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Alignment Overview

Query: NF7796_high_3 (Length: 357)

Name: NF7796_high_3
Description: NF7796
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7796_high_3
NF7796_high_3
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (18-339)||(21455678-21455998)
chr6 (129-340)||(7215481-7215692)
chr6 (153-340)||(13739136-13739324)
chr6 (194-340)||(13744677-13744824)
chr6 (18-104)||(7215365-7215451)
chr6 (162-338)||(6208047-6208224)
chr6 (191-340)||(10826059-10826210)
chr6 (153-310)||(16548069-16548228)
chr6 (153-340)||(33898987-33899176)
chr6 (194-338)||(29409235-29409381)
chr6 (201-339)||(699536-699674)
chr6 (194-338)||(31132435-31132580)
chr6 (153-310)||(16442362-16442521)
chr6 (183-340)||(17829980-17830139)
chr6 (283-338)||(3605736-3605790)
chr6 (194-338)||(1312423-1312569)
chr6 (284-346)||(15151481-15151543)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (153-340)||(5916222-5916410)
chr2 (153-340)||(7472654-7472842)
chr2 (153-340)||(36312216-36312404)
chr2 (194-340)||(39141450-39141597)
chr2 (183-340)||(9988481-9988640)
chr2 (156-338)||(42515958-42516141)
chr2 (162-338)||(14821111-14821288)
chr2 (195-340)||(1945019-1945166)
chr2 (191-340)||(2213483-2213634)
chr2 (182-340)||(31562667-31562824)
chr2 (274-338)||(31224742-31224806)
chr2 (191-340)||(28127267-28127418)
chr2 (191-340)||(28261271-28261422)
chr2 (163-340)||(8170262-8170440)
chr2 (225-340)||(2213658-2213775)
chr2 (156-338)||(32501928-32502111)
chr2 (194-338)||(7296135-7296281)
chr2 (153-251)||(28641581-28641679)
chr2 (201-340)||(44619041-44619182)
chr2 (153-338)||(26207911-26208098)
chr2 (194-321)||(23358238-23358367)
chr2 (191-250)||(2234904-2234962)
chr2 (274-340)||(30007533-30007599)
chr2 (274-340)||(34433286-34433352)
chr2 (153-338)||(36548139-36548325)
chr2 (274-340)||(45714648-45714714)
chr2 (183-338)||(25747864-25748020)
chr2 (274-340)||(2215314-2215380)
chr2 (269-339)||(41580691-41580761)
chr2 (194-338)||(7295330-7295474)
chr2 (194-340)||(16467066-16467214)
chr2 (283-340)||(1763291-1763347)
chr2 (274-310)||(28641704-28641740)
chr2 (274-338)||(34997218-34997282)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (155-340)||(3622429-3622616)
chr7 (153-340)||(37639381-37639570)
chr7 (194-340)||(34010332-34010479)
chr7 (153-340)||(34365951-34366139)
chr7 (153-340)||(37562521-37562710)
chr7 (153-340)||(38230019-38230208)
chr7 (157-340)||(44967368-44967553)
chr7 (194-340)||(3342782-3342930)
chr7 (153-340)||(3375441-3375630)
chr7 (153-340)||(48459661-48459850)
chr7 (153-340)||(9456056-9456244)
chr7 (153-338)||(39391108-39391295)
chr7 (183-338)||(48134561-48134717)
chr7 (157-340)||(3750642-3750826)
chr7 (191-319)||(32205916-32206044)
chr7 (156-340)||(43737908-43738094)
chr7 (153-340)||(10371927-10372115)
chr7 (153-340)||(12632052-12632241)
chr7 (156-338)||(47217512-47217696)
chr7 (200-338)||(43631667-43631806)
chr7 (153-338)||(47021870-47022057)
chr7 (153-246)||(47301622-47301715)
chr7 (284-340)||(36920147-36920203)
chr7 (274-338)||(39977626-39977690)
chr7 (274-338)||(42752162-42752226)
chr7 (274-338)||(46541674-46541738)
chr7 (194-338)||(386452-386597)
chr7 (191-333)||(42904542-42904686)
chr7 (277-340)||(19097474-19097537)
chr7 (278-340)||(24770880-24770942)
chr7 (214-335)||(37008325-37008447)
chr7 (274-340)||(39634134-39634200)
chr7 (278-338)||(12964676-12964736)
chr7 (191-227)||(37886854-37886890)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (153-340)||(16566220-16566409)
chr4 (194-340)||(43781501-43781648)
chr4 (162-338)||(54152969-54153146)
chr4 (162-340)||(14072427-14072606)
chr4 (155-340)||(39636702-39636889)
chr4 (153-338)||(43772107-43772294)
chr4 (153-340)||(48407680-48407868)
chr4 (153-310)||(4954063-4954222)
chr4 (195-340)||(6138602-6138749)
chr4 (162-338)||(32238043-32238220)
chr4 (153-340)||(30842047-30842235)
chr4 (191-338)||(28986974-28987120)
chr4 (156-340)||(46830051-46830237)
chr4 (183-310)||(48550439-48550568)
chr4 (194-340)||(14564128-14564276)
chr4 (194-340)||(51922896-51923044)
chr4 (191-340)||(29149289-29149440)
chr4 (163-340)||(9889317-9889495)
chr4 (153-341)||(42944879-42945069)
chr4 (160-338)||(49136444-49136624)
chr4 (163-340)||(9893636-9893815)
chr4 (155-340)||(19592213-19592400)
chr4 (191-338)||(13167478-13167627)
chr4 (153-340)||(49519645-49519834)
chr4 (194-340)||(26651830-26651978)
chr4 (194-338)||(48908231-48908375)
chr4 (194-339)||(14054807-14054954)
chr4 (200-341)||(54150488-54150631)
chr4 (154-338)||(6505117-6505303)
chr4 (183-340)||(31520353-31520511)
chr4 (153-321)||(15619532-15619699)
chr4 (200-340)||(26426097-26426238)
chr4 (200-340)||(25312677-25312819)
chr4 (278-340)||(53532019-53532081)
chr4 (274-338)||(41866192-41866256)
chr4 (208-340)||(39187704-39187838)
chr4 (153-340)||(15603275-15603464)
chr4 (191-338)||(46926001-46926150)
chr4 (183-310)||(30887166-30887294)
chr4 (274-338)||(54488643-54488707)
chr4 (284-340)||(55638737-55638793)
chr4 (156-308)||(2175161-2175315)
chr4 (274-338)||(38306049-38306113)
chr4 (274-338)||(54655270-54655334)
chr4 (274-332)||(33574216-33574274)
chr4 (269-338)||(38263932-38264001)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (194-340)||(25697942-25698089)
chr8 (201-341)||(24897569-24897710)
chr8 (194-340)||(27649725-27649872)
chr8 (153-338)||(28425456-28425643)
chr8 (194-340)||(44926820-44926967)
chr8 (201-339)||(33627017-33627157)
chr8 (194-340)||(41289040-41289188)
chr8 (191-340)||(3467509-3467660)
chr8 (185-340)||(3097188-3097345)
chr8 (154-321)||(40742063-40742232)
chr8 (153-308)||(43550829-43550986)
chr8 (240-341)||(25497717-25497819)
chr8 (191-319)||(8124947-8125076)
chr8 (153-340)||(40742277-40742464)
chr8 (162-340)||(36121527-36121695)
chr8 (274-342)||(30759285-30759353)
chr8 (202-340)||(42143346-42143486)
chr8 (153-338)||(440173-440360)
chr8 (203-340)||(22936775-22936914)
chr8 (194-340)||(4941763-4941911)
chr8 (160-338)||(6399092-6399272)
chr8 (194-340)||(36114023-36114170)
chr8 (254-340)||(38114485-38114571)
chr8 (191-338)||(31246299-31246448)
chr8 (194-308)||(42148984-42149100)
chr8 (191-250)||(41981133-41981192)
chr8 (274-340)||(26243185-26243251)
chr8 (284-338)||(30081635-30081689)
chr8 (278-340)||(36779456-36779517)
chr8 (287-340)||(30085621-30085674)
chr8 (191-338)||(3619053-3619201)
chr8 (200-267)||(11126501-11126569)
chr8 (210-340)||(15206691-15206823)
chr8 (275-338)||(25929595-25929657)
chr8 (283-338)||(29970872-29970926)
chr8 (284-346)||(3465416-3465478)
chr8 (164-250)||(16915010-16915096)
chr8 (153-227)||(26243029-26243103)
chr8 (194-251)||(29023218-29023275)
chr8 (159-228)||(30081746-30081815)
chr8 (194-251)||(45147323-45147380)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (194-340)||(13253062-13253209)
chr5 (153-340)||(22482133-22482322)
chr5 (153-340)||(32454481-32454670)
chr5 (162-338)||(33953883-33954060)
chr5 (153-340)||(32030660-32030847)
chr5 (153-340)||(41834836-41835025)
chr5 (168-340)||(2430276-2430449)
chr5 (163-338)||(7714894-7715071)
chr5 (191-340)||(3667836-3667987)
chr5 (191-340)||(39987946-39988097)
chr5 (191-340)||(35760171-35760322)
chr5 (154-338)||(9275465-9275651)
chr5 (185-341)||(3060202-3060358)
chr5 (157-340)||(10058022-10058207)
chr5 (200-340)||(40791049-40791190)
chr5 (200-340)||(42146299-42146440)
chr5 (192-338)||(34106928-34107076)
chr5 (191-340)||(8049030-8049181)
chr5 (162-338)||(40885163-40885342)
chr5 (195-340)||(5710365-5710511)
chr5 (162-338)||(16158446-16158624)
chr5 (162-342)||(40495335-40495516)
chr5 (183-342)||(4292123-4292284)
chr5 (191-340)||(7385911-7386062)
chr5 (267-339)||(16843589-16843661)
chr5 (274-338)||(2483695-2483759)
chr5 (153-340)||(24045775-24045963)
chr5 (194-340)||(41740572-41740720)
chr5 (153-267)||(28869556-28869670)
chr5 (194-340)||(27021113-27021261)
chr5 (208-308)||(41959460-41959561)
chr5 (284-346)||(35847863-35847925)
chr5 (278-310)||(2868362-2868394)
chr5 (274-338)||(23914235-23914299)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (194-340)||(43728861-43729008)
chr1 (153-340)||(5410594-5410782)
chr1 (162-340)||(25229970-25230149)
chr1 (153-340)||(20800260-20800449)
chr1 (153-340)||(35569185-35569374)
chr1 (162-338)||(45710012-45710189)
chr1 (162-340)||(6464571-6464750)
chr1 (183-340)||(31223358-31223517)
chr1 (156-340)||(42850202-42850388)
chr1 (153-310)||(4369816-4369974)
chr1 (158-340)||(6166069-6166252)
chr1 (153-338)||(7826339-7826526)
chr1 (156-340)||(1199784-1199970)
chr1 (153-338)||(13055952-13056138)
chr1 (153-340)||(48510862-48511051)
chr1 (153-340)||(50977323-50977511)
chr1 (194-340)||(10470585-10470732)
chr1 (194-340)||(15884221-15884370)
chr1 (194-338)||(12247415-12247560)
chr1 (194-337)||(13931618-13931762)
chr1 (156-338)||(40229455-40229639)
chr1 (200-338)||(47123387-47123527)
chr1 (156-338)||(11023315-11023498)
chr1 (191-340)||(50406122-50406273)
chr1 (274-340)||(49242965-49243031)
chr1 (194-342)||(12468208-12468356)
chr1 (153-228)||(11051407-11051482)
chr1 (156-251)||(36205148-36205243)
chr1 (194-251)||(35536067-35536124)
chr1 (274-338)||(42002-42066)
chr1 (274-321)||(11561899-11561946)
chr1 (200-297)||(9447534-9447632)
chr1 (284-346)||(29441271-29441333)
chr1 (284-346)||(40352478-40352539)
chr1 (278-338)||(4347055-4347114)
chr1 (156-244)||(31933684-31933772)
chr1 (274-310)||(47085910-47085946)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (191-338)||(53074871-53075019)
chr3 (153-340)||(20813076-20813264)
chr3 (162-340)||(30811514-30811693)
chr3 (166-340)||(35425277-35425452)
chr3 (153-338)||(42318260-42318446)
chr3 (153-340)||(38125424-38125612)
chr3 (185-340)||(38340768-38340924)
chr3 (168-338)||(8424714-8424885)
chr3 (153-338)||(52966793-52966980)
chr3 (162-338)||(44939400-44939576)
chr3 (183-340)||(38172289-38172448)
chr3 (153-338)||(15511360-15511546)
chr3 (153-340)||(16246078-16246265)
chr3 (153-340)||(10334068-10334257)
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chr3 (153-338)||(23207052-23207237)
chr3 (185-340)||(10853249-10853406)
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chr3 (153-340)||(50664689-50664877)
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chr3 (153-340)||(35930668-35930857)
chr3 (278-338)||(19877474-19877534)
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chr3 (160-321)||(44224699-44224862)
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 21455678 - 21455998
Alignment:
Q  18 ggttaagtgttttatgttgttaaagaatgttacggaaaaatggaaggaaggcacaacaagagagaggaaaaagatttcatttgatggnnnnnnnnnnnnn 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  21455678 ggttaagcgttttatgttgttaaagaatgttacggaaaaatggaaggaacgcacaacaagagagaggaaaaagatttcatttgatggtttttttgttagt 21455777  T
Q  118 nnnnnnnnnactattgtgttggattgaaatgtttctttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactat 217  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21455778 tttttttt-actattgtgttggattgaaatgtttctttaaatacaattaaaaagataatttaatcattacacatttaaaattaattttgattcaaactat 21455876  T
Q  218 gcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaac 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21455877 gcaaacaacattaactcatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaacttacttttaactaaaatcaattcttacaaac 21455976  T
Q  318 tcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  21455977 tcaattatatcaaaatcaattc 21455998  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Original strand, 7215481 - 7215692
Alignment:
Q  129 tattgtgttggattgaaatgtttctttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacat 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7215481 tattgtgttggattggaatgtttctttaaataaaatttaaaggataatttaatcattacatatttaaaattaattttgattcaatttatgcaaacaacat 7215580  T
Q  229 taacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatc 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  7215581 taactcatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacataattgattcacgtccaattcacttttaactaaaatcaagtcttaaaaactcaattatatc 7215680  T
Q  329 aaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||||    
T  7215681 aaaatcaattct 7215692  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 13739136 - 13739324
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    |||  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  13739136 tttaattacaattacaaggataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaa 13739235  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13739236 caagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 13739324  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 13744677 - 13744824
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||    
T  13744677 aaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcactt 13744776  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13744777 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 13744824  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 7215365 - 7215451
Alignment:
Q  18 ggttaagtgttttatgttgttaaagaatgttacggaaaaatggaaggaaggcacaacaagagagaggaaaaagatttcatttgatgg 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7215365 ggttaagcgttttatgttgttaaagaatgttacggaaaaatggaagggacgcgcagcaagagagaggaaaaagatttcatttgatgg 7215451  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6208224 - 6208047
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  6208224 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaattaattttgattcaaactatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttagtaaagtgtat 6208125  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||| | ||||||||||||||    
T  6208124 ccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 6208047  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 10826059 - 10826210
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaac-acaattgattcacatccaactc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||  ||||| || ||||||    
T  10826059 tttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaaaatcaactcataagaatcacttttaaataagtatatccaaacaaaaatcaattcaaattcaactc 10826158  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10826159 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaattaattct 10826210  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 16548069 - 16548228
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||    
T  16548069 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaat 16548168  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
     |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16548169 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct 16548228  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33899176 - 33898987
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-a 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    ||||||| || ||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||||||| || ||||||||||||| |    
T  33899176 tttaaatacaattaaaaggatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattattaactcataagaatcacttttaca 33899077  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | ||||||| |||||| || | | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33899076 ttagtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 33898987  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29409381 - 29409235
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||| || || ||||| ||||||  |||  ||||||||| ||||||||    
T  29409381 aaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaaaaactgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 29409282  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||    
T  29409281 tttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctattaaaatcaatt 29409235  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 339
Target Start/End: Original strand, 699536 - 699674
Alignment:
Q  201 attttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaact 298  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| || |||||| || | | |||  |||||||||||||| ||||    
T  699536 attttgattcaaactatccaa-caacattaacttataagaattacttttagtaaagtgcatccaaacataaatcaattcttatccaactcacttt-aact 699633  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  699634 aaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattc 699674  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 31132435 - 31132580
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||   ||| |||||||||||| ||    
T  31132435 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcacttttaaataagtgtatccaaaaataacgaattaacatccaactcattt 31132534  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||| | ||||| |||| |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  31132535 ttagccaaaataaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 31132580  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16442521 - 16442362
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||    ||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||  |||||||||||||     
T  16442521 tttaaatattattaaaaggatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttcattcaaattatccaaacaatatcaactcatatgaatcacttttaaa 16442422  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    ||||||||| |||||| || | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16442421 taagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttgtaactaaaatcaattct 16442362  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17830139 - 17829980
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataag-tgtatacaaacacaattga-ttcaca 280  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |  ||||  |||| ||||||  ||||   ||||| || | | ||||||    
T  17830139 attacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaacgacttctaataaactgtaactaaacataaatcaattcaca 17830040  T
Q  281 tccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17830039 ttcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 17829980  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3605790 - 3605736
Alignment:
Q  283 caactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3605790 caactcacttttaatcaaaatcaattct-acaaaatcaattatatcaaaatcaatt 3605736  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1312569 - 1312423
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| || ||| | | ||||| | |||| || | | ||| ||| |||||||||    
T  1312569 aaaatcaattttgggtcaaactatccaaacaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccgaacataaatcaattcgcattcaactcact 1312470  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||| | | ||||||||||||||    
T  1312469 tttaaccaaaatcaattttatcaaactcgattctatcaaaatcaatt 1312423  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15151543 - 15151481
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttctcac 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15151543 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcac 15151481  T

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Target: chr2 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5916410 - 5916222
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  5916410 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaat 5916311  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | || | ||||||||||||||||    
T  5916310 aaagtgtatccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattct 5916222  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7472842 - 7472654
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    |||  || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  7472842 tttaattacaattacaaggataatttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaa 7472743  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7472742 taagtgtatccaaacataatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 7472654  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 36312216 - 36312404
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  36312216 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaat 36312315  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | || | ||||||||||||||||    
T  36312316 aaagtgtatccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattct 36312404  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39141597 - 39141450
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  39141597 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaatgagtgtatccaaacataatcaattcatatccaactcactt 39141498  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39141497 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattatatcaaaatcaattct 39141450  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9988640 - 9988481
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcaca 280  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| || | | ||||||    
T  9988640 attacacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcaca 9988541  T
Q  281 tccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9988540 tccaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 9988481  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42516141 - 42515958
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataa 254  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||||| || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||| |||| ||| |    
T  42516141 aaatagaattaaaaagataatttggttattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcattttttaatga 42516042  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || ||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42516041 gtatattcaaacataatcaattcacatcaaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaatt 42515958  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 14821111 - 14821288
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| ||||||    
T  14821111 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtat 14821210  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14821211 ccaaacataatcaattcacattaaactcacttttaactaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaattaatt 14821288  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1945166 - 1945019
Alignment:
Q  195 aaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcactt 292  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |   |||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||    
T  1945166 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 1945067  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1945066 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 1945019  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 2213483 - 2213634
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||  ||||||| |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  2213483 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 2213582  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2213583 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 2213634  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31562824 - 31562667
Alignment:
Q  182 tattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattgattcacat 281  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||| || |||||||||||||| | | || | |||||| |||  |||||| |    
T  31562824 tattacacattcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatataaactcataagaatcacttttaa-acgagtgtccaaacataatcaattcacct 31562726  T
Q  282 ccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31562725 caaattcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaatcaattct 31562667  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 31224742 - 31224806
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  31224742 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaatt 31224806  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28127418 - 28127267
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||| | ||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||    
T  28127418 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 28127319  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |  ||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||    
T  28127318 actttttagcaaaatcaattctctcaaactaaattctatcaaaatcaattct 28127267  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 28261271 - 28261422
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||  | || |||| |||| |  |||  |||||||||||||||    
T  28261271 tttaaaattaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctatgtgagagtatccaaatataaatcaattcacatccaactc 28261370  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  28261371 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattgtattaaaattaattct 28261422  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 8170262 - 8170440
Alignment:
Q  163 attaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtata 261  Q
    |||| ||||||||||||   |||| || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| | |  ||| ||||||     
T  8170262 attagaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacatctgttaacgtgtatc 8170361  T
Q  262 caaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  8170362 caaacataatcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 8170440  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 2213658 - 2213775
Alignment:
Q  225 acattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaa 322  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||     
T  2213658 acatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaagacaaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaat 2213757  T
Q  323 tatatcaaaatcaattct 340  Q
    | ||||||||||||||||    
T  2213758 tctatcaaaatcaattct 2213775  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 32501928 - 32502111
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-a 254  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||  | | ||| |||||||||  |    
T  32501928 aaatacaattaaaagggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattga 32502027  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     ||||| |||||| |||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  32502028 atgtatccaaacataatcaattcacctaaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 32502111  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 7296135 - 7296281
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||| || | |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || | | |||||||| |||||| |    
T  7296135 aaaatcaattttgacttaaactatccaaataacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcatt 7296234  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7296235 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaagtcaatt 7296281  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Original strand, 28641581 - 28641679
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  28641581 tttaaatacaattaaaaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttaattcaacatatccaaacaacatcaacttataataatcacttttaa 28641679  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44619182 - 44619041
Alignment:
Q  201 attttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaact 298  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||| ||||||  |||||||| |||||| || | | ||| | || ||||||||||||||     
T  44619182 attttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataataatcatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcccctcaaactcacttttaacc 44619083  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44619082 aaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 44619041  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26208098 - 26207911
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||    |||  || |||||||| |||||||||||| |  || |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  26208098 tttaaatacaatcaaaaggatagtttggtcattgtacatttaaaatcaattttgattcatataatccaaacaacatcaacttgtaagaatcaattttaat 26207999  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     ||||||||  ||||| || | | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| | || | ||||||||||||||    
T  26207998 taagtgtatcaaaacataaatcaattcacatccaactgacttttaaccaaaaccaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaatt 26207911  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Original strand, 23358238 - 23358367
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||| ||||||  || |  ||||  || ||||||||    
T  23358238 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacattaactcatcacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaactatttcatctcaaactcact 23358337  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  23358338 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaa 23358367  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Original strand, 2234904 - 2234962
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2234904 tttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaaca-taactcataagaatcactttta 2234962  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30007599 - 30007533
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30007599 attcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 30007533  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34433352 - 34433286
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34433352 attcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctgtcaaactcaattctatcaaaatcaattct 34433286  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 36548139 - 36548325
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||  || || ||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||  || | ||||| ||| | |    
T  36548139 tttaaatataattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaatttaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatcattttaagt 36548238  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     || |||| |||||| || | | ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  36548239 gagagtatccaaacataaatcaattcacatcagactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 36548325  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45714714 - 45714648
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45714714 attcacatcgaactcatttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattct 45714648  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25748020 - 25747864
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacat 281  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||| || | || ||||||| |||||  | | ||||| |||||| || | | | ||||    
T  25748020 attatactttcaaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaattacat 25747921  T
Q  282 ccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25747920 tcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 25747864  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Original strand, 2215314 - 2215380
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  2215314 attcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaagctcaattctatcaaaatcaattct 2215380  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41580761 - 41580691
Alignment:
Q  269 aattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  41580761 aattaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattcgatcaaaatcaattc 41580691  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7295474 - 7295330
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||  |||  ||| || || |||||| ||    
T  7295474 aaaatcaagtttgacttaaactatccaaacaacatcaactcatgataatcactttt-atatgtgtatccaaacataaatcaatttacgtcaaactcattt 7295376  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  7295375 ttaaccagaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 7295330  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 16467066 - 16467214
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||  || ||||||||||||| || |   ||| |||||| || | | || ||||| ||||||||    
T  16467066 aaaattaattttgatctaaactatccaaactacatcaacccataagaatcacttttacattatcatatccaaacataaatcaatttacatctaactcact 16467165  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |||||||||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  16467166 tttaaccaaaatcaattatgccaaaatcaattctatcaaaatcaattct 16467214  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 340
Target Start/End: Original strand, 1763291 - 1763347
Alignment:
Q  283 caactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  1763291 caactcaattttaaccaaaatcaatt-ttacaaaatcaattttatcaaaatcaattct 1763347  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 310
Target Start/End: Original strand, 28641704 - 28641740
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28641704 attcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattct 28641740  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34997282 - 34997218
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |  |||||| || | ||||||||||||||    
T  34997282 attcacatccaattcatttttaacaaaaatcaattttgtcaaactaaattttatcaaaatcaatt 34997218  T

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Target: chr7 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3622616 - 3622429
Alignment:
Q  155 taaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-ta 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |   |||||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||    
T  3622616 taaatacaattaaaaggatactttgatcgttacacatttaaaatcaattttgatttatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagta 3622517  T
Q  254 agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3622516 agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 3622429  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 37639381 - 37639570
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |  |||||||||||||||    
T  37639381 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacatttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaat 37639480  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||| | | ||||||  |||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37639481 aaagtttctccaaacataaatcaattcacattcaattcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 37639570  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 34010332 - 34010479
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||   |||| |||||||||||||    
T  34010332 aaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaaccacttttaaatgagtgtattcaaacataatcagttcatatccaactcactt 34010431  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34010432 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattct 34010479  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34366139 - 34365951
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||    ||||| | || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  34366139 tttaaacacagttaaaagggtaatttggtcattacgccttcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaat 34366040  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||| |||| |||||| || | | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34366039 aagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactaacttttaactaaaatcaattctttcaaactccattatatcaaaatcaattct 34365951  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 37562521 - 37562710
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||    ||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||     
T  37562521 tttaaatattattaaaaggatagtttggtcattacacatacaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaa 37562620  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  37562621 taagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaatcaattct 37562710  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 38230019 - 38230208
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||    
T  38230019 tttaaatacaattaaatggatagtttagtcattacacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaat 38230118  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     || ||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  38230119 aaaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattct 38230208  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44967553 - 44967368
Alignment:
Q  157 aatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-g 255  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||   | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| |    
T  44967553 aatataattaaaaggataatttggtcattacaaactcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaag 44967454  T
Q  256 tgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44967453 tgtattcaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattct 44967368  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 3342782 - 3342930
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| |||||| |||||| || | | |||| ||||||||||||    
T  3342782 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcatatccaactcact 3342881  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  3342882 tttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 3342930  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 3375441 - 3375630
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||  ||| || ||||||||||||||     
T  3375441 tttaaatacaattaaaaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgatccaaatcatccaaacaacatcgactcataagaatcacttttaag 3375540  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | ||||||| ||||||||| | | |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3375541 tgagtgtatccaaacacaaatcaattcacaccaaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 3375630  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 48459661 - 48459850
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||    |||||||  ||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||     
T  48459661 tttaaatataattaaaaggatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaacatccattcataagaatcacttttaag 48459760  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48459761 taagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 48459850  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 9456056 - 9456244
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aa 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||  || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||||| ||    
T  9456056 tttaaatacaattaaaaagataatttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaagatcaactcataagaatcacttttaaa 9456155  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||  | |||| || | ||||||||||||||||    
T  9456156 caagtgtatccaaacataatcaatttacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcgaacttaattctatcaaaatcaattct 9456244  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39391295 - 39391108
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||     ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||| |||     
T  39391295 tttaaatacaattaaaaggatagttaggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttgtaag 39391196  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || |||||| |||||| || | | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||||    
T  39391195 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctaaaaaaatcaattctatcaaaatcaatt 39391108  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 48134561 - 48134717
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaacacaattgattcacat 281  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||| ||| |||||| |||  |||| | |    
T  48134561 attacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttataaaaatcacttttaaacaagtttatccaaacataatcaattctcct 48134660  T
Q  282 ccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  48134661 caaacccacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 48134717  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 3750642 - 3750826
Alignment:
Q  157 aatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-g 255  Q
    |||||||||||||||||| |||    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | || ||| ||| || || ||| |    
T  3750642 aatacaattaaaaggatagtttggtcattacacatt-aaaattaattttgatttaaactatccaaacaacatcaattcataagattcaattatattaaag 3750740  T
Q  256 tgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  3750741 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttattaaaatctattct 3750826  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Original strand, 32205916 - 32206044
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| || | | |||||||| ||| |    
T  32205916 tttaaaatcaattttgattcatactat-caaacaacat-aactcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaaccc 32206013  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactc 319  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32206014 acttttaattaaaatcaattctttcaaactc 32206044  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43738094 - 43737908
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Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataa 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||    ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||    
T  43738094 aaatacaattaaaaggttaatttggtcatttcacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaaataa 43737995  T
Q  255 gtgtatacaaac-acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    || ||| ||||| | |||  ||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  43737994 gtttatccaaacaaaaatcaattcatatctaactaacttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattatgttaaaatcaattct 43737908  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10372115 - 10371927
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||   ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |  |||||||||| ||||    
T  10372115 tttaaatacaattaaa-ggatggtttagtcattacgcattcaaaatcaattttgattcaaactatccgaacaacatcaacccacaagaatcacttctaat 10372017  T
Q  253 aag-tgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||  ||||  |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10372016 aaactgtaaccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 10371927  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12632241 - 12632052
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  12632241 tttaaatacaattaaaaggatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaacaattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 12632142  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
      |||  |  ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||  || | ||||||||||||||||    
T  12632141 cgagtacactcaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatctattctctcaaacaaaattctatcaaaatcaattct 12632052  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47217696 - 47217512
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-a 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||  || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || | ||||||||||||   |    
T  47217696 aaatataattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcga 47217597  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||| || |||||| || | | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  47217596 gtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 47217512  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43631806 - 43631667
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaact 298  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| || |||| |  ||||||||||||||| |||  ||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||     
T  43631806 aattttgattcaatatatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcatatccaaacataatcaattcatatctaactcacttttaacc 43631707  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  43631706 aaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 43631667  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 47021870 - 47022057
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||| || ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| || |  | |||||||| | || |    
T  47021870 tttaaatacaattaaaatgataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttcattcaaattatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacatctagt 47021969  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || |||||| |||||| || | | ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  47021970 aaagtgtatccaaacataaatcaattcactttcaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 47022057  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47301715 - 47301622
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcact 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||  || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||    
T  47301715 tttaaatataattaaaaggataatttagtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcact 47301622  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36920203 - 36920147
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  36920203 aactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattttatcaaaattaattct 36920147  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 39977626 - 39977690
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  39977626 attcatatcaaactcacttttgactaaaatcaattctttcaaactaaattctatcaaaatcaatt 39977690  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42752226 - 42752162
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||    
T  42752226 attcacattcaactcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 42752162  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 46541674 - 46541738
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  46541674 attcacattcaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 46541738  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 386597 - 386452
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || | || ||||||||||||   | ||| ||| |||||| || | | ||||||| || || |||    
T  386597 aaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacatcaa-tcataagaatcacttttcggttagtatatccaaacataaatcaattcacattcagctaact 386499  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  386498 tttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaatt 386452  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Original strand, 42904542 - 42904686
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| | || |||||||||||| ||  |||||||  |||||  |||  ||||||||| |||||    
T  42904542 tttaaaagtaattttgatttaaaatatacaaacaaaattaattcataagaatcacttttaaacgagtgtatcaaaacataaatcaattcacatctaactc 42904641  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaat 333  Q
    | ||||| | |||| |||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  42904642 atttttatccaaaaacaattctctcaaactcaattctatcaaaat 42904686  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 340
Target Start/End: Original strand, 19097474 - 19097537
Alignment:
Q  277 cacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19097474 cacatctagctcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaattaattct 19097537  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24770942 - 24770880
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| || | ||||||||| ||||||    
T  24770942 acatccaactcacttttaaccaaaatcaattatctcaaacttaattctatcaaaattaattct 24770880  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37008447 - 37008325
Alignment:
Q  214 ctatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctta 312  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| || |||| | |||||| || | | |||| || |||||||||||||| |||||||||||  |    
T  37008447 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttataagaaagtgtctccaaacataaatcaatcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattccaa 37008348  T
Q  313 caaactcaaatatatcaaaatca 335  Q
    |||| |||| | ||| |||||||    
T  37008347 caaaatcaattctataaaaatca 37008325  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39634200 - 39634134
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | || |||||||||||    
T  39634200 attcatattcaactcacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtccaaatcaattct 39634134  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Original strand, 12964676 - 12964736
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  12964676 acattcaactcacttataacgaaaatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 12964736  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37886890 - 37886854
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaaca 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37886890 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 37886854  T

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Target: chr4 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 16566220 - 16566409
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||    
T  16566220 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaat 16566319  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16566320 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 16566409  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43781648 - 43781501
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||    
T  43781648 aaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcactt 43781549  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43781548 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 43781501  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 54152969 - 54153146
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||    
T  54152969 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcatgagaatcacttctagtaaagtgtat 54153068  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54153069 tcaaacataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattatattaaaatcaatt 54153146  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Original strand, 14072427 - 14072606
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtat 260  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || | ||||||||    
T  14072427 aattaaaaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcattagaatcacttctattaaagtgtat 14072526  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||| |||  ||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14072527 ccaaacataatcaatttaccttcaactcacttttaaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 14072606  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 340
Target Start/End: Original strand, 39636702 - 39636889
Alignment:
Q  155 taaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-ta 253  Q
    |||||| ||||||||||||| |||     |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||    
T  39636702 taaatataattaaaaggatattttggtcgttacacatttaaaatcaattttgattcatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagta 39636801  T
Q  254 agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39636802 agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 39636889  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43772294 - 43772107
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||    |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||  | |||||||||| |||     
T  43772294 tttaaatataattaaaaggatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttgattcatattatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttctaaa 43772195  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaatt-gattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  43772194 aaagtgtatccaaacataaatcgattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 43772107  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48407868 - 48407680
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||  || || ||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||| || ||||||||||| ||     
T  48407868 tttaaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 48407769  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48407768 caagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 48407680  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4954222 - 4954063
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  4954222 tttaaatacaattaaaaggataattaggtcattacacatttaaaattaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 4954123  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    | || |||  ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4954122 tgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattct 4954063  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6138749 - 6138602
Alignment:
Q  195 aaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcactt 292  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  6138749 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcatttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 6138650  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6138649 ttaaccaaaatcaattatttcaaactcaattctatcaaaatcaattct 6138602  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32238220 - 32238043
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  32238220 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaatcagttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttctaatatagtgtat 32238121  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||| ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||    
T  32238120 ccaaacataaccaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 32238043  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 30842047 - 30842235
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||  || || ||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||| || ||||||||||| ||     
T  30842047 tttaaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 30842146  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30842147 caagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 30842235  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 28986974 - 28987120
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcac 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||  | | ||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||    
T  28986974 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcactta-agtgagtgtattcaaacataatcaattcacctcaaactcac 28987072  T
Q  291 ttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  28987073 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 28987120  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 46830237 - 46830051
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa- 254  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||| |||||||| |||||||||  | | ||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||     
T  46830237 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacatttaaaatcaattttgatgtagaatatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaagaaa 46830138  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||||||    
T  46830137 gtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattct 46830051  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48550568 - 48550439
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaaca-caattgattcaca 280  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || | |||| ||| ||||||  |||  |||||||    
T  48550568 attacacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtttatccaaacataaatcaattcaca 48550469  T
Q  281 tccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48550468 tccaactcacttttaaccaaaatcaattct 48550439  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14564276 - 14564128
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |  |||| |||||| || | | |||| |||||||||||     
T  14564276 aaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaaggtatccaaacataaatcaattcatatccaactcaca 14564177  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14564176 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 14564128  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 51922896 - 51923044
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||| |||||| |||||| || | | |||| || |||||||||    
T  51922896 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcagattcaactcact 51922995  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||    
T  51922996 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaacaaaatcaattct 51923044  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29149440 - 29149289
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||  ||||||| |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  29149440 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 29149341  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29149340 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 29149289  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9889495 - 9889317
Alignment:
Q  163 attaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtata 261  Q
    |||||||||||||||||   |||| || || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||| || | |||||||     
T  9889495 attaaaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatc 9889396  T
Q  262 caaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9889395 caaacatatacaattcatatctaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 9889317  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42945069 - 42944879
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||    |||| || |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||     
T  42945069 tttaaatataattaaaaggatagtttggtcattatacatttaaaatcaattttgatacatactatccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaag 42944970  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattctt 341  Q
    ||||| |||  |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  42944969 taagtatatctaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaataaattctt 42944879  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 49136444 - 49136624
Alignment:
Q  160 acaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgt 258  Q
    |||||||||||||||||||    |||  || || ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  49136444 acaattaaaaggataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattaaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgt 49136543  T
Q  259 atacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || |||||| || | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||    
T  49136544 atccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccataatcaattctctcaaactcaattataccagaatcaatt 49136624  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 9893636 - 9893815
Alignment:
Q  163 attaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtata 261  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || || ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| || |  ||||||     
T  9893636 attaaaaggataatttaatcattatacattcaaaatcaattttaatttaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttcaagtgggtgtatc 9893735  T
Q  262 caaacaca-attgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| | ||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9893736 caaacatatatcaattcatatctaactcacttttgacaaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattct 9893815  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19592400 - 19592213
Alignment:
Q  155 taaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||    |||  || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | || |  | ||||||||||||| |||    
T  19592400 taaatacaattaaaagaataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacgtcaattcgtaagaatcacttttagtaa 19592301  T
Q  255 -gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||| |||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  19592300 agtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcacttttaaccaaaatcaattctctaaaactcaattctatcaaaatcaattct 19592213  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 13167478 - 13167627
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||   || |||||||||||||| |  |||||| |||| | || | | ||||||| ||||||    
T  13167478 tttaaaagcaattttgattcaatctatccaaacatcattaatacataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaatataaatcaattcacattcaactc 13167577  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13167578 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaatt 13167627  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 49519645 - 49519834
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||    |||||||  ||||||| |||||| || || ||||| ||||||| || || | || ||||||| ||||||     
T  49519645 tttaaatataattaaaatgatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaatatcaattcataagaatcatttttaag 49519744  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  49519745 caagtgtatccaaacataaataaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaaccaattct 49519834  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26651978 - 26651830
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| || ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| || | | ||||||| |||||||||    
T  26651978 aaaatcaattttgattcaaactatccaaataacatcgactcataagaattacttttagtaaagtgtatctaaacataaatcaattcacattcaactcact 26651879  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||    
T  26651878 tttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattct 26651830  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 48908231 - 48908375
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttt 293  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||     |||| |||||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  48908231 aaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatcaacttatatgaattacttttaagcgaggtatccaaacataaccaattcacatcaaactcacttt 48908330  T
Q  294 taactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||    
T  48908331 taaccaaaatcaattctctcaaactcaataatattaaaatcaatt 48908375  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 339
Target Start/End: Original strand, 14054807 - 14054954
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||   | ||||||||||| |||||| ||| |||||| || | | |||||||| ||||||||    
T  14054807 aaaatcaattttaatttaaagtattcaaacaacatcaacttgaaataatcacttttatataagtttatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 14054906  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14054907 tttgactaaactcaattctttcaaactcaattatgtcaaaatcaattc 14054954  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Original strand, 54150488 - 54150631
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaac 297  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||     
T  54150488 aattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcatttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaat 54150587  T
Q  298 taaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattctt 341  Q
     ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  54150588 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctt 54150631  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 6505117 - 6505303
Alignment:
Q  154 ttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-at 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   |||| |  || ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| || | |||| ||||||||||| ||    
T  6505117 ttaaatgcaattaaaaggataattcagtcattatatattcaaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagtcatgataatcacttttatat 6505216  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||||  ||||| || | | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  6505217 gagtgtatctaaacataaatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaagtcaatt 6505303  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31520511 - 31520353
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaaca-caattgattcacat 281  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||  |||  |||||  |||  |||||||     
T  31520511 attacacatttaaaatcaatttttattcaaactacccaaaaaacatcaactcataaaaatcacttttaataagcatatctaaacataaatccattcacac 31520412  T
Q  282 ccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | | || |||||||||||||    
T  31520411 ccaactcacttttaaccaaaattaattctttcaaacttcattctaccaaaatcaattct 31520353  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Original strand, 15619532 - 15619699
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| || || || | |||||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||| || |    
T  15619532 tttaaatacaattaaaatgataatttagtcattacacattcaagatca-ttttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttatagt 15619630  T
Q  253 aagtgtatacaaacaca-attgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
    || ||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  15619631 aa-tgtatccaaacatacatcaattcacatccaactcactttttaccaaaatcaattctctcaaactcaa 15619699  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26426238 - 26426097
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaact 298  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| || |||| |  ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||  ||| | ||| ||||||||||||||     
T  26426238 aattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataatcaatttatatctaactcacttttaacc 26426139  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26426138 aaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 26426097  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Original strand, 25312677 - 25312819
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaac 297  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||  || | || |||||| ||||||| || |||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||     
T  25312677 aattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaat 25312776  T
Q  298 taaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25312777 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 25312819  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 53532019 - 53532081
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53532019 acatccaactcacttttaactaaaatcaattatgtcaaactcaattttatcaaaatcaattct 53532081  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 41866192 - 41866256
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| | ||||||||||||||    
T  41866192 attcacatccaactcacttttaactaaactcaattccctcaaactcaattttatcaaaatcaatt 41866256  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 39187704 - 39187838
Alignment:
Q  208 ttcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatca 305  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| |  |||||||||| || ||| |||||| |||||| || | | ||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  39187704 ttcaaattattcaaacaacatcaactaacaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaaattacttttaaccaaaatca 39187803  T
Q  306 attcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39187804 attctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 39187838  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 15603275 - 15603464
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |  |||   | || ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||     
T  15603275 tttaaaaacaatcaaaaggataatttgatcattgtgcattcaaaatcaattttgacttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaag 15603374  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||| |||  |||||||| | | |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15603375 caagtatatctaaacacaaatcaattcacatcaaactcactttttaccataatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 15603464  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 46926001 - 46926150
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||| || ||||| | || | ||||||||||||   ||||||| |||||| || | | |||||||| |||||    
T  46926001 tttaaaagtaattttgattcaaaatatataaataaaattaattcataaaaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactc 46926100  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  46926101 acttttaaccaaaaacaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 46926150  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30887294 - 30887166
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaacacaattgattcacat 281  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||||| || | | |  |||    
T  30887294 attacacattcaaaatcaattttgatacaaaccatccaaacatcattaactcataagaatcacttttatattggtgtatccaaacataaatcaatttcat 30887195  T
Q  282 ccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30887194 caaactcacgtttaactaaaataaattct 30887166  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 54488643 - 54488707
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||    
T  54488643 attcacattcaactcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 54488707  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55638793 - 55638737
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55638793 aactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 55638737  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2175315 - 2175161
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||  || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || | ||||||||||||   |    
T  2175315 aaatataattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcga 2175216  T
Q  255 gtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaatt 308  Q
    ||| || ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  2175215 gtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaatt 2175161  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 38306049 - 38306113
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||    
T  38306049 attcgcattcaactcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 38306113  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 54655270 - 54655334
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  54655270 attcacatcaaacacacttttgactaaaatcaattattttaaactcaattatgtcaaaatcaatt 54655334  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Original strand, 33574216 - 33574274
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaa 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  33574216 attcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaa 33574274  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 338
Target Start/End: Original strand, 38263932 - 38264001
Alignment:
Q  269 aattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38263932 aattaattcacatcaaactcaattttaagcaaaattaattttctcaaactcaattatatcaaaatcaatt 38264001  T

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Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25698089 - 25697942
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  25698089 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcactt 25697990  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25697989 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 25697942  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24897710 - 24897569
Alignment:
Q  201 attttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaacta 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  24897710 attttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaaataaatgtatccaaacataattcattcatatccaactcacttttaacca 24897611  T
Q  300 aaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattctt 341  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  24897610 aaatcaattctcataaactcaattttatcaaaatcaattctt 24897569  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 27649725 - 27649872
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||  ||||| | |  ||||| |||||| ||||||    
T  27649725 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatctaaacatattcaattcatatccaaatcactt 27649824  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27649825 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattct 27649872  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28425643 - 28425456
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||| |||     
T  28425643 tttaaatacaattaaaaggatagtttggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttgtaag 28425544  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || |||||| |||||| || | | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  28425543 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctatcaaaatcaatt 28425456  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 44926820 - 44926967
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||    
T  44926820 aaaattaattttgattcaaactatccaaataacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcactt 44926919  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  44926920 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattct 44926967  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33627157 - 33627017
Alignment:
Q  201 attttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaact 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||| || | | |||  |||||||||| |||||| |    
T  33627157 attttgattcaaactatccaaacaacattaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcttatccaactcagttttaaat 33627058  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  33627057 aaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattc 33627017  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41289188 - 41289040
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||  |||||||  |||||||||    
T  41289188 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacctataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacaatcaactcact 41289089  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  41289088 tttaattaaaatcaattctctcaaactcaattctgtcaaaatcaattct 41289040  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 3467509 - 3467660
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || | || |||||||||||||| ||| | ||| |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  3467509 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaccaacatcaattcataagaatcacttttaaataaatatatccaaacagaaatcaattcacattcaactc 3467608  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3467609 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 3467660  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3097345 - 3097188
Alignment:
Q  185 tacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaaca-caattgattcacatc 282  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||| ||| ||||||  |||  ||||| |||    
T  3097345 tacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 3097246  T
Q  283 caactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  3097245 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 3097188  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Original strand, 40742063 - 40742232
Alignment:
Q  154 ttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| || ||| |||||||  || ||||||| || |||| || ||||||| ||||| ||    
T  40742063 ttaaatacaattaaaaggataatttgatcattacacattcaaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaatatcaactcataagaatcaattttatta 40742162  T
Q  254 a-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
    | |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  40742163 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaa 40742232  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 43550829 - 43550986
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||  |  |||||||||||||||    
T  43550829 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtctttacacattcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaat 43550928  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaatt 308  Q
     |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43550929 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 43550986  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Original strand, 25497717 - 25497819
Alignment:
Q  240 aatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  25497717 aatcacttttaaataagtgtatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctcctaaactcaattttatcaaaatcaatt 25497816  T
Q  339 ctt 341  Q
    |||    
T  25497817 ctt 25497819  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Original strand, 8124947 - 8125076
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactca 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||  | |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  8124947 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacttcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataatcaattcacatcaaactca 8125046  T
Q  290 cttttaactaaaatcaattcttacaaactc 319  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||||||    
T  8125047 cttctaaccaaaatcaattctctcaaactc 8125076  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40742464 - 40742277
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    | ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||| || ||||||||||  | |    
T  40742464 tttaaacacaattaaaagggtaatttggtcactacacatttaaaatcaattttgatttaaaatatccaaacatcatcaactcataagaatcacttacatt 40742365  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | |||||| |||||| || | | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  40742364 a-gtgtatccaaacataaatcaattcagatcaaactcacttttaacgaaaatcaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaattct 40742277  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36121695 - 36121527
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||| || ||| ||||||    
T  36121695 aattataaggataatttagttattagacattcaaaattaattttgattcaaactattcaaaca-----------tgagaatcacttatagtaaagtgtat 36121607  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||||||    
T  36121606 ccaaacataatctattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattct 36121527  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30759353 - 30759285
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30759353 attcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatattaaaatcaattcttc 30759285  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42143486 - 42143346
Alignment:
Q  202 ttttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaacta 299  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| || | | ||||| || ||||||||||||||||    
T  42143486 ttttgtttcaaattatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaacta 42143387  T
Q  300 aaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42143386 aaatcaattttctcaaactcaattatatcataatcaattct 42143346  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 440360 - 440173
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||    |||| || || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||||     
T  440360 tttaaatacaacaaaaaggataagttggtcattatacattcaaaatcagttttgattcaatctatccaaacaacgttaactcataagaatcatttttaac 440261  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | | ||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||    
T  440260 tgaatgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcagactcaattctatcaaaatcaatt 440173  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22936914 - 22936775
Alignment:
Q  203 tttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaa 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |  |||||||||| |||||| |||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22936914 tttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaa 22936815  T
Q  301 aatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||    
T  22936814 aatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattct 22936775  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4941911 - 4941763
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| | ||| |||||| || | | ||||| || ||||||||    
T  4941911 aaaatcaattttaattcaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcgcttttaaataattttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 4941812  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4941811 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcagaatcaattct 4941763  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6399272 - 6399092
Alignment:
Q  160 acaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgt 258  Q
    |||||||||| ||||||||    ||| ||| || ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  6399272 acaattaaaaagataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgattaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgt 6399173  T
Q  259 atacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||  |||||  |||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||    
T  6399172 atcgaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccataatcaattctatcaaactcaattctaccagaatcaatt 6399092  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36114170 - 36114023
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||| || ||||||||||||||   ||||||| |||||| ||   ||  ||||| |||| ||||    
T  36114170 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaccaatctacatcaaacttactt 36114071  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36114070 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 36114023  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 340
Target Start/End: Original strand, 38114485 - 38114571
Alignment:
Q  254 agtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38114485 agtgtatccaaacataatcaattcacatccaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaataaattct 38114571  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31246448 - 31246299
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat--aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaact 287  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||  |  ||| |||| |||||| || | | ||||||| |||||    
T  31246448 tttaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaag-gtatccaaacataaatcaattcacattcaact 31246350  T
Q  288 cacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||    
T  31246349 cacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 31246299  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Original strand, 42148984 - 42149100
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||  |||||| || ||||||||    
T  42148984 aaaatcaattttgattcaaattatctaaacaacatcaactcatacgaatcacttttaaataagtctatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 42149083  T
Q  292 tttaactaaaatcaatt 308  Q
    |||||| ||||||||||    
T  42149084 tttaaccaaaatcaatt 42149100  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Original strand, 41981133 - 41981192
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  41981133 tttaaaatcaattttgattcaaagtatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 41981192  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Original strand, 26243185 - 26243251
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  26243185 attcatatcaaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaatcaattct 26243251  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30081689 - 30081635
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  30081689 aactcacttttaactaaaatcaattttcacaaaatcaattttatcaaaatcaatt 30081635  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 36779456 - 36779517
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36779456 acattcaactcacttttaatcaaaatcaattct-acaaaatcaattatatcaaaatcaattct 36779517  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30085674 - 30085621
Alignment:
Q  287 tcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30085674 tcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattatatcaaaatcaattct 30085621  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3619201 - 3619053
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactca 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | || ||||||||||| | || | ||||| ||||||||| | | |  ||  |||||||    
T  3619201 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattgataagaatcactttcatattaatgtatccaaacacaaatcaatttcactcaactca 3619102  T
Q  290 cttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||| |  | ||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||    
T  3619101 cttttgatcagaatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 3619053  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 11126501 - 11126569
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactt-ttaataagtgtatacaaaca 267  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11126501 aattttgattcaaactatccaaacaacacaaactcatgaaaatcacttatttataagtgtatccaaaca 11126569  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 340
Target Start/End: Original strand, 15206691 - 15206823
Alignment:
Q  210 caaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaat 307  Q
    |||||||| |||||||||| || || | |||||||||| ||| | | ||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15206691 caaactatccaaacaacatgaatttttaagaatcacttctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttacccaaaatcaat 15206790  T
Q  308 tcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | |  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  15206791 tttgtcaaactcaattctatcaaaattaattct 15206823  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25929657 - 25929595
Alignment:
Q  275 ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25929657 ttcacaaccaactca-ttttaactataattaattctttcaacctcaattatatcaaaatcaatt 25929595  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 338
Target Start/End: Original strand, 29970872 - 29970926
Alignment:
Q  283 caactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  29970872 caactcacttttaactaaaatcaatt-atacaaattcaattctatcaaaatcaatt 29970926  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3465478 - 3465416
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttctcac 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  3465478 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcac 3465416  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 16915010 - 16915096
Alignment:
Q  164 ttaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta 250  Q
    |||||||| |||||||   ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |  |||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  16915010 ttaaaaggttaatttagtcattacacattcaaaatcaattttgatacaaaccaaccaaacatcattaactcataagaatcactttta 16915096  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Original strand, 26243029 - 26243103
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaaca 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||   | |||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26243029 tttaaatacaattaaaagaatagtttggtttttacgcattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 26243103  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Original strand, 29023218 - 29023275
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||| ||||||    
T  29023218 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcaattttaa 29023275  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30081815 - 30081746
Alignment:
Q  159 tacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacat 228  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||| | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  30081815 tacaattaaaaggataatttggtcattacacatctaaaatcaattttgaaacaaactatccaaacaacat 30081746  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45147380 - 45147323
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  45147380 aaaatcaattttgattcaagttattcaaacaatatcaacttataagaatcacttttaa 45147323  T

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Target: chr5 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13253209 - 13253062
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  ||||| || ||||||||||    
T  13253209 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataatcaattcatattcaactcactt 13253110  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13253109 ttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattct 13253062  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 22482133 - 22482322
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||    
T  22482133 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaat 22482232  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  22482233 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattct 22482322  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 32454481 - 32454670
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aa 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    |||  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| ||    
T  32454481 tttaattacaattacaaggataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaa 32454580  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatat-atcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  32454581 caagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaatcaaaatcaattct 32454670  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33954060 - 33953883
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtat 260  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || |||||||||| || | ||||||||    
T  33954060 aattaaaaggataatttagtcattacacattcaaaattaattttgattcaaactatccgaacaacatcaactcatcagaatcacttctattaaagtgtat 33953961  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||| |||  ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||    
T  33953960 ccaaacataatcaatttacgttcaactcacttttaaataaaatcaattctctcaaactcaattctaccaaaatcaatt 33953883  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 32030660 - 32030847
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aa 251  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||| ||    
T  32030660 tttaaatacaactaaaaggatagtttagtcattacaccttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaac--ataagaatcacttttgaa 32030757  T
Q  252 taagtgtatacaaac-acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| |||  |||| | |||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32030758 taagtatatcaaaacaaaaatcaattcacatctaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 32030847  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 41834836 - 41835025
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |  | |||||||||| || |    
T  41834836 tttaaatacaattaaaaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagt 41834935  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    || |||||| |||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||    
T  41834936 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactgaattctatcaaaatcaattct 41835025  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2430449 - 2430276
Alignment:
Q  168 aaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaac 266  Q
    ||||||||||||   |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || | |||||||| |||||    
T  2430449 aaggataatttagtcattacacactcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaac 2430350  T
Q  267 acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | |||  |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  2430349 ataatcaattcatgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattccatcaaaatgaattct 2430276  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Original strand, 7714894 - 7715071
Alignment:
Q  163 attaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtata 261  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||| |     
T  7714894 attaaaaggataatttagtcattatactttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacttataagaatcaatttcaagtgagtgtgtc 7714993  T
Q  262 caaacaca-attgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     ||||| | ||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  7714994 aaaacatatatcaattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 7715071  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 3667836 - 3667987
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||  ||||||| |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  3667836 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 3667935  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3667936 actttttaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 3667987  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39988097 - 39987946
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||  |||||||||| |||  || |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| || | | ||||| || |||||    
T  39988097 tttaaaagaaattttgatttaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactc 39987998  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39987997 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 39987946  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 35760171 - 35760322
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | ||||| |||||||  ||||||| |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  35760171 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcagttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 35760270  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35760271 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 35760322  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9275651 - 9275465
Alignment:
Q  154 ttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||||| || ||||| || ||| |||||||  || |||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||    
T  9275651 ttaaatacaattaaaaagataatttggtcattacacattcaaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttatta 9275552  T
Q  254 a-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | |||||| |||||| || | | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  9275551 aagtgtatccaaacataaatcaattaacatctaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattttatcaaaatcaatt 9275465  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3060358 - 3060202
Alignment:
Q  185 tacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaa-ttgattcacatcc 283  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| | | ||| ||| |||||| || || ||||| ||      
T  3060358 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcactttaagtgagtatatccaaacataaattaattcatataa 3060260  T
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattctt 341  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||    
T  3060259 aactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctt 3060202  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 10058022 - 10058207
Alignment:
Q  157 aatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-g 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||     || ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |  | |||||||||| || ||| |    
T  10058022 aatacaattaaaatgataatttggtcgttgcacgttcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaag 10058121  T
Q  256 tgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| |||||| || | | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10058122 tgtatccaaacataaatcaattcatttccaactcacttttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattct 10058207  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40791190 - 40791049
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaact 298  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| || |||| |  ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||     
T  40791190 aattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataatcaattcatatctaactcacttttaacc 40791091  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40791090 aaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 40791049  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Original strand, 42146299 - 42146440
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaact 298  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| || |||| |  ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||     
T  42146299 aattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataatcaattcatatctaactcacttttaacc 42146398  T
Q  299 aaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42146399 aaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 42146440  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34107076 - 34106928
Alignment:
Q  192 ttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacac-aattgattcacatccaactca 289  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||| | | |||||  |||||  |||  ||||||||| ||||||    
T  34107076 ttaaaagtaattttgattcaacctattcaaacaacattaattcataagaattacttttaaatgaatgtatttaaacattaatcaattcacatctaactca 34106977  T
Q  290 cttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  34106976 cttttaaccaaaaacaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaatt 34106928  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8049181 - 8049030
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||  |||||||||| |||  || |||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| || | | || || || |||||    
T  8049181 tttaaaagcaattttgatttaaatcatccaaacaacaacaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattaacctcaaactc 8049082  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8049081 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 8049030  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 40885163 - 40885342
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaa-tcacttttaat-aagtgta 259  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | || ||||||||||  ||||||     
T  40885163 aattaaaaggataatttgatcattacatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaactcacttttaaacaagtgtg 40885262  T
Q  260 tacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | |||||| || | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||| | || |||||||||||    
T  40885263 tccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattctaacaaaatcaatt 40885342  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5710511 - 5710365
Alignment:
Q  195 aaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttt 293  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| || | |||||||| ||||||| |||| |||||| ||   | |||||| | ||||||||||    
T  5710511 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaataagcgtatccaaacataaagcaattcacaccaaactcacttt 5710412  T
Q  294 taactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  5710411 taaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattct 5710365  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16158624 - 16158446
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtat 260  Q
    ||||||||| ||| ||| |  ||||||| || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| || |  | |||||||||||||| || ||| ||    
T  16158624 aattaaaagaatattttgatcattacacattcaaaatcaattttgattcaaatcatccaaagaacatcaattcctaagaatcacttttaaaaaagtgcat 16158525  T
Q  261 acaaacacaa-ttgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||| | || || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16158524 ccaaatataaattaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaaatctataaaaatcaatt 16158446  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40495516 - 40495335
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtat 260  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||| || ||||||    
T  40495516 aattaaaaggataatttgatcattgtacattccaaatcaattttgatttaaactattcaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtat 40495418  T
Q  261 acaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttc 342  Q
     |||||| || | | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40495417 ccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattcttc 40495335  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Original strand, 4292123 - 4292284
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattga-ttcaca 280  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||  |  |||||||||| |||| |||||||| |||||| || | | ||||||    
T  4292123 attacacattcaaaattaattttgattcaaattatccaaacaatatcaaccaacaagaatcacttctaattaagtgtatccaaacataaatcaattcaca 4292222  T
Q  281 tccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttc 342  Q
    | ||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  4292223 ttcaacttatttttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattcttc 4292284  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7386062 - 7385911
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactc 288  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||  |||  |||||| || ||| |    
T  7386062 tttaaaagcaattttgatttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatttaaacataaatcaattcacctcaaaccc 7385963  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||    
T  7385962 acttttaaccaaaatcaattctctaaaacttaattctatcaaaatcaattct 7385911  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 339
Target Start/End: Original strand, 16843589 - 16843661
Alignment:
Q  267 acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16843589 acaattggtccacatccaattcacttttaaccaaaatctattcgttcaaactcaattatatcaaaatcaattc 16843661  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2483759 - 2483695
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||    
T  2483759 attcacattcaactcacttttaactaaaatcaattccaacaaaatcaattatgtccaaatcaatt 2483695  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 24045775 - 24045963
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||   |||  || || ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  || | ||||| ||| | |    
T  24045775 tttaaatctaattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatcattttaagt 24045874  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     || | || |||||| || | | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  24045875 gagagcatccaaacataaatcaattcacatcagactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattct 24045963  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41740720 - 41740572
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||| || |||||||| ||||||  ||   |||||  || |||||||     
T  41740720 aaaatcaattttgatttaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcacttttaaacaagtgtattcaaacataaaccaattcatctcaaactcacc 41740621  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | |||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41740620 tataatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 41740572  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28869670 - 28869556
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||  |  ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  28869670 tttaaatacaattaaaaggataatttggtcattacacactcgaaatctatttt-actcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 28869572  T
Q  252 taagtgtatacaaaca 267  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28869571 taagtgtattcaaaca 28869556  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 27021113 - 27021261
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaact-atgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatac-aaacacaattga-ttcacatccaactcac 290  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||   | |||||| ||||| || | | |||||||  ||||||     
T  27021113 aaaatcaattttgattcaatcttatccaaacaacatcaacttctaagaatcacttttaagt-gagtataccaaacataaatcaattcacatttaactcat 27021211  T
Q  291 ttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27021212 ttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattatatcaaaatcagttct 27021261  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 41959460 - 41959561
Alignment:
Q  208 ttcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaa 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    |||| | ||||||  |||| |||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  41959460 ttcaaactatgaaaacaacattaactcataagaatcacttttatgtggtgtttccaaacataaattaattcacttttaactcacttttaactaaaattaa 41959559  T
Q  307 tt 308  Q
    ||    
T  41959560 tt 41959561  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35847925 - 35847863
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttctcac 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  35847925 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcac 35847863  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2868394 - 2868362
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2868394 acattcaactcacttttaactaaaatcaattct 2868362  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23914299 - 23914235
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  23914299 attcatatccaactcaattttaagtataatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 23914235  T

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Target: chr1 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43729008 - 43728861
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  43729008 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcactt 43728909  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43728908 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 43728861  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 5410594 - 5410782
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    ||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||     
T  5410594 tttaaatacaattaaaaggatagtttggtcattacatattcaaaatcaattatgattcaaactatccaaacaacatcaagtcataagaatcacttttaag 5410693  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     ||||||| |||||| || | | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5410694 tagtgtattcaaacataaatcaatttacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaattcaattatatcaaaatcaattct 5410782  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Original strand, 25229970 - 25230149
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtat 260  Q
    |||||||||||||||||    |||||||  | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| ||||||    
T  25229970 aattaaaaggataatttggtcattacacactcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactaataagaatcacttctattaaagtgtat 25230069  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  25230070 ccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcagttctatcaaaatcaattct 25230149  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20800449 - 20800260
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||| || || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||    
T  20800449 tttaaatacaattaaaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaatattgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaat 20800350  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  20800349 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattct 20800260  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35569374 - 35569185
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||   |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||    
T  35569374 tttaaatacaattaaaatgatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaat 35569275  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    || |||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  35569274 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattct 35569185  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 45710012 - 45710189
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || | ||||||||    
T  45710012 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtat 45710111  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||    
T  45710112 tcaaacataatcaattcacatacaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 45710189  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Original strand, 6464571 - 6464750
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtat 260  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || | ||||||||    
T  6464571 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtat 6464670  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | ||||| |||  ||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6464671 aaaaacataatcaattcacattaaactcacttttaaccaaaatgaactcactcaaactcaattatatcaaaatcaattct 6464750  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Original strand, 31223358 - 31223517
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcaca 280  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| |||||| |||||| || | | ||||||    
T  31223358 attacacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcaca 31223457  T
Q  281 tccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  31223458 tccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattct 31223517  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42850388 - 42850202
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||| || ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||    
T  42850388 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaggaa 42850289  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||||||    
T  42850288 gtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattct 42850202  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4369974 - 4369816
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  4369974 tttaaatacaattaaaaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 4369875  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    | || |||  ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4369874 tgagggtacccaaacataaatcaattcacat-caactcacttttaaccaaaatcaattct 4369816  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Original strand, 6166069 - 6166252
Alignment:
Q  158 atacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagt 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  | |||||||||||||| | |||    
T  6166069 atacaattaaaagggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaacatcaactcctaagaatcacttttaaatgagt 6166168  T
Q  257 gtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  6166169 gtatccaaacataatcaattcagatcaaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattct 6166252  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7826526 - 7826339
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || | || ||||||||||||||     
T  7826526 tttaaatacaattaaaaggataacttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaattcataagaatcacttttaag 7826427  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | || |||  ||||||  |||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  7826426 tgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaagctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 7826339  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 1199784 - 1199970
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa- 254  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||   |  |||||||||| ||||||     
T  1199784 aaatacaactaaaaagatagtttagtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaa 1199883  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1199884 gtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 1199970  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 13055952 - 13056138
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||    ||||| | || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||    
T  13055952 tttaaacacagttaaaagggtaatttcgtcattacgcattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaat 13056051  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||| |||| |||||| || | | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  13056052 aagcgtattcaaacataaatcaattcacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaatt 13056138  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 48510862 - 48511051
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||     
T  48510862 tttaaatataatcaaaaggatagtttgatcattacacacttaaaatcaattttgatacatactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaag 48510961  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  48510962 caagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattcaatcaaaatcaattct 48511051  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50977511 - 50977323
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| || | |||||||| ||||    
T  50977511 tttaaacacagttaaaagggtaatttagtcattacacattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaat 50977412  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||| |||| |||||| ||   | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  50977411 aagcgtatccaaacataaaacaattcacaccaaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattct 50977323  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 10470585 - 10470732
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |  ||| |||||| |||||| |||  ||| |||| ||||||||||    
T  10470585 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacataatcaatttacattcaactcactt 10470684  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10470685 ttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 10470732  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 15884221 - 15884370
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa--taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcac 290  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||| |  | | ||||| |||||| || | | ||||||||||||||||    
T  15884221 aaaatcaattttgatccaaactatccaaacaacatgaatttataaaaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcac 15884320  T
Q  291 ttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15884321 ttttaaccaaaatcaattctgtcaaactcaactctatcaaaatcaattct 15884370  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 12247415 - 12247560
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||| | | |||||||||| |||| || | ||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  12247415 aaaatcaattttgattcaaattctccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataattaatttacatccaactcactt 12247514  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||||| | ||||||||||   |||||||| | ||| ||||||||||    
T  12247515 ttaaccagaatcaattctcttaaactcaattctattaaaatcaatt 12247560  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Original strand, 13931618 - 13931762
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcactt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  ||||| | ||| ||| |||||| |||  ||||||||| |||||| ||    
T  13931618 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttgtaagaatcatgtttaagtgagtatatccaaacataatcaattcacatcaaactcattt 13931717  T
Q  293 ttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaat 337  Q
    ||||  |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||    
T  13931718 ttaaacaaaatcaatttttggaaactcaattctatcaaaatcaat 13931762  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40229639 - 40229455
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa- 254  Q
    |||||| |||||||||||| |||    ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |  |||||||| | ||| ||     
T  40229639 aaatactattaaaaggatagtttggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcagaagaatcacctgtaagaaa 40229540  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| |||||| || | | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  40229539 gtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattccaacaaaatcaattctatcaaaatcaatt 40229455  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 47123387 - 47123527
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaac 297  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||     
T  47123387 aattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcacttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaat 47123486  T
Q  298 taaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  47123487 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 47123527  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11023498 - 11023315
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-a 254  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||  | | ||| |||||||||  |    
T  11023498 aaatacaattaaaagggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattga 11023399  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     ||||| |||||| |||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  11023398 atgtatccaaacataatcaattcacctaaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 11023315  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 50406122 - 50406273
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaac-acaattgattcacatccaactc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||  ||||| || ||||| | |||  ||||||||| |||||    
T  50406122 tttaaaaacaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaacttataagaatcatttttaacgaagtgcatccaaacaaaaatcaattcacatctaactc 50406221  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||  |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50406222 acttttaatcaaaatcaaatctttcaaactcaattttatcaaaatcaattct 50406273  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49243031 - 49242965
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  49243031 attcacatccaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaattaattct 49242965  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 12468208 - 12468356
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||| || |||||| |||| | || | | || ||||| ||||||||    
T  12468208 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaatataaatcaatttacatcaaactcact 12468306  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttc 342  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  12468307 tttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatc-aaatcaattcttc 12468356  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11051482 - 11051407
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11051482 tttaaatataattaaaaggataatttggtcattacacattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacat 11051407  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 251
Target Start/End: Original strand, 36205148 - 36205243
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||    |||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  36205148 aaatacaattaaaaggttaatttggtcattaaacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaagcaacattcactcgtaagaatcacttttaa 36205243  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Original strand, 35536067 - 35536124
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  35536067 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaa 35536124  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 42002 - 42066
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  42002 attcacgttcaactcaccttttactaaaatcaattctaacaaaatcaattttatcaaaatcaatt 42066  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Original strand, 11561899 - 11561946
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11561899 attcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctttcaaactcaa 11561946  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Original strand, 9447534 - 9447632
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaac 297  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  9447534 aattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcacttttaaatgagtatatctaaacataatccattcacatcaaactcacttttaac 9447632  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Original strand, 29441271 - 29441333
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttctcac 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  29441271 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcac 29441333  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Original strand, 40352478 - 40352539
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattcttctcac 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  40352478 aactcacttttaaccaaaatcaattc-cacaaaatcaattctatcaaaatcaattctcctcac 40352539  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Original strand, 4347055 - 4347114
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||    
T  4347055 acattcaactcacttttaaccaaaatcaattc-tacaaaatcaattctaccaaaatcaatt 4347114  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 31933684 - 31933772
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||| || ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  31933684 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatca 31933772  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 310
Target Start/End: Original strand, 47085910 - 47085946
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattct 310  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47085910 attcacattcaactcacttttaattaaaatcaattct 47085946  T

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Target: chr3 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 53074871 - 53075019
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactca 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  |||||| || ||||||    
T  53074871 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactca 53074970  T
Q  290 cttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  53074971 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaatt 53075019  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 20813076 - 20813264
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttt-aa 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| ||    
T  20813076 tttaaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttgaa 20813175  T
Q  252 taagtgtatacaaac-acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||| ||| ||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  20813176 taagtatatccaaacaaaaatcaattcaaatccaactcacttttaaccaaacacaattctctcaaactc-attctatcaaaatcaattct 20813264  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30811693 - 30811514
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtat 260  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || | || |||||||||| |  ||| ||||||    
T  30811693 aattaaaagaataatttaatcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaagtcataagaatcacttctgttaaagtgtat 30811594  T
Q  261 acaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30811593 ccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaattcaattatatcaaaatcaattct 30811514  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 340
Target Start/End: Original strand, 35425277 - 35425452
Alignment:
Q  166 aaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaa 264  Q
    ||||||||||||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||| |  ||| |||||| |||    
T  35425277 aaaaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaa 35425376  T
Q  265 acacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||| |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35425377 acataatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 35425452  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 42318260 - 42318446
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||  || || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||| || ||||||||||| ||     
T  42318260 tttaaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 42318359  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  42318360 caagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 42318446  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38125612 - 38125424
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||  || || |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| || ||||||||||| ||     
T  38125612 tttaaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 38125513  T
Q  253 -aagtgtatacaaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  38125512 caagtgtatccaaacataatcaattcacctcaaacccacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattct 38125424  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Original strand, 38340768 - 38340924
Alignment:
Q  185 tacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtatacaaacacaattga-ttcacatcc 283  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||  ||| |||||| || | | |||||||||    
T  38340768 tacacatttaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacgtcaacttataaaaattacttttaataagcatatccaaacataaatcaattcacatcc 38340867  T
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  38340868 aactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaacttcattctatcaaaatcaattct 38340924  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8424885 - 8424714
Alignment:
Q  168 aaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaac 266  Q
    ||||||||||||   |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || | |||||||| |||||    
T  8424885 aaggataatttagtcattacacactcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaac 8424786  T
Q  267 acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | |||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  8424785 ataatcaattcacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaattcaatt 8424714  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52966980 - 52966793
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  52966980 tttaaatacaattaaaaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 52966881  T
Q  252 taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | || |||  ||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  52966880 tgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaagtcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 52966793  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44939576 - 44939400
Alignment:
Q  162 aattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataagtgtata 261  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| |||||     
T  44939576 aattataaggataatttagtcattagacattcaaaattaattttgattaaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttatagtaaatgtatc 44939477  T
Q  262 caaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| |||  ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||| | ||||||||||||||    
T  44939476 caaacataatcaattcatattcaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaattcaattctatcaaaatcaatt 44939400  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38172448 - 38172289
Alignment:
Q  183 attacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcaca 280  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| || ||| |||||| |||||| || | | ||||||    
T  38172448 attacacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcaca 38172349  T
Q  281 tccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  38172348 tcccactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattct 38172289  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15511546 - 15511360
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||    ||||| | || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||    
T  15511546 tttaaacacaattaaaagagtaatttcgtcattacgcattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaat 15511447  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    ||| |||| |||||| || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  15511446 aagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccgttctatcaaaatcaatt 15511360  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16246265 - 16246078
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||| || |    
T  16246265 tttacatacaattaaaaggatagtttgatcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcctaagaatcacttctatt 16246166  T
Q  253 -aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||| | ||||||  |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| || |||||||||    
T  16246165 aaagtgtttccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaactaaaatcaattct--caaactcaattctattaatatcaattct 16246078  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 10334068 - 10334257
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    |||| |  || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||| |    
T  10334068 tttaaatacaattaaaaggatagtttggtcattataaattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaattacttttagt 10334167  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    || |||||| |||||| || | | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10334168 aaagtgtatccaaacataaatcaattcatattcaactgacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 10334257  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48189602 - 48189426
Alignment:
Q  163 attaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtata 261  Q
    |||| ||||||||||||   |||| || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |  ||| ||||||     
T  48189602 attagaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatc 48189503  T
Q  262 caaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  48189502 caaacataatcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 48189426  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23207237 - 23207052
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||  |||    ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||| |||     
T  23207237 tttaaatacaattaaaaggatggtttggtcattacaagttcaaaattaattttgattcaaactat-caaacaacatcaactcataa-aatcacttgtaaa 23207140  T
Q  253 aa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    || |||||| |||||| || | | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23207139 aaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattataacaaaatcaattatatcaaaatcaatt 23207052  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10853406 - 10853249
Alignment:
Q  185 tacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaaca-caattgattcacatc 282  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||| ||| ||||||  |||  ||| | ||     
T  10853406 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaatttatatt 10853307  T
Q  283 caactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10853306 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 10853249  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 23496254 - 23496436
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||   |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||     |||||||||||||      
T  23496254 tttaaatacaattaaaatgatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccgcaagaatcactttta-- 23496351  T
Q  253 aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
        |||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23496352 ----gtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 23496436  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 50664689 - 50664877
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa- 251  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||  | |||||||||| |||     
T  50664689 tttaaatattattaaaaggataatttgatcattacacattcaaaatcaattttaatttaaactatctaaacaacat-aactcttaagaatcacttctaag 50664787  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |  |||||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50664788 tgtgtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 50664877  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 26519632 - 26519783
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaata-agtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactc 288  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||  ||||||| |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  26519632 tttaaaatcaattttgtttcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 26519731  T
Q  289 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26519732 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 26519783  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 3348176 - 3348362
Alignment:
Q  156 aaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||| || ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||    
T  3348176 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatataaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaa 3348275  T
Q  255 gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||| |||||| || | | || ||||||||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||||||    
T  3348276 gtgtatccaaacataaatcaatttacatccaactcacttctaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattct 3348362  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Original strand, 31084138 - 31084307
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||    ||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||| || || || | || ||||||||||||||     
T  31084138 tttaaatacaattaaaatgatagtttggtcattacatattcaaaatcaattatgattcaaactatccaaataatatcaagtcataagaatcacttttaag 31084237  T
Q  253 aagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
    |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  31084238 aagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaaatcaa 31084307  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Original strand, 55154554 - 55154620
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55154554 attcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 55154620  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 35930668 - 35930857
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-a 251  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||    ||||||| || ||||| |||||||||| |||| || ||||||  || |||| || ||||| |||| || |    
T  35930668 tttaaatacaattaaaatgatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattatcaactcataagaatgacttataca 35930767  T
Q  252 taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    | ||||||| ||| || || | | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35930768 ttagtgtatccaagcataaatcaattcatatcaaactcacttttaataaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 35930857  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Original strand, 19877474 - 19877534
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  19877474 acatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaataaatt 19877534  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40415349 - 40415278
Alignment:
Q  269 aattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  40415349 aattaatttacatccaactcacttttaactaaaatcgattcctttaaactcaattctatcaaaatcaattct 40415278  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 321
Target Start/End: Original strand, 44224699 - 44224862
Alignment:
Q  160 acaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgt 258  Q
    |||||||||||||||||||    ||| ||| || ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  44224699 acaattaaaaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgactaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgt 44224798  T
Q  259 atacaaaca-caattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
    || ||||||  |||  ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  44224799 atccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccataatcaattatctcaaactcaa 44224862  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Original strand, 4984634 - 4984700
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4984634 attcacatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaattcaattatatcaaaatcaattct 4984700  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Original strand, 22736915 - 22737009
Alignment:
Q  157 aatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    |||||||||||||| |||||||    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  22736915 aatacaattaaaagtataatttgttcattacacattcaaaatcaattttgattcaaaccatcccaacaacattaactcataataatcacttttaa 22737009  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Original strand, 42475686 - 42475828
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcacttttaac 297  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||  || | || |||||| ||||||| || |||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||     
T  42475686 aattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtattcaaacaaaaatcaattcacatctaactcacttttaat 42475785  T
Q  298 taaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
     ||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  42475786 caaaatcaattctctcaaactcaattctataaaaatcaattct 42475828  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31619017 - 31618964
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  31619017 aaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactt 31618964  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30810078 - 30810018
Alignment:
Q  191 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  30810078 tttaaaagtaattttgattcaaactatccaaacatcatcaatttataagaatcacttttaa 30810018  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Original strand, 21224967 - 21225090
Alignment:
Q  200 aattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacaca-attgattcacatccaactcacttttaac 297  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||  | |||||| ||||||| || |||||| |||||| | ||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21224967 aattttgattcaaactatcaaaacgacatcaactcgtaagaatcgcttttaagaaagtgtatccaaacatatatcaatttacatcaaactcacttttaac 21225066  T
Q  298 taaaatcaattcttacaaactcaa 321  Q
     ||||||||||||  |||||||||    
T  21225067 caaaatcaattctctcaaactcaa 21225090  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 311
Target Start/End: Original strand, 30736177 - 30736214
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctt 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30736177 attcacatacaactcacttttaactaaaatcaattctt 30736214  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Original strand, 53179820 - 53179935
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||| || | |||||||||||| || |||||| |||||| || | | || ||||| ||||||||    
T  53179820 aaaatcaattttgatttaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcact 53179918  T
Q  292 tttaactaaaatcaatt 308  Q
    |||||| ||||||||||    
T  53179919 tttaaccaaaatcaatt 53179935  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 34561079 - 34561225
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||| || ||| | | ||||| |||||| || | | ||| ||| |||||||||    
T  34561079 aaaatcaattttgggtcaaactatccaaccaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcgcattcaactcact 34561178  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||| || | ||||||||||||||    
T  34561179 tttaaccaaaatcaattttatcaaacttaattctatcaaaatcaatt 34561225  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 42644319 - 42644381
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |   ||||||||||||||    
T  42644319 acattcaactcacttttaactaaaatcaatttttataaaatcaattcactcaaaatcaattct 42644381  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Original strand, 44225628 - 44225681
Alignment:
Q  284 aactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  44225628 aactcacttttaacgaaaatcaattc-tacaaaatcaattatattaaaatcaatt 44225681  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Original strand, 14959649 - 14959709
Alignment:
Q  153 tttaaatacaattaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaa 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  14959649 tttaaatacaattaaaaagataatttaatcgttacacattcaaaatcaagtttgattcaaa 14959709  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45423898 - 45423842
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || | || |||||||||||||    
T  45423898 aaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatgaattgataagaatcactttta 45423842  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29278 - 29107
Alignment:
Q  168 aaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaac 266  Q
    ||||||||||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||| |||| || ||| |||||| |||||    
T  29278 aaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaattcataagaataacttctattaaagtgtatccaaac 29179  T
Q  267 acaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  29178 ataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaacttaattctatcaaaatcaatt 29107  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 253099 - 253247
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |  |||| |||||| || | | |||| |||||||||||     
T  253099 aaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaaggtatccaaacataaatcaattcatatccaactcaca 253198  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
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T  253199 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 253247  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 9051 - 9229
Alignment:
Q  163 attaaaaggataatttaaatattacacttttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaa-taagtgtata 261  Q
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T  9051 attaaaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatc 9150  T
Q  262 caaacacaattgattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
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T  9151 caaacatatacaattcatatctaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 9229  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8566
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaataa-gtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
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T  8420 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcatttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 8519  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
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T  8520 tttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaatt 8566  T

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Target: scaffold0394 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5812
Alignment:
Q  274 attcacatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattct 340  Q
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T  5878 attcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattct 5812  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2157 - 2011
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcactttta-ataagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| || |||| || |||||| || | | |||| ||| |||||| |    
T  2157 aaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagccatgataatcacttttatatgagtgcatccaaacataaatcaattcatatcaaactcatt 2058  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
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T  2057 ttgaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaatt 2011  T

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Target: scaffold0983 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2398 - 2252
Alignment:
Q  194 aaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaacttatgagaatcacttttaat-aagtgtatacaaacacaattga-ttcacatccaactcact 291  Q
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T  2398 aaaatcaattttgattcaaactatctaaacaacgtcaacttgtaaaaaccacttttaaacaagtgtgtccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 2299  T
Q  292 tttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaatt 338  Q
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T  2298 tttaaccaaaatcaattatgtcaaactcaattctgtcaaaatcaatt 2252  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 118454 - 118393
Alignment:
Q  278 acatccaactcacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaaatatatcaaaatcaattc 339  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  118454 acatcaaactcacttttaacaaaaatctattctatcaaactcaattcgatcaaaatcaattc 118393  T

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