View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_49 (Length: 415)

Name: NF7829A_low_49
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_49
NF7829A_low_49
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (41-400)||(8296085-8296444)
chr3 (41-397)||(15740883-15741239)
chr3 (41-400)||(6192429-6192788)
chr3 (41-400)||(15892492-15892851)
chr3 (41-400)||(4796439-4796798)
chr3 (41-400)||(8301053-8301412)
chr3 (41-396)||(18330782-18331137)
chr3 (41-400)||(29148541-29148900)
chr3 (41-396)||(35880879-35881234)
chr3 (41-396)||(22387368-22387723)
chr3 (41-400)||(4721744-4722103)
chr3 (41-399)||(7073325-7073683)
chr3 (42-400)||(18051376-18051734)
chr3 (41-399)||(28021388-28021746)
chr3 (41-399)||(18276839-18277197)
chr3 (41-399)||(18307441-18307799)
chr3 (41-399)||(28115741-28116099)
chr3 (41-399)||(48466040-48466398)
chr3 (41-399)||(4346474-4346832)
chr3 (41-399)||(18292140-18292498)
chr3 (41-399)||(20576634-20576992)
chr3 (41-399)||(36996864-36997222)
chr3 (41-399)||(8211851-8212209)
chr3 (41-399)||(11110136-11110494)
chr3 (56-399)||(4417047-4417390)
chr3 (41-399)||(21674806-21675164)
chr3 (41-399)||(29664757-29665115)
chr3 (41-399)||(51782136-51782494)
chr3 (41-399)||(10396246-10396604)
chr3 (41-399)||(5467098-5467456)
chr3 (41-399)||(5609109-5609467)
chr3 (41-399)||(18242852-18243210)
chr3 (41-399)||(5596144-5596502)
chr3 (41-399)||(22870643-22871001)
chr3 (41-399)||(22885702-22886060)
chr3 (41-399)||(31964260-31964618)
chr3 (41-399)||(6542249-6542607)
chr3 (41-399)||(28339415-28339773)
chr3 (41-399)||(18225304-18225662)
chr3 (41-399)||(7996675-7997033)
chr3 (41-399)||(10643183-10643541)
chr3 (41-399)||(17984743-17985101)
chr3 (41-399)||(24328272-24328630)
chr3 (41-399)||(5013825-5014183)
chr3 (41-399)||(47023566-47023924)
chr3 (41-372)||(31033931-31034262)
chr3 (41-372)||(32292865-32293196)
chr3 (41-277)||(51797226-51797462)
chr3 (41-339)||(17993631-17993929)
chr3 (41-400)||(18530501-18530860)
chr3 (41-267)||(50133990-50134216)
chr3 (41-400)||(16626292-16626651)
chr3 (41-390)||(5652500-5652849)
chr3 (41-339)||(5713340-5713638)
chr3 (41-339)||(5724250-5724548)
chr3 (41-339)||(5767820-5768118)
chr3 (41-261)||(5757007-5757227)
chr3 (41-339)||(4626057-4626355)
chr3 (41-190)||(32439267-32439416)
chr3 (41-190)||(20066156-20066305)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (41-400)||(27608609-27608968)
chr8 (41-400)||(14557776-14558135)
chr8 (41-400)||(2136963-2137322)
chr8 (41-400)||(19688250-19688609)
chr8 (41-400)||(16277706-16278065)
chr8 (53-400)||(16283613-16283960)
chr8 (56-399)||(19674608-19674951)
chr8 (41-399)||(29829474-29829832)
chr8 (41-399)||(3329212-3329570)
chr8 (41-399)||(19286614-19286972)
chr8 (41-399)||(31354676-31355034)
chr8 (41-399)||(31489455-31489813)
chr8 (41-399)||(9354774-9355133)
chr8 (41-399)||(12092429-12092787)
chr8 (41-399)||(19208065-19208423)
chr8 (41-399)||(28361660-28362018)
chr8 (41-399)||(33258875-33259233)
chr8 (51-318)||(189256-189523)
chr8 (41-372)||(18710738-18711069)
chr8 (281-400)||(18791099-18791218)
chr8 (41-390)||(19658754-19659102)
chr8 (41-339)||(22080643-22080941)
chr8 (41-372)||(44563253-44563582)
chr8 (41-390)||(33244817-33245166)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (41-400)||(2154726-2155085)
chr7 (41-400)||(10916499-10916858)
chr7 (41-400)||(16518047-16518406)
chr7 (41-400)||(16503011-16503370)
chr7 (41-396)||(11424412-11424766)
chr7 (41-396)||(5128145-5128500)
chr7 (41-399)||(26435410-26435768)
chr7 (41-399)||(26537502-26537860)
chr7 (41-399)||(3445459-3445817)
chr7 (41-399)||(5146972-5147330)
chr7 (41-399)||(4144755-4145113)
chr7 (41-399)||(24592173-24592531)
chr7 (41-399)||(31564022-31564380)
chr7 (56-399)||(16736092-16736435)
chr7 (56-399)||(16751146-16751489)
chr7 (56-399)||(17523700-17524043)
chr7 (56-399)||(17529172-17529515)
chr7 (41-399)||(45387496-45387854)
chr7 (41-357)||(11441725-11442041)
chr7 (41-399)||(26274726-26275084)
chr7 (41-399)||(26319501-26319859)
chr7 (41-399)||(26669546-26669904)
chr7 (41-399)||(9618804-9619162)
chr7 (41-399)||(31125073-31125431)
chr7 (41-400)||(16449629-16449988)
chr7 (41-400)||(16041476-16041835)
chr7 (41-372)||(26484847-26485178)
chr7 (41-372)||(39210682-39211013)
chr7 (41-339)||(4200700-4200998)
chr7 (41-372)||(2775512-2775843)
chr7 (41-372)||(2108664-2108995)
chr7 (237-399)||(26513130-26513292)
chr7 (41-372)||(26682659-26682990)
chr7 (41-339)||(45733613-45733911)
chr7 (41-339)||(31088156-31088454)
chr7 (41-190)||(18540952-18541101)
chr7 (41-177)||(5159672-5159808)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (41-400)||(27290058-27290417)
chr6 (41-400)||(15424005-15424364)
chr6 (41-400)||(24304306-24304665)
chr6 (41-400)||(24863866-24864225)
chr6 (41-400)||(26989150-26989510)
chr6 (41-400)||(22934568-22934927)
chr6 (41-400)||(23857013-23857372)
chr6 (41-399)||(16750003-16750361)
chr6 (41-396)||(26918529-26918884)
chr6 (41-400)||(13298639-13298998)
chr6 (41-399)||(29549624-29549982)
chr6 (41-400)||(27272268-27272627)
chr6 (41-399)||(3696230-3696588)
chr6 (41-399)||(4545464-4545822)
chr6 (41-399)||(34463035-34463393)
chr6 (41-399)||(16674288-16674646)
chr6 (41-399)||(4723823-4724181)
chr6 (41-399)||(27485278-27485636)
chr6 (41-399)||(29501564-29501922)
chr6 (41-399)||(4525435-4525793)
chr6 (41-399)||(4757913-4758271)
chr6 (41-399)||(4773155-4773513)
chr6 (41-399)||(27044536-27044895)
chr6 (41-399)||(27007876-27008234)
chr6 (41-399)||(29573162-29573520)
chr6 (41-400)||(27359680-27360039)
chr6 (41-400)||(27450023-27450382)
chr6 (41-399)||(30557705-30558063)
chr6 (41-399)||(28207603-28207961)
chr6 (41-399)||(16943716-16944074)
chr6 (41-399)||(26116099-26116457)
chr6 (41-399)||(26777299-26777662)
chr6 (217-399)||(27019461-27019643)
chr6 (41-390)||(14142983-14143332)
chr6 (41-390)||(26788093-26788442)
chr6 (41-390)||(27196466-27196815)
chr6 (41-390)||(27252425-27252774)
chr6 (41-273)||(17025426-17025658)
chr6 (41-372)||(13521789-13522120)
chr6 (41-390)||(22456641-22456981)
chr6 (41-221)||(27000222-27000402)
chr6 (41-339)||(8892060-8892357)
chr6 (41-339)||(8903295-8903592)
chr6 (41-261)||(33374083-33374303)
chr6 (41-339)||(28162806-28163104)
chr6 (98-399)||(17092129-17092430)
chr6 (41-121)||(22477240-22477320)
chr6 (56-222)||(20160865-20161031)
chr6 (56-222)||(22171800-22171966)
chr6 (77-258)||(27629530-27629711)
chr6 (347-399)||(27629389-27629441)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (41-400)||(14665185-14665544)
chr4 (41-400)||(17014167-17014526)
chr4 (41-400)||(24592059-24592418)
chr4 (41-399)||(36344261-36344619)
chr4 (41-399)||(14763050-14763408)
chr4 (41-399)||(6570020-6570378)
chr4 (41-399)||(18800359-18800717)
chr4 (41-399)||(33673544-33673902)
chr4 (41-399)||(39850805-39851163)
chr4 (41-399)||(30753921-30754279)
chr4 (41-399)||(5006040-5006398)
chr4 (41-399)||(54833554-54833912)
chr4 (41-399)||(14098708-14099066)
chr4 (41-399)||(21969868-21970226)
chr4 (41-399)||(31126264-31126622)
chr4 (41-399)||(40105384-40105742)
chr4 (41-399)||(27163063-27163421)
chr4 (41-399)||(1900424-1900782)
chr4 (41-400)||(15228037-15228396)
chr4 (41-400)||(15284673-15285032)
chr4 (41-339)||(24460411-24460709)
chr4 (41-339)||(15391144-15391442)
chr4 (41-285)||(14235385-14235629)
chr4 (41-190)||(34188915-34189064)
chr4 (41-190)||(24112829-24112978)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (41-400)||(27434178-27434537)
chr2 (41-400)||(28882362-28882721)
chr2 (41-400)||(20838066-20838425)
chr2 (41-400)||(23128300-23128659)
chr2 (41-400)||(12655690-12656049)
chr2 (41-399)||(12586958-12587316)
chr2 (41-399)||(27777370-27777728)
chr2 (41-399)||(27817128-27817486)
chr2 (41-399)||(37375309-37375667)
chr2 (41-399)||(13936279-13936637)
chr2 (41-399)||(40233659-40234017)
chr2 (41-399)||(12716337-12716695)
chr2 (41-399)||(27803855-27804213)
chr2 (41-399)||(260488-260846)
chr2 (41-399)||(39051557-39051915)
chr2 (56-399)||(11634921-11635264)
chr2 (56-399)||(11641110-11641453)
chr2 (41-399)||(39890222-39890580)
chr2 (41-399)||(21676917-21677275)
chr2 (41-399)||(32049946-32050304)
chr2 (41-399)||(16829073-16829431)
chr2 (41-399)||(16892050-16892408)
chr2 (41-399)||(34861828-34862186)
chr2 (41-399)||(37685644-37686002)
chr2 (41-399)||(37700909-37701267)
chr2 (41-399)||(37925641-37925999)
chr2 (41-399)||(19416234-19416592)
chr2 (41-399)||(34286502-34286860)
chr2 (41-399)||(34291562-34291920)
chr2 (41-400)||(31876429-31876788)
chr2 (41-399)||(9349717-9350075)
chr2 (41-400)||(21702898-21703257)
chr2 (41-400)||(19456155-19456514)
chr2 (41-339)||(34303098-34303396)
chr2 (41-390)||(27118836-27119185)
chr2 (41-372)||(22925790-22926121)
chr2 (41-174)||(27393117-27393250)
chr2 (41-339)||(3784802-3785100)
chr2 (41-372)||(16163747-16164081)
chr2 (41-339)||(34157159-34157456)
chr2 (41-142)||(34279597-34279698)
chr2 (41-339)||(31891123-31891421)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (41-400)||(22998756-22999115)
chr5 (41-400)||(23717630-23717989)
chr5 (41-400)||(24687799-24688158)
chr5 (41-397)||(23752095-23752451)
chr5 (41-396)||(11549515-11549870)
chr5 (41-400)||(30934794-30935153)
chr5 (41-400)||(24970179-24970538)
chr5 (41-397)||(33777648-33778004)
chr5 (41-400)||(15658402-15658761)
chr5 (41-399)||(18500373-18500731)
chr5 (41-399)||(28649396-28649754)
chr5 (41-399)||(13324472-13324830)
chr5 (41-399)||(31826050-31826408)
chr5 (41-399)||(3789702-3790060)
chr5 (41-399)||(24681601-24681959)
chr5 (41-399)||(24724128-24724486)
chr5 (41-399)||(43078413-43078771)
chr5 (41-399)||(8665118-8665476)
chr5 (41-399)||(2511212-2511570)
chr5 (41-399)||(6874466-6874824)
chr5 (41-399)||(15758500-15758858)
chr5 (41-399)||(34616679-34617037)
chr5 (41-400)||(18375054-18375413)
chr5 (41-399)||(31431601-31431959)
chr5 (41-399)||(37755141-37755499)
chr5 (41-399)||(12132316-12132674)
chr5 (41-399)||(37358286-37358644)
chr5 (41-399)||(40473192-40473550)
chr5 (41-399)||(9317612-9317970)
chr5 (41-399)||(23892367-23892725)
chr5 (41-399)||(30152179-30152537)
chr5 (41-399)||(37671126-37671484)
chr5 (41-399)||(32599115-32599473)
chr5 (41-399)||(33516517-33516875)
chr5 (41-399)||(37770630-37770988)
chr5 (41-399)||(28959429-28959787)
chr5 (41-399)||(5638071-5638429)
chr5 (41-399)||(30029576-30029934)
chr5 (41-390)||(29888734-29889083)
chr5 (41-399)||(30168630-30168988)
chr5 (41-399)||(26480553-26480910)
chr5 (41-399)||(41674870-41675228)
chr5 (41-400)||(22888631-22888990)
chr5 (41-339)||(9548246-9548544)
chr5 (41-315)||(29966793-29967067)
chr5 (41-400)||(25199190-25199549)
chr5 (41-372)||(33877408-33877739)
chr5 (41-339)||(11325955-11326253)
chr5 (41-338)||(13184352-13184649)
chr5 (41-339)||(13440197-13440495)
chr5 (41-176)||(33292686-33292821)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (41-400)||(39814-40173)
scaffold0089 (41-400)||(46730-47089)
scaffold0089 (44-400)||(29918-30274)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (41-400)||(27444-27804)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (41-400)||(30604-30964)
scaffold0124 (41-232)||(20540-20730)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (41-399)||(6165-6524)
scaffold0415 (41-232)||(1831-2021)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (41-400)||(51638369-51638728)
chr1 (41-399)||(10962821-10963179)
chr1 (41-399)||(41793054-41793412)
chr1 (41-399)||(28585132-28585490)
chr1 (41-400)||(16207776-16208135)
chr1 (41-372)||(28152013-28152344)
chr1 (41-400)||(20340080-20340439)
chr1 (41-400)||(20461232-20461591)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (41-399)||(8812-9170)
scaffold0159 (41-399)||(20167-20526)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (41-399)||(9718-10076)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (41-399)||(25947-26305)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (41-400)||(14675-15034)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (41-399)||(6985-7343)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (41-399)||(8101-8459)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (77-394)||(46545-46872)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (41-273)||(1-233)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (41-400)||(2403-2762)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (41-380)||(383-722)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (41-168)||(5-132)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (41-372)||(21713-22044)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (77-258)||(277-458)
scaffold2173 (322-399)||(518-595)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 8296085 - 8296444
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8296085 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 8296184  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296185 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8296284  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296285 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 8296384  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8296385 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgatgattttttgactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15741239 - 15740883
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15741239 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15741140  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741139 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15741040  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741039 tcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 15740940  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15740939 actgttcaagatgacatccaaagcttgatggatgataattttttgactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 6192429 - 6192788
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6192429 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 6192528  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192529 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 6192628  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6192629 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 6192728  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6192729 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15892851 - 15892492
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15892851 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15892752  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15892751 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 15892652  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15892651 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgcttt 15892552  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892551 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4796798 - 4796439
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4796798 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 4796699  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796698 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 4796599  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4796598 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttat 4796499  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796498 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8301412 - 8301053
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8301412 catcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 8301313  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301312 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8301213  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8301212 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 8301113  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8301112 actgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Original strand, 18330782 - 18331137
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18330782 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18330881  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330882 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 18330981  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18330982 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctat 18331081  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18331082 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgaaaattttttgactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29148900 - 29148541
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29148900 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29148801  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29148800 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 29148701  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29148700 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 29148601  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  29148600 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattctttgactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Original strand, 35880879 - 35881234
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35880879 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 35880978  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880979 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 35881078  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881079 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 35881178  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35881179 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgaaatttttttgactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22387723 - 22387368
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22387723 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22387624  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22387623 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22387524  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22387523 tcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctat 22387424  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387423 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 4721744 - 4722103
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4721744 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatg 4721843  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4721844 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaac 4721943  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4721944 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 4722043  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4722044 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 7073325 - 7073683
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  7073325 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 7073424  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7073425 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7073524  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7073525 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctat 7073624  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7073625 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 42 - 400
Target Start/End: Original strand, 18051376 - 18051734
Alignment:
Q  42 atcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgt 141  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18051376 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 18051475  T
Q  142 cccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaact 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18051476 cccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaact 18051575  T
Q  242 cctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctata 341  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18051576 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctaca 18051675  T
Q  342 ctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051676 ccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 28021388 - 28021746
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28021388 catcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28021487  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28021488 tcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28021587  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28021588 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctat 28021687  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28021688 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18277197 - 18276839
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18277197 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18277098  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18277097 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18276998  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18276997 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 18276898  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18276897 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18307799 - 18307441
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18307799 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18307700  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18307699 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18307600  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18307599 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 18307500  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18307499 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28116099 - 28115741
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  28116099 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatg 28116000  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28115999 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28115900  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  28115899 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 28115800  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28115799 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 48466040 - 48466398
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48466040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 48466139  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48466140 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 48466239  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  48466240 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 48466339  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48466340 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4346832 - 4346474
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  4346832 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4346733  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4346732 tcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4346633  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  4346632 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 4346533  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  4346532 actgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18292498 - 18292140
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18292498 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18292399  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18292398 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18292299  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18292298 tcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 18292199  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18292198 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20576992 - 20576634
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  20576992 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 20576893  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20576892 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 20576793  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  20576792 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 20576693  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20576692 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36997222 - 36996864
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  36997222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 36997123  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36997122 tcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 36997023  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  36997022 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 36996923  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36996922 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 8211851 - 8212209
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  8211851 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8211950  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8211951 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8212050  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8212051 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 8212150  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212151 gatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11110494 - 11110136
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  11110494 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 11110395  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11110394 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 11110295  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  11110294 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 11110195  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11110194 gctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 4417047 - 4417390
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4417047 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 4417146  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4417147 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 4417246  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4417247 acacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagac 4417346  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4417347 atccaaaacttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 21674806 - 21675164
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  21674806 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21674905  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
      || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21674906 ctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21675005  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  21675006 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 21675105  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21675106 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 29665115 - 29664757
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  29665115 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29665016  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29665015 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29664916  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  29664915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 29664816  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29664815 gctgttcgagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 51782136 - 51782494
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  51782136 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51782235  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51782236 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51782335  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  51782336 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 51782435  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  51782436 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 10396246 - 10396604
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  10396246 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 10396345  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10396346 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaac 10396445  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  10396446 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 10396545  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10396546 gctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 5467098 - 5467456
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  5467098 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatg 5467197  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5467198 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5467297  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5467298 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 5467397  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  5467398 gctgttcaaggcgatatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5609467 - 5609109
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5609467 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5609368  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5609367 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 5609268  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5609267 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 5609168  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5609167 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 18242852 - 18243210
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18242852 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18242951  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  18242952 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 18243051  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18243052 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 18243151  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  18243152 actgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5596502 - 5596144
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5596502 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5596403  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  5596402 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 5596303  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  5596302 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 5596203  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5596202 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22871001 - 22870643
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  22871001 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22870902  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22870901 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22870802  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22870801 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 22870702  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  22870701 actgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22886060 - 22885702
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  22886060 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22885961  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22885960 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22885861  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22885860 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 22885761  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  22885760 actgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31964618 - 31964260
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31964618 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31964519  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31964518 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31964419  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  31964418 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 31964319  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||    
T  31964318 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6542607 - 6542249
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6542607 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 6542508  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  6542507 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 6542408  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  6542407 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 6542308  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  6542307 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatttcctgaccgtcagtgatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 28339415 - 28339773
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28339415 catcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28339514  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28339515 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28339614  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  28339615 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 28339714  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28339715 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 18225304 - 18225662
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18225304 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18225403  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18225404 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 18225503  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  18225504 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 18225603  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18225604 accgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 7996675 - 7997033
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  7996675 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7996774  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  7996775 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 7996874  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  7996875 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 7996974  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7996975 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 10643183 - 10643541
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  10643183 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10643282  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  10643283 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 10643382  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  10643383 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 10643482  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10643483 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17985101 - 17984743
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  17985101 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 17985002  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17985001 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17984902  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17984901 tcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccat 17984802  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| || ||||||||    
T  17984801 attgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgatgatcttctgaccgtcagtgatgt 17984743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 24328272 - 24328630
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  24328272 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24328371  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24328372 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24328471  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24328472 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 24328571  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24328572 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 5013825 - 5014183
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5013825 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5013924  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5013925 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5014024  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  5014025 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 5014124  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5014125 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 47023566 - 47023924
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  47023566 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 47023665  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47023666 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 47023765  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  47023766 tcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 47023865  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  47023866 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31034262 - 31033931
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31034262 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 31034163  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  31034162 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 31034063  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  31034062 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 31033963  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31033962 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 31033931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 32292865 - 32293196
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32292865 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 32292964  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  32292965 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 32293064  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  32293065 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 32293164  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  32293165 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 32293196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Original strand, 51797226 - 51797462
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  51797226 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51797325  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51797326 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51797425  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51797426 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17993929 - 17993631
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17993929 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 17993830  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  17993829 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 17993730  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17993729 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgcta 17993631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 18530501 - 18530860
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  18530501 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 18530600  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||||    
T  18530601 tccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaac 18530700  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||||||||||||||| || | || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  18530701 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctat 18530800  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| | ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  18530801 gttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 50134216 - 50133990
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  50134216 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 50134117  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50134116 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 50134017  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagct 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50134016 tcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16626651 - 16626292
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16626651 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16626552  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16626551 tccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaac 16626452  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  ||||  | |||| | | ||||||||||||||||||     
T  16626451 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctac 16626352  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||    
T  16626351 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcagcgatgtc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Original strand, 5652500 - 5652849
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  5652500 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 5652599  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| | || | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| |||||    
T  5652600 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 5652699  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  5652700 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 5652799  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  5652800 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 5652849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 5713340 - 5713638
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5713340 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5713439  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5713440 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5713539  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5713540 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 5724250 - 5724548
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5724250 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5724349  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5724350 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5724449  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5724450 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5724548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5768118 - 5767820
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5768118 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5768019  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5768018 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5767919  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5767918 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5767820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5757227 - 5757007
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  5757227 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5757128  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5757127 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5757028  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacat 261  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  5757027 tcctctggtgccactacacat 5757007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 4626057 - 4626355
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  4626057 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 4626156  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||  |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  4626157 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 4626256  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | |||  ||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  4626257 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 4626355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 32439267 - 32439416
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32439267 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 32439366  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 190  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  32439367 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 32439416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 20066156 - 20066305
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  20066156 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaata 20066255  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 190  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  20066256 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 20066305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27608968 - 27608609
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27608968 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27608869  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608868 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27608769  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27608768 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttccctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 27608669  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608668 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 14557776 - 14558135
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14557776 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 14557875  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557876 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14557975  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557976 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 14558075  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558076 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2137322 - 2136963
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2137322 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2137223  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137222 tctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2137123  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137122 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 2137023  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2137022 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 19688250 - 19688609
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19688250 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 19688349  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688350 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 19688449  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688450 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 19688549  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  19688550 actgtccaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgaatgtcaatgatgtc 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 16277706 - 16278065
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16277706 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16277805  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277806 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 16277905  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16277906 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctat 16278005  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278006 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Original strand, 16283613 - 16283960
Alignment:
Q  53 ctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcc 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16283613 ctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 16283712  T
Q  153 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 252  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16283713 tcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcc 16283812  T
Q  253 tctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagac 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16283813 tctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagat 16283912  T
Q  353 gacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16283913 gacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 19674608 - 19674951
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19674608 ggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 19674707  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19674708 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 19674807  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19674808 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 19674907  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19674908 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 29829474 - 29829832
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  29829474 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29829573  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  29829574 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 29829673  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  29829674 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctat 29829773  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29829774 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3329570 - 3329212
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3329570 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatg 3329471  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  3329470 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 3329371  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3329370 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 3329271  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  3329270 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataacttcctgactgtcagtgatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 19286614 - 19286972
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  19286614 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19286713  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  19286714 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 19286813  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19286814 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccat 19286913  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  19286914 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 31354676 - 31355034
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31354676 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31354775  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31354776 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31354875  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  31354876 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 31354975  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  31354976 gctgttcgagacgacatccaaagcctgatggatgataatctcctgactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31489813 - 31489455
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31489813 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31489714  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31489713 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31489614  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| ||||||    
T  31489613 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctat 31489514  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31489513 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 9354774 - 9355133
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaag-ctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaat 139  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  9354774 catcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataat 9354873  T
Q  140 gtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 239  Q
    || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9354874 gttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaa 9354973  T
Q  240 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  9354974 ctcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgcca 9355073  T
Q  340 tactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9355074 tactgttcaggacgacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12092787 - 12092429
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  12092787 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12092688  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  ||    
T  12092687 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcac 12092588  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  12092587 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 12092488  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  12092487 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgaccgtcagtgatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19208423 - 19208065
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  19208423 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19208324  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19208323 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19208224  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  19208223 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 19208124  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19208123 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28362018 - 28361660
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28362018 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28361919  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28361918 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28361819  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  28361818 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 28361719  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28361718 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 33258875 - 33259233
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  33258875 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 33258974  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33258975 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33259074  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  33259075 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 33259174  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33259175 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 318
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189523
Alignment:
Q  51 ctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgt 150  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  151 cctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtg 250  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtg 189455  T
Q  251 cctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 318  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189456 cctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 18710738 - 18711069
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18710738 catcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18710837  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  18710838 tcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 18710937  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  18710938 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 18711037  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18711038 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 18711069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 281 - 400
Target Start/End: Original strand, 18791099 - 18791218
Alignment:
Q  281 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18791099 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 18791198  T
Q  381 ttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18791199 ttttgactgttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19659102 - 19658754
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  19659102 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19659004  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| ||||  || || |||||||| |||||    
T  19659003 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 19658904  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || | ||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  19658903 tcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 19658804  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  19658803 gttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 19658754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22080941 - 22080643
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  22080941 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 22080842  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat-gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 239  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||| ||| |  ||| | || ||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  22080841 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaa 22080743  T
Q  240 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| || | || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  22080742 ctcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgccgccataatccttggggttgcta 22080643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 44563253 - 44563582
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  44563253 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 44563351  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  |||||||  ||||    
T  44563352 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaac 44563450  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  44563451 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 44563550  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44563551 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 44563582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Original strand, 33244817 - 33245166
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  33244817 catcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 33244916  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||  ||||  || ||  ||||||| |||||    
T  33244917 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaac 33245016  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  33245017 tcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 33245116  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  33245117 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 33245166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2155085
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2154726 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2154825  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154826 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2154925  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154926 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 2155025  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2155026 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10916858 - 10916499
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10916858 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 10916759  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916758 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 10916659  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916658 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 10916559  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916558 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16518406 - 16518047
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16518406 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 16518307  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16518306 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16518207  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16518206 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 16518107  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518106 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16503370 - 16503011
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16503370 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16503271  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16503270 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16503171  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16503170 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 16503071  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503070 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11424766 - 11424412
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11424766 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11424667  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424666 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11424567  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424566 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 11424467  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424466 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat-ttttgactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Original strand, 5128145 - 5128500
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5128145 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 5128244  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5128245 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaac 5128344  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5128345 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 5128444  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128445 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 26435410 - 26435768
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  26435410 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26435509  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26435510 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26435609  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26435610 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 26435709  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26435710 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26537860 - 26537502
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26537860 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26537761  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26537760 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26537661  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  26537660 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccat 26537561  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26537560 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 3445459 - 3445817
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  3445459 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3445558  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3445559 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 3445658  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3445659 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 3445758  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3445759 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5147330 - 5146972
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5147330 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 5147231  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5147230 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 5147131  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5147130 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 5147031  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5147030 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4145113 - 4144755
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  4145113 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 4145014  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4145013 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4144914  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  4144913 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 4144814  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4144813 actgttcaagaagacatccaaagcctaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24592531 - 24592173
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  24592531 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24592432  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24592431 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24592332  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  24592331 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 24592232  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24592231 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31564380 - 31564022
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31564380 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31564281  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  31564280 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31564181  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  31564180 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccat 31564081  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31564080 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16736435 - 16736092
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16736435 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16736336  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16736335 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 16736236  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16736235 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 16736136  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16736135 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16751489 - 16751146
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16751489 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16751390  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16751389 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 16751290  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16751289 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 16751190  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16751189 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 17523700 - 17524043
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17523700 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17523799  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17523800 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 17523899  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17523900 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 17523999  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17524000 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17529515 - 17529172
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17529515 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17529416  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17529415 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 17529316  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17529315 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 17529216  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17529215 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 45387496 - 45387854
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  45387496 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 45387595  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  45387596 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 45387695  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  45387696 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 45387795  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  45387796 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 41 - 357
Target Start/End: Original strand, 11441725 - 11442041
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  11441725 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 11441824  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11441825 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 11441924  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  11441925 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 11442024  T
Q  341 actgttcaagacgacat 357  Q
     ||||||||||||||||    
T  11442025 gctgttcaagacgacat 11442041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26275084 - 26274726
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26275084 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26274985  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26274984 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26274885  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  26274884 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 26274785  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26274784 actgttcaagaagacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26319859 - 26319501
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26319859 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26319760  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26319759 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26319660  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  26319659 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 26319560  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26319559 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26669904 - 26669546
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26669904 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26669805  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26669804 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26669705  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  26669704 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 26669605  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  26669604 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctcctgactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 9618804 - 9619162
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9618804 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9618903  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9618904 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9619003  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  9619004 tcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 9619103  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9619104 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 31125073 - 31125431
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31125073 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31125172  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||    
T  31125173 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccac 31125272  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31125273 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccat 31125372  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  31125373 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16449988 - 16449629
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  16449988 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacg 16449889  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  16449888 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaac 16449789  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||     
T  16449788 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctac 16449689  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16449688 gttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 16041476 - 16041835
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16041476 catcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 16041575  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || | ||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  16041576 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 16041675  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |  || |||||| |||| |||| || |||| | ||||||| ||||||||||||     
T  16041676 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctac 16041775  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16041776 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 26484847 - 26485178
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26484847 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26484946  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  26484947 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26485046  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  26485047 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 26485146  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26485147 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26485178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39211013 - 39210682
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39211013 catcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 39210914  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  39210913 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 39210814  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||| |    
T  39210813 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgt 39210714  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  39210713 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 39210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 4200700 - 4200998
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4200700 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 4200799  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  4200800 tccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 4200899  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||||    
T  4200900 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgcta 4200998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 2775512 - 2775843
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2775512 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2775611  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  2775612 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 2775711  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |   |||||||||||||||||      
T  2775712 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgc 2775811  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  2775812 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 2775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2108995 - 2108664
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2108995 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2108896  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  |||| || |||||||| ||  ||||    
T  2108895 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaac 2108796  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  2108795 tcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 2108696  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  2108695 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 2108664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 399
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  237 caactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  337 ctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26682990 - 26682659
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  26682990 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 26682891  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  26682890 tccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26682791  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  26682790 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 26682691  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26682690 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 45733613 - 45733911
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  45733613 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 45733712  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  45733713 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 45733812  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  45733813 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 45733911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31088454 - 31088156
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  31088454 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 31088355  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  31088354 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31088255  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||  |||||||||    
T  31088254 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgcta 31088156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 18540952 - 18541101
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18540952 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 18541051  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 190  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  18541052 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 18541101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Original strand, 5159672 - 5159808
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||  | || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5159672 catcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 5159771  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgc 177  Q
    | || ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  5159772 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgc 5159808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27290417 - 27290058
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27290417 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 27290318  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||| | || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290317 tccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27290218  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290217 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 27290118  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290117 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15424364 - 15424005
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15424364 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15424265  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424264 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15424165  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424164 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 15424065  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424064 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24304665 - 24304306
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24304665 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24304566  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24304565 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24304466  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304465 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 24304366  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304365 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 24863866 - 24864225
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24863866 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24863965  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863966 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24864065  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24864066 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 24864165  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24864166 actgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 26989150 - 26989510
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26989150 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26989249  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989250 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26989349  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989350 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 26989449  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26989450 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22934927 - 22934568
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22934927 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 22934828  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934827 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22934728  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22934727 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 22934628  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22934627 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23857372 - 23857013
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23857372 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 23857273  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857272 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23857173  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23857172 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 23857073  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23857072 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 16750003 - 16750361
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16750003 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16750102  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16750103 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaac 16750202  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16750203 tcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 16750302  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750303 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Original strand, 26918529 - 26918884
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26918529 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26918628  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918629 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26918728  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918729 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 26918828  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26918829 actgttcaagataacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13298998 - 13298639
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13298998 catcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 13298899  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298898 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 13298799  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13298798 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtat 13298699  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  13298698 actgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattatttgactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 29549624 - 29549982
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29549624 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29549723  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29549724 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaac 29549823  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29549824 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 29549923  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29549924 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27272627 - 27272268
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  27272627 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 27272528  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27272527 ttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaac 27272428  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27272427 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgcttt 27272328  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27272327 attgttcaagatgacatccagagcttgatgaatgataagtttttgactgttagtgatgtc 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 3696230 - 3696588
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  3696230 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3696329  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3696330 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3696429  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3696430 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccat 3696529  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  3696530 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4545822 - 4545464
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4545822 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4545723  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  4545722 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4545623  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  4545622 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 4545523  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4545522 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34463393 - 34463035
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  34463393 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 34463294  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34463293 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34463194  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  34463193 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 34463094  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34463093 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 16674288 - 16674646
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16674288 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16674387  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16674388 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 16674487  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  16674488 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 16674587  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16674588 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4724181 - 4723823
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4724181 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4724082  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  4724081 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4723982  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||    
T  4723981 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccat 4723882  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4723881 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 27485278 - 27485636
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  27485278 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27485377  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27485378 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 27485477  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27485478 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27485577  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27485578 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgttagtgatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 29501564 - 29501922
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  29501564 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29501663  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29501664 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29501763  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  29501764 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 29501863  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29501864 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 4525435 - 4525793
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4525435 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4525534  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  4525535 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 4525634  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  4525635 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 4525734  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4525735 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 4757913 - 4758271
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  4757913 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4758012  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||    
T  4758013 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 4758112  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  4758113 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 4758212  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  4758213 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttcggactgtcagtgatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 4773155 - 4773513
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  4773155 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4773254  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||    
T  4773255 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 4773354  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  4773355 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 4773454  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4773455 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 27044536 - 27044895
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct-atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaat 139  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || | |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  27044536 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataat 27044635  T
Q  140 gtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 239  Q
    || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |    
T  27044636 gttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgcca 27044735  T
Q  240 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27044736 ctcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgcca 27044835  T
Q  340 tactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27044836 tactgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 27007876 - 27008234
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27007876 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatg 27007975  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  27007976 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27008075  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27008076 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 27008175  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27008176 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 29573162 - 29573520
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  29573162 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29573261  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29573262 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29573361  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  29573362 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 29573461  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29573462 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27360039 - 27359680
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27360039 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27359940  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || ||    
T  27359939 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27359840  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27359839 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 27359740  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27359739 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27450382 - 27450023
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27450382 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27450283  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || ||    
T  27450282 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27450183  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27450182 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 27450083  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27450082 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30558063 - 30557705
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30558063 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30557964  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30557963 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30557864  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  30557863 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 30557764  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30557763 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 28207603 - 28207961
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28207603 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28207702  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  28207703 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 28207802  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  28207803 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 28207902  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28207903 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16944074 - 16943716
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16944074 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16943975  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16943974 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16943875  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  16943874 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 16943775  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16943774 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26116457 - 26116099
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  26116457 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26116358  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||    
T  26116357 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 26116258  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  26116257 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 26116158  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  26116157 gctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataatcttctgactgtcagtgatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26777662 - 26777299
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26777662 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26777563  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || || || ||    
T  26777562 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccac 26777463  T
Q  241 tcctctggtgcctctgc-----acattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggtt 335  Q
    |||||||||||||||||     || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |    
T  26777462 tcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggct 26777363  T
Q  336 gctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26777362 gctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 217 - 399
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  217 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  317 cttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14143332 - 14142983
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14143332 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 14143233  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  14143232 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 14143133  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  14143132 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 14143033  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  14143032 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 14142983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Original strand, 26788093 - 26788442
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26788093 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26788192  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  26788193 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26788292  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  26788293 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 26788392  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  26788393 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 26788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Original strand, 27196466 - 27196815
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27196466 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27196565  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  27196566 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27196665  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  27196666 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 27196765  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27196766 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27196815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27252774 - 27252425
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27252774 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27252675  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  27252674 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27252575  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  27252574 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 27252475  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27252474 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27252425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Original strand, 17025426 - 17025658
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  17025426 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 17025525  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17025526 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17025625  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17025626 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13522120 - 13521789
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13522120 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 13522021  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  ||||    
T  13522020 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 13521921  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |      
T  13521920 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgc 13521821  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  13521820 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 13521789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22456981 - 22456641
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  22456981 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatt 22456882  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  || | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22456881 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 22456782  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |         ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||| || | || |||| |  |||||||||||||||||||     
T  22456781 t---------cctctgcacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctac 22456691  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      ||||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  22456690 gttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgt 22456641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 27000222 - 27000402
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27000222 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27000321  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 221  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000322 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8892357 - 8892060
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8892357 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8892259  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  8892258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8892159  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8892158 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8892060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8903592 - 8903295
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8903592 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8903494  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  8903493 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8903394  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8903393 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8903295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33374303 - 33374083
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |    
T  33374303 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacg 33374204  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  33374203 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 33374104  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacat 261  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  33374103 tcctctggtgccactacacat 33374083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 28162806 - 28163104
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  28162806 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 28162905  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  28162906 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 28163005  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||   | | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  28163006 tcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 28163104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092129
Alignment:
Q  98 aagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaag 197  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||   || |    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  198 aatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatca 297  Q
     |||||||| |||| | | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||| ||  ||||   |||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatca 17092231  T
Q  298 tgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 397  Q
    |  ||  |||| |  || | | ||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||  |||||||||| || || | | ||||||||||||||    
T  17092230 tagcagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaactatctgactgttagtgat 17092131  T
Q  398 gt 399  Q
    ||    
T  17092130 gt 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22477320 - 22477240
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22477320 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 20160865 - 20161031
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || |    
T  20160865 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 20160964  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 222  Q
    | ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20160965 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22171966 - 22171800
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || |    
T  22171966 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 22171867  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 222  Q
    | ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22171866 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27629711 - 27629530
Alignment:
Q  77 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatg 176  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  27629711 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 27629612  T
Q  177 ccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgca 258  Q
    | || ||||| ||| | ||||  | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||    
T  27629611 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcccctgca 27629530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27629441 - 27629389
Alignment:
Q  347 caagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27629441 caagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 27629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 14665185 - 14665544
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  14665185 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataata 14665284  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665285 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14665384  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665385 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 14665484  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665485 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 17014167 - 17014526
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17014167 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 17014266  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014267 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 17014366  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17014367 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 17014466  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014467 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24592418 - 24592059
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24592418 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24592319  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592318 tcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24592219  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  24592218 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctac 24592119  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24592118 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36344619 - 36344261
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  36344619 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 36344520  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36344519 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 36344420  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36344419 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 36344320  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36344319 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14763408 - 14763050
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  14763408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 14763309  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14763308 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14763209  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14763208 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 14763109  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14763108 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 6570020 - 6570378
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  6570020 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6570119  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6570120 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6570219  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6570220 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 6570319  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6570320 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18800717 - 18800359
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18800717 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18800618  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18800617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18800518  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  18800517 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 18800418  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18800417 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33673902 - 33673544
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  33673902 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33673803  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33673802 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33673703  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  33673702 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 33673603  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33673602 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 39850805 - 39851163
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  39850805 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39850904  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39850905 ttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39851004  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  39851005 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 39851104  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39851105 actgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 30753921 - 30754279
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  30753921 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30754020  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30754021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30754120  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  30754121 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 30754220  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30754221 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 5006040 - 5006398
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5006040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatg 5006139  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5006140 tcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5006239  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  5006240 tcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttat 5006339  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5006340 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 54833554 - 54833912
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  54833554 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 54833653  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  54833654 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 54833753  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  54833754 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccat 54833853  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  54833854 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 14098708 - 14099066
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  14098708 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14098807  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14098808 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14098907  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  14098908 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 14099007  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  14099008 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataaccttctgactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 21969868 - 21970226
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21969868 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 21969967  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21969968 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21970067  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21970068 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctat 21970167  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21970168 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31126622 - 31126264
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31126622 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31126523  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31126522 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31126423  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  31126422 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 31126323  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31126322 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40105742 - 40105384
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  40105742 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40105643  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40105642 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40105543  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  40105542 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 40105443  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40105442 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27163421 - 27163063
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  27163421 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27163322  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  27163321 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27163222  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  27163221 tcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 27163122  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27163121 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 1900424 - 1900782
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1900424 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatg 1900523  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||    
T  1900524 tcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaac 1900623  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| |||||||  |||| || |||  | | |||| |||||||||||||     
T  1900624 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctac 1900723  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
      ||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  1900724 gttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 15228037 - 15228396
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  15228037 catcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacg 15228136  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | |  | || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15228137 tccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaac 15228236  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||| || | || |||| | ||||||||||| |||||| |     
T  15228237 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccac 15228336  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||| | | |||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| || ||||||    
T  15228337 gttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgtcagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15285032 - 15284673
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15285032 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 15284933  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| || ||| | || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  15284932 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 15284833  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||||||||||     
T  15284832 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctac 15284733  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| | |||||| | || |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  15284732 gttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24460709 - 24460411
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  24460709 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 24460610  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  24460609 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 24460510  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  24460509 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 24460411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15391442 - 15391144
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  15391442 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatg 15391343  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat-gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 239  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| || ||| ||| ||| |  ||| | || ||| || |||||  ||||||| || ||||    
T  15391342 tccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agagtcatgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaa 15391244  T
Q  240 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||| |||||||||| |||| || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  15391243 ctcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgcta 15391144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14235629 - 14235385
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14235629 catcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 14235530  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | ||    | ||| | |||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  14235529 tccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgac 14235430  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 285  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  14235429 tcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttccttgtt 14235385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34189064 - 34188915
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34189064 catcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 34188965  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 190  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  34188964 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 34188915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 24112829 - 24112978
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24112829 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 24112928  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 190  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  24112929 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 24112978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27434537 - 27434178
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27434537 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27434438  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434437 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27434338  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27434337 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 27434238  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27434237 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 28882362 - 28882721
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28882362 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 28882461  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882462 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 28882561  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882562 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 28882661  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28882662 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 20838066 - 20838425
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20838066 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 20838165  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20838166 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaac 20838265  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20838266 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 20838365  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20838366 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23128659 - 23128300
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23128659 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23128560  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128559 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23128460  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128459 tcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 23128360  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23128359 actattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 12655690 - 12656049
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12655690 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 12655789  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655790 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 12655889  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12655890 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctat 12655989  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12655990 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 12586958 - 12587316
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  12586958 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12587057  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12587058 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12587157  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12587158 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 12587257  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12587258 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 27777370 - 27777728
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27777370 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27777469  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27777470 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27777569  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27777570 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27777669  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27777670 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 27817128 - 27817486
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27817128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27817227  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27817228 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27817327  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27817328 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27817427  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27817428 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 37375309 - 37375667
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  37375309 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37375408  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37375409 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37375508  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37375509 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgaacatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 37375608  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37375609 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13936637 - 13936279
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  13936637 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 13936538  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13936537 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13936438  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  13936437 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccat 13936338  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13936337 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 40233659 - 40234017
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  40233659 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40233758  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40233759 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 40233858  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  40233859 tcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 40233958  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  40233959 actgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12716695 - 12716337
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  12716695 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12716596  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12716595 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 12716496  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12716495 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 12716396  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12716395 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 27803855 - 27804213
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27803855 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27803954  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27803955 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaac 27804054  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27804055 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27804154  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27804155 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 260846 - 260488
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  260846 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 260747  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  260746 tcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 260647  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  260646 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 260547  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  260546 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 39051915 - 39051557
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  39051915 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39051816  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39051815 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 39051716  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  39051715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 39051616  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39051615 gctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11635264 - 11634921
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11635264 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11635165  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11635164 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11635065  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11635064 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgac 11634965  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11634964 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11641453 - 11641110
Alignment:
Q  56 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcg 155  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11641453 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11641354  T
Q  156 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11641353 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11641254  T
Q  256 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 355  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11641253 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgac 11641154  T
Q  356 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11641153 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 39890222 - 39890580
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||| |||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  39890222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 39890321  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39890322 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39890421  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  39890422 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 39890521  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39890522 gttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21677275 - 21676917
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  21677275 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21677176  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21677175 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21677076  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  21677075 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 21676976  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  21676975 gctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 32049946 - 32050304
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  32049946 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32050045  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32050046 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 32050145  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  32050146 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctat 32050245  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32050246 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16829431 - 16829073
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  16829431 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16829332  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16829331 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16829232  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16829231 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 16829132  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16829131 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 16892050 - 16892408
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  16892050 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16892149  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16892150 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16892249  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16892250 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 16892349  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16892350 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 34861828 - 34862186
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  34861828 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34861927  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34861928 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaac 34862027  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  34862028 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 34862127  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34862128 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37686002 - 37685644
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  37686002 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37685903  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37685902 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37685803  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  37685802 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 37685703  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37685702 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37701267 - 37700909
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  37701267 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37701168  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37701167 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37701068  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  37701067 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 37700968  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37700967 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 37925641 - 37925999
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  37925641 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37925740  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37925741 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37925840  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  37925841 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 37925940  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37925941 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19416592 - 19416234
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  19416592 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19416493  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19416492 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19416393  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  19416392 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctat 19416293  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19416292 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 34286502 - 34286860
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34286502 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34286601  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  34286602 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34286701  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34286702 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 34286801  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34286802 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 34291562 - 34291920
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34291562 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34291661  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  34291662 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34291761  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34291762 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 34291861  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34291862 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 31876429 - 31876788
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31876429 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31876528  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31876529 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31876628  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||| ||    
T  31876629 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccat 31876728  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  31876729 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9350075 - 9349717
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  9350075 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 9349976  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  | ||||| |||||||| ||  ||||    
T  9349975 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaac 9349876  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  9349875 ccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 9349776  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9349775 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21703257 - 21702898
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21703257 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 21703158  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  21703157 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 21703058  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||| | ||| |||||| |||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||     
T  21703057 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttaaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctac 21702958  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| || ||||||    
T  21702957 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttgactgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19456514 - 19456155
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  19456514 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19456415  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||| | || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  19456414 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 19456315  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  ||||  | |||| |  |||||||||||||||||||     
T  19456314 tcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctac 19456215  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  19456214 gttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34303396 - 34303098
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  34303396 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34303297  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34303296 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 34303197  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   | ||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  34303196 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgacaatgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgcta 34303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Original strand, 27118836 - 27119185
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  27118836 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 27118935  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| ||| | || | || ||||| |||||| ||||  || ||  ||||| | |||||    
T  27118936 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaac 27119035  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  27119036 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 27119135  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  27119136 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 27119185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22926121 - 22925790
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22926121 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 22926022  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  22926021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 22925922  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||| ||||||||||||      
T  22925921 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgc 22925822  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22925821 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 22925790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Original strand, 27393117 - 27393250
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27393117 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 27393216  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 174  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  27393217 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatca 27393250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 3784802 - 3785100
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  3784802 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 3784901  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  3784902 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 3785001  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  3785002 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 3785100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 16163747 - 16164081
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16163747 catcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16163846  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  16163847 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 16163946  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttcc---ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgc 337  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| |||   |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||    
T  16163947 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgc 16164046  T
Q  338 tatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
    |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16164047 tgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 16164081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 34157159 - 34157456
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  34157159 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34157257  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  34157258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 34157357  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  34157358 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 34157456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 142
Target Start/End: Original strand, 34279597 - 34279698
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34279597 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 34279696  T
Q  141 tc 142  Q
    ||    
T  34279697 tc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31891421 - 31891123
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || |    
T  31891421 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacg 31891322  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  31891321 tccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31891222  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| |  |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  31891221 tcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 31891123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22999115 - 22998756
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22999115 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22999016  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999015 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22998916  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 22998816  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22998815 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23717989 - 23717630
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23717989 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23717890  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717889 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23717790  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717789 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 23717690  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23717689 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24688158 - 24687799
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24688158 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24688059  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24688058 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 24687959  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24687958 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 24687859  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24687858 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 41 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23752451 - 23752095
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23752451 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23752352  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752351 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23752252  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23752251 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctat 23752152  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752151 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Original strand, 11549515 - 11549870
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11549515 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11549614  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549615 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11549714  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 11549814  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11549815 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgctagtga 11549870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 30934794 - 30935153
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30934794 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 30934893  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30934894 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaac 30934993  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30934994 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 30935093  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30935094 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 24970179 - 24970538
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  24970179 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatg 24970278  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24970279 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24970378  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24970379 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 24970478  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970479 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 397
Target Start/End: Original strand, 33777648 - 33778004
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33777648 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 33777747  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777748 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 33777847  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33777848 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 33777947  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777948 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15658761 - 15658402
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15658761 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15658662  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15658661 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15658562  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15658561 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 15658462  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15658461 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18500731 - 18500373
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18500731 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18500632  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18500631 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaac 18500532  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500531 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 18500432  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18500431 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 28649396 - 28649754
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28649396 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28649495  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28649496 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28649595  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28649596 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctat 28649695  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28649696 accgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13324830 - 13324472
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  13324830 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 13324731  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13324730 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13324631  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  13324630 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 13324531  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13324530 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31826408 - 31826050
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31826408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31826309  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31826308 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 31826209  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  31826208 tcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaa 31826109  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31826108 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 3789702 - 3790060
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  3789702 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3789801  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3789802 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3789901  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3789902 tcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 3790001  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3790002 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 24681601 - 24681959
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  24681601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24681700  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24681701 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24681800  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24681801 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 24681900  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24681901 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 24724128 - 24724486
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  24724128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24724227  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24724228 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24724327  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24724328 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 24724427  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24724428 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 43078413 - 43078771
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  43078413 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 43078512  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43078513 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 43078612  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  43078613 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 43078712  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43078713 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8665476 - 8665118
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  8665476 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8665377  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665376 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8665277  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8665276 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 8665177  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  8665176 gctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 2511212 - 2511570
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2511212 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 2511311  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  2511312 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 2511411  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  2511412 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 2511511  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  2511512 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 6874466 - 6874824
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  6874466 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6874565  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6874566 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6874665  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  6874666 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 6874765  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6874766 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15758858 - 15758500
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15758858 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 15758759  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15758758 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15758659  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  15758658 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccat 15758559  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  15758558 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 34616679 - 34617037
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  34616679 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34616778  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34616779 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34616878  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34616879 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 34616978  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34616979 actgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18375413 - 18375054
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18375413 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18375314  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18375313 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18375214  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  18375213 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 18375114  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18375113 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 31431601 - 31431959
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31431601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31431700  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  31431701 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31431800  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  31431801 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 31431900  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31431901 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 37755141 - 37755499
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  37755141 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37755240  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37755241 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37755340  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  37755341 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttat 37755440  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  37755441 actgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 12132316 - 12132674
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  12132316 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12132415  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12132416 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12132515  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  12132516 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 12132615  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12132616 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37358644 - 37358286
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||     
T  37358644 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataata 37358545  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  37358544 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 37358445  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  37358444 tcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 37358345  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37358344 gctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40473550 - 40473192
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  40473550 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 40473451  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40473450 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40473351  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  40473350 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 40473251  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40473250 gctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 9317612 - 9317970
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9317612 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9317711  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9317712 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9317811  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  9317812 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 9317911  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9317912 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 23892367 - 23892725
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23892367 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 23892466  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  || | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23892467 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 23892566  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23892567 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctac 23892666  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
       |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23892667 ttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattatttaactgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 30152179 - 30152537
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  30152179 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30152278  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  30152279 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 30152378  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  30152379 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 30152478  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30152479 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37671484 - 37671126
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37671484 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37671385  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |   |    
T  37671384 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgc 37671285  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  37671284 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccat 37671185  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37671184 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32599473 - 32599115
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  32599473 catcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32599374  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || ||    
T  32599373 tcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccac 32599274  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  32599273 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 32599174  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32599173 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 33516517 - 33516875
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  33516517 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33516616  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33516617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33516716  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  33516717 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 33516816  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33516817 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37770988 - 37770630
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37770988 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37770889  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||    
T  37770888 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctac 37770789  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  37770788 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 37770689  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  37770688 actgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28959787 - 28959429
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28959787 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28959688  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||||||||||||||||  || || || ||    
T  28959687 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccac 28959588  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||    
T  28959587 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccat 28959488  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28959487 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 5638071 - 5638429
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||    
T  5638071 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatg 5638170  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5638171 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5638270  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  5638271 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 5638370  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5638371 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 30029576 - 30029934
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  30029576 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30029675  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30029676 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30029775  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| |     
T  30029776 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccac 30029875  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30029876 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29889083 - 29888734
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889083 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 29888984  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  29888983 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 29888884  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29888883 tcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccgtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctat 29888784  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 390  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  29888783 gctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 29888734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 30168630 - 30168988
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  30168630 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatg 30168729  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30168730 tcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30168829  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  30168830 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 30168929  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30168930 gctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 26480553 - 26480910
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26480553 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26480652  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26480653 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26480752  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| ||||||||||||| |||    
T  26480753 t-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttat 26480851  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26480852 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 41674870 - 41675228
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  41674870 catcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41674969  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||| | ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  41674970 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 41675069  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41675070 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctat 41675169  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  41675170 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 22888631 - 22888990
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22888631 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 22888730  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  22888731 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaac 22888830  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||  ||||   |||||||||||| |  |||| || |||| | ||||||||||||||||| ||     
T  22888831 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtttgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttac 22888930  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  22888931 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9548544 - 9548246
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9548544 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 9548445  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9548444 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9548345  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    ||||||||||||||| |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||| ||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  9548344 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 9548246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29967067 - 29966793
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  29967067 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29966968  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29966967 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29966868  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatg 315  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  29966867 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 29966793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 25199190 - 25199549
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25199190 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 25199289  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||  ||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  25199290 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 25199389  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||||||||||||||  |||| || |||| |  ||||||||| ||| |||||     
T  25199390 tcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctac 25199489  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
       |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  25199490 gtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 33877408 - 33877739
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33877408 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 33877507  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  ||||    
T  33877508 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 33877607  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |      
T  33877608 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgc 33877707  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  33877708 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 33877739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Original strand, 11325955 - 11326253
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11325955 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 11326054  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  11326055 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 11326154  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  11326155 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 11326253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13184649 - 13184352
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  13184649 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13184550  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  13184549 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13184450  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 338  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    
T  13184449 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 13184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13440495 - 13440197
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  13440495 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13440396  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  13440395 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13440296  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    ||||||||||||||| |||||  || | ||| |||| |  |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  13440295 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 13440197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 33292686 - 33292821
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33292686 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 33292785  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatg 176  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33292786 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatg 33292821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40173 - 39814
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40173 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 40074  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40073 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 39974  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39973 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 39874  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39873 actgttcaagatgacatccaaagcttgacgaatgataattttttgactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47089 - 46730
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  47089 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 46990  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46989 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaac 46890  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46889 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 46790  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46789 actgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 400
Target Start/End: Original strand, 29918 - 30274
Alignment:
Q  44 caaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcc 143  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29918 caaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30017  T
Q  144 cgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcc 243  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30018 cgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcc 30117  T
Q  244 tctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatact 343  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30118 tctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgccaagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttact 30217  T
Q  344 gttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30218 gttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 27444 - 27804
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27444 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27543  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27544 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 27643  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27644 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctatttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 27743  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27744 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 30604 - 30964
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30604 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30703  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30704 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaac 30803  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30804 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 30903  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataa-ttttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30904 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatttttttgactgtcagtgatgtc 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20730
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20540 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 20638  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 232  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20639 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 20730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 6165 - 6524
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt-gaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaat 139  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  6165 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataat 6264  T
Q  140 gtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 239  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6265 gtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaa 6364  T
Q  240 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 339  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6365 ctcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 6464  T
Q  340 tactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6465 tactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2021 - 1831
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2021 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 1923  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 232  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1922 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 51638369 - 51638728
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  51638369 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 51638468  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51638469 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 51638568  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  51638569 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 51638668  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51638669 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 10962821 - 10963179
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  10962821 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10962920  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10962921 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 10963020  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  10963021 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 10963120  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10963121 actgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41793412 - 41793054
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  41793412 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41793313  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41793312 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 41793213  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  41793212 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 41793113  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  41793112 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 28585132 - 28585490
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28585132 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28585231  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28585232 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28585331  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  28585332 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 28585431  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28585432 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16208135 - 16207776
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16208135 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 16208036  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  16208035 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 16207936  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16207935 tcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctat 16207836  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
       |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16207835 gtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 28152013 - 28152344
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28152013 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 28152112  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | ||   || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  28152113 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 28152212  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  28152213 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 28152312  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28152313 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 28152344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20340439 - 20340080
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||     
T  20340439 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 20340340  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||||    
T  20340339 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 20340240  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||      
T  20340239 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgc 20340140  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  20340139 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Original strand, 20461232 - 20461591
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  |    
T  20461232 catcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcg 20461331  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||| | || | || ||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  20461332 tccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaac 20461431  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||||||||||||||  || | || |||| ||||||||||||||||||||||     
T  20461432 tcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctac 20461531  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  20461532 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9170 - 8812
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9170 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9071  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9070 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 8971  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8970 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 8871  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8870 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 20167 - 20526
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  20167 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 20266  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20267 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 20366  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  20367 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 20466  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat-tttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20467 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctttctgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 9718 - 10076
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9718 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9817  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  9818 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 9917  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  9918 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccat 10017  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10018 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26305 - 25947
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26305 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26206  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26205 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26106  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  26105 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 26006  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26005 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14675
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15034 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14935  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14934 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14835  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  14834 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 14735  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14734 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 6985
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  7343 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7244  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7243 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7144  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  7143 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 7044  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7043 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Original strand, 8101 - 8459
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  8101 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8200  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  8201 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 8300  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  8301 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 8400  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8401 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46872 - 46545
Alignment:
Q  77 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-gttgactttt-gagaacaatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 174  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  175 tgccgctgtaaatatgg-tcgaagaatgtgaggca-gctccta-gacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgc 271  Q
    ||| ||||||||||||  || ||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  46772 tgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgc 46673  T
Q  272 aaagcttccctgttcagccatg-atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc-tttgggttgctatactgttcaaga-cgacatcc-aaagcttg 367  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  46672 aaagcttctctgttcagccatgaatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatccttttgggttgctttactgttcaagattgacatccaaaagcttg 46573  T
Q  368 atgaatgataa-ttttttgactgttagt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46572 atgaatgataatttttttgactgttagt 46545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 1
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  233 catcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 134  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 34  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 273  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2403
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||     
T  2762 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 2663  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||||    
T  2662 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 2563  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||      
T  2562 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgc 2463  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 400  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  2462 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 722 - 383
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  722 catcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataatg 623  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    | ||| | || ||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  622 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaac 523  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||  ||| ||||   ||||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| |||||| ||     
T  522 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggttgttac 423  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 380  Q
      ||||||  | |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  422 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaatgacaatt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 5
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |    
T  132 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacg 33  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttcc 168  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  32 tccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 21713 - 22044
Alignment:
Q  41 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 140  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  21713 catcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatg 21812  T
Q  141 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 240  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    | |||   || |||  | |||||||||||||| || |||||    
T  21813 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaagttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaac 21912  T
Q  241 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 340  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| |||| || |||||  | |||||||| |||||||||     
T  21913 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctac 22012  T
Q  341 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 372  Q
      ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  22013 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Original strand, 277 - 458
Alignment:
Q  77 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatg 176  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  277 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 376  T
Q  177 ccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgca 258  Q
    | || ||||| ||| | ||||  | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||    
T  377 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcccctgca 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 399
Target Start/End: Original strand, 518 - 595
Alignment:
Q  322 taatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 399  Q
    |||||| |||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  518 taatcccttgggttgccgcattgtgcaagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University