View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_10 (Length: 533)

Name: NF7829A_low_10
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_10
NF7829A_low_10
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (1-518)||(22934568-22935085)
chr6 (1-518)||(23857013-23857530)
chr6 (1-518)||(26988992-26989510)
chr6 (1-518)||(15424005-15424522)
chr6 (1-518)||(24863708-24864225)
chr6 (1-514)||(26918371-26918884)
chr6 (1-518)||(24304306-24304823)
chr6 (1-517)||(16749845-16750361)
chr6 (1-518)||(13298639-13299156)
chr6 (3-518)||(27272268-27272783)
chr6 (12-517)||(29549477-29549982)
chr6 (10-518)||(27290058-27290566)
chr6 (22-517)||(34463035-34463530)
chr6 (22-517)||(3696093-3696588)
chr6 (22-517)||(4545464-4545959)
chr6 (13-517)||(4757767-4758271)
chr6 (13-517)||(27485132-27485636)
chr6 (1-517)||(29573004-29573520)
chr6 (22-517)||(16674151-16674646)
chr6 (13-517)||(27044390-27044895)
chr6 (24-517)||(29501429-29501922)
chr6 (13-517)||(4773009-4773513)
chr6 (22-517)||(4723823-4724318)
chr6 (13-517)||(4525289-4525793)
chr6 (1-517)||(30557705-30558221)
chr6 (13-517)||(27007730-27008234)
chr6 (13-518)||(27359680-27360185)
chr6 (13-518)||(27450023-27450528)
chr6 (1-517)||(16943716-16944232)
chr6 (13-517)||(26116099-26116603)
chr6 (22-517)||(28207466-28207961)
chr6 (1-339)||(27000064-27000402)
chr6 (24-517)||(26777299-26777797)
chr6 (13-391)||(17025280-17025658)
chr6 (9-508)||(14142983-14143482)
chr6 (9-508)||(26787943-26788442)
chr6 (9-508)||(27196316-27196815)
chr6 (9-508)||(27252425-27252924)
chr6 (335-517)||(27019461-27019643)
chr6 (9-508)||(22456641-22457131)
chr6 (12-490)||(13521789-13522267)
chr6 (13-340)||(20160704-20161031)
chr6 (13-340)||(22171800-22172127)
chr6 (12-457)||(8892060-8892504)
chr6 (12-457)||(8903295-8903739)
chr6 (12-379)||(33374083-33374450)
chr6 (9-457)||(28162656-28163104)
chr6 (9-239)||(22477240-22477470)
chr6 (219-517)||(17092129-17092427)
chr6 (465-517)||(27629389-27629441)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-518)||(17014009-17014526)
chr4 (1-518)||(14665027-14665544)
chr4 (1-518)||(24592059-24592576)
chr4 (1-517)||(14763050-14763566)
chr4 (1-517)||(5005882-5006398)
chr4 (13-517)||(36344261-36344765)
chr4 (1-517)||(6569862-6570378)
chr4 (13-517)||(18800359-18800863)
chr4 (1-517)||(27163063-27163579)
chr4 (1-517)||(40105384-40105900)
chr4 (22-517)||(33673544-33674039)
chr4 (13-517)||(54833408-54833912)
chr4 (22-517)||(30753784-30754279)
chr4 (1-517)||(14098550-14099066)
chr4 (22-517)||(39850668-39851163)
chr4 (1-517)||(31126264-31126780)
chr4 (1-517)||(21969710-21970226)
chr4 (9-518)||(15284673-15285182)
chr4 (9-518)||(15227887-15228396)
chr4 (4-517)||(1900269-1900782)
chr4 (12-457)||(24460411-24460856)
chr4 (9-403)||(14235385-14235779)
chr4 (12-308)||(24112682-24112978)
chr4 (27-457)||(15391144-15391574)
chr4 (12-308)||(34188915-34189211)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-518)||(27434178-27434695)
chr2 (1-518)||(28882204-28882721)
chr2 (1-518)||(12655532-12656049)
chr2 (1-518)||(20837908-20838425)
chr2 (1-518)||(23128300-23128817)
chr2 (1-517)||(11634921-11635437)
chr2 (1-517)||(11641110-11641626)
chr2 (1-517)||(21676917-21677433)
chr2 (1-517)||(34286344-34286860)
chr2 (1-517)||(34291404-34291920)
chr2 (1-517)||(34861670-34862186)
chr2 (13-517)||(37375163-37375667)
chr2 (1-517)||(37685644-37686160)
chr2 (1-517)||(37700909-37701425)
chr2 (1-517)||(32049788-32050304)
chr2 (5-517)||(13936279-13936791)
chr2 (1-517)||(37925483-37925999)
chr2 (22-517)||(27777233-27777728)
chr2 (22-517)||(27816991-27817486)
chr2 (22-517)||(260488-260983)
chr2 (22-517)||(12716337-12716832)
chr2 (22-517)||(27803718-27804213)
chr2 (22-517)||(40233522-40234017)
chr2 (12-517)||(39890075-39890580)
chr2 (1-517)||(16829073-16829589)
chr2 (1-517)||(16891892-16892408)
chr2 (22-517)||(12586821-12587316)
chr2 (22-517)||(39051557-39052052)
chr2 (1-518)||(31876271-31876788)
chr2 (1-517)||(19416234-19416750)
chr2 (22-517)||(9349717-9350212)
chr2 (1-490)||(22925790-22926279)
chr2 (4-518)||(21702898-21703412)
chr2 (1-260)||(34279439-34279698)
chr2 (9-518)||(19456155-19456664)
chr2 (9-508)||(27118686-27119185)
chr2 (9-457)||(34303098-34303546)
chr2 (9-457)||(31891123-31891571)
chr2 (12-457)||(3784655-3785100)
chr2 (12-490)||(16163600-16164081)
chr2 (12-457)||(34157012-34157456)
chr2 (27-292)||(27392985-27393250)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-518)||(2136963-2137480)
chr8 (1-518)||(16277548-16278065)
chr8 (1-518)||(27608609-27609126)
chr8 (1-518)||(14557618-14558135)
chr8 (1-518)||(19688092-19688609)
chr8 (4-518)||(16283446-16283960)
chr8 (1-517)||(19674435-19674951)
chr8 (1-517)||(31489455-31489971)
chr8 (1-517)||(19208065-19208581)
chr8 (1-517)||(31354518-31355034)
chr8 (1-517)||(28361660-28362176)
chr8 (13-517)||(3329212-3329716)
chr8 (13-517)||(19286468-19286972)
chr8 (57-517)||(29829372-29829832)
chr8 (1-517)||(33258717-33259233)
chr8 (13-517)||(12092429-12092933)
chr8 (12-517)||(9354627-9355133)
chr8 (171-436)||(189258-189523)
chr8 (12-490)||(18710591-18711069)
chr8 (12-508)||(19658754-19659249)
chr8 (9-490)||(44563103-44563582)
chr8 (12-508)||(33244670-33245166)
chr8 (399-518)||(18791099-18791218)
chr8 (87-457)||(22080643-22081013)
chr8 (22-82)||(19518277-19518337)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-518)||(10916499-10917016)
chr7 (1-518)||(2154568-2155085)
chr7 (1-518)||(16503011-16503528)
chr7 (1-518)||(16518047-16518564)
chr7 (1-514)||(11424412-11424924)
chr7 (1-514)||(5127987-5128500)
chr7 (1-517)||(5146972-5147488)
chr7 (1-517)||(4144755-4145271)
chr7 (1-517)||(16736092-16736608)
chr7 (1-517)||(16751146-16751662)
chr7 (1-517)||(17523527-17524043)
chr7 (1-517)||(17529172-17529688)
chr7 (22-517)||(26537502-26537997)
chr7 (1-517)||(26435252-26435768)
chr7 (1-517)||(26319501-26320017)
chr7 (1-517)||(45387338-45387854)
chr7 (1-517)||(9618646-9619162)
chr7 (1-517)||(26274726-26275242)
chr7 (1-517)||(26669546-26670062)
chr7 (13-517)||(31564022-31564526)
chr7 (1-517)||(24592173-24592689)
chr7 (22-517)||(3445322-3445817)
chr7 (13-517)||(31124927-31125431)
chr7 (57-475)||(11441623-11442041)
chr7 (9-518)||(16449629-16450138)
chr7 (4-518)||(16041321-16041835)
chr7 (9-490)||(26484697-26485178)
chr7 (9-490)||(39210682-39211163)
chr7 (12-490)||(2775365-2775843)
chr7 (9-490)||(2108664-2109145)
chr7 (355-517)||(26513130-26513292)
chr7 (12-457)||(31088156-31088601)
chr7 (141-457)||(4200682-4200998)
chr7 (87-457)||(45733541-45733911)
chr7 (136-490)||(26682659-26683013)
chr7 (9-308)||(18540802-18541101)
chr7 (12-295)||(5159525-5159808)
chr7 (22-116)||(26485756-26485850)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-518)||(23717630-23718147)
chr5 (1-518)||(24687799-24688316)
chr5 (1-518)||(30934636-30935153)
chr5 (1-514)||(11549357-11549870)
chr5 (1-515)||(23752095-23752609)
chr5 (1-515)||(33777490-33778004)
chr5 (1-518)||(22998756-22999273)
chr5 (4-518)||(24970024-24970538)
chr5 (1-518)||(15658402-15658919)
chr5 (13-517)||(18500373-18500877)
chr5 (1-517)||(8665118-8665634)
chr5 (1-517)||(2511054-2511570)
chr5 (1-517)||(6874308-6874824)
chr5 (1-517)||(15758500-15759016)
chr5 (1-517)||(12132158-12132674)
chr5 (13-517)||(28649250-28649754)
chr5 (1-517)||(9317454-9317970)
chr5 (1-517)||(30152021-30152537)
chr5 (1-517)||(5637913-5638429)
chr5 (12-517)||(34616532-34617037)
chr5 (1-517)||(26480395-26480910)
chr5 (1-518)||(18375054-18375571)
chr5 (1-517)||(30168472-30168988)
chr5 (22-517)||(43078276-43078771)
chr5 (13-517)||(37754995-37755499)
chr5 (13-517)||(3789556-3790060)
chr5 (1-517)||(41674712-41675228)
chr5 (22-517)||(31826050-31826545)
chr5 (22-517)||(24681464-24681959)
chr5 (22-517)||(24723991-24724486)
chr5 (22-517)||(31431464-31431959)
chr5 (13-517)||(37671126-37671630)
chr5 (13-517)||(37770630-37771134)
chr5 (1-517)||(33516359-33516875)
chr5 (1-457)||(9548246-9548702)
chr5 (13-517)||(37358286-37358790)
chr5 (22-517)||(40473192-40473687)
chr5 (12-517)||(28959429-28959934)
chr5 (12-517)||(32599115-32599620)
chr5 (1-517)||(30029418-30029934)
chr5 (13-517)||(13324472-13324976)
chr5 (4-517)||(23892212-23892725)
chr5 (1-433)||(29966793-29967225)
chr5 (9-508)||(29888734-29889233)
chr5 (4-518)||(22888476-22888990)
chr5 (4-518)||(25199035-25199549)
chr5 (12-490)||(33877261-33877739)
chr5 (12-457)||(11325808-11326253)
chr5 (12-456)||(13184352-13184796)
chr5 (12-457)||(13440197-13440642)
chr5 (12-294)||(33292539-33292821)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-518)||(46730-47247)
scaffold0089 (1-518)||(39814-40331)
scaffold0089 (4-518)||(29760-30274)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-518)||(4796439-4796956)
chr3 (4-518)||(15892492-15893006)
chr3 (1-514)||(18330624-18331137)
chr3 (1-518)||(6192271-6192788)
chr3 (1-518)||(8295927-8296444)
chr3 (1-518)||(8301053-8301570)
chr3 (1-515)||(15740883-15741397)
chr3 (1-518)||(4721586-4722103)
chr3 (1-514)||(35880721-35881234)
chr3 (1-518)||(18051217-18051734)
chr3 (1-518)||(29148541-29149058)
chr3 (12-514)||(22387368-22387870)
chr3 (1-517)||(18276839-18277355)
chr3 (1-517)||(18307441-18307957)
chr3 (1-517)||(7073167-7073683)
chr3 (1-517)||(18292140-18292656)
chr3 (1-517)||(28115741-28116257)
chr3 (1-517)||(4416874-4417390)
chr3 (1-517)||(31964260-31964776)
chr3 (1-517)||(5609109-5609625)
chr3 (1-517)||(10396088-10396604)
chr3 (1-517)||(28339257-28339773)
chr3 (12-517)||(28021241-28021746)
chr3 (1-517)||(7996517-7997033)
chr3 (1-517)||(10643025-10643541)
chr3 (1-517)||(21674648-21675164)
chr3 (22-517)||(48465903-48466398)
chr3 (12-517)||(4346474-4346979)
chr3 (1-517)||(47023408-47023924)
chr3 (22-517)||(36996864-36997359)
chr3 (13-517)||(18242706-18243210)
chr3 (22-517)||(8211714-8212209)
chr3 (22-517)||(11110136-11110631)
chr3 (22-517)||(20576634-20577129)
chr3 (67-517)||(51782044-51782494)
chr3 (13-517)||(6542249-6542753)
chr3 (24-517)||(5596144-5596637)
chr3 (57-517)||(5466996-5467456)
chr3 (1-517)||(18225146-18225662)
chr3 (12-517)||(22870643-22871148)
chr3 (12-517)||(22885702-22886207)
chr3 (1-517)||(17984743-17985259)
chr3 (22-517)||(29664757-29665252)
chr3 (1-517)||(24328114-24328630)
chr3 (1-517)||(5013667-5014183)
chr3 (1-385)||(50133990-50134374)
chr3 (67-395)||(51797133-51797462)
chr3 (1-457)||(5713182-5713638)
chr3 (1-457)||(5724092-5724548)
chr3 (1-457)||(5767820-5768276)
chr3 (1-379)||(5757007-5757385)
chr3 (9-518)||(18530351-18530860)
chr3 (12-457)||(17993631-17994076)
chr3 (9-518)||(16626292-16626801)
chr3 (9-490)||(32292715-32293196)
chr3 (12-490)||(31033931-31034409)
chr3 (12-508)||(5652353-5652849)
chr3 (12-457)||(4625910-4626355)
chr3 (12-308)||(32439120-32439416)
chr3 (13-308)||(20066010-20066305)
chr3 (12-223)||(4893176-4893387)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-518)||(27286-27804)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-517)||(41793054-41793570)
chr1 (1-517)||(10962663-10963179)
chr1 (1-517)||(28584974-28585490)
chr1 (1-518)||(51638211-51638728)
chr1 (4-518)||(16207776-16208290)
chr1 (9-518)||(20461082-20461591)
chr1 (4-518)||(20340080-20340594)
chr1 (9-490)||(28151863-28152344)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-517)||(8812-9328)
scaffold0159 (1-517)||(20009-20526)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-518)||(30447-30964)
scaffold0124 (9-350)||(20390-20730)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-517)||(6985-7501)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (22-517)||(6025-6524)
scaffold0415 (87-350)||(1831-2093)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-391)||(1-392)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-518)||(14675-15192)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-517)||(25947-26464)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (12-517)||(9571-10076)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (22-517)||(7964-8459)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (9-512)||(46545-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (4-518)||(2403-2917)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (9-286)||(5-282)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (27-490)||(21581-22044)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (153-498)||(383-728)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (440-517)||(518-595)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22935085 - 22934568
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22935085 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 22934986  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22934985 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 22934886  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22934885 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 22934786  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22934785 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 22934686  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934685 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 22934586  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22934585 ttgactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23857530 - 23857013
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857530 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 23857431  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23857430 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23857331  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23857330 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23857231  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23857230 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 23857131  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857130 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 23857031  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  23857030 ttgactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 26988992 - 26989510
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988992 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 26989091  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26989092 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 26989191  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26989192 ttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26989291  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26989292 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26989391  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattt 499  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26989392 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgattaattt 26989491  T
Q  500 tttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26989492 tttgactgttagtgatgtc 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15424522 - 15424005
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15424522 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 15424423  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15424422 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 15424323  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15424322 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 15424223  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15424222 taaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 15424123  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424122 gttcagccatgatcatgccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 15424023  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15424022 ttgactgttagtgatgtc 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 24863708 - 24864225
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24863708 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24863807  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24863808 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 24863907  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24863908 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 24864007  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||    
T  24864008 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctct 24864107  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24864108 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaatgataatttt 24864207  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24864208 ttgactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 26918371 - 26918884
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918371 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 26918470  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918471 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 26918570  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26918571 ttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26918670  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26918671 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26918770  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918771 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagataacatccaaagcttgatgaatgataatttt 26918870  T
Q  501 ttgactgttagtga 514  Q
    |||||||| |||||    
T  26918871 ttgactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24304823 - 24304306
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304823 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24304724  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24304723 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgat 24304624  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24304623 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 24304524  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24304523 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 24304424  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24304423 gttcagccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 24304324  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24304323 ttgactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 16749845 - 16750361
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16749845 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 16749944  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16749945 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 16750044  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16750045 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16750144  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  16750145 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctct 16750244  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750245 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 16750344  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
    |||||||||||||||||    
T  16750345 ttgactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13299156 - 13298639
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13299156 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 13299057  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13299056 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacact 13298957  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13298956 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 13298857  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13298856 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 13298757  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13298756 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattat 13298657  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13298656 ttgactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27272783 - 27272268
Alignment:
Q  3 aatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 102  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27272783 aatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggta 27272684  T
Q  103 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27272683 agcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27272584  T
Q  203 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 302  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  27272583 gaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtg 27272484  T
Q  303 aatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgt 402  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||    
T  27272483 aatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgt 27272384  T
Q  403 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27272383 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatgaatgataagttttt 27272284  T
Q  503 gactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||    
T  27272283 gactgttagtgatgtc 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549982
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 29549776  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29549777 gaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 29549876  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  29549877 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcag 29549976  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  29549977 tgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290058
Alignment:
Q  10 aagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagccccc 109  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  110 acctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtac 209  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtac 27290367  T
Q  210 atcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgg 309  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||     
T  27290366 attgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatga 27290267  T
Q  310 tcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcca 409  Q
    | || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27290266 ttgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcca 27290167  T
Q  410 tgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290166 tgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtt 27290067  T
Q  510 agtgatgtc 518  Q
    |||||||||    
T  27290066 agtgatgtc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 34463530 - 34463035
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34463530 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgtt 34463431  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463430 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 34463331  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  34463330 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 34463231  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34463230 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 34463131  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34463130 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 3696093 - 3696588
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3696093 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 3696192  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  3696193 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 3696292  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||    
T  3696293 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtg 3696392  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3696393 atgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaa 3696492  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  3696493 gtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4545959 - 4545464
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4545959 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 4545860  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  4545859 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 4545760  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  4545759 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 4545660  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4545659 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 4545560  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4545559 gtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758271
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4758066  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4758067 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 4758166  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  4758167 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttcggactgtcagt 4758266  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  4758267 gatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485636
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27485331  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27485332 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27485431  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27485432 aagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 27485531  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27485532 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgttagt 27485631  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  27485632 gatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 29573004 - 29573520
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||    
T  29573004 aaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaggg 29573103  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  29573104 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 29573203  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29573204 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 29573303  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29573304 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 29573403  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29573404 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 29573503  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  29573504 ctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 16674151 - 16674646
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674151 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 16674250  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674251 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 16674350  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  16674351 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 16674450  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16674451 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaa 16674550  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16674551 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044895
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct-acgctttgaagtacat 211  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27044689  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27044690 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 27044789  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||    
T  27044790 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcag 27044889  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  27044890 tgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 517
Target Start/End: Original strand, 29501429 - 29501922
Alignment:
Q  24 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29501429 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 29501528  T
Q  124 ctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
T  29501529 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 29501628  T
Q  224 cgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgag 323  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  29501629 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 29501728  T
Q  324 gcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagt 423  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29501729 gaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 29501828  T
Q  424 gcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    | |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29501829 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773513
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4773308  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4773309 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatga 4773408  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  4773409 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 4773508  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  4773509 gatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4724318 - 4723823
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4724318 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgtt 4724219  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  4724218 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaa 4724119  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  4724118 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 4724019  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4724018 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 4723919  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4723918 gtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525793
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4525588  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4525589 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatga 4525688  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  4525689 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 4525788  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  4525789 gatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 30558221 - 30557705
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30558221 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 30558122  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  30558121 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30558022  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30558021 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30557922  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30557921 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 30557822  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30557821 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 30557722  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  30557721 ctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008234
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27008029  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27008030 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 27008129  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  27008130 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 27008229  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  27008230 gatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27359680
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27359986  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27359985 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27359886  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27359885 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatga 27359786  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  27359785 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 27359686  T
Q  513 gatgtc 518  Q
    ||||||    
T  27359685 gatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450023
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27450329  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27450328 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27450229  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27450228 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatga 27450129  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  27450128 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 27450029  T
Q  513 gatgtc 518  Q
    ||||||    
T  27450028 gatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16944232 - 16943716
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16944232 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 16944133  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  16944132 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 16944033  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  16944032 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactg 16943933  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16943932 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 16943833  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16943832 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatctt 16943733  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  16943732 ctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116099
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 26116304  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26116303 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 26116204  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||| |||    
T  26116203 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataatcttctgactgtcagt 26116104  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  26116103 gatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 28207466 - 28207961
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28207466 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgtt 28207565  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||     
T  28207566 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaa 28207665  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  28207666 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 28207765  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28207766 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaa 28207865  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28207866 gtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 27000064 - 27000402
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27000064 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27000163  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27000164 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 27000263  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27000264 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27000363  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 339  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000364 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26777797 - 26777299
Alignment:
Q  24 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26777797 ttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 26777698  T
Q  124 ctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
T  26777697 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 26777598  T
Q  224 cgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgag 323  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  26777597 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 26777498  T
Q  324 gcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgc-----acattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 418  Q
    | |  |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||     || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26777497 gaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 26777398  T
Q  419 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26777397 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 391
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025658
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
     || || || ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 17025579  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 391  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17025580 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14142983
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 14143283  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  14143282 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 14143183  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  14143182 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 14143083  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  14143082 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 14142983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788442
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26788142  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26788143 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26788242  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  26788243 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 26788342  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  26788343 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 26788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196815
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27196515  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27196516 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27196615  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  27196616 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 27196715  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27196716 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27196815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252425
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27252725  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27252724 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27252625  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  27252624 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 27252525  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27252524 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27252425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 335 - 517
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  335 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  435 cttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22457131 - 22456641
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  | | | || || |||||||||||||||||||| |    
T  22457131 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22457032  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22457031 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22456932  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||    
T  22456931 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtg 22456832  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||         ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||   ||    
T  22456831 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaact---------cctctgcacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgacc 22456741  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| || | || |||| |  |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  22456740 atgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgt 22456641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13521789
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 13521968  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  13521967 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 13521868  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    | |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  13521867 accatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 13521789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20161031
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 20160903  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||| |||    
T  20160904 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 20161003  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 340  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20161004 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171800
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 22171928  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||| |||    
T  22171927 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 22171828  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 340  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22171827 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892060
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8892305  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  8892304 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8892206  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  8892205 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 8892106  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8892105 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8892060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903295
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8903540  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  8903539 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8903441  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  8903440 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 8903341  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8903340 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8903295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374083
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33374251  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  33374250 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33374151  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacat 379  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  33374150 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacat 33374083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 457
Target Start/End: Original strand, 28162656 - 28163104
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  28162656 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 28162755  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||| |||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||    
T  28162756 cacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggta 28162855  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  28162856 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 28162955  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||   | | ||| |||| || |||||   ||    
T  28162956 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgacc 28163055  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  28163056 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 28163104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22477470 - 22477240
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  | | | || || |||||||||||||||||||| |    
T  22477470 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22477371  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22477370 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22477271  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaag 239  Q
    ||| ||||| |||||| | || |||||||||    
T  22477270 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092129
Alignment:
Q  219 aagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat 318  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||   || | ||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  319 gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 418  Q
    |||||| |||| | | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||||||||||      
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatag 17092228  T
Q  419 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||  |||| |  || | | ||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||  |||||||||| || || | | ||||||||||||||||    
T  17092227 cagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaactatctgactgttagtgatgt 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 465 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27629441 - 27629389
Alignment:
Q  465 caagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27629441 caagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 27629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 17014009 - 17014526
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17014009 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacaggg 17014108  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014109 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 17014208  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17014209 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 17014308  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17014309 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 17014408  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014409 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 17014508  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17014509 ttgactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 14665027 - 14665544
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665027 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 14665126  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14665127 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 14665226  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665227 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 14665326  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14665327 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 14665426  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665427 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 14665526  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14665527 ttgactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24592576 - 24592059
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592576 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24592477  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592476 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 24592377  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24592376 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctg 24592277  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24592276 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 24592177  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592176 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 24592077  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  24592076 ttgactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 14763566 - 14763050
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14763566 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 14763467  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  14763466 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 14763367  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14763366 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 14763267  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14763266 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 14763167  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763166 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 14763067  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  14763066 ctgactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 5005882 - 5006398
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5005882 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaagg 5005981  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5005982 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5006081  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  5006082 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctg 5006181  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5006182 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctct 5006281  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5006282 gttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatctt 5006381  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5006382 ctgactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344261
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 36344466  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36344465 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatga 36344366  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36344365 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 36344266  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  36344265 gatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 6569862 - 6570378
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6569862 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 6569961  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || |||    
T  6569962 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 6570061  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6570062 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 6570161  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6570162 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 6570261  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6570262 gttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 6570361  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  6570362 ctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800359
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18800564  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18800563 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 18800464  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  18800463 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 18800364  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  18800363 gatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27163579 - 27163063
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27163579 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 27163480  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  27163479 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 27163380  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27163379 ttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27163280  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||    
T  27163279 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctct 27163180  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27163179 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 27163080  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  27163079 ctgactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 40105900 - 40105384
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  40105900 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacaggg 40105801  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  40105800 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 40105701  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40105700 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 40105601  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40105600 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 40105501  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40105500 gtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 40105401  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  40105400 ctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 33674039 - 33673544
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  33674039 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgtt 33673940  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673939 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 33673840  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  33673839 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 33673740  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33673739 aggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 33673640  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33673639 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833912
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 54833707  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54833708 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 54833807  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  54833808 tcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaat 54833907  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  54833908 gatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 30753784 - 30754279
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30753784 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 30753883  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  30753884 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaa 30753983  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  30753984 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 30754083  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30754084 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 30754183  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30754184 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 14098550 - 14099066
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14098550 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 14098649  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  14098650 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 14098749  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14098750 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 14098849  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14098850 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 14098949  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14098950 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataacctt 14099049  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  14099050 ctgactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 39850668 - 39851163
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  39850668 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 39850767  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  39850768 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 39850867  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  39850868 ctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 39850967  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39850968 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 39851067  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39851068 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31126780 - 31126264
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31126780 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31126681  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  31126680 taagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 31126581  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31126580 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 31126481  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31126480 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 31126381  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31126380 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 31126281  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  31126280 ctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 21969710 - 21970226
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  21969710 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaagg 21969809  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| ||||| || || || ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  21969810 caagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 21969909  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21969910 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 21970009  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| | |||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21970010 tgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 21970109  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21970110 gtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 21970209  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  21970210 ctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15285182 - 15284673
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||   ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  15285182 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 15285083  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  15285082 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15284983  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| || |||    
T  15284982 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatg 15284883  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||    
T  15284882 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 15284783  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| | || |||||||| || |||| |||||||||    
T  15284782 atgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgt 15284683  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  15284682 cagcgatgtc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Original strand, 15227887 - 15228396
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  15227887 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctc 15227986  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  15227987 cacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15228086  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  15228087 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 15228186  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | |  | || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||    
T  15228187 attggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 15228286  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| || | || |||| | ||||||||||| |||||| |   ||||| | | |||||||| ||||||||||| || | || |||||||||    
T  15228287 atgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgt 15228386  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  15228387 cagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 517
Target Start/End: Original strand, 1900269 - 1900782
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||| || ||    
T  1900269 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaa 1900368  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  1900369 gcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttg 1900468  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  1900469 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 1900568  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||    
T  1900569 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtt 1900668  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
       |||||| |||||||  |||| || |||  | | |||| |||||||||||||   ||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  1900669 tgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctacgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttg 1900768  T
Q  504 actgttagtgatgt 517  Q
    ||||| || |||||    
T  1900769 actgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460411
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 24460657  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  24460656 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 24460557  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  24460556 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 24460457  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  24460456 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 24460411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14235779 - 14235385
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| | || | || ||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  14235779 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctc 14235680  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||| | || |||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||     
T  14235679 cacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagtt 14235580  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || || |||||| | || || |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  14235579 cattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 14235480  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
     | ||    | ||| | |||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  14235479 attgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttccttgtt 14235385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 308
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24112978
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 24112978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15391574 - 15391144
Alignment:
Q  27 cctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc 126  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||||||| || |  | ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  15391574 cctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctc 15391475  T
Q  127 ccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 226  Q
    |||||||| | || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  15391474 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 15391375  T
Q  227 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat-gtgaggc 325  Q
    |||  | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| || ||| ||| ||| |  ||| |     
T  15391374 tgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agagtcatgaaga 15391276  T
Q  326 agctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgc 425  Q
    || ||| || |||||  ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||| |||||||||| |||    
T  15391275 agttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgc 15391176  T
Q  426 ctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    | || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  15391175 ccagaatgccgccataatccttggggttgcta 15391144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188915
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 34188915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27434695 - 27434178
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27434695 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27434596  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27434595 caagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 27434496  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27434495 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27434396  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27434395 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 27434296  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434295 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 27434196  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  27434195 ttgactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 28882204 - 28882721
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882204 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 28882303  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28882304 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 28882403  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28882404 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 28882503  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28882504 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 28882603  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882604 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 28882703  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  28882704 ttgactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 12655532 - 12656049
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12655532 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 12655631  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655632 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 12655731  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12655732 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccg 12655831  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12655832 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 12655931  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655932 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 12656031  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  12656032 ttgactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 20837908 - 20838425
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20837908 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 20838007  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20838008 caagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 20838107  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20838108 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 20838207  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20838208 taaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 20838307  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838308 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 20838407  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20838408 ttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23128817 - 23128300
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128817 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 23128718  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23128717 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23128618  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23128617 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23128518  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23128517 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 23128418  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23128417 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataatttt 23128318  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  23128317 ttgactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 11635437 - 11634921
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11635437 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 11635338  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| || |||    
T  11635337 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgct 11635238  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11635237 ttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctg 11635138  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11635137 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 11635038  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11635037 gttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 11634938  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     |||||||  |||||||    
T  11634937 ctgactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 11641626 - 11641110
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11641626 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 11641527  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| || |||    
T  11641526 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgct 11641427  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11641426 ttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctg 11641327  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11641326 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 11641227  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11641226 gttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 11641127  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     |||||||  |||||||    
T  11641126 ctgactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21677433 - 21676917
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21677433 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 21677334  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  21677333 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 21677234  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21677233 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 21677134  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21677133 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctct 21677034  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21677033 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatctt 21676934  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     |||| || ||||||||    
T  21676933 ctgaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 34286344 - 34286860
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34286344 aaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 34286443  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  34286444 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgct 34286543  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  34286544 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccg 34286643  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34286644 tgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 34286743  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34286744 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataatttt 34286843  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  34286844 ctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 34291404 - 34291920
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34291404 aaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 34291503  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  34291504 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgct 34291603  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  34291604 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccg 34291703  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34291704 tgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 34291803  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34291804 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataatttt 34291903  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  34291904 ctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 34861670 - 34862186
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34861670 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 34861769  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  34861770 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 34861869  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34861870 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 34861969  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34861970 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 34862069  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34862070 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 34862169  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  34862170 ctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375667
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37375462  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37375463 aagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37375562  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37375563 acatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 37375662  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  37375663 gatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37686160 - 37685644
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37686160 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 37686061  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  37686060 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 37685961  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37685960 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctg 37685861  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37685860 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 37685761  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37685760 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 37685661  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  37685660 ctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37701425 - 37700909
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37701425 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 37701326  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  37701325 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 37701226  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37701225 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctg 37701126  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37701125 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 37701026  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37701025 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 37700926  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  37700925 ctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 32049788 - 32050304
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32049788 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 32049887  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  32049888 taaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 32049987  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  32049988 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 32050087  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| | ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32050088 tgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 32050187  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32050188 gtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 32050287  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  32050288 ctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 5 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 13936791 - 13936279
Alignment:
Q  5 tcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaag 104  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||    
T  13936791 tcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaag 13936692  T
Q  105 cccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttga 204  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13936691 cctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttga 13936592  T
Q  205 agtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaa 304  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13936591 agtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaa 13936492  T
Q  305 tatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttc 404  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13936491 tatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttc 13936392  T
Q  405 agccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttga 504  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13936391 agccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctga 13936292  T
Q  505 ctgttagtgatgt 517  Q
    |||| ||||||||    
T  13936291 ctgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 37925483 - 37925999
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37925483 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 37925582  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  37925583 taagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 37925682  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  37925683 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 37925782  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37925783 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 37925882  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37925883 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 37925982  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  37925983 ctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 27777233 - 27777728
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27777233 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 27777332  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  27777333 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 27777432  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  27777433 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27777532  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27777533 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27777632  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27777633 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 27816991 - 27817486
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27816991 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 27817090  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  27817091 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 27817190  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  27817191 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27817290  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27817291 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27817390  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27817391 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 260983 - 260488
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  260983 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgtt 260884  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  260883 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 260784  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |    
T  260783 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcg 260684  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  260683 aggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaa 260584  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  260583 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12716832 - 12716337
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  12716832 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 12716733  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  12716732 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 12716633  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  12716632 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 12716533  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12716532 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaa 12716433  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12716432 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 27803718 - 27804213
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27803718 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 27803817  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  27803818 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 27803917  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  27803918 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27804017  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27804018 aggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27804117  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27804118 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 40233522 - 40234017
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40233522 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 40233621  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  40233622 gcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 40233721  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||    
T  40233722 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtg 40233821  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40233822 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 40233921  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  40233922 gtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890580
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatat 39890274  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39890275 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 39890374  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39890375 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 39890474  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  39890475 atcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataatcttctgactgtcag 39890574  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  39890575 tgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16829589 - 16829073
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16829589 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 16829490  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16829489 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16829390  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16829389 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16829290  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16829289 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 16829190  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16829189 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 16829090  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  16829089 ctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 16891892 - 16892408
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16891892 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 16891991  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16891992 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16892091  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16892092 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16892191  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16892192 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 16892291  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16892292 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 16892391  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  16892392 ctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 12586821 - 12587316
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  12586821 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 12586920  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  12586921 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 12587020  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  12587021 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 12587120  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12587121 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 12587220  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12587221 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 39052052 - 39051557
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  39052052 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 39051953  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  39051952 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 39051853  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  39051852 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 39051753  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39051752 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgccaa 39051653  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39051652 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 31876271 - 31876788
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31876271 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31876370  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  31876371 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 31876470  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31876471 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 31876570  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  31876571 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctct 31876670  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31876671 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatctt 31876770  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
     ||||||| |||||||||    
T  31876771 ctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19416750 - 19416234
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19416750 aaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 19416651  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  19416650 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 19416551  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  19416550 ttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 19416451  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19416450 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 19416351  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19416350 gtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 19416251  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  19416250 ctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9350212 - 9349717
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||    
T  9350212 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggacccttt 9350113  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  9350112 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 9350013  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||    
T  9350012 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 9349913  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||  | ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9349912 aggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 9349813  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9349812 gtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22926279 - 22925790
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22926279 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 22926180  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  22926179 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 22926080  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  22926079 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctg 22925980  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || ||    
T  22925979 tgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctct 22925880  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    |||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||| ||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22925879 gtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 22925790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21703412 - 21702898
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||||| |||    
T  21703412 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaa 21703313  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  21703312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttg 21703213  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21703212 aagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 21703113  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||    
T  21703112 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtt 21703013  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
     | ||| |||||| |||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||    
T  21703012 taaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttg 21702913  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  21702912 actgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 34279439 - 34279698
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34279439 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 34279538  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  34279539 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 34279638  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 260  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279639 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19456664 - 19456155
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  19456664 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 19456565  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  19456564 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagta 19456465  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  19456464 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 19456365  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||    
T  19456364 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 19456265  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||  ||||  | |||| |  |||||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  19456264 atgatcatgccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgt 19456165  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  19456164 cagcgatgtc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27119185
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 27118885  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| |||    
T  27118886 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatg 27118985  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||  || ||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  27118986 attgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 27119085  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  27119086 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 27119185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303098
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 34303347  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||    
T  34303346 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatg 34303247  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |     
T  34303246 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaca 34303147  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  34303146 atgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgcta 34303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31891571 - 31891123
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  31891571 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 31891472  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31891471 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggta 31891372  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  31891371 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 31891272  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||  || | ||| |||| || |||||   ||    
T  31891271 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgacc 31891172  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  31891171 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 31891123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3785100
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 3784854  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  3784855 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 3784954  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  3784955 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 3785054  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  3785055 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 3785100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16164081
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 16163799  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  16163800 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 16163899  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttcc---ctgttcagcc 408  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| |||   |||||   ||    
T  16163900 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgacc 16163999  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16164000 atgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 16164081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157456
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34157211  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  34157212 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 34157310  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  34157311 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 34157410  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  34157411 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 34157456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 27392985 - 27393250
Alignment:
Q  27 cctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc 126  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| |||||||| || |  | ||| || || |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27392985 cctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctc 27393084  T
Q  127 ccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 226  Q
    ||||||||   || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  27393085 ccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 27393184  T
Q  227 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 292  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  27393185 tgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatca 27393250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2137480 - 2136963
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2137480 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 2137381  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2137380 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 2137281  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2137280 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 2137181  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2137180 taaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 2137081  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2137080 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 2136981  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2136980 ttgactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 16277548 - 16278065
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277548 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 16277647  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277648 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 16277747  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16277748 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccg 16277847  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16277848 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 16277947  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277948 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 16278047  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16278048 ttgactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27609126 - 27608609
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27609126 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27609027  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27609026 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgct 27608927  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27608926 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27608827  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27608826 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttccct 27608727  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608726 attcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 27608627  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27608626 ttgactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 14557618 - 14558135
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557618 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 14557717  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14557718 caagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 14557817  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14557818 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 14557917  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14557918 taaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 14558017  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558018 gttcagtcatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 14558117  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14558118 ttgactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 19688092 - 19688609
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688092 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 19688191  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19688192 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 19688291  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19688292 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 19688391  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19688392 taaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 19688491  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688492 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgtccaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 19688591  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||| ||| | |||||||    
T  19688592 ttgaatgtcaatgatgtc 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Original strand, 16283446 - 16283960
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16283446 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaa 16283545  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16283546 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttg 16283645  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16283646 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtga 16283745  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16283746 acatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtt 16283845  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283846 tagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 16283945  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| |||||||||    
T  16283946 actgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 19674435 - 19674951
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19674435 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 19674534  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| || |||    
T  19674535 caaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgct 19674634  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  19674635 ttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 19674734  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19674735 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 19674834  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19674835 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 19674934  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  19674935 ctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31489971 - 31489455
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31489971 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31489872  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  31489871 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 31489772  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31489771 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 31489672  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31489671 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 31489572  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31489571 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 31489472  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  31489471 ctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19208581 - 19208065
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19208581 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 19208482  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  19208481 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 19208382  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19208381 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 19208282  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19208281 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 19208182  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19208181 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 19208082  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  19208081 ctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 31354518 - 31355034
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354518 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31354617  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  31354618 caagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 31354717  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31354718 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 31354817  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31354818 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccct 31354917  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  31354918 gttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcctgatggatgataatctc 31355017  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  31355018 ctgactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 28362176 - 28361660
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28362176 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28362077  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  28362076 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 28361977  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28361976 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 28361877  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28361876 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 28361777  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28361776 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 28361677  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  28361676 ctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329212
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcg 3329417  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3329416 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 3329317  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||    
T  3329316 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataacttcctgactgtcagt 3329217  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  3329216 gatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286972
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 19286767  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19286768 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 19286867  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  19286868 tcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaat 19286967  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  19286968 gatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 57 - 517
Target Start/End: Original strand, 29829372 - 29829832
Alignment:
Q  57 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatt 156  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||  |||||||||    
T  29829372 cttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgatt 29829471  T
Q  157 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 256  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29829472 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataa 29829571  T
Q  257 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 356  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||     
T  29829572 tgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgcc 29829671  T
Q  357 actcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  29829672 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgct 29829771  T
Q  457 atactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29829772 atactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 33258717 - 33259233
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33258717 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 33258816  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33258817 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 33258916  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||    
T  33258917 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttg 33259016  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33259017 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 33259116  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33259117 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatctt 33259216  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  33259217 ctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092429
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 12092734  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12092733 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 12092634  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12092633 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatga 12092534  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12092533 tcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgaccgtcagt 12092434  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  12092433 gatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9355133
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 9354826  T
Q  212 cgtgaaaaag-ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggt 310  Q
     || |||||  ||| | || ||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9354827 tgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 9354926  T
Q  311 cgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccat 410  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9354927 cgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccat 9355026  T
Q  411 gatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtta 510  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |    
T  9355027 gatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtca 9355126  T
Q  511 gtgatgt 517  Q
    |||||||    
T  9355127 gtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 171 - 436
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189523
Alignment:
Q  171 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  271 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 370  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 189457  T
Q  371 tctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 436  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189458 tctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18711069
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 18710890  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  18710891 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 18710990  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    |||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18710991 atcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 18711069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 19659249 - 19658754
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| |  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19659249 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 19659150  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||| |||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  19659149 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 19659050  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  19659049 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 19658951  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  19658950 gaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 19658851  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  19658850 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 19658754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563582
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 44563302  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  44563303 cattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatg 44563400  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| |||   || ||  |||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  44563401 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 44563500  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44563501 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 44563582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33245166
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||| ||| || || |||||| |||| |  | ||| |  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33244869  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||| |     
T  33244870 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgatt 33244969  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||  ||||  || ||  ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   |||||    
T  33244970 gaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatg 33245069  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  33245070 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 33245166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 399 - 518
Target Start/End: Original strand, 18791099 - 18791218
Alignment:
Q  399 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18791099 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 18791198  T
Q  499 ttttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18791199 ttttgactgttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22081013 - 22080643
Alignment:
Q  87 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 186  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  22081013 acaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttg 22080914  T
Q  187 aggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    | || || ||||||||||||||||| || || |||||| |||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  22080913 aaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttcc 22080814  T
Q  287 aaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat-gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagct 385  Q
     ||||| || ||||| || ||| ||| ||| |  ||| | || ||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  22080813 gaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagct 22080715  T
Q  386 gtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
     ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| || | || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  22080714 atgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgccgccataatccttggggttgcta 22080643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19518337 - 19518277
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggaca 82  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19518337 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggaca 19518277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10917016 - 10916499
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917016 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 10916917  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10916916 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 10916817  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10916816 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 10916717  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  10916716 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctct 10916617  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916616 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 10916517  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10916516 ttgactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 2154568 - 2155085
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154568 aaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 2154667  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2154668 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgct 2154767  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2154768 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 2154867  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2154868 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 2154967  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154968 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 2155067  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2155068 ttgactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16503528 - 16503011
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16503528 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 16503429  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16503428 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtt 16503329  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16503328 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16503229  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |    
T  16503228 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttcttt 16503129  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503128 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 16503029  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16503028 ttgactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16518564 - 16518047
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16518564 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 16518465  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16518464 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtt 16518365  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16518364 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16518265  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |    
T  16518264 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttcttt 16518165  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518164 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 16518065  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16518064 ttgactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 11424924 - 11424412
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11424924 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacaggg 11424825  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11424824 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 11424725  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11424724 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 11424625  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11424624 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 11424525  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11424524 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat-tt 11424426  T
Q  501 ttgactgttagtga 514  Q
    ||||||||||||||    
T  11424425 ttgactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 5127987 - 5128500
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5127987 aaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 5128086  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5128087 taagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgct 5128186  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  5128187 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 5128286  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  5128287 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 5128386  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128387 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 5128486  T
Q  501 ttgactgttagtga 514  Q
    ||||||||||||||    
T  5128487 ttgactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5147488 - 5146972
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5147488 aaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5147389  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5147388 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5147289  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5147288 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 5147189  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5147188 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 5147089  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5147088 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 5146989  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5146988 ctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4145271 - 4144755
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4145271 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 4145172  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  4145171 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 4145072  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4145071 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 4144972  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4144971 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 4144872  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  4144871 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctaatgaatgataatctt 4144772  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  4144771 ctgactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16736608 - 16736092
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16736608 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 16736509  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16736508 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16736409  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16736408 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 16736309  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16736308 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 16736209  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16736208 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 16736109  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  16736108 ctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16751662 - 16751146
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16751662 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 16751563  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16751562 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16751463  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16751462 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 16751363  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16751362 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 16751263  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16751262 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 16751163  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  16751162 ctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 17523527 - 17524043
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17523527 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 17523626  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  17523627 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 17523726  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  17523727 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 17523826  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17523827 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 17523926  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17523927 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 17524026  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  17524027 ctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 17529688 - 17529172
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17529688 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 17529589  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  17529588 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 17529489  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  17529488 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 17529389  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17529388 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 17529289  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17529288 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 17529189  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  17529188 ctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26537997 - 26537502
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26537997 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 26537898  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  26537897 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 26537798  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  26537797 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 26537698  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26537697 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 26537598  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26537597 gtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 26435252 - 26435768
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26435252 aaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26435351  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  26435352 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 26435451  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26435452 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26435551  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26435552 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26435651  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435652 gttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 26435751  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  26435752 ctgactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26320017 - 26319501
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26320017 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26319918  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  26319917 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 26319818  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  26319817 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactg 26319718  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26319717 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26319618  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26319617 gttcaatcatgatcatgccaagtgactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 26319518  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  26319517 ctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 45387338 - 45387854
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45387338 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 45387437  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  45387438 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 45387537  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45387538 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 45387637  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45387638 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 45387737  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  45387738 gttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 45387837  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  45387838 ctgactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 9618646 - 9619162
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9618646 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 9618745  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  9618746 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 9618845  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9618846 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 9618945  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9618946 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 9619045  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9619046 gttcagccatgagcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 9619145  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  9619146 ctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26275242 - 26274726
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26275242 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26275143  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  26275142 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgct 26275043  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26275042 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26274943  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26274942 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26274843  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26274842 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttaatgaatgataatctt 26274743  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  26274742 ctgactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26670062 - 26669546
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26670062 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26669963  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  26669962 taagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 26669863  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26669862 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26669763  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26669762 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26669663  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26669662 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctc 26669563  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  26669562 ctgactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564022
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31564227  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31564226 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 31564127  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  31564126 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 31564027  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  31564026 gatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 24592689 - 24592173
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24592689 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 24592590  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  24592589 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 24592490  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24592489 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctg 24592390  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24592389 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 24592290  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24592289 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 24592190  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  24592189 ctgactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 3445322 - 3445817
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3445322 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 3445421  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445422 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaag 3445521  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  3445522 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 3445621  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3445622 aggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaa 3445721  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3445722 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125431
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31125126  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31125127 gtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31125226  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31125227 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 31125326  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||    
T  31125327 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagt 31125426  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  31125427 gatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 57 - 475
Target Start/End: Original strand, 11441623 - 11442041
Alignment:
Q  57 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatt 156  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  11441623 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 11441722  T
Q  157 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 256  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441723 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataa 11441822  T
Q  257 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 356  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11441823 tgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgca 11441922  T
Q  357 actcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  11441923 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgcc 11442022  T
Q  457 atactgttcaagacgacat 475  Q
    || ||||||||||||||||    
T  11442023 atgctgttcaagacgacat 11442041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449629
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 16449939  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  16449938 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 16449839  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||   ||    
T  16449838 attgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgacc 16449739  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  16449738 atgatcatgccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 16449639  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  16449638 cagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Original strand, 16041321 - 16041835
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  16041321 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 16041420  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16041421 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttg 16041520  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16041521 aagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 16041620  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | ||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || |||||    
T  16041621 acatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtt 16041720  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
     |  || |||||| |||| |||| || |||| | ||||||| ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  16041721 taatcacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 16041820  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  16041821 actgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26485178
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26484896  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26484897 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26484996  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  26484997 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 26485096  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26485097 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26485178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39210682
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 39210964  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  39210963 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 39210864  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  39210863 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 39210764  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  39210763 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 39210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775843
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2775664  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  2775665 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 2775764  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    |||||||||| |||| || |||  |   |||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  2775765 atcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 2775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108664
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 2108946  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  2108945 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 2108846  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||    
T  2108845 attgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgacc 2108746  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  2108745 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 2108664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 355 - 517
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  355 caactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  455 ctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088156
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 31088402  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  31088401 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 31088302  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  31088301 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 31088202  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||  |||||||||    
T  31088201 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgcta 31088156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 457
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200998
Alignment:
Q  141 gacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagc 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| || | |||||||||     
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  241 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 340  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  341 tgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgt 440  Q
     |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||    
T  4200882 cgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgt 4200981  T
Q  441 aatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||||||||||    
T  4200982 aatcctttgggttgcta 4200998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 457
Target Start/End: Original strand, 45733541 - 45733911
Alignment:
Q  87 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  45733541 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcg 45733640  T
Q  187 aggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    | || |||||||| |||| |||||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  45733641 aaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttcc 45733740  T
Q  287 aaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctg 386  Q
     ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || |     
T  45733741 gaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagtta 45733840  T
Q  387 tgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  45733841 tgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 45733911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26683013 - 26682659
Alignment:
Q  136 ggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaagg 235  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||  | ||||| ||| | || |||||    
T  26683013 ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaagg 26682914  T
Q  236 aaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctaga 335  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||    
T  26682913 aaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 26682814  T
Q  336 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcc 435  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||      
T  26682813 cttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgat 26682714  T
Q  436 ttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26682713 tctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18541101
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||| || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 18541001  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    |||||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  18541002 catcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 18541101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159808
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgc 295  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgc 5159808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26485850 - 26485756
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgat 116  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||    
T  26485850 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgat 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23718147 - 23717630
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23718147 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 23718048  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23718047 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23717948  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23717947 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23717848  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23717847 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 23717748  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717747 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 23717648  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  23717647 ttgactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24688316 - 24687799
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24688316 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24688217  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24688216 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 24688117  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24688116 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 24688017  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24688016 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 24687917  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24687916 gttcagccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 24687817  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  24687816 ttgactgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 30934636 - 30935153
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934636 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 30934735  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30934736 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 30934835  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30934836 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30934935  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  30934936 tatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 30935035  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30935036 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 30935135  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30935136 ttgactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 11549357 - 11549870
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11549357 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 11549456  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11549457 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 11549556  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11549557 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 11549656  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11549657 taaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 11549756  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549757 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 11549856  T
Q  501 ttgactgttagtga 514  Q
    ||||||| ||||||    
T  11549857 ttgactgctagtga 11549870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23752609 - 23752095
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23752609 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 23752510  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23752509 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23752410  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23752409 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23752310  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23752309 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 23752210  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752209 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 23752110  T
Q  501 ttgactgttagtgat 515  Q
    |||||||||||||||    
T  23752109 ttgactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 33777490 - 33778004
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777490 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 33777589  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777590 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 33777689  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  33777690 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactg 33777789  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33777790 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 33777889  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777890 attcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 33777989  T
Q  501 ttgactgttagtgat 515  Q
    |||||||||||||||    
T  33777990 ttgactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22999273 - 22998756
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999273 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 22999174  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22999173 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 22999074  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22999073 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctg 22998974  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22998973 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 22998874  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998873 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 22998774  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22998773 ttgactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Original strand, 24970024 - 24970538
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24970024 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 24970123  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24970124 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 24970223  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24970224 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaa 24970323  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  24970324 atatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgtt 24970423  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970424 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 24970523  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||    
T  24970524 actgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15658919 - 15658402
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15658919 aaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 15658820  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  15658819 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 15658720  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15658719 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 15658620  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  15658619 tgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctct 15658520  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658519 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 15658420  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  15658419 ttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500373
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18500578  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18500577 aagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 18500478  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18500477 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 18500378  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  18500377 gatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 8665634 - 8665118
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8665634 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 8665535  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  8665534 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 8665435  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8665434 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctg 8665335  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8665334 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccct 8665235  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8665234 gttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatctt 8665135  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     |||| || ||||||||    
T  8665134 ctgaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 2511054 - 2511570
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2511054 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 2511153  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  2511154 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 2511253  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  2511254 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 2511353  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2511354 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 2511453  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2511454 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 2511553  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  2511554 ctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 6874308 - 6874824
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6874308 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 6874407  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  6874408 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 6874507  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6874508 ttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 6874607  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6874608 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 6874707  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6874708 gttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 6874807  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  6874808 ctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 15759016 - 15758500
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15759016 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 15758917  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  15758916 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 15758817  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  15758816 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 15758717  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15758716 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccct 15758617  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15758616 gttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 15758517  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  15758516 ctgactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 12132158 - 12132674
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12132158 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 12132257  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  12132258 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 12132357  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12132358 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 12132457  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12132458 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 12132557  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12132558 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 12132657  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  12132658 ctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649754
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28649549  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28649550 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 28649649  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28649650 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctataccgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 28649749  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  28649750 gatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 9317454 - 9317970
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9317454 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 9317553  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  9317554 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 9317653  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9317654 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 9317753  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9317754 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 9317853  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9317854 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 9317953  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  9317954 ctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 30152021 - 30152537
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30152021 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 30152120  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  30152121 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30152220  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30152221 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30152320  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  30152321 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctct 30152420  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30152421 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 30152520  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  30152521 ctgactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 5637913 - 5638429
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5637913 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 5638012  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  5638013 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 5638112  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  5638113 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttg 5638212  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5638213 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 5638312  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5638313 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 5638412  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5638413 ctgactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34617037
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34616831  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34616832 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 34616931  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  34616932 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcag 34617031  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  34617032 tgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 26480395 - 26480910
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26480395 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26480494  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  26480495 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 26480594  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26480595 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26480694  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26480695 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaact-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 26480793  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26480794 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 26480893  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  26480894 ctgactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18375571 - 18375054
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18375571 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 18375472  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  18375471 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 18375372  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18375371 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 18375272  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18375271 tgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 18375172  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18375171 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataacttt 18375072  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
     ||||||| |||||||||    
T  18375071 ctgactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 30168472 - 30168988
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  30168472 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacaggg 30168571  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  30168572 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30168671  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  30168672 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 30168771  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30168772 tgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 30168871  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30168872 gttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatctt 30168971  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  30168972 ctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 43078276 - 43078771
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078276 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 43078375  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078376 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 43078475  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  43078476 ctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 43078575  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43078576 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 43078675  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43078676 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755499
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37755294  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37755295 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37755394  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  37755395 tcatgccaagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagt 37755494  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  37755495 gatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3790060
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 3789855  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3789856 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 3789955  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  3789956 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 3790055  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  3790056 gatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 41674712 - 41675228
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41674712 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 41674811  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  41674812 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgct 41674911  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
     | ||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  41674912 ctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccg 41675011  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| | ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  41675012 tgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctct 41675111  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41675112 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 41675211  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||| ||||    
T  41675212 ctgactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31826545 - 31826050
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31826545 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 31826446  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826445 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaag 31826346  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31826345 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 31826246  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31826245 aggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 31826146  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31826145 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 24681464 - 24681959
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24681464 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 24681563  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  24681564 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 24681663  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24681664 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 24681763  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24681764 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaa 24681863  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24681864 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 24723991 - 24724486
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24723991 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 24724090  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  24724091 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 24724190  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24724191 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 24724290  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24724291 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaa 24724390  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24724391 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 31431464 - 31431959
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31431464 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 31431563  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  31431564 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 31431663  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  31431664 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 31431763  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31431764 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 31431863  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31431864 gtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671126
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37671331  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37671330 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37671231  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  37671230 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 37671131  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  37671130 gatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770630
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
     |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37770835  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37770834 aagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatga 37770735  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  37770734 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagt 37770635  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  37770634 gatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 33516359 - 33516875
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33516359 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 33516458  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  33516459 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 33516558  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33516559 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 33516658  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33516659 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 33516758  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33516759 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 33516858  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  33516859 ctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9548702 - 9548246
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9548702 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 9548603  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9548602 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 9548503  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9548502 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 9548403  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||| |||| || ||    
T  9548402 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctct 9548303  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||   ||||||| ||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  9548302 gtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 9548246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358286
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 37358591  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37358590 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37358491  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37358490 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37358391  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  37358390 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataatcttctgactgtcagt 37358291  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  37358290 gatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 40473687 - 40473192
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  40473687 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 40473588  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  40473587 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 40473488  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  40473487 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 40473388  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40473387 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaa 40473288  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| |||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40473287 gtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959429
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28959735  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28959734 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 28959635  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  |||||||   ||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28959634 gaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatg 28959535  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  28959534 atcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcag 28959435  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  28959434 tgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599115
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| ||    
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatc 32599321  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32599320 gaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatg 32599221  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  32599220 atcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcag 32599121  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  32599120 tgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 30029418 - 30029934
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30029418 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 30029517  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  30029518 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 30029617  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  30029618 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 30029717  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30029718 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 30029817  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30029818 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatctt 30029917  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  30029918 ctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324472
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
     || || || ||||| |||||| | || || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 13324677  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13324676 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 13324577  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  13324576 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 13324477  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  13324476 gatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 517
Target Start/End: Original strand, 23892212 - 23892725
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  23892212 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 23892311  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||    
T  23892312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctg 23892411  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  23892412 aagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtga 23892511  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    |  || | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23892512 acgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtt 23892611  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
     | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  23892612 taaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattattta 23892711  T
Q  504 actgttagtgatgt 517  Q
    ||||||||||||||    
T  23892712 actgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29967225 - 29966793
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29967225 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 29967126  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  29967125 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 29967026  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  29967025 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 29966926  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29966925 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 29966826  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatg 433  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  29966825 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 29966793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29888734
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||| | || || ||| |||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagta 29889034  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  29889033 catcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 29888934  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  29888933 attgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaacc 29888834  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
     |||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  29888833 gtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 29888734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Original strand, 22888476 - 22888990
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || | |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  22888476 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 22888575  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22888576 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 22888675  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22888676 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 22888775  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||  ||||    
T  22888776 acatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtt 22888875  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
       |||||||||||| |  |||| || |||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  22888876 tgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 22888975  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  22888976 actgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Original strand, 25199035 - 25199549
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25199035 atcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 25199134  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  25199135 gcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcttta 25199234  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  25199235 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 25199334  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||  ||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| |   ||||    
T  25199335 acatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtt 25199434  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
       ||||||||||||||  |||| || |||| |  ||||||||| ||| |||||    |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  25199435 tgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 25199534  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  25199535 actgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877739
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33877560  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  33877561 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 33877660  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    | |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  33877661 accatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 33877739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326253
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| ||| |     
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgatt 11326107  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   |||||    
T  11326108 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 11326207  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  11326208 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 11326253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184352
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13184597  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  13184596 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13184497  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  13184496 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 13184397  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 456  Q
    |||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    
T  13184396 atcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 13184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440197
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||| | || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13440443  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| ||| |     
T  13440442 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13440343  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||| |||| |  |||||   |||||    
T  13440342 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctgtttgaccatg 13440243  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  13440242 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 13440197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292821
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatg 294  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatg 33292821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 47247 - 46730
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47247 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 47148  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47147 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 47048  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47047 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 46948  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46947 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 46848  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46847 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataatttt 46748  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  46747 ttgactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 40331 - 39814
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40331 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 40232  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40231 caagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 40132  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40131 ttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 40032  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40031 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 39932  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39931 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgacgaatgataatttt 39832  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| | |||||||    
T  39831 ttgactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Original strand, 29760 - 30274
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29760 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 29859  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29860 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttg 29959  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29960 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaa 30059  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30060 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 30159  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30160 cagccatgatcacgccaagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 30259  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||    
T  30260 actgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4796956 - 4796439
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796956 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 4796857  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4796856 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 4796757  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4796756 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 4796657  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4796656 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 4796557  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796556 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 4796457  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4796456 ttgactgttagtgatgtc 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15893006 - 15892492
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15893006 atcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 15892907  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15892906 gcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 15892807  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15892806 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaa 15892707  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15892706 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 15892607  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892606 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 15892507  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||    
T  15892506 actgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 18330624 - 18331137
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330624 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 18330723  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330724 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 18330823  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18330824 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 18330923  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  18330924 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 18331023  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18331024 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgaaaatttt 18331123  T
Q  501 ttgactgttagtga 514  Q
    ||||||||||||||    
T  18331124 ttgactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 6192271 - 6192788
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192271 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 6192370  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6192371 caagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 6192470  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6192471 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 6192570  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6192571 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 6192670  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192671 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 6192770  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6192771 ttgactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 8295927 - 8296444
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8295927 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacaggg 8296026  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8296027 caagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 8296126  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8296127 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 8296226  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8296227 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 8296326  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8296327 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgatgatttt 8296426  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  8296427 ttgactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8301570 - 8301053
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301570 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 8301471  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8301470 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgct 8301371  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8301370 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 8301271  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8301270 taaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 8301171  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301170 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 8301071  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||| |||  ||||||||    
T  8301070 ttgattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15741397 - 15740883
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15741397 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 15741298  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15741297 caagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgct 15741198  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15741197 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 15741098  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15741097 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 15740998  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15740997 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatggatgataatttt 15740898  T
Q  501 ttgactgttagtgat 515  Q
    |||||||||||||||    
T  15740897 ttgactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 4721586 - 4722103
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4721586 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 4721685  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4721686 caagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacact 4721785  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  4721786 ttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttg 4721885  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4721886 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 4721985  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721986 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 4722085  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  4722086 ttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 35880721 - 35881234
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35880721 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacaggg 35880820  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35880821 caagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 35880920  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35880921 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 35881020  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35881021 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 35881120  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35881121 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgaaattttt 35881220  T
Q  501 ttgactgttagtga 514  Q
    ||||||||||||||    
T  35881221 ttgactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 18051217 - 18051734
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051217 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 18051316  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18051317 caagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 18051416  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18051417 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 18051516  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | || ||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18051517 tgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctct 18051616  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051617 gtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 18051716  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18051717 ttgactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29149058 - 29148541
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29149058 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 29148959  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29148958 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 29148859  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29148858 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 29148759  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29148758 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 29148659  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29148658 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattct 29148559  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  29148558 ttgactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387368
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22387571  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22387570 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 22387471  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387470 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 22387371  T
Q  512 tga 514  Q
    |||    
T  22387370 tga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18277355 - 18276839
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18277355 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 18277256  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  18277255 caagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 18277156  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18277155 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 18277056  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18277055 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 18276956  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18276955 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 18276856  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  18276855 ctgactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18307957 - 18307441
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18307957 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 18307858  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  18307857 caagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 18307758  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18307757 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 18307658  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18307657 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 18307558  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307557 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 18307458  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  18307457 ctgactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 7073167 - 7073683
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  7073167 aaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaagg 7073266  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  7073267 taagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 7073366  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7073367 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 7073466  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7073467 tgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 7073566  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073567 gttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 7073666  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  7073667 ctgactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18292656 - 18292140
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18292656 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 18292557  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  18292556 caagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 18292457  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18292456 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 18292357  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  18292356 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 18292257  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292256 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 18292157  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  18292156 ctgactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 28116257 - 28115741
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28116257 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28116158  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || |||    
T  28116157 caagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 28116058  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28116057 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 28115958  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28115957 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 28115858  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28115857 gttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 28115758  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  28115757 ctgactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 4416874 - 4417390
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4416874 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 4416973  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  4416974 caaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 4417073  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4417074 ttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 4417173  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  4417174 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcctctct 4417273  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4417274 gttcagccatgatcatgccaagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaaacttgatgaatgataatctt 4417373  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  4417374 ctgactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31964776 - 31964260
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31964776 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31964677  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  31964676 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 31964577  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31964576 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 31964477  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31964476 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccct 31964377  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31964376 gttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 31964277  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| || |||||    
T  31964276 ctgactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5609625 - 5609109
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5609625 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 5609526  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  5609525 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgct 5609426  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  5609425 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 5609326  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5609325 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 5609226  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5609225 gttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 5609126  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5609125 ctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 10396088 - 10396604
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  10396088 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacaggg 10396187  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10396188 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 10396287  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10396288 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 10396387  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  10396388 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctct 10396487  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396488 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 10396587  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  10396588 ctgactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 28339257 - 28339773
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28339257 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28339356  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  28339357 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 28339456  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  28339457 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 28339556  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28339557 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 28339656  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28339657 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 28339756  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  28339757 ctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021746
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28021540  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28021541 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 28021640  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  28021641 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcag 28021740  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  28021741 tgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 7996517 - 7997033
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7996517 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 7996616  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  7996617 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 7996716  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  7996717 ttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 7996816  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7996817 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 7996916  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7996917 gttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 7997016  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  7997017 ctgactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 10643025 - 10643541
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10643025 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 10643124  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10643125 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 10643224  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  10643225 ttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 10643324  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10643325 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 10643424  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10643425 gttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 10643524  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  10643525 ctgactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 21674648 - 21675164
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  21674648 aaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacaggg 21674747  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  21674748 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 21674847  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21674848 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 21674947  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21674948 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 21675047  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21675048 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 21675147  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  21675148 ctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 48465903 - 48466398
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48465903 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 48466002  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466003 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 48466102  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  48466103 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 48466202  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48466203 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 48466302  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48466303 gtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346474
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4346680  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4346679 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 4346580  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  4346579 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcag 4346480  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  4346479 tgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 47023408 - 47023924
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47023408 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 47023507  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  47023508 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 47023607  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  47023608 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactg 47023707  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||    
T  47023708 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctct 47023807  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47023808 gtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 47023907  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  47023908 ctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 36997359 - 36996864
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36997359 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 36997260  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997259 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaag 36997160  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  36997159 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 36997060  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36997059 aggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 36996960  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36996959 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18243210
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18242905  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18242906 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18243005  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18243006 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 18243105  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||    
T  18243106 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagt 18243205  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  18243206 gatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 8211714 - 8212209
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8211714 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgtt 8211813  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211814 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 8211913  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  8211914 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 8212013  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8212014 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 8212113  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212114 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 11110631 - 11110136
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11110631 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgtt 11110532  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110531 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 11110432  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||    
T  11110431 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtg 11110332  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11110331 aggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 11110232  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11110231 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20577129 - 20576634
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  20577129 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 20577030  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  20577029 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 20576930  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  20576929 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 20576830  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20576829 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 20576730  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20576729 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 67 - 517
Target Start/End: Original strand, 51782044 - 51782494
Alignment:
Q  67 tactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaagg 166  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||    
T  51782044 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 51782143  T
Q  167 cgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcat 266  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51782144 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 51782243  T
Q  267 gtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctgg 366  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51782244 gtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctgg 51782343  T
Q  367 tgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttca 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  51782344 tgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttca 51782443  T
Q  467 agacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  51782444 agacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542249
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6542454  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatga 412  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6542453 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 6542354  T
Q  413 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 512  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||    
T  6542353 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatttcctgaccgtcagt 6542254  T
Q  513 gatgt 517  Q
    |||||    
T  6542253 gatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5596637 - 5596144
Alignment:
Q  24 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5596637 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 5596538  T
Q  124 ctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
T  5596537 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 5596438  T
Q  224 cgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgag 323  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  5596437 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 5596338  T
Q  324 gcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagt 423  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5596337 gaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 5596238  T
Q  424 gcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5596237 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 57 - 517
Target Start/End: Original strand, 5466996 - 5467456
Alignment:
Q  57 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatt 156  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  5466996 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 5467095  T
Q  157 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 256  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5467096 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataa 5467195  T
Q  257 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 356  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5467196 tgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgca 5467295  T
Q  357 actcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  5467296 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgcc 5467395  T
Q  457 atactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  5467396 atgctgttcaaggcgatatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 18225146 - 18225662
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18225146 aaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 18225245  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  18225246 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 18225345  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  18225346 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactg 18225445  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18225446 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 18225545  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18225546 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttataccgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatctt 18225645  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  18225646 ctgactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870643
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22870849  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22870848 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 22870749  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  22870748 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcag 22870649  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  22870648 tgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885702
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22885908  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22885907 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 22885808  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  22885807 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcag 22885708  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  22885707 tgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 17985259 - 17984743
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17985259 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 17985160  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || |||    
T  17985159 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgct 17985060  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17985059 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 17984960  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  17984959 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctct 17984860  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  17984859 gttcagtcatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccatattgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgatgatctt 17984760  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     |||| || ||||||||    
T  17984759 ctgaccgtcagtgatgt 17984743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 29665252 - 29664757
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  29665252 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 29665153  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29665152 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 29665053  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  29665052 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 29664953  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29664952 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 29664853  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29664852 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 24328114 - 24328630
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24328114 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 24328213  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  24328214 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 24328313  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  24328314 ttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 24328413  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24328414 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 24328513  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24328514 gtttaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 24328613  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  24328614 ctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 5013667 - 5014183
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5013667 aaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 5013766  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  5013767 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5013866  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  5013867 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 5013966  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5013967 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 5014066  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5014067 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatctt 5014166  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5014167 ctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 50134374 - 50133990
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50134374 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 50134275  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  50134274 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 50134175  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  50134174 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 50134075  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagct 385  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50134074 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 67 - 395
Target Start/End: Original strand, 51797133 - 51797462
Alignment:
Q  67 tactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccca-ggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaag 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||    
T  51797133 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaag 51797232  T
Q  166 gcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgca 265  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  51797233 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccaca 51797332  T
Q  266 tgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctg 365  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51797333 tgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctg 51797432  T
Q  366 gtgcctctgcacattaagctgtgcaaagct 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51797433 gtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5713182 - 5713638
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5713182 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5713281  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5713282 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5713381  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5713382 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5713481  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || ||    
T  5713482 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctct 5713581  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5713582 gtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5724092 - 5724548
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5724092 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5724191  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5724192 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5724291  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5724292 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5724391  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || ||    
T  5724392 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctct 5724491  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5724492 gtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5724548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5768276 - 5767820
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5768276 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5768177  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5768176 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5768077  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5768076 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5767977  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || ||    
T  5767976 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctct 5767877  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5767876 gtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5767820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5757385 - 5757007
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5757385 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5757286  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5757285 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5757186  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5757185 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5757086  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacat 379  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  5757085 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacat 5757007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530860
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 18530550  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  18530551 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 18530650  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||    
T  18530651 attgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgacc 18530750  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||| || | || |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||    
T  18530751 atgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgt 18530850  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  18530851 cagcgatgtc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993631
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 17993877  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  17993876 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 17993777  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17993776 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 17993677  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17993676 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgcta 17993631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16626801 - 16626292
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||  ||||| || || ||| |||| | |||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  16626801 caagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16626702  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  16626701 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 16626602  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||| || |||    
T  16626601 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatg 16626502  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||    
T  16626501 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 16626402  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||  ||||  | |||| | | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  16626401 atgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 16626302  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  16626301 cagcgatgtc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32293196
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||| | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 32292914  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  32292915 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 32293014  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  32293015 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 32293114  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  32293115 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 32293196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31033931
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 31034110  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  31034109 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 31034010  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    |||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31034009 atcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 31033931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652849
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||  | ||| || || ||||||||||||||||||||  |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||| |||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 5652552  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |     
T  5652553 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgatt 5652652  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||    
T  5652653 gaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 5652752  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  5652753 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 5652849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 457
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626355
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 4626109  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  4626110 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 4626209  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    || | || ||||  |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | |||  ||| || |||||   |||||    
T  4626210 gaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctgtttgaccatg 4626309  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 457  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  4626310 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 4626355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 308
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439416
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 32439416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066305
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
     |  || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    || || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 20066305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893387
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| || ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| ||||||   || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T
Q  212 cgtgaaaaagct 223  Q
    ||| || |||||    
T  4893376 cgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 27286 - 27804
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27286 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27385  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27386 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 27485  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27486 ttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27585  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27586 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 27685  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattt 499  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27686 atttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgattaattt 27785  T
Q  500 tttgactgttagtgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27786 tttgactgttagtgatgtc 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 41793570 - 41793054
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41793570 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 41793471  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  41793470 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 41793371  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  41793370 ttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 41793271  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41793270 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 41793171  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41793170 gttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 41793071  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||| ||||    
T  41793070 ctgactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 10962663 - 10963179
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10962663 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacaggg 10962762  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  10962763 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 10962862  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10962863 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 10962962  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10962963 tgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 10963062  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10963063 gttcaatcatgatcatgccaagtgtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatctt 10963162  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  10963163 ctgactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 28584974 - 28585490
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28584974 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28585073  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  28585074 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 28585173  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28585174 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 28585273  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28585274 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 28585373  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28585374 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatctt 28585473  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  28585474 ctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 51638211 - 51638728
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  51638211 aaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcaggg 51638310  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  51638311 taagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 51638410  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  51638411 ttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 51638510  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||    
T  51638511 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctct 51638610  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638611 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatttt 51638710  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
     ||||||| |||||||||    
T  51638711 ctgactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16208290 - 16207776
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||| ||    
T  16208290 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaa 16208191  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16208190 acctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 16208091  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  16208090 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 16207991  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||    
T  16207990 acatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtt 16207891  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
       ||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  16207890 tgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttg 16207791  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  16207790 actgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 518
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461591
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20461281  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  20461282 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 20461381  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | || | || ||||  |||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||    
T  20461382 attgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgacc 20461481  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 508  Q
    ||||||||||||  || | || |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  20461482 atgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 20461581  T
Q  509 tagtgatgtc 518  Q
     || ||||||    
T  20461582 cagcgatgtc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20340594 - 20340080
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  20340594 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 20340495  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20340494 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 20340395  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20340394 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 20340295  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||    
T  20340294 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 20340195  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
       ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  20340194 tgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 20340095  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  20340094 actgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152344
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 28152062  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  28152063 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 28152162  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagcc 408  Q
     | ||   || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||    
T  28152163 attgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 28152262  T
Q  409 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28152263 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 28152344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 8812
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9328 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 9229  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  9228 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 9129  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  9128 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctg 9029  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9028 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 8929  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8928 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 8829  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  8828 ctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 20009 - 20526
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20009 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 20108  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  20109 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 20208  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20209 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctg 20308  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20309 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctct 20408  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat-tt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20409 gttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctt 20508  T
Q  500 tttgactgttagtgatgt 517  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  20509 tctgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 30447 - 30964
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30447 aaaatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 30545  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  30546 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30645  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30646 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30745  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30746 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 30845  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataa-ttt 499  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30846 gtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatttt 30945  T
Q  500 tttgactgttagtgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  30946 tttgactgtcagtgatgtc 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20730
Alignment:
Q  9 caagctagacct-cctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagccc 107  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  20390 caagctagacctacctttccc-ccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcct 20488  T
Q  108 ccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20489 ccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagt 20588  T
Q  208 acatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatat 307  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  20589 acattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacat 20687  T
Q  308 ggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 350  Q
    | | || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20688 gattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 20730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7501 - 6985
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7501 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 7402  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  7401 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 7302  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  7301 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactg 7202  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7201 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 7102  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7101 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctt 7002  T
Q  501 ttgactgttagtgatgt 517  Q
     ||||||| ||||||||    
T  7001 ctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 6025 - 6524
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgtt-atatgctgagttgcttccgacttt-actccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccg 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6025 cttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccg 6124  T
Q  120 ttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttc-catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt-gaagtacatcgtgaa 217  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  6125 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaa 6224  T
Q  218 aaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaa 317  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||      
T  6225 gaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtg 6324  T
Q  318 tgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 417  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6325 tgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 6424  T
Q  418 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6425 ccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2093 - 1831
Alignment:
Q  87 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2093 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 1994  T
Q  187 aggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1993 aaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 1895  T
Q  287 aaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 350  Q
     ||||| || |||||||| ||| | || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1894 gaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 1
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctg-agttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagg 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  392 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagg 293  T
Q  100 gcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgc 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  292 gcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgc 193  T
Q  200 tttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgct 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  192 tttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgct 93  T
Q  300 gtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 391  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  92 gtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15192 - 14675
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15192 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 15093  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  15092 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 14993  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14992 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 14893  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccct 400  Q
    | ||| || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14892 tgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 14793  T
Q  401 gttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttt 500  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14792 gttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataacttt 14693  T
Q  501 ttgactgttagtgatgtc 518  Q
     ||||||| |||||||||    
T  14692 ctgactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26464 - 25947
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26464 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26365  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctccca-ggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  26364 taagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgc 26265  T
Q  200 tttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgct 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26264 tttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgct 26165  T
Q  300 gtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccc 399  Q
    || |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |    
T  26164 gtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctc 26065  T
Q  400 tgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 tgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattt 25965  T
Q  500 tttgactgttagtgatgt 517  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  25964 tctgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 517
Target Start/End: Original strand, 9571 - 10076
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9870  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg 411  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9871 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctgttcagccatg 9970  T
Q  412 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9971 atcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcag 10070  T
Q  512 tgatgt 517  Q
    ||||||    
T  10071 tgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 517
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8459
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7964 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgtt 8063  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||     
T  8064 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaa 8163  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  8164 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 8263  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8264 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaa 8363  T
Q  422 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8364 gtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46545
Alignment:
Q  9 caagctagacctccttt-ccctccgatacc-gatgttatatgctgagttgcttccgac---tttactccatagagg-acattgtacaacc-agacagggc 101  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  102 aa--gcccccacctgatccgttgcctcccaggttca-ggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc- 194  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||     
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcg 46873  T
Q  195 tacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaa-gctgactttt-gagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 292  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  293 tgccgctgtaaatatg-gtcgaagaatgtga-ggcagctcct-agacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgc 389  Q
    ||| ||||||||||||  || ||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  46772 tgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgc 46673  T
Q  390 aaagcttccctgttcagccatg-atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc-tttgggttgctatactgttcaaga-cgacatcc-aaagcttg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  46672 aaagcttctctgttcagccatgaatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatccttttgggttgctttactgttcaagattgacatccaaaagcttg 46573  T
Q  486 atgaatgataa-ttttttgactgttagt 512  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46572 atgaatgataatttttttgactgttagt 46545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2917 - 2403
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  2917 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 2818  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2817 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 2718  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  2717 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 2618  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 403  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||    
T  2617 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 2518  T
Q  404 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 503  Q
       ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  2517 tgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 2418  T
Q  504 actgttagtgatgtc 518  Q
    ||||| || ||||||    
T  2417 actgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 5
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || ||  |||||||||| |||||||| |    
T  282 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctc 183  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  182 cacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 83  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  82 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 490
Target Start/End: Original strand, 21581 - 22044
Alignment:
Q  27 cctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc 126  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  21581 cctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctc 21680  T
Q  127 ccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 226  Q
    |||||||| | || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || || |||||| |    
T  21681 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcat 21780  T
Q  227 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggca 326  Q
    ||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    | |||   |    
T  21781 tgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaa 21880  T
Q  327 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 426  Q
    | |||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| ||||    
T  21881 gttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcc 21980  T
Q  427 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 490  Q
     || |||||  | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  21981 cagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 383
Alignment:
Q  153 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgaga 252  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  253 ataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgt 352  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    | ||| | || ||| || ||||| |||||||| ||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgt 529  T
Q  353 cgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggt 452  Q
     |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||  ||| ||||   ||||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| ||||    
T  528 tgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggt 429  T
Q  453 tgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 498  Q
    || ||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  428 tgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaatgacaatt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Original strand, 518 - 595
Alignment:
Q  440 taatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 517  Q
    |||||| |||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  518 taatcccttgggttgccgcattgtgcaagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University