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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF7829A_low_194 (Length: 292)
Name: NF7829A_low_194
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF7829A_low_194 |
 |  |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0036 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0007 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0041 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0343 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0572 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0320 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0287 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 34476334 - 34476589
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34476334 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
34476433 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34476434 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacc |
34476533 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaatat |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34476534 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaatat |
34476589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 918073 - 918327
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
918073 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattactattgagggttgtgtagtttaaat |
918172 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
918173 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
918272 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
918273 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
918327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 6259344 - 6259598
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6259344 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
6259443 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6259444 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
6259543 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6259544 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6259598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23466185 - 23465931
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466185 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
23466086 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466085 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
23465986 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23465985 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
23465931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28255725 - 28255471
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28255725 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
28255626 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28255625 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
28255526 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28255525 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
28255471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 30356778 - 30357032
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30356778 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
30356877 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30356878 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
30356977 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30356978 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
30357032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 45895665 - 45895919
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45895665 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
45895764 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45895765 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
45895864 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45895865 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
45895919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 21659519 - 21659773
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21659519 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
21659618 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21659619 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
21659718 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21659719 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
21659773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 6238641 - 6238894
Alignment:
| Q |
19 |
catcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatg |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6238641 |
catcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatg |
6238740 |
T |
 |
| Q |
119 |
gtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacct |
218 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6238741 |
gtttgagcaaattgttgaaggatttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacct |
6238840 |
T |
 |
| Q |
219 |
ctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6238841 |
ctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6238894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 13994034 - 13994286
Alignment:
| Q |
20 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatgg |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13994034 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatgg |
13994133 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctc |
219 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13994134 |
tttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaaggctaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctc |
13994233 |
T |
 |
| Q |
220 |
taaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13994234 |
taaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
13994286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 33821386 - 33821637
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33821386 |
acatcaaaatagactccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
33821485 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33821486 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
33821585 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaa |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33821586 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaa |
33821637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22731634 - 22731380
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22731634 |
acatcaaaataggctcaaaaatggggcaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
22731535 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22731534 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
22731435 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22731434 |
tctaaaaataataatttgtctattaaaaataatcattattgtcactttaaaaata |
22731380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 48613609 - 48613863
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48613609 |
acatcaaaataggttccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
48613708 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48613709 |
agtttgagtaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
48613808 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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48613809 |
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48613863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 50604744 - 50604998
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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217 |
Q |
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50604943 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
50604944 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
50604998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18963883 - 18963629
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
18963783 |
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18963684 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
18963683 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccactattgtcactttaaaaata |
18963629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 42593094 - 42593348
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
42593194 |
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42593293 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
42593294 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
42593348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861774
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttt-ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
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21861618 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
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21861619 |
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21861718 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
21861719 |
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21861774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 21917380 - 21917635
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttt-ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
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21917479 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
21917480 |
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21917579 |
T |
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| Q |
217 |
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272 |
Q |
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| T |
21917580 |
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21917635 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17971515 - 17971261
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
17971515 |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
17971415 |
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17971316 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
17971315 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
17971261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 22535495 - 22535749
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
22535495 |
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22535594 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
22535595 |
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22535694 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
22535695 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
22535749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 26476625 - 26476875
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
26476625 |
acatcaaaataggctcaaaaatggggaaaaatatgaattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
26476725 |
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26476824 |
T |
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| Q |
218 |
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269 |
Q |
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| T |
26476825 |
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26476875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 27180095 - 27180349
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
27180095 |
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27180194 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
27180195 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
27180294 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
27180295 |
tctaaaaataataatttatctattataaataatcattattgtcactttaaaaata |
27180349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47838528 - 47838274
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
47838528 |
acatcaaaataggctccaaaatgaggaaaaatatttattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattggaggttgtgtactttaaat |
47838429 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
47838428 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagacaaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
47838329 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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|
| T |
47838328 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
47838274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 50181552 - 50181806
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
50181552 |
acatcaaaataggttccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataataggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
50181651 |
T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
50181652 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaaggtagtgaaggagaaaatataaatttaaatccgattattaatttgtttataaacc |
50181751 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
50181752 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
50181806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1195511 - 1195257
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
1195511 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttaaaggtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgggggttgtatagtttaaat |
1195412 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
1195411 |
ggtttcagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaattttaatctgattattaatttgtttgtaaacc |
1195312 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
1195311 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1195257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34825250 - 34824996
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
34825250 |
acatcaaaataggctccaaaataggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgtgatgatttgtggattaatattgggggttgtttagtttaaat |
34825151 |
T |
 |
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118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
34825150 |
ggtttgatcaaattgttgaagaagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
34825051 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
34825050 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
34824996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37998579 - 37998325
Alignment:
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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Q |
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 |
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118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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37998479 |
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37998380 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
37998379 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
37998325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 29245723 - 29245978
Alignment:
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18 |
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116 |
Q |
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| T |
29245723 |
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29245822 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
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29245922 |
T |
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217 |
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272 |
Q |
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| T |
29245923 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
29245978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1618416 - 1618163
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
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1618217 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
1618216 |
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1618163 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 20598994 - 20599247
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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20599092 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
20599093 |
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20599192 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
20599193 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
20599247 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23475706 - 23475452
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
23475706 |
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23475607 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
23475606 |
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23475507 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
23475506 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
23475452 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 38901651 - 38901904
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
38901651 |
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38901749 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38901750 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagagtaagatggtaaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
38901849 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
38901850 |
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38901904 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24318122 - 24317942
Alignment:
| Q |
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191 |
Q |
| |
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| T |
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24318023 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
24318022 |
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24317942 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15031324 - 15031144
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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|
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| T |
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15031225 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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|
| T |
15031224 |
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15031144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 13967354 - 13967526
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199 |
Q |
| |
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|
| T |
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13967453 |
T |
 |
| Q |
200 |
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272 |
Q |
| |
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|
| T |
13967454 |
ttaatttgtctataaatccctaaaaataataaattgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
13967526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 7972537 - 7972710
Alignment:
| Q |
100 |
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198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
7972537 |
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7972636 |
T |
 |
| Q |
199 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7972637 |
attaatttgtctataaacccctaaaaataaaaatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
7972710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29761871 - 29761692
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
29761871 |
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29761773 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29761772 |
actaattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
29761692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 44254949 - 44255121
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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|
| T |
44254949 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatgtgtggattaatattgggcgttgtgtagtttaaat |
44255048 |
T |
 |
| Q |
118 |
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199 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
44255049 |
ggtttgagcaaattgttga---------aggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgatta |
44255121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40131619 - 40131390
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138 |
Q |
| |
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| T |
40131619 |
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40131520 |
T |
 |
| Q |
139 |
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238 |
Q |
| |
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| T |
40131519 |
tagtgggaggagttacaagattaagatggtgaaggagaaaataaaaatttcaatccgattattaatttgttaatcaccctctaaaaataataatttgtct |
40131420 |
T |
 |
| Q |
239 |
attagaaataatcattattgtcactttaaa |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40131419 |
attagaaataatcattattgtccctttaaa |
40131390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51110501 - 51110370
Alignment:
| Q |
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240 |
Q |
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|
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T |
 |
| Q |
241 |
tagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||| |
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| T |
51110401 |
tagaaataactattattttcactttaaaaata |
51110370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6194574 - 6194445
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| Q |
140 |
agttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtcta |
239 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6194574 |
agttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaaactgattgttaatttgtttataaacccctaaaaataataatttatcta |
6194475 |
T |
 |
| Q |
240 |
ttagaaataatcattattgtcactttaaaa |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6194474 |
ttagaaataaccattattgtcactttaaaa |
6194445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 272
Target Start/End: Original strand, 30113726 - 30113834
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atggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcact |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
30113726 |
atggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacctttaaaaataataatttgtctattagaaataactattattgtcact |
30113825 |
T |
 |
| Q |
264 |
ttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
30113826 |
ttaaaaata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41789488 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagttt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 40132336 - 40132233
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Q |
| |
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| T |
40132336 |
acatcaaaatagactccaaaatgggggaaaatatgtatttttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaa |
40132237 |
T |
 |
| Q |
117 |
tggt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
40132236 |
tggt |
40132233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6194696 - 6194620
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6194696 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
6194620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 7972184 - 7972260
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7972184 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaaaatgtattttttaaagtgacaataatgggataatttgtggattaat |
7972260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 29762216 - 29762140
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29762216 |
acatcaaaataggcttcaaaatggaaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
29762140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 30288956 - 30289032
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30288956 |
acatcaaaataggcttgaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
30289032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 30317858 - 30317934
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30317858 |
acatcaaaataggcttgaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
30317934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 41789906 - 41789971
Alignment:
| Q |
207 |
gtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41789906 |
gtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaacattattgtcactttaaaaata |
41789971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15031658 - 15031582
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15031658 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtggcaataatgggatgatttttggattaat |
15031582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24318466 - 24318391
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24318466 |
acatcaaaataggcttcaaaatggg-aaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
24318391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 13967000 - 13967077
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgta-ttttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13967000 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatttgtatttttttatagtgacaataatgtgatgatttgtggattaat |
13967077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51110592 - 51110521
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51110592 |
acatcaaaa-aggcttcaaaatgga-aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttatggatt |
51110521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 272
Target Start/End: Original strand, 30289339 - 30289389
Alignment:
| Q |
222 |
aaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30289339 |
aaaataataatttgtctattagaagtaatcattattgtcactttaagaata |
30289389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 272
Target Start/End: Original strand, 30318241 - 30318291
Alignment:
| Q |
222 |
aaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30318241 |
aaaataataatttgtctattagaagtaatcattattgtcactttaagaata |
30318291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 212
Target Start/End: Original strand, 40131239 - 40131273
Alignment:
| Q |
178 |
aatataaatttaaatctgattattaatttgtttat |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40131239 |
aatataaatttaaatctgattattaatttgtttat |
40131273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10663512 - 10663477
Alignment:
| Q |
41 |
gggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10663512 |
gggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgg |
10663477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10877657 - 10877622
Alignment:
| Q |
41 |
gggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10877657 |
gggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgg |
10877622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 17971242 - 17971283
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17971242 |
caaaatagggaaaaatatgta-tttttaaagtgacaataatgg |
17971283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 272
Target Start/End: Original strand, 44255118 - 44255151
Alignment:
| Q |
239 |
attagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44255118 |
attagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
44255151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7554 - 7300
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7554 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
7455 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7454 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
7355 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7354 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
7300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0036 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:
Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12869 - 12615
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12869 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
12770 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12769 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
12670 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12669 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
12615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 2657114 - 2657368
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2657114 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtaatttaaat |
2657213 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657214 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
2657313 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657314 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
2657368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 7723425 - 7723679
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7723425 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
7723524 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7723525 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
7723624 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7723625 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
7723679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 36894061 - 36894315
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36894061 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
36894160 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36894161 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
36894260 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36894261 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
36894315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14450546 - 14450292
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14450546 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataataggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
14450447 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14450446 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
14450347 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14450346 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
14450292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 41257605 - 41257857
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41257605 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
41257704 |
T |
 |
| Q |
118 |
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Q |
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41257857 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32989711 - 32989458
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
32989711 |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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272 |
Q |
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| T |
32989512 |
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32989458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 39407363 - 39407617
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
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39407562 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
39407563 |
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39407617 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43433479 - 43433225
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
43433379 |
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43433280 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
43433279 |
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43433225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 29119387 - 29119639
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
29119387 |
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29119486 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
29119487 |
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29119586 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
29119587 |
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29119639 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 355750 - 355496
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
355650 |
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355551 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
355550 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataataattattgtcactttaaaaata |
355496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1077763 - 1077509
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
1077763 |
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1077664 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
1077663 |
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1077564 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
1077563 |
tctaaaaataataatttatctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1077509 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17960906 - 17960652
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
17960906 |
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17960807 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
17960806 |
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17960707 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
17960706 |
tctaaaaataataatttgtctattggaaataaccattattgtcactttaaaaata |
17960652 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5795158 - 5794904
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttatgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
5795058 |
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5794959 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
5794958 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccatcattgtcactttaaaaata |
5794904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14053763 - 14053509
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
14053763 |
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14053664 |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
14053663 |
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14053564 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
14053563 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
14053509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 15731658 - 15731912
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
15731658 |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
15731758 |
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15731857 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
15731858 |
tctaaaaatgataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
15731912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28776578 - 28776321
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
28776578 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatatgg-gggttgtgtagtttaaat |
28776480 |
T |
 |
| Q |
118 |
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213 |
Q |
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| T |
28776479 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatcgatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttata |
28776380 |
T |
 |
| Q |
214 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
28776379 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
28776321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13001962 - 13001709
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatagggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
13001862 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttgga-gagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
13001764 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
13001763 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcatattaaaaata |
13001709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39325036 - 39324783
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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Q |
| |
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|
| T |
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ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggaaaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacc |
39324838 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
39324837 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
39324783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36508312 - 36508073
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33 |
ccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattg |
132 |
Q |
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| T |
36508312 |
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36508213 |
T |
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232 |
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| T |
36508212 |
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36508113 |
T |
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| Q |
233 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
36508112 |
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36508073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 14244566 - 14244820
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
14244566 |
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14244665 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
14244666 |
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14244765 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
14244766 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattgttgtcactttaaaaata |
14244820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 35942304 - 35942559
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaa-gtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
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| T |
35942304 |
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35942403 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
35942404 |
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35942503 |
T |
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| Q |
217 |
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272 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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| T |
35942504 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
35942559 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1588427 - 1588171
Alignment:
| Q |
20 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatgg |
119 |
Q |
| |
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| T |
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1588328 |
T |
 |
| Q |
120 |
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215 |
Q |
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| T |
1588327 |
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1588228 |
T |
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| Q |
216 |
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272 |
Q |
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| T |
1588227 |
cctctaaaaataataatttttctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1588171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31918378 - 31918128
Alignment:
| Q |
20 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatgg |
119 |
Q |
| |
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| T |
31918378 |
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31918281 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
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| T |
31918280 |
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31918181 |
T |
 |
| Q |
220 |
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272 |
Q |
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| T |
31918180 |
taaaaataataatttgtctattagaaataacaattattgtcactttaaaaata |
31918128 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43085537 - 43085297
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
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| T |
43085537 |
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43085438 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
43085437 |
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43085338 |
T |
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| Q |
218 |
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258 |
Q |
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| T |
43085337 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattg |
43085297 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33880451 - 33880196
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgattt-gtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
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| T |
33880451 |
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33880352 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
33880351 |
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33880252 |
T |
 |
| Q |
217 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
33880251 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
33880196 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10308400 - 10308190
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
10308400 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
10308301 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
10308300 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
10308201 |
T |
 |
| Q |
218 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
10308200 |
tctaaaaataa |
10308190 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43284789 - 43284540
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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|
| T |
43284789 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtgttttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
43284690 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagat----ggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttata |
213 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43284689 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagtt---------aaaagactaagatcaatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttata |
43284599 |
T |
 |
| Q |
214 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43284598 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
43284540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 68 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10443583 - 10443379
Alignment:
| Q |
68 |
caataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatgg |
167 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10443583 |
caataataggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatgg |
10443484 |
T |
 |
| Q |
168 |
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267 |
Q |
| |
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| T |
10443483 |
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10443384 |
T |
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| Q |
268 |
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272 |
Q |
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||||| |
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| T |
10443383 |
aaata |
10443379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 3927326 - 3927528
Alignment:
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70 |
ataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtg |
169 |
Q |
| |
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| T |
3927326 |
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3927425 |
T |
 |
| Q |
170 |
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269 |
Q |
| |
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| T |
3927426 |
aaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaa |
3927525 |
T |
 |
| Q |
270 |
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272 |
Q |
| |
|
||| |
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|
| T |
3927526 |
ata |
3927528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5220291 - 5220092
Alignment:
| Q |
72 |
aatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaa |
171 |
Q |
| |
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|
| T |
5220291 |
aatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaatactaagatggtgaa |
5220192 |
T |
 |
| Q |
172 |
ggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaat |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5220191 |
ggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacctctaaaaataa-aatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaat |
5220093 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15211340 - 15211139
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaa-tatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15211340 |
acatcaaaataggctctaaaatggaaaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttata |
15211241 |
T |
 |
| Q |
117 |
tggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
216 |
Q |
| |
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| T |
15211240 |
tggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
15211141 |
T |
 |
| Q |
217 |
ct |
218 |
Q |
| |
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|| |
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| T |
15211140 |
ct |
15211139 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10825813 - 10825618
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| Q |
77 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
10825813 |
gatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgaacaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggaga |
10825714 |
T |
 |
| Q |
177 |
aaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10825713 |
aaatataaatttaaatttgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttatctattagaaataaccattattgtcaccttaaaaata |
10825618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 9115310 - 9115490
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92 |
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191 |
Q |
| |
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| T |
9115310 |
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9115409 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9115410 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43923780 - 43923600
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43923780 |
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43923681 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43923680 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
43923600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26431031 - 26430851
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26431031 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggatgagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
26430932 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26430931 |
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26430851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Original strand, 21559426 - 21559603
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21559426 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatagtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
21559525 |
T |
 |
| Q |
192 |
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269 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21559526 |
actaattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttttctattagaaataatcattattgtcactttaaaa |
21559603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33872243 - 33872063
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33872243 |
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33872144 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33872143 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaaata |
33872063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37429035 - 37428855
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37429035 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaatgagttggaggagttaaaagactaaaatggtgaacgagaaaatataaatttaaa |
37428936 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37428935 |
agtgattattaatttgtctataaatctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
37428855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 9736748 - 9736921
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| Q |
100 |
gggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaag-gagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgatt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9736748 |
gggttgtgtagtttaaattgtttgaacaaattgttaaactgagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaaactgatt |
9736847 |
T |
 |
| Q |
199 |
attaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9736848 |
attaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
9736921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6081043 - 6080911
Alignment:
| Q |
140 |
agttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtcta |
239 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6081043 |
agttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctaattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtcta |
6080944 |
T |
 |
| Q |
240 |
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272 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6080943 |
ttaaaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6080911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3455127 - 3454956
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3455127 |
aatattggaggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttg---------gaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
3455037 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3455036 |
attgattatttatttgtctataaatccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
3454956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12383495 - 12383390
Alignment:
| Q |
171 |
aggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataa----acctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcacttta |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12383495 |
aggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataattaaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcacttta |
12383396 |
T |
 |
| Q |
267 |
aaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12383395 |
aaaata |
12383390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 40520745 - 40520649
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaa--tatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40520745 |
acatcaaaataggctcaaaaatgggaaaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtt |
40520649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43924125 - 43924049
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43924125 |
acatcaaaataggctccaaaatggagaaaaatatgtattttttaaagcgacaataatgggatgatttgtggattaat |
43924049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 9114965 - 9115041
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9114965 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggaaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
9115041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26431376 - 26431300
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26431376 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgaattgtggattaat |
26431300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33872588 - 33872512
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33872588 |
acatcaaaatagacttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
33872512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 29100968 - 29101033
Alignment:
| Q |
207 |
gtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29100968 |
gtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
29101033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 1650648 - 1650716
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgt |
86 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650648 |
acatcaaaataggctctaaaatgaggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgt |
1650716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10308083 - 10308025
Alignment:
| Q |
214 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10308083 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
10308025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3455466 - 3455389
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatgggga-aaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3455466 |
acatcaaaataggcttcaaaataggaataaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
3455389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15207826 - 15207767
Alignment:
| Q |
213 |
aaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15207826 |
aaacctctaaaaataataatttgtctgttagaaataatcattattgccactttaaaaata |
15207767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Original strand, 9736412 - 9736472
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9736412 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtaacaataattgaatgatttgtggattaat |
9736472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 37429372 - 37429304
Alignment:
| Q |
26 |
ataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37429372 |
ataggcttcaaaatggggaaaattgtgtattttttaaagtgacaacaatgggatgatttatggattaat |
37429304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 21559061 - 21559136
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21559061 |
acatcaaattaggcttcaaaatggagaaaa-tgtgtattttttaaagtggcaataataggataatttgtggattaat |
21559136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 39133080 - 39133040
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttt |
58 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
39133080 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggggaaaatgtgtatttt |
39133040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 3628236 - 3628490
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3628236 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
3628335 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3628336 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
3628435 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3628436 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
3628490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17272360 - 17272106
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17272360 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
17272261 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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17272106 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 41080562 - 41080816
Alignment:
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117 |
Q |
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T |
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217 |
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T |
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41080816 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44335723 - 44335469
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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217 |
Q |
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Q |
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44335469 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46100703 - 46100449
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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46100504 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
46100503 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 38354271 - 38354525
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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T |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39403358 - 39403104
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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39403159 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
39403158 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8641476 - 8641222
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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8641277 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
8641276 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
8641222 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44781764 - 44781511
Alignment:
| Q |
19 |
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Q |
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T |
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| Q |
119 |
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218 |
Q |
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| T |
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44781565 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
44781564 |
ctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
44781511 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18031526 - 18031272
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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18031327 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
18031326 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
18031272 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 36786938 - 36787192
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Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
36787138 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
36787192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37007631 - 37007377
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
37007531 |
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37007432 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
37007431 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
37007377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38171472 - 38171218
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
38171372 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacc |
38171273 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
38171272 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
38171218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 40668225 - 40668479
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
40668325 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
40668424 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
40668425 |
tcaaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
40668479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45155488 - 45155234
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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Q |
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118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
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ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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T |
 |
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218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
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Q |
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| T |
45155288 |
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45155234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 35004488 - 35004742
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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| T |
35004488 |
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35004587 |
T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
35004588 |
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35004687 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
| |
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| T |
35004688 |
tctaaaaataataatatgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
35004742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 47170489 - 47170743
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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| T |
47170489 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtagattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
47170588 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
47170589 |
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47170688 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
47170689 |
tctaaaaataataatttgtcttttagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
47170743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 26931586 - 26931840
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
26931586 |
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26931685 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
26931686 |
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26931785 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
26931786 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
26931840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 30890513 - 30890767
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
30890513 |
acatcaaaataggctccaaaatagggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
30890612 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
30890613 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaacactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaact |
30890712 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |
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| T |
30890713 |
tctaaaaataataatttgtctattataaataaccattattgtcattttaaaaata |
30890767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 42028753 - 42029007
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
42028753 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
42028852 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
42028853 |
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42028952 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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|
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| T |
42028953 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
42029007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26303863 - 26303607
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctcc-aaaatgggg-aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaa |
115 |
Q |
| |
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| T |
26303863 |
acatcaagataggctcccaaaatgggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttag |
26303764 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
26303763 |
gtggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
26303664 |
T |
 |
| Q |
216 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26303663 |
cctctaaaaataataatttgtctattagaaataattattattgtcactttaaaaata |
26303607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24646693 - 24646450
Alignment:
| Q |
29 |
ggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaa |
128 |
Q |
| |
|
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| T |
24646693 |
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24646594 |
T |
 |
| Q |
129 |
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228 |
Q |
| |
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|
| T |
24646593 |
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24646494 |
T |
 |
| Q |
229 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24646493 |
taatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
24646450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 21176258 - 21176511
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
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|
| T |
21176258 |
acatcaaactaggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
21176357 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
21176358 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttttttataaacc |
21176457 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21176458 |
tctaaaaataa-aatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
21176511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 46229750 - 46230004
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46229750 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
46229849 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46229850 |
gatttgaggaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaaca |
46229949 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46229950 |
tctaaaaataataatttgtctattataaataaccattattatcactttaaaaata |
46230004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34962945 - 34962696
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
34962945 |
acatcaaaataggcttaaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattggg-----tgtaatttaaat |
34962851 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34962850 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
34962751 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34962750 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
34962696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 35788454 - 35788712
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35788454 |
acatcaaaataggctccaaaatgcggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
35788553 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35788554 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggagaagttaaaagactaaaatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
35788653 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataat----cattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35788654 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataagtaaccattattgtctctttaaaaata |
35788712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 44744565 - 44744814
Alignment:
| Q |
24 |
aaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagttt-aaatggttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44744565 |
aaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagttttaaatggttt |
44744664 |
T |
 |
| Q |
123 |
aagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaa |
222 |
Q |
| |
|
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|
| T |
44744665 |
gagcaaattgttgaaggagttagaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaaccactaa |
44744764 |
T |
 |
| Q |
223 |
aaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44744765 |
aaataataatttgtctattaaaaataaccattattgtcactttaaaaata |
44744814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 24182176 - 24182430
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24182176 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtactttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
24182275 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24182276 |
ggtttgagcaaattgttgaaagagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatataaatttgctacttaatttgtttataaacc |
24182375 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24182376 |
tctaaaaataataatttgtgtattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
24182430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46330250 - 46330003
Alignment:
| Q |
30 |
gctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatatt-----gagggttgtgtagtttaaatggtttaa |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
46330250 |
gctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattggggggggggttgtgtagtttaaatgattcga |
46330151 |
T |
 |
| Q |
125 |
gcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaa |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46330150 |
gcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaa |
46330051 |
T |
 |
| Q |
225 |
ataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
46330050 |
ataataatttgtctattagaaataaccattattgtcacgttaaaaata |
46330003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28290580 - 28290331
Alignment:
| Q |
22 |
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121 |
Q |
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T |
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Q |
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28290331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 40340729 - 40340974
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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40340828 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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272 |
Q |
| |
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|
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| T |
40340920 |
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40340974 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 51 - 272
Target Start/End: Original strand, 41409147 - 41409368
Alignment:
| Q |
51 |
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150 |
Q |
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| T |
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41409246 |
T |
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| Q |
151 |
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250 |
Q |
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| T |
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41409346 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
41409347 |
cattattgtcactttaaaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7337730 - 7337486
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| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
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| T |
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7337632 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
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7337541 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
7337540 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
7337486 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 67 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30838941 - 30838736
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67 |
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166 |
Q |
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30838842 |
T |
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| Q |
167 |
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266 |
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| T |
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30838742 |
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267 |
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272 |
Q |
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30838741 |
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30838736 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18928610 - 18928409
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169 |
Q |
| |
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| T |
18928610 |
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18928512 |
T |
 |
| Q |
170 |
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269 |
Q |
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| T |
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18928412 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
18928411 |
ata |
18928409 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 7462551 - 7462731
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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| T |
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7462650 |
T |
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| Q |
192 |
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272 |
Q |
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| T |
7462651 |
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7462731 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34994145 - 34993965
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| Q |
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191 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 43671247 - 43671419
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gggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgatta |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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| T |
43671247 |
gggttgtgtagtttaaatagtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaaactgatta |
43671346 |
T |
 |
| Q |
200 |
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272 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43671347 |
ttaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
43671419 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48936658 - 48936478
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
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| T |
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48936559 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48936558 |
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48936478 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 272
Target Start/End: Original strand, 43775156 - 43775335
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192 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43775156 |
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43775255 |
T |
 |
| Q |
193 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43775256 |
ctgattattaatttgtctataaacccttaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
43775335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
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| Q |
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191 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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6804621 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
6804622 |
tctgattattaatttgtttataaacatccacaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6804702 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
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191 |
Q |
| |
|
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| T |
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40245805 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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|
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40245886 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
18120548 |
acatcaaaatagactccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
18120647 |
T |
 |
| Q |
118 |
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159 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
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ggtttgagcaaattgttgaaggagttagaggagttaaaagac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
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191 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
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11456163 |
T |
 |
| Q |
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tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actgattattaatttgtctat-aacccctaaaaataataatttgtctattcaaaataaccattattgtcactttaaaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 159 - 272
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ctaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattg |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18121123 |
ctaagatggcgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattg |
18121222 |
T |
 |
| Q |
259 |
tcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
18121223 |
tcactttaaaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
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189 |
aaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39628779 |
aaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatat |
96 |
Q |
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| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 7462206 - 7462282
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7462206 |
acatcaaaataggctccaaaatgtggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaat |
7462282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41642057 - 41641977
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattg |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41642057 |
acatcaaaataggctccaaaatggtgaaaaatatgtattttttaaagtgacaataataagatgatttgtggattaatattg |
41641977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 6804177 - 6804253
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6804177 |
acatcaaaatagactctaaaatgaggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
6804253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 11455719 - 11455795
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11455719 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
11455795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34994490 - 34994414
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34994490 |
acatcaaaataggcttcaaaataggaaaaaatgtgtattttttaatgtgacaataatgtgatgatttgtggattaat |
34994414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Original strand, 40245363 - 40245436
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40245363 |
acatcaaaataggcttcaaaatggaaataaatgtatattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggatt |
40245436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Original strand, 43774829 - 43774890
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtatttt-ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43774829 |
caaaatggggaaaaatgtgtatttttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
43774890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 19488881 - 19488923
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttt |
60 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19488881 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttt |
19488923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Original strand, 43670919 - 43670967
Alignment:
| Q |
46 |
aaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43670919 |
aaatgtgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaat |
43670967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 48937002 - 48936927
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48937002 |
acatcaaaatagactttaaaatagggaaaaaagtgtattttttaaagtcataat-attggatgatttgtggattaat |
48936927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22599220 - 22599185
Alignment:
| Q |
41 |
gggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22599220 |
gggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgg |
22599185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 36787211 - 36787170
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36787211 |
caaaatagggaaaaatatgtat-ttttaaagtgacaataatgg |
36787170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2318266 - 2318012
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2318266 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
2318167 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2318166 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
2318067 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2318066 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
2318012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 29678490 - 29678744
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29678490 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtttagtttaaat |
29678589 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29678590 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
29678689 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29678690 |
tctaaaaataataatttatctattaaaaataatcattattgtcactttaaaaata |
29678744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8812646 - 8812392
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8812646 |
acatcaaaataggctccaaaatagggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtaatttaaat |
8812547 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8812546 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatttgattattaatttgtttataaacc |
8812447 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8812446 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
8812392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15146354 - 15146101
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15146354 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattg-gggttgtgtagtttaaat |
15146256 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15146255 |
ggtttgagcaaattgttgaaagagttggaggagttaaaagattaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
15146156 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15146155 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
15146101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24110848 - 24110595
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24110848 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacagtaatgggatgatttgtggattaatattg-gggttgtgtagtttaaat |
24110750 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24110749 |
ggtttgagcaaattcttgaaggagttggaggagttaaaagactaagttggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
24110650 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24110649 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
24110595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11625178 - 11624924
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11625178 |
acatcaaaataggttccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggagttgtgtagtttaaat |
11625079 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11625078 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
11624979 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11624978 |
tctaaaaataataatttttctattatatttaatcattattgtcactttaaaaata |
11624924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20857285 - 20857036
Alignment:
| Q |
22 |
caaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20857285 |
caaaataggctccaaaatggggaaaaatatttattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattggaggttgtgtagtttaaatggtt |
20857186 |
T |
 |
| Q |
122 |
taagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctcta |
221 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20857185 |
ga-gcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgtaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctcta |
20857087 |
T |
 |
| Q |
222 |
aaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20857086 |
aaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
20857036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 17994355 - 17994606
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17994355 |
acatcaaaataggctctaaaatggggaataatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtgaattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
17994454 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17994455 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggggaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
17994554 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaa |
269 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17994555 |
tttaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcgctttaaaa |
17994606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1060177 - 1059924
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1060177 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgcattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
1060078 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1060077 |
ggtttgaagaaattgttgaaggagttggaagagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatttaaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
1059978 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1059977 |
tct-aaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1059924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 1326770 - 1327015
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1326770 |
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1326869 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1326870 |
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1326960 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1326961 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1327015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 18738835 - 18739089
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttt-ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18738835 |
acatcaaaatag-ctccaaaatgggggaaaatatgtatttttttaaagtgacaataatgtgatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaa |
18738933 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18738934 |
tggtttgagcaaattgttgaagcaattggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
18739033 |
T |
 |
| Q |
217 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739034 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
18739089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13209654 - 13209401
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13209654 |
acatcaaaataggctccaaaatggagaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgcgggttgtgtagtttaaat |
13209555 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13209554 |
ggtttgagcacattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacc |
13209455 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13209454 |
tctaaaaatca-aatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaaata |
13209401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25404651 - 25404400
Alignment:
| Q |
20 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatgg |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25404651 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatatattttttaaagtgacaataatgggatgaattgtggattaatattggtggttgtgtagtttaaatgg |
25404552 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctc |
219 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25404551 |
tttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttttttataaacctc |
25404452 |
T |
 |
| Q |
220 |
taaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25404451 |
taaaaataa-aatttgtctattagaaataaccattgttgtcactttaaaaata |
25404400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 749200 - 748955
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
749200 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
749101 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
749100 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagtt---------aaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatcttattattaatttgtttataaacc |
749010 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
749009 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
748955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 11158306 - 11158562
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaata--tgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11158306 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaaaaaatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaa |
11158405 |
T |
 |
| Q |
116 |
atggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11158406 |
atgatttgagaaaattgttgaaggagtttgaggagttaaaatattacgatggtgaaggagaacatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
11158505 |
T |
 |
| Q |
216 |
cctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11158506 |
cctctaaaaataataatttttctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
11158562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22821635 - 22821457
Alignment:
| Q |
94 |
tattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatc |
193 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22821635 |
tattgggggttgtgtagtttaaatggtttgaacaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatc |
22821536 |
T |
 |
| Q |
194 |
tgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22821535 |
tgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
22821457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8749199 - 8749030
Alignment:
| Q |
103 |
ttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattatta |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8749199 |
ttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattatta |
8749100 |
T |
 |
| Q |
203 |
atttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8749099 |
atttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
8749030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 26610017 - 26610210
Alignment:
| Q |
72 |
aatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaa |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26610017 |
aatgggatgatttgtggattaatattgggggatgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaa |
26610116 |
T |
 |
| Q |
172 |
ggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaat |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26610117 |
ggagaaaatataaattt-------attattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaat |
26610209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23067141 - 23066961
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23067141 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggagcagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
23067042 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23067041 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaacattattgtcactttaaaaata |
23066961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Original strand, 23767399 - 23767531
Alignment:
| Q |
140 |
agttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtcta |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23767399 |
agttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtcta |
23767498 |
T |
 |
| Q |
240 |
ttagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23767499 |
ttagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
23767531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 23767259 - 23767354
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagttt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23767259 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagttt |
23767354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5430590 - 5430511
Alignment:
| Q |
193 |
ctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5430590 |
ctgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattatcactttaaaaata |
5430511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22821982 - 22821906
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22821982 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatggtatgatttgtggattaat |
22821906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 22504525 - 22504601
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22504525 |
acatcaaaataggcttcaaaatggagaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatggcatgatttgtggattaat |
22504601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23067487 - 23067410
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctc-caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23067487 |
acatcaaaataggctttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaat |
23067410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 883953 - 883699
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
883953 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
883854 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
883853 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
883754 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
883753 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
883699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23908925 - 23908671
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23908925 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
23908826 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23908825 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
23908726 |
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23908671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13342172 - 13341918
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
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13341918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 31582893 - 31583147
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44518831 - 44518577
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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217 |
Q |
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44518731 |
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44518632 |
T |
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Q |
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| T |
44518631 |
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44518577 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 52171229 - 52171482
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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118 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5152954 - 5152700
Alignment:
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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118 |
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217 |
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| T |
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5152755 |
T |
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| Q |
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272 |
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| T |
5152754 |
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5152700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 13737254 - 13737508
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
13737354 |
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13737453 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
13737454 |
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13737508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 36736175 - 36736429
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| Q |
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217 |
Q |
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| T |
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36736374 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
36736375 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
36736429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 39669089 - 39669343
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
39669089 |
acatcaaaataggctccaaagtggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
39669188 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
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| T |
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39669288 |
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| T |
39669289 |
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39669343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43727601 - 43727347
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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43727502 |
T |
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217 |
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| T |
43727501 |
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43727402 |
T |
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| Q |
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272 |
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| T |
43727401 |
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43727347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 52961210 - 52961464
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
52961210 |
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52961309 |
T |
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217 |
Q |
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| T |
52961310 |
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52961409 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
52961410 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
52961464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24086670 - 24086416
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
24086571 |
T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
24086570 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaagagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
24086471 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
24086470 |
tctaaaagtaataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
24086416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31586404 - 31586150
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaatatgctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
31586304 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggatgagttaaaagactaaaatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
31586205 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
31586204 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcattttaaaaata |
31586150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35154468 - 35154214
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
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| |
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| T |
35154268 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 10120202 - 10120457
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaa-atatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
10120202 |
acatcaaaataggctccaaaatggaaaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
10120301 |
T |
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117 |
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10120457 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20495881 - 20495627
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
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T |
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217 |
Q |
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| T |
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20495682 |
T |
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Q |
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| T |
20495681 |
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20495627 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42389953 - 42389699
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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217 |
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Q |
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| T |
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42389699 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49256226 - 49255972
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
49256026 |
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49255972 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9718493 - 9718239
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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T |
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218 |
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Q |
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| T |
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9718239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 23781304 - 23781558
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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23781503 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
23781504 |
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23781558 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36259947 - 36259693
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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36259748 |
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Q |
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| T |
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36259693 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37704163 - 37703909
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
37704063 |
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37703964 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
37703963 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
37703909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 38599167 - 38599421
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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38599167 |
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38599266 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
38599267 |
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38599366 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
38599367 |
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38599421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10656654 - 10656401
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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10656654 |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
10656555 |
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10656456 |
T |
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218 |
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272 |
Q |
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| T |
10656455 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgttactttaaaaata |
10656401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6071551 - 6071297
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaa-tatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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T |
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117 |
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216 |
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| T |
6071451 |
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6071353 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
6071352 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6071297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34941488 - 34941233
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatgggga-aaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatggggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaa |
34941389 |
T |
 |
| Q |
117 |
tggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
216 |
Q |
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| T |
34941388 |
tggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaatatggtgaaggagaaaatataaatttaaatttgattattaatttatttataaac |
34941289 |
T |
 |
| Q |
217 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
34941288 |
ctctaaaaataataacttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
34941233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 55153929 - 55153675
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaa-tatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataggttccaaaatgggaaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatt-gtggattaatattgggggttgtgtagtttaaa |
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T |
 |
| Q |
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tggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
216 |
Q |
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| T |
55153830 |
tggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttttttataaac |
55153731 |
T |
 |
| Q |
217 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
55153730 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
55153675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23323786 - 23323532
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
23323786 |
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T |
 |
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ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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|
| T |
23323686 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaaaactaagatggtgaaagagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
23323587 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
23323586 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaaata |
23323532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40783228 - 40782975
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| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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217 |
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Q |
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tttaaaaataataatttatctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
40782975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 33305454 - 33305707
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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33305652 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
33305653 |
tctaaaaataatattttttctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
33305707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21627841 - 21627587
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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21627742 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
21627741 |
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21627642 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
21627641 |
tttaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
21627587 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40163605 - 40163360
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
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| T |
40163605 |
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40163506 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40163505 |
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40163415 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40163414 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
40163360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47799565 - 47799316
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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|
| T |
47799565 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgtgatgatttcttgattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
47799466 |
T |
 |
| Q |
118 |
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213 |
Q |
| |
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| T |
47799465 |
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47799375 |
T |
 |
| Q |
214 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47799374 |
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47799316 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 38770945 - 38771125
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38770945 |
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38771044 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38771045 |
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38771125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 42856387 - 42856567
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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|
| T |
42856387 |
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42856486 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42856487 |
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42856567 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 36027624 - 36027795
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100 |
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199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36027624 |
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36027722 |
T |
 |
| Q |
200 |
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272 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36027723 |
ttaatttgtctataaacctctaaaaataataacttgtctattataaataatcattattgtcactttaaaaata |
36027795 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53627682 - 53627502
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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|
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| T |
53627682 |
aatattgggggttgcgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttgaaggagtttaaagattaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
53627583 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53627582 |
actgattattaatttgtctataaatccctaaaaataataatttgtttattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
53627502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46976321 - 46976141
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46976321 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatgatttgagcaaattgttgaaggagttagaggagttaaaagactaagatggtgaaagagaaaatataaatttaaa |
46976222 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
46976221 |
actgattattagtttgtctataaacccataaacataataatttgtctattaaaaataaccattattgtcactttaaaaata |
46976141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 20189148 - 20189328
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20189148 |
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20189247 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20189248 |
acttattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcatcttaaaaata |
20189328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 24814373 - 24814512
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaa-atatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24814373 |
acatcaaaataggctccaaaatggaaaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
24814472 |
T |
 |
| Q |
117 |
tggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaa |
156 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24814473 |
tggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaa |
24814512 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25068128 - 25068012
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25068128 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
25068029 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25068028 |
ggtttgagcaaattgtt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25067944 - 25067866
Alignment:
| Q |
194 |
tgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25067944 |
tgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcactattgtcactttaaaaata |
25067866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 36027271 - 36027347
Alignment:
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36027271 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
36027347 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 53628027 - 53627951
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| Q |
18 |
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94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53628027 |
acatcaaaataggcttcaaaattgggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 42856042 - 42856116
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggatta |
92 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42856042 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacaataattggatgatttgtggatta |
42856116 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 38770597 - 38770673
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| Q |
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94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38770597 |
acatcaaaataggcttcaaaatgagggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatcatttgtggattaat |
38770673 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 36791317 - 36791383
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgattt |
84 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36791317 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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Target Start/End: Original strand, 20186700 - 20186777
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18 |
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|
| T |
20186700 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 53178540 - 53178589
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtga |
67 |
Q |
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53178540 |
acatcaaaataggctctaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtga |
53178589 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 46976651 - 46976591
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46976651 |
caaaatgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacagtaatgagatgatttgtggattaat |
46976591 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 6071278 - 6071319
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
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|
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6071278 |
caaaatagggaaaaatatgta-tttttaaagtgacaataatgg |
6071319 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 40782956 - 40782997
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
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40782956 |
caaaatagggaaaaatatgta-tttttaaagtgacaataatgg |
40782997 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 12178229 - 12178483
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
12178229 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
12178328 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
12178329 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
12178428 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
12178429 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
12178483 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 19223164 - 19223418
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
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ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
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tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
19223418 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40651328 - 40651074
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
40651328 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
40651229 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
40651228 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
40651129 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
40651128 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
40651074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 26367629 - 26367883
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
26367729 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
26367828 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
26367829 |
tctaaaaataaaaatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
26367883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 32892398 - 32892652
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaatagactccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
32892497 |
T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
32892498 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
32892597 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
32892598 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
32892652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 33437518 - 33437772
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaataggctcaaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggtagtgtagtttaaat |
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T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
33437618 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
33437717 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
33437718 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
33437772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16057847 - 16057593
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
16057748 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
16057747 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttgaaggagttaaaagactaagatggtgaaggaaaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
16057648 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
16057647 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
16057593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 41799499 - 41799753
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataattggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtaatttaaat |
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T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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|
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| T |
41799599 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggaaaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
41799698 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
41799699 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
41799753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3074785 - 3074531
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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|
| T |
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acatcaaaataggctctaaaatgggagaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
3074685 |
ggtttgagcaaattgttgaaagagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
3074586 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
3074585 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
3074531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25992436 - 25992183
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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25992337 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
25992336 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttg-aggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
25992238 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25992237 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
25992183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42793588 - 42793334
Alignment:
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
42793588 |
acatcaaaataggctcaaaaatggagaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttatgtagtttaaat |
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T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
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| T |
42793488 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatgttgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
42793389 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42793388 |
tctaagaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
42793334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 44258285 - 44258539
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44258285 |
acatcaaaataggctccaaaatggaggaaaatatgtatttttttaagtgacaataataggatgatttatggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
44258384 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44258385 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
44258484 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44258485 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
44258539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28243192 - 28242932
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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T |
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215 |
Q |
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T |
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276 |
Q |
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28242932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 121779 - 122033
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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121878 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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| T |
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122033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8346338 - 8346084
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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8346239 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
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8346139 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
8346138 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccatgattgtcactttaaaaata |
8346084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 6166482 - 6166736
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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6166581 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
6166582 |
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6166681 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6166682 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6166736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 4357002 - 4357257
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggtt-gtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
| T |
4357002 |
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4357100 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
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4357200 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
| |
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| T |
4357201 |
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4357257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 37224756 - 37225001
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37224756 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
37224855 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37224856 |
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37224946 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37224947 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
37225001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 44 - 272
Target Start/End: Original strand, 3434771 - 3434999
Alignment:
| Q |
44 |
aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagtt |
143 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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3434870 |
T |
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| Q |
144 |
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243 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3434871 |
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3434970 |
T |
 |
| Q |
244 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3434971 |
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3434999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 44 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25775348 - 25775120
Alignment:
| Q |
44 |
aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagtt |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25775348 |
aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagtaaattgttgaaggagtt |
25775249 |
T |
 |
| Q |
144 |
ggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattag |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25775248 |
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25775149 |
T |
 |
| Q |
244 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25775148 |
aaataactattattgtcactttaaaaata |
25775120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1550464 - 1550303
Alignment:
| Q |
111 |
tttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgttt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550464 |
tttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggataaaatataaatttaaatctgattattaatttgttt |
1550365 |
T |
 |
| Q |
211 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550364 |
ataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1550303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7777972 - 7777785
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7777972 |
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7777873 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7777872 |
actgattagtgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataacaattattgacactttaaaaata |
7777785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2695658 - 2695582
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2695658 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaat |
2695582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1550528 - 1550462
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgattt |
84 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550528 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgattt |
1550462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7778316 - 7778244
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggat |
90 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7778316 |
acatcaaaatagacttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgataataatgggatgatttgtggat |
7778244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2695263 - 2695185
Alignment:
| Q |
194 |
tgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2695263 |
tgattattaatttttctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgccacttttaaaata |
2695185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 3074512 - 3074553
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3074512 |
caaaatagggaaaaatatgta-tttttaaagtgacaataatgg |
3074553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 44747719 - 44747685
Alignment:
| Q |
41 |
gggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatg |
75 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44747719 |
gggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatg |
44747685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 69)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4470033 - 4469779
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4470033 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
4469934 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4469933 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
4469834 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4469833 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
4469779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 11992287 - 11992541
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11992287 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
11992386 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11992387 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
11992486 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11992487 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
11992541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20899092 - 20898838
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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20898838 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29329866 - 29329612
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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T |
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217 |
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Q |
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29329612 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35894643 - 35894389
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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217 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
35894443 |
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35894389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 37812655 - 37812909
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 47433817 - 47434071
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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47434071 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29674870 - 29674616
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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118 |
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T |
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29674616 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 7436845 - 7437098
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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217 |
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| T |
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T |
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| T |
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7437098 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 10387137 - 10387391
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
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10387236 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
10387237 |
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10387336 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
10387337 |
tctaaaaataataatttgtctattagagataaccattattgtcactttaaaaata |
10387391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 25227706 - 25227960
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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118 |
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217 |
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25227905 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
25227906 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaaata |
25227960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 32831953 - 32832207
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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32832052 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
32832053 |
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32832152 |
T |
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Q |
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| T |
32832153 |
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32832207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 37275885 - 37276139
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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37275984 |
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217 |
Q |
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| T |
37275985 |
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37276084 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
37276085 |
tctaaaaataataatttgtctattacaaataaccattattgtcactttaaaaata |
37276139 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 1023730 - 1023984
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18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatagggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
1023830 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
1023929 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
1023930 |
tctaaaaataataatttttctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1023984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 13264890 - 13265144
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataggcttgaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtatagtttaaat |
13264989 |
T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
13264990 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
13265089 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
13265090 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
13265144 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 38456874 - 38457128
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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Q |
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| T |
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ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaagaagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
38457073 |
T |
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218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
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Q |
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| T |
38457074 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
38457128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 46804062 - 46804316
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| Q |
18 |
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T |
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Q |
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46804316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 37613131 - 37613384
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
37613131 |
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37613230 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
37613231 |
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37613330 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
37613331 |
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37613384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45508463 - 45508211
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
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45508264 |
T |
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| Q |
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270 |
Q |
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| T |
45508263 |
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45508211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37587577 - 37587323
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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37587478 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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37587378 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
37587377 |
tctacaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
37587323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8383931 - 8383677
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
8383731 |
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8383677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 22775699 - 22775953
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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22775798 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
22775799 |
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22775898 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
22775899 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
22775953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31435313 - 31435060
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
31435313 |
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31435214 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
31435213 |
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31435115 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
31435114 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgttactttaaaaata |
31435060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 38833807 - 38834060
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
38833807 |
acatcaaaataggctccaaaatggg-aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
38833905 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
38833906 |
tgtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagctaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
38834005 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
38834006 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgccactttaaaaata |
38834060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31196602 - 31196349
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
31196602 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaat-ttgggggttgtagagtttaaat |
31196504 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
31196503 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
31196404 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
31196403 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattatcactttaaaaata |
31196349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42148949 - 42148695
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgataataatgggatgatttgtggattaatattggaggttgtgtagtttaaat |
42148850 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
42148849 |
ggtttgagcaaactgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttttttataaacc |
42148750 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
42148749 |
tctaaaaataataatttatctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
42148695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 17273215 - 17273472
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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| T |
17273215 |
acatcaaaataggctctaaaatggggaaaaatatgtattttt-aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
17273313 |
T |
 |
| Q |
118 |
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213 |
Q |
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| T |
17273314 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatcgatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttata |
17273413 |
T |
 |
| Q |
214 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
17273414 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattatcactttaaaaata |
17273472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 4631946 - 4632196
Alignment:
| Q |
22 |
caaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtt |
121 |
Q |
| |
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| T |
4631946 |
caaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttcaaagtaacaataatgggatgatttgtggattattattgggggttgtgcagtttaaatggtt |
4632045 |
T |
 |
| Q |
122 |
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221 |
Q |
| |
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| T |
4632046 |
tgagcaaattgttgaaggagttagaggagttaaaagactaagatggtgaagaagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctcta |
4632145 |
T |
 |
| Q |
222 |
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272 |
Q |
| |
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|
| T |
4632146 |
aaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
4632196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 18053991 - 18054243
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
18053991 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattggaggttgtgtagtttaaat |
18054090 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
18054091 |
ggtttgagcaaattgttgaagaagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaa-ttaaatatgattattaatttgtttataaacc |
18054189 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
18054190 |
tctaaaaataa-aatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaaata |
18054243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13242789 - 13242544
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
13242789 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
13242690 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
13242689 |
ggtttgagcaaattgttcaaggagtt---------aaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatttgattattaatttgtttataaacc |
13242599 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
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Q |
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| T |
13242598 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
13242544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 272
Target Start/End: Original strand, 38617517 - 38617731
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttaaagtgacaataatgggatgatttatggattaatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaag |
38617616 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38617617 |
actaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattatt |
38617716 |
T |
 |
| Q |
258 |
gtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |
|
|
| T |
38617717 |
gtcactttaaaaata |
38617731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42246733 - 42246488
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42246733 |
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42246634 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
42246633 |
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42246543 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
42246542 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
42246488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25859413 - 25859205
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
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| T |
25859413 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatatgtatttttaaaagtgacaataatgagatgatttatggattaatattgggggttgtctagtttaaat |
25859314 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25859313 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatatgattattaatttgtttataaacc |
25859214 |
T |
 |
| Q |
218 |
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226 |
Q |
| |
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| T |
25859213 |
tctaaaaat |
25859205 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31675888 - 31675708
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31675888 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtaaaggagaaaatataaatttaaa |
31675789 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31675788 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
31675708 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 52359921 - 52360101
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
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| T |
52359921 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggagaaggagaaaatataaatttaaa |
52360020 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
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|
| T |
52360021 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
52360101 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30753442 - 30753262
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
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|
| T |
30753442 |
aatattgggggttatgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
30753343 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30753342 |
actgattattaatttgtctttaaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
30753262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 13158424 - 13158605
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaa-gactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaa |
190 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
13158424 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaa |
13158523 |
T |
 |
| Q |
191 |
atctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13158524 |
aactgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattggaaataaccattattgtcactttaaaaata |
13158605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 41115428 - 41115593
Alignment:
| Q |
107 |
gtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaattt |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41115428 |
gtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaaaataaatttaaatctgattattaattt |
41115527 |
T |
 |
| Q |
207 |
gtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41115528 |
gtttataaacctctaaaaataataatctgtctattagaaataaccattattgtcattttaaaaata |
41115593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 51000465 - 51000288
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
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|
| T |
51000465 |
aatattgaggtttgtgtagtttaaatagtttgagcaaattgttgaaagagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
51000366 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaa |
269 |
Q |
| |
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|
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| T |
51000365 |
actgattattaatttgtctataaatctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaa |
51000288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 29357987 - 29358166
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29357987 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaaaactaagatggtgaaggagaaaatat-aatttaaa |
29358085 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
| T |
29358086 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
29358166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 32074294 - 32074474
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32074294 |
aatattgggggttgtgtagtttaaaaggtttgagcaaattgttgaaggagttggagaagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
32074393 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
| T |
32074394 |
gctgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataactattattgtcactttaaaaata |
32074474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44396966 - 44396786
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
44396966 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggatttaaaagactaacatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
44396867 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
44396866 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtttattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
44396786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38788037 - 38787857
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
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||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38788037 |
aatattgggggttgtttagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggatgagttaaaagactaagatggtgaagtagaaaatataaatttaaa |
38787938 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38787937 |
actgattattaatttgtctataaacccttaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
38787857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 113 - 272
Target Start/End: Original strand, 4513764 - 4513923
Alignment:
| Q |
113 |
taaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4513764 |
taaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagattaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatttgattattaatttgtttat |
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T |
 |
| Q |
213 |
aaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4513864 |
aaacctctaaaaataataatttttctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
4513923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36304517 - 36304330
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36304517 |
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T |
 |
| Q |
192 |
tc-------tgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36304417 |
actgattagtgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
36304330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20358449 - 20358300
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
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acatcaaaataggctcaaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgcagtttaaat |
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T |
 |
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| |
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||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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20358349 |
ggtttgagcaaa-tgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggt |
20358300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20561506 - 20561655
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggt |
168 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
20561606 |
ggtttgagcaaa-tgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49203692 - 49203517
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| |
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|
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49203692 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgtaggagaaaatataaatttaaa |
49203593 |
T |
 |
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192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49203592 |
actgattattaatct----ataaacccccaaaaaaaa-aattagtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
49203517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 269
Target Start/End: Original strand, 42128329 - 42128457
Alignment:
| Q |
141 |
gttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctat |
240 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42128329 |
gttgaaggagttaaaagattaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaaactgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctat |
42128428 |
T |
 |
| Q |
241 |
tagaaataatcattattgtcactttaaaa |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42128429 |
tagaaataatcattattgtcacttaaaaa |
42128457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 20552522 - 20552634
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20552522 |
acatcaaaataggctcaaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgcagtttaaat |
20552621 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaat |
130 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |
|
|
| T |
20552622 |
ggtttgagcaaat |
20552634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Original strand, 31434929 - 31435008
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatatt |
97 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31434929 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatatt |
31435008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 23742095 - 23742170
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaa |
93 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23742095 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaa |
23742170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4213458 - 4213303
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4213458 |
aatattgggggttgtgtagtttaaattgtttgagcaaattgttg---------gaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
4213368 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4213367 |
actgattgt----------------cacttaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
4213303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 13149794 - 13149870
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13149794 |
acatcaaaataagcttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
13149870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 32073949 - 32074025
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32073949 |
acatcaaaataggcttcaaaatgaggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
32074025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38788382 - 38788306
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38788382 |
acatcaaaataggctacaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatggaatgatttgtggattaat |
38788306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36304861 - 36304786
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36304861 |
acatcaaaataggcttcaaaatggg-aaaaatttgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
36304786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 49204037 - 49203961
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
49204037 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacagtaatgggatgatttgtggaataat |
49203961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Original strand, 52359594 - 52359654
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52359594 |
caaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
52359654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30753789 - 30753711
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttt--aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30753789 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttttaaagtgacaataatgggatgatttgtgaattaat |
30753711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30751511 - 30751451
Alignment:
| Q |
212 |
taaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30751511 |
taaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
30751451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44397311 - 44397237
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44397311 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggaaaaagt--gtattttttaaagtgacaataatgtgatgatttgtggattaat |
44397237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51000820 - 51000750
Alignment:
| Q |
23 |
aaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51000820 |
aaaataggcttcaaaatggggaaaa-tatgtattttttaaagtggcaataatgagataatttgtggattaat |
51000750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20358300 - 20358248
Alignment:
| Q |
220 |
taaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20358300 |
taaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtgactttaaaaata |
20358248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 272
Target Start/End: Original strand, 20561655 - 20561707
Alignment:
| Q |
220 |
taaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20561655 |
taaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtgactttaaaaata |
20561707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31676216 - 31676157
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31676216 |
caaaatagggaaaaatgtgtattttt-aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
31676157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4213782 - 4213727
Alignment:
| Q |
39 |
tggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4213782 |
tgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatggaatgatttgtggattaat |
4213727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Original strand, 29357659 - 29357717
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaa |
93 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29357659 |
caaaatagggaaaaatgtgtatttt-taaagtgacaataatgagatgatttgtggattaa |
29357717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 97
Target Start/End: Original strand, 23742167 - 23742205
Alignment:
| Q |
59 |
ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatatt |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23742167 |
ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatatt |
23742205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9772808 - 9772551
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9772808 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaaatgacaataatgtgatgatttgtggattaatattg-gggttgtgtagtttaaat |
9772710 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9772709 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
9772610 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaatataca |
276 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9772609 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaatataca |
9772551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 12736576 - 12736830
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12736576 |
acatcaaaataggctccaaaatatggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
12736675 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12736676 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
12736775 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12736776 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
12736830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 17526357 - 17526611
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17526357 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattggggattgtgtagtttaaat |
17526456 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17526457 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
17526556 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17526557 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcatttttgtcactttaaaaata |
17526611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32272936 - 32272682
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32272936 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
32272837 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32272836 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
32272737 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32272736 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
32272682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 39760869 - 39761123
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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39761069 |
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39761123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25338703 - 25338446
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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217 |
Q |
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Q |
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| T |
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25338446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19289696 - 19289441
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttt-aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
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Q |
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| T |
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19289441 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 460047 - 459793
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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217 |
Q |
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459793 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 4152724 - 4152978
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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118 |
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217 |
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T |
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| T |
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4152978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 6680791 - 6681045
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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6680990 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
6680991 |
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6681045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 12366788 - 12367041
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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217 |
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12366986 |
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Q |
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| T |
12366987 |
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12367041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21640479 - 21640225
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
21640479 |
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21640380 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
21640379 |
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21640280 |
T |
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| Q |
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272 |
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| T |
21640279 |
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21640225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25482422 - 25482168
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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25482323 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
25482322 |
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25482223 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
25482222 |
tctaaaaataataatttgtatattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
25482168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38483495 - 38483243
Alignment:
| Q |
20 |
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119 |
Q |
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| T |
38483495 |
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38483396 |
T |
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| Q |
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| T |
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38483296 |
T |
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| T |
38483295 |
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38483243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 4843961 - 4844215
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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acatcaaaataagctccaaaatggggaaaaatatatattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
4844061 |
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4844160 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
4844161 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
4844215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6845520 - 6845266
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
6845520 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtaacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
6845421 |
T |
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| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
6845420 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaagagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
6845321 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
6845320 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6845266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 8160236 - 8160490
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Q |
| |
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| T |
8160236 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
8160335 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
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| T |
8160336 |
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8160435 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
8160436 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataataattattgtcactttaaaaata |
8160490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9475754 - 9475502
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| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
9475754 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaa-tatgtattttt-aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
9475657 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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Q |
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| T |
9475656 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
9475557 |
T |
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tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
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| T |
9475556 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
9475502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 26395689 - 26395943
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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26395788 |
T |
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217 |
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| T |
26395789 |
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T |
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272 |
Q |
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| T |
26395889 |
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26395943 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29373794 - 29373540
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
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29373595 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
29373594 |
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29373540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41412372 - 41412118
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
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41412273 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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41412173 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
41412172 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
41412118 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 12799400 - 12799653
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
12799400 |
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T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
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12799598 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
12799599 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
12799653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 18145970 - 18146224
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
18146070 |
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18146169 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
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| T |
18146170 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactctaaaaata |
18146224 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 40315167 - 40315421
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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40315167 |
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T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
40315267 |
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40315366 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
40315367 |
tctaaaaataataatttgtctattataaataaccattattgtcactttaaaaata |
40315421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2061160 - 2060905
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttt-aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
2061160 |
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2061061 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
2061060 |
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2060961 |
T |
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| Q |
217 |
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272 |
Q |
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| T |
2060960 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattatcgtcactttaaaaata |
2060905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 1829700 - 1829954
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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|
| T |
1829700 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatggaatgatttgtggattaatattggagattgtgtagtttaaat |
1829799 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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|
| T |
1829800 |
ggtttgagcaaattgttgaaagagttggaggagttgaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
1829899 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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|
| T |
1829900 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
1829954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 4912091 - 4912344
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4912091 |
acatcaaaataggctcaaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
4912190 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
4912191 |
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4912289 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
4912290 |
tctaaaaataaaaatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
4912344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 13306631 - 13306881
Alignment:
| Q |
22 |
caaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtt |
121 |
Q |
| |
|
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| T |
13306631 |
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13306730 |
T |
 |
| Q |
122 |
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221 |
Q |
| |
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| T |
13306731 |
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13306830 |
T |
 |
| Q |
222 |
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272 |
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| |
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| T |
13306831 |
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13306881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15181028 - 15180772
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaata--tgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaa |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
15181028 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaaaaaatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaa |
15180929 |
T |
 |
| Q |
116 |
atggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
215 |
Q |
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| T |
15180928 |
atggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
15180829 |
T |
 |
| Q |
216 |
cctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15180828 |
cctctaaaaataataatttatctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
15180772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 17587533 - 17587789
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaa--atatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaa |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
17587533 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaaaatatgtattttttaaagtggcaataatgagatgatttgtggattaatattgggggttgtctagtttaa |
17587632 |
T |
 |
| Q |
116 |
atggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
17587633 |
atggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaa |
17587732 |
T |
 |
| Q |
216 |
cctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17587733 |
cctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
17587789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6166455 - 6166203
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6166455 |
acatcaaaataggctccaaaatagggaaaaatatgtattttt-aaggtgacaataatgagatgatttgtggattaatattg-gggttgtgtagtttaaat |
6166358 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
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| T |
6166357 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
6166258 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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|
| T |
6166257 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
6166203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 36811110 - 36811364
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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Q |
| |
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|
| T |
36811110 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaaaaatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
36811209 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
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Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36811210 |
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Q |
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36811364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 16868754 - 16869006
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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16868851 |
T |
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217 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
16868952 |
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16869006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38395952 - 38395704
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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T |
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217 |
Q |
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38395759 |
T |
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272 |
Q |
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| T |
38395758 |
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38395704 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42341703 - 42341448
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttttt-aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
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42341604 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
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T |
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272 |
Q |
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| T |
42341503 |
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42341448 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 3508351 - 3508605
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
3508451 |
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3508550 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
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| T |
3508551 |
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3508605 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12404137 - 12403883
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
12404037 |
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12403938 |
T |
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| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
12403937 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataactattattatcactttaaaaata |
12403883 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24361543 - 24361289
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
24361543 |
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24361444 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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| T |
24361443 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
24361344 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
24361343 |
tctaaaaataataatctgtctattagaaataaccattattatcattttaaaaata |
24361289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 11445359 - 11445614
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtatttt-ttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
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| T |
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11445458 |
T |
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| Q |
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216 |
Q |
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| T |
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11445558 |
T |
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| Q |
217 |
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272 |
Q |
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| T |
11445559 |
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11445614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17086380 - 17086129
Alignment:
| Q |
21 |
tcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggt |
120 |
Q |
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| T |
17086380 |
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17086281 |
T |
 |
| Q |
121 |
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220 |
Q |
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| T |
17086280 |
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17086181 |
T |
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| Q |
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272 |
Q |
| |
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| T |
17086180 |
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17086129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 8407681 - 8407939
Alignment:
| Q |
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
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8407780 |
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| Q |
118 |
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213 |
Q |
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| T |
8407781 |
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8407880 |
T |
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| Q |
214 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
8407881 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcacttaaaaaata |
8407939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24324918 - 24324665
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
24324918 |
acatcaaaatagactctaaaatggggaaaaatatgtattttttaa-gtgacaataataggatgatttgtagattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
24324820 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
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| T |
24324819 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
24324720 |
T |
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| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
24324719 |
tctaaaaataataatctgtctattagaaataaccattattatcattttaaaaata |
24324665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40195797 - 40195552
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
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| T |
40195797 |
acatcaaaatagactccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatatgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
40195698 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
40195697 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagtt---------aaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
40195607 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
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| T |
40195606 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 16353604 - 16353855
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| Q |
20 |
atcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatgg |
119 |
Q |
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| T |
16353604 |
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16353702 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
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| T |
16353703 |
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16353802 |
T |
 |
| Q |
220 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
16353803 |
taaaaataataatttgtctattagaaatagccattattgtcactttaaaaata |
16353855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7482801 - 7482557
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
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| T |
7482801 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttt-aaagtgacaataatgagatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
7482703 |
T |
 |
| Q |
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ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
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| T |
7482702 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagtt---------aaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
7482612 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
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| T |
7482611 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
7482557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38143844 - 38143645
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acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
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| T |
38143844 |
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38143745 |
T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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|
| T |
38143744 |
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38143645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 38465399 - 38465611
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaa-atatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaa |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38465399 |
acatcaaaataggctccaaaatgggaaaaacatatgtattttttaaagtgacaataatgagatgatttgtgcattaatattgggggttgtgtagtttaaa |
38465498 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38465499 |
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38465598 |
T |
 |
| Q |
217 |
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229 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
38465599 |
ctctaaaaataat |
38465611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6864834 - 6864654
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6864834 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
6864735 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6864734 |
actgattattaatttgtctataaacccttaaaaataataatttgtctattagaaataaccattactgtcactttaaaaata |
6864654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4104427 - 4104248
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4104427 |
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4104329 |
T |
 |
| Q |
192 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4104328 |
actgattattaatttgtctataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
4104248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42438368 - 42438204
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
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|
| T |
42438368 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaa-tatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggcgttgtgtagtttaaat |
42438270 |
T |
 |
| Q |
118 |
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192 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42438269 |
ggtttgagcaaattgttgaagg---------agttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaat |
42438204 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42438203 - 42438077
Alignment:
| Q |
146 |
aggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42438203 |
aggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaa |
42438104 |
T |
 |
| Q |
246 |
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272 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42438103 |
ataaccattattgtcactttaacaata |
42438077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6865178 - 6865103
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6865178 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaa-atgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
6865103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17086468 - 17086397
Alignment:
| Q |
21 |
tcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggatta |
92 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17086468 |
tcaaaataggctccaaaatggagaaaaatatgtatttttttaagtgacaataatgagatgatttgtggatta |
17086397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 7978732 - 7978808
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7978732 |
acatcaaaataggcttcaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgaaaataatgagatgatttatggattaat |
7978808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4104770 - 4104696
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4104770 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaa-tatgt-ttttttaaagtgacaataatgagatgatttgtggattaat |
4104696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 39761142 - 39761101
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39761142 |
caaaatagggaaaaatatgtat-ttttaaagtgacaataatgg |
39761101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 75
Target Start/End: Original strand, 9475483 - 9475523
Alignment:
| Q |
34 |
caaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatg |
75 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9475483 |
caaaatagggaaaaatatgta-tttttaaagtgacaataatg |
9475523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 120928 - 121182
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
120928 |
acatcaaaataggctcaaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
121027 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
121028 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
121127 |
T |
 |
| Q |
218 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
121128 |
tctaaaaataataatttttctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
121182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41723 - 41465
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41723 |
acatcaaaataggctccaaaacggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
41624 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41623 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaattataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
41524 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaatataca |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41523 |
tctaaaaataataatttgtcgattataaataaccattattgtcactttaaaaatataca |
41465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 7382 - 7635
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7382 |
acatcaaaataggcttcaaaatggagaaaaatatgtatttt-taaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
7480 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7481 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatttgattattaatttgtttataaacc |
7580 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7581 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
7635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0041 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:
Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 7714 - 7968
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7714 |
acatcaaaataggctccaaaatggagaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
7813 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagtt-ggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
216 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7814 |
ggtttgagcaaattgttgaaggagttgggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaac |
7913 |
T |
 |
| Q |
217 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7914 |
ctctaaaaataataatttgtctattagaaat-accattattgtcattttaaaaata |
7968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0343 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:
Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10704 - 10450
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10704 |
acatcaaaataggctccaaaatgggggaaaatatgtattttttaaagtgacaataataggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
10605 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10604 |
agtttgagcaaatagttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgtagtagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
10505 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10504 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
10450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 187771 - 187522
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
187771 |
acatcaaaataggctccaaaatggg-aaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgatatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
187673 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacc |
217 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
187672 |
ggtttgagaaaattgttgaaggagttggagaagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatttgaatattaatttgtttataaacc |
187573 |
T |
 |
| Q |
218 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaa |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
187572 |
tctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtccctttaaa |
187522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 77507 - 77275
Alignment:
| Q |
38 |
atggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaa |
137 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
77507 |
atgggaaaaaatatgtatttt--aaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaatggtatgagcaaattgttgaa |
77410 |
T |
 |
| Q |
138 |
ggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtc |
237 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77409 |
ggaattggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtc |
77310 |
T |
 |
| Q |
238 |
tattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77309 |
tattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
77275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11146 - 10911
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11146 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgtgatgatttctggattaatattaggggttgtgtagtttaaat |
11047 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaa----gatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttata |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11046 |
ggtttaagcaaattattgaaggagttggaggagttaaaagactaagatcgatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttatttata |
10947 |
T |
 |
| Q |
214 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataa |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10946 |
aacctctaaaaataataatttgtctattagaaataa |
10911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 38 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 52773 - 52538
Alignment:
| Q |
38 |
atggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaata-atgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttga |
136 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52773 |
atggggaaatatatgtattttgtaaagtgacaatggatgggatgatttgtggattaatattggggtttgtgtagtgtaaatggtttgagcaaattgttga |
52674 |
T |
 |
| Q |
137 |
aggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgt |
236 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
52673 |
aggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaatctgattattagtttgtttataaacctttaaaaataataatttgt |
52574 |
T |
 |
| Q |
237 |
ctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52573 |
ctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
52538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0572
Description:
Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Original strand, 1317 - 1495
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1317 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgaacaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
1416 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaa |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1417 |
tctgattattaatttgtttacaaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaa |
1495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 982 - 1048
Alignment:
| Q |
28 |
aggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
982 |
aggctccaaaatgggggaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatggtatgatttgtggattaat |
1048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1511 - 1475
Alignment:
| Q |
40 |
ggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgg |
76 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1511 |
ggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatgg |
1475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43177
Alignment:
| Q |
92 |
aatattgagggttgtgtagtttaaatggtttaagcaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42997 |
aatattgggggttgtgtagtttaaatggtttgagtaaattgttgaaggagttggaggagttaaaagactaagatggtgaaggagaaaatataaatttaaa |
43096 |
T |
 |
| Q |
192 |
tctgattattaatttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43097 |
actggttattaatttgtccataaacccctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcacgttaaaaata |
43177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 42653 - 42729
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42653 |
acatcaaaataggcttcaaaatggggaaaaatgtgtattttttaaagtgagaataatgagatgatttgtggattaat |
42729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0320 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:
Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 15835 - 15955
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgagggttgtgtagtttaaat |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15835 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatatgtattttttaaagtgacaataatgggatgatttgtggattaatattgggggttgtgtagtttaaat |
15934 |
T |
 |
| Q |
118 |
ggtttaagcaaattgttgaag |
138 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15935 |
ggtttgagcaaattgttgaag |
15955 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0287 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:
Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17664 - 17595
Alignment:
| Q |
203 |
atttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataatcattattgtcactttaaaaata |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17664 |
atttgtttataaacctctaaaaataataatttgtctattagaaataaccattattgtcactttaaaaata |
17595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 104294 - 104261
Alignment:
| Q |
18 |
acatcaaaataggctccaaaatggggaaaaatat |
51 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
104294 |
acatcaaaataggctcaaaaatggggaaaaatat |
104261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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