View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7794_low_8 (Length: 421)

Name: NF7794_low_8
Description: NF7794
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7794_low_8
NF7794_low_8
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (13-248)||(10506160-10506395)
chr3 (13-248)||(54108114-54108349)
chr3 (13-248)||(39241361-39241596)
chr3 (13-248)||(42591787-42592022)
chr3 (13-248)||(47669262-47669497)
chr3 (21-248)||(21568749-21568975)
chr3 (21-259)||(22201608-22201846)
chr3 (21-254)||(26318402-26318635)
chr3 (13-254)||(32633277-32633518)
chr3 (21-253)||(5900643-5900875)
chr3 (14-248)||(44893743-44893977)
chr3 (13-248)||(18464459-18464694)
chr3 (13-251)||(8474058-8474296)
chr3 (13-251)||(51509331-51509567)
chr3 (13-248)||(39664396-39664631)
chr3 (13-248)||(54752166-54752401)
chr3 (13-254)||(29818174-29818415)
chr3 (13-257)||(47303231-47303472)
chr3 (13-252)||(12203763-12204002)
chr3 (13-248)||(15986238-15986472)
chr3 (13-248)||(39951360-39951595)
chr3 (13-248)||(53716298-53716531)
chr3 (13-248)||(16931609-16931844)
chr3 (13-248)||(21969632-21969867)
chr3 (13-248)||(21992068-21992303)
chr3 (13-252)||(41835138-41835377)
chr3 (13-251)||(27801489-27801727)
chr3 (21-256)||(4757714-4757948)
chr3 (13-248)||(24428570-24428805)
chr3 (21-246)||(1994389-1994613)
chr3 (13-248)||(46152618-46152851)
chr3 (13-256)||(4773238-4773480)
chr3 (13-246)||(11256108-11256341)
chr3 (51-248)||(28986392-28986588)
chr3 (13-253)||(22151843-22152083)
chr3 (89-245)||(54107908-54108064)
chr3 (89-246)||(39664189-39664346)
chr3 (89-246)||(5900428-5900585)
chr3 (89-246)||(47303024-47303181)
chr3 (89-245)||(21569033-21569189)
chr3 (92-246)||(26318187-26318341)
chr3 (89-246)||(24428855-24429012)
chr3 (89-246)||(29818465-29818622)
chr3 (89-260)||(1994160-1994331)
chr3 (89-260)||(1999319-1999490)
chr3 (89-252)||(10505947-10506110)
chr3 (89-259)||(27801777-27801947)
chr3 (89-246)||(4757499-4757656)
chr3 (89-246)||(18464744-18464901)
chr3 (100-246)||(45306991-45307137)
chr3 (92-229)||(8473868-8474005)
chr3 (89-246)||(12203556-12203713)
chr3 (89-246)||(22201904-22202061)
chr3 (91-256)||(44894030-44894195)
chr3 (89-246)||(51509124-51509281)
chr3 (108-248)||(45306835-45306975)
chr3 (90-246)||(47669548-47669704)
chr3 (98-248)||(12791473-12791623)
chr3 (89-246)||(53716581-53716738)
chr3 (89-246)||(54752451-54752608)
chr3 (91-246)||(42592074-42592229)
chr3 (93-246)||(15986526-15986679)
chr3 (90-246)||(11256392-11256548)
chr3 (98-246)||(16931903-16932051)
chr3 (89-240)||(4773530-4773681)
chr3 (89-246)||(19883528-19883684)
chr3 (89-207)||(41834970-41835088)
chr3 (89-246)||(21969917-21970076)
chr3 (89-246)||(21992353-21992512)
chr3 (89-246)||(22152133-22152292)
chr3 (123-246)||(44317537-44317660)
chr3 (123-246)||(13866025-13866148)
chr3 (123-246)||(49528154-49528277)
chr3 (134-253)||(15790677-15790796)
chr3 (13-131)||(19883359-19883477)
chr3 (133-238)||(7163463-7163568)
chr3 (125-253)||(7681447-7681576)
chr3 (92-223)||(46152904-46153032)
chr3 (89-184)||(39241646-39241741)
chr3 (89-178)||(32633138-32633227)
chr3 (140-246)||(28985514-28985620)
chr3 (121-227)||(20963545-20963651)
chr3 (150-246)||(30681766-30681862)
chr3 (132-246)||(30681034-30681148)
chr3 (89-150)||(28986261-28986322)
chr3 (146-248)||(15791454-15791551)
chr3 (121-227)||(49529076-49529182)
chr3 (130-199)||(39951682-39951751)
chr3 (112-248)||(43844346-43844482)
chr3 (165-248)||(42853249-42853331)
chr3 (121-227)||(13866920-13867026)
chr3 (174-252)||(50394333-50394411)
chr3 (123-240)||(8327697-8327814)
chr3 (150-227)||(43839984-43840061)
chr3 (149-259)||(12992297-12992407)
chr3 (156-227)||(52705483-52705554)
chr3 (121-227)||(44316651-44316756)
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (13-253)||(23756012-23756252)
chr4 (13-254)||(14985328-14985569)
chr4 (21-248)||(53751122-53751349)
chr4 (13-253)||(33091665-33091905)
chr4 (21-248)||(15477865-15478092)
chr4 (21-254)||(8591966-8592199)
chr4 (21-246)||(38339497-38339722)
chr4 (21-248)||(16038014-16038241)
chr4 (21-248)||(30683748-30683975)
chr4 (21-248)||(39448708-39448935)
chr4 (13-246)||(50768826-50769059)
chr4 (13-253)||(19088553-19088793)
chr4 (13-248)||(1433483-1433718)
chr4 (13-248)||(42855551-42855786)
chr4 (13-259)||(44991490-44991736)
chr4 (21-251)||(46849889-46850119)
chr4 (21-252)||(24898188-24898419)
chr4 (13-248)||(36122645-36122879)
chr4 (13-248)||(41752028-41752262)
chr4 (21-248)||(50508677-50508904)
chr4 (13-248)||(52557299-52557534)
chr4 (13-248)||(53259350-53259585)
chr4 (13-248)||(44957392-44957627)
chr4 (13-239)||(43734498-43734724)
chr4 (13-229)||(6711985-6712201)
chr4 (21-248)||(623899-624126)
chr4 (21-248)||(12817809-12818036)
chr4 (13-259)||(21763393-21763639)
chr4 (13-248)||(53995146-53995382)
chr4 (21-258)||(25182032-25182269)
chr4 (13-207)||(19508625-19508819)
chr4 (13-214)||(43566590-43566791)
chr4 (13-248)||(37206639-37206874)
chr4 (13-248)||(41878071-41878305)
chr4 (89-246)||(44991284-44991441)
chr4 (89-246)||(24898477-24898634)
chr4 (91-261)||(20888133-20888303)
chr4 (89-246)||(42855344-42855501)
chr4 (89-259)||(43734278-43734448)
chr4 (89-246)||(6505542-6505698)
chr4 (89-246)||(8592257-8592414)
chr4 (89-246)||(25181817-25181974)
chr4 (91-246)||(43566383-43566538)
chr4 (92-246)||(1433276-1433430)
chr4 (92-246)||(50769112-50769266)
chr4 (89-246)||(14985619-14985776)
chr4 (89-246)||(33091458-33091615)
chr4 (93-246)||(53750907-53751060)
chr4 (89-246)||(53994939-53995096)
chr4 (89-246)||(8398036-8398193)
chr4 (89-246)||(15477650-15477807)
chr4 (89-246)||(16037799-16037956)
chr4 (89-246)||(41751823-41751978)
chr4 (89-246)||(52557092-52557249)
chr4 (108-248)||(44125777-44125917)
chr4 (91-246)||(38339782-38339937)
chr4 (89-246)||(46849674-46849831)
chr4 (89-240)||(19508423-19508575)
chr4 (107-255)||(25269306-25269454)
chr4 (92-246)||(30683531-30683686)
chr4 (93-244)||(41877867-41878017)
chr4 (89-246)||(19088346-19088503)
chr4 (89-261)||(6712251-6712421)
chr4 (88-240)||(12818093-12818245)
chr4 (89-227)||(623703-623841)
chr4 (89-246)||(36122438-36122595)
chr4 (89-246)||(39448493-39448650)
chr4 (285-374)||(40123543-40123632)
chr4 (89-205)||(53259184-53259300)
chr4 (89-246)||(21763185-21763343)
chr4 (91-229)||(23755440-23755578)
chr4 (93-196)||(50508512-50508615)
chr4 (108-254)||(55022281-55022426)
chr4 (113-246)||(44957669-44957802)
chr4 (91-192)||(37206486-37206587)
chr4 (139-248)||(4513254-4513363)
chr4 (96-246)||(49135928-49136082)
chr4 (118-246)||(44125627-44125755)
chr4 (129-248)||(47602946-47603065)
chr4 (129-248)||(52692768-52692886)
chr4 (13-91)||(23755630-23755708)
chr4 (13-87)||(6505748-6505822)
chr4 (153-248)||(52692027-52692122)
chr4 (150-248)||(47603710-47603808)
chr4 (163-254)||(31214159-31214250)
chr4 (165-246)||(55022424-55022504)
chr4 (252-281)||(40123659-40123688)
chr4 (175-227)||(11102285-11102337)
chr4 (187-227)||(22307463-22307503)
chr4 (169-205)||(46621231-46621267)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (13-260)||(5938025-5938272)
chr6 (13-248)||(34890647-34890882)
chr6 (13-248)||(7269954-7270191)
chr6 (13-253)||(5639385-5639625)
chr6 (13-248)||(18052959-18053194)
chr6 (21-253)||(26600355-26600587)
chr6 (13-248)||(9046089-9046324)
chr6 (21-248)||(21856775-21857002)
chr6 (13-248)||(24744332-24744566)
chr6 (13-248)||(34994592-34994827)
chr6 (13-246)||(6137590-6137822)
chr6 (13-248)||(5310829-5311064)
chr6 (13-248)||(32993227-32993462)
chr6 (25-254)||(31237743-31237972)
chr6 (13-252)||(2517001-2517240)
chr6 (13-255)||(21540189-21540432)
chr6 (13-248)||(32753180-32753411)
chr6 (13-212)||(7270668-7270867)
chr6 (25-254)||(31247113-31247342)
chr6 (21-246)||(6236141-6236366)
chr6 (21-205)||(3423390-3423574)
chr6 (13-196)||(26957017-26957200)
chr6 (66-246)||(6532197-6532377)
chr6 (21-174)||(25176877-25177030)
chr6 (89-259)||(9046374-9046544)
chr6 (89-246)||(35167495-35167652)
chr6 (89-246)||(15932844-15933001)
chr6 (89-253)||(5937811-5937975)
chr6 (89-252)||(34994379-34994542)
chr6 (89-246)||(978420-978577)
chr6 (89-246)||(21856560-21856717)
chr6 (89-229)||(26600635-26600775)
chr6 (98-246)||(26957258-26957406)
chr6 (89-256)||(3423165-3423332)
chr6 (89-248)||(6235924-6236083)
chr6 (95-246)||(25176668-25176819)
chr6 (89-246)||(32753461-32753618)
chr6 (89-240)||(34890932-34891083)
chr6 (92-246)||(2517293-2517447)
chr6 (91-246)||(6137384-6137538)
chr6 (89-246)||(31238034-31238191)
chr6 (89-261)||(18053241-18053413)
chr6 (89-244)||(5311114-5311269)
chr6 (93-246)||(32993020-32993173)
chr6 (89-246)||(31247404-31247561)
chr6 (96-246)||(10412796-10412946)
chr6 (13-146)||(35167702-35167837)
chr6 (123-246)||(17244669-17244792)
chr6 (92-246)||(7270920-7271074)
chr6 (116-252)||(14276398-14276534)
chr6 (89-246)||(7270241-7270398)
chr6 (89-246)||(24744609-24744765)
chr6 (140-259)||(7438796-7438915)
chr6 (129-255)||(15286341-15286467)
chr6 (100-246)||(6228735-6228880)
chr6 (151-256)||(15932725-15932830)
chr6 (100-248)||(34517991-34518139)
chr6 (108-205)||(3035926-3036024)
chr6 (129-254)||(29261279-29261404)
chr6 (150-254)||(34517269-34517373)
chr6 (129-248)||(29260534-29260652)
chr6 (176-254)||(25180223-25180301)
chr6 (147-260)||(34251545-34251656)
chr6 (121-248)||(6229643-6229769)
chr6 (121-223)||(17245580-17245682)
chr6 (133-226)||(27829297-27829390)
chr6 (179-248)||(35167833-35167902)
chr6 (89-130)||(5639294-5639335)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (13-255)||(38588584-38588825)
chr8 (13-253)||(7949410-7949650)
chr8 (13-253)||(27473283-27473523)
chr8 (13-248)||(45077415-45077650)
chr8 (13-253)||(45276808-45277048)
chr8 (13-248)||(15048402-15048637)
chr8 (13-248)||(33295896-33296131)
chr8 (13-254)||(1432128-1432369)
chr8 (13-253)||(1651784-1652023)
chr8 (13-253)||(1740160-1740399)
chr8 (13-248)||(44594813-44595047)
chr8 (16-249)||(27669418-27669651)
chr8 (21-248)||(5152754-5152980)
chr8 (13-248)||(15871833-15872068)
chr8 (25-248)||(5435124-5435347)
chr8 (25-251)||(11173858-11174084)
chr8 (13-246)||(1646719-1646951)
chr8 (13-254)||(7535045-7535286)
chr8 (13-248)||(1869937-1870173)
chr8 (13-248)||(40048070-40048293)
chr8 (92-246)||(15048690-15048844)
chr8 (89-254)||(33819782-33819947)
chr8 (14-250)||(37569527-37569764)
chr8 (89-245)||(37569320-37569476)
chr8 (89-246)||(34470832-34470989)
chr8 (89-246)||(45276602-45276759)
chr8 (89-246)||(15871626-15871783)
chr8 (89-251)||(40048342-40048504)
chr8 (89-246)||(1646506-1646663)
chr8 (89-246)||(5152540-5152696)
chr8 (89-246)||(5434905-5435062)
chr8 (89-246)||(11707755-11707912)
chr8 (90-246)||(1870224-1870380)
chr8 (60-183)||(18298488-18298611)
chr8 (89-246)||(1739953-1740110)
chr8 (89-229)||(38588875-38589015)
chr8 (89-246)||(27473077-27473233)
chr8 (94-246)||(40660179-40660331)
chr8 (91-248)||(40659986-40660143)
chr8 (89-238)||(27669709-27669857)
chr8 (100-248)||(22763232-22763380)
chr8 (89-246)||(44594606-44594763)
chr8 (129-246)||(24666006-24666123)
chr8 (165-248)||(11920136-11920219)
chr8 (125-252)||(33295735-33295862)
chr8 (89-246)||(7534847-7534995)
chr8 (13-98)||(11707962-11708047)
chr8 (21-81)||(34470714-34470774)
chr8 (13-84)||(24659408-24659479)
chr8 (89-246)||(45077226-45077364)
chr8 (150-248)||(22762516-22762614)
chr8 (129-205)||(24652898-24652974)
chr8 (169-246)||(24652828-24652905)
chr8 (129-227)||(15740637-15740735)
chr8 (172-246)||(15741603-15741677)
chr8 (173-246)||(12643888-12643961)
chr8 (163-239)||(33819975-33820051)
chr8 (170-249)||(29769365-29769444)
chr8 (198-248)||(18298612-18298661)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (21-252)||(41453225-41453456)
chr7 (13-253)||(6356763-6357003)
chr7 (13-227)||(17359205-17359419)
chr7 (13-255)||(48626275-48626517)
chr7 (13-250)||(33716589-33716826)
chr7 (13-248)||(31638155-31638390)
chr7 (13-248)||(44332731-44332966)
chr7 (13-229)||(28297841-28298057)
chr7 (13-248)||(10526314-10526548)
chr7 (13-248)||(21391402-21391637)
chr7 (13-254)||(19681707-19681948)
chr7 (13-248)||(41191897-41192132)
chr7 (13-248)||(7579084-7579319)
chr7 (13-256)||(8937061-8937304)
chr7 (13-252)||(6356285-6356523)
chr7 (25-248)||(8542502-8542725)
chr7 (13-249)||(35146910-35147137)
chr7 (21-248)||(28286337-28286564)
chr7 (13-248)||(41751653-41751888)
chr7 (13-229)||(43247437-43247653)
chr7 (13-248)||(34037123-34037358)
chr7 (15-233)||(36423387-36423605)
chr7 (56-248)||(1114057-1114249)
chr7 (13-178)||(40673219-40673382)
chr7 (89-246)||(8936854-8937011)
chr7 (89-246)||(10526598-10526755)
chr7 (89-246)||(35146704-35146861)
chr7 (89-246)||(41453010-41453167)
chr7 (89-239)||(28286129-28286279)
chr7 (89-261)||(6356573-6356745)
chr7 (76-259)||(7909279-7909461)
chr7 (89-246)||(1114333-1114490)
chr7 (89-246)||(7578877-7579034)
chr7 (89-246)||(17749940-17750097)
chr7 (91-246)||(6357055-6357210)
chr7 (92-246)||(48626068-48626222)
chr7 (93-246)||(31075485-31075638)
chr7 (89-246)||(41191688-41191844)
chr7 (95-239)||(7909460-7909604)
chr7 (89-229)||(36423657-36423797)
chr7 (91-246)||(21391195-21391350)
chr7 (89-246)||(19681500-19681657)
chr7 (91-246)||(31637948-31638103)
chr7 (84-254)||(4931556-4931726)
chr7 (71-227)||(27738935-27739090)
chr7 (95-246)||(8542793-8542943)
chr7 (89-237)||(28298107-28298255)
chr7 (95-229)||(17363532-17363664)
chr7 (118-248)||(16867710-16867840)
chr7 (134-258)||(8416478-8416602)
chr7 (123-246)||(4155603-4155726)
chr7 (128-246)||(36673980-36674098)
chr7 (129-248)||(36282789-36282908)
chr7 (89-239)||(41751938-41752088)
chr7 (108-248)||(41891969-41892109)
chr7 (150-248)||(8417285-8417383)
chr7 (129-257)||(29277671-29277799)
chr7 (89-223)||(33716872-33717005)
chr7 (129-254)||(36283533-36283659)
chr7 (95-154)||(17359479-17359538)
chr7 (74-157)||(38447600-38447682)
chr7 (165-261)||(36674095-36674189)
chr7 (121-248)||(28263499-28263626)
chr7 (129-207)||(32946669-32946747)
chr7 (100-205)||(28264587-28264692)
chr7 (165-246)||(29276880-29276961)
chr7 (191-248)||(36423790-36423847)
chr7 (129-227)||(41893403-41893501)
chr7 (89-201)||(40673058-40673169)
chr7 (13-53)||(17750147-17750187)
chr7 (13-48)||(17363437-17363472)
chr7 (174-248)||(38677051-38677125)
chr7 (170-248)||(40263616-40263694)
chr7 (121-250)||(4156509-4156638)
chr7 (170-227)||(43050408-43050465)
chr7 (129-205)||(29276950-29277026)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (13-246)||(29472247-29472480)
chr2 (13-248)||(38332707-38332942)
chr2 (21-248)||(15744460-15744687)
chr2 (13-251)||(7469166-7469404)
chr2 (25-257)||(13192982-13193214)
chr2 (13-232)||(2148098-2148317)
chr2 (13-248)||(15405968-15406202)
chr2 (13-248)||(26181912-26182147)
chr2 (21-261)||(19847539-19847778)
chr2 (13-248)||(24372179-24372414)
chr2 (13-248)||(16305028-16305263)
chr2 (13-248)||(8174097-8174332)
chr2 (14-248)||(34735556-34735790)
chr2 (21-253)||(10991849-10992081)
chr2 (13-253)||(19815916-19816156)
chr2 (13-246)||(24138718-24138952)
chr2 (21-205)||(12860587-12860771)
chr2 (13-248)||(36713591-36713823)
chr2 (21-246)||(7496200-7496424)
chr2 (15-248)||(41474085-41474318)
chr2 (73-246)||(33470195-33470368)
chr2 (92-248)||(24138071-24138227)
chr2 (92-243)||(29472533-29472684)
chr2 (89-246)||(12860385-12860542)
chr2 (89-246)||(15405761-15405918)
chr2 (89-248)||(17052342-17052501)
chr2 (89-260)||(8173876-8174047)
chr2 (89-251)||(30898589-30898751)
chr2 (89-246)||(16305313-16305470)
chr2 (92-252)||(19815703-19815863)
chr2 (89-260)||(24371958-24372129)
chr2 (92-246)||(26181705-26181859)
chr2 (89-240)||(34735354-34735505)
chr2 (95-246)||(38332974-38333125)
chr2 (89-239)||(13193276-13193426)
chr2 (89-246)||(7495985-7496142)
chr2 (89-246)||(2147890-2148048)
chr2 (92-246)||(41474373-41474527)
chr2 (91-221)||(42834452-42834582)
chr2 (89-205)||(10992139-10992255)
chr2 (89-229)||(36713873-36714013)
chr2 (122-252)||(8444821-8444951)
chr2 (141-248)||(17050932-17051039)
chr2 (139-246)||(15744785-15744892)
chr2 (141-248)||(17032596-17032703)
chr2 (13-144)||(17052164-17052292)
chr2 (134-258)||(8962353-8962477)
chr2 (93-251)||(7469458-7469608)
chr2 (150-248)||(8963166-8963264)
chr2 (135-248)||(8445123-8445236)
chr2 (121-226)||(23992162-23992267)
chr2 (170-205)||(16655911-16655946)
chr2 (169-205)||(33819699-33819735)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (21-248)||(9989326-9989553)
chr5 (13-248)||(32288289-32288523)
chr5 (13-248)||(24040297-24040534)
chr5 (21-254)||(2182940-2183173)
chr5 (13-248)||(36440412-36440647)
chr5 (13-229)||(35569992-35570208)
chr5 (13-248)||(37424474-37424711)
chr5 (21-246)||(27185879-27186103)
chr5 (21-253)||(25567208-25567440)
chr5 (13-246)||(38958936-38959168)
chr5 (13-248)||(34264560-34264799)
chr5 (51-252)||(11315958-11316158)
chr5 (89-246)||(38958729-38958886)
chr5 (89-255)||(27186161-27186327)
chr5 (92-246)||(35569780-35569934)
chr5 (89-246)||(36440205-36440362)
chr5 (92-248)||(16860306-16860462)
chr5 (90-246)||(39325417-39325573)
chr5 (91-246)||(32288083-32288237)
chr5 (89-246)||(24040090-24040247)
chr5 (89-246)||(25182941-25183098)
chr5 (82-248)||(39325636-39325802)
chr5 (89-246)||(37424267-37424424)
chr5 (89-229)||(2183231-2183371)
chr5 (89-229)||(9989611-9989751)
chr5 (91-223)||(11316244-11316376)
chr5 (123-246)||(19184602-19184725)
chr5 (94-229)||(29198974-29199109)
chr5 (108-246)||(1140080-1140210)
chr5 (134-246)||(34264356-34264479)
chr5 (129-252)||(31756630-31756753)
chr5 (13-86)||(16860632-16860705)
chr5 (121-253)||(19185504-19185636)
chr5 (13-86)||(16860515-16860588)
chr5 (173-248)||(33817656-33817731)
chr5 (16-98)||(29199167-29199249)
chr5 (158-260)||(2597377-2597479)
chr5 (182-246)||(19128434-19128498)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (13-254)||(1762886-1763127)
chr1 (21-248)||(16023900-16024127)
chr1 (13-252)||(20306001-20306240)
chr1 (21-248)||(37304031-37304258)
chr1 (13-252)||(12127265-12127507)
chr1 (13-257)||(23476553-23476797)
chr1 (21-248)||(2064431-2064658)
chr1 (21-248)||(12481279-12481506)
chr1 (13-253)||(45052901-45053141)
chr1 (13-248)||(35612294-35612529)
chr1 (13-253)||(8762611-8762851)
chr1 (21-248)||(6798027-6798254)
chr1 (13-253)||(3089340-3089580)
chr1 (13-253)||(25995782-25996022)
chr1 (13-248)||(49140355-49140589)
chr1 (15-248)||(27547883-27548116)
chr1 (13-246)||(38127714-38127947)
chr1 (13-248)||(9006403-9006637)
chr1 (13-248)||(37284940-37285174)
chr1 (51-255)||(45843367-45843571)
chr1 (13-254)||(37585905-37586146)
chr1 (13-248)||(49643883-49644117)
chr1 (13-192)||(27400636-27400815)
chr1 (21-248)||(37576184-37576411)
chr1 (21-205)||(31703660-31703844)
chr1 (22-247)||(4330058-4330283)
chr1 (89-246)||(44322948-44323105)
chr1 (13-246)||(39486414-39486637)
chr1 (89-246)||(12481064-12481221)
chr1 (89-254)||(4696879-4697044)
chr1 (89-254)||(9006188-9006353)
chr1 (89-246)||(49643676-49643833)
chr1 (89-252)||(37304316-37304479)
chr1 (92-246)||(12127062-12127216)
chr1 (89-246)||(16024185-16024342)
chr1 (89-246)||(27547674-27547831)
chr1 (89-246)||(49140148-49140305)
chr1 (92-248)||(26723092-26723248)
chr1 (89-243)||(26707204-26707358)
chr1 (92-246)||(35612087-35612241)
chr1 (89-246)||(23476346-23476503)
chr1 (89-246)||(37576469-37576626)
chr1 (89-246)||(1762679-1762836)
chr1 (93-246)||(37585698-37585851)
chr1 (95-251)||(38000489-38000645)
chr1 (91-246)||(45052695-45052849)
chr1 (93-239)||(37284740-37284886)
chr1 (89-246)||(8760277-8760434)
chr1 (89-246)||(20306290-20306447)
chr1 (89-246)||(31703901-31704058)
chr1 (89-248)||(39486205-39486364)
chr1 (89-246)||(6797812-6797969)
chr1 (122-248)||(23598075-23598201)
chr1 (13-96)||(26707408-26707491)
chr1 (129-248)||(34967050-34967169)
chr1 (129-252)||(5537132-5537255)
chr1 (129-248)||(46593559-46593677)
chr1 (139-257)||(10831125-10831243)
chr1 (13-95)||(44322816-44322898)
chr1 (150-255)||(10831935-10832040)
chr1 (144-248)||(37467563-37467667)
chr1 (13-91)||(4697094-4697172)
chr1 (129-248)||(34966306-34966425)
chr1 (129-205)||(49837417-49837493)
chr1 (129-248)||(5536401-5536520)
chr1 (165-248)||(13183769-13183852)
chr1 (129-246)||(32047748-32047865)
chr1 (129-252)||(28884016-28884139)
chr1 (129-248)||(46592815-46592934)
chr1 (165-248)||(13109191-13109274)
chr1 (165-250)||(4697163-4697248)
chr1 (89-147)||(25996072-25996130)
chr1 (129-239)||(28884751-28884861)
chr1 (178-251)||(46289324-46289397)
chr1 (129-246)||(32048510-32048627)
chr1 (129-253)||(37466800-37466922)
chr1 (210-255)||(46289405-46289450)
chr1 (171-248)||(49838756-49838832)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (21-254)||(19705-19938)
scaffold0182 (89-246)||(19996-20153)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (13-248)||(50688-50924)
scaffold0019 (89-246)||(50481-50638)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (13-248)||(18276-18511)
scaffold0340 (89-246)||(18561-18718)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (21-248)||(14355-14582)
scaffold0134 (89-246)||(14140-14297)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (13-248)||(45759-45994)
scaffold0037 (89-246)||(56424-56581)
scaffold0037 (89-246)||(63549-63706)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (21-246)||(72767-72991)
scaffold0029 (89-246)||(73049-73206)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (21-248)||(24165-24392)
scaffold0186 (95-246)||(24456-24607)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (13-229)||(349095-349311)
scaffold0003 (89-244)||(349361-349515)
scaffold0003 (89-246)||(113654-113811)
scaffold0003 (13-98)||(113519-113604)
scaffold0003 (122-248)||(113396-113522)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (13-248)||(8432-8666)
scaffold0221 (89-246)||(8716-8873)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (21-246)||(20756-20980)
scaffold0220 (89-137)||(21038-21086)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (13-246)||(21517-21749)
scaffold0115 (99-246)||(22451-22598)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (13-248)||(15456-15686)
scaffold0072 (89-246)||(15736-15893)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (13-205)||(6044-6233)
scaffold0246 (89-227)||(6283-6420)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (13-174)||(82070-82231)
scaffold0032 (89-246)||(81863-82020)
scaffold0032 (145-252)||(90782-90889)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (92-196)||(14246-14350)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (94-251)||(147133-147289)
scaffold0001 (121-229)||(144042-144150)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (100-227)||(9806-9932)
scaffold0225 (121-227)||(10876-10982)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 10506160 - 10506395
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10506160 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 10506259  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10506260 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 10506359  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10506360 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 10506395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 54108114 - 54108349
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  54108114 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 54108213  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  54108214 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacactgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 54108313  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54108314 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 54108349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39241596 - 39241361
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  39241596 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacattaacg 39241497  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39241496 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 39241397  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  39241396 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 39241361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42592022 - 42591787
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  42592022 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 42591923  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  42591922 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggacaaatccgata 42591823  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42591822 ccgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 42591787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47669497 - 47669262
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  47669497 aatatctatcactatttaatcataatatcttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccttaacg 47669398  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  47669397 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggactaatccgata 47669298  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47669297 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 47669262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21568975 - 21568749
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21568975 tcactatttaatcataatatcttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaggttagaggacc-acataacacaaaccctaacatttatttg 21568877  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  21568876 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgataccaattaa 21568777  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21568776 atagttagaggatcaaaaagataattta 21568749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22201846 - 22201608
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22201846 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccttaacgtttatttg 22201747  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  22201746 aataaacctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacagaaataaatcaatttttatttagaggatcaatccgataccaattaa 22201647  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  22201646 atagttagaggaccaaaaatgtaatttaaccttaaattt 22201608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 26318402 - 26318635
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  26318402 tcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacactaacgtttatttg 26318501  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||    
T  26318502 aataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggattaatccgataccaattaa 26318601  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26318602 atagttagatgaccaaaaaggtaatttagccttt 26318635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 32633277 - 32633518
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  32633277 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 32633376  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32633377 tttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgata 32633476  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
     | |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  32633477 acaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagccttt 32633518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 5900643 - 5900875
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5900643 tcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 5900742  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  5900743 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 5900842  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  5900843 atagttagaggaccaaaaatgtaatttagcctt 5900875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44893977 - 44893743
Alignment:
Q  14 atatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacat 113  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  44893977 atatcagtcactatttgatcataatatcttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgt 44893878  T
Q  114 ttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44893877 ttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatccgatac 44893778  T
Q  214 ctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||| |||||||    
T  44893777 caattaaatagttagagaaccaaaaagataattta 44893743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18464694 - 18464459
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||     
T  18464694 aatatcagtcactatttaaccataataccttaacaatgcatatgaccaaaatgatactaataaataaagctataggacctacataacacaaaccctaacg 18464595  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18464594 tttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaata 18464495  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  18464494 ccaattaaatagttagaggagcaaaaatgtaattta 18464459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 8474058 - 8474296
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  8474058 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacactaacg 8474157  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||    
T  8474158 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtcataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggactaattcgata 8474257  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8474258 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttaacc 8474296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 51509331 - 51509567
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51509331 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaaccctaaca 51509430  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  51509431 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttaga-gactaatccaata 51509529  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    || ||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  51509530 ccaattaaatagttggagga-caaaaatgtaatttaacc 51509567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 39664396 - 39664631
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  39664396 aatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaactctaaca 39664495  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||    
T  39664496 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatctgata 39664595  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  39664596 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 39664631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 54752401 - 54752166
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  54752401 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataatg 54752302  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  54752301 tttatttgaataaaactaacagaaaggatcaaatgtagtaacggtgagaaacttatatgaccgaaataaatcaatttttagttacaggaccaatcttata 54752202  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  54752201 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 54752166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29818415 - 29818174
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  29818415 aatatcagtcactatttaatcataataccttaataaaacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccatataacacaaaccctaacg 29818316  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||    
T  29818315 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttatttagaggactaatctgata 29818216  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29818215 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttaaccttt 29818174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Original strand, 47303231 - 47303472
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  47303231 aatatcagtcactatttaatcataataccttaataaggcatatgatcaaaatgata-taataaataaagttagaggacccacataaca--aactctaacg 47303327  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  47303328 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttacttagaggaccaatccgata 47303427  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaat 257  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  47303428 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaaacctataat 47303472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 12203763 - 12204002
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||     
T  12203763 aatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaaacatattaccaaaatgatactaataaataaagttagaggtcccacataacacaaactctaacg 12203862  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  12203863 tttatttgaataaaactatcagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgata 12203962  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    || |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  12203963 ccaattaaatagttaggggaccaaaacggtaatttaacct 12204002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15986472 - 15986238
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  15986472 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacacga-ataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacataacacaaactctaaca 15986374  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||    
T  15986373 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagctaggggactaatccgata 15986274  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15986273 ccaattaaatagttagaggatcaaaaagataattta 15986238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39951595 - 39951360
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  39951595 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaaaggacccacataacacaaactctaaca 39951496  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  39951495 tttatttgaataaaactaacataaagaactaaatatagtaacgatgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatttttaattagaggactaatccgata 39951396  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39951395 ccaattaaatagtcagatgatcaaaagggtaattta 39951360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53716531 - 53716298
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  53716531 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg-cccacgtaacacaaaccctaacg 53716433  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  53716432 tttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 53716333  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  53716332 ccaattaaatagttagagga-caaaaaagtaattta 53716298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16931844 - 16931609
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16931844 aatatcagtaactatttaatcttaataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 16931745  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  16931744 tatatttgtataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagcaccaatcc-gta 16931646  T
Q  213 cc-tattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  16931645 ccaaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 16931609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21969867 - 21969632
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  21969867 aatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataagaccaaaacgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 21969768  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||    
T  21969767 tttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgtta 21969668  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21969667 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 21969632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21992303 - 21992068
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  21992303 aatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataagaccaaaacgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 21992204  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||    
T  21992203 tttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgtta 21992104  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21992103 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 21992068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 41835138 - 41835377
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||     
T  41835138 aatatcagtcactatttaatcaaaatacattaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagatgacccatgtaacacaaacactaacg 41835237  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||    
T  41835238 tttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattaaagaactaattcaata 41835337  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
     | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41835338 tcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttaacct 41835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27801727 - 27801489
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||     
T  27801727 aatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatagaaccaaaatgatattaataaataaagttagaggatccacataacagaaactctaacg 27801628  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27801627 tttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatctagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 27801528  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    || |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  27801527 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatataatttaacc 27801489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 4757714 - 4757948
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4757714 tcactatttgatcataattc-ttatcaaggaatagaaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 4757812  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  4757813 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 4757912  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaa 256  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| | |||||||    
T  4757913 atagttagaggaccaaaaatgtaattaagcctttaa 4757948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24428805 - 24428570
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||     
T  24428805 aatatcagtcactatttaatcataataccttaagaaggcataggagcaaaatgatactaataaattaagttagaggatccacataacacaaatcccaacg 24428706  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  24428705 tttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 24428606  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  24428605 ccaattgaatagttagaggaccaaaaagataattta 24428570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 1994389 - 1994613
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1994389 tcactatttaatcataattc-ttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 1994487  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||    
T  1994488 aataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 1994587  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||    
T  1994588 atagttagaggaccaaaaatgtaatt 1994613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46152851 - 46152618
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||     
T  46152851 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagatg--ccagataacacaaaccctaacg 46152754  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||     
T  46152753 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtgatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaattcgatg 46152654  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  46152653 ccaattaaatagttagaggaccaaagatgtaattta 46152618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4773480 - 4773238
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||     
T  4773480 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacaaaaaacctaac- 4773382  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||    
T  4773381 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatctgata 4773282  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaa 256  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  4773281 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctttaa 4773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11256341 - 11256108
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||     
T  11256341 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacacacataacagaaactctaacg 11256242  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||    
T  11256241 tttatttgaataaaactatcaaaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaaaggatcgaaataaattattttttagttagaggatcaatccgata 11256142  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  11256141 ccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaatt 11256108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 28986392 - 28986588
Alignment:
Q  51 catatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28986392 catatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaat-tag 28986490  T
Q  151 taacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28986491 taacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaattta 28986588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22152083 - 22151843
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |     
T  22152083 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctatcg 22151984  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||    
T  22151983 tttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgtta 22151884  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||    
T  22151883 ccaattaaatagttataggaccaaaaatgtaatttagcctt 22151843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54108064 - 54107908
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54108064 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 54107965  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaat 245  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54107964 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaat 54107908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39664346 - 39664189
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39664346 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattt 39664247  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  39664246 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 39664189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5900585 - 5900428
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5900585 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 5900486  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5900485 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaatt 5900428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47303181 - 47303024
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47303181 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatt 47303082  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||| ||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47303081 tttaattagaggactgattcaataccaattaaatagttagatgatcaaaaaagtaatt 47303024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Original strand, 21569033 - 21569189
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21569033 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 21569132  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaat 245  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21569133 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaat 21569189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26318341 - 26318187
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26318341 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 26318242  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  26318241 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaaggtaatt 26318187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 24428855 - 24429012
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24428855 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 24428954  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24428955 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaatt 24429012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 29818465 - 29818622
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29818465 acccacataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 29818564  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29818565 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaataattagaagatcaaaaaggtaatt 29818622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1994331 - 1994160
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994331 acccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 1994232  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattta 260  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| |||||| | |||| ||||||    
T  1994231 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccttcaattta 1994160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1999490 - 1999319
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1999490 acccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 1999391  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattta 260  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| |||||| | |||| ||||||    
T  1999390 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccttcaattta 1999319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10506110 - 10505947
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10506110 acccatatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10506011  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  10506010 tttagttaaaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacct 10505947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 27801777 - 27801947
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27801777 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattt 27801876  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  27801877 tttaattagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccttttattt 27801947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4757656 - 4757499
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757656 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagaataaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 4757557  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  4757556 tttagttagaggaccaatccgattccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 4757499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 18464744 - 18464901
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18464744 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatt 18464843  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18464844 tttagttagaagaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 18464901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 45306991 - 45307137
Alignment:
Q  100 acaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45306991 acaaaccctaacatttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 45307090  T
Q  200 gaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  45307091 gatcaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 45307137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8474005 - 8473868
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8474005 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagtaccgaaataaatcaattttt 8473906  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8473905 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttaga 8473868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12203713 - 12203556
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  12203713 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaatataccaatt 12203614  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12203613 tttagttagatgaccaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaaggtaatt 12203556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 22201904 - 22202061
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22201904 acccacatagcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaaccgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 22202003  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  22202004 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 22202061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Original strand, 44894030 - 44894195
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44894030 ccacataacacaaactctaatgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggtccgaaataaatcaatttt 44894129  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaa 256  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  44894130 tagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctttaa 44894195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51509281 - 51509124
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  51509281 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtaggaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 51509182  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  51509181 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 51509124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45306975 - 45306835
Alignment:
Q  108 taacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  45306975 taacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagttagaggactaatc 45306876  T
Q  208 caatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45306875 cgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaattta 45306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 47669548 - 47669704
Alignment:
Q  90 cccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattt 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47669548 cccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagtaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaattt 47669647  T
Q  190 ttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  47669648 ttagttagagaaccaatccgataccaaataaatagttagaggaccaaaaagataatt 47669704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 248
Target Start/End: Original strand, 12791473 - 12791623
Alignment:
Q  98 acacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaa 197  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  12791473 acacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttaattag 12791572  T
Q  198 aggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  12791573 aggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 12791623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 53716581 - 53716738
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  53716581 acccacataacacaaaccctaacgttaatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaatgatgataaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 53716680  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53716681 tttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaatt 53716738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 54752451 - 54752608
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  54752451 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagcaccgaaataaatcaatt 54752550  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  54752551 tttagttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 54752608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 42592074 - 42592229
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42592074 ccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttt 42592173  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| |||||||||   ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  42592174 tagttagaggaccaatttgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 42592229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 15986526 - 15986679
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15986526 acataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacttattgaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 15986625  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  15986626 gttagaggaccaatccgataccaactaaataattagaggaccaaaaagttaatt 15986679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 11256392 - 11256548
Alignment:
Q  90 cccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattt 189  Q
    |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  11256392 cccacatagcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatttagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcatttt 11256491  T
Q  190 ttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11256492 ttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 11256548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 16931903 - 16932051
Alignment:
Q  98 acacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaa 197  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  16931903 acacaaactctaacgtttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacagaaataaatcaatttttagttag 16932002  T
Q  198 aggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16932003 aggacaaatccgataccaattaaaaagttagaggaccaaaaaggtaatt 16932051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Original strand, 4773530 - 4773681
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4773530 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccaaaataaatcaatt 4773629  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  4773630 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 4773681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 19883528 - 19883684
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19883528 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaataaaaacgattaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattt 19883627  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19883628 tttagttagagaaccaatccgataccaattaaatagttagaggat-aaaaaggtaatt 19883684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41835088 - 41834970
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41835088 acccacataacacaaaccctaacgtttatttaaatacaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 41834989  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatc 207  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41834988 tttagttagaggaccaatc 41834970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 21969917 - 21970076
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  21969917 acccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggactgaaataaatgaatt 21970016  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaa--atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||  ||||||||| || |||||| ||||||    
T  21970017 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaatgtaatt 21970076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 21992353 - 21992512
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  21992353 acccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggactgaaataaatgaatt 21992452  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaa--atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||  ||||||||| || |||||| ||||||    
T  21992453 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaatgtaatt 21992512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 22152133 - 22152292
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22152133 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaacgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggactgaaataaatcaatt 22152232  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaa--atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||| | |||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  22152233 tttagttagaggatcaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaaggtaatt 22152292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 44317537 - 44317660
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  44317537 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 44317636  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  44317637 agttagaggaccaaaaaggtaatt 44317660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13866148 - 13866025
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  13866148 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 13866049  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  13866048 agttagaggaccaaaaaggtaatt 13866025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49528277 - 49528154
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  49528277 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagctagaggaccaaaccgataccaattaaat 49528178  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  49528177 agttagaggaccaaaaaggtaatt 49528154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15790796 - 15790677
Alignment:
Q  134 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgat 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  15790796 gaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggatggaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgac 15790697  T
Q  234 caaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  15790696 caaaaagataatttaacctt 15790677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19883477 - 19883359
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||     
T  19883477 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacttagaaccaaaatgatactaataaataaagttaaggtactcacataacacaaaccctaacg 19883378  T
Q  113 tttatttgaataaaactaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19883377 tttatttaaataaaactaa 19883359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7163568 - 7163463
Alignment:
Q  133 agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatga 232  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7163568 agaaaggactaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagatgaccaatccaataccaattaaatagttagagga 7163469  T
Q  233 tcaaaa 238  Q
     |||||    
T  7163468 ccaaaa 7163463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 253
Target Start/End: Original strand, 7681447 - 7681576
Alignment:
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagtta-aaggaccaatccaatacctattaaata 223  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  7681447 aaactaacagaaaggactgaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagggactaatccgataccaattaaata 7681546  T
Q  224 gttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
     ||||| || |||||  |||||||| ||||    
T  7681547 attagaggaccaaaagtgtaatttagcctt 7681576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Original strand, 46152904 - 46153032
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46152904 cacataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagta---gtgagaaacttataggaccgaaataaatcaattttt 46153000  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaata 223  Q
    ||||| || |||||| | ||||| | ||||||    
T  46153001 agttagagaaccaattcgataccaactaaata 46153032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Original strand, 39241646 - 39241741
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatc 184  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39241646 acccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 39241741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32633227 - 32633138
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaa 178  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32633227 acccacatatcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggacaaaaa 32633138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28985620 - 28985514
Alignment:
Q  140 actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||     
T  28985620 actaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaaattttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaag 28985521  T
Q  240 ggtaatt 246  Q
    |||||||    
T  28985520 ggtaatt 28985514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 227
Target Start/End: Original strand, 20963545 - 20963651
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||||  |||||    
T  20963545 aataaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaa 20963644  T
Q  221 atagtta 227  Q
    |||||||    
T  20963645 atagtta 20963651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 246
Target Start/End: Original strand, 30681766 - 30681862
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  30681766 gtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaactgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 30681862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30681148 - 30681034
Alignment:
Q  132 cagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatg 231  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  30681148 cagaaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatatttttttagttagagaaccaaaccgttaccaattaaatagttagatg 30681049  T
Q  232 atcaaaaaggtaatt 246  Q
    | |||||| ||||||    
T  30681048 accaaaaatgtaatt 30681034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28986322 - 28986261
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 150  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986322 acccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 28986261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 248
Target Start/End: Original strand, 15791454 - 15791551
Alignment:
Q  146 tgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||     |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  15791454 tgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag-----atccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataat 15791548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 227
Target Start/End: Original strand, 49529076 - 49529182
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  |||||    
T  49529076 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 49529175  T
Q  221 atagtta 227  Q
    |||||||    
T  49529176 atagtta 49529182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Original strand, 39951682 - 39951751
Alignment:
Q  130 aacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  39951682 aacagaaatgactaaatgtaataacgttgaaaaacttagagaattgaaataaatcaatttttagttaaag 39951751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 248
Target Start/End: Original strand, 43844346 - 43844482
Alignment:
Q  112 atttatttgaataaaactaacagaaatgactaaa-tgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaa 210  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |    
T  43844346 attttttttaattaaactaacggaaatgaccaaaatgt-gtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccga 43844444  T
Q  211 tacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||  |||||||||||| | || ||||||  |||||||    
T  43844445 tactaattaaatagttaaaggaccaaaaaaataattta 43844482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42853331 - 42853249
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  42853331 ttagaggacccacataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaactaaatagataga-gaccaaaaaggtaattta 42853249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 227
Target Start/End: Original strand, 13866920 - 13867026
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| || |||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  |||||    
T  13866920 aataaaattaacggaaaggattaaaagtagtaactgagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 13867019  T
Q  221 atagtta 227  Q
    |||||||    
T  13867020 atagtta 13867026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Original strand, 50394333 - 50394411
Alignment:
Q  174 caaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  50394333 caaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttaacct 50394411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 8327697 - 8327814
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||   || ||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||    
T  8327697 taaaactaatagaaataactaaatgtggtaacaaagataaatttaaaggaccaaaataaatcaaaatatagttaagggaccaaaccgataccaaataaat 8327796  T
Q  223 agttagatgatcaaaaag 240  Q
    |||||   ||||||||||    
T  8327797 agttaagggatcaaaaag 8327814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43840061 - 43839984
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||||    
T  43840061 gtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagtta 43839984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 259
Target Start/End: Original strand, 12992297 - 12992407
Alignment:
Q  149 agtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12992297 agtaacggagagaaagttaagggaccaaaataatttaaaatatagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggatcaaaaaggtaattta 12992396  T
Q  249 acctttaattt 259  Q
     ||||| ||||    
T  12992397 gccttttattt 12992407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52705554 - 52705483
Alignment:
Q  156 gtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  52705554 gtgagaaatttaagggatcaaaataaatcaaattttagttaagggatcaaaccaatactaattaaatagtta 52705483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44316756 - 44316651
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||  |||| || || ||||  |||||    
T  44316756 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaa-taaatcaaattttagttaggggactaaaccgatactaattaa 44316658  T
Q  221 atagtta 227  Q
    |||||||    
T  44316657 atagtta 44316651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 23756012 - 23756252
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  23756012 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacgcaaaccctaaca 23756111  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23756112 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatttttagttaaaggaccaatccgata 23756211  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23756212 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttaacctt 23756252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14985569 - 14985328
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  14985569 aatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacgaaccctaacg 14985470  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14985469 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 14985370  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  14985369 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccttt 14985328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 53751122 - 53751349
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  53751122 tcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaattatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcataacgtttatttg 53751221  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  53751222 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaa 53751321  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  53751322 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 53751349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 33091665 - 33091905
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33091665 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 33091764  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33091765 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagatgactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 33091864  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    |  |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  33091865 ctaattaaatagttagaggactaaaaatgtaatttaacctt 33091905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 15477865 - 15478092
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  15477865 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaacaaagttagaggacccacgtaacacaaactctaacgtttatttg 15477964  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15477965 aataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaattaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 15478064  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  15478065 atagttagaagaccaaaaaggtaattta 15478092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8592199 - 8591966
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8592199 tcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 8592100  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  8592099 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 8592000  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  8591999 atagttagaggactaaaaaggtaatttagccttt 8591966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38339722 - 38339497
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38339722 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 38339623  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||    
T  38339622 aataaaactaaccgaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggacctaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccagttaa 38339523  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  38339522 atagttagaggaccaaaaaggtaatt 38339497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 16038014 - 16038241
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16038014 tcactacttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 16038113  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||    
T  16038114 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 16038213  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  16038214 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 16038241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 30683748 - 30683975
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30683748 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 30683847  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  30683848 aataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgcgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 30683947  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||| ||||| || ||||||  |||||||    
T  30683948 atatttagaggaccaaaaatataattta 30683975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 39448708 - 39448935
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  39448708 tcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccagataacacaaactctaacgtttatttg 39448807  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  39448808 aataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaa 39448907  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  39448908 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 39448935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50769059 - 50768826
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  50769059 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaaccctaacg 50768960  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  50768959 tttatttgaataaaactaatagaaagtactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaattcgata 50768860  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50768859 ccaattaaatagttaaaggatcaaaaaggtaatt 50768826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 19088553 - 19088793
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19088553 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataagatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 19088652  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||    
T  19088653 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggattaatctgata 19088752  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  19088753 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcctt 19088793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 1433483 - 1433718
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  1433483 aatatcagtcactatttaatcataataccataacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 1433582  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  1433583 tttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaaattagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 1433682  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  1433683 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 1433718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 42855551 - 42855786
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  42855551 aatatcagtcattatttaatcataataccttaacgaggaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 42855650  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  42855651 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttggaggaccaatccgata 42855750  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  42855751 ctaattaaatagttaaatgactaaaaaggtaattta 42855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 44991490 - 44991736
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  44991490 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 44991589  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  44991590 tttatttgaacaaaactaacaaaaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttcagttagaggatcaatccgata 44991689  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  44991690 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcctataattt 44991736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Original strand, 46849889 - 46850119
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46849889 tcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 46849988  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |    
T  46849989 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattta 46850088  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46850089 atagttagatgaccaaaaagataatttaacc 46850119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24898419 - 24898188
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  24898419 tcactatttaatcataatacattaacaagacatgtgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacgcacataacacaaactctaacgtttatttg 24898320  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  24898319 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgataccaattaa 24898220  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  24898219 atagttagaggaccaaaaatgtaatttaacct 24898188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 36122645 - 36122879
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||     
T  36122645 aatatcaatcactatttagtcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaatatagttagaggacctatataacacaaactctaacg 36122744  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  36122745 tttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaatttttagttagaggaccaatccgata 36122843  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36122844 ccaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaattta 36122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 41752028 - 41752262
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41752028 aatatcagtcactatttaatcataataccttagcaaggcatatgatcaaaatgatattaataaataaaattagaggacccacataacacaaaccctaacg 41752127  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41752128 tttatttgaataaaactaacagaaaggactacatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatgaatttttagttagaggaccaatccgata 41752227  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  41752228 ccaattaaatagttagagga-ccaaaaggtaattta 41752262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 50508677 - 50508904
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50508677 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaataatactaataaataaagttagaggacccacataacataaaccataacgtttatttg 50508776  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||    
T  50508777 aataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaacggtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctgataccaattaa 50508876  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  50508877 ataattagaaaaccaaaaagataattta 50508904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 52557299 - 52557534
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||     
T  52557299 aatatcagttactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataatacaaactctaacg 52557398  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  52557399 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgata 52557498  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  52557499 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 52557534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 53259350 - 53259585
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||     
T  53259350 aatatcactcattgtttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaactctaacg 53259449  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  53259450 tgtatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgata 53259549  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  53259550 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 53259585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44957627 - 44957392
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  44957627 aatatcagtcactatttaatcataatacattatcaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaaccctaacg 44957528  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44957527 tttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 44957428  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || || ||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  44957427 ccaataaaatagttagaggaccaaaaatataattta 44957392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 43734498 - 43734724
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  43734498 aatatcagtcactatttaatcataatattttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcttaacg 43734597  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  43734598 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 43734697  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    || |||||||||||||| || ||||||    
T  43734698 ccaattaaatagttagaggaccaaaaa 43734724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6712201 - 6711985
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  6712201 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaataaggcacaggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaaccctaacg 6712102  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  6712101 tttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 6712002  T
Q  213 cctattaaatagttaga 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  6712001 ccaattaaatagttaga 6711985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 623899 - 624126
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  623899 tcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggatccacataacacaaactctaacatttatttg 623998  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  623999 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 624098  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  624099 atagttagaggaccaaaaatgtaattta 624126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12818036 - 12817809
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  12818036 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactgataaataaagttacaggacccacataacacaaactctaacgtttatttg 12817937  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12817936 aataaaactaatagaaagggctaaatgtagtaacagtgataaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 12817837  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||    
T  12817836 atagttagagaaccaaaaaggtaattta 12817809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 21763393 - 21763639
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  21763393 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataaaaacaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 21763492  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  21763493 tttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatcttata 21763592  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  21763593 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcctataattt 21763639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 53995146 - 53995382
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  53995146 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaac- 53995244  T
Q  113 tttatttgaataaaactaac--agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaa 210  Q
     |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  53995245 gttatttgaataaaactaacataaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatgcga 53995344  T
Q  211 tacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53995345 taccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 53995382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 25182032 - 25182269
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  25182032 tcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggaccaaaatgatgttaataaataaagttagaggacccacataacacaaactcaaacgtttatttg 25182131  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| | |||    
T  25182132 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaactaa 25182231  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatt 258  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25182232 atagttagaagaccaaaaagataatttagccttaaatt 25182269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 19508625 - 19508819
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  19508625 aatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatcatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 19508724  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19508725 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagggtgagaaacttggaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatc 19508819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 43566590 - 43566791
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||     
T  43566590 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagtttgaggacccacataacacaaatcctaacg 43566689  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43566690 tttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaagactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 43566789  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  43566790 cc 43566791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 37206639 - 37206874
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  37206639 aatatcagccactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaacg 37206738  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  37206739 tttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacgatgaaaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 37206838  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | ||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  37206839 tcaattaaatagttagagaacaaaaaaggtaattta 37206874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 41878071 - 41878305
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41878071 aatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaataatatgaccaaaatgatactaataaataaagttggaggacccacataacataaaccctaaca 41878170  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||     
T  41878171 tttatttgaataaaactagcagaaaggact-aatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgcaataaatcaatttttagttagaggactaatctgatt 41878269  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41878270 ccaattatatagttagaggaccaaaaaagtaattta 41878305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44991441 - 44991284
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44991441 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44991342  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44991341 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 44991284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 24898477 - 24898634
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24898477 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatt 24898576  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  24898577 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggacaaaaaaagtaatt 24898634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20888303 - 20888133
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20888303 ccacataacacaaaccctaacattcatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 20888204  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatttac 261  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  20888203 tagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagagtacctaaaaggtaatttaacctttattttac 20888133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42855501 - 42855344
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42855501 acccacataacacaaaccctaacctttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 42855402  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  42855401 tttagttagaggaccactccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 42855344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43734448 - 43734278
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43734448 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatctatt 43734349  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  43734348 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctttaattt 43734278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6505698 - 6505542
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6505698 acccacataacacaaaccctaac-tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6505600  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6505599 tttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaatt 6505542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 8592257 - 8592414
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8592257 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 8592356  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  8592357 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 8592414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25181974 - 25181817
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25181974 acccatataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaagaccaaaataaatcaatt 25181875  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  25181874 tttagttaaaggaccaatccgatacaaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 25181817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43566538 - 43566383
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43566538 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaattgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 43566439  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  43566438 tagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaagaccaaaaagataatt 43566383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1433430 - 1433276
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1433430 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacgatgagaaacttagagaaccaaaataaatcaattttt 1433331  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||    
T  1433330 agttagaggaccaatccaataccaatgaaatagttagaggaccaaaaagataatt 1433276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 50769112 - 50769266
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50769112 cacataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaattttt 50769211  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50769212 agttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 50769266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 14985619 - 14985776
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14985619 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatt 14985718  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14985719 tttagttagatgaccaatctgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 14985776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33091615 - 33091458
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33091615 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaatggtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatt 33091516  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33091515 tttagttagaggaccaatctaatactgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 33091458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53751060 - 53750907
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53751060 acataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 53750961  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  53750960 gttagaggaccaatccgataccaatttaatagttagaggactaaaaaggtaatt 53750907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53995096 - 53994939
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  53995096 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 53994997  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  53994996 tttagttaaaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 53994939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8398193 - 8398036
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  8398193 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacaatgagaaagttagaggatcgaaataaatcaatt 8398094  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  8398093 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 8398036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15477807 - 15477650
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15477807 acccacataacacaaacactaacgtttattttaataaaactaacagaatggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatg 15477708  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15477707 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 15477650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16037956 - 16037799
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16037956 acccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 16037857  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  16037856 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 16037799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41751978 - 41751823
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41751978 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagtaaagactaaatgtagtaacagtgagaaactta-aagaccaaaataaatcaatt 41751880  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  41751879 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaagga-caaaaaggtaatt 41751823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 52557249 - 52557092
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52557249 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtaagaaacttataggaccgaaataaatcaatt 52557150  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52557149 tttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 52557092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 44125777 - 44125917
Alignment:
Q  108 taacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44125777 taacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaagaccaatc 44125876  T
Q  208 caatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44125877 cgacaccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaattta 44125917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 38339782 - 38339937
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38339782 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgtgaaacttagaggatcgaaataaatcaatttt 38339881  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38339882 tagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 38339937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46849831 - 46849674
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46849831 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 46849732  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  46849731 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggacgaaaaaggtaatt 46849674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19508575 - 19508423
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaacca-taacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaat 187  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19508575 acccacataacacaaacccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtcacagtgagaaacttagagggccgacataaatcaat 19508476  T
Q  188 ttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19508475 tgttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaag 19508423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 255
Target Start/End: Original strand, 25269306 - 25269454
Alignment:
Q  107 ataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25269306 ataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaat 25269405  T
Q  207 ccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    || ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||||    
T  25269406 ccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagccttta 25269454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30683686 - 30683531
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaa-ctaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30683686 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 30683587  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || ||  |||| |||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30683586 taattggaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 30683531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41878017 - 41877867
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41878017 acataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgag-aacttagaggaccgaaataaatcaattttta 41877919  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaa 244  Q
    |||| | ||||||||  ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  41877918 gttagatgaccaatctgataccaactaaataattagatgaccaaaaaggtaa 41877867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19088503 - 19088346
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19088503 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtattaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19088404  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| || ||| ||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  19088403 tttagttagaggatcattccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataatt 19088346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Original strand, 6712251 - 6712421
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6712251 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtga-aaatttagaggaccgaaataaatcaatt 6712349  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatttac 261  Q
    | |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  6712350 tgtagttagaggatcaatccattaccaattaaatagttaga-gaccaaaaaggtaattaagccttttatttac 6712421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 12818093 - 12818245
Alignment:
Q  88 gacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaat 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12818093 gacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaag 12818192  T
Q  188 ttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  12818193 ttttagttagagcaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaag 12818245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 623841 - 623703
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  623841 acccatataacataaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttataggaccaaaataaaacaatt 623742  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  623741 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagtta 623703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36122595 - 36122438
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36122595 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacagtgaaaaacttagatgacaaaaataaatcaatt 36122496  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  36122495 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatt 36122438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39448650 - 39448493
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39448650 acccacataacacaaactctaacgcttatttaaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 39448551  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||| || |||||    
T  39448550 tttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaacagataatt 39448493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 285 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40123632 - 40123543
Alignment:
Q  285 aataaatgaagcaaagtaaatgaggcaacttggtcccctattagtttcgtccctcgctaaaaataataaaacattgattccaaatttgtc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40123632 aataaatgaagcaaagtaaatgaggcaacttggtcccctattagtttcgtccctcgctaaaaataataaaacattgattccaaatttgtc 40123543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53259300 - 53259184
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  53259300 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaattaattaatt 53259201  T
Q  189 tttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||||||| ||||||||    
T  53259200 tttagttagaggaccaa 53259184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21763343 - 21763185
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaa-ctaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaat 187  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21763343 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaacaaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacctggaggaccgaaataaatcaat 21763244  T
Q  188 ttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  21763243 ttttagttggaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataatt 21763185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23755578 - 23755440
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23755578 ccacgtaacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgataagaaacttagagaaccgaaataaattaatttt 23755479  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23755478 tagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttaga 23755440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50508615 - 50508512
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50508615 acataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttta 50508516  T
Q  193 gtta 196  Q
    ||||    
T  50508515 gtta 50508512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55022426 - 55022281
Alignment:
Q  108 taacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  55022426 taacgtttattttaataaaactaacagaaagga-taaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatc 55022328  T
Q  208 caatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
      ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  55022327 tgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccttt 55022281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 44957669 - 44957802
Alignment:
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  44957669 tttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaaatgtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatttgata 44957768  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
     | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44957769 tcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 44957802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37206587 - 37206486
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37206587 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 37206488  T
Q  191 ta 192  Q
    ||    
T  37206487 ta 37206486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Original strand, 4513254 - 4513363
Alignment:
Q  139 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||    
T  4513254 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaa 4513353  T
Q  239 aggtaattta 248  Q
    ||||||||||    
T  4513354 aggtaattta 4513363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 49135928 - 49136082
Alignment:
Q  96 taacacaaaccataacatttatttgaataaaactaac----agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49135928 taacacaaatcctaacgtttatttgaataaaattgacataaagaaataactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttt 49136027  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  49136028 agttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagacgataaaaaaagtaatt 49136082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44125755 - 44125627
Alignment:
Q  118 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||    
T  44125755 ttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaaaaaatcaatttttagttagagaaccaatttaataccaat 44125656  T
Q  218 taaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||||    
T  44125655 taaatagttaaaggaccaaaaagataatt 44125627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47603065 - 47602946
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47603065 taacggaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttaattagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 47602966  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | || ||||||| |||||||    
T  47602965 aggaccaaaaagataattta 47602946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 52692768 - 52692886
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||| ||     
T  52692768 taacggaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaat-cgatagcaattaaatagctaa 52692866  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | || |||||||||||||||    
T  52692867 aggaccaaaaaggtaattta 52692886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 23755630 - 23755708
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacc 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23755630 aatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaagcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacc 23755708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Original strand, 6505748 - 6505822
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6505748 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaaattagag 6505822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52692122 - 52692027
Alignment:
Q  153 acggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52692122 acggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataattta 52692027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 47603710 - 47603808
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47603710 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 47603808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31214250 - 31214159
Alignment:
Q  163 acttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31214250 actttgaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgatcaaaaatgtaatttagccttt 31214159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Original strand, 55022424 - 55022504
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  55022424 ttagaggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaatccgataccaattaaatagttagagga-caaaaagataatt 55022504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40123688 - 40123659
Alignment:
Q  252 tttaatttaccgatctcaactaattcttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40123688 tttaatttaccgatctcaactaattcttaa 40123659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Original strand, 11102285 - 11102337
Alignment:
Q  175 aaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  11102285 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaccaatactaattaaatagtta 11102337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22307503 - 22307463
Alignment:
Q  187 tttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22307503 tttttagttaaaggaccaaagcaataccaattaaatagtta 22307463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Original strand, 46621231 - 46621267
Alignment:
Q  169 aggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46621231 aggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaa 46621267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 5938025 - 5938272
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5938025 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccttaacg 5938124  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5938125 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 5938224  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattta 260  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5938225 ccaattaaataattagatgaccaaaaaggtaatttaatctttaattta 5938272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34890882 - 34890647
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34890882 aatatcagtcattatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 34890783  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34890782 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtaataacagtgagaaactttgaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaata 34890683  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34890682 ccaattaaatagttagaggaacaaaaaggtaattta 34890647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7270191 - 7269954
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7270191 aatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaaca 7270092  T
Q  113 tttatttgaat--aaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaa 210  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7270091 tttatttaaataaaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaa 7269992  T
Q  211 tacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  7269991 taccaattaaatagttagaggattaaaaaagtaattta 7269954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 5639385 - 5639625
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  5639385 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacataacacaaaccataatg 5639484  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  5639485 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttagttagaggactaatccgata 5639584  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5639585 ccaattaaatagttagaagatcaaaaatgtaatttaacctt 5639625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18053194 - 18052959
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18053194 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 18053095  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18053094 tttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 18052995  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18052994 ccaattaaatagttaaaggatcaaaaaagtaattta 18052959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26600587 - 26600355
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26600587 tcactatttaatcataataccttaataaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 26600488  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  26600487 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggactaatccgataccaattta 26600388  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  26600387 atagttagaggaccaaaaagataatttagcctt 26600355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9046324 - 9046089
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9046324 aatatcagtcactatttaatcataatagcttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaatttagaggacccacataacacaaactctaaca 9046225  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||    
T  9046224 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgacaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttacttagaggaccaatctgata 9046125  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  9046124 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattta 9046089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 21856775 - 21857002
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  21856775 tcactgtttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccatataacaaaaaccataacgtttatttg 21856874  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  21856875 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 21856974  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21856975 atacttagaggaccaaaaaggtaattta 21857002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24744566 - 24744332
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24744566 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 24744467  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24744466 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacggtgtgaaagttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 24744367  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24744366 ccaattaaatagttagagga-caaaaaggtaattta 24744332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 34994592 - 34994827
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  34994592 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaatcaagttagaggacccgcataacacaaaccctaacg 34994691  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34994692 tttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 34994791  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34994792 ccaattaaatagttagatgactaaaaaggtaattta 34994827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 6137590 - 6137822
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  6137590 aatatcactcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaatctaac- 6137688  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6137689 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgata 6137788  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6137789 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 6137822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5311064 - 5310829
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5311064 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaaca 5310965  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||    
T  5310964 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttataggactactctgata 5310865  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  5310864 tcaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 5310829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 32993227 - 32993462
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  32993227 aatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaaccctaacg 32993326  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32993327 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 32993426  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  32993427 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatataattta 32993462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31237972 - 31237743
Alignment:
Q  25 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaata 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  31237972 tatttaatcataataccttaacaaggaacatgatcaaaataatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaactctaacatttatttgaata 31237873  T
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  31237872 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagagaactaatccgataccaattaaatag 31237773  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31237772 ttagaggaccaaaaaagtaatttaaccttt 31237743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2517240 - 2517001
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||     
T  2517240 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgattcttataaataaagttggaggacccacataacacaaacactaacg 2517141  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  2517140 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 2517041  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  2517040 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttaacct 2517001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 21540189 - 21540432
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  21540189 aatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacgcaaaccctaacg 21540288  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||    
T  21540289 tttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggactaatctgata 21540388  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatc-aaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    || |||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||    
T  21540389 ccaattaaatagttaaaggaccaaaaaaggtaatttagccttta 21540432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32753411 - 32753180
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32753411 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacc----ttatactaataaatacagttagaggacccacataacacaaaccttaaca 32753316  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  32753315 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgata 32753216  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |  |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  32753215 ctaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 32753180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7270867 - 7270668
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7270867 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 7270768  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7270767 tttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatatagtaacggtaagaaacttaaaagatcaaaataaatcaatttttaattagaggaccaatccaata 7270668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31247342 - 31247113
Alignment:
Q  25 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaata 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  31247342 tatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataaaacaaactctaacgtttatttgaata 31247243  T
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  31247242 aaactaacagaaaagattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaacaccgaaataaatcaatttttagttagagaactaatccgataccaattaaatag 31247143  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31247142 ttagaggaccaaaaaagtaatttaaccttt 31247113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 6236141 - 6236366
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6236141 tcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaagatgatactaataaatgaagttagaggattcacataacacaaaccctaacgtttatttg 6236240  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||    
T  6236241 aataaaactaacagaaaggattaaatttagtaactgttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcaaatatcaattaa 6236340  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||    
T  6236341 atagttaggggaccaaaaaagtaatt 6236366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 3423390 - 3423574
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  3423390 tcactatttaatcgtaataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacatatcacaaactctaacgtttatttg 3423489  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||    
T  3423490 aataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaaattagaggaccgaaataaaccaatttttaattagcggaccaa 3423574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26957200 - 26957017
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||     
T  26957200 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagctagaggacccccataacataaactttaacg 26957101  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagtta 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26957100 tttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 26957017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6532377 - 6532197
Alignment:
Q  66 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaact 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6532377 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatcactaaatgtagtaacggtgagaaatt 6532278  T
Q  166 tagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  6532277 tagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgatacaaattaaatagttagaggacaaaaaaggtaatt 6532197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 25176877 - 25177030
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25176877 tcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggccccacataacacaaaccctaacgtttatttg 25176976  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176977 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 25177030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 9046374 - 9046544
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9046374 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaatagaactaacagaaaggactaaatgtagtagcggtgagaaacttagcggaccgaaataaatcaatt 9046473  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  9046474 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctttaattt 9046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35167652 - 35167495
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35167652 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 35167553  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  35167552 tttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 35167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 15932844 - 15933001
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932844 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 15932943  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  15932944 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 15933001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5937975 - 5937811
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5937975 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 5937876  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    |||||||| || | |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5937875 tttagttagagaatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctt 5937811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34994542 - 34994379
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34994542 acccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34994443  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  34994442 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttaaaggaccaaaaaggtaattaaacct 34994379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 978577 - 978420
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  978577 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 978478  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  978477 tttagttagaggatcaatacgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 978420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21856717 - 21856560
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856717 acccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 21856618  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  21856617 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 21856560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 26600635 - 26600775
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26600635 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 26600734  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26600735 tttagttagaagaccaatccaataccaactaaatagttaga 26600775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 26957258 - 26957406
Alignment:
Q  98 acacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaa 197  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26957258 acacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttaa 26957357  T
Q  198 aggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26957358 aggaccaatctaataccaattaaatagttagatgaccaaaaagataatt 26957406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3423332 - 3423165
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3423332 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 3423233  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaa 256  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||| | |||||||    
T  3423232 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaatggtaattaagcctttaa 3423165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6236083 - 6235924
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6236083 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6235984  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6235983 tttaattataggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 6235924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25176819 - 25176668
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25176819 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccataataaatcaatttttagt 25176720  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  25176719 tagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 25176668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 32753461 - 32753618
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32753461 acccacataacacaaactctgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 32753560  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32753561 tttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 32753618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Original strand, 34890932 - 34891083
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34890932 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34891031  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  34891032 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 34891083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 2517293 - 2517447
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2517293 cacataacacagatcataacgtttatttaaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 2517392  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2517393 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 2517447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6137538 - 6137384
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6137538 ccacataacacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatc-atttt 6137440  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6137439 taattagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 6137384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 31238034 - 31238191
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt-agaggaccaaaataaatcaat 187  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31238034 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaagaggaccgaaataaatcaat 31238133  T
Q  188 ttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  31238134 ttttagttaga-gaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 31238191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Original strand, 18053241 - 18053413
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18053241 acccatataaaacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagtaccgaaataaatcaatt 18053340  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatttac 261  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  18053341 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaactaagcctataatttac 18053413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 5311114 - 5311269
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5311114 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagcaccgaaataaatcaatt 5311213  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaa 244  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  5311214 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaa 5311269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32993173 - 32993020
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32993173 acataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 32993074  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
     ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  32993073 cttagatgaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaagaaggtaatt 32993020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 31247404 - 31247561
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt-agaggaccaaaataaatcaat 187  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||    
T  31247404 acccacataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgact-aatgtagtaacggtgaaaaacttaagaggactgaaataaattaat 31247502  T
Q  188 ttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  31247503 ttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 31247561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 10412796 - 10412946
Alignment:
Q  96 taacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagtt 195  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10412796 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaatagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 10412895  T
Q  196 aaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    | || || ||||| ||||| | |||||||||| | || ||||||| |||||    
T  10412896 agagaactaatccgataccaactaaatagttaaaagaccaaaaagataatt 10412946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 35167702 - 35167837
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcata--ataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35167702 aatatcagtcactatttaatcatataataccttaacaaggattaggactaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaa 35167801  T
Q  111 catttatttgaataaaactaacagaaatgactaaat 146  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  35167802 cgtttacttgaataaaactaacagaaaggattaaat 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17244792 - 17244669
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  17244792 taaaactaacagaaatgacgaaatataataacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 17244693  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  17244692 agttagaggaccaaaaaggtaatt 17244669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 7270920 - 7271074
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7270920 cacataacacaaaccccaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatatagtaacgatgagaaacttagaggactgaaataaatcaattttt 7271019  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  7271020 agttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggcaatt 7271074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14276534 - 14276398
Alignment:
Q  116 atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacct 215  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  14276534 atttgaataaaactaatacaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaagtaaatcaatttttagttagaggatcaatccgatacca 14276435  T
Q  216 attaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||    
T  14276434 attaaataggtagaggaccaaaaaggtaattaaacct 14276398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 7270241 - 7270398
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  7270241 acccacataccacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacgatgagaaatttagagaaccaaaaaaaattaatt 7270340  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||    
T  7270341 tttagttagaggatcaattcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaaagataatt 7270398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 24744609 - 24744765
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |   |||||||||||||    
T  24744609 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttaaagaatggaaataaatcaatt 24744708  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  24744709 tttagttagaggaccaat-taataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataatt 24744765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7438915 - 7438796
Alignment:
Q  140 actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  7438915 actaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 7438816  T
Q  240 ggtaatttaacctttaattt 259  Q
    | ||||||| ||||||||||    
T  7438815 gataatttagcctttaattt 7438796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15286467 - 15286341
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15286467 taacggaaatgactaaatgcagtaacggtgagaaacttaagggattgaaataaatcaatttttagtcagaggaccaatccgacaccaattaaatagttag 15286368  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  15286367 aggatcaaaaaggtaatttaaccttta 15286341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6228880 - 6228735
Alignment:
Q  100 acaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    ||||||| |||||||| ||  | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6228880 acaaaccctaacatttcttctattaaaacaaacagaaatgacgaaatatagtaacggtgataaacttag-ggaccaaaataaatcaatttttagttagag 6228782  T
Q  200 gaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  6228781 gaccaaaccgataccaattaaataattagaggactaaaaaggtaatt 6228735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15932830 - 15932725
Alignment:
Q  151 taacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  15932830 taacgatgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagc 15932731  T
Q  251 ctttaa 256  Q
    ||||||    
T  15932730 ctttaa 15932725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 34517991 - 34518139
Alignment:
Q  100 acaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    ||||||| |||| ||| ||| | ||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||  ||    
T  34517991 acaaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttagtttgag 34518090  T
Q  200 gaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34518091 gaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 34518139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3036024 - 3035926
Alignment:
Q  108 taacatttatttgaataaaactaacagaaa-tgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3036024 taacgtttatttgaataaaattaacagaaaatgactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaa 3035926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Original strand, 29261279 - 29261404
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29261279 taacggaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgacataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttag 29261378  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    | ||  |||||  ||||||| |||||    
T  29261379 aggactaaaaatataatttagccttt 29261404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34517373 - 34517269
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaa 249  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||     
T  34517373 gtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgacaccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttag 34517274  T
Q  250 ccttt 254  Q
    |||||    
T  34517273 ccttt 34517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29260652 - 29260534
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  29260652 taacggaaatgactaaatgtagtaatg-tgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagtttgaggaccaatctgataccaattaaatagttag 29260554  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | || || ||||||||||||    
T  29260553 aggaccagaaaggtaattta 29260534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 254
Target Start/End: Original strand, 25180223 - 25180301
Alignment:
Q  176 aaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  25180223 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccagaaaggtaatttagccttt 25180301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34251656 - 34251545
Alignment:
Q  147 gtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  34251656 gtagtaacgatgagaaacttagaggatcgaaataaattaatttttagt--caggactaatccgataccaactaaataattagaggattaaaaaggtaatt 34251559  T
Q  247 taacctttaattta 260  Q
    || ||||| |||||    
T  34251558 tagccttttattta 34251545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 6229643 - 6229769
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || ||||  |||||    
T  6229643 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagtt-agggaccaaaccgatactaattaa 6229741  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||   || |||||||| ||||||    
T  6229742 atagttaagggaccaaaaaggcaattta 6229769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 223
Target Start/End: Original strand, 17245580 - 17245682
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  |||||    
T  17245580 aataaaattaacggaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 17245679  T
Q  221 ata 223  Q
    |||    
T  17245680 ata 17245682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Original strand, 27829297 - 27829390
Alignment:
Q  133 agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtt 226  Q
    ||||||||| |||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |   |||| |||||||||||    
T  27829297 agaaatgacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaactgttaccaattaaatagtt 27829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Original strand, 35167833 - 35167902
Alignment:
Q  179 taaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  35167833 taaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 35167902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5639335 - 5639294
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaacta 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5639335 acccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaacta 5639294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38588825 - 38588584
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  38588825 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 38588726  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38588725 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 38588626  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  38588625 ccaattaaatagttagagga-cgaaaaggtaatttagccttta 38588584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7949650 - 7949410
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  7949650 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 7949551  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  7949550 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattaaaagaccaatctgata 7949451  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7949450 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttaacctt 7949410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 27473283 - 27473523
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  27473283 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacctacataacacaaaccctaacg 27473382  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  27473383 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 27473482  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || ||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  27473483 ccaattaaattgttagaggaccaaaaaggtaatttagcctt 27473523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 45077415 - 45077650
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  45077415 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 45077514  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  45077515 tttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 45077614  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |  || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45077615 ctaatcaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 45077650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 45276808 - 45277048
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  45276808 aatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaatccctaacg 45276907  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  45276908 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttagttagaggactaatccgata 45277007  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  45277008 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcctt 45277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15048637 - 15048402
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  15048637 aatatcaatcattatttaatcataataccttaacaaataatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacaaaaaccctaacg 15048538  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15048537 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 15048438  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15048437 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 15048402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 33295896 - 33296131
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  33295896 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccctaacg 33295995  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  33295996 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggactaatctgata 33296095  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33296096 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 33296131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1432369 - 1432128
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1432369 aatatcagtcactatttaaacataatacattaacaaggcatatgatcaaaatgatattaataaataaagttagaggacccaaataacacaaaccctaacg 1432270  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  1432269 tttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 1432170  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  1432169 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttatccttt 1432128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 1651784 - 1652023
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  1651784 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaacaaataaagttagaggacccacataacacaaaacctaac- 1651882  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1651883 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 1651982  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1651983 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctt 1652023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 1740160 - 1740399
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  1740160 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaacaaataaagttagaggacccacataacacaaaacctaac- 1740258  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1740259 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 1740358  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1740359 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctt 1740399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 44594813 - 44595047
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  44594813 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatagaaccaaaataatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaaccctaacg 44594912  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44594913 tttatttgaataaaactaaccgaaatgactaaatgtagtaacggttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccaata 44595012  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  44595013 tcaattaaatagttagagga-caaaaagataattta 44595047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27669651 - 27669418
Alignment:
Q  16 atcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacattt 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  27669651 atcagtcactatttaatcataataatttaacaaggtatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacataaaccctaacgttt 27669552  T
Q  116 atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacct 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  27669551 atttcaataaaactaacagaaaggactaaatgtactaacagtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatacca 27669452  T
Q  216 attaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaa 249  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  27669451 attaaatagttaaatgatcgaaaaagtaatttaa 27669418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 5152754 - 5152980
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  5152754 tcactatttaatcataataccttaagaaggcatatgaccaaaatgatactagtaaataaagttagaggacccatataacacaaactctaacgtttatttg 5152853  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  5152854 aataaaactaacagaaaaaactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 5152953  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | ||| ||| || |||||||||||||||    
T  5152954 acagtcagagga-caaaaaggtaattta 5152980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 15871833 - 15872068
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  15871833 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaagctctaacg 15871932  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||    
T  15871933 tttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttatttagaggaccaatctgata 15872032  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |  |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  15872033 caaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 15872068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 5435124 - 5435347
Alignment:
Q  25 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaata 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  5435124 tatttaattataataccttaactaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagatgacccacataacacaaactctaacgtttatttgaata 5435223  T
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||    
T  5435224 aaactaacaaaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagagcaccaatccgataccaattatatag 5435323  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||| || ||||||| |||||||    
T  5435324 ttagaggaccaaaaagataattta 5435347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 251
Target Start/End: Original strand, 11173858 - 11174084
Alignment:
Q  25 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaata 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||    
T  11173858 tatttattcataataccttaacaaagcatagaacccaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatctaaactctaacatttatttgaata 11173957  T
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  11173958 aaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcagataccaattaaatag 11174057  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||    
T  11174058 ttagaggaccaaaaaggtaatttaacc 11174084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 1646719 - 1646951
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||     
T  1646719 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacataaaacctaac- 1646817  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  1646818 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatccgata 1646917  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  1646918 ccaattaaatagttagaggacgaaaaaggtaatt 1646951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 7535045 - 7535286
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  7535045 aatatcagtcattatttaatcataatacgttaacgaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagctagaggactcacataacacaaactataacg 7535144  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  7535145 tttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 7535244  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  7535245 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagccttt 7535286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1870173 - 1869937
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcata--ataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||    
T  1870173 aatatcagtcactatttaatcatataatacattaataaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttaggggacccacaattcacaaaccctaa 1870074  T
Q  111 catttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaa 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |    
T  1870073 cgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatctga 1869974  T
Q  211 tacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1869973 taccaattaaatagttagagga-caaaaaggtaattta 1869937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40048293 - 40048070
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||     
T  40048293 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg----acataacacaaactttaacg 40048198  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40048197 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac--------agttagagaatcaaaataaattaatttttagttagaggactaatccaata 40048106  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40048105 tcaattaaatagttagattatcaaaaaagtaattta 40048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 15048690 - 15048844
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15048690 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 15048789  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15048790 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 15048844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33819947 - 33819782
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33819947 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 33819848  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  33819847 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaatttagccttt 33819782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 37569527 - 37569764
Alignment:
Q  14 atatcaatcactattt-aatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||  ||||     
T  37569527 atatcagtcactattttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacgtagcataaactctaacg 37569626  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| |||    
T  37569627 tttatttgaataaaactaactgaaaagactaaatatagtaacaacgagaaatttagaggaccaaaataaataaatttttaattagatgatcaatccgata 37569726  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
     | |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  37569727 tcaattaaatacttagaagatcaaaaggataatttaac 37569764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37569476 - 37569320
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37569476 acccacataacaaaaaccataacgtttattcgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 37569377  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaat 245  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37569376 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaat 37569320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 34470832 - 34470989
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34470832 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 34470931  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  34470932 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 34470989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45276759 - 45276602
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45276759 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaatataaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 45276660  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  45276659 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataatt 45276602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15871783 - 15871626
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15871783 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagaggaccaaaataaattaatt 15871684  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15871683 tttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttaaaggaccaaaaaggtaatt 15871626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 251
Target Start/End: Original strand, 40048342 - 40048504
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40048342 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcaaaataaaacaatt 40048441  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  40048442 tttagttagaggatcaatacgataccaactaaataactagaggatcaaaaaggtaattaaacc 40048504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1646663 - 1646506
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1646663 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1646564  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1646563 tttagttagagaaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 1646506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5152696 - 5152540
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5152696 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggacc-aaataaatcaatt 5152598  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5152597 tttagtcagaggaccaatctgataccaattaaacagttagaggatcaaaaaggtaatt 5152540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5435062 - 5434905
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  5435062 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaataaatcaaat 5434963  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5434962 tttaggtagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 5434905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11707912 - 11707755
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  11707912 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtattaacagtgagaaacttagaggatcgaaacaaatcaatt 11707813  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11707812 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggatcaaaaagataatt 11707755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 1870224 - 1870380
Alignment:
Q  90 cccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattt 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1870224 cccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactttgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 1870323  T
Q  190 ttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1870324 ttagttagaggatctatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 1870380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Original strand, 18298488 - 18298611
Alignment:
Q  60 aaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18298488 aaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaattgtga 18298587  T
Q  160 gaaacttagaggaccaaaataaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18298588 gaaacttagaggaccaaaataaat 18298611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1740110 - 1739953
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1740110 acccacatagcacaaatcttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1740011  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1740010 tttagttagaggactaatccgataccgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 1739953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 38588875 - 38589015
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38588875 acccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacataaaggactaaatctagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38588974  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38588975 tttagttagaggatcaatccaataccaattaaatagttaga 38589015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27473233 - 27473077
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27473233 acccacataacacaaatcataatgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacg-tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 27473135  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| | | |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  27473134 tttagttagaggaccaatctgatatcaactaaatagttagaggaccaaaaagataatt 27473077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 40660179 - 40660331
Alignment:
Q  94 cataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 193  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40660179 cataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 40660278  T
Q  194 ttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||| ||||||||| | ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  40660279 ttagaggaccaattcgataacaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 40660331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40660143 - 40659986
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40660143 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactattagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttt 40660044  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||| | ||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  40660043 tagttagatgactaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattta 40659986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 27669709 - 27669857
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || | |||||||||||||    
T  27669709 acccacataacacaaaccctaatgattatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgtgaaactta-aagatcgaaataaatcaatt 27669807  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaa 238  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  27669808 tttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggataaaaa 27669857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 22763232 - 22763380
Alignment:
Q  100 acaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    ||||||| |||| ||| ||| | ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22763232 acaaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 22763331  T
Q  200 gaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22763332 gaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 22763380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44594763 - 44594606
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  44594763 acccacatagcacaaactctaatgtttatatgaataaaactaacagaaataactaaatgtagtaacgaatataaatttaaaggaccgaaataaatcaatt 44594664  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  44594663 tttagttaaaggaccaatctaatagcaattaaataattagaggaccaaaaatgtaatt 44594606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 246
Target Start/End: Original strand, 24666006 - 24666123
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  24666006 taacagaaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttaaaggaccaaaccgttaccaattaaatagttag 24666105  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    | || |||||||||||||    
T  24666106 aggaccaaaaaggtaatt 24666123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 248
Target Start/End: Original strand, 11920136 - 11920219
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11920136 ttagaggacccaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattta 11920219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33295862 - 33295735
Alignment:
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||| | |||||||    
T  33295862 aaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgacaaacttagaataccgaaataaatcaatttttaattagaagaccaatctgataccaactaaatag 33295763  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  33295762 ttagaggaccaaaaaggtcattaaacct 33295735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7534995 - 7534847
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  7534995 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaa---------cggtgagaaacttaaatgaccgaaataaatcaatt 7534905  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| | | |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  7534904 tttaattaaaggactaatccgatatcaactaaataattagaagaccaaaaaggtaatt 7534847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 11707962 - 11708047
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 98  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11707962 aatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaaacataagatcaaaatgatactaataaataaagttagatgacccacataa 11708047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 34470774 - 34470714
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaag 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34470774 tcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataaataaag 34470714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Original strand, 24659408 - 24659479
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagtta 84  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659408 aatatcagtcactatttaatcagaataccttaataaggcagaggaccaaaatgatactaataaataaagtta 24659479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45077364 - 45077226
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||                   ||||||||| |||||||||||||    
T  45077364 acccacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaat-------------------tagaggaccgaaataaatcaatt 45077284  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45077283 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 45077226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22762614 - 22762516
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22762614 gtaacggtgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaatataattta 22762516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24652974 - 24652898
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24652974 taacagaaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaattattttttagttaaaggaccaa 24652898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24652905 - 24652828
Alignment:
Q  169 aggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  24652905 aggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 24652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15740735 - 15740637
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||| |||| ||||||| || |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  15740735 taacggaaaggactaaaagtggtaacggaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagtta 15740637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 15741603 - 15741677
Alignment:
Q  172 accaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||    
T  15741603 accaaaataaatcaaaatttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatt 15741677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 12643888 - 12643961
Alignment:
Q  173 ccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  12643888 ccaaaataaatcaatatttagttagaggaccaaatcgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 12643961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 33819975 - 33820051
Alignment:
Q  163 acttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  33819975 acttagaagactgaaataaattaatttttagttagatgatcaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaa 33820051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29769444 - 29769365
Alignment:
Q  170 ggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaa 249  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  29769444 ggaccaaaataaatcaaaatttagttaaggaaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagagaccaaaaaggtaatttaa 29769365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Original strand, 18298612 - 18298661
Alignment:
Q  198 aggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18298612 aggaccaatccaatatcaattaaatagttagaggatc-aaaaggtaattta 18298661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 41453225 - 41453456
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41453225 tcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacatttatttg 41453324  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  41453325 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 41453424  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41453425 atagttagaggaccaaaaaggtaatttaacct 41453456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6357003 - 6356763
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6357003 aatatcaatcactgtttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacactaaca 6356904  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  6356903 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 6356804  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  6356803 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcctt 6356763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17359419 - 17359205
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  17359419 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaatg 17359320  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17359319 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaata 17359220  T
Q  213 cctattaaatagtta 227  Q
    || ||||||||||||    
T  17359219 ccaattaaatagtta 17359205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 48626275 - 48626517
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  48626275 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaacg 48626374  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  48626375 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtcagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 48626474  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  48626475 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccttta 48626517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33716826 - 33716589
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  33716826 aatatcagtcattatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaactctaacg 33716727  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33716726 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 33716627  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
    || |||||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  33716626 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaactaatttaac 33716589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 31638155 - 31638390
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  31638155 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacatgacacaaaccataacg 31638254  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31638255 tttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaatttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 31638354  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  31638355 ccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaattta 31638390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 44332731 - 44332966
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  44332731 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaactctaacg 44332830  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  44332831 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatttgata 44332930  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  44332931 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 44332966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28298057 - 28297841
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  28298057 aatatcagtcactatttaatcataataccttaactagtcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 28297958  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28297957 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagagaactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 28297858  T
Q  213 cctattaaatagttaga 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  28297857 ccaattaaatagttaga 28297841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10526548 - 10526314
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  10526548 aatatcagtcaatatttaatcataataccttaaca-ggcattggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 10526450  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  10526449 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 10526350  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10526349 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 10526314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 21391402 - 21391637
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  21391402 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagatcaaaatgatactaataaataaagttagatgatccacataacacaaacactaaca 21391501  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21391502 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgata 21391601  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21391602 ccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaattta 21391637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 19681707 - 19681948
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19681707 aatatcagtcaatatttaatcataatgcattaacaagaaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaaca 19681806  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  19681807 tttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 19681906  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || |||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  19681907 ccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatttagccttt 19681948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 41191897 - 41192132
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41191897 aatatcagtcactatttaatcataataccttaataagaaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 41191996  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  41191997 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttacttagaggactaatccgata 41192096  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41192097 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattta 41192132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 7579084 - 7579319
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7579084 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacaaaaaccataacg 7579183  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  7579184 tttatttgaatataactaaaataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaaattagatgatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 7579283  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7579284 ccaattaaatagttagaagaccaaaaagataattta 7579319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Original strand, 8937061 - 8937304
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8937061 aatatcaatcactatttaatcacaataccttaacaaggaatatgaccaacatgatattaataaataaagttagagaacccacataacacaaaccataacg 8937160  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||  |||    
T  8937161 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaacttttaattagaggacaaatctgata 8937260  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaa 256  Q
    |  |||||||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||    
T  8937261 ctaattaaatagttagaggaccaaaaatataatttagcctttaa 8937304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6356523 - 6356285
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||     
T  6356523 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaaatctaac- 6356425  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  6356424 tttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtaaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggaccaatccgata 6356325  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6356324 ccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaaacct 6356285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8542725 - 8542502
Alignment:
Q  25 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaata 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | || ||||||||||||    
T  8542725 tatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagaagacccacacaacacaaactctgacgtttatttgaata 8542626  T
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8542625 aaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatag 8542526  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||    
T  8542525 ttagaagacgaaaaaggtaattta 8542502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 35146910 - 35147137
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  35146910 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatattgataaataaagttagag---------aacacaaaccataaca 35147000  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  35147001 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagttagaggactaatccaata 35147100  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaa 249  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  35147101 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttaa 35147137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 28286337 - 28286564
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28286337 tcactatttaatcataataccttaagaaggaatagttccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttg 28286436  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28286437 aataaaactaatataaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaatcaatcaatttttagttaaaggactaatccgataccaattaa 28286536  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | ||||||| || |||||| ||||||||    
T  28286537 aaagttagaggaccaaaaatgtaattta 28286564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41751888 - 41751653
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||     
T  41751888 aatatcagtcactatttaatcataataacttaacaagacataggaccaaaataatactaataaataaagttagaagatccacataacacaaaccctaacg 41751789  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41751788 tttatttgaataaaactaacaaaaaggattaaatgtagtaacggttagaaacttagaggaccgaaataagtcaatttttagttagaggactaatccaata 41751689  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | |||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  41751688 tcaattaaatagttaaaggaccaaaaagataattta 41751653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43247653 - 43247437
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||      
T  43247653 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacataaacc-taatg 43247555  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaa-tgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43247554 tttatttgaataaaactaatagaaagggagtaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgat 43247455  T
Q  212 acctattaaatagttaga 229  Q
    | | ||||||||||||||    
T  43247454 atcaattaaatagttaga 43247437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 34037123 - 34037358
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  34037123 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaaaatatgaccaaaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacataaactctaacg 34037222  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||    
T  34037223 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgcagtaacggagataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtcagaggactaatcatata 34037322  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  34037323 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 34037358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36423605 - 36423387
Alignment:
Q  15 tatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatt 114  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  36423605 tatcagtcactatttgatcataataccttaaccaggtataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaacgtt 36423506  T
Q  115 tatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  36423505 tatttgaataaaactaacagaaagaaccaaaagtggcaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatttttagttagaggaccaatctaatgcc 36423406  T
Q  215 tattaaatagttagatgat 233  Q
     ||||||||||||||||||    
T  36423405 aattaaatagttagatgat 36423387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1114249 - 1114057
Alignment:
Q  56 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 155  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  1114249 gaccacaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaact 1114150  T
Q  156 gtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1114149 gtgtgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 1114057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 40673219 - 40673382
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  40673219 aatatcagtcactatttaattctaatactttaacaaggcatatgactaaaat--tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 40673316  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40673317 tttatttgaataaaactaacataaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaa 40673382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8937011 - 8936854
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8937011 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 8936912  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  8936911 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaagataatt 8936854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 10526598 - 10526755
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10526598 acccacataacacaaaacttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10526697  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  10526698 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacaaaaaagataatt 10526755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35146861 - 35146704
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35146861 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 35146762  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  35146761 tttagttagaggaccaatccgatactaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 35146704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41453167 - 41453010
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41453167 acccatataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 41453068  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  41453067 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 41453010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28286279 - 28286129
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28286279 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 28286180  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  28286179 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaagaccaaaaa 28286129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Original strand, 6356573 - 6356745
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6356573 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6356672  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatttac 261  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6356673 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttataggaccaaaaaggtaattaagcctttaagttac 6356745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7909461 - 7909279
Alignment:
Q  76 ataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacca 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7909461 ataaagttagaggatccacataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccg 7909362  T
Q  176 aaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  7909361 aaataaatcaatttttagttagaaaaccaatctgataccaattaaatagttaaagga-caaaaaagtaattaaaccttttattt 7909279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 1114333 - 1114490
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114333 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagagtaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 1114432  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1114433 tttagttagaggaccaatccgataacaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 1114490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7579034 - 7578877
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7579034 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgaagtaacattgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 7578935  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  7578934 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 7578877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17750097 - 17749940
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17750097 acccatataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatt 17749998  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| || |||||||  ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17749997 tttagttagagaaccaatctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 17749940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 6357055 - 6357210
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6357055 ccacatagcacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 6357154  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  6357155 tagttagaggaccaatccgatactaactaaataattagaggatcaaaaatgtaatt 6357210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48626222 - 48626068
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48626222 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 48626123  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  48626122 agttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 48626068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 31075485 - 31075638
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31075485 acataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 31075584  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
     ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  31075585 attggaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 31075638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41191844 - 41191688
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  41191844 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaactgaaataaaccaatt 41191745  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41191744 tttagttagaggaccaatccaatatcaactaaatagttagaggat-aaaaaggtaatt 41191688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 7909460 - 7909604
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7909460 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtactaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagt 7909559  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  7909560 tagaggaccaatccaatatcaattaaatagttagaggataaaaaa 7909604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 36423657 - 36423797
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36423657 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 36423756  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36423757 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttaga 36423797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21391350 - 21391195
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21391350 ccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtagcggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 21391251  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21391250 tagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 21391195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19681657 - 19681500
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19681657 acccacataacacaaaccctaacgtttattcgactaaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggcaaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19681558  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  19681557 tttagttagaggaccaatccaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 19681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31638103 - 31637948
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  31638103 ccacgtaacacaaaccctaacgtttatatgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggttcgaaataaatcaatttt 31638004  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  31638003 tagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaatt 31637948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Original strand, 4931556 - 4931726
Alignment:
Q  84 agaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaat 183  Q
    |||||||  ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4931556 agaggacttacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactgaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataatt 4931655  T
Q  184 caatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  4931656 caatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttaatcttt 4931726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 27738935 - 27739090
Alignment:
Q  71 aataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  27738935 aataaataaagttagaggacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaa-gattaaatatagtaacggtgagaaactaaaag 27739033  T
Q  171 gaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| | ||||||||||    
T  27739034 gaccgaaataaatcaatttttagttaggggatcaatctgataccaaataaatagtta 27739090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 8542793 - 8542943
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8542793 ataacacaaaccctaacatttatttgaataaaacta-cagaaaggattaaatgtagtcacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 8542891  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  8542892 tagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 8542943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 28298107 - 28298255
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  28298107 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaatcgaaataaatcaatt 28298206  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaa 237  Q
    |||| ||| |||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28298207 tttaattagagggtaaatctgataccaattaaatagttagatgatcaaa 28298255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Original strand, 17363532 - 17363664
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17363532 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacatt--gaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagt 17363629  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17363630 tagaggacaaatccaataccaattaaatagttaga 17363664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16867840 - 16867710
Alignment:
Q  118 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  16867840 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaat 16867741  T
Q  218 taaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  16867740 tatatagttagaggaccaaaaaggtaattta 16867710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8416602 - 8416478
Alignment:
Q  134 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgat 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8416602 gaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggac 8416503  T
Q  234 caaaaaggtaatttaacctttaatt 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  8416502 caaaaaggtaatttagcctttaatt 8416478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4155726 - 4155603
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||    
T  4155726 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgataccaattaaat 4155627  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  4155626 agttagaggaccaaaaaggtaatt 4155603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36674098 - 36673980
Alignment:
Q  128 ctaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  36674098 ctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagtta 36673999  T
Q  228 gatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || || || ||||||||||    
T  36673998 gaggaccataaaggtaatt 36673980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36282908 - 36282789
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  36282908 taacggaaaagaccaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttag 36282809  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | ||  ||||| ||||||||    
T  36282808 aggactaaaaatgtaattta 36282789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 239
Target Start/End: Original strand, 41751938 - 41752088
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41751938 acccacatagcataaaccctaatgtttatttgattaaaactaacagaaagaactaaatatggtaacagatagaaacttagaggactgaaataaatcaatt 41752037  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  41752038 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggataaaaaa 41752088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41892109 - 41891969
Alignment:
Q  108 taacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    |||| ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41892109 taacgtttttttaaataaatttaacagaaaggactaaatgtagtaacattaagaaacttaagggaccgaaagaaatcaatttttagttagaggaccaatc 41892010  T
Q  208 caatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41892009 cgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattta 41891969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 8417285 - 8417383
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8417285 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaattaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 8417383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Original strand, 29277671 - 29277799
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||    
T  29277671 taacagaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaaataaatagttag 29277770  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaacctttaat 257  Q
    | || ||||||||||||| | ||||||||    
T  29277771 aggaccaaaaaggtaattaagcctttaat 29277799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 223
Target Start/End: Original strand, 33716872 - 33717005
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  33716872 acccacataacaccaaccctaacgtttatttgaacaaaattaacataaatgact-aatgtagtaacaatgagaaacttaaatgaccgaaataaattaatt 33716970  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaata 223  Q
    |||||||| | || |||||| ||| | ||||||||    
T  33716971 tttagttagatgatcaatccgatatcaattaaata 33717005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Original strand, 36283533 - 36283659
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaagga-ccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  36283533 taacaaaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttaagggacggaaataaatcaatttttagttagaggatcaaatccgataccaattaaatagtta 36283632  T
Q  228 gatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  36283633 gagaacaaaaaatgtaatttaaccttt 36283659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 17359479 - 17359538
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac 154  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359479 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac 17359538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38447682 - 38447600
Alignment:
Q  74 aaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggt 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  38447682 aaataaagttagaggatccacataacacaaaccc-aatatttatttgaataaaatttaaagaaatgattaaatgtagtaacggt 38447600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Original strand, 36674095 - 36674189
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatttac 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || || ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36674095 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaa--gactaacccgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatttagcctttattttac 36674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28263626 - 28263499
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  ||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  |||||    
T  28263626 aataaaactaacggaaacgactaaaggtggtaacgggaagaaatttaaggtaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 28263527  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||   ||||||||| ||||||||    
T  28263526 atagttaagggatcaaaaaagtaattta 28263499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Original strand, 32946669 - 32946747
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32946669 taacagaaaggactaaatgtactaacagtgaaaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttagttagagtaccaatc 32946747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 28264587 - 28264692
Alignment:
Q  100 acaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||| || |||| ||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28264587 acaaaccctaacgtttttttaaataaaactaatggaaaggattaaaagtagtaacatagagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaa 28264686  T
Q  200 gaccaa 205  Q
    ||||||    
T  28264687 gaccaa 28264692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29276961 - 29276880
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  29276961 ttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 29276880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 248
Target Start/End: Original strand, 36423790 - 36423847
Alignment:
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36423790 tagttagaggacaaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 36423847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 41893403 - 41893501
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||  | | | |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||   ||||||||||||    
T  41893403 taacggaaaagattaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaatcgaaataaataaatttttagttagatgaccaatccgatattaattaaatagtta 41893501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40673169 - 40673058
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataac--atttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||   ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||  |||||||| ||    
T  40673169 acccacataacacaaatcctaacgtgtttatttg---aaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgaaaaacttacagaactcaaataaattaa 40673073  T
Q  187 tttttagttaaagga 201  Q
     ||||||||| ||||    
T  40673072 attttagttagagga 40673058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 17750147 - 17750187
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcat 53  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17750147 aatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcat 17750187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 17363472 - 17363437
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaa 48  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17363472 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaa 17363437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 248
Target Start/End: Original strand, 38677051 - 38677125
Alignment:
Q  174 caaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  38677051 caaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattta 38677125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 248
Target Start/End: Original strand, 40263616 - 40263694
Alignment:
Q  170 ggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||| |||   || |||||||||||||||    
T  40263616 ggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatatttaagggaccaaaaaggtaattta 40263694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 4156509 - 4156638
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |  ||||  |||||    
T  4156509 aataaaattaacgaaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagagaccaaaataaatcaaattttagttagggtaccaaacagatactaattaa 4156608  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
    |||||||   || |||||||| ||||||||    
T  4156609 atagttaagggaccaaaaaggcaatttaac 4156638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43050465 - 43050408
Alignment:
Q  170 ggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  43050465 ggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatagtta 43050408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29277026 - 29276950
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||| |||| ||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  29277026 taactgaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaagaaatcattttttaattagaggaccaa 29276950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29472480 - 29472247
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  29472480 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccttaacg 29472381  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||    
T  29472380 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaggaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatctatttttagttagaggaccaatctgata 29472281  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29472280 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 29472247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38332942 - 38332707
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38332942 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaaccctaaca 38332843  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38332842 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccaata 38332743  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  38332742 ccaattaaatagttagagaaccaaaaatgtaattta 38332707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15744687 - 15744460
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15744687 tcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 15744588  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  15744587 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 15744488  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  15744487 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 15744460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7469404 - 7469166
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7469404 aatatcactaactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatactagtaaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 7469305  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  7469304 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 7469205  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  7469204 ccaattaaatagttagagggccaaaaaggtaatttaacc 7469166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13193214 - 13192982
Alignment:
Q  25 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaata 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  13193214 tatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccaacataacacaaactctaacgtttatttgaata 13193115  T
Q  125 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatag 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  13193114 aaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatag 13193015  T
Q  225 ttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaat 257  Q
    ||||| || |||||| |||||||| ||| ||||    
T  13193014 ttagaggaccaaaaaagtaatttagcctataat 13192982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 2148098 - 2148317
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  2148098 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaactctaacg 2148197  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  2148198 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgata 2148297  T
Q  213 cctattaaatagttagatga 232  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  2148298 ccaattaaatagttaaatga 2148317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 15405968 - 15406202
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  15405968 aatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaataatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccctaacg 15406067  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15406068 tttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaata 15406167  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15406168 ccaattaaatagttagagga-caaaaaggtaattta 15406202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 26181912 - 26182147
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  26181912 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 26182011  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26182012 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagggccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 26182111  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | |||||||| ||| | || |||||| ||||||||    
T  26182112 tcaattaaataattaaaggaccaaaaatgtaattta 26182147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Original strand, 19847539 - 19847778
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19847539 tcactatttaatcataattc-ttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 19847637  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  19847638 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatccaataccaactaa 19847737  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaatttac 261  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||    
T  19847738 atagttagatgaccaaaaatgtaattaagccttaaatttac 19847778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 24372179 - 24372414
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||      
T  24372179 aatatcagtcacaatttaatcataatactttaaaaaggaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaatg 24372278  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  24372279 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 24372378  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24372379 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 24372414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16305263 - 16305028
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16305263 aatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaagacataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 16305164  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggacc-aatccaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  16305163 tttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaaatccgat 16305064  T
Q  212 acctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  16305063 accaattaaatagttagagga-caaaaatgtaattta 16305028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 8174097 - 8174332
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8174097 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataaaaacaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 8174196  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  8174197 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagaaacggtgagaaatttaaaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgata 8174296  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8174297 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 8174332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 34735556 - 34735790
Alignment:
Q  14 atatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacat 113  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  34735556 atatcagtcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgt 34735655  T
Q  114 ttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34735656 ttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgatac 34735755  T
Q  214 ctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  34735756 caattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 34735790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10992081 - 10991849
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  10992081 tcactatttaatcataatatcttagcaagacataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactgtaacgtttatttg 10991982  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||    
T  10991981 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaa 10991882  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  10991881 atagttagaggaccaaaaaggtaatttagcctt 10991849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 19815916 - 19816156
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  19815916 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgagcaaaatgatactaataaataaagtcagaggacccacataacacagactctaacg 19816015  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  19816016 tttatttgaataaaactagcagaaaggactaaatgtagtaatggtctgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 19816115  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  19816116 ccaattaaatagtttgaggaccaaaaaggtaatttagcctt 19816156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 24138718 - 24138952
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24138718 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 24138817  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacag-aaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||   ||    
T  24138818 tttatttgaataaaactaacagaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttaattaaagtactaatttgat 24138917  T
Q  212 acctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24138918 accaattaaatagttagaataccaaaaaggtaatt 24138952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 12860587 - 12860771
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12860587 tcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccgtaacgtttatttg 12860686  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12860687 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 12860771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36713823 - 36713591
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  36713823 aatatcagtcactatt-aatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatga--ctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 36713727  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  36713726 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacactgagaaatttagaggacataaataaatcaatttttagttagaagatcaatccgata 36713627  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36713626 ccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaattta 36713591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 7496200 - 7496424
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7496200 tcactatttactcataattc-ttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagaacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 7496298  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  7496299 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 7496398  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  7496399 atagttagaggactaaaaatgtaatt 7496424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41474318 - 41474085
Alignment:
Q  15 tatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatt 114  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||    
T  41474318 tatcagtcactatttaattataataccttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagatgacccacataacacaaacactaacgtt 41474219  T
Q  115 tatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacc 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  41474218 tatttaaataaaactaacataaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttaattacaggaccgatccgatacc 41474119  T
Q  215 tattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41474118 aattaaatagttagaagaccaaaaatgtaattta 41474085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Original strand, 33470195 - 33470368
Alignment:
Q  73 taaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33470195 taaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 33470294  T
Q  173 ccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  33470295 ccgaaataaatcaatttttagtcagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 33470368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24138227 - 24138071
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24138227 cacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaattttt 24138128  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24138127 agttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 24138071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 243
Target Start/End: Original strand, 29472533 - 29472684
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29472533 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccaaaataaatcaattttt 29472632  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggta 243  Q
     |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  29472633 tgttagaggatcaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggta 29472684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12860542 - 12860385
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860542 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 12860443  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  12860442 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 12860385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15405918 - 15405761
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15405918 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 15405819  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  15405818 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 15405761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 248
Target Start/End: Original strand, 17052342 - 17052501
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052342 acccacataacacaaacactaacgtttatttgaatgaaactaacagaaatgactaaatgtagtaanggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 17052441  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  17052442 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaacatgtaattta 17052501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8174047 - 8173876
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8174047 acccacataacacaaaccctaacgttcatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 8173948  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattta 260  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8173947 tttagttagaggaccaatctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctataattta 8173876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 251
Target Start/End: Original strand, 30898589 - 30898751
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30898589 acccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaacaaaataaatcaatt 30898688  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  30898689 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaaacc 30898751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 16305313 - 16305470
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16305313 acccacataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggattgaaataaatcaatt 16305412  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16305413 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataatt 16305470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19815863 - 19815703
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19815863 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 19815764  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  19815763 agttagagaaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaaacct 19815703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24372129 - 24371958
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24372129 acccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 24372030  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaattta 260  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  24372029 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctttatttta 24371958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26181859 - 26181705
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26181859 cacataacacaaaccttaaggtttatttgaataaaactaacagaaaggaatatatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 26181760  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26181759 agttagtggaccaatccaattccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 26181705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34735505 - 34735354
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34735505 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34735406  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  34735405 tttagttagaggatcaattcgataccaactaaatagttagaggaccaaaaag 34735354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 38332974 - 38333125
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38332974 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 38333073  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  38333074 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 38333125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 239
Target Start/End: Original strand, 13193276 - 13193426
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13193276 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 13193375  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  13193376 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 13193426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7496142 - 7495985
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7496142 acccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 7496043  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  7496042 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 7495985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2148048 - 2147890
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatca-at 187  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  2148048 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggcccgaaataaatcattt 2147949  T
Q  188 ttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2147948 ttttagttagaggaccaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 2147890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 41474373 - 41474527
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41474373 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggaccgaaataaatcaattttt 41474472  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  41474473 agttagaggactaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataatt 41474527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42834582 - 42834452
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42834582 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaatagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttt 42834483  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaa 221  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  42834482 tagttagaggaccaatccgataccaattaaa 42834452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 10992139 - 10992255
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10992139 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10992238  T
Q  189 tttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  10992239 tttaattagaggaccaa 10992255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 36713873 - 36714013
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  36713873 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaatgactaagtgtggtaacggtgagaaacctagatgacgaaaataaatcaatt 36713972  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36713973 tttagtttgaggaccaattcaataccaattaaatagttaga 36714013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8444951 - 8444821
Alignment:
Q  122 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| | | ||||    
T  8444951 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagataaccaatccgatatcaactaaa 8444852  T
Q  222 tagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  8444851 tagttagaagaccaaaaaggtaattaaacct 8444821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17051039 - 17050932
Alignment:
Q  141 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17051039 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 17050940  T
Q  241 gtaattta 248  Q
     |||||||    
T  17050939 ataattta 17050932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Original strand, 15744785 - 15744892
Alignment:
Q  139 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||    
T  15744785 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaa 15744884  T
Q  239 aggtaatt 246  Q
    | ||||||    
T  15744885 atgtaatt 15744892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17032703 - 17032596
Alignment:
Q  141 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaag 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17032703 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 17032604  T
Q  241 gtaattta 248  Q
     |||||||    
T  17032603 ataattta 17032596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17052292 - 17052164
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataac- 111  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17052292 aatatcagtcattatttaatcataataccttaacgt----taagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 17052197  T
Q  112 atttatttgaataaaactaacagaaatgactaa 144  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17052196 ttttatttgaataaaactaacagcaaagactaa 17052164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8962477 - 8962353
Alignment:
Q  134 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgat 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||     
T  8962477 gaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttgagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatactaattaaatagttagaggac 8962378  T
Q  234 caaaaaggtaatttaacctttaatt 258  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8962377 caaaaagataatttaccctttaatt 8962353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 251
Target Start/End: Original strand, 7469458 - 7469608
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7469458 acataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgacta--------aacgatgagaaacttagacgactgaaataaatcaattttta 7469549  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    |||| || |||||||  ||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  7469550 gttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagagaaccaaaaaggtaattaaacc 7469608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 8963166 - 8963264
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  8963166 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaagtaattta 8963264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Original strand, 8445123 - 8445236
Alignment:
Q  135 aaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||      
T  8445123 aaatgactaaatgtagtaactgtgataaacttagaggaccgaagtaaatcaatttttaattagagtgctaatccgataccaattaaatagttagaggaca 8445222  T
Q  235 aaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||    
T  8445223 aaaaaggtaattta 8445236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 23992162 - 23992267
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||  |||||||   |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  |||||    
T  23992162 aataaaattaacggaaatgtctaaaattagtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 23992261  T
Q  221 atagtt 226  Q
    ||||||    
T  23992262 atagtt 23992267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 205
Target Start/End: Original strand, 16655911 - 16655946
Alignment:
Q  170 ggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16655911 ggaccaaaataaatcaaattttagttaaaggaccaa 16655946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Original strand, 33819699 - 33819735
Alignment:
Q  169 aggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33819699 aggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaa 33819735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9989553 - 9989326
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9989553 tcactgtttaatcataataccttaataagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 9989454  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  9989453 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 9989354  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9989353 atagttagatgaccaaaaaagtaattta 9989326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 32288289 - 32288523
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32288289 aatatcaatcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaataatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaaca 32288388  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32288389 tt-atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtattaacagtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 32288487  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32288488 tcaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaattta 32288523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 24040297 - 24040534
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaat--gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24040297 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatatgatactaataaataaagttagaagacccacataacacaaaccctaa 24040396  T
Q  111 catttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaa 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  24040397 cgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaggaacggtgagaaacttaaaggactgaaataagtcaatttttagttagaggatcaatccga 24040496  T
Q  211 tacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24040497 tactaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattta 24040534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2183173 - 2182940
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2183173 tcactatttaatcataatactttaacaagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 2183074  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  2183073 aataaagctaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagacgacataaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 2182974  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||| |||||    
T  2182973 atagttagaggaccaaaaaattaatttagccttt 2182940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 36440412 - 36440647
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||     
T  36440412 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaaccccaacg 36440511  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  36440512 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagttatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 36440611  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  36440612 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 36440647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 35569992 - 35570208
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  35569992 aatatcagtcactatttaatcataataacttaacaaggaataagaccgaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccctaacg 35570091  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  35570092 tttatttgaataaaactaacagaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagactaaaataaatcaatttttagttagaggagtaatcaaata 35570191  T
Q  213 cctattaaatagttaga 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  35570192 ccaattaaatagttaga 35570208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 37424474 - 37424711
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg---acccacataacacaaaccata 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||    
T  37424474 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaaaaataggaccaaaatgatattaataaataaagttagaggaggacccacataacacaaactcta 37424573  T
Q  110 acatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatcca 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37424574 acgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggactaatcca 37424673  T
Q  210 atacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37424674 ata-caattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 37424711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27186103 - 27185879
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27186103 tcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaattaataaaattagaggacccacataaaacaaaccctaacatttatttg 27186004  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||    
T  27186003 aataaaact-acaggaaggactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaa 27185905  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||    
T  27185904 atagttagaggaccaaaaaagtaatt 27185879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 25567208 - 25567440
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  25567208 tcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgactaaaataatactaataaataaagttagaggactcacataacaaaaactctaacgtttatttg 25567307  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  25567308 aataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaaggatcaaaataaatcaatttttagttaaagaaccaatccgataccaattaa 25567407  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    ||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||    
T  25567408 atagttaaaggactaaaaaagtaatttagcctt 25567440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 38958936 - 38959168
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||     
T  38958936 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataagaccaaaatgatacttataaataaagttagaggactcacataacacaaaatctaac- 38959034  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38959035 tttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 38959134  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38959135 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 38959168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 34264560 - 34264799
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  34264560 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatagaaccaaaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 34264659  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaa----taaatcaatttttagttaaaggaccaatcc 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34264660 tttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataattaaatcaatttttagttagaggaccaattc 34264759  T
Q  209 aatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||  |||||||    
T  34264760 aataccaattaaatagttggaggaccaaaaatataattta 34264799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11316158 - 11315958
Alignment:
Q  51 catatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316158 cataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacctacataacacaaaccctaacgtttattggaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 11316059  T
Q  151 taacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
    |||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  11316058 taatagtaagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaagga-caaaaaaataatttaac 11315960  T
Q  251 ct 252  Q
    ||    
T  11315959 ct 11315958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38958886 - 38958729
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38958886 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38958787  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38958786 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 38958729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Original strand, 27186161 - 27186327
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27186161 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatt 27186260  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  27186261 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagccttta 27186327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35569934 - 35569780
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35569934 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 35569835  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  35569834 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaagaccaaaaaggtaatt 35569780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36440362 - 36440205
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36440362 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 36440263  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36440262 tttagttagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaggatcaaaaaggtaatt 36440205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16860462 - 16860306
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16860462 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttt 16860363  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16860362 agttagaggaccaatctgataccgattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 16860306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39325573 - 39325417
Alignment:
Q  90 cccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattt 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39325573 cccacataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 39325474  T
Q  190 ttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  39325473 ttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatt 39325417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32288237 - 32288083
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32288237 ccacataacacaaacc-taacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttt 32288139  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32288138 tagttagatgaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 32288083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24040247 - 24040090
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24040247 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaatt 24040148  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||    
T  24040147 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaggaccaaaaagataatt 24040090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 25182941 - 25183098
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25182941 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagcaacattgagaagcttagaggaccgaaataaatcaatt 25183040  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25183041 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 25183098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 248
Target Start/End: Original strand, 39325636 - 39325802
Alignment:
Q  82 ttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataa 181  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  39325636 ttagaggagccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagtactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataa 39325735  T
Q  182 atcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||    
T  39325736 atcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagaggactaaaaatgtaattta 39325802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37424424 - 37424267
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37424424 acccaaataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 37424325  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37424324 tttagttagaggaccaatctgataccaaataaatagttagaggatcaaaaagataatt 37424267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 2183231 - 2183371
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  2183231 acccacataagacaaaccttaatgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttacagaaccgaaataaatcaatt 2183330  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2183331 tttagttaaaggatcaatccgataccaattaaatagttaga 2183371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 9989611 - 9989751
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9989611 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 9989710  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    |||||||| | || |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  9989711 tttagttagaagatcaatccgataccaattaaataggtaga 9989751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 223
Target Start/End: Original strand, 11316244 - 11316376
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11316244 ccacataacacaaaccctaacgtttattcgaataaaattaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 11316343  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaata 223  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11316344 tagttagaggaccaatccgataccaattaaata 11316376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19184725 - 19184602
Alignment:
Q  123 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaat 222  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  19184725 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 19184626  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  19184625 agttagaggaccaaaaaggtaatt 19184602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29199109 - 29198974
Alignment:
Q  94 cataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 193  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||     
T  29199109 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttaa 29199010  T
Q  194 ttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttaga 229  Q
    ||| ||||| |||  |||| | ||||||||||||||    
T  29199009 ttagaggactaatttaatatcaattaaatagttaga 29198974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 1140080 - 1140210
Alignment:
Q  108 taacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatc 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1140080 taacgtttatttgaataaaactaaca--------taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatc 1140171  T
Q  208 caatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1140172 cgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggcaatt 1140210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34264479 - 34264356
Alignment:
Q  134 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaagg-----------accaatccaatacctattaaat 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||| ||| |||||||    
T  34264479 gaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagagggccaatccaacaccaatccaacaccaattaaat 34264380  T
Q  223 agttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  34264379 agttagaggatcaaaaaggtaatt 34264356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Original strand, 31756630 - 31756753
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||    
T  31756630 taacagaaatgacaaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggactaaaccgttaccaattaaatagttag 31756729  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
      || ||||||||||||| |||||    
T  31756730 gagaccaaaaaggtaattaaacct 31756753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16860632 - 16860705
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 86  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860632 aatatcagtcactaattaatcataatacattaacaagacataagaccaaaatgatactaataaataaagttaga 16860705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 253
Target Start/End: Original strand, 19185504 - 19185636
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  |||||    
T  19185504 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccaatactaattaa 19185603  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    |||||||   || ||||||||||||||| ||||    
T  19185604 atagttaagggaccaaaaaggtaatttagcctt 19185636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16860515 - 16860588
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 86  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860515 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatggaaccaaaatgatactaataaataaagttaga 16860588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 33817656 - 33817731
Alignment:
Q  173 ccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33817656 ccaaaataaataaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagagaatcaaaaaggtaattta 33817731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Original strand, 29199167 - 29199249
Alignment:
Q  16 atcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  29199167 atcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaattaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 29199249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 260
Target Start/End: Original strand, 2597377 - 2597479
Alignment:
Q  158 gagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaat 257  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||| ||    
T  2597377 gagaaagttaaaggaccaaaataaatcaaaatttagttaagagaccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaagataatttaaccttttat 2597476  T
Q  258 tta 260  Q
    |||    
T  2597477 tta 2597479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Original strand, 19128434 - 19128498
Alignment:
Q  182 atcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19128434 atcaatttttagttagaggatcaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 19128498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 1762886 - 1763127
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1762886 aatatcagtcactatttaatcagaacactttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 1762985  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  1762986 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatttgata 1763085  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  1763086 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccttt 1763127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16024127 - 16023900
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16024127 tcactatttaatcataatacctcaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccctcataacacaaaccctaacgtttatttg 16024028  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16024027 aataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 16023928  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  16023927 atagttagaggaccaaaaaagtaattta 16023900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20306240 - 20306001
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  20306240 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaatcctaacg 20306141  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20306140 tttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacggtgggaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 20306041  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  20306040 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacct 20306001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37304258 - 37304031
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37304258 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccctcataacacaaaccctaacgtttatttg 37304159  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  37304158 aataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 37304059  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||| || |||||||||||||||    
T  37304058 atggttagaggaccaaaaaggtaattta 37304031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 12127265 - 12127507
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12127265 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 12127364  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaagg---accaatcca 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||   || |||||     
T  12127365 tttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggagaactaatccg 12127464  T
Q  210 atacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  12127465 ataccaattaaatagttagaggataaaaaatgtaatttaacct 12127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Original strand, 23476553 - 23476797
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||     
T  23476553 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaacattaacg 23476652  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23476653 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgaagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 23476752  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctttaat 257  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  23476753 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcctttaat 23476797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 2064431 - 2064658
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2064431 tcactatttaatcataataccttaacaagacataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacatttatttg 2064530  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  2064531 aataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaa 2064630  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2064631 atagttagaggatcaaaaatgtaattta 2064658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 12481279 - 12481506
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12481279 tcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 12481378  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  12481379 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 12481478  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  12481479 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 12481506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 45052901 - 45053141
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  45052901 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 45053000  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  45053001 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacactgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 45053100  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  45053101 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcctt 45053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 35612294 - 35612529
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||     
T  35612294 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccaacataacacagaccctaacg 35612393  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  35612394 tttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacagtgataaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 35612493  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35612494 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 35612529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 8762611 - 8762851
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||     
T  8762611 aatatcagttactatttattcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaactcttaacg 8762710  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8762711 tttatttgaataaagctaacagaaaggactaaatgtagtaccgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 8762810  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  8762811 ccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagcctt 8762851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 6798027 - 6798254
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6798027 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaaattagaggaccctcataacacaaaccctaacgtttatttg 6798126  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  6798127 aataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaa 6798226  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  6798227 atagttagaagaccaaaaagataattta 6798254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3089580 - 3089340
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||     
T  3089580 aatatcagtcactatttaatcataatactttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttataggatccacataacacaaaccctaacg 3089481  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||     
T  3089480 tttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagtaccaatccgatg 3089381  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||    
T  3089380 ccaattaaatagttagaggacccaaaaggtaatttagcctt 3089340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25996022 - 25995782
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||     
T  25996022 aatatcagccactatttaatcatattaccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaatctcaacg 25995923  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  25995922 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttaattaaaggaccaatctgata 25995823  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  25995822 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttatcctt 25995782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 49140355 - 49140589
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  49140355 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatataaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 49140454  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||    
T  49140455 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttataggaccgaaataaatcaa-ttttagttagaggactaatctgata 49140553  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  49140554 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 49140589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Original strand, 27547883 - 27548116
Alignment:
Q  15 tatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  27547883 tatcagtcactatttaatcataatactttaacaaagcatagtaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataccataaaccctaacgtt 27547982  T
Q  115 tatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  27547983 tatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatacc 27548082  T
Q  215 tattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  27548083 aattaaatagttagaggacaaaaaaggtaattta 27548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38127947 - 38127714
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38127947 aatatcattcactatttaatcataataccttaataaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaaccataacg 38127848  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  38127847 tttatttgaataaaactaacagcaaggactaaatatagtaacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatccgaaa 38127748  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  38127747 ccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaatt 38127714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 9006403 - 9006637
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  9006403 aatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaactctaacg 9006502  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9006503 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaa-ggtgagaaacttggaggatccaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 9006601  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     | |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  9006602 acgattaaatagttagaagaccaaaaagataattta 9006637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 37284940 - 37285174
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37284940 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaaca 37285039  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37285040 tttatttaaataaaactaaca-taaggactaaatgtagtaattgtgagaaatttagagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 37285138  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  37285139 ccaattaaatagttaaaggaccaaaaatgtaattta 37285174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 255
Target Start/End: Original strand, 45843367 - 45843571
Alignment:
Q  51 catatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45843367 cataggaccaaaatgatactaataaaaaaagctagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 45843466  T
Q  151 taacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  45843467 taacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttaac 45843566  T
Q  251 cttta 255  Q
    |||||    
T  45843567 cttta 45843571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 37585905 - 37586146
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||     
T  37585905 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatatgaccaaaataatactaataaataaagttagaggacccacataatataaactctaacg 37586004  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  37586005 tttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaagaccgaaataaattaatttttaattagaggatcaatccgata 37586104  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    || ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  37586105 ccaattaagtagttagatgacaaaaaagataatttaaccttt 37586146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 49643883 - 49644117
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  49643883 aatatcactcactatttaatcataataccttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacataacacaaacc-taacg 49643981  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||    
T  49643982 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggatggaaacttagaggaccgaattaaatcaatttttaattagaggaccaatctgata 49644081  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  49644082 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattta 49644117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 27400636 - 27400815
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27400636 aatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataagactaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 27400735  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27400736 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaacaaaataaatcaattttta 27400815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37576411 - 37576184
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37576411 tcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggaccaaaatgatacttataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 37576312  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  37576311 aataaaactaacagaaaggactaaatttagtaactttgataaatttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattta 37576212  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||    
T  37576211 atagttaaaggaccaaaaaggtaattta 37576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31703844 - 31703660
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  31703844 tcactatttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccccaacgtttatttg 31703745  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31703744 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 31703660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 247
Target Start/End: Original strand, 4330058 - 4330283
Alignment:
Q  22 cactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttga 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4330058 cactatttaaccataataccttaacaaggaatatgattaaaatgatactaataaataaagttagaagacccacataacacaaaccctaacgtttatttga 4330157  T
Q  122 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaa 221  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| ||||||    
T  4330158 ataaaactaagagaaaggactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagggttaatccgataccaattaaa 4330257  T
Q  222 tagttagatgatcaaaaaggtaattt 247  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||    
T  4330258 taattagaggacaaaaaaggtaattt 4330283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 44322948 - 44323105
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44322948 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44323047  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44323048 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 44323105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 39486414 - 39486637
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  39486414 aatatcaatcactatttaatcataatac---------gcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaaccctaacg 39486504  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  39486505 ttt-tttgaataaaactaactgaaaggactaaatgtagtaacggtaaaaaacttagaaaacggaaataaatcaatttttagttagaggaacaattcaata 39486603  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39486604 ccaattaaatagttagatgattaaaaaagtaatt 39486637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12481221 - 12481064
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481221 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 12481122  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  12481121 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 12481064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4697044 - 4696879
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697044 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 4696945  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||    
T  4696944 tttagttataggaccaatccgataccaattaaatagttagaggactaaaaagataatttagccttt 4696879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9006353 - 9006188
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9006353 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtactaacggtgataaacttagatgaccgaaataaatcaatt 9006254  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  9006253 tttagttaaaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaaaccttt 9006188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49643833 - 49643676
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49643833 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 49643734  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  49643733 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 49643676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 37304316 - 37304479
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37304316 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 37304415  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||    
T  37304416 tttagttataggatcaatccgataccaattaaatagttagagggccaaaaaaataatttaacct 37304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12127216 - 12127062
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12127216 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 12127117  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  12127116 agttagagaaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 12127062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 16024185 - 16024342
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16024185 acccacataacataaaccctaacgtttatttgaataaaactaccagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 16024284  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  16024285 tttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 16024342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27547831 - 27547674
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27547831 acccacatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaaggactaaatgtattaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 27547732  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  27547731 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaagaccaaaaaggtaatt 27547674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49140305 - 49140148
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49140305 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 49140206  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  49140205 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataatt 49140148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Original strand, 26723092 - 26723248
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26723092 cacataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 26723191  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||| | || |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26723192 agttagatgatcaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaattta 26723248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26707358 - 26707204
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26707358 acccacataacacaaactccaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggggagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 26707259  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggta 243  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  26707258 tttagttagaggaccgatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggta 26707204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35612241 - 35612087
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35612241 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaacaaaataaatcaattttt 35612142  T
Q  192 agttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  35612141 agttagaggatcaatccgataccaattaaatacttagaggaccaaaaaggtaatt 35612087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23476503 - 23476346
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23476503 acccacataacacagattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaatt 23476404  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  23476403 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 23476346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 37576469 - 37576626
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37576469 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatt 37576568  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  37576569 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 37576626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1762836 - 1762679
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1762836 acccacataatacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacataaatgattaaatgttgtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1762737  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1762736 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 1762679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37585851 - 37585698
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  37585851 acataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatataataacggtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaattttta 37585752  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  37585751 gttagaggatcaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 37585698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38000645 - 38000489
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38000645 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaat 38000546  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  38000545 tagaagaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacc 38000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45052849 - 45052695
Alignment:
Q  91 ccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttt 190  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45052849 ccacataaca-aaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttt 45052751  T
Q  191 tagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  45052750 tagttagaggatcaatctgataccaattaaatagtttgaagatcaaaaagataatt 45052695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37284886 - 37284740
Alignment:
Q  93 acataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  37284886 acataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaatgaccgaaataaatcaattttta 37284787  T
Q  193 gttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaa 239  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  37284786 gttagagaaccaatccgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaa 37284740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8760434 - 8760277
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  8760434 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaagctaacataaatgactaaatgtagtaacactgaaaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 8760335  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8760334 tttagttagagggtcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 8760277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 20306290 - 20306447
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20306290 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatc 20306389  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  20306390 tttagttggaggatcaatctgataccaattaactagttagaggaccaaagaggtaatt 20306447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 31703901 - 31704058
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31703901 acccatataacataaagcctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttataggtccaaaataaatcaatt 31704000  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  31704001 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 31704058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 89 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39486364 - 39486205
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  39486364 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaatagaactaacagaaaagaccaaatgcagtaaatgtgagaaacttaaacgaccgaaataaatcaatt 39486265  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||    
T  39486264 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaagataattta 39486205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6797969 - 6797812
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6797969 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatggagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6797870  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||| ||| | || |||||  ||| | ||||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  6797869 tttaattagaagatcaatctgatatcaattaaatagttagagaaccaaaaaagtaatt 6797812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23598201 - 23598075
Alignment:
Q  122 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaa 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  23598201 ataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaa 23598102  T
Q  222 tagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||    
T  23598101 tagttagaggaccaaaaagataattta 23598075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 26707408 - 26707491
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacat 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707408 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacat 26707491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 34967050 - 34967169
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34967050 taacggaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttaatggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 34967149  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |  |||||||| ||||||||    
T  34967150 agaatcaaaaatgtaattta 34967169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Original strand, 5537132 - 5537255
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5537132 taacggaaatgactaaatgtagtaacagtgagaatcttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccgattaaatagttag 5537231  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    | || ||||||  |||||||||||    
T  5537232 aggaccaaaaatataatttaacct 5537255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 46593559 - 46593677
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  46593559 taacggaaatgactaaatatagtaacagtgagaaactta-aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 46593657  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | || |||||| ||||||||    
T  46593658 aggaccaaaaaagtaattta 46593677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10831243 - 10831125
Alignment:
Q  139 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10831243 gactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 10831144  T
Q  239 aggtaatttaacctttaat 257  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  10831143 aggtaatttagcctttaat 10831125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 44322898 - 44322816
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccaca 95  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322898 aatatcagtcacaatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccaca 44322816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 10831935 - 10832040
Alignment:
Q  150 gtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaa 249  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10831935 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccagttaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttaa 10832034  T
Q  250 ccttta 255  Q
    ||||||    
T  10832035 ccttta 10832040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Original strand, 37467563 - 37467667
Alignment:
Q  144 aatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggta 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37467563 aatgtagtaacagtgagaaacttaagggacctaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggta 37467662  T
Q  244 attta 248  Q
    |||||    
T  37467663 attta 37467667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 4697094 - 4697172
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacc 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697094 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacc 4697172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34966425 - 34966306
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34966425 taacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggactgaaataaatcaagttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 34966326  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | |  |||||||||||||||    
T  34966325 aggtccaaaaaggtaattta 34966306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 49837493 - 49837417
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49837493 taacggaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 49837417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5536520 - 5536401
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5536520 taacggaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagagacccaaataaatcaaattttaggtagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 5536421  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | |  |||||| ||||||||    
T  5536420 agggccaaaaatgtaattta 5536401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13183852 - 13183769
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13183852 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagactaattcaataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaattta 13183769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32047865 - 32047748
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  32047865 taacagaaagaacgaaatatggtaacggtgatgaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttag 32047766  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    | || |||||||||||||    
T  32047765 aggaccaaaaaggtaatt 32047748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28884139 - 28884016
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||    
T  28884139 taacagaaatgatgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaattattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaataattag 28884040  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaacct 252  Q
    | || ||||||||||||| |||||    
T  28884039 aggaccaaaaaggtaattaaacct 28884016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46592934 - 46592815
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||||||||    
T  46592934 taacggaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggatcgaaataaatcattttttagttagaggatcaatctgatatcaattaaatagttag 46592835  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    | |  |||||||||||||||    
T  46592834 agggccaaaaaggtaattta 46592815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 248
Target Start/End: Original strand, 13109191 - 13109274
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13109191 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatcggataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaattta 13109274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Original strand, 4697163 - 4697248
Alignment:
Q  165 ttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||   || ||||||||||||||||    
T  4697163 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagatagcgaattaaaaaggtaatttaac 4697248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 25996072 - 25996130
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatg 147  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25996072 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatg 25996130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Original strand, 28884751 - 28884861
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||   ||| |||||||||||||    
T  28884751 taacagaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggactaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgtaaccaattaaatagttag 28884850  T
Q  229 atgatcaaaaa 239  Q
    | || ||||||    
T  28884851 aggaccaaaaa 28884861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46289397 - 46289324
Alignment:
Q  178 ataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  46289397 ataaatcaatttttagttagatgaccaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataattaaacc 46289324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 246
Target Start/End: Original strand, 32048510 - 32048627
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||| ||  |||| | ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  || | | |||||||||||    
T  32048510 taacagaaaggatgaaatatggtaactgtgataaagttagaggacaaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttatcaaataaatagttag 32048609  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    | || |||||| ||||||    
T  32048610 aggaccaaaaaagtaatt 32048627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37466922 - 37466800
Alignment:
Q  129 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttag 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||  ||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||  ||||    
T  37466922 taacagaaaagactaaatgtagtaacaatgaaaaacttgg--gacggaaataaatcaatttttagttagagcagtaatccgataccaattaaatgattag 37466825  T
Q  229 atgatcaaaaaggtaatttaacctt 253  Q
    |  || ||||| |||||||| ||||    
T  37466824 agaataaaaaatgtaatttagcctt 37466800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 46289405 - 46289450
Alignment:
Q  210 atacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttta 255  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  46289405 ataccaattaaatagttaaaggatcaaaaaagtaatttaaccttta 46289450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 248
Target Start/End: Original strand, 49838756 - 49838832
Alignment:
Q  171 gaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  49838756 gaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaataatta-aaggccaaaaaggtaattta 49838832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19938 - 19705
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  19938 tcactatttaatcataaaaccttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataatacaaactctaacgtttatttg 19839  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  19838 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccaataccaactaa 19739  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatttaaccttt 254  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19738 atagttagaggaccaaaaaggtaatttaaccttt 19705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 19996 - 20153
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  19996 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacaaaaaataatcaatt 20095  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  20096 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 20153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 50688 - 50924
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50688 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 50787  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  50788 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgata 50887  T
Q  213 cctatt-aaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  50888 ccaattaaaatagttagaggaccaaaaatgtaattta 50924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50638 - 50481
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  50638 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 50539  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  50538 tttagttagaggaccaatcagataccaattaaataggtagaggaccaaaaagataatt 50481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18511 - 18276
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18511 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaaattagaggacccacataacacaaaccctaacg 18412  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18411 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtagcggtgagaaacttagaagacctaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 18312  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  18311 ccaattaaatagttagaggaccaaaaatataattta 18276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 18561 - 18718
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 18660  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||| ||||||    
T  18661 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattaaaggaccaaaaatgtaatt 18718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 14355 - 14582
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  14355 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccagataacacaaactctaacgtttatttg 14454  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||    
T  14455 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacatagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgatatcaattaa 14554  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  14555 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 14582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14297 - 14140
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14297 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 14198  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14197 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaacaggtaatt 14140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45994 - 45759
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45994 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgaaactaataagtaaagttagaggacccacataacacaaaccctaacg 45895  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  45894 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaccgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgata 45795  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||    
T  45794 ccaattaaataattagaggaccaaaatagtaattta 45759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 56424 - 56581
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56424 acccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 56523  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  56524 tttagttagatgaccaatcaaataccaactaaatagttagaggataaaaaagataatt 56581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 63549 - 63706
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  63549 acccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 63648  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  63649 tttagttagatgaccaatcaaataccaactaaatagttagaggataaaaaagataatt 63706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 72991 - 72767
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  72991 tcactatttaatcataattc-ttaacaaggaataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 72893  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  72892 aataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 72793  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  72792 atagttagaggaccaaaaaggtaatt 72767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 73049 - 73206
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73049 acccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 73148  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  73149 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 73206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24392 - 24165
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24392 tcactatttaatcataatatcttaacaaggaacaggaccaaaatgatgttaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttg 24293  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  24292 aaaaaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcaataccaactaa 24193  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  24192 atagttagaggaccaaaaaggtaattta 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24607
Alignment:
Q  95 ataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 194  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24456 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 24555  T
Q  195 taaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  24556 tagaggaccaatccgataccaactaaatagttagagtaccaaaaatgtaatt 24607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 349311 - 349095
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||     
T  349311 aatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacgcaaactctaacg 349212  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  349211 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaaaaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctaata 349112  T
Q  213 cctattaaatagttaga 229  Q
    |  ||||||||||||||    
T  349111 ctaattaaatagttaga 349095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 349361 - 349515
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  349361 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaaaagtgag-aacttagaggaccgaaataaatcaatt 349459  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaa 244  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||    
T  349460 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaggggaccaaaaaggtaa 349515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 113654 - 113811
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  113654 acccacataacactaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagatgaccgaaagaaatcaatt 113753  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| |  ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  113754 tttagttacaggaccaatctgatagcacttaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 113811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 113604 - 113519
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  113604 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagaggagccacataa 113519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 113522 - 113396
Alignment:
Q  122 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaa 221  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  113522 ataaaactaacggaaaggaataaatttactaacgatgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcggataccaattaaa 113423  T
Q  222 tagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
     ||||||| || |||||| || |||||    
T  113422 cagttagaggaccaaaaatgttattta 113396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8666 - 8432
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  8666 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacctcaacg 8567  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  8566 tttatttgaataaaactaacagaaaatactaaatattgtaacagtgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatttttagttaaa-gatcaatctgata 8468  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8467 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattta 8432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 8716 - 8873
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  8716 acccgcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaacataaataaatcaatt 8815  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  8816 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 8873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20980 - 20756
Alignment:
Q  21 tcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataacatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  20980 tcactatttaatcataattc-ttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttg 20882  T
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  20881 aataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgtgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaa 20782  T
Q  221 atagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||    
T  20781 atagttagatgaccaaaaatgtaatt 20756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 21038 - 21086
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21038 acccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaatagaaa 21086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21749 - 21517
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  21749 aatatcagtcactatttaatcataatattttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacctaac- 21651  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  21650 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 21551  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21550 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 21517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 22451 - 22598
Alignment:
Q  99 cacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaa 198  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22451 cacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 22550  T
Q  199 ggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22551 ggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 22598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15686 - 15456
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15686 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggacaaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactcaaaca 15587  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaata 212  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  15586 tttatttgaat-----taacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaatgaccaaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgata 15492  T
Q  213 cctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaattta 248  Q
    || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15491 ccaattgaatagttagaggataaaaaaggtaattta 15456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15893
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15736 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagggattaaatgtagtcatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 15835  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15836 tttagttagatgaccaatccgataccagttaaatagttagaggatcaaaaaagtaatt 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6233 - 6044
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||      
T  6233 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgatcaaaatgata---ataaataaagttagaggatccacataacacaaactctaatg 6137  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6136 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacaatgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 6044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 227
Target Start/End: Original strand, 6283 - 6420
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6283 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaatt 6381  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  6382 tttagttagaggaccaatacgataccaattaattagtta 6420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 82070 - 82231
Alignment:
Q  13 aatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  82070 aatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaataggaccaaaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacg 82169  T
Q  113 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82170 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 82231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 82020 - 81863
Alignment:
Q  89 acccacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 188  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  82020 acccaaattacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 81921  T
Q  189 tttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  81920 tttagttagaggaccaatctgataccaaataaatagttagaggatcaaaaagataatt 81863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 252
Target Start/End: Original strand, 90782 - 90889
Alignment:
Q  145 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaaatagttagatgatcaaaaaggtaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  90782 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaactaaatagttagaggacgaaaaatataa 90881  T
Q  245 tttaacct 252  Q
    ||||||||    
T  90882 tttaacct 90889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14350 - 14246
Alignment:
Q  92 cacataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 191  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14350 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagcaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 14251  T
Q  192 agtta 196  Q
    |||||    
T  14250 agtta 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 251
Target Start/End: Original strand, 147133 - 147289
Alignment:
Q  94 cataacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 193  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  147133 cataacataaatcctaacgtttattcgaataaaattaacggaaatgactaaatatagtaacgatgagaaacttaacggaccgaaataaatcaatttttag 147232  T
Q  194 ttaaaggaccaatccaatacctattaa--atagttagatgatcaaaaaggtaatttaacc 251  Q
    ||  ||||||||| |||||   |||||  ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  147233 ttcgaggaccaattcaata---attaaatatagttagaggaccaaaaaggtactttaacc 147289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 144150 - 144042
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||||    
T  144150 aataaaaccaatggaaaagactaaaagtagtaacggtgagaaatttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatatgataccaattaa 144051  T
Q  221 atagttaga 229  Q
    |||||||||    
T  144050 atagttaga 144042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9932 - 9806
Alignment:
Q  100 acaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaag 199  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  9932 acaaaccctaacgttttttt-aataaaactaacggaaaggactaaaagtagtaacggatagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagag 9834  T
Q  200 gaccaatccaatacctattaaatagtta 227  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||    
T  9833 gagcaaaccgataccaattaaatagtta 9806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 227
Target Start/End: Original strand, 10876 - 10982
Alignment:
Q  121 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccaatacctattaa 220  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||| || ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||  |||||    
T  10876 aataaaattaacggaaagaactaaaagtggtaacagaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 10975  T
Q  221 atagtta 227  Q
    |||||||    
T  10976 atagtta 10982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University