View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7829A_low_66 (Length: 398)

Name: NF7829A_low_66
Description: NF7829A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7829A_low_66
NF7829A_low_66
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-398)||(22934688-22935085)
chr6 (1-398)||(23857133-23857530)
chr6 (1-398)||(26988992-26989389)
chr6 (1-398)||(26918371-26918768)
chr6 (1-398)||(13298759-13299156)
chr6 (1-398)||(15424125-15424522)
chr6 (1-392)||(24863708-24864099)
chr6 (1-398)||(24304426-24304823)
chr6 (1-398)||(16749845-16750242)
chr6 (3-398)||(27272388-27272783)
chr6 (1-339)||(27000064-27000402)
chr6 (22-398)||(34463154-34463530)
chr6 (12-398)||(29549477-29549863)
chr6 (1-398)||(29573004-29573401)
chr6 (22-398)||(3696093-3696469)
chr6 (13-398)||(4757767-4758152)
chr6 (1-398)||(30557824-30558221)
chr6 (22-398)||(4545583-4545959)
chr6 (22-398)||(16674151-16674527)
chr6 (1-398)||(16943835-16944232)
chr6 (13-398)||(27485132-27485517)
chr6 (24-398)||(29501429-29501803)
chr6 (22-398)||(4723942-4724318)
chr6 (13-398)||(27044390-27044776)
chr6 (13-398)||(26116218-26116603)
chr6 (13-398)||(4525289-4525674)
chr6 (13-394)||(4773009-4773390)
chr6 (10-398)||(27290178-27290566)
chr6 (13-398)||(27007730-27008115)
chr6 (13-394)||(27359804-27360185)
chr6 (13-394)||(27450147-27450528)
chr6 (22-398)||(28207466-28207842)
chr6 (24-373)||(26777448-26777797)
chr6 (13-391)||(17025280-17025658)
chr6 (9-383)||(14143108-14143482)
chr6 (9-383)||(26787943-26788317)
chr6 (9-383)||(27196316-27196690)
chr6 (9-383)||(27252550-27252924)
chr6 (9-365)||(22456775-22457131)
chr6 (12-383)||(13521896-13522267)
chr6 (13-340)||(20160704-20161031)
chr6 (13-340)||(22171800-22172127)
chr6 (12-380)||(33374082-33374450)
chr6 (12-380)||(8892137-8892504)
chr6 (12-380)||(8903372-8903739)
chr6 (9-380)||(28162656-28163027)
chr6 (9-239)||(22477240-22477470)
chr6 (335-398)||(27019461-27019524)
chr6 (219-385)||(17092261-17092427)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-398)||(17014009-17014406)
chr4 (1-398)||(14665027-14665424)
chr4 (1-398)||(24592179-24592576)
chr4 (1-398)||(14763169-14763566)
chr4 (1-394)||(5005882-5006275)
chr4 (1-398)||(40105503-40105900)
chr4 (1-398)||(6569862-6570259)
chr4 (13-398)||(18800478-18800863)
chr4 (1-398)||(27163182-27163579)
chr4 (13-398)||(36344380-36344765)
chr4 (1-398)||(14098550-14098947)
chr4 (1-398)||(31126383-31126780)
chr4 (22-398)||(33673663-33674039)
chr4 (13-398)||(54833408-54833793)
chr4 (22-398)||(30753784-30754160)
chr4 (22-398)||(39850668-39851044)
chr4 (1-398)||(21969710-21970107)
chr4 (9-394)||(15284797-15285182)
chr4 (9-394)||(15227887-15228272)
chr4 (4-394)||(1900269-1900659)
chr4 (12-380)||(24460488-24460856)
chr4 (9-397)||(14235391-14235779)
chr4 (12-396)||(24112682-24113066)
chr4 (12-396)||(34188827-34189211)
chr4 (27-394)||(15391207-15391574)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-398)||(27434298-27434695)
chr2 (1-398)||(28882204-28882601)
chr2 (1-398)||(12655532-12655929)
chr2 (1-398)||(20837908-20838305)
chr2 (1-398)||(23128420-23128817)
chr2 (1-398)||(11635040-11635437)
chr2 (1-398)||(11641229-11641626)
chr2 (1-398)||(21677036-21677433)
chr2 (1-398)||(34861670-34862067)
chr2 (1-398)||(37685763-37686160)
chr2 (1-398)||(37701028-37701425)
chr2 (1-398)||(32049788-32050185)
chr2 (1-398)||(37925483-37925880)
chr2 (5-398)||(13936398-13936791)
chr2 (1-398)||(34286344-34286741)
chr2 (1-398)||(34291404-34291801)
chr2 (13-398)||(37375163-37375548)
chr2 (1-398)||(16829192-16829589)
chr2 (1-398)||(16891892-16892289)
chr2 (22-398)||(27777233-27777609)
chr2 (22-398)||(27816991-27817367)
chr2 (1-398)||(31876271-31876668)
chr2 (22-398)||(40233522-40233898)
chr2 (22-398)||(260607-260983)
chr2 (22-398)||(12716456-12716832)
chr2 (22-398)||(27803718-27804094)
chr2 (22-398)||(39051676-39052052)
chr2 (1-383)||(22925897-22926279)
chr2 (12-398)||(39890075-39890461)
chr2 (1-398)||(19416353-19416750)
chr2 (22-398)||(12586821-12587197)
chr2 (1-260)||(34279439-34279698)
chr2 (4-394)||(21703022-21703412)
chr2 (22-398)||(9349836-9350212)
chr2 (9-394)||(19456279-19456664)
chr2 (9-394)||(34303161-34303546)
chr2 (9-383)||(27118686-27119060)
chr2 (9-380)||(31891200-31891571)
chr2 (12-380)||(3784655-3785023)
chr2 (12-380)||(16163600-16163968)
chr2 (12-380)||(34157012-34157379)
chr2 (27-292)||(27392985-27393250)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-398)||(46850-47247)
scaffold0089 (1-398)||(39934-40331)
scaffold0089 (4-398)||(29760-30154)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-398)||(16277548-16277945)
chr8 (1-398)||(2137083-2137480)
chr8 (1-398)||(19688092-19688489)
chr8 (1-397)||(27608730-27609126)
chr8 (1-398)||(14557618-14558015)
chr8 (4-398)||(16283446-16283840)
chr8 (1-398)||(31489574-31489971)
chr8 (1-398)||(19208184-19208581)
chr8 (1-398)||(19674435-19674832)
chr8 (1-398)||(28361779-28362176)
chr8 (1-397)||(31354518-31354914)
chr8 (13-398)||(3329331-3329716)
chr8 (13-398)||(19286468-19286853)
chr8 (1-398)||(33258717-33259114)
chr8 (57-398)||(29829372-29829713)
chr8 (13-398)||(12092548-12092933)
chr8 (171-398)||(189258-189485)
chr8 (12-383)||(18710591-18710962)
chr8 (12-398)||(9354627-9355014)
chr8 (12-383)||(19658879-19659249)
chr8 (9-383)||(44563103-44563475)
chr8 (12-382)||(33244670-33245040)
chr8 (87-394)||(22080706-22081013)
chr8 (22-82)||(19518277-19518337)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-398)||(10916619-10917016)
chr7 (1-398)||(16503131-16503528)
chr7 (1-398)||(16518167-16518564)
chr7 (1-398)||(2154568-2154965)
chr7 (1-398)||(11424527-11424924)
chr7 (1-398)||(5127987-5128384)
chr7 (1-398)||(4144874-4145271)
chr7 (1-398)||(5147091-5147488)
chr7 (1-398)||(26319620-26320017)
chr7 (1-398)||(26274845-26275242)
chr7 (1-398)||(26669665-26670062)
chr7 (1-398)||(9618646-9619043)
chr7 (1-398)||(16736211-16736608)
chr7 (1-398)||(16751265-16751662)
chr7 (1-398)||(17523527-17523924)
chr7 (1-398)||(17529291-17529688)
chr7 (1-398)||(45387338-45387735)
chr7 (22-398)||(26537621-26537997)
chr7 (1-398)||(26435252-26435649)
chr7 (13-398)||(31564141-31564526)
chr7 (57-398)||(11441623-11441964)
chr7 (1-398)||(24592292-24592689)
chr7 (22-398)||(3445322-3445698)
chr7 (13-398)||(31124927-31125312)
chr7 (4-385)||(16041321-16041702)
chr7 (9-394)||(16449753-16450138)
chr7 (9-383)||(26484697-26485071)
chr7 (9-382)||(2108772-2109145)
chr7 (9-383)||(39210789-39211163)
chr7 (12-383)||(2775365-2775736)
chr7 (12-380)||(31088233-31088601)
chr7 (141-383)||(4200682-4200924)
chr7 (87-380)||(45733541-45733834)
chr7 (9-396)||(18540802-18541189)
chr7 (136-383)||(26682766-26683013)
chr7 (12-396)||(5159525-5159909)
chr7 (355-398)||(26513130-26513173)
chr7 (22-116)||(26485756-26485850)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-398)||(11549357-11549754)
chr5 (1-398)||(23717750-23718147)
chr5 (1-398)||(24687919-24688316)
chr5 (1-398)||(30934636-30935033)
chr5 (1-398)||(33777490-33777887)
chr5 (1-398)||(23752212-23752609)
chr5 (1-398)||(22998876-22999273)
chr5 (4-398)||(24970024-24970418)
chr5 (1-398)||(15658522-15658919)
chr5 (1-380)||(9548323-9548702)
chr5 (1-397)||(8665238-8665634)
chr5 (1-398)||(9317454-9317851)
chr5 (1-398)||(12132158-12132555)
chr5 (1-397)||(15758620-15759016)
chr5 (1-398)||(2511054-2511451)
chr5 (1-398)||(6874308-6874705)
chr5 (1-398)||(30152021-30152418)
chr5 (13-398)||(18500492-18500877)
chr5 (1-398)||(26480395-26480791)
chr5 (1-398)||(30168472-30168869)
chr5 (1-398)||(5637913-5638310)
chr5 (13-398)||(28649250-28649635)
chr5 (12-398)||(34616532-34616918)
chr5 (1-398)||(18375174-18375571)
chr5 (13-398)||(37754995-37755380)
chr5 (22-398)||(43078276-43078652)
chr5 (1-398)||(33516359-33516756)
chr5 (1-398)||(29966828-29967225)
chr5 (1-398)||(30029418-30029815)
chr5 (13-398)||(37770749-37771134)
chr5 (22-398)||(24681464-24681840)
chr5 (22-398)||(24723991-24724367)
chr5 (22-398)||(31826169-31826545)
chr5 (22-398)||(40473311-40473687)
chr5 (13-398)||(3789556-3789941)
chr5 (13-398)||(37671245-37671630)
chr5 (22-398)||(31431464-31431840)
chr5 (1-398)||(41674712-41675109)
chr5 (4-398)||(23892212-23892606)
chr5 (4-385)||(22888476-22888857)
chr5 (13-398)||(37358405-37358790)
chr5 (12-394)||(28959552-28959934)
chr5 (12-394)||(32599238-32599620)
chr5 (9-398)||(29888844-29889233)
chr5 (13-398)||(13324591-13324976)
chr5 (4-394)||(25199035-25199425)
chr5 (12-383)||(33877261-33877632)
chr5 (12-380)||(11325808-11326176)
chr5 (12-383)||(13184425-13184796)
chr5 (12-380)||(13440274-13440642)
chr5 (12-396)||(33292539-33292923)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-398)||(8301173-8301570)
chr3 (1-398)||(18330624-18331021)
chr3 (4-398)||(15892612-15893006)
chr3 (1-398)||(4796559-4796956)
chr3 (1-398)||(6192271-6192668)
chr3 (1-398)||(15741000-15741397)
chr3 (1-398)||(4721586-4721983)
chr3 (1-398)||(8295927-8296324)
chr3 (1-398)||(18051217-18051614)
chr3 (1-398)||(29148661-29149058)
chr3 (1-398)||(35880721-35881118)
chr3 (1-398)||(18276958-18277355)
chr3 (1-398)||(18307560-18307957)
chr3 (12-398)||(22387484-22387870)
chr3 (1-398)||(18292259-18292656)
chr3 (1-394)||(4416874-4417267)
chr3 (1-398)||(28115860-28116257)
chr3 (1-398)||(7073167-7073564)
chr3 (1-397)||(31964380-31964776)
chr3 (1-398)||(5609228-5609625)
chr3 (1-385)||(50133990-50134374)
chr3 (1-394)||(10396088-10396481)
chr3 (1-398)||(28339257-28339654)
chr3 (1-398)||(47023408-47023805)
chr3 (1-398)||(7996517-7996914)
chr3 (1-398)||(10643025-10643422)
chr3 (12-398)||(4346593-4346979)
chr3 (1-398)||(21674648-21675045)
chr3 (12-398)||(28021241-28021627)
chr3 (22-398)||(48465903-48466279)
chr3 (13-398)||(6542368-6542753)
chr3 (22-398)||(8211714-8212090)
chr3 (22-398)||(20576753-20577129)
chr3 (22-398)||(36996983-36997359)
chr3 (57-398)||(5466996-5467337)
chr3 (12-398)||(22870762-22871148)
chr3 (12-398)||(22885821-22886207)
chr3 (13-398)||(18242706-18243091)
chr3 (22-398)||(11110255-11110631)
chr3 (22-398)||(29664876-29665252)
chr3 (67-398)||(51782044-51782375)
chr3 (1-398)||(17984862-17985259)
chr3 (1-398)||(18225146-18225543)
chr3 (1-398)||(24328114-24328511)
chr3 (1-398)||(5013667-5014064)
chr3 (24-398)||(5596263-5596637)
chr3 (67-395)||(51797133-51797462)
chr3 (1-380)||(5713182-5713561)
chr3 (1-380)||(5724092-5724471)
chr3 (1-380)||(5757006-5757385)
chr3 (1-380)||(5767897-5768276)
chr3 (9-394)||(18530351-18530736)
chr3 (9-394)||(16626416-16626801)
chr3 (9-383)||(32292715-32293089)
chr3 (12-383)||(31034038-31034409)
chr3 (12-398)||(17993690-17994076)
chr3 (12-383)||(5652353-5652724)
chr3 (12-380)||(4625910-4626278)
chr3 (12-389)||(32439120-32439497)
chr3 (13-308)||(20066010-20066305)
chr3 (12-223)||(4893176-4893387)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-398)||(27286-27683)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-391)||(1-392)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-398)||(41793173-41793570)
chr1 (1-398)||(10962663-10963060)
chr1 (1-398)||(28584974-28585371)
chr1 (1-398)||(51638211-51638608)
chr1 (4-394)||(16207900-16208290)
chr1 (4-383)||(20340215-20340594)
chr1 (9-383)||(28151863-28152237)
chr1 (9-385)||(20461082-20461458)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-398)||(7104-7501)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-398)||(8931-9328)
scaffold0159 (1-398)||(20009-20406)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-398)||(30447-30843)
scaffold0124 (9-350)||(20390-20730)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-398)||(14795-15192)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (22-398)||(6025-6405)
scaffold0415 (87-350)||(1831-2093)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-398)||(26066-26464)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (12-394)||(9571-9953)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (22-398)||(7964-8340)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (9-398)||(46664-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (4-383)||(2538-2917)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (9-286)||(5-282)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (27-394)||(21581-21948)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (153-385)||(496-728)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22935085 - 22934688
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22935085 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 22934986  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22934985 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 22934886  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22934885 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 22934786  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934785 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 22934688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23857530 - 23857133
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857530 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 23857431  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23857430 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23857331  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23857330 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23857231  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857230 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 23857133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 26988992 - 26989389
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988992 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 26989091  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26989092 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 26989191  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26989192 ttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26989291  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989292 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26989389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 26918371 - 26918768
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918371 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 26918470  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918471 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 26918570  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26918571 ttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26918670  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918671 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26918768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13299156 - 13298759
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13299156 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 13299057  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13299056 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacact 13298957  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13298956 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 13298857  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298856 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 13298759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15424522 - 15424125
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15424522 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 15424423  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15424422 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 15424323  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15424322 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 15424223  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424222 taaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 15424125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 24863708 - 24864099
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24863708 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24863807  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24863808 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 24863907  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24863908 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 24864007  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaa 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24864008 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaa 24864099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24304823 - 24304426
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304823 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24304724  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24304723 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgat 24304624  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24304623 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 24304524  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304523 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 24304426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 16749845 - 16750242
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16749845 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 16749944  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16749945 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 16750044  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16750045 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16750144  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16750145 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttct 16750242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27272783 - 27272388
Alignment:
Q  3 aatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 102  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27272783 aatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggta 27272684  T
Q  103 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27272683 agcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27272584  T
Q  203 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 302  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  27272583 gaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtg 27272484  T
Q  303 aatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27272483 aatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttct 27272388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 27000064 - 27000402
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27000064 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27000163  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27000164 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 27000263  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27000264 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27000363  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 339  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000364 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34463530 - 34463154
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34463530 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgtt 34463431  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463430 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 34463331  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  34463330 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 34463231  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463230 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 34463154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549863
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 29549776  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549777 gaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 29549863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 29573004 - 29573401
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||    
T  29573004 aaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaggg 29573103  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  29573104 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 29573203  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29573204 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 29573303  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573304 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 29573401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 3696093 - 3696469
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3696093 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 3696192  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  3696193 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 3696292  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||    
T  3696293 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtg 3696392  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3696393 atgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 3696469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758152
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4758066  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4758067 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 4758152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30558221 - 30557824
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30558221 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 30558122  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  30558121 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30558022  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30558021 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30557922  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557921 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 30557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4545959 - 4545583
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4545959 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 4545860  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  4545859 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 4545760  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  4545759 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 4545660  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4545659 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 4545583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 16674151 - 16674527
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674151 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 16674250  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674251 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 16674350  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  16674351 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 16674450  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674451 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16674527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16944232 - 16943835
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16944232 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 16944133  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  16944132 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 16944033  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  16944032 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactg 16943933  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16943932 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16943835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485517
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27485331  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27485332 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27485431  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485432 aagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 27485517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 398
Target Start/End: Original strand, 29501429 - 29501803
Alignment:
Q  24 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29501429 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 29501528  T
Q  124 ctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
T  29501529 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 29501628  T
Q  224 cgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgag 323  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  29501629 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 29501728  T
Q  324 gcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29501729 gaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 29501803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4724318 - 4723942
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4724318 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgtt 4724219  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  4724218 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaa 4724119  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  4724118 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 4724019  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4724018 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 4723942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044776
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct-acgctttgaagtacat 211  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27044689  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27044690 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttct 27044776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116218
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 26116304  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26116303 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttct 26116218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525674
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4525588  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  4525589 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttct 4525674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773390
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4773308  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4773309 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagc 4773390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290178
Alignment:
Q  10 aagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagccccc 109  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  110 acctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtac 209  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtac 27290367  T
Q  210 atcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgg 309  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||     
T  27290366 attgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatga 27290267  T
Q  310 tcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27290266 ttgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 27290178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008115
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27008029  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27008030 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 27008115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27359804
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27359986  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27359985 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27359886  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27359885 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagc 27359804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450147
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27450329  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27450328 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27450229  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27450228 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagc 27450147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 28207466 - 28207842
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28207466 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgtt 28207565  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||     
T  28207566 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaa 28207665  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  28207666 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 28207765  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  28207766 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttct 28207842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26777797 - 26777448
Alignment:
Q  24 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26777797 ttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 26777698  T
Q  124 ctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
T  26777697 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 26777598  T
Q  224 cgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgag 323  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  26777597 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 26777498  T
Q  324 gcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 373  Q
    | |  |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26777497 gaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctct 26777448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 391
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025658
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
     || || || ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 17025579  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 391  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17025580 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14143108
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 14143283  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  14143282 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 14143183  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14143182 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 14143108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788317
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26788142  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26788143 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26788242  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26788243 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 26788317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196690
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27196515  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27196516 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27196615  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196616 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 27196690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252550
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27252725  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27252724 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27252625  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27252624 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 27252550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22457131 - 22456775
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  | | | || || |||||||||||||||||||| |    
T  22457131 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22457032  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22457031 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22456932  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||    
T  22456931 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtg 22456832  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctg 365  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22456831 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctg 22456775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13521896
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 13521968  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13521967 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 13521896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20161031
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 20160903  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||| |||    
T  20160904 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 20161003  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 340  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20161004 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171800
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 22171928  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||| |||    
T  22171927 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 22171828  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 340  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22171827 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374082
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33374251  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  33374250 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33374151  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33374150 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 33374082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892137
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8892305  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  8892304 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8892206  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8892205 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 8892137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903372
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8903540  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  8903539 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8903441  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8903440 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 8903372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 380
Target Start/End: Original strand, 28162656 - 28163027
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  28162656 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 28162755  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||| |||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||    
T  28162756 cacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggta 28162855  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  28162856 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 28162955  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
     | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28162956 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 28163027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22477470 - 22477240
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  | | | || || |||||||||||||||||||| |    
T  22477470 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22477371  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22477370 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22477271  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaag 239  Q
    ||| ||||| |||||| | || |||||||||    
T  22477270 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 398
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019524
Alignment:
Q  335 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 27019524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092261
Alignment:
Q  219 aagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat 318  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||   || | ||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  319 gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
    |||||| |||| | | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagct 17092261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 17014009 - 17014406
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17014009 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacaggg 17014108  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014109 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 17014208  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17014209 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 17014308  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014309 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 17014406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 14665027 - 14665424
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665027 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 14665126  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14665127 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 14665226  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665227 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 14665326  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665327 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 14665424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24592576 - 24592179
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592576 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24592477  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592476 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 24592377  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24592376 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctg 24592277  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592276 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 24592179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14763566 - 14763169
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14763566 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 14763467  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  14763466 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 14763367  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14763366 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 14763267  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763266 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 14763169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 5005882 - 5006275
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5005882 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaagg 5005981  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5005982 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5006081  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  5006082 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctg 5006181  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5006182 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagc 5006275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40105900 - 40105503
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  40105900 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacaggg 40105801  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  40105800 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 40105701  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40105700 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 40105601  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105600 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 40105503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 6569862 - 6570259
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6569862 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 6569961  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || |||    
T  6569962 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 6570061  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6570062 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 6570161  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570162 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 6570259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800478
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18800564  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800563 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 18800478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27163579 - 27163182
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27163579 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 27163480  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  27163479 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 27163380  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27163379 ttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27163280  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27163279 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttct 27163182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344380
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 36344466  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36344465 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 36344380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 14098550 - 14098947
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14098550 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 14098649  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  14098650 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 14098749  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14098750 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 14098849  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098850 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 14098947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31126780 - 31126383
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31126780 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31126681  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  31126680 taagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 31126581  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31126580 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 31126481  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31126480 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 31126383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33674039 - 33673663
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  33674039 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgtt 33673940  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673939 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 33673840  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  33673839 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 33673740  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33673739 aggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 33673663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833793
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 54833707  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833708 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 54833793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 30753784 - 30754160
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30753784 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 30753883  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  30753884 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaa 30753983  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  30753984 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 30754083  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30754084 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 30754160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 39850668 - 39851044
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  39850668 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 39850767  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  39850768 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 39850867  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  39850868 ctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 39850967  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850968 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 39851044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 21969710 - 21970107
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  21969710 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaagg 21969809  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| ||||| || || || ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  21969810 caagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 21969909  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21969910 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 21970009  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| | |||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21970010 tgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 21970107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15285182 - 15284797
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||   ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  15285182 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 15285083  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  15285082 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15284983  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| || |||    
T  15284982 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatg 15284883  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15284882 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagc 15284797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Original strand, 15227887 - 15228272
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  15227887 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctc 15227986  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  15227987 cacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15228086  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  15228087 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 15228186  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | |  | || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15228187 attggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagc 15228272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Original strand, 1900269 - 1900659
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||| || ||    
T  1900269 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaa 1900368  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  1900369 gcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttg 1900468  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  1900469 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 1900568  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1900569 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagc 1900659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460488
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 24460657  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  24460656 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 24460557  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24460556 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 24460488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14235779 - 14235391
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| | || | || ||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  14235779 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctc 14235680  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||| | || |||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||     
T  14235679 cacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagtt 14235580  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || || |||||| | || || |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  14235579 cattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 14235480  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 397  Q
     | ||    | ||| | |||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  14235479 attgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttc 14235391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 396
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24113066
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||| |     
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 24112981  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagctt 396  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  24112982 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 24113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188827
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||| |     
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 34188912  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagctt 396  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  34188911 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 34188827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15391574 - 15391207
Alignment:
Q  27 cctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc 126  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||||||| || |  | ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  15391574 cctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctc 15391475  T
Q  127 ccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 226  Q
    |||||||| | || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  15391474 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 15391375  T
Q  227 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat-gtgaggc 325  Q
    |||  | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| || ||| ||| ||| |  ||| |     
T  15391374 tgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agagtcatgaaga 15391276  T
Q  326 agctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    || ||| || |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  15391275 agttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagc 15391207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27434695 - 27434298
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27434695 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27434596  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27434595 caagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 27434496  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27434495 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27434396  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434395 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 27434298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 28882204 - 28882601
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882204 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 28882303  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28882304 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 28882403  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28882404 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 28882503  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882504 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 28882601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 12655532 - 12655929
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12655532 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 12655631  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655632 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 12655731  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12655732 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccg 12655831  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655832 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 12655929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 20837908 - 20838305
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20837908 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 20838007  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20838008 caagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 20838107  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20838108 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 20838207  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838208 taaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 20838305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23128817 - 23128420
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128817 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 23128718  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23128717 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23128618  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23128617 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23128518  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128517 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttct 23128420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11635437 - 11635040
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11635437 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 11635338  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| || |||    
T  11635337 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgct 11635238  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11635237 ttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctg 11635138  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11635137 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 11635040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11641626 - 11641229
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11641626 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 11641527  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| || |||    
T  11641526 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgct 11641427  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11641426 ttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctg 11641327  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641326 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 11641229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21677433 - 21677036
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21677433 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 21677334  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  21677333 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 21677234  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21677233 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 21677134  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21677133 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttct 21677036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 34861670 - 34862067
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34861670 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 34861769  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  34861770 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 34861869  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34861870 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 34861969  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861970 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 34862067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37686160 - 37685763
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37686160 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 37686061  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  37686060 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 37685961  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37685960 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctg 37685861  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37685860 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 37685763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37701425 - 37701028
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37701425 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 37701326  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  37701325 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 37701226  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37701225 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctg 37701126  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701125 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 37701028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 32049788 - 32050185
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32049788 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 32049887  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  32049888 taaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 32049987  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  32049988 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 32050087  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| | ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32050088 tgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 32050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 37925483 - 37925880
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37925483 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 37925582  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  37925583 taagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 37925682  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  37925683 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 37925782  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925783 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 37925880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13936791 - 13936398
Alignment:
Q  5 tcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaag 104  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||    
T  13936791 tcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaag 13936692  T
Q  105 cccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttga 204  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13936691 cctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttga 13936592  T
Q  205 agtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaa 304  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13936591 agtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaa 13936492  T
Q  305 tatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936491 tatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 13936398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 34286344 - 34286741
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34286344 aaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 34286443  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  34286444 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgct 34286543  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  34286544 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccg 34286643  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286644 tgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 34286741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 34291404 - 34291801
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34291404 aaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 34291503  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  34291504 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgct 34291603  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  34291604 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccg 34291703  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291704 tgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 34291801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375548
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37375462  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37375463 aagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttct 37375548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16829589 - 16829192
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16829589 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 16829490  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16829489 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16829390  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16829389 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16829290  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829289 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16829192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 16891892 - 16892289
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16891892 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 16891991  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16891992 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16892091  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16892092 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16892191  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16892192 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16892289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 27777233 - 27777609
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27777233 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 27777332  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  27777333 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 27777432  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  27777433 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27777532  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27777533 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 27777609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 27816991 - 27817367
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27816991 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 27817090  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  27817091 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 27817190  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  27817191 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27817290  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27817291 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 27817367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 31876271 - 31876668
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31876271 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31876370  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  31876371 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 31876470  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31876471 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 31876570  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31876571 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttct 31876668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 40233522 - 40233898
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40233522 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 40233621  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  40233622 gcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 40233721  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||    
T  40233722 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtg 40233821  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40233822 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttct 40233898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 260983 - 260607
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  260983 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgtt 260884  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  260883 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 260784  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |    
T  260783 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcg 260684  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260683 aggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 260607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12716832 - 12716456
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  12716832 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 12716733  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  12716732 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 12716633  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  12716632 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 12716533  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12716532 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 12716456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 27803718 - 27804094
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27803718 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 27803817  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  27803818 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 27803917  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  27803918 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27804017  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27804018 aggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 27804094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39052052 - 39051676
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  39052052 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 39051953  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  39051952 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 39051853  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  39051852 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 39051753  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39051752 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 39051676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22926279 - 22925897
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22926279 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 22926180  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  22926179 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 22926080  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  22926079 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctg 22925980  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    | || ||| | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22925979 tgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 22925897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890461
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatat 39890274  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39890275 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 39890374  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39890375 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 39890461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19416750 - 19416353
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19416750 aaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 19416651  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  19416650 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 19416551  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  19416550 ttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 19416451  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416450 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 19416353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 12586821 - 12587197
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  12586821 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 12586920  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  12586921 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 12587020  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  12587021 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 12587120  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587121 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 12587197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 34279439 - 34279698
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34279439 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 34279538  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  34279539 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 34279638  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 260  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279639 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21703412 - 21703022
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||||| |||    
T  21703412 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaa 21703313  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  21703312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttg 21703213  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21703212 aagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 21703113  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21703112 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagc 21703022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9350212 - 9349836
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||    
T  9350212 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggacccttt 9350113  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  9350112 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 9350013  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||    
T  9350012 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 9349913  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||  | ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9349912 aggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 9349836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19456664 - 19456279
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  19456664 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 19456565  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  19456564 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagta 19456465  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  19456464 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 19456365  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  19456364 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagc 19456279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303161
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 34303347  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||    
T  34303346 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatg 34303247  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  34303246 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagc 34303161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27119060
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 27118885  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| |||    
T  27118886 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatg 27118985  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||  || ||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27118986 attgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaag 27119060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31891571 - 31891200
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  31891571 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 31891472  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31891471 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggta 31891372  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  31891371 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 31891272  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
     | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  31891271 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccaccacacatc 31891200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3785023
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 3784854  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  3784855 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 3784954  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3784955 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 3785023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16163968
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 16163799  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  16163800 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 16163899  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16163900 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 16163968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157379
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34157211  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  34157212 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 34157310  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34157311 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 34157379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 27392985 - 27393250
Alignment:
Q  27 cctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc 126  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| |||||||| || |  | ||| || || |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27392985 cctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctc 27393084  T
Q  127 ccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 226  Q
    ||||||||   || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  27393085 ccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 27393184  T
Q  227 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 292  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  27393185 tgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatca 27393250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47247 - 46850
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47247 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 47148  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47147 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 47048  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47047 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 46948  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46947 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 46850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40331 - 39934
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40331 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 40232  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40231 caagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 40132  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40131 ttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 40032  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40031 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 39934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 29760 - 30154
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29760 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 29859  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29860 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttg 29959  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29960 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaa 30059  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30060 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttct 30154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 16277548 - 16277945
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277548 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 16277647  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277648 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 16277747  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16277748 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccg 16277847  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277848 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16277945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2137480 - 2137083
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2137480 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 2137381  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2137380 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 2137281  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2137280 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 2137181  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137180 taaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 2137083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 19688092 - 19688489
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688092 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 19688191  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19688192 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 19688291  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19688292 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 19688391  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688392 taaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 19688489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27609126 - 27608730
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27609126 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27609027  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27609026 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgct 27608927  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27608926 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27608827  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 397  Q
    | |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608826 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27608730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 14557618 - 14558015
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557618 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 14557717  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14557718 caagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 14557817  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14557818 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 14557917  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557918 taaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 14558015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 16283446 - 16283840
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16283446 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaa 16283545  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16283546 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttg 16283645  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16283646 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtga 16283745  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | ||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16283746 acatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttct 16283840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31489971 - 31489574
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31489971 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31489872  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  31489871 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 31489772  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31489771 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 31489672  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489671 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 31489574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19208581 - 19208184
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19208581 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 19208482  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  19208481 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 19208382  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19208381 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 19208282  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208281 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 19208184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 19674435 - 19674832
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19674435 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 19674534  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| || |||    
T  19674535 caaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgct 19674634  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  19674635 ttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 19674734  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19674735 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 19674832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28362176 - 28361779
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28362176 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28362077  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  28362076 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 28361977  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28361976 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 28361877  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28361876 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 28361779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 31354518 - 31354914
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354518 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31354617  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  31354618 caagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 31354717  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31354718 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 31354817  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 397  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31354818 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31354914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329331
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcg 3329417  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329416 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 3329331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286853
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 19286767  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286768 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 19286853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 33258717 - 33259114
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33258717 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 33258816  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33258817 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 33258916  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||    
T  33258917 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttg 33259016  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259017 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 33259114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 57 - 398
Target Start/End: Original strand, 29829372 - 29829713
Alignment:
Q  57 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatt 156  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||  |||||||||    
T  29829372 cttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgatt 29829471  T
Q  157 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 256  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29829472 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataa 29829571  T
Q  257 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 356  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||     
T  29829572 tgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgcc 29829671  T
Q  357 actcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29829672 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 29829713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092548
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 12092734  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12092733 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 12092634  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  12092633 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttct 12092548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 171 - 398
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189485
Alignment:
Q  171 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  271 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 370  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 189457  T
Q  371 tctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189458 tctacacatcaagctgtgcaaagcttct 189485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18710962
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 18710890  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18710891 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 18710962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9355014
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 9354826  T
Q  212 cgtgaaaaag-ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggt 310  Q
     || |||||  ||| | || ||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9354827 tgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 9354926  T
Q  311 cgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9354927 cgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttct 9355014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19659249 - 19658879
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| |  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19659249 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 19659150  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||| |||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  19659149 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 19659050  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  19659049 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 19658951  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19658950 gaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaag 19658879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563475
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 44563302  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  44563303 cattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatg 44563400  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| |||||| |||   || ||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44563401 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 44563475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 382
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33245040
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||| ||| || || |||||| |||| |  | ||| |  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33244869  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||| |     
T  33244870 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgatt 33244969  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaa 382  Q
    || | || ||||| |||||  ||||  || ||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33244970 gaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaa 33245040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22081013 - 22080706
Alignment:
Q  87 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 186  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  22081013 acaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttg 22080914  T
Q  187 aggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    | || || ||||||||||||||||| || || |||||| |||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  22080913 aaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttcc 22080814  T
Q  287 aaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaat-gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
     ||||| || ||||| || ||| ||| ||| |  ||| | || ||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22080813 gaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagct 22080715  T
Q  386 gtgcaaagc 394  Q
     ||| ||||    
T  22080714 atgccaagc 22080706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19518337 - 19518277
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggaca 82  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19518337 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggaca 19518277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10917016 - 10916619
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917016 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 10916917  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10916916 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 10916817  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10916816 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 10916717  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10916716 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttct 10916619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16503528 - 16503131
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16503528 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 16503429  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16503428 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtt 16503329  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16503328 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16503229  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503228 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16503131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16518564 - 16518167
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16518564 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 16518465  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16518464 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtt 16518365  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16518364 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 16518265  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518264 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 16518167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 2154568 - 2154965
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154568 aaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 2154667  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2154668 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgct 2154767  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2154768 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 2154867  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154868 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 2154965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11424924 - 11424527
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11424924 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacaggg 11424825  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11424824 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 11424725  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11424724 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 11424625  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424624 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 11424527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 5127987 - 5128384
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5127987 aaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 5128086  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5128087 taagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgct 5128186  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  5128187 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 5128286  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5128287 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 5128384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4145271 - 4144874
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4145271 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 4145172  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  4145171 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 4145072  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4145071 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 4144972  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4144971 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 4144874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5147488 - 5147091
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5147488 aaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5147389  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5147388 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5147289  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5147288 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 5147189  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147188 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 5147091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26320017 - 26319620
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26320017 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26319918  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  26319917 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 26319818  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  26319817 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactg 26319718  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319717 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26319620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26275242 - 26274845
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26275242 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26275143  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  26275142 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgct 26275043  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26275042 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26274943  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26274942 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26274845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26670062 - 26669665
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26670062 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26669963  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  26669962 taagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 26669863  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26669862 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26669763  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669762 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26669665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 9618646 - 9619043
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9618646 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 9618745  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  9618746 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 9618845  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9618846 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 9618945  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9618946 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttct 9619043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16736608 - 16736211
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16736608 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 16736509  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16736508 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16736409  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16736408 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 16736309  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16736308 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 16736211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16751662 - 16751265
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16751662 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 16751563  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  16751562 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 16751463  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16751462 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 16751363  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16751362 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 16751265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 17523527 - 17523924
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17523527 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 17523626  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  17523627 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 17523726  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  17523727 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 17523826  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17523827 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 17523924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17529688 - 17529291
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17529688 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 17529589  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  17529588 caagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 17529489  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  17529488 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccg 17529389  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17529388 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 17529291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 45387338 - 45387735
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45387338 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 45387437  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  45387438 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 45387537  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45387538 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 45387637  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45387638 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 45387735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26537997 - 26537621
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26537997 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 26537898  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  26537897 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 26537798  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  26537797 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 26537698  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26537697 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26537621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 26435252 - 26435649
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26435252 aaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26435351  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  26435352 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 26435451  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26435452 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26435551  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435552 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26435649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564141
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31564227  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31564226 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 31564141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 57 - 398
Target Start/End: Original strand, 11441623 - 11441964
Alignment:
Q  57 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatt 156  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  11441623 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 11441722  T
Q  157 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 256  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441723 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataa 11441822  T
Q  257 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 356  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11441823 tgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgca 11441922  T
Q  357 actcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11441923 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 11441964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24592689 - 24592292
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24592689 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 24592590  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  24592589 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 24592490  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24592489 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctg 24592390  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24592389 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 24592292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 3445322 - 3445698
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3445322 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 3445421  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445422 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaag 3445521  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  3445522 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 3445621  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3445622 aggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 3445698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125312
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31125126  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31125127 gtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31125226  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125227 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 31125312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 385
Target Start/End: Original strand, 16041321 - 16041702
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  16041321 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 16041420  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16041421 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttg 16041520  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16041521 aagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 16041620  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
    | ||| | || | ||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041621 acatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 16041702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449753
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 16449939  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  16449938 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 16449839  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | || | || ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16449838 attgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagc 16449753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26485071
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26484896  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26484897 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26484996  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26484997 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 26485071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108772
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 2108946  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  2108945 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 2108846  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaa 382  Q
     | || | || ||||| ||||||  |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108845 attgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaa 2108772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39210789
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 39210964  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  39210963 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 39210864  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39210863 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 39210789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775736
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2775664  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2775665 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 2775736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088233
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 31088402  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  31088401 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 31088302  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31088301 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 31088233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 141 - 383
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200924
Alignment:
Q  141 gacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagc 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| || | |||||||||     
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  241 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 340  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  341 tgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4200882 cgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 4200924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 380
Target Start/End: Original strand, 45733541 - 45733834
Alignment:
Q  87 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  45733541 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcg 45733640  T
Q  187 aggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    | || |||||||| |||| |||||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  45733641 aaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttcc 45733740  T
Q  287 aaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
     ||||| || |||||||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45733741 gaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 45733834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 396
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18541189
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||| || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 18541001  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    |||||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  18541002 catcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 18541101  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagctt 396  Q
     | ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  18541102 attgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 18541189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 26683013 - 26682766
Alignment:
Q  136 ggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaagg 235  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||  | ||||| ||| | || |||||    
T  26683013 ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaagg 26682914  T
Q  236 aaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctaga 335  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| | || | || ||||| ||||||  ||    
T  26682913 aaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 26682814  T
Q  336 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26682813 cttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 26682766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 396
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159909
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| || || |||||  |     
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataatt 5159824  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagctt 396  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  5159825 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctt 5159909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 398
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513173
Alignment:
Q  355 caactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 26513173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26485850 - 26485756
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgat 116  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||    
T  26485850 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgat 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 11549357 - 11549754
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11549357 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 11549456  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11549457 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 11549556  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11549557 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 11549656  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549657 taaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 11549754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23718147 - 23717750
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23718147 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 23718048  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23718047 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23717948  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23717947 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23717848  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717847 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 23717750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24688316 - 24687919
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24688316 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 24688217  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24688216 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 24688117  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24688116 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 24688017  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688016 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 24687919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 30934636 - 30935033
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934636 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 30934735  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30934736 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 30934835  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30934836 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30934935  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30934936 tatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 30935033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 33777490 - 33777887
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777490 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 33777589  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777590 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 33777689  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  33777690 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactg 33777789  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777790 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 33777887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23752609 - 23752212
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23752609 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 23752510  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23752509 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 23752410  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23752409 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 23752310  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752309 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 23752212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22999273 - 22998876
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999273 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 22999174  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22999173 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 22999074  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22999073 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctg 22998974  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998973 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 22998876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 24970024 - 24970418
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24970024 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 24970123  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24970124 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 24970223  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24970224 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaa 24970323  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24970324 atatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 24970418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15658919 - 15658522
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15658919 aaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 15658820  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  15658819 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 15658720  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15658719 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 15658620  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15658619 tgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttct 15658522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9548702 - 9548323
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9548702 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 9548603  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9548602 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 9548503  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9548502 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 9548403  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548402 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 9548323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8665634 - 8665238
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8665634 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 8665535  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  8665534 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 8665435  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8665434 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctg 8665335  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 397  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8665334 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 8665238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 9317454 - 9317851
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9317454 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 9317553  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  9317554 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 9317653  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9317654 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 9317753  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317754 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 9317851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 12132158 - 12132555
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12132158 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 12132257  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  12132258 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 12132357  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12132358 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 12132457  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132458 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 12132555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15759016 - 15758620
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15759016 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 15758917  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  15758916 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 15758817  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  15758816 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 15758717  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 397  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15758716 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 15758620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 2511054 - 2511451
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2511054 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 2511153  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  2511154 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 2511253  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  2511254 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 2511353  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2511354 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 2511451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 6874308 - 6874705
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6874308 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 6874407  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  6874408 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 6874507  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6874508 ttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 6874607  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6874608 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 6874705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 30152021 - 30152418
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30152021 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 30152120  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  30152121 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30152220  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30152221 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30152320  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30152321 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttct 30152418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500492
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18500578  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500577 aagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 18500492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 26480395 - 26480791
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26480395 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26480494  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  26480495 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 26480594  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26480595 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 26480694  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480695 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaact-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 26480791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 30168472 - 30168869
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  30168472 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacaggg 30168571  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  30168572 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30168671  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  30168672 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 30168771  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168772 tgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 30168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 5637913 - 5638310
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5637913 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 5638012  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  5638013 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 5638112  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  5638113 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttg 5638212  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5638213 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 5638310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649635
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28649549  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649550 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 28649635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616918
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34616831  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34616832 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttct 34616918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18375571 - 18375174
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18375571 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 18375472  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  18375471 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 18375372  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18375371 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 18375272  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18375271 tgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 18375174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755380
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37755294  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37755295 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttct 37755380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 43078276 - 43078652
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078276 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 43078375  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078376 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 43078475  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  43078476 ctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 43078575  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078576 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 43078652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 33516359 - 33516756
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33516359 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 33516458  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  33516459 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 33516558  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33516559 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 33516658  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516659 tgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 33516756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29967225 - 29966828
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29967225 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 29967126  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  29967125 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 29967026  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  29967025 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 29966926  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29966925 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 29966828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 30029418 - 30029815
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30029418 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 30029517  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  30029518 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 30029617  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  30029618 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 30029717  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029718 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 30029815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770749
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
     |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37770835  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37770834 aagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttct 37770749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 24681464 - 24681840
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24681464 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 24681563  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  24681564 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 24681663  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24681664 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 24681763  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24681764 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 24681840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 24723991 - 24724367
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24723991 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 24724090  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  24724091 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 24724190  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24724191 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 24724290  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24724291 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 24724367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31826545 - 31826169
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31826545 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 31826446  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826445 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaag 31826346  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31826345 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 31826246  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31826245 aggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 31826169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40473687 - 40473311
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  40473687 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 40473588  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  40473587 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 40473488  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  40473487 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 40473388  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473387 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 40473311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789941
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 3789855  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3789856 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 3789941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671245
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37671331  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37671330 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 37671245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 31431464 - 31431840
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31431464 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 31431563  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  31431564 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 31431663  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  31431664 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 31431763  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31431764 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttct 31431840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 41674712 - 41675109
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41674712 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 41674811  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  41674812 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgct 41674911  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
     | ||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  41674912 ctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccg 41675011  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| | ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41675012 tgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttct 41675109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 23892212 - 23892606
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  23892212 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 23892311  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||    
T  23892312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctg 23892411  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  23892412 aagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtga 23892511  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |  || | || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23892512 acgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttct 23892606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 385
Target Start/End: Original strand, 22888476 - 22888857
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || | |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  22888476 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 22888575  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22888576 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 22888675  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22888676 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 22888775  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888776 acatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 22888857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358405
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 37358591  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37358590 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37358491  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37358490 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 37358405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959552
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28959735  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28959734 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 28959635  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    ||||  |||||||   ||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28959634 gaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagc 28959552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599238
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| ||    
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatc 32599321  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32599320 gaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagc 32599238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29888844
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||| | || || ||| |||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagta 29889034  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  29889033 catcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 29888934  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
     | || |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29888933 attgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttct 29888844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324591
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
     || || || ||||| |||||| | || || ||| ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 13324677  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13324676 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 13324591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Original strand, 25199035 - 25199425
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25199035 atcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 25199134  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  25199135 gcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcttta 25199234  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  25199235 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 25199334  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | ||| | || | || ||||  ||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  25199335 acatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagc 25199425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877632
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33877560  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33877561 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 33877632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326176
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| ||| |     
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgatt 11326107  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11326108 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 11326176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184425
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13184597  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  13184596 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13184497  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13184496 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaag 13184425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440274
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||| | || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13440443  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| ||| |     
T  13440442 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13440343  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13440342 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatc 13440274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 396
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292923
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||  || || |||||| |     
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgatt 33292838  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagctt 396  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  33292839 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 33292923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8301570 - 8301173
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301570 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 8301471  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8301470 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgct 8301371  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8301370 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 8301271  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301270 taaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 8301173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 18330624 - 18331021
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330624 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 18330723  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330724 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 18330823  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18330824 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 18330923  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18330924 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 18331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15893006 - 15892612
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15893006 atcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 15892907  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15892906 gcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 15892807  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15892806 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaa 15892707  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892706 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 15892612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4796956 - 4796559
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796956 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 4796857  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4796856 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 4796757  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4796756 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 4796657  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796656 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 4796559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 6192271 - 6192668
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192271 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 6192370  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6192371 caagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 6192470  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6192471 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 6192570  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192571 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 6192668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15741397 - 15741000
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15741397 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 15741298  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15741297 caagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgct 15741198  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15741197 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 15741098  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15741097 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttct 15741000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 4721586 - 4721983
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4721586 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 4721685  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4721686 caagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacact 4721785  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  4721786 ttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttg 4721885  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721886 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 4721983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 8295927 - 8296324
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8295927 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacaggg 8296026  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8296027 caagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 8296126  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8296127 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 8296226  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296227 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 8296324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 18051217 - 18051614
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051217 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 18051316  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18051317 caagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 18051416  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18051417 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 18051516  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | || ||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18051517 tgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttct 18051614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29149058 - 29148661
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29149058 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacaggg 29148959  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29148958 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 29148859  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29148858 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 29148759  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148758 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 29148661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 35880721 - 35881118
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35880721 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacaggg 35880820  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35880821 caagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 35880920  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35880921 ttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 35881020  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881021 tgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 35881118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18277355 - 18276958
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18277355 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 18277256  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  18277255 caagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 18277156  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18277155 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 18277056  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277055 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 18276958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18307957 - 18307560
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18307957 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 18307858  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  18307857 caagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 18307758  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18307757 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 18307658  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307657 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 18307560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387484
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22387571  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22387570 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttct 22387484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18292656 - 18292259
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18292656 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 18292557  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  18292556 caagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 18292457  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18292456 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctg 18292357  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18292356 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 18292259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 4416874 - 4417267
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4416874 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 4416973  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  4416974 caaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 4417073  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4417074 ttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 4417173  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4417174 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagc 4417267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28116257 - 28115860
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28116257 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28116158  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || |||    
T  28116157 caagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 28116058  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28116057 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 28115958  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28115957 tgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 28115860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 7073167 - 7073564
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  7073167 aaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaagg 7073266  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  7073267 taagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 7073366  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7073367 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 7073466  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073467 tgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 7073564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 31964776 - 31964380
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31964776 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 31964677  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  31964676 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 31964577  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31964576 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 31964477  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 397  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31964476 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31964380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5609625 - 5609228
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5609625 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 5609526  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  5609525 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgct 5609426  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  5609425 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 5609326  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5609325 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 5609228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 50134374 - 50133990
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50134374 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 50134275  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  50134274 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 50134175  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  50134174 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 50134075  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50134074 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 10396088 - 10396481
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  10396088 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacaggg 10396187  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10396188 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 10396287  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10396288 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 10396387  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10396388 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagc 10396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 28339257 - 28339654
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28339257 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28339356  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  28339357 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 28339456  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  28339457 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 28339556  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28339557 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 28339654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 47023408 - 47023805
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47023408 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 47023507  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  47023508 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 47023607  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  47023608 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactg 47023707  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47023708 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttct 47023805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 7996517 - 7996914
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7996517 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 7996616  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  7996617 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 7996716  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  7996717 ttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 7996816  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7996817 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 7996914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 10643025 - 10643422
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10643025 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 10643124  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10643125 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 10643224  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  10643225 ttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 10643324  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10643325 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 10643422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346593
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4346680  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4346679 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 4346593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 21674648 - 21675045
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  21674648 aaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacaggg 21674747  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  21674748 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 21674847  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21674848 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctg 21674947  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674948 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 21675045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021627
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28021540  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021541 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 28021627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 48465903 - 48466279
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48465903 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgtt 48466002  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466003 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 48466102  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  48466103 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 48466202  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466203 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 48466279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542368
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6542454  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542453 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 6542368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 8211714 - 8212090
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8211714 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgtt 8211813  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211814 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 8211913  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  8211914 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 8212013  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8212014 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttct 8212090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20577129 - 20576753
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  20577129 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 20577030  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  20577029 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 20576930  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  20576929 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 20576830  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20576829 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 20576753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36997359 - 36996983
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36997359 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgtt 36997260  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997259 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaag 36997160  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  36997159 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 36997060  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36997059 aggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 36996983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 57 - 398
Target Start/End: Original strand, 5466996 - 5467337
Alignment:
Q  57 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatt 156  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  5466996 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 5467095  T
Q  157 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 256  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5467096 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataa 5467195  T
Q  257 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 356  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5467196 tgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgca 5467295  T
Q  357 actcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5467296 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 5467337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870762
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22870849  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22870848 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttct 22870762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885821
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22885908  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22885907 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttct 22885821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18243091
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18242905  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcg 312  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18242906 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18243005  T
Q  313 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18243006 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 18243091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11110631 - 11110255
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11110631 cttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgtt 11110532  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110531 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 11110432  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||    
T  11110431 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtg 11110332  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11110331 aggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 11110255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29665252 - 29664876
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  29665252 cttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccttt 29665153  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
     ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29665152 acctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaag 29665053  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  29665052 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 29664953  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29664952 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 29664876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 67 - 398
Target Start/End: Original strand, 51782044 - 51782375
Alignment:
Q  67 tactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaagg 166  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||    
T  51782044 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 51782143  T
Q  167 cgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcat 266  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51782144 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 51782243  T
Q  267 gtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctgg 366  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51782244 gtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctgg 51782343  T
Q  367 tgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51782344 tgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 51782375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17985259 - 17984862
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17985259 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 17985160  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || |||    
T  17985159 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgct 17985060  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17985059 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 17984960  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  17984959 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttct 17984862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 18225146 - 18225543
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18225146 aaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 18225245  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  18225246 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 18225345  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  18225346 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactg 18225445  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18225446 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 18225543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 24328114 - 24328511
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24328114 aaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 24328213  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  24328214 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 24328313  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  24328314 ttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 24328413  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328414 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 24328511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 5013667 - 5014064
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5013667 aaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 5013766  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  5013767 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5013866  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  5013867 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 5013966  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013967 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 5014064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5596637 - 5596263
Alignment:
Q  24 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5596637 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 5596538  T
Q  124 ctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
T  5596537 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 5596438  T
Q  224 cgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgag 323  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  5596437 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 5596338  T
Q  324 gcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5596337 gaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttct 5596263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 67 - 395
Target Start/End: Original strand, 51797133 - 51797462
Alignment:
Q  67 tactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccca-ggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaag 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||    
T  51797133 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaag 51797232  T
Q  166 gcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgca 265  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  51797233 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccaca 51797332  T
Q  266 tgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctg 365  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51797333 tgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctg 51797432  T
Q  366 gtgcctctacacatcaagctgtgcaaagct 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51797433 gtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 5713182 - 5713561
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5713182 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5713281  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5713282 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5713381  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5713382 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5713481  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5713482 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 5713561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 5724092 - 5724471
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5724092 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5724191  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5724192 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5724291  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5724292 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5724391  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5724392 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 5724471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5757385 - 5757006
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5757385 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5757286  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5757285 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5757186  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5757185 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5757086  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5757085 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 5757006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5768276 - 5767897
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5768276 aaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacaggg 5768177  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  5768176 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 5768077  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  5768076 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctg 5767977  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    |||| ||| | || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5767976 taaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 5767897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530736
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 18530550  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  18530551 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 18530650  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | || | || ||||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18530651 attgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagc 18530736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16626801 - 16626416
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||  ||||| || || ||| |||| | |||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  16626801 caagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16626702  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  16626701 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 16626602  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||| || |||    
T  16626601 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatg 16626502  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
     | || | || ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  16626501 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagc 16626416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32293089
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||| | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 32292914  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  32292915 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 32293014  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32293015 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 32293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31034038
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||| |     
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 31034110  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31034109 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 31034038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993690
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 17993877  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  17993876 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 17993777  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993776 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 17993690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652724
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||  | ||| || || ||||||||||||||||||||  |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||| |||| |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 5652552  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |     
T  5652553 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgatt 5652652  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    || | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5652653 gaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaag 5652724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626278
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |  | ||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 4626109  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |     
T  4626110 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 4626209  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatc 380  Q
    || | || ||||  |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4626210 gaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatc 4626278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 389
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439497
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||| |     
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 32439419  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgc 389  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  32439420 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgc 32439497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066305
Alignment:
Q  13 ctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  113 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatc 212  Q
     |  || || ||||| |||||| | || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  213 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    || || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 20066305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893387
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| || ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    | || || || ||||| ||||||   || || ||  | ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T
Q  212 cgtgaaaaagct 223  Q
    ||| || |||||    
T  4893376 cgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 27286 - 27683
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27286 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacaggg 27385  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27386 caagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgct 27485  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27486 ttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 27585  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27586 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttct 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 1
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctg-agttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagg 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  392 aaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagg 293  T
Q  100 gcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgc 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  292 gcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgc 193  T
Q  200 tttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgct 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  192 tttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgct 93  T
Q  300 gtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 391  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  92 gtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41793570 - 41793173
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41793570 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 41793471  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  41793470 caagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 41793371  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  41793370 ttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 41793271  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41793270 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 41793173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 10962663 - 10963060
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10962663 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacaggg 10962762  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  10962763 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 10962862  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10962863 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 10962962  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962963 tgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 10963060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 28584974 - 28585371
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28584974 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 28585073  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  28585074 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 28585173  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28585174 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctg 28585273  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28585274 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 28585371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 51638211 - 51638608
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  51638211 aaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcaggg 51638310  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  51638311 taagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 51638410  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  51638411 ttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 51638510  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  51638511 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttct 51638608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16208290 - 16207900
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||| ||    
T  16208290 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaa 16208191  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16208190 acctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 16208091  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  16208090 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 16207991  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | ||| | || | || ||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16207990 acatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagc 16207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20340594 - 20340215
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  20340594 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 20340495  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20340494 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 20340395  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20340394 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 20340295  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20340294 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 20340215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 383
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152237
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 28152062  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  28152063 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 28152162  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
     | ||   || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28152163 attgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 28152237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461458
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20461281  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 308  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  20461282 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 20461381  T
Q  309 gtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
     | || | || ||||  |||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461382 attgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagct 20461458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7501 - 7104
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7501 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 7402  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  7401 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 7302  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  7301 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactg 7202  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7201 tgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 7104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 8931
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9328 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 9229  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  9228 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 9129  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  9128 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctg 9029  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9028 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 8931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 20009 - 20406
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20009 aaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 20108  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  20109 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 20208  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20209 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctg 20308  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20309 tgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttct 20406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 30447 - 30843
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30447 aaaatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacaggg 30545  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  30546 caagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgct 30645  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30646 ttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 30745  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30746 taaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20730
Alignment:
Q  9 caagctagacct-cctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagccc 107  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  20390 caagctagacctacctttccc-ccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcct 20488  T
Q  108 ccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20489 ccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagt 20588  T
Q  208 acatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatat 307  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  20589 acattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacat 20687  T
Q  308 ggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 350  Q
    | | || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20688 gattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 20730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15192 - 14795
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15192 aaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaggg 15093  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||    
T  15092 taagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgct 14993  T
Q  201 ttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctg 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14992 ttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctg 14893  T
Q  301 taaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    | ||| || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892 tgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 14795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 6025 - 6405
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgtt-atatgctgagttgcttccgacttt-actccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccg 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6025 cttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccg 6124  T
Q  120 ttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttc-catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt-gaagtacatcgtgaa 217  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  6125 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaa 6224  T
Q  218 aaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaa 317  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||      
T  6225 gaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtg 6324  T
Q  318 tgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6325 tgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 6405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2093 - 1831
Alignment:
Q  87 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2093 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 1994  T
Q  187 aggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1993 aaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 1895  T
Q  287 aaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 350  Q
     ||||| || |||||||| ||| | || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1894 gaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26464 - 26066
Alignment:
Q  1 aaaatcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacaggg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26464 aaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacaggg 26365  T
Q  101 caagcccccacctgatccgttgcctccca-ggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  26364 taagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgc 26265  T
Q  200 tttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgct 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26264 tttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgct 26165  T
Q  300 gtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    || |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26164 gtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttct 26066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9953
Alignment:
Q  12 gctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 111  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  112 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacat 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  212 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtc 311  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9870  T
Q  312 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9871 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 9953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 398
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8340
Alignment:
Q  22 ctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgtt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7964 cttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgtt 8063  T
Q  122 gcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaag 221  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||     
T  8064 gcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaa 8163  T
Q  222 ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtg 321  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  8164 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 8263  T
Q  322 aggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8264 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttct 8340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46664
Alignment:
Q  9 caagctagacctccttt-ccctccgatacc-gatgttatatgctgagttgcttccgac---tttactccatagagg-acattgtacaacc-agacagggc 101  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  102 aa--gcccccacctgatccgttgcctcccaggttca-ggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc- 194  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||     
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcg 46873  T
Q  195 tacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaa-gctgactttt-gagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 292  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  293 tgccgctgtaaatatg-gtcgaagaatgtga-ggcagctcct-agacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgc 389  Q
    ||| ||||||||||||  || ||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46772 tgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgc 46673  T
Q  390 aaagcttct 398  Q
    |||||||||    
T  46672 aaagcttct 46664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2917 - 2538
Alignment:
Q  4 atcagcaagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaa 103  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  2917 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 2818  T
Q  104 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2817 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 2718  T
Q  204 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 303  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  2717 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 2618  T
Q  304 atatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 383  Q
    | ||| | || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2617 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaag 2538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 5
Alignment:
Q  9 caagctagacctcctttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || ||  |||||||||| |||||||| |    
T  282 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctc 183  T
Q  109 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagta 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  182 cacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 83  T
Q  209 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 286  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  82 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 394
Target Start/End: Original strand, 21581 - 21948
Alignment:
Q  27 cctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc 126  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  21581 cctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctc 21680  T
Q  127 ccaggttcaggtcagacctcgaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 226  Q
    |||||||| | || |||||| | || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || || |||||| |    
T  21681 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcat 21780  T
Q  227 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggca 326  Q
    ||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    | |||   |    
T  21781 tgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaa 21880  T
Q  327 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 394  Q
    | |||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  21881 gttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagc 21948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 496
Alignment:
Q  153 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgaga 252  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  253 ataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgt 352  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    | ||| | || ||| || ||||| |||||||| ||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgt 529  T
Q  353 cgcaactcctctggtgcctctacacatcaagct 385  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  528 tgcaactcctctggtaccgctacacatcaagct 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University