View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7824_low_19 (Length: 385)

Name: NF7824_low_19
Description: NF7824
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7824_low_19
NF7824_low_19
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (156-374)||(33509890-33510108)
chr6 (15-128)||(33510135-33510247)
chr6 (16-128)||(1063609-1063722)
chr6 (16-128)||(31894216-31894329)
chr6 (17-125)||(13909422-13909531)
chr6 (17-124)||(32440652-32440760)
chr6 (32-128)||(181551-181648)
chr6 (16-128)||(5302346-5302459)
chr6 (31-128)||(24983470-24983568)
chr6 (17-125)||(3720248-3720357)
chr6 (16-128)||(11655952-11656065)
chr6 (45-125)||(17828938-17829019)
chr6 (55-124)||(34657608-34657677)
chr6 (32-126)||(34299992-34300087)
chr6 (28-125)||(13087528-13087626)
chr6 (16-125)||(29363304-29363414)
chr6 (56-125)||(3291815-3291884)
chr6 (185-241)||(668960-669015)
chr6 (17-128)||(1225043-1225154)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (15-128)||(49746956-49747070)
chr4 (15-124)||(2653419-2653529)
chr4 (17-125)||(42616917-42617026)
chr4 (17-128)||(6643674-6643786)
chr4 (17-128)||(7061678-7061790)
chr4 (17-128)||(21240718-21240830)
chr4 (17-128)||(47464379-47464491)
chr4 (18-128)||(16821346-16821457)
chr4 (32-125)||(18741503-18741597)
chr4 (16-125)||(35380346-35380456)
chr4 (16-125)||(52247441-52247551)
chr4 (17-125)||(6609759-6609868)
chr4 (28-128)||(47358974-47359075)
chr4 (16-128)||(49175947-49176060)
chr4 (28-128)||(49428367-49428468)
chr4 (32-124)||(53412107-53412200)
chr4 (17-128)||(36985781-36985893)
chr4 (28-128)||(17237321-17237422)
chr4 (17-125)||(43237241-43237350)
chr4 (17-128)||(34360650-34360762)
chr4 (16-126)||(32884798-32884909)
chr4 (16-114)||(54506797-54506896)
chr4 (27-124)||(22130042-22130140)
chr4 (28-128)||(26147640-26147742)
chr4 (43-88)||(37868638-37868684)
chr4 (28-125)||(38502507-38502605)
chr4 (31-128)||(38663475-38663573)
chr4 (17-114)||(52859813-52859911)
chr4 (16-128)||(461953-462066)
chr4 (15-87)||(3098754-3098827)
chr4 (16-128)||(33790744-33790857)
chr4 (28-128)||(47773044-47773145)
chr4 (17-125)||(49579192-49579301)
chr4 (45-128)||(3689557-3689641)
chr4 (29-124)||(7986973-7987069)
chr4 (17-124)||(11907613-11907721)
chr4 (17-124)||(38405116-38405224)
chr4 (17-111)||(2942659-2942753)
chr4 (16-124)||(11288643-11288751)
chr4 (16-84)||(30192244-30192313)
chr4 (28-128)||(50264105-50264206)
chr4 (71-128)||(51624781-51624838)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (28-124)||(8896354-8896451)
chr1 (17-128)||(39864106-39864218)
chr1 (16-128)||(6160469-6160582)
chr1 (17-128)||(28748986-28749098)
chr1 (15-128)||(44761540-44761654)
chr1 (28-128)||(14757616-14757717)
chr1 (28-128)||(31978674-31978775)
chr1 (28-128)||(33733284-33733385)
chr1 (17-128)||(12039077-12039189)
chr1 (15-128)||(7759210-7759324)
chr1 (17-128)||(37506119-37506234)
chr1 (30-106)||(12151193-12151270)
chr1 (24-124)||(27896954-27897055)
chr1 (16-128)||(40144857-40144970)
chr1 (32-124)||(44707786-44707879)
chr1 (16-128)||(49223996-49224109)
chr1 (17-128)||(917019-917131)
chr1 (17-124)||(9307626-9307734)
chr1 (45-124)||(10495838-10495917)
chr1 (45-128)||(20209879-20209963)
chr1 (35-114)||(24903980-24904060)
chr1 (28-114)||(6023671-6023758)
chr1 (15-128)||(15699117-15699231)
chr1 (30-114)||(24880882-24880970)
chr1 (16-125)||(31154126-31154236)
chr1 (16-128)||(26093389-26093502)
chr1 (17-125)||(36701919-36702028)
chr1 (17-125)||(36718023-36718132)
chr1 (33-123)||(9379231-9379323)
chr1 (17-124)||(24991664-24991772)
chr1 (26-128)||(32826011-32826117)
chr1 (16-83)||(32970577-32970645)
chr1 (28-90)||(17988580-17988645)
chr1 (73-128)||(52429339-52429394)
chr1 (56-128)||(25089136-25089209)
chr1 (17-84)||(3312150-3312218)
chr1 (64-128)||(6785251-6785315)
chr1 (30-126)||(11449882-11449977)
chr1 (17-128)||(37276456-37276568)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (17-128)||(7172909-7173021)
chr8 (45-128)||(4924104-4924188)
chr8 (29-124)||(17823920-17824016)
chr8 (17-128)||(39405757-39405869)
chr8 (17-128)||(44761503-44761615)
chr8 (30-128)||(32476282-32476381)
chr8 (15-124)||(17719265-17719375)
chr8 (17-114)||(21216110-21216208)
chr8 (28-124)||(27294079-27294176)
chr8 (17-124)||(31082618-31082726)
chr8 (57-128)||(1739538-1739609)
chr8 (32-114)||(10179971-10180054)
chr8 (17-126)||(34948696-34948806)
chr8 (28-125)||(42886998-42887096)
chr8 (28-128)||(31271016-31271117)
chr8 (16-128)||(45425674-45425787)
chr8 (17-112)||(31331419-31331515)
chr8 (57-125)||(32678401-32678469)
chr8 (28-124)||(4428371-4428468)
chr8 (28-124)||(11976956-11977053)
chr8 (17-81)||(12559635-12559700)
chr8 (17-128)||(396620-396732)
chr8 (56-128)||(29226577-29226649)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (17-128)||(8947058-8947170)
chr2 (28-124)||(35242314-35242411)
chr2 (16-128)||(39691485-39691598)
chr2 (17-127)||(16805877-16805988)
chr2 (17-127)||(16845158-16845269)
chr2 (28-114)||(43410435-43410522)
chr2 (19-103)||(41220954-41221039)
chr2 (17-128)||(17695325-17695437)
chr2 (17-128)||(25637476-25637588)
chr2 (28-114)||(14523389-14523476)
chr2 (17-114)||(43115808-43115906)
chr2 (28-128)||(37322423-37322524)
chr2 (45-124)||(17346396-17346476)
chr2 (17-128)||(34225585-34225697)
chr2 (57-128)||(39785580-39785651)
chr2 (19-128)||(15359095-15359205)
chr2 (55-124)||(26863403-26863472)
chr2 (17-125)||(35313885-35313994)
chr2 (28-83)||(10005141-10005197)
chr2 (17-124)||(16463688-16463796)
chr2 (16-114)||(34120444-34120541)
chr2 (15-89)||(1206707-1206782)
chr2 (73-128)||(9458329-9458384)
chr2 (42-108)||(19444161-19444228)
chr2 (30-121)||(27866494-27866585)
chr2 (30-124)||(34451354-34451449)
chr2 (28-126)||(45235578-45235677)
chr2 (17-108)||(19426470-19426563)
chr2 (28-124)||(36354460-36354557)
chr2 (32-124)||(39329685-39329777)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (15-128)||(19271746-19271860)
chr7 (16-120)||(5524390-5524495)
chr7 (17-124)||(26974032-26974143)
chr7 (16-128)||(34100561-34100674)
chr7 (17-124)||(22738707-22738815)
chr7 (16-124)||(24516303-24516412)
chr7 (28-128)||(32346078-32346179)
chr7 (56-128)||(6494989-6495061)
chr7 (17-124)||(7463219-7463327)
chr7 (17-124)||(13961965-13962073)
chr7 (17-128)||(34947502-34947614)
chr7 (57-125)||(46478349-46478417)
chr7 (17-127)||(32018727-32018838)
chr7 (57-128)||(37245692-37245763)
chr7 (17-125)||(83390-83499)
chr7 (28-128)||(3178230-3178331)
chr7 (28-128)||(21350651-21350752)
chr7 (17-125)||(41506080-41506189)
chr7 (17-128)||(759106-759218)
chr7 (17-124)||(30865973-30866081)
chr7 (28-114)||(35333059-35333146)
chr7 (28-125)||(11373454-11373552)
chr7 (16-125)||(28103738-28103848)
chr7 (57-127)||(32018972-32019042)
chr7 (17-125)||(8592455-8592564)
chr7 (17-128)||(2459473-2459583)
chr7 (16-114)||(21759998-21760097)
chr7 (56-114)||(17610918-17610976)
chr7 (28-125)||(23670491-23670589)
chr7 (45-128)||(40076320-40076401)
chr7 (16-124)||(38391754-38391863)
chr7 (57-125)||(28202365-28202433)
chr7 (17-128)||(33819216-33819328)
chr7 (17-124)||(43873929-43874037)
chr7 (16-67)||(44180268-44180320)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (15-124)||(4441020-4441130)
chr5 (16-128)||(40530229-40530342)
chr5 (28-126)||(7827943-7828042)
chr5 (35-128)||(6753682-6753776)
chr5 (28-125)||(11796184-11796282)
chr5 (17-124)||(27580599-27580707)
chr5 (15-124)||(37184083-37184193)
chr5 (28-125)||(42803637-42803735)
chr5 (28-128)||(6315794-6315895)
chr5 (28-124)||(15818497-15818596)
chr5 (17-128)||(8698304-8698416)
chr5 (28-125)||(27542793-27542891)
chr5 (17-125)||(29570390-29570499)
chr5 (45-124)||(21060629-21060709)
chr5 (17-128)||(31655048-31655160)
chr5 (57-128)||(6754024-6754095)
chr5 (28-128)||(4818546-4818647)
chr5 (28-128)||(6615897-6615997)
chr5 (16-128)||(29374337-29374450)
chr5 (17-124)||(8725015-8725123)
chr5 (17-84)||(15439325-15439393)
chr5 (17-128)||(40899913-40900025)
chr5 (31-116)||(29856054-29856140)
chr5 (28-128)||(22848401-22848502)
chr5 (16-56)||(3076658-3076698)
chr5 (56-84)||(14339342-14339370)
chr5 (17-84)||(32440180-32440248)
chr5 (57-113)||(38161459-38161515)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (16-128)||(54726480-54726593)
chr3 (17-128)||(30190668-30190780)
chr3 (30-125)||(44301560-44301656)
chr3 (28-113)||(54477478-54477564)
chr3 (17-128)||(43253871-43253983)
chr3 (16-122)||(24569107-24569214)
chr3 (15-128)||(5322943-5323057)
chr3 (28-128)||(36460435-36460536)
chr3 (30-128)||(12904859-12904959)
chr3 (17-128)||(37695674-37695786)
chr3 (17-128)||(51837967-51838079)
chr3 (44-114)||(48541035-48541106)
chr3 (15-124)||(11632080-11632190)
chr3 (28-128)||(39043773-39043877)
chr3 (16-128)||(3901156-3901269)
chr3 (16-124)||(11905821-11905930)
chr3 (17-124)||(28690790-28690898)
chr3 (28-128)||(36476579-36476680)
chr3 (16-128)||(45710845-45710958)
chr3 (17-128)||(1778638-1778749)
chr3 (17-128)||(23004390-23004502)
chr3 (28-114)||(14194565-14194651)
chr3 (15-124)||(29023972-29024081)
chr3 (28-124)||(19611908-19612004)
chr3 (28-124)||(34750495-34750592)
chr3 (17-128)||(12736580-12736692)
chr3 (17-128)||(19823006-19823118)
chr3 (17-127)||(38795340-38795451)
chr3 (59-128)||(17652747-17652816)
chr3 (17-125)||(37311948-37312057)
chr3 (73-125)||(3313252-3313304)
chr3 (45-124)||(30682102-30682182)
chr3 (30-125)||(30711071-30711167)
chr3 (57-125)||(33459045-33459113)
chr3 (17-128)||(37772972-37773084)
chr3 (65-125)||(38705173-38705233)
[»] scaffold0330 (2 HSPs)
scaffold0330 (16-124)||(5389-5498)
scaffold0330 (185-241)||(5285-5341)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (17-128)||(50199-50311)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (28-128)||(703-804)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (17-126)||(16095-16205)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (17-81)||(6779-6844)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 156 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33510108 - 33509890
Alignment:
Q  156 gttgcattggtattttaaagtaacagttataacaattattttgatatagagaaaaaatattaaaaggattattattttgagacggatggagtaacacctt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510108 gttgcattggtattttaaagtaacagttataacaattattttgatatagagaaaaaatattaaaatgatcattattttgagacggatggagtaacacctt 33510009  T
Q  256 tggtcaaaacaattnnnnnnnntcccattgtttttatggtgacaagtgacaacataagaagagataatgctaatgatacgtgaaacacacgaaatagtta 355  Q
    ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510008 tggtcaaaacaattaaaaaaaatcccattgtttttatggtgacaagtgacaacataagaagagataatgctaatgatacgtgaaacacacgaaatagtta 33509909  T
Q  356 tgcttgaacaattgttctt 374  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33509908 tgcttgaacaattgttctt 33509890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33510247 - 33510135
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtatatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33510247 aaaaacgaataaatgtgttgattttat-gataaaattagtatatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtagttaagttggatgaaatt 33510149  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
    ||||||||||||||    
T  33510148 tattaaataagggt 33510135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 1063609 - 1063722
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||    
T  1063609 aaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactctgagtaattgtagttagtggagtagttaagttaaatgaaatt 1063708  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
    || ||| |||||||    
T  1063709 taataagtaagggt 1063722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 31894216 - 31894329
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  31894216 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacgtcattattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaatt 31894315  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
    || |||||||||||    
T  31894316 taataaataagggt 31894329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13909531 - 13909422
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagt-atatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||||  ||||||| |||||||||     
T  13909531 aaatgattaaatgtgttgatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtaattaagttagatgaaattg 13909432  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  13909431 aataaataag 13909422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 32440652 - 32440760
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |    
T  32440652 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttactaaaacacccttattaattgtaattagtagagtagttaagttggatgaaatgt 32440751  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  32440752 aataaataa 32440760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 181648 - 181551
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  181648 ttgatttcaatagtaaaattagtagtatttactaaaacatcattattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggt 181551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5302459 - 5302346
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  5302459 aaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatataatttaccaaaacatccttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaagtt 5302360  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||| ||||    
T  5302359 caataaatacgggt 5302346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Original strand, 24983470 - 24983568
Alignment:
Q  31 gttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24983470 gttgatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgggtgaaattcaataaataagggt 24983568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 3720248 - 3720357
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| | | |||||||||||| ||| | || | ||||||||| ||||||||     
T  3720248 aaatgattaattgtgttgatttcaattataaaatttgtagtatttacaaaaacactcttattaattgtagttagtggaatagttaagttgaatgaaattc 3720347  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  3720348 agtaaataag 3720357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 11655952 - 11656065
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||| | ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||    
T  11655952 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaatt 11656051  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  11656052 caataaataagggt 11656065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17829019 - 17828938
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17829019 taaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatgaaatttaattaataag 17828938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 34657608 - 34657677
Alignment:
Q  55 atatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34657608 atatttattaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 34657677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 34300087 - 34299992
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||| |  ||| |||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  34300087 ttgatttgaatgataaaattagtattatttactaaaatatccttattaattgtggttagtgaagtagttaagttggatggtattcaataaataagg 34299992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13087626 - 13087528
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||| || ||| |  |||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13087626 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattatagttagtgaagtaattaagttggatgaaattcaataaataag 13087528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29363414 - 29363304
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||   || | ||||||||||||||||||    
T  29363414 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagcggattagttaagttggatgaaatt 29363315  T
Q  115 tattaaataag 125  Q
     | ||||||||    
T  29363314 caataaataag 29363304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Original strand, 3291815 - 3291884
Alignment:
Q  56 tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  3291815 tatttactaaaatacctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggataaaattcaataaataag 3291884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 669015 - 668960
Alignment:
Q  185 taacaattattttgatatagagaaaaaatattaaaaggattattattttgagacgga 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  669015 taacaattattttgaaataga-aaaaaatgttaaaaatatgattattttgagacgga 668960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1225154 - 1225043
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||| |  ||  |||||||||||| |||||     
T  1225154 aaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattaatattatttactaaaatattcttattaattttagttagtgaagaagttaagttggat-aaattg 1225056  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  1225055 aataaataagggt 1225043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49747070 - 49746956
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  49747070 aaaaataattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaataccttcattaattatagttagttgagtagttaagttggatgaaat 49746971  T
Q  114 ttattaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||||    
T  49746970 tcaataaataagggt 49746956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2653529 - 2653419
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2653529 aaaaatgattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtatcatttattaaaatactcttattaattgtagttaaaggagtagttaaattggatgaaat 2653430  T
Q  114 ttattaaataa 124  Q
    ||| |||||||    
T  2653429 ttaataaataa 2653419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 42616917 - 42617026
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||| | ||||||||     
T  42616917 aaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagtaagtggagtagttaagtcgaatgaaattc 42617016  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  42617017 aataaataag 42617026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 6643674 - 6643786
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||||||||     
T  6643674 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatctttattaattgtagttagtggtatagttaagttggatgaaattc 6643773  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  6643774 aataaataagggt 6643786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 7061678 - 7061790
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | || |  |||||||| ||||||||     
T  7061678 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactataatatctttattaattgtagttagtggattaattaagttgaatgaaattc 7061777  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  7061778 aataaataagggt 7061790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 21240718 - 21240830
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  21240718 aaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaacacatccttattaattgtagttagttgagtagttaagttggatgaaattc 21240817  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  21240818 aataaataagggt 21240830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 47464379 - 47464491
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||     
T  47464379 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaactcttattaattgtagttggtggagtagttaagttggatgaaattc 47464478  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  47464479 aataaataagggt 47464491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 16821346 - 16821457
Alignment:
Q  18 aatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattta 116  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| || ||| | ||||  |||||||| |||||||| |    
T  16821346 aatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatccttattaattatagttagtggagtatttaagttgaatgaaattca 16821445  T
Q  117 ttaaataagggt 128  Q
     |||||||||||    
T  16821446 ataaataagggt 16821457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 125
Target Start/End: Original strand, 18741503 - 18741597
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    |||||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18741503 ttgatttcaacggtaaaattagtgtcatttattaaaatatctttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaaattcaataaataag 18741597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 35380346 - 35380456
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35380346 aaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcattattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaatt 35380445  T
Q  115 tattaaataag 125  Q
     | ||||||||    
T  35380446 caataaataag 35380456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 52247441 - 52247551
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| || |||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  52247441 aaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattaatacaatttactaaaatatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 52247540  T
Q  115 tattaaataag 125  Q
     ||||||||||    
T  52247541 cattaaataag 52247551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6609868 - 6609759
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |     
T  6609868 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacaaaaacatctttattaattgtaattattggagtagttaagttggatgaaactc 6609769  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  6609768 aataaataag 6609759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 47358974 - 47359075
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||  |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  47358974 tgtgttgatttcaatgataaaattagaataattttctaaaatacttttattaattgtagtcagtggagtaattaagttgaatgaaattcaataaataagg 47359073  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  47359074 gt 47359075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 49175947 - 49176060
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||   |||| |||||||||||| |||||    
T  49175947 aaaatgattaattgtggagatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaataaccttattaattgtagttagcggagtagttaagttggataaaatt 49176046  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  49176047 caataaataagggt 49176060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 49428367 - 49428468
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49428367 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatataatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataagg 49428466  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  49428467 gt 49428468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 53412200 - 53412107
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | || | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  53412200 ttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatttttattaattatagtttgtggaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 53412107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 36985893 - 36985781
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||| | || |  |||||||||||||||||     
T  36985893 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccgtattaattgtagttagtagaataattaagttggatgaaattc 36985794  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  36985793 aataaataagggt 36985781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 17237321 - 17237422
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17237321 tgtgttgattgcaatggtaaaattagtaacatttactaaaacaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagg 17237420  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  17237421 gt 17237422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 43237350 - 43237241
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| || ||| |  ||| ||||||||||||||||||     
T  43237350 aaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtaatatttactaaaaaatcattattaattatagttagtgaagtagttaagttggatgaaattc 43237251  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  43237250 aataaataag 43237241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34360762 - 34360650
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| || |||||     
T  34360762 aaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaataaaattc 34360663  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  34360662 aataaataagggt 34360650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32884909 - 32884798
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||| | | |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  32884909 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtagaattagtagcatttagtaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatggaatt 32884810  T
Q  115 tattaaataagg 126  Q
     | |||||||||    
T  32884809 caataaataagg 32884798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 54506896 - 54506797
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  54506896 aaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatcattatcaattgtagttagtggagtagttaagtttgatgaaatt 54506797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22130140 - 22130042
Alignment:
Q  27 atgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22130140 atgtgttgatttcaatggtataattagtatcatttacaaaaacatccttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataa 22130042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 26147640 - 26147742
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt-attaaataag 125  Q
    |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26147640 tgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaattttcaataaataag 26147739  T
Q  126 ggt 128  Q
    |||    
T  26147740 ggt 26147742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 37868638 - 37868684
Alignment:
Q  43 gataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaatta 88  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37868638 gataaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtaatta 37868684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 38502507 - 38502605
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    |||||||||||   || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  38502507 tgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaatacttttattaattatagttaatgtagtagttaagttggataaaattcaataaataag 38502605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Original strand, 38663475 - 38663573
Alignment:
Q  31 gttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38663475 gttgttttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacttttattaatcgtagttagtaaagtagttaagttggatgaaatttaataaatatgggt 38663573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 52859813 - 52859911
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  52859813 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 52859911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 462066 - 461953
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||| || |||||    
T  462066 aaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaagtaatattatttactaaaatatccttattaattgtaattagcggagtagttaagttgaataaaatt 461967  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     |  ||||||||||    
T  461966 caacaaataagggt 461953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3098827 - 3098754
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaatt 87  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3098827 aaaaatgattaattatattgatttcaatgataaaattgatatcatttactaaaatatctttattaattgtaatt 3098754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 33790744 - 33790857
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||| | |||| |||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  33790744 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtttcatttgctaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatt 33790843  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  33790844 caataaataagggt 33790857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 47773044 - 47773145
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  47773044 tgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaataaataagg 47773143  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  47773144 gt 47773145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 49579192 - 49579301
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttc-attgataaaattagtatatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||     
T  49579192 aaatgattaattgtgttgatttttaatgataaaattattattattactaaaacacttttattaattgtagttattgaaattgttaagttggatgaaattc 49579291  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  49579292 aataaataag 49579301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3689641 - 3689557
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  3689641 taaaattagtatcatttactaaaacactcttattaattatagttagttgagttgttaagttagatgaaattaaattaataagggt 3689557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7987069 - 7986973
Alignment:
Q  29 gtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |  ||| | |||| ||||||||  |||||||| | |||||||    
T  7987069 gtgttgattttaatgataaaattagtatcatctactaaaatattattattaattattgttagtagagtagttaagtttaatgaaattaaataaataa 7986973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 11907613 - 11907721
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||     
T  11907613 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttattggagtagttaagttggatgaagttc 11907712  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  11907713 aataaataa 11907721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 38405116 - 38405224
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| | ||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||     
T  38405116 aaatgattaattctgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggtgtagttaagttggatgaaattc 38405215  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  38405216 aataaataa 38405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 2942659 - 2942753
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaa 111  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  2942659 aaatgattaattgtgttgatttcgatgataaaattagtagcatttactaaaaca-ccttattaattgtagttagtggagtggttaagttgaatgaa 2942753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Original strand, 11288643 - 11288751
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||  | |||| |||||||||||| |||||    
T  11288643 aaaatgattaattgtattgatttcaatggcaaaattaatatcatttactaaaatatctt-attaattgtagttggtggagtagttaagttggataaaatt 11288741  T
Q  115 tattaaataa 124  Q
     | |||||||    
T  11288742 caataaataa 11288751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 30192313 - 30192244
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgta 84  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30192313 aaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaattaatgtcatttgctaaaatattcttattaattgta 30192244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 50264105 - 50264206
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||| ||| |  | |  |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  50264105 tgtgttgatttcaatgttaaaattaacatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtgaaatatttaagttgaatgaaattcaataaataagg 50264204  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  50264205 gt 50264206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51624838 - 51624781
Alignment:
Q  71 ttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51624838 ttttattatttgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggt 51624781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 8896354 - 8896451
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8896354 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatatttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattcaataaataa 8896451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39864218 - 39864106
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  39864218 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 39864119  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  39864118 aataaataagggt 39864106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 6160469 - 6160582
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||| ||||    
T  6160469 aaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgtagttaatggaatagttaagttgaatgtaatt 6160568  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||| ||||||    
T  6160569 caataaacaagggt 6160582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28749098 - 28748986
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||    
T  28749098 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtaattagtagaattgttaagttggatgaaattt 28748999  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
      |||||||||||    
T  28748998 tataaataagggt 28748986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Original strand, 44761540 - 44761654
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||| | || ||||||||||| |||||||    
T  44761540 aaaaatgattaattatgttaattttaatgataaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattatagttagtggaatggttaagttgaatgaaat 44761639  T
Q  114 ttattaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||||    
T  44761640 tcaataaataagggt 44761654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 14757616 - 14757717
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||| ||| |  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14757616 tgtgttgatttcaacgataaaattagtaacatttactaaaacactcttattaattgtagttagtgaagtagttaagttcgatgaaatttaataaataagg 14757715  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  14757716 gt 14757717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 31978674 - 31978775
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  31978674 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcacttactaaactattcttattaattatagttaatggagtagttaagttgaattaaattcattaaataagg 31978773  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  31978774 gt 31978775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 33733284 - 33733385
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| || | |||||||| | |||||||||    
T  33733284 tgtgttgatttcaatggtaaaattattaacatttactaaaatacttttattaattgtagttagtagagtggttaggtagaatgaaattcaataaataagg 33733383  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  33733384 gt 33733385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12039189 - 12039077
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| | | | |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||     
T  12039189 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaatacactcttattaattgtagttaatggagtatttaagttggatgtaattc 12039090  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  12039089 aataaataagggt 12039077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7759324 - 7759210
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| | || | ||||||||| |||||||    
T  7759324 aaaaataattaattgtgttgatttcaatggtgaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggaatagttaagttgaatgaaat 7759225  T
Q  114 ttattaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||||    
T  7759224 tcaataaataagggt 7759210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37506234 - 37506119
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat----atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaa 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||     ||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  37506234 aaatgattaattgtgttgattttgatgataaaattagtactatcatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaa 37506135  T
Q  113 tttattaaataagggt 128  Q
    || | |||||||||||    
T  37506134 ttcaataaataagggt 37506119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12151270 - 12151193
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttgg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  12151270 tgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatattgtaattaattgtagttagtggagcagttaagttgg 12151193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27897055 - 27896954
Alignment:
Q  24 taaatgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaat 122  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| || ||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  27897055 taaacgtgttgattttaatgataaaattagtataatttatcaaaatattcttattaattatagttagtggagtaatttagttggatgaaatttaataaat 27896956  T
Q  123 aa 124  Q
    ||    
T  27896955 aa 27896954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 40144857 - 40144970
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  40144857 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaagtt 40144956  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  40144957 caataaataagggt 40144970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 44707786 - 44707879
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  44707786 ttgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaacacatttattaattgtagttagtgaagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 44707879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 49223996 - 49224109
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  49223996 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagtt 49224095  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  49224096 caataaataagggt 49224109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 917131 - 917019
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| | ||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | || | ||||||||| |||||||||    
T  917131 aaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtagattagttaagttgcatgaaattt 917032  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  917031 aataaataagggt 917019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9307734 - 9307626
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |   || ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  9307734 aaatgattaactgtgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacacccttgttaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 9307635  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  9307634 aataaataa 9307626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10495917 - 10495838
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  10495917 taaaattagtatcatttactaaaacacttt-attaattgtaattagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 10495838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Original strand, 20209879 - 20209963
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  20209879 taaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaataaataagggt 20209963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24904060 - 24903980
Alignment:
Q  35 atttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24904060 atttcaatgagaaaatttgtatcatttactaaaatatttttattaattataattagttaggtagttaagttgaatgaaatt 24903980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Original strand, 6023671 - 6023758
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtatattt-actaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  6023671 tgtgttgatttcaatggtaaatttagtagcttttactaaaatacctttattaattgtagttattggagtagttaagttggatgaaatt 6023758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15699231 - 15699117
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| |||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |    
T  15699231 aaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagt 15699132  T
Q  114 ttattaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||||    
T  15699131 tcaataaataagggt 15699117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24880970 - 24880882
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggt---taagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||   ||||||||||||||||    
T  24880970 tgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacttttattaattgtagttagtggagtagttagtaagttggatgaaatt 24880882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31154236 - 31154126
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |   ||||||||||||| ||  | ||||| ||||||| |||||||||    
T  31154236 aaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattagtattatctactaaattgcatttattaattgtagttggtagagtgcttaagtttgatgaaatt 31154137  T
Q  115 tattaaataag 125  Q
     | ||||||||    
T  31154136 cagtaaataag 31154126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26093502 - 26093389
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |  |||  ||||||| |||||| ||    
T  26093502 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatccttattaattgtagttagtgaagtaattaagttagatgaagtt 26093403  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  26093402 caataaataagggt 26093389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36702028 - 36701919
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||| | || | |||||||| |||||||||     
T  36702028 aaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatgaaattc 36701929  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  36701928 aataaataag 36701919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36718132 - 36718023
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||| | || | |||||||| |||||||||     
T  36718132 aaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatgaaattc 36718033  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  36718032 aataaataag 36718023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9379323 - 9379231
Alignment:
Q  33 tgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattg-agtggttaagttggatgaaatttattaaata 123  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9379323 tgattttaatgataaaattaatatcatttattaaaatatatttattaattgtagttagtgggagtagttaagtttgatgaaatttaataaata 9379231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 24991664 - 24991772
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| || |  ||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||     
T  24991664 aaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatagtatttactacaacacctttattaattgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattc 24991763  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  24991764 aataaataa 24991772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 32826011 - 32826117
Alignment:
Q  26 aatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaat---tgagtggttaagttggatgaaatttattaaa 121  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||| || | ||||    
T  32826011 aatgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacctttattaattgtaattagtggaggagtagttaagttggatgaagttcaataaa 32826110  T
Q  122 taagggt 128  Q
    |||||||    
T  32826111 taagggt 32826117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 32970577 - 32970645
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgt 83  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  32970577 aaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaatactcgtattaattgt 32970645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 17988580 - 17988645
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagta---tatttactaaaatatttttattaattgtaattaat 90  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  17988580 tgtgttgatttcaatgttaaaattagtatattatttactaaaatactcttattaattgtagttaat 17988645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52429394 - 52429339
Alignment:
Q  73 ttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52429394 ttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcattaaataagggt 52429339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 25089136 - 25089209
Alignment:
Q  56 tatttactaaaatatt-tttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25089136 tatttactaaaacatcctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggt 25089209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3312218 - 3312150
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgta 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  3312218 aaatgattaattgtgttgattttaatgattaaattagtatcatttactataatattgatattaattgta 3312150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6785315 - 6785251
Alignment:
Q  64 aaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6785315 aaaatatcttcattaattgtagttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaataaataagggt 6785251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11449977 - 11449882
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtatatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||| ||| || |  ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||| | |||||||||    
T  11449977 tgttgatttcaatggtaaaattaata-attttctataacacatttattaattgtagttaatagagtagtaaaattggatgaaattcaataaataagg 11449882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37276568 - 37276456
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || ||||||||||||  |||||||||| |   |||||||||||| ||| | || | ||||| ||||||||||||     
T  37276568 aaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtggaatagttaaattggatgaaattc 37276469  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  37276468 aataaataagggt 37276456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7173021 - 7172909
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||     
T  7173021 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttactaaaacatatttattaattgtagttaatgaagtagttaagttgaatgaaattc 7172922  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  7172921 aataaataagggt 7172909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Original strand, 4924104 - 4924188
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  4924104 taaaattagtattatttactaaaatatctttattaattgtagttaatagagtagttaagttgaatgaaacttaataaataagggt 4924188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17824016 - 17823920
Alignment:
Q  29 gtgttgatttcattgataaaattagtatattt-actaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  17824016 gtgttgatttcaatgataaaattagtatcttttactagaatacctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattaaataaataa 17823920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39405869 - 39405757
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  | ||| | ||||  |||||||| ||||||||     
T  39405869 aaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatctttattaattacagttagtggagtaattaagttgaatgaaatta 39405770  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  39405769 aataaataagggt 39405757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 44761503 - 44761615
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  44761503 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 44761602  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | ||||| |||||    
T  44761603 aataaatgagggt 44761615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32476381 - 32476282
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  32476381 tgttgatttcaatgataaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgtagttaatgaagtagttaagtttgatgaaattcaataaataagggt 32476282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 17719265 - 17719375
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| |||  |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  17719265 aaaaatgattaattgtaatgattttaatggtaaagttagtattatttactaaaatatccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaat 17719364  T
Q  114 ttattaaataa 124  Q
    ||| |||||||    
T  17719365 ttaataaataa 17719375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 21216110 - 21216208
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21216110 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatt 21216208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 27294079 - 27294176
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtatattt-actaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  27294079 tgtgttcatttgaatgataaaattagtatcttttactaaaatatatttattaattgcagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataa 27294176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31082726 - 31082618
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |   ||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  31082726 aaatgattaattgtcttgattttaatgataaaattagtggtatttactaaaacacccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattt 31082627  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  31082626 aataaataa 31082618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1739609 - 1739538
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  1739609 atttaccaaaatattcttattaattgtagttagttaagtagttaattttgatgaaatttaataaataagggt 1739538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Original strand, 10179971 - 10180054
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  10179971 ttgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaatacacttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 10180054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 34948696 - 34948806
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  34948696 aaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattagtatcatttacagaaacacatttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 34948795  T
Q  116 attaaataagg 126  Q
    | |||||||||    
T  34948796 aataaataagg 34948806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 42887096 - 42886998
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | || |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  42887096 tgtgttgatttcaatagcaaaattagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggcgtagttaagttggataaaattcaataaataag 42886998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31271117 - 31271016
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| || ||| | |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  31271117 tgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatatactaaaatactcttattaattatagttagtggagtagttaagttggataaaattcaataaataagg 31271018  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  31271017 gt 31271016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 45425674 - 45425787
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||| ||  ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||||||    
T  45425674 aaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattaataacatttattaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttgtatgaaatt 45425773  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  45425774 caataaataagggt 45425787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31331515 - 31331419
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaa 112  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||    
T  31331515 aaatgattaattgtattgatttcaattataaaattattattatttactaaaatatcattattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatgaaa 31331419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32678469 - 32678401
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32678469 atttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattaaataaataag 32678401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 4428371 - 4428468
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |  | | |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  4428371 tgtgttgattttaatgataaaattattatcatttactaaaatacaattattaattgtagttagtgaattagttaagttagatgaaattcaataaataa 4428468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 11976956 - 11977053
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11976956 tgtgttgatttcaatggtataatcagtagcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtagagtagttaagttagatgaaattcaataaataa 11977053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12559700 - 12559635
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaatt 81  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12559700 aaatgattaattgtgttgattttaataataaaattaataccatttactaaaatatttttattaatt 12559635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 396620 - 396732
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||  ||| ||||  |||||| |||||     
T  396620 aaatgattaattatgttgatttcaacggtaaaattagtatcatttactacaatatccttattaattgtagttaatgaagtagttatattggataaaattc 396719  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||    
T  396720 aattaataagggt 396732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 29226577 - 29226649
Alignment:
Q  56 tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||| ||||| | | |||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  29226577 tatttattaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataaataagggt 29226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 8947058 - 8947170
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  8947058 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaatatttactaaaacatccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 8947157  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  8947158 aataaataagggt 8947170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 35242314 - 35242411
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35242314 tgtgttgattttaatgttaaaattagaatcatttactagaatatatttattaattgtagttagttgagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 35242411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39691598 - 39691485
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| | |||| || |||||| ||||||||    
T  39691598 aaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgcagttagtggagtagtaaagttgaatgaaatt 39691499  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  39691498 caataaataagggt 39691485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16805988 - 16805877
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  16805988 aaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagttagtggagttgttaagttggattaaattt 16805889  T
Q  116 attaaataaggg 127  Q
    | || |||||||    
T  16805888 aatagataaggg 16805877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16845269 - 16845158
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  16845269 aaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagttagtggagttgttaagttggattaaattt 16845170  T
Q  116 attaaataaggg 127  Q
    | || |||||||    
T  16845169 aatagataaggg 16845158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43410522 - 43410435
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  43410522 tgtgttgatatcaatgataaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgtagttaatggagtagttaagttgaatgaaatt 43410435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 41220954 - 41221039
Alignment:
Q  19 atgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagt 103  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  41220954 atgattaattgtgttgatttcaattataaaattagtatcatttattaaaatatttttattaattgtagttaatgaagtagttaagt 41221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17695437 - 17695325
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  17695437 aaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattgatatcatttacaaaaatattcttattaattatagttagtagagtagttaagttggatgaaattc 17695338  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  17695337 aataaataagggt 17695325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25637588 - 25637476
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||    
T  25637588 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacctttattaattgtagttataggagtagttaagttggatgaaattt 25637489  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  25637488 aataaataagggt 25637476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Original strand, 14523389 - 14523476
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  14523389 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaatt 14523476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 43115808 - 43115906
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  43115808 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaagttagtagcatttactaaaatactcttatttattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 43115906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37322524 - 37322423
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  37322524 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataaataagg 37322425  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  37322424 gt 37322423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 17346396 - 17346476
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  17346396 taaaattaatatcatttattaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggaagaaattcaataaataa 17346476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34225697 - 34225585
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||||||| | | ||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  34225697 aaatgaataattatattgattttaatggtaaacttagtattatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggagtatttaagttgaatgaaattt 34225598  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  34225597 aataaataagggt 34225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39785651 - 39785580
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  39785651 atttactaaaacactcttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaagttcaataaataagggt 39785580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 15359095 - 15359205
Alignment:
Q  19 atgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttat 117  Q
    |||| ||| |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || |     
T  15359095 atgattaattgtgttgattttgatgataaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaa 15359194  T
Q  118 taaataagggt 128  Q
    |||||||||||    
T  15359195 taaataagggt 15359205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 26863403 - 26863472
Alignment:
Q  55 atatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26863403 atatttattaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagtcggatgaaattcattaaataa 26863472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35313994 - 35313885
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||  |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||     
T  35313994 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagtatttattaaagcaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagtttgatgaaattc 35313895  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  35313894 aataaataag 35313885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Original strand, 10005141 - 10005197
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgt 83  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10005141 tgtgttgatttcagcaataaaattagtatcatttactaaaatatctttattaattgt 10005197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16463796 - 16463688
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||    
T  16463796 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagtttgatgaaattt 16463697  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  16463696 aataaataa 16463688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 34120444 - 34120541
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||    
T  34120444 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtattatttactaaaatattt--attaattgtagttagtggaatagttaagttggatgaaatt 34120541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 1206707 - 1206782
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagt-atatttactaaaatatttttattaattgtaattaa 89  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1206707 aaaaatgattaattatgttgatttcagtggtaaaattagtaacatttactaaaatatccttattaattgtagttaa 1206782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 128
Target Start/End: Original strand, 9458329 - 9458384
Alignment:
Q  73 ttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9458329 ttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaatttaataaataagggt 9458384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19444228 - 19444161
Alignment:
Q  42 tgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggat 108  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  19444228 tgataaaattaatattatttactaaaatgttattattaattgtaattagtcgagtagttaagatggat 19444161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27866585 - 27866494
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtatatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaa 121  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||  | || || || ||||| |||||||||||||    
T  27866585 tgttgattttaatgataaaattaatatctttagtaaaatatccttattaattgtagttaacggtgtagtaaaattggaggaaatttattaaa 27866494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 34451354 - 34451449
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  | | ||| |||||||||||||| | |||||||    
T  34451354 tgttgatttcgatgagaaaattagtattatttactaaaatattttcattaattctagttattgaaatagtttagttggatgaaattcaataaataa 34451449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45235677 - 45235578
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| |||||  | | |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  45235677 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatgaaatagttaagtttgatgaaattcaataaataagg 45235578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19426563 - 19426470
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgattt-cattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggat 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||| | | | |||| ||||||||||||    
T  19426563 aaatgattaattgtgttgattttcaatgataaaattagcaacatttactaaaatatcattattaattgtagtaagtcgagtagttaagttggat 19426470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 36354460 - 36354557
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||||||   || |||||||||||| ||||| | ||| | | |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  36354460 tgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttattgaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 36354557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 39329685 - 39329777
Alignment:
Q  32 ttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| | | |||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  39329685 ttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacactcttattaattgtagtt-atggagtagttaaattggatgaaattcaataaataa 39329777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Original strand, 19271746 - 19271860
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||     
T  19271746 aaaaatgattaattgtgttgatttcaatgatcaaattagtggcattgactaaaatacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaaa 19271845  T
Q  114 ttattaaataagggt 128  Q
    ||| |||||||||||    
T  19271846 ttaataaataagggt 19271860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5524495 - 5524390
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5524495 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttaataaaacacttttattaattatagttagttgagtagttaagttggatgaaatt 5524396  T
Q  115 tattaa 120  Q
    ||||||    
T  5524395 tattaa 5524390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26974143 - 26974032
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat----atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaa 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  26974143 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaa 26974044  T
Q  113 tttattaaataa 124  Q
    ||||||||||||    
T  26974043 tttattaaataa 26974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 34100561 - 34100674
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||| |||    
T  34100561 aaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattagtagcatttactaaaatatctttattaattgtagttactgaagtagttaagttggatgacatt 34100660  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  34100661 caataaataagggt 34100674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22738815 - 22738707
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||    
T  22738815 aaatgattaattgtgtagatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatcctcattaattgtagttagtagattagttaagttggatgaaattt 22738716  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  22738715 aataaataa 22738707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Original strand, 24516303 - 24516412
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  24516303 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaaaaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatt 24516402  T
Q  115 tattaaataa 124  Q
     | |||||||    
T  24516403 caataaataa 24516412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 32346078 - 32346179
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  32346078 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatctactaaaatactcttattaattataattagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataagg 32346177  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  32346178 gt 32346179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 6494989 - 6495061
Alignment:
Q  56 tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6494989 tatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaatttaataaataagggt 6495061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7463327 - 7463219
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||   | |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  7463327 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttacttaaataccctcattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 7463228  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  7463227 aataaataa 7463219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13962073 - 13961965
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||| ||||||||  ||||||| |||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13962073 aaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatatcacttaataaaatatccttattaagtgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattt 13961974  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  13961973 aataaataa 13961965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34947614 - 34947502
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  34947614 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattattatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 34947515  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | ||||| |||||    
T  34947514 aataaatgagggt 34947502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 46478349 - 46478417
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  46478349 atttactaaaatacccttattaattgtagttaattgagtagttaagttggatgaaattcaataaataag 46478417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 32018727 - 32018838
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||||    
T  32018727 aaatgaataattgtgttgatttcaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgtcgttagtagagtaattaagttggattaaattt 32018826  T
Q  116 attaaataaggg 127  Q
    | ||||||||||    
T  32018827 aataaataaggg 32018838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37245763 - 37245692
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37245763 atttactaaaacactcttattaattgtaataagtggagtggttaagttggatgaaattcaataaataagggt 37245692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 83499 - 83390
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||   |||| |||||||| |||||||||     
T  83499 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagcggagtagttaagtttgatgaaattc 83400  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  83399 aataaataag 83390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 3178230 - 3178331
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3178230 tgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagg 3178329  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  3178330 gt 3178331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 21350651 - 21350752
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21350651 tgtgttgatttcaatggtaaaaatagttgtatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagg 21350750  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  21350751 gt 21350752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 41506080 - 41506189
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||| |||| | || |||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  41506080 aaatgattaattgtgttaattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 41506179  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  41506180 aataaataag 41506189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 759106 - 759218
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||     
T  759106 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagcggagtagttaagttggatgaaattc 759205  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  759206 aataaataagggt 759218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30866081 - 30865973
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||     
T  30866081 aaatgattaattgtgttaatttcaatggtataattaatatcatttactaaaatactcttattaattataattagtggagtagttaagttagatgaaattc 30865982  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  30865981 aataaataa 30865973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35333146 - 35333059
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  35333146 tgtgttgatttcaattatataattaatattatttattaaaatattattattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaatt 35333059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 11373454 - 11373552
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11373454 tgtgttgatttcgatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataag 11373552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28103848 - 28103738
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||| |   |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28103848 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagcagcatttaccaaaacacccttattaattgtagttagtgaagtggttaagttggatgaaatt 28103749  T
Q  115 tattaaataag 125  Q
     | ||||||||    
T  28103748 caataaataag 28103738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Original strand, 32018972 - 32019042
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataaggg 127  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32018972 atttactaaaatactcttattaattgttgttagtggagtaattaagttggatgaaatttaataaataaggg 32019042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 8592455 - 8592564
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||| |   |||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||    
T  8592455 aaatgattaattgtgttgatttcaatggttaaattagtagtatttaataaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttagatgaaattt 8592554  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  8592555 aataaataag 8592564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2459583 - 2459473
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtatatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattta 116  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| || |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||| |    
T  2459583 aaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagtc-atttactacaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagtaggatgaaattca 2459485  T
Q  117 ttaaataagggt 128  Q
     |||||||||||    
T  2459484 ataaataagggt 2459473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 21759998 - 21760097
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||| ||||| |   ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21759998 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttaataaaacacccttactaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaaatt 21760097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17610976 - 17610918
Alignment:
Q  56 tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||    
T  17610976 tatttactaaaatatttgtattaattgtagttattgaaatagttaagttggatgaaatt 17610918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23670589 - 23670491
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||  ||||||||||| | | |||||||| ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23670589 tgtgttgatttccatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttattaatggtagttagtggagtagttaagtttgatgaaatttaataaataag 23670491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40076401 - 40076320
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| |||   || | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40076401 taaaattagtatcatttactaaaacactattattaattgtactta---gattagttaagttggatgaaattcaataaataagggt 40076320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38391863 - 38391754
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||| ||| | || |  |||||||||||||||||    
T  38391863 aaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttgttaattgtagttagtggaataattaagttggatgaaatt 38391764  T
Q  115 tattaaataa 124  Q
     | |||||||    
T  38391763 caataaataa 38391754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 28202365 - 28202433
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  28202365 atttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaattcaataaataag 28202433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33819328 - 33819216
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||  | | |||||||||||  ||  | |||| || |||||| ||||||||     
T  33819328 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttacaaaatcactcttattaattgttgtttgtggagtagtgaagttgaatgaaattc 33819229  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    |||||||||||||    
T  33819228 attaaataagggt 33819216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43874037 - 43873929
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||||| |   ||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||    
T  43874037 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaaatgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttt 43873938  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  43873937 aataaataa 43873929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 44180320 - 44180268
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaa 67  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  44180320 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaa 44180268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4441130 - 4441020
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  4441130 aaaaataattaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaaattggatgaaat 4441031  T
Q  114 ttattaaataa 124  Q
    | | |||||||    
T  4441030 tcaataaataa 4441020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 40530229 - 40530342
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40530229 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaatt 40530328  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  40530329 aaataaataagggt 40530342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 126
Target Start/End: Original strand, 7827943 - 7828042
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7827943 tgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaataaataagg 7828042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 6753682 - 6753776
Alignment:
Q  35 atttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6753682 atttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaataaataagggt 6753776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 11796184 - 11796282
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11796184 tgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatattattattaattgtagttagtgtagtagttaagttagatgaaatttaataaataag 11796282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27580707 - 27580599
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||     
T  27580707 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatta 27580608  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    |||||||||    
T  27580607 attaaataa 27580599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 37184083 - 37184193
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || || ||||||| ||||||||    
T  37184083 aaaaatgattaattgagttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattcattgtagttaatagactgattaagtttgatgaaat 37184182  T
Q  114 ttattaaataa 124  Q
    | | |||||||    
T  37184183 tcaataaataa 37184193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 42803637 - 42803735
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42803637 tgtgttcatttcaattgtaaaattagtagtatttactaaaacaccattattaattgtagttaatggagtggttaagttggatgaaattcaataaataag 42803735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 6315794 - 6315895
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6315794 tgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataaataagg 6315893  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  6315894 gt 6315895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 15818497 - 15818596
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagta---tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15818497 tgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatatttactaaaacacctttattaattgtaatcagtggagtagttaaattggatgaaatttaataaataa 15818596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8698416 - 8698304
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||   |||||| |||| |   |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||     
T  8698416 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttaccaaaacacccttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattc 8698317  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  8698316 aataaataagggt 8698304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27542891 - 27542793
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  27542891 tgtgttgatttcaatggtaaaattaataccatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggataaaattcaataaataag 27542793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29570499 - 29570390
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | || |||||||| || ||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||     
T  29570499 aaatgattaattgtgttgattttaatgttaaaattattagtatttgctaaaacacctttattaattgtagttaatggaatagttaagttggatgaaattc 29570400  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  29570399 aataaataag 29570390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21060709 - 21060629
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  21060709 taaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggataaaattcaataaataa 21060629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31655160 - 31655048
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||| | ||||  ||| |||| ||||||||     
T  31655160 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactataatatccttattaattgtagttagtggagtaattatgttgaatgaaattc 31655061  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  31655060 aataaataagggt 31655048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6754095 - 6754024
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6754095 atttactaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggt 6754024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4818647 - 4818546
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  4818647 tgtgttgatttcaattgtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtgattaagttagatgaaattcaataaataagg 4818548  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  4818547 gt 4818546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 6615897 - 6615997
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||| ||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6615897 tgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttaccaaaacatccttattaattttagttagtggagtggttaagttggatg-aattcaataaataagg 6615995  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  6615996 gt 6615997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29374450 - 29374337
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||| || |||||    
T  29374450 aaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaagacctttattaattgtagttagtggagtagttaaattgaataaaatt 29374351  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  29374350 caataaataagggt 29374337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 8725015 - 8725123
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||| ||| ||||||||     
T  8725015 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacacttattaattgtagttagtggagtagttaacttgaatgaaattc 8725114  T
Q  116 attaaataa 124  Q
    | |||||||    
T  8725115 aataaataa 8725123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 15439325 - 15439393
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgta 84  Q
    |||||| ||| ||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15439325 aaatgattaattgtattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacttttattaattgta 15439393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40900025 - 40899913
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||     
T  40900025 aaatgattaattgtgttgattttgatggcaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattc 40899926  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  40899925 aataaataagggt 40899913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29856140 - 29856054
Alignment:
Q  31 gttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattta 116  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| | |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  29856140 gttgatttcaatgataaaattaatatcacttgctaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgcaattta 29856054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 22848401 - 22848502
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||||| |   |||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  22848401 tgtgttgatttcaatagtaaaattaatagtatttattaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttagattggatgaaattcaataaataagg 22848500  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  22848501 gt 22848502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3076698 - 3076658
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat 56  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3076698 aaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtat 3076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14339370 - 14339342
Alignment:
Q  56 tatttactaaaatatttttattaattgta 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14339370 tatttactaaaatatttttattaattgta 14339342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32440248 - 32440180
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgta 84  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  32440248 aaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 32440180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Original strand, 38161459 - 38161515
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  38161459 atttactaaaatatccttattaatcgtagttagtggagtagttaagttggatgaaat 38161515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 54726593 - 54726480
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||    
T  54726593 aaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttaatggagtagttaagttagatgaagtt 54726494  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
    || |||||||||||    
T  54726493 taataaataagggt 54726480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 30190668 - 30190780
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  30190668 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 30190767  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||    
T  30190768 aattaataagggt 30190780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44301656 - 44301560
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44301656 tgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatacccttatcaattgtaattagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataag 44301560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 54477478 - 54477564
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  54477478 tgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagttaatggagtagttaagttgaatgaaat 54477564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 43253871 - 43253983
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||     
T  43253871 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagtgggatgaaattc 43253970  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    |||||||||||||    
T  43253971 attaaataagggt 43253983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 24569107 - 24569214
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  24569107 aaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatattatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 24569206  T
Q  115 tattaaat 122  Q
     |||||||    
T  24569207 cattaaat 24569214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Original strand, 5322943 - 5323057
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||    
T  5322943 aaaaatgattaattatgttgatttcagtgataaaattaatatcatttactaaaatacacttattaattataattagtaaagtagttaagtttgatgaaat 5323042  T
Q  114 ttattaaataagggt 128  Q
    | | |||||||||||    
T  5323043 tcaataaataagggt 5323057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 36460435 - 36460536
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||| |||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36460435 tgtgttaatttcaatagtaaaattagtaacatttattaaaatattcttattaattgtagttaatggagtaattaagttggatgaaattcaataaataagg 36460534  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  36460535 gt 36460536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12904959 - 12904859
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatat-ttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataaggg 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12904959 tgttgatttcaattataaaattagtatgatttatcaaaatatcttttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataaggg 12904860  T
Q  128 t 128  Q
    |    
T  12904859 t 12904859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 37695674 - 37695786
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||     
T  37695674 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattc 37695773  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  37695774 aataaataagggt 37695786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 51837967 - 51838079
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||| |||||  || | |||| |||| |||| ||||||||     
T  51837967 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattagttgtagctagtggagtagttacgttgaatgaaattc 51838066  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    |||||||||||||    
T  51838067 attaaataagggt 51838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 48541035 - 48541106
Alignment:
Q  44 ataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  48541035 ataaaattaatatcatttattaaaatattcttattaattgtaattagttgagtagttaagttgaatgaaatt 48541106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11632190 - 11632080
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | ||   |||||||||||||||||    
T  11632190 aaaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagtagtatttactaaaacacctttattaattgtagttagtggaaaagttaagttggatgaaat 11632091  T
Q  114 ttattaaataa 124  Q
    | | |||||||    
T  11632090 tcaataaataa 11632080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 39043773 - 39043877
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaatta---gtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaata 123  Q
    ||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  39043773 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaata 39043872  T
Q  124 agggt 128  Q
    |||||    
T  39043873 agggt 39043877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 3901156 - 3901269
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||    
T  3901156 aaaatgattaattgtattaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacattcttattagttgtagttagtggggtacttaagttggatgaaatt 3901255  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  3901256 caataaataagggt 3901269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11905930 - 11905821
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |   |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11905930 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttggatgaaatt 11905831  T
Q  115 tattaaataa 124  Q
     | |||||||    
T  11905830 caataaataa 11905821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 28690790 - 28690898
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgag-tggttaagttggatgaaatt 114  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||    
T  28690790 aaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagtt-agtgagatagttaagttggatgaaatt 28690888  T
Q  115 tattaaataa 124  Q
     | |||||||    
T  28690889 caataaataa 28690898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 36476680 - 36476579
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  36476680 tgtgttgattgcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataaataagg 36476581  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  36476580 gt 36476579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45710958 - 45710845
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| | |||||||||   || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  45710958 aaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagtt 45710859  T
Q  115 tattaaataagggt 128  Q
     | |||||||||||    
T  45710858 caataaataagggt 45710845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1778749 - 1778638
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagt-atatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||     
T  1778749 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatgacatttactaaaacatccttatt-attgtagttagtggagtagataagttggatgaaattc 1778651  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  1778650 aataaataagggt 1778638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 23004390 - 23004502
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||     
T  23004390 aaatgattaattgtgtcgatttcaatggtaaaattagtagtatatactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgtatgaaattc 23004489  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  23004490 aataaataagggt 23004502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14194651 - 14194565
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  14194651 tgtgttgatttcaatgataaaattagtaccatttactaaaatacttttatgaattgt-gttagtggagtaattaagttggatgaaatt 14194565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 29023972 - 29024081
Alignment:
Q  15 aaaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaat 113  Q
    |||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  29023972 aaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacatctt-attaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaat 29024070  T
Q  114 ttattaaataa 124  Q
    | | |||||||    
T  29024071 tcaataaataa 29024081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19612004 - 19611908
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtata-tttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19612004 tgtgttgatttcaatgttaaaatta-tataatttactaaaatatccttattaattgttgttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaataaataa 19611908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34750592 - 34750495
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||  | |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  34750592 tgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttggtggagtagttaacttggatgaaaattaataaataa 34750495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 12736580 - 12736692
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||| |  ||| ||||| |||||| |||||     
T  12736580 aaatgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcatttactacaatacccttattaattgtacttagtgtagtagttaatttggataaaattc 12736679  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  12736680 aataaataagggt 12736692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19823118 - 19823006
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||   || || ||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||     
T  19823118 aaatgattaattgtgttgattttgatggtagaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattc 19823019  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  19823018 aataaataagggt 19823006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38795451 - 38795340
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||  ||||    |||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  38795451 aaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtatcatttacccaaatgcccttattaattgtagttggtggagttgttaagttggatgaaattt 38795352  T
Q  116 attaaataaggg 127  Q
    | |||| |||||    
T  38795351 aataaaaaaggg 38795340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17652816 - 17652747
Alignment:
Q  59 ttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagggt 128  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17652816 ttactaaaacatccttattaattgtagttagtgaggtagttaagttggatgaaatttaataaataagggt 17652747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37312057 - 37311948
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| | |||| ||||| ||  ||||||||     
T  37312057 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaacccttattaattgtagttagtggagtagttaaatttaatgaaattc 37311958  T
Q  116 attaaataag 125  Q
    | ||||||||    
T  37311957 aataaataag 37311948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3313304 - 3313252
Alignment:
Q  73 ttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3313304 ttattaattgtagttaatggagtatttaagttggatgaaattcaataaataag 3313252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 30682102 - 30682182
Alignment:
Q  45 taaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataa 124  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |  |||||||||| |||||| | |||||||    
T  30682102 taaaatgagtatcatttactaaaataatcttattaattgtagttaatggaataattaagttggacgaaattcaataaataa 30682182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30711167 - 30711071
Alignment:
Q  30 tgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| |||   ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  30711167 tgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaaaacaccattattaattgtagttaatggagcaattaagttagatgaaattcaataaataag 30711071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33459113 - 33459045
Alignment:
Q  57 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | || |  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33459113 atttattaaaatatctttattaattgtagttagtagaatacttaaattgaatgaaatttattaaataag 33459045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 37772972 - 37773084
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||| |||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||| || | | | || | ||||||||| ||||||||     
T  37772972 aaatgattaattgtattgattacaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattatagtcagtggaatagttaagttgaatgaaattc 37773071  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    |||||||||||||    
T  37773072 attaaataagggt 37773084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 38705233 - 38705173
Alignment:
Q  65 aaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataag 125  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38705233 aaatattcttattaattgtagttagttgagtaattaagttagatgaaattcaataaataag 38705173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5389
Alignment:
Q  16 aaaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatt 114  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  5498 aaaatgattaactgtgttgaattcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattttagttagtggagtagttaagttggatgaaatt 5399  T
Q  115 tattaaataa 124  Q
     | |||||||    
T  5398 caataaataa 5389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5341 - 5285
Alignment:
Q  185 taacaattattttgatatagagaaaaaatattaaaaggattattattttgagacgga 241  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  5341 taacaattattttgagaaaaagaaaaaatattaaagagattattattgtgagacgga 5285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 50311 - 50199
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  | ||| | ||||  |||||||| ||||||||     
T  50311 aaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatctttattaattacagttagtggagtaattaagttgaatgaaatta 50212  T
Q  116 attaaataagggt 128  Q
    | |||||||||||    
T  50211 aataaataagggt 50199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Original strand, 703 - 804
Alignment:
Q  28 tgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaatttattaaataagg 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||| |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  703 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacctttattgattgtagttagtggagtgtttaaattggatgaaattcaataaataagg 802  T
Q  127 gt 128  Q
    ||    
T  803 gt 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16205 - 16095
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtggttaagttggatgaaattt 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||| |   |||||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||     
T  16205 aaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatagcatttactaaaacacacttattaattgtagttaatgaagcagttaagatggatgaaattc 16106  T
Q  116 attaaataagg 126  Q
    | |||||||||    
T  16105 aataaataagg 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6844 - 6779
Alignment:
Q  17 aaatgaataaatgtgttgatttcattgataaaattagta-tatttactaaaatatttttattaatt 81  Q
    |||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  6844 aaatgattaattgttttaatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatgtctttattaatt 6779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University