View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_271 (Length: 255)

Name: NF7829A_low_271
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_271
NF7829A_low_271
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (6-255)||(17671748-17671997)
chr8 (6-255)||(18859383-18859632)
chr8 (6-255)||(20015989-20016238)
chr8 (6-255)||(19115206-19115455)
chr8 (6-255)||(19481798-19482047)
chr8 (6-255)||(22126685-22126934)
chr8 (6-255)||(22117901-22118150)
chr8 (6-252)||(19980776-19981022)
chr8 (6-252)||(30310870-30311116)
chr8 (6-249)||(22129343-22129586)
chr8 (6-252)||(32602954-32603200)
chr8 (6-252)||(21164264-21164510)
chr8 (6-252)||(15536192-15536438)
chr8 (6-252)||(22042636-22042882)
chr8 (6-255)||(22030909-22031158)
chr8 (9-242)||(22989864-22990097)
chr8 (6-255)||(21253751-21254000)
chr8 (6-255)||(21391587-21391836)
chr8 (6-255)||(21780913-21781162)
chr8 (6-255)||(21786081-21786330)
chr8 (9-252)||(22421621-22421864)
chr8 (9-209)||(22523398-22523598)
chr8 (9-249)||(22375183-22375422)
chr8 (9-247)||(22246162-22246400)
chr8 (9-133)||(22245744-22245868)
chr8 (6-225)||(22373705-22373924)
chr8 (6-219)||(21928270-21928483)
chr8 (6-204)||(19985037-19985235)
chr8 (16-204)||(20390943-20391131)
chr8 (6-204)||(22053720-22053918)
chr8 (9-234)||(22028009-22028234)
chr8 (6-225)||(28983747-28983966)
chr8 (6-177)||(29301152-29301323)
chr8 (6-225)||(31414258-31414477)
chr8 (6-225)||(28988966-28989185)
chr8 (6-182)||(16268950-16269126)
chr8 (6-174)||(27357423-27357591)
chr8 (163-255)||(21919987-21920079)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (6-255)||(14335125-14335374)
chr7 (6-255)||(44788643-44788892)
chr7 (6-255)||(8200777-8201026)
chr7 (6-255)||(8710334-8710583)
chr7 (6-255)||(18587463-18587712)
chr7 (6-255)||(11234505-11234754)
chr7 (12-255)||(10873419-10873662)
chr7 (6-255)||(13688770-13689019)
chr7 (6-253)||(18180474-18180721)
chr7 (6-255)||(15158349-15158598)
chr7 (6-252)||(11550394-11550640)
chr7 (6-252)||(17703747-17703993)
chr7 (6-252)||(14957286-14957532)
chr7 (6-252)||(12690234-12690480)
chr7 (6-252)||(9591100-9591342)
chr7 (8-201)||(15146217-15146410)
chr7 (9-252)||(14042427-14042670)
chr7 (9-252)||(14352457-14352700)
chr7 (10-203)||(15627305-15627498)
chr7 (140-255)||(14149862-14149977)
chr7 (6-225)||(19149771-19149990)
chr7 (6-225)||(20749170-20749389)
chr7 (6-252)||(13676184-13676430)
chr7 (6-225)||(14261516-14261734)
chr7 (6-225)||(18051223-18051442)
chr7 (6-177)||(13024153-13024324)
chr7 (6-225)||(14140439-14140658)
chr7 (6-225)||(15099873-15100092)
chr7 (6-225)||(16947742-16947961)
chr7 (7-182)||(11385700-11385875)
chr7 (6-225)||(26092068-26092287)
chr7 (6-182)||(12459431-12459607)
chr7 (6-176)||(26115860-26116030)
chr7 (6-182)||(14283644-14283820)
chr7 (176-252)||(16726845-16726921)
chr7 (6-225)||(49155061-49155280)
chr7 (6-198)||(12798771-12798963)
chr7 (6-182)||(21755215-21755391)
chr7 (6-225)||(15343191-15343410)
chr7 (6-225)||(40925087-40925306)
chr7 (10-112)||(12204074-12204176)
chr7 (6-150)||(13965938-13966082)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (6-255)||(40711452-40711701)
chr5 (6-255)||(16359174-16359423)
chr5 (6-255)||(34569166-34569415)
chr5 (6-255)||(22330352-22330601)
chr5 (6-255)||(27521078-27521327)
chr5 (6-255)||(27613028-27613277)
chr5 (6-255)||(27665955-27666204)
chr5 (6-255)||(41773514-41773763)
chr5 (6-255)||(19772632-19772881)
chr5 (6-255)||(22137340-22137589)
chr5 (6-255)||(29473538-29473787)
chr5 (6-255)||(37288961-37289210)
chr5 (6-255)||(14997204-14997453)
chr5 (6-255)||(22350591-22350840)
chr5 (7-255)||(27682866-27683114)
chr5 (6-252)||(20803272-20803518)
chr5 (6-252)||(18781789-18782035)
chr5 (6-252)||(21882449-21882695)
chr5 (6-252)||(21342879-21343125)
chr5 (7-255)||(25429093-25429341)
chr5 (9-243)||(26736195-26736429)
chr5 (9-249)||(23473873-23474113)
chr5 (9-252)||(21336762-21337005)
chr5 (23-204)||(20311573-20311754)
chr5 (63-147)||(23525867-23525951)
chr5 (10-225)||(21983646-21983861)
chr5 (6-225)||(23563633-23563852)
chr5 (10-204)||(21561494-21561688)
chr5 (6-74)||(23460824-23460892)
chr5 (11-234)||(17266804-17267027)
chr5 (6-253)||(20824109-20824356)
chr5 (6-208)||(20778614-20778816)
chr5 (6-253)||(22464606-22464853)
chr5 (6-253)||(28892407-28892654)
chr5 (14-171)||(21409890-21410047)
chr5 (6-234)||(14884456-14884684)
chr5 (6-182)||(23078370-23078546)
chr5 (9-66)||(21631867-21631924)
chr5 (9-182)||(22505406-22505579)
chr5 (6-174)||(25850807-25850975)
chr5 (6-174)||(20345017-20345185)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (6-255)||(12479340-12479589)
chr4 (6-255)||(16234015-16234264)
chr4 (6-255)||(17092172-17092421)
chr4 (6-255)||(23958487-23958736)
chr4 (6-255)||(8050646-8050895)
chr4 (6-255)||(8389152-8389401)
chr4 (6-255)||(19634876-19635125)
chr4 (6-255)||(19775816-19776065)
chr4 (6-253)||(40475782-40476029)
chr4 (6-255)||(14301002-14301251)
chr4 (6-255)||(27714076-27714325)
chr4 (6-252)||(16250873-16251119)
chr4 (6-252)||(18224469-18224715)
chr4 (6-252)||(14683310-14683556)
chr4 (6-252)||(15144915-15145162)
chr4 (6-210)||(14162255-14162459)
chr4 (9-207)||(14188294-14188492)
chr4 (9-243)||(14696853-14697087)
chr4 (9-255)||(16061-16307)
chr4 (8-154)||(16350579-16350725)
chr4 (41-252)||(16218973-16219184)
chr4 (41-252)||(16222293-16222504)
chr4 (6-225)||(15073129-15073348)
chr4 (150-252)||(16352697-16352799)
chr4 (6-177)||(29450820-29450991)
chr4 (6-225)||(3262077-3262296)
chr4 (6-225)||(14993650-14993869)
chr4 (6-225)||(51604075-51604294)
chr4 (6-60)||(13513285-13513339)
chr4 (6-176)||(44659149-44659319)
chr4 (6-182)||(15354323-15354499)
chr4 (6-182)||(27903198-27903374)
chr4 (6-182)||(20892844-20893020)
chr4 (6-66)||(53750753-53750813)
chr4 (6-100)||(16150531-16150625)
chr4 (6-100)||(16154677-16154771)
chr4 (10-182)||(11204519-11204691)
chr4 (167-255)||(22632440-22632528)
chr4 (32-225)||(15258697-15258890)
chr4 (161-203)||(14848543-14848585)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (6-255)||(12889068-12889317)
chr3 (6-255)||(13255049-13255298)
chr3 (6-255)||(16638132-16638381)
chr3 (6-255)||(20059576-20059825)
chr3 (6-255)||(43165034-43165283)
chr3 (6-255)||(48427806-48428055)
chr3 (6-255)||(3688302-3688551)
chr3 (6-255)||(15345767-15346016)
chr3 (6-255)||(15713578-15713827)
chr3 (6-255)||(16754223-16754472)
chr3 (6-255)||(5422452-5422701)
chr3 (6-255)||(15586914-15587163)
chr3 (6-255)||(26790935-26791184)
chr3 (6-255)||(53382540-53382789)
chr3 (6-255)||(6603095-6603343)
chr3 (6-255)||(10007959-10008208)
chr3 (6-255)||(10908569-10908818)
chr3 (6-255)||(15358442-15358691)
chr3 (6-255)||(15400039-15400288)
chr3 (6-252)||(15065433-15065679)
chr3 (6-252)||(24185552-24185798)
chr3 (7-255)||(16804470-16804718)
chr3 (9-252)||(14874093-14874336)
chr3 (6-252)||(16694526-16694772)
chr3 (9-255)||(14578933-14579179)
chr3 (105-255)||(26190937-26191087)
chr3 (9-255)||(15261989-15262235)
chr3 (6-255)||(17492210-17492459)
chr3 (9-243)||(12843628-12843862)
chr3 (6-225)||(12858006-12858225)
chr3 (6-225)||(12272737-12272956)
chr3 (6-204)||(14291043-14291241)
chr3 (6-225)||(47126343-47126562)
chr3 (10-204)||(15013284-15013476)
chr3 (6-225)||(10408367-10408586)
chr3 (6-225)||(13944423-13944642)
chr3 (6-225)||(31941302-31941521)
chr3 (6-207)||(12358038-12358239)
chr3 (6-127)||(17188871-17188992)
chr3 (6-208)||(17494062-17494265)
chr3 (6-225)||(31692696-31692915)
chr3 (6-204)||(14575406-14575604)
chr3 (158-255)||(18437499-18437596)
chr3 (6-253)||(10417556-10417803)
chr3 (6-225)||(16832039-16832258)
chr3 (6-225)||(24189703-24189922)
chr3 (6-204)||(16825792-16825990)
chr3 (6-177)||(8744901-8745072)
chr3 (6-177)||(11958692-11958863)
chr3 (10-225)||(15230002-15230217)
chr3 (10-225)||(15235870-15236085)
chr3 (6-225)||(16378445-16378664)
chr3 (6-225)||(28756718-28756937)
chr3 (9-206)||(12180762-12180959)
chr3 (6-252)||(18131857-18132103)
chr3 (6-182)||(12509994-12510170)
chr3 (86-252)||(11949499-11949665)
chr3 (6-76)||(16327220-16327290)
chr3 (86-208)||(13318093-13318215)
chr3 (158-243)||(13969783-13969868)
chr3 (6-62)||(11949436-11949492)
chr3 (6-47)||(13318045-13318086)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (6-255)||(16983611-16983860)
chr2 (6-255)||(17001371-17001620)
chr2 (6-255)||(9337953-9338202)
chr2 (6-255)||(9486587-9486836)
chr2 (6-255)||(22323165-22323414)
chr2 (6-255)||(27220387-27220636)
chr2 (6-255)||(44383393-44383642)
chr2 (6-255)||(24712405-24712654)
chr2 (6-255)||(27373640-27373889)
chr2 (6-255)||(21142864-21143113)
chr2 (6-255)||(10871221-10871470)
chr2 (6-255)||(24874573-24874822)
chr2 (6-252)||(11351534-11351780)
chr2 (6-253)||(24264743-24264990)
chr2 (6-255)||(41606210-41606457)
chr2 (6-252)||(24677861-24678107)
chr2 (6-252)||(24705305-24705551)
chr2 (6-252)||(24657481-24657727)
chr2 (6-252)||(21323089-21323335)
chr2 (6-252)||(23204688-23204934)
chr2 (6-213)||(23029284-23029491)
chr2 (6-183)||(45673835-45674012)
chr2 (6-255)||(23105551-23105800)
chr2 (6-255)||(23074234-23074483)
chr2 (6-255)||(22733597-22733846)
chr2 (9-200)||(24817666-24817857)
chr2 (5-225)||(23097840-23098060)
chr2 (6-73)||(22742789-22742856)
chr2 (10-225)||(23113124-23113339)
chr2 (6-204)||(19716840-19717038)
chr2 (6-208)||(23274011-23274213)
chr2 (23-204)||(19817269-19817450)
chr2 (6-66)||(23064973-23065033)
chr2 (6-225)||(12576754-12576973)
chr2 (10-204)||(30208747-30208941)
chr2 (6-148)||(20848067-20848209)
chr2 (86-252)||(23279150-23279316)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (6-255)||(16347950-16348199)
chr1 (6-255)||(33388384-33388633)
chr1 (6-255)||(51330847-51331096)
chr1 (6-255)||(21833057-21833306)
chr1 (6-255)||(19109123-19109372)
chr1 (6-255)||(41351023-41351272)
chr1 (6-252)||(17042370-17042616)
chr1 (6-252)||(24785212-24785458)
chr1 (6-171)||(20081731-20081896)
chr1 (9-225)||(16378879-16379095)
chr1 (6-156)||(21842066-21842216)
chr1 (101-252)||(21233181-21233332)
chr1 (152-255)||(21839705-21839808)
chr1 (113-252)||(22502751-22502890)
chr1 (6-100)||(22496611-22496705)
chr1 (70-255)||(21751692-21751877)
chr1 (6-252)||(19857063-19857309)
chr1 (6-225)||(22016100-22016319)
chr1 (6-204)||(21739391-21739589)
chr1 (85-225)||(429591-429731)
chr1 (6-225)||(21742907-21743126)
chr1 (6-225)||(20833255-20833474)
chr1 (6-225)||(31537352-31537571)
chr1 (6-177)||(38910181-38910352)
chr1 (6-225)||(48425689-48425908)
chr1 (6-225)||(52988557-52988776)
chr1 (9-66)||(21751991-21752048)
chr1 (9-225)||(24096973-24097189)
chr1 (6-177)||(12200382-12200553)
chr1 (6-253)||(20854115-20854362)
chr1 (6-176)||(37679914-37680084)
chr1 (6-182)||(20297240-20297416)
chr1 (158-255)||(22359751-22359848)
chr1 (6-126)||(18710300-18710420)
chr1 (6-66)||(20075064-20075124)
chr1 (6-42)||(21228911-21228947)
chr1 (158-252)||(21861880-21861974)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (6-255)||(29589867-29590116)
chr6 (6-255)||(2872230-2872479)
chr6 (6-255)||(28260625-28260874)
chr6 (6-255)||(28285042-28285291)
chr6 (6-255)||(28312234-28312483)
chr6 (6-255)||(28339374-28339623)
chr6 (8-255)||(27190040-27190287)
chr6 (8-255)||(27258953-27259200)
chr6 (6-255)||(25115156-25115405)
chr6 (6-255)||(16574494-16574743)
chr6 (6-255)||(16620637-16620886)
chr6 (6-255)||(24293210-24293459)
chr6 (6-252)||(27559397-27559643)
chr6 (9-252)||(19867294-19867537)
chr6 (6-252)||(16925068-16925314)
chr6 (6-252)||(22436476-22436722)
chr6 (64-255)||(22827841-22828032)
chr6 (6-249)||(5836656-5836899)
chr6 (6-255)||(18405372-18405621)
chr6 (9-243)||(23081039-23081273)
chr6 (9-252)||(18182798-18183041)
chr6 (10-161)||(23085257-23085408)
chr6 (10-204)||(30678456-30678650)
chr6 (86-213)||(20135620-20135747)
chr6 (86-213)||(22197122-22197249)
chr6 (6-234)||(19437627-19437855)
chr6 (5-225)||(21567418-21567638)
chr6 (6-225)||(19455657-19455876)
chr6 (6-225)||(18797324-18797543)
chr6 (6-225)||(21474234-21474453)
chr6 (6-182)||(34643014-34643190)
chr6 (6-225)||(25770478-25770697)
chr6 (6-253)||(15461942-15462189)
chr6 (18-204)||(19486734-19486918)
chr6 (6-182)||(10466276-10466452)
chr6 (6-225)||(24515842-24516061)
chr6 (179-252)||(16961082-16961156)
chr6 (6-176)||(24367083-24367253)
chr6 (6-51)||(19465976-19466021)
chr6 (6-182)||(14377344-14377520)
chr6 (9-100)||(20010885-20010976)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (6-255)||(10137-10386)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (6-255)||(22016-22265)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (6-255)||(40924-41173)
scaffold0109 (6-249)||(13410-13653)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (6-255)||(11238-11487)
scaffold0028 (6-255)||(17706-17955)
scaffold0028 (28-255)||(53496-53723)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (6-255)||(3193-3442)
scaffold0044 (6-252)||(16932-17178)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (6-252)||(36270-36516)
scaffold0079 (158-252)||(28850-28944)
scaffold0079 (120-225)||(3517-3622)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (6-252)||(17352-17598)
scaffold0017 (6-252)||(195124-195370)
scaffold0017 (9-204)||(24126-24321)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (6-253)||(1318-1565)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (6-252)||(29214-29460)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (6-252)||(8030-8276)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (10-252)||(10448-10690)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (6-252)||(50631-50877)
scaffold0102 (6-204)||(42518-42716)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (6-252)||(35001-35246)
scaffold0022 (9-252)||(41404-41647)
scaffold0022 (9-252)||(75124-75367)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (6-247)||(10524-10765)
scaffold0080 (6-247)||(13179-13420)
scaffold0080 (7-252)||(31656-31900)
scaffold0080 (7-252)||(37122-37366)
scaffold0080 (9-255)||(54406-54652)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (6-252)||(21376-21622)
scaffold0081 (6-252)||(36800-37046)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (6-252)||(37106-37352)
scaffold0042 (9-255)||(26121-26367)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (10-245)||(14203-14438)
scaffold0010 (9-225)||(4714-4930)
scaffold0010 (6-225)||(44713-44932)
scaffold0010 (6-225)||(39619-39838)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (9-252)||(12435-12678)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (9-255)||(10555-10801)
scaffold0476 (6-225)||(831-1050)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (6-252)||(11642-11888)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (6-255)||(18419-18668)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (6-255)||(24998-25247)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (6-213)||(766-973)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (6-255)||(3370-3619)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (6-243)||(13865-14102)
scaffold0120 (191-255)||(8791-8855)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (9-252)||(23822-24065)
scaffold0011 (9-252)||(151339-151582)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (9-255)||(24234-24480)
scaffold0243 (6-208)||(10058-10260)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (6-255)||(7992-8241)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (9-255)||(111196-111442)
scaffold0040 (9-202)||(17700-17893)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (9-255)||(103996-104242)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (6-255)||(8719-8968)
scaffold0358 (105-255)||(17915-18065)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (6-255)||(151850-152099)
scaffold0023 (9-254)||(47272-47498)
scaffold0023 (6-81)||(30860-30935)
scaffold0023 (122-210)||(1907-1995)
scaffold0023 (86-208)||(164767-164889)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (6-225)||(781-1000)
scaffold0993 (128-255)||(651-778)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (9-252)||(6645-6888)
scaffold0270 (9-252)||(13775-14018)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (9-252)||(5885-6128)
scaffold0074 (7-225)||(14922-15140)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (9-255)||(4203-4449)
scaffold0621 (9-40)||(1-32)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (9-243)||(13768-14002)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (6-200)||(11166-11360)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (9-255)||(55759-56005)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (9-252)||(495792-496035)
scaffold0001 (9-170)||(441507-441668)
scaffold0001 (6-175)||(514639-514808)
scaffold0001 (158-204)||(452651-452697)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (6-164)||(1-159)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (9-243)||(14555-14789)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (9-243)||(216709-216943)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (9-252)||(4355-4598)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (6-243)||(664-901)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (6-183)||(2549-2726)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (9-255)||(40796-41040)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (6-255)||(17635-17878)
scaffold0114 (6-227)||(39855-40076)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (6-156)||(8065-8217)
scaffold0130 (10-225)||(4179-4394)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (125-255)||(8146-8276)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (9-252)||(15268-15511)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (9-188)||(15258-15437)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (105-252)||(15379-15526)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (9-168)||(57903-58062)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (9-252)||(23587-23830)
scaffold0018 (9-200)||(9640-9831)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (152-255)||(9709-9812)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (6-119)||(7141-7254)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (9-201)||(4911-5103)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (50-255)||(1221-1426)
scaffold0278 (9-54)||(3521-3566)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (9-148)||(1865-2004)
scaffold0324 (83-252)||(12577-12746)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (127-252)||(601-726)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (6-242)||(60521-60757)
scaffold0046 (6-51)||(70081-70126)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (6-207)||(141-342)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (6-182)||(1169-1345)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (6-105)||(8329-8428)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (6-225)||(11759-11978)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (6-252)||(20586-20832)
scaffold0222 (6-204)||(773-971)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (6-227)||(2668-2889)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (149-252)||(1-104)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (9-204)||(1819-2014)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (10-225)||(200758-200973)
scaffold0004 (6-225)||(325506-325725)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (6-252)||(355-601)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (10-148)||(21475-21613)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (6-204)||(63805-64003)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (85-225)||(819-959)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (9-225)||(98872-99088)
scaffold0020 (6-225)||(175787-176006)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (6-225)||(11608-11827)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (6-225)||(53709-53928)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (6-253)||(94180-94427)
scaffold0029 (6-126)||(115460-115580)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (6-76)||(1055-1125)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (6-204)||(29347-29545)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (122-252)||(6489-6619)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (6-66)||(424266-424326)
scaffold0003 (6-111)||(203294-203399)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (6-225)||(1558-1777)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (10-225)||(4379-4594)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (6-225)||(28571-28790)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (6-177)||(3456-3627)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (6-225)||(43705-43924)
scaffold0104 (24-225)||(25015-25216)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (6-225)||(110409-110628)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (6-225)||(263025-263244)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (6-204)||(1597-1795)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (6-208)||(6854-7056)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (10-224)||(11630-11844)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (6-204)||(7564-7762)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (6-208)||(25928-26130)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (6-208)||(29440-29642)
scaffold0067 (6-204)||(49466-49664)
scaffold0067 (6-204)||(58500-58698)
scaffold0067 (6-204)||(64888-65086)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (6-63)||(1-58)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (6-219)||(8748-8961)
scaffold0235 (6-219)||(18962-19175)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (9-98)||(8028-8117)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (6-234)||(5392-5620)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (6-182)||(251464-251640)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (177-252)||(27952-28027)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (6-225)||(919-1138)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (6-225)||(49904-50123)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (6-225)||(65584-65803)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-225)||(49163-49382)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (23-234)||(83824-84035)
scaffold0007 (6-38)||(48651-48683)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (6-62)||(14873-14929)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (6-182)||(5135-5311)
scaffold0348 (6-177)||(17770-17941)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (6-225)||(10072-10291)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (7-182)||(1141-1316)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (6-177)||(36786-36957)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (6-225)||(53846-54065)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (6-208)||(2238-2441)
scaffold0034 (6-182)||(70214-70390)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (6-76)||(4590-4660)
scaffold0335 (140-225)||(4670-4755)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (10-176)||(41398-41563)
scaffold0035 (6-137)||(5692-5823)
scaffold0035 (88-225)||(5550-5687)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (6-150)||(12601-12745)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (6-182)||(303-479)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (6-182)||(21693-21869)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (6-225)||(120-339)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (6-137)||(1101-1232)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (6-225)||(8413-8632)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (6-208)||(20814-21014)
scaffold0261 (9-208)||(12637-12834)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (6-225)||(21921-22140)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (26-252)||(9533-9758)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (6-182)||(5023-5199)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (6-182)||(5431-5607)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (6-177)||(1568-1739)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (6-225)||(41534-41753)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (6-100)||(30612-30706)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (8-110)||(67396-67498)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (9-182)||(5498-5671)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (6-66)||(6543-6603)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (8-252)||(991-1227)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (133-218)||(8459-8544)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (6-225)||(34136-34355)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (6-177)||(29781-29952)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (174-255)||(231-312)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (6-182)||(10819-10995)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (6-35)||(15865-15894)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (159-252)||(5328-5421)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (140-225)||(51611-51696)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 17671748 - 17671997
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17671748 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17671847  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671848 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17671947  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671948 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 17671997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18859632 - 18859383
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18859632 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18859533  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859532 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 18859433  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859432 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 18859383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 20015989 - 20016238
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015989 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20016088  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016089 ttttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 20016188  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016189 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 20016238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19115455 - 19115206
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19115455 ctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19115356  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115355 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19115256  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115255 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 19115206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 19481798 - 19482047
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19481798 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtga 19481897  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19481898 ttttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 19481997  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481998 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 19482047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 22126685 - 22126934
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22126685 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22126784  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126785 tttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22126884  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126885 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 22126934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 22117901 - 22118150
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22117901 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22118000  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22118001 tttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacatttttattaattgttttagc 22118100  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22118101 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 22118150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19981022 - 19980776
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19981022 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19980923  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  19980922 ttttgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 19980823  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980822 aagttagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 19980776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 30310870 - 30311116
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30310870 ctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 30310969  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  30310970 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 30311069  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30311070 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 30311116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 22129343 - 22129586
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22129343 ctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22129442  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22129443 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22129542  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22129543 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaga 22129586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32603200 - 32602954
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32603200 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtga 32603101  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32603100 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 32603001  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32603000 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaggtggtgcagagtt 32602954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 21164264 - 21164510
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21164264 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21164363  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21164364 tttcgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 21164463  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21164464 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 21164510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15536438 - 15536192
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||||    
T  15536438 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtga 15536339  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15536338 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 15536239  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15536238 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 15536192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22042882 - 22042636
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22042882 ctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22042783  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22042782 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22042683  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22042682 aagttagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 22042636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22031158 - 22030909
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22031158 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatga 22031059  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22031058 tttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22030959  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  22030958 aagtcagtgtgtttctcttccgctgaggaggaaagtggtgcatagttttt 22030909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22990097 - 22989864
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22990097 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattt 22989998  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22989997 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22989898  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 242  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||    
T  22989897 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtg 22989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21254000 - 21253751
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21254000 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21253901  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  21253900 ttttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatgagctggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 21253801  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||  |  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  21253800 aagtcgctgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 21253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 21391587 - 21391836
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21391587 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21391686  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |||     
T  21391687 ttttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagt 21391786  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  21391787 aagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagttttt 21391836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 21780913 - 21781162
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21780913 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21781012  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |||     
T  21781013 ttttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagt 21781112  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  21781113 aagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagttttt 21781162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 21786081 - 21786330
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21786081 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21786180  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |||     
T  21786181 ttttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagt 21786280  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  21786281 aagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagttttt 21786330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 22421621 - 22421864
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22421621 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattt 22421720  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22421721 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22421820  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22421821 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggtaagtggcgcagagtt 22421864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22523598 - 22523398
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  22523598 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattt 22523499  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22523498 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22523399  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  22523398 t 22523398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 22375183 - 22375422
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22375183 atatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattt 22375281  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22375282 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22375381  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    || ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  22375382 tcggtgtatttttcttctgccgacgaggaaagtggcgcaga 22375422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 22246162 - 22246400
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22246162 atatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 22246261  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||||||  |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||    
T  22246262 tgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattagttgttttagtaag 22246361  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 247  Q
    ||  |  |||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  22246362 tcgatgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggtgca 22246400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 22245744 - 22245868
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22245744 atatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 22245843  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacct 133  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||    
T  22245844 tgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22373924 - 22373705
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||| | | ||    
T  22373924 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagaga 22373825  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || | ||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  22373824 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 22373725  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  22373724 aagacggtacatttttcttc 22373705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21928483 - 21928270
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||  | ||||||||||||||| | ||    
T  21928483 ctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagaga 21928384  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||| | ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  21928383 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 21928284  T
Q  206 aagtcagtacattt 219  Q
    ||| | ||||||||    
T  21928283 aagacggtacattt 21928270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19985235 - 19985037
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  19985235 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 19985136  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |  | ||||    ||||||||| ||  | || || |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  19985135 ctttgaagtcgatctagtatgtttgtcgttgacgaatatggatgtaatctttgggataaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttag 19985037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20391131 - 20390943
Alignment:
Q  16 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatg 115  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  || |  ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  20391131 tggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagtt 20391032  T
Q  116 gatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  20391031 gatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttag 20390943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22053918 - 22053720
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  || |||   |||||||||||| | ||    
T  22053918 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagaga 22053819  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  22053818 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttag 22053720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22028009 - 22028234
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | |||||    
T  22028009 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattt 22028108  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||  | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||    
T  22028109 tgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagtaag 22028208  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaaga 234  Q
     | || ||||| ||||| || |||||    
T  22028209 acggtgcatttttcttctgttgaaga 22028234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28983966 - 28983747
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  28983966 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28983867  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  28983866 ttttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 28983767  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  28983766 aagacggtacatttctcttc 28983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 29301152 - 29301323
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  29301152 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 29301251  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
     ||||   | |||||||||||| | || ||    ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  29301252 ctttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 29301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 31414258 - 31414477
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  31414258 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 31414357  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||| |   || ||||||||| |  | ||||   |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  31414358 ctttgtagccgacttagtttgtttgtcgttgacgagtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 31414457  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  31414458 aagacggtgcatttttcttc 31414477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28989185 - 28988966
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  28989185 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28989086  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  28989085 ttttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 28988986  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  28988985 aagacggtacatttctcttc 28988966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 16268950 - 16269126
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  16268950 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16269049  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||| |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16269050 tttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 16269126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27357591 - 27357423
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  27357591 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 27357492  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 174  Q
    |||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  27357491 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 27357423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 255
Target Start/End: Original strand, 21919987 - 21920079
Alignment:
Q  163 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  21919987 gaactggttggaatagaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 21920079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14335374 - 14335125
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14335374 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14335275  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335274 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14335175  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335174 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 14335125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 44788643 - 44788892
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44788643 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 44788742  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788743 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 44788842  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788843 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 44788892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8201026 - 8200777
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8201026 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8200927  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200926 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8200827  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200826 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 8200777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8710583 - 8710334
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8710583 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8710484  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710483 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8710384  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710383 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 8710334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 18587463 - 18587712
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18587463 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18587562  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18587563 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 18587662  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587663 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 18587712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 11234505 - 11234754
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11234505 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11234604  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234605 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 11234704  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234705 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 11234754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873419
Alignment:
Q  12 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  112 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873562 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 10873463  T
Q  212 gtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873462 gtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 10873419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13689019 - 13688770
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13689019 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 13688920  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688919 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 13688820  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13688819 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 13688770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18180721 - 18180474
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18180721 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18180622  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18180621 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatcaattgttttagc 18180522  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180521 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 18180474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 15158349 - 15158598
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15158349 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15158448  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158449 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15158548  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15158549 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 15158598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 11550394 - 11550640
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  11550394 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11550493  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11550494 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 11550593  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11550594 aagtcagtgtattcctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagtt 11550640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 17703747 - 17703993
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17703747 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17703846  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17703847 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17703946  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17703947 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 17703993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14957532 - 14957286
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  14957532 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14957433  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14957432 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 14957333  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14957332 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagtt 14957286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12690480 - 12690234
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  12690480 ctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12690381  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  12690380 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagc 12690281  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  12690280 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaagaatgtggtgcagagtt 12690234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9591342 - 9591100
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9591342 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 9591243  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  9591242 ttttgaaatggatttagtt----tacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagc 9591147  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9591146 aagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 9591100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 15146217 - 15146410
Alignment:
Q  8 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||    
T  15146217 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgatt 15146316  T
Q  108 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 201  Q
    |||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15146317 ttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14042670 - 14042427
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  14042670 atataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattt 14042571  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||    
T  14042570 tgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaag 14042471  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  14042470 tcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagtt 14042427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14352700 - 14352457
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  14352700 atataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattt 14352601  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||    
T  14352600 tgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaag 14352501  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  14352500 tcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagtt 14352457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15627498 - 15627305
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | |  ||  ||||| | ||||||||||| || |||    
T  15627498 tatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagacttt 15627399  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 203  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15627398 gaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttta 15627305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 14149862 - 14149977
Alignment:
Q  140 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  14149862 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaagaggaaa 14149961  T
Q  240 gtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||    
T  14149962 gtggtgcagagttttt 14149977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19149990 - 19149771
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  19149990 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 19149891  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  19149890 ctttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 19149791  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  19149790 aagacgatacatttttcttc 19149771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20749389 - 20749170
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20749389 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 20749290  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  20749289 ctttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 20749190  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  20749189 aagacgatacatttttcttc 20749170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13676430 - 13676184
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  13676430 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 13676331  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  13676330 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 13676231  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  13676230 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 13676184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 14261516 - 14261734
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  14261516 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 14261615  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
      ||||| | ||| |||| ||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| |||||     
T  14261616 -attgaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagt 14261714  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  14261715 aagacggtgcatttttcttc 14261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 18051223 - 18051442
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | ||    
T  18051223 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 18051322  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  18051323 ttttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 18051422  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  18051423 aagactgtgcatttttcttc 18051442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13024324 - 13024153
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  13024324 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtaggga 13024225  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    ||||    | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  13024224 ttttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14140658 - 14140439
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  14140658 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14140559  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| ||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || ||||||||     
T  14140558 ttttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagt 14140459  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  14140458 aagacggtacatttttcttc 14140439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 15099873 - 15100092
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  15099873 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 15099972  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  15099973 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 15100072  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  15100073 aagacggtgcatttttcttc 15100092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 16947742 - 16947961
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  16947742 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 16947841  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||| | | || ||||||||  | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  16947842 ctttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16947941  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  16947942 aagacggtgcatttttcttc 16947961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 11385700 - 11385875
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | |||    
T  11385700 tgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagat 11385799  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11385800 tttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 11385875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 26092068 - 26092287
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  26092068 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 26092167  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  26092168 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 26092267  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  26092268 aagacggtacatttctcttc 26092287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12459607 - 12459431
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||    
T  12459607 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagaga 12459508  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12459507 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 12459431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 26115860 - 26116030
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  26115860 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 26115959  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 176  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  26115960 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 14283644 - 14283820
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  14283644 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14283743  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14283744 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 14283820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 252
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726921
Alignment:
Q  176 tacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 16726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49155280 - 49155061
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||  | |||||||||||| | ||    
T  49155280 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagaga 49155181  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  49155180 ttttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 49155081  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  49155080 aagacggtacatttctcttc 49155061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 12798771 - 12798963
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||  | ||| | |  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  12798771 ctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 12798870  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 198  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  12798871 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattg 12798963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21755391 - 21755215
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  21755391 ctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 21755292  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||| |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  21755291 tttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataacc 21755215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15343410 - 15343191
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  15343410 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 15343311  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||  | ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||| ||| ||||| |||||     
T  15343310 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattatttttggaatgaattggttagagtataacagagttcatatcaattgctttagt 15343211  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  15343210 aagacggtacatttttcttc 15343191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 40925087 - 40925306
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||  | || ||||||||| | ||    
T  40925087 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggga 40925186  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  40925187 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 40925286  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  40925287 aagacggtacatttctcttc 40925306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Original strand, 12204074 - 12204176
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  12204074 tatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagatttt 12204173  T
Q  110 gaa 112  Q
    |||    
T  12204174 gaa 12204176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 13965938 - 13966082
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  13965938 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 13966037  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 150  Q
    |||||   | |||||||||||||| || |||   |||||||||||    
T  13966038 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgt 13966082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40711701 - 40711452
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40711701 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 40711602  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711601 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 40711502  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711501 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 40711452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16359423 - 16359174
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16359423 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16359324  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359323 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16359224  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359223 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 16359174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34569415 - 34569166
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34569415 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 34569316  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569315 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 34569216  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569215 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 34569166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 22330352 - 22330601
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22330352 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22330451  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330452 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22330551  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330552 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 22330601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27521327 - 27521078
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27521327 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27521228  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521227 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27521128  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27521127 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggcgcagagttttt 27521078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27613277 - 27613028
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27613277 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27613178  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613177 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27613078  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613077 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27613028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 27665955 - 27666204
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27665955 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27666054  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666055 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27666154  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666155 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27666204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41773763 - 41773514
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  41773763 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcga 41773664  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773663 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 41773564  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773563 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 41773514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19772881 - 19772632
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19772881 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19772782  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772781 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19772682  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772681 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 19772632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22137589 - 22137340
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22137589 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtga 22137490  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137489 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22137390  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137389 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 22137340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 29473538 - 29473787
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29473538 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 29473637  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473638 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 29473737  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473738 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 29473787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 37288961 - 37289210
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37288961 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtga 37289060  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289061 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 37289160  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37289161 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttttt 37289210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 14997204 - 14997453
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14997204 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14997303  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997304 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14997403  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14997404 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 14997453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22350840 - 22350591
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22350840 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcga 22350741  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22350740 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaatttttttagc 22350641  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22350640 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttt 22350591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 27682866 - 27683114
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27682866 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27682965  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682966 ttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 27683065  T
Q  207 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27683066 agtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 27683114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20803518 - 20803272
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20803518 ctgatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20803419  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  20803418 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagc 20803319  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803318 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 20803272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18782035 - 18781789
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18782035 ctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18781936  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18781935 ttttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 18781836  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18781835 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 18781789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21882695 - 21882449
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21882695 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21882596  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21882595 ttttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 21882496  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21882495 aagtcggtgtatttctcctccgtctaggaggaaagtggtgcagagtt 21882449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 21342879 - 21343125
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21342879 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21342978  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  21342979 ttttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 21343078  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21343079 aagtcagtttatttctattccgttgaagaggaaagtggtgcagagtt 21343125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25429341 - 25429093
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  25429341 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgat 25429242  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  25429241 tttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagta 25429142  T
Q  207 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    | |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  25429141 aatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 25429093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 26736195 - 26736429
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26736195 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 26736294  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  26736295 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 26736394  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26736395 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtgg 26736429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23474113 - 23473873
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23474113 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 23474014  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  23474013 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 23473914  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    || ||  |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  23473913 tcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcaga 23473873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 21336762 - 21337005
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21336762 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgattt 21336861  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || | |||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  21336862 tgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 21336961  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  21336962 tcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagtt 21337005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311573
Alignment:
Q  23 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 122  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 20311655  T
Q  123 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    | ||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  20311654 tctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 20311573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23525951 - 23525867
Alignment:
Q  63 ctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23525951 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 21983646 - 21983861
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  || || |||| |||||||||| | ||||||    
T  21983646 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagatttt 21983745  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||     
T  21983746 gaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaaga 21983845  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    | || ||||| |||||    
T  21983846 cggtgcatttttcttc 21983861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 23563633 - 23563852
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||  | ||||||||||||||| | ||    
T  23563633 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagaga 23563732  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  23563733 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 23563832  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  23563833 aagacggtgcatttttcttc 23563852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 21561494 - 21561688
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  21561494 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagatttt 21561593  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||| ||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21561594 gaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttag 21561688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23460892 - 23460824
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 74  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460892 ctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 23460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 17266804 - 17267027
Alignment:
Q  11 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttg 110  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | |||||||    
T  17266804 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttg 17266903  T
Q  111 aaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtc 210  Q
    || | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||| ||| || |||||||| ||| |    
T  17266904 aagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgttttagtaagac 17267003  T
Q  211 agtacatttctcttccgtcgaaga 234  Q
     |||||||| ||||||| ||||||    
T  17267004 ggtacatttttcttccgccgaaga 17267027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20824356 - 20824109
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20824356 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20824257  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  20824256 tttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 20824157  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||    
T  20824156 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagttt 20824109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20778816 - 20778614
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20778816 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20778717  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  20778716 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 20778617  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  20778616 aag 20778614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22464853 - 22464606
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  22464853 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 22464754  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||| |    
T  22464753 ttttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtacaaccgagtctgtataaattgttttaac 22464654  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||    
T  22464653 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagcagagttt 22464606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 28892407 - 28892654
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  28892407 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 28892506  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  28892507 ttttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 28892606  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||    
T  28892607 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagttt 28892654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21410047 - 21409890
Alignment:
Q  14 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 113  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||||||| | ||||||| |     
T  21410047 aatggggaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcag 21409948  T
Q  114 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 171  Q
    |||| ||||| ||| | || |||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  21409947 tggacttagtctgtttgccgttgactgggatggatgtaatactaggtatgaactggtt 21409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 14884456 - 14884684
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  14884456 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14884555  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  14884556 ttttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgggttcatatcaactgctttagt 14884655  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 234  Q
    ||| | |||||||||||||| || |||||    
T  14884656 aagacggtacatttctcttctgttgaaga 14884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 23078370 - 23078546
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  23078370 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 23078469  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     |||| | | ||| || ||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  23078470 ctttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 23078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 21631867 - 21631924
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631867 atatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22505579 - 22505406
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||  | | |||||    
T  22505579 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattt 22505480  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||   |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22505479 tgtggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 22505406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25850975 - 25850807
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  25850975 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 25850876  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 174  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  25850875 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20345185 - 20345017
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| ||   || ||| | ||| |||||||| | ||    
T  20345185 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctttgtttggtagaga 20345086  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 174  Q
    |||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  20345085 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 20345017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12479589 - 12479340
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12479589 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12479490  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479489 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 12479390  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479389 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 12479340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 16234015 - 16234264
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16234015 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16234114  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234115 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16234214  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234215 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 16234264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 17092172 - 17092421
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17092172 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17092271  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092272 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17092371  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092372 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 17092421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23958736 - 23958487
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23958736 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 23958637  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958636 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 23958537  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958536 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 23958487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 8050646 - 8050895
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8050646 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 8050745  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050746 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8050845  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050846 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 8050895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8389401 - 8389152
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8389401 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8389302  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389301 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8389202  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389201 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 8389152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19635125 - 19634876
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19635125 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtga 19635026  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635025 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19634926  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19634925 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttttt 19634876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 19775816 - 19776065
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19775816 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19775915  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775916 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19776015  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776016 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 19776065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40476029 - 40475782
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40476029 ctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 40475930  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40475929 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttatagc 40475830  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475829 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 40475782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 14301002 - 14301251
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14301002 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtga 14301101  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301102 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14301201  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14301202 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 14301251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27714325 - 27714076
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27714325 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 27714226  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714225 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27714126  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714125 aagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27714076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 16250873 - 16251119
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16250873 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16250972  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16250973 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16251072  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16251073 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 16251119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 18224469 - 18224715
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18224469 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18224568  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  18224569 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagc 18224668  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18224669 aagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagtt 18224715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14683556 - 14683310
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  14683556 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14683457  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14683456 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 14683357  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14683356 atgtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagtt 14683310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 15144915 - 15145162
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15144915 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15145014  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag- 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  15145015 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagt 15145113  T
Q  205 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagt-ggtgcagagtt 252  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15145114 caagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtaggtgcagagtt 15145162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14162459 - 14162255
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||||||||||| || ||||||    
T  14162459 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtga 14162360  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14162359 ttttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcttattaattgttttagc 14162260  T
Q  206 aagtc 210  Q
    |||||    
T  14162259 aagtc 14162255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14188492 - 14188294
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  14188492 atattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattt 14188393  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  14188392 tgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgttttagcaa 14188294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14697087 - 14696853
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  14697087 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattt 14696988  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  14696987 tgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 14696888  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    |||||  |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  14696887 tcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtgg 14696853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 16061 - 16307
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16061 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 16160  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
      |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  16161 ctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 16260  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  16261 tcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagttttt 16307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 16350579 - 16350725
Alignment:
Q  8 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16350579 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatt 16350678  T
Q  108 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 154  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16350679 tcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16218973
Alignment:
Q  41 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtg 140  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  141 gtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaag 240  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16218985  T
Q  241 tggtgcagagtt 252  Q
    ||| ||||||||    
T  16218984 tggcgcagagtt 16218973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222293
Alignment:
Q  41 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtg 140  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  141 gtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaag 240  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16222305  T
Q  241 tggtgcagagtt 252  Q
    ||| ||||||||    
T  16222304 tggcgcagagtt 16222293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15073348 - 15073129
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||| | ||    
T  15073348 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagaga 15073249  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  15073248 ctttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 15073149  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  15073148 aagacggtacatttttcttc 15073129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352799
Alignment:
Q  150 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  250 gtt 252  Q
    |||    
T  16352797 gtt 16352799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 29450820 - 29450991
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  29450820 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 29450919  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  29450920 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 3262077 - 3262296
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  3262077 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 3262176  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  3262177 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 3262276  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  3262277 aagacggtacatttctcttc 3262296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 14993650 - 14993869
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | |     
T  14993650 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtggagg 14993749  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  | |||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  14993750 ctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 14993849  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  14993850 aagacggtgcatttttcttc 14993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 51604075 - 51604294
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | ||    
T  51604075 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 51604174  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  51604175 ttttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 51604274  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  51604275 aagactgtgcatttttcttc 51604294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13513339 - 13513285
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513339 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 44659149 - 44659319
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  44659149 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 44659248  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 176  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  44659249 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 15354323 - 15354499
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||| | | ||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  15354323 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagaga 15354422  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     ||| || | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||    
T  15354423 ctttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataacc 15354499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27903374 - 27903198
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  27903374 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 27903275  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27903274 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagtataacc 27903198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20893020 - 20892844
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||   |  ||| | |||||||||||| | ||    
T  20893020 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctatgtttggtagaga 20892921  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||   | ||| |||||||  | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20892920 ttttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaactggttagagtataacc 20892844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Original strand, 53750753 - 53750813
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53750753 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16150625 - 16150531
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || |||||||||||||||    
T  16150625 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16150531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16154771 - 16154677
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || |||||||||||||||    
T  16154771 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16154677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 11204519 - 11204691
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || |||   |||||||||||| | ||||||    
T  11204519 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagatttt 11204618  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11204619 gtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 11204691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632440
Alignment:
Q  167 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 22632440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15258890 - 15258697
Alignment:
Q  32 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctac 131  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | || |||| | | ||  | |||||| |||    
T  15258890 gaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgtttac 15258791  T
Q  132 ctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    | ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||    
T  15258790 cgttgacgggtatggatgtcattttttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 15258697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 203
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848585
Alignment:
Q  161 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattatttta 14848585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12889317 - 12889068
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12889317 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12889218  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889217 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 12889118  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889117 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 12889068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13255298 - 13255049
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13255298 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 13255199  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255198 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 13255099  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255098 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 13255049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16638381 - 16638132
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16638381 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16638282  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638281 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16638182  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638181 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 16638132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 20059576 - 20059825
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20059576 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20059675  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059676 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 20059775  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059776 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 20059825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43165283 - 43165034
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43165283 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 43165184  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165183 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 43165084  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165083 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 43165034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48428055 - 48427806
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48428055 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 48427956  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48427955 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattattttagc 48427856  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427855 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 48427806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3688551 - 3688302
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3688551 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 3688452  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688451 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 3688352  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688351 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 3688302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 15345767 - 15346016
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15345767 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15345866  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345867 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15345966  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345967 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 15346016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 15713578 - 15713827
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15713578 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15713677  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713678 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15713777  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713778 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 15713827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 16754223 - 16754472
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16754223 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtga 16754322  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16754323 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 16754422  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16754423 aagtcagtacatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcagagttttt 16754472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 5422452 - 5422701
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5422452 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 5422551  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422552 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 5422651  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422652 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 5422701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 15586914 - 15587163
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15586914 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15587013  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15587014 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 15587113  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587114 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 15587163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 26790935 - 26791184
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26790935 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 26791034  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791035 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 26791134  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791135 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 26791184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 53382540 - 53382789
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53382540 ctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 53382639  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53382640 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 53382739  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382740 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 53382789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6603343 - 6603095
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6603343 ctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 6603244  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6603243 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 6603145  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603144 aagtcaatacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 6603095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10008208 - 10007959
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10008208 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcga 10008109  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008108 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10008009  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008008 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 10007959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10908818 - 10908569
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10908818 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtca 10908719  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908718 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10908619  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908618 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 10908569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15358691 - 15358442
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15358691 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15358592  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358591 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttattaattgttttagc 15358492  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358491 aagtcagtgcatttttcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttt 15358442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 15400039 - 15400288
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15400039 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15400138  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15400139 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagt 15400238  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15400239 aagtcagtgcatttttcttccgtcgaagagaagagtggtgcagagttttt 15400288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15065679 - 15065433
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065679 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15065580  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||     
T  15065579 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttaga 15065480  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065479 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 15065433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24185798 - 24185552
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  24185798 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24185699  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24185698 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 24185599  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24185598 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagtt 24185552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 16804470 - 16804718
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  16804470 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgat 16804569  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||    
T  16804570 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattattttacca 16804669  T
Q  207 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16804670 agtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttttt 16804718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 14874093 - 14874336
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14874093 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattt 14874192  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  14874193 tgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatattaattattttagcaag 14874292  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14874293 tcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaattggtgcagagtt 14874336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16694772 - 16694526
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16694772 ctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16694673  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16694672 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16694573  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16694572 aagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 16694526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 14578933 - 14579179
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14578933 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 14579032  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  14579033 tgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 14579132  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  14579133 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaattttt 14579179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191087
Alignment:
Q  105 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  205 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 26191087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15262235 - 15261989
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15262235 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 15262136  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  15262135 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 15262036  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||  |||| |||||    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15262035 tcagtgtatttttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagttttt 15261989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17492459 - 17492210
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || |||| |||||||| ||||||    
T  17492459 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtga 17492360  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  17492359 ttttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 17492260  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||    
T  17492259 aaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagttttt 17492210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 12843628 - 12843862
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  12843628 atatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattt 12843727  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  12843728 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 12843827  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    || ||  |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  12843828 tcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtgg 12843862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 12858006 - 12858225
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| ||||    
T  12858006 ctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtga 12858105  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  12858106 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 12858205  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  12858206 aagacggtacatttctcttc 12858225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12272956 - 12272737
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  12272956 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 12272857  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  12272856 ctttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 12272757  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  12272756 aagacggtgcatttttcttc 12272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 14291043 - 14291241
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  14291043 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 14291142  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14291143 ctttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttag 14291241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47126562 - 47126343
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  47126562 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 47126463  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  47126462 ttttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 47126363  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  47126362 aagacggtacatttctcttc 47126343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 15013284 - 15013476
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | | ||||    
T  15013284 tatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagag-tttt 15013382  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    | | |||| ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  15013383 gcagtggacttagtat-tctgccgttgagtggaatggatgtgatactaggtatgaactacttggagtttaactatgttcatataaattgttttag 15013476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10408586 - 10408367
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  10408586 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 10408487  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  10408486 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 10408387  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  10408386 aagacggtacatttctcttc 10408367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13944642 - 13944423
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | ||    
T  13944642 ctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 13944543  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  13944542 ttttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 13944443  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  13944442 aagactgtgcatttttcttc 13944423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31941521 - 31941302
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||  | ||    
T  31941521 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagaga 31941422  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  31941421 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagc 31941322  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  31941321 aagacagtgcatttttcttc 31941302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 12358038 - 12358239
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  12358038 ctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 12358137  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  12358138 ctttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 12358237  T
Q  206 aa 207  Q
    ||    
T  12358238 aa 12358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17188992 - 17188871
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  17188992 ctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 17188893  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgt 127  Q
    ||||||| | || |||||||||    
T  17188892 ttttgaagtagacttagtttgt 17188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17494265 - 17494062
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtg 104  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | ||| || ||||||||||||||| | |    
T  17494265 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 17494166  T
Q  105 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    | |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  17494165 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 17494066  T
Q  205 caag 208  Q
    ||||    
T  17494065 caag 17494062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 31692696 - 31692915
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  31692696 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 31692795  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  31692796 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 31692895  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  31692896 aagacggtgcatttttcttc 31692915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14575604 - 14575406
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  14575604 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 14575505  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  | || ||||||||| |||||    
T  14575504 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttagattataaccgagctcgtattaattgctttag 14575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437499
Alignment:
Q  158 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagttttt 18437499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 10417556 - 10417803
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  10417556 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 10417655  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||  |||||||||||||| |    
T  10417656 tttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataactgagtttgtattaattgttttaac 10417755  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||    
T  10417756 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagttt 10417803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 16832039 - 16832258
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  16832039 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16832138  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  16832139 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16832238  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  16832239 aagacggtacatttttcttc 16832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24189922 - 24189703
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  24189922 ctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 24189823  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||||| | ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||| || ||||  |||| ||| || || ||||||    
T  24189822 ttttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataaccgagttcatatcaactgctttagc 24189723  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  24189722 aagacggtgcatttttcttc 24189703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 16825792 - 16825990
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||  ||||| | ||    
T  16825792 ctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagaga 16825891  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  16825892 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 16825990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 8744901 - 8745072
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | ||    
T  8744901 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 8745000  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    ||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  8745001 ttttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 8745072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 11958692 - 11958863
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  11958692 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 11958791  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
     ||||   | |||||||||||| |  | |||   ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  11958792 ctttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagta 11958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15230217 - 15230002
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || || |||||||||||| || | ||||||    
T  15230217 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagatttt 15230118  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| | || ||| | || || |  ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||     
T  15230117 gaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaaga 15230018  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    | |||||||| |||||    
T  15230017 cggtacatttttcttc 15230002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15236085 - 15235870
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || || |||||||||||| || | ||||||    
T  15236085 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagatttt 15235986  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| | || ||| | || || |  ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||     
T  15235985 gaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaaga 15235886  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    | |||||||| |||||    
T  15235885 cggtacatttttcttc 15235870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 16378445 - 16378664
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | ||    
T  16378445 ctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagaga 16378544  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || ||||||||     
T  16378545 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagt 16378644  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  16378645 aagacggtacatttttcttc 16378664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28756937 - 28756718
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    || ||| | |||||||||||| | ||    
T  28756937 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28756838  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  28756837 ttttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 28756738  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  28756737 aagacggtacatttctcttc 28756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12180959 - 12180762
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||   | ||| || ||||||||||||||| | || ||    
T  12180959 atatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactt 12180860  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    |||| | || ||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  12180859 tgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagca 12180762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 18131857 - 18132103
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  18131857 ctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 18131956  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     | |||| | || ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  18131957 ctatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 18132056  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  18132057 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 18132103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 12509994 - 12510170
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||  ||| |  || |||||||| || ||||||   || | | | |||||||||||| | ||    
T  12509994 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctatgtttggtagaga 12510093  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12510094 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 12510170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 11949499 - 11949665
Alignment:
Q  86 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 185  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  11949499 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgag 11949598  T
Q  186 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  11949599 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 16327220 - 16327290
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 76  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  16327220 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 16327290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 208
Target Start/End: Original strand, 13318093 - 13318215
Alignment:
Q  86 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 185  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  13318093 ttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgag 13318192  T
Q  186 ttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||    
T  13318193 ttcatataaattgttttaacaag 13318215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 243
Target Start/End: Original strand, 13969783 - 13969868
Alignment:
Q  158 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  13969783 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtgg 13969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 11949436 - 11949492
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 62  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11949436 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 11949492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Original strand, 13318045 - 13318086
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 47  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13318045 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16983860 - 16983611
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16983860 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16983761  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983760 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16983661  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983660 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 16983611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17001620 - 17001371
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17001620 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17001521  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001520 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17001421  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001420 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 17001371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9338202 - 9337953
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9338202 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 9338103  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338102 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 9338003  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338002 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 9337953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9486836 - 9486587
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9486836 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 9486737  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486736 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 9486637  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486636 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 9486587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 22323165 - 22323414
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22323165 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22323264  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323265 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22323364  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323365 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 22323414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27220636 - 27220387
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27220636 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27220537  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220536 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27220437  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220436 aagtcagtacgtttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27220387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 44383393 - 44383642
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44383393 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 44383492  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383493 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 44383592  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44383593 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttttt 44383642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24712654 - 24712405
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24712654 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24712555  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712554 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 24712455  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24712454 aaatcagtacatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttt 24712405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27373889 - 27373640
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27373889 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27373790  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373789 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27373690  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373689 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27373640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 21142864 - 21143113
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21142864 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21142963  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142964 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 21143063  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143064 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 21143113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10871470 - 10871221
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10871470 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtga 10871371  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871370 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10871271  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871270 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 10871221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 24874573 - 24874822
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24874573 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24874672  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24874673 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttattaattgttttagc 24874772  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24874773 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttt 24874822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 11351534 - 11351780
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11351534 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11351633  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11351634 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 11351733  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351734 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 11351780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24264990 - 24264743
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24264990 ctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtga 24264891  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264890 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 24264791  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24264790 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttt 24264743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 41606210 - 41606457
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41606210 ctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcgtga 41606307  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606308 tttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 41606407  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41606408 aagtctgtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 41606457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24678107 - 24677861
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24678107 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24678008  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  24678007 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagc 24677908  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24677907 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtt 24677861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 24705305 - 24705551
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24705305 ctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtga 24705404  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  24705405 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 24705504  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705505 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 24705551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 24657481 - 24657727
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24657481 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24657580  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||     
T  24657581 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagt 24657680  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24657681 cagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggagcagagtt 24657727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 21323089 - 21323335
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21323089 ctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21323188  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  21323189 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatatgaactgttttagc 21323288  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21323289 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggcgcagagtt 21323335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23204934 - 23204688
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  23204934 ctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtga 23204835  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  23204834 ttttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 23204735  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  23204734 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggagagtgatgcagagtt 23204688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 23029284 - 23029491
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23029284 ctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 23029383  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  23029384 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 23029483  T
Q  206 aagtcagt 213  Q
    ||||||||    
T  23029484 aagtcagt 23029491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 45673835 - 45674012
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  45673835 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 45673934  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45673935 ttttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 23105551 - 23105800
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23105551 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 23105650  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  23105651 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 23105750  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23105751 aagtcggtgtatttctcttctgatgaagaggaaagtggcgcagagttttt 23105800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23074483 - 23074234
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| || |||    
T  23074483 ctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttga 23074384  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  23074383 ttttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagt 23074284  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  23074283 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagttttt 23074234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 22733597 - 22733846
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  22733597 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtga 22733696  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  22733697 ttttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagt 22733796  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  22733797 aagtcggtgtttttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 22733846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 24817666 - 24817857
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  24817666 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 24817765  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 200  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  24817766 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgtt 24817857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 23097840 - 23098060
Alignment:
Q  5 actgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | |    
T  23097840 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 23097939  T
Q  105 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||    
T  23097940 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttag 23098039  T
Q  205 caagtcagtacatttctcttc 225  Q
    |||| | || ||||| |||||    
T  23098040 caagacggtgcatttttcttc 23098060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Original strand, 22742789 - 22742856
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742789 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22742856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23113339 - 23113124
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  23113339 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagatttt 23113240  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||| |||     
T  23113239 gaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgttttagtaaga 23113140  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    |  ||||||| |||||    
T  23113139 cgatacatttttcttc 23113124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 19716840 - 19717038
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  19716840 ctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 19716939  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  19716940 ctttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 19717038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23274213 - 23274011
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  23274213 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 23274114  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  23274113 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 23274014  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  23274013 aag 23274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19817450 - 19817269
Alignment:
Q  23 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 122  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| || |||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  19817450 atggttgtcaaaaacccggctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttag 19817351  T
Q  123 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    | ||| | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |  ||| | |||| |||||||||||||||    
T  19817350 tctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgttttag 19817269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23065033 - 23064973
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065033 ctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12576973 - 12576754
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||||||||| | ||    
T  12576973 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 12576874  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  12576873 ttttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 12576774  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  12576773 aagactgtgcatttttcttc 12576754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 30208747 - 30208941
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    |||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||| || || || || || |||||||| ||||||| | | ||||||    
T  30208747 tatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagatttt 30208846  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    | | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || || |  ||| | |||| |||||||||||||||    
T  30208847 gcagtggacttagtctgtttgccattgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactaattggaatttaactatgttcatattaattgttttag 30208941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20848209 - 20848067
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  20848209 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 20848110  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 148  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  20848109 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23279316 - 23279150
Alignment:
Q  86 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 185  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||||  |    
T  23279316 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgag 23279217  T
Q  186 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  23279216 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctacggaagaagaaagtggagcagagtt 23279150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 16347950 - 16348199
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16347950 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16348049  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348050 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16348149  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348150 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 16348199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 33388384 - 33388633
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33388384 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 33388483  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388484 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 33388583  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388584 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 33388633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 51330847 - 51331096
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51330847 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 51330946  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330947 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 51331046  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331047 aagtcagtgcatttcttttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 51331096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21833306 - 21833057
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21833306 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtga 21833207  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833206 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 21833107  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833106 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 21833057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19109372 - 19109123
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19109372 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatga 19109273  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19109272 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 19109173  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109172 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 19109123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 41351023 - 41351272
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41351023 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtga 41351122  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41351123 ttttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 41351222  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351223 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 41351272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 17042370 - 17042616
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17042370 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17042469  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17042470 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17042569  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17042570 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 17042616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 24785212 - 24785458
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24785212 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24785311  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  24785312 ttttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 24785411  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24785412 aaatcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 24785458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 171
Target Start/End: Original strand, 20081731 - 20081896
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20081731 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20081830  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081831 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16379095 - 16378879
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16379095 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 16378996  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| || ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16378995 tgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaag 16378896  T
Q  209 tcagtacatttctcttc 225  Q
    |||||  ||||||||||    
T  16378895 tcagtgtatttctcttc 16378879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21842216 - 21842066
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21842216 ctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtga 21842117  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21842116 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233332
Alignment:
Q  101 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  201 ttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagtt 21233332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839705
Alignment:
Q  152 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  252 tttt 255  Q
    ||||    
T  21839708 tttt 21839705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 252
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502890
Alignment:
Q  113 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||     
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  213 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagtt 22502890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Original strand, 22496611 - 22496705
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22496611 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21751877 - 21751692
Alignment:
Q  70 atgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactgg 169  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |    
T  21751877 atgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcg 21751778  T
Q  170 ttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||  ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  21751777 ttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagttttt 21751692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19857309 - 19857063
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||  | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  19857309 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 19857210  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19857209 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 19857110  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  19857109 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 19857063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 22016100 - 22016319
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  22016100 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 22016199  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  22016200 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 22016299  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  22016300 aagacggtgcatttttcttc 22016319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 21739391 - 21739589
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  21739391 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 21739490  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  21739491 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 21739589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Original strand, 429591 - 429731
Alignment:
Q  85 tttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccac 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||     
T  429591 tttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatacaaccat 429690  T
Q  185 gttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    || |  ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||    
T  429691 gtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 429731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 21742907 - 21743126
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  21742907 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 21743006  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| || |||||     
T  21743007 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccattttcatattaactgctttagt 21743106  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  21743107 aagacggtgcatttttcttc 21743126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 20833255 - 20833474
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20833255 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20833354  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  20833355 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 20833454  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  20833455 aagacggtgcatttttcttc 20833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 31537352 - 31537571
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  31537352 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 31537451  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  31537452 ttttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 31537551  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31537552 aagacggtacatttctcttc 31537571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 38910181 - 38910352
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  38910181 ctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 38910280  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  38910281 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48425908 - 48425689
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  48425908 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 48425809  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  48425808 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 48425709  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  48425708 aagacggtacatttctcttc 48425689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52988776 - 52988557
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  52988776 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 52988677  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  52988676 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 52988577  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  52988576 aagacggtacatttctcttc 52988557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21752048 - 21751991
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752048 atatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 24096973 - 24097189
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | || ||    
T  24096973 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactt 24097072  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    || | | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||    
T  24097073 tgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaag 24097172  T
Q  209 tcagtacatttctcttc 225  Q
     | || ||||| |||||    
T  24097173 acggtgcatttttcttc 24097189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12200553 - 12200382
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||  | |||||||||||| | ||    
T  12200553 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagaga 12200454  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    |||||  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  12200453 ttttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 20854115 - 20854362
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20854115 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20854214  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   ||| |||||||||| |    
T  20854215 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaac 20854314  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||    
T  20854315 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagcagagttt 20854362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37680084 - 37679914
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  37680084 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 37679985  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 176  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  37679984 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20297416 - 20297240
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||   || ||| | | |||||||||| | ||    
T  20297416 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagaga 20297317  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||   | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20297316 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataacc 20297240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 255
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359848
Alignment:
Q  158 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||  || ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagttttt 22359848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18710420 - 18710300
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  18710420 ctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 18710321  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttg 126  Q
     |||||| | || ||||||||    
T  18710320 ctttgaagtcgacttagtttg 18710300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Original strand, 20075064 - 20075124
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20075064 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 42
Target Start/End: Original strand, 21228911 - 21228947
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228911 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21861974
Alignment:
Q  158 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagtt 21861974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 29589867 - 29590116
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29589867 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 29589966  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589967 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 29590066  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29590067 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 29590116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 2872230 - 2872479
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2872230 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 2872329  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872330 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 2872429  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872430 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 2872479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 28260625 - 28260874
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28260625 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28260724  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28260725 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28260824  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260825 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 28260874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28285291 - 28285042
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28285291 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28285192  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28285191 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28285092  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285091 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 28285042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28312483 - 28312234
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28312483 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28312384  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28312383 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28312284  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312283 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 28312234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 28339374 - 28339623
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28339374 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28339473  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28339474 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28339573  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339574 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 28339623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27190287 - 27190040
Alignment:
Q  8 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27190287 gatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatt 27190188  T
Q  108 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27190187 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaa 27190088  T
Q  208 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190087 gtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27190040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Original strand, 27258953 - 27259200
Alignment:
Q  8 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27258953 gatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatt 27259052  T
Q  108 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27259053 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaa 27259152  T
Q  208 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259153 gtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 27259200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25115405 - 25115156
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25115405 ctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 25115306  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115305 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 25115206  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25115205 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcaaagttttt 25115156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16574743 - 16574494
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16574743 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16574644  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16574643 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagc 16574544  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16574543 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 16574494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 16620637 - 16620886
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16620637 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16620736  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16620737 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagc 16620836  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16620837 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 16620886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 24293210 - 24293459
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24293210 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24293309  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24293310 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattagttgttttagc 24293409  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24293410 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttt 24293459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 27559397 - 27559643
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27559397 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27559496  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  27559497 ttttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 27559596  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559597 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtt 27559643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19867537 - 19867294
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19867537 atatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 19867438  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19867437 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaag 19867338  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19867337 tcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtt 19867294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 16925068 - 16925314
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16925068 ctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtga 16925167  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16925168 ttttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16925267  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16925268 aagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcagagtt 16925314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22436722 - 22436476
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22436722 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtga 22436623  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| || ||| | |||||  | ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22436622 ttttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 22436523  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22436522 aagtcagtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 22436476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 255
Target Start/End: Original strand, 22827841 - 22828032
Alignment:
Q  64 tctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22827841 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 22827940  T
Q  164 aactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22827941 aattgcttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagttttt 22828032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 5836656 - 5836899
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5836656 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtga 5836755  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||    
T  5836756 ttttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgttcatattaattgtgctagc 5836855  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5836856 aagtcagtgtatttctcttcagtcgaagaggaaagtggtgcaga 5836899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 18405372 - 18405621
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||    
T  18405372 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtga 18405471  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||     
T  18405472 ttttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagt 18405571  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  18405572 aaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagttttt 18405621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23081273 - 23081039
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  23081273 atattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatta 23081174  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||    
T  23081173 tgaaattgacttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttagtaag 23081074  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    || ||  ||||||||||    ||||||||||||||    
T  23081073 tcggtgtatttctcttcttctgaagaggaaagtgg 23081039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 18182798 - 18183041
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  18182798 atatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattt 18182897  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| |||    ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  18182898 tgaaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaag 18182997  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||  | || ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  18182998 tcagtgtacttttcttctgctgaagaagaaagtggagcagagtt 18183041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 161
Target Start/End: Original strand, 23085257 - 23085408
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23085257 tatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttt 23085356  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggta 161  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23085357 gaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 30678456 - 30678650
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | ||||| ||||||||||| || |||    
T  30678456 tatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagacttt 30678555  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||| | |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30678556 gaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttag 30678650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135620
Alignment:
Q  86 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 185  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 20135648  T
Q  186 ttcttattaattgttttagcaagtcagt 213  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20135647 ttcatattaattgttttagtaagtcagt 20135620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197249
Alignment:
Q  86 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 185  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 22197221  T
Q  186 ttcttattaattgttttagcaagtcagt 213  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22197222 ttcatattaattgttttagtaagtcagt 22197249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19437855 - 19437627
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || |||| |||||||| | | ||    
T  19437855 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagaga 19437756  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19437755 ctttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 19437656  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 234  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||    
T  19437655 aagacggtgcatttttcttctgtggaaga 19437627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 21567418 - 21567638
Alignment:
Q  5 actgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | |    
T  21567418 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 21567517  T
Q  105 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  21567518 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 21567617  T
Q  205 caagtcagtacatttctcttc 225  Q
     ||| | || ||||| |||||    
T  21567618 taagacggtgcatttttcttc 21567638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19455876 - 19455657
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||  | ||||||||||||||| | ||    
T  19455876 ctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagaga 19455777  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  19455776 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 19455677  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  19455676 aagacggtgcatttttcttc 19455657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18797543 - 18797324
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |  ||| | |||||||||||| | ||    
T  18797543 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtaggga 18797444  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || || ||||||    
T  18797443 ttttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactgctttagc 18797344  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  18797343 aagacagtgcatttttcttc 18797324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21474453 - 21474234
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  21474453 ctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 21474354  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | || ||| |  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  21474353 ctttgaagttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgttttagt 21474254  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  21474253 aagacggtacatttttcttc 21474234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 34643014 - 34643190
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||    
T  34643014 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggga 34643113  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||||||| | ||  |||||||  |||||||||  || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  34643114 ttttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataacc 34643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25770697 - 25770478
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  25770697 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 25770598  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||     
T  25770597 ctttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattattttagt 25770498  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| || ||||||| |||||    
T  25770497 aagacaatacatttttcttc 25770478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15462189 - 15461942
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || || |||||||||||| | ||    
T  15462189 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagaga 15462090  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||  |||||||||||||| |    
T  15462089 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaatataaccgagtttgtattaattgttttaac 15461990  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || ||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  15461989 aagacggtgcatttttcttctatggaagaagagagtggagcagagttt 15461942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 19486734 - 19486918
Alignment:
Q  18 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 117  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||  || |  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||    
T  19486734 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttga 19486833  T
Q  118 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    | |||| ||| | ||  |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  19486834 tctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatgaattgttttag 19486918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 10466276 - 10466452
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || |  || |||||||||||| | ||    
T  10466276 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtaggga 10466375  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||    
T  10466376 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataacc 10466452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 24515842 - 24516061
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  24515842 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 24515941  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || |||||  | ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  24515942 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 24516041  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  24516042 aagacggtgcatttttcttc 24516061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 252
Target Start/End: Original strand, 16961082 - 16961156
Alignment:
Q  179 aaccacgttcttat-taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16961082 aaccatgttcttatctaatagttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 16961156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24367253 - 24367083
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | ||||| |||||| | ||    
T  24367253 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagaga 24367154  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 176  Q
    |||||  || |||||||||||||| || || |  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  24367153 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 19466021 - 19465976
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 51  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466021 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 14377344 - 14377520
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||  |||||||||| || ||| | |  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  14377344 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 14377443  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     || ||| | || ||||||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||    
T  14377444 cttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaactagttagagtataacc 14377520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010976
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggt 100  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || |||||||| ||||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggt 20010976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10386 - 10137
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10386 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 10287  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10286 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttattaattgttttagc 10187  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186 aagtcagtgcatttctcttccctcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 10137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22265 - 22016
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22265 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22166  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22066  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22065 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtgcagagttttt 22016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41173 - 40924
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41173 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 41074  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41073 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttataaattgttttagc 40974  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40973 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 40924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13653
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  13410 ctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtga 13509  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  13510 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 13609  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13610 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaga 13653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11487 - 11238
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11487 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11388  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11387 ttttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 11288  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11287 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttt 11238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17955 - 17706
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17955 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17856  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855 ttttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17756  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17755 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttt 17706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53496
Alignment:
Q  28 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgt 53624  T
Q  128 ctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53623 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccg 53524  T
Q  228 tcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53523 tcgaagaggaaagtggtgcaaagttttt 53496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3442 - 3193
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3442 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 3343  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3342 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 3243  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3242 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcgaagttttt 3193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17178 - 16932
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17178 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtga 17079  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  17078 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaattgttttagc 16979  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16978 aagtcagtgtacttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 16932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36516 - 36270
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36516 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 36417  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36416 ttttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 36317  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36316 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 36270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28850
Alignment:
Q  158 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 28850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3517
Alignment:
Q  120 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 219  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||  ||||||||| | || |||||    
T  3622 tagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcattt 3523  T
Q  220 ctcttc 225  Q
     |||||    
T  3522 ttcttc 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 17352 - 17598
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17352 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 17451  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17452 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17551  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17552 aagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 195124 - 195370
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  195124 ctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtga 195223  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  195224 tttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaactgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtttcagc 195323  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  195324 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 195370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24321 - 24126
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| ||||||||| | |||||    
T  24321 atatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 24222  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    || | ||||  |||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24221 tgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttag 24126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 1318 - 1565
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1318 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 1417  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  1418 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 1517  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1518 aagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgtagagttt 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 29214 - 29460
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29214 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 29313  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29314 ttttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 29413  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 29460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8276 - 8030
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  8276 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtga 8177  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8176 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 8077  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8076 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggatagtggtgcagagtt 8030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10690
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10448 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 10547  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  10548 gagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatattagttgttttagcaagt 10647  T
Q  210 cagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10648 cagtgtatttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 10690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 50631 - 50877
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50631 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 50730  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  50731 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaactggttaaaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 50830  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50831 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 50877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42716 - 42518
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  42716 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 42617  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  42616 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttag 42518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 35001 - 35246
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35001 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 35100  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35101 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 35199  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35200 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 35246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41647 - 41404
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41647 atatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 41548  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  41547 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 41448  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  41447 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtt 41404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 75367 - 75124
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  75367 atatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 75268  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  75267 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 75168  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  75167 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtt 75124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 10524 - 10765
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  10524 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtga 10623  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  10624 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 10723  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 247  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10724 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgca 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 13179 - 13420
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13179 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtga 13278  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  13279 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 13378  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 247  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13379 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgca 13420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31900 - 31656
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31900 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 31801  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31800 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagca 31701  T
Q  207 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| |||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31700 agtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 31656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37366 - 37122
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37366 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 37267  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37266 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagca 37167  T
Q  207 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| |||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 agtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 37122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54652 - 54406
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  54652 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattt 54553  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  54552 tgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 54453  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  54452 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 54406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21622 - 21376
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21622 ctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 21523  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21522 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 21423  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21422 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 21376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37046 - 36800
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37046 ctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 36947  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  36946 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 36847  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36846 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 36800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 37106 - 37352
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37106 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 37205  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  37206 tttcaagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 37305  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37306 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 37352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26367 - 26121
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  26367 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactt 26268  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  26267 tgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataag 26168  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||||| || ||||||||    
T  26167 tcggtatatttttcttctgttaaagaagagagtggggcggagttttt 26121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14203
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14438 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 14339  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  14338 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagt 14239  T
Q  210 cagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 245  Q
    ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  14238 cagtgtatttttcttccgctgaagaggaaagtggtg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4930 - 4714
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||  || ||    
T  4930 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtt 4831  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  4830 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 4731  T
Q  209 tcagtacatttctcttc 225  Q
    |||||| |||| |||||    
T  4730 tcagtatatttttcttc 4714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 44713 - 44932
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  44713 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 44812  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  44813 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 44912  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  44913 aagacggtgcatttttcttc 44932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 39619 - 39838
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  39619 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 39718  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  39719 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 39818  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  39819 aagacggtacatttctcttc 39838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12435
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| || ||| | |||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaag 12479  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12478 tcagtgtatttctcctccgtcaaagaggaaagtggtgcagagtt 12435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10801 - 10555
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10801 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattt 10702  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  10701 tgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 10602  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||  |||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||    
T  10601 tcagtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtagcgtagagttttt 10555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 831 - 1050
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  831 ctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtaggga 930  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || |  ||||||    
T  931 ttttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactactttagc 1030  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  1031 aagacagtgcatttttcttc 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 11642 - 11888
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  11642 ctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtga 11741  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  11742 ttttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 11841  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11842 aagtcagtgtatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgtagagtt 11888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18668 - 18419
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  18668 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtga 18569  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  18568 ttttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 18469  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18468 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 18419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 24998 - 25247
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24998 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtga 25097  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  25098 ttttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagt 25197  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  25198 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 25247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 766 - 973
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  766 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtga 865  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||    
T  866 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaattgtttcagc 965  T
Q  206 aagtcagt 213  Q
    ||||||||    
T  966 aagtcagt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3370
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3619 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 3520  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  3519 ttttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 3420  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  3419 aagtcggtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcagagttttt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14102 - 13865
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||| |||| ||||||    
T  14102 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtga 14003  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  14002 ctttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 13903  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13902 aagtcggtgtatttctcttctgttgaagaggaaagtgg 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8855 - 8791
Alignment:
Q  191 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8855 attaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 8791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 23822 - 24065
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  23822 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattt 23921  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  23922 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 24021  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||| |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24022 tcggtatatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtt 24065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 151582 - 151339
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | ||| || ||||||||||||||| | ||  |    
T  151582 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacat 151483  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||| | || ||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  151482 tgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 151383  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
     | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  151382 acggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 151339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 24234 - 24480
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24234 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 24333  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |   || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  24334 taggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaa 24433  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  24434 tcggtgtatttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagttttt 24480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 10058 - 10260
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | ||| || |||||||||||| || | ||    
T  10058 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagaga 10157  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  10158 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 10257  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  10258 aag 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8241 - 7992
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8241 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8142  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  8141 ttttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 8042  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8041 aattctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 7992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 111196 - 111442
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  111196 atatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattt 111295  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  111296 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 111395  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  111396 tcggtgtatttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagttttt 111442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17893 - 17700
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  17893 atatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactt 17794  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 202  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  17793 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgtttt 17700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 104242 - 103996
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  104242 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 104143  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  104142 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaag 104043  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  104042 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 103996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8968 - 8719
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  8968 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtga 8869  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  8868 ttttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 8769  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  8768 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagatttttt 8719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17915
Alignment:
Q  105 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  205 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
     ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagatttttt 17915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 152099 - 151850
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  152099 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 152000  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  151999 ttttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 151900  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  151899 aagtcggtgtatttcgcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 151850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Original strand, 47272 - 47498
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  || | |||||||||||||| |||||||||    
T  47272 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagg-ttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattt 47370  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |                  ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  47371 tgaaattgatttggtttgtctacctttgaat------------------ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaag 47452  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttt 254  Q
    ||| |  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47453 tcaatgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttt 47498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 30860 - 30935
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30860 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatg 30935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 210
Target Start/End: Original strand, 1907 - 1995
Alignment:
Q  122 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtc 210  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 1995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 208
Target Start/End: Original strand, 164767 - 164889
Alignment:
Q  86 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 185  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |  | |||||||| ||| |||| ||||  || || ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  164767 ttgtctatgtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 164866  T
Q  186 ttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  164867 ttcatatcaattgttttagcaag 164889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 781
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||    
T  1000 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtga 901  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| || || || |||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  900 ttttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 801  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  800 aagtcagtgtatttctcttc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 651
Alignment:
Q  128 ctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctg 679  T
Q  228 tcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
       ||||||| ||||| |||||||||||    
T  678 ctaaagaggagagtggcgcagagttttt 651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6888 - 6645
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6888 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 6789  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  6788 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 6689  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||    
T  6688 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagtt 6645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14018 - 13775
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14018 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 13919  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  13918 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 13819  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||    
T  13818 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagtt 13775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6128 - 5885
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  6128 atatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgt 6029  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  6028 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaag 5929  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  5928 tcggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagtt 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15140 - 14922
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| | |  || || |||||||||||| || | |||    
T  15140 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagat 15041  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 206  Q
    |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |    
T  15040 tttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagta 14941  T
Q  207 agtcagtacatttctcttc 225  Q
    || | || ||||| |||||    
T  14940 agacggtgcatttttcttc 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4449 - 4203
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4449 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 4350  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  4349 tgagatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 4250  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4249 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttttt 4203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 32 - 1
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32 atatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 13768 - 14002
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || | ||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  13768 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattt 13867  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  13868 taaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 13967  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    |||||  |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  13968 tcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtgg 14002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 200
Target Start/End: Original strand, 11166 - 11360
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11166 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 11265  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 200  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  11266 ttttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 55759 - 56005
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55759 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 55858  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
      |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  55859 ctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 55958  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  55959 tcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagttttt 56005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 496035 - 495792
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  496035 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattt 495936  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  495935 ttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 495836  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  495835 tcggtttatttttcttcttctgaagatgaaagtggcgcagagtt 495792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 441668 - 441507
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  441668 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 441569  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggt 170  Q
    | | || ||||| |||||| | |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  441568 ttagattgatttggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattcttggtatgaattggt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 514639 - 514808
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  514639 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 514738  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagag 175  Q
    |||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  514739 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 204
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452697
Alignment:
Q  158 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttag 452697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 1
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  159 ctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatga 60  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  59 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 14555 - 14789
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14555 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 14654  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  14655 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 14754  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    |  ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  14755 ttggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtgg 14789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 216709 - 216943
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  216709 atatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattt 216808  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  216809 taaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 216908  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    || ||  |||| ||||| |  |||| |||||||||    
T  216909 tcggtgtatttttcttctgctgaagcggaaagtgg 216943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4598 - 4355
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| | | | |||||||||||||||| || ||||||    
T  4598 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattt 4499  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  4498 tgaaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 4399  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||    
T  4398 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagttgcgcagagtt 4355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Original strand, 664 - 901
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  664 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 763  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||     
T  764 ttttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgttatagt 863  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 243  Q
    ||||| ||  ||||||||||    ||||||||||||||    
T  864 aagtcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtgg 901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 2549 - 2726
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2549 ctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 2648  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 183  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  2649 ttttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaacca 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 40796 - 41040
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||  ||||||||| || ||||||    
T  40796 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaatatgtccttt--ctatgtttgatcctgattt 40893  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||    
T  40894 tgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaaatgttttagtaag 40993  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  40994 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagttttt 41040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 17635 - 17878
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17635 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctt-gtctatgtttgatcgtga 17733  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     ||| ||||  |||||||||| |||     
T  17734 ttttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgttatagt 17828  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  17829 aagtcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 17878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40076 - 39855
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  40076 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 39977  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  39976 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgctttagt 39877  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccg 227  Q
    ||| | || ||||| |||||||    
T  39876 aagacggtgcatttttcttccg 39855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Original strand, 8065 - 8217
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctc--tcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  8065 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgt 8164  T
Q  104 gattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8165 gattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 4179 - 4394
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | ||| |  ||||||||||||||| | || | |    
T  4179 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagagaatat 4278  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||  |||| ||| |||| || |  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||     
T  4279 gaagtagaaatagtatgtttaccgttaaagggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaaga 4378  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    | ||||| || |||||    
T  4379 cggtacacttttcttc 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8276
Alignment:
Q  125 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  225 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagttttt 8276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 15268 - 15511
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||  ||||| |||||||||||| |  ||||    
T  15268 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattt 15367  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| || ||||    
T  15368 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaag 15467  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  15468 tcagtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagtt 15511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15437 - 15258
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||||    
T  15437 atatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattt 15338  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttc 188  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15337 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttc 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15526
Alignment:
Q  105 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttag 15478  T
Q  205 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15479 caagtcggtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 15526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 57903 - 58062
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  57903 atatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 58002  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 168  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  58003 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaactg 58062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 23587 - 23830
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  23587 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattt 23686  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| || ||||    
T  23687 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaag 23786  T
Q  209 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    || ||  |||| ||||| |||||| | || ||||| ||||||||    
T  23787 tcggtgtatttttcttctgtcgaataagagagtggagcagagtt 23830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 9640 - 9831
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  9640 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 9739  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 200  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  9740 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgtt 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9709
Alignment:
Q  152 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  252 tttt 255  Q
    ||||    
T  9712 tttt 9709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7254 - 7141
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  7254 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtga 7155  T
Q  106 ttttgaaatggatt 119  Q
    ||||||||||||||    
T  7154 ttttgaaatggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5103 - 4911
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |  || |||||||| ||||||||||| || ||    
T  5103 atatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactt 5004  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 201  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  5003 tgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttt 4911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1221
Alignment:
Q  50 tcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatg 149  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  150 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | |||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtaga 1227  T
Q  250 gttttt 255  Q
    ||||||    
T  1226 gttttt 1221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 3566 - 3521
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3566 atatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2004 - 1865
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2004 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 1905  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 148  Q
    ||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1904 tgagattgatatggtttgtttacctttgagcggtatggat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 252
Target Start/End: Original strand, 12577 - 12746
Alignment:
Q  83 cctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12577 cctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtacaacc 12676  T
Q  183 acgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |  ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12677 atgttcatattaattgttttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtt 12746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 601
Alignment:
Q  127 tctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttcc 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  227 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 60757 - 60521
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  60657 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 60558  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 242  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| |||||||    
T  60557 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaagtg 60521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 70126 - 70081
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 51  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70126 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 70081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 141 - 342
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||  | ||||||||||||||| | ||    
T  141 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagaga 240  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  241 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatattaattgctttagc 340  T
Q  206 aa 207  Q
    ||    
T  341 aa 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1345
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  1169 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 1268  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     |||||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  1269 ctttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8428 - 8329
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8428 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11978 - 11759
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| |  |    
T  11978 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagata 11879  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||  | ||| | |||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  11878 ctttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 11779  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  11778 aagacggtacatttttcttc 11759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20832 - 20586
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20832 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 20733  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  20732 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 20633  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  20632 aagacagtgcatttttcttctgcggaacaagaaagtggagcagagtt 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 773 - 971
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| || | ||    
T  773 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagaga 872  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | || |||||| || | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  873 ctttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2889 - 2668
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  2889 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 2790  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  2789 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 2690  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccg 227  Q
    ||| | || ||||| |||||||    
T  2689 aagacggtgcatttttcttccg 2668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 252
Target Start/End: Original strand, 1 - 104
Alignment:
Q  149 gtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  249 agtt 252  Q
    ||||    
T  101 agtt 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2014 - 1819
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||    
T  2014 atatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 1915  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    || | || | ||||| ||  | || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  1914 tgcagtgaacttagtctgcttgccattcagtgggatggatgtgatactaggtataaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 200758 - 200973
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  || |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  200758 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 200857  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||     
T  200858 gaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaaga 200957  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    | || ||||| |||||    
T  200958 cggtgcatttttcttc 200973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 325725 - 325506
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | ||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  325725 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagaga 325626  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||||||     
T  325625 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattattttaga 325526  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  325525 aagacggtgcatttttcttc 325506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 355
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  601 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 502  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  501 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagc 402  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  401 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 21475 - 21613
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || || || || ||||||||||| || |||    
T  21475 tatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagacttt 21574  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 148  Q
    ||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21575 gaagttgatttagtttgtttgcctttgagtggaatggat 21613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 63805 - 64003
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  63805 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 63904  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  63905 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 64003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 959 - 819
Alignment:
Q  85 tttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccac 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||     
T  959 tttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatacaaccat 860  T
Q  185 gttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    || |  ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||    
T  859 gtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 98872 - 99088
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||  | ||||||||||||||| | || ||    
T  98872 atatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactt 98971  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  98972 tgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 99071  T
Q  209 tcagtacatttctcttc 225  Q
     | || ||||| |||||    
T  99072 acggtgcatttttcttc 99088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 176006 - 175787
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  176006 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 175907  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| | || |  |||| ||| |||||||||||     
T  175906 ttttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagaataatcgtgttcatatcaattgttttagt 175807  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  175806 aagacgatacatttttcttc 175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11827 - 11608
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  11827 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 11728  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  11727 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 11628  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  11627 aagacggtacatttctcttc 11608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 53709 - 53928
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  53709 ctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 53808  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  53809 ctttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 53908  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  53909 aagacggtgcatttttcttc 53928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 94180 - 94427
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  94180 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 94279  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| |||||||| || ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  94280 ttttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatataaccgagtctgtattaattgttttaac 94379  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 253  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||    
T  94380 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggggcagagttt 94427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 115580 - 115460
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||    
T  115580 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtaggga 115481  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttg 126  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  115480 ttttgaagtagatttagtttg 115460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1125
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055 ctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29545 - 29347
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  29545 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 29446  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||  | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  29445 ctttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttag 29347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 252
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6619
Alignment:
Q  122 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttct 6588  T
Q  222 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    |||| |  |||||||||||||| | ||||||    
T  6589 cttctgctgaagaggaaagtggcgtagagtt 6619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 424326 - 424266
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424326 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 203399 - 203294
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  203399 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 203300  T
Q  106 ttttga 111  Q
    ||||||    
T  203299 ttttga 203294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 1558 - 1777
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  1558 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 1657  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||     
T  1658 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagt 1757  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  1758 aagacgatacatttttcttc 1777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 4379 - 4594
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  4379 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagacttt 4478  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| | || ||| | || ||||  ||| ||||||| || || || |||||||||||||| || ||||  |||| ||| || |||||||| |||     
T  4479 gaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatccttgggatgaactggttagaatataaccgtgttcatatcaactgttttagtaaga 4578  T
Q  210 cagtacatttctcttc 225  Q
    | ||||||||||||||    
T  4579 cggtacatttctcttc 4594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 28571 - 28790
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  28571 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 28670  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||     
T  28671 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagt 28770  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  28771 aagacgatacatttttcttc 28790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 3456 - 3627
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||    
T  3456 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggga 3555  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    ||||||| | || ||||||||  ||||  |||  || |||||||||||  | || ||||| |||||||||||    
T  3556 ttttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagta 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 43705 - 43924
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||| |  |    
T  43705 ctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagata 43804  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||  |||||     
T  43805 ctttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaatttctttagt 43904  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  43905 aagacagtgcatttttcttc 43924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25015
Alignment:
Q  24 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || |||||||  || || |||||||||| |||| | ||||||||  |  | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  124 ttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctct 223  Q
    |||| |||| ||||  || |||||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagaccgtgcatttttct 25017  T
Q  224 tc 225  Q
    ||    
T  25016 tc 25015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 110628 - 110409
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  110628 ctgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 110529  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| |  |  |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  110528 ctttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 110429  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  110428 aagacggtgcatttttcttc 110409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 263244 - 263025
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  263244 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 263145  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  263144 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 263045  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  263044 aagacggtacatttttcttc 263025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 1597 - 1795
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  1597 ctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 1696  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  1697 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6854
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  7056 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 6957  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  6956 ctttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 6857  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  6856 aag 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11844 - 11630
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11844 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagatttt 11745  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 209  Q
    ||| | ||| | || ||| | |  |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||     
T  11744 gaagttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaaga 11645  T
Q  210 cagtacatttctctt 224  Q
    |||| ||||| ||||    
T  11644 cagtgcatttttctt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7762 - 7564
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  7762 ctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 7663  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  7662 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 7564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26130 - 25928
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  26130 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 26031  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||| |    
T  26030 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtttgtataaattgttttaac 25931  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  25930 aag 25928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29642 - 29440
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  29642 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 29543  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  ||| |||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  29542 ctttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 29443  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  29442 aag 29440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 49466 - 49664
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  49466 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 49565  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  49566 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 49664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 58500 - 58698
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  58500 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 58599  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  58600 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 58698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 64888 - 65086
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  64888 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 64987  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  64988 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 65086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 58 - 1
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 8748 - 8961
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  8748 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 8847  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||||| || ||| | || || |||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  8848 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagc 8947  T
Q  206 aagtcagtacattt 219  Q
    ||| |||| |||||    
T  8948 aagacagtgcattt 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 18962 - 19175
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  18962 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 19061  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||||| || ||| | || || |||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19062 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagc 19161  T
Q  206 aagtcagtacattt 219  Q
    ||| |||| |||||    
T  19162 aagacagtgcattt 19175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 8028 - 8117
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  8028 atattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5620 - 5392
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||  | |||||||  || || ||||||||||||||| | ||    
T  5620 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagaga 5521  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| |  || |||| ||| | || |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  5520 ctttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 5421  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 234  Q
    ||| | |||||||| ||||| || |||||    
T  5420 aagacggtacatttttcttctgttgaaga 5392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 251640 - 251464
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  251640 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 251541  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     |||| | | ||| |||||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  251540 ctttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 251464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 252
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28027
Alignment:
Q  177 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagtt 28027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 919
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  1138 ctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 1039  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  1038 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 939  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  938 aagacggtgcatttttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50123 - 49904
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  50123 ctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 50024  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| | |||||  |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||     
T  50023 ctttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagtataaccaagttcatatcaattgctttagt 49924  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  49923 aagacggtgcatttttcttc 49904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 65584 - 65803
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || ||| | || ||||||||| | ||    
T  65584 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagaga 65683  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||| | || ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| || |  |||| ||| ||||| |||||     
T  65684 ttttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagt 65783  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  65784 aagacggtacatttttcttc 65803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 49163 - 49382
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |  ||||||||||||||| | ||    
T  49163 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 49262  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||| |||| | | | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  49263 ctttgaagtcgatctagtatatttgccgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 49362  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  49363 aagacagtgcatttttcttc 49382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 83824 - 84035
Alignment:
Q  23 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 122  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  83824 atggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 83923  T
Q  123 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 222  Q
    | ||  | || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||  |||  ||| | ||||  |||||||||||||| ||| |||| | ||| ||    
T  83924 tctgcttgccgttaagtgggatggatgtgaaactaggaatgaactggttgaagtttaactatgttcacattaattgttttagaaagacagtgcgtttttc 84023  T
Q  223 ttccgtcgaaga 234  Q
    ||| ||||||||    
T  84024 ttctgtcgaaga 84035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 48683 - 48651
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48683 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14929 - 14873
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 62  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14929 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 5135 - 5311
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  5135 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 5234  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  5235 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 5311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 17770 - 17941
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |   | |  ||| ||||||||||| | ||    
T  17770 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagaga 17869  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || || || |||||||||||    
T  17870 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaattggttagagta 17941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 10072 - 10291
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||||||| | ||    
T  10072 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 10171  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  10172 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 10271  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  10272 aagacggtacatttttcttc 10291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1316
Alignment:
Q  7 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgat 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||     
T  1141 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagac 1240  T
Q  107 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||| | || ||||| ||| |||| ||||   | |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  1241 tttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36957 - 36786
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  36957 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 36858  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||| ||||||||    
T  36857 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatatttttgggatgaactgtttagagta 36786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54065 - 53846
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  54065 ctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 53966  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||||    
T  53965 cttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatctattgttttagc 53866  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  53865 aagacggtgcatttttcttc 53846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 2238 - 2441
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||  | ||||||||||||||| | ||    
T  2238 ctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagaga 2337  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtga-ttctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 204  Q
     |||||| | || ||||||||| |||  ||||  | ||||||||| | || || | ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  2338 ctttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 2437  T
Q  205 caag 208  Q
    ||||    
T  2438 caag 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 70390 - 70214
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  70390 ctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 70291  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  70290 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 70214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 4590 - 4660
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 76  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  4590 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4755
Alignment:
Q  140 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 4755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 41398 - 41563
Alignment:
Q  10 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatttt 109  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |  || ||||| |||||||||   ||||||    
T  41398 tatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttctttattatgcttgaagtatcc-ttgtcgatgtttggtatagatttt 41496  T
Q  110 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 176  Q
    | | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  41497 gtagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggcatgaactggttggagt 41563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5823 - 5692
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||| | | ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  5823 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 5724  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttga 137  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  5723 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5550
Alignment:
Q  88 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtt 187  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggtt 5588  T
Q  188 cttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  5587 catatcaattgctttagcaagacagtgcatttttcttc 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12745 - 12601
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  12745 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggtagaga 12646  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 150  Q
     ||||||||  || | |||||| | || ||||  |||||||||||    
T  12645 ctttgaaatcaatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgt 12601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 479 - 303
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  479 ctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 380  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  379 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21869 - 21693
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  || ||| | |||||||| ||| | ||    
T  21869 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtaggga 21770  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    ||||||  | || ||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||    
T  21769 ttttgaggtagacttagtttgtttaccgctgacgggaatggatgttatttttgggattaattggttagagtataacc 21693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 120 - 339
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| || ||||||   || ||| | |||||||||| | | ||    
T  120 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttaggga 219  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     ||||   |||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || || |||||     
T  220 ctttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 319  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  320 aagacggtacatttttcttc 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 137
Target Start/End: Original strand, 1101 - 1232
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | ||| || ||||||||||||||| | ||    
T  1101 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 1200  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttga 137  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  1201 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8632 - 8413
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  8632 ctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 8533  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | || ||||| ||| | || ||||   |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  8532 ttttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 8433  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  8432 aagacggtgcatttttcttc 8413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 20814 - 21014
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  20814 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20913  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||  ||    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  20914 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgtt--gtctcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 21011  T
Q  206 aag 208  Q
    |||    
T  21012 aag 21014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12834
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | || ||    
T  12637 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactt 12736  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 208  Q
    |||| | ||  |||||||| |||| ||  ||    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  12737 tgaagtcgacctagtttgtttaccgtt--gtctcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 12834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22140 - 21921
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||    
T  22140 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 22041  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    ||||||  | |||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  22040 ttttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 21941  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  21940 aagacggtgcatttttcttc 21921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 252
Target Start/End: Original strand, 9533 - 9758
Alignment:
Q  26 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagttt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||| | ||  || || | || |||||||    
T  9533 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacattaaagtcgacttagttt 9632  T
Q  126 gtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    || |||| ||||  || |||||||| ||| |  | |||||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  9633 gtttaccgttgacggg-atggatgttattttttggatgaactggttagaatataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 9731  T
Q  226 cgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
     |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  9732 tgcggaagaagaaagtggagcagagtt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5199 - 5023
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| || ||| | |  || || ||||| ||||||||| | ||    
T  5199 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagaga 5100  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  5099 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataacc 5023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 5431 - 5607
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||  || || |||| |||||||||| | ||    
T  5431 ctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagaga 5530  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    |||||   | |||||||||||| | || |||    |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  5531 ttttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 5607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1739 - 1568
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||||  |  ||  |||||||||||||| | ||    
T  1739 ctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagaga 1640  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || || |  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  1639 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41753 - 41534
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   || ||  | || ||||||||| | ||    
T  41753 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggga 41654  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  41653 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 41554  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  41553 aagacggtacatttctcttc 41534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Original strand, 30612 - 30706
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggt 100  Q
    |||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||    
T  30612 ctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 30706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 67396 - 67498
Alignment:
Q  8 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatt 107  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||   || ||| | |||||||||||| | ||||    
T  67396 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagatt 67495  T
Q  108 ttg 110  Q
    |||    
T  67496 ttg 67498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 5498 - 5671
Alignment:
Q  9 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 108  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  || |  ||||||||||||||| | || ||    
T  5498 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactt 5597  T
Q  109 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
    | || | || ||||| ||| |||| ||||  ||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  5598 taaagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatggatattatttttgggatgaactggttagagtataacc 5671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6603
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 66  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6543 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1227 - 991
Alignment:
Q  8 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtgatt 107  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||        |||||||| || ||| | | ||| |  ||||||||||||||| | || |    
T  1227 gatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagact 1136  T
Q  108 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 207  Q
    ||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||    
T  1135 ttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagcaa 1036  T
Q  208 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    | | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  1035 gacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8544
Alignment:
Q  133 tttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 218  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8459 tttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttagtaagacggtacatt 8544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34355 - 34136
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||| || ||| | |  || || |||||||||||||||   ||    
T  34355 ctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaaga 34256  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 205  Q
     |||||| | ||  |||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||  ||||||    
T  34255 ctttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtacaatcgagttcatatcaattactttagc 34156  T
Q  206 aagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  34155 aagacggtgcatttttcttc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29952 - 29781
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  29952 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 29853  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 177  Q
    |||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||    
T  29852 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 255
Target Start/End: Original strand, 231 - 312
Alignment:
Q  174 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 255  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttt 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10819
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgccctttgtctatgtttggtcgtga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||   || ||| | |||||||||||| | ||    
T  10995 ctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtaggga 10896  T
Q  106 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 182  Q
     ||||   | |||||||||||  | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  10895 ctttgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 10819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 35
Target Start/End: Original strand, 15865 - 15894
Alignment:
Q  6 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5421
Alignment:
Q  159 gtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 252  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagtt 5421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51696 - 51611
Alignment:
Q  140 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 225  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  51696 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttattaagactgtacatttttcttc 51611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University