View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7801_low_9 (Length: 415)

Name: NF7801_low_9
Description: NF7801
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7801_low_9
NF7801_low_9
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (189-403)||(123369-123583)
scaffold0029 (177-231)||(77379-77433)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (189-403)||(9582893-9583107)
chr7 (189-403)||(16119850-16120064)
chr7 (192-403)||(23515067-23515278)
chr7 (189-403)||(14551098-14551313)
chr7 (189-403)||(8717865-8718079)
chr7 (189-403)||(13673856-13674070)
chr7 (189-403)||(18593353-18593567)
chr7 (189-403)||(18618117-18618331)
chr7 (189-396)||(4312564-4312771)
chr7 (189-396)||(538756-538964)
chr7 (189-396)||(12567020-12567228)
chr7 (190-396)||(9003958-9004165)
chr7 (189-395)||(12548806-12549012)
chr7 (189-396)||(8780937-8781146)
chr7 (189-396)||(20108375-20108583)
chr7 (189-395)||(48801777-48801983)
chr7 (189-393)||(9264940-9265145)
chr7 (189-396)||(13657873-13658080)
chr7 (189-396)||(11921308-11921512)
chr7 (34-192)||(25752025-25752183)
chr7 (189-396)||(16532100-16532310)
chr7 (189-396)||(16633352-16633562)
chr7 (189-396)||(16465617-16465821)
chr7 (189-244)||(825783-825838)
chr7 (189-244)||(4461243-4461298)
chr7 (189-244)||(14221719-14221774)
chr7 (189-244)||(15916777-15916832)
chr7 (189-244)||(18287761-18287816)
chr7 (189-244)||(27291496-27291551)
chr7 (189-251)||(15206585-15206647)
chr7 (189-246)||(5397273-5397330)
chr7 (189-237)||(15065935-15065983)
chr7 (118-231)||(1826257-1826370)
chr7 (120-193)||(19690044-19690117)
chr7 (192-244)||(6713072-6713124)
chr7 (189-241)||(9194545-9194597)
chr7 (187-244)||(4791381-4791438)
chr7 (187-244)||(15348532-15348589)
chr7 (177-231)||(15940731-15940785)
chr7 (204-244)||(15522517-15522557)
chr7 (315-396)||(15065779-15065858)
chr7 (315-396)||(18287612-18287691)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (189-403)||(15699555-15699769)
chr6 (189-403)||(22165550-22165764)
chr6 (189-403)||(22243812-22244026)
chr6 (189-403)||(22061504-22061718)
chr6 (189-396)||(24855246-24855453)
chr6 (189-403)||(22767117-22767331)
chr6 (189-403)||(20170242-20170457)
chr6 (189-396)||(18448140-18448348)
chr6 (189-396)||(23023093-23023301)
chr6 (192-396)||(20107784-20107989)
chr6 (189-396)||(25625691-25625898)
chr6 (189-393)||(2181063-2181268)
chr6 (189-388)||(18854026-18854225)
chr6 (189-396)||(21560555-21560762)
chr6 (189-396)||(25631270-25631477)
chr6 (189-395)||(29595697-29595903)
chr6 (189-396)||(25963248-25963456)
chr6 (189-396)||(25967895-25968103)
chr6 (189-391)||(30671808-30672011)
chr6 (268-396)||(19585622-19585750)
chr6 (299-402)||(20016339-20016443)
chr6 (189-251)||(18184875-18184937)
chr6 (189-245)||(35270971-35271027)
chr6 (189-251)||(18731868-18731930)
chr6 (189-251)||(20218982-20219044)
chr6 (189-251)||(22113007-22113069)
chr6 (189-244)||(11204004-11204059)
chr6 (187-244)||(23517830-23517887)
chr6 (189-244)||(29686601-29686656)
chr6 (356-396)||(29686449-29686489)
chr6 (138-192)||(7435216-7435270)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (189-403)||(11496615-11496829)
chr4 (189-403)||(13822913-13823127)
chr4 (189-397)||(42709732-42709940)
chr4 (189-402)||(15254349-15254562)
chr4 (189-395)||(10630758-10630964)
chr4 (189-396)||(3354646-3354854)
chr4 (189-395)||(18291945-18292152)
chr4 (189-396)||(18081460-18081669)
chr4 (32-192)||(13898599-13898759)
chr4 (189-395)||(17484911-17485118)
chr4 (189-396)||(45234233-45234441)
chr4 (189-395)||(38426745-38426937)
chr4 (189-395)||(56580540-56580748)
chr4 (34-192)||(48085559-48085717)
chr4 (318-393)||(8092559-8092634)
chr4 (189-251)||(14653999-14654061)
chr4 (190-244)||(15865647-15865701)
chr4 (189-244)||(10650547-10650602)
chr4 (189-244)||(15260110-15260165)
chr4 (189-244)||(16682913-16682968)
chr4 (189-239)||(15409534-15409584)
chr4 (189-244)||(9488879-9488934)
chr4 (187-237)||(17296248-17296298)
chr4 (189-248)||(8092428-8092487)
chr4 (120-192)||(18273304-18273376)
chr4 (174-232)||(14233258-14233316)
chr4 (120-193)||(20958735-20958808)
chr4 (315-394)||(15260235-15260312)
chr4 (174-231)||(50882120-50882177)
chr4 (356-396)||(12515042-12515081)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (189-403)||(10602473-10602687)
chr3 (189-403)||(13504882-13505096)
chr3 (189-403)||(11947407-11947621)
chr3 (189-403)||(16448761-16448975)
chr3 (189-403)||(7600355-7600569)
chr3 (189-403)||(15556943-15557157)
chr3 (189-403)||(9360972-9361186)
chr3 (189-403)||(16373566-16373780)
chr3 (189-403)||(12187077-12187291)
chr3 (189-403)||(37942378-37942592)
chr3 (187-395)||(12193489-12193697)
chr3 (192-403)||(6814868-6815079)
chr3 (189-403)||(10147011-10147225)
chr3 (189-403)||(15645001-15645215)
chr3 (189-403)||(10160174-10160388)
chr3 (189-403)||(13187418-13187632)
chr3 (189-395)||(3245589-3245795)
chr3 (189-395)||(2721305-2721510)
chr3 (32-193)||(1735670-1735831)
chr3 (189-396)||(4382751-4382960)
chr3 (189-395)||(13001426-13001634)
chr3 (189-396)||(13097711-13097918)
chr3 (189-396)||(10546937-10547148)
chr3 (189-396)||(20156516-20156722)
chr3 (189-396)||(1992803-1993010)
chr3 (189-396)||(13690608-13690815)
chr3 (189-396)||(11398215-11398423)
chr3 (189-396)||(14348589-14348797)
chr3 (189-393)||(22637702-22637907)
chr3 (189-395)||(3279191-3279398)
chr3 (189-393)||(17387839-17388044)
chr3 (189-396)||(12160208-12160416)
chr3 (305-403)||(16655798-16655897)
chr3 (196-403)||(17045697-17045902)
chr3 (196-403)||(17047857-17048062)
chr3 (189-244)||(27356729-27356784)
chr3 (189-245)||(13601220-13601276)
chr3 (189-244)||(3339227-3339282)
chr3 (189-244)||(12776535-12776590)
chr3 (189-244)||(13136211-13136266)
chr3 (189-244)||(20584262-20584317)
chr3 (189-239)||(15946773-15946823)
chr3 (189-246)||(14445769-14445826)
chr3 (189-244)||(15619284-15619339)
chr3 (189-244)||(13195459-13195514)
chr3 (189-243)||(8686388-8686442)
chr3 (189-251)||(20225755-20225817)
chr3 (189-239)||(13068306-13068356)
chr3 (356-403)||(13601062-13601108)
chr3 (189-219)||(2005499-2005529)
chr3 (315-396)||(12776660-12776739)
chr3 (315-396)||(15946619-15946698)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (189-403)||(22665062-22665276)
chr2 (189-403)||(117543-117757)
chr2 (189-403)||(22044661-22044875)
chr2 (189-403)||(25357511-25357725)
chr2 (189-403)||(16775651-16775865)
chr2 (189-396)||(11616-11823)
chr2 (189-403)||(17590407-17590621)
chr2 (189-403)||(24795286-24795500)
chr2 (189-403)||(27627580-27627795)
chr2 (189-396)||(25144758-25144966)
chr2 (40-233)||(19805470-19805662)
chr2 (189-395)||(5500266-5500473)
chr2 (189-396)||(25804268-25804475)
chr2 (193-394)||(25370890-25371091)
chr2 (189-395)||(23798923-23799129)
chr2 (189-396)||(23643950-23644159)
chr2 (268-396)||(24502168-24502297)
chr2 (189-342)||(24178194-24178348)
chr2 (189-244)||(23159386-23159441)
chr2 (189-244)||(23570643-23570698)
chr2 (189-244)||(27631655-27631710)
chr2 (189-244)||(27768817-27768872)
chr2 (189-239)||(24171510-24171560)
chr2 (118-231)||(17334535-17334648)
chr2 (189-251)||(24506802-24506864)
chr2 (192-244)||(24321328-24321380)
chr2 (189-244)||(23257571-23257625)
chr2 (189-251)||(25337652-25337714)
chr2 (187-234)||(29955868-29955915)
chr2 (187-237)||(21512565-21512615)
chr2 (207-249)||(23648123-23648165)
chr2 (187-244)||(24019066-24019123)
chr2 (315-396)||(27631506-27631585)
chr2 (356-396)||(15532753-15532792)
chr2 (356-396)||(24019228-24019267)
chr2 (187-235)||(25582766-25582814)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (189-403)||(27046874-27047088)
chr1 (189-403)||(17094602-17094816)
chr1 (189-403)||(21798663-21798878)
chr1 (189-403)||(20237456-20237670)
chr1 (192-393)||(8653126-8653327)
chr1 (189-396)||(52938622-52938830)
chr1 (40-192)||(27775944-27776095)
chr1 (189-396)||(3989944-3990153)
chr1 (189-389)||(19364043-19364243)
chr1 (189-276)||(14070632-14070719)
chr1 (192-246)||(19875648-19875702)
chr1 (189-251)||(21784473-21784535)
chr1 (189-251)||(4027832-4027894)
chr1 (191-244)||(16382578-16382631)
chr1 (189-251)||(8947516-8947578)
chr1 (174-231)||(18478219-18478276)
chr1 (315-395)||(21784598-21784677)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (189-403)||(20595832-20596046)
chr5 (189-403)||(20602118-20602332)
chr5 (189-403)||(20608409-20608623)
chr5 (189-403)||(15735534-15735748)
chr5 (18-233)||(27270563-27270778)
chr5 (189-403)||(23748051-23748265)
chr5 (213-403)||(23710701-23710892)
chr5 (189-396)||(24940540-24940748)
chr5 (189-403)||(18072900-18073114)
chr5 (189-403)||(24953175-24953389)
chr5 (206-395)||(20622170-20622359)
chr5 (189-403)||(20790715-20790929)
chr5 (189-396)||(23600637-23600845)
chr5 (189-396)||(24219752-24219960)
chr5 (192-396)||(20444843-20445048)
chr5 (189-382)||(21387410-21387604)
chr5 (189-392)||(20916457-20916660)
chr5 (318-396)||(22948518-22948596)
chr5 (272-395)||(20575510-20575633)
chr5 (189-244)||(22317514-22317569)
chr5 (189-244)||(25006809-25006864)
chr5 (189-244)||(30759656-30759711)
chr5 (189-251)||(18484213-18484275)
chr5 (189-238)||(25116172-25116221)
chr5 (189-244)||(26847803-26847858)
chr5 (192-244)||(22855723-22855775)
chr5 (189-233)||(25175262-25175306)
chr5 (187-237)||(17412736-17412786)
chr5 (315-396)||(22317639-22317719)
chr5 (163-227)||(26306847-26306911)
chr5 (122-192)||(28360054-28360124)
chr5 (315-396)||(22855572-22855651)
chr5 (315-395)||(25006934-25007012)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (189-403)||(15678-15892)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (189-403)||(21382093-21382308)
chr8 (189-403)||(21098795-21099009)
chr8 (189-403)||(21104116-21104330)
chr8 (189-403)||(23911441-23911654)
chr8 (189-403)||(8314467-8314682)
chr8 (189-403)||(8322847-8323062)
chr8 (189-396)||(21843525-21843733)
chr8 (189-396)||(21939997-21940206)
chr8 (189-396)||(20038982-20039189)
chr8 (189-395)||(23454945-23455153)
chr8 (189-395)||(17620755-17620960)
chr8 (189-396)||(16418621-16418830)
chr8 (189-367)||(24034049-24034229)
chr8 (199-395)||(14352181-14352378)
chr8 (189-377)||(21538573-21538764)
chr8 (189-299)||(20712537-20712648)
chr8 (189-244)||(11346954-11347009)
chr8 (189-244)||(19767684-19767739)
chr8 (189-244)||(22370102-22370157)
chr8 (189-239)||(20002279-20002329)
chr8 (189-244)||(22033556-22033611)
chr8 (189-244)||(22099656-22099711)
chr8 (189-244)||(22102552-22102607)
chr8 (189-239)||(21831181-21831231)
chr8 (327-396)||(20712470-20712539)
chr8 (189-239)||(22817755-22817805)
chr8 (177-231)||(19902162-19902216)
chr8 (187-237)||(18572975-18573025)
chr8 (315-396)||(22102403-22102482)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (189-403)||(1038-1252)
scaffold0404 (189-261)||(3451-3523)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (189-403)||(616-831)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (189-396)||(220-427)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (189-393)||(2853-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (189-396)||(251871-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (189-388)||(11064-11263)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (189-396)||(2288-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (189-396)||(831-1040)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (189-395)||(14663-14869)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (189-393)||(482-686)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (189-396)||(7941-8148)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (189-395)||(120954-121161)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (189-346)||(164404-164562)
scaffold0011 (187-251)||(172254-172318)
scaffold0011 (189-251)||(161995-162057)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (189-396)||(1108-1317)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (40-193)||(6426-6578)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (189-396)||(58629-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (189-396)||(97727-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (189-396)||(511-718)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (189-306)||(10207-10325)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (189-393)||(13003-13207)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (189-393)||(35105-35307)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (189-335)||(8720-8868)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (190-349)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (190-349)||(232789-232948)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (189-396)||(5090-5294)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (189-289)||(38509-38610)
scaffold0096 (318-368)||(38625-38675)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (189-251)||(42237-42299)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (189-251)||(50507-50569)
scaffold0035 (174-231)||(88346-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (189-246)||(912-969)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (329-396)||(2859-2926)
[»] scaffold0566 (2 HSPs)
scaffold0566 (189-244)||(2762-2817)
scaffold0566 (315-396)||(2612-2692)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (192-251)||(22159-22218)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (189-239)||(12743-12793)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (187-244)||(1193-1250)
scaffold0094 (356-396)||(1041-1080)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (189-244)||(10720-10775)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (189-244)||(54850-54905)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (192-394)||(37722-37922)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (189-251)||(1839-1901)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (189-251)||(37744-37806)
scaffold0116 (315-395)||(37869-37948)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (189-251)||(22756-22817)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (189-251)||(45229-45291)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (189-238)||(72573-72622)
scaffold0037 (189-238)||(84763-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (189-233)||(18218-18262)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (174-231)||(31415-31472)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (204-244)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (177-231)||(3251-3305)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (356-396)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 123583 - 123369
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123583 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 123484  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123483 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 123384  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  123383 tgtgtgtgaagtcca 123369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 77379 - 77433
Alignment:
Q  177 attttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  77379 attttacgtgttatcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 77433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9583107 - 9582893
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583107 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 9583008  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583007 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 9582908  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  9582907 tgtgtgtgaagtcca 9582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 16119850 - 16120064
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119850 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatatacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 16119949  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119950 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 16120049  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  16120050 tgtgtgtgaagtcca 16120064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 192 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23515278 - 23515067
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515278 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 23515179  T
Q  292 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515178 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 23515079  T
Q  392 gtgtgatgtcca 403  Q
    |||||| |||||    
T  23515078 gtgtgaagtcca 23515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14551313 - 14551098
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551313 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 14551214  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat-ttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551213 atgtcccctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaattttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 14551114  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  14551113 gtgtgtgtgaagtcca 14551098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8718079 - 8717865
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8718079 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 8717980  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717979 atgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 8717880  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  8717879 tgtgtgtgaagtcca 8717865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13674070 - 13673856
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13674070 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 13673971  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13673970 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatcttttttctacccaacgatcaagttttaagtgagtg 13673871  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  13673870 tgtgtgtgaagtcca 13673856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 18593353 - 18593567
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18593353 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagtac 18593452  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18593453 atgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 18593552  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  18593553 tgtgtgtgaagtcca 18593567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18618331 - 18618117
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18618331 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagtac 18618232  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18618231 atgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 18618132  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  18618131 tgtgtgtgaagtcca 18618117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4312771 - 4312564
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    ||||| ||||||||||||||||| |      
T  4312771 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaactt 4312672  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4312671 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 4312572  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  4312571 tgtgtgtg 4312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 538756 - 538964
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  538756 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaacac 538855  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagca-tttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||| ||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  538856 atgtctcctgaagggttttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 538955  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  538956 gtgtgtgtg 538964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12567228 - 12567020
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || || |  ||||| ||||||||| ||||||| |     
T  12567228 atcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagaacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaact 12567129  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12567128 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 12567029  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  12567028 gtgtgtgtg 12567020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9004165 - 9003958
Alignment:
Q  190 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  | ||||| ||||||||||||||||| |      
T  9004165 tcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagtttatcatatgacaattcaattaaaactt 9004066  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004065 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaattacaaactcaagcatttcttgtgatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 9003966  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    | ||||||    
T  9003965 tatgtgtg 9003958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 12548806 - 12549012
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||| |||| ||||||||| |||||||  |    
T  12548806 atcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaat-a 12548904  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12548905 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtccactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagcttcaagtgagt 12549004  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  12549005 gtgtgtgt 12549012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 8780937 - 8781146
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||    || || |||||||||||||||||  ||    
T  8780937 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaaac 8781036  T
Q  289 --atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
      |||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  8781037 ttatgtctcctcaaaggcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagtttcaaggtag 8781136  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  8781137 tgtgtgtgtg 8781146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20108583 - 20108375
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||    ||||| |||| |||||||||||| |     
T  20108583 atcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcataaaacaaggttatcatatgagaattcaattaaaact 20108484  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     |||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20108483 gatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 20108384  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  20108383 gtgtgtgtg 20108375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 48801777 - 48801983
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaac--ag-ttatatcaaatgacaattcaattaaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   || ||||||   ||||||||||||| |||     
T  48801777 atcaaactcccccacacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcatacacatagtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaatcaaaa 48801873  T
Q  286 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 385  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  48801874 ctcatgtctcctcaaaggctttaatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtaaaaagtga 48801973  T
Q  386 gtgtgtgtgt 395  Q
    || |||||||    
T  48801974 gtatgtgtgt 48801983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 9264940 - 9265145
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaag-ca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||    || || ||||||||||||| |||  |     
T  9264940 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataagcaagattaacatatgacaattcaataaaaaact 9265039  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     |||||||||||| | |||  ||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9265040 tatgtctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 9265139  T
Q  388 gtgtgt 393  Q
    ||||||    
T  9265140 gtgtgt 9265145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13658080 - 13657873
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||    ||    ||||||||| ||||||| |||    
T  13658080 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcgtaaacaagattacttcatgacaatttaattaaaacac 13657981  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    || ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13657980 atatctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcccttttccacccaacaatcaagtttcaaatgagtg 13657881  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  13657880 tgtgtgtg 13657873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 11921308 - 11921512
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||   ||| |||||||||  ||||||||||    
T  11921308 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcataaacatggtagca-taacattt---tcacatgacaattacattaaagcac 11921403  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    | |||||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||   ||||||||    
T  11921404 acgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaacgcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatctagtcctaagtgagt 11921503  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  11921504 gtgtgtgtg 11921512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25752183 - 25752025
Alignment:
Q  34 aagttgctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25752183 aagttgctctcttcacctccttcttgattcttttacttttgaaaccctcattacctgaaacataacaaaatactagccagaagacatgcaaaacacaaga 25752084  T
Q  134 aacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | | |||  ||||||||||||||    
T  25752083 aacgaccctaaaataaataaaaattaaactatttaaatagtgtgctttgcgtgttatca 25752025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16532310 - 16532100
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || |    | ||| |||||||||  |||||||||    
T  16532310 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagca 16532211  T
Q  288 catgtctcctcaagggc-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagtttcaagtga 385  Q
    ||||||||||||| ||| || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||| | || |||    
T  16532210 catgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattga 16532111  T
Q  386 gtgtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||||    
T  16532110 gtgtgtgtgtg 16532100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 16633352 - 16633562
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || |    | ||| |||||||||  |||||||||    
T  16633352 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagca 16633451  T
Q  288 catgtctcctcaagggc-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagtttcaagtga 385  Q
    ||||||||||||| ||| || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||| | || |||    
T  16633452 catgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattga 16633551  T
Q  386 gtgtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||||    
T  16633552 gtgtgtgtgtg 16633562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 16465617 - 16465821
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    || ||  ||||||| |  |||||| |||    
T  16465617 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagca-taac----atttctcatgacaaatacattaaaacac 16465711  T
Q  289 atgtctcctc-aagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    | |||||||| || |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |  || |||   |||||||    
T  16465712 acgtctcctcaaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccatcagtctagtcctaagtgag 16465811  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  16465812 tgtgtgtgtg 16465821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 825838 - 825783
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  825838 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 825783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 4461243 - 4461298
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4461243 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 4461298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 14221719 - 14221774
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14221719 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 14221774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 15916777 - 15916832
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15916777 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15916832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18287816 - 18287761
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18287816 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 18287761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27291551 - 27291496
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27291551 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27291496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 15206585 - 15206647
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  15206585 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcatagacatagcagca 15206647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5397330 - 5397273
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5397330 atcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatag 5397273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15065983 - 15065935
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065983 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 15065935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1826370 - 1826257
Alignment:
Q  118 catgcaaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgc 217  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||  | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||    
T  1826370 catgcaagacacaataattgactctaaaacaaatggatatcaagctatttagacaatgtattttgtgtgttatcaaagtcccctacacttgaacaattgc 1826271  T
Q  218 ttgtcctcaagcaa 231  Q
    ||||||| ||||||    
T  1826270 ttgtcctaaagcaa 1826257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 193
Target Start/End: Original strand, 19690044 - 19690117
Alignment:
Q  120 tgcaaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaa 193  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19690044 tgcaaaacacaataatcgactctaaaataaatgaaaaacaaactatttagacaatgtattttgcatgttatcaa 19690117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Original strand, 6713072 - 6713124
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713072 aaactcccctatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 6713124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 9194545 - 9194597
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9194545 atcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaa 9194597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Original strand, 4791381 - 4791438
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4791381 ttatcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcagaatgcatagacat 4791438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15348589 - 15348532
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15348589 ttatcaaacttccccaaacttgaatctttgtttgtcctcaagtaaaaggcataaacat 15348532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15940785 - 15940731
Alignment:
Q  177 attttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15940785 attttacgtgttatcaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 15940731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15522557 - 15522517
Alignment:
Q  204 acttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15522557 acttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacat 15522517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15065858 - 15065779
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||    
T  15065858 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatctcaagtgagtgtgtgtgtg 15065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18287691 - 18287612
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  18287691 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtctgtgtg 18287612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15699769 - 15699555
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699769 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 15699670  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699669 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 15699570  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  15699569 tgtgtgtgaagtcca 15699555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 22165550 - 22165764
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165550 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 22165649  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165650 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 22165749  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  22165750 tgtgtgtgaagtcca 22165764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22244026 - 22243812
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244026 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 22243927  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243926 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 22243827  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  22243826 tgtgtgtgaagtcca 22243812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 22061504 - 22061718
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061504 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 22061603  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061604 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 22061703  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  22061704 tgtgtgtgaagtcca 22061718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 24855246 - 24855453
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24855246 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 24855344  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24855345 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 24855444  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  24855445 gtgtgtgtg 24855453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 22767117 - 22767331
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22767117 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtaacatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 22767215  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  22767216 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgaga 22767315  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  22767316 gtgtgtgtgaagtcca 22767331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20170457 - 20170242
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagtt-atatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20170457 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagtttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 20170359  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20170358 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 20170259  T
Q  387 tgtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20170258 tgtgtgtgtgaagtcca 20170242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18448348 - 18448140
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  18448348 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacttggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 18448249  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |    
T  18448248 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcatcccaacagtcaagtttcaagtgact 18448149  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  18448148 gtgtgtgtg 18448140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23023301 - 23023093
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacca-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  | ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  23023301 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcttaaacatggtagcataagacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 23023202  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23023201 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 23023102  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    ||| |||||    
T  23023101 gtgcgtgtg 23023093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 396
Target Start/End: Original strand, 20107784 - 20107989
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaaca-gttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcaca 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || | || |||||||||||||| ||| |  |    
T  20107784 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagataaa-catatgacaattcaattgaaaactta 20107882  T
Q  290 tgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgt 389  Q
    ||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20107883 tgtctcctcaaaggctttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgt 20107982  T
Q  390 gtgtgtg 396  Q
    |||||||    
T  20107983 gtgtgtg 20107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25625898 - 25625691
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||     
T  25625898 atcaaactcccccatacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggtgtaaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaacat 25625799  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25625798 atgtctccttaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 25625699  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  25625698 tgtgtgtg 25625691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2181268 - 2181063
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcac-caacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2181268 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 2181169  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |  | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  2181168 catgtctcctcaagggcttaaatttcgagcgcacattaatcacaaacttaagcatttctcgtaatccttattcaactcaacaaccaagtttcaagtgagt 2181069  T
Q  388 gtgtgt 393  Q
    ||||||    
T  2181068 gtgtgt 2181063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18854225 - 18854026
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  18854225 atcaaactcccccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaatacac 18854126  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18854125 atgtctcctcaagggctttaatttccagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 18854026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 21560555 - 21560762
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    ||    ||| ||||| ||||||| |||    
T  21560555 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgtcaatttaattaaaacac 21560654  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21560655 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagtg 21560754  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  21560755 tgtgtgtg 21560762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 25631270 - 25631477
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaac--ag-ttatatcaaatgacaattcaattaaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||  ||   || ||||||   |||||||||||||||||     
T  25631270 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaggaaaaatgcataaacatggtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaattaaaa 25631366  T
Q  286 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 385  Q
    |  || |||| |||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25631367 cttatatctcttcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtga 25631466  T
Q  386 gtgtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||||    
T  25631467 gtgtgtgtgtg 25631477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29595903 - 29595697
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |    ||||| ||||| ||| ||||||| |||    
T  29595903 atcaaactccctcacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcataaataagattatcacatgacgatttaattaaaacac 29595804  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||| ||| ||    
T  29595803 atgtctccccaagggctttaatttcaagtgtacactaataaaaaactcaaacatttcttgtaatcctttttcaacccaataatcaagtttcaaatgactg 29595704  T
Q  389 tgtgtgt 395  Q
    |||||||    
T  29595703 tgtgtgt 29595697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25963456 - 25963248
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||   || || |||||||||||||||||       
T  25963456 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaatt 25963357  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
      ||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  25963356 tgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 25963257  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  25963256 gtgtgtgtg 25963248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25968103 - 25967895
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||   || || |||||||||||||||||       
T  25968103 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaatt 25968004  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
      ||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  25968003 tgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 25967904  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  25967903 gtgtgtgtg 25967895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 391
Target Start/End: Original strand, 30671808 - 30672011
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||   || || |||||||||||||||||       
T  30671808 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaatt 30671907  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
      ||| ||| ||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||    
T  30671908 tgtgtttccccaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaattgagt 30672007  T
Q  388 gtgt 391  Q
    ||||    
T  30672008 gtgt 30672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 396
Target Start/End: Original strand, 19585622 - 19585750
Alignment:
Q  268 atgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 367  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||  ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19585622 atgacaatacaattaaaactcatgtctcctaaaaggcttttatttcaaacgtacactaatcacaaacacaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 19585721  T
Q  368 cgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19585722 caatcaagttttaagtgagtgtgtatgtg 19585750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 402
Target Start/End: Original strand, 20016339 - 20016443
Alignment:
Q  299 aagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtga 397  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016339 aagggcttaaatcccaaaatgtacactaattgcaaactcaagtatttcttgaaatctttattctatccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtga 20016438  T
Q  398 tgtcc 402  Q
     ||||    
T  20016439 agtcc 20016443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 18184875 - 18184937
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18184875 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagca 18184937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35271027 - 35270971
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacata 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35271027 atcaaacacccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacata 35270971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18731930 - 18731868
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18731930 atcaaactcctccacacttgaatcttagcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 18731868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 20218982 - 20219044
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20218982 atcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagca 20219044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 22113007 - 22113069
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22113007 atcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagca 22113069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11204059 - 11204004
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11204059 atcaaactcccccacacttaaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 11204004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Original strand, 23517830 - 23517887
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23517830 ttataaaactcccccatacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcatacacat 23517887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29686656 - 29686601
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29686656 atcaaactctcccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaagaggcataaacat 29686601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29686489 - 29686449
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29686489 tattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgtg 29686449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 7435216 - 7435270
Alignment:
Q  138 actctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7435216 actctaaaataaatagaaaataaactatttagacaatgtagtttgcatgttatca 7435270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 11496615 - 11496829
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496615 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 11496714  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496715 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 11496814  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  11496815 tgtgtgtgaagtcca 11496829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13823127 - 13822913
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823127 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 13823028  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823027 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 13822928  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  13822927 tgtgtgtgaagtcca 13822913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 189 - 397
Target Start/End: Original strand, 42709732 - 42709940
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709732 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 42709831  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709832 atgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 42709931  T
Q  389 tgtgtgtga 397  Q
    |||||||||    
T  42709932 tgtgtgtga 42709940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15254562 - 15254349
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15254562 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacgtagttgcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagcac 15254463  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15254462 atgtctccttaagggtttaaatccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagtg 15254363  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcc 402  Q
    ||||||||| ||||    
T  15254362 tgtgtgtgaagtcc 15254349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10630964 - 10630758
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacca-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10630964 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacatat-tatcatatgacaatttaattaaagca 10630866  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10630865 catgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 10630766  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  10630765 gtgtgtgt 10630758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3354854 - 3354646
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  3354854 atcaaactcccccacacttgaatagttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 3354755  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3354754 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 3354655  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  3354654 gtgtgtgtg 3354646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18292152 - 18291945
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  18292152 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagaaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 18292053  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18292052 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaagtcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagc 18291953  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  18291952 gtgtgtgt 18291945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 18081460 - 18081669
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  18081460 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagca 18081559  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18081560 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 18081659  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  18081660 tgtgtgtgtg 18081669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 13898599 - 13898759
Alignment:
Q  32 tcaagttgctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  13898599 tcaagttgctcttttcaccttcttcttgattcttttacttttgacaccctcgttacctgaaacataacaaaatactagcaagaagacatgcataacacaa 13898698  T
Q  132 taaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13898699 taaaagactctaaaatgaataaaaattaaactatttagacaatgtattttgcgtgttatca 13898759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 17484911 - 17485118
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||    ||||| ||||||||| ||||||| |     
T  17484911 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaaacaagattatcacatgacaatttaattaaaact 17485010  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     ||||||||||| ||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17485011 tatgtctcctcaggggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 17485110  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  17485111 gtgtgtgt 17485118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 45234233 - 45234441
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  || ||    ||||| ||||||||| ||||||| |     
T  45234233 atcaaactcccccagacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtggcataaaacaagattatcatatgacaattaaattaaaact 45234332  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45234333 aatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaactatcaagtttcaagtgagt 45234432  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  45234433 gtgtgtgtg 45234441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38426937 - 38426745
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||             ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  38426937 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa--taatat------------tatcatatgacaatttaattaaaacac 38426852  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38426851 atgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaagccaacaatcaagtttcaagtgagtg 38426752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 56580540 - 56580748
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |    |||||  |||||||| ||||||||||    
T  56580540 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatctgacaattaaattaaagca 56580639  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||   ||||||| | |||||||    
T  56580640 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcatttttcaacccataaatcaagtcttaagtgag 56580739  T
Q  387 tgtgtgtgt 395  Q
    |||||||||    
T  56580740 tgtgtgtgt 56580748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 48085717 - 48085559
Alignment:
Q  34 aagttgctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48085717 aagttgctcttttcacctccttcttgattcttttacttttgaaaccctcattaccttaaacataacaaaatactagccagaagacatgcaaaacacaaga 48085618  T
Q  134 aacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | | |||  ||||||||||||||    
T  48085617 aacgaccctaaaataaataaaaattaaactatttaaatagtgtgctttgcgtgttatca 48085559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 393
Target Start/End: Original strand, 8092559 - 8092634
Alignment:
Q  318 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  8092559 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtgtgtgt 8092634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 14653999 - 14654061
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14653999 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 14654061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15865701 - 15865647
Alignment:
Q  190 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15865701 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15865647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10650602 - 10650547
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10650602 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 10650547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 15260110 - 15260165
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15260110 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcatagacat 15260165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16682968 - 16682913
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16682968 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcatcaagcaaaaggcatagacat 16682913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15409584 - 15409534
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15409584 atcaaactcccccacactagaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15409534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 9488879 - 9488934
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9488879 atcaaactcccccatacttcaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatgaacat 9488934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 17296248 - 17296298
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 237  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17296248 ttatcaaactcccccatgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 17296298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 248
Target Start/End: Original strand, 8092428 - 8092487
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagta 248  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8092428 atcaaactttcccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaagacataaacatagta 8092487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18273376 - 18273304
Alignment:
Q  120 tgcaaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273376 tgcaaaacaaaataattgactctaaaataaatggaaaacaaactatttagacaatgtattttgcgtgttatca 18273304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14233316 - 14233258
Alignment:
Q  174 tgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaa 232  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14233316 tgtattttccatgttatcaaactcccctatacttgaaccattgcttgtcctcaagcaaa 14233258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 193
Target Start/End: Original strand, 20958735 - 20958808
Alignment:
Q  120 tgcaaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaa 193  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  20958735 tgcaaaacacaataattgactctaaaataaatgaaaaataaactatttagatagtgcattttgcatgttatcaa 20958808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 394
Target Start/End: Original strand, 15260235 - 15260312
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 394  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  15260235 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtg 15260312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 50882120 - 50882177
Alignment:
Q  174 tgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||| ||||||||    
T  50882120 tgtattttacgtgttatcaaactcccctacacctgaaccgttacttgtcttcaagcaa 50882177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12515081 - 12515042
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12515081 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 12515042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 10602473 - 10602687
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602473 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 10602572  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602573 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 10602672  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  10602673 tgtgtgtgaagtcca 10602687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 13504882 - 13505096
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13504882 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagcac 13504981  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504982 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 13505081  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  13505082 tgtgtgtgaagtcca 13505096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11947621 - 11947407
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11947621 atcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagcac 11947522  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11947521 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaaatgagtg 11947422  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  11947421 tgtgtgtgaagtcca 11947407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 16448761 - 16448975
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16448761 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagcac 16448860  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448861 atgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 16448960  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  16448961 tgtgtgtgaagtcca 16448975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7600569 - 7600355
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7600569 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 7600470  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7600469 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtg 7600370  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  7600369 tgtgtgtgaagtcca 7600355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 15556943 - 15557157
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15556943 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagcac 15557042  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557043 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 15557142  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||| ||| |||||    
T  15557143 tgtgtatgaagtcca 15557157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 9360972 - 9361186
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9360972 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaaggac 9361071  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9361072 atgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagtg 9361171  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  9361172 tgtgtgtgaagtcca 9361186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 16373566 - 16373780
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16373566 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 16373664  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16373665 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 16373764  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  16373765 gtgtgtgtgaagtcca 16373780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 12187077 - 12187291
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12187077 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 12187175  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12187176 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 12187275  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  12187276 gtgtgtgtgaagtcca 12187291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37942592 - 37942378
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37942592 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 37942494  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37942493 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcctgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 37942394  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  37942393 gtgtgtgtgaagtcca 37942378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 12193489 - 12193697
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 286  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12193489 ttatcaaactcccccatacctgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagc 12193587  T
Q  287 acatgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12193588 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtga 12193687  T
Q  386 gtgtgtgtgt 395  Q
    ||||||||||    
T  12193688 gtgtgtgtgt 12193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 192 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6815079 - 6814868
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 291  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6815079 aaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcacatg 6814981  T
Q  292 tctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814980 tctcctcaagggcataaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 6814881  T
Q  391 tgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||| |||||    
T  6814880 tgtgtgaagtcca 6814868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10147225 - 10147011
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  10147225 atcaaactcccccatacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcac 10147127  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10147126 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 10147027  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  10147026 gtgtgtgtgaagtcca 10147011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15645215 - 15645001
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15645215 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagcac 15645117  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  15645116 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgagt 15645017  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  15645016 gtgtgtgtgaagtcca 15645001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 10160174 - 10160388
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  10160174 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcgaatgacagtt-aattaaagcac 10160272  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10160273 atgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 10160372  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  10160373 gtgtgtgtgaagtcca 10160388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 13187418 - 13187632
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13187418 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcac 13187516  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13187517 atgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcgagtttcaagtgagt 13187616  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  13187617 gtgtgtgtgaagtcca 13187632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 3245589 - 3245795
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    ||||| ||||||||||||||||| |      
T  3245589 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaactt 3245688  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  3245689 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagta 3245788  T
Q  389 tgtgtgt 395  Q
    |||||||    
T  3245789 tgtgtgt 3245795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2721510 - 2721305
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    ||| | ||||||||||||||||| |      
T  2721510 atcaaactcccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattataatatgacaattcaattaaaactt 2721412  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  |   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2721411 atgtctcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 2721312  T
Q  389 tgtgtgt 395  Q
    |||||||    
T  2721311 tgtgtgt 2721305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 1735670 - 1735831
Alignment:
Q  32 tcaagttgctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1735670 tcaagttgctcttttcaccttcttcttgattcttttacttttgacaccctcgttacctgaaacacaacgaaatactagctagaagacatgcaaaacacaa 1735769  T
Q  132 taaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaa 193  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1735770 taaatgacccgaaaataaataaaaattaaactatttagacaacgtattttgcgtgttgtcaa 1735831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4382960 - 4382751
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4382960 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagca 4382861  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  4382860 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 4382761  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  4382760 tgtgtgtgtg 4382751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 13001426 - 13001634
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  13001426 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagca 13001525  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  13001526 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 13001625  T
Q  387 tgtgtgtgt 395  Q
    |||||||||    
T  13001626 tgtgtgtgt 13001634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13097918 - 13097711
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    ||    ||||||||| ||||||| |||    
T  13097918 atcaaactcccccacatttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaacac 13097819  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13097818 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 13097719  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  13097718 tgtgtgtg 13097711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 10546937 - 10547148
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagtta-tatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | || ||||| ||||||||| | |  |||||    
T  10546937 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacgatattatcatatgacaattaattcgaagca 10547036  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat--ttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtg 384  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | |||||    
T  10547037 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttttcaacccaacaatcaagtcttaagtg 10547136  T
Q  385 agtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||    
T  10547137 agtgtgtgtgtg 10547148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 20156516 - 20156722
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaaca-gttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | || |||| ||||||||| ||||||| |     
T  20156516 atcaaactcccccacacttgaatctt-gcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagcataaacaagata-atcatatgacaattaaattaaaact 20156613  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20156614 catgtctcctcaaaggcttttatttcaattttacactaatcacaagctcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagt 20156713  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  20156714 gtgtgtgtg 20156722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1993010 - 1992803
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    ||||| ||||||||| ||||||| |      
T  1993010 atcaaactctctcccacttgaatctttgcttatgctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattaaattaaaactt 1992911  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  1992910 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaactcaacaatcaaatttcaagtgagtg 1992811  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  1992810 tgtgtgtg 1992803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13690815 - 13690608
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    |||   ||||||||| ||||||| |||    
T  13690815 atcaaactcccccacacttgaatctttagttgtcatcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattatttcatgacaatttaattaaaacac 13690716  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13690715 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtccactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagtg 13690616  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  13690615 tgtgtgtg 13690608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11398423 - 11398215
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||    || || | |||||||||||| ||| |     
T  11398423 atcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaacaagattaacatacgacaattcaattgaaaact 11398324  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     ||||||| |||| |||||  ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11398323 tatgtctcttcaaaggcttttatttaaagcgtacactaatcataaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 11398224  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  11398223 gtgtgtgtg 11398215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 14348589 - 14348797
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaaca-gttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  | || |   || || ||||||||||||||||| |     
T  14348589 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatggtaacataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaact 14348688  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
      ||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14348689 tgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccaaacaatcaagttctaagtgagt 14348788  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  14348789 gtgtgtgtg 14348797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22637907 - 22637702
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||    ||||| ||||||||||||||||| |     
T  22637907 atcaaactcccctacacttgaatctttacttgtgctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaact 22637808  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     ||| |||||||| | |||  ||  |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22637807 tatgcctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaacttaagcaattcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 22637708  T
Q  388 gtgtgt 393  Q
    ||||||    
T  22637707 gtgtgt 22637702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3279398 - 3279191
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| |  | | || ||||||||| ||||||| |     
T  3279398 atcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcaacataaacaatacttaacatatgacaattaaattaaaact 3279299  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
      ||||||||||| | |||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3279298 tgtgtctcctcaaagacttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcgaacatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 3279199  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  3279198 gtgtgtgt 3279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17388044 - 17387839
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||    |||||  |||||||||||||||| |     
T  17388044 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccttaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatgtgacaattcaattaaaact 17387945  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     || ||||||||| |||||  ||  |||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17387944 tatatctcctcaaaggcttttatttcaagcacacactaatcacaaactcaagcaattcttgaaatctttattcaacccaacaatcaagtttaaagtgagt 17387845  T
Q  388 gtgtgt 393  Q
    ||||||    
T  17387844 gtgtgt 17387839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 12160208 - 12160416
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||   || |    ||||| ||||||||| |||||||| |    
T  12160208 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtggcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagaa 12160307  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    |||||||||||||  | ||  ||  ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  12160308 catgtctcctcaaatgtttttatttcaaagagtacactaataaaaaactcaagcatttcttgtaattctt-ttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 12160406  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  12160407 tgtgtgtgtg 12160416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16655897 - 16655798
Alignment:
Q  305 ttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16655897 ttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 16655798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17045902 - 17045697
Alignment:
Q  196 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    || || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17045902 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17045803  T
Q  295 cctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 394  Q
    |||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  17045802 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17045706  T
Q  395 tgatgtcca 403  Q
    ||| |||||    
T  17045705 tgaagtcca 17045697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17048062 - 17047857
Alignment:
Q  196 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    || || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17048062 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17047963  T
Q  295 cctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 394  Q
    |||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  17047962 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17047866  T
Q  395 tgatgtcca 403  Q
    ||| |||||    
T  17047865 tgaagtcca 17047857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 27356729 - 27356784
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356729 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 27356784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13601276 - 13601220
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13601276 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacata 13601220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 3339227 - 3339282
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3339227 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 3339282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 12776535 - 12776590
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12776535 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 12776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 13136211 - 13136266
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13136211 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 13136266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20584317 - 20584262
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20584317 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 20584262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15946823 - 15946773
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946823 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15946773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 14445769 - 14445826
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14445769 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcatagacatag 14445826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 15619284 - 15619339
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15619284 atcaaactgccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15619339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 13195459 - 13195514
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13195459 atcaaactcccacacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacat 13195514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Original strand, 8686388 - 8686442
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaca 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8686388 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaagcataaaca 8686442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 20225755 - 20225817
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20225755 atcaaactcccccatacttaaatctttgtttgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagca 20225817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13068356 - 13068306
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13068356 atcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaccaaaagacata 13068306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13601108 - 13601062
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13601108 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 13601062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2005529 - 2005499
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgctt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005529 atcaaactcccccacacttgaatctttgctt 2005499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Original strand, 12776660 - 12776739
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12776660 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactt-attcaacccaacaa-caagtctcaagtgagtgtgtgtgtg 12776739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15946698 - 15946619
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||    
T  15946698 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatctcaagtgagtgtgtgtgtg 15946619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22665276 - 22665062
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665276 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 22665177  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665176 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 22665077  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  22665076 tgtgtgtgaagtcca 22665062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 117757 - 117543
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  117757 atcaaactcccccacacttgcatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagcac 117658  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117657 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 117558  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  117557 tgtgtgtgaagtcca 117543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 22044661 - 22044875
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22044661 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 22044760  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22044761 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 22044860  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  22044861 tgtgtgtgaagtcca 22044875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25357725 - 25357511
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25357725 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 25357626  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25357625 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 25357526  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  25357525 tgtgtgtgaagtcca 25357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16775865 - 16775651
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16775865 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagcac 16775766  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16775765 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtg 16775666  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  16775665 tgtgtgtgaagtcca 16775651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 11616 - 11823
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11616 atcaaactcccccacacttgcctctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagcac 11715  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11716 atatctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagtg 11815  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  11816 tgtgtgtg 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17590621 - 17590407
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17590621 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcagcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagcac 17590522  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17590521 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttctggaaatctctattctacccaacgatcaagttttaagtgagtg 17590422  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||| ||||| |||||    
T  17590421 tgtatgtgaagtcca 17590407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 24795286 - 24795500
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24795286 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtaccatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 24795385  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24795386 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtg 24795485  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  24795486 tgtgtgtgaagtcca 24795500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27627795 - 27627580
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  27627795 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttgaatcaaatgacaaattaattaaagcac 27627696  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcc-caaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27627695 atgtctcctcaagggcttaaatcctaaaatgtacattaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 27627596  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  27627595 gtgtgtgtgaagtcca 27627580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 25144758 - 25144966
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  25144758 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 25144857  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25144858 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 25144957  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  25144958 gtgtgtgtg 25144966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 19805470 - 19805662
Alignment:
Q  40 ctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaataaacgac 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  19805470 ctcttttcacctccttcttgattcttttacttttaacaccctcgttacctgaaacataacaaaatactagccagaagacatacaaaacacaataaaagac 19805569  T
Q  140 tctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 233  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19805570 tct-aaatgaataaaaattaaactatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacactagaaccattgcttgtcctcaagcaaaa 19805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 5500266 - 5500473
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  5500266 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 5500365  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5500366 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcacgtaaaccttattcaactcaacaatcaagtttcaagtgagt 5500465  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  5500466 gtgtgtgt 5500473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 25804268 - 25804475
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    || || ||||||||||||||||| |      
T  25804268 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcacaaacaagattaacatatgacaattcaattaaaactt 25804367  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||| ||||||| |||||  |   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25804368 atgtatcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaaatttcaagtgagtg 25804467  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    || |||||    
T  25804468 tgcgtgtg 25804475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Original strand, 25370890 - 25371091
Alignment:
Q  193 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagcaca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||  ||||||   ||||||||||||| ||| | ||    
T  25370890 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtaacaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaactca 25370986  T
Q  290 tgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgt 389  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25370987 tgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaattacaaactcaagcatttcttataatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtgt 25371086  T
Q  390 gtgtg 394  Q
    |||||    
T  25371087 gtgtg 25371091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 23798923 - 23799129
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||     ||  || ||||||||||||| ||| | |    
T  23798923 atcaaactcccccacacttgaatctttgattatcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaactc 23799022  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  23799023 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtatcctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtg 23799122  T
Q  389 tgtgtgt 395  Q
    |||||||    
T  23799123 tgtgtgt 23799129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23644159 - 23643950
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || |    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23644159 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagca 23644060  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaa-atgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    | ||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| || ||||||| | ||||| |    
T  23644059 cgtgtctcctcaaaggcttttatttcaaggagtacactaatcacaaactcaagcatttcctgtaatcctttttcaaccctacaatcaagtcttaagtggg 23643960  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    || |||||||    
T  23643959 tgcgtgtgtg 23643950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24502297 - 24502168
Alignment:
Q  268 atgacaattcaattaaag-cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaaccca 366  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24502297 atgacaattcaattaaaaacttatgtctcctcaaatgcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccca 24502198  T
Q  367 acgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24502197 acaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24502168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 342
Target Start/End: Original strand, 24178194 - 24178348
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||    ||||| ||||||||| |||| ||| |     
T  24178194 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaatttaattaaaaact 24178293  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcat 342  Q
     ||||||||||||  ||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24178294 tatgtctcctcaaaagcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcat 24178348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 23159386 - 23159441
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23159386 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 23159441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 23570643 - 23570698
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23570643 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 23570698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27631710 - 27631655
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27631710 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27631655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 27768817 - 27768872
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27768817 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27768872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24171560 - 24171510
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171560 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 24171510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Original strand, 17334535 - 17334648
Alignment:
Q  118 catgcaaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgc 217  Q
    |||||||||||| | ||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  17334535 catgcaaaacacgacaaatgaccccaaaacaaataaaaattaagctacttagatagtgcattttgcttgttatcaaactcccccacacttgaaccattga 17334634  T
Q  218 ttgtcctcaagcaa 231  Q
    ||||||||||||||    
T  17334635 ttgtcctcaagcaa 17334648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24506864 - 24506802
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24506864 atcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagca 24506802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24321380 - 24321328
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24321380 aaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcgtaaacat 24321328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 23257571 - 23257625
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257571 atcaaactcccc-atacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 23257625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 25337652 - 25337714
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25337652 atcaaattcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaatatagcagca 25337714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29955915 - 29955868
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 234  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29955915 ttatcaaacttcccgatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 29955868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 21512565 - 21512615
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 237  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21512565 ttatcaaattcccccatgcttgaatccttgcttgtcctcaagcaaaaggca 21512615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23648165 - 23648123
Alignment:
Q  207 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23648165 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagtag 23648123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Original strand, 24019066 - 24019123
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  24019066 ttatcaaattcccccatacttgaatctttttttgtcctcaaacaaaagacataaacat 24019123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27631585 - 27631506
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  27631585 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgtg 27631506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15532792 - 15532753
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15532792 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 15532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 396
Target Start/End: Original strand, 24019228 - 24019267
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24019228 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24019267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 25582766 - 25582814
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagg 235  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25582766 ttatcaaactgccccatgcttgaatccttgcttgtcctcaagtaaaagg 25582814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27047088 - 27046874
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047088 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagctccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 27046989  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046988 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 27046889  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  27046888 tgtgtgtgaagtcca 27046874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 17094602 - 17094816
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17094602 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagcac 17094701  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094702 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 17094801  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  17094802 tgtgtgtgaagtcca 17094816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 21798663 - 21798878
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagca 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21798663 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaatttaaagca 21798762  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21798763 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatttttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 21798862  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  21798863 gtgtgtgtgaagtcca 21798878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20237670 - 20237456
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20237670 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatgcagtagcacaaataattttatcaaatgacaattcgattaaagcac 20237571  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20237570 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaaccacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagctttaagtgagtg 20237471  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    | ||||||| |||||    
T  20237470 tttgtgtgaagtcca 20237456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8653327 - 8653126
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaac--ag-ttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || ||||||   ||||||||||||| ||| | |    
T  8653327 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaatcaaaactc 8653231  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  8653230 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgtgtg 8653131  T
Q  389 tgtgt 393  Q
    |||||    
T  8653130 tgtgt 8653126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 52938622 - 52938830
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||    ||||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  52938622 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataatcatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaatca 52938721  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  52938722 catgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgagt 52938821  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  52938822 gtgtgtgtg 52938830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Original strand, 27775944 - 27776095
Alignment:
Q  40 ctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaataaacgac 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  27775944 ctcttttcacctccttcttgattcttttacttttaacaccctcgttacctgaaacataacaaaatactagccagaagacatacaaaacacaataaaagac 27776043  T
Q  140 tctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    ||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27776044 tct-aaatgaataaaaattaaactatttagacaatgtattttgcgtgttatca 27776095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3990153 - 3989944
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  3990153 atcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagca 3990054  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaat-gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    |||||||| |||| |||||  ||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  3990053 catgtctcgtcaaaggcttttatttcaaagagtgcactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 3989954  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  3989953 tgtgtgtgtg 3989944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19364243 - 19364043
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||     ||  || ||||||||||||| ||| | |    
T  19364243 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagcagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaactc 19364144  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  19364143 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccaacaatccagttctaagtgagtg 19364044  T
Q  389 t 389  Q
    |    
T  19364043 t 19364043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14070719 - 14070632
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaatt 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14070719 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt 14070632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Original strand, 19875648 - 19875702
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875648 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 19875702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 21784473 - 21784535
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21784473 atcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 21784535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4027894 - 4027832
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4027894 atcaaactcccccacccttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 4027832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 16382578 - 16382631
Alignment:
Q  191 caaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382578 caaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaataaacat 16382631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 8947516 - 8947578
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  8947516 atcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaggaaaagacatagacatagcagca 8947578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 18478219 - 18478276
Alignment:
Q  174 tgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18478219 tgtattttgcatgttatcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 18478276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 395
Target Start/End: Original strand, 21784598 - 21784677
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 395  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  21784598 aatgtacactaatcacaacttcaagtatttcttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 21784677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 20595832 - 20596046
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595832 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 20595931  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595932 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 20596031  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  20596032 tgtgtgtgaagtcca 20596046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 20602118 - 20602332
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602118 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 20602217  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602218 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 20602317  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  20602318 tgtgtgtgaagtcca 20602332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 20608409 - 20608623
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608409 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 20608508  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608509 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 20608608  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  20608609 tgtgtgtgaagtcca 20608623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15735748 - 15735534
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735748 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 15735649  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735648 atgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 15735549  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  15735548 tgtgtgtgaagtcca 15735534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27270778 - 27270563
Alignment:
Q  18 catcattgactggttcaagttgctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataaga 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27270778 catcattggctggttcaagttgctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataaaa 27270679  T
Q  118 catgcaaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgc 217  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27270678 catgcaaaacacaataaacaaccctaaaataaataaaaataaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatcattgc 27270579  T
Q  218 ttgtcctcaagcaaaa 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  27270578 ttgtcctcaagcaaaa 27270563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23748265 - 23748051
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23748265 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagcac 23748166  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23748165 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtg 23748066  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  23748065 tgtgtgtgaagtcca 23748051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Original strand, 23710701 - 23710892
Alignment:
Q  213 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaatt-caattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710701 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 23710800  T
Q  312 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23710801 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttatttaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 23710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24940748 - 24940540
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24940748 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 24940649  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24940648 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtaaactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 24940549  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    | |||||||    
T  24940548 gagtgtgtg 24940540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18073114 - 18072900
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18073114 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagcac 18073016  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  18073015 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgagt 18072916  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  18072915 gtgtgtgtgaagtcca 18072900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 24953175 - 24953389
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24953175 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggtataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 24953273  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24953274 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 24953373  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  24953374 gtgtgtgtgaagtcca 24953389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 206 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20622359 - 20622170
Alignment:
Q  206 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaagggct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622359 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacaattaaatcaaatgacaatttaattaaagcacatgtctcctcaagggct 20622260  T
Q  306 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20622259 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtgtgtgtgt 20622170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 20790715 - 20790929
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20790715 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcac 20790813  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  20790814 atgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacctaacaatcaagtttcaagcgagt 20790913  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  20790914 gtgtgtgtgaagtcca 20790929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 23600637 - 23600845
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacca-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  23600637 atcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattagaaca 23600736  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23600737 catgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 23600836  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  23600837 gtgtgtgtg 23600845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24219960 - 24219752
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  24219960 atcaaactcccccacacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 24219861  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24219860 catgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 24219761  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  24219760 gtgtgtgtg 24219752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 396
Target Start/End: Original strand, 20444843 - 20445048
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagcacat 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20444843 aaactcccccacacttgaatctttgattgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaaacacat 20444942  T
Q  291 gtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 390  Q
    |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20444943 gtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtg 20445042  T
Q  391 tgtgtg 396  Q
    ||||||    
T  20445043 tgtgtg 20445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21387604 - 21387410
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||    || || |||||||||||||| ||| |     
T  21387604 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaatgcataaacatagcagcacacacaagactaacatatgacaattcaattgaaaact 21387505  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaag 382  Q
     |||||||||||| | |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21387504 tatgtctcctcaaagactttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaag 21387410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 392
Target Start/End: Original strand, 20916457 - 20916660
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||     ||  || | ||||||| ||| ||| | |    
T  20916457 atcaaactcccctacacatgaatttttggttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagctgcataaaataagattacataggacaattaaatcaaaactc 20916556  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20916557 atgtctcctcaaaggcttttatttcaaccgtacactaatcacgaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 20916656  T
Q  389 tgtg 392  Q
    ||||    
T  20916657 tgtg 20916660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22948596 - 22948518
Alignment:
Q  318 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22948596 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 22948518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20575633 - 20575510
Alignment:
Q  272 caattcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgat 371  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  20575633 caattcaatcaaaactcatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccgacaat 20575534  T
Q  372 caagtttcaagtgagtgtgtgtgt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  20575533 caagtttcaagtgagtgcgtgtgt 20575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 22317514 - 22317569
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22317514 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22317569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 25006809 - 25006864
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25006809 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 25006864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 30759656 - 30759711
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30759656 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 30759711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 18484213 - 18484275
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18484213 atcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 18484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 25116172 - 25116221
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116172 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 25116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26847858 - 26847803
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26847858 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaccaaaaggcatagacat 26847803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22855775 - 22855723
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22855775 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22855723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 25175262 - 25175306
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175262 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 25175306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17412786 - 17412736
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17412786 ttatcaaactcccccatacttgaatcattgtttgtcgtcaagcaaaaggca 17412736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Original strand, 22317639 - 22317719
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22317639 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22317719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Original strand, 26306847 - 26306911
Alignment:
Q  163 tatttagacaatgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaa 227  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||    
T  26306847 tatttaaacagtgtattttacgtgttatcaaactacctcacacttgaaccattacttgtcctcaa 26306911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28360124 - 28360054
Alignment:
Q  122 caaaacacaataaacgactctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatca 192  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28360124 caaaacaaaataattgactctaaaataaatgaaaaacaaactatttagacagtgtattttgcatgttatca 28360054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22855651 - 22855572
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||   |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22855651 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtaa-acttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22855572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 395
Target Start/End: Original strand, 25006934 - 25007012
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 395  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25006934 aatgtacactaatcataacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgt 25007012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15892 - 15678
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15892 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 15793  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15792 atgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 15693  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  15692 tgtgtgtgaagtcca 15678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21382308 - 21382093
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaatt-caattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21382308 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagca 21382209  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382208 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 21382109  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  21382108 gtgtgtgtgaagtcca 21382093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 21098795 - 21099009
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21098795 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagcac 21098894  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21098895 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagtg 21098994  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  21098995 tgtgtgtgaagtcca 21099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 21104116 - 21104330
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21104116 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagcac 21104215  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21104216 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagtg 21104315  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  21104316 tgtgtgtgaagtcca 21104330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23911654 - 23911441
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23911654 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcgattaaagcac 23911555  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23911554 atgtctcctcaagggcttaaatcccagatgtacactaatcacaaacttaaacatttcttgtaatttttattcaacccaa-gatcaaatttcaagtgagtg 23911456  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    ||||||||| |||||    
T  23911455 tgtgtgtgaagtcca 23911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8314682 - 8314467
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagca 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  8314682 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacatttaaatcaaatgacaattaaatttaaagca 8314583  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8314582 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 8314483  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  8314482 gtgtgtgtgaagtcca 8314467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 8322847 - 8323062
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  8322847 atcaaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttaaatcaaatgacaaattaattaaagcac 8322946  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8322947 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 8323046  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  8323047 gtgtgtgtgaagtcca 8323062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 21843525 - 21843733
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacca-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  21843525 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 21843624  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21843625 catgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 21843724  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  21843725 gtgtgtgtg 21843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 21939997 - 21940206
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   || |    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21939997 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagca 21940096  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21940097 catgtctcctcaaaggctttcatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtctgaagtgag 21940196  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  21940197 tgtgtgtgtg 21940206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 20038982 - 20039189
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     |||| |||||| || || |||   ||    
T  20038982 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagatcatcacatgacattttaactaagatac 20039081  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||| |||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20039082 atgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacaataatcacaaactcaagtatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagtg 20039181  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  20039182 tgtgtgtg 20039189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23455153 - 23454945
Alignment:
Q  189 atcaaactccccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    |  || |||||||||||||| |||      
T  23455153 atcaaactccccccacacttgaatctttgcttgtcctcgagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagactcacatatgacaattcaattgaaaat 23455054  T
Q  287 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
      |||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23455053 ttatgtctcctcaaaggctttcatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaatccaacaatcaagtttcaagtgag 23454954  T
Q  387 tgtgtgtgt 395  Q
    |||||||||    
T  23454953 tgtgtgtgt 23454945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17620960 - 17620755
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    ||    ||||||||| ||||||| |||    
T  17620960 atcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaacac 17620861  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17620860 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtaccctaatcataaactcaagcattctttgtaatcctttttcaa-ccaacaatcaagtttcaagtgagtg 17620762  T
Q  389 tgtgtgt 395  Q
    |||||||    
T  17620761 tgtgtgt 17620755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 16418621 - 16418830
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   || |    ||||| |||||||||  |||||| ||    
T  16418621 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaaaca 16418720  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16418721 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 16418820  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  16418821 tgtgtgtgtg 16418830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24034229 - 24034049
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagtta-tatcaaatgacaattcaatt-aaagc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  |  | ||  | |||||||||||||| ||| |    
T  24034229 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacgagattaatatatgacaattcaattgaaaac 24034130  T
Q  287 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 367  Q
      |||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24034129 ttatgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactgatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 24034049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 395
Target Start/End: Original strand, 14352181 - 14352378
Alignment:
Q  199 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaaca-gttatatcaaatgacaattcaa-ttaaagcacatgtctcc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| | || || | ||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  14352181 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaacaagata-attatatgacaattaaaattaaaactcatgtctcc 14352279  T
Q  297 tcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 395  Q
    ||   |||||  ||  |||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14352280 tccgaggcttttatttcaagcgtacactaattactaactcaagcattctttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgt 14352378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21538764 - 21538573
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    ||||| ||||||||||||||||| |     
T  21538764 atcaaaatcccccacacttaaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaact 21538665  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacac--taatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtt 377  Q
     |||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21538664 tatgtctcctcaaagactttaatttcaatcgtacactataatcacaaactccagggtttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtt 21538573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20712648 - 20712537
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcac-caacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  20712648 atcaaactcccctacacttaaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaacattatcatatgacaatttaatcaaagca 20712549  T
Q  288 catgtctcctca 299  Q
    ||||||||||||    
T  20712548 catgtctcctca 20712537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 11346954 - 11347009
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11346954 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 11347009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19767739 - 19767684
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19767739 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 19767684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22370157 - 22370102
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22370157 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20002329 - 20002279
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002329 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 20002279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 22033556 - 22033611
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22033556 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22033611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 22099656 - 22099711
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22099656 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22099711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22102607 - 22102552
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22102607 atcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22102552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21831231 - 21831181
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21831231 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 21831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20712539 - 20712470
Alignment:
Q  327 tcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20712539 tcacaaactcaatcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtctcaaatgagtgtgtgtgtg 20712470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22817805 - 22817755
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22817805 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaagacata 22817755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 19902162 - 19902216
Alignment:
Q  177 attttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19902162 attttacgtgttatcaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 19902216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 18572975 - 18573025
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18572975 ttatcaaactcccccatacttgaattttttcttgtccttaagcaaaaggca 18573025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22102482 - 22102403
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22102482 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgcgtgtgtg 22102403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1252 - 1038
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1252 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagcac 1153  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1152 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 1053  T
Q  389 tgtgtgtgatgtcca 403  Q
    | ||||||| |||||    
T  1052 tatgtgtgaagtcca 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3451
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagtta 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  3523 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcagcagtta 3451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 403
Target Start/End: Original strand, 616 - 831
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  616 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaagcataaatatggtagcacaaacaattttatcaaatcacaattcgattaaagcac 715  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag-tttcaagtgagt 387  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  716 aagtctcctcaagggattaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttttaagtgagt 815  T
Q  388 gtgtgtgtgatgtcca 403  Q
    |||||||||| |||||    
T  816 gtgtgtgtgaagtcca 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 220
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||||  ||||||||| |||||||  ||    
T  427 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcgtatgacaatttaattaaaatac 328  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  327 atgtctcctcaagggctttaatttaaagcgtacactaatcacaaactgaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 228  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  227 tgtgtgtg 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 2853 - 3058
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2853 atcaaactcccacatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 2952  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    |||||||||| |||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2953 catgtctccttaagggctttaatttcatgtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 3052  T
Q  388 gtgtgt 393  Q
    ||||||    
T  3053 gtgtgt 3058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 251871 - 252079
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |  |||||  |||||||| ||||||| ||    
T  251871 atcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaatggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatttgacaatttaattaaaaca 251970  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  251971 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactagtcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagttccaagtgagt 252070  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  252071 gtgtgtgtg 252079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11263 - 11064
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  11263 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaacac 11164  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  11163 atgtctcctcaagggctttaattttaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaaaaattaagtttcaagtgagtg 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 2288 - 2496
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  2288 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagca 2387  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  2388 catgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgagt 2487  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  2488 gtgtgtgtg 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1040 - 831
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1040 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaattaacattatcatatgacaattaaattaaagca 941  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  940 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 841  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  840 tgtgtgtgtg 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 14663 - 14869
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||||| |||| |||| ||||||| |||    
T  14663 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgaaaatttaattaaaacac 14762  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14763 atgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacattattcataaactcaagcatttcttgtaaaccttatgaaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 14862  T
Q  389 tgtgtgt 395  Q
    |||||||    
T  14863 tgtgtgt 14869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 686 - 482
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||    ||||| |||||||||||||||||        
T  686 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgtataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaatta 587  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||||||||  ||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  586 atgtctcctcaaaagcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaaccattttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaaatgagtg 487  T
Q  389 tgtgt 393  Q
    |||||    
T  486 tgtgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8148 - 7941
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||     || | |||||| || || |||| |||    
T  8148 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaagcaaaaggcataaacacggtagcataaacaagatcattacatgacattttaactaaaacac 8049  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    ||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8048 atgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacactaatcacaaactcgagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagtg 7949  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  7948 tgtgtgtg 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 121161 - 120954
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaa-atgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||| |  | ||||||||| |||| || ||    
T  121161 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatatttttatatgacaatttaattgaaaca 121062  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||||| |||||| ||    
T  121061 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaaaccttattcaacccaacaaccaagttccaagtgtgt 120962  T
Q  388 gtgtgtgt 395  Q
    ||||||||    
T  120961 gtgtgtgt 120954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 346
Target Start/End: Original strand, 164404 - 164562
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcac-caacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  164404 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 164503  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttct 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  164504 catgtctcctcaagggcttcaatttaaagcgcacactaatcacaaactcaagcatttct 164562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 172318 - 172254
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  172318 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagca 172254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 162057 - 161995
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  162057 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 161995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1317 - 1108
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |    ||||| |||||||||  ||||| |||    
T  1317 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaggca 1218  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    |||||| |||||| |||||  ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  1217 catgtcccctcaaaggcttttatttcaaagagtacattaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 1118  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  1117 tgtgtgtgtg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 6426 - 6578
Alignment:
Q  40 ctcttttcacctccttcttggttcttttatctttgacacccttgttacctgaaacacaacgaaatactagccataagacatgcaaaacacaataaacgac 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  6426 ctcttttcacctccttcatgactcttttatttttgacaccctcgttacctaaaacacaacgaaatactagacagaagacatgcaaaacacaataaa-gac 6524  T
Q  140 tctaaaataaataaaaattaatttatttagacaatgtattttgcgtgttatcaa 193  Q
     | ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  6525 cccaaaataaataaaaattaaactatttacataatgtattttgcatgttatcaa 6578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 58629 - 58838
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || |    ||||| |||||||||  |||||||||    
T  58629 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagca 58728  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    |||||||||||||  ||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  58729 catgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaaccatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 58828  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||    
T  58829 tgtgtgtgtg 58838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 97727 - 97936
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   || |    ||||| |||||||||  |||||||||    
T  97727 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagca 97826  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 386  Q
    |||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  97827 catgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 97926  T
Q  387 tgtgtgtgtg 396  Q
    | ||||||||    
T  97927 tatgtgtgtg 97936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 511 - 718
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||     ||  || ||||||||||||| ||| |      
T  511 atcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaactt 610  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    || ||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  611 atatctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtg 710  T
Q  389 tgtgtgtg 396  Q
    ||||||||    
T  711 tgtgtgtg 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 306
Target Start/End: Original strand, 10207 - 10325
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacca-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10207 atcaaactcccccaaacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 10306  T
Q  288 catgtctcctcaagggctt 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10307 catgtctcctcaagggctt 10325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 13003 - 13207
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||    ||||| || | |||||||||||| |      
T  13003 atcaaactccgccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaagaggcataaacatagtagcataaccaagattatcatataataattcaattaaaactt 13102  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 388  Q
    |||||| ||||| |||||  ||  ||   ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  13103 atgtcttctcaaaggcttttatttcatgcgtacactaataccatactcaagcatttcttgtaatctttattaaacccaagaatcaagtttcaagtgagtg 13202  T
Q  389 tgtgt 393  Q
     ||||    
T  13203 cgtgt 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 35105 - 35307
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||        | |||||||||||| |||| |||    
T  35105 atcaaactcccccacacttgaatctttccttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca--------agatgacaattcaactaaaacac 35196  T
Q  289 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaa------tttttattcaacccaacgatcaagtttcaag 382  Q
    |||||||||  | ||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||      ||||| ||||||||||| || |||||||||     
T  35197 atgtctcctttaaggctttaatttcaagtgtacagtaatcacaaactcaagcattcttggtaatcttttttttttttcaacccaacaatgaagtttcaaa 35296  T
Q  383 tgagtgtgtgt 393  Q
    |||||||||||    
T  35297 tgagtgtgtgt 35307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8868 - 8720
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-ccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  8868 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagca 8769  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaact 335  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  8768 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaact 8720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12609 - 12450
Alignment:
Q  190 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagc-accaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||   ||||||||||||| |||      
T  12609 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaat 12513  T
Q  287 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 349  Q
     ||||||||||||| | |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512 tcatgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Original strand, 232789 - 232948
Alignment:
Q  190 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagc-accaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||   ||||||||||||| |||      
T  232789 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaat 232885  T
Q  287 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 349  Q
     ||||||||||||| | |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232886 tcatgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 232948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5294 - 5090
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattc-aattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |   ||| || |||||||||| ||| |||||     
T  5294 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagcaataaaaaagataacatatgacaattcaaataaaagct 5195  T
Q  288 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 387  Q
     |||||||||| | || || | | |  ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  5194 tatgtctcctctaaggtttcatttc--aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaacaat-aagtctcaagtgagt 5099  T
Q  388 gtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||    
T  5098 gtgtgtgtg 5090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 289
Target Start/End: Original strand, 38509 - 38610
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagtta-tatcaaatgacaattcaattaaagca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |  || ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  38509 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcacaaaaaaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 38608  T
Q  288 ca 289  Q
    ||    
T  38609 ca 38610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Original strand, 38625 - 38675
Alignment:
Q  318 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaac 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  38625 gtacattaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaac 38675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42299 - 42237
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42299 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 42237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 50507 - 50569
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50507 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 50569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 88346 - 88403
Alignment:
Q  174 tgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  88346 tgtattttgcatgttatcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 88403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 969 - 912
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  969 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatag 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2926 - 2859
Alignment:
Q  329 acaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2926 acaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2817 - 2762
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2817 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2692 - 2612
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||||    
T  2692 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacatgtcttaagtgagtgtgtgtgtg 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 22159 - 22218
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22159 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 22218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12793 - 12743
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12793 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 1193
Alignment:
Q  187 ttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1250 ttatcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacat 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1080 - 1041
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1080 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10775 - 10720
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10775 atcaaactcccccacactttaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 10720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 54850 - 54905
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54850 atcaaactcccccacgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 54905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37922 - 37722
Alignment:
Q  192 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||    ||  | |||||||||||||| ||| |  ||    
T  37922 aaactcccccacacttgaatcttttcttgccctcaagcaaaagccataaacatagcaacataaacaaaattaaaatatgacaattcaattaaaatcttat 37823  T
Q  291 gtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 390  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  |    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37822 gtctcctcaaaggctt-aatttcaagtgtacactaatcacaacatcaagtattccttgcga-acctattcaacccaac-aacaagtttcaagtgagtgtg 37726  T
Q  391 tgtg 394  Q
    ||||    
T  37725 tgtg 37722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1901 - 1839
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1901 atcaaactcccccacacttgaatctttgattgttctcaagcaaaaggcataaatatagcagca 1839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 37744 - 37806
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37744 atcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaatagacatagcagca 37806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 395
Target Start/End: Original strand, 37869 - 37948
Alignment:
Q  315 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 395  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  37869 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-atcaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22817 - 22756
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  22817 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagc-aaaggcatagacatagcagca 22756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 45229 - 45291
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  45229 atcaaactcccccacacctgaatctttgcttgttctcaagcaaaagacatagacatagcagca 45291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 72573 - 72622
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  72573 atcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 72622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 84763 - 84812
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  84763 atcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 84812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18262 - 18218
Alignment:
Q  189 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18262 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 18218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 31415 - 31472
Alignment:
Q  174 tgtattttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31415 tgtattttgcatgttatcaaactcccctaaacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 31472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 83174 - 83214
Alignment:
Q  204 acttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83174 acttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 83214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3305 - 3251
Alignment:
Q  177 attttgcgtgttatcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 231  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3305 attttacgtgttaacaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 3251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 396
Target Start/End: Original strand, 5830 - 5869
Alignment:
Q  356 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5830 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University