View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_178 (Length: 297)

Name: NF7829A_low_178
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_178
NF7829A_low_178
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (26-297)||(29888732-29889003)
chr5 (21-293)||(23892451-23892723)
chr5 (25-293)||(22888715-22888983)
chr5 (25-297)||(33877488-33877760)
chr5 (25-293)||(25199274-25199542)
chr5 (26-297)||(11326035-11326306)
chr5 (26-296)||(13184299-13184568)
chr5 (21-295)||(24687802-24688076)
chr5 (21-295)||(22998759-22999033)
chr5 (21-295)||(23717633-23717907)
chr5 (26-296)||(13440144-13440414)
chr5 (21-295)||(23752095-23752369)
chr5 (29-295)||(11549597-11549863)
chr5 (21-295)||(33777730-33778004)
chr5 (21-295)||(18500375-18500649)
chr5 (21-295)||(30934876-30935150)
chr5 (26-295)||(9548193-9548462)
chr5 (21-295)||(15658405-15658679)
chr5 (21-294)||(24970262-24970535)
chr5 (21-295)||(28649478-28649752)
chr5 (21-295)||(43078495-43078769)
chr5 (21-295)||(6874548-6874822)
chr5 (21-295)||(12132398-12132672)
chr5 (21-295)||(33516599-33516873)
chr5 (21-295)||(9317694-9317968)
chr5 (21-295)||(13324474-13324748)
chr5 (21-295)||(18375057-18375331)
chr5 (21-295)||(24681683-24681957)
chr5 (21-295)||(24724210-24724484)
chr5 (21-295)||(30152261-30152535)
chr5 (21-295)||(31826052-31826326)
chr5 (21-295)||(37358288-37358562)
chr5 (24-295)||(41674952-41675223)
chr5 (21-295)||(3789784-3790058)
chr5 (21-295)||(5638153-5638427)
chr5 (21-295)||(31431683-31431957)
chr5 (21-295)||(40473194-40473468)
chr5 (21-295)||(2511294-2511568)
chr5 (21-295)||(30029658-30029932)
chr5 (21-295)||(37671128-37671402)
chr5 (21-293)||(30168714-30168986)
chr5 (21-295)||(26480635-26480908)
chr5 (21-295)||(34616761-34617035)
chr5 (115-295)||(29966805-29966985)
chr5 (21-295)||(32599117-32599391)
chr5 (21-295)||(37755223-37755497)
chr5 (21-295)||(37770632-37770906)
chr5 (69-295)||(8665168-8665394)
chr5 (21-295)||(15758502-15758776)
chr5 (21-295)||(28959431-28959705)
chr5 (21-293)||(33292770-33293042)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (25-293)||(16449636-16449904)
chr7 (25-297)||(39210661-39210933)
chr7 (25-293)||(16041560-16041828)
chr7 (25-297)||(26484927-26485199)
chr7 (25-297)||(2775592-2775864)
chr7 (26-297)||(4200780-4201051)
chr7 (26-297)||(2108644-2108915)
chr7 (25-296)||(26682638-26682909)
chr7 (26-296)||(31088103-31088373)
chr7 (26-296)||(45733694-45733964)
chr7 (21-295)||(10916502-10916776)
chr7 (21-295)||(2154808-2155082)
chr7 (22-295)||(11424412-11424684)
chr7 (21-297)||(16518050-16518326)
chr7 (21-295)||(16503014-16503288)
chr7 (22-295)||(5128227-5128500)
chr7 (21-295)||(26435492-26435766)
chr7 (21-295)||(26537504-26537778)
chr7 (21-295)||(24592175-24592449)
chr7 (21-295)||(3445541-3445815)
chr7 (21-295)||(5146974-5147248)
chr7 (69-295)||(11441807-11442033)
chr7 (21-295)||(26274728-26275002)
chr7 (21-295)||(31564024-31564298)
chr7 (21-295)||(9618886-9619160)
chr7 (21-295)||(16736094-16736368)
chr7 (21-295)||(16751148-16751422)
chr7 (21-295)||(17523767-17524041)
chr7 (21-295)||(17529174-17529448)
chr7 (21-295)||(26319503-26319777)
chr7 (21-295)||(26669548-26669822)
chr7 (21-295)||(31125155-31125429)
chr7 (21-295)||(4144757-4145031)
chr7 (21-295)||(45387578-45387852)
chr7 (21-293)||(18541036-18541308)
chr7 (21-181)||(26513130-26513290)
chr7 (21-293)||(5159756-5160028)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (25-293)||(21702905-21703173)
chr2 (25-296)||(19456162-19456433)
chr2 (25-295)||(22925769-22926039)
chr2 (26-296)||(27118917-27119187)
chr2 (26-296)||(3784883-3785153)
chr2 (21-295)||(28882444-28882718)
chr2 (26-296)||(34157239-34157509)
chr2 (26-296)||(34303045-34303315)
chr2 (25-296)||(16163828-16164102)
chr2 (21-295)||(9349719-9349993)
chr2 (21-295)||(27434181-27434455)
chr2 (21-295)||(12655772-12656046)
chr2 (26-296)||(31891070-31891340)
chr2 (21-295)||(20838148-20838422)
chr2 (21-295)||(23128303-23128577)
chr2 (21-295)||(27777452-27777726)
chr2 (21-295)||(27817210-27817484)
chr2 (21-295)||(37375391-37375665)
chr2 (21-295)||(12587040-12587314)
chr2 (21-295)||(13936281-13936555)
chr2 (21-295)||(27803937-27804211)
chr2 (21-295)||(32050028-32050302)
chr2 (21-295)||(34286584-34286858)
chr2 (21-295)||(34291644-34291918)
chr2 (21-295)||(39051559-39051833)
chr2 (21-295)||(16829075-16829349)
chr2 (21-295)||(16892132-16892406)
chr2 (21-295)||(12716339-12716613)
chr2 (21-295)||(260490-260764)
chr2 (21-295)||(11634923-11635197)
chr2 (21-295)||(11641112-11641386)
chr2 (21-295)||(34861910-34862184)
chr2 (21-295)||(37685646-37685920)
chr2 (21-295)||(37700911-37701185)
chr2 (21-295)||(37925723-37925997)
chr2 (21-295)||(19416236-19416510)
chr2 (21-295)||(39890304-39890578)
chr2 (21-295)||(40233741-40234015)
chr2 (21-295)||(31876511-31876785)
chr2 (69-295)||(21676967-21677193)
chr2 (194-293)||(27393201-27393300)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (25-293)||(2410-2678)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (25-293)||(16207783-16208051)
chr1 (25-293)||(20340087-20340355)
chr1 (25-297)||(28152093-28152365)
chr1 (25-278)||(20461331-20461584)
chr1 (21-295)||(51638451-51638725)
chr1 (48-295)||(41793083-41793330)
chr1 (21-295)||(10962903-10963177)
chr1 (21-295)||(28585214-28585488)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (25-297)||(14142980-14143252)
chr6 (25-297)||(26788173-26788445)
chr6 (25-297)||(27196546-27196818)
chr6 (25-297)||(27252422-27252694)
chr6 (25-297)||(13521768-13522040)
chr6 (25-293)||(22456638-22456897)
chr6 (21-295)||(13298642-13298916)
chr6 (21-293)||(27290061-27290333)
chr6 (26-296)||(28162887-28163157)
chr6 (26-296)||(33373952-33374222)
chr6 (26-296)||(8892007-8892277)
chr6 (26-296)||(8903242-8903512)
chr6 (22-295)||(26918611-26918884)
chr6 (21-293)||(22934571-22934843)
chr6 (21-293)||(23857016-23857288)
chr6 (21-295)||(26989232-26989507)
chr6 (21-295)||(29549706-29549980)
chr6 (21-295)||(15424008-15424282)
chr6 (21-295)||(16750085-16750359)
chr6 (21-295)||(24304309-24304583)
chr6 (21-295)||(24863948-24864222)
chr6 (21-297)||(17092131-17092407)
chr6 (21-295)||(27272271-27272545)
chr6 (21-295)||(30557707-30557981)
chr6 (21-295)||(34463037-34463311)
chr6 (25-295)||(3696312-3696582)
chr6 (21-295)||(4723825-4724099)
chr6 (21-295)||(16674370-16674644)
chr6 (21-295)||(27044619-27044893)
chr6 (21-295)||(29573244-29573518)
chr6 (21-295)||(4545466-4545740)
chr6 (21-295)||(4757995-4758269)
chr6 (21-295)||(28207685-28207959)
chr6 (21-295)||(16943718-16943992)
chr6 (21-295)||(26116101-26116375)
chr6 (21-295)||(27485360-27485634)
chr6 (21-295)||(4525517-4525791)
chr6 (21-295)||(4773237-4773511)
chr6 (21-295)||(27007958-27008232)
chr6 (21-295)||(29501646-29501920)
chr6 (21-295)||(27359683-27359957)
chr6 (21-295)||(27450026-27450300)
chr6 (21-201)||(27019461-27019641)
chr6 (21-295)||(26777301-26777580)
chr6 (145-295)||(17025508-17025658)
chr6 (193-295)||(20160932-20161034)
chr6 (193-295)||(22171797-22171899)
chr6 (205-295)||(27000304-27000394)
chr6 (21-295)||(27629391-27629665)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (25-297)||(31033910-31034182)
chr3 (25-297)||(32292945-32293217)
chr3 (25-296)||(18530582-18530853)
chr3 (25-296)||(16626299-16626570)
chr3 (26-296)||(5652581-5652851)
chr3 (26-295)||(5713422-5713691)
chr3 (26-295)||(5724332-5724601)
chr3 (26-295)||(5767767-5768036)
chr3 (21-295)||(18051457-18051731)
chr3 (26-296)||(17993578-17993848)
chr3 (21-295)||(6192511-6192785)
chr3 (21-295)||(15740883-15741157)
chr3 (21-297)||(8296165-8296441)
chr3 (26-296)||(4626138-4626408)
chr3 (21-295)||(4796442-4796716)
chr3 (21-295)||(29148544-29148818)
chr3 (22-295)||(18330864-18331137)
chr3 (21-295)||(4721826-4722100)
chr3 (21-295)||(8301056-8301330)
chr3 (21-293)||(7073409-7073681)
chr3 (21-295)||(15892495-15892769)
chr3 (22-295)||(35880961-35881234)
chr3 (21-295)||(18276841-18277115)
chr3 (21-295)||(18307443-18307717)
chr3 (21-295)||(28021470-28021744)
chr3 (22-295)||(22387368-22387641)
chr3 (21-295)||(18292142-18292416)
chr3 (21-295)||(11110138-11110412)
chr3 (21-295)||(20576636-20576910)
chr3 (21-295)||(48466122-48466396)
chr3 (89-295)||(5756940-5757145)
chr3 (21-295)||(8211933-8212207)
chr3 (21-295)||(18242934-18243208)
chr3 (21-295)||(28115743-28116017)
chr3 (21-295)||(29664759-29665033)
chr3 (21-295)||(51782218-51782492)
chr3 (21-295)||(4417114-4417388)
chr3 (21-295)||(21674888-21675162)
chr3 (21-295)||(36996866-36997140)
chr3 (69-295)||(5467180-5467406)
chr3 (21-295)||(6542251-6542525)
chr3 (21-295)||(10396328-10396602)
chr3 (21-295)||(24328354-24328628)
chr3 (21-295)||(5596146-5596420)
chr3 (21-295)||(4346476-4346750)
chr3 (21-295)||(5013907-5014181)
chr3 (21-295)||(5609111-5609385)
chr3 (21-295)||(47023648-47023922)
chr3 (21-295)||(18225386-18225660)
chr3 (21-295)||(22870645-22870919)
chr3 (21-295)||(22885704-22885978)
chr3 (21-295)||(28339497-28339771)
chr3 (48-295)||(17984772-17985019)
chr3 (48-295)||(31964289-31964536)
chr3 (21-295)||(7996757-7997031)
chr3 (21-295)||(10643265-10643539)
chr3 (141-295)||(51797308-51797462)
chr3 (21-293)||(32439351-32439623)
chr3 (151-295)||(50133990-50134134)
chr3 (119-293)||(20066240-20066414)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (25-296)||(15284680-15284951)
chr4 (25-290)||(15228124-15228389)
chr4 (25-293)||(1900508-1900776)
chr4 (21-295)||(14665267-14665541)
chr4 (26-296)||(24460358-24460628)
chr4 (21-295)||(24592062-24592336)
chr4 (21-295)||(17014249-17014523)
chr4 (25-293)||(15391090-15391358)
chr4 (21-293)||(14235273-14235545)
chr4 (21-295)||(36344263-36344537)
chr4 (21-295)||(14763052-14763326)
chr4 (21-295)||(18800361-18800635)
chr4 (21-295)||(6570102-6570376)
chr4 (21-295)||(21969950-21970224)
chr4 (21-295)||(31126266-31126540)
chr4 (21-295)||(40105386-40105660)
chr4 (21-295)||(54833636-54833910)
chr4 (21-295)||(30754003-30754277)
chr4 (21-295)||(33673546-33673820)
chr4 (21-297)||(5006120-5006396)
chr4 (21-295)||(27163065-27163339)
chr4 (21-295)||(14098790-14099064)
chr4 (21-295)||(39850887-39851161)
chr4 (21-293)||(24112913-24113185)
chr4 (21-293)||(34188708-34188980)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (25-295)||(18710820-18711090)
chr8 (26-296)||(19658752-19659022)
chr8 (21-295)||(16283683-16283957)
chr8 (25-297)||(44563332-44563603)
chr8 (26-296)||(33244898-33245168)
chr8 (21-295)||(16277788-16278062)
chr8 (25-293)||(22080589-22080857)
chr8 (21-297)||(19688330-19688606)
chr8 (21-295)||(27608612-27608886)
chr8 (21-295)||(14557858-14558132)
chr8 (21-295)||(2136966-2137240)
chr8 (21-295)||(3329214-3329488)
chr8 (21-295)||(19286696-19286970)
chr8 (21-295)||(19674675-19674949)
chr8 (21-295)||(19208067-19208341)
chr8 (21-295)||(28361662-28361936)
chr8 (21-295)||(29829556-29829830)
chr8 (21-295)||(31489457-31489731)
chr8 (110-295)||(189328-189513)
chr8 (21-295)||(12092431-12092705)
chr8 (21-295)||(33258957-33259231)
chr8 (21-296)||(9354856-9355131)
chr8 (71-295)||(31354758-31354982)
chr8 (21-140)||(18791096-18791215)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (21-295)||(46733-47007)
scaffold0089 (21-295)||(39817-40091)
scaffold0089 (21-295)||(29997-30271)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (26-293)||(21797-22064)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (25-293)||(370-638)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (21-295)||(30686-30961)
scaffold0124 (199-293)||(20623-20717)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (21-295)||(6248-6522)
scaffold0415 (199-293)||(1844-1938)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (21-295)||(27526-27801)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (21-295)||(9800-10074)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (21-295)||(6987-7261)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (21-295)||(14678-14952)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (21-295)||(8183-8457)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (21-295)||(8814-9088)
scaffold0159 (48-295)||(20249-20496)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (21-295)||(25949-26223)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (145-295)||(1-151)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (69-291)||(46593-46820)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (246-287)||(1-42)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (119-295)||(323-499)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (26-75)||(119651-119700)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Original strand, 29888732 - 29889003
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888732 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 29888831  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29888832 acggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctca 29888931  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888932 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 29889003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23892723 - 23892451
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  23892723 atcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggca 23892624  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23892623 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 23892524  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892523 cctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 23892451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22888983 - 22888715
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  22888983 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgat 22888884  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22888883 catggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctc 22888784  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888783 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 22888715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877488
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 33877561  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33877560 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 33877488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25199542 - 25199274
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  25199542 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgat 25199443  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25199442 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctc 25199343  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199342 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 25199274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11326035
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 11326107  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 11326035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 13184299 - 13184568
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||    
T  13184299 tgacagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 13184397  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13184398 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13184497  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  13184498 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 13184568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 24687802 - 24688076
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||  |||||    
T  24687802 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggca 24687901  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24687902 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 24688001  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24688002 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24688076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 22998759 - 22999033
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  22998759 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 22998858  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  22998859 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 22998958  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22998959 cttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 22999033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 23717633 - 23717907
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  23717633 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 23717732  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  23717733 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 23717832  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  23717833 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 23717907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440414
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13440343  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 13440414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 23752095 - 23752369
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  || |||| ||||||    
T  23752095 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggca 23752194  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  23752195 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 23752294  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  23752295 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 23752369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549597
Alignment:
Q  29 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatg 128  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  129 gttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 228  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  229 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11549663 atatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11549597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33778004 - 33777730
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  33778004 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 33777905  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  33777904 tgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 33777805  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  33777804 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 33777730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 18500375 - 18500649
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  18500375 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 18500474  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| | |    
T  18500475 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacaca 18500574  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  18500575 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 18500649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30935150 - 30934876
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  30935150 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 30935051  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  30935050 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 30934951  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30934950 cttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 30934876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548462
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||     
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 9548392  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9548393 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 9548462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 15658405 - 15658679
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  15658405 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 15658504  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  15658505 tgatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 15658604  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
      || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15658605 tttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 15658679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24970535 - 24970262
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  24970535 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 24970436  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  24970435 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgta 24970336  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtc 294  Q
    | |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24970335 ctttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtc 24970262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28649752 - 28649478
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  28649752 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 28649653  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  28649652 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 28649553  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28649552 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 28649478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43078769 - 43078495
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  43078769 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 43078670  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  43078669 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 43078570  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  43078569 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 43078495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6874822 - 6874548
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  6874822 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 6874723  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  6874722 tgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 6874623  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  6874622 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 6874548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12132672 - 12132398
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  || | || ||||||    
T  12132672 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggca 12132573  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  12132572 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 12132473  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12132472 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 12132398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33516873 - 33516599
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  33516873 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 33516774  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  33516773 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 33516674  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  33516673 cctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 33516599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9317968 - 9317694
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  9317968 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 9317869  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  9317868 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 9317769  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  9317768 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9317694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 13324474 - 13324748
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  13324474 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 13324573  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  13324574 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 13324673  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  13324674 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 13324748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 18375057 - 18375331
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | | || || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  18375057 atcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 18375156  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  18375157 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 18375256  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18375257 cttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18375331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24681957 - 24681683
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  24681957 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 24681858  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24681857 tgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacata 24681758  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24681757 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 24681683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24724484 - 24724210
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  24724484 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 24724385  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24724384 tgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacata 24724285  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24724284 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 24724210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30152535 - 30152261
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  30152535 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 30152436  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  30152435 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 30152336  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  30152335 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 30152261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 31826052 - 31826326
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  31826052 atcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 31826151  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  31826152 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacata 31826251  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31826252 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 31826326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 37358288 - 37358562
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || |||||||| || | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  37358288 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 37358387  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  37358388 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 37358487  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  37358488 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtca 37358562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41675223 - 41674952
Alignment:
Q  24 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatga 123  Q
    ||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  || | || |||||||||    
T  41675223 actgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatga 41675124  T
Q  124 tcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 223  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| ||| ||    
T  41675123 tcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatct 41675024  T
Q  224 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  41675023 caatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtca 41674952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3790058 - 3789784
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  3790058 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 3789959  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  3789958 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 3789859  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  3789858 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 3789784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5638427 - 5638153
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  5638427 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 5638328  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  5638327 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 5638228  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  5638227 cttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtca 5638153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31431957 - 31431683
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  31431957 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 31431858  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  31431857 tgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 31431758  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31431757 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31431683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 40473194 - 40473468
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  || | || ||||||    
T  40473194 atcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggca 40473293  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  40473294 tggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 40473393  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  40473394 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 40473468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2511568 - 2511294
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  2511568 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 2511469  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  2511468 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 2511369  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2511368 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 2511294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30029932 - 30029658
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |  ||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  30029932 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 30029833  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  30029832 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 30029733  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30029732 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 30029658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 37671128 - 37671402
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || |||||||| || | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  37671128 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 37671227  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  37671228 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 37671327  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37671328 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 37671402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30168986 - 30168714
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || || |||    
T  30168986 atcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagca 30168887  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||    
T  30168886 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacata 30168787  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30168786 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagt 30168714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26480908 - 26480635
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |   |  |  | || ||||||    
T  26480908 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggca 26480809  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  26480808 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 26480710  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26480709 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26480635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34617035 - 34616761
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || ||||||    
T  34617035 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggca 34616936  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  34616935 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 34616836  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  34616835 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 34616761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Original strand, 29966805 - 29966985
Alignment:
Q  115 ttggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcct 214  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  29966805 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29966904  T
Q  215 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29966905 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 29966985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 32599117 - 32599391
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  32599117 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 32599216  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||||||| | |    
T  32599217 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacaca 32599316  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32599317 cttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 32599391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37755497 - 37755223
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  |||  | ||||||||| | | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  37755497 atcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggca 37755398  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  37755397 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 37755298  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37755297 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 37755223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 37770632 - 37770906
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  |||  | ||||||||| | | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  37770632 atcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 37770731  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| | |    
T  37770732 tgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacaca 37770831  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37770832 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 37770906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 295
Target Start/End: Original strand, 8665168 - 8665394
Alignment:
Q  69 ttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  8665168 ttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggc 8665267  T
Q  169 accagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 268  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  8665268 accagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgagga 8665367  T
Q  269 catgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||    
T  8665368 catgtggaacattattctcaaaagtca 8665394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 15758502 - 15758776
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  15758502 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 15758601  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  15758602 tgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 15758701  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15758702 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 15758776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 28959431 - 28959705
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || ||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  28959431 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 28959530  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||  |||||| | |    
T  28959531 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacaca 28959630  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28959631 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 28959705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33293042 - 33292770
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||| ||  ||| ||| |||||||| || ||  | || ||| |||| |  |||    
T  33293042 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagca 33292943  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| | |||||   |||||| ||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  33292942 tgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 33292843  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33292842 tctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagt 33292770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 16449636 - 16449904
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16449636 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgat 16449735  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449736 catggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctc 16449835  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16449836 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagt 16449904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39210933
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 39210860  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39210861 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 39210933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16041828 - 16041560
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  16041828 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgat 16041729  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    | || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16041728 cgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctc 16041629  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041628 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 16041560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26484927
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26485000  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26484999 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 26484927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2775864 - 2775592
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   || || ||| |||||||||||||||    
T  2775864 ctgatagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgat 2775765  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2775764 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 2775665  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2775664 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 2775592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200780
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctca 4200852  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 4200780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Original strand, 2108644 - 2108915
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2108644 tgacagttagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 2108743  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2108744 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctca 2108843  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2108844 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 2108915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26682909
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26682837  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  26682838 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 26682909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088373
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31088302  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 31088373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733694
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 45733765  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 45733694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 10916502 - 10916776
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  10916502 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 10916601  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  10916602 tgatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 10916701  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10916702 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 10916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2155082 - 2154808
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  2155082 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 2154983  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  2154982 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 2154883  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2154882 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 2154808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11424684
Alignment:
Q  22 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 121  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaa-aattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  122 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 11424610  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11424611 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11424684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 16518050 - 16518326
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  16518050 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 16518149  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  16518150 tgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacata 16518249  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16518250 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaac 16518326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 16503014 - 16503288
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  16503014 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 16503113  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  16503114 tgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacata 16503213  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16503214 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 16503288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5128227
Alignment:
Q  22 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 121  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  122 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| | || ||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 5128301  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5128300 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 5128227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26435766 - 26435492
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || | ||||    
T  26435766 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggca 26435667  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  26435666 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 26435567  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26435566 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26435492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 26537504 - 26537778
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  || | || ||||||    
T  26537504 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggca 26537603  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  26537604 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 26537703  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26537704 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 26537778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 24592175 - 24592449
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  24592175 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 24592274  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  24592275 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 24592374  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  24592375 cttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 24592449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3445815 - 3445541
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  3445815 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 3445716  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  3445715 tgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacata 3445616  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3445615 cttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 3445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 5146974 - 5147248
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  5146974 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 5147073  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  5147074 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcaca 5147173  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  5147174 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 5147248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11442033 - 11441807
Alignment:
Q  69 ttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  11442033 ttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggc 11441934  T
Q  169 accagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 268  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11441933 accagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgagga 11441834  T
Q  269 catgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  11441833 catgtgggacattattctcaaaagtca 11441807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 26274728 - 26275002
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  26274728 atcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 26274827  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  26274828 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 26274927  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26274928 cctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26275002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 31564024 - 31564298
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || |||||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  31564024 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 31564123  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  31564124 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 31564223  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31564224 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31564298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9619160 - 9618886
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  9619160 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 9619061  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  9619060 tgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 9618961  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  9618960 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9618886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 16736094 - 16736368
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  16736094 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 16736193  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  16736194 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 16736293  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16736294 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 16736368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 16751148 - 16751422
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  16751148 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 16751247  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  16751248 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 16751347  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16751348 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 16751422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17524041 - 17523767
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  17524041 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 17523942  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  17523941 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 17523842  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17523841 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17523767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 17529174 - 17529448
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  17529174 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 17529273  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  17529274 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 17529373  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17529374 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17529448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 26319503 - 26319777
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  26319503 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggca 26319602  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  26319603 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 26319702  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26319703 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26319777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 26669548 - 26669822
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||||||||    ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  26669548 atcactgacagtcaggagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 26669647  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  26669648 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 26669747  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26669748 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26669822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31125429 - 31125155
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | || ||||||    
T  31125429 atcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggca 31125330  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  31125329 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 31125230  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31125229 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31125155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 4144757 - 4145031
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  4144757 atcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 4144856  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  4144857 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 4144956  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  4144957 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 4145031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45387852 - 45387578
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  45387852 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 45387753  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |    
T  45387752 tgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacaca 45387653  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  45387652 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 45387578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18541308 - 18541036
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||  | || ||| |||| |  |||    
T  18541308 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagca 18541209  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| | |||||   |||||| ||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  18541208 tgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 18541109  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18541108 tctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagt 18541036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26513290 - 26513130
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  26513290 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggca 26513191  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 181  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26513190 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5160028 - 5159756
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||  | || ||| |||| |  |||    
T  5160028 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagca 5159929  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| | |||||   |||||| ||| | |||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  5159928 tgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 5159829  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5159828 tctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagt 5159756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 21702905 - 21703173
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21702905 ctgacagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgat 21703004  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21703005 cgtggttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 21703104  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703105 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 21703173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 19456162 - 19456433
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||    
T  19456162 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgat 19456261  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19456262 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 19456361  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19456362 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 19456433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22926039
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 22925968  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22925969 aatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 22926039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118917
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 27118988  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaa 27118917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784883
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 3784954  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 3784883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28882718 - 28882444
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  28882718 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 28882619  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  28882618 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 28882519  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28882518 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 28882444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34157239
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 34157310  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 34157239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303315
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| | ||||||||||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    || || |||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 34303244  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 34303315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163828
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  125 catggttaaacagagaag---ctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||| ||||||||| |   ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatac 16163903  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16163902 ctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 16163828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 9349719 - 9349993
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | | ||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||||||    
T  9349719 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggca 9349818  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9349819 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatata 9349918  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9349919 cctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 9349993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27434181 - 27434455
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  27434181 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27434280  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  27434281 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 27434380  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27434381 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 27434455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12656046 - 12655772
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || |||| ||||||    
T  12656046 atcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggca 12655947  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  12655946 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 12655847  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12655846 cttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 12655772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891340
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31891269  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| ||| |||||    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaa 31891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20838422 - 20838148
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  20838422 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 20838323  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  20838322 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 20838223  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20838222 cttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 20838148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 23128303 - 23128577
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  23128303 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 23128402  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  23128403 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 23128502  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23128503 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 23128577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27777726 - 27777452
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  27777726 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 27777627  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  27777626 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 27777527  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27777526 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27777452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27817484 - 27817210
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  27817484 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 27817385  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  27817384 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 27817285  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27817284 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27817210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37375665 - 37375391
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  37375665 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 37375566  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| || | |    
T  37375565 tgttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacaca 37375466  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37375465 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 37375391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12587314 - 12587040
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  12587314 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 12587215  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  12587214 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 12587115  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12587114 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 12587040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 13936281 - 13936555
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || | |||  || | || ||||||    
T  13936281 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggca 13936380  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  13936381 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 13936480  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  13936481 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 13936555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27804211 - 27803937
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  27804211 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 27804112  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||||| | |    
T  27804111 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacaca 27804012  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27804011 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27803937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32050302 - 32050028
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  32050302 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 32050203  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  32050202 tgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 32050103  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  32050102 cttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 32050028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34286858 - 34286584
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || ||||||    
T  34286858 atcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggca 34286759  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  34286758 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 34286659  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  34286658 tctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtca 34286584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34291918 - 34291644
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || ||||||    
T  34291918 atcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggca 34291819  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  34291818 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 34291719  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  34291718 tctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtca 34291644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 39051559 - 39051833
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  39051559 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 39051658  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  39051659 tgatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 39051758  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  39051759 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 39051833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 16829075 - 16829349
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  16829075 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 16829174  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  16829175 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 16829274  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16829275 cctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 16829349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16892406 - 16892132
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  16892406 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 16892307  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  16892306 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 16892207  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16892206 cctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 16892132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 12716339 - 12716613
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  12716339 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 12716438  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  12716439 tgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacata 12716538  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12716539 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 12716613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 260490 - 260764
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  260490 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 260589  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| ||| |||||||  | |    
T  260590 tgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcaca 260689  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  260690 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 260764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 11634923 - 11635197
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||| |||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  11634923 atcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 11635022  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  11635023 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcaca 11635122  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11635123 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 11635197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 11641112 - 11641386
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||| |||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  11641112 atcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 11641211  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  11641212 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcaca 11641311  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11641312 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 11641386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34862184 - 34861910
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  34862184 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 34862085  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||| | |    
T  34862084 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacaca 34861985  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  34861984 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 34861910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 37685646 - 37685920
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  37685646 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 37685745  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  37685746 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 37685845  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  37685846 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 37685920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 37700911 - 37701185
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  37700911 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 37701010  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  37701011 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 37701110  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  37701111 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 37701185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37925997 - 37925723
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  37925997 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 37925898  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  37925897 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 37925798  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  37925797 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 37925723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 19416236 - 19416510
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  19416236 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 19416335  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  19416336 tgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 19416435  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19416436 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 19416510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39890578 - 39890304
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||  | |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  39890578 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 39890479  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  39890478 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 39890379  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  39890378 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 39890304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40234015 - 40233741
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| | |||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||| | |||  |  | || ||||||    
T  40234015 atcactgacagttagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggca 40233916  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  40233915 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 40233816  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  40233815 cttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 40233741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31876785 - 31876511
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  31876785 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggca 31876686  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  31876685 tgatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 31876586  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31876585 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 31876511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 295
Target Start/End: Original strand, 21676967 - 21677193
Alignment:
Q  69 ttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||     
T  21676967 ttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggc 21677066  T
Q  169 accagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 268  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  21677067 accagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgagga 21677166  T
Q  269 catgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||    
T  21677167 catgtggaacattattctcaaaagtca 21677193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27393300 - 27393201
Alignment:
Q  194 cgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27393300 cgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 27393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 2410 - 2678
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||  || || ||||| ||| |||||||||    
T  2410 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 2509  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 2609  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2610 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagt 2678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 16207783 - 16208051
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  16207783 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgat 16207882  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16207883 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctc 16207982  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16207983 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 16208051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 20340087 - 20340355
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||  || || ||||| ||| |||||||||    
T  20340087 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 20340186  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340187 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 20340286  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20340287 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagt 20340355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28152093
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctc 28152166  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28152165 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 28152093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20461584 - 20461331
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20461584 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgat 20461485  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20461484 catggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctc 20461385  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggac 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20461384 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggac 20461331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51638725 - 51638451
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  51638725 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 51638626  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  51638625 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 51638526  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  51638525 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 51638451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Original strand, 41793083 - 41793330
Alignment:
Q  48 catcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 147  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41793083 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 41793182  T
Q  148 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 247  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  41793183 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 41793282  T
Q  248 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  41793283 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 41793330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10963177 - 10962903
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  ||   || ||||||    
T  10963177 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggca 10963078  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  10963077 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 10962978  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
      || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  10962977 tttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 10962903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28585488 - 28585214
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  28585488 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 28585389  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  28585388 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 28585289  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28585288 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 28585214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 14142980 - 14143252
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  14142980 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 14143079  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14143080 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 14143179  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14143180 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 14143252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26788445 - 26788173
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  26788445 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26788346  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788345 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26788246  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26788245 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 26788173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27196818 - 27196546
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  27196818 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27196719  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27196718 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27196619  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27196618 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 27196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 27252422 - 27252694
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  27252422 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27252521  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27252522 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27252621  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27252622 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 27252694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13522040
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 13521967  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13521968 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 13522040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22456897
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 22456828  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22456829 aatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagt 22456897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 13298642 - 13298916
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||  || |||| ||||||    
T  13298642 atcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggca 13298741  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  13298742 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 13298841  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13298842 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 13298916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 27290061 - 27290333
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  27290061 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27290160  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27290161 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatata 27290260  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290261 cctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 27290333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162887
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 28162958  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 28162887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374222
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
     |||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 33374151  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaa 33374222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892277
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8892206  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  8892207 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 8892277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903512
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8903441  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  8903442 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 8903512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918611
Alignment:
Q  22 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 121  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  122 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 26918685  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26918684 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26918611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 22934571 - 22934843
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  22934571 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 22934670  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  22934671 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 22934770  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22934771 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagt 22934843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 23857016 - 23857288
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  23857016 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 23857115  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  23857116 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 23857215  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23857216 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagt 23857288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26989507 - 26989232
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggc 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||    
T  26989507 atcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggc 26989408  T
Q  120 atgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  26989407 atgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacat 26989308  T
Q  220 acctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26989307 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 26989232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29549980 - 29549706
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  29549980 atcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 29549881  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||| | |    
T  29549880 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacaca 29549781  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29549780 cttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 29549706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 15424008 - 15424282
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| | ||||    
T  15424008 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggca 15424107  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  15424108 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 15424207  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  15424208 ctttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtca 15424282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16750359 - 16750085
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  16750359 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 16750260  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  16750259 tgatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacata 16750160  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16750159 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 16750085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 24304309 - 24304583
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  24304309 atcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 24304408  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24304409 tggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 24304508  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24304509 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24304583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24864222 - 24863948
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  24864222 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 24864123  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24864122 tgatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 24864023  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24864022 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24863948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 17092131 - 17092407
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||| ||  |    
T  17092131 atcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgcta 17092230  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  17092231 tgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacata 17092330  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  17092331 cctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaac 17092407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27272271 - 27272545
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| | || || ||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| | |||  || |||| ||||||    
T  27272271 atcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggca 27272370  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||    
T  27272371 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacata 27272470  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  27272471 cttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtca 27272545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 30557707 - 30557981
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  30557707 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 30557806  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  30557807 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 30557906  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  30557907 cctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 30557981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 34463037 - 34463311
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  34463037 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 34463136  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  34463137 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 34463236  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  34463237 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 34463311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3696582 - 3696312
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | || ||||||||||    
T  3696582 ctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgat 3696483  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |  ||    
T  3696482 cgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttc 3696383  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3696382 gatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 3696312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 4723825 - 4724099
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  || | |||  || | || ||||||    
T  4723825 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggca 4723924  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4723925 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4724024  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4724025 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 4724099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674370
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  16674644 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 16674545  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  16674544 tgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 16674445  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16674444 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 16674370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27044893 - 27044619
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| | |||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  || | || ||||||    
T  27044893 atcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggca 27044794  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  27044793 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 27044694  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27044693 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27044619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29573518 - 29573244
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  29573518 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 29573419  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  29573418 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 29573319  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29573318 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 29573244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 4545466 - 4545740
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  4545466 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 4545565  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4545566 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4545665  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4545666 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 4545740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4758269 - 4757995
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||  |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  4758269 atcactgacagtccgaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 4758170  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4758169 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4758070  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4758069 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 4757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28207959 - 28207685
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||| ||    
T  28207959 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtca 28207860  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  28207859 tgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 28207760  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28207759 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 28207685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 16943718 - 16943992
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  16943718 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 16943817  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  16943818 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 16943917  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16943918 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 16943992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 26116101 - 26116375
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  26116101 atcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 26116200  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  26116201 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 26116300  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  26116301 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 26116375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27485634 - 27485360
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  27485634 atcactaacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 27485535  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  27485534 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 27485435  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27485434 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27485360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4525791 - 4525517
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  4525791 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 4525692  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4525691 tgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4525592  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4525591 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 4525517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4773511 - 4773237
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  4773511 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 4773412  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4773411 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4773312  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4773311 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 4773237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27008232 - 27007958
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  27008232 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 27008133  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | | |    
T  27008132 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacaca 27008033  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27008032 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27007958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29501920 - 29501646
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  29501920 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 29501821  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  29501820 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 29501721  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29501720 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 29501646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27359683 - 27359957
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  27359683 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 27359782  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  27359783 tgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 27359882  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27359883 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27359957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27450026 - 27450300
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  27450026 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 27450125  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  27450126 tgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 27450225  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27450226 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27450300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27019641 - 27019461
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||  || |||| ||||||    
T  27019641 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttggca 27019542  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagt 201  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  27019541 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 26777301 - 26777580
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  26777301 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 26777400  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtg-----gtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctc 215  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||| || |     | ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||  ||||||    
T  26777401 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctc 26777500  T
Q  216 atatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26777501 acacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 26777580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17025658 - 17025508
Alignment:
Q  145 ttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 244  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |    
T  17025658 ttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcat 17025559  T
Q  245 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17025558 gatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17025508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20161034 - 20160932
Alignment:
Q  193 acgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20161034 acgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaag 20160935  T
Q  293 tca 295  Q
    |||    
T  20160934 tca 20160932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 22171797 - 22171899
Alignment:
Q  193 acgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||    
T  22171797 acgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaag 22171896  T
Q  293 tca 295  Q
    |||    
T  22171897 tca 22171899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000304
Alignment:
Q  205 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27000304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27629391 - 27629665
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||| || | ||| ||| |   ||||||||| |||||| |   ||| || | |||| || ||    
T  27629391 atcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgtca 27629490  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||| || || |  || || || |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||      
T  27629491 tgatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacg 27629590  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  27629591 cttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtca 27629665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034182
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 31034109  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31034110 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 31034182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32292945
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 32293018  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32293017 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaac 32292945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18530853 - 18530582
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18530853 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 18530754  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530753 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctc 18530654  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||    
T  18530653 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaa 18530582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 16626299 - 16626570
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||    
T  16626299 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgat 16626398  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626399 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 16626498  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16626499 aatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 16626570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652581
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctca 5652652  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 5652581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713422
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5713492  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtca 5713422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5724332
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5724402  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtca 5724332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5768036
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5767966  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtca 5768036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18051731 - 18051457
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||    
T  18051731 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgaca 18051632  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||    
T  18051631 tgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacata 18051532  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18051531 cttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 18051457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17993848
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||  || | || |||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 17993777  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 17993848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6192785 - 6192511
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  6192785 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 6192686  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  6192685 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 6192586  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6192585 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 6192511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 15740883 - 15741157
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  15740883 atcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 15740982  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  15740983 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 15741082  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15741083 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 15741157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8296441 - 8296165
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  8296441 atcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 8296342  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  8296341 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 8296242  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8296241 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaac 8296165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4626138
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctca 4626209  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 4626138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 4796442 - 4796716
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  4796442 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 4796541  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  4796542 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 4796641  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  4796642 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 4796716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 29148544 - 29148818
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  29148544 atcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 29148643  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  29148644 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 29148743  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29148744 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 29148818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330864
Alignment:
Q  22 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 121  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  122 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 18330938  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18330937 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18330864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4722100 - 4721826
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  4722100 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 4722001  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  4722000 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacata 4721901  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  4721900 cttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtca 4721826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 8301056 - 8301330
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  8301056 atcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 8301155  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  8301156 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 8301255  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8301256 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 8301330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7073681 - 7073409
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  7073681 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggca 7073582  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  7073581 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 7073482  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  7073481 cttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 7073409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 15892495 - 15892769
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |||  || |||| ||||||    
T  15892495 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggca 15892594  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  15892595 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 15892694  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15892695 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 15892769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35880961
Alignment:
Q  22 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 121  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  122 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 35881035  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  35881034 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 35880961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 18276841 - 18277115
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || ||||||    
T  18276841 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggca 18276940  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  18276941 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 18277040  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18277041 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18277115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 18307443 - 18307717
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || ||||||    
T  18307443 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggca 18307542  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  18307543 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 18307642  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18307643 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18307717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28021744 - 28021470
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  28021744 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggca 28021645  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  28021644 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacata 28021545  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28021544 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtca 28021470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22387641
Alignment:
Q  22 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 121  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  || | || |||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  122 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||   | |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22387567  T
Q  222 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22387568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 22387641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 18292142 - 18292416
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || ||||||    
T  18292142 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggca 18292241  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  18292242 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 18292341  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18292342 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 11110138 - 11110412
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||| | | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  11110138 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 11110237  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  11110238 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacaca 11110337  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11110338 cttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11110412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 20576636 - 20576910
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  20576636 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 20576735  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  20576736 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 20576835  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  20576836 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 20576910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48466396 - 48466122
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || ||||||    
T  48466396 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggca 48466297  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  48466296 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 48466197  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  48466196 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 48466122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 295
Target Start/End: Original strand, 5756940 - 5757145
Alignment:
Q  89 aaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacatt 188  Q
    |||||||| | ||||| |||||  || ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5756940 aaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgtt 5757038  T
Q  189 acggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctca 288  Q
    ||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5757039 acaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctca 5757138  T
Q  289 aaagtca 295  Q
    |||||||    
T  5757139 aaagtca 5757145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8212207 - 8211933
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  8212207 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 8212108  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  8212107 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 8212008  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  8212007 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 8211933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18243208 - 18242934
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  18243208 atcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 18243109  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  18243108 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 18243009  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  18243008 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 18242934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 28115743 - 28116017
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  28115743 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 28115842  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  28115843 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcaca 28115942  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28115943 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtca 28116017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 29664759 - 29665033
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  29664759 atcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 29664858  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  29664859 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 29664958  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29664959 cttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 29665033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51782492 - 51782218
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  51782492 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 51782393  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  51782392 tgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 51782293  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  51782292 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 51782218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4417388 - 4417114
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||| | | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  4417388 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttggca 4417289  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4417288 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4417189  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4417188 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 4417114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21675162 - 21674888
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  21675162 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 21675063  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  21675062 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 21674963  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  21674962 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtca 21674888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 36996866 - 36997140
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  36996866 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 36996965  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  36996966 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacata 36997065  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  36997066 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtca 36997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5467406 - 5467180
Alignment:
Q  69 ttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  5467406 ttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggc 5467307  T
Q  169 accagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 268  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  5467306 accagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgagga 5467207  T
Q  269 catgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || |||||||| |||||||||||||    
T  5467206 cgtgtgggacattattctcaaaagtca 5467180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 6542251 - 6542525
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| ||||   |||| || |||||||| || | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  6542251 atcactgacggtcaggaaattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 6542350  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | | |    
T  6542351 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacaca 6542450  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6542451 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 6542525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10396602 - 10396328
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  10396602 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 10396503  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  10396502 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 10396403  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  10396402 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtca 10396328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24328628 - 24328354
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  24328628 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 24328529  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  24328528 tgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 24328429  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24328428 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 24328354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 5596146 - 5596420
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  5596146 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 5596245  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  5596246 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 5596345  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5596346 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 5596420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 4346476 - 4346750
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || | |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || ||||||    
T  4346476 atcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggca 4346575  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  4346576 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 4346675  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  4346676 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 4346750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5014181 - 5013907
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  5014181 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 5014082  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  5014081 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 5013982  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5013981 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 5013907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 5609111 - 5609385
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  5609111 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 5609210  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  5609211 tgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 5609310  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5609311 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 5609385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47023922 - 47023648
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  47023922 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 47023823  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  47023822 tgatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 47023723  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  47023722 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 47023648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18225660 - 18225386
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  18225660 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 18225561  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||| | |    
T  18225560 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacaca 18225461  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18225460 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18225386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 22870645 - 22870919
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || | |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || ||||||    
T  22870645 atcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggca 22870744  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  22870745 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 22870844  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22870845 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 22870919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 22885704 - 22885978
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || | |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || ||||||    
T  22885704 atcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggca 22885803  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  22885804 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 22885903  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22885904 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 22885978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28339771 - 28339497
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  28339771 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 28339672  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  28339671 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 28339572  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28339571 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 28339497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985019
Alignment:
Q  48 catcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 147  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||  || |||||||| ||||||||||| |||  || | || ||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  148 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 247  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  248 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17985019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Original strand, 31964289 - 31964536
Alignment:
Q  48 catcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 147  Q
    ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  31964289 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31964388  T
Q  148 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 247  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31964389 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31964488  T
Q  248 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31964489 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31964536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7997031 - 7996757
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  7997031 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 7996932  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |    
T  7996931 tgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacaca 7996832  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7996831 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 7996757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10643539 - 10643265
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  10643539 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 10643440  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |    
T  10643439 tgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacaca 10643340  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  10643339 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 10643265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51797462 - 51797308
Alignment:
Q  141 agctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||||||     
T  51797462 agctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcg 51797363  T
Q  241 gcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  51797362 gcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 51797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32439623 - 32439351
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||  | || ||| |||| |  |||    
T  32439623 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagca 32439524  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| | |||||   |||| | ||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  32439523 tgatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 32439424  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32439423 tctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagt 32439351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 295
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134134
Alignment:
Q  151 agcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 250  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  251 gaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  50134090 gtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 50134134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20066414 - 20066240
Alignment:
Q  119 catgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcata 218  Q
    |||||||||| | |||||   |||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||   |||| | || ||| |    
T  20066414 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcaca 20066315  T
Q  219 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  20066314 tatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagt 20066240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 15284680 - 15284951
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  15284680 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgat 15284779  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15284780 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 15284879  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  15284880 aatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 15284951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15228389 - 15228124
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15228389 ctgacagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 15228290  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15228289 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatatacccc 15228190  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  15228189 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaa 15228124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1900776 - 1900508
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| | || || ||||||||| ||||||| |    
T  1900776 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggt 1900677  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900676 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 1900577  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1900576 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagt 1900508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14665541 - 14665267
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  14665541 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 14665442  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  14665441 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 14665342  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  14665341 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtca 14665267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24460628
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 24460557  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24460558 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaa 24460628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 24592062 - 24592336
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  || |||| ||||||    
T  24592062 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggca 24592161  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24592162 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 24592261  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24592262 cttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24592336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17014523 - 17014249
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  17014523 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 17014424  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  17014423 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 17014324  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17014323 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 17014249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391358
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
     ||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctc 15391289  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15391290 gatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 15391358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 14235273 - 14235545
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||| | | ||| || || |||  ||||    
T  14235273 atcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggca 14235372  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    || ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||      
T  14235373 tggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcatagg 14235472  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14235473 tctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagt 14235545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 36344263 - 36344537
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  36344263 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 36344362  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  36344363 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 36344462  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36344463 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 36344537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 14763052 - 14763326
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || ||||||    
T  14763052 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggca 14763151  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  14763152 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 14763251  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14763252 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 14763326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 18800361 - 18800635
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  18800361 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 18800460  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  18800461 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 18800560  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  18800561 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 18800635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6570376 - 6570102
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || ||||||    
T  6570376 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggca 6570277  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  6570276 taatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 6570177  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  6570176 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 6570102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21970224 - 21969950
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  21970224 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 21970125  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  21970124 tgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 21970025  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
      |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  21970024 tttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 21969950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 31126266 - 31126540
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  31126266 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 31126365  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  31126366 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 31126465  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  31126466 cctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 31126540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 40105386 - 40105660
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  40105386 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 40105485  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  40105486 tgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 40105585  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40105586 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 40105660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54833910 - 54833636
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  || | || ||||||    
T  54833910 atcattgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggca 54833811  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  54833810 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 54833711  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  54833710 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 54833636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30754277 - 30754003
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  30754277 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 30754178  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  30754177 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 30754078  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  30754077 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 30754003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 33673546 - 33673820
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  33673546 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 33673645  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  33673646 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 33673745  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  33673746 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 33673820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5006396 - 5006120
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  5006396 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 5006297  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  5006296 tgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 5006197  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  5006196 cttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaac 5006120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27163065 - 27163339
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || ||||||    
T  27163065 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggca 27163164  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  27163165 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 27163264  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27163265 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27163339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14099064 - 14098790
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |   || || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  14099064 atcactgacagtcagaaggttatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 14098965  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  14098964 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 14098865  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14098864 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 14098790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39851161 - 39850887
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  39851161 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 39851062  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  39851061 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 39850962  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  39850961 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 39850887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24113185 - 24112913
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||  | || ||| |||| || |||    
T  24113185 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagca 24113086  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| | |||||   |||||| ||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  24113085 tgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 24112986  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24112985 tctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagt 24112913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 34188708 - 34188980
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||| ||  ||| ||| |||||||| || ||  | || ||| |||| |  |||    
T  34188708 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagca 34188807  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| | |||||   |||||| ||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| | || ||| |||    
T  34188808 tgatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacata 34188907  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34188908 tctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagt 34188980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710820
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 18710891  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18710890 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18710820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19659022
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 19658951  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaa 19659022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16283957 - 16283683
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||| |    
T  16283957 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggta 16283858  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  16283857 tgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacata 16283758  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16283757 cttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 16283683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44563332
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctc 44563404  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44563403 aatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaac 44563332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244898
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctca 33244969  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaa 33244898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16278062 - 16277788
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  16278062 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 16277963  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  16277962 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 16277863  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16277862 cttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 16277788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22080857
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctc 22080788  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22080789 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 22080857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19688606 - 19688330
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  19688606 atcattgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 19688507  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  |||    
T  19688506 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcata 19688407  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaac 297  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19688406 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaac 19688330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 27608612 - 27608886
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  27608612 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27608711  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  27608712 tgatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 27608811  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27608812 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 27608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14558132 - 14557858
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  14558132 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 14558033  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  14558032 tgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 14557933  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  14557932 cttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtca 14557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 2136966 - 2137240
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  2136966 atcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 2137065  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||     
T  2137066 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatg 2137165  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  2137166 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtca 2137240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 3329214 - 3329488
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||||||||   | || || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  3329214 atcactgacagtcaggaagttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 3329313  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  3329314 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 3329413  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3329414 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 3329488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19286970 - 19286696
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  || | || ||||||    
T  19286970 atcattgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggca 19286871  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  19286870 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 19286771  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19286770 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 19286696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19674949 - 19674675
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  19674949 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 19674850  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  19674849 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 19674750  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19674749 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 19674675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 19208067 - 19208341
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  19208067 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 19208166  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  19208167 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 19208266  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  19208267 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 19208341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 28361662 - 28361936
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  28361662 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 28361761  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  28361762 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 28361861  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28361862 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 28361936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29829830 - 29829556
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  29829830 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 29829731  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  29829730 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 29829631  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29829630 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 29829556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 31489457 - 31489731
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||  |  | |||  || | || ||||||    
T  31489457 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggca 31489556  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  31489557 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 31489656  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  31489657 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 31489731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 189513 - 189328
Alignment:
Q  110 ggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagc 209  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  189513 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 189414  T
Q  210 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  189413 ttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 189328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 12092431 - 12092705
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    ||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||| ||    
T  12092431 atcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtca 12092530  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  12092531 tgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 12092630  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12092631 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 12092705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33259231 - 33258957
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  33259231 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 33259132  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  33259131 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 33259032  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33259031 cttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 33258957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9355131 - 9354856
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| | |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || ||||||    
T  9355131 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggca 9355032  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |    
T  9355031 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacaca 9354932  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaa 296  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  9354931 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaa 9354856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31354982 - 31354758
Alignment:
Q  71 gaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtac 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  31354982 gaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcac 31354883  T
Q  171 cagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggaca 270  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  31354882 cagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggaca 31354783  T
Q  271 tgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || || ||||| |||||||||||||    
T  31354782 tgtggaacattattctcaaaagtca 31354758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18791215 - 18791096
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  18791215 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttggca 18791116  T
Q  121 tgatcatggttaaacagaga 140  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  18791115 tgatcatggctgaacagaga 18791096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 46733 - 47007
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||  | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  46733 atcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 46832  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  46833 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 46932  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46933 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 47007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 39817 - 40091
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  39817 atcattgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 39916  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  39917 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 40016  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40017 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 40091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30271 - 29997
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||     
T  30271 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcg 30172  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||    
T  30171 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacata 30072  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30071 cttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 29997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22064 - 21797
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 125  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  22064 tgacaatcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatc 21965  T
Q  126 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 225  Q
    ||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||||   |||     
T  21964 atggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcg 21865  T
Q  226 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagt 21797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 370 - 638
Alignment:
Q  25 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 124  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| | || |||||| |||||||| |   ||| | |||||||||||||||||    
T  370 ctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgat 469  T
Q  125 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 224  Q
    |||||| |||||  ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||   |||    
T  470 catggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctc 569  T
Q  225 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  570 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagt 638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30961 - 30686
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataa-ttgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggc 119  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||    
T  30961 atcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggc 30862  T
Q  120 atgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  30861 atgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacat 30762  T
Q  220 acctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  30761 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 30686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20717 - 20623
Alignment:
Q  199 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20717 agtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 20623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6522 - 6248
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||    
T  6522 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggca 6423  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| | |    
T  6422 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacaca 6323  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  6322 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 6248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 293
Target Start/End: Original strand, 1844 - 1938
Alignment:
Q  199 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1844 agtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagt 1938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27801 - 27526
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggc 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||    
T  27801 atcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggc 27702  T
Q  120 atgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatat 219  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  27701 atgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacat 27602  T
Q  220 acctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27601 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 27526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10074 - 9800
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  10074 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 9975  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  9974 tgatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 9875  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  9874 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 6987 - 7261
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  6987 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 7086  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  7087 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 7186  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  7187 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 7261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 14678 - 14952
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | | || || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || ||||||    
T  14678 atcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggca 14777  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  14778 tgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 14877  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  14878 cttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 14952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8457 - 8183
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||| ||    
T  8457 atcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtca 8358  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  8357 tgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacaca 8258  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8257 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 8183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 8814 - 9088
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  8814 atcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 8913  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| | |    
T  8914 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 9013  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  9014 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 20249
Alignment:
Q  48 catcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 147  Q
    ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20496 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20397  T
Q  148 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 247  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20396 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20297  T
Q  248 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    | || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  20296 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 20249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 25949 - 26223
Alignment:
Q  21 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || ||||||    
T  25949 atcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggca 26048  T
Q  121 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatata 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |    
T  26049 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacaca 26148  T
Q  221 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
      || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26149 tttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Original strand, 1 - 151
Alignment:
Q  145 ttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 244  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || |    
T  1 ttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcat 100  T
Q  245 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  101 gatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 291
Target Start/End: Original strand, 46593 - 46820
Alignment:
Q  69 ttgaacagcatagcaacccaaa-ggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat-catggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtg 166  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||  || |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  46593 ttgaacagtaaagcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagag 46692  T
Q  167 gtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtc 263  Q
    | |||||||||||||  |  |||||||| ||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46693 gcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtc 46792  T
Q  264 gaggacatgagggacattgttctcaaaa 291  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  46793 gaggacatgcgggacattattctcaaaa 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 287
Target Start/End: Original strand, 1 - 42
Alignment:
Q  246 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctc 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 323
Alignment:
Q  119 catgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcata 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | ||| || || |  || || || |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||    
T  499 catgatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggtgcttcttcata 400  T
Q  219 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 295  Q
      | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  399 cgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtca 323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 119651 - 119700
Alignment:
Q  26 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctcgatgtcattttgaaca 75  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  119651 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaaca 119700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University