View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7850_low_75 (Length: 247)

Name: NF7850_low_75
Description: NF7850
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7850_low_75
NF7850_low_75
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-247)||(15741387-15741633)
chr3 (1-247)||(4721338-4721596)
chr3 (34-247)||(4796991-4797204)
chr3 (1-247)||(35880473-35880731)
chr3 (1-247)||(6192023-6192281)
chr3 (1-247)||(18050969-18051227)
chr3 (1-247)||(7072919-7073177)
chr3 (34-247)||(28116295-28116508)
chr3 (34-247)||(8295682-8295895)
chr3 (1-247)||(18330381-18330634)
chr3 (34-247)||(7996269-7996482)
chr3 (34-247)||(10642777-10642990)
chr3 (34-247)||(29149093-29149306)
chr3 (34-247)||(20065753-20065966)
chr3 (1-247)||(10395843-10396098)
chr3 (34-246)||(15893044-15893256)
chr3 (34-247)||(8301602-8301815)
chr3 (34-247)||(11110699-11110912)
chr3 (1-247)||(21674400-21674658)
chr3 (34-247)||(47023160-47023373)
chr3 (34-247)||(20577200-20577413)
chr3 (34-247)||(6542812-6543025)
chr3 (34-247)||(29665323-29665536)
chr3 (34-247)||(36997427-36997640)
chr3 (34-247)||(8211448-8211661)
chr3 (34-247)||(17985294-17985507)
chr3 (34-247)||(24327866-24328079)
chr3 (34-247)||(4347022-4347235)
chr3 (34-247)||(4416623-4416836)
chr3 (34-247)||(22871212-22871425)
chr3 (34-247)||(22886271-22886484)
chr3 (34-247)||(28339009-28339222)
chr3 (34-247)||(31964811-31965024)
chr3 (34-247)||(50134409-50134622)
chr3 (34-247)||(51781718-51781931)
chr3 (34-237)||(51796817-51797020)
chr3 (34-247)||(5013419-5013632)
chr3 (34-247)||(5466692-5466905)
chr3 (34-247)||(5609660-5609873)
chr3 (34-247)||(18224898-18225111)
chr3 (34-247)||(18277390-18277603)
chr3 (34-247)||(18292691-18292904)
chr3 (34-247)||(18307992-18308205)
chr3 (34-247)||(48465622-48465835)
chr3 (34-246)||(28020986-28021198)
chr3 (41-247)||(18242434-18242640)
chr3 (38-247)||(5596708-5596917)
chr3 (47-243)||(18530108-18530304)
chr3 (47-243)||(16626854-16627049)
chr3 (1-123)||(5713058-5713192)
chr3 (1-123)||(5723968-5724102)
chr3 (34-123)||(5757420-5757509)
chr3 (34-123)||(5768311-5768400)
chr3 (34-247)||(4892920-4893133)
chr3 (34-247)||(22387913-22388126)
chr3 (34-247)||(32438864-32439077)
chr3 (47-123)||(17994132-17994208)
chr3 (48-123)||(4625778-4625853)
chr3 (1-39)||(4796946-4796984)
chr3 (1-39)||(5757375-5757413)
chr3 (1-39)||(5768266-5768304)
chr3 (1-39)||(17985249-17985287)
chr3 (1-39)||(29149048-29149086)
chr3 (47-123)||(5652221-5652297)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-247)||(26918123-26918381)
chr6 (1-247)||(26999816-27000074)
chr6 (1-247)||(26988744-26989002)
chr6 (34-247)||(15424557-15424770)
chr6 (1-247)||(16749597-16749855)
chr6 (1-247)||(13299146-13299404)
chr6 (34-247)||(24304858-24305071)
chr6 (1-247)||(24863460-24863718)
chr6 (34-247)||(3695806-3696019)
chr6 (34-246)||(22935117-22935329)
chr6 (34-246)||(23857562-23857774)
chr6 (34-247)||(34463601-34463814)
chr6 (34-247)||(17025005-17025218)
chr6 (34-247)||(27007455-27007668)
chr6 (34-247)||(27044133-27044346)
chr6 (34-247)||(29572756-29572969)
chr6 (34-247)||(16944267-16944480)
chr6 (34-247)||(26777867-26778080)
chr6 (34-247)||(27360250-27360463)
chr6 (34-247)||(27450593-27450806)
chr6 (34-247)||(29549221-29549434)
chr6 (41-247)||(27484860-27485066)
chr6 (34-247)||(4546024-4546237)
chr6 (34-247)||(4724383-4724596)
chr6 (34-247)||(4757504-4757717)
chr6 (34-247)||(4772740-4772953)
chr6 (34-247)||(28207185-28207398)
chr6 (34-247)||(30558256-30558469)
chr6 (34-247)||(16673870-16674083)
chr6 (34-247)||(26116659-26116872)
chr6 (34-247)||(4525032-4525245)
chr6 (38-247)||(29501149-29501358)
chr6 (35-193)||(22477514-22477672)
chr6 (38-243)||(20160454-20160656)
chr6 (38-243)||(22172175-22172377)
chr6 (47-123)||(13522323-13522399)
chr6 (47-123)||(28162527-28162603)
chr6 (47-123)||(33374506-33374582)
chr6 (47-123)||(8892560-8892636)
chr6 (1-39)||(15424512-15424550)
chr6 (1-39)||(30558211-30558249)
chr6 (47-123)||(8903795-8903871)
chr6 (1-30)||(24304813-24304842)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (1-247)||(23718137-23718395)
chr5 (1-247)||(23752599-23752857)
chr5 (1-247)||(11549109-11549367)
chr5 (1-247)||(22999263-22999521)
chr5 (1-247)||(33777242-33777500)
chr5 (34-247)||(9548737-9548950)
chr5 (1-247)||(24688306-24688564)
chr5 (1-247)||(41674464-41674722)
chr5 (34-247)||(15658954-15659167)
chr5 (34-247)||(30934391-30934604)
chr5 (34-247)||(8665669-8665882)
chr5 (34-247)||(18500942-18501155)
chr5 (34-247)||(24681192-24681405)
chr5 (34-247)||(24723719-24723932)
chr5 (34-247)||(31431183-31431396)
chr5 (34-247)||(5637665-5637878)
chr5 (34-247)||(9317206-9317419)
chr5 (34-247)||(12131910-12132123)
chr5 (34-247)||(28648981-28649194)
chr5 (34-247)||(31826613-31826826)
chr5 (34-247)||(37358849-37359062)
chr5 (34-247)||(43078004-43078217)
chr5 (34-247)||(6874057-6874270)
chr5 (34-247)||(26480147-26480360)
chr5 (1-247)||(30168224-30168482)
chr5 (34-247)||(37671686-37671899)
chr5 (34-247)||(2510806-2511019)
chr5 (34-247)||(3789281-3789494)
chr5 (34-247)||(13325038-13325251)
chr5 (34-247)||(18375606-18375819)
chr5 (34-247)||(29967260-29967473)
chr5 (34-247)||(30029170-30029383)
chr5 (34-247)||(37754723-37754936)
chr5 (47-246)||(23891962-23892161)
chr5 (34-247)||(15759051-15759264)
chr5 (34-247)||(28959992-28960205)
chr5 (34-247)||(30151773-30151986)
chr5 (1-247)||(33516111-33516369)
chr5 (38-247)||(32599667-32599876)
chr5 (34-247)||(34616276-34616489)
chr5 (34-247)||(37771193-37771406)
chr5 (34-247)||(40473746-40473959)
chr5 (57-246)||(25198788-25198977)
chr5 (34-159)||(24969867-24969992)
chr5 (161-246)||(24951866-24951951)
chr5 (34-247)||(33292283-33292496)
chr5 (47-188)||(22888287-22888428)
chr5 (47-123)||(13184852-13184928)
chr5 (47-123)||(13440698-13440774)
chr5 (47-123)||(33877129-33877205)
chr5 (1-39)||(15658909-15658947)
chr5 (1-39)||(18375561-18375599)
chr5 (47-123)||(11325676-11325752)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-247)||(16277300-16277558)
chr8 (1-247)||(2137470-2137728)
chr8 (1-247)||(27609116-27609374)
chr8 (34-247)||(14557373-14557586)
chr8 (34-247)||(19674184-19674397)
chr8 (34-247)||(19687844-19688057)
chr8 (34-247)||(19518399-19518612)
chr8 (34-247)||(3329775-3329988)
chr8 (34-247)||(19208616-19208829)
chr8 (34-247)||(29829059-29829272)
chr8 (34-247)||(18710332-18710545)
chr8 (34-247)||(31490006-31490219)
chr8 (34-246)||(16283196-16283408)
chr8 (34-237)||(33258479-33258682)
chr8 (34-247)||(19286211-19286424)
chr8 (34-247)||(31354270-31354483)
chr8 (34-247)||(28362211-28362424)
chr8 (34-247)||(12092989-12093202)
chr8 (38-243)||(22081132-22081337)
chr8 (47-149)||(19659305-19659407)
chr8 (47-149)||(44562948-44563050)
chr8 (47-123)||(9354495-9354571)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (34-247)||(2154320-2154533)
chr7 (1-247)||(5127739-5127997)
chr7 (1-247)||(11424914-11425172)
chr7 (34-247)||(10917048-10917261)
chr7 (34-247)||(16736643-16736856)
chr7 (34-247)||(16751697-16751910)
chr7 (34-247)||(17523279-17523492)
chr7 (34-247)||(17529723-17529936)
chr7 (34-247)||(45387090-45387303)
chr7 (34-247)||(11441307-11441520)
chr7 (34-247)||(5147523-5147736)
chr7 (34-246)||(16503563-16503775)
chr7 (34-246)||(16518599-16518811)
chr7 (1-247)||(26435004-26435262)
chr7 (34-247)||(24592724-24592937)
chr7 (34-247)||(26275277-26275490)
chr7 (34-247)||(26320052-26320265)
chr7 (34-247)||(31124658-31124871)
chr7 (34-247)||(3445041-3445254)
chr7 (34-247)||(26485927-26486140)
chr7 (34-247)||(31564582-31564795)
chr7 (34-247)||(9618398-9618611)
chr7 (34-247)||(26538056-26538269)
chr7 (34-247)||(4145306-4145519)
chr7 (34-247)||(26670097-26670310)
chr7 (53-243)||(16041077-16041267)
chr7 (55-243)||(16450199-16450387)
chr7 (34-247)||(5159269-5159482)
chr7 (47-123)||(31088657-31088733)
chr7 (47-123)||(45733334-45733410)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-247)||(28881956-28882214)
chr2 (1-246)||(23128807-23129064)
chr2 (34-247)||(13936830-13937043)
chr2 (1-247)||(34279191-34279449)
chr2 (1-247)||(12655284-12655542)
chr2 (34-247)||(11635475-11635688)
chr2 (34-247)||(11641664-11641877)
chr2 (1-247)||(20837660-20837918)
chr2 (34-247)||(32049540-32049753)
chr2 (34-247)||(34286096-34286309)
chr2 (34-247)||(34291156-34291369)
chr2 (34-247)||(21677468-21677681)
chr2 (34-247)||(261051-261264)
chr2 (34-247)||(12716891-12717104)
chr2 (34-246)||(27434730-27434942)
chr2 (34-247)||(37925235-37925448)
chr2 (34-247)||(12586543-12586756)
chr2 (34-247)||(27803434-27803647)
chr2 (34-247)||(39889804-39890017)
chr2 (34-247)||(40233241-40233454)
chr2 (34-247)||(9350280-9350493)
chr2 (34-247)||(27776949-27777162)
chr2 (34-247)||(27816716-27816929)
chr2 (34-247)||(31876023-31876236)
chr2 (34-247)||(34861422-34861635)
chr2 (34-247)||(37686195-37686408)
chr2 (34-247)||(37701460-37701673)
chr2 (34-247)||(19416785-19416998)
chr2 (34-247)||(22926314-22926527)
chr2 (34-247)||(16829624-16829837)
chr2 (1-247)||(16891644-16891902)
chr2 (34-247)||(37374903-37375116)
chr2 (34-247)||(39052114-39052327)
chr2 (47-243)||(21703460-21703656)
chr2 (47-243)||(19456717-19456913)
chr2 (47-149)||(31891624-31891726)
chr2 (38-243)||(27392739-27392944)
chr2 (47-123)||(3784523-3784599)
chr2 (47-123)||(27118557-27118633)
chr2 (47-123)||(34156880-34156956)
chr2 (48-123)||(34303600-34303675)
chr2 (47-123)||(16163468-16163544)
chr2 (1-39)||(16829579-16829617)
chr2 (1-39)||(27434685-27434723)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-247)||(27038-27296)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (34-247)||(427-640)
scaffold0029 (1-39)||(382-420)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-247)||(30199-30457)
scaffold0124 (47-243)||(20162-20358)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-247)||(17013761-17014019)
chr4 (34-247)||(24592608-24592821)
chr4 (1-247)||(14664779-14665037)
chr4 (34-247)||(5005631-5005844)
chr4 (34-247)||(27163614-27163827)
chr4 (34-247)||(6569614-6569827)
chr4 (34-247)||(30753503-30753716)
chr4 (1-247)||(21969462-21969720)
chr4 (34-247)||(18800919-18801132)
chr4 (1-247)||(14098302-14098560)
chr4 (34-247)||(33674107-33674320)
chr4 (34-237)||(40105935-40106138)
chr4 (34-247)||(31126815-31127028)
chr4 (34-247)||(54833151-54833364)
chr4 (34-247)||(14763601-14763814)
chr4 (34-247)||(39850384-39850597)
chr4 (67-247)||(19373022-19373202)
chr4 (34-247)||(36344809-36345022)
chr4 (47-243)||(1900025-1900221)
chr4 (47-243)||(15227638-15227834)
chr4 (47-243)||(15285235-15285431)
chr4 (34-247)||(24112426-24112639)
chr4 (34-247)||(34189254-34189467)
chr4 (38-243)||(14235826-14236031)
chr4 (38-243)||(15391633-15391839)
chr4 (47-123)||(24460912-24460988)
chr4 (1-39)||(31126770-31126808)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (1-247)||(47237-47495)
scaffold0089 (34-246)||(40366-40578)
scaffold0089 (34-246)||(29510-29722)
scaffold0089 (1-39)||(40321-40359)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (34-247)||(41793605-41793818)
chr1 (34-247)||(10962415-10962628)
chr1 (34-247)||(51637963-51638176)
chr1 (34-247)||(28584726-28584939)
chr1 (47-243)||(20460857-20461053)
chr1 (155-243)||(16208443-16208531)
chr1 (47-123)||(20340642-20340718)
chr1 (1-39)||(41793560-41793598)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (34-247)||(7536-7749)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (34-247)||(26499-26712)
scaffold0144 (1-39)||(26454-26492)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (34-247)||(15227-15440)
scaffold0237 (1-39)||(15182-15220)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (34-247)||(9363-9576)
scaffold0159 (34-201)||(19807-19974)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (34-247)||(7683-7896)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (43-247)||(5735-5940)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (34-247)||(7978-8191)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (34-208)||(30-204)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (38-243)||(21317-21522)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (47-123)||(2965-3041)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 15741387 - 15741633
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15741387 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaat 15741486  T
Q  101 ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15741487 ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctc 15741586  T
Q  201 cagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15741587 cagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 15741633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4721596 - 4721338
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4721596 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 4721497  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721496 tgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 4721397  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4721396 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4721338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 4796991 - 4797204
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796991 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 4797090  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797091 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 4797190  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4797191 tcttgtggtgtcca 4797204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35880731 - 35880473
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35880731 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 35880632  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880631 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 35880532  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35880531 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 35880473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6192281 - 6192023
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6192281 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 6192182  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192181 taatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 6192082  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6192081 attgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 6192023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18051227 - 18050969
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18051227 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 18051128  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051127 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 18051028  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18051027 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18050969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7073177 - 7072919
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7073177 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 7073078  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073077 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 7072978  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7072977 attgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 7072919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 28116295 - 28116508
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  28116295 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 28116394  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28116395 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 28116494  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28116495 tcttgtggtgtcca 28116508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8295895 - 8295682
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8295895 ctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 8295796  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295795 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 8295696  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  8295695 tcttgtggtgtcca 8295682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18330634 - 18330381
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18330634 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg--- 18330538  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330537 --atgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 18330440  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18330439 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18330381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7996482 - 7996269
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7996482 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 7996383  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7996382 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 7996283  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  7996282 tcttgtggtgtcca 7996269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10642990 - 10642777
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  10642990 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 10642891  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10642890 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 10642791  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  10642790 tcttgtggtgtcca 10642777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 29149093 - 29149306
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29149093 ctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcaca 29149192  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149193 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 29149292  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  29149293 tcttgtggtgtcca 29149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20065966 - 20065753
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20065966 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 20065867  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20065866 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttct 20065767  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  20065766 tcttgtgatgtcca 20065753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10396098 - 10395843
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg---------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  10396098 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactga 10395999  T
Q  92 tgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10395998 tgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggatt 10395899  T
Q  192 gatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10395898 gaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 10395843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 15893044 - 15893256
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15893044 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 15893143  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893144 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 15893243  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  15893244 tcttgtggtgtcc 15893256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 8301602 - 8301815
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8301602 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 8301701  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8301702 tatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttct 8301801  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  8301802 tcttgtggtgtcca 8301815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 11110699 - 11110912
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  11110699 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 11110798  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11110799 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttct 11110898  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  11110899 tcttgtggtgtcca 11110912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21674658 - 21674400
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactgg------------caactgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            || |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21674658 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtac 21674559  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21674558 tgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgg 21674459  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21674458 gttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 21674400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47023373 - 47023160
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  47023373 ctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 47023274  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47023273 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 47023174  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  47023173 tcttgtggtgtcca 47023160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 20577200 - 20577413
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  20577200 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 20577299  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20577300 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 20577399  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  20577400 tcttgtggtgtcca 20577413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 6542812 - 6543025
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6542812 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 6542911  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6542912 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 6543011  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  6543012 tcttgtggtgtcca 6543025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 29665323 - 29665536
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  29665323 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 29665422  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29665423 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29665522  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  29665523 tcttgtggtgtcca 29665536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 36997427 - 36997640
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  36997427 ctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 36997526  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36997527 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 36997626  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  36997627 tcttgtggtgtcca 36997640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8211661 - 8211448
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  8211661 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgca 8211562  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8211561 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 8211462  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  8211461 tcttgtggtgtcca 8211448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 17985294 - 17985507
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  17985294 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 17985393  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17985394 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 17985493  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  17985494 tcttgtggtgtcca 17985507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24328079 - 24327866
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24328079 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 24327980  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24327979 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 24327880  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  24327879 tcttgtggtgtcca 24327866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 4347022 - 4347235
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4347022 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4347121  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4347122 catgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4347221  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4347222 tcttgtggtgtcca 4347235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4416836 - 4416623
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4416836 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4416737  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4416736 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4416637  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4416636 tcttgtggtgtcca 4416623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 22871212 - 22871425
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22871212 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 22871311  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22871312 tatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 22871411  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  22871412 tcttgtggtgtcca 22871425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 22886271 - 22886484
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22886271 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 22886370  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22886371 tatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 22886470  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  22886471 tcttgtggtgtcca 22886484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28339222 - 28339009
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28339222 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28339123  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28339122 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 28339023  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28339022 tcttgtggtgtcca 28339009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 31964811 - 31965024
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31964811 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31964910  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31964911 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 31965010  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31965011 tcttgtggtgtcca 31965024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 50134409 - 50134622
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50134409 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 50134508  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50134509 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 50134608  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  50134609 tcttgtggtgtcca 50134622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51781931 - 51781718
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  51781931 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 51781832  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51781831 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 51781732  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  51781731 tcttgtggtgtcca 51781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51797020 - 51796817
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  51797020 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 51796921  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51796920 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 51796821  T
Q  234 tctt 237  Q
    ||||    
T  51796820 tctt 51796817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5013632 - 5013419
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5013632 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5013533  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5013532 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 5013433  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  5013432 tcttgtggtgtcca 5013419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5466905 - 5466692
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5466905 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5466806  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5466805 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttct 5466706  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  5466705 tcttgtggtgtcca 5466692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 5609660 - 5609873
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| || |    
T  5609660 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgtcata 5609759  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5609760 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 5609859  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  5609860 tcttgtggtgtcca 5609873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18225111 - 18224898
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  18225111 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 18225012  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18225011 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 18224912  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18224911 tcttgtggtgtcca 18224898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 18277390 - 18277603
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18277390 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18277489  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18277490 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18277589  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18277590 tcttgtggtgtcca 18277603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 18292691 - 18292904
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18292691 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18292790  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18292791 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18292890  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18292891 tcttgtggtgtcca 18292904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 18307992 - 18308205
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18307992 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18308091  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18308092 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18308191  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18308192 tcttgtggtgtcca 18308205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48465835 - 48465622
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  48465835 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 48465736  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48465735 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 48465636  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  48465635 tcttgtggtgtcca 48465622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28021198 - 28020986
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28021198 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28021099  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28021098 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttct 28020999  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  28020998 tcttgtggtgtcc 28020986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18242640 - 18242434
Alignment:
Q  41 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18242640 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 18242541  T
Q  141 atgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatg 240  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18242540 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 18242441  T
Q  241 atgtcca 247  Q
     ||||||    
T  18242440 gtgtcca 18242434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 5596708 - 5596917
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5596708 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatg 5596807  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5596808 ggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 5596907  T
Q  238 atgatgtcca 247  Q
     || ||||||    
T  5596908 gtggtgtcca 5596917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18530304 - 18530108
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |    
T  18530304 gcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatg 18530205  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   | ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18530204 gaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 18530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Original strand, 16626854 - 16627049
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |  |||| ||||| ||||    
T  16626854 gcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacg 16626953  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16626954 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-ttcttcttatgatg 16627049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5713192 - 5713058
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5713192 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 5713093  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5713092 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5724102 - 5723968
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5724102 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 5724003  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5724002 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 123
Target Start/End: Original strand, 5757420 - 5757509
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5757420 ctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 123
Target Start/End: Original strand, 5768311 - 5768400
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5768311 ctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5768400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4893133 - 4892920
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  4893133 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 4893034  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  4893033 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 4892934  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    | || |||||||||    
T  4892933 ttttgtgatgtcca 4892920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 22387913 - 22388126
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  22387913 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgca 22388012  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  22388013 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 22388112  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  22388113 tcttgtgatgtcca 22388126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32439077 - 32438864
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  32439077 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 32438978  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  32438977 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 32438878  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  32438877 tcttgtgatgtcca 32438864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 17994132 - 17994208
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17994132 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 17994208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625778
Alignment:
Q  48 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 4625778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 4796946 - 4796984
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4796946 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 4796984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 5757375 - 5757413
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5757375 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 5757413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 5768266 - 5768304
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5768266 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 5768304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 17985249 - 17985287
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17985249 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 17985287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 29149048 - 29149086
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29149048 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 29149086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5652297 - 5652221
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5652297 gcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5652221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26918381 - 26918123
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26918381 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26918282  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918281 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 26918182  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26918181 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26918123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27000074 - 26999816
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27000074 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26999975  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999974 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 26999875  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26999874 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26999816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26989002 - 26988744
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26989002 ttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26988903  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988902 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 26988803  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26988802 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26988744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 15424557 - 15424770
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15424557 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 15424656  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424657 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 15424756  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  15424757 tcttgtggtgtcca 15424770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16749855 - 16749597
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16749855 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 16749756  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16749755 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatgg 16749656  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16749655 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 16749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 13299146 - 13299404
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13299146 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 13299245  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299246 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 13299345  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13299346 attgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 13299404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 24304858 - 24305071
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24304858 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 24304957  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304958 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 24305057  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  24305058 tcttgtggtgtcca 24305071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24863718 - 24863460
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  24863718 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtac 24863619  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863618 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 24863519  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24863518 attgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24863460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3696019 - 3695806
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  3696019 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 3695920  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3695919 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 3695820  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  3695819 tcttgtggtgtcca 3695806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 22935117 - 22935329
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  22935117 ctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgca 22935216  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22935217 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttct 22935316  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  22935317 tcttgtggtgtcc 22935329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 23857562 - 23857774
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  23857562 ctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgca 23857661  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23857662 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttct 23857761  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  23857762 tcttgtggtgtcc 23857774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 34463601 - 34463814
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  34463601 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 34463700  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34463701 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 34463800  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  34463801 tcttgtggtgtcca 34463814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17025218 - 17025005
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17025218 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 17025119  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17025118 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 17025019  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  17025018 tcttgtggtgtcca 17025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27007668 - 27007455
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27007668 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcata 27007569  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27007568 tataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27007469  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27007468 tcttgtggtgtcca 27007455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27044346 - 27044133
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27044346 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 27044247  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27044246 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27044147  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27044146 tcttgtggtgtcca 27044133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29572969 - 29572756
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29572969 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 29572870  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29572869 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29572770  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  29572769 tcttgtggtgtcca 29572756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 16944267 - 16944480
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16944267 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 16944366  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16944367 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 16944466  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  16944467 tcttgtggtgtcca 16944480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26777867 - 26778080
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  26777867 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 26777966  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26777967 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26778066  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26778067 tcttgtggtgtcca 26778080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 27360250 - 27360463
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  27360250 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 27360349  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27360350 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27360449  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27360450 tcttgtggtgtcca 27360463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 27450593 - 27450806
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  27450593 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 27450692  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27450693 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27450792  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27450793 tcttgtggtgtcca 27450806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29549434 - 29549221
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29549434 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 29549335  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29549334 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29549235  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  29549234 tcttgtgatgtcca 29549221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27485066 - 27484860
Alignment:
Q  41 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27485066 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 27484967  T
Q  141 atgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatg 240  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27484966 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 27484867  T
Q  241 atgtcca 247  Q
     ||||||    
T  27484866 gtgtcca 27484860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 4546024 - 4546237
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4546024 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4546123  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4546124 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttct 4546223  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4546224 tcttgtggtgtcca 4546237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 4724383 - 4724596
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4724383 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4724482  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4724483 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttct 4724582  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4724583 tcttgtggtgtcca 4724596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4757717 - 4757504
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  4757717 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 4757618  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4757617 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttct 4757518  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4757517 tcttgtggtgtcca 4757504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4772953 - 4772740
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  4772953 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 4772854  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4772853 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttct 4772754  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4772753 tcttgtggtgtcca 4772740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28207398 - 28207185
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28207398 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28207299  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28207298 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttct 28207199  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28207198 tcttgtggtgtcca 28207185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 30558256 - 30558469
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  30558256 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 30558355  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30558356 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttct 30558455  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  30558456 tcttgtggtgtcca 30558469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16674083 - 16673870
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  16674083 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 16673984  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16673983 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 16673884  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  16673883 tcttgtggtgtcca 16673870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26116659 - 26116872
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  26116659 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaatgctgagaatacggcata 26116758  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26116759 tatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26116858  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26116859 tcttgtggtgtcca 26116872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4525245 - 4525032
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4525245 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4525146  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4525145 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4525046  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4525045 tcttgtggtgtcca 4525032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29501358 - 29501149
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29501358 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatg 29501259  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29501258 ggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29501159  T
Q  238 atgatgtcca 247  Q
     || ||||||    
T  29501158 gtggtgtcca 29501149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Original strand, 22477514 - 22477672
Alignment:
Q  35 tgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||    
T  22477514 tgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcat 22477613  T
Q  135 atgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattga 193  Q
    | ||||| ||| |||  | |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22477614 acgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattga 22477672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20160656 - 20160454
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  |  || |      
T  20160656 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaaca 20160557  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    ||||||  ||||  | ||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||  |  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20160556 ggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccgg---cagcaaattccatccctacttctgtttccttcttctt 20160460  T
Q  238 atgatg 243  Q
    ||||||    
T  20160459 atgatg 20160454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 22172175 - 22172377
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  |  || |      
T  22172175 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaaca 22172274  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    ||||||  ||||  | ||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||  |  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22172275 ggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccgg---cagcaaattccatccctacttctgtttccttcttctt 22172371  T
Q  238 atgatg 243  Q
    ||||||    
T  22172372 atgatg 22172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 13522323 - 13522399
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13522323 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13522399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 28162603 - 28162527
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28162603 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaga 28162527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 33374506 - 33374582
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33374506 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33374582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 8892560 - 8892636
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8892560 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 8892636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15424512 - 15424550
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15424512 ttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttg 15424550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 30558211 - 30558249
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30558211 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 30558249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 8903795 - 8903871
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8903795 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgaga 8903871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 24304813 - 24304842
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactgg 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304813 ttgctgattttgttgttgttgttgaactgg 24304842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 23718137 - 23718395
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23718137 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 23718236  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718237 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 23718336  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23718337 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 23718395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 23752599 - 23752857
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23752599 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 23752698  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752699 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 23752798  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23752799 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 23752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11549367 - 11549109
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11549367 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 11549268  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549267 tgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 11549168  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11549167 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 11549109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 22999263 - 22999521
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22999263 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtac 22999362  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999363 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 22999462  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  22999463 attgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 22999521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33777500 - 33777242
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33777500 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 33777401  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777400 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 33777301  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33777300 attgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 33777242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 9548737 - 9548950
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9548737 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 9548836  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9548837 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 9548936  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  9548937 tcttgtggtgtcca 9548950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 24688306 - 24688564
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgt------------tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24688306 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 24688405  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688406 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 24688505  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24688506 attgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24688564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41674722 - 41674464
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  41674722 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtac 41674623  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41674622 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatgg 41674523  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41674522 attgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 41674464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 15658954 - 15659167
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658954 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 15659053  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15659054 tatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 15659153  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  15659154 tcttgtggtgtcca 15659167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30934604 - 30934391
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30934604 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 30934505  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934504 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttct 30934405  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  30934404 tcttgtggtgtcca 30934391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 8665669 - 8665882
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8665669 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 8665768  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  8665769 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 8665868  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  8665869 tcttgtggtgtcca 8665882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 18500942 - 18501155
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  18500942 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 18501041  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18501042 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18501141  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18501142 tcttgtggtgtcca 18501155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24681405 - 24681192
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24681405 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 24681306  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24681305 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 24681206  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  24681205 tcttgtggtgtcca 24681192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24723932 - 24723719
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24723932 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 24723833  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24723832 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 24723733  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  24723732 tcttgtggtgtcca 24723719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31431396 - 31431183
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31431396 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31431297  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31431296 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 31431197  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31431196 tcttgtggtgtcca 31431183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5637878 - 5637665
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5637878 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5637779  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5637778 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 5637679  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  5637678 tcttgtggtgtcca 5637665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9317419 - 9317206
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9317419 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 9317320  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9317319 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 9317220  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  9317219 tcttgtggtgtcca 9317206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12132123 - 12131910
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12132123 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 12132024  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12132023 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 12131924  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  12131923 tcttgtggtgtcca 12131910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28649194 - 28648981
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  28649194 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 28649095  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649094 tatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 28648995  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28648994 tcttgtggtgtcca 28648981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 31826613 - 31826826
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31826613 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31826712  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31826713 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 31826812  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31826813 tcttgtggtgtcca 31826826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 37358849 - 37359062
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37358849 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37358948  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37358949 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 37359048  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37359049 tcttgtggtgtcca 37359062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43078217 - 43078004
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  43078217 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 43078118  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43078117 tatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttct 43078018  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  43078017 tcttgtggtgtcca 43078004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6874270 - 6874057
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6874270 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 6874171  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6874170 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 6874071  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  6874070 tcttgtggtgtcca 6874057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26480360 - 26480147
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26480360 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26480261  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26480260 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttct 26480161  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26480160 tcttgtggtgtcca 26480147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30168482 - 30168224
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30168482 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 30168383  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30168382 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatgg 30168283  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  30168282 attgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 30168224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 37671686 - 37671899
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37671686 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37671785  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37671786 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttct 37671885  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37671886 tcttgtggtgtcca 37671899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2511019 - 2510806
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2511019 ctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 2510920  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2510919 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttct 2510820  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  2510819 tcttgtggtgtcca 2510806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3789494 - 3789281
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  3789494 ctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 3789395  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3789394 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 3789295  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  3789294 tcttgtggtgtcca 3789281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 13325038 - 13325251
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  13325038 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 13325137  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13325138 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 13325237  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  13325238 tcttgtggtgtcca 13325251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 18375606 - 18375819
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  18375606 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 18375705  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18375706 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 18375805  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18375806 tcttgtggtgtcca 18375819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 29967260 - 29967473
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29967260 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 29967359  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29967360 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29967459  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    | || || ||||||    
T  29967460 ttttgtggtgtcca 29967473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30029383 - 30029170
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30029383 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 30029284  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30029283 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 30029184  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    | || || ||||||    
T  30029183 ttttgtggtgtcca 30029170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37754936 - 37754723
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37754936 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37754837  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37754836 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 37754737  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37754736 tcttgtggtgtcca 37754723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23892161 - 23891962
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23892161 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacg 23892062  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcc 246  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23892061 gaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgtcc 23891962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 15759051 - 15759264
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15759051 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 15759150  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15759151 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttct 15759250  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  15759251 tcttgtggtgtcca 15759264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 28959992 - 28960205
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28959992 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28960091  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28960092 tatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 28960191  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28960192 tcttgtggtgtcca 28960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30151986 - 30151773
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30151986 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 30151887  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30151886 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 30151787  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  30151786 tcttgtggtgtcca 30151773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33516369 - 33516111
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||     
T  33516369 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 33516270  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33516269 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatgg 33516170  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  33516169 attgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 33516111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 32599667 - 32599876
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32599667 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatg 32599766  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32599767 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttctt 32599866  T
Q  238 atgatgtcca 247  Q
     || ||||||    
T  32599867 gtggtgtcca 32599876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34616489 - 34616276
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34616489 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34616390  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34616389 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 34616290  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  34616289 tcttgtggtgtcca 34616276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 37771193 - 37771406
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37771193 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37771292  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37771293 tatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 37771392  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37771393 tcttgtggtgtcca 37771406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 40473746 - 40473959
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  40473746 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 40473845  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40473846 tgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 40473945  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  40473946 tcttgtggtgtcca 40473959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25198977 - 25198788
Alignment:
Q  57 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttg 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||    
T  25198977 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattg 25198878  T
Q  157 ggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcc 246  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25198877 ggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttcttatgatgtcc 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24969992 - 24969867
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24969992 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 24969893  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggc 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24969892 tatgggtacgacggaggcatttgggc 24969867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951866
Alignment:
Q  161 gcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 24951866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33292496 - 33292283
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  33292496 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 33292397  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  33292396 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 33292297  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  33292296 tcttgtgatgtcca 33292283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22888428 - 22888287
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  22888428 gcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 22888329  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22888328 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 13184852 - 13184928
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13184852 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13184928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 13440698 - 13440774
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13440698 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13440774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33877205 - 33877129
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33877205 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33877129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15658909 - 15658947
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15658909 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 15658947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 18375561 - 18375599
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18375561 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 18375599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11325752 - 11325676
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11325752 gcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 11325676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16277558 - 16277300
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16277558 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 16277459  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277458 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 16277359  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16277358 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 16277300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 2137470 - 2137728
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2137470 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 2137569  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137570 tgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 2137669  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2137670 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 2137728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27609116 - 27609374
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27609116 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 27609215  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609216 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 27609315  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  27609316 attgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27609374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14557586 - 14557373
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14557586 ctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 14557487  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557486 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 14557387  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  14557386 tcttgtggtgtcca 14557373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19674397 - 19674184
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19674397 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 19674298  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19674297 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttct 19674198  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  19674197 tcttgtgatgtcca 19674184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19688057 - 19687844
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19688057 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgca 19687958  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19687957 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttct 19687858  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  19687857 tcttgtggtgtcca 19687844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 19518399 - 19518612
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19518399 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 19518498  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19518499 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 19518598  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  19518599 tcttgtggtgtcca 19518612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 3329775 - 3329988
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3329775 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcata 3329874  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3329875 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 3329974  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  3329975 tcttgtggtgtcca 3329988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 19208616 - 19208829
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19208616 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 19208715  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19208716 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 19208815  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  19208816 tcttgtggtgtcca 19208829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29829272 - 29829059
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29829272 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 29829173  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29829172 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29829073  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  29829072 tcttgtggtgtcca 29829059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18710545 - 18710332
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18710545 ctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18710446  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18710445 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 18710346  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18710345 tcttgtggtgtcca 18710332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 31490006 - 31490219
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  31490006 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 31490105  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31490106 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttct 31490205  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31490206 tcttgtggtgtcca 31490219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16283408 - 16283196
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16283408 ctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16283309  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283308 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 16283209  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  16283208 tcttgtggtgtcc 16283196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33258682 - 33258479
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33258682 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 33258583  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33258582 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 33258483  T
Q  234 tctt 237  Q
    ||||    
T  33258482 tctt 33258479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19286424 - 19286211
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 19286225  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  19286224 tcttgtggtgtcca 19286211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31354483 - 31354270
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31354483 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31354384  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31354383 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 31354284  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31354283 tcttgtggtgtcca 31354270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 28362211 - 28362424
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28362211 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28362310  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28362311 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 28362410  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28362411 tcttgtggtgtcca 28362424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 12092989 - 12093202
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12092989 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 12093088  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12093089 tatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttct 12093188  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  12093189 tcttgtggtgtcca 12093202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 22081132 - 22081337
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  22081132 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 22081231  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    | || | |||||  |  || || |||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  22081232 gatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 22081331  T
Q  238 atgatg 243  Q
    ||||||    
T  22081332 atgatg 22081337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Original strand, 19659305 - 19659407
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  19659305 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 19659404  T
Q  147 gag 149  Q
    |||    
T  19659405 gag 19659407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44563050 - 44562948
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  44563050 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 44562951  T
Q  147 gag 149  Q
    |||    
T  44562950 gag 44562948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9354571 - 9354495
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9354571 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 9354495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2154533 - 2154320
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154533 ctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 2154434  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154433 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 2154334  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  2154333 tcttgtggtgtcca 2154320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5127997 - 5127739
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5127997 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatac 5127898  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127897 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 5127798  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5127797 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5127739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 11424914 - 11425172
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11424914 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 11425013  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11425014 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatgg 11425113  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11425114 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 11425172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 10917048 - 10917261
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10917048 ctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 10917147  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10917148 tatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 10917247  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  10917248 tcttgtggtgtcca 10917261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 16736643 - 16736856
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16736643 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 16736742  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16736743 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 16736842  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  16736843 tcttgtggtgtcca 16736856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 16751697 - 16751910
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16751697 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 16751796  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16751797 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 16751896  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  16751897 tcttgtggtgtcca 16751910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17523492 - 17523279
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17523492 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 17523393  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  17523392 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 17523293  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  17523292 tcttgtggtgtcca 17523279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 17529723 - 17529936
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17529723 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 17529822  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  17529823 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 17529922  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  17529923 tcttgtggtgtcca 17529936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45387303 - 45387090
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  45387303 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 45387204  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  45387203 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 45387104  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  45387103 tcttgtggtgtcca 45387090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11441520 - 11441307
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  11441520 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 11441421  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11441420 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 11441321  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  11441320 tcttgtggtgtcca 11441307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 5147523 - 5147736
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  5147523 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 5147622  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5147623 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 5147722  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  5147723 tcttgtggtgtcca 5147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 16503563 - 16503775
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16503563 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16503662  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503663 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 16503762  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  16503763 tcttgtggtgtcc 16503775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 16518599 - 16518811
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16518599 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16518698  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518699 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 16518798  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  16518799 tcttgtggtgtcc 16518811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26435262 - 26435004
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactgg------------caactgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26435262 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26435163  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26435162 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatgg 26435063  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26435062 actgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26435004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 24592724 - 24592937
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24592724 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 24592823  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24592824 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 24592923  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  24592924 tcttgtggtgtcca 24592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26275277 - 26275490
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26275277 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26275376  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26275377 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26275476  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26275477 tcttgtggtgtcca 26275490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26320052 - 26320265
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26320052 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26320151  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26320152 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26320251  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26320252 tcttgtggtgtcca 26320265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31124871 - 31124658
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31124871 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31124772  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124771 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 31124672  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31124671 tcttgtggtgtcca 31124658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3445254 - 3445041
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  3445254 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 3445155  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3445154 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 3445055  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  3445054 tcttgtggtgtcca 3445041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26485927 - 26486140
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  26485927 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 26486026  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26486027 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26486126  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26486127 tcttgtggtgtcca 26486140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 31564582 - 31564795
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  31564582 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 31564681  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31564682 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 31564781  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31564782 tcttgtggtgtcca 31564795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9618611 - 9618398
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9618611 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 9618512  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  9618511 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 9618412  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  9618411 tcttgtggtgtcca 9618398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26538056 - 26538269
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  26538056 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 26538155  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26538156 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 26538255  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26538256 tcttgtggtgtcca 26538269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 4145306 - 4145519
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4145306 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4145405  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4145406 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 4145505  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  4145506 tcttgtggtgtcca 4145519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26670097 - 26670310
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26670097 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26670196  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26670197 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26670296  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26670297 tcttgtggtgtcca 26670310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16041267 - 16041077
Alignment:
Q  53 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagaca 152  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||  |    
T  16041267 acgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 16041168  T
Q  153 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16041167 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 16041077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 16450199 - 16450387
Alignment:
Q  55 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatt 154  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||  |      
T  16450199 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaac 16450298  T
Q  155 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16450299 tgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttcttcttatgatg 16450387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5159482 - 5159269
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  5159482 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 5159383  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  5159382 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 5159283  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  5159282 tcttgtgatgtcca 5159269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 31088657 - 31088733
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31088657 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 31088733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 45733410 - 45733334
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45733410 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 45733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28882214 - 28881956
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28882214 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 28882115  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882114 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 28882015  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  28882014 attgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28881956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 23128807 - 23129064
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23128807 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 23128906  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128907 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 23129006  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcc 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23129007 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 23129064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 13936830 - 13937043
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13936830 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 13936929  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13936930 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 13937029  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  13937030 tcttgtggtgtcca 13937043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34279449 - 34279191
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34279449 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 34279350  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279349 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 34279250  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34279249 attgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 34279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12655542 - 12655284
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12655542 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtac 12655443  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655442 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 12655343  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12655342 attgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 12655284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 11635475 - 11635688
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11635475 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 11635574  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11635575 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttct 11635674  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  11635675 tcttgtggtgtcca 11635688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 11641664 - 11641877
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11641664 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 11641763  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11641764 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttct 11641863  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  11641864 tcttgtggtgtcca 11641877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20837918 - 20837660
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20837918 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtac 20837819  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837818 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 20837719  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20837718 attgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 20837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32049753 - 32049540
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32049753 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 32049654  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32049653 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttt 32049554  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  32049553 tcttgtggtgtcca 32049540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34286309 - 34286096
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34286309 ctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 34286210  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286209 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttct 34286110  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  34286109 tcttgtggtgtcca 34286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34291369 - 34291156
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34291369 ctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 34291270  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291269 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttct 34291170  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  34291169 tcttgtggtgtcca 34291156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 21677468 - 21677681
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21677468 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 21677567  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21677568 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 21677667  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  21677668 tcttgtggtgtcca 21677681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 261051 - 261264
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  261051 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 261150  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  261151 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 261250  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  261251 tcttgtggtgtcca 261264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 12716891 - 12717104
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12716891 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 12716990  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12716991 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 12717090  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  12717091 tcttgtggtgtcca 12717104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 27434730 - 27434942
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27434730 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 27434829  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434830 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 27434929  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  27434930 tcttgtggtgtcc 27434942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37925448 - 37925235
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37925448 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37925349  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37925348 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 37925249  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37925248 tcttgtggtgtcca 37925235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12586756 - 12586543
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  12586756 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 12586657  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12586656 tatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 12586557  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  12586556 tcttgtggtgtcca 12586543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27803647 - 27803434
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  27803647 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 27803548  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27803547 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27803448  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27803447 tcttgtggtgtcca 27803434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39890017 - 39889804
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39890017 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 39889918  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39889917 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 39889818  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  39889817 tcttgtggtgtcca 39889804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40233454 - 40233241
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  40233454 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 40233355  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40233354 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 40233255  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  40233254 tcttgtggtgtcca 40233241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 9350280 - 9350493
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  9350280 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 9350379  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9350380 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 9350479  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  9350480 tcttgtggtgtcca 9350493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27777162 - 27776949
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  27777162 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 27777063  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27777062 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27776963  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27776962 tcttgtggtgtcca 27776949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27816929 - 27816716
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  27816929 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 27816830  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27816829 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27816730  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27816729 tcttgtggtgtcca 27816716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31876236 - 31876023
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31876236 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31876137  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31876136 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 31876037  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31876036 tcttgtggtgtcca 31876023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34861635 - 34861422
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34861635 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34861536  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34861535 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 34861436  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  34861435 tcttgtggtgtcca 34861422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 37686195 - 37686408
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37686195 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37686294  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37686295 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 37686394  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37686395 tcttgtggtgtcca 37686408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 37701460 - 37701673
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37701460 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37701559  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37701560 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 37701659  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37701660 tcttgtggtgtcca 37701673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 19416785 - 19416998
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19416785 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 19416884  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19416885 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 19416984  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  19416985 tcttgtggtgtcca 19416998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 22926314 - 22926527
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22926314 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 22926413  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22926414 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 22926513  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  22926514 tcttgtggtgtcca 22926527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 16829624 - 16829837
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  16829624 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 16829723  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16829724 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttct 16829823  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  16829824 tcttgtggtgtcca 16829837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16891902 - 16891644
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||     
T  16891902 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 16891803  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16891802 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatgg 16891703  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  16891702 attgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 16891644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37375116 - 37374903
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37375116 ctgttgagcgatgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 37375017  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37375016 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 37374917  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  37374916 tcttgtggtgtcca 37374903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 39052114 - 39052327
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  39052114 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 39052213  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39052214 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 39052313  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  39052314 tcttgtggtgtcca 39052327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Original strand, 21703460 - 21703656
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  21703460 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 21703559  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21703560 gaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 21703656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Original strand, 19456717 - 19456913
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||| ||||    
T  19456717 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacg 19456816  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19456817 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 19456913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Original strand, 31891624 - 31891726
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  31891624 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 31891723  T
Q  147 gag 149  Q
    |||    
T  31891724 gag 31891726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27392944 - 27392739
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  27392944 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 27392845  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    |||| |  ||||  |  || || |||| ||| || |||||||||||||  ||||||  || ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  27392844 ggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 27392745  T
Q  238 atgatg 243  Q
    ||||||    
T  27392744 atgatg 27392739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3784599 - 3784523
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3784599 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3784523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27118633 - 27118557
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27118633 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 27118557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34156956 - 34156880
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34156956 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34156880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303675
Alignment:
Q  48 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34303675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16163544 - 16163468
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16163544 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 16163468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 16829579 - 16829617
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16829579 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 16829617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 27434685 - 27434723
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27434685 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 27434723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27296 - 27038
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27296 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtac 27197  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 27097  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27096 attgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 427 - 640
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  427 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 526  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  527 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttct 626  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  627 tcttgtggtgtcca 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 382 - 420
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  382 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30457 - 30199
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30457 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 30358  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30357 tgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 30258  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  30257 attgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 30199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20162
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 20162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17014019 - 17013761
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17014019 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 17013920  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013919 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 17013820  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17013819 attgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 17013761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 24592608 - 24592821
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592608 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 24592707  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24592708 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttct 24592807  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  24592808 tcttgtggtgtcca 24592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14665037 - 14664779
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14665037 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 14664938  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664937 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatgg 14664838  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14664837 attgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 14664779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5005844 - 5005631
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5005844 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 5005745  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5005744 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 5005645  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  5005644 tcttgtggtgtcca 5005631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 27163614 - 27163827
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27163614 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 27163713  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27163714 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 27163813  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  27163814 tcttgtggtgtcca 27163827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6569827 - 6569614
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6569827 ctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 6569728  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6569727 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 6569628  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  6569627 tcttgtggtgtcca 6569614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30753716 - 30753503
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  30753716 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 30753617  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30753616 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttct 30753517  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  30753516 tcttgtggtgtcca 30753503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21969720 - 21969462
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21969720 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 21969621  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21969620 tgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 21969521  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21969520 attgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtcca 21969462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 18800919 - 18801132
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18800919 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 18801018  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18801019 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttct 18801118  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  18801119 tcttgtggtgtcca 18801132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14098560 - 14098302
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaact------------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||     
T  14098560 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 14098461  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14098460 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 14098361  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14098360 attgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 14098302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 33674107 - 33674320
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  33674107 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 33674206  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33674207 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 33674306  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  33674307 tcttgtggtgtcca 33674320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 40105935 - 40106138
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40105935 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 40106034  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40106035 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 40106134  T
Q  234 tctt 237  Q
    ||||    
T  40106135 tctt 40106138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 31126815 - 31127028
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  31126815 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 31126914  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  31126915 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 31127014  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  31127015 tcttgtggtgtcca 31127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54833364 - 54833151
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 54833165  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  54833164 tcttgtggtgtcca 54833151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 14763601 - 14763814
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14763601 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 14763700  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14763701 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 14763800  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  14763801 tcttgtggtgtcca 14763814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39850597 - 39850384
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
T  39850597 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 39850498  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39850497 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttct 39850398  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  39850397 tcttgtggtgtcca 39850384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373022
Alignment:
Q  67 ttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattg 166  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  167 ataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19373022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 36344809 - 36345022
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36344809 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcaca 36344908  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36344909 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 36345008  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  36345009 tcttgtggtgtcca 36345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1900221 - 1900025
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  1900221 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 1900122  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1900121 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 1900025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15227834 - 15227638
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  15227834 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 15227735  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227734 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 15227638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Original strand, 15285235 - 15285431
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  | |    
T  15285235 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatg 15285334  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15285335 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttcttatgatg 15285431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24112639 - 24112426
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  24112639 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 24112540  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  24112539 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 24112440  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  24112439 tcttgtgatgtcca 24112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 34189254 - 34189467
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  34189254 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 34189353  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  34189354 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 34189453  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| |||||||||    
T  34189454 tcttgtgatgtcca 34189467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 14235826 - 14236031
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||| |||      
T  14235826 tgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatact 14235925  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    |||| | | |||  |  || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||  || ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  14235926 ggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 14236025  T
Q  238 atgatg 243  Q
    ||||||    
T  14236026 atgatg 14236031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 15391633 - 15391839
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  15391633 tgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 15391732  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaa-cagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttct 236  Q
    | || | |||||  |  || ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||  || |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  15391733 gatacggcggaggtagctgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttct 15391832  T
Q  237 tatgatg 243  Q
    |||||||    
T  15391833 tatgatg 15391839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 24460912 - 24460988
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24460912 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 24460988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 31126770 - 31126808
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31126770 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 31126808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 47237 - 47495
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  47237 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtac 47336  T
Q  89 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47337 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgg 47436  T
Q  189 attgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatgtcca 247  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  47437 gttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 47495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 40366 - 40578
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40366 ctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 40465  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466 tatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 40565  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  40566 tcttgtggtgtcc 40578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29722 - 29510
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29722 ctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 29623  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622 tacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttct 29523  T
Q  234 tcttatgatgtcc 246  Q
    |||| || |||||    
T  29522 tcttgtggtgtcc 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 40321 - 40359
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40321 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 40359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 41793605 - 41793818
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41793605 ctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcata 41793704  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  41793705 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttct 41793804  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  41793805 tcttgtggtgtcca 41793818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10962628 - 10962415
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10962628 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 10962529  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10962528 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 10962429  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  10962428 tcttgtggtgtcca 10962415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51638176 - 51637963
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51638176 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 51638077  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51638076 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 51637977  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  51637976 tcttgtggtgtcca 51637963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28584939 - 28584726
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28584939 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28584840  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28584839 tacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 28584740  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  28584739 tcttgtggtgtcca 28584726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460857
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| | ||    
T  20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
Q  147 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctttcttcttatgatg 20460857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 243
Target Start/End: Original strand, 16208443 - 16208531
Alignment:
Q  155 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatgatg 243  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16208443 tgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctttcttcttatgatg 16208531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 20340642 - 20340718
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20340642 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 20340718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 41793560 - 41793598
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41793560 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttg 41793598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 7536 - 7749
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7536 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 7635  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7636 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 7735  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  7736 tcttgtggtgtcca 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 26499 - 26712
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26499 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26598  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26599 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 26698  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  26699 tcttgtggtgtcca 26712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 26454 - 26492
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26454 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 26492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 15227 - 15440
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  15227 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 15326  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15327 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 15426  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  15427 tcttgtggtgtcca 15440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15182 - 15220
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15182 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 15220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 9363 - 9576
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9363 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 9462  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9463 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 9562  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  9563 tcttgtggtgtcca 9576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19974 - 19807
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19974 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 19875  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctcc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  19874 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7896 - 7683
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7896 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 7797  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7796 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttct 7697  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  7696 tcttgtggtgtcca 7683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5940 - 5735
Alignment:
Q  43 aattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaat-ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5940 aattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggta 5841  T
Q  142 tgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca-tggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttatg 240  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5840 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtg 5742  T
Q  241 atgtcca 247  Q
     ||||||    
T  5741 gtgtcca 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 7978
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8191 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 8092  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8091 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 7992  T
Q  234 tcttatgatgtcca 247  Q
    |||| || ||||||    
T  7991 tcttgtggtgtcca 7978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 30 - 204
Alignment:
Q  34 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 129  T
Q  134 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgac 208  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  130 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21522 - 21317
Alignment:
Q  38 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  21522 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 21423  T
Q  138 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 237  Q
    |||| | |||||  |  || |  |||||||| || ||||||||||||| |||||||  || ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  21422 ggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 21323  T
Q  238 atgatg 243  Q
    ||||||    
T  21322 atgatg 21317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3041
Alignment:
Q  47 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtaatgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2965 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University