View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7843_high_1 (Length: 480)

Name: NF7843_high_1
Description: NF7843
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7843_high_1
NF7843_high_1
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (16-480)||(17166-17630)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (16-480)||(10687121-10687585)
chr8 (16-480)||(35742155-35742619)
chr8 (16-480)||(18868527-18868991)
chr8 (16-480)||(33035790-33036254)
chr8 (16-480)||(26298148-26298612)
chr8 (16-480)||(26311405-26311869)
chr8 (16-480)||(26401207-26401671)
chr8 (23-438)||(4814058-4814473)
chr8 (23-438)||(28330829-28331244)
chr8 (23-438)||(16754092-16754507)
chr8 (23-438)||(25682841-25683256)
chr8 (41-438)||(28893698-28894095)
chr8 (117-225)||(40827427-40827535)
chr8 (128-438)||(15947596-15947906)
chr8 (221-426)||(21040376-21040581)
chr8 (208-398)||(40827235-40827425)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (16-480)||(18857342-18857806)
chr4 (16-467)||(3791003-3791454)
chr4 (16-480)||(16626849-16627313)
chr4 (16-480)||(5144676-5145138)
chr4 (186-480)||(9227258-9227552)
chr4 (23-438)||(4568277-4568692)
chr4 (23-438)||(15315251-15315666)
chr4 (16-127)||(9227542-9227653)
chr4 (48-438)||(16637095-16637485)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (16-480)||(24264180-24264644)
chr7 (16-480)||(16881693-16882157)
chr7 (16-480)||(21641456-21641920)
chr7 (16-480)||(18410423-18410887)
chr7 (16-480)||(21985685-21986149)
chr7 (16-480)||(9188002-9188466)
chr7 (16-480)||(24272757-24273226)
chr7 (107-429)||(12404827-12405149)
chr7 (23-438)||(7072985-7073400)
chr7 (23-438)||(3321620-3322035)
chr7 (23-438)||(25403591-25404006)
chr7 (23-438)||(25408348-25408763)
chr7 (16-114)||(12398521-12398619)
chr7 (103-360)||(5071509-5071756)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (16-480)||(14740429-14740892)
chr6 (16-480)||(33333933-33334397)
chr6 (190-480)||(24434171-24434460)
chr6 (23-438)||(35202895-35203310)
chr6 (47-438)||(13881673-13882064)
chr6 (16-193)||(24714559-24714730)
chr6 (128-435)||(17691789-17692096)
chr6 (130-438)||(25944603-25944911)
chr6 (135-438)||(22347917-22348222)
chr6 (23-112)||(22345832-22345921)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (16-480)||(27446589-27447053)
chr5 (16-480)||(33769805-33770269)
chr5 (16-480)||(28805579-28806043)
chr5 (16-480)||(37559450-37559914)
chr5 (16-480)||(31399849-31400313)
chr5 (16-480)||(43593887-43594351)
chr5 (16-480)||(43626681-43627145)
chr5 (76-480)||(24558441-24558845)
chr5 (76-480)||(24599473-24599877)
chr5 (16-366)||(28833825-28834175)
chr5 (41-438)||(25450691-25451088)
chr5 (142-480)||(31301224-31301563)
chr5 (363-480)||(28835415-28835532)
chr5 (162-310)||(30102726-30102874)
chr5 (281-480)||(31333674-31333875)
chr5 (175-310)||(28664136-28664275)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (16-480)||(22171165-22171629)
chr3 (16-480)||(32477106-32477570)
chr3 (16-480)||(2675077-2675541)
chr3 (16-480)||(8513860-8514324)
chr3 (16-480)||(1307637-1308101)
chr3 (16-480)||(16256835-16257299)
chr3 (124-480)||(3326383-3326739)
chr3 (23-474)||(54191406-54191857)
chr3 (23-438)||(10095638-10096053)
chr3 (23-438)||(10202524-10202939)
chr3 (23-438)||(10899943-10900358)
chr3 (23-438)||(10609605-10610020)
chr3 (23-438)||(47879721-47880136)
chr3 (23-436)||(16460400-16460813)
chr3 (23-291)||(22622957-22623225)
chr3 (16-91)||(3326735-3326810)
chr3 (41-110)||(9149586-9149655)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (16-480)||(242-706)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (16-480)||(19346044-19346508)
chr2 (17-480)||(39484524-39484987)
chr2 (16-478)||(39486070-39486532)
chr2 (16-480)||(31057725-31058188)
chr2 (40-419)||(31134502-31134880)
chr2 (23-438)||(39685181-39685596)
chr2 (23-438)||(20051594-20052008)
chr2 (23-436)||(22714066-22714479)
chr2 (23-438)||(2739139-2739554)
chr2 (275-438)||(17935018-17935181)
chr2 (23-189)||(17942004-17942170)
chr2 (218-294)||(27568379-27568455)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (101-480)||(41395102-41395481)
chr1 (16-480)||(47701894-47702357)
chr1 (16-331)||(47101013-47101328)
chr1 (269-480)||(13599886-13600097)
chr1 (23-438)||(9524662-9525077)
chr1 (41-438)||(2396105-2396502)
chr1 (16-105)||(41392218-41392307)
chr1 (17-207)||(34689683-34689874)
chr1 (17-207)||(34694211-34694402)
chr1 (77-258)||(7155149-7155329)
chr1 (319-356)||(13599844-13599881)
chr1 (19-87)||(41131045-41131112)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (16-480)||(33806-34269)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (269-480)||(7683-7894)
scaffold0006 (319-356)||(7641-7678)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (209-438)||(161-390)
[»] scaffold0559 (1 HSPs)
scaffold0559 (208-398)||(4811-5001)


Alignment Details
Target: scaffold0197 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17630 - 17166
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17630 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 17531  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17530 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 17431  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17430 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 17331  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17330 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 17231  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17230 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 17166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 10687585 - 10687121
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687585 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 10687486  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687485 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 10687386  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687385 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 10687286  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687285 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 10687186  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687185 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 10687121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 35742155 - 35742619
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35742155 catcaagatatcatccacatatagaagaagatagagaataactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaactg 35742254  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742255 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 35742354  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742355 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 35742454  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742455 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 35742554  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742555 acaagtcttgctttataccttggaccttcaacacccagaatgccatcctttttcttgaagatcca 35742619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18868991 - 18868527
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18868991 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccccttctcacaaaaccg 18868892  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18868891 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacctatacaaagatttcttcaaaagacacaccttggacttgtcct 18868792  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18868791 ccacagaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 18868692  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18868691 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagcc 18868592  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18868591 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 18868527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33036254 - 33035790
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33036254 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 33036155  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33036154 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttggacttgtcct 33036055  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33036054 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 33035955  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33035954 attcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagcc 33035855  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33035854 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 33035790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 26298148 - 26298612
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26298148 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaactg 26298247  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26298248 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 26298347  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26298348 ccacaaaacctttcggttgctccatgtagattgtctctttaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 26298447  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26298448 attcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 26298547  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26298548 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 26298612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 26311405 - 26311869
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26311405 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaactg 26311504  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26311505 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 26311604  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311605 ccacaaaacctttcggttgctccatgtagattgtctctttaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 26311704  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26311705 attcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 26311804  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26311805 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 26311869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26401671 - 26401207
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26401671 catcaagatatcatccacatatagaagaaggtagagaatgactttctcacccctcttcaacatatacacgcaagaatcatatccgcttctcacaaaactg 26401572  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26401571 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 26401472  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401471 ccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 26401372  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  26401371 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatctcctccacttgagtgaaacccttggcc 26401272  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26401271 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaactcccggaataccttcctttttcttgaagatcca 26401207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 4814058 - 4814473
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  4814058 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 4814157  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  4814158 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 4814257  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  4814258 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 4814357  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4814358 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 4814457  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  4814458 ttgccttataccttgg 4814473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28331244 - 28330829
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  28331244 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 28331145  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  28331144 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 28331045  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    ||||||  |||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    || |||    
T  28331044 accttctagttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattatacatgttaaca 28330945  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  28330944 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttcgctacaagtc 28330845  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  28330844 ttgccttataccttgg 28330829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 16754092 - 16754507
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||   |||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  16754092 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactgtcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 16754191  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  16754192 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 16754291  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  16754292 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 16754391  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16754392 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaagccctttgctacaagtc 16754491  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  16754492 ttgccttataccttgg 16754507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25683256 - 25682841
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  25683256 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 25683157  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  25683156 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 25683057  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    ||||||  |||  | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||   |    || |||    
T  25683056 accttctagttattgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctagctcaagatcatacatgttaaca 25682957  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25682956 atcgccataagtacctttatagaacaatgctttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 25682857  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  25682856 ttgccttataccttgg 25682841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28894095 - 28893698
Alignment:
Q  41 agaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaacc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||    || |||||||||||||    
T  28894095 agaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttttctaggaactcatcaaacc 28893996  T
Q  141 gacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccat 240  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || | ||||||||| ||||| | |||    
T  28893995 gacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctataaaaccttctggttgttgcat 28893896  T
Q  241 gtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatcctt 340  Q
     ||||| || ||||| |  || |||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| ||||    
T  28893895 atagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcagtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtaccctt 28893796  T
Q  341 atggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  28893795 atagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagttttgctttatacattgg 28893698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40827535 - 40827427
Alignment:
Q  117 tcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  40827535 tcttcaaaataaactcatcaaactaacaataccatttcctagggctttgcttcaacctatagaaagatatcttcaaaatatgcaacttagacttgtcctc 40827436  T
Q  217 cacaaaacc 225  Q
    |||||||||    
T  40827435 cacaaaacc 40827427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15947906 - 15947596
Alignment:
Q  128 aactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaacctt 227  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||| || || || || |  |||||||    
T  15947906 aactcatcaaaccgaagaaaccactgccttggactttgcttcaacctatagaaagatttcttcaacatacatacctttgaattatcttctatgaaacctt 15947807  T
Q  228 ccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagc 327  Q
    | ||||| |||||  | ||  | ||||| |  || |||||||  || ||||| ||||||||||| | ||  |||| |||||   |    || ||||  ||    
T  15947806 ctggttgttccatacatatattttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatctattttaacttaagatcatacatgttaacaaacgc 15947707  T
Q  328 cataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgct 427  Q
    |||||||||||||||  || |||| || |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  15947706 cataagtatccttatacaagaatgttttaccatcggtgaaaagattttgttgtaatcgatcccttccacctgagtaaaacccttagccacaagtcttgcc 15947607  T
Q  428 ttgtaccttgg 438  Q
    || ||||||||    
T  15947606 ttataccttgg 15947596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21040581 - 21040376
Alignment:
Q  221 aaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattca 320  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||   |    || |    
T  21040581 aaaccttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttcttactcaagatcatacatgttaa 21040482  T
Q  321 caatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaag 420  Q
    ||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  21040481 caatctccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaactgagtaaaaccctttgctacaag 21040382  T
Q  421 tcttgc 426  Q
    ||||||    
T  21040381 tcttgc 21040376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40827425 - 40827235
Alignment:
Q  208 cttgtcctccacaaaacc--ttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaa 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |  |  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40827425 cttgtcctccacaaaacccattcc--ttgctccatttagattgtctcttcaaaatatccatgtaaggacacaatcttcacatccatttattccaaatcaa 40827328  T
Q  306 gattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccactt 398  Q
    ||||| ||| ||| |  |||  |||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| ||||    
T  40827327 gattgtattcattgaatataaacataagtacccttattaaacaatgttttaacactggtgagaaaatcttgttgtactcaattccctcaactt 40827235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 18857342 - 18857806
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857342 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 18857441  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857442 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 18857541  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857542 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 18857641  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857642 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 18857741  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857742 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 18857806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3791454 - 3791003
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3791454 catcaagatatcatccacatatagaagaaggtagagaatgactttctcacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttcttacaaaaccg 3791355  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3791354 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttacttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 3791255  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791254 ccaaaaaaccttccggttgctccatgtagattttctcttcaaggtcaccatgtaacaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 3791155  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3791154 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtactcgatcccctccacttgagtgaaacccttgacc 3791055  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttt 467  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3791054 acaagtcttgctttgtacctaggaccttcaacacccggaataccatcctttt 3791003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16627313 - 16626849
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16627313 catcaagatatcatcaacatataaaagaagatagagaatgactctctcacccctctgcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcaaaaaatcg 16627214  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16627213 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgccttgggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 16627114  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627113 ctacaaaaccttccagttgctccatgtagattgtcttttcaaggtcaccatgtaagaaaacggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 16627014  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16627013 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccatcggtgagaagatctcattgtagtccatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 16626914  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16626913 acaagtcttgctttgtacctaaaaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 16626849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 5144676 - 5145138
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5144676 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcacccttcttcaacatgtacacacaagaatcttatccgcttctcacaaaaccg 5144775  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5144776 ggcttcaaaagaaattcatcaaactgatgataccattgcccagggatttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacataccttagacttgtctt 5144875  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5144876 tcacaaaaccttccggttgctccatgta--ttgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcagtcttcacatccatttgttcaaactcaagattgaattg 5144973  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5144974 attcacaataaccataagtatcgttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 5145073  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  5145074 ataagtattgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatacctttctttttcttgaagatcca 5145138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 186 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9227552 - 9227258
Alignment:
Q  186 tcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9227552 tcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttctagttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcac 9227453  T
Q  286 atccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9227452 atccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccactggtgaaaagatctcgttgtagtcg 9227353  T
Q  386 atcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9227352 atcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 9227258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4568692 - 4568277
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| |  || |    
T  4568692 atatcatcaacataaaggagaaaatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagcattta 4568593  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || |  || || || || ||    
T  4568592 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaa 4568493  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| |||||  | ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || |||    
T  4568492 accttctggttgttgcatatagatattttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaaca 4568393  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4568392 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttatcaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 4568293  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  4568292 ttgccttataccttgg 4568277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15315666 - 15315251
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| || |  ||| |||||| ||| ||  ||||||   ||||||||||||||  | ||| |    
T  15315666 atatcatctacataaaggagaaggtagagaataactttctcattccttctcatcatgtaaacataactatcatagttgcttctcacaaaactagccttta 15315567  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    || || || || ||    
T  15315566 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttctattatcttctacgaa 15315467  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || |||    
T  15315466 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaaca 15315367  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15315366 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtagtcaatcccttcaacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 15315267  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  15315266 ttgccttataccttgg 15315251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9227653 - 9227542
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9227653 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttttccaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 9227554  T
Q  116 gtcttcaaaaga 127  Q
    ||||||||||||    
T  9227553 gtcttcaaaaga 9227542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16637485 - 16637095
Alignment:
Q  48 agagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgata 147  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||| |||||||    
T  16637485 agagaatgactttctcattccttctcatcatgtacacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagcctttacaaggaactcatcaaacagacgata 16637386  T
Q  148 ccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagatt 247  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |  ||    || || || || |||||||  ||||| | ||| |||||     
T  16637385 ccactgccttggactttgattcaatccatacaaagatttcttcaacaaacataattttatattatcttctacgaaaccttttggttgttacatatagata 16637286  T
Q  248 gtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaac 347  Q
    ||  |||| |  || |||||||  || | |||||||||||| || ||||  ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16637285 gttacttccaaatctccatgtagaaatgtggtcttcacatctatctgttttaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtacccttattgaac 16637186  T
Q  348 aatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  16637185 aatgttttaccaccgctgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacatgagtaaaaccctttgctacaagccttgccttataccttgg 16637095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24264644 - 24264180
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264644 catcaagatatcatccacatatagaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 24264545  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264544 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 24264445  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264444 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 24264345  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264344 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 24264245  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264244 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 24264180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 16881693 - 16882157
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16881693 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatacccgcttctcacaaaaccg 16881792  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16881793 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 16881892  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16881893 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 16881992  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16881993 attcactatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 16882092  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16882093 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 16882157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 21641456 - 21641920
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21641456 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 21641555  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21641556 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 21641655  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21641656 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 21641755  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  21641756 attcacgatagtcataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttaaatgaaacccttagcc 21641855  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21641856 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacactcggaataccttcctttttcttgaagatcca 21641920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 18410423 - 18410887
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18410423 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcattcttctttaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaagccg 18410522  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18410523 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcgt 18410622  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18410623 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcaatcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 18410722  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18410723 attcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 18410822  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18410823 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 18410887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 21985685 - 21986149
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21985685 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatacccgcttctcacaaaaccg 21985784  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |    
T  21985785 gtcttcaaaagaaattcatgaaaccgacgatagcattgcctagggctttgcttcaaccgatacaaagatttctttaaaaaacataccttagacttgtctt 21985884  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
     || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21985885 tcaaaaaaccttctggtttctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 21985984  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21985985 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 21986084  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  21986085 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacactcagaataccttcctttttcttgaagatcca 21986149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9188466 - 9188002
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9188466 catcaagatatcatcaacatataaaagaaggtagaaaataactttctcactcctcttcaacatgtacacacaagaatcatatctgcttctcacaaaaccg 9188367  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
     ||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9188366 atcttcaaaagaaattcatcaaacttacaatacaattgcctatgactttgtttcaatccatacaaagatttctttaaaagacataccttagacttgtcct 9188267  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188266 ccacaaaaccttccgtttgctccatgtagattgtctcttcaagatcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 9188167  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9188166 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcactaccagtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 9188067  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9188066 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 9188002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24273226 - 24272757
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaa-tgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24273226 catcaagatatcatcaacatataaaagaagataaaaaaatgaatttctcattcctcttcaacatgtacacacaataatcatatccgcttctcataaaacc 24273127  T
Q  115 ggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcc 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24273126 ggtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctaagactttacttcaacccatacaaagatttcttcaatagatataccttagacttgtcc 24273027  T
Q  215 tccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaac----tcaagattg 310  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  24273026 tccacaaaatcttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaagtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcgatcaagattg 24272927  T
Q  311 aattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24272926 aattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccatttgagtgacaccct 24272827  T
Q  411 ttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24272826 tagccacaagtcttgctttgtaccttgaaccttcaacacccggaataccttcttttttcttgaagatcca 24272757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 107 - 429
Target Start/End: Original strand, 12404827 - 12405149
Alignment:
Q  107 acaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12404827 acaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggcttttcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttag 12404926  T
Q  207 acttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaag 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12404927 acttgtcctccataaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaag 12405026  T
Q  307 attgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12405027 attgaattgattcacaatagccataactatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtctatcccctccacttgagtgaaa 12405126  T
Q  407 ccctttgccacaagtcttgcttt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12405127 ccctttgccacaagtcttgcttt 12405149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7073400 - 7072985
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  7073400 atatcatctacataaagaagatgatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 7073301  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  7073300 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaatccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 7073201  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || |||    
T  7073200 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaaca 7073101  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  7073100 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 7073001  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  7073000 ttgccttataccttgg 7072985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 3321620 - 3322035
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||| |||| || || |  ||| |||||| ||||||   |||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  3321620 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatgattttcccattccttctcatcatgtaaacacaactgtcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 3321719  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||    
T  3321720 ctaggaactcatcaaaccgacgataccattgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaa 3321819  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  3321820 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 3321919  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3321920 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 3322019  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  3322020 ttgccttataccttgg 3322035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25404006 - 25403591
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  25404006 atatcatctacataaaggagaagatagataatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 25403907  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || |  ||||| || || ||    
T  25403906 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacatggatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacgaa 25403807  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || | |    
T  25403806 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaata 25403707  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  25403706 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaatcctttgctacaagtc 25403607  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  25403606 ttgccttataccttgg 25403591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25408763 - 25408348
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  25408763 atatcatctacataaaggagaagatagataatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 25408664  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || |  ||||| || || ||    
T  25408663 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgcctaggactttgcttcaacccatacatggatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacgaa 25408564  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || | |    
T  25408563 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaata 25408464  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25408463 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccgatgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 25408364  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  25408363 ttgccttataccttgg 25408348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 12398521 - 12398619
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12398521 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaacc 12398619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 360
Target Start/End: Original strand, 5071509 - 5071756
Alignment:
Q  103 tctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacacc 202  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||| |   ||||  || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5071509 tctcacaaaaccagtcatcgaaagaaacttatcaaactgacaacgtcattttcttgggctttgtttcaaccaatacaaatatttcttcaaaagacacatc 5071608  T
Q  203 ttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaact 302  Q
    ||||||||||| ||      ||| || |||||| ||||   || | |||||| ||| |  |||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||    
T  5071609 ttagacttgtcttc------accctctggttgcaccat---gagtctctcttaaagctttccatgtaagaacatgatcttcacgtccatttgttccaact 5071699  T
Q  303 caagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccac 360  Q
    |  ||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5071700 c-ggattatatcgattcacaatcgctataagtatccttatggaacaatgtttcaccac 5071756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14740892 - 14740429
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14740892 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgtctttctcactcttcttcaacatgtacacaca-gaatcatatccgcttctcacaaaactg 14740794  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14740793 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 14740694  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14740693 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 14740594  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14740593 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 14740494  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14740493 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 14740429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33334397 - 33333933
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33334397 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 33334298  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33334297 gtcttcaaaagaaactcatcaaactgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccgtacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 33334198  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33334197 ccacaaaaccttccggttgttccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatctgttccaactcaagattgaattg 33334098  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33334097 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttttcc 33333998  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33333997 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 33333933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24434460 - 24434171
Alignment:
Q  190 caaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatcc 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  24434460 caaaagacataccttagacttgtccaacacaaa-ccttcaggtttctccatatagattttcttttcaagatcaccgagtaagaaagcggtctttacatgc 24434362  T
Q  290 atttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcc 389  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  24434361 atttgttccaactcaaggttgaattgattcacaataaccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtaaatcc 24434262  T
Q  390 cctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |  |||| ||||| ||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  24434261 cctccacttgagtgaaacccttggccataagtcttgttgttcacctaggaccctcaactcttggaatactttcctttttcttgaagatcca 24434171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 35202895 - 35203310
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  35202895 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 35202994  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  35202995 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 35203094  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  35203095 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 35203194  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  35203195 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 35203294  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  35203295 ttgccttataccttgg 35203310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13882064 - 13881673
Alignment:
Q  47 tagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgat 146  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||||||||||||    
T  13882064 tagagaatgactttctcattccttctcatcatgtatacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagcctttactaggaactcatcaaaccgacgat 13881965  T
Q  147 accattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagat 246  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || ||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  13881964 accactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctggttgttgcatatagat 13881865  T
Q  247 tgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaa 346  Q
     || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13881864 agtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtacccttatagaa 13881765  T
Q  347 caatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  13881764 caatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttgg 13881673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 24714559 - 24714730
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24714559 catcaagatatcatacacatataaaagaaggtagagaatgactttctcacccttcttcaacatgtacatacaagaatcatagccgcttctcacaaaaccg 24714658  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaa 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24714659 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacga------tgcctagggctttgcttcaatccatacaaagatttcttcaaa 24714730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 435
Target Start/End: Original strand, 17691789 - 17692096
Alignment:
Q  128 aactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaacctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || |||||||    
T  17691789 aactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaataaacacacttttgtattatcttctacgaaacctt 17691888  T
Q  228 ccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagc 327  Q
    | ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||    
T  17691889 ctggttgttgcatatagatggtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgc 17691988  T
Q  328 cataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgct 427  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  17691989 cataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcc 17692088  T
Q  428 ttgtacct 435  Q
    || |||||    
T  17692089 ttatacct 17692096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25944911 - 25944603
Alignment:
Q  130 ctcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttcc 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| || |  ||||| || |||||||||||     
T  25944911 ctcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaaaatttcttaaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttct 25944812  T
Q  230 ggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagat-tgaattgattcacaatagcc 328  Q
    ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || || || ||||| |||    
T  25944811 ggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatatgttctaactcaagatcataaatg-ttaacaatcgcc 25944713  T
Q  329 ataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctt 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  25944712 ataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacttgagtaaaaccctttgctagaagtcttgcct 25944613  T
Q  429 tgtaccttgg 438  Q
    | ||||||||    
T  25944612 tataccttgg 25944603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 438
Target Start/End: Original strand, 22347917 - 22348222
Alignment:
Q  135 caaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttg 234  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || |  || || || || |||||||| |||||    
T  22347917 caaaccgacgatacctctgccttggactttgcttcaacccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctggttg 22348016  T
Q  235 ctcc--atgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataa 332  Q
     | |  || ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| | |||||    
T  22348017 ttgcatatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgtcataa 22348116  T
Q  333 gtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgta 432  Q
    ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | | ||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  22348117 gtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttacacctaagtaaaaccctttgctacaagtcatgccttata 22348216  T
Q  433 ccttgg 438  Q
    ||||||    
T  22348217 ccttgg 22348222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 112
Target Start/End: Original strand, 22345832 - 22345921
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaa 112  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  22345832 atatcatctacatataggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaa 22345921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 27446589 - 27447053
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27446589 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 27446688  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27446689 gtcttcaaaagaaattcatcaaaacgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcct 27446788  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27446789 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 27446888  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27446889 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 27446988  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27446989 acaagtcttgctttgtaccttagaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 27447053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 33769805 - 33770269
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33769805 catcaagatatcatccacatatagaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 33769904  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33769905 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 33770004  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33770005 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 33770104  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33770105 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgaccccctccacttgagtgaaaccctttgcc 33770204  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33770205 acaagtcttgctttataccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 33770269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28806043 - 28805579
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28806043 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagagtcatatccgcttctcacaaaaccg 28805944  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28805943 gtcttcaaaagaaactcgtcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacgcaccttagacttgtcct 28805844  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28805843 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtattcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 28805744  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28805743 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 28805644  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28805643 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 28805579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37559914 - 37559450
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559914 catcaagatgtcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 37559815  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37559814 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacgccttagacttgtcct 37559715  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37559714 ccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaatta 37559615  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559614 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 37559515  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559514 acaagtcttgctttataccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 37559450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31400313 - 31399849
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400313 catcaagatatcatccacatatagaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 31400214  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400213 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 31400114  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31400113 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagatcgaattg 31400014  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31400013 attcactatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctacacttgagtgaaaccctttgcc 31399914  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31399913 acaagtcttgctttataccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 31399849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 43593887 - 43594351
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43593887 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcacttttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 43593986  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43593987 gtcttcaaaagaaattcatcaaaacgacgataccattgcgtagggctttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcct 43594086  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594087 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 43594186  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594187 attcacaatagtcataaatatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 43594286  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594287 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 43594351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 43626681 - 43627145
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43626681 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcacttttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 43626780  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43626781 gtcttcaaaagaaattcatcaaaacgacgataccattgcgtagggctttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcct 43626880  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43626881 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 43626980  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43626981 attcacaatagtcataaatatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 43627080  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43627081 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 43627145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 76 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24558845 - 24558441
Alignment:
Q  76 catgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaaccca 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24558845 catgtacacacatgaatcatatccgcttctcacaaaatcgatcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaaccca 24558746  T
Q  176 tacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaag 275  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24558745 tataaagatttattcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtaaccgtgtaagaaag 24558646  T
Q  276 cggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctc 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24558645 cggtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctc 24558546  T
Q  376 gttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaag 475  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  24558545 attgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaggaccttcaactcccggaataccttcctttttcttgaag 24558446  T
Q  476 atcca 480  Q
    |||||    
T  24558445 atcca 24558441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 76 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24599877 - 24599473
Alignment:
Q  76 catgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaaccca 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24599877 catgtacacacatgaatcatatccgcttctcacaaaatcgatcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaaccca 24599778  T
Q  176 tacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaag 275  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24599777 tataaagatttattcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtaaccgtgtaagaaag 24599678  T
Q  276 cggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctc 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24599677 cggtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctc 24599578  T
Q  376 gttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaag 475  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  24599577 attgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaggaccttcaactcccggaataccttcctttttcttgaag 24599478  T
Q  476 atcca 480  Q
    |||||    
T  24599477 atcca 24599473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 366
Target Start/End: Original strand, 28833825 - 28834175
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28833825 catcaagatatcatccacatatagaagaaggtagagaatgactttctcacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaatcg 28833924  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  28833925 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgatatcattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagatataccttagacttgtcat 28834024  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  28834025 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatctatttgttccaaattaagattgaattg 28834124  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28834125 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtga 28834175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25451088 - 25450691
Alignment:
Q  41 agaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaacc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |  || |||| ||||||||    
T  25451088 agaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagcctttactaggaactaatcaaacc 25450989  T
Q  141 gacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccat 240  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || ||||||||||| ||||  | |||    
T  25450988 gacgataccactaccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctggttattgcat 25450889  T
Q  241 gtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatcctt 340  Q
     ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| ||||    
T  25450888 atagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtaccctt 25450789  T
Q  341 atggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25450788 atagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcgttgtaatcaatcccttccacctaagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttgg 25450691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 480
Target Start/End: Original strand, 31301224 - 31301563
Alignment:
Q  142 acgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatg 241  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||   ||    
T  31301224 acgatatcattgccttggattttgtttcaattcttacaatgatttcttcaaaagacacaccttagatttgtcttccataaaacctttcgaatgctttgtg 31301323  T
Q  242 tagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatcctta 341  Q
    |||||||||| || ||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||| | | |||||| |||    
T  31301324 tagattgtctttttaaggggtccatgtaagaatgcggcattcacatccatttgttccaactcaatattgtattgataaacgatagtcgtgagtatcttta 31301423  T
Q  342 tggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcca-caagtcttgctttgtaccttggac 440  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||  ||  |||||||| ||||||||||    
T  31301424 tggaacaatgtttttctaccggtgagaagatctcattttagttgatcccctcaacttgagtgaaacctgtttccataaaaccttgctttataccttggac 31301523  T
Q  441 cttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  31301524 ctttaactcccggaatgcctgccttttttttgaagttcca 31301563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 363 - 480
Target Start/End: Original strand, 28835415 - 28835532
Alignment:
Q  363 gtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatc 462  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||    
T  28835415 gtgagaagatctcattgtagtcgattcccttcacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctaggaccttcaacacccgaaataccttc 28835514  T
Q  463 ctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28835515 ctttttcttgaagatcca 28835532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 310
Target Start/End: Original strand, 30102726 - 30102874
Alignment:
Q  162 tttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtc 261  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30102726 tttgtttcaactcatacaaatatttcttcaaaagacccaccgtagatttatcctctacaaaaccttttggttgctctatgtaaattgtctcttcaaggtc 30102825  T
Q  262 accatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattg 310  Q
     |||||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  30102826 tccatgtaagaaaaccgtttacgtatccatttgttccaactcaaaattg 30102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 480
Target Start/End: Original strand, 31333674 - 31333875
Alignment:
Q  281 ttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgt 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||| | | |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |    
T  31333674 ttcacatcaatttgttccaactcaatatcgtattgattaacgatagtcgtgagtatctttatggaacaatgtttttccaccggtgaaaagatctcatttt 31333773  T
Q  381 agtcgatcccctccacttgagtgaaacc-ctttgcca-caagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatc 478  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||  ||||||| |||||| ||    
T  31333774 agttgatcccctcaacttgagtgaaacctgttttccataaaaccttgctttataccttggacctttaactcctagaatgcctgccttttttttgaagttc 31333873  T
Q  479 ca 480  Q
    ||    
T  31333874 ca 31333875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 28664136 - 28664275
Alignment:
Q  175 atacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaa---aacct-tccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaa 270  Q
    |||||| ||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| ||||   || || || |||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||      
T  28664136 atacaatgatttattcaaatgaaataccttagacttttcctctacaattaaatctctctggttgctccatgtagattttttcttcaaggtaaagatgttg 28664235  T
Q  271 gaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattg 310  Q
    |||  || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  28664236 gaacacgctcttcacatccatgtgtttcaacttaagattg 28664275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22171629 - 22171165
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171629 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaataaatttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 22171530  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171529 gtctttaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 22171430  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171429 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 22171330  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171329 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaaaatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 22171230  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171229 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 22171165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 32477106 - 32477570
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477106 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 32477205  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477206 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 32477305  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477306 ctacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 32477405  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477406 attcactatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 32477505  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32477506 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 32477570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2675541 - 2675077
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2675541 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacgcaagagtcatatccgcttctcacaaaaccg 2675442  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675441 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgaccataccattgcctaaggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 2675342  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2675341 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagatcgaattg 2675242  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675241 attcactatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 2675142  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675141 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 2675077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 8513860 - 8514324
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513860 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcgttcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 8513959  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513960 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagtgctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 8514059  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514060 ctacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 8514159  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514160 attcactatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 8514259  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514260 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 8514324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 1307637 - 1308101
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1307637 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgaatttctcactcttcttcaacatgtacacataagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 1307736  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1307737 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 1307836  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1307837 ccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttgaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 1307936  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1307937 attcacgatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttaagtgaaacccttggcc 1308036  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1308037 acaagtcttgttttgtaccttggaccttcaacacccagaataccttcctttttcttgaagatcca 1308101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 16256835 - 16257299
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16256835 catcaagatatcatcaacatataaaacaaggtagagaatgactttctcactcctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 16256934  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16256935 gtctttaaaagaaattcatcaaatcgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 16257034  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16257035 ccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 16257134  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16257135 attcacaatagtcataagtatccttatggtacaatgtttcaccaccggtgaaaatatcttattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagcc 16257234  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  16257235 acaagtcttgctttgtaccttggaccattaacacccggaatacgttcctttttcttgaagatcca 16257299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 124 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3326739 - 3326383
Alignment:
Q  124 aagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaa 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  3326739 aagaaattcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacattccttagatttgtcttctacaaaa 3326640  T
Q  224 ccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaa 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3326639 ccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaa 3326540  T
Q  324 tagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtct 423  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3326539 tagcgatatgtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtaagaagatctcattgtagtcgatcccctccatttgagtgaaacccttggccacaagtct 3326440  T
Q  424 tgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  3326439 tgctttgtaccttggaccttcaacaccctgaataccttcttttttcttgaagatcca 3326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 54191857 - 54191406
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  54191857 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 54191758  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||    
T  54191757 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaa 54191658  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || |||    
T  54191657 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaaca 54191558  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  54191557 atcgccataagtacccttatagaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 54191458  T
Q  423 ttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaa 474  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  54191457 ttgccttataccttggtgcttcgacccccggtataccttcttttttcttgaa 54191406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 10095638 - 10096053
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  10095638 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 10095737  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  10095738 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaagatttcttgaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 10095837  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  10095838 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 10095937  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  10095938 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 10096037  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  10096038 ttgccttataccttgg 10096053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 10202524 - 10202939
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  10202524 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 10202623  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  10202624 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaatatttcttgaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 10202723  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  10202724 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 10202823  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  10202824 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 10202923  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  10202924 ttgccttataccttgg 10202939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10900358 - 10899943
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||| ||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  10900358 atatcatctacataaagaagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacataactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 10900259  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |  || ||    
T  10900258 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttatacgaa 10900159  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || |||    
T  10900158 accttctggttgctgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaaca 10900059  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  10900058 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctgcaagtc 10899959  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  10899958 ttgccttataccttgg 10899943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 10609605 - 10610020
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  10609605 atatcatccacataaaggagaaggtagagaatgactttctcattctttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 10609704  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |  ||||| || || ||    
T  10609705 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactaccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaaaacaaacttttgtattgtcttctacgaa 10609804  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |    || |||    
T  10609805 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccattcgttctaactcaagatcatacatgttaaca 10609904  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    ||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  10609905 attaccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaatcctttgctacaagtc 10610004  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  10610005 ttgccttataccttgg 10610020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 47879721 - 47880136
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  47879721 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 47879820  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  47879821 ctaggaattcatcaatccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 47879920  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |   ||| |||    
T  47879921 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatatgttctaactcaagatcatacatattaaca 47880020  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  47880021 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccatcggtgaaaagatttcattgtaatcaatccattccacctgagtaaaacccattgctacaagtc 47880120  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  47880121 ttgccttataccttgg 47880136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16460813 - 16460400
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| || |  ||| |||||| ||||||   |||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  16460813 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatcactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactgtcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 16460714  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  16460713 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 16460614  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||  ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  16460613 accttatggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 16460514  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16460513 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 16460414  T
Q  423 ttgctttgtacctt 436  Q
    |||| || ||||||    
T  16460413 ttgccttatacctt 16460400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 291
Target Start/End: Original strand, 22622957 - 22623225
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  22622957 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 22623056  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||| || |||||    
T  22623057 ctaggaactcatcaaaccgacgataccattgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaa 22623156  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccat 291  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || |||||||||||||||||    
T  22623157 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccat 22623225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3326810 - 3326735
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3326810 catcaagatatcatccacatatagaagaaggtagagaatgactttctcacccatcttcaacatgtacacacaagaa 3326735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9149655 - 9149586
Alignment:
Q  41 agaagatagagaatgactttctcactctt-cttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9149655 agaaggtagagaatgactttctc-ctctttctttaacatgtacgcacaaaaatcatacccgcttctcacaa 9149586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 706 - 242
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  706 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 607  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  606 gtcttcaaaagaaactcgtcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtctt 507  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  506 ccacaaaaccttcaggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 407  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  406 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctctttgtagtcgatcccctccacttgggtgaaaccctttgcc 307  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  306 acaagtcttgctttataccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 19346044 - 19346508
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19346044 catcaagatatcatccacatatagaagaagatagagaatgactttctcattcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 19346143  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19346144 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagattttttcaaaagacacaccttagacttgtcct 19346243  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19346244 ccacaaaaccttccggttgttccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatataagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 19346343  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19346344 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgaccccctccacttgagtgaaaccctttacc 19346443  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19346444 acaagtcttgctttataccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 19346508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 39484524 - 39484987
Alignment:
Q  17 atcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39484524 atcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttctcacccatctccaacatgtacacacaagaatcatatctgcttctcacaaaaccgg 39484623  T
Q  117 tcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctc 216  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39484624 tcttcaaaagaaattcataaaaacaacgataccattgcctaaggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctc 39484723  T
Q  217 cacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattga 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39484724 tacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggttaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattgaattga 39484823  T
Q  317 ttcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39484824 ttcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggcca 39484923  T
Q  417 caagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39484924 caagtcttgctttgtacctttgaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 39484987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 39486532 - 39486070
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39486532 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttcacaaacatcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaacca 39486433  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39486432 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgatatcattgtctagggctttgcttcaacccatacaaagatatcttcaaaagacatatcttagacttgtcct 39486333  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39486332 ccacaaaaccttctggttactccatgtagattgtctcttcaaggtcaacatgtaagaaagcggtcttcacatccatttcttccaactcaagattgaattg 39486233  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39486232 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagcc 39486133  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatc 478  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39486132 acaagtcttgctttgtacctagtactttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatc 39486070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 31057725 - 31058188
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057725 catcaagatatcatccacatataaaagaaggtagagaatgactttc-cacccctcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 31057823  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31057824 gtcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccatttcctagggttttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 31057923  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31057924 ccacaaaaccttccaattgctccatgtagattgtctcttcatggtcagcatgtaagaaatcagtcttcacatccatttgttccaacttaagattgaattg 31058023  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31058024 attcacaatggtcataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccgatgagaagatctgattgtagtggatcccctccacttgagtgaaacccttggcc 31058123  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  31058124 acaagtcttgctttctacctacgaccttcaacacccgaaataccttcctttttcttgaagatcca 31058188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31134880 - 31134502
Alignment:
Q  40 aagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaac 139  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||| || ||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31134880 aagaaggtagagaatgactttttcatccttctttaatatgtacacataaaaatcatacctacttcttacaacaccggtcttcaaaagaaactcatcaaac 31134781  T
Q  140 cgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctcca 239  Q
     || || || |||| || || ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  31134780 tgatga-actattgtcttggactttgtttcaacacatacaacaatttcttcaaaagacacatcttggacttgtcctccataaaaccttccagtttctcca 31134682  T
Q  240 tgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatcct 339  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || |||||  | ||||||||||||| | |||||||   |||| ||||||| |||    
T  31134681 tatagatcgtctcttcaatgtcaccatataagaaggcggtcttcatatacattttcttcaactcaagattgtaatgattcatggtagctataagtaacct 31134582  T
Q  340 tatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  31134581 tatggaacaatgcttcaccacatgtgaaaagatctcatagtagtcaatcccttcaactagagtgaaaccctttcccacaa 31134502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39685596 - 39685181
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  39685596 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 39685497  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  39685496 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgctttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 39685397  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    || ||  ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    || |||    
T  39685396 acgttatggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattatacatgttaaca 39685297  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  39685296 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttcgctacaagtc 39685197  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  39685196 ttgccttataccttgg 39685181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 20051594 - 20052008
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  20051594 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtagacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 20051693  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| || |  || || || || ||    
T  20051694 ctaggaactcatcaaaccgacgata-cactgccttggactttgcttcaaccgatacaaagttttcttcaacaaacacactttggtattatcttctacgaa 20051792  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  20051793 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 20051892  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  20051893 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattataatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 20051992  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  20051993 ttgccttataccttgg 20052008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 436
Target Start/End: Original strand, 22714066 - 22714479
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| || |  ||| |||||| ||||||   |||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  22714066 atatcatctacataaaggagaaggtagagaataactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactgtcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 22714165  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  22714166 ctaggaactcatcaaaccgacgataccaatgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 22714265  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||  ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  22714266 accttatggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 22714365  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22714366 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 22714465  T
Q  423 ttgctttgtacctt 436  Q
    |||| || ||||||    
T  22714466 ttgccttatacctt 22714479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2739554 - 2739139
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  2739554 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 2739455  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  2739454 ctaggaactcatcataccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctattacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 2739355  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  2739354 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgtggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 2739255  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  2739254 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccagcggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttagctacaagtc 2739155  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  2739154 ttgccttataccttgg 2739139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17935181 - 17935018
Alignment:
Q  275 gcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatct 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  17935181 gcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagattt 17935082  T
Q  375 cgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17935081 cattgtagtcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttgg 17935018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17942170 - 17942004
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||   ||| |    
T  17942170 atatcatctacataaaggagaagatagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccaaccttta 17942071  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttctt 189  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942070 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctt 17942004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 27568379 - 27568455
Alignment:
Q  218 acaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttg 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||    
T  27568379 acaaaaccttcaggttgttccatatagattacttcttcaagttcaccatttaaaaaagttgttttcacatccatttg 27568455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 480
Target Start/End: Original strand, 41395102 - 41395481
Alignment:
Q  101 cttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41395102 cttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacaca 41395201  T
Q  201 ccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41395202 ccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtgaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaa 41395301  T
Q  301 ctcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41395302 ctcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagttctcgttgtagtcgatcccctccacttga 41395401  T
Q  401 gtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41395402 gtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 41395481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 47702357 - 47701894
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47702357 catcaagatatcatcaacatatagaagaaggtagagaatgactttctcacccctcttcaacatgt-cacacaagaatcatatccgcttcttacaaaaccg 47702259  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  47702258 gtttccaaaagaaattcatcaaactgatgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgttct 47702159  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47702158 ccacaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtattcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 47702059  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  47702058 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccactttagtgaaacccttggct 47701959  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47701958 acaagtctttctttgtacctaggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcca 47701894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47101328 - 47101013
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47101328 catcaacatatcatccacatataaaagaagttagagaatgactttctcaccccttttcaacatgtatacacaagaatcatatccgcttctcacaaatccg 47101229  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47101228 atcttcaaaagaaattcatcaaaccgacgataccattgtctatggctttgcttcaacctatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcct 47101129  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47101128 ccacaaaaccttccagttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattcaattg 47101029  T
Q  316 attcacaatagccata 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  47101028 attcacaatagccata 47101013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 269 - 480
Target Start/End: Original strand, 13599886 - 13600097
Alignment:
Q  269 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  13599886 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaataatgtttcaccactggtgaga 13599985  T
Q  369 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatccttttt 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13599986 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgattgaaacccttggccacaagtcttgctttgtatcttggaccttcaacacccggaataccttccttttt 13600085  T
Q  469 cttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||    
T  13600086 cttgaagatcca 13600097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9525077 - 9524662
Alignment:
Q  23 atatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttca 122  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | ||| |    
T  9525077 atatcatctacataaaggagaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaaccagccttta 9524978  T
Q  123 aaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaa 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| || |||||    
T  9524977 ctaggaactcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaa 9524878  T
Q  223 accttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcaca 322  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || |||    
T  9524877 accttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaaca 9524778  T
Q  323 atagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtc 422  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9524777 atcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtc 9524678  T
Q  423 ttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| || ||||||||    
T  9524677 ttgccttataccttgg 9524662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 438
Target Start/End: Original strand, 2396105 - 2396502
Alignment:
Q  41 agaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaacc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||  | ||| |  || |||||||||||||    
T  2396105 agaaggtagagaatgactttctcattccttctcatcatgtaaacacaactatcatagttgcttctcacaaaactagcctttactaggaactcatcaaacc 2396204  T
Q  141 gacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccat 240  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || |||||||| ||||| | |||    
T  2396205 gacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctggttgttgcat 2396304  T
Q  241 gtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatcctt 340  Q
     ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| |||||||||| ||||    
T  2396305 atagatagtttcttccaaatctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataagtaccctt 2396404  T
Q  341 atggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  2396405 atagaacaatgttttaccaccggtgagaagatttcattgtaataaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttgg 2396502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 41392218 - 41392307
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41392218 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttct 41392307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34689874 - 34689683
Alignment:
Q  17 atcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctca-ctcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||| ||  ||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| ||| || ||||||| ||  ||||||||||||      
T  34689874 atcaatatatcatccatatattgaagtaggaagagaatgattttctcatcccttttttaatatgtaaacataataatcataaccttttctcacaaaacat 34689775  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttaga 207  Q
    || |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||  |||| || |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  34689774 gtgttcaaaagaaactcatcaaacccatgacaccatttccttaggctatgtttcaacacatacaaaggtttgttctaaagacacaccttaga 34689683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34694402 - 34694211
Alignment:
Q  17 atcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctca-ctcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||| ||  ||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| ||| || ||||||| ||  ||||||||||||      
T  34694402 atcaatatatcatccatatattgaagtaggaagagaatgattttctcatcccttttttaatatgtaaacataataatcataaccttttctcacaaaacat 34694303  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttaga 207  Q
    || |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||  |||| || |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  34694302 gtgttcaaaagaaactcatcaaacccatgacaccatttccttaggctatgtttcaacacatacaaaggtttgttctaaagacacaccttaga 34694211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7155329 - 7155149
Alignment:
Q  77 atgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccggtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccat 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||     |||||||| |||||  |||    
T  7155329 atgtacacataagaatcatatcc--ttctcccacaaccggtcttcaaaagaaatttctcaaactgacgataccattcatgtgggctttgtttcaaggcat 7155232  T
Q  177 acaaaga-tttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaag 258  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   ||||  ||| || | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7155231 acaaagatttttttcaaaagacatgtcttaaccttatctttcacaaaaccttctagttactccatgtatattatctcttcaag 7155149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Original strand, 13599844 - 13599881
Alignment:
Q  319 cacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13599844 cacaatagccataagtatccttatggaataatgtttca 13599881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41131112 - 41131045
Alignment:
Q  19 caagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacaca 87  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  41131112 caagatatcatccacatatagta-aagatagagatcgactttcacacacttcttcaatatgtagacaca 41131045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 33806 - 34269
Alignment:
Q  16 catcaagatatcatccacatataaaagaagatagagaatgactttctcactcttcttcaacatgtacacacaagaatcatatccgcttctcacaaaaccg 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| | ||||| |    
T  33806 catcaagatatcatctacatataaaagaagttatagaatgacttcctaagccttctttaacatatacacacaagaatcatacatgcttctaa-aaaactg 33904  T
Q  116 gtcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcct 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33905 atcttcaaaagaaactcatcaaaccgacgataccatttcctaggactttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcct 34004  T
Q  216 ccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattg 315  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34005 ccccaaaaccttctggttgctccatgtagattgtctcttcaagggtaccatgtaagaaagcagtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattg 34104  T
Q  316 attcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgcc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||| |||    
T  34105 attcacaatatccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattatactcgatcccctccacctaagttaaacccttggcc 34204  T
Q  416 acaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatcca 480  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  34205 acaagtcttgttttgtacctaggaccttcaactcctagaataccttcctttttcttgaagatcca 34269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 269 - 480
Target Start/End: Original strand, 7683 - 7894
Alignment:
Q  269 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaa 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  7683 aagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaataatgtttcaccactggtgaga 7782  T
Q  369 agatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatccttttt 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7783 agatctcattgtagtcgatcccctccacttgattgaaacccttggccacaagtcttgctttgtatcttggaccttcaacacccggaataccttccttttt 7882  T
Q  469 cttgaagatcca 480  Q
    ||||||||||||    
T  7883 cttgaagatcca 7894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Original strand, 7641 - 7678
Alignment:
Q  319 cacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7641 cacaatagccataagtatccttatggaataatgtttca 7678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 438
Target Start/End: Original strand, 161 - 390
Alignment:
Q  209 ttgtcctccacaaaaccttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagat 308  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  161 ttgtcttctacaaaaccttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagat 260  T
Q  309 tgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacc 408  Q
       |   ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  261 catacatattaacaatcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaaaatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacc 360  T
Q  409 ctttgccacaagtcttgctttgtaccttgg 438  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  361 ctttactacaagtcttgctttataccttgg 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5001 - 4811
Alignment:
Q  208 cttgtcctccacaaaacc--ttccggttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaa 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |  |  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5001 cttgtcctccacaaaacccattcc--ttgctccatttagattgtctcttcaaaatatccatgtaaggacacaatcttcacatccatttattccaaatcaa 4904  T
Q  306 gattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccactt 398  Q
    ||||| ||| ||| |  |||  |||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| ||||    
T  4903 gattgtattcattgaatataaacataagtacccttattaaacaatgttttaacactggtgagaaaatcttgttgtactcaattccctcaactt 4811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University