View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_189 (Length: 294)

Name: NF7829A_low_189
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_189
NF7829A_low_189
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (7-282)||(43929-44204)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (7-282)||(25956766-25957041)
chr6 (7-276)||(27850884-27851144)
chr6 (8-294)||(18708468-18708736)
chr6 (8-167)||(19399687-19399846)
chr6 (8-291)||(20734211-20734477)
chr6 (104-294)||(17318969-17319154)
chr6 (8-144)||(31630673-31630809)
chr6 (8-218)||(23151082-23151279)
chr6 (14-181)||(28708550-28708704)
chr6 (132-237)||(27323545-27323649)
chr6 (8-97)||(18927823-18927912)
chr6 (8-137)||(34297033-34297161)
chr6 (210-294)||(19444250-19444330)
chr6 (135-232)||(31733740-31733836)
chr6 (210-294)||(16133640-16133720)
chr6 (8-77)||(27322234-27322303)
chr6 (209-294)||(23017094-23017174)
chr6 (106-189)||(31733829-31733911)
chr6 (258-294)||(27326767-27326803)
chr6 (258-294)||(27387507-27387543)
chr6 (245-276)||(18822102-18822133)
chr6 (139-237)||(20136594-20136691)
chr6 (139-237)||(22196178-22196275)
chr6 (139-237)||(23528201-23528298)
chr6 (245-282)||(18822053-18822090)
chr6 (107-176)||(19829807-19829875)
chr6 (236-276)||(18456587-18456627)
chr6 (236-276)||(18461747-18461787)
chr6 (266-294)||(31733716-31733744)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (10-282)||(15099050-15099321)
chr4 (8-282)||(361956-362221)
chr4 (8-294)||(19609292-19609560)
chr4 (8-294)||(35812253-35812521)
chr4 (136-282)||(19857283-19857429)
chr4 (8-294)||(33185920-33186190)
chr4 (8-189)||(630910-631091)
chr4 (8-189)||(15868845-15869026)
chr4 (135-276)||(15869019-15869163)
chr4 (136-294)||(15042058-15042212)
chr4 (136-294)||(15112212-15112366)
chr4 (7-138)||(13844384-13844515)
chr4 (182-294)||(46642580-46642691)
chr4 (8-138)||(46642679-46642809)
chr4 (8-151)||(32851218-32851361)
chr4 (137-274)||(32851052-32851192)
chr4 (193-282)||(13844304-13844393)
chr4 (127-237)||(10357362-10357471)
chr4 (202-294)||(3484989-3485077)
chr4 (106-212)||(10357285-10357391)
chr4 (174-276)||(3514880-3514985)
chr4 (8-97)||(9923296-9923385)
chr4 (84-189)||(14185097-14185201)
chr4 (8-90)||(11479474-11479556)
chr4 (8-74)||(52873303-52873369)
chr4 (8-67)||(15880726-15880785)
chr4 (240-294)||(10357535-10357588)
chr4 (199-276)||(21815788-21815868)
chr4 (236-276)||(21815877-21815917)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (8-282)||(38550137-38550411)
chr8 (8-282)||(20982771-20983045)
chr8 (8-282)||(27472442-27472708)
chr8 (8-281)||(39833687-39833961)
chr8 (24-237)||(6102530-6102738)
chr8 (8-294)||(39936826-39937094)
chr8 (8-294)||(21579970-21580241)
chr8 (8-150)||(18760481-18760623)
chr8 (148-282)||(13428328-13428462)
chr8 (106-294)||(24713189-24713371)
chr8 (153-282)||(1323366-1323495)
chr8 (8-137)||(1327171-1327300)
chr8 (8-272)||(41680886-41681133)
chr8 (8-235)||(29763632-29763846)
chr8 (8-137)||(42560291-42560419)
chr8 (26-202)||(21415244-21415421)
chr8 (193-294)||(19127978-19128073)
chr8 (38-150)||(19128061-19128160)
chr8 (193-294)||(18760398-18760493)
chr8 (139-237)||(2418971-2419066)
chr8 (139-187)||(35026960-35027008)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (10-282)||(9389845-9390116)
chr7 (8-282)||(17232330-17232596)
chr7 (9-282)||(37727692-37727957)
chr7 (42-282)||(6170283-6170522)
chr7 (8-282)||(45847786-45848043)
chr7 (8-251)||(14270190-14270428)
chr7 (8-254)||(8468173-8468402)
chr7 (7-294)||(36686013-36686284)
chr7 (8-294)||(8851981-8852249)
chr7 (8-294)||(11066436-11066704)
chr7 (8-294)||(30821020-30821290)
chr7 (8-294)||(38480055-38480325)
chr7 (8-294)||(32434406-32434673)
chr7 (8-237)||(12371299-12371514)
chr7 (40-294)||(59239-59476)
chr7 (10-237)||(12127982-12128195)
chr7 (118-294)||(13150458-13150620)
chr7 (140-294)||(46386997-46387146)
chr7 (140-294)||(48811869-48812018)
chr7 (8-135)||(18302016-18302143)
chr7 (8-137)||(15213659-15213787)
chr7 (14-181)||(11391948-11392102)
chr7 (8-97)||(13148288-13148377)
chr7 (193-294)||(18875861-18875956)
chr7 (202-294)||(20619253-20619340)
chr7 (140-237)||(18075463-18075559)
chr7 (136-233)||(14183560-14183653)
chr7 (240-294)||(20253594-20253648)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (10-282)||(1465559-1465830)
chr3 (8-276)||(18439993-18440261)
chr3 (8-282)||(49389816-49390090)
chr3 (8-294)||(12269267-12269545)
chr3 (8-282)||(20630243-20630509)
chr3 (8-294)||(40806964-40807232)
chr3 (8-294)||(22307399-22307667)
chr3 (8-294)||(30175330-30175598)
chr3 (8-294)||(17538075-17538343)
chr3 (8-294)||(31224718-31224988)
chr3 (8-167)||(49970016-49970175)
chr3 (8-294)||(15447764-15448031)
chr3 (8-291)||(31415230-31415492)
chr3 (8-229)||(14500888-14501109)
chr3 (106-294)||(41173220-41173403)
chr3 (127-294)||(17519827-17519989)
chr3 (127-294)||(17534689-17534851)
chr3 (106-294)||(5214886-5215068)
chr3 (121-288)||(13516368-13516529)
chr3 (140-294)||(40811779-40811928)
chr3 (106-294)||(5206503-5206687)
chr3 (8-184)||(45796978-45797153)
chr3 (8-134)||(12852504-12852631)
chr3 (106-294)||(14507872-14508054)
chr3 (135-274)||(23413557-23413699)
chr3 (135-274)||(45796838-45796980)
chr3 (121-291)||(15932371-15932535)
chr3 (14-181)||(5841857-5842011)
chr3 (206-294)||(13026636-13026720)
chr3 (8-189)||(23413385-23413564)
chr3 (206-294)||(13031725-13031809)
chr3 (121-231)||(17693155-17693264)
chr3 (201-276)||(19485261-19485335)
chr3 (8-137)||(11912881-11913009)
chr3 (210-293)||(17548519-17548598)
chr3 (210-294)||(17044064-17044143)
chr3 (8-89)||(40811993-40812074)
chr3 (8-61)||(1988996-1989049)
chr3 (140-194)||(17519784-17519838)
chr3 (140-194)||(17534646-17534700)
chr3 (129-186)||(52466418-52466475)
chr3 (199-276)||(53070856-53070936)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (8-282)||(2746-3020)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (8-282)||(28194595-28194869)
chr1 (8-282)||(46382701-46382975)
chr1 (10-282)||(35981836-35982099)
chr1 (7-282)||(43697075-43697349)
chr1 (8-282)||(43542819-43543085)
chr1 (80-282)||(41305814-41306007)
chr1 (8-294)||(48300831-48301099)
chr1 (8-294)||(51274352-51274622)
chr1 (10-138)||(20636694-20636821)
chr1 (121-294)||(20587698-20587866)
chr1 (121-294)||(20592236-20592404)
chr1 (139-294)||(20634508-20634658)
chr1 (183-282)||(20636606-20636705)
chr1 (193-294)||(35088485-35088580)
chr1 (202-294)||(14238498-14238586)
chr1 (210-293)||(13528762-13528841)
chr1 (133-237)||(41227622-41227725)
chr1 (99-201)||(11809380-11809482)
chr1 (10-91)||(41227522-41227603)
chr1 (99-201)||(23073052-23073154)
chr1 (139-237)||(16381109-16381203)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (8-294)||(6576181-6576462)
chr2 (8-294)||(24781656-24781924)
chr2 (8-294)||(5032140-5032408)
chr2 (113-286)||(22689656-22689824)
chr2 (113-286)||(22694252-22694420)
chr2 (8-294)||(24436021-24436279)
chr2 (8-294)||(24883430-24883689)
chr2 (127-294)||(9974893-9975055)
chr2 (8-237)||(22500860-22501077)
chr2 (8-237)||(22508794-22509011)
chr2 (8-237)||(24865534-24865751)
chr2 (206-294)||(26896278-26896362)
chr2 (179-294)||(7672421-7672531)
chr2 (53-189)||(21367914-21368050)
chr2 (210-293)||(6478254-6478333)
chr2 (140-237)||(20915126-20915222)
chr2 (222-294)||(356983-357051)
chr2 (240-294)||(24865791-24865845)
chr2 (121-212)||(9975026-9975116)
chr2 (240-294)||(19202169-19202223)
chr2 (256-294)||(20913058-20913096)
chr2 (240-294)||(23969686-23969740)
chr2 (99-189)||(5985197-5985286)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (10-243)||(2440-2672)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (8-240)||(84991-85223)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (10-282)||(21741681-21741961)
chr5 (7-282)||(5889320-5889579)
chr5 (8-254)||(29915219-29915457)
chr5 (8-294)||(12122285-12122555)
chr5 (8-294)||(21557809-21558079)
chr5 (15-294)||(21555150-21555414)
chr5 (8-294)||(17875032-17875302)
chr5 (38-294)||(31454896-31455135)
chr5 (38-294)||(31455509-31455748)
chr5 (8-137)||(36460130-36460258)
chr5 (8-196)||(30615667-30615844)
chr5 (193-294)||(19920683-19920778)
chr5 (8-72)||(21871707-21871771)
chr5 (8-72)||(21875987-21876051)
chr5 (99-237)||(25250739-25250875)
chr5 (99-237)||(25314524-25314660)
chr5 (240-294)||(21309019-21309073)
chr5 (139-237)||(25743647-25743744)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (92-282)||(106266-106456)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (8-201)||(362787-362980)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (8-294)||(9118-9386)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (8-294)||(14158-14428)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (109-282)||(46923-47095)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (106-294)||(145755-145938)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (8-294)||(10042-10310)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (8-294)||(59369-59637)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (8-294)||(1384-1654)
[»] scaffold1792 (2 HSPs)
scaffold1792 (135-276)||(103-243)
scaffold1792 (10-189)||(236-414)
[»] scaffold0230 (3 HSPs)
scaffold0230 (135-276)||(23657-23797)
scaffold0230 (10-189)||(23486-23664)
scaffold0230 (179-276)||(20770-20867)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (10-294)||(9576-9842)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (9-294)||(76719-76977)
[»] scaffold0737 (4 HSPs)
scaffold0737 (8-294)||(6442-6711)
scaffold0737 (106-212)||(5562-5667)
scaffold0737 (128-194)||(5639-5705)
scaffold0737 (131-194)||(5751-5814)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (106-294)||(57768-57951)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (8-294)||(2893-3152)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (131-284)||(19320-19469)
scaffold0061 (8-113)||(15491-15595)
scaffold0061 (8-113)||(24549-24653)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (8-134)||(24790-24916)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (8-189)||(8430-8612)
scaffold0075 (135-274)||(8605-8747)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (8-184)||(8202-8365)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (135-274)||(13233-13375)
scaffold0235 (8-184)||(13373-13549)
scaffold0235 (135-268)||(24940-25076)
scaffold0235 (78-184)||(25074-25180)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (137-291)||(2768-2917)
scaffold0507 (247-291)||(2942-2986)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (145-274)||(34820-34952)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (8-134)||(7784-7911)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (14-181)||(2499-2653)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (8-237)||(10766-10983)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (202-294)||(33428-33516)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (174-276)||(4567-4672)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (202-294)||(286-374)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (202-294)||(10873-10961)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (202-294)||(863-951)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (26-202)||(1780-1957)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (8-137)||(157-285)
scaffold0599 (8-137)||(4575-4703)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (193-294)||(78299-78394)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (210-290)||(605-681)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (58-294)||(95299-95531)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (8-97)||(5520-5609)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (135-274)||(74522-74656)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (8-85)||(11015-11092)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (8-97)||(6823-6912)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (8-89)||(812-893)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (106-214)||(263-368)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (210-290)||(41193-41269)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (8-117)||(463-572)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (202-294)||(78054-78141)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (136-189)||(7585-7638)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (8-82)||(18472-18546)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (8-61)||(36194-36247)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (240-294)||(15944-15998)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (236-276)||(9752-9792)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Original strand, 43929 - 44204
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43929 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatgatgttgccttgctgatgtgatgtattaata 44028  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44029 tcattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaaga 44128  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44129 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 44204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Original strand, 25956766 - 25957041
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25956766 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatgatgttgccttgctgatgtgatgtattaata 25956865  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25956866 tcattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaaga 25956965  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25956966 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 25957041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27851144 - 27850884
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27851144 ctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgattattgtcgatgttgacttgctgcaaattatttgatggtgttgccttactgatgtgatgtattaata 27851045  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27851044 tcattaagatgctaatgttggt---------ttaagttgtaagatgttggtccaaattattggagtcatacgagatgtctaagttgttaagttgttaaga 27850954  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27850953 tgttgagtcaattgcatactcgtttacattgggtgagggcttgatgctctataatgtatatttgtacata 27850884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18708736 - 18708468
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  18708736 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgtttatgttgacttgctgcatattatttaatggtgatgccttgctgtcgtgat---------- 18708647  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18708646 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 18708551  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18708550 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtacatttatacatattatgttgagggcttgat 18708468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19399846 - 19399687
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19399846 tgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggttctgccttgcttttgtgatgtattattat 19399747  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattatt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19399746 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaagtatt 19399687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 291
Target Start/End: Original strand, 20734211 - 20734477
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  20734211 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 20734310  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||    
T  20734311 cattaagatg----------tc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaag-tcataagat 20734397  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20734398 gttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 20734477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 294
Target Start/End: Original strand, 17318969 - 17319154
Alignment:
Q  104 atatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgtt 202  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  17318969 atatcattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-t 17319067  T
Q  203 aagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17319068 aagacgttgagtcca-tgtatactcatttaagt----tgagggcttgatgcaatgtaatgtatatttatatatattatgttgagggcttgat 17319154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Original strand, 31630673 - 31630809
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31630673 tgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgttgatgtgatgtattaatat 31630772  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31630773 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagtt 31630809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Original strand, 23151082 - 23151279
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||              
T  23151082 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctatcgtgat---------- 23151171  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  23151172 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagtcgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttatgttg-taaga 23151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28708704 - 28708550
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||             ||     
T  28708704 gaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgttgttttgctgtcgtgat-------------tag 28708618  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28708617 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 28708550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 27323545 - 27323649
Alignment:
Q  132 agttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27323545 agttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggcgtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttgagtcca-tgcatactcatt 27323642  T
Q  231 taagttg 237  Q
    |||||||    
T  27323643 taagttg 27323649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18927912 - 18927823
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18927912 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 18927823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 34297033 - 34297161
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  34297033 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgtttccttgcggttgtgacgtattaatat 34297132  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34297133 catgaagat-ctaatgttgggataagttgt 34297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 294
Target Start/End: Original strand, 19444250 - 19444330
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19444250 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 19444330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31733836 - 31733740
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcattta 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31733836 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcattta 31733740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 294
Target Start/End: Original strand, 16133640 - 16133720
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16133640 tgagttcattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 16133720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 77
Target Start/End: Original strand, 27322234 - 27322303
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatgg 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27322234 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgg 27322303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 294
Target Start/End: Original strand, 23017094 - 23017174
Alignment:
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23017094 ttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 23017174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31733911 - 31733829
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  31733911 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtttaag 31733829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Original strand, 27326767 - 27326803
Alignment:
Q  258 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27326767 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 27326803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Original strand, 27387507 - 27387543
Alignment:
Q  258 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27387507 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 27387543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 276
Target Start/End: Original strand, 18822102 - 18822133
Alignment:
Q  245 gcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18822102 gcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 18822133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20136691 - 20136594
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| | || ||||||||  ||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20136691 taagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgt-aagatgttgagtccat-gcatactcatttaagttg 20136594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 22196178 - 22196275
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| | || ||||||||  ||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22196178 taagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgt-aagatgttgagtccat-gcatactcatttaagttg 22196275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 23528201 - 23528298
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||  | | ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23528201 taagatgtaagatgttgatccaaactattggagtcatataagatgttcatgatgtctaagttgt-aagatgttgagttcat-gcatactcatttaagttg 23528298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 282
Target Start/End: Original strand, 18822053 - 18822090
Alignment:
Q  245 gcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18822053 gcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 18822090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 19829807 - 19829875
Alignment:
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcata 176  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  19829807 tcattaagttgcaagtgttggtctaagttgta-aagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcata 19829875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18456627 - 18456587
Alignment:
Q  236 tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456627 tgggagagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 18456587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18461787 - 18461747
Alignment:
Q  236 tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18461787 tgggagagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 18461747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31733744 - 31733716
Alignment:
Q  266 atttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733744 atttatacatattatgttgagggcttgat 31733716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15099321 - 15099050
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15099321 atatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatactatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatca 15099222  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15099221 tgaagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattagagtcataagagctgtctaagttgttaagttgttaaaatgt 15099123  T
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15099122 tgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 15099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 362221 - 361956
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  362221 tgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 362122  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362121 cattaagatgctaatgttggt---------ttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 362031  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  362030 attgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 361956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19609560 - 19609292
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  19609560 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgttacatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 19609471  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||    
T  19609470 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagctg-taaga 19609375  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609374 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgaggacttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 19609292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 35812253 - 35812521
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||              
T  35812253 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatctaatgatgttgtcttgctgttgtgat---------- 35812342  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  35812343 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgaaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 35812438  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35812439 cgttgactcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatatatatttatacatatcatgttgagggcttgat 35812521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19857429 - 19857283
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19857429 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtagttaagatgttgaggccattgcatactcatttacgt 19857330  T
Q  236 tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857329 tgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 19857283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33186190 - 33185920
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |  || |||| || || |||| |||||||||| |||||||     
T  33186190 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaattaatac 33186091  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33186090 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaatcattggtatcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagat 33186003  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33186002 gttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgtcctgtaatgtatatttatacatattatattgaaggcttgat 33185920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 630910 - 631091
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  630910 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattattgatgttgacttgctgcaaattatttgattttgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 631009  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | || |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  631010 cattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatatcgacccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 631091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 15868845 - 15869026
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15868845 tgatatgaagttgtaatgattatatctgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 15868944  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  15868945 cattaagatgctaatgttggtttaagtcgcttgagttataagatgttggcccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 15869026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Original strand, 15869019 - 15869163
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-ttaa 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  15869019 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcatactcataatac 15869118  T
Q  234 gt--tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15869119 gtgatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 15869163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 294
Target Start/End: Original strand, 15042058 - 15042212
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt--aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaa 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15042058 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaa 15042155  T
Q  234 gttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15042156 gttg----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 15042212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15112366 - 15112212
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt--aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaa 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15112366 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaa 15112269  T
Q  234 gttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15112268 gttg----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 15112212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13844515 - 13844384
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13844515 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgattattattgttgatgatgacttgctataaattatttgatggtgttgccttgttgatgtgatgtattaata 13844416  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtt 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  13844415 tcattaagatgttaatattggtttaagttgtt 13844384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46642691 - 46642580
Alignment:
Q  182 tgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatg 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46642691 tgtctaagttgttaagttgttaagatgttgaatc-attgcatactcatttaagttgggtgagggtttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatg 46642593  T
Q  282 ttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||    
T  46642592 ttgagggcttgat 46642580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46642809 - 46642679
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  46642809 tgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacgtgctgcatattagttaatagtgttgccttgccgtcgtggtgtattaatat 46642710  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtt 138  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46642709 cattaaggtgctaatgtttgtctaagttgtt 46642679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32851361 - 32851218
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32851361 tgatatgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatatgatgttgttgccttgctgatgtgatatattaatat 32851262  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  32851261 cattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagat 32851218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32851192 - 32851052
Alignment:
Q  137 tttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---atttaa 233  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||   || | |    
T  32851192 tttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaggttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatatga 32851093  T
Q  234 gttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32851092 gatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 32851052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13844393 - 13844304
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13844393 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 13844304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 237
Target Start/End: Original strand, 10357362 - 10357471
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10357362 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttgagtcca-tgcatac 10357459  T
Q  226 tcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||    
T  10357460 tcatttaagttg 10357471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3485077 - 3484989
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485077 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 3484989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 10357285 - 10357391
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  10357285 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taa 10357383  T
Q  205 gatgttga 212  Q
    ||||||||    
T  10357384 gatgttga 10357391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3514985 - 3514880
Alignment:
Q  174 ataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta--agttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatattta 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3514985 ataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcataatacgagatgggagagggcttgatgatctgtaatgtatattta 3514886  T
Q  271 tacata 276  Q
    ||||||    
T  3514885 tacata 3514880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9923385 - 9923296
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9923385 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 9923296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14185201 - 14185097
Alignment:
Q  84 cttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatg 183  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  14185201 cttgttgttgtgacgtattaatatcattaaggtgctaatgttggtctaagttgcttaagttgtaagatgttgatccaaacta-tcgagtcatatgagatg 14185103  T
Q  184 tctaag 189  Q
    | ||||    
T  14185102 tttaag 14185097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 11479474 - 11479556
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctg 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  11479474 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattacttaatggcgctgccttgctg 11479556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 52873303 - 52873369
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  52873303 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttaa 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15880785 - 15880726
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatat 67  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15880785 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctacatat 15880726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 10357535 - 10357588
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  10357535 tgagggcttgatgccctgtaatgtata-ttatacatataatgttgagggtttgat 10357588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 276
Target Start/End: Original strand, 21815788 - 21815868
Alignment:
Q  199 tgttaagatgttgagtccattgcatactcatt-ta--agttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||  || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815788 tgttaagaagttgagtccattacatacgcataatacgagatgggagagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 21815868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Original strand, 21815877 - 21815917
Alignment:
Q  236 tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815877 tgggagagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 21815917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 38550137 - 38550411
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38550137 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgctgatgtgatgtattaatat 38550236  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38550237 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagat 38550336  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38550337 gttgagtccattgcatacttatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 38550411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 20982771 - 20983045
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20982771 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgatttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 20982870  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20982871 cattaagatgttaatgtttgtttaaattgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagat 20982970  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20982971 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgaaagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 20983045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 27472442 - 27472708
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27472442 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 27472541  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  27472542 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagat 27472633  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27472634 gttgagtctattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatatatatttatacataatatgt 27472708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39833961 - 39833687
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaa-tggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtg-ttgccttgctgttgtgatgtattaat 105  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||| |||||| | ||| |||  ||||  || |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39833961 tgatatgaagttgcaaatggttatatatgaagattattattgatggttactcgctgtatatgtttaaatgatgattgccttgctgatgtgatgtattaat 39833862  T
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaag 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39833861 atcatgaagat-ctaatgttgatctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttgagttgttaag 39833763  T
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatg 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39833762 atgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgatggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatg 39833687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 6102530 - 6102738
Alignment:
Q  24 tggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatg 123  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6102530 tggttatatttgatgattgttgttgatgttgacttgctccatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatg 6102629  T
Q  124 ttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    || | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6102630 ttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatg----agttcttaagtcg-taagatgttgagtccattgcat 6102724  T
Q  224 actcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  6102725 actcatttaagttg 6102738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 39936826 - 39937094
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||              
T  39936826 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctatcgtgat---------- 39936915  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  39936916 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagtcgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 39937011  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39937012 tgttgagtcca-tgcatacttatttaagt----tgagggcttgatgccctctaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 39937094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 21579970 - 21580241
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  21579970 tgatatgaagttgtaattgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 21580069  T
Q  108 catt-aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||| ||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||    
T  21580070 catttaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aaga 21580157  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21580158 tgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 21580241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18760623 - 18760481
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18760623 tgatatgaagttataatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgatgccttgctattgtgatgtattaatat 18760524  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaaga 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18760523 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaaga 18760481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Original strand, 13428328 - 13428462
Alignment:
Q  148 agatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggct 247  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  13428328 agatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattacatactcatttacgttgggtgagggtt 13428427  T
Q  248 tgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13428428 tgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 13428462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24713371 - 24713189
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24713371 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtctaagctgtttaagttgt-aa 24713274  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713273 gacgttgagtccct-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 24713189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Original strand, 1323366 - 1323495
Alignment:
Q  153 ttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatg 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  1323366 ttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttaagtacattgcatattcatttacgtcgggtgagggcttgatg 1323465  T
Q  253 ctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1323466 ctctgtaatgtatatttatacataatatgt 1323495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 1327171 - 1327300
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1327171 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 1327270  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1327271 cattaagatgctaatgttggtttaagttgt 1327300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 272
Target Start/End: Original strand, 41680886 - 41681133
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || ||||||| || |||| |||||||||| |||||||     
T  41680886 tgatatcaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaattaatac 41680985  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||    
T  41680986 cattaagatg----------tc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcg-taagat 41681072  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttata 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41681073 gttgagtccattgcatactcatttaagt----cgagggcttgatgccctgtaatgtatatttata 41681133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 29763632 - 29763846
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||  || |||| || || ||||||||||||||| |||||||     
T  29763632 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaatac 29763730  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  29763731 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtttaagttgttaagtcg-taagat 29763818  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763819 gttgagtccattgcatactcatttaagt 29763846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 42560291 - 42560419
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  42560291 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttaccttgcggttgtgacgtattaatat 42560390  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42560391 catgaagat-ctaatgttggtataagttgt 42560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Original strand, 21415244 - 21415421
Alignment:
Q  26 gttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaag-atgctaatgt 124  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||    
T  21415244 gttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattatatgatgttgccttgctgttgtgaagtaataatgtcattaagaattctaa-gt 21415342  T
Q  125 tggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcat-aagagatgtctaagctgttaagttgtt 202  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  21415343 tggtcaaagtcgttcaagtcgtaagatgttgatccaagttattggagtcataaagagatgtctaagtcgttaagatgtt 21415421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19128073 - 19127978
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128073 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 19127980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19128160 - 19128061
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||             |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19128160 gattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcctg-------------attaggatgctaatgttggtctaagttgt 19128074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18760493 - 18760398
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18760493 ttaagttgt-aagacgttgagtccata-catactcatttaagttg----agggcttgatgtcctgtaatgtatatttatacatgttatgttgggggcttg 18760400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 2418971 - 2419066
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  2418971 taagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcat---atatgtctacgttgtttaagttg-taagatgttgagtctcatgcatactcattcaagttg 2419066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 187
Target Start/End: Original strand, 35026960 - 35027008
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtcta 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  35026960 taagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcgtataagatgtcta 35027008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Original strand, 9389845 - 9390116
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9389845 atatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatca 9389944  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgt 209  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  9389945 tgaagat-ctaatgtgggtctaagttgtttaagttgtaaaatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagctgttaagatat 9390043  T
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9390044 tgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 9390116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17232596 - 17232330
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17232596 tgatatgaagttggaatggttgtattagatgattattgttgctgttgacttgctgtatattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 17232497  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  17232496 cattaagatgctaatgttggtttgagttgtttaagttgtaaggtgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagat 17232405  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17232404 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctatgtaatgtatatttatacataatatgt 17232330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 37727692 - 37727957
Alignment:
Q  9 gatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37727692 gatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatc 37727791  T
Q  109 attaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatg 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||        |||||||||||||||    
T  37727792 attaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcatatgagatgtc--------taagttgttaagatg 37727883  T
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37727884 ttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 37727957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 6170283 - 6170522
Alignment:
Q  42 attgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaa 141  Q
    ||||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6170283 attgttgatgatgacctactgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagttgctaatgttggt-taagttgtttaa 6170381  T
Q  142 gttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtg 241  Q
    ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6170382 gttatatgatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtg 6170481  T
Q  242 agggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  6170482 agggcttgatgctctataatgtatatttatacataatatgt 6170522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 45847786 - 45848043
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45847786 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 45847885  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  45847886 cattaagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagat 45847968  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45847969 gctgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 45848043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Original strand, 14270190 - 14270428
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14270190 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 14270289  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaag----ttgtta 203  Q
    |||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||    
T  14270290 cattaagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtcaattgtta 14270380  T
Q  204 agatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14270381 agatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgat 14270428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8468402 - 8468173
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8468402 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttaatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 8468303  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  8468302 cattaagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcataagagatgtc--------taagttgttaagat 8468220  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8468219 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgct 8468173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Original strand, 36686013 - 36686284
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36686013 ctgatatgaagttttaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaata 36686112  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
     ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  36686113 ccattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taaga 36686200  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36686201 tgttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 36686284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 8851981 - 8852249
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||              
T  8851981 tgatataaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttactgcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgtgat---------- 8852070  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  8852071 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 8852166  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8852167 cattgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattattttgagggcttgat 8852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11066704 - 11066436
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  11066704 tgatatgaagttgtaatagttatattggatgatcattgttgttgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 11066615  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11066614 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 11066519  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11066518 cgttgagtcca-tgcatactcttttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 11066436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 30821020 - 30821290
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||  || |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  30821020 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaatac 30821119  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  30821120 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 30821207  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30821208 gttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgtcatgtaatgtatatttttacatattatgttgagggcttgat 30821290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38480325 - 38480055
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  38480325 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 38480226  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||           ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  38480225 cattaagata----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 38480138  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38480137 gtagagtctattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccatgtaatatatatttatacatattatgttgggggcttgat 38480055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 32434406 - 32434673
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  32434406 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgctgatgttgactt-ctggattttatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 32434494  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaaga 206  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  32434495 ---tagaatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aaga 32434590  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||     ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32434591 cgttgagtccat-gcatactcatttaagttt----aggtcttgatgttctttaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 32434673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12371514 - 12371299
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||              
T  12371514 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgtgat---------- 12371425  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  12371424 ---taggatgctaatgttagtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 12371329  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
      ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12371328 cattgagtcca-tgcatactcattcaagttg 12371299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 59239 - 59476
Alignment:
Q  40 ttattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgttt 139  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||       ||  |||     |||||||||||||||||||||||    
T  59239 ttattgttgatgttgacttgctccatattatttaatgttgttgccttgctgtcgtaat-------taggatt-----gctaatgttggtctaagttgttt 59326  T
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgg 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||       
T  59327 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatgctcatttaagt--- 59421  T
Q  239 gtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  59422 -tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgtgggattgat 59476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 12127982 - 12128195
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||                
T  12127982 atatgaagttgtaatggatatattggacgattattgttgatgttgacttactgcatattagttaatggtgctgccttgctgtcgtgat------------ 12128069  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatg 208  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  12128070 -taggatgctaatgttggtcgaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacg 12128167  T
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12128168 ttgagtcca-tgcatactcatttaagttg 12128195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 294
Target Start/End: Original strand, 13150458 - 13150620
Alignment:
Q  118 ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtcca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||         |||| ||||||||||    
T  13150458 ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatctaaattatttgagtcatatgagatttctaagttgt---------aagacgttgagtcca 13150548  T
Q  218 ttgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150549 t-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 13150620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Original strand, 46386997 - 46387146
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgg 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  46386997 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg- 46387093  T
Q  239 gtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
       ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46387094 ---agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 46387146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48812018 - 48811869
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttggg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48812018 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg-- 48811922  T
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
      || | |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48811921 --agagtttgatgccctgtaatgtatatttataaatatcatgttgagggcttgat 48811869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18302143 - 18302016
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18302143 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttggcttgttgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 18302044  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18302043 cattaagatgctaatgttggtttaagtt 18302016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15213787 - 15213659
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15213787 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatat 15213688  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15213687 catgaagat-ctaatgttggtataagttgt 15213659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 11391948 - 11392102
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||             ||     
T  11391948 gaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgctgttttgctgtcgtgat-------------tag 11392034  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11392035 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 11392102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 13148288 - 13148377
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13148288 tgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 13148377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Original strand, 18875861 - 18875956
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875861 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 18875954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20619340 - 20619253
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20619340 taagacgttgagtccat-gcatactcattcaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 20619253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 18075463 - 18075559
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18075463 aagttgtaagatgttgattcaaattatttgagtcatataagatatctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcatttaagttg 18075559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 14183560 - 14183653
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaa 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |   |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14183560 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctttg--tttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcatttaa 14183653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 20253594 - 20253648
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20253594 tgagagcttgatgctctgaaatgtataattatacatattaagttgagggtttgat 20253648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Original strand, 1465559 - 1465830
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  1465559 atatgaagtcgtaatggttggatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgtggttgtggcgtattaatatca 1465658  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1465659 tgaagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgt 1465757  T
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1465758 tgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttaaacataatatgt 1465830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Original strand, 18439993 - 18440261
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  18439993 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacctgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgctgaggtgatgtattaatat 18440092  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagag-atgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18440093 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagaatgtctaagttgttaagttgttaaga 18440192  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18440193 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgaggg-ttgatgctctgtaatgtatatttatacata 18440261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 49389816 - 49390090
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49389816 tgatatgaagttgtaattgttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtgttaatat 49389915  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49389916 cattaagatgttaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagat 49390015  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49390016 gttgagttcattgcatactcatttacgttgggtgacagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 49390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12269545 - 12269267
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  12269545 tgatatgaagttgtaatgattatatttgatgattattgttgatgttgacgtgctgcatattagttaatagtgttgccttgcagtcgtggtctattaatat 12269446  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||        ||||||||||||||    
T  12269445 cattaaggtgctaatgttagtataagttgtttaagttgtaaggtgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc--------taagttgttaagat 12269354  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12269353 gttgagtccattgcatacttatttaagttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtacatttatacatattatgttgagggcttgat 12269267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 20630243 - 20630509
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20630243 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 20630342  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||| ||||||    
T  20630343 cattaagatgctaatgtttgtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttggtaagat 20630434  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20630435 gttgagtccattgcatactcatttacattaggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 20630509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40807232 - 40806964
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  40807232 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 40807143  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40807142 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 40807047  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807046 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 40806964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 22307399 - 22307667
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||             
T  22307399 tgatatgaagttgtaatgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgatg--------- 22307489  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  22307490 ----aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 22307584  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307585 cgttgagtcca-tgcatactcattcaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 22307667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 30175330 - 30175598
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||              
T  30175330 tgatatgaagttgtaatggatatatgggatgattattgttgatgttgacttgcttcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgtgat---------- 30175419  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  30175420 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 30175515  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30175516 ttttgagtcca-tgcttactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatccatattatgttgagggcttgat 30175598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17538343 - 17538075
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  17538343 tgatatgaagttgtattgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 17538254  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  17538253 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgaaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 17538158  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538157 cgttgactcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 17538075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 31224718 - 31224988
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  31224718 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 31224817  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||||||| |          ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  31224818 cattaagatgtt----------taagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 31224905  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224906 gttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 31224988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 49970016 - 49970175
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49970016 tgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtactgccttgctgttgtgatgtattattat 49970115  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattatt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49970116 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaagtatt 49970175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 15447764 - 15448031
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||   ||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  15447764 tgatatgaagttgtaattgttatatatga---ttattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 15447860  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  15447861 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagat 15447948  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447949 gttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 15448031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31415492 - 31415230
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  31415492 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 31415393  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  31415392 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 31415305  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415304 gttgagtccattgcatactcatt---------tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 31415230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14501109 - 14500888
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  14501109 tgatatgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatatgatgttgttgccttgctaatgtgatatattaatat 14501010  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  14501009 cattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtttttaggat 14500910  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcat 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  14500909 gttgagtccattgcatattcat 14500888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Original strand, 41173220 - 41173403
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  41173220 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taa 41173318  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41173319 gacgttgagtcca-tgcatactcatttacgt----tgagggctagatgccatgtaatgtatatttatacacattatgttgagggcttgat 41173403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Original strand, 17519827 - 17519989
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  17519827 gtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatac 17519924  T
Q  226 tcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519925 tcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 17519989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Original strand, 17534689 - 17534851
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  17534689 gtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatac 17534786  T
Q  226 tcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534787 tcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 17534851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5215068 - 5214886
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5215068 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aa 5214971  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5214970 gtcgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 5214886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13516529 - 13516368
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattg 220  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13516529 atgttggtcaaagttgtc-aagttgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaagttgttaagtcgt-aagatgttgagtccattg 13516432  T
Q  221 catactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgaggg 288  Q
    |||||| ||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516431 catacttatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgaggg 13516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40811928 - 40811779
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgg 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40811928 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg- 40811832  T
Q  239 gtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
       ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811831 ---agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 40811779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Original strand, 5206503 - 5206687
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagtt-gtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgtta 203  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||| |    
T  5206503 atcattaagttgcatatattggtctaagttgtttaaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttttttaagttgt-a 5206601  T
Q  204 agatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206602 agacgttaagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 5206687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45797153 - 45796978
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45797153 tgatatgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgca-attatatgatgttgttgccttgctgatgtgatatattaatat 45797055  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  45797054 cattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcatatgagatgt 45796978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 12852504 - 12852631
Alignment:
Q  8 tgatatgaagtt-gtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12852504 tgatatgaagtttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaata 12852603  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagt 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12852604 tcattaagatgctaatgttggtttaagt 12852631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14508054 - 14507872
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||| ||||||| ||    
T  14508054 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgaatcaaattattggagtcatataagatatttaagttgtttaagttgt-aa 14507957  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507956 gacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 14507872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Original strand, 23413557 - 23413699
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||   || |    
T  23413557 tgtttaagttgtatgatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgctaggatgttgagtccattgcatattcataatct 23413656  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23413657 gagatgggggagggcttgatgctctataatgtatatttataca 23413699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45796980 - 45796838
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||   || |    
T  45796980 tgtttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgtttagttgttaggatgttaagtccattgcatattcataatct 45796881  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45796880 gagatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 45796838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 291
Target Start/End: Original strand, 15932371 - 15932535
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| | ||||||| || |    
T  15932371 atgttggtc-aagttgtttaaattgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtttaagttgtttaagttg-taacacgttgagt-caat 15932467  T
Q  220 gcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15932468 gcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatattgagggctt 15932535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5842011 - 5841857
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||             ||     
T  5842011 gaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgttgttttgctgtcgtgat-------------tag 5841925  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5841924 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 5841857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 294
Target Start/End: Original strand, 13026636 - 13026720
Alignment:
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026636 atgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 13026720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 23413385 - 23413564
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |  |||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23413385 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattactgttgacgttgacttgttgcgaattattga-tgttgttgtcttgctgatgtgatgtattaatat 23413483  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  ||| |||| |||||| | |  |||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  23413484 cattaagatgctaatgtt-gtttaagtcatttgagttataagatgtcggcccaaattattggagtcatttgagatgtttaag 23413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 294
Target Start/End: Original strand, 13031725 - 13031809
Alignment:
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13031725 atgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatgttatgttgagggcttgat 13031809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17693264 - 17693155
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17693264 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttaatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagttgttgagtcca-t 17693167  T
Q  220 gcatactcattt 231  Q
    ||| ||||||||    
T  17693166 gcacactcattt 17693155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 276
Target Start/End: Original strand, 19485261 - 19485335
Alignment:
Q  201 ttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19485261 ttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgaggg-ttgatgctctgtaatgtatatttatacata 19485335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11913009 - 11912881
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  11913009 tgatatgaaattgtaattgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacatattaattt 11912910  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11912909 catgaagat-ctaatgttggtataagttgt 11912881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 17548519 - 17548598
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17548519 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatctatatttatacatattatgttgagggcttga 17548598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17044143 - 17044064
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044143 tgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 17044064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40812074 - 40811993
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgct 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40812074 tgatatgaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgctttgct 40811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 1988996 - 1989049
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgct 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1988996 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgct 1989049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 17519784 - 17519838
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17519784 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtt 17519838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 17534646 - 17534700
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17534646 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtt 17534700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 186
Target Start/End: Original strand, 52466418 - 52466475
Alignment:
Q  129 ctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtct 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  52466418 ctaagctgttcaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtct 52466475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 276
Target Start/End: Original strand, 53070856 - 53070936
Alignment:
Q  199 tgttaagatgttgagtccattgcatactcatt-ta--agttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||  || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53070856 tgttaagaagttgagtccattgcatacgcataatacgagatgggagagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 53070936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3020 - 2746
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3020 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatatgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 2921  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2920 cattaagatgctaatgttggtttaagttttttaagttataagatgttggtctaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtttttaagat 2821  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2820 gttgagtgcattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 28194595 - 28194869
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28194595 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgataacctgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgaggtgatgtattaatat 28194694  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28194695 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtctaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgtttagat 28194794  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28194795 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 28194869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 46382701 - 46382975
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  46382701 tgatatgaagttgtaatggttttattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccatgctgatgtaatgtattaatat 46382800  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46382801 cattaagatgctaatgttggtttaagttttttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagat 46382900  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46382901 attgagtctattgcatactcatttacgttgggtgagggtttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 46382975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Original strand, 35981836 - 35982099
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35981836 atatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgttgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatca 35981935  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |        ||||||||||||||||    
T  35981936 tgaagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgcc--------taagttgttaagatgt 35982026  T
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  35982027 tgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtttatttatacataatatgt 35982099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43697349 - 43697075
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  43697349 ctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatggtgttaccttgttgatgtgatgtattaata 43697250  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  43697249 tcattaagatgctaatgttggt-taagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagtgatgtctaagtttttaagttgttaaga 43697151  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43697150 tgttgagtttattgcatactcatttacgttgggtgagggtttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 43697075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43543085 - 43542819
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43543085 tgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtcatgtattaatat 43542986  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  43542985 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgaaccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagat 43542894  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43542893 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 43542819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Original strand, 41305814 - 41306007
Alignment:
Q  80 ttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataaga 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41305814 ttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggt---------ttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataaga 41305904  T
Q  180 gatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatatta 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41305905 gatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataata 41306004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48301099 - 48300831
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||              
T  48301099 tgatatgaagttgtaatggttacatgagattattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgtcttgttgtcgtgat---------- 48301010  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaaga 206  Q
       || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| | || ||||||| ||||    
T  48301009 ---taggatgttaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagttgtttaagttttttaagttgt-aaga 48300914  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48300913 ttttgagtccat-gcatactcatttaagttt----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 48300831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 51274352 - 51274622
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| | |||  ||| |||||||||| |||||||     
T  51274352 tgatatgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaattaatac 51274451  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  51274452 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 51274539  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51274540 gttgagtctattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgcaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 51274622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20636821 - 20636694
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20636821 atatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccctgttgttgtgatgtattaatatca 20636722  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtt 138  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20636721 tgaagat-ctaatgttggtctaagttgtt 20636694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20587866 - 20587698
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  20587866 atgttggtctaagttgtttaagctgtaagatgttgatccaaattataggagtcatattaaatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat- 20587769  T
Q  220 gcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587768 gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatataatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 20587698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20592404 - 20592236
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  20592404 atgttggtctaagttgtttaagctgtaagatgttgatccaaattataggagtcatattaaatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat- 20592307  T
Q  220 gcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592306 gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatataatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 20592236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Original strand, 20634508 - 20634658
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  20634508 taagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttgagtaca-tgcatactcatttaagt-- 20634603  T
Q  238 ggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
      ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20634604 --tgagggcttgatgccctataatgtatatttatacaaattatgttgagggtttgat 20634658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20636705 - 20636606
Alignment:
Q  183 gtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20636705 gtctaagttgttaagtcgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatccataatatgt 20636606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35088580 - 35088485
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088580 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 35088487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Original strand, 14238498 - 14238586
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14238498 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagagcttgat 14238586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 13528762 - 13528841
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13528762 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 13528841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 41227622 - 41227725
Alignment:
Q  133 gttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcattt 231  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||    
T  41227622 gttgtctaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-caacacgttgagtcca-tgcatactcattt 41227719  T
Q  232 aagttg 237  Q
    ||||||    
T  41227720 aagttg 41227725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Original strand, 11809380 - 11809482
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  11809380 tattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttacg-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtgtaagttgtctaag 11809478  T
Q  198 ttgt 201  Q
    ||||    
T  11809479 ttgt 11809482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Original strand, 41227522 - 41227603
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgt 91  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41227522 atatgaagttttaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcataatatttaattgtgctgccttgctgt 41227603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23073154 - 23073052
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  23073154 tattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttaca-aagttctaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtttaagttgtctaag 23073056  T
Q  198 ttgt 201  Q
    ||||    
T  23073055 ttgt 23073052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16381203 - 16381109
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||| | | |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16381203 taagatgtaagatgttgatccaaattattggaatcataaga--tgtcgatgtttctaagttgt-aagatgttgagtcca-tgcatactcatttatgttg 16381109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6576462 - 6576181
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6576462 tgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctattgtgatgtaataatat 6576363  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  6576362 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 6576264  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6576263 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttataaatattatgttgggggcttgat 6576181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 24781656 - 24781924
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||              
T  24781656 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgatgctgccttgatgtcgtgat---------- 24781745  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24781746 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 24781841  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781842 cgttgagtcca-tgcatactcatttatgt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 24781924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 5032140 - 5032408
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||              
T  5032140 tgatatgaagttataatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgttgttgccttgctgtcgtgat---------- 5032229  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagct-gttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||    
T  5032230 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgaggtgtttaagttatttaagttg-taaga 5032325  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5032326 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 5032408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22689824 - 22689656
Alignment:
Q  113 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  22689824 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttg 22689726  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgag 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22689725 agtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgag 22689656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22694420 - 22694252
Alignment:
Q  113 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  22694420 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttg 22694322  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgag 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694321 agtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgag 22694252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24436279 - 24436021
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||              
T  24436279 tgatatgaaattgtaatggttacattggatgatt-ttgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtaat---------- 24436191  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||         ||||||    
T  24436190 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttg---------taagat 24436103  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24436102 gttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgaaggcttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 24436021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24883689 - 24883430
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||              
T  24883689 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttggtgtcgtgat---------- 24883600  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaaga 206  Q
       || ||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  24883599 ---taggatgctaatgttggtctaagttgt---------aagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aaga 24883513  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24883512 cgttgagtccat-gcatactaatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttttacatattatgttgagggcttgat 24883430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9975055 - 9974893
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  9975055 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatataagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatac 9974958  T
Q  226 tcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9974957 ccatttaagt----tgagggcttgatgccctggaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 9974893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22501077 - 22500860
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||| | |||||| | ||||||| |||||  || |||| || || |||||| |||||||| |||||||     
T  22501077 tgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaatac 22500978  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  22500977 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 22500890  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22500889 gttgagtctattgcatactcatttaagttg 22500860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22509011 - 22508794
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||| | |||||| | ||||||| |||||  || |||| || || |||||| |||||||| |||||||     
T  22509011 tgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaatac 22508912  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  22508911 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 22508824  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22508823 gttgagtctattgcatactcatttaagttg 22508794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 24865534 - 24865751
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||     
T  24865534 tgatatgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctattgtgatgaattaatac 24865633  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  24865634 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagat 24865721  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  24865722 gtcgagtccgttgcatactcatgtaagttg 24865751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26896362 - 26896278
Alignment:
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896362 atgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggattgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 26896278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Original strand, 7672421 - 7672531
Alignment:
Q  179 agatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatatt 278  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7672421 agatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgtcgagtccattgcatactcatggaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatatt 7672515  T
Q  279 atgttgagggcttgat 294  Q
    | ||||||||||||||    
T  7672516 acgttgagggcttgat 7672531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21368050 - 21367914
Alignment:
Q  53 tgacttgctacatattatttaatggtgttgcct-tgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagat 151  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | | ||||||||||||    
T  21368050 tgacttgttgcatgttatttaatgttgctgcctctgcggttgtgatttattaatatcattaagatgcaaacgttggtctaagaag-taaagttgtaagat 21367952  T
Q  152 cttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  21367951 gttgttccaaattattggagtcatatgagttgtctaag 21367914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 6478254 - 6478333
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6478254 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttgatgccctgtaatgtatatttatgcatattatgttgagggcttga 6478333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20915222 - 20915126
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20915222 aagttgtaagatgttgttctaaagtattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttgaatccattgcatgctcatttaagttg 20915126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 357051 - 356983
Alignment:
Q  222 atactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  357051 atactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 356983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 24865791 - 24865845
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24865791 tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 24865845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9975116 - 9975026
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttga 212  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9975116 atgttggtcaaa-ttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttga 9975026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 19202169 - 19202223
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19202169 tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatatatattatgttgagggcttgat 19202223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 20913058 - 20913096
Alignment:
Q  256 tgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913058 tgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 20913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 23969686 - 23969740
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23969686 tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacaaattatgtgtagggcttgat 23969740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5985286 - 5985197
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  || ||||||||    
T  5985286 tattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-taaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgtctaag 5985197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 2440 - 2672
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2440 atatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcattttatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatca 2539  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2540 tgaagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgt 2638  T
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgag 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2639 tgagtccattgcatactcatttacgttgggtgag 2672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 85223 - 84991
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  85223 tgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattaattgatggtgttgccttgctgatttgatgtattaatat 85124  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  85123 cattaatatgctaatgttggtttaagttgtttaagttttaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagat 85024  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  85023 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggt 84991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Original strand, 21741681 - 21741961
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21741681 atatgaaatcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttacggttgtgacgtattaatatca 21741780  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaag---------ttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttg 200  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||         ||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21741781 tgaagat-ctaatgttggtttaagttgtttaagttgtttaagttataagatgttggcccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaaattg 21741879  T
Q  201 ttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741880 ttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 21741961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Original strand, 5889320 - 5889579
Alignment:
Q  7 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5889320 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaata 5889419  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||                | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5889420 tcattaagatgctaatgttgatttaagatgtt----------------ggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaaga 5889503  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5889504 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 5889579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 29915219 - 29915457
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29915219 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattattgaatggcgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 29915318  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  29915319 cattaagatgctaatgtttatttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagat 29915410  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29915411 gttgagtccattgcatactcatttacgatgggcgagggcttgatgct 29915457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 12122285 - 12122555
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||  || |||| || || ||||||||||||||| |||||||     
T  12122285 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaatac 12122384  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    |||| ||||| |          ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12122385 cattgagatgtt----------taagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgttaagttg-taagat 12122472  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122473 gttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 12122555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 21557809 - 21558079
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  21557809 tgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttatgatgaattaatac 21557908  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||    
T  21557909 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaacttgttaagtcgtta-gat 21557996  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557997 gttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 21558079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 21555150 - 21555414
Alignment:
Q  15 aagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt-aa 113  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  21555150 aagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaa 21555249  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgag 213  Q
    ||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  21555250 gatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttgag 21555337  T
Q  214 tccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21555338 tccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgataccctgtaatgtatatttatatatattatgttgagggcttgat 21555414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17875302 - 17875032
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| | ||  ||||||||||||| | |||||||     
T  17875302 tgatatgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattatcttgctgttgtgaagaattaatac 17875203  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  17875202 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatataagatgtctaagttgttaagtcgt-aagat 17875115  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875114 gctgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 17875032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31455135 - 31454896
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||          ||||||||||    
T  31455135 gattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatg----------tctaagttgt 31455046  T
Q  138 ttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31455045 t-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagttcat-gcatactcatttaagttg 31454949  T
Q  238 ggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
        ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31454948 ----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 31454896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31455748 - 31455509
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||          ||||||||||    
T  31455748 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatg----------tctaagttgt 31455659  T
Q  138 ttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31455658 t-aagttgtaagatgttgatacaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagttcat-gcatactcatttaagttg 31455562  T
Q  238 ggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
        ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31455561 ----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 31455509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36460258 - 36460130
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||    
T  36460258 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgtcttgcggttgtgacatattaatat 36460159  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36460158 catgaagat-ctaatgttggtataagttgt 36460130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30615844 - 30615667
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||  || || | || || |||||||||| |||| |||||||     
T  30615844 tgatatgaagttgtaattgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgttgcgatgaattaatac 30615745  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaa 196  Q
    ||||||||||          | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30615744 cattaagatg----------tataagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcgtatgagatgtctaagttgttaa 30615667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19920778 - 19920683
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19920778 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgtcatgtaatgtatatttatacatattattttgagggcttg 19920685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 21871707 - 21871771
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattattt 72  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  21871707 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattattt 21871771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 21875987 - 21876051
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattattt 72  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  21875987 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattattt 21876051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 25250739 - 25250875
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  || |||  ||| ||| ||||    
T  25250739 tattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaag 25250837  T
Q  198 ttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25250838 ttg-taagttgttgagtcca-tgcatactcatataagttg 25250875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 25314524 - 25314660
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  || |||  ||| ||| ||||    
T  25314524 tattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaag 25314622  T
Q  198 ttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25314623 ttg-taagttgttgagtcca-tgcatactcatataagttg 25314660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 21309019 - 21309073
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21309019 tgagggtttgatgccctgaaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 21309073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25743744 - 25743647
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||  | | || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25743744 taagatgtaagatgtcaatccaaattattggagtcatatgagatgttcacgttgtttaagttg-taagaagttgagtcca-tgcatactcatttaagttg 25743647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 106456 - 106266
Alignment:
Q  92 tgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagct 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  106456 tgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaagttattggagtcataagagatgtctaagtt 106357  T
Q  192 gttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  106356 gttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttaggtgagagtttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 106266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 362980 - 362787
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  362980 tgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattaattgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 362881  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  362880 cattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggattcataagagatgtctaagttgtaaagttgt 362787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9386
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||              
T  9118 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgatgtcgtgat---------- 9207  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagct-gttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||    
T  9208 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgaggtgtttaagttatttaagttg-taaga 9303  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9304 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 9386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14428 - 14158
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  14428 tgatatgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatac 14329  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  14328 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagat 14241  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14240 gttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 109 - 282
Target Start/End: Original strand, 46923 - 47095
Alignment:
Q  109 attaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  46923 attaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaattgttggagtcatatgagatgtctaagttgttaagttg-taaaatg 47021  T
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47022 ttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 47095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 145938 - 145755
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaag 205  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  145938 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaaattg-taag 145840  T
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145839 atgttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 145755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 10042 - 10310
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  10042 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 10131  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10132 ---taggatgctaatgttggcctaagttgtttaagtcgtaagacgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 10227  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    | || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10228 cgttgagtcca-tgcatactcatttaagt----taagagcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgaaggcttgat 10310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 59369 - 59637
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||              
T  59369 tgatatgaagttgtaattgttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatggtgttgccttgctgtcgtgat---------- 59458  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaaga 206  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  59459 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgcaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taaga 59554  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  59555 tgttgagtcca-tgcatactcatttaatt----tgaggacttgatgccctgtaatatatatttatacatatcatgttgaggacttgat 59637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1654 - 1384
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  1654 tgatatgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaatac 1555  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  1554 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagat 1467  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1466 gtcgagtctattgcatactcatgtaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 103
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaag 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  243 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacg 144  T
Q  235 ttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  143 ttgggtga-ggcttgacgctctgtaatgtatatttatacata 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 414 - 236
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  414 atatgaagttataatgattatatttgatgattattgttgatgttgacttgttgtaaattattcgatggtgttgcct-gctgatgtgatgtattaatatca 316  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  315 ttaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgttggtccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Original strand, 23657 - 23797
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaag 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23657 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacg 23756  T
Q  235 ttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23757 ttgggtga-ggcttgacgctctgtaatgtatatttatacata 23797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 23486 - 23664
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23486 atatgaagttataatgattatatttgatgattattgttgatgttgacttgttgtaaattattcgatggtgttgcct-gctgatgtgatgtattaatatca 23584  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23585 ttaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgttggtccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 23664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Original strand, 20770 - 20867
Alignment:
Q  179 agatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20770 agatgtcaaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctataatgtatatttatacata 20867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Original strand, 9576 - 9842
Alignment:
Q  10 atatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatca 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||                
T  9576 atatgaagttgtaatggttatattggatgattaccgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgcattactgtcgtgat------------ 9663  T
Q  110 ttaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatg 208  Q
     || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  9664 -taggatgaaaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacg 9761  T
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9762 ttgagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatggcctataatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 9842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 76977 - 76719
Alignment:
Q  9 gatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||               
T  76977 gatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgattttgatttgctacatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat----------- 76889  T
Q  109 attaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagat 207  Q
      || ||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||     
T  76888 --taggatgctaatgttggtctaagttgt---------aagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtcaaagttgtttaagttgt-aagac 76801  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76800 gttgagtgcat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 76719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 6442 - 6711
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||     
T  6442 tgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctattgtgatgaattaatac 6541  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaaga 206  Q
    ||||||||||          || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  6542 cattaagatg----------tc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aaga 6628  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6629 cgttgagttcat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatatatatttatacatattatgttgagggcttgat 6711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 5562 - 5667
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||    
T  5562 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatctctaagttgtttaagttg-taa 5659  T
Q  205 gatgttga 212  Q
    ||||||||    
T  5660 gatgttga 5667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 194
Target Start/End: Original strand, 5639 - 5705
Alignment:
Q  128 tctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5639 tctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgcagtcatatgagatgtctaagttgtt 5705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 5751 - 5814
Alignment:
Q  131 aagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5751 aagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgcagtcatatgagatgtctaagttgtt 5814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 57951 - 57768
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  57951 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattactggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aa 57853  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57852 gacattgagtccat-gcatactcatttaagtta----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 57768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3152 - 2893
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |             |    
T  3152 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgttgttgccttgttgtcg-------------t 3066  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||        | |||||||| |||||     
T  3065 tattaggatgctaatgtttgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagat--------ttttaagttg-taagac 2975  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2974 gttgagtcca-tgcatactaatttaagt----tgagggcttcctgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgat 2893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 284
Target Start/End: Original strand, 19320 - 19469
Alignment:
Q  131 aagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 230  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320 aagttgttcaagtcgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 19419  T
Q  231 taagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttg 284  Q
    |||||||    |||| ||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19420 taagttg----agggtttgttgccctataatgtatagttatacatattatgttg 19469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 15491 - 15595
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||  || ||| |||| || ||||||  |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15491 tgatatgaagttgcgattgttatattcgatgattatcattgatgttgatttgctgcatat-atttaatgttgatgccttgttgttgtgatgcattaatat 15589  T
Q  108 cattaa 113  Q
    ||||||    
T  15590 cattaa 15595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 24549 - 24653
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||  || ||| |||| || ||||||  |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24549 tgatatgaagttgcgattgttatattcgatgattatcattgatgttgatttgctgcatat-atttaatgttgatgccttgttgttgtgatgcattaatat 24647  T
Q  108 cattaa 113  Q
    ||||||    
T  24648 cattaa 24653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 24790 - 24916
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24790 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 24889  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24890 cattaagatgctaatgttggtttaagt 24916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 8430 - 8612
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8430 tgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatat 8529  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaag-ttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  ||| || || |||||| | |  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8530 cattaagatgctaatgttgatttaagtcatttgagtttataagatgtcggcccaatttattagagtcatatgagatgtttaag 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Original strand, 8605 - 8747
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta- 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  8605 tgtttaagttgtaatatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaaattattaagttgttaggatgttgagtccattgcatactcataatac 8704  T
Q  233 -agttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8705 gagatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 8747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 8202 - 8365
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||              
T  8202 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattgttgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat---------- 8291  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgt 184  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8292 ---taggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13375 - 13233
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || |    
T  13375 tgtttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatat 13276  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13275 gagatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13549 - 13373
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  13549 tgatatgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatatgatgttgttgccttgctgatctgatatattaatat 13450  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13449 cattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcatatgagatgt 13373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25076 - 24940
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||   || |    
T  25076 tgtttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcacattcataatct 24977  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatt 268  Q
     || |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24976 gagatgggggacggcttgatgctctgtaatgtatatt 24940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25180 - 25074
Alignment:
Q  78 tgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataa 177  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| ||||| ||||||||     
T  25180 tgttgccttgctgatctgatatattaatatcattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcatat 25081  T
Q  178 gagatgt 184  Q
    |||||||    
T  25080 gagatgt 25074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Original strand, 2768 - 2917
Alignment:
Q  137 tttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2768 tttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcatttaagt 2865  T
Q  236 tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
        |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2866 ----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Original strand, 2942 - 2986
Alignment:
Q  247 ttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2942 ttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 2986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34952 - 34820
Alignment:
Q  145 gtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta--agttgggtg 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||  || |||| |    
T  34952 gtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatacgagatggggg 34853  T
Q  242 agggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34852 agggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 34820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 7784 - 7911
Alignment:
Q  8 tgatatgaagtt-gtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7784 tgatatgaagtttgtaatgattgtatttgatgattattgttgacgttgacttgctgtgaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaata 7883  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagt 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7884 tcattaagatgctaatgttggtttaagt 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 2499 - 2653
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||             ||     
T  2499 gaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgttgttttgctgtcgtgat-------------tag 2585  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2586 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10983 - 10766
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  10983 tgatatgaatttttaattgttatatatgatgattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttttgatgaattaatac 10884  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagat 207  Q
    ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||| | |||||| || |||||    
T  10883 cattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgaggtgtataagttattaagtcgt-aagat 10796  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10795 gttgagtccattgcatactcatttaggttg 10766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33516 - 33428
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggattgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 33428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4567
Alignment:
Q  174 ataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta--agttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatattta 270  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4672 ataagagatgtctaagttattaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcataatacgagatgggagagggcttgatgctctgtaatgtatattta 4573  T
Q  271 tacata 276  Q
    ||||||    
T  4572 tacata 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 286
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  374 taagatgttaagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtataattatacatattatgttgagggcttgat 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10961 - 10873
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 10873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Original strand, 863 - 951
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  863 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1780
Alignment:
Q  26 gttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaag-atgctaatgt 124  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||    
T  1957 gttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattagatgatgttgccttgctgttgtgaagtaataatgtcattaagaattctaa-gt 1859  T
Q  125 tggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcat-aagagatgtctaagctgttaagttgtt 202  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  1858 tggtcaaagtcgttcaagtcgtaagatgttgatccaagttattggagtcataaagagttgtctaagttgttaagatgtt 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 285 - 157
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  285 tgatatgaaattgtaattgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacatattaattt 186  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  185 catgaagat-ctaatgttggtataagttgt 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4703 - 4575
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  4703 tgatatgaaattgtaattgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacatattaattt 4604  T
Q  108 cattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4603 catgaagat-ctaatgttggtataagttgt 4575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Original strand, 78299 - 78394
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78299 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 78392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 605 - 681
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggct 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 95531 - 95299
Alignment:
Q  58 tgctacatattatttaatggtgttgcct-tgctgttgtgatgtattaatat-cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttg 155  Q
    |||| ||| |||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| |||    
T  95531 tgctgcatgttatttaatgttgatgtctctgctgttgtgat-tattaatattcattaagatgcaaatgttggtctaagttgca-aagtcgtaagatgttg 95434  T
Q  156 atccaaattattagagtcataagagatgtctaagct-gt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgc 253  Q
     ||||| ||||| ||||||||  || |||  ||| | || |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||    
T  95433 ttccaagttattggagtcatataagttgttcaagtttgtctaagttgt-aagttgttgagtccat-gcatactcattaaagttg----agggcttgatgc 95340  T
Q  254 tttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  95339 tctagaatgtatattcatacatattacgttgagggcttgat 95299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 5520 - 5609
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5520 tgatatgaagttgtaatgtttatattggatgattattgttgatgttaacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 5609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 74656 - 74522
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta- 232  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  74656 tgtttaattcgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatac 74565  T
Q  233 -agttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  74564 gagatgggggagggtttgatgctctgtaatgtatatttataca 74522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 85
Target Start/End: Original strand, 11015 - 11092
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgcct 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  11015 tgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgcct 11092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 6823 - 6912
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6823 tgatatggagttgtaatgattatatttgatgattattgttcatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttactgtcgtgat 6912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 893 - 812
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgct 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  893 tgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatctaatcgtgctgccttgct 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 263
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaag 205  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  368 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcg-taag 272  T
Q  206 atgttgagt 214  Q
    |||||||||    
T  271 atgttgagt 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 41193 - 41269
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41193 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctataatgtatatttatacatattatgttaagggct 41269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 572 - 463
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatat 107  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  |  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  572 tgatatgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgttaaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatat 473  T
Q  108 cattaagatg 117  Q
    ||||||||||    
T  472 cattaagatg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 78141 - 78054
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78141 taagttgttgagtccat-gcatcctcatttaagttg----agggcttaatgccctgtaatctatatttatacatattatgttgagggcttgat 78054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Original strand, 7585 - 7638
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattattagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7585 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaag 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 18472 - 18546
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttg 82  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||| |||||    
T  18472 tgatatgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatttgatgttgttg 18546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 36194 - 36247
Alignment:
Q  8 tgatatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgct 61  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  36194 tgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgct 36247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15998 - 15944
Alignment:
Q  240 tgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgat 294  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||    
T  15998 tgagggcttgatgctctggaatgtataatcattcatattaagttgagggcttgat 15944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9792 - 9752
Alignment:
Q  236 tgggtgagggcttgatgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9792 tgggagagggcttgatgctctgtaatgaatatttatacata 9752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University