771)
chr5 (4-201)||(28649557-28649754)
chr5 (4-201)||(3789863-3790060)
chr5 (4-201)||(13324472-13324669)
chr5 (36-201)||(41675063-41675228)
chr5 (4-202)||(18375054-18375252)
chr5 (4-201)||(2511373-2511570)
chr5 (8-201)||(5638236-5638429)
chr5 (8-201)||(12132481-12132674)
chr5 (4-201)||(24681762-24681959)
chr5 (4-201)||(24724289-24724486)
chr5 (8-201)||(30029741-30029934)
chr5 (4-201)||(31826050-31826247)
chr5 (4-201)||(37358286-37358483)
chr5 (8-201)||(9317777-9317970)
chr5 (4-201)||(30152340-30152537)
chr5 (4-201)||(31431762-31431959)
chr5 (8-201)||(33516682-33516875)
chr5 (4-201)||(37755302-37755499)
chr5 (4-201)||(37770630-37770827)
chr5 (4-201)||(40473192-40473389)
chr5 (4-201)||(15758500-15758697)
chr5 (4-201)||(34616840-34617037)
chr5 (4-201)||(8665118-8665315)
chr5 (36-201)||(28959429-28959594)
chr5 (36-201)||(32599115-32599280)
chr5 (36-201)||(33292879-33293044)
chr5 (44-201)||(37671126-37671283)
chr5 (38-201)||(30168825-30168988)
chr5 (8-201)||(26480718-26480910)
chr5 (8-104)||(29966806-29966902)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-202)||(20461390-20461591)
chr1 (1-202)||(16207776-16207977)
chr1 (1-202)||(20340080-20340281)
chr1 (1-195)||(28152171-28152365)
chr1 (4-201)||(41793054-41793251)
chr1 (4-202)||(51638530-51638728)
chr1 (8-201)||(28585297-28585490)
chr1 (8-201)||(10962986-10963179)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-194)||(19658752-19658945)
chr8 (1-195)||(18710896-18711090)
chr8 (1-195)||(44563409-44563603)
chr8 (1-194)||(33244975-33245168)
chr8 (3-195)||(22080589-22080781)
chr8 (4-202)||(16277867-16278065)
chr8 (4-202)||(16283762-16283960)
chr8 (4-202)||(14557937-14558135)
chr8 (5-202)||(19688412-19688609)
chr8 (4-202)||(2136963-2137161)
chr8 (4-202)||(27608609-27608807)
chr8 (4-201)||(3329212-3329409)
chr8 (4-201)||(19674754-19674951)
chr8 (4-201)||(12092429-12092626)
chr8 (4-201)||(19286775-19286972)
chr8 (4-201)||(29829635-29829832)
chr8 (91-202)||(18791107-18791218)
chr8 (8-201)||(19208065-19208258)
chr8 (8-201)||(28361660-28361853)
chr8 (8-201)||(33259040-33259233)
chr8 (4-118)||(189407-189521)
chr8 (4-201)||(31354837-31355034)
chr8 (8-201)||(31489455-31489648)
chr8 (4-201)||(9354936-9355133)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-202)||(2403-2604)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-195)||(14142980-14143174)
chr6 (1-195)||(26788251-26788445)
chr6 (1-195)||(27196624-27196818)
chr6 (1-195)||(27252422-27252616)
chr6 (1-195)||(13521768-13521962)
chr6 (1-194)||(8892007-8892200)
chr6 (1-194)||(8903242-8903435)
chr6 (1-194)||(28162964-28163157)
chr6 (1-194)||(33373952-33374145)
chr6 (1-195)||(22456638-22456823)
chr6 (4-202)||(13298639-13298837)
chr6 (36-201)||(17092129-17092294)
chr6 (4-198)||(26918690-26918884)
chr6 (1-202)||(27290058-27290259)
chr6 (4-202)||(15424005-15424203)
chr6 (4-202)||(22934568-22934766)
chr6 (4-202)||(23857013-23857211)
chr6 (4-202)||(27272268-27272466)
chr6 (4-202)||(26989311-26989510)
chr6 (4-202)||(24304306-24304504)
chr6 (4-202)||(24864027-24864225)
chr6 (4-201)||(29549785-29549982)
chr6 (4-201)||(16750164-16750361)
chr6 (4-201)||(34463035-34463232)
chr6 (4-201)||(27485439-27485636)
chr6 (19-201)||(27019461-27019643)
chr6 (8-201)||(3696395-3696588)
chr6 (4-201)||(4545464-4545661)
chr6 (4-201)||(4723823-4724020)
chr6 (4-201)||(16674449-16674646)
chr6 (4-201)||(26116099-26116296)
chr6 (4-201)||(4758074-4758271)
chr6 (4-201)||(4773316-4773513)
chr6 (8-201)||(16943716-16943909)
chr6 (4-201)||(27044698-27044895)
chr6 (4-201)||(28207764-28207961)
chr6 (8-201)||(29573327-29573520)
chr6 (8-201)||(30557705-30557898)
chr6 (4-202)||(27359680-27359878)
chr6 (4-202)||(27450023-27450221)
chr6 (4-201)||(4525596-4525793)
chr6 (4-201)||(29501725-29501922)
chr6 (6-201)||(27008039-27008234)
chr6 (4-175)||(20161011-20161182)
chr6 (4-175)||(22171649-22171820)
chr6 (63-201)||(26777299-26777437)
chr6 (4-69)||(17025587-17025652)
chr6 (2-201)||(27629389-27629588)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (36-194)||(21906-22064)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (2-201)||(364-563)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (4-202)||(46730-46928)
scaffold0089 (4-202)||(39814-40012)
scaffold0089 (4-202)||(30076-30274)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (4-202)||(30765-30964)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (4-201)||(6327-6524)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (4-202)||(27605-27804)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (4-201)||(9879-10076)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (4-202)||(14675-14873)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (4-201)||(8812-9009)
scaffold0159 (4-201)||(20328-20526)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (8-201)||(25947-26140)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (8-201)||(6985-7178)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-201)||(8262-8459)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (139-194)||(119651-119706)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (4-69)||(7-72)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (17-140)||(46604-46729)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15284871 - 15284673
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284871 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 15284772  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15284771 agttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15228195 - 15228396
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228195 atatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 15228294  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15228295 gccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgtcagcgatg 15228394  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  15228395 tc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1900582 - 1900782
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1900582 atatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccat 1900681  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1900682 gccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctacgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 1900781  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  1900782 t 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24460551 - 24460358
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24460551 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 24460452  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24460451 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 24460358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15391282 - 15391090
Alignment:
Q  3 atgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgc 102  Q
    |||| |||| |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15391282 atgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgc 15391183  T
Q  103 cacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    || ||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15391182 caattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtcag 15391090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14235470 - 14235270
Alignment:
Q  2 tatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14235470 tatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttccttgtttgaccatgaccatg 14235371  T
Q  102 ccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    ||  ||| |  |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  14235370 ccgtttgtccggaatgcctccataatcctttaggctgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatggacaacaaatatctgattgttagtgatgt 14235271  T
Q  202 c 202  Q
    |    
T  14235270 c 14235270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24592257 - 24592059
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  24592257 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 24592158  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  24592157 aagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 14665346 - 14665544
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  14665346 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 14665445  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  14665446 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 17014328 - 17014526
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  17014328 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 17014427  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  17014428 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18800556 - 18800359
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18800556 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18800457  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  18800456 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36344458 - 36344261
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  36344458 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 36344359  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | |||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  36344358 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14763247 - 14763050
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  14763247 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 14763148  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  14763147 aagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 6570181 - 6570378
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||| |||||    
T  6570181 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgattatgcc 6570280  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  6570281 aagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33673741 - 33673544
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  33673741 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 33673642  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  33673641 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 39850966 - 39851163
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  39850966 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 39851065  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||| | | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  39851066 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 21970029 - 21970226
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  21970029 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgcc 21970128  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||  ||||| ||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  21970129 aagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 30754082 - 30754279
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  30754082 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 30754181  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  30754182 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 5006201 - 5006398
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  5006201 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgcc 5006300  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||| ||||| ||||||||| ||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  5006301 aagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40105577 - 40105384
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  40105577 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 40105478  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  40105477 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 54833715 - 54833912
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  54833715 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 54833814  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | |||||||| ||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||| ||||||    
T  54833815 aaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 24113022 - 24113187
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  24113022 ttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctaagtgccaagaatgttcccgcaatcctttggg 24113121  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  24113122 ctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacggcaattaccttactgtcagtgatgt 24113187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31126457 - 31126264
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  31126457 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 31126358  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  31126357 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 14098873 - 14099066
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  14098873 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 14098972  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||   | ||||||||||||||||    
T  14098973 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataaccttctgactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27163260 - 27163063
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||||    
T  27163260 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgcc 27163161  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  27163160 aagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34188871 - 34188706
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||| |||||||||||    |||| |||||| | ||| || ||||||||    
T  34188871 ttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttgttgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcccgcaaccctttggg 34188772  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  34188771 ctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacggcaattaccttactgtcagtgatgt 34188706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16626493 - 16626292
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626493 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 16626394  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16626393 gccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcagcgatg 16626294  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  16626293 tc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18530659 - 18530860
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18530659 atatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcat 18530758  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18530759 gccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 18530858  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  18530859 tc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 5652661 - 5652851
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5652661 tgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 5652760  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5652761 agttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 5652851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31034104 - 31033910
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31034104 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 31034005  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31034004 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 31033910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 32293023 - 32293217
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32293023 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 32293122  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32293123 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 32293217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 5713498 - 5713691
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5713498 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 5713597  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5713598 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 5713691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 5724408 - 5724601
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5724408 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 5724507  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5724508 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 5724601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5767960 - 5767767
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5767960 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 5767861  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5767860 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 5767767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 4626215 - 4626408
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4626215 atatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctgtttgaccatgatcat 4626314  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4626315 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 4626408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 6192590 - 6192788
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  6192590 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 6192689  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  6192690 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 4721905 - 4722103
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4721905 tgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4722004  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  4722005 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 18051536 - 18051734
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||| |    
T  18051536 tgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgtc 18051635  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    | |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  18051636 aattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29148739 - 29148541
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  29148739 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 29148640  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29148639 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattctttgactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17993771 - 17993578
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||    
T  17993771 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcat 17993672  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    ||||  || |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17993671 gccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 17993578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15741078 - 15740883
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  15741078 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 15740979  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgat 199  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||    
T  15740978 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatggatgataattttttgactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4796637 - 4796439
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4796637 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4796538  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  4796537 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 8296246 - 8296444
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  8296246 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 8296345  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8296346 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgatgattttttgactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8301251 - 8301053
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  8301251 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 8301152  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||    
T  8301151 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 7073486 - 7073683
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  7073486 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 7073585  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  7073586 aagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15892690 - 15892492
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  15892690 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 15892591  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  15892590 aagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 18330943 - 18331137
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18330943 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18331042  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtga 198  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  18331043 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgaaaattttttgactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 10396407 - 10396604
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  10396407 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgcc 10396506  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  10396507 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 35881040 - 35881234
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  35881040 tgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 35881139  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtga 198  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| |||||    
T  35881140 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgaaatttttttgactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 8212012 - 8212209
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  8212012 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 8212111  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  8212112 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20576831 - 20576634
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  20576831 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 20576732  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  20576731 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 51782297 - 51782494
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  51782297 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgcc 51782396  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  51782397 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5757069 - 5756907
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5757069 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttga-catgatcat 5756971  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccaga 164  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||||||     ||||||  || ||| |||||||||||||    
T  5756970 gccagtttgccagaatgcttccataatccttgnnngtgctacngtgntcagaatgacatccaga 5756907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11110333 - 11110136
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  11110333 tgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 11110234  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| | ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  11110233 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18277036 - 18276839
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18277036 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18276937  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  18276936 aagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18307638 - 18307441
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18307638 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18307539  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  18307538 aagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 28021549 - 28021746
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  28021549 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 28021648  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  28021649 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 48466201 - 48466398
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  48466201 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 48466300  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  48466301 aagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18292337 - 18292140
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18292337 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18292238  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  18292237 aagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 21674967 - 21675164
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  21674967 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 21675066  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  21675067 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29664954 - 29664757
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  29664954 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 29664855  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||| ||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  29664854 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28115937 - 28115741
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  28115937 gaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcca 28115838  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
      || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  28115837 agtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22387562 - 22387368
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  22387562 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 22387463  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtga 198  Q
    |  || |||| |||| | |||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  22387462 aagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 4417193 - 4417390
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  4417193 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgcc 4417292  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| | ||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  4417293 aagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaaacttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5609306 - 5609109
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  5609306 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgcc 5609207  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  5609206 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 18243013 - 18243210
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18243013 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18243112  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| || |||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  18243113 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 24328437 - 24328630
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  24328437 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 24328536  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  24328537 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6542444 - 6542249
Alignment:
Q  6 aggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccac 105  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||     
T  6542444 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 6542345  T
Q  106 ttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||   |||| |||||||||||    
T  6542344 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatttcctgaccgtcagtgatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 28339580 - 28339773
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  |    
T  28339580 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 28339679  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  28339680 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36997061 - 36996864
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  36997061 tgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 36996962  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  36996961 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 5013990 - 5014183
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  5013990 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 5014089  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  5014090 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 5467259 - 5467456
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  5467259 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 5467358  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||   || ||||| || |||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  5467359 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5596341 - 5596144
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  5596341 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 5596242  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| || || ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  5596241 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 47023731 - 47023924
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||| ||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  47023731 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 47023830  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  47023831 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31964457 - 31964260
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| ||||||    
T  31964457 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgcc 31964358  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||| | || |||  | |||||||||| |||||    
T  31964357 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 32439460 - 32439625
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| || |  |||||||| |||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  32439460 ttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaggctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcccgcaatcctttggg 32439559  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  32439560 ttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacggcaattaccttactgtcagtgatgt 32439625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4346671 - 4346474
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4346671 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4346572  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |  ||||||| ||||||||| |   ||||||  | |||||||| || |||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  4346571 aagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 18225469 - 18225662
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| || ||||| || || ||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  |    
T  18225469 gaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 18225568  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||    |||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  18225569 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttataccgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22870840 - 22870643
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  22870840 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 22870741  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |  ||||||| ||||||||| |   ||||||  | |||||||| || |||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  22870740 aagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22885899 - 22885702
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  22885899 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 22885800  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |  ||||||| ||||||||| |   ||||||  | |||||||| || |||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  22885799 aagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Original strand, 7996870 - 7997033
Alignment:
Q  38 gcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggtt 137  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||    |||||||||||||  || || | |||  ||||| ||||||||||||    
T  7996870 gcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggtt 7996969  T
Q  138 gctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | ||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  7996970 gttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Original strand, 10643378 - 10643541
Alignment:
Q  38 gcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggtt 137  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||    |||||||||||||  || || | |||  ||||| ||||||||||||    
T  10643378 gcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggtt 10643477  T
Q  138 gctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | ||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  10643478 gttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 20066349 - 20066514
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||     |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  20066349 ttgcaactcctctggtaccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgttgaatgccaagaatgttcccgcaatcctttggg 20066448  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||  |||| |  | ||||||||||||||    
T  20066449 ttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacagcaatcaccttactgtcagtgatgt 20066514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17984936 - 17984772
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || || || |||||||| ||  |||| ||| ||||    |||||||||||||  |    
T  17984936 gaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagt 17984837  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 172  Q
    | |||| |||| | ||||||||| |||||||| |  |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17984836 gtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccatattgttcaagacgacatccaaagcttgatg 17984772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 51797387 - 51797461
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagc 78  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  51797387 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagc 51797461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 50134055 - 50133990
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagct 69  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  50134055 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19456353 - 19456155
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456353 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 19456254  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19456253 agttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21703099 - 21702898
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21703099 atatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttaaccacgatcat 21703000  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21702999 accaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttgactgtcagcgatg 21702900  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  21702899 tc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 27118994 - 27119187
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27118994 atatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 27119093  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27119094 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 27119187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22925963 - 22925769
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22925963 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 22925864  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22925863 gccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 22925769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 3784960 - 3785153
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3784960 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 3785059  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3785060 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 3785153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31891263 - 31891070
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31891263 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 31891164  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31891163 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 31891070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 34157316 - 34157509
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34157316 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 34157415  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34157416 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 34157509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34303238 - 34303045
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34303238 atatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgacaatgatcat 34303139  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  34303138 gccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatcaacgacaattatctgactgtca 34303045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16163905 - 16164102
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctt---tgtttgaccatgat 97  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  16163905 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgaccatgat 16164004  T
Q  98 catgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16164005 catgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 16164102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 20838227 - 20838425
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  20838227 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 20838326  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  20838327 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 28882523 - 28882721
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  28882523 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 28882622  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  28882623 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 12655851 - 12656049
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  12655851 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 12655950  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| || | | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  12655951 aagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27434376 - 27434178
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27434376 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27434277  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  27434276 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23128498 - 23128300
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  23128498 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 23128399  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   | ||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  23128398 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 27777531 - 27777728
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27777531 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27777630  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  27777631 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 27817289 - 27817486
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27817289 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27817388  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  27817389 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 34286695 - 34286860
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  34286695 ttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttggg 34286794  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |||| |   ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  34286795 ttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 34291755 - 34291920
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  34291755 ttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttggg 34291854  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |||| |   ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  34291855 ttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 12587119 - 12587316
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  12587119 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 12587218  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  12587219 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13936476 - 13936279
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  13936476 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 13936377  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  13936376 aaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 27804016 - 27804213
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |  || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27804016 tgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27804115  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  27804116 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 37375473 - 37375667
Alignment:
Q  7 ggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccact 106  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||   |||||| |||||||      
T  37375473 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgaacatgccaag 37375572  T
Q  107 tgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    || |||| |||| | |||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  37375573 tgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 39890383 - 39890580
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  39890383 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 39890482  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  39890483 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9349917 - 9349717
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||    
T  9349917 atatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcat 9349818  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    ||||  || |||| |||| ||||| || ||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||||| || |||  | |||||||||||||||    
T  9349817 gccaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatg 9349718  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  9349717 t 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 32050107 - 32050304
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  32050107 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgcc 32050206  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||  ||||| ||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  32050207 aagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39051754 - 39051557
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| || |   |||||||||||||    
T  39051754 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgcc 39051655  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| |  ||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  39051654 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12716534 - 12716337
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||    
T  12716534 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgcc 12716435  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  12716434 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19416427 - 19416234
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  19416427 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 19416328  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  19416327 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11635117 - 11634921
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  11635117 gaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcca 11635018  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
      || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | |||||||| |||||||    
T  11635017 agtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11641306 - 11641110
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  11641306 gaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcca 11641207  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
      || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | |||||||| |||||||    
T  11641206 agtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16829266 - 16829073
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  16829266 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 16829167  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  16829166 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 16892215 - 16892408
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  16892215 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 16892314  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  16892315 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21677114 - 21676917
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  21677114 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 21677015  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||   || ||||| ||||||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  21677014 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37685837 - 37685644
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  37685837 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 37685738  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  37685737 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37701102 - 37700909
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  37701102 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 37701003  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  37701002 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 37925806 - 37925999
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  37925806 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 37925905  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  37925906 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 260684 - 260488
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||| ||| |||||||| || || ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||| ||||||||||    
T  260684 gaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgcca 260585  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
      || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  260584 agtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 34861993 - 34862186
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  34861993 gaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 34862092  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  34862093 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 40233820 - 40234017
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | | |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  40233820 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 40233919  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||  | | ||||||||||||||    
T  40233920 aagtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 31876594 - 31876788
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||  ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  31876594 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 31876693  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    | || | |||  ||||| | |||||||||||| | | ||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||  | |||||||||||||||||    
T  31876694 gtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16449830 - 16449629
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16449830 atatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 16449731  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16449730 gccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 16449631  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  16449630 tc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 16041638 - 16041835
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||| |||    
T  16041638 gaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcatacca 16041737  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16041738 attgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 26485005 - 26485199
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26485005 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 26485104  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26485105 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 26485199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26682832 - 26682638
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26682832 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 26682733  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26682732 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 26682638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39210855 - 39210661
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39210855 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 39210756  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39210755 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 39210661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 4200858 - 4201051
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4200858 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 4200957  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200958 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 4201051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 2775670 - 2775864
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2775670 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 2775769  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2775770 gccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcag 2775864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2108837 - 2108644
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2108837 atatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 2108738  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  2108737 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctaactgtca 2108644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31088296 - 31088103
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31088296 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 31088197  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31088196 gccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 31088103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 45733771 - 45733964
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45733771 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 45733870  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45733871 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 45733964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10916697 - 10916499
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  10916697 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 10916598  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  10916597 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 2154887 - 2155085
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  2154887 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 2154986  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  2154987 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16503209 - 16503011
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||    
T  16503209 tgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgcc 16503110  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  16503109 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16518245 - 16518047
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||    
T  16518245 tgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgcc 16518146  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  16518145 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 5128306 - 5128500
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  5128306 tgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 5128405  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtga 198  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  5128406 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11424605 - 11424412
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  11424605 tgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 11424506  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtga 198  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  11424505 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt-tttgactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 26435571 - 26435768
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  26435571 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 26435670  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
       || |||| |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  26435671 gagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26537699 - 26537502
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  26537699 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 26537600  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||| |||||| ||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  26537599 aagtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 31125234 - 31125431
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  31125234 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 31125333  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| || |||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  31125334 aagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5147168 - 5146972
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  5147168 gaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcca 5147069  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
      || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  5147068 agtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16736289 - 16736092
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  16736289 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 16736190  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  16736189 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16751343 - 16751146
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  16751343 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 16751244  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  16751243 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 17523846 - 17524043
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  17523846 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 17523945  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  17523946 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17529369 - 17529172
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  17529369 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 17529270  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  17529269 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24592370 - 24592173
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  24592370 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 24592271  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  24592270 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31564219 - 31564022
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  31564219 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 31564120  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||| ||||||| | | ||||||| | |||||||| || |||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  31564119 aagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  39 caactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttg 138  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  139 ctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 3445620 - 3445817
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||    
T  3445620 tgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgcc 3445719  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  3445720 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26319694 - 26319501
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  26319694 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 26319595  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  26319594 gactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4144948 - 4144755
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  |    
T  4144948 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 4144849  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| || || ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||| | ||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  4144848 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 9618969 - 9619162
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| |||||||  |    
T  9618969 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagt 9619068  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  9619069 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26274919 - 26274726
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  26274919 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 26274820  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  26274819 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26669739 - 26669546
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  26669739 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 26669640  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||    ||||||||||||||||    
T  26669639 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctcctgactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 11441886 - 11442021
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  11441886 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 11441985  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgc 139  Q
    |  || |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  11441986 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgc 11442021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 199
Target Start/End: Original strand, 18541145 - 18541308
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||| |||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  18541145 ttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgaatgccaagaatgttcccgcaatcctttggg 18541244  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgat 199  Q
     ||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||    
T  18541245 ctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacggcaattaccttactgtcagtgat 18541308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 5159865 - 5160030
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| |  |||||||| |||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  5159865 ttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcccgcaatcctttggg 5159964  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  5159965 ctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacggcaattaccttactgtcagtgatgt 5160030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Original strand, 45387691 - 45387854
Alignment:
Q  38 gcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggtt 137  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||    |||||||||||||  || || | |||  ||||| ||||||||||||    
T  45387691 gcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggtt 45387790  T
Q  138 gctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | ||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  45387791 gttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 22888789 - 22888990
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22888789 atatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtttgaccatgatcat 22888888  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22888889 gctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 22888988  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  22888989 tc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 25199348 - 25199549
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25199348 atatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcat 25199447  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25199448 gccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 25199547  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  25199548 tc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29888924 - 29888732
Alignment:
Q  2 tatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  29888924 tatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccgtgatcatg 29888825  T
Q  102 ccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888824 ccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 29888732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 33877566 - 33877760
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33877566 atatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccat 33877665  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33877666 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 33877760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 11326113 - 11326306
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11326113 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 11326212  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11326213 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 11326306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13184491 - 13184299
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13184491 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 13184392  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13184391 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcagaatgacatccagag-atgatgaacgacaattatctgactgtca 13184299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13440337 - 13440144
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13440337 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctgtttgaccatgatcat 13440238  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13440237 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 13440144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9548383 - 9548193
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9548383 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgattatgcc 9548284  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9548283 agttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 9548193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23892525 - 23892725
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  23892525 atatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccatgatcat 23892624  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    ||||  |||| || |||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  23892625 gccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattatttaactgttagtgatg 23892724  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  23892725 t 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24687997 - 24687799
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  24687997 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 24687898  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  24687897 atgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22998954 - 22998756
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  22998954 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 22998855  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  22998854 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23717828 - 23717630
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  23717828 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 23717729  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  23717728 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Original strand, 33777809 - 33778004
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| | ||   |||||||||||||    
T  33777809 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgcc 33777908  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgat 199  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  33777909 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 30934955 - 30935153
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  30934955 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 30935054  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  30935055 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23752290 - 23752095
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  23752290 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 23752191  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgat 199  Q
    |  ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  23752190 aagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 24970340 - 24970538
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  24970340 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 24970439  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  24970440 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 11549677 - 11549863
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  11549677 gaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcca 11549776  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactg 191  Q
      || |||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  11549777 agtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactg 11549863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15658600 - 15658402
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  15658600 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 15658501  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || |||| |||| | |||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  15658500 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18500570 - 18500373
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  18500570 tgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 18500471  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  18500470 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 6874627 - 6874824
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  6874627 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgcc 6874726  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  6874727 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 43078574 - 43078771
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  43078574 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 43078673  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  43078674 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 28649557 - 28649754
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  28649557 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 28649656  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  28649657 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctataccgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 3789863 - 3790060
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  3789863 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 3789962  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  3789963 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13324669 - 13324472
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  13324669 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 13324570  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  13324569 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 41675063 - 41675228
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  41675063 ttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttggg 41675162  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    ||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||    
T  41675163 ttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18375252 - 18375054
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||||    
T  18375252 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgcc 18375153  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || || | | |||||||||||||||||    
T  18375152 aagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 2511373 - 2511570
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  2511373 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 2511472  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  2511473 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 5638236 - 5638429
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  5638236 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 5638335  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  5638336 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 12132481 - 12132674
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  12132481 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 12132580  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  12132581 gtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 24681762 - 24681959
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||    
T  24681762 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgcc 24681861  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  24681862 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 24724289 - 24724486
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||    
T  24724289 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgcc 24724388  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  24724389 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 30029741 - 30029934
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  30029741 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 30029840  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  30029841 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31826247 - 31826050
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  31826247 tgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 31826148  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||    
T  31826147 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37358483 - 37358286
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  37358483 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 37358384  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| || |||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  37358383 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 9317777 - 9317970
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  9317777 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 9317876  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  9317877 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 30152340 - 30152537
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||||    
T  30152340 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgcc 30152439  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || || | |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  30152440 aagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 31431762 - 31431959
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  31431762 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 31431861  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  31431862 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 33516682 - 33516875
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  33516682 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 33516781  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  33516782 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 37755302 - 37755499
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  37755302 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 37755401  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || ||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| | ||||||||| |  |||  | ||||||||||||||||    
T  37755402 aagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37770827 - 37770630
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||| | |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||    
T  37770827 tgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgcc 37770728  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| | ||||||||| |  |||  | ||||||||||||||||    
T  37770727 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40473389 - 40473192
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||    
T  40473389 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgcc 40473290  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||  ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||| ||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  40473289 aagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15758697 - 15758500
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| ||||||    
T  15758697 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgcc 15758598  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| ||||||| |||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  15758597 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 34616840 - 34617037
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  34616840 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 34616939  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |  ||||||| ||||||||| |   ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  34616940 aagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8665315 - 8665118
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| ||||||    
T  8665315 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgcc 8665216  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||   || ||||| ||||||||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  8665215 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28959594 - 28959429
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| || || ||||||||||    
T  28959594 ttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttggg 28959495  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  28959494 ctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32599280 - 32599115
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| || || ||||||||||    
T  32599280 ttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttggg 32599181  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     |||||   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  32599180 ctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 33292879 - 33293044
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||| |||||||||||    |||| |||||| | ||| || ||||||||    
T  33292879 ttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcccgcaaccctttggg 33292978  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||| | || || ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  33292979 ctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacggcaattaccttactgtcagtgatgt 33293044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37671283 - 37671126
Alignment:
Q  44 cctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacg 143  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| || || |||||||||||||| | |    
T  37671283 cctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatg 37671184  T
Q  144 ttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||||||| | |||||||| || |||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  37671183 ctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Original strand, 30168825 - 30168988
Alignment:
Q  38 gcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggtt 137  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||| |  || || | |||  ||||| ||||||||||||    
T  30168825 gcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggtt 30168924  T
Q  138 gctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | ||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  30168925 gttatgctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 26480718 - 26480910
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  26480718 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactc-tctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 26480816  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | ||   ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  26480817 gtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29966902 - 29966806
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||    
T  29966902 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgcca 29966806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20461390 - 20461591
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20461390 atatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcat 20461489  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20461490 gccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 20461589  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  20461590 tc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16207977 - 16207776
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16207977 atatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 16207878  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16207877 gccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 16207778  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  16207777 tc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20340281 - 20340080
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20340281 atatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 20340182  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20340181 gccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 20340082  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  20340081 tc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 28152171 - 28152365
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28152171 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 28152270  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28152271 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 28152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41793251 - 41793054
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  41793251 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgcc 41793152  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||| ||||    
T  41793151 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 51638530 - 51638728
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  51638530 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 51638629  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || |||| |||| || || ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  51638630 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 28585297 - 28585490
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  28585297 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 28585396  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  28585397 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 10962986 - 10963179
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  10962986 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 10963085  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  ||| |||| |  ||||||| ||||||||| |   ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  10963086 gtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19658945 - 19658752
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19658945 atatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 19658846  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19658845 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 19658752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 18710896 - 18711090
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18710896 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 18710995  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18710996 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 18711090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 44563409 - 44563603
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44563409 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 44563508  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44563509 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 44563603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 33244975 - 33245168
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33244975 atatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 33245074  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33245075 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 33245168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22080781 - 22080589
Alignment:
Q  3 atgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgc 102  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080781 atgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgc 22080682  T
Q  103 cacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    || ||| | |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22080681 caattgtccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatgaacgacaattatctgactatcag 22080589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 16277867 - 16278065
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  16277867 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 16277966  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  16277967 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 16283762 - 16283960
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||    
T  16283762 tgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatacc 16283861  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  16283862 atttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 14557937 - 14558135
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    ||||||||||||    
T  14557937 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgcc 14558036  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  14558037 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 19688412 - 19688609
Alignment:
Q  5 gaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  19688412 gaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcca 19688511  T
Q  105 cttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
      ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||    
T  19688512 agtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgtccaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgaatgtcaatgatgtc 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2137161 - 2136963
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||| ||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  2137161 tgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 2137062  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||    
T  2137061 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27608807 - 27608609
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | ||   |||||||||||||    
T  27608807 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttccctattcagccatgatcatgcc 27608708  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  27608707 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3329409 - 3329212
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  3329409 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 3329310  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || || |   ||||||||||||||||    
T  3329309 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataacttcctgactgtcagtgatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 19674754 - 19674951
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  19674754 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 19674853  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  19674854 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12092626 - 12092429
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||  |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||| |    
T  12092626 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgac 12092527  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| || ||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||    
T  12092526 aagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgaccgtcagtgatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 19286775 - 19286972
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  19286775 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 19286874  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | |||||||| ||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||| ||||||    
T  19286875 aaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 29829635 - 29829832
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  29829635 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 29829734  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  29829735 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Original strand, 18791107 - 18791218
Alignment:
Q  91 ccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgact 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  18791107 ccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgact 18791206  T
Q  191 gtcagtgatgtc 202  Q
    || |||||||||    
T  18791207 gttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19208258 - 19208065
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  19208258 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 19208159  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  19208158 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28361853 - 28361660
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  28361853 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 28361754  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  28361753 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 33259040 - 33259233
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  33259040 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 33259139  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  33259140 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 189407 - 189521
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  189407 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 189506  T
Q  104 acttgcctagaatgc 118  Q
    |  ||||||| ||||    
T  189507 aagtgcctaggatgc 189521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 31354837 - 31355034
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| ||||||    
T  31354837 tgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgcc 31354936  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||| ||||| | || |||    ||||||||||||||||    
T  31354937 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcctgatggatgataatctcctgactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31489648 - 31489455
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  31489648 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 31489549  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| || |  |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  31489548 gtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 9354936 - 9355133
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||| ||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  9354936 tgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 9355035  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| |  ||||||| ||||||||| |   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  9355036 aagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2604 - 2403
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2604 atatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 2505  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    |||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2504 gccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 2405  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  2404 tc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14143174 - 14142980
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14143174 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 14143075  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14143074 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 14142980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 26788251 - 26788445
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26788251 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 26788350  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26788351 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 26788445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27196624 - 27196818
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27196624 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 27196723  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27196724 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 27196818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27252616 - 27252422
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27252616 atatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 27252517  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27252516 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 27252422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13521962 - 13521768
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13521962 atatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccat 13521863  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13521862 gccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 13521768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8892200 - 8892007
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8892200 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 8892101  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8892100 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 8892007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8903435 - 8903242
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8903435 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 8903336  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8903335 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaattatctgactgtca 8903242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 28162964 - 28163157
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28162964 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcat 28163063  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28163064 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacggtgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 28163157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33374145 - 33373952
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33374145 atatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccacgatcat 33374046  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33374045 gccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 33373952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22456823 - 22456638
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||         ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22456823 atatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctg---------cacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgaccatgatcat 22456733  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcag 195  Q
    |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456732 gccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgtcag 22456638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13298837 - 13298639
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  13298837 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 13298738  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13298737 aagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattatttgactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17092294 - 17092129
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  17092294 ttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatagcagttgcccataatacttccgtgatcctttggg 17092195  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17092194 ttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaactatctgactgttagtgatgt 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 26918690 - 26918884
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  26918690 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 26918789  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtga 198  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  26918790 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagataacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27290259 - 27290058
Alignment:
Q  1 atatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||    
T  27290259 atatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcat 27290160  T
Q  101 gccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatg 200  Q
    ||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  27290159 gccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatg 27290060  T
Q  201 tc 202  Q
    ||    
T  27290059 tc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15424203 - 15424005
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  15424203 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 15424104  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
       ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  15424103 gagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22934766 - 22934568
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  22934766 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 22934667  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  22934666 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23857211 - 23857013
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  23857211 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 23857112  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  23857111 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27272466 - 27272268
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27272466 tgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27272367  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||    
T  27272366 aagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatgaatgataagtttttgactgttagtgatgtc 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 26989311 - 26989510
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  26989311 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 26989410  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacga-caattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  26989411 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24304504 - 24304306
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||    
T  24304504 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgcc 24304405  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||    
T  24304404 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 24864027 - 24864225
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  24864027 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgttcagccatgatcatgcc 24864126  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  24864127 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 29549785 - 29549982
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  29549785 tgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 29549884  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||    
T  29549885 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 16750164 - 16750361
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |  || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  16750164 tgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 16750263  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  16750264 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34463232 - 34463035
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  34463232 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 34463133  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  34463132 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 27485439 - 27485636
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27485439 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27485538  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||| ||||||||    
T  27485539 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgttagtgatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  19 acttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgc 118  Q
    |||||| || |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  119 ttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     | |||||| ||||| |||| ||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 3696395 - 3696588
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||| ||||||||||  |    
T  3696395 gaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagt 3696494  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| | ||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||    
T  3696495 gtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4545661 - 4545464
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4545661 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4545562  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  4545561 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4724020 - 4723823
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4724020 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4723921  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||  |||||||||| ||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  4723920 aagtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 16674449 - 16674646
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| | ||   |||||||||||||    
T  16674449 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgcc 16674548  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  16674549 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26116296 - 26116099
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  26116296 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 26116197  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| || | ||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  26116196 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataatcttctgactgtcagtgatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 4758074 - 4758271
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||  || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4758074 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4758173  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  |  |||||||||||||||    
T  4758174 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttcggactgtcagtgatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 4773316 - 4773513
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||  |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  4773316 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgcc 4773415  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  4773416 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16943909 - 16943716
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  16943909 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 16943810  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| |||||||||||||| | | ||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  16943809 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 27044698 - 27044895
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  27044698 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 27044797  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | |||||||| ||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  27044798 aagtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 28207764 - 28207961
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||| |    
T  28207764 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgac 28207863  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| || ||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  28207864 aagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 29573327 - 29573520
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  29573327 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 29573426  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  29573427 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30557898 - 30557705
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  30557898 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 30557799  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  30557798 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27359878 - 27359680
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |  ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  27359878 tgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgcc 27359779  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||| | || |||  | |||||||||||||||||    
T  27359778 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27450221 - 27450023
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |  ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  27450221 tgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgcc 27450122  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||| | || |||  | |||||||||||||||||    
T  27450121 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 4525596 - 4525793
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  4525596 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 4525695  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| ||| ||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  4525696 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 29501725 - 29501922
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  29501725 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 29501824  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  29501825 aagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 27008039 - 27008234
Alignment:
Q  6 aggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccac 105  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||     
T  27008039 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27008138  T
Q  106 ttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  27008139 gtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 20161011 - 20161182
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||| | |||| || |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||| |||| |    
T  20161011 tgaggaagctcctagacttgacgttcgcaacatcgtgactcatttggtaccgctacatgtcaagctctaccaagcctcgttgtttagccatgaccatgtc 20161110  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaac 175  Q
    | |||||  |||||| ||| ||||||| | ||||| | | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20161111 agttgcccggaatgcctccttaatcctctaggttgttgcattgtgcagaatgatatccagagcctgatgaac 20161182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22171820 - 22171649
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||| | |||| || |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||| |||| |    
T  22171820 tgaggaagctcctagacttgacgttcgcaacatcgtgactcatttggtaccgctacatgtcaagctctaccaagcctcgttgtttagccatgaccatgtc 22171721  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaac 175  Q
    | |||||  |||||| ||| ||||||| | ||||| | | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22171720 agttgcccggaatgcctccttaatcctctaggttgttgcattgtgcagaatgatatccagagcctgatgaac 22171649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26777437 - 26777299
Alignment:
Q  63 tcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatcca 162  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||  || |||| |||| || || |||||||||| |||||   ||||||| | ||||||||    
T  26777437 tcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatcca 26777338  T
Q  163 gagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  26777337 aagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 17025587 - 17025652
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagct 69  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17025587 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 17025652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27629588 - 27629389
Alignment:
Q  2 tatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 101  Q
    ||||| ||||| |||| ||| || || |||||  |||| |||||| ||||||| || ||  | || || ||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  27629588 tatgaagaagcgcccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcccctgcatgttaaactttgccaggcttctttgtttaaacatgatcatg 27629489  T
Q  102 ccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
     || ||||   || |||  || |||||| |||||||||  |||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||    
T  27629488 acagttgctccgagtgcgcccttaatcccttgggttgccgcgttgtgcaagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 27629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 21906 - 22064
Alignment:
Q  36 ttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttggg 135  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||    
T  21906 ttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttgggg 22005  T
Q  136 ttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22006 ttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgattgtca 22064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 563 - 364
Alignment:
Q  2 tatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 101  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  563 tatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatg 464  T
Q  102 ccacttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    ||| ||||| | |||||  || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  463 ccaattgcccataatgccgccataatccttggggttgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaatgacaattatcttactgtcagcgatgt 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 46928 - 46730
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  46928 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 46829  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  46828 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40012 - 39814
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  40012 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 39913  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||    
T  39912 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgacgaatgataattttttgactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 30076 - 30274
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||| |||    
T  30076 tgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgcc 30175  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | || ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  30176 aagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 30765 - 30964
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  30765 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgcc 30864  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaa-ttatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  30865 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatttttttgactgtcagtgatgtc 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 6327 - 6524
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  6327 tgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 6426  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  6427 aagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 27605 - 27804
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| | |||  |||||||||||||    
T  27605 tgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctatttagccatgatcatgcc 27704  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacga-caattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  27705 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 9879 - 10076
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | ||||   |||||||||||||    
T  9879 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctgttcagccatgatcatgcc 9978  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| ||||||| |||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  9979 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14873 - 14675
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||||    
T  14873 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgcc 14774  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgtc 202  Q
    |  || || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || || | | |||||||||||||||||    
T  14773 aagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9009 - 8812
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  9009 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 8910  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||    
T  8909 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 20328 - 20526
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  20328 tgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 20427  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaat-tatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | | |||||||| ||||||||| | || ||| | | ||||||||||||||||    
T  20428 aagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctttctgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26140 - 25947
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||  |    
T  26140 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 26041  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | |||| |||| || || ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  26040 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7178 - 6985
Alignment:
Q  8 gaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccactt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  7178 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 7079  T
Q  108 gcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    | || | |||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  7078 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 8262 - 8459
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||| |    
T  8262 tgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgac 8361  T
Q  104 acttgcctagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagtgatgt 201  Q
    |  || |||| |||| ||||| || ||||||||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  8362 aagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 119706 - 119651
Alignment:
Q  139 ctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  119706 ctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 119651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 7
Alignment:
Q  4 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagct 69  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  72 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 46729 - 46604
Alignment:
Q  17 agacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatg-atcatgccacttgcctagaa 115  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   ||||| |||||||||  ||||||| |    
T  46729 agacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgaatcatgccaagtgcctagga 46630  T
Q  116 tgcttccgtaatcc-tttgggttgct 140  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||    
T  46629 tgccttcgtaatccttttgggttgct 46604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University