View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7794_low_25 (Length: 249)

Name: NF7794_low_25
Description: NF7794
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7794_low_25
NF7794_low_25
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-189)||(4230800-4230982)
chr8 (1-189)||(2075915-2076097)
chr8 (66-189)||(32302885-32303008)
chr8 (1-189)||(28977195-28977377)
chr8 (1-189)||(24927774-24927956)
chr8 (4-189)||(45235890-45236069)
chr8 (2-189)||(24870106-24870286)
chr8 (6-189)||(27932238-27932415)
chr8 (4-189)||(29108906-29109085)
chr8 (79-189)||(31325090-31325199)
chr8 (71-183)||(40248492-40248604)
chr8 (4-189)||(17220542-17220721)
chr8 (66-189)||(39445708-39445830)
chr8 (66-189)||(1063332-1063455)
chr8 (66-189)||(11255147-11255267)
chr8 (66-135)||(34776945-34777014)
chr8 (127-189)||(34776287-34776349)
chr8 (66-171)||(20399435-20399539)
chr8 (81-171)||(1012461-1012551)
chr8 (66-172)||(35215347-35215452)
chr8 (139-188)||(34301367-34301416)
chr8 (81-168)||(24568786-24568873)
chr8 (66-168)||(34139294-34139395)
chr8 (66-171)||(43113766-43113870)
chr8 (6-50)||(40248457-40248501)
chr8 (84-171)||(29089554-29089640)
chr8 (81-172)||(34021321-34021412)
chr8 (81-171)||(17469099-17469189)
chr8 (4-44)||(11255092-11255132)
chr8 (9-50)||(34777024-34777065)
chr8 (9-43)||(1063472-1063506)
chr8 (1-50)||(32303018-32303068)
chr8 (85-134)||(14186205-14186254)
chr8 (1-41)||(20399559-20399599)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (1-189)||(29936242-29936424)
chr1 (9-189)||(42439759-42439933)
chr1 (1-181)||(24710692-24710866)
chr1 (1-183)||(24236842-24237018)
chr1 (1-189)||(36187301-36187483)
chr1 (1-189)||(20774458-20774641)
chr1 (66-189)||(28297759-28297882)
chr1 (1-182)||(49250854-49251029)
chr1 (4-189)||(50426739-50426918)
chr1 (1-182)||(51421691-51421866)
chr1 (4-189)||(5180871-5181050)
chr1 (66-189)||(34610899-34611022)
chr1 (7-189)||(17134773-17134949)
chr1 (4-189)||(17092043-17092222)
chr1 (4-179)||(42707914-42708083)
chr1 (4-181)||(40087547-40087718)
chr1 (4-189)||(45866269-45866448)
chr1 (66-189)||(34060159-34060282)
chr1 (4-189)||(19572596-19572774)
chr1 (87-189)||(23493497-23493599)
chr1 (7-182)||(18354167-18354336)
chr1 (4-182)||(23966705-23966878)
chr1 (4-189)||(39616129-39616308)
chr1 (66-189)||(3628127-3628250)
chr1 (66-182)||(13020521-13020637)
chr1 (66-137)||(16408824-16408895)
chr1 (109-181)||(13390283-13390355)
chr1 (83-172)||(35936973-35937062)
chr1 (66-171)||(44615616-44615720)
chr1 (66-171)||(44792849-44792953)
chr1 (68-171)||(44632278-44632380)
chr1 (81-172)||(16433315-16433406)
chr1 (66-172)||(9983030-9983135)
chr1 (81-171)||(12494855-12494945)
chr1 (4-50)||(13390372-13390418)
chr1 (81-172)||(29871439-29871530)
chr1 (81-172)||(34673436-34673527)
chr1 (81-168)||(49741161-49741248)
chr1 (1-43)||(34611039-34611081)
chr1 (1-50)||(29871366-29871415)
chr1 (2-50)||(23490853-23490901)
chr1 (66-169)||(38733838-38733940)
chr1 (1-50)||(28297892-28297942)
chr1 (8-50)||(3628073-3628117)
chr1 (1-50)||(16433245-16433294)
chr1 (4-44)||(34060103-34060144)
chr1 (1-50)||(35936898-35936947)
chr1 (81-145)||(8679688-8679752)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-189)||(5908770-5908952)
chr5 (1-189)||(22694983-22695165)
chr5 (1-182)||(42987561-42987736)
chr5 (1-189)||(40517631-40517813)
chr5 (1-188)||(4920652-4920833)
chr5 (4-189)||(17853377-17853555)
chr5 (4-188)||(35311649-35311826)
chr5 (66-183)||(3564868-3564985)
chr5 (4-182)||(4582951-4583123)
chr5 (4-189)||(13402088-13402266)
chr5 (69-189)||(10126933-10127053)
chr5 (4-189)||(28045480-28045660)
chr5 (4-189)||(1218582-1218759)
chr5 (4-189)||(15890032-15890211)
chr5 (66-183)||(20973626-20973743)
chr5 (66-189)||(12834716-12834839)
chr5 (1-189)||(30996422-30996603)
chr5 (66-189)||(6156059-6156182)
chr5 (66-189)||(29246092-29246215)
chr5 (4-189)||(12866636-12866816)
chr5 (1-135)||(6092600-6092728)
chr5 (92-188)||(27302899-27302995)
chr5 (66-189)||(6369520-6369644)
chr5 (66-171)||(27088492-27088596)
chr5 (66-172)||(3573067-3573172)
chr5 (81-172)||(2984990-2985081)
chr5 (81-172)||(30115326-30115417)
chr5 (81-172)||(35194144-35194235)
chr5 (127-183)||(6093307-6093363)
chr5 (81-172)||(2412881-2412972)
chr5 (66-181)||(8453513-8453627)
chr5 (81-172)||(38006624-38006715)
chr5 (66-172)||(42717773-42717873)
chr5 (66-171)||(12447225-12447329)
chr5 (66-171)||(33862325-33862428)
chr5 (4-44)||(3564813-3564853)
chr5 (4-43)||(12834659-12834698)
chr5 (10-43)||(20973576-20973609)
chr5 (3-39)||(6369665-6369701)
chr5 (81-172)||(18206860-18206951)
chr5 (7-50)||(27302823-27302866)
chr5 (4-50)||(29246036-29246082)
chr5 (1-50)||(3573182-3573231)
chr5 (1-50)||(12447339-12447388)
chr5 (1-42)||(35194071-35194112)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (6-189)||(45885851-45886028)
chr7 (1-188)||(16866000-16866181)
chr7 (1-189)||(7779838-7780020)
chr7 (1-189)||(17851684-17851866)
chr7 (1-183)||(24753012-24753187)
chr7 (7-189)||(25905458-25905634)
chr7 (1-182)||(18125309-18125484)
chr7 (1-189)||(30650461-30650643)
chr7 (1-189)||(44794108-44794290)
chr7 (1-189)||(35074299-35074482)
chr7 (66-189)||(38139933-38140056)
chr7 (66-189)||(45709002-45709125)
chr7 (4-183)||(37182111-37182284)
chr7 (66-181)||(44986038-44986153)
chr7 (66-189)||(43507263-43507386)
chr7 (66-189)||(45379936-45380059)
chr7 (66-189)||(41741589-41741712)
chr7 (6-183)||(44734443-44734614)
chr7 (79-189)||(3227696-3227806)
chr7 (3-156)||(21702522-21702669)
chr7 (66-189)||(39316825-39316948)
chr7 (66-189)||(25980057-25980180)
chr7 (1-171)||(37196079-37196243)
chr7 (4-164)||(17885320-17885474)
chr7 (87-189)||(38152732-38152834)
chr7 (71-189)||(10072318-10072438)
chr7 (81-172)||(12980224-12980315)
chr7 (66-172)||(37579110-37579215)
chr7 (66-183)||(41103489-41103609)
chr7 (79-172)||(26004673-26004766)
chr7 (66-172)||(5376933-5377038)
chr7 (66-172)||(16078861-16078966)
chr7 (66-172)||(18826012-18826117)
chr7 (66-168)||(27850466-27850566)
chr7 (66-116)||(44658589-44658639)
chr7 (66-153)||(39456153-39456240)
chr7 (66-172)||(3920386-3920491)
chr7 (81-162)||(2630728-2630809)
chr7 (6-50)||(10072429-10072473)
chr7 (2-50)||(38152850-38152898)
chr7 (1-114)||(16811635-16811742)
chr7 (81-172)||(23328457-23328548)
chr7 (81-172)||(26622799-26622890)
chr7 (81-147)||(46127334-46127400)
chr7 (7-50)||(43507408-43507451)
chr7 (81-155)||(24425246-24425319)
chr7 (4-50)||(39456098-39456143)
chr7 (4-50)||(41741533-41741579)
chr7 (9-50)||(3227035-3227076)
chr7 (1-50)||(44658530-44658579)
chr7 (2-50)||(3274761-3274809)
chr7 (6-50)||(39316958-39317002)
chr7 (4-44)||(44985984-44986023)
chr7 (81-120)||(26004626-26004665)
chr7 (2-41)||(41103628-41103667)
chr7 (81-158)||(25783061-25783138)
chr7 (1-50)||(27850407-27850456)
chr7 (2-50)||(45380069-45380118)
chr7 (81-177)||(26874208-26874304)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (1-189)||(47550435-47550617)
chr4 (4-189)||(48459312-48459491)
chr4 (1-189)||(5902696-5902878)
chr4 (1-189)||(7608801-7608983)
chr4 (66-189)||(31918700-31918823)
chr4 (66-183)||(6382414-6382531)
chr4 (1-189)||(21423692-21423874)
chr4 (1-189)||(44317365-44317548)
chr4 (66-189)||(11027903-11028026)
chr4 (1-188)||(11122951-11123132)
chr4 (4-189)||(39046784-39046962)
chr4 (4-189)||(42774592-42774771)
chr4 (1-156)||(43893092-43893241)
chr4 (4-182)||(31752294-31752466)
chr4 (66-182)||(47239526-47239642)
chr4 (66-183)||(32585325-32585443)
chr4 (66-189)||(15987381-15987503)
chr4 (66-189)||(4766453-4766577)
chr4 (66-189)||(55826765-55826888)
chr4 (71-189)||(53906427-53906545)
chr4 (66-181)||(42299630-42299745)
chr4 (66-180)||(32596325-32596438)
chr4 (66-182)||(28695283-28695399)
chr4 (66-172)||(425672-425777)
chr4 (66-172)||(19534304-19534409)
chr4 (81-171)||(26564681-26564771)
chr4 (66-172)||(7985262-7985368)
chr4 (66-171)||(6482177-6482280)
chr4 (81-172)||(12825616-12825707)
chr4 (81-172)||(37348972-37349063)
chr4 (81-163)||(1724465-1724547)
chr4 (103-183)||(13015550-13015630)
chr4 (66-172)||(37107260-37107365)
chr4 (81-162)||(9230142-9230226)
chr4 (2-50)||(53906388-53906436)
chr4 (81-172)||(29755485-29755576)
chr4 (81-171)||(13770610-13770700)
chr4 (1-50)||(31918640-31918690)
chr4 (1-43)||(32585460-32585502)
chr4 (8-50)||(47239474-47239516)
chr4 (1-50)||(55826705-55826755)
chr4 (1-50)||(13015333-13015382)
chr4 (1-50)||(26564795-26564844)
chr4 (1-50)||(6382354-6382404)
chr4 (1-50)||(11028036-11028086)
chr4 (1-50)||(1724392-1724441)
chr4 (1-50)||(19534419-19534468)
chr4 (83-172)||(39188364-39188453)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-189)||(39728496-39728678)
chr3 (1-182)||(44953516-44953691)
chr3 (1-189)||(17146231-17146413)
chr3 (1-189)||(44106873-44107055)
chr3 (1-189)||(44252572-44252754)
chr3 (1-180)||(49579898-49580071)
chr3 (66-189)||(52197979-52198102)
chr3 (1-189)||(44172452-44172633)
chr3 (1-189)||(44179152-44179333)
chr3 (1-189)||(49025506-49025688)
chr3 (5-189)||(52572434-52572612)
chr3 (1-182)||(39655354-39655529)
chr3 (9-177)||(10823782-10823944)
chr3 (1-189)||(29284161-29284343)
chr3 (4-189)||(20086834-20087013)
chr3 (66-189)||(23547112-23547235)
chr3 (4-179)||(29842143-29842312)
chr3 (66-180)||(7469918-7470032)
chr3 (1-189)||(44639100-44639281)
chr3 (4-187)||(6738478-6738655)
chr3 (66-181)||(34154251-34154366)
chr3 (4-189)||(43582403-43582582)
chr3 (66-183)||(48306676-48306793)
chr3 (66-189)||(22535981-22536104)
chr3 (66-189)||(23580653-23580776)
chr3 (4-182)||(34025786-34025958)
chr3 (66-176)||(48390957-48391066)
chr3 (81-172)||(31126949-31127040)
chr3 (66-172)||(34119501-34119606)
chr3 (81-172)||(830852-830943)
chr3 (81-172)||(19111578-19111669)
chr3 (81-172)||(53631747-53631838)
chr3 (66-172)||(30682664-30682769)
chr3 (66-172)||(41937142-41937247)
chr3 (81-168)||(4557459-4557546)
chr3 (66-172)||(42758217-42758322)
chr3 (81-168)||(4016198-4016285)
chr3 (2-50)||(23910326-23910374)
chr3 (9-44)||(23154153-23154188)
chr3 (66-109)||(23154203-23154246)
chr3 (1-39)||(48305722-48305760)
chr3 (4-50)||(48390901-48390947)
chr3 (1-50)||(7469859-7469908)
chr3 (1-50)||(30682779-30682828)
chr3 (1-42)||(52198121-52198162)
chr3 (4-43)||(34154378-34154418)
chr3 (81-137)||(54317022-54317078)
chr3 (7-50)||(22535928-22535971)
chr3 (9-44)||(23580791-23580826)
chr3 (1-42)||(54317110-54317151)
chr3 (66-122)||(14208294-14208348)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-189)||(10920471-10920653)
chr2 (1-189)||(13830562-13830744)
chr2 (66-189)||(42798129-42798252)
chr2 (1-189)||(9632212-9632394)
chr2 (66-189)||(18106230-18106353)
chr2 (66-189)||(30846771-30846894)
chr2 (1-181)||(8916018-8916192)
chr2 (1-189)||(10208511-10208693)
chr2 (1-189)||(24414213-24414395)
chr2 (66-189)||(36128247-36128370)
chr2 (1-189)||(37999309-37999491)
chr2 (66-189)||(37472869-37472992)
chr2 (2-183)||(13705443-13705618)
chr2 (4-181)||(37106533-37106703)
chr2 (4-182)||(12193911-12194083)
chr2 (2-179)||(45115394-45115565)
chr2 (4-182)||(7314732-7314904)
chr2 (2-181)||(45256657-45256830)
chr2 (81-189)||(44746264-44746372)
chr2 (82-189)||(16105444-16105551)
chr2 (66-172)||(6028029-6028135)
chr2 (66-171)||(31942326-31942430)
chr2 (96-172)||(14540629-14540705)
chr2 (66-171)||(16226867-16226971)
chr2 (1-50)||(36128187-36128237)
chr2 (1-50)||(42798069-42798119)
chr2 (81-172)||(19104995-19105086)
chr2 (1-50)||(30846904-30846954)
chr2 (1-50)||(14540740-14540789)
chr2 (93-162)||(35337650-35337719)
chr2 (1-42)||(44746190-44746231)
chr2 (95-163)||(37319794-37319862)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-188)||(32853670-32853851)
chr6 (1-189)||(10142599-10142781)
chr6 (1-189)||(27534509-27534691)
chr6 (66-189)||(10188213-10188336)
chr6 (1-189)||(2367151-2367333)
chr6 (1-189)||(3484004-3484186)
chr6 (1-189)||(12141210-12141392)
chr6 (1-189)||(5863464-5863646)
chr6 (1-189)||(24225524-24225705)
chr6 (1-132)||(27738654-27738779)
chr6 (1-171)||(14032400-14032563)
chr6 (66-172)||(14505929-14506034)
chr6 (71-161)||(32532417-32532507)
chr6 (83-188)||(32052883-32052988)
chr6 (81-172)||(7394041-7394132)
chr6 (66-172)||(14410973-14411078)
chr6 (1-189)||(12309405-12309579)
chr6 (66-172)||(12678234-12678338)
chr6 (81-153)||(24603010-24603082)
chr6 (68-171)||(14245091-14245193)
chr6 (81-171)||(14254802-14254892)
chr6 (4-50)||(32532498-32532544)
chr6 (81-162)||(30816110-30816191)
chr6 (1-50)||(32053046-32053095)
chr6 (66-172)||(11762288-11762393)
chr6 (1-50)||(10188154-10188203)
chr6 (1-42)||(11762411-11762452)
[»] scaffold1630 (1 HSPs)
scaffold1630 (92-189)||(1448-1545)
[»] scaffold0189 (2 HSPs)
scaffold0189 (66-189)||(4083-4205)
scaffold0189 (1-50)||(4215-4265)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (66-189)||(32670-32792)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (4-188)||(10127-10301)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (82-172)||(14618-14708)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (71-171)||(14290-14389)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (81-180)||(197481-197580)
scaffold0007 (1-42)||(197408-197449)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (81-171)||(33237-33327)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (81-172)||(6249-6340)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (81-171)||(33427-33517)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (81-162)||(36008-36092)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (92-172)||(90440-90520)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 4230800 - 4230982
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4230800 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 4230893  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4230894 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 4230982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 2075915 - 2076097
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2075915 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 2076008  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2076009 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggatgatgtattacaacgttgctcttggggatgc 2076097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32303008 - 32302885
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32303008 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 32302909  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  32302908 ttacaacgttgctcttggggatgc 32302885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 28977195 - 28977377
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28977195 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 28977288  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28977289 ttaaatgatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 28977377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24927956 - 24927774
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||               ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24927956 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatcttaataaaaactaccattgatat 24927863  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24927862 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgggcttattgttggataatgtattacaacgttgctctcggagatgc 24927774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45236069 - 45235890
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45236069 acccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattatcatgttaataaaaactaccattgatattta 45235976  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45235975 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattacaacattgctcttggggatgc 45235890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 24870106 - 24870286
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24870106 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttaatttgtttg------ataattgtcatgttaataaaa-ctaccattgatatt 24870198  T
Q  102 taaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24870199 taaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagtgtattgttgaatgatgtattacaacgttggtcttggagatgc 24870286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27932415 - 27932238
Alignment:
Q  6 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27932415 ccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 27932322  T
Q  106 ggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27932321 ggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcacattggtggataatgtattacaacgttactcttggggatgc 27932238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 29108906 - 29109085
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29108906 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatattattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttg 29108999  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29109000 aaggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattggtagataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 29109085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31325199 - 31325090
Alignment:
Q  79 taataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgct 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31325199 taataaaaactaccattgatatttaaag-atcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgtgggataatgtattacaacgttgct 31325101  T
Q  179 cttggagatgc 189  Q
    ||||| |||||    
T  31325100 cttggggatgc 31325090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Original strand, 40248492 - 40248604
Alignment:
Q  71 tgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattaca 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40248492 tgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattcagtctaacaaatgttaaagtgagaatattgttggataatgtattaca 40248591  T
Q  171 acgttgctcttgg 183  Q
    | |||||||||||    
T  40248592 atgttgctcttgg 40248604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17220721 - 17220542
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17220721 acccgtcccaaatgtaaaagattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttg 17220628  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  17220627 aaggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattggtggataatgtattataacgttgcttttggggatgc 17220542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 39445708 - 39445830
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39445708 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaatg-atcaattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 39445806  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  39445807 ttacaacgttgctcttggggatgc 39445830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1063455 - 1063332
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  1063455 ataattgtcatgttgataaaaattaccattgatatttaaacgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacgtattgttgaataatgta 1063356  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  1063355 ctacaacgttgctcttggtgatgc 1063332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 11255147 - 11255267
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  11255147 ataattgtcatattaataaaaactaccgtc---atttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgta 11255243  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  11255244 ttacaatgttgctcttggggatgc 11255267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34777014 - 34776945
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777014 ataattgcaatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 34776945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34776349 - 34776287
Alignment:
Q  127 ctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34776349 ctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 34776287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20399539 - 20399435
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |    
T  20399539 ataattgtcgtgtta-taaaaactagcattgatatttaaaggaccaaccaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatcttgctggataatgca 20399441  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  20399440 ttacaa 20399435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1012551 - 1012461
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  1012551 ataaaaagtaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatccattacaa 1012461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35215452 - 35215347
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |    
T  35215452 ataattgtcgtgtta-taaaaactacccttgatatttaatggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttagataatgca 35215354  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  35215353 ttacaac 35215347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Original strand, 34301367 - 34301416
Alignment:
Q  139 aaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34301367 aaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatg 34301416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24568873 - 24568786
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatta 168  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24568873 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcatta 24568786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34139395 - 34139294
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  34139395 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaaacaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgca 34139297  T
Q  166 tta 168  Q
    |||    
T  34139296 tta 34139294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 43113766 - 43113870
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||||| |||||||   || ||||||||| || |    
T  43113766 ataattgtcgtgtta-taaaaactatcattgatatttgaaggagcaactaaatcaatcggtataacaaatgttaaagtgaatatagtgttggatattgca 43113864  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  43113865 ttacaa 43113870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 40248457 - 40248501
Alignment:
Q  6 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40248457 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 40248501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 29089640 - 29089554
Alignment:
Q  84 aaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  29089640 aaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaattaatgggtctaacaaat-ttaaagtaaacatattgttggataatgcattacaa 29089554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 34021412 - 34021321
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||    
T  34021412 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaacgaaatcaattaatctaacaaatgttaaagtgagcatattattagataacgcattacaac 34021321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17469189 - 17469099
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  17469189 ataaaagctaccattgatatttaaaggagaaactaaatcaatgggtctaaaaaattttaaagtgaacatattgttggataatgcattacaa 17469099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 11255092 - 11255132
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11255092 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgta 11255132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 34777065 - 34777024
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34777065 tcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgtta 34777024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 1063506 - 1063472
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 43  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063506 tcccaagtgtaaaaaattactttatgttgatatgt 1063472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32303068 - 32303018
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaa-aaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  32303068 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatgtta 32303018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14186254 - 14186205
Alignment:
Q  85 aaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaa 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  14186254 aaactaccattgatatttaaaggagtaactaaatcaattggtctaacaaa 14186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 20399599 - 20399559
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 41  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20399599 caaacccgtcccgaatgcaaaaaattattttatgttgatat 20399559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29936424 - 29936242
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29936424 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttattttttttt------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 29936331  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29936330 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattataatgttgctcttggagatgc 29936242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 42439759 - 42439933
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42439759 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 42439852  T
Q  109 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42439853 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgttaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcatggggatgc 42439933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24710866 - 24710692
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710866 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 24710773  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710772 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaaatgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 24710692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 24236842 - 24237018
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24236842 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 24236935  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24236936 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtggacttattgttggataatgtattacaacgttgcttttgg 24237018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 36187301 - 36187483
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36187301 caaacccgtcccaaatgtaaaaagttattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 36187394  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36187395 ttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaggttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 36187483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20774641 - 20774458
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20774641 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaacttttattgata 20774548  T
Q  100 tttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20774547 tttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 20774458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28297882 - 28297759
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28297882 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggacaatgta 28297783  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  28297782 ttacaacgttgctcttggggatgc 28297759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 49250854 - 49251029
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||               |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49250854 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgctattttgtttg------ataattgtcatgttgataaaaactatcattgatat 49250947  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49250948 ttaaaagatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 49251029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 50426739 - 50426918
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426739 acccgtcccaaatgtaaaaatttactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 50426832  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50426833 aaggatcaactaaatcattccgtcttacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 50426918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 51421866 - 51421691
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||               ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51421866 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactctatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactaccattgctat 51421773  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51421772 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttgtataatgtattacaacgttgctcttg 51421691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5181050 - 5180871
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5181050 acccgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 5180957  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5180956 aaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaattttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 5180871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34611022 - 34610899
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34611022 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatata 34610923  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  34610922 ttacaacgttgctcttggggatgc 34610899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17134949 - 17134773
Alignment:
Q  7 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaag 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17134949 cgtcccatatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaag 17134856  T
Q  107 gatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17134855 gatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgaataatgtattacaacgttgctcttggtgatgc 17134773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 17092043 - 17092222
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092043 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 17092136  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17092137 aaggatcaactaaatcattccatctaataaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattacaaagttgctcttggggatgc 17092222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 42707914 - 42708083
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42707914 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 42708007  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctc 179  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42708008 aaggatcaactaaatcattccgtctaacagatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctc 42708083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 40087547 - 40087718
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40087547 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatatcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 40087640  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40087641 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggatactgtattacaaagttgctctt 40087718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 45866269 - 45866448
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45866269 acccatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattatcatgttaataaaaactaccattgatattta 45866362  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  45866363 aaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcattacaacgttgatcttggggatgc 45866448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 34060159 - 34060282
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34060159 ataattgtcatgttaataaaaacaaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgaa 34060258  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||| |||||| |||||    
T  34060259 ttacaacgttgatcttggggatgc 34060282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 19572596 - 19572774
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19572596 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactaccattgatattga 19572689  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19572690 a-ggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattggtggataatgtattacaacgttgctcttggaaatgc 19572774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 189
Target Start/End: Original strand, 23493497 - 23493599
Alignment:
Q  87 actatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggaga 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23493497 actaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtggaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctcgggga 23493596  T
Q  187 tgc 189  Q
    |||    
T  23493597 tgc 23493599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 18354167 - 18354336
Alignment:
Q  7 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaag 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18354167 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaa 18354260  T
Q  107 gatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18354261 gatcaactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtgaacatattgttggataatattttacaacgttgctcttg 18354336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23966878 - 23966705
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23966878 acccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgtttataaaaactactattgatattt 23966785  T
Q  103 aaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23966784 aaagtatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtgttacaacgttgctcttg 23966705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39616308 - 39616129
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||                ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39616308 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgc------taattatcatgttaataaaaattaccattgatattta 39616215  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    || |||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39616214 aatgatcagttaaatcattccgtctaacagatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 39616129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 3628127 - 3628250
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3628127 ataattatcatgttaataaaaactaccattaatatttaacggatcaactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 3628226  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| | || |||||| |||||    
T  3628227 ttacaaagctgttcttggggatgc 3628250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13020637 - 13020521
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||||    
T  13020637 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtgggtgtattgttcgataatgta 13020538  T
Q  166 ttacaacgttgctcttg 182  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13020537 ttataacgttgctcttg 13020521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16408895 - 16408824
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16408895 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 16408824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13390355 - 13390283
Alignment:
Q  109 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13390355 tcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaaagttgctctt 13390283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 172
Target Start/End: Original strand, 35936973 - 35937062
Alignment:
Q  83 aaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  35936973 aaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgctcgataatgcattacaac 35937062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 44615616 - 44615720
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  44615616 ataattgtcgtgtta-taaaaactattattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataattta 44615714  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  44615715 ttacaa 44615720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 44792953 - 44792849
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  44792953 ataattgtcgtgtta-taaaaactattattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataattta 44792855  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  44792854 ttacaa 44792849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 171
Target Start/End: Original strand, 44632278 - 44632380
Alignment:
Q  68 aattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatt 167  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||  |||    
T  44632278 aattgtcgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaataggtctaacaaatgttaaagtgatcatattgttcgataatacatt 44632376  T
Q  168 acaa 171  Q
    ||||    
T  44632377 acaa 44632380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 16433315 - 16433406
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||    
T  16433315 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatattaaagtgagcatattactagataatgcattacaac 16433406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 9983030 - 9983135
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  9983030 ataattctcatgtta-tcaaaactaccattgatattcaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgctggataataca 9983128  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  9983129 ttacaac 9983135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12494945 - 12494855
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||   |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  12494945 ataaaaactaccactgatatttaaaggagcaactaaatttatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcattacaa 12494855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13390418 - 13390372
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13390418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 13390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 29871439 - 29871530
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  29871439 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactacatcaatcggtctaacaaatattaaaatgagcatattgctgaataatgcattacaac 29871530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 34673436 - 34673527
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||    
T  34673436 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaaccggtctaacaaatgttaaaatgagcgtatttcttgataatgcattacaac 34673527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Original strand, 49741161 - 49741248
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatta 168  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  49741161 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtttaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcatta 49741248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 34611081 - 34611039
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 43  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34611081 caaacccgtcccaaatgtaaaatactactttatgttgatatgt 34611039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 29871366 - 29871415
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29871366 caaacccgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 29871415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 23490853 - 23490901
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  23490853 aaacccgtcccaaatgtaaaaaactaatttatgtggatatgttatgtta 23490901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38733940 - 38733838
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||| | ||||| | ||| |  |||||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  38733940 ataattgtcatgtta-taaaaattgtcattgatatttaaagaagcaaccatatcatctggtcaatgaaatgttaaagtaaatatattgttggataatgta 38733842  T
Q  166 ttac 169  Q
    ||||    
T  38733841 ttac 38733838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28297942 - 28297892
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaa-aaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  28297942 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatgtta 28297892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Original strand, 3628073 - 3628117
Alignment:
Q  8 gtcccaaatgtaaaa--aattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3628073 gtcccaaatgtaaaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 3628117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 16433245 - 16433294
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16433245 caaacccaccccaaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 16433294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 34060103 - 34060144
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaa-aattactttatgttgatatgta 44  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34060103 acccgtcccaattgtaaaaaaattactttatgttgatatgta 34060144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 35936898 - 35936947
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35936898 caaacccgtcatgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 35936947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 8679688 - 8679752
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtga 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |  |||||| |||||||    
T  8679688 ataaaaattatcattgatatttaaaggagcaatcaaatcatttagtcaaggaaatgttaaagtga 8679752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5908770 - 5908952
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5908770 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 5908863  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5908864 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 5908952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22694983 - 22695165
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22694983 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtaatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 22695076  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22695077 ttaaaggatcaactatatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 22695165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 42987561 - 42987736
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42987561 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 42987654  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42987655 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaggttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 42987736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40517813 - 40517631
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40517813 caaacccgtcccaaaggtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 40517720  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40517719 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatatattacaacgttgctcttggagatgc 40517631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4920833 - 4920652
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4920833 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 4920740  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4920739 ttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattattggataatgtattacaacgttgctcttggggatg 4920652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 17853377 - 17853555
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17853377 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 17853469  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17853470 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 17853555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35311826 - 35311649
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35311826 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt-atgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 35311734  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35311733 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatg 35311649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 3564868 - 3564985
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3564868 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 3564967  T
Q  166 ttacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  3564968 ttacaacattgctcttgg 3564985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4583123 - 4582951
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4583123 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 4583030  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4583029 aaggatcaactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgttttacaacgttgctcttg 4582951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 13402088 - 13402266
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13402088 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactactattgatattta 13402180  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13402181 aaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttaaaatgagcatattgttggataatgtattacaacattgctcttggggatgc 13402266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10127053 - 10126933
Alignment:
Q  69 attgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatta 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10127053 attgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataacgtatta 10126954  T
Q  169 caacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||| ||| |||||| |||||    
T  10126953 caacattggtcttggggatgc 10126933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28045660 - 28045480
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaa-taaaaactatcattgatattt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28045660 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttt------ataattgttatgttaaataaaaactatcattgatattt 28045567  T
Q  103 aaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28045566 aaaggatcaactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattataacgttgctcttggggatgc 28045480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1218759 - 1218582
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||               |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1218759 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgt-atgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaa-aaaaactaccattgatattta 1218668  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1218667 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgaataatatattacaacgttgctcttggggatgc 1218582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15890211 - 15890032
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||     
T  15890211 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttatttg------ataattgtcatattaatgaaaactaccattgatatttg 15890118  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15890117 aaggatcaattaaataattacgtctaacaaatgttaaagtgaacatattggtggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 15890032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 20973626 - 20973743
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20973626 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatgtaaagtatcaactaaatcattccgtctaaaaaatattaaagtgagcgtattgttcgataatgta 20973725  T
Q  166 ttacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20973726 ttacaacgttgctcttgg 20973743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 12834716 - 12834839
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12834716 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatgatcaattaaatcgttacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattggtggataatgta 12834815  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  12834816 ttacaatgttgctcttggggatgc 12834839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30996603 - 30996422
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||               ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30996603 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttaagttgatatgccatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatat 30996510  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  30996509 ttaaaggatcaaataaatcattccgtctaac-aatgttaaagtgagcgtattgttgaataatgtattactacgttgttcttggggatgc 30996422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 6156059 - 6156182
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||    
T  6156059 ataattgtcatggtaataaaaaatatcattgatatttaaaggagcaaataaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatttttagataatcta 6156158  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||| ||||| |||||    
T  6156159 ttacaacgttgcccttggggatgc 6156182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 29246092 - 29246215
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29246092 ataattgttatgttaataaacactaccattgatatttaatgaatcaattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 29246191  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||    
T  29246192 ttacaacattgttcttggggatgc 29246215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 12866636 - 12866816
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-atgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12866636 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtctatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattt 12866729  T
Q  103 aaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
     || |||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12866730 gaatgatcaattaaattgttacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattggtggataacgtattacaatgttgctcttggggatgc 12866816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 6092600 - 6092728
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  6092600 caaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgcaatgttaataaaaactaccattgatat 6092693  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6092694 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 6092728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 188
Target Start/End: Original strand, 27302899 - 27302995
Alignment:
Q  92 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27302899 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgatcatattgttggataatgtattacaacattgctcttggggatg 27302995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6369644 - 6369520
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||    
T  6369644 ataattatcatgttaatgaaaactaccgttgatgtttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgggtgtactgttggataatgta 6369545  T
Q  166 ttacaacg-ttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  6369544 ttacaacgtttgctcttggggatgc 6369520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 27088492 - 27088596
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  27088492 ataattgttatgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtaagcatattgctggataatgca 27088590  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  27088591 ttacaa 27088596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3573172 - 3573067
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  3573172 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatattcaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgctggataatgca 3573074  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  3573073 ttacaac 3573067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2985081 - 2984990
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  2985081 ataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtgagcatattgtcggataatacattacaac 2984990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30115417 - 30115326
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30115417 ataaaaaccaccatttatatttaaaggagcaactaaatcgatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgcattacaac 30115326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 35194144 - 35194235
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  35194144 ataaaaactaccattgatatttaaagaataaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaaagtgaacatattgctggataatgcattacaac 35194235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 183
Target Start/End: Original strand, 6093307 - 6093363
Alignment:
Q  127 ctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093307 ctaacacatgtgaaagtgaacttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 6093363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 2412881 - 2412972
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2412881 ataaaaactacaattgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatattaaagtgagcatattgttggataatgcactacaac 2412972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Original strand, 8453513 - 8453627
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||| |    
T  8453513 ataattgtcatgtta-taaaaattaccattgatatttaaaggagtaactaaatcattcggtcaaacaaatgttaaaatgagcatattactggagaatgca 8453611  T
Q  166 ttacaacgttgctctt 181  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  8453612 ttataacattgctctt 8453627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 38006624 - 38006715
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  38006624 ataaaaaccaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaattgttaaaacgagcatattgttggataatgcattgcaac 38006715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 42717773 - 42717873
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||| ||||     |||||| |||||||||||    
T  42717773 ataattgtcgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaaccggtctaacaaatgttaaag-----ttattgctggataatgta 42717866  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  42717867 ttacaac 42717873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12447329 - 12447225
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |   |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |    
T  12447329 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagcagttaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaatatattgttggataatgca 12447231  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  12447230 ttacaa 12447225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 33862325 - 33862428
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  33862325 ataattgtcatgttg-taaaaactacgattgatatttaaatgaccaactaaatcaatggg-ctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgca 33862422  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  33862423 ttacaa 33862428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 3564813 - 3564853
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 44  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564813 acccgttccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 3564853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Original strand, 12834659 - 12834698
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12834659 acccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgt 12834698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 20973576 - 20973609
Alignment:
Q  10 cccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20973576 cccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 20973609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 6369701 - 6369665
Alignment:
Q  3 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 39  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6369701 aacccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgat 6369665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18206951 - 18206860
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| || ||||  | ||||||| ||||||||    
T  18206951 ataaaaactactaatgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtgggcatatttctagataatgcattacaac 18206860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Original strand, 27302823 - 27302866
Alignment:
Q  7 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27302823 cgtcccaaacgtaaaaaattactttatgttaatatgtcatgtta 27302866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 29246036 - 29246082
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  29246036 acccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttggtatgtcatgtta 29246082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3573231 - 3573182
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3573231 caaacccctcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 3573182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12447388 - 12447339
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  12447388 caaacccgtcccaaatatagaaaactactttatgttaatatgtcatgtta 12447339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 35194071 - 35194112
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 42  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35194071 caaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttaatatg 35194112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Original strand, 45885851 - 45886028
Alignment:
Q  6 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885851 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 45885944  T
Q  106 ggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885945 ggatcaacttaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 45886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16866181 - 16866000
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16866181 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactatcattgatat 16866088  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16866087 ttaaatgattaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatg 16866000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7780020 - 7779838
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7780020 caaacccgtcccaaatgtaaaaatttattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 7779927  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7779926 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaggttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 7779838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17851866 - 17851684
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17851866 caaacccatcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 17851773  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17851772 ttaaaggatcaactaaatcattttatctaataaatgtgaaagtgagctttttgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 17851684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24753187 - 24753012
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24753187 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 24753094  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24753093 ttaaag-atcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 24753012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25905634 - 25905458
Alignment:
Q  7 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaag 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25905634 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaag 25905541  T
Q  107 gatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25905540 gatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaggtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 25905458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 18125309 - 18125484
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18125309 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 18125402  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18125403 ttaaagaatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatatattacaacgttgctcttg 18125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30650643 - 30650461
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30650643 caaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactaccattgatat 30650550  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30650549 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagtttattgtttgataatgtattacaacattgctcttggggatgc 30650461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 44794108 - 44794290
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  44794108 caaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttactaaaaactaccattgatac 44794201  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44794202 ttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 44794290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35074482 - 35074299
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35074482 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgata 35074389  T
Q  100 tttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  35074388 tttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgcattacaacattgctcttggggatgc 35074299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 38139933 - 38140056
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38139933 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattgttggataatgta 38140032  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  38140033 ttacaacgttactcttggggatgc 38140056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 45709002 - 45709125
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45709002 ataattgtcatattaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 45709101  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  45709102 ttacaatgttgctcttggggatgc 45709125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37182284 - 37182111
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37182284 acccgtcccaaatgtaaaaaattatcttatgttgatatgtcatgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 37182191  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37182190 aaggatcaactaaatcattgtgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 37182111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Original strand, 44986038 - 44986153
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  44986038 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgta 44986137  T
Q  166 ttacaacgttgctctt 181  Q
    ||||||||||||||||    
T  44986138 ttacaacgttgctctt 44986153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43507386 - 43507263
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43507386 ataattgtcatattaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaattttaaagtgagcatattgttggataatgta 43507287  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  43507286 ttacaacgttgctcttggggatgc 43507263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45380059 - 45379936
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45380059 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcagttcgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattgttggatgatgta 45379960  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||    
T  45379959 ttataacattgctcttggggatgc 45379936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 41741589 - 41741712
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41741589 ataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaacggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 41741688  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||| |||||| |||||    
T  41741689 ttacaacgttgttcttggggatgc 41741712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 44734443 - 44734614
Alignment:
Q  6 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44734443 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttatttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttgaa 44734536  T
Q  106 ggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44734537 ggatcaattaaatcattacgtctaacaaatattaaagcgagcatattggtggataatatattacaacgttgctcttgg 44734614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 3227696 - 3227806
Alignment:
Q  79 taataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgct 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3227696 taataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttgaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgct 3227795  T
Q  179 cttggagatgc 189  Q
    | |||||||||    
T  3227796 catggagatgc 3227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21702669 - 21702522
Alignment:
Q  3 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21702669 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccatttatattt 21702576  T
Q  103 aaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttg 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21702575 aaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttg 21702522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39316948 - 39316825
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39316948 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcgattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattggtggataatgta 39316849  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  39316848 ttacaacgttgctcatggggatgc 39316825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 25980057 - 25980180
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25980057 ataattatcatgttaataaaaacttacattgatatttaaaggattaaataaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgtgcgtattgttggataatgta 25980156  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  25980157 ttacaatgttgctcttggggatgc 25980180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 37196079 - 37196243
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37196079 caaacccgtcataaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataactgtcatgttaataaaaactaccattgatat 37196172  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
     |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37196173 ataaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattattggataatgtattacaa 37196243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17885474 - 17885320
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17885474 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgtcaataaaaactaccattgatattta 17885381  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgt 164  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  17885380 aaggatcaactaaatcattccatctatcaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgt 17885320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38152834 - 38152732
Alignment:
Q  87 actatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggaga 186  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38152834 actaccattgatatctaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattgttggatgatgtattacaacgttgctcttgggga 38152735  T
Q  187 tgc 189  Q
    |||    
T  38152734 tgc 38152732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10072438 - 10072318
Alignment:
Q  71 tgtcatgttaataaaaa-ctatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta-tta 168  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  10072438 tgtcatgttaataaaaaactaccattgataattaaatgatcaactaaatcattccgcctaacaaatgttaaagtgagcatatcgttggataatgtattta 10072339  T
Q  169 caacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10072338 caacgttgctcttggggatgc 10072318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12980315 - 12980224
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  12980315 ataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcattacaac 12980224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 37579215 - 37579110
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37579215 ataattgtcatgtta-taaaaattatcattgatatttaaatgagcaactaaatcaatccatctaacaaatgttaaagtgagcatattgctagataatgta 37579117  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  37579116 ttacaac 37579110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41103609 - 41103489
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgat---atttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataat 162  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||||    
T  41103609 ataattgtcatgttaatacaaattaccattgatgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtggacgtattattgaataat 41103510  T
Q  163 gtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  41103509 gtactataacgttgctgttgg 41103489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 172
Target Start/End: Original strand, 26004673 - 26004766
Alignment:
Q  79 taataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  26004673 taataaaaactaccattgatatttaaaggagcgactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgagcatattgttggataattaattacaac 26004766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5377038 - 5376933
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  5377038 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccaatgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtttaacaaatgttaaaatgagcatattgttggacaatgca 5376940  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  5376939 ttacaac 5376933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16078966 - 16078861
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  16078966 ataattgtcgtgtta-taaaaactacccttgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaaaaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgaa 16078868  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  16078867 ttacaac 16078861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 18826012 - 18826117
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |    
T  18826012 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatataaaagaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattattggatgatgca 18826110  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  18826111 ttacaac 18826117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 168
Target Start/End: Original strand, 27850466 - 27850566
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  27850466 ataattgtcgtgtta-taaaaactttcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaa-tgagcatattgttggataatgca 27850563  T
Q  166 tta 168  Q
    |||    
T  27850564 tta 27850566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 116
Target Start/End: Original strand, 44658589 - 44658639
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44658589 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaa 44658639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 39456153 - 39456240
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattg 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39456153 ataattgccatggtaataaaaattaccattgatattggaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattg 39456240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3920491 - 3920386
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||| |    
T  3920491 ataattgccatgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggaacaactaaatgaatcggtctaacaaatgttaaaatgagcgtatttcttgataatgca 3920393  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  3920392 ttacaac 3920386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Original strand, 2630728 - 2630809
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataat 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  2630728 ataaaaactaccattgatatttaaatgagcaactaaatcaatcggtctatcaaatgttaaagtgaacatattgttggataat 2630809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10072473 - 10072429
Alignment:
Q  6 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10072473 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 10072429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 38152898 - 38152850
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38152898 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 38152850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16811742 - 16811635
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||               ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16811742 caaagccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatattatgtta------ttttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatat 16811649  T
Q  101 ttaaaggatcaact 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  16811648 ttaaaagatcaact 16811635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23328548 - 23328457
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  23328548 ataaaaattatcattgatatttaaaggaataactaaatcaatcggtctaataaatgctaaagtgagcatattactggataatgcattacaac 23328457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26622890 - 26622799
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||| || ||||| | ||||||| ||||||||    
T  26622890 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaattaaatcaattggtcaaacaaatgtcaatgtgcgcatattgcttgataatgcattacaac 26622799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Original strand, 46127334 - 46127400
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagc 147  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  46127334 ataataactaccattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagc 46127400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 43507451 - 43507408
Alignment:
Q  7 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43507451 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 43507408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24425319 - 24425246
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgtt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24425319 ataaaaactaccattgatatttaaagga-caaataaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgtt 24425246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 39456098 - 39456143
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39456098 acccgtcccaaatgtaaaa-attactttatgttgatatgtcatgtta 39456143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 41741533 - 41741579
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  41741533 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatactgatatgtcatgtta 41741579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 3227035 - 3227076
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3227035 tcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 3227076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 44658530 - 44658579
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  44658530 caaacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgtcatgtta 44658579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 3274761 - 3274809
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3274761 aaacccgtcccgaatgtagaaaattacattatgttgatatgtcatgtta 3274809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 39317002 - 39316958
Alignment:
Q  6 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39317002 ccgtctcaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 39316958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 44985984 - 44986023
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44985984 acccgtcccaaatgtaaaaaatta-tttatgttgatatgta 44986023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Original strand, 26004626 - 26004665
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26004626 ataaaaactatcattgatatttaaaggagcgactaaatca 26004665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 41103667 - 41103628
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 41  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41103667 aaacccgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 41103628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 25783061 - 25783138
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttgga 158  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |  || ||| |||| | |||||||||  |||||||||    
T  25783061 ataaaaactatcatcaatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtataataaatattaaagtgagcacattgttgga 25783138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 27850407 - 27850456
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  27850407 caaacccgtcccgaatgtagaaaattactttacgatgatatgtcatgtta 27850456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 45380118 - 45380069
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  45380118 aaactcgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgacatgtcatgtta 45380069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26874304 - 26874208
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgc 177  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |  |||||| |||| || | ||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  26874304 ataaaaagtgtcattgatatttaaaggagcaagcaaatcatttggtcaaggaaatgttaaagcgaacatattactggataatgcattacaacattgc 26874208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 47550435 - 47550617
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47550435 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 47550528  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47550529 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaggttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 47550617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48459491 - 48459312
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48459491 acccatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 48459398  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48459397 aaggatcaactaaatcattttgtctaaaaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 48459312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5902696 - 5902878
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5902696 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatcttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 5902789  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5902790 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 5902878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7608983 - 7608801
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7608983 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactctatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactgtcattgatat 7608890  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7608889 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 7608801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 31918700 - 31918823
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31918700 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 31918799  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  31918800 ttacaacgttgctcttggggatgc 31918823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 6382414 - 6382531
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6382414 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 6382513  T
Q  166 ttacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6382514 ttacaacgttgctcttgg 6382531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21423874 - 21423692
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21423874 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatattattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 21423781  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21423780 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaatttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 21423692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44317548 - 44317365
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44317548 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactacgattgata 44317455  T
Q  100 tttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44317454 tttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagtttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 44317365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11028026 - 11027903
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11028026 ataattgtcatgttaataaaaactactatttatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgatcttattgttggataatata 11027927  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  11027926 ttacaacgttgctcttggggatgc 11027903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 11122951 - 11123132
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||               |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11122951 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttttgttattttgtttt------ataattgtcatgttaataaaaagtaccattgatat 11123044  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11123045 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagtttattgttgaataatgtattacagcgttgctcttggggatg 11123132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39046962 - 39046784
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39046962 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatattta 39046870  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39046869 aaggattaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaaatgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 39046784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42774771 - 42774592
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42774771 acccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 42774678  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42774677 aaggatcaactaaatcattccttctaacaaatgttaaaatgaacatattgttggataatgtattacaacgttgcttttggggatgc 42774592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43893241 - 43893092
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43893241 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 43893148  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttg 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43893147 ttaaaggatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttg 43893092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31752466 - 31752294
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31752466 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaacaatgatattta 31752373  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    || ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31752372 aaagatcaactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtgagcatattgctggataatgttttacaacgttgctcttg 31752294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Original strand, 47239526 - 47239642
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  47239526 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcatttatcaaatgttaaagtgagcatattgctggataatgtt 47239625  T
Q  166 ttacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||||||||    
T  47239626 ttacaacgttgctcttg 47239642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32585443 - 32585325
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaacta-tcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32585443 ataattgtcatgttaataaaaactaatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaattgttaaagtgagcgtattgttagataatgt 32585344  T
Q  165 attacaacgttgctcttgg 183  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  32585343 attacaatgttgctcttgg 32585325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 15987381 - 15987503
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||    
T  15987381 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt-taagtgagagtatagttggataatata 15987479  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  15987480 ttacaacgttgctcttggggatgc 15987503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 4766453 - 4766577
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaa-actatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  4766453 ataattgtcatgttaataaaaaactatcattgatatttaaaggataaactaaatcattacctctaacaaatgttaaagtaaacatattgttggataatgt 4766552  T
Q  165 attacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  4766553 attacaacgttgcttttggggatgc 4766577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 55826765 - 55826888
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagt--gagcttattgttggataatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  55826765 ataattgtcacgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaact--ataattttgtctgacagatgtgaaagtgagagcttattgttggataatg 55826862  T
Q  164 tattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  55826863 tattacaacgttgctcttggggatgc 55826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 53906427 - 53906545
Alignment:
Q  71 tgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattaca 170  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  53906427 tgtcatgttaataaaaactactattgatatttaatggatcaactaaatcattccttctaacaaatgttaaagtgaacgtattgttggattatgtattaca 53906526  T
Q  171 acgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  53906527 acgttgctcttggggatgc 53906545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42299745 - 42299630
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  42299745 ataattgtcttgttaataaaaactactgttgatatttaaatgagcaactaaatcatcctctctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggatattgta 42299646  T
Q  166 ttacaacgttgctctt 181  Q
    ||||||| ||||||||    
T  42299645 ttacaacattgctctt 42299630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 180
Target Start/End: Original strand, 32596325 - 32596438
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32596325 ataattgtcatgtta-taaaaactagcattaatatttgaaggaacaactaaatcattaagtctaacaaattttaaagtgagcatattgttagataatgta 32596423  T
Q  166 ttacaacgttgctct 180  Q
    ||||| | |||||||    
T  32596424 ttacagcattgctct 32596438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Original strand, 28695283 - 28695399
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatg-taaaagtgagcttattgttggataatgt 164  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||     
T  28695283 ataattgtcacgtta-taaaaactatcattaatatttaaaggagcaactaaatcattcggtttaacaaatgttaaaaatgagcgtattgttggataatgc 28695381  T
Q  165 attacaacgttgctcttg 182  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  28695382 attgcaacattgctcttg 28695399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 425777 - 425672
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  425777 ataattgtcatgtta-taaaaactaccattgatatttaaaagaacaactaaatcaatcggtctaacaaatcttaaagtgaacatattgctggataatgta 425679  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  425678 ttacaac 425672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19534409 - 19534304
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  19534409 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatctaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttagataatgga 19534311  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  19534310 ttacaac 19534304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26564771 - 26564681
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  26564771 ataaaaactatcattgatatttaacggaacaactaaatcaatcggtcaaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcattacaa 26564681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 7985262 - 7985368
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |    
T  7985262 ataattgtcgtgttataaaaaactaccgttgatatttaaatgagcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtgaaaatattgatggataatgca 7985361  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  7985362 ttacaac 7985368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 6482177 - 6482280
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||    
T  6482177 ataattgtcgtgtta-taaaaactaacattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgtt-gataattta 6482274  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  6482275 ttacaa 6482280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 12825616 - 12825707
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  12825616 ataaaaactaaaattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaataaatattaaagtgaggatattgttagataatgcattacaac 12825707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 37349063 - 37348972
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  37349063 ataaaaactaccgttgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatcttaaagtgagcatattgctggataatgcattacaac 37348972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 1724465 - 1724547
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatg 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  1724465 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatg 1724547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 183
Target Start/End: Original strand, 13015550 - 13015630
Alignment:
Q  103 aaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13015550 aaaggagcaactaaattattcggtctaacagatgttaaagtgaacatattattggataatgtattacaacattgctcttgg 13015630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 37107365 - 37107260
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |  |||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| |    
T  37107365 ataattgccatgtta-taaaaactaccattggtatttaaagaagcaactaaatcaatcggtctgacaaatattaaaatgagcatattgctggataatgca 37107267  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  37107266 ttacaac 37107260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9230226 - 9230142
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaagg--atcaactaaatcattttgtctaacaaatg-taaaagtgagcttattgttggataat 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  9230226 ataaaaactaccattgatatttaaaggaaagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaagtgaacatattgttggataat 9230142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 53906388 - 53906436
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  53906388 aaactcgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgatatgtcatgtta 53906436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 29755485 - 29755576
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  29755485 ataaacactaccattgatatttaaagaagtaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaaatgagtatattgttggataatgcattacaac 29755576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Original strand, 13770610 - 13770700
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  13770610 ataaaaacgaccattaatatttgaaggagcaactaaatcaatcggtcaaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatacattacaa 13770700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 31918640 - 31918690
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgt-aaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31918640 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta 31918690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 32585502 - 32585460
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 43  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32585502 caaacccgtcccaaatgtaaaaacttactttatgtttatatgt 32585460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Original strand, 47239474 - 47239516
Alignment:
Q  8 gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  47239474 gtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 47239516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 55826705 - 55826755
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgt-aaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  55826705 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta 55826755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 13015333 - 13015382
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13015333 caaacccgtctcgaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 13015382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 26564844 - 26564795
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26564844 caaacccgtcccaaatgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgtta 26564795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 6382354 - 6382404
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgt-aaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  6382354 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatgtta 6382404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11028086 - 11028036
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11028086 caaacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatattgatatgttatgtta 11028036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 1724392 - 1724441
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1724392 caaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgtta 1724441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19534468 - 19534419
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19534468 caaacccgtcacgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 19534419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39188453 - 39188364
Alignment:
Q  83 aaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||| |   |||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||    
T  39188453 aaaaactaccatttatatttaaagaaaaaactaaatcaatcgttctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgggttatgcattacaac 39188364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39728678 - 39728496
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39728678 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttattttgtttg------ataattgttctgttaataaaaactatcattgatat 39728585  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39728584 ttaaaagattaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 39728496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 44953516 - 44953691
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44953516 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 44953609  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44953610 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 44953691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 17146231 - 17146413
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17146231 caaacccttcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 17146324  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  17146325 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtcagcttattgttggataatgtattacaacgtcgctctgggggatgc 17146413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 44106873 - 44107055
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44106873 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 44106966  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44106967 ttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaaatgtgaaagtgagtttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggtgatgc 44107055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44252754 - 44252572
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44252754 caaacccgtcccaaatataaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 44252661  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44252660 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacattgctcttggggatgc 44252572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49580071 - 49579898
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||               || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49580071 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgatatgttatgttattttgtttg------atgattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 49579978  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49579977 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctct 49579898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52198102 - 52197979
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52198102 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgtttgataatgta 52198003  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  52198002 ttacaacgttgctcttggggatgc 52197979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44172633 - 44172452
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44172633 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccactgatat 44172540  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44172539 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcgtattgttggataatgtatta-aacgttgctcttggggatgc 44172452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44179333 - 44179152
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44179333 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccactgatat 44179240  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44179239 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcgtattgttggataatgtatta-aacgttgctcttggggatgc 44179152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49025688 - 49025506
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||               |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49025688 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgttatgttaataaaaactaccattgatat 49025595  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49025594 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaataaatgtgaaagtgagcttattattggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 49025506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52572612 - 52572434
Alignment:
Q  5 cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52572612 cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaa 52572519  T
Q  105 aggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52572518 agtatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggaaaatgtattacaacgttgctcttggggatgc 52572434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 39655354 - 39655529
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39655354 caaacccgtctcaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 39655447  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39655448 ttaaaggatcaactaaataattttctctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 39655529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 10823782 - 10823944
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10823782 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 10823875  T
Q  109 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10823876 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttggataatgtattacaacgttgc 10823944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29284343 - 29284161
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29284343 caaacccgtcccagatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattaatat 29284250  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29284249 ttaaaagatcaactaaataattttgtttaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacattgctcttggagatgc 29284161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20087013 - 20086834
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20087013 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgcttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 20086920  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20086919 aaggatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgggcatattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 20086834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 23547112 - 23547235
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23547112 ataattgtcatgttaataaaaactagcatttatatttaaaggatcaactaaataattttgtttaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 23547211  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  23547212 ctacaacgttgctcttggggatgc 23547235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29842312 - 29842143
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29842312 acccgtctcaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtcatgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 29842219  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctc 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29842218 aaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttgaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctc 29842143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 180
Target Start/End: Original strand, 7469918 - 7470032
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7469918 ataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttcttgtttgataatgta 7470017  T
Q  166 ttacaacgttgctct 180  Q
    |||||||||||||||    
T  7470018 ttacaacgttgctct 7470032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44639281 - 44639100
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44639281 caaacccgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 44639188  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44639187 ttaaaggatcaactaaatca-tttatctaacaaatgtgaaagtgaatttattattggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 44639100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 6738478 - 6738655
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  6738478 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactaccattgatattgg 6738571  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagat 187  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6738572 aaggatcaattaaatcattatgtctaacagatgttaaagtgagcatattggtggataatgtattacaacgttgctcttggagat 6738655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34154366 - 34154251
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  34154366 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattatgtctaacaaatattaaagtgaacatattgttggataatata 34154267  T
Q  166 ttacaacgttgctctt 181  Q
    ||||||||||||||||    
T  34154266 ttacaacgttgctctt 34154251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43582582 - 43582403
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||               |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43582582 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgatatgtcatgttattttgtttg------ataattatcatgtaaataaaaactaccattgatattta 43582489  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43582488 acggatcaactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgttcttggggatgc 43582403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 48306676 - 48306793
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48306676 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtgagcgtattgttcgataatgta 48306775  T
Q  166 ttacaacgttgctcttgg 183  Q
    |||||||||||| |||||    
T  48306776 ttacaacgttgcgcttgg 48306793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 22535981 - 22536104
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22535981 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgtataatgta 22536080  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||| ||  ||||| |||| |||||    
T  22536081 ttataatattgcttttggggatgc 22536104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23580776 - 23580653
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  23580776 ataattgtcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtataacaaatgttaaagtgtggatattgttggataatgta 23580677  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  23580676 ttacaacgttgctcttggggatgc 23580653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34025958 - 34025786
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34025958 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaattaccattgatattta 34025865  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34025864 aaggatcaactaaatcattccatctatcaaatgttaaagggagcatattgttggataatgttttacaacgttgttcttg 34025786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 48390957 - 48391066
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  48390957 ataattgtcatgttaa-aaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttgaagtgaacatattgttggataatgta 48391055  T
Q  166 ttacaacgttg 176  Q
    ||||| |||||    
T  48391056 ttacagcgttg 48391066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 31126949 - 31127040
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31126949 ataaaaactaacattgatattgaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgcattacaac 31127040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 34119606 - 34119501
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34119606 ataattgtcgtgtta-taaaaactaacattgatattgaaatgagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgca 34119508  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  34119507 ttacaac 34119501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 830943 - 830852
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  830943 ataaaaactatcattgatattttaaggagaaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaacgtgagcatattgctggataatgtattacaac 830852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19111669 - 19111578
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  19111669 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaactaaatcaattggtataacaaatgttaaagtgatcatattgttggataatgcattacaac 19111578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 53631838 - 53631747
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  53631838 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcgatcggtctaacaaatgataaagtgagcatattgttggataatgcattacaac 53631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30682769 - 30682664
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||| |    
T  30682769 ataatggtcatgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcaattaaatcattcgttctaacaaatgttaaagtgaacatattgctagataatgca 30682671  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    | |||||    
T  30682670 tcacaac 30682664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 41937142 - 41937247
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  41937142 ataattgtcgtgtta-taaagactaacattgatattgaaatgaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatgttgttggataatgca 41937240  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  41937241 ttacaac 41937247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Original strand, 4557459 - 4557546
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatta 168  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  4557459 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcatta 4557546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 42758322 - 42758217
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||| |    
T  42758322 ataattgccatgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaaatgagcgtatttcttgataatgca 42758224  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  42758223 ttacaac 42758217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Original strand, 4016198 - 4016285
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatta 168  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  4016198 ataaaaactactatcgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcatta 4016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 23910326 - 23910374
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23910326 aaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 23910374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 44
Target Start/End: Original strand, 23154153 - 23154188
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23154153 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 23154188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 109
Target Start/End: Original strand, 23154203 - 23154246
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23154203 ataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaaggat 23154246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 48305722 - 48305760
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 39  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48305722 caaacccgttccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 48305760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 48390901 - 48390947
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48390901 acccgtcccgaacgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 48390947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 7469859 - 7469908
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  7469859 caaacccgtcccaaatgtaaaacactactttatgtggatatgttatgtta 7469908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 30682828 - 30682779
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30682828 caaacccgtcctgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 30682779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 52198162 - 52198121
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 42  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52198162 caaacccgttccaaatgtaaaaaattactttacgttgatatg 52198121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 34154418 - 34154378
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgt 43  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34154418 acccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgt 34154378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 54317078 - 54317022
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgt 137  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  54317078 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaatcaacatgtctaacaaatgt 54317022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Original strand, 22535928 - 22535971
Alignment:
Q  7 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22535928 cgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgtta 22535971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 23580826 - 23580791
Alignment:
Q  9 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta 44  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23580826 tcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgta 23580791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 54317151 - 54317110
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 42  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  54317151 caaacccgtcccaaacgaagaaaattactttatgttgatatg 54317110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14208348 - 14208294
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcatt 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14208348 ataattgtcatgtta-taaaaa-tgtcattgatatttaaaggagcaacaaaatcatt 14208294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10920653 - 10920471
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10920653 caaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 10920560  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10920559 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaggttattgttggataatgtattacaacgttgctattggggatgc 10920471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13830744 - 13830562
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13830744 caaacctgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgtaaataaaaactaccattgatat 13830651  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13830650 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 13830562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 42798129 - 42798252
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42798129 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 42798228  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  42798229 ttacaacgttgctcttggggatgc 42798252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9632394 - 9632212
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9632394 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttttttt------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 9632301  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9632300 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgtttctcttggggatgc 9632212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 18106230 - 18106353
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18106230 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaattaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttggataatgta 18106329  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  18106330 ttacaacgttgctcttggggatgc 18106353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30846894 - 30846771
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30846894 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 30846795  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  30846794 ttacaacgttgctcttggggatgc 30846771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 8916018 - 8916192
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8916018 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 8916111  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8916112 ttaaaggattaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 8916192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 10208511 - 10208693
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10208511 caaaccagtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 10208604  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10208605 ttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaaatgtgaaagtgagtttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 10208693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24414213 - 24414395
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24414213 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 24414306  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24414307 ttaaatgatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttagataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 24414395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 36128247 - 36128370
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36128247 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttggataatgta 36128346  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  36128347 ttacaacgttgctcttggggatgc 36128370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37999491 - 37999309
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37999491 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 37999398  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37999397 ttaaagaatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagattatagttagaaaatgtattacaacgttgctcttggggatgc 37999309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 37472869 - 37472992
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37472869 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 37472968  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  37472969 ttacaacgtttctcttggggatgc 37472992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 13705443 - 13705618
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13705443 aaacccgtcccaaatgtgaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatt 13705536  T
Q  102 taaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttgg 183  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13705537 taaaggatcaactaaatcattccgtataacaaatgttaaagtgagcgtattgttggatgatgtattacaacgttgctcttgg 13705618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37106703 - 37106533
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37106703 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatat-atgtta------ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 37106611  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106610 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgtattacaacgttgctctt 37106533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 12193911 - 12194083
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12193911 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattatcatgttaataaaaactaccattgatattta 12194004  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194005 aaggatcaactacatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 12194083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45115565 - 45115394
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45115565 aaacccatcccaaatgtaaaaaattacattatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatt 45115472  T
Q  102 taaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctc 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45115471 taaaggatcaattaaatcattttgtctaataaatgttaaagtgagcgtattgtttgataatgtattacaatgttgctc 45115394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 7314732 - 7314904
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7314732 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataaatatcatgttaataaaaactatcattgatattta 7314825  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7314826 aaggatcaactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtgggcatattgttggataatgttttacaacgttgctcttg 7314904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45256830 - 45256657
Alignment:
Q  2 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||               |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45256830 aaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttattttgatatgtcttgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatt 45256737  T
Q  102 taaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45256736 taaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacgtattgttgaataatgtactacaacgttgctctt 45256657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 44746264 - 44746372
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44746264 ataaaaactatcattgatatttaaaggagcaaataaattattccgtctaacaaatgttagagtgagcatattgttggataatgtattacaacattgctct 44746363  T
Q  181 tggagatgc 189  Q
    ||| |||||    
T  44746364 tggggatgc 44746372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16105551 - 16105444
Alignment:
Q  82 taaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctt 181  Q
    |||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16105551 taaaaattaccattgatatttcacagatcaactaaatcattatgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattgtttgataatgtattacaacgttgctctt 16105452  T
Q  182 ggagatgc 189  Q
    || |||||    
T  16105451 ggggatgc 16105444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 6028029 - 6028135
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  6028029 ataattgtcgtgttataaaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtgagaatattgatggataatgca 6028128  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  6028129 ttacaac 6028135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 31942326 - 31942430
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  31942326 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcagtcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgca 31942424  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  31942425 ttacaa 31942430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14540705 - 14540629
Alignment:
Q  96 gatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  14540705 gatatttaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgctggataatgcattacaac 14540629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 16226867 - 16226971
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||  |    
T  16226867 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaattagcaactaaatcaattggtctaagaaatgttaaagtgaatatattgttggataataca 16226965  T
Q  166 ttacaa 171  Q
    ||||||    
T  16226966 ttacaa 16226971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 36128187 - 36128237
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgt-aaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36128187 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta 36128237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 42798069 - 42798119
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaa-aattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42798069 caaacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgtta 42798119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 19104995 - 19105086
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  19104995 ataaaaactactatcgatatttaaaagagcaactaaatcgatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgctaaacaatgtattacaac 19105086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 30846954 - 30846904
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  30846954 caaacccgtcccaattgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgtta 30846904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14540789 - 14540740
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14540789 caaatccgtcccgaacgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 14540740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35337719 - 35337650
Alignment:
Q  93 attgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataat 162  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  35337719 attgatatttaaaggaacaaccaaatcatttagttgaaataatgttaaaatgaacttattgttggataat 35337650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 44746190 - 44746231
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 42  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  44746190 caaacccgtcccaaatgtagaaaatcactttatcttgatatg 44746231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37319862 - 37319794
Alignment:
Q  95 tgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatg 163  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  37319862 tgatatttaaagtagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgaacatattgctggataatg 37319794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32853851 - 32853670
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32853851 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgccatgttaataaaaactaccattgatat 32853758  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32853757 ttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatg 32853670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 10142599 - 10142781
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10142599 caaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 10142692  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10142693 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaggttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 10142781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27534691 - 27534509
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534691 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 27534598  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27534597 ttaaagaatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggggatgc 27534509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 10188213 - 10188336
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10188213 ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgta 10188312  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  10188313 ttacaatgttgctcttggggatgc 10188336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2367333 - 2367151
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2367333 caaacccgtcccaaatggaaaaaattactttatgtggatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 2367240  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2367239 ttaaaggataaactaaatcattttgtctaacaaatgttaaagtgagcttattgttggataatgtattacaatgttgctcttggggatgc 2367151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 3484004 - 3484186
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||               ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3484004 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttattttgtttc------ataattgtcatcttaataaaaactaccattgatat 3484097  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3484098 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctctcggggatgc 3484186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12141392 - 12141210
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||               ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12141392 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacgttatgttattttgtttg------ataattgtcatcttaataaaaactaacattgatat 12141299  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12141298 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagtttattgttgaataatgtattactacgttgctcttggggatgc 12141210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5863464 - 5863646
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||               |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5863464 caaacccgtcccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattatcatgttaataaaaactaccattgatat 5863557  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5863558 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaaaaatgtgaaagtgagtttattattggataatgtattacaacgatgctcttggggatgc 5863646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24225705 - 24225524
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24225705 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 24225612  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24225611 ttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtcagcttattgttaaataa-gtattacaaagttgctcttggggatgc 24225524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27738779 - 27738654
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27738779 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtatg------ataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 27738686  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaca 132  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  27738685 ttaaaggagcaactaaatcattatgtttaaca 27738654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14032563 - 14032400
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  14032563 caaacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgttgtgtta-taaaaactatcattgatat 14032471  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14032470 ttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataattcattacaa 14032400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14506034 - 14505929
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14506034 ataattgtcgtgtta-taaaaactaacattgatattgaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgca 14505936  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  14505935 ttacaac 14505929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32532507 - 32532417
Alignment:
Q  71 tgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataa 161  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  32532507 tgtcatgttaataaaaactaccaatgatatttaaaggaccaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattattggataa 32532417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32052988 - 32052883
Alignment:
Q  83 aaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttg 182  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32052988 aaaaacttacattgatatttaaaggattaaataaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgtgcgtattgtaggataatgtattacaatgttgctcttg 32052889  T
Q  183 gagatg 188  Q
    | ||||    
T  32052888 gggatg 32052883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 7394041 - 7394132
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  7394041 ataaaaactaacattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgcattacaac 7394132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 14410973 - 14411078
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  14410973 ataattgtcgtgtta-taaaaaccatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgctggataataca 14411071  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  14411072 ttacaac 14411078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12309579 - 12309405
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||| |||       |||||||||||||    
T  12309579 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttg------ataattgtcatatta-------ctatcattgatat 12309493  T
Q  101 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  12309492 ttaaaggggcaattaaatcatttcgtctaacaaatgttaaagtaaacatattatttgataatgaattacaac-ttgctcttggggatgc 12309405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 12678234 - 12678338
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  12678234 ataattgtcgtgtta-taaaaattatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaataaa-gttaaagtgagcatattgctggataatgca 12678331  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  12678332 ttacaac 12678338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Original strand, 24603010 - 24603082
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattg 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24603010 ataaaaactaccattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattg 24603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14245193 - 14245091
Alignment:
Q  68 aattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtatt 167  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  14245193 aattgtcgtgtta-taaaaactaccattaatatttaaaggagcgactaaatcattcggtctaataaatgttaaagtgaacatattgctagataatgtatt 14245095  T
Q  168 acaa 171  Q
    ||||    
T  14245094 acaa 14245091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14254892 - 14254802
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||| ||||| | | ||||| | |||||||||||||||    
T  14254892 ataaaaactatcattgatatttaaaggagcgattaaatcattcggtctaataaatgttaaagtcaacatattgctagataatgtattacaa 14254802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32532544 - 32532498
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32532544 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgtta 32532498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30816191 - 30816110
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataat 162  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  30816191 ataaaaactaccattgacatttaaaggagcacctaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgtacatattgttggataat 30816110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32053095 - 32053046
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32053095 caaacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgtta 32053046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11762393 - 11762288
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||   |||||||  ||| ||| | ||| ||||| ||||||||| |    
T  11762393 ataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttataggagcaactaaattattggatctaacatttgttaaaataagcatattgctggataatgca 11762295  T
Q  166 ttacaac 172  Q
    |||||||    
T  11762294 ttacaac 11762288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 10188154 - 10188203
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  10188154 caaacccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatattatgtta 10188203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 11762452 - 11762411
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 42  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11762452 caaacccatcccaaatgtagaaaattactttatgttgatatg 11762411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1630 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1545 - 1448
Alignment:
Q  92 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1545 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttggataatatattacaacgttgctcttggggatgc 1448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4205 - 4083
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  4205 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgta 4106  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  4105 ttacaac-ttgctcttggggatgc 4083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4265 - 4215
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgtaatgtta 50  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  4265 caaactcgtcccaaatgtaaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgtta 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Original strand, 32670 - 32792
Alignment:
Q  66 ataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgta 165  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32670 ataatggtcatggtaataaaaactaccagtgatatttaatg-atcaattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttggataatgta 32768  T
Q  166 ttacaacgttgctcttggagatgc 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  32769 ttacaacgttgctcttggggatgc 32792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10301 - 10127
Alignment:
Q  4 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttannnnnnnnnnnnnnnataattgtcatgttaataaaaactatcattgatattta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||               ||||||||||| ||||||||||||| |   |  |||||    
T  10301 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgt-atgtta------ttttgtttgataattgtcatattaataaaaactacc---gtcattta 10212  T
Q  104 aaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctcttggagatg 188  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10211 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataatgtattacaatgttgctcttggggatg 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14708 - 14618
Alignment:
Q  82 taaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  14708 taaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtttaacaaatgttaaagtgagcatattgctggataatgcattacaac 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 171
Target Start/End: Original strand, 14290 - 14389
Alignment:
Q  71 tgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattaca 170  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  14290 tgtcatgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggaacaattaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttggataattcattaca 14388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Original strand, 197481 - 197580
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaacgttgctct 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  197481 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtgagcattttgctggataatgcattataacgtttctct 197580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 197408 - 197449
Alignment:
Q  1 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 42  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  197408 caaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatg 197449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33327 - 33237
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  33327 ataaaaactacgattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaattgttaaagtaaacatattgttggataatgcattacaa 33237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6340 - 6249
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  6340 ataaaaattaccattgaaatttaaaggagcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaacatattgctggataatgcattacaac 6249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33517 - 33427
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaa 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |  || |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  33517 ataaaaactaccattgatatttaaagaagcaattaaatcagtcggtgtaacaaatattaaagtgaacatattgttggataatgcattacaa 33427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36092 - 36008
Alignment:
Q  81 ataaaaactatcattgatatttaaagg--atcaactaaatcattttgtctaacaaatg-taaaagtgagcttattgttggataat 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  36092 ataaaaactaccattgatatttaaaggaaagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaagtgaacatattgttggataat 36008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 90520 - 90440
Alignment:
Q  92 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtgagcttattgttggataatgtattacaac 172  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  90520 cattgatatttaaaggagcaaataaatcaatcggtctaacaaatattaaagtgagtatattgctggataatgcattacaac 90440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University