View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7830_low_11 (Length: 223)

Name: NF7830_low_11
Description: NF7830
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7830_low_11
NF7830_low_11
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (2-223)||(29148775-29148996)
chr3 (2-223)||(22387598-22387819)
chr3 (2-223)||(6192333-6192554)
chr3 (2-223)||(28115974-28116195)
chr3 (5-223)||(18330689-18330907)
chr3 (2-223)||(4416936-4417157)
chr3 (2-223)||(4796673-4796894)
chr3 (2-219)||(18277076-18277293)
chr3 (2-219)||(18292377-18292594)
chr3 (2-219)||(18307678-18307895)
chr3 (1-223)||(8301287-8301509)
chr3 (2-223)||(10396150-10396371)
chr3 (2-219)||(31964497-31964714)
chr3 (2-223)||(35880783-35881004)
chr3 (2-219)||(47023470-47023687)
chr3 (2-219)||(50134095-50134312)
chr3 (6-222)||(21674714-21674930)
chr3 (1-223)||(8295988-8296210)
chr3 (1-223)||(15892726-15892948)
chr3 (6-223)||(5467006-5467223)
chr3 (2-223)||(7073229-7073450)
chr3 (2-223)||(15741114-15741335)
chr3 (6-223)||(22870876-22871093)
chr3 (6-223)||(22885935-22886152)
chr3 (6-223)||(51782044-51782261)
chr3 (6-219)||(5013733-5013946)
chr3 (6-219)||(5596381-5596594)
chr3 (2-219)||(5609346-5609563)
chr3 (2-219)||(7996579-7996796)
chr3 (6-223)||(8211759-8211976)
chr3 (2-219)||(10643087-10643304)
chr3 (2-219)||(18242756-18242973)
chr3 (2-219)||(28339319-28339536)
chr3 (2-222)||(48465944-48466164)
chr3 (1-223)||(18051278-18051500)
chr3 (6-223)||(51797133-51797351)
chr3 (2-223)||(5713244-5713465)
chr3 (2-223)||(5724154-5724375)
chr3 (2-223)||(5757102-5757323)
chr3 (2-223)||(5767993-5768214)
chr3 (6-219)||(36997101-36997314)
chr3 (2-222)||(11110370-11110590)
chr3 (2-223)||(4346707-4346928)
chr3 (2-223)||(4721648-4721869)
chr3 (2-219)||(6542486-6542703)
chr3 (6-223)||(17984976-17985193)
chr3 (6-219)||(18225212-18225425)
chr3 (6-219)||(24328180-24328393)
chr3 (6-223)||(28021296-28021513)
chr3 (2-223)||(20576867-20577088)
chr3 (2-223)||(29664990-29665211)
chr3 (13-223)||(16626526-16626736)
chr3 (14-223)||(18530417-18530626)
chr3 (14-223)||(31034137-31034346)
chr3 (14-223)||(32292781-32292990)
chr3 (16-223)||(17993804-17994011)
chr3 (16-223)||(4625975-4626182)
chr3 (16-223)||(5652418-5652625)
chr3 (2-219)||(32439171-32439388)
chr3 (2-219)||(20066060-20066277)
chr3 (2-162)||(4893227-4893387)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-223)||(23128534-23128756)
chr2 (2-223)||(34286406-34286627)
chr2 (2-223)||(34291466-34291687)
chr2 (2-223)||(12655594-12655815)
chr2 (2-223)||(28882266-28882487)
chr2 (2-219)||(21677154-21677371)
chr2 (2-219)||(22926000-22926217)
chr2 (2-223)||(34861732-34861953)
chr2 (2-198)||(34279501-34279697)
chr2 (2-220)||(37685880-37686098)
chr2 (2-220)||(37701145-37701363)
chr2 (2-223)||(11635154-11635375)
chr2 (2-223)||(11641343-11641564)
chr2 (2-223)||(32049850-32050071)
chr2 (3-223)||(27434412-27434632)
chr2 (2-222)||(37375213-37375433)
chr2 (5-223)||(16829306-16829524)
chr2 (5-223)||(16891957-16892175)
chr2 (5-223)||(39890129-39890347)
chr2 (2-223)||(20837970-20838191)
chr2 (6-219)||(31876337-31876550)
chr2 (2-222)||(37925545-37925765)
chr2 (2-223)||(260721-260942)
chr2 (6-219)||(19416471-19416684)
chr2 (2-222)||(40233563-40233783)
chr2 (2-219)||(12716574-12716791)
chr2 (2-223)||(27777274-27777495)
chr2 (2-223)||(27817032-27817253)
chr2 (2-223)||(13936512-13936733)
chr2 (2-223)||(27803759-27803980)
chr2 (2-223)||(39051790-39052011)
chr2 (2-223)||(12586862-12587083)
chr2 (2-223)||(9349950-9350171)
chr2 (16-223)||(31891296-31891503)
chr2 (14-223)||(21703132-21703341)
chr2 (16-223)||(19456389-19456596)
chr2 (16-223)||(27118754-27118961)
chr2 (16-223)||(27393035-27393242)
chr2 (16-223)||(34303271-34303478)
chr2 (16-223)||(3784720-3784927)
chr2 (16-223)||(16163665-16163872)
chr2 (16-223)||(34157077-34157283)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (2-223)||(15658636-15658857)
chr5 (1-223)||(11549418-11549640)
chr5 (1-223)||(23752326-23752548)
chr5 (2-223)||(22998990-22999211)
chr5 (1-223)||(23717864-23718086)
chr5 (2-223)||(9548419-9548640)
chr5 (2-219)||(8665355-8665572)
chr5 (1-223)||(24970082-24970304)
chr5 (1-223)||(30934697-30934919)
chr5 (2-219)||(2511116-2511333)
chr5 (2-223)||(9317516-9317737)
chr5 (2-223)||(12132220-12132441)
chr5 (2-219)||(15758737-15758954)
chr5 (2-223)||(18500606-18500827)
chr5 (2-223)||(28649300-28649521)
chr5 (1-223)||(24688033-24688255)
chr5 (2-219)||(6874370-6874587)
chr5 (2-223)||(26480457-26480678)
chr5 (2-223)||(30152083-30152304)
chr5 (2-223)||(33777552-33777773)
chr5 (6-223)||(43078321-43078538)
chr5 (2-219)||(18375292-18375509)
chr5 (6-219)||(28959666-28959879)
chr5 (6-223)||(31431509-31431726)
chr5 (6-219)||(31826287-31826500)
chr5 (6-219)||(34616587-34616800)
chr5 (5-223)||(33516424-33516642)
chr5 (2-223)||(5637975-5638196)
chr5 (2-219)||(30168534-30168751)
chr5 (2-223)||(37671359-37671580)
chr5 (2-219)||(37755045-37755262)
chr5 (2-219)||(37770867-37771084)
chr5 (2-219)||(3789606-3789823)
chr5 (6-223)||(37358519-37358736)
chr5 (6-219)||(29966946-29967159)
chr5 (6-219)||(30029484-30029697)
chr5 (2-219)||(32599352-32599569)
chr5 (2-219)||(41674774-41674991)
chr5 (2-222)||(40473426-40473646)
chr5 (2-219)||(24681505-24681722)
chr5 (2-219)||(24724032-24724249)
chr5 (2-223)||(13324705-13324926)
chr5 (14-223)||(29888958-29889167)
chr5 (14-223)||(23892283-23892492)
chr5 (14-223)||(22888547-22888756)
chr5 (14-223)||(25199106-25199315)
chr5 (16-223)||(11325873-11326080)
chr5 (16-223)||(33877326-33877533)
chr5 (16-223)||(13184524-13184731)
chr5 (16-223)||(13440370-13440577)
chr5 (2-219)||(33292590-33292807)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (2-223)||(16749907-16750128)
chr6 (2-223)||(24304540-24304761)
chr6 (2-223)||(24863770-24863991)
chr6 (6-223)||(29549532-29549749)
chr6 (1-223)||(26989053-26989275)
chr6 (2-223)||(27000126-27000347)
chr6 (1-223)||(26918432-26918654)
chr6 (2-219)||(27044440-27044658)
chr6 (2-223)||(3696134-3696355)
chr6 (2-223)||(4757817-4758038)
chr6 (2-223)||(13298873-13299094)
chr6 (1-223)||(15424239-15424461)
chr6 (1-219)||(26116336-26116554)
chr6 (6-223)||(27359914-27360131)
chr6 (6-223)||(27450257-27450474)
chr6 (6-219)||(29501472-29501685)
chr6 (1-223)||(22934802-22935024)
chr6 (1-223)||(23857247-23857469)
chr6 (5-223)||(30557938-30558156)
chr6 (6-219)||(26777541-26777754)
chr6 (2-223)||(27007780-27008001)
chr6 (2-219)||(27485182-27485399)
chr6 (2-219)||(34463272-34463489)
chr6 (2-222)||(16674192-16674412)
chr6 (6-219)||(4545701-4545914)
chr6 (6-219)||(4724060-4724273)
chr6 (2-223)||(4773059-4773280)
chr6 (2-219)||(4525339-4525556)
chr6 (6-219)||(16943953-16944166)
chr6 (6-223)||(28207511-28207728)
chr6 (2-223)||(29573066-29573287)
chr6 (1-223)||(27272502-27272724)
chr6 (6-223)||(17025334-17025551)
chr6 (14-223)||(14143207-14143416)
chr6 (2-223)||(20160754-20160975)
chr6 (2-223)||(22171856-22172077)
chr6 (26-223)||(22456856-22457053)
chr6 (14-223)||(26788009-26788218)
chr6 (14-223)||(27196382-27196591)
chr6 (14-223)||(27252649-27252858)
chr6 (26-223)||(27290292-27290489)
chr6 (16-223)||(13521995-13522202)
chr6 (26-177)||(22477241-22477392)
chr6 (16-223)||(8892233-8892439)
chr6 (16-223)||(8903468-8903674)
chr6 (16-223)||(33374178-33374385)
chr6 (16-223)||(28162724-28162931)
chr6 (5-192)||(27629653-27629840)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-223)||(27347-27569)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-223)||(27608843-27609065)
chr8 (1-223)||(19688153-19688375)
chr8 (2-223)||(16277610-16277831)
chr8 (2-219)||(19286518-19286735)
chr8 (2-223)||(31489688-31489909)
chr8 (1-223)||(2137197-2137419)
chr8 (2-223)||(14557680-14557901)
chr8 (2-223)||(19208298-19208519)
chr8 (2-223)||(29829378-29829599)
chr8 (2-219)||(31354580-31354797)
chr8 (6-223)||(12092662-12092879)
chr8 (2-223)||(18710642-18710863)
chr8 (2-219)||(19674497-19674714)
chr8 (2-223)||(28361893-28362114)
chr8 (1-223)||(16283504-16283726)
chr8 (6-219)||(33258783-33258996)
chr8 (2-223)||(3329445-3329666)
chr8 (113-223)||(189261-189371)
chr8 (26-223)||(33244745-33244942)
chr8 (16-223)||(9354692-9354900)
chr8 (16-223)||(22080816-22081023)
chr8 (26-223)||(19658978-19659174)
chr8 (16-223)||(44563171-44563377)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-223)||(10916733-10916955)
chr7 (2-223)||(2154630-2154851)
chr7 (2-223)||(11424641-11424862)
chr7 (2-222)||(5128049-5128269)
chr7 (2-223)||(5147205-5147426)
chr7 (2-219)||(16736329-16736546)
chr7 (2-219)||(16751383-16751600)
chr7 (2-219)||(17523589-17523806)
chr7 (2-219)||(17529409-17529626)
chr7 (1-223)||(16503245-16503467)
chr7 (2-223)||(4144988-4145209)
chr7 (2-223)||(26319734-26319955)
chr7 (6-223)||(26435318-26435535)
chr7 (1-223)||(16518281-16518503)
chr7 (2-223)||(26274959-26275180)
chr7 (2-223)||(31564255-31564476)
chr7 (2-223)||(45387400-45387621)
chr7 (6-219)||(3445367-3445580)
chr7 (2-223)||(9618708-9618929)
chr7 (6-219)||(11441633-11441846)
chr7 (2-219)||(26537739-26537956)
chr7 (2-223)||(26669779-26670000)
chr7 (6-223)||(24592406-24592623)
chr7 (2-219)||(31124977-31125194)
chr7 (14-223)||(16449863-16450072)
chr7 (14-223)||(2108870-2109079)
chr7 (14-223)||(16041392-16041601)
chr7 (14-223)||(26484763-26484972)
chr7 (14-223)||(2775428-2775637)
chr7 (14-223)||(39210888-39211097)
chr7 (16-223)||(31088329-31088536)
chr7 (16-223)||(45733531-45733738)
chr7 (14-219)||(18540868-18541073)
chr7 (2-219)||(5159576-5159793)
chr7 (83-223)||(4200685-4200825)
chr7 (83-223)||(26682865-26683005)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (2-219)||(14763287-14763504)
chr4 (2-223)||(24592293-24592514)
chr4 (2-223)||(14665089-14665310)
chr4 (2-219)||(54833458-54833675)
chr4 (1-223)||(17014070-17014292)
chr4 (2-223)||(5005944-5006165)
chr4 (6-219)||(14098616-14098829)
chr4 (2-223)||(18800592-18800813)
chr4 (2-223)||(27163296-27163517)
chr4 (6-219)||(30753829-30754042)
chr4 (2-223)||(40105617-40105838)
chr4 (6-222)||(6569928-6570144)
chr4 (6-223)||(31126497-31126714)
chr4 (2-223)||(36344494-36344715)
chr4 (2-223)||(33673777-33673998)
chr4 (6-223)||(21969776-21969993)
chr4 (2-216)||(39850709-39850923)
chr4 (14-223)||(15284907-15285116)
chr4 (14-223)||(15227953-15228162)
chr4 (14-223)||(1900340-1900549)
chr4 (16-223)||(14235504-14235711)
chr4 (2-219)||(34188943-34189160)
chr4 (16-223)||(24460584-24460791)
chr4 (2-219)||(24112733-24112950)
chr4 (16-223)||(15391317-15391524)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-223)||(46964-47186)
scaffold0089 (1-223)||(29818-30040)
scaffold0089 (1-223)||(40048-40270)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (2-223)||(7218-7439)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (2-219)||(41793291-41793508)
chr1 (2-223)||(10962725-10962946)
chr1 (6-223)||(51638277-51638494)
chr1 (2-219)||(28585036-28585253)
chr1 (14-223)||(16208010-16208219)
chr1 (14-223)||(20461148-20461357)
chr1 (26-223)||(20340314-20340511)
chr1 (14-223)||(28151929-28152138)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (2-222)||(9046-9266)
scaffold0159 (2-222)||(20071-20291)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (6-223)||(9626-9843)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (2-223)||(14909-15130)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (6-223)||(26180-26398)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (5-223)||(30511-30729)
scaffold0124 (14-223)||(20456-20664)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-223)||(108-330)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (4-223)||(6070-6291)
scaffold0415 (16-223)||(1897-2103)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-223)||(8009-8226)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (4-223)||(46781-47011)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (26-223)||(2637-2834)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (14-223)||(7-216)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (26-223)||(21641-21838)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (92-223)||(597-728)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (5-192)||(148-335)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29148996 - 29148775
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148996 actttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 29148897  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  29148896 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 29148797  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29148796 acatgtcctcgacaatcctctt 29148775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22387819 - 22387598
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387819 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 22387720  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22387719 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 22387620  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22387619 acatgtcctcgacaatcctctt 22387598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 6192333 - 6192554
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6192333 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatc 6192432  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6192433 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 6192532  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6192533 acatgtcctcgacaatcctctt 6192554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28116195 - 28115974
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116195 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 28116096  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  28116095 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtccc 28115996  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28115995 acatgtcctcgacaatcctctt 28115974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 18330689 - 18330907
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18330689 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaag 18330788  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18330789 gcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccaca 18330888  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18330889 tgtcctcgacaatcctctt 18330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 4416936 - 4417157
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416936 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 4417035  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4417036 agggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 4417135  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4417136 acatgtcctcgacaatcctctt 4417157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4796894 - 4796673
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4796894 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 4796795  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4796794 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 4796695  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4796694 acacgtcctcgacaatcctctt 4796673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18277293 - 18277076
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277293 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 18277194  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18277193 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 18277094  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18277093 acatgtcctcgacaatcc 18277076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18292594 - 18292377
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292594 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 18292495  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18292494 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 18292395  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18292394 acatgtcctcgacaatcc 18292377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18307895 - 18307678
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307895 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 18307796  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18307795 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 18307696  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18307695 acatgtcctcgacaatcc 18307678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8301509 - 8301287
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8301509 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 8301410  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  8301409 caaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 8301310  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  8301309 cgcatgtcctcgacaatcctctt 8301287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 10396150 - 10396371
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396150 actttactccagagaggacactgcacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 10396249  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  10396250 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtccc 10396349  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  10396350 acacgtcctcgacaatcctctt 10396371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31964714 - 31964497
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964714 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 31964615  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31964614 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 31964515  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31964514 acatgtcctcgacaatcc 31964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 35880783 - 35881004
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35880783 actttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 35880882  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  35880883 aaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 35880982  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  35880983 acacgtcctcgacaatcctctt 35881004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 47023470 - 47023687
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47023470 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 47023569  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  47023570 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 47023669  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47023670 acatgtcctcgacaatcc 47023687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50134312 - 50134095
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134312 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 50134213  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  50134212 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 50134113  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50134112 acatgtcctcgacaatcc 50134095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 21674714 - 21674930
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674714 tactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 21674813  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21674814 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacat 21674913  T
Q  206 gtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  21674914 gtcctcgacaatcctct 21674930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8295988 - 8296210
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8295988 gactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 8296087  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |    
T  8296088 caaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcc 8296187  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8296188 cacatgtcctcgacaatcctctt 8296210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15892948 - 15892726
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15892948 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 15892849  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15892848 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 15892749  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  15892748 cgcatgtcctcgacaatcctctt 15892726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 5467006 - 5467223
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5467006 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 5467105  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  5467106 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacac 5467205  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5467206 gtcctcgacaatcctctt 5467223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 7073229 - 7073450
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073229 actttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 7073328  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  7073329 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtccc 7073428  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  7073429 acacgtcctcgacaatcctctt 7073450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15741335 - 15741114
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15741335 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 15741236  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  15741235 aaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 15741136  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  15741135 gcatgtcctcgacaatcctctt 15741114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22871093 - 22870876
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871093 tactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 22870994  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22870993 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 22870894  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  22870893 gtccttgacaatcctctt 22870876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22886152 - 22885935
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886152 tactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 22886053  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886052 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 22885953  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  22885952 gtccttgacaatcctctt 22885935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 51782044 - 51782261
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51782044 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 51782143  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51782144 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 51782243  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  51782244 gtccttgacaatcctctt 51782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 5013733 - 5013946
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5013733 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaagg 5013832  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5013833 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 5013932  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||| ||||||||    
T  5013933 gtccttgacaatcc 5013946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5596594 - 5596381
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5596594 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 5596495  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5596494 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 5596395  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  5596394 gtcctcgacaatcc 5596381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5609563 - 5609346
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609563 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 5609464  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  5609463 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 5609364  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  5609363 acatgtccttgacaatcc 5609346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 7996579 - 7996796
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7996579 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 7996678  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  7996679 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 7996778  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  7996779 acatgtccttgacaatcc 7996796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 8211759 - 8211976
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211759 tactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 8211858  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  8211859 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacac 8211958  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8211959 gtcctcgacaatcctctt 8211976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 10643087 - 10643304
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10643087 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 10643186  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  10643187 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 10643286  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  10643287 acatgtccttgacaatcc 10643304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 18242756 - 18242973
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18242756 actttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 18242855  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  18242856 aaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 18242955  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18242956 acatgtcctcgacaatcc 18242973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 28339319 - 28339536
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339319 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 28339418  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  28339419 aaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 28339518  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28339519 acatgtccttgacaatcc 28339536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 48465944 - 48466164
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48465944 actttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 48466043  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  48466044 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 48466143  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  48466144 acacgtcctcgacaatcctct 48466164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18051278 - 18051500
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  18051278 gactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctat 18051377  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  18051378 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 18051477  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  18051478 cgcatgtcctcgacaatcctctt 18051500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 51797133 - 51797351
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctc-caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51797133 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaag 51797232  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51797233 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccaca 51797332  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  51797333 tgtccttgacaatcctctt 51797351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 5713244 - 5713465
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5713244 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 5713343  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||    
T  5713344 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccc 5713443  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  5713444 tcatgtcgtcgacaatcctctt 5713465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 5724154 - 5724375
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5724154 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 5724253  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||    
T  5724254 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccc 5724353  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  5724354 tcatgtcgtcgacaatcctctt 5724375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5757323 - 5757102
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5757323 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 5757224  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||    
T  5757223 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccc 5757124  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  5757123 tcatgtcgtcgacaatcctctt 5757102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5768214 - 5767993
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5768214 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 5768115  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||    
T  5768114 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccc 5768015  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  5768014 tcatgtcgtcgacaatcctctt 5767993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36997314 - 36997101
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36997314 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 36997215  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  36997214 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatat 36997115  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  36997114 gtcctcgacaatcc 36997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11110590 - 11110370
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11110590 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 11110491  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  11110490 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 11110391  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11110390 acatgtcctcgacaatcctct 11110370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4346928 - 4346707
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346928 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 4346829  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4346828 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 4346729  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  4346728 acacgtcctcgataatcctctt 4346707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 4721648 - 4721869
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4721648 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatc 4721747  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  4721748 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtccc 4721847  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4721848 acatgtcctcgacaatcctctt 4721869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6542703 - 6542486
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6542703 actttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 6542604  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  6542603 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttcc 6542504  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  6542503 acatgtccttgacaatcc 6542486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17985193 - 17984976
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17985193 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaagg 17985094  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17985093 tgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 17984994  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  17984993 gtccttgacaatcctctt 17984976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 18225212 - 18225425
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18225212 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 18225311  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18225312 tgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 18225411  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  18225412 gtcctcgacaatcc 18225425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 24328180 - 24328393
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24328180 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaagg 24328279  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24328280 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 24328379  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||| ||||||||    
T  24328380 gtccttgacaatcc 24328393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 28021296 - 28021513
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021296 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 28021395  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  28021396 tgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccac 28021495  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28021496 gtcctcgacaatcctctt 28021513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20577088 - 20576867
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  20577088 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 20576989  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20576988 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 20576889  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  20576888 acacgtcctcgacaatcctctt 20576867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29665211 - 29664990
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  29665211 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 29665112  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  29665111 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 29665012  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  29665011 acacgtcctcgacaatcctctt 29664990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16626736 - 16626526
Alignment:
Q  13 tagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcccta 112  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  16626736 tagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 16626637  T
Q  113 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcg 212  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  16626636 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttg 16626537  T
Q  213 acaatcctctt 223  Q
    |||||||||||    
T  16626536 acaatcctctt 16626526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 18530417 - 18530626
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  18530417 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 18530516  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  18530517 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcga 18530616  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  18530617 caatcctctt 18530626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31034346 - 31034137
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31034346 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 31034247  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  31034246 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 31034147  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  31034146 caaccctctt 31034137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 32292781 - 32292990
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  32292781 agagggcactgcacaatcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 32292880  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  32292881 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 32292980  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  32292981 caaccctctt 32292990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17994011 - 17993804
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  17994011 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggt 17993912  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  17993911 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 17993812  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  17993811 atcctctt 17993804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 4625975 - 4626182
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  4625975 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 4626074  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  4626075 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 4626174  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  4626175 atcctctt 4626182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 5652418 - 5652625
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  5652418 agggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 5652517  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  5652518 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 5652617  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  5652618 atcctctt 5652625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 32439171 - 32439388
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  32439171 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatc 32439270  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||    
T  32439271 aaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgcc 32439370  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  32439371 acatgtcctcgataatcc 32439388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 20066060 - 20066277
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  20066060 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatc 20066159  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||| | ||    
T  20066160 aaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgcc 20066259  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20066260 acatgtcctcgataatcc 20066277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 4893227 - 4893387
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||   |||||||| || ||||| || ||||    
T  4893227 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatc 4893326  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 162  Q
    |||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  4893327 aaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23128756 - 23128534
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23128756 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 23128657  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23128656 caaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 23128557  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23128556 cacatgtcctcgacaatcctctt 23128534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 34286406 - 34286627
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286406 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 34286505  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34286506 aaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttcc 34286605  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34286606 acatgtcctcgacaatcctctt 34286627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 34291466 - 34291687
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291466 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 34291565  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34291566 aaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttcc 34291665  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34291666 acatgtcctcgacaatcctctt 34291687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 12655594 - 12655815
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12655594 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 12655693  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12655694 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 12655793  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12655794 acatgtcctcgacaatcctctt 12655815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 28882266 - 28882487
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28882266 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 28882365  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  28882366 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 28882465  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28882466 acatgtcctcgacaatcctctt 28882487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21677371 - 21677154
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21677371 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 21677272  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21677271 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 21677172  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21677171 acatgtcctcgacaatcc 21677154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22926217 - 22926000
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926217 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 22926118  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  22926117 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 22926018  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22926017 acatgtcctcgacaatcc 22926000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 34861732 - 34861953
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34861732 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 34861831  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  34861832 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 34861931  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  34861932 acacgtcctcgacaatcctctt 34861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 34279501 - 34279697
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279501 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 34279600  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34279601 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 34279697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37686098 - 37685880
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37686098 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 37685999  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  37685998 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 37685899  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcct 220  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  37685898 acacgtcctcgacaatcct 37685880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37701363 - 37701145
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37701363 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 37701264  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  37701263 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 37701164  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcct 220  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  37701163 acacgtcctcgacaatcct 37701145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11635375 - 11635154
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11635375 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 11635276  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  11635275 agggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 11635176  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  11635175 acatgtcctcgataatcctctt 11635154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11641564 - 11641343
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641564 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 11641465  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  11641464 agggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 11641365  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  11641364 acatgtcctcgataatcctctt 11641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 32049850 - 32050071
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32049850 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 32049949  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32049950 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 32050049  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  32050050 acatgtccttgacaatcctctt 32050071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27434632 - 27434412
Alignment:
Q  3 ctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27434632 ctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatca 27434533  T
Q  103 aggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcca 202  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27434532 aggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccg 27434433  T
Q  203 catgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27434432 catgtcctcgacaatcctctt 27434412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 37375213 - 37375433
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375213 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 37375312  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  37375313 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 37375412  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37375413 acatgtcctcgacaatcctct 37375433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16829524 - 16829306
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16829524 ttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaag 16829425  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829424 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccaca 16829325  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16829324 cgtcctcgacaatcctctt 16829306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 16891957 - 16892175
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16891957 ttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaag 16892056  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16892057 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccaca 16892156  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16892157 cgtcctcgacaatcctctt 16892175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 39890129 - 39890347
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39890129 ttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaag 39890228  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39890229 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccaca 39890328  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  39890329 tgtccttgacaatcctctt 39890347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 20837970 - 20838191
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  20837970 actttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatc 20838069  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20838070 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 20838169  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  20838170 gcatgtcctcgacaatcctctt 20838191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 31876337 - 31876550
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31876337 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 31876436  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31876437 tgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 31876536  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  31876537 gtcctcgacaatcc 31876550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 37925545 - 37925765
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  37925545 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatc 37925644  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  37925645 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 37925744  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  37925745 acacgtcctcgacaatcctct 37925765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 260942 - 260721
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260942 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 260843  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  260842 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 260743  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  260742 gcatgtcctcaacaatcctctt 260721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19416684 - 19416471
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19416684 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaagg 19416585  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19416584 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 19416485  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||| ||||||||    
T  19416484 gtccttgacaatcc 19416471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 40233563 - 40233783
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40233563 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 40233662  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  40233663 aaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 40233762  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40233763 acatgtcctcgacaatcctct 40233783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12716791 - 12716574
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  12716791 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 12716692  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12716691 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 12716592  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12716591 acatgtcctcgacaatcc 12716574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 27777274 - 27777495
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  27777274 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 27777373  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27777374 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 27777473  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27777474 acacgtcctcgacaatcctctt 27777495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 27817032 - 27817253
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  27817032 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 27817131  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27817132 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 27817231  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27817232 acacgtcctcgacaatcctctt 27817253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13936733 - 13936512
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  13936733 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 13936634  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  13936633 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 13936534  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  13936533 acacgtcctcgacaatcctctt 13936512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 27803759 - 27803980
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  27803759 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 27803858  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27803859 aaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 27803958  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27803959 acacgtcctcgacaatcctctt 27803980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39052011 - 39051790
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  39052011 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 39051912  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  39051911 aaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 39051812  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  39051811 acacgtcctcgacaatcctctt 39051790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 12586862 - 12587083
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  12586862 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 12586961  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  12586962 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 12587061  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12587062 acacgtcctcgacaatcctctt 12587083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9350171 - 9349950
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  9350171 actttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 9350072  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||    
T  9350071 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccc 9349972  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  9349971 tcatgtcctcgacaaccctctt 9349950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31891503 - 31891296
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31891503 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 31891404  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||| ||||||| || || || ||| ||||||    
T  31891403 catgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgaca 31891304  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  31891303 atcctctt 31891296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21703341 - 21703132
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  21703341 agagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 21703242  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||| | || || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21703241 gtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 21703142  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  21703141 caatcctctt 21703132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19456596 - 19456389
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  19456596 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 19456497  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    |||||||| || |  || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19456496 catgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgaca 19456397  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  19456396 atcctctt 19456389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 27118754 - 27118961
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  27118754 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 27118853  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  27118854 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgaca 27118953  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  27118954 atcctctt 27118961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 27393035 - 27393242
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  27393035 agggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 27393134  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  27393135 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 27393234  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  27393235 atcctctt 27393242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34303478 - 34303271
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  34303478 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 34303379  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  34303378 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 34303279  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  34303278 atcctctt 34303271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 3784720 - 3784927
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  3784720 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 3784819  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  3784820 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 3784919  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  3784920 atcctctt 3784927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 16163665 - 16163872
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  16163665 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 16163764  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||| ||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  16163765 catgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 16163864  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  16163865 atcctctt 16163872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 34157077 - 34157283
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  34157077 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 34157176  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  34157177 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 34157275  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  34157276 atcctctt 34157283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15658857 - 15658636
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658857 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 15658758  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  15658757 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 15658658  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15658657 acatgtcctcgacaatcctctt 15658636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11549418 - 11549640
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11549418 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 11549517  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  11549518 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 11549617  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11549618 cacatgtcctcgacaatcctctt 11549640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23752548 - 23752326
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23752548 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcat 23752449  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23752448 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 23752349  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23752348 cacacgtcctcgacaatcctctt 23752326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22999211 - 22998990
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22999211 actttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatc 22999112  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22999111 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 22999012  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22999011 acatgtcctcgacaatcctctt 22998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23718086 - 23717864
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23718086 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 23717987  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23717986 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 23717887  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23717886 cacacgtcctcgacaatcctctt 23717864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9548640 - 9548419
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9548640 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatc 9548541  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  9548540 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 9548441  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9548440 acatgtcctcgacaatcctctt 9548419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8665572 - 8665355
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8665572 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 8665473  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  8665472 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 8665373  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8665372 acatgtcctcgacaatcc 8665355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24970082 - 24970304
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24970082 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 24970181  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |    
T  24970182 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcc 24970281  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  24970282 cgcatgtcctcgacaatcctctt 24970304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30934697 - 30934919
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30934697 gactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 30934796  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  30934797 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30934896  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  30934897 cgcatgtcctcgacaatcctctt 30934919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 2511116 - 2511333
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2511116 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 2511215  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  2511216 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 2511315  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2511316 acatgtccttgacaatcc 2511333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 9317516 - 9317737
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9317516 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 9317615  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  9317616 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 9317715  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  9317716 acacgtcctcgacaatcctctt 9317737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 12132220 - 12132441
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12132220 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 12132319  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  12132320 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 12132419  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12132420 acacgtcctcgacaatcctctt 12132441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15758954 - 15758737
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15758954 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 15758855  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15758854 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 15758755  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15758754 acatgtccttgacaatcc 15758737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18500827 - 18500606
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500827 actttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 18500728  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18500727 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 18500628  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18500627 acacgtcctcgacaatcctctt 18500606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 28649300 - 28649521
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649300 actttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 28649399  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  28649400 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 28649499  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  28649500 acacgtcctcgacaatcctctt 28649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24688255 - 24688033
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688255 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 24688156  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  24688155 caaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 24688056  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24688055 cacatgtcctcgacaatcctctt 24688033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 6874370 - 6874587
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874370 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 6874469  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  6874470 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 6874569  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6874570 acatgtcctcgacaatcc 6874587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 26480457 - 26480678
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26480457 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 26480556  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  26480557 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 26480656  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  26480657 acacgtcctcgacaatcctctt 26480678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 30152083 - 30152304
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30152083 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 30152182  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  30152183 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 30152282  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  30152283 acacgtcctcgacaatcctctt 30152304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 33777552 - 33777773
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33777552 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatc 33777651  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  33777652 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 33777751  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  33777752 acacgtcctcgacaatcctctt 33777773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 43078321 - 43078538
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078321 tactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 43078420  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43078421 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 43078520  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  43078521 gtccttgacaatcctctt 43078538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18375509 - 18375292
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18375509 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 18375410  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  18375409 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 18375310  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18375309 acatgtcctcgacaatcc 18375292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28959879 - 28959666
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28959879 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 28959780  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28959779 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 28959680  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  28959679 gtcctcgacaatcc 28959666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 31431509 - 31431726
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31431509 tactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 31431608  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31431609 tgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 31431708  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  31431709 gtccttgacaatcctctt 31431726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31826500 - 31826287
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31826500 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 31826401  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31826400 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 31826301  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  31826300 gtcctcgacaatcc 31826287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 34616587 - 34616800
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34616587 tactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 34616686  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34616687 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 34616786  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  34616787 gtcctcgacaatcc 34616800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 33516424 - 33516642
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33516424 ttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaag 33516523  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516524 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccaca 33516623  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33516624 cgtcctcgacaatcctctt 33516642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 5637975 - 5638196
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5637975 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 5638074  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  5638075 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtccc 5638174  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5638175 acacgtcctcgacaatcctctt 5638196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 30168534 - 30168751
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30168534 actttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatc 30168633  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||    
T  30168634 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtccc 30168733  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  30168734 acatgtccttgacaatcc 30168751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37671580 - 37671359
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671580 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 37671481  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  37671480 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttcc 37671381  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  37671380 acatgtccttgacaatcctctt 37671359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 37755045 - 37755262
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37755045 actttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 37755144  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37755145 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 37755244  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37755245 acatgtccttgacaatcc 37755262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37771084 - 37770867
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37771084 actttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 37770985  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  37770984 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttcc 37770885  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37770884 acatgtccttgacaatcc 37770867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 3789606 - 3789823
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3789606 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 3789705  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  3789706 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 3789805  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3789806 acatgtcctcgacaatcc 3789823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37358736 - 37358519
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37358736 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 37358637  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37358636 tgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacat 37358537  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37358536 gtcctcgacaatcctctt 37358519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29967159 - 29966946
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29967159 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 29967060  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29967059 tgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 29966960  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  29966959 gtcctcgacaatcc 29966946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 30029484 - 30029697
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30029484 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 30029583  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30029584 tgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 30029683  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  30029684 gtcctcgacaatcc 30029697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32599569 - 32599352
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599569 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 32599470  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  32599469 aaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 32599370  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
     |||||||||||||||||    
T  32599369 gcatgtcctcgacaatcc 32599352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 41674774 - 41674991
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41674774 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatc 41674873  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  41674874 aaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgcc 41674973  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  41674974 acatgtcctcgataatcc 41674991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40473646 - 40473426
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  40473646 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 40473547  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  40473546 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 40473447  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40473446 acatgtcctcgacaatcctct 40473426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 24681505 - 24681722
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  24681505 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 24681604  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24681605 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 24681704  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24681705 acatgtcctcgacaatcc 24681722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 24724032 - 24724249
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  24724032 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 24724131  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24724132 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 24724231  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24724232 acatgtcctcgacaatcc 24724249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13324926 - 13324705
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  13324926 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatc 13324827  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13324826 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 13324727  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  13324726 acatgtccttgacaatcctctt 13324705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29889167 - 29888958
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  29889167 agagggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgg 29889068  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  29889067 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 29888968  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  29888967 caatcctctt 29888958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 23892283 - 23892492
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  23892283 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 23892382  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||||||||||||  | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23892383 gtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 23892482  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  23892483 caatcctctt 23892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 22888547 - 22888756
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  22888547 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 22888646  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22888647 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 22888746  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  22888747 caatcctctt 22888756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 25199106 - 25199315
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  25199106 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 25199205  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  25199206 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 25199305  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  25199306 caatcctctt 25199315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 11325873 - 11326080
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  11325873 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggt 11325972  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||    
T  11325973 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgaca 11326072  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    | ||||||    
T  11326073 accctctt 11326080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 33877326 - 33877533
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  33877326 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 33877425  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||    
T  33877426 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgaca 33877525  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    | ||||||    
T  33877526 accctctt 33877533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13184731 - 13184524
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  13184731 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 13184632  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  13184631 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 13184532  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  13184531 atcctctt 13184524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13440577 - 13440370
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  13440577 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 13440478  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  13440477 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 13440378  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  13440377 atcctctt 13440370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 33292590 - 33292807
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  33292590 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatc 33292689  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||    
T  33292690 aaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgcc 33292789  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  33292790 acatgtcctcgataatcc 33292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 16749907 - 16750128
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749907 actttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 16750006  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  16750007 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 16750106  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16750107 acatgtcctcgacaatcctctt 16750128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24304761 - 24304540
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24304761 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 24304662  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24304661 aaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 24304562  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24304561 acatgtcctcgacaatcctctt 24304540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 24863770 - 24863991
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24863770 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 24863869  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24863870 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 24863969  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24863970 acatgtcctcgacaatcctctt 24863991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 29549532 - 29549749
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549532 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 29549631  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  29549632 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacac 29549731  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29549732 gtcctcgacaatcctctt 29549749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26989053 - 26989275
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26989053 gactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 26989152  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  26989153 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 26989252  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26989253 cacatgtcctcgacaatcctctt 26989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 27000126 - 27000347
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27000126 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 27000225  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  27000226 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 27000325  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27000326 acacgtcctcgacaatcctctt 27000347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26918432 - 26918654
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918432 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 26918531  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  26918532 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 26918631  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26918632 cacacgtcctcgacaatcctctt 26918654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 27044440 - 27044658
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044440 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 27044539  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggt-gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  27044540 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttc 27044639  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27044640 cacatgtcctcgacaatcc 27044658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 3696134 - 3696355
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3696134 actttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatc 3696233  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  3696234 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 3696333  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  3696334 acacgtcctcgacaatcctctt 3696355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 4757817 - 4758038
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4757817 actttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 4757916  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4757917 aaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 4758016  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  4758017 acatgtccttgacaatcctctt 4758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13299094 - 13298873
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13299094 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 13298995  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  13298994 aaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 13298895  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13298894 acatgtcctcgacaatcctctt 13298873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15424461 - 15424239
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15424461 gactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 15424362  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15424361 caaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 15424262  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  15424261 cgcacgtcctcgacaatcctctt 15424239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26116554 - 26116336
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26116554 gactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcat 26116455  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26116454 caaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttc 26116355  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  26116354 cacatgtccttgacaatcc 26116336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27360131 - 27359914
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27360131 tactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 27360032  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27360031 tgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 27359932  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27359931 gtccttgacaatcctctt 27359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27450474 - 27450257
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27450474 tactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 27450375  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27450374 tgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 27450275  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27450274 gtccttgacaatcctctt 27450257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 29501472 - 29501685
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29501472 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 29501571  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29501572 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 29501671  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  29501672 gtcctcgacaatcc 29501685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22935024 - 22934802
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  22935024 gactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccat 22934925  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  22934924 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcc 22934825  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  22934824 cgcatgtcctcgacaatcctctt 22934802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23857469 - 23857247
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  23857469 gactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccat 23857370  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  23857369 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcc 23857270  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  23857269 cgcatgtcctcgacaatcctctt 23857247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30558156 - 30557938
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30558156 ttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaag 30558057  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558056 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccaca 30557957  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30557956 cgtcctcgacaatcctctt 30557938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26777754 - 26777541
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26777754 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 26777655  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26777654 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 26777555  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  26777554 gtcctcgacaatcc 26777541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 27007780 - 27008001
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007780 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 27007879  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27007880 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 27007979  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27007980 acatgtccttgacaatcctctt 27008001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 27485182 - 27485399
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27485182 actttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 27485281  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  27485282 aaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 27485381  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27485382 acatgtccttgacaatcc 27485399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34463489 - 34463272
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463489 actttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 34463390  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34463389 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 34463290  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34463289 acatgtcctcgacaatcc 34463272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 16674192 - 16674412
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674192 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 16674291  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  16674292 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 16674391  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16674392 acacgtcctcgacaatcctct 16674412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4545914 - 4545701
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4545914 tactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 4545815  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4545814 tgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacat 4545715  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||| ||||||||    
T  4545714 gtccttgacaatcc 4545701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4724273 - 4724060
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4724273 tactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 4724174  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4724173 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacat 4724074  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  4724073 gtcctcgacaatcc 4724060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 4773059 - 4773280
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4773059 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 4773158  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4773159 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 4773258  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  4773259 acatgtccttgacaatcctctt 4773280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 4525339 - 4525556
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4525339 actttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatc 4525438  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4525439 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttcc 4525538  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  4525539 acatgtccttgacaatcc 4525556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16944166 - 16943953
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16944166 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 16944067  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16944066 tgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 16943967  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  16943966 gtcctcgacaatcc 16943953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 28207511 - 28207728
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28207511 tactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 28207610  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28207611 tgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 28207710  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28207711 gtccttgacaatcctctt 28207728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 29573066 - 29573287
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29573066 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 29573165  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  29573166 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 29573265  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  29573266 acacgtcctcgacaatcctctt 29573287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27272724 - 27272502
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  27272724 gactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccat 27272625  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27272624 caaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttc 27272525  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  27272524 cgcatgtcctcgataatcctctt 27272502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 17025334 - 17025551
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17025334 tactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaagg 17025433  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17025434 tgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 17025533  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  17025534 gtccttgacaatcctctt 17025551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14143416 - 14143207
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  14143416 agagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 14143317  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  14143316 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 14143217  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  14143216 caaccctctt 14143207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 20160754 - 20160975
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || |    
T  20160754 actttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccacc 20160853  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| || ||    
T  20160854 aaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccc 20160953  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||| || ||||||||||||    
T  20160954 tcatgttcttgacaatcctctt 20160975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22172077 - 22171856
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || |    
T  22172077 actttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccacc 22171978  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| || ||    
T  22171977 aaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccc 22171878  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||| || ||||||||||||    
T  22171877 tcatgttcttgacaatcctctt 22171856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22457053 - 22456856
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22457053 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 22456954  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  22456953 aaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctctt 22456856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 26788009 - 26788218
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  26788009 agagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 26788108  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  26788109 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 26788208  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  26788209 caaccctctt 26788218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 27196382 - 27196591
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  27196382 agagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 27196481  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  27196482 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 27196581  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  27196582 caaccctctt 27196591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27252858 - 27252649
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  27252858 agagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 27252759  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  27252758 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 27252659  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  27252658 caaccctctt 27252649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27290489 - 27290292
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  27290489 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 27290390  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  27290389 aaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttctt 27290292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13522202 - 13521995
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  13522202 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 13522103  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||    
T  13522102 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgaca 13522003  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    | ||||||    
T  13522002 accctctt 13521995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22477392 - 22477241
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22477392 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 22477293  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 177  Q
    | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  22477292 aaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8892439 - 8892233
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  8892439 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 8892340  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  8892339 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 8892241  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  8892240 atcctctt 8892233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8903674 - 8903468
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  8903674 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 8903575  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  8903574 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 8903476  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  8903475 atcctctt 8903468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33374385 - 33374178
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  33374385 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 33374286  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33374285 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgaca 33374186  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    | ||||||    
T  33374185 accctctt 33374178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 28162724 - 28162931
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  28162724 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 28162823  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||  || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  28162824 catgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 28162923  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  28162924 atcctctt 28162931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27629840 - 27629653
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| | ||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27629840 ttacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagg 27629741  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaa 192  Q
    | ||| | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27629740 gggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaa 27629653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27347 - 27569
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27347 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 27446  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27447 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 27546  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27547 cacatgtcctcgacaatcctctt 27569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27609065 - 27608843
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27609065 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 27608966  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27608965 caaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 27608866  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27608865 cacatgtcctcgacaatcctctt 27608843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19688153 - 19688375
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19688153 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 19688252  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |    
T  19688253 caaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcc 19688352  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  19688353 cgcatgtcctcgacaatcctctt 19688375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 16277610 - 16277831
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16277610 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 16277709  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  16277710 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 16277809  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16277810 acatgtcctcgacaatcctctt 16277831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 19286518 - 19286735
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286518 actttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 19286617  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  19286618 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 19286717  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19286718 acatgtcctcgacaatcc 19286735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31489909 - 31489688
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31489909 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatc 31489810  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  31489809 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 31489710  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  31489709 acacgtcctcgacaatcctctt 31489688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2137419 - 2137197
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2137419 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 2137320  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||      
T  2137319 caaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtct 2137220  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  2137219 cgcatgtcctcgacaatcctctt 2137197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 14557680 - 14557901
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14557680 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 14557779  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  14557780 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 14557879  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  14557880 gcacgtcctcgacaatcctctt 14557901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19208519 - 19208298
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19208519 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 19208420  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  19208419 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 19208320  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  19208319 acacgtcctcgacaatcctctt 19208298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 29829378 - 29829599
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  29829378 actttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 29829477  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29829478 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 29829577  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  29829578 acatgtccttgacaatcctctt 29829599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 31354580 - 31354797
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354580 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 31354679  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31354680 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 31354779  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31354780 acatgtcctcgacaatcc 31354797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12092879 - 12092662
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12092879 tactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 12092780  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12092779 tgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 12092680  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12092679 gtccttgacaatcctctt 12092662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 18710642 - 18710863
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18710642 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatc 18710741  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18710742 agggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 18710841  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18710842 acatgtcctcgacaaccctctt 18710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 19674497 - 19674714
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674497 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 19674596  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  19674597 agggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 19674696  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19674697 acatgtcctcgacaatcc 19674714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28362114 - 28361893
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28362114 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 28362015  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  28362014 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 28361915  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  28361914 acacgtcctcgacaatcctctt 28361893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16283504 - 16283726
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  16283504 gactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccat 16283603  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16283604 caaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 16283703  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  16283704 cgcatgtcctcgacaatcctctt 16283726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 33258783 - 33258996
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33258783 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 33258882  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33258883 tgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 33258982  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  33258983 gtcctcgacaatcc 33258996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3329666 - 3329445
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3329666 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 3329567  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  3329566 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttcc 3329467  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  3329466 acatgtccttgacaatcctctt 3329445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 189261 - 189371
Alignment:
Q  113 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcg 212  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  189261 ggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 189360  T
Q  213 acaatcctctt 223  Q
    |||||||||||    
T  189361 acaatcctctt 189371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 33244745 - 33244942
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  33244745 acaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcg 33244844  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  33244845 aaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 33244942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 9354692 - 9354900
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  9354692 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 9354791  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt-gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgac 214  Q
    ||||| ||||| || || || || |||| ||| || ||  || || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9354792 catgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgac 9354891  T
Q  215 aatcctctt 223  Q
    |||||||||    
T  9354892 aatcctctt 9354900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22081023 - 22080816
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  22081023 agggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 22080924  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  22080923 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 22080824  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  22080823 atcctctt 22080816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19659174 - 19658978
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  19659174 acaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcg 19659075  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19659074 aaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 19658978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 44563171 - 44563377
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  44563171 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 44563270  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  44563271 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 44563369  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  44563370 atcctctt 44563377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10916955 - 10916733
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10916955 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 10916856  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  10916855 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 10916756  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  10916755 cgcatgtcctcgacaatcctctt 10916733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 2154630 - 2154851
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2154630 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 2154729  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  2154730 aaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 2154829  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2154830 acatgtcctcgacaatcctctt 2154851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11424862 - 11424641
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11424862 actttactccatagagggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 11424763  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  11424762 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 11424663  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11424662 acatgtcctcgacaatcctctt 11424641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5128049 - 5128269
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128049 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 5128148  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  5128149 aaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 5128248  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5128249 acatgtcctcgacaatcctct 5128269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5147426 - 5147205
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147426 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 5147327  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  5147326 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 5147227  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5147226 acacgtcctcgacaatcctctt 5147205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16736546 - 16736329
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736546 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 16736447  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16736446 agggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 16736347  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16736346 acatgtcctcgacaatcc 16736329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16751600 - 16751383
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751600 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 16751501  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16751500 agggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 16751401  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16751400 acatgtcctcgacaatcc 16751383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 17523589 - 17523806
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523589 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 17523688  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  17523689 agggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 17523788  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17523789 acatgtcctcgacaatcc 17523806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17529626 - 17529409
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529626 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 17529527  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  17529526 agggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 17529427  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17529426 acatgtcctcgacaatcc 17529409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16503467 - 16503245
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16503467 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 16503368  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16503367 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 16503268  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  16503267 cgcatgtcctcgacaatcctctt 16503245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4145209 - 4144988
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4145209 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 4145110  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  4145109 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 4145010  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4145009 acacgtcctcgacaatcctctt 4144988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26319955 - 26319734
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26319955 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 26319856  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  26319855 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 26319756  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  26319755 acacgtcctcgacaatcctctt 26319734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 26435318 - 26435535
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435318 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 26435417  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  26435418 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacac 26435517  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26435518 gtcctcgacaatcctctt 26435535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16518503 - 16518281
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16518503 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 16518404  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |    
T  16518403 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcc 16518304  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  16518303 cgcatgtcctcgacaatcctctt 16518281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26275180 - 26274959
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26275180 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 26275081  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  26275080 aaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 26274981  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  26274980 acacgtcctcgacaatcctctt 26274959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31564476 - 31564255
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31564476 actttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 31564377  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31564376 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 31564277  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  31564276 acatgtccttgacaatcctctt 31564255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 45387400 - 45387621
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45387400 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 45387499  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  45387500 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 45387599  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  45387600 acacgtcctcgacaatcctctt 45387621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 3445367 - 3445580
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3445367 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 3445466  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3445467 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 3445566  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  3445567 gtcctcgacaatcc 3445580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 9618708 - 9618929
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9618708 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 9618807  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  9618808 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 9618907  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  9618908 acacgtcctcgacaatcctctt 9618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 11441633 - 11441846
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11441633 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 11441732  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11441733 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 11441832  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  11441833 gtcctcgacaatcc 11441846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26537956 - 26537739
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26537956 actttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatc 26537857  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  26537856 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 26537757  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26537756 acatgtcctcgacaatcc 26537739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26670000 - 26669779
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26670000 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 26669901  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  26669900 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 26669801  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  26669800 acacgtcctcgacaatcctctt 26669779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24592623 - 24592406
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24592623 tactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 24592524  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24592523 tgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacac 24592424  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24592423 gtcctcgacaatcctctt 24592406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 31124977 - 31125194
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31124977 actttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 31125076  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31125077 aaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 31125176  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31125177 acatgtccttgacaatcc 31125194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16450072 - 16449863
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  16450072 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 16449973  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  16449972 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcga 16449873  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  16449872 caatcctctt 16449863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2109079 - 2108870
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  2109079 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 2108980  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  2108979 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 2108880  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  2108879 caaccctctt 2108870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 16041392 - 16041601
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |    
T  16041392 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 16041491  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16041492 gtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 16041591  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  16041592 caatcctctt 16041601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 26484763 - 26484972
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  26484763 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 26484862  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  26484863 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 26484962  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  26484963 caaccctctt 26484972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 2775428 - 2775637
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  2775428 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 2775527  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  2775528 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 2775627  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  2775628 caaccctctt 2775637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39211097 - 39210888
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |    
T  39211097 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgg 39210998  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  39210997 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 39210898  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  39210897 caaccctctt 39210888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31088536 - 31088329
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  31088536 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 31088437  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  31088436 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 31088337  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  31088336 atcctctt 31088329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 45733531 - 45733738
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  45733531 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 45733630  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  45733631 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 45733730  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  45733731 atcctctt 45733738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 18540868 - 18541073
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||    
T  18540868 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttag 18540967  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    | |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18540968 ggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcga 18541067  T
Q  214 caatcc 219  Q
     |||||    
T  18541068 taatcc 18541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 5159576 - 5159793
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  5159576 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatc 5159675  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||  |||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||    
T  5159676 aaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgcc 5159775  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  5159776 acatgtcctcgataatcc 5159793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 4200685 - 4200825
Alignment:
Q  83 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctga 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  4200685 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttga 4200784  T
Q  183 cctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  4200785 cttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctctt 4200825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26683005 - 26682865
Alignment:
Q  83 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctga 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||  | || || ||||| || ||||||||  |||    
T  26683005 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 26682906  T
Q  183 cctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||    
T  26682905 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctctt 26682865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14763504 - 14763287
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763504 actttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 14763405  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  14763404 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 14763305  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14763304 acatgtcctcgacaatcc 14763287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24592514 - 24592293
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24592514 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 24592415  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24592414 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtccc 24592315  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24592314 acatgtcctcgacaatcctctt 24592293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 14665089 - 14665310
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14665089 actttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatc 14665188  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  14665189 aaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatccc 14665288  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  14665289 gcatgtcctcgacaatcctctt 14665310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 54833458 - 54833675
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833458 actttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 54833557  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  54833558 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 54833657  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54833658 acatgtcctcgacaatcc 54833675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17014070 - 17014292
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17014070 gactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcat 17014169  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  17014170 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 17014269  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17014270 cacatgtcctcgacaatcctctt 17014292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 5005944 - 5006165
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005944 actttactccagagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 5006043  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||    
T  5006044 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtccc 5006143  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5006144 acacgtcctcgacaatcctctt 5006165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 14098616 - 14098829
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098616 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaagg 14098715  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14098716 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacat 14098815  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  14098816 gtcctcgacaatcc 14098829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18800813 - 18800592
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800813 actttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatc 18800714  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  18800713 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 18800614  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18800613 acacgtcctcgacaatcctctt 18800592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27163517 - 27163296
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27163517 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 27163418  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  27163417 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 27163318  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27163317 acatgtccttgacaatcctctt 27163296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 30753829 - 30754042
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30753829 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 30753928  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30753929 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 30754028  T
Q  206 gtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||    
T  30754029 gtcctcgacaatcc 30754042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40105838 - 40105617
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40105838 actttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 40105739  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  40105738 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 40105639  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  40105638 acacgtcctcgacaatcctctt 40105617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 6569928 - 6570144
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569928 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 6570027  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  6570028 tgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacac 6570127  T
Q  206 gtcctcgacaatcctct 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  6570128 gtcctcgacaatcctct 6570144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31126714 - 31126497
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31126714 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 31126615  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  31126614 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacac 31126515  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31126514 gtcctcgacaatcctctt 31126497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36344715 - 36344494
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344715 actttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 36344616  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36344615 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 36344516  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36344515 acatgtcctcgacaatcctctt 36344494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33673998 - 33673777
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33673998 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 33673899  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33673898 aaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 33673799  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  33673798 acatgtccttgacaatcctctt 33673777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 21969776 - 21969993
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21969776 tactccagagaggacattgtacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaagg 21969875  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21969876 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 21969975  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  21969976 gtccttgacaatcctctt 21969993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 39850709 - 39850923
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  39850709 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatc 39850808  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39850809 aaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttcc 39850908  T
Q  202 acatgtcctcgacaa 216  Q
    ||||||||| |||||    
T  39850909 acatgtccttgacaa 39850923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15285116 - 15284907
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  15285116 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 15285017  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  15285016 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcga 15284917  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  15284916 caatcctctt 15284907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 15227953 - 15228162
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  15227953 agagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 15228052  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  15228053 gtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcga 15228152  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  15228153 caatcctctt 15228162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900549
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||  |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  1900340 agagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 1900439  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||||||||| || || || ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  1900440 gtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttga 1900539  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  1900540 caatcctctt 1900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14235711 - 14235504
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||   |  || |||||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  14235711 agggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggc 14235612  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| || || |||||  | || |||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  14235611 catgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgaca 14235512  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  14235511 atcctctt 14235504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34189160 - 34188943
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  34189160 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatc 34189061  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||    
T  34189060 aaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgcc 34188961  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  34188960 acatgtcctcgataatcc 34188943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24460791 - 24460584
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  24460791 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 24460692  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||| || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  24460691 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 24460592  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  24460591 atcctctt 24460584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 24112733 - 24112950
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||    
T  24112733 actttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatc 24112832  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||    
T  24112833 aaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgcc 24112932  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  24112933 acatgtcctcgataatcc 24112950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15391524 - 15391317
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  15391524 agggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 15391425  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  15391424 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 15391325  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  15391324 atcctctt 15391317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47186 - 46964
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47186 gactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 47087  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  47086 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 46987  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  46986 cacatgtcctcgacaatcctctt 46964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29818 - 30040
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  29818 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccac 29917  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  29918 caaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30017  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  30018 cgcatgtcctcgacaatcctctt 30040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40270 - 40048
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  40270 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccat 40171  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  40170 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 40071  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40070 cacatgtcctcgacaatcctctt 40048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7439 - 7218
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7439 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 7340  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  7339 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 7240  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  7239 acacgtcctcgacaatcctctt 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41793508 - 41793291
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793508 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 41793409  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  41793408 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttcc 41793309  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41793308 acatgtcctcgacaatcc 41793291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 10962725 - 10962946
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10962725 actttgctccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 10962824  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  10962825 aaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 10962924  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  10962925 acacgtcctcgacaatcctctt 10962946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 51638277 - 51638494
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638277 tactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 51638376  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51638377 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 51638476  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  51638477 gtccttgacaatcctctt 51638494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 28585036 - 28585253
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28585036 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 28585135  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  28585136 aaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 28585235  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28585236 acatgtcctcgacaatcc 28585253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16208219 - 16208010
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  16208219 agagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 16208120  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16208119 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 16208020  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  16208019 caatcctctt 16208010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 20461148 - 20461357
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20461148 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctag 20461247  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||  || || |||||||||||    
T  20461248 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcga 20461347  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
     |||||||||    
T  20461348 taatcctctt 20461357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20340511 - 20340314
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  20340511 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 20340412  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  20340411 aaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctctt 20340314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 28151929 - 28152138
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  28151929 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 28152028  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  28152029 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 28152128  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||| ||||||    
T  28152129 caaccctctt 28152138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9266 - 9046
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9266 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 9167  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  9166 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 9067  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  9066 acacgtcctcgacaatcctct 9046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 20071 - 20291
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20071 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatc 20170  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  20171 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 20270  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctct 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20271 acacgtcctcgacaatcctct 20291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 9626 - 9843
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9626 tactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 9725  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  9726 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacac 9825  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9826 gtcctcgacaatcctctt 9843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15130 - 14909
Alignment:
Q  2 actttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15130 actttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatc 15031  T
Q  102 aaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  15030 aaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtccc 14931  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  14930 acacgtcctcgacaatcctctt 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26398 - 26180
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaa-ggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26398 tactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaag 26299  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26298 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccaca 26199  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||||||||||||    
T  26198 cgtcctcgacaatcctctt 26180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 30511 - 30729
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30511 ttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaag 30610  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccaca 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  30611 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccaca 30710  T
Q  205 tgtcctcgacaatcctctt 223  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30711 cgtcctcgacaatcctctt 30729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 20456 - 20664
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  20456 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 20555  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20556 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaat-taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 20654  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  20655 caatcctctt 20664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 330 - 108
Alignment:
Q  1 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  330 gactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcat 231  T
Q  101 caaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttc 200  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  230 caaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 131  T
Q  201 cacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  130 cacatgtcctcgacaatcctctt 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6291
Alignment:
Q  4 tttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga-ttttcatca 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6070 tttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatca 6169  T
Q  103 aggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgc-tttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttcc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6170 aggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtccc 6269  T
Q  202 acatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  6270 acacgtcctcgacaatcctctt 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1897
Alignment:
Q  16 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 115  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 215  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaat-taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  216 atcctctt 223  Q
    ||||||||    
T  1904 atcctctt 1897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 8009 - 8226
Alignment:
Q  6 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaagg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8009 tactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 8108  T
Q  106 tgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacat 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8109 tgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacat 8208  T
Q  206 gtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  8209 gtccttgacaatcctctt 8226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47011 - 46781
Alignment:
Q  4 tttactccatagaggg-cattgtacaacc-agacagggcaa--gcccccacctgatccgttgcctccaaggttca-ggtctgatctcaaatgtgattttc 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  47011 tttactccatagagggacattgtacaacctagacagggcaaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttcc 46912  T
Q  99 atcaaggtgccctaggtc--atg-atgtcgaggggtgt-tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg-aaatctgac-ctttgagaa 192  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||    
T  46911 atcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaa 46812  T
Q  193 taatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  46811 taatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 46781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2834 - 2637
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  2834 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 2735  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  2734 aaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctctt 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 216 - 7
Alignment:
Q  14 agagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctag 113  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  216 agagggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 117  T
Q  114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcga 213  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  116 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcga 17  T
Q  214 caatcctctt 223  Q
    ||||||||||    
T  16 caatcctctt 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 21641 - 21838
Alignment:
Q  26 acaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |    
T  21641 acaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttg 21740  T
Q  126 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    | || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||  | || ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  21741 aaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctctt 21838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 597
Alignment:
Q  92 gattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgaga 191  Q
    ||||| ||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  192 ataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 223  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctctt 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Original strand, 148 - 335
Alignment:
Q  5 ttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaag 104  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  148 ttacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagg 247  T
Q  105 gtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaa 192  Q
    | ||| | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  248 gggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaa 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University