View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7850_low_17 (Length: 514)

Name: NF7850_low_17
Description: NF7850
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7850_low_17
NF7850_low_17
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (44-514)||(26143732-26144202)
chr6 (93-514)||(25483972-25484393)
chr6 (93-514)||(25539456-25539877)
chr6 (92-514)||(25580634-25581056)
chr6 (105-514)||(25511817-25512225)
chr6 (14-514)||(26056756-26057256)
chr6 (105-514)||(26076817-26077226)
chr6 (1-507)||(27530159-27530662)
chr6 (1-509)||(25492172-25492680)
chr6 (1-439)||(27676543-27676981)
chr6 (1-439)||(27591944-27592382)
chr6 (1-425)||(27717436-27717860)
chr6 (13-425)||(31285392-31285804)
chr6 (91-425)||(27426549-27426883)
chr6 (40-425)||(26884930-26885312)
chr6 (43-433)||(26656828-26657215)
chr6 (43-433)||(26762799-26763186)
chr6 (1-425)||(27610057-27610481)
chr6 (3-514)||(27215275-27215786)
chr6 (40-433)||(26647339-26647732)
chr6 (40-433)||(26753307-26753700)
chr6 (13-425)||(27679783-27680195)
chr6 (40-397)||(27697551-27697908)
chr6 (42-425)||(26862442-26862825)
chr6 (13-425)||(26624104-26624516)
chr6 (13-425)||(26730081-26730493)
chr6 (40-408)||(27337049-27337417)
chr6 (40-408)||(27397789-27398157)
chr6 (1-514)||(28787059-28787572)
chr6 (1-514)||(28793180-28793693)
chr6 (13-433)||(26803279-26803699)
chr6 (1-433)||(27603633-27604065)
chr6 (91-433)||(26824730-26825072)
chr6 (217-425)||(27705191-27705399)
chr6 (1-273)||(28781922-28782194)
chr6 (92-266)||(28326390-28326564)
chr6 (92-266)||(28504026-28504200)
chr6 (92-345)||(28227864-28228117)
chr6 (92-345)||(28182029-28182283)
chr6 (95-345)||(28235480-28235730)
chr6 (105-287)||(26812453-26812635)
chr6 (115-185)||(27576142-27576212)
chr6 (146-251)||(29477176-29477281)
chr6 (105-289)||(26950668-26950852)
chr6 (92-256)||(28296846-28297010)
chr6 (92-256)||(28515063-28515227)
chr6 (91-288)||(28097517-28097714)
chr6 (155-257)||(28240329-28240431)
chr6 (13-176)||(27705590-27705753)
chr6 (355-425)||(28140710-28140780)
chr6 (224-292)||(25074911-25074979)
chr6 (219-257)||(27664310-27664348)
chr6 (163-257)||(28243778-28243872)
chr6 (316-372)||(28186530-28186586)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-433)||(28163305-28163736)
chr1 (1-514)||(28126523-28127036)
chr1 (40-425)||(267277-267662)
chr1 (91-289)||(26136799-26136997)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-425)||(2476-2900)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (91-425)||(60480-60814)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (91-425)||(18074672-18075006)
chr4 (1-439)||(18654396-18654834)
chr4 (1-439)||(18678479-18678917)
chr4 (1-434)||(18698324-18698757)
chr4 (1-434)||(18730428-18730861)
chr4 (1-439)||(18723004-18723442)
chr4 (109-425)||(5089887-5090203)
chr4 (328-403)||(18688581-18688656)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-514)||(3560-4073)
scaffold0277 (1-514)||(12523-13036)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (13-514)||(29272686-29273187)
chr8 (155-266)||(35984274-35984385)
chr8 (155-251)||(31906029-31906125)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-514)||(8308-8821)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (92-345)||(28362-28615)
scaffold0038 (95-345)||(35642-35892)
scaffold0038 (155-257)||(40491-40593)
scaffold0038 (163-257)||(43940-44034)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (91-371)||(57285-57565)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (91-273)||(16691778-16691960)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (105-289)||(17992288-17992472)
chr2 (73-143)||(3280552-3280622)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (135-191)||(5879638-5879694)
chr3 (135-191)||(5917003-5917059)
chr3 (136-192)||(5982798-5982854)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 514
Target Start/End: Original strand, 26143732 - 26144202
Alignment:
Q  44 tgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctaca 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| || | |   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||      
T  26143732 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 26143831  T
Q  144 tagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26143832 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtc 26143931  T
Q  244 atcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttga 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143932 atcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttga 26144031  T
Q  344 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaac 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144032 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaac 26144131  T
Q  444 aatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtatgaaaatattc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26144132 aatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattgggagcgtacattagacgagtatgaaaatattc 26144202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 93 - 514
Target Start/End: Original strand, 25483972 - 25484393
Alignment:
Q  93 taagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25483972 taagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcag 25484071  T
Q  193 ctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaa 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484072 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaa 25484171  T
Q  293 gtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 392  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484172 gtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 25484271  T
Q  393 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtaca 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484272 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtaca 25484371  T
Q  493 ttagatgagtatgaaaatattc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25484372 ttagatgagtatgaaaatattc 25484393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 93 - 514
Target Start/End: Original strand, 25539456 - 25539877
Alignment:
Q  93 taagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25539456 taagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcag 25539555  T
Q  193 ctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaa 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25539556 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaa 25539655  T
Q  293 gtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 392  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25539656 gtacacatgtagtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagat 25539755  T
Q  393 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtaca 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539756 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctacccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtaca 25539855  T
Q  493 ttagatgagtatgaaaatattc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25539856 ttagatgagtatgaaaatattc 25539877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 514
Target Start/End: Original strand, 25580634 - 25581056
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25580634 ttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagca 25580733  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattaca 291  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580734 gctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattaca 25580833  T
Q  292 agtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaga 391  Q
    |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25580834 agtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagaga 25580933  T
Q  392 ttttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtac 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25580934 ttttaaaccgtgtagttacttatgcatctgggctgcccttagcaatagtaacaataggggataatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtat 25581033  T
Q  492 attagatgagtatgaaaatattc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25581034 attagatgagtatgaaaatattc 25581056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 25511817 - 25512225
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25511817 tgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttg 25511916  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaa 304  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25511917 gctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg-attacaagtacacatgcag 25512015  T
Q  305 taaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgt 404  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25512016 tagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgt 25512115  T
Q  405 agttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25512116 agttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtat 25512215  T
Q  505 gaaaatattc 514  Q
    ||||||||||    
T  25512216 gaaaatattc 25512225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 514
Target Start/End: Original strand, 26056756 - 26057256
Alignment:
Q  14 atgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtga 113  Q
    |||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |  ||||||||   |||| ||||| ||  ||   | |||||| || |||||||||    
T  26056756 atgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtga 26056855  T
Q  114 gggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagga 213  Q
    ||||||  |||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26056856 gggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggagga 26056955  T
Q  214 ctcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggt 313  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||    
T  26056956 cttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggt 26057055  T
Q  314 tgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26057056 tgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgtgtagttactta 26057155  T
Q  414 tgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtatgaaaatatt 513  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26057156 tgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattgggagcgtatattagacgagtatgaaaatatt 26057255  T
Q  514 c 514  Q
    |    
T  26057256 c 26057256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 26076817 - 26077226
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  26076817 tgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttg 26076916  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaa 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  26076917 gctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcag 26077016  T
Q  305 taaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgt 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26077017 tagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgtgt 26077116  T
Q  405 agttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  26077117 agttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattgggagcgtatattagacgagtat 26077216  T
Q  505 gaaaatattc 514  Q
    ||||||||||    
T  26077217 gaaaatattc 26077226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27530662 - 27530159
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27530662 tgttttctagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttag 27530563  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27530562 gaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggc 27530463  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||     |||||||||   ||||||||||    
T  27530462 cttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacat 27530363  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||   || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27530362 gcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggctttcaaa---gaaaatgttccttcaagtcatgaagacattttaaacc 27530266  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    ||| | |||||||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||  | | ||||||||||||     
T  27530265 gtgcacttacttatgcttctggccttccattagctattgtaataatagggtccaatttggttggaaggagcgtacaagattcaatgagtacattagatgg 27530166  T
Q  501 gtatgaa 507  Q
    |||||||    
T  27530165 gtatgaa 27530159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25492680 - 25492172
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||  |||||||  || |||||||||     
T  25492680 tgttttctaggagatgtgagagagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaa 25492581  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  25492580 gaagtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagagga 25492481  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||   |||||  |||    
T  25492480 tttggctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcat 25492381  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    ||| || ||| |||| ||| |  |||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |    
T  25492380 gcagtagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacattttaacac 25492281  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
     || | |||| ||||| |||||||| || |||||  |||||| |||||||   |||||||||||||  |   ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25492280 ttgcaattacctatgcttctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatggaagtgtacattagatga 25492181  T
Q  501 gtatgaaaa 509  Q
    |||||||||    
T  25492180 gtatgaaaa 25492172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27676981 - 27676543
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||   ||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  27676981 tgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 27676882  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||| || |||||| | |  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27676881 gaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggc 27676782  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||   ||  ||| ||    
T  27676781 tttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatat 27676682  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27676681 gcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagc 27676582  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 439  Q
    ||| ||||   ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  27676581 gtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatag 27676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27592382 - 27591944
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||   ||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  27592382 tgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 27592283  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||| || |||||| | |  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  27592282 gaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgc 27592183  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||   ||  ||| ||    
T  27592182 tttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatat 27592083  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    ||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27592082 gcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagc 27591983  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 439  Q
    ||| ||||   ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  27591982 gtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatag 27591944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27717860 - 27717436
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||| ||  |   || |||||||| |    
T  27717860 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttg 27717761  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||  | ||    
T  27717760 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgc 27717661  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||    
T  27717660 tttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcat 27717561  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27717560 gaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaacc 27717461  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||||    
T  27717460 gtgcagttgcatatgcttctggcct 27717436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 425
Target Start/End: Original strand, 31285392 - 31285804
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||    ||||||||    
T  31285392 gatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtg 31285491  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||| | ||||||||||||||    
T  31285492 agggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggagg 31285591  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaaggg 312  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  31285592 acttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaaggg 31285691  T
Q  313 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactt 412  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  31285692 ttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 31285791  T
Q  413 atgcatctggcct 425  Q
    || | ||||||||    
T  31285792 attcttctggcct 31285804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27426883 - 27426549
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  || |||    
T  27426883 attaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagc 27426784  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattac 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  27426783 aactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagataga 27426684  T
Q  291 aagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagag 390  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27426683 aaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaag 27426584  T
Q  391 attttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27426583 attttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 27426549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 425
Target Start/End: Original strand, 26884930 - 26885312
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||| ||   | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||| |    
T  26884930 aacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagac 26885029  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26885030 tacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcag 26885129  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |    || ||| ||| | || ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||    
T  26885130 ggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattg 26885229  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    |||||| |  |||| ||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  26885230 ttgaggtggctggcctttaaa---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggcct 26885312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 433
Target Start/End: Original strand, 26656828 - 26657215
Alignment:
Q  43 ttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctac 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||     
T  26656828 ttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactat 26656927  T
Q  143 atagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagt 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26656928 ctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagt 26657027  T
Q  243 catcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttg 342  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||| |||||   ||  ||| ||||  |||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26657028 catcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttg 26657127  T
Q  343 aggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
    ||  | |||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  26657128 agatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttag 26657215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 433
Target Start/End: Original strand, 26762799 - 26763186
Alignment:
Q  43 ttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctac 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||     
T  26762799 ttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactat 26762898  T
Q  143 atagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagt 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26762899 ctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagt 26762998  T
Q  243 catcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttg 342  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||| |||||   ||  ||| ||||  |||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26762999 catcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttg 26763098  T
Q  343 aggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
    ||  | |||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  26763099 agatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttag 26763186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27610481 - 27610057
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||  |   || |||||||| |    
T  27610481 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttg 27610382  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||  | ||    
T  27610381 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgc 27610282  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| | |||||  |||    
T  27610281 tttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgcat 27610182  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
      | |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27610181 aaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaacc 27610082  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    |||  ||| | ||||| ||||||||    
T  27610081 gtgctgttgcatatgcttctggcct 27610057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 514
Target Start/End: Original strand, 27215275 - 27215786
Alignment:
Q  3 ttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttagga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||| |||||||  ||   ||||||||||    
T  27215275 ttttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttagga 27215374  T
Q  103 ggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  27215375 ggtgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctt 27215474  T
Q  203 tggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgc 302  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||  | | ||| |||||| ||| |||||||||   |||    |||      
T  27215475 tggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagacagttactaacctatcatgggatagaaagattgcatca 27215574  T
Q  303 aataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgt 402  Q
      |||  ||  |  ||||   |||||||| | |||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  27215575 cgtaagcggtctatatgacgaagaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggcatttttaatcgt 27215674  T
Q  403 gtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagt 502  Q
    | | |||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  27215675 gcacttacttatgtttctggccttccattagctatagtaacaatagggtccaatttgtttggaaggagtgtagaagattgggaacgtatattagatgagt 27215774  T
Q  503 atgaaaatattc 514  Q
    ||||||| ||||    
T  27215775 atgaaaagattc 27215786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 433
Target Start/End: Original strand, 26647339 - 26647732
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||| |  | | |||||||| |||  | || ||||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  26647339 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggc 26647438  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26647439 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 26647538  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| ||||| ||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  26647539 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattg 26647638  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26647639 ttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 26647732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 433
Target Start/End: Original strand, 26753307 - 26753700
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||| |  | | |||||||| |||  | || ||||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  26753307 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggc 26753406  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26753407 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 26753506  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| ||||| ||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  26753507 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattg 26753606  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26753607 ttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 26753700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 425
Target Start/End: Original strand, 27679783 - 27680195
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||||| ||  |||||||| | ||||||    | | ||| ||||||||||    ||||||||    
T  27679783 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtg 27679882  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  || |||| ||| | ||||||||||||||    
T  27679883 agggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggagg 27679982  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaaggg 312  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||  | ||||||| ||   ||||||||||||| || |||||    
T  27679983 acttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatggcatagaaagtacacatgcagtagaaggg 27680082  T
Q  313 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  27680083 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 27680182  T
Q  413 atgcatctggcct 425  Q
    |||| | ||||||    
T  27680183 atgcttttggcct 27680195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27697908 - 27697551
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||||||| ||||| ||||    ||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||    
T  27697908 aacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggc 27697809  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27697808 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcag 27697709  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||   ||  ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27697708 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactagaccatcatgggatagaaaaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattg 27697609  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaa 397  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  27697608 ttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtacaaagagattttaa 27697551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 425
Target Start/End: Original strand, 26862442 - 26862825
Alignment:
Q  42 cttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggcta 141  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| || | | ||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||  |||| |||    
T  26862442 cttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataaaggaaagacta 26862541  T
Q  142 catagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagag 241  Q
     |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  26862542 aatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtcatggaagtagag 26862641  T
Q  242 tcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgtt 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||   ||| ||| ||||  |||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  26862642 tcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagacagaagcttttgaattgtt 26862741  T
Q  342 gaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    |||| | ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  26862742 gaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttataacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggcct 26862825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 425
Target Start/End: Original strand, 26624104 - 26624516
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||| ||| |||||||| |    ||||||||    
T  26624104 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtg 26624203  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   |   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26624204 agggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagg 26624303  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaaggg 312  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||  |  ||||||||| | ||| ||||||||| || |||||    
T  26624304 gcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaaggg 26624403  T
Q  313 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactt 412  Q
    ||| ||| |||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  26624404 ttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 26624503  T
Q  413 atgcatctggcct 425  Q
    |||| ||||||||    
T  26624504 atgcttctggcct 26624516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 425
Target Start/End: Original strand, 26730081 - 26730493
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||| ||| |||||||| |    ||||||||    
T  26730081 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtg 26730180  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   |   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26730181 agggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagg 26730280  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaaggg 312  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||  |  ||||||||| | ||| ||||||||| || |||||    
T  26730281 gcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaaggg 26730380  T
Q  313 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactt 412  Q
    ||| ||| |||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  26730381 ttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 26730480  T
Q  413 atgcatctggcct 425  Q
    |||| ||||||||    
T  26730481 atgcttctggcct 26730493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27337417 - 27337049
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||  |  | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  27337417 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggc 27337318  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27337317 tatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 27337218  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| ||||| ||| |||| |  ||| ||  |||||||||||||||    
T  27337217 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattg 27337118  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagtt 408  Q
    |||||| | | ||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  27337117 ttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtt 27337049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27398157 - 27397789
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||  |  | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  27398157 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggc 27398058  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27398057 tatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 27397958  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| ||||| ||| |||| |  ||| ||  |||||||||||||||    
T  27397957 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattg 27397858  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagtt 408  Q
    |||||| | | ||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  27397857 ttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtt 27397789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 28787059 - 28787572
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  28787059 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttag 28787158  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  28787159 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 28787258  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||    
T  28787259 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacat 28787358  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | | |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  28787359 gaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 28787458  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| |||||||   ||| || | | ||   ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| |||| |||||||     
T  28787459 gtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatgg 28787558  T
Q  501 gtatgaaaatattc 514  Q
     |||||||| ||||    
T  28787559 atatgaaaagattc 28787572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 28793180 - 28793693
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||   |  ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  28793180 tgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttag 28793279  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  28793280 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 28793379  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||    
T  28793380 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacat 28793479  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | | |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  28793480 gaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 28793579  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    ||| |||| | ||||| || ||||| |||||||   ||| || | | ||   ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| |||| |||||||     
T  28793580 gtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatgg 28793679  T
Q  501 gtatgaaaatattc 514  Q
     |||||||| ||||    
T  28793680 atatgaaaagattc 28793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 26803279 - 26803699
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||  | ||| | | || |||||||    |||| |||    
T  26803279 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtg 26803378  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||| ||| |||| |||||  |||| ||   |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  26803379 aggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggagg 26803478  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaaggg 312  Q
    ||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||||  ||   ||| ||| ||||| || | |||    
T  26803479 acctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagagggg 26803578  T
Q  313 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactt 412  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |    
T  26803579 ttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcat 26803678  T
Q  413 atgcatctggcctgcccttag 433  Q
    |||| || || || |||||||    
T  26803679 atgcttcaggtcttcccttag 26803699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27604065 - 27603633
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  27604065 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 27603966  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||| ||  ||||    
T  27603965 gaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggc 27603866  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||| ||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||||  ||   ||| |   ||    
T  27603865 tttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatatagaaagaaagtat 27603766  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    ||| || ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||    
T  27603765 gcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaagacgttttaaacc 27603666  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
    ||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  27603665 gtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttag 27603633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 433
Target Start/End: Original strand, 26824730 - 26825072
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||| | || ||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  26824730 attaagttaggaggtgttagtcaaggtattcaaatcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagc 26824829  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattac 290  Q
    | || || ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||  ||||| || ||     
T  26824830 aactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatgaga-tag 26824928  T
Q  291 aagt-acacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaga 389  Q
    || | |   ||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  26824929 aattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaaca 26825028  T
Q  390 gattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
     ||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26825029 cattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 26825072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27705399 - 27705191
Alignment:
Q  217 gattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttga 316  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||   ||  ||| || || || |||||||||    
T  27705399 gattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggttga 27705300  T
Q  317 atgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgc 416  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||    
T  27705299 atgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgc 27705200  T
Q  417 atctggcct 425  Q
     ||||||||    
T  27705199 ttctggcct 27705191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 28781922 - 28782194
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||  |  | | ||||||||||    
T  28781922 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttag 28782021  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  | ||    
T  28782022 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgc 28782121  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttacta 273  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28782122 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 28782194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 28326390 - 28326564
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||| ||||    
T  28326390 ttaagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagca 28326489  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaaca 266  Q
      || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28326490 attgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaaca 28326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 28504026 - 28504200
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||| ||||    
T  28504026 ttaagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagca 28504125  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaaca 266  Q
      || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28504126 attgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaaca 28504200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 345
Target Start/End: Original strand, 28227864 - 28228117
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| || || |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||    
T  28227864 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccagtcttaaagcaaaggcttcaccgaaagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagca 28227963  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattaca 291  Q
      ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||  | ||||| || |||||  |||||||||||  |    
T  28227964 attgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaa 28228063  T
Q  292 agtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 345  Q
    ||  || ||| |||| |   ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  28228064 agagcatatgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgatgagg 28228117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 345
Target Start/End: Original strand, 28182029 - 28182283
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaa-caaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||| |||    
T  28182029 ttaagttaggagatgtcaacgagggaactccaatcataaaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctattgattctagatgatgttcacgaactgaagc 28182128  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattac 290  Q
    |  || ||| ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||  |||| || ||||   |||||||||||      
T  28182129 aattgcaggttttggctggaggaattgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagtaggtcatgggattga 28182228  T
Q  291 aagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 345  Q
    |||  || ||| |||| |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28182229 aagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgagg 28182283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 345
Target Start/End: Original strand, 28235480 - 28235730
Alignment:
Q  95 agttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagct 194  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||  ||||  |    
T  28235480 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaatt 28235579  T
Q  195 ggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagt 294  Q
    | ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||  |||     
T  28235580 gcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaaga 28235679  T
Q  295 acacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 345  Q
    ||  | | |||| |   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28235680 acgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgagg 28235730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 287
Target Start/End: Original strand, 26812453 - 26812635
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||  ||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||   ||||  || ||| ||||    
T  26812453 tgttagtgaaggaattccaatcataaaagataggctgcatcaaaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaccaaagcaattgaaggttttg 26812552  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggat 287  Q
    | |||||  |  | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | ||| || ||| | |||||||||||    
T  26812553 gttggagagcctggttggctcggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacagacatttgctatcatgtcatgggat 26812635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27576212 - 27576142
Alignment:
Q  115 ggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaact 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27576212 ggaattccaatcataaaacaaaggctacatacaaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaact 27576142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29477281 - 29477176
Alignment:
Q  146 gaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcat 245  Q
    |||||||| ||||| | || || |||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||  |    
T  29477281 gaaagaaagttcttctcatcctagatgatgtggacagactagagcaaatggaggctttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagcagagttgt 29477182  T
Q  246 cattac 251  Q
    ||||||    
T  29477181 cattac 29477176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 289
Target Start/End: Original strand, 26950668 - 26950852
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||| || | |||||||| |||||||| |||||| |  ||||  || ||| ||||    
T  26950668 tgttaatgaaggaattccaatcataaaacgaaggctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaataaagcaattgcaggttttg 26950767  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggatta 289  Q
      |||||  |  | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||    
T  26950768 attggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtgacaaacatttgttatcatgtcatgggatta 26950852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28297010 - 28296846
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  || | |||||||| ||||||||  |  ||||| ||||    
T  28297010 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagca 28296911  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactc 256  Q
      || | | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28296910 attgcaagttttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28296846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 28515063 - 28515227
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  || | |||||||| ||||||||  |  ||||| ||||    
T  28515063 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagca 28515162  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactc 256  Q
      || | | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28515163 attgcaagttttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28515227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28097714 - 28097517
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||||||| || ||  |  | ||| || |||    
T  28097714 attaagttagcagatactagtgagggaattccaatcataaaacaaaggctacaacaaaagaaggttctattgattctcgacgacattaataaattgaagc 28097615  T
Q  191 agctggaggctttggctgga-ggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggatt 288  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  28097614 agctgcaagctatggctggagggact-gattggtttggtgctggcagtagagtgattgttaccactcgagataaaaacttgctagcaagtcatgggatt 28097517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Original strand, 28240329 - 28240431
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28240329 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 28240428  T
Q  255 tcg 257  Q
    |||    
T  28240429 tcg 28240431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27705753 - 27705590
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||  | ||||| | || |||||||    |||| |||    
T  27705753 gatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtg 27705654  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgt 176  Q
    |||| ||| || |||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27705653 aggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27705590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 425
Target Start/End: Original strand, 28140710 - 28140780
Alignment:
Q  355 tttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28140710 tttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagttacttatgcctctggcct 28140780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 25074911 - 25074979
Alignment:
Q  224 tcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaa 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  || | | ||||||||||||||    
T  25074911 tcggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttatcatctcatgggattacaa 25074979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27664348 - 27664310
Alignment:
Q  219 ttggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcg 257  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27664348 ttggttcggtcaaggaagcagagtcatcattaccactcg 27664310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 257
Target Start/End: Original strand, 28243778 - 28243872
Alignment:
Q  163 attcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcg 257  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| ||||  || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  28243778 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcg 28243872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Original strand, 28186530 - 28186586
Alignment:
Q  316 aatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagtt 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||| ||||||||    
T  28186530 aatgagaaagaagctcttgaattgttgacgtggaaggctttaaaaaataacaaagtt 28186586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28163736 - 28163305
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28163736 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctctttttgaaa-cagttagatcggacattaagttag 28163638  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163637 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 28163538  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||  |||    
T  28163537 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 28163438  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
     |  || |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  28163437 tcggtagaagggttgtatgggacggaagcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgttttaaatc 28163338  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 433  Q
    ||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  28163337 gtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 28163305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 28127036 - 28126523
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  28127036 tgttttctagaagatgtgagagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttag 28126937  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28126936 gaggtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggc 28126837  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||    
T  28126836 tttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgcat 28126737  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    ||  ||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  28126736 gcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 28126637  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    | | |||| | ||||| || ||||| |||||||  |||| || | | ||   ||| || ||||||| ||   ||||||| |||||| ||||||||||||     
T  28126636 gggcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatgg 28126537  T
Q  501 gtatgaaaatattc 514  Q
     |||||||| ||||    
T  28126536 atatgaaaagattc 28126523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 267662 - 267277
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||| ||| ||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||    
T  267662 aacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggc 267563  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |  |  | ||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  267562 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcag 267463  T
Q  240 agtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattg 339  Q
    |||| || |||||||||| || || || |||||| |||||||||||||   |||||| |||| | || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  267462 agtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattg 267363  T
Q  340 ttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    |||||  | |||||||||||||||||   |||||| |||| |||  | ||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  267362 ttgagttggatggcttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaatgagattttaattcgtgcagttgcttatgcttctggcct 267277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 289
Target Start/End: Original strand, 26136799 - 26136997
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||    
T  26136799 attaagttaggacatgttagtaaaggaattccaatcataaaagaaaggctacatcaaaagaaaattttgttgattctcgatgacgttgacaagctaaagc 26136898  T
Q  191 agctggaggctttggctggag-gactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggatta 289  Q
    || || ||| ||||| ||||| | || | |||| | |||| ||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  26136899 agttgcaggttttggttggagagcctag-ttggcttggtcctgggagtagagtcatcattaccacccgagacaaacatttgctatcatgtcatgggatta 26136997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2900 - 2476
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||| |||   ||||||||| | |||||| ||  |   || |||||||| |    
T  2900 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttg 2801  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||  | ||    
T  2800 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgc 2701  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||    
T  2700 tttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcat 2601  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2600 gaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaacc 2501  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||||    
T  2500 gtgcagttgcatatgcttctggcct 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 425
Target Start/End: Original strand, 60480 - 60814
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  || |||    
T  60480 attaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagc 60579  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattac 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  60580 aactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagataga 60679  T
Q  291 aagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagag 390  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60680 aaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaag 60779  T
Q  391 attttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  60780 attttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 60814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 425
Target Start/End: Original strand, 18074672 - 18075006
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  || |||    
T  18074672 attaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagc 18074771  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattac 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  18074772 aactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagataga 18074871  T
Q  291 aagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagag 390  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18074872 aaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaag 18074971  T
Q  391 attttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 425  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18074972 attttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 18075006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18654834 - 18654396
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  18654834 tgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttag 18654735  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |  ||| | ||    
T  18654734 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgc 18654635  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |  ||||| |||   || ||  |||    
T  18654634 tttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcat 18654535  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | |||||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654534 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 18654435  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 439  Q
    ||| |||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18654434 gtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatag 18654396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18678917 - 18678479
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  18678917 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttag 18678818  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||  |||| || ||| | ||    
T  18678817 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgc 18678718  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |  ||||| |||   || ||  |||    
T  18678717 tttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcat 18678618  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | |||||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18678617 gaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaac 18678518  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 439  Q
    ||| ||||   ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18678517 gtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatag 18678479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18698757 - 18698324
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |   |  | | ||||||||||    
T  18698757 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttag 18698658  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || ||| | ||    
T  18698657 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgc 18698558  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||   || ||  |||    
T  18698557 tttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccat 18698458  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | |||||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18698457 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaacc 18698358  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagc 434  Q
     || ||||   ||||| |||||||| || |||||    
T  18698357 atgcagttgtgtatgcttctggccttccattagc 18698324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18730861 - 18730428
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |   |  | | ||||||||||    
T  18730861 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttag 18730762  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || ||| | ||    
T  18730761 gaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgc 18730662  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||   || ||  |||    
T  18730661 tttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccat 18730562  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | |||||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18730561 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaacc 18730462  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagc 434  Q
     || ||||   ||||| |||||||| || |||||    
T  18730461 atgcagttgtgtatgcttctggccttccattagc 18730428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18723442 - 18723004
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | ||||| ||||    
T  18723442 tgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttag 18723343  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||| ||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||| | ||    
T  18723342 gaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgc 18723243  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  ||||| | |   || ||  |||    
T  18723242 tttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacaattactaaccaatcatgaggtagaaattatgcat 18723143  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | |||||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18723142 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 18723043  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 439  Q
    | | |||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18723042 gagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatag 18723004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5090203 - 5089887
Alignment:
Q  109 agtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||  ||| |||||| |    
T  5090203 agtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccg 5090104  T
Q  209 gaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaa 308  Q
    ||| ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||   ||||||||||||   |  ||| | | | || |    
T  5090103 gagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacatacgaagtaga 5090004  T
Q  309 agggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagtt 408  Q
     || || |||||||  ||||||||| |||| || ||| | | |||||||||||||   |  |||  | ||||||||||||  |||||||||||||| ||     
T  5090003 tggtttaaatgagaacgaagctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaaggaattttaaaccgtgtggta 5089904  T
Q  409 acttatgcatctggcct 425  Q
    |||||||| ||||||||    
T  5089903 acttatgcttctggcct 5089887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688581
Alignment:
Q  328 gctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 403  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 18688581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 4073 - 3560
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  4073 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 3974  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  ||||    
T  3973 gaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggc 3874  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||| ||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||    ||||||||||   |||||| |||    
T  3873 tttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggatagaaagtacgcat 3774  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | | |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  3773 gaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 3674  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    ||| |||| | ||||| || ||||| |||||||   ||| || | | ||   ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||     
T  3673 gtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatgg 3574  T
Q  501 gtatgaaaatattc 514  Q
     |||||||| ||||    
T  3573 atatgaaaagattc 3560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 13036 - 12523
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | | ||||||||    
T  13036 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttag 12937  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  12936 gaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 12837  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||| | |||||| |||    
T  12836 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcat 12737  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | | |||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  12736 gaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 12637  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    ||| |||| | ||||| || ||||| |||||||   ||| || | | ||   ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||     
T  12636 gtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatgg 12537  T
Q  501 gtatgaaaatattc 514  Q
     |||||||| ||||    
T  12536 atatgaaaagattc 12523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 29273187 - 29272686
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||  | ||| ||| ||||||||||    ||||||||    
T  29273187 gatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtg 29273088  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||| ||| |||| |||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || |||| ||  | ||||||||||||||    
T  29273087 aggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggagg 29272988  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcaataaaaggg 312  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| | |||||  |||| | || |||||    
T  29272987 acatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaaggg 29272888  T
Q  313 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttactt 412  Q
     || ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||| | |    
T  29272887 ctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcat 29272788  T
Q  413 atgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtatgaaaatat 512  Q
    |||| || ||||| |||||||   ||| || | | ||   ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||    
T  29272787 atgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagat 29272688  T
Q  513 tc 514  Q
    ||    
T  29272687 tc 29272686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 266
Target Start/End: Original strand, 35984274 - 35984385
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| ||||||  | |||||| | |||  ||| |||||||| |||||||| ||    
T  35984274 ttcttttgattctagatgatgttgacaaaatagaacagctagaggccttggttggagggtttgattggcttggttctggcagcagagttatcattacaac 35984373  T
Q  255 tcgtgataaaca 266  Q
    ||| || |||||    
T  35984374 tcgggacaaaca 35984385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 251
Target Start/End: Original strand, 31906029 - 31906125
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattac 251  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| | || || |||||||| |||| ||||||| || ||||| | |||  |||||||||||| || |||||    
T  31906029 ttcttttgattctagatgatgttgataaaatagaacaactggaggccttggttggaggattctattggcttggttctggaagcagagttattattac 31906125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 8308 - 8821
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | | ||||||||    
T  8308 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttag 8407  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  8408 gaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 8507  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||| | |||||| |||    
T  8508 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcat 8607  T
Q  301 gcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 400  Q
    | | | |||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  8608 gaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 8707  T
Q  401 gtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatga 500  Q
    ||| |||| | ||||| || ||||| |||||||   ||| || | | ||   ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||     
T  8708 gtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatgg 8807  T
Q  501 gtatgaaaatattc 514  Q
     |||||||| ||||    
T  8808 atatgaaaagattc 8821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 345
Target Start/End: Original strand, 28362 - 28615
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| || || |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||    
T  28362 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccagtcttaaagcaaaggcttcaccgaaagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagca 28461  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattaca 291  Q
      ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||  | ||||| || |||||  |||||||||||  |    
T  28462 attgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaa 28561  T
Q  292 agtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 345  Q
    ||  || ||| |||| |   ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  28562 agagcatatgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgatgagg 28615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 345
Target Start/End: Original strand, 35642 - 35892
Alignment:
Q  95 agttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagct 194  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||  ||||  |    
T  35642 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaatt 35741  T
Q  195 ggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagt 294  Q
    | ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||  |||     
T  35742 gcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaaga 35841  T
Q  295 acacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 345  Q
    ||  | | |||| |   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35842 acgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgagg 35892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Original strand, 40491 - 40593
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  40491 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 40590  T
Q  255 tcg 257  Q
    |||    
T  40591 tcg 40593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 257
Target Start/End: Original strand, 43940 - 44034
Alignment:
Q  163 attcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcg 257  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| ||||  || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  43940 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcg 44034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 57565 - 57285
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  || | |||||||| ||||||||  || | ||| |||    
T  57565 attaagttagtagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctcgatgatgttcacgagctgaagc 57466  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattac 290  Q
    |  |  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||  |||| || |||||  |||||||||||      
T  57465 aattacaggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagcaggtcatgggattga 57366  T
Q  291 aagtacacatgcaataaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagt 371  Q
    |||  || ||| |||| |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||| |||||||    
T  57365 aagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgaggtggaatgctttcaaaaataacaaagt 57285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 16691778 - 16691960
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |   |||    
T  16691778 attaagttaggacatgttagtgaaggaattccaataataaaacaaaggctacaacaaaaaaaggttcttttgattctcgatgatgttgatgagcaaaagc 16691877  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttacta 273  Q
    |  || | | | ||| |||||  | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16691878 aattgcaagttatggttggagagcccgattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 16691960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17992472 - 17992288
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||  ||||  || ||| ||||    
T  17992472 tgttaatgaaggtattccaatcataaagcaaaggctatgtcaaaagaaagttctcttgattctcgatgacatcgacaaactaaagcaattgcaggttttg 17992373  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggatta 289  Q
    | |||||  |  | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  || | |||||||||||||    
T  17992372 gttggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttaacatgtcatgggatta 17992288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Original strand, 3280552 - 3280622
Alignment:
Q  73 aaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctaca 143  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3280552 aaaactgttggattggacattaagttaggagatagtagtgagggaattccaatcataaagcaaaggctaca 3280622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5879694 - 5879638
Alignment:
Q  135 aaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5879694 aaggcttcaaagaaagaaagtccttttgattcttgatgatgtggacaaagtggagca 5879638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5917059 - 5917003
Alignment:
Q  135 aaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5917059 aaggcttcaaagaaagaaagtccttttgattcttgatgatgtggacaaagtggagca 5917003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5982854 - 5982798
Alignment:
Q  136 aggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  5982854 aggcttcaaagaaagaaagtccttttgattcttgataatgtcgacaaagtgcagcag 5982798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University