View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7846_low_2 (Length: 253)

Name: NF7846_low_2
Description: NF7846
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7846_low_2
NF7846_low_2
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (1-249)||(19773579-19773827)
chr6 (5-250)||(22805758-22806012)
chr6 (1-150)||(23414819-23414968)
chr6 (1-150)||(27556577-27556726)
chr6 (1-248)||(17743215-17743461)
chr6 (1-188)||(15705480-15705668)
chr6 (2-150)||(18917385-18917533)
chr6 (1-253)||(17377834-17378085)
chr6 (1-150)||(31477928-31478077)
chr6 (1-184)||(28103935-28104119)
chr6 (1-150)||(16760134-16760283)
chr6 (30-253)||(18913777-18914000)
chr6 (30-253)||(18937035-18937258)
chr6 (19-150)||(27415994-27416125)
chr6 (1-147)||(18955881-18956027)
chr6 (2-150)||(1644547-1644695)
chr6 (1-147)||(22948950-22949096)
chr6 (30-253)||(15174163-15174386)
chr6 (2-128)||(11566723-11566849)
chr6 (2-128)||(19870451-19870577)
chr6 (1-147)||(22952906-22953052)
chr6 (2-128)||(23394929-23395055)
chr6 (1-147)||(23871394-23871540)
chr6 (1-147)||(23875350-23875496)
chr6 (1-188)||(15817558-15817744)
chr6 (2-128)||(8243722-8243848)
chr6 (2-128)||(23989781-23989907)
chr6 (2-147)||(14472113-14472258)
chr6 (2-124)||(22862811-22862933)
chr6 (1-188)||(15875279-15875467)
chr6 (2-128)||(12618963-12619087)
chr6 (4-120)||(14979427-14979543)
chr6 (30-250)||(19656076-19656297)
chr6 (19-92)||(18696480-18696553)
chr6 (19-89)||(18706301-18706371)
chr6 (114-167)||(23538745-23538798)
chr6 (72-167)||(17105771-17105865)
chr6 (30-88)||(23956148-23956206)
chr6 (30-176)||(22376621-22376772)
chr6 (206-250)||(20078286-20078330)
chr6 (206-250)||(27573163-27573207)
chr6 (206-253)||(18927731-18927778)
chr6 (206-253)||(28708482-28708529)
chr6 (209-250)||(18453143-18453184)
chr6 (206-250)||(17743159-17743203)
chr6 (210-250)||(23538690-23538730)
chr6 (206-250)||(27573109-27573153)
chr6 (48-95)||(20078134-20078181)
chr6 (207-250)||(23838136-23838179)
chr6 (206-253)||(28104140-28104187)
chr6 (206-252)||(2201058-2201104)
chr6 (61-190)||(18259926-18260058)
chr6 (206-252)||(22420906-22420952)
chr6 (206-250)||(17105716-17105760)
chr6 (206-250)||(18896429-18896473)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (1-250)||(125781-126039)
scaffold0011 (206-250)||(38267-38311)
scaffold0011 (172-207)||(125760-125795)
scaffold0011 (206-242)||(125735-125771)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-253)||(675-936)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-253)||(16796326-16796569)
chr3 (1-250)||(18700344-18700602)
chr3 (1-250)||(324070-324318)
chr3 (1-253)||(52989759-52990010)
chr3 (2-253)||(17691746-17692006)
chr3 (1-250)||(43889663-43889911)
chr3 (1-150)||(12339640-12339789)
chr3 (1-253)||(14966001-14966252)
chr3 (1-250)||(12469736-12469984)
chr3 (1-150)||(4588891-4589040)
chr3 (1-150)||(5223238-5223387)
chr3 (1-150)||(11300548-11300697)
chr3 (1-150)||(37439754-37439903)
chr3 (1-253)||(21837247-21837508)
chr3 (1-250)||(11914053-11914301)
chr3 (30-253)||(35961596-35961819)
chr3 (24-253)||(54876450-54876688)
chr3 (1-147)||(15964814-15964960)
chr3 (1-147)||(15968738-15968884)
chr3 (1-147)||(15972662-15972808)
chr3 (1-150)||(19775607-19775756)
chr3 (2-128)||(4111368-4111494)
chr3 (2-128)||(7109562-7109688)
chr3 (2-128)||(7113497-7113623)
chr3 (2-128)||(11165648-11165774)
chr3 (2-128)||(22321528-22321654)
chr3 (2-128)||(22336583-22336709)
chr3 (2-128)||(27409763-27409889)
chr3 (2-128)||(28949588-28949714)
chr3 (2-128)||(55022731-55022857)
chr3 (1-150)||(11854575-11854724)
chr3 (2-128)||(4107516-4107642)
chr3 (2-128)||(11069932-11070058)
chr3 (2-127)||(30065811-30065936)
chr3 (2-127)||(15617239-15617364)
chr3 (30-169)||(22652036-22652174)
chr3 (2-128)||(14499189-14499315)
chr3 (1-91)||(15465068-15465158)
chr3 (4-121)||(16643135-16643252)
chr3 (56-188)||(17046206-17046339)
chr3 (1-93)||(14670914-14671006)
chr3 (102-207)||(16979092-16979207)
chr3 (27-167)||(14569023-14569163)
chr3 (1-93)||(14682413-14682505)
chr3 (180-253)||(17685744-17685817)
chr3 (141-207)||(36527737-36527804)
chr3 (30-88)||(41813-41871)
chr3 (134-253)||(24513773-24513891)
chr3 (30-88)||(16325249-16325307)
chr3 (56-157)||(13026420-13026521)
chr3 (56-157)||(13030012-13030113)
chr3 (206-253)||(24178763-24178810)
chr3 (206-250)||(9577586-9577630)
chr3 (206-250)||(10542508-10542552)
chr3 (141-207)||(3265075-3265142)
chr3 (206-253)||(5841789-5841836)
chr3 (206-253)||(22651976-22652023)
chr3 (205-250)||(15265100-15265145)
chr3 (113-150)||(15465039-15465076)
chr3 (206-251)||(32403075-32403120)
chr3 (206-250)||(15245979-15246023)
chr3 (206-249)||(324017-324060)
chr3 (172-207)||(324049-324084)
chr3 (172-207)||(18700588-18700623)
chr3 (206-252)||(6808076-6808122)
chr3 (215-253)||(45220417-45220455)
chr3 (206-251)||(23318829-23318874)
chr3 (206-242)||(10542562-10542598)
chr3 (206-238)||(10834219-10834251)
chr3 (206-250)||(15206897-15206941)
chr3 (30-66)||(16979218-16979254)
chr3 (206-242)||(43889921-43889957)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (1-242)||(119842-120092)
scaffold0034 (206-250)||(117192-117236)
scaffold0034 (206-250)||(117138-117182)
scaffold0034 (209-244)||(119802-119837)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-253)||(48603275-48603536)
chr1 (1-253)||(51326614-51326876)
chr1 (1-253)||(27653259-27653520)
chr1 (1-150)||(1925247-1925396)
chr1 (1-150)||(20924261-20924410)
chr1 (20-250)||(48520347-48520576)
chr1 (1-253)||(12271387-12271638)
chr1 (19-253)||(22130961-22131193)
chr1 (2-150)||(20228928-20229076)
chr1 (30-253)||(29764346-29764569)
chr1 (30-253)||(50000595-50000817)
chr1 (30-186)||(46198433-46198590)
chr1 (22-150)||(33797456-33797584)
chr1 (2-128)||(21407216-21407342)
chr1 (2-128)||(1010584-1010710)
chr1 (2-128)||(16375578-16375704)
chr1 (2-128)||(52639402-52639528)
chr1 (4-124)||(13881421-13881541)
chr1 (102-188)||(20316532-20316619)
chr1 (1-93)||(41781625-41781718)
chr1 (180-253)||(636090-636163)
chr1 (1-69)||(43543144-43543212)
chr1 (1-42)||(23819416-23819457)
chr1 (206-253)||(11809492-11809539)
chr1 (206-253)||(23072995-23073042)
chr1 (206-253)||(25263084-25263131)
chr1 (206-250)||(14800490-14800534)
chr1 (206-250)||(14809364-14809408)
chr1 (206-250)||(20958069-20958113)
chr1 (206-250)||(21043397-21043441)
chr1 (206-253)||(43630375-43630422)
chr1 (206-250)||(23967675-23967719)
chr1 (206-250)||(28312475-28312519)
chr1 (206-246)||(47190566-47190606)
chr1 (206-250)||(48520293-48520337)
chr1 (206-250)||(20316416-20316460)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-250)||(16579584-16579842)
chr7 (1-250)||(16585821-16586079)
chr7 (1-249)||(14258277-14258534)
chr7 (1-250)||(16460802-16461060)
chr7 (1-253)||(15719818-15720079)
chr7 (1-253)||(16998415-16998676)
chr7 (1-253)||(46580712-46580963)
chr7 (1-250)||(32301123-32301371)
chr7 (1-252)||(8940083-8940333)
chr7 (1-150)||(13918562-13918711)
chr7 (1-150)||(25927285-25927434)
chr7 (1-150)||(1858868-1859017)
chr7 (1-253)||(14273337-14273598)
chr7 (1-253)||(15112776-15113027)
chr7 (1-253)||(8468539-8468801)
chr7 (1-251)||(16323886-16324134)
chr7 (2-150)||(39722105-39722253)
chr7 (1-147)||(45170124-45170270)
chr7 (1-128)||(18283227-18283354)
chr7 (2-128)||(32968-33094)
chr7 (19-149)||(2530191-2530320)
chr7 (2-128)||(12704778-12704904)
chr7 (2-128)||(12714725-12714851)
chr7 (2-128)||(12718529-12718655)
chr7 (2-128)||(16907320-16907446)
chr7 (30-253)||(16550712-16550935)
chr7 (1-128)||(18279264-18279391)
chr7 (2-128)||(12723440-12723566)
chr7 (2-127)||(70884-71009)
chr7 (2-127)||(74993-75118)
chr7 (30-188)||(32160910-32161068)
chr7 (30-253)||(17232740-17232973)
chr7 (2-128)||(16114102-16114228)
chr7 (2-128)||(16117255-16117381)
chr7 (2-128)||(26292256-26292382)
chr7 (1-207)||(15116352-15116564)
chr7 (1-176)||(17060461-17060635)
chr7 (72-253)||(14981543-14981723)
chr7 (45-150)||(15084035-15084140)
chr7 (30-253)||(16614727-16614950)
chr7 (56-249)||(1490146-1490348)
chr7 (72-188)||(15411019-15411136)
chr7 (1-93)||(20487533-20487625)
chr7 (201-253)||(11092679-11092731)
chr7 (1-69)||(14270063-14270131)
chr7 (141-207)||(10501483-10501550)
chr7 (206-253)||(11392123-11392170)
chr7 (141-207)||(14157164-14157231)
chr7 (180-252)||(16185913-16185984)
chr7 (206-253)||(11084937-11084984)
chr7 (206-248)||(38519335-38519377)
chr7 (206-250)||(9033462-9033507)
chr7 (206-250)||(11661233-11661277)
chr7 (206-242)||(32301077-32301113)
chr7 (206-253)||(15116316-15116363)
chr7 (172-207)||(16461046-16461081)
chr7 (206-245)||(16461070-16461109)
chr7 (206-253)||(32161084-32161131)
chr7 (172-207)||(32301102-32301137)
chr7 (206-250)||(130933-130977)
chr7 (206-250)||(14421911-14421955)
chr7 (172-204)||(16579566-16579598)
chr7 (172-204)||(16586065-16586097)
chr7 (206-250)||(42461910-42461954)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-253)||(17048171-17048422)
chr4 (1-253)||(13591963-13592213)
chr4 (1-251)||(14746620-14746869)
chr4 (1-150)||(10712695-10712844)
chr4 (1-150)||(10926465-10926614)
chr4 (1-150)||(12487550-12487699)
chr4 (1-147)||(14954285-14954431)
chr4 (1-147)||(27533868-27534014)
chr4 (1-253)||(15497072-15497324)
chr4 (32-250)||(40619661-40619872)
chr4 (19-150)||(43256213-43256344)
chr4 (1-147)||(25689712-25689858)
chr4 (2-128)||(9556391-9556517)
chr4 (30-253)||(10694955-10695177)
chr4 (30-253)||(10908721-10908943)
chr4 (2-128)||(14757541-14757667)
chr4 (30-176)||(15008163-15008309)
chr4 (2-125)||(4561453-4561576)
chr4 (2-128)||(5757057-5757183)
chr4 (30-253)||(15884123-15884346)
chr4 (2-127)||(17810134-17810259)
chr4 (1-189)||(19857416-19857605)
chr4 (30-250)||(53631320-53631541)
chr4 (2-128)||(33742241-33742365)
chr4 (42-207)||(14650697-14650866)
chr4 (72-253)||(26013314-26013496)
chr4 (1-70)||(10056653-10056722)
chr4 (30-88)||(28385529-28385587)
chr4 (141-207)||(14184973-14185040)
chr4 (206-247)||(13592219-13592260)
chr4 (56-157)||(15990254-15990355)
chr4 (1-62)||(52873179-52873240)
chr4 (206-253)||(9923204-9923251)
chr4 (209-246)||(15791739-15791776)
chr4 (206-250)||(24047415-24047459)
chr4 (210-253)||(11479612-11479655)
chr4 (206-250)||(26045409-26045453)
chr4 (206-250)||(26050590-26050634)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-229)||(23069320-23069557)
chr2 (1-253)||(23707325-23707576)
chr2 (1-253)||(24917943-24918194)
chr2 (1-253)||(27472252-27472503)
chr2 (1-253)||(34874249-34874500)
chr2 (1-235)||(18358770-18359007)
chr2 (1-253)||(24670828-24671079)
chr2 (1-253)||(24681249-24681498)
chr2 (1-150)||(30345109-30345258)
chr2 (1-150)||(31345051-31345200)
chr2 (4-253)||(22459602-22459850)
chr2 (1-150)||(1283228-1283377)
chr2 (4-188)||(21081776-21081961)
chr2 (1-150)||(41531122-41531271)
chr2 (2-128)||(24628598-24628724)
chr2 (2-128)||(27601657-27601783)
chr2 (2-128)||(12901631-12901757)
chr2 (2-128)||(27379552-27379678)
chr2 (2-128)||(27383598-27383724)
chr2 (30-253)||(21914743-21914966)
chr2 (30-253)||(34492200-34492423)
chr2 (2-128)||(24649218-24649344)
chr2 (2-127)||(10101764-10101889)
chr2 (72-253)||(24316193-24316382)
chr2 (1-93)||(9784673-9784765)
chr2 (89-188)||(20320723-20320823)
chr2 (42-250)||(39827952-39828153)
chr2 (206-253)||(13101762-13101809)
chr2 (206-250)||(34136901-34136945)
chr2 (176-253)||(27485341-27485420)
chr2 (206-250)||(21073608-21073652)
chr2 (207-250)||(9241888-9241931)
chr2 (207-250)||(43947481-43947524)
chr2 (206-250)||(22252604-22252648)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (1-253)||(22107471-22107722)
chr5 (1-150)||(18356131-18356280)
chr5 (1-150)||(20910953-20911102)
chr5 (1-188)||(6765724-6765912)
chr5 (1-188)||(33895682-33895870)
chr5 (30-253)||(17010846-17011069)
chr5 (1-150)||(40723705-40723854)
chr5 (2-128)||(20295708-20295834)
chr5 (1-150)||(10753203-10753352)
chr5 (19-251)||(29447838-29448069)
chr5 (2-128)||(15236954-15237080)
chr5 (2-128)||(19472839-19472965)
chr5 (30-188)||(263042-263201)
chr5 (19-93)||(18356308-18356381)
chr5 (21-93)||(20910854-20910925)
chr5 (103-150)||(11220587-11220634)
chr5 (103-150)||(11225173-11225220)
chr5 (103-150)||(11228996-11229043)
chr5 (30-88)||(33473272-33473330)
chr5 (103-150)||(11230985-11231032)
chr5 (206-253)||(19076342-19076389)
chr5 (206-253)||(41861578-41861625)
chr5 (206-248)||(23469766-23469808)
chr5 (103-148)||(11227008-11227053)
chr5 (206-253)||(262980-263026)
chr5 (209-252)||(24212307-24212350)
chr5 (209-252)||(35852562-35852605)
chr5 (206-250)||(33895886-33895929)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (2-253)||(2751-3011)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-253)||(53875-54126)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-253)||(6978-7229)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (4-252)||(17461092-17461349)
chr8 (1-253)||(22238056-22238306)
chr8 (1-253)||(37515538-37515789)
chr8 (1-253)||(23409628-23409879)
chr8 (1-150)||(21410789-21410938)
chr8 (1-150)||(21805281-21805430)
chr8 (1-150)||(21828132-21828281)
chr8 (2-188)||(18833458-18833645)
chr8 (1-147)||(18862763-18862909)
chr8 (1-188)||(19808399-19808587)
chr8 (2-128)||(21976789-21976915)
chr8 (32-253)||(23478201-23478422)
chr8 (2-128)||(19278402-19278528)
chr8 (2-128)||(43251674-43251800)
chr8 (1-150)||(14397899-14398040)
chr8 (30-176)||(26453908-26454054)
chr8 (15-128)||(22111792-22111905)
chr8 (30-253)||(19879949-19880172)
chr8 (30-207)||(19929556-19929736)
chr8 (2-128)||(21972704-21972826)
chr8 (4-121)||(23659371-23659488)
chr8 (61-250)||(5760517-5760705)
chr8 (1-112)||(16402039-16402150)
chr8 (102-188)||(22352932-22353019)
chr8 (116-253)||(44384821-44384957)
chr8 (1-93)||(23914029-23914121)
chr8 (30-88)||(8414418-8414476)
chr8 (30-88)||(11775008-11775066)
chr8 (204-251)||(37515487-37515534)
chr8 (206-251)||(16799446-16799491)
chr8 (1-69)||(1327044-1327112)
chr8 (206-250)||(22253280-22253324)
chr8 (206-250)||(28397511-28397555)
chr8 (53-95)||(22381703-22381745)
chr8 (208-250)||(22381849-22381891)
chr8 (206-250)||(5083269-5083313)
chr8 (206-250)||(18833398-18833442)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (1-250)||(21017-21250)
scaffold0096 (206-250)||(20963-21007)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-253)||(169786-170037)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-150)||(20247-20396)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-150)||(31058-31207)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-252)||(15565-15826)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (21-248)||(365-601)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (19-253)||(3382-3625)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-253)||(85367-85629)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-253)||(1911-2172)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-150)||(234-383)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (1-150)||(11619-11768)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-150)||(36204-36353)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-150)||(189495-189644)
scaffold0012 (206-250)||(221322-221366)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-250)||(1329-1577)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-132)||(39205-39336)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-253)||(24634-24883)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (1-150)||(32778-32927)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-150)||(207620-207769)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (1-188)||(313-501)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (19-150)||(71236-71367)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (1-221)||(10121-10350)
scaffold0107 (19-110)||(15469-15560)
scaffold0107 (206-250)||(36141-36185)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-176)||(468-643)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (2-188)||(7731-7917)
scaffold0278 (205-250)||(7615-7660)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-253)||(6939-7190)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (2-128)||(65647-65773)
scaffold0029 (2-150)||(80554-80702)
scaffold0029 (2-128)||(61731-61857)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-150)||(14205-14354)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (78-250)||(13490-13671)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (30-253)||(10342-10564)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-151)||(36060-36208)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-128)||(58837-58964)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (30-207)||(5615-5802)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-253)||(67094-67339)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (26-169)||(1227-1370)
scaffold0017 (26-169)||(7978-8121)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (2-128)||(5220-5346)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (2-128)||(12283-12409)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (30-207)||(33074-33261)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-188)||(49-243)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-128)||(311-437)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (2-127)||(3994-4119)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (30-207)||(22477-22664)
scaffold0046 (206-250)||(17032-17076)
scaffold0046 (209-250)||(26147-26188)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (2-128)||(67421-67546)
[»] scaffold0515 (2 HSPs)
scaffold0515 (30-188)||(4215-4374)
scaffold0515 (206-245)||(4160-4199)
[»] scaffold0306 (3 HSPs)
scaffold0306 (30-188)||(4215-4374)
scaffold0306 (1-176)||(14906-15081)
scaffold0306 (206-245)||(4160-4199)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-112)||(80453-80564)
scaffold0037 (91-150)||(80562-80621)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-99)||(17559-17657)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (30-253)||(70536-70752)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (30-250)||(1314-1535)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (42-207)||(56842-57011)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (42-250)||(15416-15625)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (63-253)||(6851-7040)
scaffold0741 (1-78)||(4306-4383)
[»] scaffold0500 (2 HSPs)
scaffold0500 (44-207)||(7544-7711)
scaffold0500 (206-250)||(7511-7555)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (42-207)||(166426-166595)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (113-226)||(20652-20774)
scaffold0018 (1-66)||(20769-20834)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (72-150)||(6854-6932)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (102-253)||(78236-78386)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-96)||(6196-6291)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (180-253)||(3526-3599)
scaffold0165 (180-253)||(7590-7663)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-87)||(105078-105164)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (141-253)||(7989-8092)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (42-250)||(8851-9051)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (30-88)||(176078-176136)
scaffold0001 (30-88)||(168724-168782)
scaffold0001 (210-250)||(497387-497427)
scaffold0001 (42-92)||(497538-497588)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (141-207)||(10467-10534)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-69)||(36067-36135)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (142-253)||(21784-21894)
scaffold0019 (207-250)||(132878-132921)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-69)||(10888-10956)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (73-184)||(11577-11692)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (206-253)||(2674-2721)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (206-253)||(7765-7812)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (206-253)||(77820-77867)
scaffold0014 (159-207)||(126896-126945)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (208-250)||(1855-1897)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (208-250)||(18285-18327)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (209-253)||(49-93)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (206-242)||(8130-8166)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (206-245)||(5654-5693)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (206-249)||(10125-10168)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (207-250)||(9836-9879)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (206-245)||(720-759)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (206-253)||(362730-362777)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (208-250)||(3218-3260)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (206-250)||(899-943)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (206-250)||(1662-1706)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (30-130)||(1122-1225)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (206-250)||(2917-2961)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (206-250)||(608-652)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19773579 - 19773827
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773579 ttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 19773678  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaagttgtcgttcta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19773679 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgtaggtgttgtctaagttgtaagttatcgttcca 19773778  T
Q  201 aagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19773779 aagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttg 19773827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22806012 - 22805758
Alignment:
Q  5 gatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacat 104  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22806012 gatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcat 22805913  T
Q  105 taatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||     
T  22805912 taatattgttatgttgtgaattgctcgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtca 22805813  T
Q  196 ttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22805812 ttccaaagtatcccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 22805758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23414968 - 23414819
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414968 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 23414869  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414868 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27556726 - 27556577
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556726 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 27556627  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556626 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17743461 - 17743215
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17743461 ttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 17743362  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg-taagttgtcgttc 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |     
T  17743361 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttgcaggt- 17743263  T
Q  199 taaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 248  Q
    |   |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17743262 tgtcg--ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagtt 17743215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15705480 - 15705668
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15705480 ttgagatgtttacttgttttctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttc 15705579  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705580 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15705668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 18917385 - 18917533
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18917385 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 18917484  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917485 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17377834 - 17378085
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |      
T  17377834 ttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgttct 17377933  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  17377934 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 17378033  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17378034 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 17378085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 31477928 - 31478077
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31477928 ttgagatgtttacgtgtcgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 31478027  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478028 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 28103935 - 28104119
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  28103935 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 28104034  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28104035 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagtttcaggtgttggtctaagtt 28104119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16760283 - 16760134
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  16760283 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatacttt 16760184  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760183 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913777
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18913901  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  18913900 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 18913805  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18913804 aagttgttgatgttgtctaagttgttga 18913777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937035
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18937159  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  18937158 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 18937063  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18937062 aagttgttgatgttgtctaagttgttga 18937035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 27415994 - 27416125
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27415994 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 27416093  T
Q  119 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416094 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 18955881 - 18956027
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18955881 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 18955980  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18955981 ataataatattgttatgttgtgaattgcatgcgctgtttctgttgct 18956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1644695 - 1644547
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1644695 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttca 1644596  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644595 taataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22949096 - 22948950
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22949096 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 22948997  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948996 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 22948950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174386
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattact 15174262  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  15174263 tgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 15174358  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15174359 aagttgttgatgttgtctaagttgttga 15174386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11566849 - 11566723
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11566849 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 11566750  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11566749 cattaatattgttatgttgtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19870577 - 19870451
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19870577 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 19870478  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19870477 cattaatattgttatgttgtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22953052 - 22952906
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22953052 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 22952953  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22952952 atattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 22952906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23395055 - 23394929
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23395055 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 23394956  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23394955 cattaatattgttatgttgtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23871540 - 23871394
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23871540 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 23871441  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23871440 atattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23875496 - 23875350
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23875496 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 23875397  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23875396 atattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23875350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15817558 - 15817744
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15817558 ttgagatgtttacgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttt 15817657  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15817658 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15817744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8243848 - 8243722
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8243848 tgagatgtttatgtgtcacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 8243749  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8243748 cattaatattgttatgttgtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23989907 - 23989781
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23989907 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 23989808  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23989807 cattaatattgttatgttgtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14472258 - 14472113
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14472258 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatacttca 14472159  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14472158 taataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 14472113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22862933 - 22862811
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22862933 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 22862834  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22862833 cattaatattgttatgttgtgaa 22862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15875467 - 15875279
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||| |||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  15875467 ttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgataattt 15875368  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15875367 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgcaagtgttggtctatgttgtaa 15875279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 12618963 - 12619087
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12618963 tgagatgtttatgtgtctcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 12619060  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12619061 cattaatattgttatgctgtgaattgc 12619087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 14979427 - 14979543
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  14979427 agatgtttaagtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttca 14979526  T
Q  104 ttaatattgttatgttg 120  Q
    |||||||||||||||||    
T  14979527 ttaatattgttatgttg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 19656076 - 19656297
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  19656076 tgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 19656175  T
Q  128 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtct 224  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  ||| |     ||||||||||||||||||||    
T  19656176 catgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtcaaagttgtaaagttgtaagttgt----cattccaaagtattggagtct 19656271  T
Q  225 taagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||    
T  19656272 taagttgttgatgttgtccaagttgt 19656297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18696553 - 18696480
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18696553 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18706371 - 18706301
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagtt 89  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18706371 gcctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23538798 - 23538745
Alignment:
Q  114 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538798 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17105865 - 17105771
Alignment:
Q  72 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 167  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17105865 atgtatgatgttaaagt-gttgatgtttgtcattattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Original strand, 22376621 - 22376772
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatt--tatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtgaatt 126  Q
    |||||||||| |||||| ||| |  ||||||  ||||||| || |||||||||||| | ||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||| ||    
T  22376621 tgttgttggtaatgtgatatagtaatatatgtattatgtgaaaaatgtatgatgttgaggttgttgttgattaccattgattattgttatgttgtgagtt 22376720  T
Q  127 gctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 176  Q
    ||||  ||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22376721 gcttacgtgctgcctctgctgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttg 22376772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 20078286 - 20078330
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20078286 ttccaaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 20078330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 27573163 - 27573207
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27573163 ttccaaagtatttgagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 27573207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18927778 - 18927731
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  18927778 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtcgttga 18927731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28708529 - 28708482
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28708529 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtataagttgttga 28708482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18453184 - 18453143
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18453184 caaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 18453143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17743203 - 17743159
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  17743203 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 17743159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23538730 - 23538690
Alignment:
Q  210 aaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23538730 aaagtattggagtcttaagtcgtcgatgttgtctaagttgt 23538690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 27573109 - 27573153
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27573109 ttccaaagtattggagtcttaagttattgacgttgtctaagttgt 27573153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 20078134 - 20078181
Alignment:
Q  48 atatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 95  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20078134 atatatatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgat 20078181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23838179 - 23838136
Alignment:
Q  207 tccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23838179 tccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 23838136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 28104140 - 28104187
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  28104140 ttccaaagtatttgagtcttaagttgttaatgttgtctaagtttttga 28104187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2201104 - 2201058
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  2201104 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtttacgttgttg 2201058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Original strand, 18259926 - 18260058
Alignment:
Q  61 ttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||  |||| || |||||||||||||| | ||||  |||| ||| |||| || || ||||||||    
T  18259926 ttatgtggaaaatgtatgatgttcaagttgttgttgattatcattgatcattgttatgttgtg-agtgcttatgtgatgtctctgctgttgctgaatatt 18260024  T
Q  158 gatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagt 190  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18260025 aattaagttgcaagtgttggtctaagttgcaagt 18260058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22420952 - 22420906
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  22420952 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgatgtctacgttgttg 22420906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17105760 - 17105716
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  17105760 ttccaaagtattggagtcttaagtcgtcgatgccgtctaagttgt 17105716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 18896429 - 18896473
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18896429 ttccaaaatattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 18896473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 126039 - 125781
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  126039 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 125940  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  125939 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 125840  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  125839 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 125781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 38267 - 38311
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38267 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 38311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 125795 - 125760
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  125795 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 125760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 125771 - 125735
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  125771 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtc 125735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 675
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 ttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 837  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  836 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 737  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  736 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtcttagttgttga 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16796569 - 16796326
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796569 ttgaaatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 16796470  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  16796469 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtcg---- 16796374  T
Q  200 aaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16796373 ------ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 16796326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18700344 - 18700602
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18700344 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttc 18700443  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||    
T  18700444 tcattaatattgttatgttgtgaattgctagtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagtt 18700543  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18700544 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 18700602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 324318 - 324070
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  324318 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 324219  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  324218 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 324119  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  324118 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaagttgt 324070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 52989759 - 52990010
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  52989759 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 52989858  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  52989859 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 52989958  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52989959 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 52990010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 17691746 - 17692006
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |      
T  17691746 tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcattt 17691845  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttg 192  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||    
T  17691846 cgttaatattgttatgtgttgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttg 17691945  T
Q  193 tcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17691946 tctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 17692006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 43889663 - 43889911
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43889663 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctc 43889762  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||    
T  43889763 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaaattgtaagtt 43889862  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43889863 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttatctaagttgt 43889911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12339789 - 12339640
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339789 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 12339690  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339689 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14966252 - 14966001
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      
T  14966252 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgctct 14966153  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgtcgttc 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |     
T  14966152 tcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 14966053  T
Q  199 taaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||     |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  14966052 ta---ctttccaaagtattggagtcttaagttgtcaatgttgtctaagttgttga 14966001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12469984 - 12469736
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12469984 ttgagatgttcacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttc 12469885  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  12469884 tcattaatattgttatgttgtgaattggttgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 12469785  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
     |      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12469784 gt----cgttcaaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 12469736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 4588891 - 4589040
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4588891 ttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttc 4588990  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588991 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5223387 - 5223238
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223387 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 5223288  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5223287 acattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11300548 - 11300697
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11300548 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 11300647  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300648 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 37439754 - 37439903
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37439754 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 37439853  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37439854 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21837508 - 21837247
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21837508 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttt 21837409  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||        ||||||||||||    
T  21837408 tcatgaatattattatgttgtgaatgacttgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgttgatgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 21837309  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  21837308 gtctttccaaaatgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatattatctaagttgttga 21837247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 11914053 - 11914301
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||      
T  11914053 ttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctct 11914152  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  11914153 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 11914252  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11914253 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgt 11914301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961819
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgct 35961695  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  35961696 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 35961791  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35961792 aagttgttgatgttgtctaagttgttga 35961819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 54876450 - 54876688
Alignment:
Q  24 tgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtga 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| |    
T  54876450 tgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaa 54876549  T
Q  124 attgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  54876550 attgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaaat 54876649  T
Q  215 attggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  54876650 attgaagtcttaagttgttaatgttgtctgagttgttga 54876688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15964960 - 15964814
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15964960 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 15964861  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964860 atattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15964814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15968884 - 15968738
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15968884 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 15968785  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968784 atattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15972808 - 15972662
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15972808 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 15972709  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972708 atattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19775756 - 19775607
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19775756 ttgagatgtttacatgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 19775657  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19775656 atattaatattgctatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 4111368 - 4111494
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4111368 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 4111467  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4111468 cattaatattgttatgttgtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7109688 - 7109562
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7109688 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 7109589  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7109588 cattaatattgttatgttgtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7113623 - 7113497
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7113623 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 7113524  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7113523 cattaatattgttatgttgtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 11165648 - 11165774
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11165648 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 11165747  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11165748 cattaatattgttatgttgtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321528
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22321654 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 22321555  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22321554 cattaatattgttatgttgtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22336709 - 22336583
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22336709 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 22336610  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22336609 cattaatattgttatgttgtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 27409763 - 27409889
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27409763 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 27409862  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27409863 cattaatattgttatgttgtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28949714 - 28949588
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28949714 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 28949615  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28949614 cattaatattgttatgttgtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 55022857 - 55022731
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55022857 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 55022758  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  55022757 cattaatattgttatgttgtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11854724 - 11854575
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11854724 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcc 11854625  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11854624 gtattaatattgttatgttgtgaattgcttgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 4107516 - 4107642
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4107516 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttca 4107615  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4107616 cattaatattgttatgttgtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11070058 - 11069932
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11070058 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 11069959  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11069958 cattaatattgttatgttgtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 30065936 - 30065811
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30065936 tgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 30065837  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30065836 cattaatattgttatgttgtgaattg 30065811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15617364 - 15617239
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15617364 tgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 15617265  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15617264 cattaatattgttatgttgtgaattg 15617239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652036
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgct 22652076  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 169  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22652075 tgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14499315 - 14499189
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14499315 tgagatgtttatgtgtcgccaatgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttca 14499216  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14499215 cattaatattgttatgttgtgaattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15465158 - 15465068
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15465158 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16643252 - 16643135
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    ||||||||| |||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  16643252 agatgtttatgtgatgtctaagttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttca 16643153  T
Q  104 ttaatattgttatgttgt 121  Q
     |||||||||||||||||    
T  16643152 gtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17046339 - 17046206
Alignment:
Q  56 atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaata 155  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17046339 atgcattatgtggaatatatatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaata 17046240  T
Q  156 ttgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046239 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17046206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14671006 - 14670914
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14671006 ttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16979207 - 16979092
Alignment:
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||    
T  16979207 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagtt 16979108  T
Q  192 gtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16979107 gtcgttccaaagtatt 16979092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 167
Target Start/End: Original strand, 14569023 - 14569163
Alignment:
Q  27 tgctgttgttggttatg-tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  14569023 tgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaaga-gttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaat 14569121  T
Q  126 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 167  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569122 tacttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14682505 - 14682413
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  14682505 ttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Original strand, 17685744 - 17685817
Alignment:
Q  180 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  17685744 aagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttatctaagttgttga 17685817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527737
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 36527737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24513891 - 24513773
Alignment:
Q  134 ctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaa-gttgtc-gttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtg 230  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| |      ||||||||||||||||||||||||     
T  24513891 ctgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaaagttgtaagttgtct----ttccaaagtattggagtcttaagtt 24513796  T
Q  231 gttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  24513795 gttaatgttgtctaagttgttga 24513773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 13026420 - 13026521
Alignment:
Q  56 atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaata 155  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  13026420 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgatta 13026519  T
Q  156 tt 157  Q
    ||    
T  13026520 tt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 13030012 - 13030113
Alignment:
Q  56 atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaata 155  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  13030012 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgatta 13030111  T
Q  156 tt 157  Q
    ||    
T  13030112 tt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 24178763 - 24178810
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24178763 ttccaaagtattggagtcttaaggtgttgatgttgtctaagttgttga 24178810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9577630 - 9577586
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9577630 ttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 9577586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 10542508 - 10542552
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10542508 ttccaaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 10542552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 3265075 - 3265142
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3265075 tgttgttgttgcatattgatcaattcgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 3265142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5841836 - 5841789
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5841836 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtataagttgttga 5841789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22652023 - 22651976
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  22652023 ttccaaagtattggagtcttaaattgttaatgttgtctaagttgttga 22651976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15265145 - 15265100
Alignment:
Q  205 attccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  15265145 attccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 15265100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15465076 - 15465039
Alignment:
Q  113 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15465076 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 15465039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 251
Target Start/End: Original strand, 32403075 - 32403120
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32403075 ttccaaagtgttggattcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 32403120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15246023 - 15245979
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  15246023 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 15245979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 324060 - 324017
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  324060 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttg 324017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 324084 - 324049
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  324084 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 324049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 207
Target Start/End: Original strand, 18700588 - 18700623
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18700588 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18700623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6808122 - 6808076
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  6808122 ttccaaagtattgaagtcttaagttgttaatgttgtctacgttgttg 6808076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 253
Target Start/End: Original strand, 45220417 - 45220455
Alignment:
Q  215 attggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45220417 attggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 45220455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 251
Target Start/End: Original strand, 23318829 - 23318874
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23318829 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagatgtt 23318874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Original strand, 10542562 - 10542598
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10542562 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtc 10542598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 238
Target Start/End: Original strand, 10834219 - 10834251
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10834219 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgt 10834251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15206941 - 15206897
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  15206941 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgattttgtctaagttgt 15206897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16979254 - 16979218
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 66  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16979254 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Original strand, 43889921 - 43889957
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43889921 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtc 43889957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 120092 - 119842
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  120092 ttgagatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 119993  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtcta--------agttgtaagtt 191  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||    
T  119992 tcattaatattattatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtatagttgtaagtt 119893  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtc 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  119892 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc 119842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 117236 - 117192
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  117236 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctatgttgt 117192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 117182 - 117138
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  117182 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 117138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 119837 - 119802
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtcta 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  119837 caaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtcta 119802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48603536 - 48603275
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603536 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 48603437  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagtt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||    
T  48603436 acattaatattgttatgatggaaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgttaagttgtaagtt 48603337  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48603336 gtcgttccaaagtattcaaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 48603275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51326876 - 51326614
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  51326876 ttgagatgtttaggtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 51326777  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |        ||||||||||||    
T  51326776 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtataagttgtaaagttgtaagtt 51326677  T
Q  192 gtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  51326676 gtctttccaaagtgtttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 51326614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 27653259 - 27653520
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27653259 ttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttt 27653358  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||        ||||||||||||    
T  27653359 tcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagatgcagatgttggtctaagttataaagttgtaagtt 27653458  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  27653459 gtctttccaaagtgtttcaaagtattggagtcttaagttgataatgttgtctaagttgttga 27653520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1925247 - 1925396
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1925247 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 1925346  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925347 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 20924261 - 20924410
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20924261 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 20924360  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924361 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48520576 - 48520347
Alignment:
Q  20 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48520576 cctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgtt 48520477  T
Q  120 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttg-tcgttctaaagtattccaaagtat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||| |      |||||||||||    
T  48520476 gtgaattgcttgtgctgtttctattgccgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaaagttgcaagttgt----cgttccaaagtat 48520381  T
Q  217 tggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48520380 tggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 48520347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12271638 - 12271387
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12271638 ttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 12271539  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  12271538 tcattaattttgttatgctgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 12271439  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12271438 gt----ctttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 12271387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 22130961 - 22131193
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg-tttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||            | |||    
T  22130961 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttc------------tcatg 22131048  T
Q  118 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22131049 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttctcgttccaaagtattc 22131148  T
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22131149 caaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 22131193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 20228928 - 20229076
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20228928 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttca 20229027  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229028 taataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764569
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgct 29764445  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  29764446 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 29764541  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29764542 aagttgttgatgttgtctaagttgttga 29764569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000595
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgct 50000718  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctta 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||| |      |||||||||||||||||||||    
T  50000717 tgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaaagttgtaagttgt----ctttccaaagtattggagtctta 50000622  T
Q  227 agtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  50000621 agttgttaatgttgtctaagttgttga 50000595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198590
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 46198532  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 186  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46198533 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 46198590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33797584 - 33797456
Alignment:
Q  22 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33797584 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgt 33797485  T
Q  122 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797484 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21407342 - 21407216
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21407342 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 21407243  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21407242 cattaatattgttatgttgtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1010710 - 1010584
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1010710 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 1010611  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1010610 cattaatattgttatgttgtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 16375578 - 16375704
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16375578 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 16375677  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16375678 cattaatattgttatgttgtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52639528 - 52639402
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  52639528 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttca 52639429  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52639428 cattaatattgttatgttgtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 13881421 - 13881541
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  13881421 agatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttca 13881520  T
Q  104 ttaatattgttatgttgtgaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13881521 ttaatattgttatgttgtgaa 13881541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20316619 - 20316532
Alignment:
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20316619 cattgatattgacatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgtaa 20316532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 41781625 - 41781718
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg-aagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  41781625 ttgaaatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Original strand, 636090 - 636163
Alignment:
Q  180 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  636090 aagttgtaagttgtctttctaaagtattccaaagtattggattcttaagttcttgatgttgtctaagttcttga 636163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43543212 - 43543144
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 69  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43543212 ttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 43543144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 23819416 - 23819457
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819416 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 23819457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 11809492 - 11809539
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11809492 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 11809539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23073042 - 23072995
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23073042 ttccaaagtattggagacttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 23072995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 25263084 - 25263131
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25263084 ttccaaagtattggagtcttaagttgtttatgttgtctaagttgttga 25263131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14800534 - 14800490
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14800534 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 14800490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14809408 - 14809364
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14809408 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 14809364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20958113 - 20958069
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20958113 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 20958069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 21043397 - 21043441
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21043397 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 21043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 43630375 - 43630422
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  43630375 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttttctaagttgttga 43630422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23967719 - 23967675
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  23967719 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 23967675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28312519 - 28312475
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  28312519 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 28312475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47190606 - 47190566
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47190606 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttatctaag 47190566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48520337 - 48520293
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  48520337 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 48520293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20316460 - 20316416
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  20316460 ttccaaagtattagagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 20316416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16579842 - 16579584
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16579842 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttc 16579743  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  16579742 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 16579643  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16579642 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 16579584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16585821 - 16586079
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16585821 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttc 16585920  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  16585921 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 16586020  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16586021 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 16586079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14258534 - 14258277
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14258534 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttc 14258435  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  14258434 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 14258335  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttg 249  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14258334 gtcattccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttg 14258277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16460802 - 16461060
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460802 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 16460901  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||    
T  16460902 tcatcaatattgttatgttgtgaattgcttttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagtt 16461001  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16461002 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 16461060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15720079 - 15719818
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15720079 ttgagatgtttacgtgctgcatatgtttctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 15719980  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  15719979 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgatgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 15719880  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15719879 gtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagttgttgatgttgtctaagttgttga 15719818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16998676 - 16998415
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  16998676 ttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttt 16998577  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  16998576 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 16998477  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16998476 gtatttccaaagtgttccaaagtattggagccttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 16998415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 46580712 - 46580963
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  46580712 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 46580811  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  46580812 tcattaatattgttatgctgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 46580911  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46580912 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 46580963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32301371 - 32301123
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  32301371 ttgagatgtttacgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttt 32301272  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt-gttgtctaagttgt-aagttg-tcgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||   |||    
T  32301271 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtggtggtctaagttgtaaagttgcaagtt 32301172  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32301171 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaagttgt 32301123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8940333 - 8940083
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  8940333 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 8940234  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  8940233 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 8940134  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
     |      ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  8940133 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttattaatgttgtctacgttgttg 8940083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 13918562 - 13918711
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918562 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 13918661  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918662 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 25927285 - 25927434
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927285 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 25927384  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25927385 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1858868 - 1859017
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858868 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 1858967  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858968 acattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14273598 - 14273337
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
T  14273598 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttt 14273499  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||||||||||||||||||| ||||   |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||    
T  14273498 tcattaatattgttatgttgcgaatattttgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagtt 14273399  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  14273398 gtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtttaagttgttga 14273337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15113027 - 15112776
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15113027 ttgagatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 15112928  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  15112927 tcattaatattgttatgttgtgaatttcttgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 15112828  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15112827 gt----ctttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 15112776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8468801 - 8468539
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  8468801 ttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgcttt 8468702  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  8468701 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 8468602  T
Q  192 gtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8468601 gtctttccaaagtgtttccaaaatattggagtattaagttgttaatgttgtctaagttgttga 8468539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16324134 - 16323886
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      
T  16324134 ttgagatgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatgtttaagttgttgatgctct 16324036  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttg-tcgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||    
T  16324035 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtctaagttgtaaagttgttagtt 16323936  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
     |      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16323935 gt----ctttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaagttgtt 16323886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39722253 - 39722105
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39722253 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 39722154  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39722153 taataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 45170124 - 45170270
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45170124 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 45170223  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45170224 atattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgct 45170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18283354 - 18283227
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18283354 ttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttc 18283255  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283254 acattaatattgttatgttgtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33094 - 32968
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33094 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 32995  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32994 cattaatattgttatgttgtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 2530191 - 2530320
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530191 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 2530289  T
Q  119 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530290 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 2530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 12704778 - 12704904
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12704778 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 12704877  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12704878 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12714851 - 12714725
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12714851 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 12714752  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12714751 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12718655 - 12718529
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12718655 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 12718556  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12718555 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 16907320 - 16907446
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16907320 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 16907419  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16907420 cattaatattgttatgttgtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550935
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16550811  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |     |||||||||||||||||||||    
T  16550812 tgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cattccaaagtattggagtctt 16550907  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16550908 aaggtgttgatgttgtctaagttgttga 16550935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18279391 - 18279264
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18279391 ttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttc 18279292  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18279291 acattaatattgttatgttttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12723566 - 12723440
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12723566 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttca 12723467  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12723466 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 70884 - 71009
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  70884 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttca 70983  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  70984 cattaatattgttatgttgtgaattg 71009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 74993 - 75118
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  74993 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttca 75092  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  75093 cattaatattgttatgttgtgaattg 75118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161068
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32161008  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32161009 tgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 32161068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232740
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagt-attccaaagtattgg 219  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattgg 17232774  T
Q  220 agtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17232773 agtattaagttgttaatgttgtctaagttgttga 17232740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16114228 - 16114102
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16114228 tgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 16114129  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16114128 cattaatattgttatgttgtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16117381 - 16117255
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16117381 tgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 16117282  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16117281 cattaatattgttatgttgtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26292382 - 26292256
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26292382 tgagatgtttatgtgtcgtcaatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 26292283  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26292282 cattaatattgttatgttgtgaattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15116564 - 15116352
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  15116564 ttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttacgttgttgatgtttt 15116465  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct-----aagttgtaagttgtc 194  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||     |||||||||||||||    
T  15116464 tcattaatattgttattttgtgaatttcttgtattgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaagtgttggtctttgtaaagttgtaagttgtc 15116365  T
Q  195 gttctaaagtatt 207  Q
     ||| ||||||||    
T  15116364 tttccaaagtatt 15116352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17060461 - 17060635
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17060461 ttgagatgtttatgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 17060560  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 176  Q
     ||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  17060561 tcattaatgttggtct-ttgtgaattgcttgtactgtttctattgctgttgaatattgatcaaattacaagtgttg 17060635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 14981543 - 14981723
Alignment:
Q  72 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14981543 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 14981642  T
Q  172 tgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||| |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14981643 tgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 14981723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084035
Alignment:
Q  45 gaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 15084041  T
Q  145 gctgtt 150  Q
    ||||||    
T  15084040 gctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614727
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16614851  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgc--aggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtc 223  Q
    |||| ||||||| ||| |||| ||||   ||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||||  ||| |     |||||||||||||||||||    
T  16614850 tgtgttgtttctattgatgttaaata--aatcaagttgcgaagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cattccaaagtattggagtc 16614757  T
Q  224 ttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16614756 ttaaggtgttgatgttgtctaagttgttga 16614727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Original strand, 1490146 - 1490348
Alignment:
Q  56 atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaata 155  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  1490146 atgcattatgtggaatatatatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaata 1490245  T
Q  156 ttgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaag 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1490246 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaag 1490345  T
Q  247 ttg 249  Q
    |||    
T  1490346 ttg 1490348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 188
Target Start/End: Original strand, 15411019 - 15411136
Alignment:
Q  72 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15411019 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcagg 15411118  T
Q  172 tgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15411119 tgttggtctaagttgtaa 15411136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20487625 - 20487533
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20487625 ttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11092731 - 11092679
Alignment:
Q  201 aagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11092731 aagttttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 11092679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 14270063 - 14270131
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 69  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14270063 ttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatgttcatatgctttatgtgga 14270131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 10501483 - 10501550
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10501483 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctgagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 11392123 - 11392170
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11392123 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 11392170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 14157164 - 14157231
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14157164 tgttgctgttgcatattgatcaagttccaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttgcaaagtatt 14157231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16185984 - 16185913
Alignment:
Q  180 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16185984 aagttgtaagttatctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagttgtt-atgctgtctaagttgttg 16185913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11084984 - 11084937
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  11084984 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtttttga 11084937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38519377 - 38519335
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38519377 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagtt 38519335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 9033462 - 9033507
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaag-tggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9033462 ttccaaagtattggagtcttaagttgtttgatgttgtctaagttgt 9033507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11661277 - 11661233
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  11661277 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 11661233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32301113 - 32301077
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32301113 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc 32301077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15116363 - 15116316
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  15116363 ttccaaagtattggaatcttaagttgttaatattgtctaagttgttga 15116316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 207
Target Start/End: Original strand, 16461046 - 16461081
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16461046 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Original strand, 16461070 - 16461109
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16461070 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaa 16461109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 32161084 - 32161131
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  32161084 ttctaaagtattggagtcttaagttgttaatgttatctaagttgttga 32161131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32301137 - 32301102
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301137 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 32301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 130933 - 130977
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  130933 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 130977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14421955 - 14421911
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  14421955 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgaccaagttgt 14421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16579598 - 16579566
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579598 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 204
Target Start/End: Original strand, 16586065 - 16586097
Alignment:
Q  172 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586065 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16586097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42461954 - 42461910
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  42461954 ttccaatgtattggagtcttaagttgttgatgttatccaagttgt 42461910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17048171 - 17048422
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048171 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 17048270  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  17048271 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 17048370  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17048371 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 17048422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 13591963 - 13592213
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13591963 ttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgatgatgcttt 13592061  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta-agttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
T  13592062 tcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgaaggtgttggtctaagttgtagagttgtaagtt 13592161  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13592162 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 13592213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 14746620 - 14746869
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  14746620 ttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 14746719  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  14746720 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 14746819  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14746820 tt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgtt 14746869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10712844 - 10712695
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10712844 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 10712745  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712744 atattaatattgttgtgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10926614 - 10926465
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10926614 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 10926515  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926514 atattaatattgttgtgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12487699 - 12487550
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12487699 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttc 12487600  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487599 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 14954285 - 14954431
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14954285 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 14954384  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954385 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 14954431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27534014 - 27533868
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27534014 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 27533915  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27533914 ataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 27533868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 15497072 - 15497324
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15497072 ttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 15497171  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgt 196  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||    
T  15497172 tcattaatattgttatgttgagaattgattgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagt 15497271  T
Q  197 tctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    | |      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15497272 ttt----ccttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaaattgttga 15497324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619661
Alignment:
Q  32 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  132 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaag 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtcg----------ttccaaagtattggagtcttaag 40619683  T
Q  229 tggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  40619682 ttgttgatgttgtctaagttgt 40619661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 43256213 - 43256344
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43256213 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgt 43256312  T
Q  119 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256313 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25689858 - 25689712
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25689858 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 25689759  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689758 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 25689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9556517 - 9556391
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9556517 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 9556418  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9556417 cattaatattgttatgttgtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695177
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10695054  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt--aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  10695055 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtccaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 10695150  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10695151 aagt-tttgatgttgtctaagttgttga 10695177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908943
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10908820  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt--aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  10908821 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtccaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 10908916  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10908917 aagt-tttgatgttgtctaagttgttga 10908943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 14757541 - 14757667
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14757541 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 14757640  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14757641 cattaatattgttatgttgtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008163
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 15008210  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008209 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15008163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 4561453 - 4561576
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4561453 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 4561552  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaat 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  4561553 cattaataatgttatgttgtgaat 4561576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 5757057 - 5757183
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5757057 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttca 5757156  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5757157 cattaatattgttatgttgtggattgc 5757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884346
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgct 15884222  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt----------tgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattgg 219  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||| |||||||||||          ||||||| ||||||    
T  15884223 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagatgtctaagtcgtaagttgtcg----------ttccaaattattgg 15884312  T
Q  220 agtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15884313 aatcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 15884346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17810259 - 17810134
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17810259 tgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 17810160  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17810159 cattaatattgttatgttgtgaattg 17810134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19857605 - 19857416
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||     
T  19857605 ttgaggtgtttaagtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggagaatatatgatatttaagttgttgatgtttt 19857506  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaag 189  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  19857505 tcattaatattgtcatgttgtgaattacttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgcaggtgttggtttaagttgtaag 19857416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 53631320 - 53631541
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  53631320 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 53631419  T
Q  128 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| |     ||||||||||||||||||||    
T  53631420 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt----cattccaaagtattggagtct 53631515  T
Q  225 taagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||    
T  53631516 taagttgttgatgttgtccaagttgt 53631541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33742365 - 33742241
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33742365 tgagatgtttatgtgtctcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 33742268  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33742267 cattaatattgttatgctgtgaattgc 33742241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650697
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 14650767  T
Q  140 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14650766 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 14650697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26013496 - 26013314
Alignment:
Q  72 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct--gttgaatattgatcaagttgca 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26013496 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttgca 26013397  T
Q  170 ggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    | |||| || |||||||| |||||||  ||| |      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26013396 gatgttggtttaagttgtaaagttgtaagttgt----ctttccaaagtattggattcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 26013314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 10056722 - 10056653
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa 70  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056722 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa 10056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14185040 - 14184973
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  14185040 tgttgctgttgtatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaagttatctttccaaagtatt 14184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 247
Target Start/End: Original strand, 13592219 - 13592260
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13592219 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagt 13592260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15990355 - 15990254
Alignment:
Q  56 atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaata 155  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  15990355 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgatta 15990256  T
Q  156 tt 157  Q
    ||    
T  15990255 tt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 52873179 - 52873240
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 62  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  52873179 ttgaggtgtttaagtgttggctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcctt 52873240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9923251 - 9923204
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  9923251 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtcgttga 9923204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15791776 - 15791739
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15791776 caaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaag 15791739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 24047415 - 24047459
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  24047415 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 24047459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 253
Target Start/End: Original strand, 11479612 - 11479655
Alignment:
Q  210 aaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  11479612 aaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtcgttga 11479655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 26045409 - 26045453
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  26045409 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 26045453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 26050590 - 26050634
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  26050590 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 26050634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23069320 - 23069557
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069320 ttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 23069419  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| |    
T  23069420 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagct 23069519  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069520 gtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 23069557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 23707325 - 23707576
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  23707325 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 23707424  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  23707425 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 23707524  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23707525 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 23707576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24918194 - 24917943
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  24918194 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 24918095  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  24918094 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 24917995  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  24917994 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaattttgtctaagttgttga 24917943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27472503 - 27472252
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  27472503 ttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 27472404  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  27472403 tcattaatattattatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 27472304  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27472303 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 27472252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 34874249 - 34874500
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||      
T  34874249 ttgagatgtttaagtgccgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 34874348  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  34874349 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 34874448  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34874449 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 34874500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18358770 - 18359007
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18358770 ttgagatgtttaagtaccgcctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttt 18358869  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgtcgttc 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  18358870 tcattaatattattatgttgtgaatttcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaaagttgtctttc 18358969  T
Q  199 taaagt-attccaaagtattggagtcttaagtggttga 235  Q
     |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18358970 caaagtgtttccgaagtattggagtcttaagttgttga 18359007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24671079 - 24670828
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  24671079 ttgagatgtttacgtactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 24670980  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  24670979 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 24670880  T
Q  198 ctaaagtattcca-aagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
         || || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24670879 -----gtctttcacaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 24670828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24681498 - 24681249
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  24681498 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcg 24681399  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttg-tcgtt 197  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||    
T  24681398 tcattagtattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttg--tattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgcaagtt 24681301  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24681300 tt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 24681249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 30345109 - 30345258
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30345109 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 30345208  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345209 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31345200 - 31345051
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31345200 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttc 31345101  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31345100 acactaatattgttatgttgtgaattacttgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 22459602 - 22459850
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  22459602 agatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttca 22459701  T
Q  104 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttcta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |     
T  22459702 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt- 22459800  T
Q  201 aagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
         ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22459801 ---ctttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaaattgttga 22459850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1283377 - 1283228
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1283377 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 1283278  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1283277 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 21081776 - 21081961
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||   ||    
T  21081776 agatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttca 21081875  T
Q  104 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21081876 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21081961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 41531122 - 41531271
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41531122 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 41531221  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41531222 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 24628598 - 24628724
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24628598 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 24628697  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24628698 cattaatattgttatgttgtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27601783 - 27601657
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27601783 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 27601684  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27601683 cattaatattgttatgttgtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 12901631 - 12901757
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12901631 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 12901730  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12901731 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 27379552 - 27379678
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27379552 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 27379651  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27379652 cattaatattgttatgttgcgaattgc 27379678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 27383598 - 27383724
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27383598 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 27383697  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27383698 cattaatattgttatgttgcgaattgc 27383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914743
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgct 21914867  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  21914866 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 21914771  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||    
T  21914770 aagttgctaatgttgtctaagttgttga 21914743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492423
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt----------gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattgg 219  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgtaagttgtcg----------ttccaaagtattgg 34492389  T
Q  220 agtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34492390 agtcttaagttgttgatgttgtataagttgttga 34492423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24649344 - 24649218
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24649344 tgagatgtttatgtgtcgcctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttca 24649245  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24649244 cattaatattgttatgttgtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 10101764 - 10101889
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10101764 tgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttca 10101863  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10101864 cattaatattgttatgttgtgaattg 10101889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 24316193 - 24316382
Alignment:
Q  72 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24316193 atgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 24316291  T
Q  172 tgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  24316292 tgttggtctaagttacaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaaattgttaatgttgtctaagttgttga 24316382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9784765 - 9784673
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  9784765 ttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 20320723 - 20320823
Alignment:
Q  89 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 187  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20320723 tgttgatgcttttcattaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgta 20320822  T
Q  188 a 188  Q
    |    
T  20320823 a 20320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828153
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc--ttgtgctgttt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||  |||| |||| |||||| |||||||| |   |||| ||  |    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaattacctatgtgttgcct 39828051  T
Q  140 ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgt 238  Q
     ||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||  || |||| || ||| |||||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39828052 atgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgaaagatgtcg----------ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgt 39828141  T
Q  239 tgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||    
T  39828142 tgtctaagttgt 39828153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 13101762 - 13101809
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13101762 ttccaaagtattggagtcttaaatggttgatgttgtctaagttgttga 13101809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34136945 - 34136901
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34136945 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 34136901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 253
Target Start/End: Original strand, 27485341 - 27485420
Alignment:
Q  176 gtctaagttgtaa-gttgtcgttctaaagtattc-caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27485341 gtctaagttgtaaagttgtctttccaaagtgttttcaaagtattggggtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 27485420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 21073608 - 21073652
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  21073608 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 21073652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9241931 - 9241888
Alignment:
Q  207 tccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  9241931 tccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 9241888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Original strand, 43947481 - 43947524
Alignment:
Q  207 tccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  43947481 tccaaagtattggagtcataagttgatgatgttgtctaagttgt 43947524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 22252604 - 22252648
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22252604 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 22252648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22107471 - 22107722
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107471 ttgagatgtttaggtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 22107570  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  22107571 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 22107670  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22107671 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagtttttga 22107722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18356280 - 18356131
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18356280 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttc 18356181  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18356180 acattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 20910953 - 20911102
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910953 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 20911052  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20911053 acattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6765912 - 6765724
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  6765912 ttgagatgtttaagtgccgcctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 6765813  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  6765812 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcatgtgttggtctaagttgtaa 6765724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 33895682 - 33895870
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  33895682 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 33895781  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33895782 tcattaatattgttatgttgtgaactgcttgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaagttgtaa 33895870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010846
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17010970  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgtcgttctaaagt----attccaaagtattggagt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||       ||||     |||||||||||||||||    
T  17010969 tgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-------aagttgccgttccaaagtattggagt 17010877  T
Q  223 cttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17010876 cttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 17010846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 40723705 - 40723854
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40723705 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 40723804  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40723805 ataatagtattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20295834 - 20295708
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20295834 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 20295735  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20295734 cattaatattgttatgttgtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10753352 - 10753203
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10753352 ttgagatgtttacatgttgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 10753253  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10753252 atattaatattgctatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29448069 - 29447838
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttg-ttgatgcttcacattaatattgttatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  29448069 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaa-atgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatg 29447971  T
Q  118 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagt 214  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |      |||||||||    
T  29447970 ttgtgaattgcttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt----ctttccaaagt 29447875  T
Q  215 attggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29447874 attggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 29447838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 15236954 - 15237080
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15236954 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 15237053  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15237054 cattaatattgttatgttgtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 19472839 - 19472965
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19472839 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 19472938  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19472939 cattaatattgttatgttgtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263042
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 263102  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaa 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  263101 tgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgtaa 263042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18356381 - 18356308
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18356381 gcctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 20910854 - 20910925
Alignment:
Q  21 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20910854 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11220634 - 11220587
Alignment:
Q  103 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220634 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11225220 - 11225173
Alignment:
Q  103 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11225220 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11229043 - 11228996
Alignment:
Q  103 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11229043 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11231032 - 11230985
Alignment:
Q  103 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11231032 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19076389 - 19076342
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19076389 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtttaagttgttga 19076342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 41861578 - 41861625
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41861578 ttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 41861625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23469808 - 23469766
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23469808 ttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaagtt 23469766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11227053 - 11227008
Alignment:
Q  103 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  11227053 attaatattgttatgttgtgaatttcatgtgctgtatctgttgctg 11227008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 263026 - 262980
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  263026 ttccaaagtattggagtcttaagttgtt-aagttgtctaagttgttga 262980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24212350 - 24212307
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  24212350 caaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctacgttgttg 24212307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35852605 - 35852562
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  35852605 caaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctacgttgttg 35852562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 33895886 - 33895929
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  33895886 ttccaaagtattggagtcttaagttg-tgatgttgtccaagttgt 33895929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 2751 - 3011
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||      
T  2751 tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgctttt 2850  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  2851 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttg 2950  T
Q  193 tcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2951 tctttccaaagtgttccaaagtattggattcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 3011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 53875 - 54126
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  53875 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 53974  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  53975 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 54074  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  54075 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 54126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 6978 - 7229
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6978 ttgagatgtttacgtgctgactatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 7077  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  7078 tcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 7177  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7178 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 17461092 - 17461349
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  17461092 agatgtttatgtgtttcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttca 17461191  T
Q  104 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||    
T  17461192 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtc 17461291  T
Q  195 gttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  17461292 tttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgatgtctaagttgttg 17461349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22238056 - 22238306
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  22238056 ttgagatgtttacgtgtttcttatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatcctct 22238154  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  22238155 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 22238254  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22238255 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 22238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37515789 - 37515538
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  37515789 ttgatatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttt 37515690  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta-agttg-tcgtt 197  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  37515689 tcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtagagttgcaagtt 37515590  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37515589 gt----cgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaagttgttga 37515538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23409879 - 23409628
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |      
T  23409879 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttct 23409780  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  23409779 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 23409680  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23409679 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 23409628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21410938 - 21410789
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21410938 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 21410839  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410838 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21805430 - 21805281
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21805430 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 21805331  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805330 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 21828132 - 21828281
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21828132 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 21828231  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828232 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18833645 - 18833458
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||     
T  18833645 tgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttct 18833546  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18833545 cattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagttgtaggagttggtctaagttgtaa 18833458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 18862763 - 18862909
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18862763 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 18862862  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862863 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 18862909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 19808399 - 19808587
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  19808399 ttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 19808498  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19808499 tcattaatatttttatgttgtgaattgcttgtaatggttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 19808587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 21976789 - 21976915
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21976789 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 21976888  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21976889 cattaatattgttatgttgtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478201
Alignment:
Q  32 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  132 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaa 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||  |||||| |  ||| |      ||||||||||||||||||||||    
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttggtttaagttgtctaagttataagttgt----cgttccaaagtattggagtcttaa 23478227  T
Q  228 gtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  23478226 gttgttgatgttgtctaagttgttga 23478201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 19278402 - 19278528
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19278402 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 19278501  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19278502 cattaatattgttatgttctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 43251800 - 43251674
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251800 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 43251701  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43251700 cattaatattgttatgttgtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 14397899 - 14398040
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14397899 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc--------gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttc 14397990  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14397991 acattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453908
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 26453955  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 176  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26453954 tgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttg 26453908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22111905 - 22111792
Alignment:
Q  15 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111905 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 22111806  T
Q  115 atgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||    
T  22111805 atgttgtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19879949
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgct 19880073  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt----------gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattgg 219  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||          |||| |||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  19880072 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttggtttaagtggtctgagttgtaagttgtcg----------ttccaaagtattgg 19879983  T
Q  220 agtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19879982 agtcttaagttgttgatgttgccaaagttgttga 19879949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929736
Alignment:
Q  30 tgttgttggttat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgc 19929655  T
Q  129 ttgtgctg-tttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19929656 ttgtgctgttttatgttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatatt 19929736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 21972704 - 21972826
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||    
T  21972704 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgcttca 21972799  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21972800 cataaatattgttatgttgtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23659488 - 23659371
Alignment:
Q  4 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcaca 103  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  23659488 agatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttca 23659389  T
Q  104 ttaatattgttatgttgt 121  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23659388 ttaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5760705 - 5760517
Alignment:
Q  61 ttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760705 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaatattgat 5760606  T
Q  161 caagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5760605 caagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt----cattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 5760517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 16402039 - 16402150
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  16402039 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatactct 16402138  T
Q  101 acattaatattg 112  Q
     |||||||||||    
T  16402139 tcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22353019 - 22352932
Alignment:
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22353019 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22352932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 253
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384957
Alignment:
Q  116 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgtcgttctaaagt-attccaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||    ||  |||||||    
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtc----gtcgttccaaa 44384916  T
Q  213 gtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44384917 gtattggagtcttaagctgttgatgttgtctaagttgttga 44384957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23914121 - 23914029
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 93  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23914121 ttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37515534 - 37515487
Alignment:
Q  204 tattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37515534 tattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 37515487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16799491 - 16799446
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16799491 ttccaaagtatttgagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 16799446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 1327044 - 1327112
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 69  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1327044 ttgaggtgtttaagtgctgcctaagttgctgttgtaggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 1327112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 22253280 - 22253324
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  22253280 ttccaaagtattggagtcttaagatgttgatgttgtccaagttgt 22253324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28397555 - 28397511
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28397555 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 28397511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 22381703 - 22381745
Alignment:
Q  53 tatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 95  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22381703 tatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgat 22381745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 250
Target Start/End: Original strand, 22381849 - 22381891
Alignment:
Q  208 ccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22381849 ccaaagtattggagtcttaagttcttgatgttgtccaagttgt 22381891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 5083269 - 5083313
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  5083269 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 5083313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18833442 - 18833398
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  18833442 ttccgaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 18833398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21250 - 21017
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250 ttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 21151  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaagttgtcgttcta 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||      | | ||||||||||         
T  21150 tcagtaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagttgcaggtgtt------ggtctaagttgtcg----- 21062  T
Q  201 aagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21061 -----ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 21017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21007 - 20963
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  21007 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 169786 - 170037
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  169786 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 169885  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  169886 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 169985  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  169986 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttcttaattttgtctaagttgttga 170037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 20247 - 20396
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20247 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 20346  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31207 - 31058
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31207 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 31108  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31107 acattaatattgttatgttttgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15826 - 15565
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatat-ttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15826 ttgagatgtttacgtgttacctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgctt 15727  T
Q  100 cacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagt 190  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||         |||||||||||    
T  15726 ttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaagtgttggtcgaatttgtaaagttgtaagt 15627  T
Q  191 tgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 252  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15626 tgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgatgtctaagttgttg 15565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 365
Alignment:
Q  21 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  601 ctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 502  T
Q  121 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaa 211  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  501 tgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagctgtaaagttgtaagttgtctttcaaaagtgttccaa 402  T
Q  212 agtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 248  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  401 actattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 3382 - 3625
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  3382 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgt 3481  T
Q  119 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa--------gttgtcgttctaaagtattcc 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        ||| || ||| ||||| ||||    
T  3482 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaaagttctatgttttctttccaaagtgttcc 3581  T
Q  210 aaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3582 aaagtattgaagtcttaagttgttattgttgtctaagttgttga 3625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 85629 - 85367
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  85629 ttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttt 85530  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  85529 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 85430  T
Q  192 gtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  85429 gtctttccaaagtgtttccaaagtattggagtattaagttgttaatgttgtctaagttgttga 85367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 1911 - 2172
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  1911 ttgagatgtttacgtgctgcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 2010  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||        ||||||||||||    
T  2011 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttacaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 2110  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||  ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  2111 gtatttgcaaagtgttccaaagtattgaagtcttaagttgttaatgttgtctatgttgttga 2172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 234
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  383 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 284  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  283 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11619 - 11768
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11619 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 11718  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11719 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 36204 - 36353
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36204 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 36303  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36304 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 189495 - 189644
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  189495 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttt 189594  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189595 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 221322 - 221366
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  221322 ttccaaagtattggaggcttaagttgttgatgttgttcaagttgt 221366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1329 - 1577
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||      
T  1329 ttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctct 1428  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  1429 tcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 1528  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
     |      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1529 gt----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgt 1577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39336 - 39205
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 39237  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39236 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 24634 - 24883
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24634 ttgaaatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt- 24732  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaa--gttgtcgttc 198  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||  |||     
T  24733 tcattaatattgttatgttctgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttgtttaagttgtaaagtttgaagttg 24832  T
Q  199 taaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24833 t----ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaaattgttga 24883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 32778 - 32927
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32778 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttc 32877  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32878 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 207620 - 207769
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207620 ttgatatgtttatgtgtcgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 207719  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  207720 acattaatattgttatcttgtgaattgcttgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 313
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  501 ttgagatgtttacgtgctccctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttt 402  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  401 tcattaatattgttacgtcgtgaatttcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 71367 - 71236
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71367 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 71268  T
Q  119 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71267 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10121 - 10350
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10121 ttgagatgtttacgtgctgcctatgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt 10220  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagtt 191  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  10221 tcattaattttgttattttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttgtaagtt 10320  T
Q  192 gtcgttctaaagtattccaaagtattggag 221  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10321 gtctttccaaagtgttccaaagtattggag 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Original strand, 15469 - 15560
Alignment:
Q  19 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15469 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36185 - 36141
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36185 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 36141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 643 - 468
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  643 ttgagatgtttacgtgctttctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 544  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 176  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  543 tcattaatattattatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttg 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7917 - 7731
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||     
T  7917 tgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttct 7819  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaa 188  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7818 cattaatattgacatgttgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgctctaaattgtaa 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7660 - 7615
Alignment:
Q  205 attccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  7660 attccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 6939 - 7190
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  6939 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctct 7038  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgtt 197  Q
     |||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  7039 tcattaatactgttacgatgtgtattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtt 7138  T
Q  198 ctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
     |      ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7139 gt----ctttcaaaagaattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 7190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 65647 - 65773
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65647 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 65746  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  65747 cattaatattgttatgttgtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 80702 - 80554
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  80702 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttca 80603  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  80602 taataatattgttatgttgtgaattgattgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 61731 - 61857
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  61731 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 61830  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  61831 cattaatattgttatgttgtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 14205 - 14354
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  14205 ttgatatgtttacgtgtcgcctatgttcctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatacttt 14304  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305 atattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 250
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13671
Alignment:
Q  78 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-g 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  177 tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13590 tctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtctaaagttgttgatgttgtctaagttgt 13671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10342
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10466  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctt 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||  ||| |      ||||||||||||||||||||    
T  10465 tgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggagtctt 10370  T
Q  226 aagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10369 aagttgttgatgttgtctaagttgttga 10342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 36060 - 36208
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36060 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttc 36159  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttg 151  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  36160 ataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtt--tgttgctgttg 36208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 58837 - 58964
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  58837 ttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttc 58936  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  58937 acattaatattgttatgttgtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5615
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgct 5703  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5702 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 67339 - 67094
Alignment:
Q  7 tgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacatta 106  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  67339 tgtttacgtgctgcttatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcatta 67240  T
Q  107 atattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||| |        
T  67239 atattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagttgcaggtgttggtctaagttataaagttgtaagttgt---- 67144  T
Q  204 tattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  67143 ctttccaaagtattggagtcttaagttgttaattttgtctaagttgttga 67094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1370
Alignment:
Q  26 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 1326  T
Q  126 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1327 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8121
Alignment:
Q  26 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 8077  T
Q  126 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 5220 - 5346
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5220 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 5319  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5320 cattaatattgttatgttgtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12409 - 12283
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12409 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 12310  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12309 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33074
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgct 33162  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33161 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 49
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  243 ttgatatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttt 144  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttc------tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||      ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  143 tcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgtttctgttgctgttgcatattaagcaagttgcaggtgttggtctaatttgtaa 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 437 - 311
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  437 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttca 338  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  337 cattaatattgttatgttgtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 3994 - 4119
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3994 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttca 4093  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  4094 cattaatattgttatgttatgaattg 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22664
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 22576  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22577 tgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 22664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 17032 - 17076
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  17032 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 17076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Original strand, 26147 - 26188
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  26147 caaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 26188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 67421 - 67546
Alignment:
Q  2 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67421 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 67519  T
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  67520 cattaatattgttatgttgtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4199 - 4160
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4199 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaa 4160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15081 - 14906
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||| || |||      
T  15081 ttgagatgtttacatgtggcctatgttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctct 14982  T
Q  101 acattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 176  Q
     ||| ||||||| |||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  14981 ccataaatattgatatgatgaaaattgcttgcactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagtcgcacgtgttg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4199 - 4160
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4199 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaa 4160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 80453 - 80564
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80453 ttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttc 80552  T
Q  101 acattaatattg 112  Q
    ||||||||||||    
T  80553 acattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 80562 - 80621
Alignment:
Q  91 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80562 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17657 - 17559
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17657 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70752
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 70635  T
Q  130 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtctta 226  Q
    |||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||| |      ||| |||||||||||||||||    
T  70636 tgtgttgtttctgttgc------atattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaaattgtaagttgt----ctttcaaaagtattggagtctta 70725  T
Q  227 agtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  70726 agttgttaatgttgtctaagttgttga 70752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1535
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 127  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  1314 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 1413  T
Q  128 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| |     ||||||||||||||||||||    
T  1414 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt----cattccaaagtattggagtct 1509  T
Q  225 taagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||    
T  1510 taagttgttgatgttgtccaagttgt 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 57011 - 56842
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||    
T  57011 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgttt 56912  T
Q  140 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56911 cctgttgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 56842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15416
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  15625 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgttt 15526  T
Q  140 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgat 236  Q
     ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |      ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15525 cctaatgttgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtaagttgt----cgttccaaagtattggattcttaagttgttgat 15430  T
Q  237 gttgtctaagttgt 250  Q
    |||||| |||||||    
T  15429 gttgtccaagttgt 15416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 253
Target Start/End: Original strand, 6851 - 7040
Alignment:
Q  63 atgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  163 agttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt-cgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |      |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgt----ctttccaatgtattggagtcttaatttgttaatgttgtctaagttgttga 7040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 4306 - 4383
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatg 78  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4306 ttgatatgtttacgtgttgcctattttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatgtggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7544
Alignment:
Q  44 tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-c 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcc 7612  T
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7611 tattgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7555 - 7511
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7555 ttccaaagtattggattcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 7511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166595
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 166525  T
Q  140 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  166526 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 166595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20652
Alignment:
Q  113 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||    
T  20774 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaag 20675  T
Q  204 tattccaaagtattggagtctta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20674 tattccaaagtattggagtctta 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20834 - 20769
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 66  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20834 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  72 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 78386 - 78236
Alignment:
Q  102 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgt---cgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |      
T  78386 cattaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagctg 78287  T
Q  197 tctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  78286 tct------ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttga 78236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6291
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 96  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6196 ttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3526
Alignment:
Q  180 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3599 aagttgtaagttgtcgttccaaagtattcgaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 3526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7663 - 7590
Alignment:
Q  180 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7663 aagttgtaagttgtctttccaaagtattctaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 7590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 105164 - 105078
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaag 87  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  105164 ttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 7989
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgtt 239  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8092 tgttgctgttgcatattgataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtc----------tttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgtt 8003  T
Q  240 gtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||    
T  8002 gtctaagttgttga 7989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8851
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  || |||  |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||  |    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaattacttatgtgctgcct 8952  T
Q  140 ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgt 238  Q
     ||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||  ||||||| || | | |||||          |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8951 atgttgctgttgtatattaat-aagctgcatgtgtcggtctaagatgaaggatgtcg----------ttccaaagtattggagtcataagttgttgatgt 8863  T
Q  239 tgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||    
T  8862 tgtctaagttgt 8851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 88  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 497427 - 497387
Alignment:
Q  210 aaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  497427 aaagtattgaagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 497387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 497588 - 497538
Alignment:
Q  42 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 92  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  497588 tgtgaaatatttatataacttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10467
Alignment:
Q  141 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 36067 - 36135
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 69  Q
    ||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36067 ttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 36135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21784
Alignment:
Q  142 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaa-gttgtc-gttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagtggttgatgt 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtct----ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgt 21799  T
Q  239 tgtctaagttgttga 253  Q
    | |||||||||||||    
T  21798 tatctaagttgttga 21784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 132921 - 132878
Alignment:
Q  207 tccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  132921 tccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 132878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 10888 - 10956
Alignment:
Q  1 ttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 69  Q
    ||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10888 ttgaggtgtttaagtgttgcttatattgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcattatgtgga 10956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 11577 - 11692
Alignment:
Q  73 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||  |||| || |||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11577 tgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgttgaatattgattaagttgca 11676  T
Q  170 ggtgtt-gtctaagtt 184  Q
     ||||| |||||||||    
T  11677 agtgttggtctaagtt 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 2674 - 2721
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2674 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtataagttgttga 2721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7812 - 7765
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7812 ttccaaagtattggagtctttagttgttaatgttgtctaagttgttga 7765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 77867 - 77820
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  77867 ttccaaagtattggagtcgtaagttgttaatgttgtctaagttgttga 77820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 126945 - 126896
Alignment:
Q  159 atcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  126945 atcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 126896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1855
Alignment:
Q  208 ccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1897 ccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 250
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18327
Alignment:
Q  208 ccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18285 ccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 18327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 93 - 49
Alignment:
Q  209 caaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  93 caaagtattggagtcttaagttgttagtgttgtctaagttgttga 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 8130
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8166 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc 8130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Original strand, 5654 - 5693
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5654 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaa 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10168 - 10125
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10168 ttccaaagtgttggagtcttaagttgttgaagttgtctaagttg 10125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Original strand, 9836 - 9879
Alignment:
Q  207 tccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  9836 tccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 9879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 759 - 720
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  759 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaa 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 362777 - 362730
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  362777 ttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaaattgttga 362730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3260 - 3218
Alignment:
Q  208 ccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  3260 ccaaagtattggagtcttaagttgttgattttgtccaagttgt 3218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 899
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  943 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1706 - 1662
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  1706 ttccaaagtattagagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1122
Alignment:
Q  30 tgttgttggttatgtgaaatatttatat--gccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacatt-aatattgttatgttgtgaatt 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  || |||  ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||  |||| | ||||| |||||||||| ||    
T  1225 tgttgttggtaatgtgaaatagttatatatgcattaattggaaaatgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgctatgttgtgagtt 1126  T
Q  127 gctt 130  Q
    ||||    
T  1125 gctt 1122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2961 - 2917
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  2961 ttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaagttgt 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 608
Alignment:
Q  206 ttccaaagtattggagtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  652 ttccaaagtattggagtcttaagttgttattgttgtccaagttgt 608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University