View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_158 (Length: 310)

Name: NF7829A_low_158
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_158
NF7829A_low_158
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-204)||(6110064-6110267)
chr3 (1-204)||(10572596-10572799)
chr3 (1-204)||(15600888-15601091)
chr3 (1-204)||(15607433-15607636)
chr3 (1-201)||(13211305-13211505)
chr3 (1-204)||(13248607-13248810)
chr3 (1-202)||(16482487-16482688)
chr3 (1-198)||(17781122-17781319)
chr3 (1-198)||(10579359-10579556)
chr3 (1-202)||(18522665-18522866)
chr3 (1-204)||(15357590-15357793)
chr3 (18-204)||(8490488-8490674)
chr3 (1-202)||(18519980-18520178)
chr3 (1-198)||(19089749-19089946)
chr3 (1-185)||(15342223-15342407)
chr3 (1-202)||(17200188-17200389)
chr3 (1-202)||(13516813-13517014)
chr3 (43-204)||(18640792-18640953)
chr3 (3-198)||(32056906-32057101)
chr3 (1-198)||(1647525-1647726)
chr3 (16-184)||(16200145-16200313)
chr3 (12-204)||(29924971-29925163)
chr3 (12-204)||(29974124-29974316)
chr3 (16-184)||(16200451-16200619)
chr3 (3-197)||(24253394-24253589)
chr3 (1-98)||(17136465-17136562)
chr3 (240-296)||(6109972-6110028)
chr3 (240-296)||(8490396-8490452)
chr3 (240-296)||(13248515-13248571)
chr3 (140-202)||(18534758-18534820)
chr3 (240-296)||(13211211-13211267)
chr3 (240-296)||(18640989-18641045)
chr3 (240-296)||(17136137-17136193)
chr3 (246-296)||(10579603-10579653)
chr3 (240-296)||(15607672-15607729)
chr3 (240-296)||(15351237-15351293)
chr3 (240-296)||(15357829-15357885)
chr3 (240-296)||(16482727-16482782)
chr3 (240-296)||(17200427-17200483)
chr3 (240-296)||(18519885-18519941)
chr3 (246-296)||(10572840-10572890)
chr3 (240-297)||(1647768-1647825)
chr3 (240-296)||(15601127-15601184)
chr3 (157-202)||(18510924-18510969)
chr3 (240-296)||(13516719-13516775)
chr3 (240-296)||(17781358-17781414)
chr3 (240-296)||(19089985-19090041)
chr3 (240-296)||(32057144-32057200)
chr3 (240-296)||(18510829-18510885)
chr3 (240-296)||(18522570-18522626)
chr3 (240-288)||(18534671-18534719)
chr3 (240-296)||(29924879-29924935)
chr3 (240-296)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (1-204)||(2325-2528)
scaffold0234 (1-204)||(11216-11419)
scaffold0234 (240-296)||(2564-2620)
scaffold0234 (240-296)||(11455-11511)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (1-204)||(19926764-19926967)
chr4 (1-204)||(26970463-26970666)
chr4 (1-204)||(55612683-55612886)
chr4 (1-204)||(868597-868800)
chr4 (1-204)||(5707320-5707523)
chr4 (1-204)||(26963640-26963843)
chr4 (1-202)||(18262214-18262415)
chr4 (1-204)||(5713948-5714151)
chr4 (1-204)||(10621337-10621540)
chr4 (1-204)||(10628416-10628619)
chr4 (1-184)||(18269093-18269276)
chr4 (1-202)||(28393138-28393339)
chr4 (1-202)||(4426608-4426808)
chr4 (1-192)||(8845215-8845406)
chr4 (1-192)||(8858179-8858370)
chr4 (89-204)||(12357136-12357251)
chr4 (5-196)||(20311299-20311491)
chr4 (1-198)||(10677559-10677753)
chr4 (1-198)||(10891199-10891393)
chr4 (12-198)||(5668140-5668327)
chr4 (240-300)||(19927003-19927063)
chr4 (5-202)||(5616215-5616414)
chr4 (240-296)||(5713856-5713912)
chr4 (240-296)||(26963548-26963604)
chr4 (240-296)||(26970371-26970427)
chr4 (4-198)||(35223576-35223760)
chr4 (240-296)||(5707228-5707284)
chr4 (240-296)||(10621576-10621632)
chr4 (240-296)||(12357044-12357100)
chr4 (240-294)||(868507-868561)
chr4 (240-298)||(17142372-17142430)
chr4 (240-296)||(10628655-10628711)
chr4 (240-296)||(55612594-55612650)
chr4 (242-296)||(28393380-28393434)
chr4 (240-297)||(4426847-4426904)
chr4 (240-296)||(18268976-18269032)
chr4 (88-155)||(39074278-39074346)
chr4 (240-289)||(55992680-55992729)
chr4 (240-281)||(5668371-5668412)
chr4 (240-288)||(8845118-8845166)
chr4 (240-288)||(8858082-8858130)
chr4 (240-280)||(18262136-18262176)
chr4 (95-178)||(21454235-21454319)
chr4 (95-154)||(11161913-11161972)
chr4 (240-294)||(20311207-20311261)
chr4 (240-288)||(24699958-24700006)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (1-204)||(18252030-18252233)
chr1 (1-204)||(18532518-18532721)
chr1 (1-204)||(27131413-27131616)
chr1 (1-202)||(21171237-21171438)
chr1 (1-202)||(27310581-27310782)
chr1 (1-202)||(16359039-16359240)
chr1 (1-198)||(36816637-36816834)
chr1 (1-204)||(3855923-3856126)
chr1 (1-204)||(22657225-22657429)
chr1 (4-198)||(27277564-27277756)
chr1 (240-299)||(18532757-18532816)
chr1 (240-297)||(18251935-18251992)
chr1 (12-170)||(12006554-12006712)
chr1 (5-170)||(12014292-12014457)
chr1 (240-296)||(27310821-27310877)
chr1 (240-296)||(16359280-16359336)
chr1 (240-296)||(21171479-21171535)
chr1 (6-192)||(9917927-9918106)
chr1 (243-288)||(36816881-36816926)
chr1 (240-296)||(3856164-3856220)
chr1 (244-296)||(22657469-22657521)
chr1 (240-296)||(27131652-27131704)
chr1 (97-174)||(3403248-3403325)
chr1 (97-174)||(3443494-3443571)
chr1 (129-198)||(30720625-30720694)
chr1 (240-296)||(27277800-27277856)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-204)||(18288-18491)
scaffold0220 (240-296)||(18196-18252)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (1-204)||(29327784-29327987)
chr7 (1-204)||(11536066-11536269)
chr7 (1-204)||(11542984-11543187)
chr7 (1-202)||(15152445-15152646)
chr7 (1-202)||(15148144-15148345)
chr7 (1-202)||(18561009-18561210)
chr7 (1-202)||(12750828-12751029)
chr7 (1-198)||(12738542-12738739)
chr7 (12-202)||(18257857-18258047)
chr7 (16-198)||(13392157-13392338)
chr7 (240-298)||(12738441-12738499)
chr7 (1-182)||(2364917-2365097)
chr7 (240-297)||(2653275-2653332)
chr7 (240-296)||(11543223-11543279)
chr7 (240-296)||(11536305-11536361)
chr7 (240-296)||(12750733-12750789)
chr7 (240-296)||(15152350-15152406)
chr7 (241-296)||(29327690-29327745)
chr7 (111-198)||(39111819-39111905)
chr7 (12-171)||(7396221-7396381)
chr7 (240-296)||(15148049-15148105)
chr7 (87-130)||(3132748-3132791)
chr7 (241-296)||(13392030-13392085)
chr7 (89-154)||(10234179-10234244)
chr7 (240-296)||(18258087-18258143)
chr7 (240-296)||(18560913-18560969)
chr7 (172-204)||(2653207-2653239)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-204)||(27381256-27381459)
chr6 (1-204)||(27471639-27471842)
chr6 (1-202)||(17684473-17684674)
chr6 (1-204)||(29308890-29309093)
chr6 (1-204)||(29315850-29316053)
chr6 (1-202)||(16566324-16566525)
chr6 (1-204)||(17691444-17691647)
chr6 (1-202)||(188981-189182)
chr6 (1-202)||(25537163-25537364)
chr6 (1-202)||(11651725-11651926)
chr6 (1-202)||(13359273-13359474)
chr6 (240-294)||(17691683-17691737)
chr6 (1-165)||(20553591-20553755)
chr6 (240-296)||(27381495-27381551)
chr6 (240-296)||(27471878-27471934)
chr6 (240-296)||(29308798-29308854)
chr6 (240-296)||(29315758-29315814)
chr6 (240-296)||(17684712-17684768)
chr6 (242-296)||(11651630-11651684)
chr6 (240-296)||(25537405-25537461)
chr6 (12-185)||(8509941-8510115)
chr6 (1-166)||(17850499-17850663)
chr6 (12-181)||(27925772-27925946)
chr6 (240-288)||(13359512-13359560)
chr6 (240-288)||(16566563-16566611)
chr6 (142-197)||(31258065-31258120)
chr6 (240-297)||(189221-189281)
chr6 (240-282)||(16394484-16394526)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (1-204)||(6938-7141)
scaffold0390 (1-204)||(13954-14157)
scaffold0390 (240-296)||(7177-7233)
scaffold0390 (240-296)||(14193-14249)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-204)||(21940665-21940868)
chr8 (3-202)||(28554885-28555084)
chr8 (1-202)||(22171491-22171690)
chr8 (5-198)||(6094129-6094322)
chr8 (1-198)||(24642655-24642852)
chr8 (71-198)||(24636860-24636987)
chr8 (240-299)||(22070105-22070164)
chr8 (240-296)||(21940573-21940629)
chr8 (240-296)||(6094031-6094087)
chr8 (240-296)||(22171396-22171452)
chr8 (244-296)||(24642556-24642608)
chr8 (240-296)||(28554791-28554847)
chr8 (1-192)||(38232381-38232570)
chr8 (125-183)||(2375027-2375085)
chr8 (13-174)||(32872857-32873019)
chr8 (103-166)||(10920234-10920297)
chr8 (243-296)||(2374947-2375000)
chr8 (259-296)||(24636605-24636642)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1-204)||(21330252-21330455)
chr2 (1-185)||(18796525-18796709)
chr2 (6-202)||(18619807-18620002)
chr2 (59-198)||(19692598-19692737)
chr2 (12-139)||(20977957-20978084)
chr2 (240-298)||(21330493-21330551)
chr2 (1-170)||(36270199-36270369)
chr2 (12-170)||(18822115-18822275)
chr2 (240-296)||(19692773-19692829)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (1-204)||(7107-7310)
scaffold0433 (240-296)||(7015-7071)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-204)||(24695470-24695673)
chr5 (1-204)||(18569867-18570070)
chr5 (1-202)||(19714502-19714703)
chr5 (1-198)||(19707222-19707419)
chr5 (16-199)||(27347497-27347679)
chr5 (12-198)||(22547031-22547217)
chr5 (95-204)||(39537962-39538071)
chr5 (19-200)||(17285754-17285935)
chr5 (240-296)||(24695709-24695765)
chr5 (240-296)||(19714742-19714798)
chr5 (95-198)||(31886537-31886640)
chr5 (240-296)||(19707462-19707518)
chr5 (240-296)||(27347722-27347778)
chr5 (1-138)||(18807038-18807175)
chr5 (1-91)||(39538701-39538791)
chr5 (19-200)||(17298907-17299088)
chr5 (88-178)||(33477389-33477479)
chr5 (240-288)||(18570108-18570156)
chr5 (241-296)||(39537870-39537925)
chr5 (86-154)||(11479420-11479489)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (1-204)||(993-1196)
scaffold0657 (240-297)||(900-957)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-204)||(25994-26197)
scaffold0186 (241-296)||(26231-26286)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-202)||(5531-5732)
scaffold0063 (240-288)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (21-202)||(230365-230545)
scaffold0008 (240-296)||(230584-230640)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (240-296)||(23769-23825)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (140-204)||(8446-8510)
scaffold0176 (240-296)||(8546-8602)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (240-296)||(16523-16579)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (240-296)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (240-296)||(8944-9000)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (240-294)||(10202-10256)
scaffold0565 (154-185)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (260-296)||(1-37)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (244-296)||(5878-5930)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (103-175)||(92194-92267)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6110267 - 6110064
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110267 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 6110168  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6110167 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 6110068  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  6110067 ttgt 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 10572596 - 10572799
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572596 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 10572695  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10572696 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 10572795  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  10572796 ttgt 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15600888 - 15601091
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600888 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 15600987  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15600988 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 15601087  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  15601088 ttgt 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15607433 - 15607636
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607433 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 15607532  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15607533 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 15607632  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  15607633 ttgt 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13211505 - 13211305
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211505 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 13211406  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13211405 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 13211306  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  13211305 t 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13248810 - 13248607
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248810 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 13248711  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13248710 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 13248611  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  13248610 ttgt 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16482487 - 16482688
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16482487 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatg 16482586  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16482587 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 16482686  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  16482687 tt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17781122 - 17781319
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781122 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 17781221  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17781222 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10579359 - 10579556
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579359 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 10579458  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10579459 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18522866 - 18522665
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18522866 tcagtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatg 18522767  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18522766 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18522667  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  18522666 tt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15357590 - 15357793
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15357590 tcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatg 15357689  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15357690 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 15357789  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  15357790 ttgt 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490488
Alignment:
Q  18 tagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  118 tatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgccttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18520178 - 18519980
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |    
T  18520178 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacg 18520082  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18520081 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18519982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19089749 - 19089946
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  19089749 tcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaag 19089848  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19089849 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 15342223 - 15342407
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15342223 tcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatg 15342322  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342323 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17200188 - 17200389
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  17200188 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaag 17200287  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17200288 gggtatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 17200387  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  17200388 tt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13517014 - 13516813
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  13517014 tcagtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacg 13516915  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13516914 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 13516815  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  13516814 tt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  43 cacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  143 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgccttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 32056906 - 32057101
Alignment:
Q  3 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  32056906 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacggg 32057005  T
Q  103 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32057006 gtcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1647525 - 1647726
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  1647525 tcagtctatccacataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacg 1647624  T
Q  101 gggtctcacaattaag----ttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaa 196  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1647625 gggtctcacaattaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 1647724  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  1647725 tg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200145
Alignment:
Q  16 aatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  116 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaa 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa 16200145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgccttgt 204  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgccttgt 204  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200451
Alignment:
Q  16 aatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 115  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  116 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaa 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa 16200451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 24253394 - 24253589
Alignment:
Q  3 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  24253394 agtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatggg 24253493  T
Q  103 g-tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaat 197  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24253494 gatctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17136562 - 17136465
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaa 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17136562 tcagtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  140 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Original strand, 10579603 - 10579653
Alignment:
Q  246 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579603 acaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200483
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Original strand, 10572840 - 10572890
Alignment:
Q  246 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572840 acaaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  157 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781414
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090041
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 2325 - 2528
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 2424  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2425 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 2524  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  2525 ttgt 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11216 - 11419
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 11315  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11316 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 11415  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  11416 ttgt 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19926764 - 19926967
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926764 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 19926863  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19926864 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 19926963  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  19926964 ttgt 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26970666 - 26970463
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970666 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 26970567  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26970566 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 26970467  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  26970466 ttgt 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55612886 - 55612683
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55612886 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatg 55612787  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55612786 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 55612687  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  55612686 ttgt 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 868800 - 868597
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  868800 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacg 868701  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  868700 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 868601  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  868600 ttgt 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5707523 - 5707320
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707523 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 5707424  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5707423 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 5707324  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  5707323 ttgt 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26963843 - 26963640
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963843 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 26963744  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26963743 gggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 26963644  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  26963643 ttgt 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18262415 - 18262214
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18262415 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacg 18262316  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18262315 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18262216  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  18262215 tt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5714151 - 5713948
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714151 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 5714052  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5714051 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 5713952  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  5713951 ttgt 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 10621337 - 10621540
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621337 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 10621436  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10621437 ggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 10621536  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  10621537 ttgt 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 10628416 - 10628619
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628416 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 10628515  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10628516 ggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 10628615  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  10628616 ttgt 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18269276 - 18269093
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18269276 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacg 18269177  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269176 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaa 18269093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 28393138 - 28393339
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28393138 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatg 28393237  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28393238 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcc 28393337  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  28393338 tt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4426608 - 4426808
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  4426608 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgtttaacg 4426706  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4426707 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 4426806  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  4426807 tt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8845406 - 8845215
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8845406 tcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacg 8845307  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaa 192  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8845306 ggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8858370 - 8858179
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8858370 tcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacg 8858271  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaa 192  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8858270 ggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  89 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  189 taaagaaatgccttgt 204  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20311491 - 20311299
Alignment:
Q  5 tctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 104  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  20311491 tctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatggggt 20311392  T
Q  105 ctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaa 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20311391 ctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10677559 - 10677753
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || | || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||    
T  10677559 tcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatg 10677656  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    || |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  10677657 gg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10891199 - 10891393
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || | || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||    
T  10891199 tcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatg 10891296  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    || |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  10891297 gg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 5668140 - 5668327
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcac 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || | |  ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   ||||||||| ||||||    
T  5668140 acataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcac 5668238  T
Q  110 aattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
     ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5668239 gattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 300
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927063
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 19927063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5616414 - 5616215
Alignment:
Q  5 tctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||  || ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||| |||    
T  5616414 tctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacggg 5616315  T
Q  103 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
     |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5616314 atctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35223760 - 35223576
Alignment:
Q  4 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 103  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||   ||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  |||            
T  35223760 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgtt-------- 35223669  T
Q  104 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
      | || ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  35223668 --ttacgattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 298
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142430
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacata 17142430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  242 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426904
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacat 4426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 155
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  88 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 155  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 281
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 281  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 21454235 - 21454319
Alignment:
Q  95 ttaatggggtctcacaattaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454235 ttaatggggtctcaatattaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  95 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20311261 - 20311207
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20311261 catgatacaaagccaaatccaatgaatacagattggctattacagcttactccaa 20311207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24700006 - 24699958
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24700006 catgatacaaaaccaaattcaatcaatatagattggttattcgggctta 24699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18252233 - 18252030
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252233 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 18252134  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18252133 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18252034  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  18252033 ttgt 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18532518 - 18532721
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532518 tcagtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 18532617  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18532618 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18532717  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  18532718 ttgt 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27131413 - 27131616
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131413 tcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 27131512  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27131513 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 27131612  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  27131613 ttgt 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 21171237 - 21171438
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  21171237 tcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacg 21171336  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21171337 gggtctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 21171436  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  21171437 tt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 27310581 - 27310782
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  27310581 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacg 27310680  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27310681 tggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 27310780  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  27310781 tt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16359039 - 16359240
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16359039 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacg 16359138  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16359139 gggtctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 16359238  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  16359239 tt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36816637 - 36816834
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  36816637 tcagtctatccacataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacg 36816736  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36816737 gagtctcacaattaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 3855923 - 3856126
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  3855923 tcagtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatg 3856022  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3856023 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgcc 3856122  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  3856123 ttgt 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22657225 - 22657429
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||  || ||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  22657225 tcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaag 22657324  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcgataaagaaatgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  22657325 gggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatgt 22657424  T
Q  200 cttgt 204  Q
    |||||    
T  22657425 cttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 27277564 - 27277756
Alignment:
Q  4 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||||   ||    
T  27277564 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaa-aagg 27277662  T
Q  104 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||| | ||||||| | || ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27277663 tctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 299
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532816
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 18532816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 12006554 - 12006712
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    |||||| | |||||| | ||||||| || ||| |||| ||  || ||||||||||| ||  ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12006554 acataacaatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacga 12006653  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 170  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006654 ttaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 12014292 - 12014457
Alignment:
Q  5 tctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 104  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||  || ||| |||| ||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||   || |||||||||||||| |    
T  12014292 tctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggat 12014391  T
Q  105 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 170  Q
    || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014392 ctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 9917927 - 9918106
Alignment:
Q  6 ctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| || |||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||    
T  9917927 ctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tc 9918025  T
Q  106 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaa 192  Q
    ||   || |||||||||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9918026 tcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816926
Alignment:
Q  243 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657521
Alignment:
Q  244 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  97 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 174  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  97 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 174  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  129 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18491 - 18288
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18491 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 18392  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18391 gggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18292  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  18291 ttgt 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29327987 - 29327784
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327987 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 29327888  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29327887 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 29327788  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  29327787 ttgt 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11536066 - 11536269
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11536066 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatg 11536165  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11536166 gggtctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 11536265  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  11536266 ttgt 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11542984 - 11543187
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11542984 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatg 11543083  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  11543084 gggtctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgca 11543183  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  11543184 ttgt 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15152646 - 15152445
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  15152646 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacg 15152547  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15152546 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcc 15152447  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  15152446 tt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15148345 - 15148144
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15148345 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacg 15148246  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15148245 gggtctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcc 15148146  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  15148145 tt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18561210 - 18561009
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  18561210 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacg 18561111  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18561110 gggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 18561011  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  18561010 tt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12751029 - 12750828
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  12751029 tcagtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacg 12750930  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12750929 aggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 12750830  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  12750829 tt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12738739 - 12738542
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  12738739 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaaca 12738640  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12738639 aggtctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 18257857 - 18258047
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || || || ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18257857 acataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggtctcacaa 18257956  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18257957 ttaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  16 aatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||  ||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  116 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738441
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacata 12738441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2365097 - 2364917
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || | || ||| ||| || | ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  ||||||||    
T  2365097 tcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatg 2364999  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 182  Q
    || |||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2364998 ggttctcacgattaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  241 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  111 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |  | ||| ||  || ||||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  87 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  241 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  89 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 154  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 204
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  172 aaacaaaacaaaatcgataaagaaatgccttgt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27381256 - 27381459
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27381256 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatg 27381355  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27381356 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 27381455  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  27381456 ttgt 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27471639 - 27471842
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27471639 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatg 27471738  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27471739 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 27471838  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  27471839 ttgt 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17684473 - 17684674
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17684473 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacg 17684572  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17684573 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 17684672  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  17684673 tt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29309093 - 29308890
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309093 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 29308994  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29308993 ggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 29308894  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  29308893 ttgt 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29316053 - 29315850
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316053 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 29315954  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29315953 ggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 29315854  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  29315853 ttgt 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16566324 - 16566525
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16566324 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacg 16566423  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16566424 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 16566523  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  16566524 tt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17691444 - 17691647
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17691444 tcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatg 17691543  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17691544 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 17691643  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  17691644 ttgt 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 188981 - 189182
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  188981 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatg 189080  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  189081 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 189180  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  189181 tt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 25537163 - 25537364
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25537163 tcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacg 25537262  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25537263 gggtctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 25537362  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  25537363 tt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11651926 - 11651725
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11651926 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatg 11651827  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11651826 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcc 11651727  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  11651726 tt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13359273 - 13359474
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||    
T  13359273 tcagtctatccatataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatg 13359372  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13359373 gagtttcacgattaagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcc 13359472  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  13359473 tt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 20553591 - 20553755
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  || | |||||| ||| |||  || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||||||    
T  20553591 tcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatg 20553690  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 165  Q
    || |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553691 ggatctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381551
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471934
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  242 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcaca 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || | || |||  || ||||||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  111 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 185  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 17850499 - 17850663
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| ||    ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||     
T  17850499 tcagtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaatt 17850597  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 166  Q
    || | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850598 ggatatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27925946 - 27925772
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||  |||||||  || |||| |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||| |    
T  27925946 acataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcacga 27925847  T
Q  112 ttaagttatac--ttaat---gttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 181  Q
    |||||| | ||  |||||   ||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925846 ttaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 197
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  142 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaat 197  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189281
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacat 189281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 282
Target Start/End: Original strand, 16394484 - 16394526
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattag 282  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16394484 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattgtctattag 16394526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 6938 - 7141
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6938 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaata 7037  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7038 gggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 7137  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  7138 ttgt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13954 - 14157
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13954 tcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 14053  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14054 gggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 14153  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  14154 ttgt 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21940868 - 21940665
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940868 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 21940769  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21940768 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgca 21940669  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  21940668 ttgt 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28554885
Alignment:
Q  3 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 28554985  T
Q  103 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28554984 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22171690 - 22171491
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22171690 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatg 22171593  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22171592 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcc 22171493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6094322 - 6094129
Alignment:
Q  5 tctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 104  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  6094322 tctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggt 6094223  T
Q  105 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6094222 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24642852 - 24642655
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24642852 tcagtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacg 24642753  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24642752 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  71 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  171 gaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070105
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 22070105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642556
Alignment:
Q  244 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 38232381 - 38232570
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||   || | |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  ||| ||||||||    
T  38232381 tcagtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaatg 38232479  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaa 192  Q
    | || |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38232480 gagtgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  125 aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 183  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  13 cataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  113 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  103 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 166  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2375000 - 2374947
Alignment:
Q  243 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||    
T  2375000 gatacaaagccaaatccaatcaatacatatttattattagggcttattccaaca 2374947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  259 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21330252 - 21330455
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330252 tcagtccacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 21330351  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21330352 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 21330451  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  21330452 ttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18796709 - 18796525
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| || |    
T  18796709 tcagtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaag 18796610  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 185  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18796609 aggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaat 18796525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18620002 - 18619807
Alignment:
Q  6 ctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 105  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  || |||  ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  18620002 ctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tc 18619904  T
Q  106 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
    ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18619903 tcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  59 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 158  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  159 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977957
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttccattaaac 139  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 298
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330551
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 21330551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36270369 - 36270199
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| || || |||||||||    
T  36270369 tcagtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgtttaatg 36270270  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga-ctaactattctagggactttattatttt 170  Q
      ||||||| ||||||| | ||||||  || |||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270269 atgtctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18822275 - 18822115
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |    
T  18822275 acataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacga 18822176  T
Q  112 ttaagttatacttaatgtt-ccatt-aaacggactaactattctagggactttattatttt 170  Q
    |||||  | ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822175 ttaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7310 - 7107
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7310 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatg 7211  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7210 gggtctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatacc 7111  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  7110 ttgt 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 24695470 - 24695673
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24695470 tcagtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatg 24695569  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24695570 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 24695669  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  24695670 ttgt 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18569867 - 18570070
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  18569867 tcagtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacg 18569966  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18569967 gggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 18570066  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  18570067 ttgt 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19714502 - 19714703
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  19714502 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacg 19714601  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19714602 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcc 19714701  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  19714702 tt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19707222 - 19707419
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  19707222 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacg 19707321  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19707322 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  16 aatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  116 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgc 199  Q
    || | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 22547031 - 22547217
Alignment:
Q  12 acataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || | |||||| ||| |||| |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| ||||||| | |||||| |    
T  22547031 acataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgagatctcacga 22547130  T
Q  112 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  22547131 ttaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  95 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaaga 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  195 aatgccttgt 204  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  19 agtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 118  Q
    ||||| |||||||||||  || |||| ||| ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  119 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  95 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaaga 194  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  195 aatg 198  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 18807038 - 18807175
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtttaat 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |  ||||| ||| || |||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| ||||||    
T  18807038 tcagtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaat 18807136  T
Q  100 ggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 138  Q
    || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807137 ggtgtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 39538791 - 39538701
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcctta 91  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538791 tcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  19 agtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 118  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||||  ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  119 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 178
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  88 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 178  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  241 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  86 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1196 - 993
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1196 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatg 1097  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1096 gggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 997  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  996 ttgt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25994 - 26197
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25994 tcagtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 26093  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26094 gggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtc 26193  T
Q  201 ttgt 204  Q
    ||||    
T  26194 ttgt 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  241 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5732 - 5531
Alignment:
Q  1 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  5732 tcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacg 5633  T
Q  101 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5632 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcc 5533  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  5532 tt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  21 tctctatgctttaatgataccccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  121 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgcctt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  140 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcgataaagaaatgccttgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16523
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  240 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 294  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 185
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  154 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 296
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  260 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5878
Alignment:
Q  244 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 296  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  103 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaac 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University