View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_228 (Length: 274)

Name: NF7829A_low_228
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_228
NF7829A_low_228
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (9-274)||(33256171-33256436)
chr1 (9-274)||(33276343-33276608)
chr1 (9-274)||(48704199-48704464)
chr1 (9-270)||(19717519-19717780)
chr1 (9-262)||(1577862-1578115)
chr1 (9-274)||(22600000-22600267)
chr1 (9-248)||(28492248-28492489)
chr1 (9-265)||(20954300-20954558)
chr1 (9-248)||(12284418-12284657)
chr1 (9-272)||(22153852-22154117)
chr1 (9-248)||(10757416-10757656)
chr1 (9-274)||(38282562-38282828)
chr1 (9-248)||(1900340-1900581)
chr1 (33-234)||(32785798-32785998)
chr1 (9-274)||(2268526-2268789)
chr1 (9-229)||(22201601-22201821)
chr1 (37-274)||(35401832-35402069)
chr1 (14-248)||(30893092-30893327)
chr1 (37-248)||(22427203-22427414)
chr1 (9-248)||(29215792-29216031)
chr1 (9-216)||(36134185-36134391)
chr1 (37-248)||(2267112-2267321)
chr1 (20-219)||(39200869-39201066)
chr1 (37-234)||(22464670-22464866)
chr1 (37-248)||(16235142-16235353)
chr1 (37-274)||(23036347-23036584)
chr1 (37-262)||(7309842-7310068)
chr1 (38-234)||(2834714-2834908)
chr1 (9-237)||(26701986-26702214)
chr1 (9-219)||(25448443-25448651)
chr1 (9-248)||(21028788-21029029)
chr1 (14-197)||(21191763-21191945)
chr1 (9-199)||(35040161-35040351)
chr1 (37-248)||(17024811-17025021)
chr1 (9-197)||(12613713-12613899)
chr1 (37-234)||(2327301-2327497)
chr1 (20-234)||(30572203-30572414)
chr1 (9-219)||(44821422-44821630)
chr1 (9-234)||(21702809-21703031)
chr1 (9-234)||(48570094-48570316)
chr1 (20-158)||(14263387-14263525)
chr1 (9-234)||(46088984-46089198)
chr1 (37-234)||(7744952-7745147)
chr1 (14-234)||(10250986-10251194)
chr1 (37-154)||(18896537-18896654)
chr1 (37-101)||(21984619-21984683)
chr1 (37-101)||(42284651-42284715)
chr1 (9-101)||(19215607-19215699)
chr1 (37-101)||(21121057-21121121)
chr1 (37-101)||(21135153-21135217)
chr1 (37-80)||(21204937-21204980)
chr1 (210-248)||(12284651-12284689)
chr1 (9-78)||(23024783-23024852)
chr1 (214-274)||(21191697-21191757)
chr1 (37-101)||(37642271-37642335)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (9-274)||(16681201-16681466)
chr8 (9-274)||(39693523-39693790)
chr8 (37-265)||(33082873-33083101)
chr8 (9-274)||(16188972-16189237)
chr8 (14-274)||(17525626-17525887)
chr8 (9-272)||(17914447-17914712)
chr8 (9-248)||(19156184-19156425)
chr8 (9-271)||(16207294-16207558)
chr8 (9-237)||(602655-602883)
chr8 (14-237)||(12757698-12757921)
chr8 (9-274)||(29693303-29693570)
chr8 (14-262)||(17441716-17441965)
chr8 (9-274)||(24646326-24646593)
chr8 (14-262)||(18321067-18321317)
chr8 (20-271)||(19943234-19943489)
chr8 (14-270)||(20382296-20382552)
chr8 (14-272)||(17267467-17267724)
chr8 (9-248)||(18718989-18719228)
chr8 (8-248)||(18679802-18680042)
chr8 (37-274)||(23263509-23263747)
chr8 (45-261)||(18121018-18121236)
chr8 (37-248)||(23185150-23185361)
chr8 (9-271)||(17701733-17701997)
chr8 (9-248)||(21932871-21933112)
chr8 (77-265)||(20255473-20255660)
chr8 (14-248)||(30421352-30421587)
chr8 (9-248)||(17797410-17797649)
chr8 (9-234)||(15336028-15336251)
chr8 (9-234)||(15425093-15425316)
chr8 (9-234)||(15516397-15516620)
chr8 (14-274)||(19707499-19707758)
chr8 (128-274)||(22745594-22745742)
chr8 (9-233)||(40845329-40845550)
chr8 (37-234)||(24551290-24551485)
chr8 (9-234)||(45538379-45538602)
chr8 (20-216)||(18722602-18722798)
chr8 (20-216)||(18730947-18731143)
chr8 (20-139)||(18685430-18685549)
chr8 (37-199)||(1237653-1237815)
chr8 (9-195)||(43644884-43645069)
chr8 (33-274)||(22673790-22674032)
chr8 (20-234)||(9320567-9320781)
chr8 (37-234)||(36105211-36105406)
chr8 (33-237)||(22663128-22663330)
chr8 (37-139)||(19956374-19956476)
chr8 (33-194)||(22461617-22461777)
chr8 (25-234)||(24832996-24833204)
chr8 (9-85)||(25164058-25164134)
chr8 (9-234)||(6407714-6407927)
chr8 (37-130)||(45567943-45568036)
chr8 (9-105)||(14989518-14989614)
chr8 (9-105)||(18151713-18151809)
chr8 (178-234)||(3598286-3598340)
chr8 (37-101)||(13430699-13430763)
chr8 (62-118)||(21540985-21541041)
chr8 (37-101)||(33560295-33560359)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (9-274)||(14644-14909)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (9-274)||(17814960-17815225)
chr5 (9-248)||(21910548-21910787)
chr5 (9-248)||(23412880-23413119)
chr5 (9-248)||(6512337-6512573)
chr5 (9-272)||(7745575-7745838)
chr5 (9-262)||(21072131-21072385)
chr5 (9-248)||(89328-89567)
chr5 (9-248)||(41566338-41566579)
chr5 (9-274)||(19536180-19536446)
chr5 (9-229)||(20550887-20551107)
chr5 (37-248)||(33022684-33022895)
chr5 (16-248)||(26784353-26784587)
chr5 (39-219)||(13545455-13545627)
chr5 (37-243)||(31117897-31118102)
chr5 (9-274)||(23881059-23881325)
chr5 (33-274)||(642586-642828)
chr5 (9-249)||(6499231-6499471)
chr5 (20-228)||(30742983-30743189)
chr5 (20-234)||(42243683-42243896)
chr5 (9-234)||(4887014-4887237)
chr5 (37-234)||(11993908-11994103)
chr5 (9-274)||(21099583-21099849)
chr5 (9-249)||(21198910-21199148)
chr5 (20-234)||(15516972-15517184)
chr5 (9-248)||(9398649-9398879)
chr5 (9-234)||(29138330-29138551)
chr5 (14-234)||(3245364-3245581)
chr5 (20-201)||(25096777-25096960)
chr5 (20-201)||(25154747-25154930)
chr5 (37-234)||(26759169-26759364)
chr5 (9-104)||(12352845-12352940)
chr5 (9-219)||(14086474-14086684)
chr5 (9-234)||(33933259-33933486)
chr5 (9-128)||(30115863-30115982)
chr5 (38-153)||(26765519-26765634)
chr5 (9-147)||(28139599-28139737)
chr5 (14-104)||(28464389-28464479)
chr5 (9-105)||(9088961-9089057)
chr5 (9-105)||(25930205-25930301)
chr5 (14-118)||(32160763-32160867)
chr5 (9-104)||(10848765-10848860)
chr5 (14-129)||(11208011-11208125)
chr5 (33-109)||(16607528-16607603)
chr5 (37-101)||(35932059-35932123)
chr5 (125-234)||(5429991-5430099)
chr5 (178-234)||(30115798-30115852)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (9-248)||(25829124-25829363)
chr2 (9-274)||(30666979-30667246)
chr2 (9-274)||(22187945-22188212)
chr2 (9-274)||(23234997-23235264)
chr2 (16-271)||(20568596-20568853)
chr2 (9-274)||(24576025-24576291)
chr2 (9-262)||(19540406-19540659)
chr2 (9-274)||(21537091-21537358)
chr2 (9-274)||(25037102-25037369)
chr2 (9-274)||(25041209-25041476)
chr2 (9-274)||(9015214-9015478)
chr2 (9-237)||(13963860-13964088)
chr2 (9-274)||(10009594-10009860)
chr2 (14-248)||(30621211-30621447)
chr2 (14-248)||(30623832-30624068)
chr2 (9-248)||(18376775-18377016)
chr2 (45-274)||(22260432-22260661)
chr2 (9-274)||(24850508-24850776)
chr2 (9-248)||(24377091-24377332)
chr2 (9-274)||(40782467-40782726)
chr2 (37-274)||(38781417-38781654)
chr2 (37-248)||(20151905-20152117)
chr2 (20-234)||(22317594-22317809)
chr2 (20-248)||(6573993-6574223)
chr2 (9-262)||(23595427-23595677)
chr2 (9-248)||(39037511-39037752)
chr2 (9-229)||(28140509-28140729)
chr2 (9-201)||(24779333-24779525)
chr2 (97-273)||(7609039-7609216)
chr2 (9-262)||(41121577-41121829)
chr2 (9-274)||(22454833-22455100)
chr2 (14-248)||(25189393-25189629)
chr2 (37-234)||(45087069-45087266)
chr2 (9-153)||(31800853-31800997)
chr2 (9-199)||(28711618-28711808)
chr2 (33-265)||(22272146-22272378)
chr2 (20-248)||(22802461-22802687)
chr2 (20-154)||(26619066-26619200)
chr2 (9-234)||(33074216-33074439)
chr2 (20-234)||(6392634-6392848)
chr2 (9-262)||(23184170-23184414)
chr2 (40-234)||(28701116-28701308)
chr2 (34-217)||(34321840-34322021)
chr2 (37-248)||(30557190-30557403)
chr2 (20-234)||(31327852-31328065)
chr2 (20-234)||(31334573-31334786)
chr2 (9-130)||(35743989-35744110)
chr2 (33-262)||(44881181-44881409)
chr2 (33-216)||(19115097-19115279)
chr2 (9-104)||(22776303-22776398)
chr2 (9-104)||(22781681-22781776)
chr2 (9-104)||(28550933-28551028)
chr2 (9-104)||(40332077-40332172)
chr2 (9-104)||(44840424-44840519)
chr2 (20-234)||(1586929-1587132)
chr2 (33-104)||(14581529-14581600)
chr2 (33-105)||(3277044-3277116)
chr2 (33-237)||(18702752-18702955)
chr2 (9-101)||(31968061-31968153)
chr2 (39-216)||(18430844-18431020)
chr2 (33-104)||(22785670-22785741)
chr2 (60-118)||(1084047-1084105)
chr2 (178-248)||(22776171-22776239)
chr2 (178-248)||(22781549-22781617)
chr2 (37-80)||(23392707-23392750)
chr2 (185-234)||(22785552-22785599)
chr2 (9-49)||(22258191-22258231)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (9-274)||(377407-377674)
scaffold0004 (17-274)||(220242-220500)
scaffold0004 (9-248)||(211394-211631)
scaffold0004 (18-152)||(244256-244390)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (9-274)||(1686-1951)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (9-274)||(16632430-16632695)
chr4 (37-274)||(37435391-37435628)
chr4 (17-263)||(12601099-12601345)
chr4 (9-262)||(29680410-29680665)
chr4 (9-274)||(14604762-14605028)
chr4 (20-274)||(45833395-45833651)
chr4 (9-217)||(37985525-37985733)
chr4 (9-270)||(12811036-12811296)
chr4 (9-214)||(19666362-19666567)
chr4 (9-237)||(3395580-3395808)
chr4 (33-234)||(19884716-19884916)
chr4 (9-248)||(55380280-55380519)
chr4 (9-204)||(9140902-9141097)
chr4 (14-248)||(56034569-56034803)
chr4 (9-229)||(19620962-19621182)
chr4 (37-248)||(3483739-3483952)
chr4 (9-237)||(14904249-14904477)
chr4 (20-219)||(22675433-22675630)
chr4 (33-219)||(10072949-10073134)
chr4 (37-248)||(13575996-13576207)
chr4 (17-248)||(19911760-19911994)
chr4 (72-247)||(14833449-14833626)
chr4 (9-270)||(6641674-6641934)
chr4 (38-248)||(413021-413231)
chr4 (9-274)||(40846089-40846356)
chr4 (9-234)||(10692841-10693064)
chr4 (9-234)||(10906607-10906830)
chr4 (38-274)||(17247263-17247499)
chr4 (14-199)||(29121365-29121550)
chr4 (20-248)||(54679931-54680157)
chr4 (9-234)||(6517475-6517698)
chr4 (9-252)||(23750512-23750755)
chr4 (116-258)||(23123528-23123672)
chr4 (75-271)||(15139283-15139482)
chr4 (39-154)||(11915720-11915835)
chr4 (20-199)||(8105638-8105819)
chr4 (9-248)||(3105304-3105540)
chr4 (33-153)||(16940030-16940150)
chr4 (37-158)||(56533033-56533155)
chr4 (20-147)||(25651087-25651214)
chr4 (9-218)||(17398598-17398795)
chr4 (9-118)||(16853493-16853602)
chr4 (83-219)||(55731844-55731977)
chr4 (36-146)||(41114754-41114864)
chr4 (34-154)||(11901202-11901322)
chr4 (33-132)||(17788044-17788144)
chr4 (164-271)||(22089733-22089841)
chr4 (37-80)||(38513896-38513939)
chr4 (20-146)||(17540396-17540522)
chr4 (37-78)||(3499704-3499745)
chr4 (178-234)||(14571183-14571237)
chr4 (37-101)||(22190864-22190928)
chr4 (9-77)||(39419787-39419855)
chr4 (33-64)||(8685509-8685540)
chr4 (224-262)||(17540632-17540670)
chr4 (224-262)||(41114604-41114642)
chr4 (9-78)||(20977447-20977516)
chr4 (37-101)||(40860685-40860749)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (9-274)||(49642659-49642926)
chr3 (14-274)||(13948336-13948598)
chr3 (9-248)||(37467328-37467567)
chr3 (9-274)||(14392903-14393168)
chr3 (9-274)||(31303381-31303648)
chr3 (9-274)||(20646149-20646417)
chr3 (9-274)||(6090727-6090994)
chr3 (18-248)||(17238847-17239077)
chr3 (14-274)||(15903198-15903461)
chr3 (9-248)||(12963010-12963249)
chr3 (14-274)||(52920406-52920667)
chr3 (16-194)||(41495001-41495179)
chr3 (9-234)||(2561183-2561408)
chr3 (14-234)||(28582106-28582326)
chr3 (9-274)||(29951335-29951602)
chr3 (9-274)||(30000489-30000756)
chr3 (37-248)||(38177566-38177779)
chr3 (37-237)||(18121558-18121758)
chr3 (37-262)||(49553400-49553625)
chr3 (33-237)||(14969346-14969550)
chr3 (37-248)||(18142677-18142888)
chr3 (9-182)||(13780575-13780748)
chr3 (9-248)||(47207701-47207941)
chr3 (9-248)||(12726155-12726394)
chr3 (9-248)||(16658541-16658782)
chr3 (37-208)||(13824092-13824263)
chr3 (9-248)||(19888869-19889107)
chr3 (37-248)||(47405346-47405557)
chr3 (9-248)||(40799869-40800108)
chr3 (9-248)||(16032520-16032757)
chr3 (37-248)||(20627356-20627567)
chr3 (38-234)||(46349785-46349979)
chr3 (20-219)||(11223569-11223766)
chr3 (9-139)||(22804057-22804187)
chr3 (37-234)||(2785087-2785283)
chr3 (9-153)||(53056747-53056891)
chr3 (20-234)||(14955433-14955645)
chr3 (37-219)||(24775490-24775670)
chr3 (20-274)||(20725093-20725346)
chr3 (9-248)||(22140759-22140996)
chr3 (9-274)||(25398172-25398419)
chr3 (37-274)||(33583252-33583492)
chr3 (14-201)||(12388845-12389031)
chr3 (38-201)||(19249385-19249547)
chr3 (20-262)||(5213583-5213822)
chr3 (83-248)||(11869137-11869302)
chr3 (20-215)||(12968312-12968506)
chr3 (20-135)||(29855415-29855530)
chr3 (33-154)||(23538185-23538306)
chr3 (33-234)||(21640886-21641084)
chr3 (37-158)||(50300246-50300367)
chr3 (34-147)||(26417705-26417818)
chr3 (107-234)||(49666356-49666480)
chr3 (9-80)||(11868264-11868335)
chr3 (33-219)||(46796333-46796507)
chr3 (37-118)||(11909079-11909160)
chr3 (9-101)||(21605726-21605818)
chr3 (47-118)||(45858804-45858875)
chr3 (37-101)||(21636742-21636806)
chr3 (37-101)||(40850991-40851055)
chr3 (62-118)||(51341051-51341107)
chr3 (9-80)||(30054310-30054381)
chr3 (222-274)||(41495182-41495236)
chr3 (60-118)||(12752683-12752741)
chr3 (178-234)||(21605604-21605658)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (9-274)||(60012-60277)
scaffold0026 (9-248)||(7922-8161)
scaffold0026 (200-270)||(115708-115778)
scaffold0026 (224-274)||(151738-151788)
scaffold0026 (164-201)||(151794-151831)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (9-274)||(16316458-16316723)
chr7 (9-274)||(10883072-10883339)
chr7 (9-270)||(11792899-11793162)
chr7 (14-274)||(21283274-21283534)
chr7 (9-272)||(22577924-22578187)
chr7 (9-262)||(29935272-29935524)
chr7 (9-237)||(13137833-13138061)
chr7 (9-237)||(13302802-13303030)
chr7 (9-274)||(13880096-13880363)
chr7 (14-237)||(15088517-15088740)
chr7 (14-274)||(28409036-28409297)
chr7 (9-248)||(44467056-44467298)
chr7 (9-248)||(21695393-21695634)
chr7 (9-274)||(12366649-12366914)
chr7 (9-237)||(2913546-2913774)
chr7 (14-270)||(11319402-11319660)
chr7 (9-248)||(13648721-13648960)
chr7 (14-248)||(24788138-24788372)
chr7 (9-248)||(21692279-21692517)
chr7 (9-248)||(30025897-30026138)
chr7 (9-234)||(33691653-33691878)
chr7 (9-213)||(2500030-2500234)
chr7 (14-222)||(13730628-13730836)
chr7 (9-274)||(9069554-9069822)
chr7 (40-274)||(15467939-15468175)
chr7 (38-274)||(13692372-13692599)
chr7 (20-234)||(23279900-23280113)
chr7 (37-248)||(30945285-30945494)
chr7 (9-247)||(30944253-30944489)
chr7 (9-274)||(13260524-13260781)
chr7 (37-248)||(9709729-9709940)
chr7 (14-248)||(14426544-14426776)
chr7 (14-208)||(5000788-5000983)
chr7 (37-248)||(48236829-48237040)
chr7 (9-234)||(28622299-28622522)
chr7 (14-248)||(39284490-39284725)
chr7 (37-248)||(33605705-33605917)
chr7 (14-197)||(19237022-19237204)
chr7 (9-248)||(331637-331877)
chr7 (9-259)||(13018421-13018671)
chr7 (14-234)||(35952630-35952849)
chr7 (14-146)||(14193111-14193243)
chr7 (9-121)||(16309961-16310073)
chr7 (9-199)||(16111860-16112050)
chr7 (43-219)||(16542978-16543152)
chr7 (43-219)||(16622510-16622684)
chr7 (9-240)||(41842209-41842439)
chr7 (32-197)||(13880603-13880768)
chr7 (20-158)||(12174357-12174496)
chr7 (37-234)||(2265462-2265657)
chr7 (20-216)||(13893958-13894153)
chr7 (9-147)||(4821466-4821603)
chr7 (37-138)||(9098283-9098384)
chr7 (34-201)||(13032046-13032213)
chr7 (62-231)||(15704445-15704612)
chr7 (149-229)||(4494638-4494718)
chr7 (14-129)||(19711059-19711174)
chr7 (9-234)||(8182922-8183144)
chr7 (90-199)||(13472555-13472665)
chr7 (10-233)||(14425440-14425651)
chr7 (62-147)||(16556666-16556751)
chr7 (62-147)||(16608911-16608996)
chr7 (9-104)||(48062891-48062986)
chr7 (14-104)||(1293027-1293117)
chr7 (184-274)||(14193241-14193333)
chr7 (37-101)||(19339324-19339388)
chr7 (9-101)||(27871710-27871803)
chr7 (166-219)||(7339832-7339883)
chr7 (37-77)||(24794813-24794853)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (14-274)||(476-738)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (9-263)||(49328-49584)
scaffold0084 (9-248)||(32481-32722)
scaffold0084 (13-130)||(339-456)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (14-274)||(18469-18731)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (14-274)||(25823-26085)
scaffold0083 (46-177)||(44651-44782)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (9-274)||(13602168-13602435)
chr6 (37-274)||(13435556-13435795)
chr6 (14-274)||(23284565-23284827)
chr6 (9-248)||(15302196-15302435)
chr6 (9-248)||(12715333-12715573)
chr6 (14-237)||(20112624-20112848)
chr6 (14-274)||(9717844-9718106)
chr6 (9-262)||(19623975-19624228)
chr6 (37-274)||(15531510-15531749)
chr6 (9-219)||(32544261-32544471)
chr6 (9-247)||(29918013-29918250)
chr6 (20-229)||(14100373-14100582)
chr6 (14-216)||(15987234-15987437)
chr6 (9-274)||(24116824-24117091)
chr6 (33-274)||(21625121-21625361)
chr6 (9-248)||(26972140-26972379)
chr6 (37-245)||(19688790-19688996)
chr6 (9-195)||(18378310-18378496)
chr6 (37-248)||(18435580-18435793)
chr6 (9-237)||(19086154-19086372)
chr6 (37-219)||(20730649-20730829)
chr6 (37-248)||(22802165-22802376)
chr6 (92-271)||(25597558-25597739)
chr6 (43-235)||(34451595-34451787)
chr6 (9-248)||(16265064-16265303)
chr6 (9-234)||(16336123-16336346)
chr6 (9-234)||(22076337-22076560)
chr6 (37-274)||(19470694-19470930)
chr6 (20-234)||(21618251-21618463)
chr6 (14-219)||(15954704-15954907)
chr6 (37-197)||(10640384-10640544)
chr6 (20-234)||(19832962-19833175)
chr6 (20-234)||(16877220-16877432)
chr6 (20-234)||(20487847-20488060)
chr6 (9-156)||(26943572-26943719)
chr6 (15-219)||(12348995-12349196)
chr6 (14-147)||(12423262-12423395)
chr6 (9-100)||(25594064-25594155)
chr6 (37-117)||(21235149-21235229)
chr6 (149-219)||(21235249-21235317)
chr6 (9-147)||(33351943-33352079)
chr6 (37-90)||(17381545-17381598)
chr6 (37-101)||(19066079-19066143)
chr6 (34-78)||(17316609-17316653)
chr6 (34-78)||(19482773-19482817)
chr6 (33-109)||(25930493-25930568)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (9-274)||(5540-5805)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (9-274)||(12205-12472)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (14-274)||(19322-19582)
scaffold0035 (9-237)||(99097-99320)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (9-274)||(212350-212616)
scaffold0005 (72-247)||(6073-6250)
scaffold0005 (178-234)||(246139-246193)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (14-234)||(9997-10218)
scaffold0161 (14-80)||(14816-14882)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (37-248)||(1684-1895)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (27-274)||(4795-5044)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (18-248)||(15122-15352)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (9-274)||(36623-36890)
scaffold0120 (9-274)||(42115-42382)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (9-274)||(20819-21086)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (9-248)||(9965-10204)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (9-248)||(27305-27544)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (9-248)||(22672-22913)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (37-262)||(103596-103821)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (78-272)||(638-832)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (18-248)||(7708-7940)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (43-274)||(9825-10056)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (9-237)||(19027-19255)
scaffold0217 (14-234)||(9561-9778)
scaffold0217 (9-234)||(22023-22246)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (9-229)||(15789-16011)
scaffold0193 (238-274)||(16005-16041)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (9-181)||(13567-13739)
scaffold0426 (205-248)||(13818-13861)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (9-248)||(89931-90170)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (72-247)||(30283-30460)
scaffold0047 (9-262)||(9899-10151)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (14-248)||(533-765)
scaffold1359 (10-233)||(1658-1869)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (9-248)||(6003-6241)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (15-233)||(9958-10176)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-234)||(215389-215601)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (37-234)||(6632-6827)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (14-234)||(60804-61022)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (54-248)||(143129-143325)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (37-219)||(1606-1786)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (76-248)||(39488-39662)
scaffold0022 (76-248)||(137548-137722)
scaffold0022 (9-201)||(159051-159242)
scaffold0022 (37-74)||(37426-37463)
scaffold0022 (37-74)||(135486-135523)
scaffold0022 (230-274)||(159288-159332)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (37-234)||(78258-78453)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (33-234)||(9175-9373)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (37-218)||(5510-5689)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (33-274)||(36035-36275)
scaffold0056 (9-101)||(34827-34919)
scaffold0056 (14-101)||(25688-25775)
scaffold0056 (178-274)||(25523-25620)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (129-270)||(4845-4988)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (37-216)||(40661-40839)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (37-234)||(3328-3523)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (33-154)||(1491-1612)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (192-274)||(9256-9338)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (20-216)||(43828-44023)
scaffold0064 (224-274)||(43753-43803)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (33-92)||(2027-2086)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (20-234)||(7048-7260)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (20-147)||(5634-5760)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (129-248)||(5813-5935)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (9-114)||(74577-74682)
scaffold0025 (164-270)||(74718-74824)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (44-234)||(7963-8150)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (20-106)||(1324-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (20-106)||(1-87)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (14-130)||(164940-165056)
scaffold0011 (67-234)||(65321-65485)
scaffold0011 (67-234)||(144366-144530)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (9-130)||(25393-25514)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (9-153)||(2702-2845)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (14-129)||(15617-15732)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (20-129)||(38080-38189)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (37-118)||(1803-1884)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (9-104)||(17785-17880)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (194-264)||(13391-13462)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (37-80)||(7405-7448)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (194-262)||(60729-60799)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (37-80)||(3939-3982)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (37-95)||(850-908)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (9-77)||(2738-2806)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256171
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33256236 cctgttgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 33256171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276343
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33276408 cctggtgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 33276343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704464
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| ||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48704399 tctgatgaactttagcttctggtgatctagcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctga 48704464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717780
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||| |  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19717719 ccatatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctt 19717780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578115
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1578062 cctgataaactttagcttcttgtgatcttgcttctgacgagatgtttctgatga 1578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22600000
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  22600067 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctga 22600000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492248
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  28492289 cctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatga 28492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954300
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||    
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20954458 tcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20954359  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaact 265  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20954358 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaact 20954300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284657
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12284618 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154117
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 272  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  22154052 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttct 22154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757656
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  10757616 tcctgatgaacttcagcttttgatgatcttgcttctgatga 10757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282828
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  38282761 cctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctga 38282828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900581
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  1900540 cctgatgaactagatcttctggcgatctttagcttctgatga 1900581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32785998 - 32785798
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32785998 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttc 32785899  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  32785898 acttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaacttctagtg 32785800  T
Q  233 at 234  Q
    ||    
T  32785799 at 32785798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268789
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2268626 tcatttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtga-tcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2268723 cctaatgaactttagcttctagtgattgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 2268789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201601
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctg 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  22201621 cctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 35401832 - 35402069
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35401832 tagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 35401931  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatc 235  Q
    ||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   | ||||||||||||    
T  35401932 ttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgagac---agcttctggtgatc 35402028  T
Q  236 tt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35402029 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 35402069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 30893092 - 30893327
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  30893092 agacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcctt 30893191  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||  |||||||||  | |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30893192 tcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcctg 30893291  T
Q  213 atgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30893292 atgaactttagcttttggtgatcttgcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22427414 - 22427203
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22427414 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 22427315  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  22427314 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactggagcttctggtgattt 22427217  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  22427216 tcagcttctgatga 22427203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29216031
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 29215989  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  29215990 cctgatgaattgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 29216031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134391
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc-ttcaaa 36134283  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  209 cctgatga 216  Q
     |||||||    
T  36134384 tctgatga 36134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 2267112 - 2267321
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  2267112 tagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaactagttgttgcttcactt 2267211  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  2267212 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgtagcttctgatgaact 2267309  T
Q  237 tgcttctgatga 248  Q
    ||||||| ||||    
T  2267310 tgcttctaatga 2267321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39201066 - 39200869
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  39201066 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaac 39200967  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  39200966 tagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 39200869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22464866 - 22464670
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  22464866 tagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaattagtcgttgcttcactt 22464767  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  22464766 ttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatctcctgatgaactgtagcatctggtgat 22464670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16235353 - 16235142
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16235353 tagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 16235254  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatc 235  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||    
T  16235253 ttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatgagac---aacttctggtgatc 16235157  T
Q  236 tt--gcttctgatga 248  Q
    ||  |||||||||||    
T  16235156 ttcagcttctgatga 16235142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23036584 - 23036347
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  23036584 tagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactt 23036485  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatc 235  Q
    ||  ||||||| ||| |  ||| | ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   | ||||||||||||    
T  23036484 ttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgagac---agcttctggtgatc 23036388  T
Q  236 tt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23036387 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctga 23036347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 262
Target Start/End: Original strand, 7309842 - 7310068
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||    
T  7309842 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaa-gaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgaccgttgcttcactc 7309940  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||  ||||||| ||||| |||| | || | | |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  7309941 ttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatct 7310040  T
Q  237 t--gcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  7310041 tcagcttctgatgagatgtttctgatga 7310068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 2834714 - 2834908
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2834714 agtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcacttt 2834813  T
Q  138 tccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    | ||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  2834814 ttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcagcttctggtgat 2834908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26701986
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||| |||||||||||     
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || || | ||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  26702114 ttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatct 26702015  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26702014 tctgatgaactttagcttctggtgatctt 26701986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448443
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25448551 tcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 25448454  T
Q  209 cctgatgaact 219  Q
     ||||||||||    
T  25448453 tctgatgaact 25448443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21029029
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||  ||| |    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatat 21028987  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
     || ||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21028988 tctaatgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21029029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21191945 - 21191763
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21191945 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 21191846  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 197  Q
    |  || |||  |||||||||||||||  |||||| |||||| ||   || |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  21191845 ttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa 21191763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040351
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||| | ||| ||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  35040261 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaagt 35040351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17025021 - 17024811
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  17025021 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcactc 17024922  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||   |||||  |||||| |||   | |||||||||| || ||||  | |||||||||||| |||  || || ||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  17024921 ttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgt 17024823  T
Q  237 tgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||    
T  17024822 tgcttctgatga 17024811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 197  Q
    | ||||  || ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2327497 - 2327301
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2327497 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaaatagtttttgcttcact 2327398  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
     || ||||| || |||||  ||| | ||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  2327397 ttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 2327301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 30572203 - 30572414
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  30572203 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaa 30572302  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| || | | ||| || ||||| |  |||| |  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  30572303 tagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatctcctgatgaact 30572399  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      |||||||||||||    
T  30572400 gcaacttctggtgat 30572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821422
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||  || |||||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||  |||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44821530 tccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 44821433  T
Q  209 cctgatgaact 219  Q
    |||||||||||    
T  44821432 cctgatgaact 44821422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703031
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| |  |||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  21702909 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatct 21703005  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  21703006 cctgatgaactgcagcttctggtgat 21703031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570094
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  48570216 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 48570120  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||| |  | |||||||||||    
T  48570119 cctgatgaattacagcttctggtgat 48570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263387
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14263426  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgctta 158  Q
    ||||||||| ||  ||  |||||||||| ||||| ||||    
T  14263425 tagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatcctta 14263387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089198
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||            
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 46089075  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||  |||   ||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  46089076 -cctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 46089172  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    | |||||||||  | |||||||||||    
T  46089173 catgatgaactgcagcttctggtgat 46089198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7745147 - 7744952
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| | ||     
T  7745147 tagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaactgttgctactctt 7745048  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
     | |||||||  ||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||| |||||| || || |  |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  7745047 cttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 7744952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 10250986 - 10251194
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||| |||||||||            
T  10250986 agacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttc-------- 10251077  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
     |||| ||| ||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10251078 -caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 10251173  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  10251174 tgaactgcagcttctggtgat 10251194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18896654 - 18896537
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||   |    
T  18896654 tagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcttgc 18896555  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatg 154  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  18896554 ttctagtcttctgcaatg 18896537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 21984619 - 21984683
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21984619 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 42284651 - 42284715
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  42284651 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 19215607 - 19215699
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |  | ||| |||||||||||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctccttgaggaataagcatcaaatgc 19215699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21121121 - 21121057
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21121121 tagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21135217 - 21135153
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21135217 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21204980 - 21204937
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  21204980 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 12284651 - 12284689
Alignment:
Q  210 ctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12284651 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 23024783 - 23024852
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 78  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23024783 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 23024852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21191757 - 21191697
Alignment:
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  21191757 tgaacttcagcttcttgtgatattgtttctgatgagatgcttcagatgaacttgcttctga 21191697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 37642271 - 37642335
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  37642271 tagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 37642335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681201
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16681266 cctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 16681201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693790
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  39693723 cctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctga 39693790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 265
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083101
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    |||   ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatct 33083072  T
Q  237 tgcttctgatgagatgtttctgatgaact 265  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33083073 tgcttctgatgagttgcttcagatgaact 33083101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189237
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaa 16189071  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16189072 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16189171  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  16189172 cctaatgaacttcggcttctggtgatcttgcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctga 16189237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17525887 - 17525626
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17525887 agacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctt 17525788  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17525787 tcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcctg 17525688  T
Q  213 atgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17525687 atgaactacagtttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctga 17525626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914712
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 272  Q
    ||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17914647 cctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttct 17914712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156425
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19156384 cttgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 19156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207558
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 271  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  16207494 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgataaacttgcttc 16207558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602655
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  602683 cctgatgaactttagcttcttgtgatctt 602655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12757921 - 12757698
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12757921 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 12757822  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12757821 tcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcctga 12757722  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    ||||||  | || |||||||||||    
T  12757721 tgaactagagctactggtgatctt 12757698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693570
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29693503 cctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 29693570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17441965 - 17441716
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17441965 agacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcctt 17441867  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17441866 tcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctga 17441767  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17441766 tgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatga 17441716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646593
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24646526 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctga 24646593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18321317 - 18321067
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18321317 agacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcctt 18321218  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    | |||||||  ||||||||||||||   ||||   |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18321217 tgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 18321118  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  18321117 tgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatga 18321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 271
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943489
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943334 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19943433  T
Q  218 ctttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 271  Q
    ||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19943434 cttcagcttctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 19943489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20382552 - 20382296
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||||||    
T  20382552 agacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaatcctt 20382453  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||||| |  | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20382452 tcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctcctga 20382353  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20382352 tgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctt 20382296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 17267467 - 17267724
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17267467 agacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctt 17267566  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||  |||||||||||| | | |||||  |||||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17267567 tcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttga 17267665  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 272  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17267666 tgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttct 17267724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719228
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||| || |||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
     |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18719189 tctgaagaacttaagcttctggtgatcttgcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 18679802 - 18680042
Alignment:
Q  8 aagcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18679802 aagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaa 18679901  T
Q  108 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||||||| | |||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18679902 atcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatc 18680001  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    | |||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  18680002 ttctgatgaaatgaagcttctagtgatcttgcttctgatga 18680042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23263747 - 23263509
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23263747 tagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgtttcactc 23263648  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct-ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatc 235  Q
    ||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23263647 ttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatgatc 23263548  T
Q  236 ttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  23263547 ttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 23263509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18121236 - 18121018
Alignment:
Q  45 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18121236 gtacacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtc 18121137  T
Q  145 ttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttc 242  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||    
T  18121136 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttc 18121037  T
Q  243 tgatgagatgtttctgatg 261  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  18121036 tgatgagatgcttctgatg 18121018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23185361 - 23185150
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23185361 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 23185262  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  23185261 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattt 23185164  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  23185163 tcagcttctgatga 23185150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701997
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 271  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||    
T  17701933 tctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatgaacttgcttc 17701997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933112
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21933071 cctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatga 21933112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20255660 - 20255473
Alignment:
Q  77 tcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatt 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  20255660 tcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccatt 20255561  T
Q  177 taacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaact 265  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||   || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20255560 gaacagcctttgacgctttaagtcttgcat---ctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaact 20255473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30421587 - 30421352
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttc--aaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcc 111  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30421587 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 30421489  T
Q  112 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 211  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| ||    
T  30421488 attcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatcttct 30421391  T
Q  212 gatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  30421390 gatgaactgcagcttctggtgattttgagcttctgatga 30421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797649
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||| | |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  17797510 tcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 17797607  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||| ||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17797608 cctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 17797649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15336251 - 15336028
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15336251 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15336152  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||| | ||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15336151 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15336054  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  15336053 cctgatgaactacagcttctggtgat 15336028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15425316 - 15425093
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15425316 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15425217  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||| | ||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15425216 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15425119  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  15425118 cctgatgaactacagcttctggtgat 15425093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15516620 - 15516397
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15516620 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15516521  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||| | ||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15516520 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15516423  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  15516422 cctgatgaactacagcttctggtgat 15516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 19707499 - 19707758
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |    
T  19707499 agacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattcat 19707598  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |  || ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||     |||||| ||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  19707599 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttctga 19707697  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  19707698 tgatcttcagcttctggcgatcttgcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctga 19707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 274
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745742
Alignment:
Q  128 gcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttc 227  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
Q  228 tggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22745694 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 22745742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845329
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  40845450 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 40845354  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  40845353 cctgatgaactatagcttctggtga 40845329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 24551290 - 24551485
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  24551290 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 24551389  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||  | |||||||||||    
T  24551390 ttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgat 24551485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538379
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||     
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 45538405  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    | |||||||||  | |||||||||||    
T  45538404 catgatgaactgcagcttctggtgat 45538379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722602
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttc-cgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||   | |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18730947
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18731044  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttc-cgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||   | |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18731043 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18730947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685430
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18685450  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttc 139  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18685449 tagttgttgcttcactcttc 18685430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 1237653 - 1237815
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1237653 tagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 1237752  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 199  Q
    |||| |||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  1237753 ttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 1237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43645069
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 195  Q
    | | ||  || ||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  43644984 ttcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 22673790 - 22674032
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||      
T  22673790 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatccttccaaaatagatgttgctat 22673889  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||| ||| ||||||| |||||    | | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22673890 acttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctccggatgaactacaacttctggtg 22673987  T
Q  233 atctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||  |||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||    
T  22673988 atcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctga 22674032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 9320567 - 9320781
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttca-aagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9320567 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 9320666  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatcc-atttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  9320667 ataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaa 9320764  T
Q  218 ctttaacttctggtgat 234  Q
    ||  | |||||||||||    
T  9320765 ctgcagcttctggtgat 9320781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 36105211 - 36105406
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||     
T  36105211 tagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatactt 36105310  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||| ||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36105311 ttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgat 36105406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 22663128 - 22663330
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||| |||| || ||||||||| ||||||      
T  22663128 gagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatctttccaaaatagttgttgctat 22663227  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    | | ||||||||||| |||||  | | | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||    
T  22663228 atttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctaatgaactacaacttctagtg 22663325  T
Q  233 atctt 237  Q
    |||||    
T  22663326 atctt 22663330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19956476 - 19956374
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  19956476 tagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgcttcactc 19956377  T
Q  137 ttc 139  Q
    |||    
T  19956376 ttc 19956374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22461777 - 22461617
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  22461777 gagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgttgcttc 22461678  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatg--agattaaatccatttaacaacctttgaagctt 194  Q
    | ||||| ||||||| ||||||   | |||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22461677 attcttctagtcttctgcaatg---atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagctt 22461617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24833204 - 24832996
Alignment:
Q  25 gagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 123  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||     
T  24833204 gagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagc 24833105  T
Q  124 cgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttta 222  Q
    | |||||||||| || |||||||| ||||| |||| | ||| || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||  |    
T  24833104 cattgcttcact-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 24833008  T
Q  223 acttctggtgat 234  Q
     |||||||||||    
T  24833007 gcttctggtgat 24832996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164134
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag 85  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407927
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||       
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 6407810  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
          |||||||| |||||    ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6407811 ------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6407901  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  6407902 cctgatgaactgcagcttctggtgat 6407927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45568036 - 45567943
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45568036 tagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgct 45567943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989518
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 105  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 14989518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151713
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 105  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3598340 - 3598286
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3598340 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 3598286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13430763 - 13430699
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  13430763 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Original strand, 21540985 - 21541041
Alignment:
Q  62 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21540985 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttctattcctttcaaa 21541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33560359 - 33560295
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  33560359 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 33560295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14909
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14844 cctaatgatttttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctga 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815225
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  17815160 cttgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactga 17815225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910787
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21910748 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 21910787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412880
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23412919 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 23412880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512337
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcc---aatgccttcaaa 6512477  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6512376 cctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 6512337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745575
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 272  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  7745638 cctgatgtacttcagcttcttgtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttct 7745575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072131
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||   | | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatct 21072187  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21072186 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 21072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89328
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  89367 cctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 89328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566338
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  41566379 cctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 41566338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536180
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcact-cttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||   |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  19536246 tcctgatgaacttctgcttcttgcgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctga 19536180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551107
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctg 229  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  20551086 tcctgatgaacttcagcttctg 20551107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 33022684 - 33022895
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  33022684 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 33022783  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  33022784 ttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcaaattctggtgattt 33022881  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  33022882 tcagcttctgatga 33022895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 26784353 - 26784587
Alignment:
Q  16 acacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttc 115  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | | | |||||||||||    
T  26784353 acacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttc 26784452  T
Q  116 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26784453 aaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctg 26784552  T
Q  216 aactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  26784553 aactacagcttctggtgatcttcagcttctgatga 26784587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13545627 - 13545455
Alignment:
Q  39 gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctt 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||       
T  13545627 gtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagttgttgcttcact--- 13545531  T
Q  139 ccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
         |||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13545530 -----cttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 31117897 - 31118102
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  31117897 tagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaattagtcgttgcttcactt 31117996  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatc 235  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | |||||| ||| |    
T  31117997 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgaac 31118094  T
Q  236 ttgcttct 243  Q
    ||||||||    
T  31118095 ttgcttct 31118102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881325
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    | | ||  || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatc 23881256  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  23881257 ttctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctga 23881325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 642828 - 642586
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |   ||  || ||| ||||| |||    
T  642828 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagccgttgtttc 642729  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||||| |   ||||| | ||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  642728 actctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaatttctggtg 642630  T
Q  233 atctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||  || ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  642629 atcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499471
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||     
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    | | ||  ||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||| | |   || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  6499331 ttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct--catc 6499427  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgag 249  Q
    | |  |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6499428 ttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgag 6499471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 30742983 - 30743189
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30742983 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 30743082  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    || |||||||||  |  ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30743083 taatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 30743180  T
Q  220 ttaacttct 228  Q
      |||||||    
T  30743181 gcaacttct 30743189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 42243683 - 42243896
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42243683 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaa 42243782  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42243783 atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 42243880  T
Q  219 tttaacttctggtgat 234  Q
    |  | |||||||||||    
T  42243881 tacagcttctggtgat 42243896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887237
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaa-atgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaat-cttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcata 4887210  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    || |||||||||  | |||||||||||    
T  4887211 tcttgatgaactgcagcttctggtgat 4887237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 11993908 - 11994103
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||     
T  11993908 tagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaatcccttcaaattagccgttgcttcacta 11994007  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  11994008 ttccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 11994103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099583
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||    |||||  | |||||| |     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgct-aggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatct 21099651  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  21099650 tctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctga 21099583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198910
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || ||| |||||| ||| | |||  |||||| ||| | | ||   | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 21198951  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgag 249  Q
     ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  21198950 tctgatgaacttcagctcctggtgatattgcttctgatgag 21198910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 15516972 - 15517184
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15516972 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 15517071  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15517072 tagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaact 15517169  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      |||||||||||||    
T  15517170 acaacttctggtgat 15517184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398649
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||     
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaac 9398780  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || ||||||||||| ||||| ||| |         || |||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  9398779 ttcatttgaattagtcgttgctccactc-tcctg---------at-cttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatct 9398691  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9398690 tctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatga 9398649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138330
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||  || ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  29138451 tccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 29138356  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  29138355 cctgatgaactacaacttctggtgat 29138330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3245581 - 3245364
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  3245581 agacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattctt 3245482  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| |  ||||   || |||||||||||  |||||||||||||    
T  3245481 tcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcctga 3245385  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  3245384 tgaactgcagcttctggtgat 3245364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25096960 - 25096777
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttca 116  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||      
T  25096960 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25096861  T
Q  117 aaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||   |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25096860 aattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25154930 - 25154747
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttca 116  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||      
T  25154930 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25154831  T
Q  117 aaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||   |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25154830 aattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 26759169 - 26759364
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| | ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||     
T  26759169 tagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgttatactt 26759268  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| |||||  |||   ||  || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26759269 ttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 26759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352845
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctt 12352845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086474
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaa 107  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  108 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcat 206  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  14086584 atcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 14086487  T
Q  207 ctcctgatgaact 219  Q
    |  ||||||||||    
T  14086486 cctctgatgaact 14086474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933486
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaa 107  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||   || |||||||||| ||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  108 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaac--ctttgaagctttaagtcttgc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| | ||| || ||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||    
T  33933359 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaag--ttgc 33933456  T
Q  205 atctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||  ||||||||||  ||||| |||||||    
T  33933457 atcctctgatgaactgcaacttatggtgat 33933486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115863
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30115882 tcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 26765519 - 26765634
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |    
T  26765519 agtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagttgttgctatacttt 26765618  T
Q  138 tccagtcttccgcaat 153  Q
    |||||||||| |||||    
T  26765619 tccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139737
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||   ||||| ||||||| |||| |||  ||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaa 28139698  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  28139699 tcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttc 28139737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 28464479 - 28464389
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  28464479 agacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 28464389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089057
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 105  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||    
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc 9089057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930205
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 105  Q
    |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  || || ||||||| |||||||||    
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc 25930205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 32160763 - 32160867
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  32160763 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 32160862  T
Q  114 tcaaa 118  Q
    |||||    
T  32160863 tcaaa 32160867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 10848765 - 10848860
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  10848765 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgcctt 10848860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208011
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    |||||| ||||| ||||||||  |    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtaca-tagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctct 11208027  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgc 129  Q
    ||||||||||||||||    
T  11208026 tcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 109
Target Start/End: Original strand, 16607528 - 16607603
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  16607528 gagatagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcttccaatgccttcaaat 16607603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 35932123 - 35932059
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  35932123 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 234
Target Start/End: Original strand, 5429991 - 5430099
Alignment:
Q  125 gttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatcc-atttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaa 223  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| || ||||| ||  |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |     
T  5429991 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 5430088  T
Q  224 cttctggtgat 234  Q
    |||||||||||    
T  5430089 cttctggtgat 5430099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30115852 - 30115798
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  30115852 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 30115798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829363
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25829324 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 25829363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667246
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  |||||||| |  ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  30667179 cctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctga 30667246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187945
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22188012 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 22187945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235264
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | |||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23235197 catgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 23235264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20568853 - 20568596
Alignment:
Q  16 acacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttc 115  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20568853 acacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttc 20568754  T
Q  116 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 215  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20568753 aaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatg 20568654  T
Q  216 aactttaacttctggtgatcttg--cttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 271  Q
    ||||  | |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  20568653 aactacagcttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttc 20568596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576291
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||| |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgaga-ttaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24576225 tcctaatgaactttagcttctggtgatcttgcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctga 24576291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540659
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19540606 catgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 19540659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537091
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537258 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21537159  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||    
T  21537158 cctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctga 21537091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037102
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25037169 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 25037102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041209
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25041276 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 25041209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015214
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9015380 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 9015281  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9015280 cctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctga 9015214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963860
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
     ||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13963888 actgatgaactagagcttctagtgatctt 13963860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009594
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttc-cagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10009660 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctttcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 10009594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 30621211 - 30621447
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30621211 agacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctt 30621310  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30621311 tcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctga 30621410  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    || |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  30621411 tgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30621447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 30623832 - 30624068
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30623832 agacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctt 30623931  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30623932 tcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctga 30624031  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    || |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  30624032 tgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30624068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376775
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 18376817  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatga 248  Q
     |  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18376816 tcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatga 18376775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 274
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260661
Alignment:
Q  45 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  145 ttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctg 244  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttccttctg 22260631  T
Q  245 atgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22260632 atgagatgcttttgatgaacttgcttctga 22260661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850508
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24850676 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24850577  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  24850576 tcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377332
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24377289  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24377290 tcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 24377332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782726
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| ||     |||  |||| ||||||||||||||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatct 40782660  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  40782661 cctgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctga 40782726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 38781417 - 38781654
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  38781417 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactt 38781516  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatc 235  Q
    |||||||||||  || || ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||   | ||||||||||||    
T  38781517 ttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatgagac---atcttctggtgatc 38781613  T
Q  236 tt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38781614 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 38781654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151905
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||     
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattt 20151919  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  20151918 tcagcttctgatga 20151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 22317594 - 22317809
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22317594 aaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaa 22317693  T
Q  120 -tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22317694 atagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaa 22317793  T
Q  219 tttaacttctggtgat 234  Q
    |  | |||||||||||    
T  22317794 tagagcttctggtgat 22317809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6573993
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgc-ttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  6574123 ctagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaa 6574026  T
Q  218 ctttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  6574025 ctgcaacttctagtgattttcagcttctgatga 6573993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595427
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct--tcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  || |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatct 23595481  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
     ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23595480 tctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23595427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037511
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || ||| |||||||||||| | | | ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatct 39037553  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  39037552 tctgatcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatga 39037511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140509
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||      ||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctg 229  Q
    || ||||||||| | ||||||    
T  28140529 cccgatgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||   ||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609216
Alignment:
Q  97 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag-tcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | ||||  | |||||||  | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  196 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctg 7609216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121577
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||   | |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||  || ||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagct 41121631  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  41121630 tctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaggtgcatctgatga 41121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454833
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    | | ||  || ||   |||||||||||||||  |||||| |||||| ||    | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatc 22454902  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | |||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  22454901 ttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctga 22454833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 25189393 - 25189629
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | |    
T  25189393 agacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttcat 25189492  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |  || ||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  25189493 ttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaa 25189591  T
Q  214 tgaac-tttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | ||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  25189592 taaacttttagcttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087069
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 45087167  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  45087166 ttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtgat 45087069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800853
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaat 153  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  31800897 tcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaat 31800853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711618
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 199  Q
    | | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||| |  || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 28711618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 265
Target Start/End: Original strand, 22272146 - 22272378
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa-gcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||    
T  22272146 gagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcattgctt 22272245  T
Q  132 cactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggt 231  Q
    || ||||||||||||| |||||| | | | | |||||||||  || ||||||||||||| ||  || |||  || || ||||||| ||| | ||||||||    
T  22272246 cattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggt 22272344  T
Q  232 gatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaact 265  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22272345 gatgttgcttctgatgaggtgtttctgatgaact 22272378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 22802461 - 22802687
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22802461 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaaa 22802560  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| | |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22802561 tagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatctcctgatgaact 22802658  T
Q  220 ttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
      |  ||||| | | ||||||||||||||    
T  22802659 gcaggttctgataaacttgcttctgatga 22802687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26619066
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||  |||    
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaa 26619101  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatg 154  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26619100 tagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg 26619066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074439
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||  ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  33074316 tctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 33074413  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||    
T  33074414 cctgatgaactacaacttctagtgat 33074439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 6392634 - 6392848
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6392634 aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 6392733  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatc-catttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || |||| |||| |||| | |||||||| |||||   ||||||  ||||||||    
T  6392734 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag--atgcatcctctgatgaa 6392831  T
Q  218 ctttaacttctggtgat 234  Q
    ||  ||||| |||||||    
T  6392832 ctgcaacttatggtgat 6392848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184170
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaac-agaatccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || |||||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgc-atgc-taggtgtgatt-aatcctttgaacaacctttgaagc-ttaattctt-catct 23184224  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
     ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23184223 tctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23184170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28701308 - 28701116
Alignment:
Q  40 tggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttc 139  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||    
T  28701308 tggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatatctgttgctttacttttc 28701209  T
Q  140 cagtcttccgcaatgcttaa-atgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||| || |||| ||| |||| | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||  | |||||||||||    
T  28701208 cagtcttctgcaat-cttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgat 28701116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34322021 - 34321840
Alignment:
Q  34 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  34322021 agatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctata 34321922  T
Q  134 ctcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    || |||||| |||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  34321921 cttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaa 34321840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30557403 - 30557190
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30557403 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagtcgatgcttcact 30557304  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
     || ||||| || ||||| |||| | ||| || ||| ||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||  | |||||||||||    
T  30557303 ttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgat 30557206  T
Q  235 ctt--gcttctgatga 248  Q
     ||  |||||||||||    
T  30557205 atttagcttctgatga 30557190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31328065 - 31327852
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||    
T  31328065 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaa 31327966  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||  |||   ||| || ||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  31327965 tagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaac 31327868  T
Q  219 tttaacttctggtgat 234  Q
    |  | |||||||||||    
T  31327867 tgcagcttctggtgat 31327852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31334786 - 31334573
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||    
T  31334786 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaa 31334687  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||  |||   ||| || ||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  31334686 tagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaac 31334589  T
Q  219 tttaacttctggtgat 234  Q
    |  | |||||||||||    
T  31334588 tgcagcttctggtgat 31334573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743989
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||  ||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgct 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35744010 tccttccaaaatagtcgttgct 35743989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 262
Target Start/End: Original strand, 44881181 - 44881409
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||  || || |||| |||||||||||| || ||  || |||  | ||||||    
T  44881181 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagctgctgcttc 44881280  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    | ||||||||||||| ||||||  || | | |||||| ||  || |||| |||||||||||| || | |  || || ||||||| ||| | ||| |||||    
T  44881281 attcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagcttttggtg 44881379  T
Q  233 atcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||    
T  44881380 atgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 44881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 216
Target Start/End: Original strand, 19115097 - 19115279
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| | ||||| | || ||||| |||| |   || |||| ||||||||    
T  19115097 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagttgttgcttc 19115196  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    | ||||||||||||| |||||   ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||| || || |||||||    
T  19115197 attcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 19115279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776303
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781681
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550933
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 28550933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332172
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840519
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 44840519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1587132 - 1586929
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| ||||         ||||||||||    
T  1587132 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatg---------cctttcaaaa 1587042  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| |||||    ||| || |||||||| |||||  | | ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1587041 tagccgttgtaatactttttcagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttccatctcctgatgaact 1586944  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      | |||||||||||    
T  1586943 ccagcttctggtgat 1586929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 104
Target Start/End: Original strand, 14581529 - 14581600
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  14581529 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 105
Target Start/End: Original strand, 3277044 - 3277116
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  3277044 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 3277116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 18702752 - 18702955
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||    
T  18702752 gagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagccgttacttc 18702851  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    |  |||| ||||||| | ||||  || | | ||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||| || || ||||||| ||| |||| ||| ||    
T  18702852 atgcttctagtcttctgtaatg-atagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatg 18702950  T
Q  233 atctt 237  Q
    |||||    
T  18702951 atctt 18702955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31968061
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 31968061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18431020 - 18430844
Alignment:
Q  39 gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||| | | ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||  |||    
T  18431020 gtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcatgctt 18430921  T
Q  139 ccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    | ||||||| ||||||  ||   | ||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  18430920 ctagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatga 18430844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22785741 - 22785670
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  22785741 gagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Original strand, 1084047 - 1084105
Alignment:
Q  60 ttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1084047 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatctaatgccttcaattcctttcaaa 1084105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22776239 - 22776171
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22776239 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22776171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22781617 - 22781549
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22781617 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22781549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392707
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctt 23392707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22785599 - 22785552
Alignment:
Q  185 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22785599 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgat 22785552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 22258191 - 22258231
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 49  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22258191 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377407
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  377574 tcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatct 377475  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  377474 cctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 377407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Original strand, 220242 - 220500
Alignment:
Q  17 cacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttca 116  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||      
T  220242 cacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatg-cttcaaattcatttg 220340  T
Q  117 aaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    || ||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  220341 aattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatga 220440  T
Q  217 actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  220441 acttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 220500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211631
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  211494 tccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 211591  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||| ||  | |||||| | | ||||||||||||||    
T  211592 cctgatgagctacagcttctgataaacttgcttctgatga 211631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 244390 - 244256
Alignment:
Q  18 acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaa 117  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  244390 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 244291  T
Q  118 aatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaa 152  Q
    | |||| |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  244290 attagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1951
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 1885  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1886 cctaatgatttttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctga 1951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632695
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  16632630 cctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctga 16632695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37435628 - 37435391
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37435628 tagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 37435529  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37435528 ttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatct 37435429  T
Q  237 tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37435428 tgcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 37435391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601345
Alignment:
Q  17 cacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttca 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  117 aaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatga 12601298  T
Q  217 actttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaa 263  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12601299 gctttaacttctagtgatcttgcttctgatgagatgcttcttatgaa 12601345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680410
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29680565 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatct 29680466  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||| | ||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  29680465 cctggtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 29680410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14605028 - 14604762
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14605028 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14604929  T
Q  109 tcctttcaaaa-tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  14604928 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 14604829  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14604828 tcctgatgaagtttagcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 14604762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 45833395 - 45833651
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  45833395 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaa 45833494  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45833495 tagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 45833594  T
Q  220 ttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
      | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  45833595 agagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctga 45833651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37985534  T
Q  209 cctgatgaa 217  Q
    | |||||||    
T  37985533 catgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811036
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    ||| |||||||  | |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12811099 cctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatgaacttgctt 12811036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  209 cctgat 214  Q
    ||||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395808
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| | || ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  3395780 cctgatgaactatagcttctagtgatctt 3395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 19884716 - 19884916
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19884716 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttc 19884815  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  19884816 acttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtg 19884914  T
Q  233 at 234  Q
    ||    
T  19884915 at 19884916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380519
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||     ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 55380478  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  55380479 tcctaatgaacttcagcttctgatgatcttgcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 56034569 - 56034803
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||    
T  56034569 agacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattatt 56034668  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56034669 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctga 56034768  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  56034769 tgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 56034803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620962
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctg 229  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  19620982 cctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483952
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatct 3483938  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  3483939 tcagcttctgatga 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904249
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| || || | | |||||||||||| |||||||||||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14904277 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 14904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675433
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  22675530 tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 22675433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 219
Target Start/End: Original strand, 10072949 - 10073134
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  10072949 gagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaactagcagttgcttc 10073048  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073049 acttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 10073134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13576207 - 13575996
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13576207 tagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactc 13576108  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  13576107 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattt 13576010  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  13576009 tcagcttctgatga 13575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19911994 - 19911760
Alignment:
Q  17 cacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt-caaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttc 115  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19911994 cacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttc 19911895  T
Q  116 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19911894 aaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatg 19911795  T
Q  216 aactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19911794 aactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833626
Alignment:
Q  72 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  172 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg 247  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 14833626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641934
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||  || ||| ||||| ||||||||||   |||||  |||||| ||     |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatct 6641872  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
     |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  6641873 tctgatgaaattcagcttctggtgatattgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgctt 6641934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Original strand, 413021 - 413231
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  413021 agtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcacttt 413120  T
Q  138 tccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    || ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
T  413121 tcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttt 413218  T
Q  238 --gcttctgatga 248  Q
      |||||||||||    
T  413219 cagcttctgatga 413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846356
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||     
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    | | ||  || |||||||||||||||| | |  |||||| ||||||| ||   | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  40846189 ttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatc 40846287  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | ||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  40846288 ttctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctga 40846356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693064
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  10693039 cctgatgaactacagcttctggtgat 10693064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906830
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  10906805 cctgatgaactacagcttctggtgat 10906830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 17247263 - 17247499
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17247263 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcact-t 17247361  T
Q  138 tccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
T  17247362 tccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttt 17247459  T
Q  238 --gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
      |||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||    
T  17247460 cagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctga 17247499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 29121365 - 29121550
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29121365 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcctt 29121464  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  29121465 tcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680157
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 54680030  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |  ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54680031 tagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 54680126  T
Q  220 ttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
      | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  54680127 gcagcttctggtgattttcagcttctgatga 54680157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517698
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||  |||| ||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  6517575 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatct 6517672  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  6517673 cctgatgaactacaacttctggtgat 6517698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750755
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttca-aagaacaagcatcaaatgccttcaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  108 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcat 206  Q
     | | ||  ||  ||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| |   | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgct-aggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 23750707  T
Q  207 ctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatg 252  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  23750708 ctcctgatgaacttcagcttctggttatctttaacttctgatgagatg 23750755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 258
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123672
Alignment:
Q  116 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  216 aactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctg 258  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23123628 aacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttctg 23123672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Original strand, 15139283 - 15139482
Alignment:
Q  75 gctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatcca 174  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15139283 gctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 15139382  T
Q  175 tttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac-tttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 271  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||||| |||||    
T  15139383 ttgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatgaacttgcttc 15139482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 11915720 - 11915835
Alignment:
Q  39 gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctt 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11915720 gtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaatagtcgttgcttcactctt 11915819  T
Q  139 ccagtcttccgcaatg 154  Q
      ||||||| ||||||    
T  11915820 ttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 8105638 - 8105819
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8105638 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 8105737  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagt 199  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| | ||  || ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8105738 atagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagt 8105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105304
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||| | ||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3105440 tcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3105344  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  3105343 cctgatgaactgcagcttctgatgaacttgcttttgatga 3105304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Original strand, 16940030 - 16940150
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  16940030 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctat 16940129  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaat 153  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  16940130 acttttccagtcttctgcaat 16940150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 56533155 - 56533033
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  56533155 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcatt 56533056  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgctta 158  Q
     || |||||||| ||||| ||||    
T  56533055 ttttcagtcttctgcaatcctta 56533033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25651214 - 25651087
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25651214 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaaa 25651115  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25651114 tagccgttgcttcacttttcaagtcttc 25651087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398598
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||   ||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17398703 -cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 17398608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  109 tcctttcaaa 118  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 55731844 - 55731977
Alignment:
Q  83 aagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa 182  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||  |||||  ||| | ||| || |||||||| |||||    
T  55731844 aagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaa 55731942  T
Q  183 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  55731943 cttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaact 55731977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41114864 - 41114754
Alignment:
Q  36 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |||  || ||||||| ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| |    
T  41114864 atagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagccgttgcttcatt 41114765  T
Q  136 cttccagtctt 146  Q
    |||| ||||||    
T  41114764 cttctagtctt 41114754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 11901202 - 11901322
Alignment:
Q  34 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||    
T  11901202 agatagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatccaatgccttcaaaatcttttgaattagtcgttgcttca 11901301  T
Q  134 ctcttccagtcttccgcaatg 154  Q
       ||| ||||||| ||||||    
T  11901302 tgtttctagtcttctgcaatg 11901322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17788144 - 17788044
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctt 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||  |||||||| ||||||    
T  17788144 gagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaattcctttgaaatagtcattgctt 17788045  T
Q  132 c 132  Q
    |    
T  17788044 c 17788044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 271
Target Start/End: Original strand, 22089733 - 22089841
Alignment:
Q  164 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatg 261  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  22089733 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatgaggtacttctgatg 22089831  T
Q  262 aactagcttc 271  Q
     ||| |||||    
T  22089832 cacttgcttc 22089841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Original strand, 38513896 - 38513939
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38513896 tagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 38513939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540522
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| | ||||| | || ||||| |||| |   ||     
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaat 17540495  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtctt 146  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  17540496 tagttgttgcttcattctttcagtctt 17540522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3499745 - 3499704
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3499745 tagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctc 3499704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Original strand, 14571183 - 14571237
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14571183 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 14571237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 22190864 - 22190928
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  22190864 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaatcagcatccaatgc 22190928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 77  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8685540 - 8685509
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685540 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Original strand, 17540632 - 17540670
Alignment:
Q  224 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17540632 cttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 17540670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41114642 - 41114604
Alignment:
Q  224 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41114642 cttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 41114604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 20977447 - 20977516
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 78  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  20977447 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 20977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 40860685 - 40860749
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  40860685 tagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642659
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  49642726 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaccttgcttctga 49642659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 13948336 - 13948598
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13948336 agacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 13948435  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13948436 tcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctga 13948535  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  13948536 tgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctga 13948598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467567
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  37467528 cctgatgaactactgcttctggtgatcttgcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392903
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  14392968 cctaatgaacttcagcttctagtgatcttgcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctga 14392903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303648
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||  ||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31303581 cctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 31303648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646417
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  | ||||| |||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20646349 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 20646417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090994
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6090927 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctga 6090994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17239077 - 17238847
Alignment:
Q  18 acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaa 117  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  17239077 acaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaa 17238978  T
Q  118 aatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17238977 aatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgca 17238878  T
Q  218 ctttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17238877 cttcatcttctggtgatcttgcttctgatga 17238847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 15903198 - 15903461
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa-gcatcaaatgccttcaaatcct 112  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  15903198 agacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcct 15903297  T
Q  113 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15903298 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctg 15903397  T
Q  213 atgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    || || |  | ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15903398 ataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctga 15903461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12963010
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12963149 accttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatct 12963050  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12963049 cctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 12963010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 52920406 - 52920667
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52920406 agacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatactt 52920505  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52920506 t-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 52920604  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52920605 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 52920667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 41495001 - 41495179
Alignment:
Q  16 acacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttc 115  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41495001 acacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttc 41495100  T
Q  116 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41495101 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561408
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  2561383 cctgatgaactagagcttctggtgat 2561408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 28582106 - 28582326
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  28582106 agacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatcctt 28582205  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582206 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 28582305  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||| |  | |||||||||||    
T  28582306 tgaaatagagcttctggtgat 28582326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951335
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | |||    
T  29951502 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 29951403  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  29951402 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 29951335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000489
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | |||    
T  30000656 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 30000557  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  30000556 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 30000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38177779 - 38177566
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38177779 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 38177680  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||| ||||| ||| |||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||    
T  38177679 ttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagcttctgatgatct 38177580  T
Q  237 --tgcttctgatga 248  Q
      ||||||||||||    
T  38177579 tctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18121758 - 18121558
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18121758 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 18121659  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  18121658 ttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 18121559  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  18121558 t 18121558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49553625 - 49553400
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49553625 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcactgcttcactc 49553526  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    || || ||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  49553525 tttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggcttctggtgatct 49553426  T
Q  237 tgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||    
T  49553425 tacttctgatgagatgcttctaatga 49553400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 14969346 - 14969550
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  14969346 gagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttt 14969445  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||    
T  14969446 actcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttctggtg 14969545  T
Q  233 atctt 237  Q
    |||||    
T  14969546 atctt 14969550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18142888 - 18142677
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18142888 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 18142789  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||    
T  18142788 ttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctgatgaact 18142689  T
Q  237 tgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||    
T  18142688 tgcttctgatga 18142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780575
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 47207701 - 47207941
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  47207701 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 47207800  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgc-ttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  47207801 tcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatc 47207898  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47207899 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47207941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726155
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  12726194 cctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgtttctcatga 12726155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658541
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||  | |||||||  | |||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16658582 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824263
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcactc 13824191  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||  || || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13824192 ttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888869
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19889107 agcagagacacaaactgagg--tggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaaca-acctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  19889009 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatc 19888910  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19888909 tcttgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatga 19888869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47405557 - 47405346
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  47405557 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagttgttgcttcattt 47405458  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |    
T  47405457 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcgtgatgaactgcagcttctggtgattt 47405360  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  47405359 tcagcttctgatga 47405346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800108
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatct 40800066  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | |||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  40800067 cttgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 40800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032757
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||| ||| ||  ||     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 16032718  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
     |||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  16032719 tctgatg-acttcaacttcgggtgatattgcttatgatga 16032757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20627567 - 20627356
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  20627567 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttgttgcttcactt 20627468  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  20627467 ttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattt 20627370  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  20627369 tcagcttctgatga 20627356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46349979 - 46349785
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  46349979 agtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttt 46349880  T
Q  138 tccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||  ||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46349879 tccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaacttctggtgat 46349785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 11223569 - 11223766
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11223569 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 11223668  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || | |||||| || ||||| |||| | |||||||||  |||  ||| |||||||||||||||    
T  11223669 tagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatctcctgatgaact 11223766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804057
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttc 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22804087 tcctttcaaaatagccgttgcttcactcttc 22804057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 2785087 - 2785283
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2785087 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 2785186  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
     ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2785187 tttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 2785283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056747
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  53056791 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaat 53056747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955645
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaa 14955532  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  14955533 tagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaact 14955630  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      |||||||||||||    
T  14955631 gcaacttctggtgat 14955645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24775670 - 24775490
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24775670 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactt 24775571  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24775570 ttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 24775490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725346
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||  ||     
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | | ||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||  || ||  |||||| ||    
T  20725193 tagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatct 20725291  T
Q  220 ttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | | ||||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  20725292 tcagcttctggtgatgtttcttttgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctga 20725346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140996
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     || |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||| ||||   ||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22140859 acccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 22140956  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||    
T  22140957 cctgatgaactgtagcttctgatgaactagcttctgatga 22140996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398172
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||  ||  ||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||                  || || ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398319 tcctttcaaaatagtcgttgctt------------------cattgtttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25398238  T
Q  209 cctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
      |||||| ||   |||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25398237 tatgatgagac---aacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 25398172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 33583252 - 33583492
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33583252 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcact 33583351  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
     |||||||||||  |||| |||| |  || || ||| ||||  |||||| |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||    
T  33583352 tttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgat 33583449  T
Q  235 ctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
     ||  ||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||    
T  33583450 ttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33583492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12389031 - 12388845
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||    
T  12389031 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaattctt 12388932  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    |  || ||||||| |||||||| |||   ||||| ||||| | || |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12388931 ttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19249547 - 19249385
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||    
T  19249547 agtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttcactct 19249448  T
Q  138 tccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    ||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  19249447 tctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Original strand, 5213583 - 5213822
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| || ||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5213583 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgcttttgaat-aataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaa 5213681  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5213682 tagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 5213779  T
Q  220 ttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
      | |||||| | | ||||||| ||||||  || |||||||||    
T  5213780 acagcttctgataaacttgcttatgatgaactgcttctgatga 5213822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 248
Target Start/End: Original strand, 11869137 - 11869302
Alignment:
Q  83 aagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | | | |||| | |||||| ||| |||| |||||    
T  11869137 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaaacaa 11869236  T
Q  183 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
      |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  11869237 attttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 11869302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968506
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  ||     
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaat 12968411  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 215  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||  || ||| ||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||| || || ||||||    
T  12968412 tagtcgttacttcatgcttctagtcttctgcaatg-atagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagcttcaaatctttcagcttctgatg 12968506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 29855415 - 29855530
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  29855415 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaac 29855514  T
Q  120 tagtcgttgcttcact 135  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29855515 tagccgttgcttcact 29855530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23538306 - 23538185
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||    
T  23538306 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgttgtttc 23538207  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatg 154  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  23538206 attcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 21640886 - 21641084
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  || || ||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||      
T  21640886 gagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaaatagccgttgctat 21640985  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||   ||| || ||||| |  |||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21640986 acttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtg 21641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Original strand, 50300246 - 50300367
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || ||||  |||| ||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  50300246 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttcaaa-tagcagttgcttcact 50300344  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgctta 158  Q
     ||||||||||| ||||| ||||    
T  50300345 tttccagtcttctgcaatcctta 50300367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26417818 - 26417705
Alignment:
Q  34 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  26417818 agatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttca 26417719  T
Q  134 ctcttccagtcttc 147  Q
     ||||| |||||||    
T  26417718 ttcttctagtcttc 26417705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49666480 - 49666356
Alignment:
Q  107 aatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  49666480 aatcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcat 49666384  T
Q  207 ctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||    
T  49666383 ctcctgatgaactgcagcttctggtgat 49666356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868335
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctt 11868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46796507 - 46796333
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||         ||||||||| ||| |||||        
T  46796507 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatg---------cctttcaaattagccgttgtaat 46796417  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46796416 acttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 46796333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11909160 - 11909079
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11909160 tagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 45858875 - 45858804
Alignment:
Q  47 acacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45858875 acacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21636806 - 21636742
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21636806 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 40850991 - 40851055
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  40850991 tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40851055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Original strand, 51341051 - 51341107
Alignment:
Q  62 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51341051 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctttcaaa 51341107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054310
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30054310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 274
Target Start/End: Original strand, 41495182 - 41495236
Alignment:
Q  222 aacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41495182 aacttctggtgatcttcagtttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 41495236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12752741 - 12752683
Alignment:
Q  60 ttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12752741 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagtatccaatgccttcaattcctttcaaa 12752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21605658 - 21605604
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21605658 aacaacttttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 21605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60277
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  60212 tctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctga 60277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8161
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8022 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 8121  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8122 cctgatgaactttagcttctggttatcttgcttctgatga 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 270
Target Start/End: Original strand, 115708 - 115778
Alignment:
Q  200 cttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  115708 cttgcatctcctgatgaacatcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgataaacttgctt 115778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 151788 - 151738
Alignment:
Q  224 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  151788 cttctggtgatcttgcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 151738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 151831 - 151794
Alignment:
Q  164 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  151831 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316458
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16316523 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 16316458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883072
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10883239 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 10883140  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10883139 cctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctga 10883072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793162
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11793099 cctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgtttatgatgaacttgctt 11793162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21283534 - 21283274
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21283534 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcctt 21283435  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21283434 tcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctga 21283335  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21283334 tgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagattcttctgatgaacttgattctga 21283274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577924
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 272  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  22577987 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttct 22577924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935272
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| || ||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatct 29935326  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29935325 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatga 29935272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137833
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  13137861 ccttatgaactagagcttctggtgatctt 13137833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303030
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  13303002 cctaatgaactacagcttctggtgatctt 13303030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880363
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  | |||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13880296 cctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 13880363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 15088517 - 15088740
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15088517 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctt 15088616  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15088617 tcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctga 15088716  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||| |  | ||||||||||||||    
T  15088717 tgaattagagcttctggtgatctt 15088740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 28409036 - 28409297
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28409036 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 28409135  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  28409136 tcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttga 28409235  T
Q  214 tgaactttaacttctggtga-tcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28409236 tgaactttagcttctggtgactgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 28409297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467298
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44467256 tcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatga 44467298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695634
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21695593 cttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21695634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366649
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  12366814 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 12366715  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  12366714 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctga 12366649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913546
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||    
T  2913574 cctgatgaactacagtttctggtgatctt 2913546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 11319402 - 11319660
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11319402 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcctt 11319501  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11319502 tcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctcttga 11319601  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11319602 tgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctt 11319660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648960
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13648921 cctgatgagctttagcttctgttgatcttgcttctgatga 13648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 24788138 - 24788372
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24788138 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcctt 24788237  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24788238 tcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaa 24788337  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24788338 tgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692517
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||| |||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||    
T  21692479 cctaatgaacttcagcttctgatgat-atgcttctgatga 21692517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026138
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | |||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  30025997 tcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 30026096  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | |||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  30026097 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 30026138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691653
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  33691678 cctgatgaactagagcttctggtgat 33691653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500234
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  209 cctga 213  Q
    |||||    
T  2500230 cctga 2500234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13730836 - 13730628
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  13730836 agacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatcttt 13730737  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  13730736 tcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcctgg 13730637  T
Q  214 tgaacttta 222  Q
    ||| |||||    
T  13730636 tgagcttta 13730628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069822
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||  |||||||| |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||    
T  9069754 cctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctga 9069822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Original strand, 15467939 - 15468175
Alignment:
Q  40 tggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttc 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15467939 tggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgattcactcttc 15468038  T
Q  140 cagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt-- 237  Q
    |||||||| ||| ||| || | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||      
T  15468039 cagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtaatcttca 15468138  T
Q  238 gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    || ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  15468139 gcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctga 15468175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692599
Alignment:
Q  38 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| |||         |||||||||| |||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  138 tccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  238 gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13692563 gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctga 13692599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279900
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280013 tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 23279915  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      |||||||||||||    
T  23279914 acaacttctggtgat 23279900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30945494 - 30945285
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30945494 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactt 30945395  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||| |||||  |||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||    
T  30945394 ttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgaact 30945297  T
Q  237 tgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||    
T  30945296 tgcttctgatga 30945285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944253
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatg 247  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| | |||||||||||    
T  30944291 cctgatgaactgcagcttctgatgaacgtgcttctgatg 30944253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260524
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |    
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttcata 13260682  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
           | |||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13260681 -------agaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  13260589 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctga 13260524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9709940 - 9709729
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9709940 tagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactc 9709841  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  9709840 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattt 9709743  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  9709742 tcagcttctgatga 9709729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 14426544 - 14426776
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14426544 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 14426643  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14426644 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctga 14426741  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  14426742 tgaactgcaccttctgatgaacttgcttctgatga 14426776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5000983 - 5000788
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  5000983 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcctt 5000884  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcac-tcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||    |||||  |||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5000883 tcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48237040 - 48236829
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||      
T  48237040 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcgttgcttcacct 48236941  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    || |||||||  |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  48236940 tttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattt 48236843  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  48236842 tcagcttctgatga 48236829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28622522 - 28622299
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| ||||||||||||    
T  28622522 agcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaa 28622423  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28622422 tcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 28622325  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  28622324 cctgatgaactgcagcttctggtgat 28622299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39284725 - 39284490
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  39284725 agacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattcat 39284626  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |  || ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||  ||||| ||||    
T  39284625 ttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctga 39284527  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39284526 tgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39284490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 33605705 - 33605917
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  33605705 tagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcaatt 33605804  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatc 235  Q
    |||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| || || | || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | |||||||||||     
T  33605805 ttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatt 33605902  T
Q  236 tt--gcttctgatga 248  Q
    ||  |||||||||||    
T  33605903 ttcagcttctgatga 33605917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19237022
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331877
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |   || ||||||| |||||||||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagc-aataagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  109 tcctttcaaaa-tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  331835 tcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 331877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018421
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    | | || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |    | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  | ||    
T  13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct--cgtc 13018475  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctga 259  Q
    | |  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  13018474 ttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaggtgcttctga 13018421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35952849 - 35952630
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35952849 agacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 35952750  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| | ||| || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  |||    
T  35952749 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctg 35952652  T
Q  213 atgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  35952651 atgaactgcaacttctggtgat 35952630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 14193111 - 14193243
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14193111 agacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctt 14193210  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193211 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309961
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  109 tcctttcaaaata 121  Q
    |||||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111860
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 199  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||| |  ||| | ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16111950 ttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaagt 16111860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542978
Alignment:
Q  43 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 142  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  143 tcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||||| |||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaact 16542978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622684
Alignment:
Q  43 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 142  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  143 tcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||||| |||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaact 16622684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842209
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||| ||||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || |||||||||||||||||| |   ||||  ||| |||||| | ||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatct 41842241  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgct 240  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41842240 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgct 41842209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 13880603 - 13880768
Alignment:
Q  32 agagatagtggttgtac-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 130  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13880603 agaggtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgct 13880702  T
Q  131 tcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||   | |||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  13880703 tcactcttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12174496 - 12174357
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12174496 aaacagagtactaaaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 12174397  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  12174396 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcctta 12174357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2265657 - 2265462
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||     
T  2265657 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaatagccgttgctatactt 2265558  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    || |||||||| |||||  ||| | ||| || ||||  || |||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2265557 tttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 2265462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13894153 - 13893958
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||     
T  13894153 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaat 13894054  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13894053 tagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgatga 13893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821603
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  4821566 t-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttc 4821603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098283
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcactc 9098285  T
Q  137 tt 138  Q
    ||    
T  9098284 tt 9098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032046
Alignment:
Q  34 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||| | | ||  ||||||| |||||||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  134 ctcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtct 201  Q
    |||| |  |||||| ||||| | ||   | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct 13032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704445
Alignment:
Q  62 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaat 161  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| |     
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  162 gagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggt 231  Q
    ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--tttcatcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Original strand, 4494638 - 4494718
Alignment:
Q  149 gcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 229  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4494638 gcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19711174 - 19711059
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  19711174 agacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 19711075  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgc 129  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19711074 tcaaattagtcgttgc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183144
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||  ||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa 8183021  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || || |  ||  ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  8183022 tcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatct 8183118  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  8183119 cctgatgaactgcagcttctggtgat 8183144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13472665 - 13472555
Alignment:
Q  90 agcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttg 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  13472665 agcatcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttta 13472566  T
Q  189 aagctttaagt 199  Q
    |||||||||||    
T  13472565 aagctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 14425440 - 14425651
Alignment:
Q  10 gcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 109  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||             
T  14425440 gcaaagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg--------- 14425530  T
Q  110 cctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 209  Q
    | ||||||||||| ||||||   |||  |||||||||| |||||| |||   ||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14425531 catttcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctc 14425627  T
Q  210 ctgatgaactttaacttctggtga 233  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  14425628 ctgatgaactntagcttctggtga 14425651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556666
Alignment:
Q  62 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttc 16556666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 147
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608996
Alignment:
Q  62 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttc 16608996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062891
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 48062891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Original strand, 1293027 - 1293117
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  1293027 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 1293117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Original strand, 14193241 - 14193333
Alignment:
Q  184 ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  14193241 ctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctga 14193333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19339388 - 19339324
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  19339388 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871803
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcatccaatgc 27871803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7339883 - 7339832
Alignment:
Q  166 ttaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7339883 ttaaatccattaaacaatttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 7339832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24794853 - 24794813
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 77  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24794853 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 476 - 738
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  476 agacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 575  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  576 tcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctga 675  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  676 tgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctga 738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49584
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaa 263  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49528 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 49584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32722
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||  |||||||||||    
T  32681 cctgatgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatga 32722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 339
Alignment:
Q  13 aagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcct 112  Q
    |||||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  456 aagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcct 357  T
Q  113 ttcaaaatagtcgttgct 130  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  356 ttcaaattagccgttgct 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18731 - 18469
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18731 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatcctt 18632  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  18631 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcctga 18532  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18531 tgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 18469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26085 - 25823
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26085 agacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 25986  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25985 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctga 25886  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  25885 tgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgtttttcatgaacgtgcttctga 25823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44651
Alignment:
Q  46 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtct 145  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  146 tccgcaatgcttaaatgagattaaatccattt 177  Q
    ||  |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatccattt 44651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602435
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13602268 tcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13602367  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13602368 cctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 13602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 13435556 - 13435795
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435556 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 13435655  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13435656 ttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttatggtgatct 13435755  T
Q  237 --tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  13435756 tctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctga 13435795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 23284565 - 23284827
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23284565 agacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcctt 23284664  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284665 tcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctga 23284764  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||| | ||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  23284765 tgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctga 23284827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302435
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15302296 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatct 15302395  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15302396 cctaatgagctttagcttttggtgatcttgcttctgatga 15302435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715333
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12715473 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 12715374  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12715373 tcctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 12715333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20112848 - 20112624
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20112848 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctt 20112749  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20112748 tcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatctcttg 20112649  T
Q  213 atgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||||||| | |||| |||||||||    
T  20112648 atgaacttcagcttcaggtgatctt 20112624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 9717844 - 9718106
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9717844 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcctt 9717943  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717944 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 9718043  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||   ||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||    
T  9718044 tgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctga 9718106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624228
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactt-tgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  108 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19624074 atcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatc 19624173  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19624174 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgtttctgatgagatgcttctgatga 19624228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15531749 - 15531510
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  15531749 tagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataaccgttgttttactc 15531650  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15531649 ttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgatct 15531550  T
Q  237 --tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
      || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15531549 tatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 15531510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544471
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||| |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  209 cctgatgaact 219  Q
    |||||||||||    
T  32544461 cctgatgaact 32544471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 29918013 - 29918250
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  29918013 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaa 29918112  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918113 tcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 29918211  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatg 247  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  29918212 cctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctgatg 29918250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14100582 - 14100373
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14100582 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14100483  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100482 tagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaact 14100383  T
Q  220 ttaacttctg 229  Q
    | | ||||||    
T  14100382 tcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 15987234 - 15987437
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat-cct 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15987234 agacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccct 15987333  T
Q  113 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||    
T  15987334 tttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttctg 15987433  T
Q  213 atga 216  Q
    ||||    
T  15987434 atga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117091
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    |||||||||||||  || | |||||||| ||  |||||  |||||||||  | |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctga-tgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  24117024 ttctgatgaacttcatcttctggtgatcttgcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctga 24117091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 21625121 - 21625361
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  21625121 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccgttgcttt 21625219  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggt 231  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||    
T  21625220 actcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatgagac---aacttctggt 21625316  T
Q  232 gatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  21625317 gatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctga 21625361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972140
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatga 248  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26972181 cctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatga 26972140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688996
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||| |||  ||||||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagcttctgatgaact 19688987  T
Q  237 tgcttctga 245  Q
    |||||||||    
T  19688988 tgcttctga 19688996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378496
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 18435580 - 18435793
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18435580 tagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 18435679  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||| ||||||  | ||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  18435680 ttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatct 18435779  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  18435780 tcagcttctgatga 18435793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086372
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||            
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg-------- 19086245  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaa-caacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||    
T  19086246 --ctttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatc 19086342  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19086343 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt 19086372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20730829 - 20730649
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20730829 tagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 20730730  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  20730729 ttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctgatgaact 20730649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 22802165 - 22802376
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||     
T  22802165 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtcgttgtttcactt 22802264  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    |||||||| || |||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22802265 ttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattt 22802362  T
Q  237 t--gcttctgatga 248  Q
    |  |||||||||||    
T  22802363 tcagcttctgatga 22802376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 271
Target Start/End: Original strand, 25597558 - 25597739
Alignment:
Q  92 catcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaag 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25597558 catccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaag 25597657  T
Q  192 ctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25597658 ctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 25597739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451595
Alignment:
Q  43 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  143 tcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatc 235  Q
    ||||| |||||||||| | || | | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 34451595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265064
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
     ||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||    
T  16265203 acctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatct 16265106  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | ||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  16265105 cttgacgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 16265064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336346
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  16336223 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatct 16336320  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||    
T  16336321 cctgatgatctacaacttctggtgat 16336346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076337
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||  ||| | ||| |||||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||    
T  22076460 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatct 22076363  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||||||  | |||||||||||    
T  22076362 cctgatgaactacatcttctggtgat 22076337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 19470694 - 19470930
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  19470694 tagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcattc 19470793  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    |||  |||||  ||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||| |  |||  |||||  |||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  19470794 ttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaacttcttgtgatgt 19470892  T
Q  237 tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  19470893 tgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 19470930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618463
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 21618350  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  21618351 tagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaact 21618448  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      | |||||||||||    
T  21618449 acagcttctggtgat 21618463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 15954704 - 15954907
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15954704 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcctt 15954803  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  15954804 tcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttga 15954901  T
Q  214 tgaact 219  Q
    ||||||    
T  15954902 tgaact 15954907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10640544 - 10640384
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  10640544 tagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 10640445  T
Q  136 cttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 197  Q
    ||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10640444 cttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19833175 - 19832962
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19833175 aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 19833076  T
Q  119 atagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||| || ||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19833075 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 19832978  T
Q  219 tttaacttctggtgat 234  Q
    |  | |||||||||||    
T  19832977 tacatcttctggtgat 19832962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 16877220 - 16877432
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||  |||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  16877220 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaaga 16877319  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16877320 tagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 16877417  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      ||||| |||||||    
T  16877418 acaacttttggtgat 16877432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20488060 - 20487847
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20488060 aaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 20487961  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagatt-aaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||| | ||| || ||  ||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||  |||||||||    
T  20487960 tagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaac 20487863  T
Q  219 tttaacttctggtgat 234  Q
    |  ||||||| |||||    
T  20487862 tgcaacttctagtgat 20487847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 26943572 - 26943719
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26943572 agcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaa 26943671  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgct 156  Q
    |||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26943672 tcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgct 26943719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349196
Alignment:
Q  15 gacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatccttt 114  Q
    |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatccttt 12349094  T
Q  115 caaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgat 214  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12349095 caaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgat 12349191  T
Q  215 gaact 219  Q
    |||||    
T  12349192 gaact 12349196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 12423262 - 12423395
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  12423262 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcctt 12423361  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12423362 tcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttc 12423395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 100  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 117
Target Start/End: Original strand, 21235149 - 21235229
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaa 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21235149 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa 21235229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 219
Target Start/End: Original strand, 21235249 - 21235317
Alignment:
Q  149 gcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21235249 gcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaact 21235317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33351943
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||  ||  ||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatccaatgtttttcaa 33351981  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||    
T  33351980 tcctttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttc 33351943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Original strand, 17381545 - 17381598
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 90  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17381545 tagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaa 17381598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19066143 - 19066079
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  19066143 tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17316653 - 17316609
Alignment:
Q  34 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17316653 agatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 17316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 19482773 - 19482817
Alignment:
Q  34 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  19482773 agatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 19482817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 109
Target Start/End: Original strand, 25930493 - 25930568
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25930493 gagatagtggttgtacaatt-gtactattatccttttccaacgctcttcaaggaataagcatccaatgacttcaaat 25930568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5540
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||  |||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5605 cctgatgaacttcagcttcaggtgatcttgcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctga 5540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12472
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  12305 ttctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtct 12404  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12405 cctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 12472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19322
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19582 agacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcctt 19483  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||   || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19482 tcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctca 19383  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19382 tgaactacaacttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 19322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99097
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  || |||  ||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtca--gcgctttgaagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| || ||||   ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |    
T  99222 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcactt 99126  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  99125 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 99097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 212350 - 212616
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  212350 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 212449  T
Q  109 tcctttcaaaa-tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 207  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  212450 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 212549  T
Q  208 tcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  212550 tcctgatgaagtttagcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 212616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6073
Alignment:
Q  72 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  172 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg 247  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 6073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 246193 - 246139
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  246193 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 246139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10218 - 9997
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10218 agacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 10119  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10118 tcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctg 10019  T
Q  213 atgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  10018 atgaacttcagcttctggtgat 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14882 - 14816
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882 agacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 1684 - 1895
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1684 tagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactc 1783  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1784 ttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatct 1883  T
Q  237 tgcttctgatga 248  Q
    ||||||||||||    
T  1884 tgcttctgatga 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5044 - 4795
Alignment:
Q  27 gtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 126  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5044 gtaatggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 4945  T
Q  127 tgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaactt 226  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||    
T  4944 cgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagctt 4845  T
Q  227 ctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4844 ctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Original strand, 15122 - 15352
Alignment:
Q  18 acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaa 117  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15122 acaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaa 15221  T
Q  118 aatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15222 aatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgca 15321  T
Q  218 ctttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15322 cttcatcttctggtgatcttgcttctgatga 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36623
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | |||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  36690 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctga 36623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42382
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | |||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  42315 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctga 42382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20819
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  20886 cttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctga 20819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10204
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10165 cctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgcttctgatga 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27305
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  27344 cctgatgaacttcagcatctggtgatcttgcttctgatga 27305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22913
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  22872 cctgatgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatga 22913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 262
Target Start/End: Original strand, 103596 - 103821
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  103596 tagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccgttgcttcactc 103695  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct 236  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||    
T  103696 ttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgtcct 103795  T
Q  237 tgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    
T  103796 tgcttctgatgagatacttctgatga 103821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 638
Alignment:
Q  78 cttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccattt 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||     
T  832 cttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattg 733  T
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 272  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  732 aacagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttct 638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7940
Alignment:
Q  18 acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaa 117  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||| |||||||| |||    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  118 aatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7808 aatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 7907  T
Q  218 ctttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
     |  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7908 atagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 274
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10056
Alignment:
Q  43 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  143 tcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttc 242  Q
    |||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatcttgctta 10024  T
Q  243 tgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  10025 tgatgagatgcttctgattaacttgcttctga 10056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19255
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt 237  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  19227 cctgatgaaatagagcttctggtgatctt 19255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 9561 - 9778
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   |||| ||||||| |||||| |  |||||||    
T  9561 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctt 9660  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||| |||| |  || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9661 tcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 9757  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  9758 tgaactgcagcttctggtgat 9778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22023
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||  || ||||||||||||  |||  |||||||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  22146 tccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatct 22049  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
     || |||||||  |||||||||||||    
T  22048 tctaatgaactacaacttctggtgat 22023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16011
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  108 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa-cctttgaagctttaagtcttgcat 206  Q
     ||||||||||||| | | |||||||||| ||  |||||  ||||| |||  | |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  207 ctcctgatgaactttaacttctg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  15989 ctcctgatgaactttagcttctg 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Original strand, 16005 - 16041
Alignment:
Q  238 gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16005 gcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctga 16041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13739
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaaca 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Original strand, 13818 - 13861
Alignment:
Q  205 atctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13818 atctcctgatgagctttagcttctggtgatcttgcttctgatga 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89931
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  89972 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 89931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30460
Alignment:
Q  72 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  172 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg 247  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 30460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10151
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    | | ||  || ||||||||| | ||||||||   ||||| ||||||| || | | |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatct 10097  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
     ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  10098 tctgatgaacttcagcttctggtgatattgcttctaatgaggtgcttctgatga 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 765 - 533
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  765 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 666  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||  |||| | | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  665 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctga 568  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
    ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  567 tgaactgcaccttctgatgaacttgcttctgatga 533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1658
Alignment:
Q  10 gcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 109  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||             
T  1869 gcaaagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg--------- 1779  T
Q  110 cctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 209  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||| |||||| |||   ||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1778 catttcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctc 1682  T
Q  210 ctgatgaactttaacttctggtga 233  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  1681 ctgatgaactgtagcttctggtga 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6241
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 208  Q
    ||||||  || |||| ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||  |||||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatct 6201  T
Q  209 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 248  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6202 tctgatgaacttcaacttctagtgatattgcttctgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10176
Alignment:
Q  15 gacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatccttt 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  9958 gacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatt 10057  T
Q  115 caaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
      || ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||| ||   | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   |||| ||||    
T  10058 tgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatcttctga 10156  T
Q  214 tgaactttaacttctggtga 233  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  10157 tgaacttcagcttctggtga 10176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 215601 - 215389
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  215601 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 215502  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  215501 tagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgataaact 215404  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      | |||||||||||    
T  215403 gcagcttctggtgat 215389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6827 - 6632
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  6827 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcggtgcttcactt 6728  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  6727 ttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 6632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 60804 - 61022
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  60804 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatcctt 60903  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 213  Q
     |||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  60904 ccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctga 61001  T
Q  214 tgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  61002 tgaactacaacttctggtgat 61022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 143129 - 143325
Alignment:
Q  54 gtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaat 153  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  143129 gtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 143228  T
Q  154 gcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||  | ||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |  | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  143229 gctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1786 - 1606
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1786 tagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 1687  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1686 ttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatctcctgatgaact 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 248
Target Start/End: Original strand, 39488 - 39662
Alignment:
Q  76 ctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccat 175  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||| || | ||||||||||||||    
T  39488 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 39587  T
Q  176 ttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39588 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 248
Target Start/End: Original strand, 137548 - 137722
Alignment:
Q  76 ctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccat 175  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||| || | ||||||||||||||    
T  137548 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 137647  T
Q  176 ttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  137648 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 137722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159242
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 201  Q
    | | ||  || ||| ||||||||||||||||   ||||  |||||| ||| | | |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 37426 - 37463
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37426 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 135486 - 135523
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  135486 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 159288 - 159332
Alignment:
Q  230 gtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  159288 gtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 159332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78453 - 78258
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  78453 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 78354  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||  | || | | ||||||||||||||   |||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  78353 ttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatctcatgatgaactacagcttctggtgat 78258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 9175 - 9373
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  9175 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcgttgctat 9274  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9275 acttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtg 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5689 - 5510
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  5689 tagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttactt 5590  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 218  Q
    ||||||||||| |||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||| ||||||   |||||||| |||||||||    
T  5589 ttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatcttctgatgaac 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36275 - 36035
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||    
T  36275 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgttgcttc 36176  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 232  Q
    | ||||||||||||| ||||||  || | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |  ||  | ||||||| ||| | ||| |||||    
T  36175 attcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagcttatggtg 36077  T
Q  233 atcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  36076 atgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 36035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25775 - 25688
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 101  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||    
T  25775 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25620 - 25523
Alignment:
Q  178 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat--cttgcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||   | |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  25620 aacaacttttgaaactttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctga 25523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4845
Alignment:
Q  129 cttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttct 228  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaactttt 4889  T
Q  229 ggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 270  Q
    ||||||||   |||||| || ||||| || ||||||||| ||||    
T  4888 ggtgatctccagcttctaataagatgcttttgatgaacttgctt 4845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 40661 - 40839
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||    
T  40661 tagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcactc 40760  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    |||  |||||| ||||||| ||  || |||||||||  || |||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  40761 ttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctgatga 40839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 3328 - 3523
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||     
T  3328 tagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatactt 3427  T
Q  137 ttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    ||||| ||||| |||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3428 ttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgat 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1612 - 1491
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1612 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcgttgcttc 1513  T
Q  133 actcttccagtcttccgcaatg 154  Q
    |||| |  ||||||| ||||||    
T  1512 actcctatagtcttctgcaatg 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9256
Alignment:
Q  192 ctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  9338 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaactttcttctga 9256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44023 - 43828
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||     
T  44023 aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaat 43924  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 216  Q
    ||| | ||||||||||||||   ||||| |||||| |||   | |||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  43923 tagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgatga 43828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43803 - 43753
Alignment:
Q  224 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  43803 cttctggtgatgttgcttctgattaggtgcttctgatgaacttgcttctga 43753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 2027
Alignment:
Q  33 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7048
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||  ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaa 7161  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 219  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  | | | | | || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7160 tagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 7063  T
Q  220 ttaacttctggtgat 234  Q
      | |||||||||||    
T  7062 acagcttctggtgat 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5760
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  |||    
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttc-caacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaa 5732  T
Q  120 tagtcgttgcttcactcttccagtcttc 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5733 tagtcgttgcttcattcttctagtcttc 5760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5813
Alignment:
Q  129 cttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttc 227  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  5935 cttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttc 5836  T
Q  228 tggtgatctt--gcttctgatga 248  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  5835 tggtgatctttagcttctgatga 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74682
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  109 tccttt 114  Q
    ||||||    
T  74677 tccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 270
Target Start/End: Original strand, 74718 - 74824
Alignment:
Q  164 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaa 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  || || |||||||  || | ||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||    
T  74718 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgttgtttctgatgaggtgcttatgatgaa 74817  T
Q  264 ctagctt 270  Q
    || ||||    
T  74818 cttgctt 74824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8150
Alignment:
Q  44 tgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagt 143  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  144 cttccgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    |||| ||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1410
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttca 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttca 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164940
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 164957  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgct 130  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  164956 tcaaattagttgttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65321
Alignment:
Q  67 ttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagat 166  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  167 taaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 65321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144366
Alignment:
Q  67 ttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaatgcttaaatgagat 166  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  167 taaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 234  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 144366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25393
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||  ||| |||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 108  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  109 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttccgcaat 153  Q
     |||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||    
T  2745 -ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15617
Alignment:
Q  14 agacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctt 113  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||  ||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctt 15633  T
Q  114 tcaaaatagtcgttgc 129  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  15632 tcaaactagccgttgc 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38189 - 38080
Alignment:
Q  20 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 119  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38189 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaat 38090  T
Q  120 tagtcgttgc 129  Q
    ||||| ||||    
T  38089 tagtcattgc 38080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1884 - 1803
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1884 tagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17785
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 104  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||    
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13462 - 13391
Alignment:
Q  194 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaac 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13462 ttaagtcttgcatctc-tgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaac 13391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Original strand, 7405 - 7448
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7405 tagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60729
Alignment:
Q  194 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 60729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3982 - 3939
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3982 tagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 908 - 850
Alignment:
Q  37 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  908 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2738
Alignment:
Q  9 agcaaagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 77  Q
    |||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University