View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7851_low_12 (Length: 361)

Name: NF7851_low_12
Description: NF7851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7851_low_12
NF7851_low_12
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (15-361)||(27187606-27187952)
chr6 (15-361)||(27261288-27261634)
chr6 (17-360)||(2874570-2874913)
chr6 (15-361)||(1542849-1543195)
chr6 (17-357)||(24312935-24313275)
chr6 (17-361)||(25112722-25113066)
chr6 (15-361)||(28292137-28292483)
chr6 (17-357)||(29591687-29592027)
chr6 (15-361)||(28262962-28263308)
chr6 (15-361)||(28341711-28342057)
chr6 (17-357)||(16626484-16626824)
chr6 (17-357)||(5838986-5839326)
chr6 (20-361)||(19864857-19865198)
chr6 (29-361)||(25609640-25609972)
chr6 (26-361)||(16927416-16927751)
chr6 (22-361)||(22434039-22434378)
chr6 (26-361)||(27331209-27331544)
chr6 (26-361)||(27391949-27392284)
chr6 (38-325)||(17032589-17032876)
chr6 (26-361)||(18407718-18408054)
chr6 (38-361)||(22078478-22078799)
chr6 (26-361)||(22762231-22762566)
chr6 (38-361)||(16963155-16963478)
chr6 (26-361)||(23078639-23078974)
chr6 (26-361)||(14381243-14381578)
chr6 (26-360)||(25768362-25768696)
chr6 (91-360)||(1640943-1641212)
chr6 (26-361)||(17415656-17415991)
chr6 (26-361)||(19453590-19453925)
chr6 (26-360)||(21471772-21472106)
chr6 (26-360)||(34645362-34645696)
chr6 (26-357)||(19879472-19879803)
chr6 (27-361)||(28282590-28282924)
chr6 (27-357)||(27560394-27560724)
chr6 (26-353)||(5296982-5297308)
chr6 (26-361)||(21563908-21564243)
chr6 (26-361)||(22796408-22796743)
chr6 (26-360)||(10468625-10468959)
chr6 (27-348)||(27559765-27560086)
chr6 (29-360)||(24364583-24364914)
chr6 (22-360)||(11280277-11280615)
chr6 (231-361)||(12498196-12498326)
chr6 (231-361)||(12510575-12510705)
chr6 (26-359)||(18794862-18795195)
chr6 (26-242)||(15896383-15896599)
chr6 (29-360)||(15459507-15459838)
chr6 (231-361)||(12505525-12505655)
chr6 (26-245)||(21569767-21569986)
chr6 (17-132)||(21836964-21837079)
chr6 (26-179)||(8762709-8762862)
chr6 (26-117)||(20637077-20637168)
chr6 (26-132)||(18197504-18197610)
chr6 (275-361)||(25765315-25765401)
chr6 (213-361)||(8766111-8766259)
chr6 (38-360)||(16382161-16382483)
chr6 (38-360)||(18837696-18838018)
chr6 (22-88)||(22442710-22442776)
chr6 (212-359)||(18801114-18801261)
chr6 (38-361)||(25742876-25743199)
chr6 (251-361)||(15078365-15078475)
chr6 (38-360)||(23996419-23996741)
chr6 (252-360)||(1648786-1648894)
chr6 (38-361)||(16098220-16098543)
chr6 (283-360)||(16233380-16233457)
chr6 (56-141)||(23027522-23027607)
chr6 (251-330)||(1652274-1652353)
chr6 (311-361)||(18197608-18197658)
chr6 (38-159)||(21927577-21927698)
chr6 (38-158)||(1648602-1648722)
chr6 (80-228)||(14625068-14625216)
chr6 (38-361)||(18571821-18572144)
chr6 (283-357)||(21412971-21413045)
chr6 (253-361)||(25655652-25655760)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (17-361)||(37291300-37291644)
chr5 (15-357)||(34566736-34567078)
chr5 (15-357)||(16356744-16357086)
chr5 (17-357)||(19770202-19770542)
chr5 (17-361)||(22332691-22333035)
chr5 (17-357)||(27668294-27668634)
chr5 (17-361)||(27685204-27685548)
chr5 (17-357)||(40709022-40709362)
chr5 (15-357)||(27518649-27518991)
chr5 (38-361)||(29475898-29476221)
chr5 (17-361)||(14999543-14999887)
chr5 (17-361)||(22134906-22135250)
chr5 (17-357)||(27610596-27610936)
chr5 (17-361)||(22348661-22349005)
chr5 (17-357)||(41771084-41771424)
chr5 (20-361)||(23573980-23574321)
chr5 (38-357)||(23516783-23517102)
chr5 (17-361)||(18776015-18776352)
chr5 (45-361)||(20798998-20799314)
chr5 (26-361)||(21339099-21339434)
chr5 (58-359)||(23440465-23440766)
chr5 (29-361)||(25423427-25423759)
chr5 (26-361)||(21497850-21498184)
chr5 (26-361)||(23471467-23471802)
chr5 (26-361)||(20467909-20468244)
chr5 (26-359)||(21563786-21564119)
chr5 (26-361)||(26738540-26738853)
chr5 (29-360)||(24749370-24749701)
chr5 (26-361)||(22235733-22236068)
chr5 (26-361)||(22381419-22381754)
chr5 (29-360)||(22502900-22503231)
chr5 (156-361)||(21984248-21984453)
chr5 (29-360)||(14886807-14887138)
chr5 (26-360)||(21831574-21831890)
chr5 (26-361)||(23079902-23080237)
chr5 (26-360)||(21890572-21890906)
chr5 (136-360)||(21405059-21405285)
chr5 (29-360)||(25848296-25848627)
chr5 (29-360)||(20342503-20342834)
chr5 (53-360)||(37545336-37545643)
chr5 (29-360)||(24798213-24798544)
chr5 (27-361)||(17269148-17269481)
chr5 (62-360)||(22462173-22462471)
chr5 (104-335)||(919-1150)
chr5 (26-329)||(28923581-28923884)
chr5 (26-329)||(20821705-20822008)
chr5 (29-264)||(24716342-24716577)
chr5 (38-329)||(20774012-20774302)
chr5 (26-317)||(28916226-28916517)
chr5 (29-258)||(24620111-24620340)
chr5 (26-329)||(28894755-28895058)
chr5 (26-258)||(21496481-21496713)
chr5 (26-140)||(21407597-21407711)
chr5 (38-357)||(21937013-21937332)
chr5 (38-360)||(24581432-24581753)
chr5 (38-359)||(27011306-27011627)
chr5 (260-360)||(24735658-24735758)
chr5 (38-186)||(25244175-25244323)
chr5 (38-186)||(25308327-25308475)
chr5 (251-360)||(11210732-11210841)
chr5 (272-348)||(21229232-21229308)
chr5 (236-306)||(21680429-21680499)
chr5 (125-186)||(16065604-16065665)
chr5 (71-187)||(23503837-23503952)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (15-361)||(109434-109780)
scaffold0029 (26-360)||(95636-95970)
scaffold0029 (26-357)||(112900-113231)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (15-361)||(18178037-18178383)
chr7 (15-357)||(8198927-8199269)
chr7 (15-357)||(10871294-10871636)
chr7 (15-357)||(44790980-44791322)
chr7 (17-361)||(15160688-15161032)
chr7 (17-361)||(16947-17291)
chr7 (17-361)||(11236844-11237188)
chr7 (17-361)||(13686359-13686703)
chr7 (15-361)||(12687796-12688142)
chr7 (17-357)||(8707904-8708244)
chr7 (17-361)||(9596352-9596696)
chr7 (17-357)||(14332696-14333036)
chr7 (17-357)||(18551389-18551729)
chr7 (15-361)||(11552731-11553077)
chr7 (15-361)||(14954915-14955261)
chr7 (23-361)||(15154294-15154632)
chr7 (26-361)||(14039991-14040326)
chr7 (26-361)||(14350021-14350356)
chr7 (26-348)||(21662269-21662591)
chr7 (137-361)||(23516520-23516744)
chr7 (26-361)||(11771881-11772216)
chr7 (26-361)||(15624847-15625182)
chr7 (26-360)||(12206418-12206752)
chr7 (26-361)||(15102221-15102556)
chr7 (26-361)||(13021653-13021988)
chr7 (26-361)||(14263862-14264197)
chr7 (26-361)||(14285994-14286329)
chr7 (26-360)||(11388046-11388380)
chr7 (26-357)||(6413811-6414142)
chr7 (29-360)||(8211749-8212080)
chr7 (26-361)||(13665833-13666168)
chr7 (26-361)||(16071912-16072247)
chr7 (26-361)||(16950089-16950424)
chr7 (29-360)||(23505491-23505822)
chr7 (27-361)||(14130169-14130503)
chr7 (27-361)||(18053572-18053906)
chr7 (26-361)||(1025-1360)
chr7 (29-360)||(11305884-11306215)
chr7 (29-360)||(49152598-49152929)
chr7 (27-361)||(14433987-14434321)
chr7 (26-360)||(19147508-19147842)
chr7 (26-360)||(20746907-20747241)
chr7 (83-360)||(23199418-23199695)
chr7 (146-359)||(15204176-15204389)
chr7 (26-361)||(12455998-12456333)
chr7 (29-360)||(13968289-13968620)
chr7 (29-360)||(26118226-26118557)
chr7 (27-361)||(15340727-15341061)
chr7 (15-141)||(23203242-23203368)
chr7 (15-141)||(23509369-23509495)
chr7 (182-360)||(35964646-35964824)
chr7 (138-361)||(12457075-12457298)
chr7 (38-357)||(14936646-14936965)
chr7 (38-357)||(7824199-7824518)
chr7 (38-357)||(27107426-27107745)
chr7 (38-357)||(15364239-15364558)
chr7 (38-228)||(4440356-4440546)
chr7 (38-361)||(21674185-21674508)
chr7 (38-159)||(17924148-17924269)
chr7 (45-153)||(23641951-23642059)
chr7 (80-208)||(45147003-45147131)
chr7 (283-354)||(12368473-12368544)
chr7 (64-186)||(15171642-15171764)
chr7 (30-109)||(40790-40869)
chr7 (62-120)||(17144936-17144994)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (15-357)||(15589251-15589593)
chr3 (15-357)||(20061913-20062255)
chr3 (26-361)||(53384888-53385223)
chr3 (15-357)||(16635702-16636044)
chr3 (15-357)||(43163026-43163368)
chr3 (17-361)||(14876360-14876704)
chr3 (15-357)||(10005529-10005871)
chr3 (15-361)||(16756444-16756790)
chr3 (15-357)||(48425376-48425718)
chr3 (17-361)||(12498173-12498517)
chr3 (17-361)||(16806787-16807131)
chr3 (15-357)||(10906139-10906481)
chr3 (17-357)||(15348106-15348446)
chr3 (17-361)||(15724795-15725139)
chr3 (20-361)||(16371338-16371679)
chr3 (17-357)||(13252619-13252959)
chr3 (17-361)||(15402371-15402715)
chr3 (17-361)||(16412143-16412487)
chr3 (17-357)||(5424791-5425131)
chr3 (17-361)||(15339194-15339538)
chr3 (17-361)||(26792260-26792604)
chr3 (17-361)||(16692085-16692433)
chr3 (15-361)||(6600672-6601007)
chr3 (26-361)||(9522644-9522979)
chr3 (20-327)||(11564545-11564852)
chr3 (26-357)||(17489779-17490110)
chr3 (26-306)||(14126464-14126744)
chr3 (26-356)||(16492051-16492381)
chr3 (26-361)||(15248072-15248407)
chr3 (26-361)||(15208816-15209151)
chr3 (20-265)||(15061777-15062022)
chr3 (26-360)||(15227585-15227919)
chr3 (26-360)||(13971979-13972313)
chr3 (26-360)||(14086609-14086943)
chr3 (34-353)||(15015634-15015941)
chr3 (26-361)||(17492565-17492900)
chr3 (26-360)||(15952827-15953161)
chr3 (26-361)||(11303632-11303967)
chr3 (26-361)||(12360401-12360736)
chr3 (29-360)||(28754254-28754585)
chr3 (27-361)||(8758942-8759276)
chr3 (26-360)||(12850138-12850472)
chr3 (26-336)||(14573889-14574199)
chr3 (27-361)||(16836370-16836704)
chr3 (27-361)||(41177457-41177791)
chr3 (29-357)||(13941963-13942291)
chr3 (26-361)||(13322511-13322846)
chr3 (32-361)||(4678373-4678702)
chr3 (29-360)||(10383905-10384235)
chr3 (27-354)||(44777189-44777516)
chr3 (27-360)||(16380788-16381121)
chr3 (36-361)||(18134215-18134540)
chr3 (125-361)||(11960992-11961228)
chr3 (29-360)||(47123880-47124211)
chr3 (29-360)||(10419907-10420238)
chr3 (26-361)||(16329520-16329853)
chr3 (134-360)||(13001845-13002070)
chr3 (122-361)||(26008948-26009187)
chr3 (26-180)||(16828061-16828215)
chr3 (26-246)||(16338371-16338591)
chr3 (38-360)||(8274281-8274603)
chr3 (39-360)||(15576686-15577007)
chr3 (38-360)||(16742585-16742907)
chr3 (38-357)||(6152733-6153052)
chr3 (283-360)||(13975172-13975249)
chr3 (45-228)||(18748733-18748916)
chr3 (286-361)||(6712539-6712614)
chr3 (38-208)||(13967222-13967392)
chr3 (283-357)||(17193033-17193107)
chr3 (71-165)||(17193224-17193318)
chr3 (283-357)||(18748604-18748678)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (15-357)||(10868791-10869133)
chr2 (15-357)||(9610077-9610419)
chr2 (15-357)||(16982093-16982435)
chr2 (15-357)||(16998941-16999283)
chr2 (15-357)||(17063658-17064000)
chr2 (15-357)||(17067316-17067658)
chr2 (17-361)||(41608547-41608891)
chr2 (17-357)||(44385731-44386071)
chr2 (15-357)||(27217957-27218299)
chr2 (17-361)||(24262307-24262651)
chr2 (17-357)||(22325018-22325358)
chr2 (17-357)||(24709974-24710314)
chr2 (26-361)||(23188945-23189279)
chr2 (17-357)||(27371210-27371550)
chr2 (20-361)||(24707647-24707988)
chr2 (20-357)||(21325431-21325768)
chr2 (20-357)||(24675430-24675767)
chr2 (15-359)||(21145201-21145534)
chr2 (29-361)||(23064014-23064346)
chr2 (20-353)||(22756630-22756963)
chr2 (26-360)||(30211088-30211422)
chr2 (26-360)||(45529449-45529783)
chr2 (45-361)||(24825472-24825788)
chr2 (180-357)||(16925201-16925378)
chr2 (26-360)||(27365250-27365584)
chr2 (26-330)||(23293926-23294230)
chr2 (26-361)||(23276713-23277048)
chr2 (179-361)||(24878319-24878501)
chr2 (26-361)||(19652223-19652555)
chr2 (15-177)||(16923010-16923172)
chr2 (15-179)||(16925479-16925643)
chr2 (17-172)||(20442675-20442830)
chr2 (17-184)||(24876911-24877078)
chr2 (27-361)||(12574290-12574624)
chr2 (29-360)||(20832923-20833254)
chr2 (27-361)||(27787678-27788012)
chr2 (26-323)||(24948564-24948861)
chr2 (29-360)||(31830596-31830927)
chr2 (29-330)||(20828227-20828528)
chr2 (29-360)||(1063689-1064020)
chr2 (38-360)||(11358057-11358379)
chr2 (137-360)||(23087388-23087611)
chr2 (29-207)||(21125331-21125509)
chr2 (26-114)||(23107901-23107989)
chr2 (26-141)||(23110892-23111007)
chr2 (26-180)||(24641860-24642014)
chr2 (38-360)||(22276217-22276538)
chr2 (38-187)||(25128758-25128907)
chr2 (93-361)||(23817291-23817559)
chr2 (38-359)||(24569851-24570172)
chr2 (38-360)||(24831370-24831692)
chr2 (251-360)||(12640315-12640424)
chr2 (38-357)||(22761752-22762071)
chr2 (251-327)||(23890753-23890829)
chr2 (252-360)||(25128585-25128693)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (17-357)||(16350293-16350633)
chr1 (17-361)||(19106688-19107032)
chr1 (17-357)||(51333187-51333527)
chr1 (17-361)||(17044709-17045053)
chr1 (17-357)||(21837275-21837615)
chr1 (17-357)||(33390723-33391063)
chr1 (17-361)||(21830624-21830968)
chr1 (17-361)||(16078350-16078690)
chr1 (56-357)||(41354202-41354503)
chr1 (38-361)||(50619959-50620282)
chr1 (26-359)||(16369620-16369953)
chr1 (26-273)||(21749350-21749597)
chr1 (26-361)||(19760569-19760904)
chr1 (154-361)||(20250171-20250378)
chr1 (26-246)||(22361947-22362167)
chr1 (144-359)||(20137101-20137316)
chr1 (29-361)||(19854635-19854966)
chr1 (29-360)||(37677402-37677733)
chr1 (24-361)||(22432817-22433154)
chr1 (26-361)||(20835591-20835926)
chr1 (30-361)||(20939770-20940101)
chr1 (26-297)||(24099306-24099577)
chr1 (29-360)||(20294734-20295065)
chr1 (96-359)||(41308148-41308411)
chr1 (38-360)||(20856476-20856798)
chr1 (26-330)||(19662844-19663143)
chr1 (29-276)||(31539703-31539950)
chr1 (26-151)||(20139361-20139486)
chr1 (38-108)||(20250376-20250446)
chr1 (281-359)||(21747857-21747935)
chr1 (38-357)||(20831107-20831426)
chr1 (283-360)||(20914532-20914609)
chr1 (278-360)||(31550136-31550218)
chr1 (38-187)||(22135272-22135421)
chr1 (18-63)||(41353357-41353402)
chr1 (38-228)||(20914664-20914854)
chr1 (71-180)||(20184683-20184792)
chr1 (285-361)||(22135520-22135596)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (15-357)||(8386722-8387064)
chr4 (15-361)||(12523982-12524328)
chr4 (15-357)||(29038764-29039106)
chr4 (17-361)||(14303340-14303684)
chr4 (15-357)||(12476910-12477252)
chr4 (17-357)||(18297515-18297855)
chr4 (17-357)||(27711646-27711986)
chr4 (15-361)||(14680873-14681219)
chr4 (17-361)||(40473346-40473690)
chr4 (19-357)||(19778157-19778495)
chr4 (17-357)||(8052985-8053325)
chr4 (17-361)||(18226808-18227152)
chr4 (20-361)||(15147249-15147590)
chr4 (20-361)||(16251810-16252151)
chr4 (17-357)||(23956057-23956397)
chr4 (26-361)||(16354816-16355151)
chr4 (23-361)||(1639793-1640131)
chr4 (23-357)||(7090742-7091076)
chr4 (26-360)||(8706225-8706559)
chr4 (124-361)||(14266368-14266605)
chr4 (26-361)||(14850737-14851072)
chr4 (26-360)||(15414657-15414991)
chr4 (26-360)||(15077942-15078276)
chr4 (26-361)||(1648908-1649243)
chr4 (26-361)||(15246230-15246565)
chr4 (26-361)||(15358721-15359056)
chr4 (26-361)||(20891288-20891623)
chr4 (26-216)||(14691353-14691543)
chr4 (29-360)||(3264428-3264759)
chr4 (29-360)||(29453171-29453502)
chr4 (26-360)||(15002995-15003329)
chr4 (26-360)||(27900693-27901027)
chr4 (29-360)||(11206865-11207196)
chr4 (26-361)||(33223224-33223564)
chr4 (29-360)||(44661500-44661831)
chr4 (204-361)||(14159798-14159955)
chr4 (26-167)||(14159970-14160111)
chr4 (26-177)||(15319641-15319792)
chr4 (122-361)||(16146218-16146459)
chr4 (218-360)||(15070720-15070862)
chr4 (221-361)||(14652614-14652754)
chr4 (38-360)||(14997623-14997945)
chr4 (212-361)||(51605998-51606147)
chr4 (80-357)||(13247955-13248232)
chr4 (251-360)||(15293013-15293122)
chr4 (38-360)||(9291142-9291464)
chr4 (80-361)||(12342548-12342829)
chr4 (29-169)||(18549694-18549834)
chr4 (251-357)||(55375214-55375320)
chr4 (126-165)||(15423974-15424013)
chr4 (251-361)||(16685559-16685669)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (17-361)||(14697-15041)
scaffold0044 (17-361)||(957-1301)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (15-361)||(43491-43837)
scaffold0028 (17-361)||(15284-15617)
scaffold0028 (17-359)||(8824-9155)
scaffold0028 (26-360)||(50148-50482)
scaffold0028 (45-357)||(106226-106538)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (17-357)||(755-1095)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (17-357)||(19113066-19113406)
chr8 (17-361)||(30313209-30313553)
chr8 (36-361)||(15533752-15534077)
chr8 (17-361)||(18856949-18857293)
chr8 (38-361)||(22133127-22133450)
chr8 (19-357)||(17674090-17674428)
chr8 (17-359)||(22120239-22120581)
chr8 (17-355)||(32600522-32600860)
chr8 (17-357)||(22046749-22047089)
chr8 (38-361)||(16408131-16408454)
chr8 (17-357)||(22040235-22040575)
chr8 (56-357)||(19484974-19485275)
chr8 (38-361)||(22164278-22164600)
chr8 (67-357)||(20017865-20018155)
chr8 (26-361)||(21921809-21922144)
chr8 (20-357)||(21166606-21166942)
chr8 (17-361)||(19978339-19978683)
chr8 (26-361)||(23650413-23650748)
chr8 (26-355)||(21788433-21788761)
chr8 (26-357)||(21251317-21251648)
chr8 (26-355)||(21393939-21394268)
chr8 (26-360)||(22377528-22377861)
chr8 (26-360)||(22383703-22384036)
chr8 (28-361)||(23949291-23949624)
chr8 (38-360)||(20388472-20388794)
chr8 (26-359)||(22987575-22987903)
chr8 (26-361)||(20396199-20396534)
chr8 (26-361)||(20975725-20976060)
chr8 (26-361)||(31416548-31416883)
chr8 (38-360)||(19851784-19852106)
chr8 (38-360)||(19857820-19858142)
chr8 (26-360)||(23655300-23655634)
chr8 (26-361)||(1266610-1266945)
chr8 (26-361)||(22061507-22061842)
chr8 (27-361)||(22051235-22051569)
chr8 (29-360)||(14565515-14565846)
chr8 (29-360)||(803750-804081)
chr8 (29-356)||(16271301-16271628)
chr8 (26-361)||(29303500-29303835)
chr8 (27-361)||(31570917-31571251)
chr8 (29-360)||(6604031-6604362)
chr8 (29-360)||(6679484-6679815)
chr8 (29-360)||(12305131-12305462)
chr8 (26-360)||(20009974-20010308)
chr8 (26-360)||(21840790-21841124)
chr8 (26-302)||(22371371-22371647)
chr8 (29-246)||(27355035-27355252)
chr8 (17-144)||(22129005-22129132)
chr8 (38-360)||(21850423-21850745)
chr8 (38-360)||(16877181-16877503)
chr8 (38-357)||(21196588-21196907)
chr8 (38-361)||(22315563-22315886)
chr8 (38-361)||(22982806-22983128)
chr8 (38-357)||(23157098-23157416)
chr8 (254-360)||(20652635-20652741)
chr8 (18-63)||(19484130-19484175)
chr8 (38-187)||(23900822-23900971)
chr8 (24-150)||(19863639-19863765)
chr8 (24-150)||(19868276-19868402)
chr8 (284-333)||(19863457-19863506)
chr8 (284-333)||(19868094-19868143)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (17-359)||(12826-13168)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (17-361)||(8127-8471)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (17-359)||(7736-8078)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (17-361)||(4030-4374)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (17-361)||(7276-7620)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (17-361)||(8933-9277)
scaffold0109 (17-361)||(33198-33542)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (17-361)||(65742-66086)
scaffold0042 (38-357)||(39466-39784)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (17-354)||(17785-18122)
scaffold0106 (26-357)||(14380-14711)
scaffold0106 (26-359)||(31749-32082)
scaffold0106 (26-94)||(18489-18557)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (17-361)||(22204-22548)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (17-361)||(7714-8047)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (20-357)||(278458-278795)
scaffold0005 (27-361)||(260645-260979)
scaffold0005 (221-361)||(164538-164678)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (26-357)||(6713-7044)
scaffold0403 (31-336)||(3153-3458)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (26-360)||(6361-6695)
scaffold0120 (26-361)||(1158-1493)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (20-359)||(63659-63998)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (20-357)||(451-788)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (21-357)||(6355-6691)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (26-361)||(33-368)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (24-361)||(1013-1350)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (26-357)||(5562-5893)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (38-357)||(6390-6709)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (26-361)||(49830-50165)
scaffold0081 (20-179)||(19121-19280)
scaffold0081 (20-120)||(34604-34704)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (26-359)||(15994-16327)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (26-357)||(7963-8293)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (26-361)||(229380-229715)
scaffold0012 (26-354)||(219051-219379)
scaffold0012 (62-186)||(32667-32791)
scaffold0012 (251-360)||(32856-32965)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (20-318)||(197106-197404)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (26-361)||(328-663)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (26-357)||(9311-9642)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (26-361)||(9680-10015)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (38-361)||(1336-1659)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (26-314)||(130532-130820)
scaffold0023 (23-361)||(4085-4423)
scaffold0023 (26-353)||(59099-59426)
scaffold0023 (20-176)||(29008-29163)
scaffold0023 (212-314)||(134626-134728)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (26-361)||(14713-15048)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (26-360)||(203102-203436)
scaffold0004 (26-361)||(112358-112693)
scaffold0004 (26-361)||(117905-118240)
scaffold0004 (26-360)||(386157-386491)
scaffold0004 (26-357)||(323045-323376)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (26-361)||(32387-32721)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (26-361)||(25353-25688)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (20-258)||(4727-4965)
scaffold0761 (38-360)||(32-354)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (20-361)||(180554-180877)
scaffold0020 (26-304)||(101186-101464)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (23-360)||(24702-25039)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (26-361)||(1245-1580)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (26-361)||(15214-15549)
scaffold0040 (26-258)||(113121-113353)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (26-361)||(1602-1937)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (26-360)||(5225-5559)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (26-359)||(26167-26500)
scaffold0011 (26-361)||(195338-195672)
scaffold0011 (30-361)||(148907-149238)
scaffold0011 (251-360)||(180262-180371)
scaffold0011 (283-357)||(121841-121915)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (26-361)||(3477-3812)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (146-361)||(46565-46780)
scaffold0007 (36-360)||(86154-86472)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (26-361)||(16050-16385)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (20-267)||(3442-3689)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (26-361)||(116539-116874)
scaffold0037 (101-360)||(98353-98612)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (30-354)||(4376-4699)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (26-266)||(19636-19876)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (26-258)||(390834-391066)
scaffold0001 (26-361)||(90566-90901)
scaffold0001 (83-336)||(114542-114795)
scaffold0001 (242-361)||(448396-448515)
scaffold0001 (26-111)||(89888-89973)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (26-361)||(27562-27897)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (26-306)||(18839-19119)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (29-361)||(41970-42302)
scaffold0010 (30-267)||(2352-2589)
scaffold0010 (26-361)||(47033-47368)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (26-341)||(28402-28717)
scaffold0064 (26-341)||(40393-40708)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (48-361)||(12633-12946)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (102-357)||(12-267)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (26-361)||(20320-20655)
scaffold0298 (26-361)||(12995-13330)
scaffold0298 (26-361)||(16765-17100)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (26-360)||(33311-33645)
scaffold0076 (38-357)||(40599-40918)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (26-358)||(10133-10465)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (26-361)||(43120-43455)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (26-361)||(19457-19792)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (26-360)||(4213-4547)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (26-208)||(25464-25646)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (26-361)||(13535-13870)
scaffold0034 (26-361)||(4587-4922)
scaffold0034 (26-171)||(67897-68042)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (26-360)||(47462-47796)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (104-361)||(126911-127168)
scaffold0022 (26-217)||(80128-80319)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (26-361)||(18171-18506)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (26-361)||(48841-49176)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (26-361)||(51814-52148)
scaffold0067 (26-361)||(60848-61182)
scaffold0067 (26-361)||(67236-67570)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-361)||(248950-249285)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (26-360)||(40077-40410)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (26-360)||(51497-51831)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (26-359)||(6523-6856)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (29-361)||(2992-3324)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (26-361)||(5087-5422)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (26-361)||(21305-21640)
scaffold0235 (251-357)||(26147-26253)
scaffold0235 (80-216)||(26288-26424)
scaffold0235 (26-99)||(11091-11164)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (26-360)||(26480-26814)
scaffold0192 (26-360)||(26862-27196)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (26-359)||(11108-11441)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (56-361)||(27856-28161)
scaffold0139 (30-361)||(787-1118)
scaffold0139 (56-180)||(34290-34414)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (149-360)||(1477-1688)
scaffold0894 (26-158)||(2914-3046)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (26-361)||(2131-2466)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (26-361)||(207-541)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (26-361)||(6872-7207)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (26-361)||(48668-49002)
scaffold0053 (86-361)||(57511-57786)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (26-361)||(3088-3423)
scaffold0035 (29-150)||(12833-12954)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (26-360)||(6670-7004)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (26-360)||(866-1200)
scaffold0104 (26-93)||(12582-12649)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (26-361)||(435-770)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (29-360)||(16350-16681)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (39-361)||(37539-37861)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (26-255)||(11302-11531)
scaffold0149 (26-246)||(6871-7091)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (26-361)||(5550-5885)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (77-360)||(10425-10708)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (26-361)||(5086-5421)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (26-267)||(2509-2750)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (38-359)||(25511-25832)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (39-321)||(4945-5227)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (26-361)||(38-368)
scaffold0124 (26-361)||(11225-11560)
scaffold0124 (38-360)||(7456-7778)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (26-361)||(43842-44177)
scaffold0114 (26-361)||(44854-45189)
scaffold0114 (83-361)||(20459-20737)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (26-361)||(5969-6306)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (38-360)||(19187-19509)
scaffold0090 (38-360)||(23349-23671)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (91-356)||(9782-10047)
scaffold0483 (26-132)||(12060-12166)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (26-361)||(26598-26933)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (27-361)||(12420-12750)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (26-177)||(1988-2139)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (26-270)||(41347-41589)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (38-307)||(1618-1887)
scaffold0249 (302-359)||(4912-4969)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (240-361)||(628-749)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (38-354)||(880-1196)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (135-361)||(13994-14220)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (64-361)||(226-523)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (27-180)||(844-997)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (26-244)||(4884-5102)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (225-361)||(339-475)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (26-144)||(4425-4543)
scaffold0270 (26-144)||(11555-11673)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (26-228)||(68225-68427)
scaffold0066 (38-360)||(46492-46814)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (26-266)||(32953-33193)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (38-361)||(7505-7828)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (65-180)||(17877-17992)
scaffold0244 (194-355)||(25959-26120)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (234-360)||(5756-5882)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (235-361)||(17324-17450)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (26-111)||(39645-39730)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (26-99)||(8721-8794)
scaffold0138 (302-361)||(16375-16434)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (38-360)||(23732-24054)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (218-330)||(136278-136390)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (38-357)||(3521-3840)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (20-99)||(24097-24176)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (30-153)||(81470-81593)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (45-187)||(11167-11309)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (38-333)||(3524-3818)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (38-357)||(14383-14702)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (38-357)||(13249-13568)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (38-180)||(5693-5835)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (38-228)||(9507-9697)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (38-208)||(18541-18711)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (252-357)||(71560-71665)
scaffold0021 (38-153)||(33059-33174)
scaffold0021 (38-132)||(24529-24623)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (38-357)||(14478-14798)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (269-361)||(38764-38856)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (38-361)||(24217-24540)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (38-360)||(3590-3912)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (38-165)||(700-827)
scaffold0808 (251-359)||(913-1021)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (38-217)||(3565-3744)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (253-357)||(2897-3001)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (261-361)||(1293-1393)
scaffold0117 (80-208)||(1112-1240)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (38-217)||(44019-44198)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (38-217)||(27912-28091)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (251-330)||(17-96)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (251-361)||(9324-9434)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (236-306)||(33952-34022)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (26-99)||(2187-2260)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (26-111)||(470-555)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (249-357)||(8748-8856)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (45-141)||(19-115)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27187952 - 27187606
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187952 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27187853  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187852 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27187753  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27187752 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27187653  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27187652 ctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 27187606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 27261288 - 27261634
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261288 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27261387  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261388 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27261487  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27261488 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27261587  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27261588 ctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 27261634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Original strand, 2874570 - 2874913
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874570 atcaaggagattgtgaacttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 2874669  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874670 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 2874769  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2874770 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 2874869  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2874870 ttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtc 2874913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 1542849 - 1543195
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542849 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 1542948  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1542949 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgt 1543048  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543049 gttcttgagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 1543148  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1543149 ctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgctggtttgagtca 1543195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 24312935 - 24313275
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24312935 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 24313034  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313035 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 24313134  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313135 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 24313234  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313235 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 24313275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25113066 - 25112722
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25113066 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 25112967  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112966 tgggttcgaagttgagattaagttcggcctatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 25112867  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25112866 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 25112767  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25112766 ttatatggtcggagatgcagaattccgttatgctggtttgagtca 25112722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 28292137 - 28292483
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292137 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 28292236  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28292237 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgt 28292336  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292337 gttcttgagcaaggaggaacttcggacagtcatcttccattgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 28292436  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28292437 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 28292483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 29591687 - 29592027
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29591687 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgtcccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 29591786  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591787 tgggttcgaagttgagagtgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 29591886  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29591887 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagct 29591986  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29591987 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 29592027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 28262962 - 28263308
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262962 acatcaaagagattttgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 28263061  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28263062 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgt 28263161  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263162 gttcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 28263261  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28263262 ctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 28263308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 28341711 - 28342057
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341711 acatcaaagagattttgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 28341810  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28341811 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgt 28341910  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341911 gttcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 28342010  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28342011 ctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 28342057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 16626484 - 16626824
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626484 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 16626583  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16626584 tgggttcaaagatgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaaatttgtgt 16626683  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16626684 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagct 16626783  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626784 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 5838986 - 5839326
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5838986 atcaaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagttagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 5839085  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5839086 tgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgt 5839185  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  5839186 tcttgagcagggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggct 5839285  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5839286 ttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttga 5839326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19865198 - 19864857
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19865198 aaggagattgtgaagtttcatggtgttcctacgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 19865099  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19865098 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggataggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 19864999  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||     
T  19864998 tgagcaaggaggaacctgggctagtcatcttccgttgattgagttcacgtataataatagttatcattttggtattggaatggcaccttttgcggcttta 19864899  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19864898 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 19864857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 25609640 - 25609972
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25609640 gtgaagttgcatggtgttccttcgaccattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagt 25609739  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25609740 tgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagg 25609839  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  25609840 aggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgatgctttgtatggtcgg 25609939  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25609940 agatgcagaactccattgtgttggtttgagtca 25609972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16927416 - 16927751
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  16927416 attgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcaaatagagacccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtacca 16927515  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  16927516 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgaggatttgtgtgctagagca 16927615  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16927616 agctggaacttgggacagtcatctcccgttaatagagttcacgtataacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggt 16927715  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16927716 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 16927751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22434378 - 22434039
Alignment:
Q  22 ggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggc 121  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22434378 ggaaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctggattttggaagagtttgcaagaggctttgggt 22434279  T
Q  122 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttg 221  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  22434278 tctaagttgagattgagttcagcgtatcatccgcagacagatgattagtcggagaggacgattaagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgtacttg 22434179  T
Q  222 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgta 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22434178 agcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacttacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttata 22434079  T
Q  322 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22434078 tggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 22434039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 27331209 - 27331544
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  27331209 attgtgaagttgcatggtgttctttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgagttcta 27331308  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27331309 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagca 27331408  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27331409 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 27331508  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27331509 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 27331544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 27391949 - 27392284
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  27391949 attgtgaagttgcatggtgttctttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgagttcta 27392048  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27392049 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagca 27392148  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27392149 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 27392248  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27392249 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 27392284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 38 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17032876 - 17032589
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17032876 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 17032777  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17032776 gttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttg 17032677  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  17032676 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacactaatagttatcattctagtatcagaatggcaccttttgaagctttatatggt 17032589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 18407718 - 18408054
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18407718 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacgtctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 18407817  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18407818 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagagggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 18407917  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacata-taacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatgg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  18407918 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaaatactagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttatatgg 18408017  T
Q  325 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18408018 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 18408054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 22078478 - 22078799
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22078478 catggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggctctaagttgaggttga 22078577  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||    
T  22078578 gttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgctggaagatttgttgaaagtttgtgaactcgagcaaggaggaacttg 22078677  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| || || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22078678 ggatagtcatcttccattgataaagttcacgtacaataatagttat--ttctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaga 22078775  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  22078776 actccgttgtgttggtttgagtca 22078799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 22762231 - 22762566
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |    
T  22762231 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgccagaggctttaggttata 22762330  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  22762331 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaactgatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagga 22762430  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  22762431 aggaggaacttgagatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgagactttgtgtggt 22762530  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22762531 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 22762566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 16963155 - 16963478
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||    
T  16963155 catggtgttccttcgagcattatatcagatagagacccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtaccaagttgaggttga 16963254  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||    
T  16963255 gttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagagaatttgttaaggatttgtgtgctagagcaaggtgaaacttg 16963354  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16963355 ggacagtcatctcccgttaatagagttcacgtctaacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaga 16963454  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  16963455 actccgttgtgttgatttgagtca 16963478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23078974 - 23078639
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || |  |    
T  23078974 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttttgaagagtttacaagagtctttaggttata 23078875  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||  | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23078874 agttgaggttgagttcggcgtatcgtccgcagagagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaatacttgttgagagtttgtgtacttgagca 23078775  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23078774 aggaggaacttgggatagtcatcttccatttatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggt 23078675  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23078674 cggagatgcataactccgttgtgttggtttgagtca 23078639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14381243 - 14381578
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14381243 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 14381342  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  14381343 agttgaggttgagttcagcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatcaaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttaagca 14381442  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14381443 aggtggaacttgggacagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 14381542  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  14381543 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 14381578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25768696 - 25768362
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  25768696 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtccgatagagatccgaggtttaattcaagattttggaagagtttccaagatgccttgggttcaa 25768597  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  | ||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  25768596 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaaaacgattcagtcattcgaggatttgctaagagtgtgtgtgcttgagca 25768497  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  25768496 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaactgttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggt 25768397  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25768396 cggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtc 25768362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1641212 - 1640943
Alignment:
Q  91 attttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1641212 attttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcg 1641113  T
Q  191 ctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattcta 290  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  1641112 ttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcga 1641013  T
Q  291 gtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  1641012 gtattggtatggcaccgttcgaagctttgcatggacggaggtgcagaactccgttatgttggtttaagtc 1640943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17415991 - 17415656
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  17415991 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 17415892  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||||||||| ||| | | ||||| ||||||||    
T  17415891 agttgaggttaagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggaggatttgctgatagtgtgtgtacttgagca 17415792  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  17415791 aggtggagcttgggatagtcacctaccgtcgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgatatgacaccgttcgaagctttgtatggt 17415692  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17415691 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 17415656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19453925 - 19453590
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19453925 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 19453826  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||   |||| | ||||| ||||||||    
T  19453825 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgcttgagca 19453726  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| ||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19453725 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcgcatacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19453626  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19453625 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 19453590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21472106 - 21471772
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  21472106 attgtgaagtttcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 21472007  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||  | ||| | ||||| ||||||||    
T  21472006 agttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtgggagagaactattcagtcattagaggactttctaagagtgtgtgtacttgagca 21471907  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  21471906 aggtggagcttgggatagtcatttaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgga 21471807  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21471806 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtc 21471772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 34645362 - 34645696
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  34645362 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagggatccaaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggatcga 34645461  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  34645462 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 34645561  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| | |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  34645562 aggtggagcgtgggatagccacttaccgttgatagaatttacttataacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggt 34645661  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  34645662 cgcagatgcaggactcctttgtgttggtttgagtc 34645696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19879803 - 19879472
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19879803 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 19879704  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  19879703 agttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggacagtcagagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 19879604  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  19879603 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatgga 19879504  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19879503 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttga 19879472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 28282590 - 28282924
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  28282590 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 28282689  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  28282690 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 28282789  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28282790 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 28282889  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28282890 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 28282924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 357
Target Start/End: Original strand, 27560394 - 27560724
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  27560394 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27560493  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  27560494 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 27560593  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27560594 ggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 27560693  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27560694 gaaggtgcaggactccattgtgttggtttga 27560724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Original strand, 5296982 - 5297308
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  5296982 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 5297081  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5297082 aattgaggttgggttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 5297181  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5297182 aggtggagc-tgggatagtcacctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 5297280  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggt 353  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||    
T  5297281 cggaggtgtaggactcctttatgctggt 5297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 21563908 - 21564243
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21563908 attgttaagcttcatggtgtacggtcgagtattgtgtaggatagagattcgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 21564007  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21564008 agttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 21564107  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||    
T  21564108 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacatcaatagttaccattcgagtattggtatggttccgttcgaagctttgtacggt 21564207  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||    
T  21564208 cggaggtgccggactcctttatgttggtttgagtca 21564243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 22796408 - 22796743
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  22796408 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcta 22796507  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  22796508 agttgaggttgagttcggcttatcattcgcaaacatatggtcagtcggagagaacgattcaatcgtcagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 22796607  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |||  |||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||    
T  22796608 aggtggagattgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtacggt 22796707  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  22796708 cggaggtgcaggactcctttatgttgatttgagtca 22796743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 10468625 - 10468959
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  10468625 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttttggaagagtttacaggatgctttgggttcga 10468724  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| || |||||    
T  10468725 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctcgagca 10468824  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| | | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  10468825 aggtgaagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 10468924  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  10468925 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 10468959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 348
Target Start/End: Original strand, 27559765 - 27560086
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  27559765 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27559864  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  27559865 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 27559964  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27559965 ggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 27560064  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtg 348  Q
    | || ||||| ||||| |||||    
T  27560065 gaaggtgcaggactccattgtg 27560086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24364914 - 24364583
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  24364914 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 24364815  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  24364814 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 24364715  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  24364714 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcatcgttcgaagccttgtatggtcgg 24364615  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  24364614 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 24364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 360
Target Start/End: Original strand, 11280277 - 11280615
Alignment:
Q  22 ggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggc 121  Q
    ||||||||||||| | |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11280277 ggaaattgtgaagttgcatggtattacatcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggc 11280376  T
Q  122 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttg 221  Q
    ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||  | ||||| ||||    
T  11280377 tcgaaattgaggctgagttcggcttaccatcctcagaccgatggccagtcagagaggacaatgcaatccttagaagatcttttgagggtgtgtgtacttg 11280476  T
Q  222 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgta 321  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  || || || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  11280477 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgacagaatttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgta 11280576  T
Q  322 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11280577 tgatcgaagatgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 11280615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 231 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12498326 - 12498196
Alignment:
Q  231 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggag 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12498326 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggag 12498227  T
Q  331 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498226 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 12498196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 231 - 361
Target Start/End: Original strand, 12510575 - 12510705
Alignment:
Q  231 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggag 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12510575 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggag 12510674  T
Q  331 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510675 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 12510705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18795195 - 18794862
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  18795195 attgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtactgtgtcagatagagatccgaggttcacttctagattatggaagcgtttgcaagatgctttgggttcga 18795096  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||||  |||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||  |||||||| |  ||||| | ||||| ||||||||    
T  18795095 aattgaggctgagtttggcttatcatcctcatacggatggtcaatcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagca 18794996  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||    
T  18794995 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacctacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccatttgaagccttgtacggt 18794896  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    || || |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  18794895 cgaaggtgcataactcctttgtgttggtttgagt 18794862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15896599 - 15896383
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || || |    
T  15896599 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtatcagatagagatgtgaggtatacttctatattttggaagagtttgcaagaggctgtaggttcta 15896500  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| || |||||    
T  15896499 agttgaagttgagttcggcgtatcatccgcagacagataatcagtcggaaagaatgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtactagagca 15896400  T
Q  226 aggaggaacttgggata 242  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896399 aggaggaacttgggata 15896383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15459838 - 15459507
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||| || || |    
T  15459838 gtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaggagtttacaggacgcgttgggttcaaaat 15459739  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  | ||  | ||||| |||||||| ||    
T  15459738 tgaagttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcaggg 15459639  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  15459638 tggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaataacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcgg 15459539  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || |||||  | || |||||||||||    
T  15459538 aggtgtaggactcctctatgttggtttgagtc 15459507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12505655 - 12505525
Alignment:
Q  231 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggag 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  12505655 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggttttttatggtcggag 12505556  T
Q  331 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505555 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 12505525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 21569767 - 21569986
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21569767 attgttaagcttcatggtgtacggtcgagtattgtgtaggatagagattcgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 21569866  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21569867 agttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 21569966  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtc 245  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21569967 aggtggagcttgggatagtc 21569986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Original strand, 21836964 - 21837079
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21836964 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 21837063  T
Q  117 tgggctcgaagttgag 132  Q
    | || || ||||||||    
T  21837064 taggttctaagttgag 21837079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Original strand, 8762709 - 8762862
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  8762709 attgtgaagctacatggcgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 8762808  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8762809 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagga 8762862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 20637077 - 20637168
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttt 117  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637077 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttt 20637168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 18197504 - 18197610
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  18197504 attgtgaagctacatggtgttccatcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 18197603  T
Q  126 agttgag 132  Q
    |||||||    
T  18197604 agttgag 18197610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 361
Target Start/End: Original strand, 25765315 - 25765401
Alignment:
Q  275 aatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25765315 aatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtca 25765401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 361
Target Start/End: Original strand, 8766111 - 8766259
Alignment:
Q  213 gtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcga 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8766111 gtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcga 8766210  T
Q  313 ggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||||||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  8766211 agctttgtatggttggaggtgcaggactcatttatgctggtttgagtca 8766259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 16382161 - 16382483
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  16382161 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 16382260  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  16382261 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 16382360  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  16382361 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 16382460  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  16382461 acaccgttgtgttggtttgagtc 16382483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 18837696 - 18838018
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  18837696 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaatttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagtttga 18837795  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  18837796 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 18837895  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  18837896 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatccgaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 18837995  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  18837996 acaccgttgtgttggtttgagtc 18838018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22442776 - 22442710
Alignment:
Q  22 ggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttct 88  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22442776 ggaaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttct 22442710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18801261 - 18801114
Alignment:
Q  212 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcg 311  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| || || ||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  18801261 tgtgtactagagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtttatagagttcatttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcctcgttcg 18801162  T
Q  312 aggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  18801161 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 18801114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 25742876 - 25743199
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||  || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  25742876 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatctgaggtttacttctacgttttgggagagtttacaagctgctttgggaactaagttgagattga 25742975  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    | ||  | || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||  ||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  25742976 gatctacttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactatctagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 25743075  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | ||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||     
T  25743076 ggacgaatgtttaccgttaattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggagctgtagg 25743175  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  25743176 acaccgttgtgttggtttgagtca 25743199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 361
Target Start/End: Original strand, 15078365 - 15078475
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  || |||||||| |    
T  15078365 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgatcggaggtgtaagacaccgttgtgtt 15078464  T
Q  351 ggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||    
T  15078465 ggtttgagtca 15078475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23996741 - 23996419
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||  || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  23996741 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatctgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 23996642  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |    |||    
T  23996641 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagatggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttagagcaaggtgttggttg 23996542  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
     ||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  23996541 agacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcactgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtagg 23996442  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  23996441 acaccgttgtgttggtttgagtc 23996419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 360
Target Start/End: Original strand, 1648786 - 1648894
Alignment:
Q  252 cgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 351  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||    
T  1648786 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttg 1648885  T
Q  352 gtttgagtc 360  Q
    |||||||||    
T  1648886 gtttgagtc 1648894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16098543 - 16098220
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| | ||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  16098543 catggtataccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 16098444  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| |||    ||||||| ||||||    | || ||||||||||||  |||| |  | |||||||| |  | |||    
T  16098443 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagaaaaagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtatgttggagcaaggtgttagttg 16098344  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || || ||||| |  | |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||     
T  16098343 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggctccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagg 16098244  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  16098243 acaccgttgtgttggtttgagtca 16098220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16233457 - 16233380
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  16233457 tcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 16233380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 23027522 - 23027607
Alignment:
Q  56 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttc 141  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  23027522 attgtgtcagatagggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagatgctttgggaactaagttgaggttgagttc 23027607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1652353 - 1652274
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggag 330  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  1652353 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggag 1652274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 361
Target Start/End: Original strand, 18197608 - 18197658
Alignment:
Q  311 gaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  18197608 gaggctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttcgtttaagtca 18197658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21927698 - 21927577
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||  | |||||||| ||||    
T  21927698 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgcattgggaactaagttgaggttga 21927599  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagac 159  Q
    |||| || |||||||| |||||    
T  21927598 gttctgcttatcatccccagac 21927577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 158
Target Start/End: Original strand, 1648602 - 1648722
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  1648602 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 1648701  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcaga 158  Q
    |||| || || ||||| ||||    
T  1648702 gttctgcttaccatcctcaga 1648722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 14625068 - 14625216
Alignment:
Q  80 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||| ||    
T  14625068 tttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaaattgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagatga 14625167  T
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  14625168 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaagg 14625216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18572144 - 18571821
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||  || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  18572144 catggtattccttatagtattgtgtcagatcaggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaaccaagttgagattga 18572045  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
     ||| || || ||||| ||||| |||||  |  |||||||||| || ||     | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  18572044 tttctgcttaccatcctcagaccgatgggaaaacggagaggactatccaaagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 18571945  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||     || | | ||| || ||||| || || ||||| || | |||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| |||| || ||     
T  18571944 ggacgaatatttacagttaattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgactccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagg 18571845  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || | |||||| ||||||||||||    
T  18571844 acactgttgtgttggtttgagtca 18571821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 357
Target Start/End: Original strand, 21412971 - 21413045
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||| ||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  21412971 tcattctaatatcggtatggcactgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttga 21413045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25655760 - 25655652
Alignment:
Q  253 gttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 352  Q
    |||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| | ||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || || |   ||||||| |||    
T  25655760 gttgatggagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgaaatgaaaccttttgaggatttgtatggtcggaggtgtaggatgtcgttgtgttgg 25655661  T
Q  353 tttgagtca 361  Q
    |||||||||    
T  25655660 tttgagtca 25655652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 37291300 - 37291644
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291300 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 37291399  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37291400 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgt 37291499  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291500 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 37291599  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291600 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 37291644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34567078 - 34566736
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567078 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 34566979  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566978 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 34566879  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34566878 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 34566779  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34566778 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 34566736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16357086 - 16356744
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357086 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16356987  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356986 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16356887  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16356886 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 16356787  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16356786 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16356744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19770542 - 19770202
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19770542 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 19770443  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770442 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 19770343  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19770342 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 19770243  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19770242 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 19770202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 22332691 - 22333035
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332691 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 22332790  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332791 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagaaagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttcagaatttgtgt 22332890  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22332891 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacagacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 22332990  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332991 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 22333035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 27668294 - 27668634
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27668294 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27668393  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668394 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27668493  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27668494 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 27668593  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668594 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 27668634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 27685204 - 27685548
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685204 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 27685303  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685304 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27685403  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  27685404 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatgacacctttcgaggcc 27685503  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685504 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 27685548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40709362 - 40709022
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40709362 atcaaggagattgttaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 40709263  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709262 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 40709163  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40709162 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 40709063  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40709062 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 40709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27518991 - 27518649
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518991 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27518892  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518891 cttgggttcgaagttgagattgagttcgacgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27518792  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27518791 gttcttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27518692  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518691 ctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 27518649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 29475898 - 29476221
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29475898 catggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttggggttcgaagttgaggttga 29475997  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475998 gttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggattttttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 29476097  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29476098 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 29476197  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29476198 actccgttgtgctggtttgagtca 29476221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 14999543 - 14999887
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999543 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggttt 14999642  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999643 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacatatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 14999742  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999743 tcttgagcaaggaggaatttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgagact 14999842  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999843 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 14999887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22135250 - 22134906
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135250 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 22135151  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22135150 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagagaatttgttgagaatttttgt 22135051  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22135050 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 22134951  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134950 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctagtttgagtca 22134906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27610936 - 27610596
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27610936 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27610837  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610836 tgggttcgaagttgagattgagttcggtgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27610737  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27610736 tcttgagcaaggagggacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 27610637  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610636 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 27610596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22349005 - 22348661
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349005 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 22348906  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  22348905 tgggttcgaagcagagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctcaatgatttgttggggatttgtgt 22348806  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348805 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 22348706  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348705 ttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 22348661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41771424 - 41771084
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41771424 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 41771325  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771324 tgggttcgaagttcagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 41771225  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41771224 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagctcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 41771125  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41771124 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 41771084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23574321 - 23573980
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23574321 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcatttattgatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 23574222  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23574221 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 23574122  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23574121 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 23574022  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23574021 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 23573980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23517102 - 23516783
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  23517102 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttgaaagagtttgcaagagggtttgggttctaagttgagattga 23517003  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23517002 gttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttg 23516903  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23516902 ggataatcatcttccgttgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttggtatggtcggagatgcaga 23516803  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23516802 actccgttgtgctggtttga 23516783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18776352 - 18776015
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18776352 atcaaggagattatgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggcct 18776253  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18776252 taggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaactttgtgt 18776153  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18776152 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtca-------ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggct 18776060  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776059 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 18776015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 45 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20799314 - 20798998
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||    
T  20799314 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaaaagtttgcaagaggttttgggttctaagttgagattgagtttggc 20799215  T
Q  145 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 244  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799214 ttattatccgcggacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 20799115  T
Q  245 catcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgt 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20799114 catcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 20799015  T
Q  345 tgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20799014 tgtgttggtttgagtca 20798998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 21339099 - 21339434
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |    
T  21339099 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggttttaggttcta 21339198  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21339199 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgttagagaacttgttgagagtttgtgtacttgagca 21339298  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21339299 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggt 21339398  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21339399 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 21339434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23440766 - 23440465
Alignment:
Q  58 tgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcag 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23440766 tgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggtgtatcatccgcag 23440667  T
Q  158 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 257  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23440666 acagatggtcagtcggagagaaaaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttccattga 23440567  T
Q  258 tcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440566 ttgagtttacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttcaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 23440467  T
Q  358 gt 359  Q
    ||    
T  23440466 gt 23440465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25423759 - 25423427
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25423759 gtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagt 25423660  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25423659 tgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagacagagaagacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagg 25423560  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25423559 aggaactagggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcgg 25423460  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25423459 agatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 25423427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 21497850 - 21498184
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || |    
T  21497850 attgtgaagttgcatggtgttc-ttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctggattttggaaaattttgcaagaggctttaggttcta 21497948  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21497949 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagccggagagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgtacttgagca 21498048  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21498049 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtaaaataaaagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 21498148  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21498149 cggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtca 21498184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23471802 - 23471467
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |    
T  23471802 attgtgaagctacatggttttccttcaagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgaaagaggctttaggttcta 23471703  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23471702 agttgaggtttagttaggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 23471603  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23471602 agggggaacttgggatagtcatctcccattaatagagttcacgtacaataacagctatcattctagtattggaatggcaccttttgatgctttgtatggt 23471503  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23471502 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 23471467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 20467909 - 20468244
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  20467909 attgtgaagctacatggtgttctgtcaagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 20468008  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20468009 agttgaggttgagttcggcgtattatccgcagacagatggccagtctgaaaggatgattcagtcgttggaggacttgttgagattttgtgtacttgagca 20468108  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||    
T  20468109 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgcatggt 20468208  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20468209 cggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtca 20468244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 21563786 - 21564119
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21563786 attgtgaagctgcatggtgttccatcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcta 21563885  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21563886 agttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacatatggtcagtcggagaaagcgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21563985  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  21563986 aggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggt 21564085  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21564086 cggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagt 21564119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 26738540 - 26738853
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                      |||||| || || |    
T  26738540 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttata----------------------ggctttaggttcta 26738617  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  26738618 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgtacttgagca 26738717  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||| |||| |||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  26738718 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttattattccagtaatggaatggcacaatttaaggctttgtatggt 26738817  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26738818 tggagatgcagaactccattgtgttggttcgagtca 26738853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 24749370 - 24749701
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24749370 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagt 24749469  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24749470 tgaggttgagttcgacttagcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 24749569  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24749570 tggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 24749669  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24749670 aggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 24749701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 22235733 - 22236068
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  22235733 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgctttgggttcaa 22235832  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  22235833 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 22235932  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  22235933 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgtatggt 22236032  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||  ||||| || | |||||||||||||    
T  22236033 cggaggtgcaagactcctttattctggtttgagtca 22236068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22381754 - 22381419
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  22381754 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgggttcga 22381655  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  22381654 agttgaggttgagttcggcttatcatccttaggcagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagca 22381555  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  22381554 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtataggtatggcactattcgaagctttgtatggt 22381455  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  22381454 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 22381419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22503231 - 22502900
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  22503231 gtgaagcttcatggtgttccatcgagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgcattgggttcgaagt 22503132  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  22503131 tgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 22503032  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  22503031 tggagcttgggatagtcacctgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggcatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 22502932  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || |  ||||| || ||||||||||||||    
T  22502931 aggtgtaagactcctttatgctggtttgagtc 22502900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 21984248 - 21984453
Alignment:
Q  156 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21984248 agacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcatt 21984347  T
Q  256 gatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    ||| |||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21984348 gatagagttcacgtacaataatagtaatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggttt 21984447  T
Q  356 gagtca 361  Q
    ||||||    
T  21984448 gagtca 21984453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 14886807 - 14887138
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  14886807 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 14886906  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14886907 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 14887006  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  14887007 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccgg 14887106  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  14887107 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 14887138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 21831574 - 21831890
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21831574 attgtgaagctgcaccgtgttctgtcgagcattgtgtcagatagagatcgaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcta 21831673  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||                   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21831674 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacacatggtcagtcgt------------------tagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 21831755  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || | ||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||    
T  21831756 aggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttacctttctagtataggaatgacaccatttgaagctttgtatggt 21831855  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  21831856 cggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtc 21831890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 23079902 - 23080237
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | ||    
T  23079902 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtatcggatagggattcgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgggtttga 23080001  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23080002 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 23080101  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23080102 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggt 23080201  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  23080202 cggaggtgcaggactcctctatgctggtttgagtca 23080237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 21890572 - 21890906
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  21890572 attgtgaagttccatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 21890671  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  21890672 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcagagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgcacttgagca 21890771  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    | | ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21890772 acgtggagcttgggatactcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 21890871  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| | ||  ||||| || || |||||||||||    
T  21890872 cggaggtacaagactccattatgttggtttgagtc 21890906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21405285 - 21405059
Alignment:
Q  136 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 235  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21405285 gagttcggcgtatcatccacagacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagcaaggaggaact 21405186  T
Q  236 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggc--tttgtatggtcggagatg 333  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  21405185 tgggatagtcatctttcattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgtgttgtatggtcggagatg 21405086  T
Q  334 cagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  21405085 cagaacttcgttgtgttggtatgagtc 21405059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25848627 - 25848296
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || || || ||||| |||||||    
T  25848627 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagaatttacaggacgccttgggttcgaagt 25848528  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  25848527 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcattggaagatttgttgaggatgtgtatgcttgagcaagg 25848428  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  25848427 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 25848328  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  25848327 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 25848296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20342834 - 20342503
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  20342834 gtgaagcttcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 20342735  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  20342734 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaagg 20342635  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20342634 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 20342535  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || |||| |||||||||    
T  20342534 aggtgtaggactcctttatgctagtttgagtc 20342503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 360
Target Start/End: Original strand, 37545336 - 37545643
Alignment:
Q  53 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatc 152  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  37545336 agcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaattttacaggacgccttgggttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatc 37545435  T
Q  153 cgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttcc 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||    
T  37545436 ctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcc 37545535  T
Q  253 gttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 352  Q
     ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  37545536 tttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcactgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctgg 37545635  T
Q  353 tttgagtc 360  Q
    ||||||||    
T  37545636 tttgagtc 37545643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 24798213 - 24798544
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||      
T  24798213 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttggggtcgaaac 24798312  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  24798313 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 24798412  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
    |||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  24798413 aggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 24798512  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  24798513 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 24798544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 17269148 - 17269481
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||| |||||    
T  17269148 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctctgggttcgaa 17269247  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
     |||||| | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  17269248 attgagactaa-ttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 17269346  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17269347 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 17269446  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17269447 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 17269481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22462471 - 22462173
Alignment:
Q  62 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacag 161  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22462471 tcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacag 22462372  T
Q  162 atggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcga 261  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| || || ||||| ||    
T  22462371 atggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtacttgagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattgataga 22462272  T
Q  262 gttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  22462271 atttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtc 22462173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 335
Target Start/End: Original strand, 919 - 1150
Alignment:
Q  104 ttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt 203  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||      
T  919 ttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttac 1018  T
Q  204 tgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggc 303  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  1019 tgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggc 1118  T
Q  304 acctttcgaggctttgtatggtcggagatgca 335  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1119 accgttcgaagctttgtatggtcggaggtgca 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 28923581 - 28923884
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  28923581 attgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagtttacaagatgcgttgggatcga 28923680  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  28923681 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 28923780  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28923781 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggt 28923880  T
Q  326 cgga 329  Q
    ||||    
T  28923881 cgga 28923884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20822008 - 20821705
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||| || |    
T  20822008 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccgaggtttacttcaagattttggaggagtttacaggacgcgttgggttcaa 20821909  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  20821908 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 20821809  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||    
T  20821808 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaactcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggt 20821709  T
Q  326 cgga 329  Q
    ||||    
T  20821708 cgga 20821705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 264
Target Start/End: Original strand, 24716342 - 24716577
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24716342 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagt 24716441  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24716442 tgaggttgagttcggcttagcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 24716541  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagtt 264  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24716542 tggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtt 24716577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20774302 - 20774012
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  20774302 catggggttccgtcgagtatagtgtcagacagagacccaaggtttacttcgagattttggagaagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattga 20774203  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| |||||||| || ||| ||||    
T  20774202 gttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggac-atccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttg 20774104  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgga 329  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  20774103 ggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcgga 20774012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 28916226 - 28916517
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  28916226 attgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagtttacaagatgcgttgggatcga 28916325  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  28916326 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 28916425  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 317  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  28916426 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctt 28916517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 24620111 - 24620340
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24620111 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagt 24620210  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24620211 tgaggttgagttcgacttagcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 24620310  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgat 258  Q
     ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  24620311 tggagcttgggatagtcacctaccgttgat 24620340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 28894755 - 28895058
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||    
T  28894755 attgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagtttacaagatgtgttgggatcga 28894854  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||| | ||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  28894855 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagtgaatttgctaagggtatgtgtacttgagca 28894954  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28894955 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggt 28895054  T
Q  326 cgga 329  Q
    ||||    
T  28895055 cgga 28895058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21496713 - 21496481
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||| || |    
T  21496713 attgtgaagttgcatggggttccatcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaaaatgccctgggttcta 21496614  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21496613 agttaaggttgagttcggcttatcattcgcaaatagatggtcagtaggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21496514  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 258  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21496513 aggtggagcttgggatagtcatctatcgttgat 21496481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21407711 - 21407597
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  | |    
T  21407711 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttcggaagagtttgcaggaggcgttgggtccta 21407612  T
Q  126 agttgagattgagtt 140  Q
    ||||||| |||||||    
T  21407611 agttgagtttgagtt 21407597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 21937013 - 21937332
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  21937013 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 21937112  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  21937113 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 21937212  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  21937213 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 21937312  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  21937313 acaccgttgtgttggtttga 21937332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24581753 - 24581432
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  24581753 catggtattccttctagtattgtgtcggattgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 24581654  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |    |||    
T  24581653 gttctgcttaccatcctcagaccgatgg-cagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttggttg 24581555  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  24581554 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 24581455  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  24581454 acaccgttgtgttggtttgagtc 24581432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27011627 - 27011306
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  27011627 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagttgctttgggaactaagttgagattga 27011528  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||  || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  || |||  | |||||||| |  | |||    
T  27011527 gttttgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttatgtgttagagcaaggtgtcagttg 27011428  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  27011427 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 27011328  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  27011327 acaccgttgtgttggtttgagt 27011306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 360
Target Start/End: Original strand, 24735658 - 24735758
Alignment:
Q  260 gagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24735658 gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 24735757  T
Q  360 c 360  Q
    |    
T  24735758 c 24735758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 25244175 - 25244323
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||| | | |||||||||  |||||||||  | |||||||| ||||    
T  25244175 catggtattccatctagcattgtgtcagatagagatccgaggtttacttctaagttttaggagagtttgcaatcggctttgggaactaagttgaggttga 25244274  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattca 186  Q
     |||  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  25244275 attctccttatcatcctcagactgatggtcagaccgagaggactattca 25244323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 25308327 - 25308475
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||| | | |||||||||  |||||||||  | |||||||| ||||    
T  25308327 catggtattccatctagcattgtgtcagatagagatccgaggtttacttctaagttttaggagagtttgcaatcggctttgggaactaagttgaggttga 25308426  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattca 186  Q
     |||  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  25308427 attctccttatcatcctcagactgatggtcagaccgagaggactattca 25308475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 11210732 - 11210841
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||| || || ||  ||||||| |    
T  11210732 ccgttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtaggaggtgtaggacatcgttgtgtt 11210831  T
Q  351 ggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||    
T  11210832 ggtttgagtc 11210841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 21229232 - 21229308
Alignment:
Q  272 aacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtg 348  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21229232 aacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactcctttgtg 21229308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 306
Target Start/End: Original strand, 21680429 - 21680499
Alignment:
Q  236 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacc 306  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  21680429 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 21680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 186
Target Start/End: Original strand, 16065604 - 16065665
Alignment:
Q  125 aagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattca 186  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16065604 aagttgagattgagttctgcttattatcctcagactgatggtcatgcggagagaacaattca 16065665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23503952 - 23503837
Alignment:
Q  71 gatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagt 170  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| | |||     
T  23503952 gatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggaa-ctaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgataggcaga 23503854  T
Q  171 cggagaggacaattcag 187  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23503853 cggagaggactattcag 23503837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 109434 - 109780
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  109434 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagaaccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagacgc 109533  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109534 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 109633  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  109634 gttcttgagcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcacctttcgagg 109733  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109734 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 109780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 95636 - 95970
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  95636 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgagattttggagaagtttacaagatgcgttgggttcga 95735  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  95736 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggaaaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 95835  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  95836 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggt 95935  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| || ||||||||  | || |||||||||||    
T  95936 cggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtc 95970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 113231 - 112900
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  113231 attgtgaagctgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagattcgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 113132  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || || ||  |||| ||| |||||||  | ||||| |||| |||    
T  113131 aattgaggctgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagttagagaggacgatacaatccttagaagatctgttgagggtgtgtgtacttgtgca 113032  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  113031 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggt 112932  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  112931 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttga 112900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18178383 - 18178037
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18178383 acatcaaggagattgtgaagctacatggtgttccttcgaacattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaaaagtttgcaagaggc 18178284  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18178283 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatctgttgaggatttgt 18178184  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18178183 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 18178084  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178083 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 18178037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8199269 - 8198927
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199269 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 8199170  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199169 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 8199070  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8199069 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 8198970  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8198969 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 8198927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10871636 - 10871294
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871636 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtattccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 10871537  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871536 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10871437  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871436 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10871337  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871336 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 10871294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 44790980 - 44791322
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790980 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 44791079  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791080 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 44791179  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44791180 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 44791279  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44791280 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 44791322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 15160688 - 15161032
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160688 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15160787  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160788 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 15160887  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15160888 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15160987  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160988 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 15161032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 16947 - 17291
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16947 atcaaggagattgtgaggctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 17046  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17047 taggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 17146  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17147 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcagtttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 17246  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17247 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttcagtca 17291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 11236844 - 11237188
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236844 atcaaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 11236943  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236944 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 11237043  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11237044 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttaccattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 11237143  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11237144 ttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtca 11237188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13686703 - 13686359
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686703 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 13686604  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686603 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 13686504  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13686503 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 13686404  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13686403 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgatggtttgagtca 13686359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12688142 - 12687796
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12688142 acattaaggagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 12688043  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12688042 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgt 12687943  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12687942 gtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 12687843  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12687842 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 12687796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8708244 - 8707904
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8708244 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 8708145  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8708144 tgggttcgaagttgagattgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 8708045  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8708044 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 8707945  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707944 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 8707904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9596696 - 9596352
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596696 atcaaggagattgtgaggttacatggtgtcccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 9596597  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9596596 tgggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 9596497  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9596496 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtcatcattctattattggaatggcaccttttgaggct 9596397  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9596396 ttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgagtca 9596352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14333036 - 14332696
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14333036 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 14332937  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14332936 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttattgagaatttgtgt 14332837  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14332836 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 14332737  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14332736 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 14332696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 18551389 - 18551729
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18551389 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 18551488  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551489 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 18551588  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18551589 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 18551688  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18551689 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 18551729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 11552731 - 11553077
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552731 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttccttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 11552830  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||    
T  11552831 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggacagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgaggatccgt 11552930  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11552931 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 11553030  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11553031 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 11553077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14955261 - 14954915
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||    
T  14955261 acattaaggagattgtgacgttgcatggtattccttcgagcattgtattggatagagatccaagatttacttctaggattttcaaaagtttgcaacaggc 14955162  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955161 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 14955062  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  14955061 gtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaga 14954962  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14954961 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 14954915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 15154294 - 15154632
Alignment:
Q  23 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |    
T  15154294 gaaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagattcacttctagattttggaaaagtttgcagcaggctttaggtt 15154393  T
Q  123 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 222  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15154394 ctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcaatcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttga 15154493  T
Q  223 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  15154494 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattgggatggcaccttatgaagctttgtat 15154593  T
Q  323 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154594 ggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 15154632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14040326 - 14039991
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || || |    
T  14040326 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaattttgcaagaggctctaggttcta 14040227  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14040226 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagca 14040127  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14040126 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggt 14040027  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14040026 cagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 14039991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14350356 - 14350021
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || || |    
T  14350356 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaattttgcaagaggctctaggttcta 14350257  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14350256 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagca 14350157  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14350156 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggt 14350057  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14350056 cagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 14350021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21662591 - 21662269
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || |    
T  21662591 attgtgaagttacatggtgttccatcgagtattgtattagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgtaggaggcgttgggttcta 21662492  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21662491 agttgagtttgagttaggcgtatcatccgcagacagatggatagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 21662392  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  21662391 agggggatcttgggatagtcatcttccattaatcgagttcacttacaataatagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggt 21662292  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21662291 cggagatgcagaactccgttgtg 21662269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 137 - 361
Target Start/End: Original strand, 23516520 - 23516744
Alignment:
Q  137 agttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 236  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23516520 agttcggcgtatcatccacagaaagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagagcatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggagggactt 23516619  T
Q  237 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516620 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 23516719  T
Q  337 aactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  23516720 aactccgttgtgccggtttgagtca 23516744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 11771881 - 11772216
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  11771881 attgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaggagtttgcaagaggctttaggttcta 11771980  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||  | || |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11771981 agttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcggaaaaaacgattcagtcattggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 11772080  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||     
T  11772081 aggagaaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttaaggctttgtgtgga 11772180  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     | || ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  11772181 agaaggtgcagaacttcgttgtgttgatttgagtca 11772216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15625182 - 15624847
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |    
T  15625182 attgtgaagctacatggtgttccgccgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggttttgggttcta 15625083  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  15625082 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaagaacaatccagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagca 15624983  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  15624982 tggaggaacttgggatagtcatcttctgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattagaatgacaccattcgaagcactgtatggt 15624883  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15624882 cggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtca 15624847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 12206418 - 12206752
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12206418 attgtgaagctgcatggtgttccgtcgagtattgtgttggatagagatccaagatttacatcgagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaa 12206517  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  12206518 agttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagca 12206617  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||| |    
T  12206618 aggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagagttcacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatgat 12206717  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||    
T  12206718 cggaggtgcaatactccgttatgttggtttgagtc 12206752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 15102221 - 15102556
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||  ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15102221 attgtgaagctacatggtttaccatcgaatattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 15102320  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15102321 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15102420  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15102421 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15102520  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15102521 cggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtca 15102556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13021988 - 13021653
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13021988 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacctctaggttctggaaaagtttgcaagatgctttgggatcga 13021889  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13021888 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggagaggactatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 13021789  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13021788 aggtggagcttgggataatcacctactgttgatagagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaggctttgtatggt 13021689  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||    
T  13021688 cggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtca 13021653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14263862 - 14264197
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  14263862 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagaaatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 14263961  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| || |||||    
T  14263962 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgttagaggatttgatgagagtgtctgtactcgagca 14264061  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14264062 aggtggagcttgggatagtcatctactgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 14264161  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  14264162 cggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtca 14264197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14285994 - 14286329
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| || |    
T  14285994 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacatctagatttcggaagagcttgcaagatgctttgggttcaa 14286093  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  14286094 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagca 14286193  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  14286194 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 14286293  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14286294 cggaggtgcaggactcctttgtgctggtttgagtca 14286329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 11388046 - 11388380
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11388046 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 11388145  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| |  ||||| | ||||| ||||||||    
T  11388146 aattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagca 11388245  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |    
T  11388246 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatgtt 11388345  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11388346 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 11388380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6414142 - 6413811
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  6414142 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttaggttcga 6414043  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6414042 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagaaggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 6413943  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6413942 aggtggggcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 6413843  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  6413842 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 6413811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 8211749 - 8212080
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  8211749 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaagacgccttgggttcgaagt 8211848  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8211849 tgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 8211948  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  8211949 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcgccgttcgaagccttgtatggtcgg 8212048  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  8212049 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 8212080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13666168 - 13665833
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  13666168 attgtgaagctacatggtgtatcgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagcttacaagatgcattgggttcga 13666069  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||  ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  13666068 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 13665969  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13665968 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 13665869  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||  |||  ||||| || |||||||||||||||    
T  13665868 cggaggggcatgactcctttatgctggtttgagtca 13665833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16071912 - 16072247
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  16071912 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcagttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 16072011  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  16072012 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcagagaggacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 16072111  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16072112 aggtggagcttgggatagtcacctatggttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggt 16072211  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||  ||| |||||| || || ||||||||||||    
T  16072212 cggaggcgcataactcctttatgttggtttgagtca 16072247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16950089 - 16950424
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16950089 attgtgaagctacatggagtactgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 16950188  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16950189 agttgaggttgagttcggattatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 16950288  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |||   ||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16950289 aggtggagtatggaatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 16950388  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16950389 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 16950424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 23505491 - 23505822
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  23505491 gtgaagctacatggagttccttcgtgtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 23505590  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  23505591 tgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttcttgaacaggg 23505690  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  23505691 tggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcga 23505790  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23505791 aggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 23505822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14130503 - 14130169
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  14130503 ttgtgaagctacatggagttccttcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgagttcgaa 14130404  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  14130403 gttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 14130304  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14130303 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 14130204  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14130203 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtca 14130169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 18053572 - 18053906
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  18053572 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcagatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 18053671  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  18053672 gttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 18053771  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18053772 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 18053871  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  18053872 gagggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtca 18053906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1360
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1025 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatacaaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 1124  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1125 ggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggaaaagacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 1224  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  1225 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 1324  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  1325 cagaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtca 1360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 11305884 - 11306215
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  11305884 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 11305983  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  11305984 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 11306083  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  11306084 tggagcttgggatagtcacttacctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 11306183  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  11306184 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 11306215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49152929 - 49152598
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  49152929 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 49152830  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  49152829 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacggatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtatgtgtgcttgagcaagg 49152730  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49152729 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 49152630  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  49152629 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 49152598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14434321 - 14433987
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  14434321 ttgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgagttcgaa 14434222  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  14434221 gttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 14434122  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14434121 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 14434022  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14434021 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtca 14433987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19147842 - 19147508
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  19147842 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 19147743  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    || |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||    
T  19147742 agatgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagca 19147643  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19147642 aggtggagcttggaatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19147543  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  19147542 cggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtc 19147508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20747241 - 20746907
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  20747241 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 20747142  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    || |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||    
T  20747141 agatgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagca 20747042  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20747041 aggtggagcttggaatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 20746942  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20746941 cggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtc 20746907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 360
Target Start/End: Original strand, 23199418 - 23199695
Alignment:
Q  83 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaa 182  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23199418 acttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacga 23199517  T
Q  183 ttcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagcta 282  Q
    | || ||  | || || ||||||||| | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  23199518 tccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagtta 23199617  T
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23199618 tcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 23199695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15204389 - 15204176
Alignment:
Q  146 tatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15204389 tatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttggaatagtc 15204290  T
Q  246 atcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgtt 345  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||| ||| || || ||  ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  15204289 atcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggaaccatttgaagcgctgtatggtcagaggtgtaggactccgtt 15204190  T
Q  346 gtgctggtttgagt 359  Q
    ||| ||||| ||||    
T  15204189 gtgttggttcgagt 15204176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12456333 - 12455998
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  12456333 attgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagaatttacaagatgctttgggatcga 12456234  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  12456233 agttgaggttgagctcggcttatcatccccagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggaattgttgacagtgtgtgtgcttgagca 12456134  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  12456133 aggtggagcttgggatagtcacctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggtaccgttcgaagctttgtatggt 12456034  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  12456033 aggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 12455998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 13968289 - 13968620
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  13968289 gtgaagcttcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 13968388  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  13968389 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaagg 13968488  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  13968489 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgggttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 13968588  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || |  ||||| || ||||||||||||||    
T  13968589 aggtgtatgactcctttatgctggtttgagtc 13968620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 26118226 - 26118557
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || |||||  |||| || || || ||||| |||||||    
T  26118226 gtgaaacttcatggtgttccggcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagcgtttacaggacgccttgggttcgaagt 26118325  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  26118326 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 26118425  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  26118426 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 26118525  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  26118526 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 26118557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15341061 - 15340727
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  15341061 ttgtgaagctacatagagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 15340962  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | |   | ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  15340961 gttgaggatgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatcaaataattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 15340862  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  15340861 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtc 15340762  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  15340761 ggaggtgcaggactccgttatgctagtttgagtca 15340727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 23203242 - 23203368
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203242 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 23203341  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttc 141  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23203342 cttggggtcgaagttgagattgagttc 23203368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 23509369 - 23509495
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509369 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 23509468  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttc 141  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23509469 cttggggtcgaagttgagattgagttc 23509495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 360
Target Start/End: Original strand, 35964646 - 35964824
Alignment:
Q  182 attcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagct 281  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || |    
T  35964646 attcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttctattgatcgagttcacttataataacagtt 35964745  T
Q  282 atcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35964746 accattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtc 35964824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12457298 - 12457075
Alignment:
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || ||||| |||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12457298 gttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttattgagagtgtctgtgcttgagcaaggtggaacttg 12457199  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  12457198 agatagtcacctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtatagg 12457099  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || |||| ||||||||||    
T  12457098 actcctttatgctagtttgagtca 12457075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14936965 - 14936646
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  14936965 catggtattccttctagtattgtatcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 14936866  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||  | |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||  | |||||| | |  | |||    
T  14936865 gttcttcttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttagaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaatgtgtcagttg 14936766  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  14936765 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 14936666  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||  ||||||| ||||||||    
T  14936665 acgtcgttgtgttggtttga 14936646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7824518 - 7824199
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  7824518 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaaattttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 7824419  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  7824418 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 7824319  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  7824318 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 7824219  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  7824218 acaccgttgtgttggtttga 7824199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 27107426 - 27107745
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  27107426 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 27107525  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  27107526 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 27107625  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  27107626 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 27107725  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  27107726 acaccgttgtgttggtttga 27107745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15364558 - 15364239
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  15364558 catggtattccttctagtattgtatcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 15364459  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||  | |||||| | |  | |||    
T  15364458 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttagaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaatgtgtcagttg 15364359  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  15364358 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 15364259  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||  ||||||| ||||||||    
T  15364258 acgacgttgtgttggtttga 15364239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4440546 - 4440356
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  4440546 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggttga 4440447  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||    
T  4440446 gttctgcttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttattgagagcttgtgttttggagcaagg 4440356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 21674185 - 21674508
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  21674185 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 21674284  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||  || |||||| | ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||  |  | ||     
T  21674285 gttatgcttatcatgcccagaccgatggccagactgagaggactattcagagtttagaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaagatgtcagtt- 21674383  T
Q  238 ggatagtcatctt--ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgca 335  Q
    |||| |  || ||  |||||||| || || || || ||||| || | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  21674384 ggatcg-aatgtttaccgttgattgaatttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgta 21674482  T
Q  336 gaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
      ||  ||||||| ||||||||||||    
T  21674483 agacaacgttgtgttggtttgagtca 21674508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17924269 - 17924148
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||    |||||||| ||||    
T  17924269 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgaaaaagtttgcaagctgctttgggaaataagttgaggttga 17924170  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagac 159  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17924169 gttcggcttatcatccccagac 17924148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23642059 - 23641951
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| | |||||||||| ||| |||||  | ||||| || |||||||| ||    
T  23642059 ttccttctagcattgtgtcagatagagatccaaagtttactccgacattttgggagagtttgcaagcggcgttggggactaagttaaggttgagttctgc 23641960  T
Q  145 atatcatcc 153  Q
     ||||||||    
T  23641959 ttatcatcc 23641951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45147131 - 45147003
Alignment:
Q  80 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||  | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  45147131 tttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgcttttggaaccaagttgaggttgagttctgcttatcatcctcagacggatgggcagacagagagga 45147032  T
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgaga 208  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||    
T  45147031 ctattcagagtttggaggatttgttgaga 45147003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 354
Target Start/End: Original strand, 12368473 - 12368544
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtt 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  12368473 tcattctagtattggtatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtt 12368544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 186
Target Start/End: Original strand, 15171642 - 15171764
Alignment:
Q  64 agatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagat 163  Q
    |||||||||||  || ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||||  || ||||| || ||||  |||    
T  15171642 agatagagatctgaggtttacttctatgtttcggaaaagttttcaagcggctttggaaactaagttgagattgagttttgcttatcagcctcagatcgat 15171741  T
Q  164 ggtcagtcggagaggacaattca 186  Q
    |||||| || ||||||| |||||    
T  15171742 ggtcagacgaagaggactattca 15171764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 40790 - 40869
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||    
T  40790 tgaagctgcatggtcttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaa 40869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 120
Target Start/End: Original strand, 17144936 - 17144994
Alignment:
Q  62 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttggg 120  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17144936 tcagatagagatccgaggtttacttcaaagttttggaagagtatgcaagaggctttggg 17144994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 15589251 - 15589593
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589251 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 15589350  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589351 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 15589450  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15589451 gttcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 15589550  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15589551 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 15589593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 20061913 - 20062255
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061913 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 20062012  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062013 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 20062112  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20062113 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 20062212  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20062213 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 20062255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 53384888 - 53385223
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53384888 attgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcga 53384987  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384988 agttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 53385087  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53385088 aggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggt 53385187  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53385188 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 53385223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16636044 - 16635702
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636044 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16635945  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635944 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16635845  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16635844 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 16635745  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16635744 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16635702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43163368 - 43163026
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163368 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 43163269  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163268 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 43163169  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  43163168 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 43163069  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43163068 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 43163026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 14876360 - 14876704
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876360 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 14876459  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14876460 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgt 14876559  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14876560 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatattccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 14876659  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876660 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 14876704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10005871 - 10005529
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10005871 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttacaagaggc 10005772  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005771 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10005672  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10005671 gttcttgaacaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10005572  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10005571 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 10005529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 16756444 - 16756790
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756444 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16756543  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756544 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16756643  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16756644 gtgcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcatcgttcgagg 16756743  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16756744 ccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 16756790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48425718 - 48425376
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425718 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 48425619  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425618 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 48425519  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48425518 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcaagg 48425419  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48425418 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 48425376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12498517 - 12498173
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12498517 atcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 12498418  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498417 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 12498318  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12498317 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 12498218  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12498217 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 12498173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 16806787 - 16807131
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16806787 atcaaggagatcgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagttagcaagaggctt 16806886  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16806887 tgggttcaaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 16806986  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16806987 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggct 16807086  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807087 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 16807131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10906481 - 10906139
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906481 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 10906382  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906381 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10906282  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10906281 gttcttgaacgaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10906182  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10906181 ctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 10906139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 15348106 - 15348446
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15348106 atcaaggagattatgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 15348205  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348206 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 15348305  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15348306 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 15348405  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15348406 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 15348446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 15724795 - 15725139
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724795 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcaggcattgtgtcagatagagatccaagatttacttgtagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15724894  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724895 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 15724994  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15724995 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15725094  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725095 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 15725139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16371679 - 16371338
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371679 aaggaaattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 16371580  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16371579 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttct 16371480  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16371479 tgagcaaggaggaacttgggatattcatctttcattgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 16371380  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371379 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 16371338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13252959 - 13252619
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13252959 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 13252860  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252859 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 13252760  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13252759 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 13252660  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13252659 ttgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttga 13252619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 15402371 - 15402715
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402371 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccctcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15402470  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402471 tgggttcgaagctgagattgagttcggcgtatcatccatagacagctggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 15402570  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402571 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15402670  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402671 ttacatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 15402715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 16412143 - 16412487
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412143 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 16412242  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412243 tgggttcgaagttgaggttgagttcggagtatcaaccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 16412342  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16412343 tcttcagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 16412442  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412443 ttatatggttggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 16412487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 5424791 - 5425131
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5424791 atcaaggagattgtaaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 5424890  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424891 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 5424990  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5424991 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 5425090  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5425091 ctgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttga 5425131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15339538 - 15339194
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339538 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccctcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15339439  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15339438 tgggttcgtagctgagattgagttcggcgtatcatcgacagacagatggtcagtcgaagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 15339339  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15339338 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15339239  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339238 ttatatggtcggagatacagaactccgttgtgctggtttgagtca 15339194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 26792260 - 26792604
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792260 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttccagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 26792359  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792360 tgggttcaaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 26792459  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26792460 tcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 26792559  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26792560 ttatatggtcggagatgcagaactccattatgctggtttgagtca 26792604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16692433 - 16692085
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaag----ag 112  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  16692433 atcaaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagctagag 16692334  T
Q  113 gctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaattt 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16692333 gctttgggttcgaagttgagattgagttcagcttatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagttt 16692234  T
Q  213 gtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcga 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16692233 gtgttcttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccttttga 16692134  T
Q  313 ggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16692133 ggctttgtatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 16692085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6601007 - 6600672
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601007 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 6600908  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||    
T  6600907 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggat-----------ttgt 6600819  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6600818 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 6600719  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6600718 ctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtca 6600672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9522979 - 9522644
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  9522979 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 9522880  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9522879 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgtttcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 9522780  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9522779 aggagggacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatatttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 9522680  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9522679 cggagatgcagaactccgttgtcttggtttgagtca 9522644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 327
Target Start/End: Original strand, 11564545 - 11564852
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11564545 aaggagattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagattttcttctagattttggaaaagttagcaagaggctttgg 11564644  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  11564645 gttcgaagttgaaattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgttct 11564744  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11564745 tgagaaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttg 11564844  T
Q  320 tatggtcg 327  Q
    ||||||||    
T  11564845 tatggtcg 11564852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17490110 - 17489779
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  17490110 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtccgatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 17490011  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  17490010 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatctgttgagagtttgtgtacttgagca 17489911  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17489910 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 17489811  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17489810 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 17489779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 14126464 - 14126744
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  14126464 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagttttcaagaggctttgggttcta 14126563  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14126564 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggtgaggaggattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagca 14126663  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14126664 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 14126744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 16492051 - 16492381
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16492051 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattatggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 16492150  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16492151 agttgaggttgagttcggtgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttaagggtttgtgttcttgagca 16492250  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  16492251 aggaggtacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacaccttgtgaggctttgtatggt 16492350  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16492351 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15248407 - 15248072
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  15248407 attgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatatgagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 15248308  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15248307 agttgaggttgagctcggcgtatcatcagcagacagatggtcagttggagagaacgatttagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtaattgagca 15248208  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15248207 aggaggaacttgggatagtcatcttctattgatatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatagt 15248108  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15248107 cggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtca 15248072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15209151 - 15208816
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | || || |    
T  15209151 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatatgagatttacttctagattttggaagattttgcaagaggttgtaggttcta 15209052  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15209051 agttgaggttgagctcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtctgagagaatgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtatttgagca 15208952  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  15208951 aggaggaacttgggatagtcatcttctattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgga 15208852  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15208851 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 15208816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15062022 - 15061777
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15062022 aaggaaattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaatagtttgcaagaggctttgg 15061923  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15061922 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatacgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgttct 15061823  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttc 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15061822 tgagcaaggtggaacttgggatagtcattttccattgattgagttc 15061777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15227919 - 15227585
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15227919 attgcgaagctgcatggtgttccatcgagtattgtatcggatagagatccaagatttacatctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaa 15227820  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  15227819 agttgaggtggagttcagcttatcatccgcaaacaattggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtacttaagca 15227720  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  15227719 aggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatggt 15227620  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
     |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  15227619 tggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtc 15227585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 13971979 - 13972313
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13971979 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 13972078  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  13972079 aattgaggctgagttcggcttatcatccccagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 13972178  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  13972179 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 13972278  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13972279 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 13972313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14086943 - 14086609
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14086943 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 14086844  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  14086843 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 14086744  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  14086743 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 14086644  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14086643 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 14086609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 15015634 - 15015941
Alignment:
Q  34 gctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgaga 133  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  15015634 gctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttaggaagagtttgcaggaggcgttgggttctaagttgagt 15015733  T
Q  134 ttgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15015734 ttgagttcggcatatcatccgcag------------tcggagaggacaattcagacgttggaggacttgttgagaatttgtgtacttgagcaaggcggaa 15015821  T
Q  234 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatg 333  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |  || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  15015822 cttgggatagtcatctctcattgatcgagttcacttgcaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcattgtatgatcggagatg 15015921  T
Q  334 cagaactccgttgtgctggt 353  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  15015922 cagaactccattgtgttggt 15015941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17492900 - 17492565
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | | |  |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  17492900 attgtgaagttgcatggtgttccgttgtgtgttgtttcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttggggtcga 17492801  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  17492800 acttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 17492701  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17492700 aggtggatcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttatcattcgaatattggtatggcaccgatcgaagctttgtatggt 17492601  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  17492600 cggaggtgcaggactcctttaagctggtttgagtca 17492565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 15952827 - 15953161
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15952827 attgtgaagttacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcga 15952926  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||  ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15952927 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacatatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggagttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15953026  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15953027 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttgccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15953126  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||||||||| || || | |||||||||    
T  15953127 cggaggtgcagaactcctttatgtttgtttgagtc 15953161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 11303632 - 11303967
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  11303632 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaggacgccttgggatcga 11303731  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  11303732 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtacttgagca 11303831  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||  ||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| || || || || ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  11303832 agttggagcttgggatagtcacctaccgttgatatagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtaaggcaccgttcgaagctttgtatggt 11303931  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11303932 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 11303967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 12360401 - 12360736
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  12360401 attgtgaagctacatggtgtaccgtagagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagattatggaagagattacaagatgcattgggttcga 12360500  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||| | | ||||| ||||||||    
T  12360501 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggaccatacaatctttggaggatttattgaaagtgtgtgtacttgagca 12360600  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12360601 aggtggagcttcggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 12360700  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12360701 cggaggtgcaggactccattatgctggtttgagtca 12360736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28754585 - 28754254
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  28754585 gtgaagcttcatggtgttccgtctagtattgtgtcagatagagatccgaggtttacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 28754486  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  28754485 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 28754386  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28754385 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 28754286  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  28754285 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 28754254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 8758942 - 8759276
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  8758942 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 8759041  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  8759042 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 8759141  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8759142 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 8759241  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8759242 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 8759276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 12850138 - 12850472
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || || |||||||| || ||||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||  || |    
T  12850138 attgtgaagttgcatggtgtcccatcaagcattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttggattcaa 12850237  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  12850238 agttgaggttgagttcggcttataatccgtagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagattgtgtgttcttgagca 12850337  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||    
T  12850338 aggtggagcttgggatagtcatctatcgttgatagagttcacgtacaacaacaattaccattcaagtattggtatggcaccgttcaaagatttgtatggt 12850437  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12850438 cggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtc 12850472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14574199 - 14573889
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||   || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  14574199 attgtgaagttacatggagtttcgtcgagtattgtgtcagatagagatttcaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 14574100  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||   | ||| | ||||||||    
T  14574099 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagagtacgattcagtcgttagaggatttgctgatggtgtgtatacttgagca 14574000  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14573999 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccaatcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 14573900  T
Q  326 cggagatgcag 336  Q
    ||||| |||||    
T  14573899 cggaggtgcag 14573889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 16836370 - 16836704
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16836370 ttgtgaagcttcatggagttccgtcgagtattgcatcggatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 16836469  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||    
T  16836470 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatccttggaggatttgttgagagtgcgtgtgcttgaacaa 16836569  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||| | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16836570 ggtggagcttgggatagtcacctaccattggtagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 16836669  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16836670 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtca 16836704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41177791 - 41177457
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  41177791 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 41177692  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  41177691 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacat 41177592  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41177591 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 41177492  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41177491 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 41177457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13942291 - 13941963
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  13942291 gtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 13942192  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||    
T  13942191 tgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcaatggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaggg 13942092  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  13942091 tggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcga 13941992  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13941991 aggtgcaggactccgttgtgttggtttga 13941963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 13322511 - 13322846
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  13322511 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcagatagggatctgaggtttacttctagattctggaagagtttgcaagatgttttgggttcga 13322610  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
     ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||| | ||||| ||||||||    
T  13322611 ggttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatccttagaggatttcctaagagtatgtgtgcttgagca 13322710  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| | | ||||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  13322711 aggtgaagcttgggatagtcacctacctttgatagagtttacctacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtacggt 13322810  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13322811 cggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtca 13322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4678702 - 4678373
Alignment:
Q  32 aagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttga 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  4678702 aagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttga 4678603  T
Q  132 gattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggagg 231  Q
    |  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||    
T  4678602 ggctgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtgg 4678503  T
Q  232 aacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggaga 331  Q
    | ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4678502 agcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcgaagg 4678403  T
Q  332 tgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4678402 tgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 4678373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10384235 - 10383905
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| || || ||||| |||||||    
T  10384235 gtgaagcttcatggtgttccgtt-agtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaatgtttgcaggacgccttgggttcgaagt 10384137  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  10384136 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 10384037  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  10384036 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 10383937  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  10383936 aggtgtaggactcctttgtgctggtttgagtc 10383905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44777516 - 44777189
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  44777516 ttgtgaagctacatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggtttacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggctcgaa 44777417  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  44777416 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 44777317  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  44777316 ggtggagcttgggatagtcacctgccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattatatggtc 44777217  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtt 354  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  44777216 gaaggtgcaggactcctttgtgttggtt 44777189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 360
Target Start/End: Original strand, 16380788 - 16381121
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16380788 ttgtgaagctacatggagttccttcaagtattgtgtcggatagggatccgatgttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 16380887  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  || || ||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  16380888 gttgagattgagttcggcttatcattctcagacagatggtcagtcggagaggatgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 16380987  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16380988 ggtggagcttgggataatcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtc 16381087  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16381088 gaaggtgcaggactccgttgtgctggtttgagtc 16381121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 361
Target Start/End: Original strand, 18134215 - 18134540
Alignment:
Q  36 tacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagatt 135  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  18134215 tacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaggacactttgggttcgaagttgaggtt 18134314  T
Q  136 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 235  Q
    ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18134315 gagttcaacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagct 18134414  T
Q  236 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgca 335  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18134415 tgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgca 18134514  T
Q  336 gaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | | ||| || |||||||||||||||    
T  18134515 ggaatcctttatgctggtttgagtca 18134540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 125 - 361
Target Start/End: Original strand, 11960992 - 11961228
Alignment:
Q  125 aagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagc 224  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  11960992 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagc 11961091  T
Q  225 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatgg 324  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11961092 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatgg 11961191  T
Q  325 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11961192 tcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 11961228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47124211 - 47123880
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  47124211 gtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 47124112  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  47124111 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 47124012  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  47124011 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 47123912  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  47123911 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 47123880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 10419907 - 10420238
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||| || || |    
T  10419907 gtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaggagtttacaggacgcgttgggttcaaaat 10420006  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  | ||  | ||||| |||||||| ||    
T  10420007 tgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcaggg 10420106  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  10420107 tggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcgg 10420206  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || |||||  | || |||||||||||    
T  10420207 aggtgtaggactcctctatgttggtttgagtc 10420238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16329520 - 16329853
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16329520 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaggttctggaagagtttacaagacgccttgggttcga 16329619  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||    ||||| ||| ||||    
T  16329620 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggttagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgag--ggtgtgtactttagca 16329717  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  16329718 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 16329817  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || |||||  | || ||||||||||||    
T  16329818 cggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtca 16329853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13002070 - 13001845
Alignment:
Q  134 ttgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaa 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||     
T  13002070 ttgagttcggcttatcacccgcaaacagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgatgagagtgtgtgtacttgagcaagg-ggag 13001972  T
Q  234 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatg 333  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13001971 cttgggatagtcatttaccgttaatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 13001872  T
Q  334 cagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||| || || |||||||||||    
T  13001871 caaaactccattatgttggtttgagtc 13001845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 122 - 361
Target Start/End: Original strand, 26008948 - 26009187
Alignment:
Q  122 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttg 221  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| |  ||||| | ||||| ||||    
T  26008948 tcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttg 26009047  T
Q  222 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgta 321  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  26009048 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgagagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 26009147  T
Q  322 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26009148 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtca 26009187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 16828061 - 16828215
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||    
T  16828061 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagaatttgcaagatgcattgggttcga 16828160  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 180  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16828161 agttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggac 16828215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 16338371 - 16338591
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || || | |||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  16338371 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcagttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 16338470  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||    
T  16338471 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgtttagggtgtgtgtgcttgaaca 16338570  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtca 246  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  16338571 aggtggagcttgggatagtca 16338591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 8274281 - 8274603
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  8274281 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 8274380  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||     | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  8274381 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcaaagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 8274480  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  8274481 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 8274580  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  8274581 acaccgttgtgttggtttgagtc 8274603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15577007 - 15576686
Alignment:
Q  39 atggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgag 138  Q
    ||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||    
T  15577007 atggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgag 15576908  T
Q  139 ttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 238  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | ||||    
T  15576907 ttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgg 15576808  T
Q  239 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaa 338  Q
    ||      | |  ||||||| ||||| || || ||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  15576807 gacgaatgtttatcgttgattgagtttacttacaacaacagtttgcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagaa 15576708  T
Q  339 ctccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    | ||||| || |||||||||||    
T  15576707 caccgttatgttggtttgagtc 15576686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 16742585 - 16742907
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  16742585 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatcccaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 16742684  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  16742685 gttctgcttaccatcctcagaccgatggtcagacagagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttg 16742784  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  16742785 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 16742884  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||||| || |||||||||||    
T  16742885 acaccgttttgttggtttgagtc 16742907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 6152733 - 6153052
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||    
T  6152733 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgagatttacttataagttttgggaaagtttgcaagctgctttgagaactaagttgagattga 6152832  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || ||  |||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||| | || ||||| |  | |||    
T  6152833 gttctgcttactatcctcagactgatgggcaaacagagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggaacaaggtgttagttg 6152932  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | |||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||     
T  6152933 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacatacaacaacaattttcattctagtatcgagatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 6153032  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  6153033 acaccgttgtgttggtttga 6153052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 360
Target Start/End: Original strand, 13975172 - 13975249
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  13975172 tcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 13975249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18748916 - 18748733
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||| || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | || ||||| |||||||| ||    
T  18748916 ttccttctagtattgtgtcagatcaggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaaattgaggttgagttctgc 18748817  T
Q  145 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | ||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||    
T  18748816 ttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttaagagcttgtgttttggagcaagg 18748733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Original strand, 6712539 - 6712614
Alignment:
Q  286 ttctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  6712539 ttctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccgttgtgttggtatgagtca 6712614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 13967222 - 13967392
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||  || | || || || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  13967222 catggtattccttctagcattgtgtcgtatcgggaaccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgcttttggaactaagttgagattga 13967321  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga 208  Q
    |||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||   || |||||||||||||||    
T  13967322 gttctgctaaccatcctcagacggatgggcagacgaagaggactattcagagtctggaggatttgttgaga 13967392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17193107 - 17193033
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  17193107 tcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttgtgttggtttga 17193033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17193318 - 17193224
Alignment:
Q  71 gatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatgg 165  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||   |||||||  | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  17193318 gatccaaggtttacttctaagtttagggaaagtttgcaagcttctttgggaactaagttgaggttgagttctgcttatcatccccagaccgatgg 17193224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18748678 - 18748604
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||| || || ||  ||||||| ||||||||    
T  18748678 tcattctagtatcggtatggcaccgtttgagggtttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggtttga 18748604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10869133 - 10868791
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869133 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 10869034  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869033 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10868934  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10868933 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatcgagttcacttataacaatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10868834  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10868833 ctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 10868791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9610419 - 9610077
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610419 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 9610320  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610319 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 9610220  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9610219 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 9610120  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9610119 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 9610077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16982435 - 16982093
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982435 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16982336  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982335 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16982236  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16982235 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 16982136  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16982135 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16982093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16999283 - 16998941
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999283 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16999184  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999183 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16999084  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16999083 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 16998984  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16998983 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16998941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17064000 - 17063658
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064000 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 17063901  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063900 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 17063801  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17063800 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 17063701  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17063700 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 17063658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17067658 - 17067316
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067658 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 17067559  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067558 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 17067459  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17067458 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 17067359  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17067358 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 17067316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 41608547 - 41608891
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608547 atcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagacagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 41608646  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608647 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 41608746  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41608747 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 41608846  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608847 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 41608891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 44385731 - 44386071
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385731 atcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 44385830  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385831 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 44385930  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44385931 tcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 44386030  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386031 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 44386071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27218299 - 27217957
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218299 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27218200  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218199 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggacagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27218100  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27218099 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27218000  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27217999 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 27217957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24262651 - 24262307
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262651 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 24262552  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262551 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 24262452  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24262451 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatcgagtccacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 24262352  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262351 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 24262307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 22325018 - 22325358
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22325018 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 22325117  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325118 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 22325217  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22325218 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 22325317  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22325318 ttgtatggtcggagatgcagaactccgtggtgttggtttga 22325358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24710314 - 24709974
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24710314 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 24710215  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710214 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 24710115  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||     
T  24710114 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgtttgaggcc 24710015  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24710014 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 24709974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23189279 - 23188945
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189279 attgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 23189180  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23189179 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcggagaggacagttcagtcgctagaggatttattgagagtttgtgtttttgagca 23189080  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23189079 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtttaggaatggcaccttttgaggctttgtatggt 23188980  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23188979 cggagatgcagaactccg-tgtgttggtttgagtca 23188945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27371550 - 27371210
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27371550 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27371451  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371450 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27371351  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27371350 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 27371251  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  27371250 ttgtatggtcggagatgaagaactatgttgtgttggtttga 27371210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 24707647 - 24707988
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24707647 aaggaaattatgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 24707746  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  24707747 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagatttattgagggtttgtgttct 24707846  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24707847 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 24707946  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24707947 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 24707988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 21325431 - 21325768
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21325431 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttctgtcgagcattatatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttag 21325530  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21325531 gttctaagttgagattgagtccggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgct 21325630  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21325631 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 21325730  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21325731 tctggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 21325768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24675767 - 24675430
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24675767 aaggagattgtgaagttgcatggtgttctttcgagcattgtatcatatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 24675668  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24675667 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgctagaggatttgctgagagtctgtgttct 24675568  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24675567 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 24675468  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24675467 tatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttga 24675430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 21145201 - 21145534
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21145201 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagatgc 21145300  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  21145301 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagagg-----------atttgt 21145389  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145390 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagccatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 21145489  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21145490 ctttatatggtcggagatgcaaaactccgttgtgctggtttgagt 21145534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23064346 - 23064014
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  23064346 gtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtgtcagatagagatccaagttttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagt 23064247  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23064246 tgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcttttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagg 23064147  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  23064146 aggtacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattcaagtattggaatggcaccttatgaggctttatatggtcgg 23064047  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23064046 agatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 23064014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 22756630 - 22756963
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22756630 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacctctagattttggaagagttttcaagaggctttgg 22756729  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  22756730 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatacacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagggtttgtgtact 22756829  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  22756830 tgagaaaggagggacttcggatagtcatcttccgttgatagacttcacgtacaataacagttaccgttctagtattggaatggcaccctttgaggcttta 22756929  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22756930 tatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggt 22756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 30211088 - 30211422
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  30211088 attgtgaagctacatggtgttccatcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggcgttgggttcta 30211187  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30211188 agttgagtttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 30211287  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  30211288 agggggaacttgggatagtcatcttccattggtcgagttcacttacaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaaacgttgtatggt 30211387  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  30211388 cggagatgcagaactctgttgtgttggtatgagtc 30211422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45529783 - 45529449
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  45529783 attgtgaagctacatggtgttgcatcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggcgttgggttcta 45529684  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  45529683 agttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggacagacgtagaggacaattcagtcgttggaggacttgttcagagtttgtgtacttgagca 45529584  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| || || || |||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  45529583 aggaggaacttgggataatcatcttccattgatcgagttcatttataataacagttaccattttagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggt 45529484  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  45529483 cggagatgcaaaactccattgtgttggtatgagtc 45529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 361
Target Start/End: Original strand, 24825472 - 24825788
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  24825472 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttaagttcggc 24825571  T
Q  145 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24825572 gtatcatccgcagacagatggtcaatcggaaagaacgattcagtcgctggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtggaacttgggatagt 24825671  T
Q  245 catcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgt 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  24825672 catctcccgttgatagagttcacgtataataatagttaacattctagtattggtatggcaccttttgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgt 24825771  T
Q  345 tgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  24825772 tgtgttgggttgagtca 24825788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16925378 - 16925201
Alignment:
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatag 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16925378 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatag 16925279  T
Q  280 ctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16925278 ttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16925201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 27365250 - 27365584
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27365250 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 27365349  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  27365350 aattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 27365449  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  27365450 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatgga 27365549  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27365550 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 27365584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23294230 - 23293926
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  23294230 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttacaagatgctttgggttcga 23294131  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||| |||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  23294130 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggagggtttgctgagagtgtgtgtgcttgagca 23294031  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23294030 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 23293931  T
Q  326 cggag 330  Q
    |||||    
T  23293930 cggag 23293926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23277048 - 23276713
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| | || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  23277048 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagtgattcgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgcattgggttcga 23276949  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||    
T  23276948 agttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgaaagtgtttgtacttgagca 23276849  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23276848 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 23276749  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  23276748 cggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtca 23276713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 179 - 361
Target Start/End: Original strand, 24878319 - 24878501
Alignment:
Q  179 acaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaata 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24878319 acaattcagtcgctcgaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataata 24878418  T
Q  279 gctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24878419 gttatcattatagtattggaatgacacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 24878501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 19652223 - 19652555
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| || |||| || || ||||| ||||| || ||||  ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19652223 attgtgaagttatatggagtaccgtcgagtattgtgtcggataaggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 19652322  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19652323 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 19652422  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||   |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19652423 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacat---acaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19652519  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19652520 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 19652555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16923172 - 16923010
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923172 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16923073  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 177  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16923072 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagag 16923010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16925643 - 16925479
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925643 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16925544  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16925543 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcggagagga 16925479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 20442675 - 20442830
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442675 atcaaggagattgtgatgttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 20442774  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20442775 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcg 20442830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 24876911 - 24877078
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24876911 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaagtttgcaagaggctt 24877010  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatt 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24877011 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaatt 24877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12574624 - 12574290
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  12574624 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 12574525  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  12574524 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 12574425  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12574424 ggtggagcttgggacagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 12574325  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  12574324 gaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtca 12574290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20833254 - 20832923
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20833254 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 20833155  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  20833154 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 20833055  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20833054 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 20832955  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  20832954 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 20832923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27788012 - 27787678
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  27788012 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27787913  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  27787912 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 27787813  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27787812 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 27787713  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27787712 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 27787678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24948861 - 24948564
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||    
T  24948861 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaagatgcattggtttcga 24948762  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||   |||| | ||||| ||||||||    
T  24948761 tgttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgcttgagca 24948662  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatg 323  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24948661 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatg 24948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31830927 - 31830596
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  31830927 gtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 31830828  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  31830827 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 31830728  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  31830727 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 31830628  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  31830627 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 31830596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20828528 - 20828227
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20828528 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 20828429  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  20828428 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 20828329  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20828328 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 20828229  T
Q  329 ag 330  Q
    ||    
T  20828228 ag 20828227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1064020 - 1063689
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |    
T  1064020 gtgaaacttcatggtgttccgtctagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaaat 1063921  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  1063920 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcatgggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 1063821  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1063820 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 1063721  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  1063720 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 1063689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 11358057 - 11358379
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11358057 catggtgttccgtctagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttga 11358156  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| || |||||||| ||| ||||    
T  11358157 gttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctagagcaaggtggagcttg 11358256  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||     
T  11358257 ggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtagg 11358356  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  11358357 actcctttatgctggtttgagtc 11358379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23087611 - 23087388
Alignment:
Q  137 agttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 236  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||| |||    
T  23087611 agttcagcttatcatcggcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtactttagcaaggtggagctt 23087512  T
Q  237 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 336  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  23087511 gggatagtcacctatcgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgactattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcgg 23087412  T
Q  337 aactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  23087411 aactccgttatgttggtttgagtc 23087388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 21125331 - 21125509
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  21125331 gtgaagttacatggggttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaaagt 21125430  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgag 207  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21125431 tgaggttgagttcgacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgag 21125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 23107901 - 23107989
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107901 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtccgatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 23107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23111007 - 23110892
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23111007 attgtgaagttgcattgtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcattgggttcaa 23110908  T
Q  126 agttgagattgagttc 141  Q
    |||| || ||||||||    
T  23110907 agttaaggttgagttc 23110892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24642014 - 24641860
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| | || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||    
T  24642014 attgtgaagttacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagaggtccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgacttgggttcga 24641915  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 180  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24641914 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggttagtcggataggac 24641860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22276538 - 22276217
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | |||||||||||||    
T  22276538 catggtattccttctagtattgtgtc-gatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggaaactaagttgagattga 22276440  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||||  || |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  22276439 gttctgcttaccatccccagactgatgggtagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 22276340  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  22276339 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 22276240  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  22276239 acaccgttgtgttggtttgagtc 22276217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25128907 - 25128758
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  25128907 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagatgctttgggaactaagttgagattga 25128808  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 187  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| |||   |||||||| ||||||    
T  25128807 gttctgcttatcatccccataccgatgggcagatagagaggactattcag 25128758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 361
Target Start/End: Original strand, 23817291 - 23817559
Alignment:
Q  93 tttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgct 192  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |  |||| || ||||||    |    
T  23817291 tttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatggtcagacaaagagaactattcagagttt 23817390  T
Q  193 agaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagt 292  Q
     || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |    ||||||      | | || ||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  23817391 ggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtctgttgggacgtatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagt 23817490  T
Q  293 attggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  23817491 atcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggagatgtaggacaccgttgtgttggtttgagtca 23817559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 359
Target Start/End: Original strand, 24569851 - 24570172
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  24569851 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 24569950  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||||    | || |||||||||||| |||||||| | ||||||||    | ||     
T  24569951 gttctgcttaccatcctcacaccgatgggcaaacagaaaggactattcagagtttggaagatttgttgagagtttgtgttttggagcaaggtttcagttc 24570050  T
Q  238 gga-tagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 336  Q
    |||  |||  | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||| || ||    
T  24570051 ggacgagt-gtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttatatcgtcagaggtgtag 24570149  T
Q  337 aactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
     || |||||||| ||||||||||    
T  24570150 gacaccgttgtgttggtttgagt 24570172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 24831370 - 24831692
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||  || ||||||||||  |||||| | ||||||||||   |||||||  | |||||||||||||    
T  24831370 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatctgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctcctttggggactaagttgagattga 24831469  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||| | ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  24831470 gttctgcttaccatcctcagtccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttagttg 24831569  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || || ||||| || | ||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  24831570 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcatgttagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 24831669  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  24831670 acaccgttgtgttggtttgagtc 24831692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 12640315 - 12640424
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || |    
T  12640315 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgtt 12640414  T
Q  351 ggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||    
T  12640415 ggtttgagtc 12640424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 22761752 - 22762071
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||  || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  22761752 catggtattccttttagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 22761851  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||  | || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||     | |||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| |  | |||    
T  22761852 gttcttcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactcttcaaagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttgaagcaaggtgtcagttg 22761951  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||     
T  22761952 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagg 22762051  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||  ||||||| ||||||||    
T  22762052 acgtcgttgtgttggtttga 22762071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23890829 - 23890753
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcg 327  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23890829 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcg 23890753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25128693 - 25128585
Alignment:
Q  252 cgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 351  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || | |||||| ||||| || ||| |||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||    
T  25128693 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattcaagtatcggtatgacaccgtttgatgctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttatgttg 25128594  T
Q  352 gtttgagtc 360  Q
    |||||||||    
T  25128593 gtttgagtc 25128585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 16350293 - 16350633
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16350293 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 16350392  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350393 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 16350492  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16350493 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 16350592  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350593 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16350633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19107032 - 19106688
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107032 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaatatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 19106933  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19106932 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 19106833  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19106832 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagtct 19106733  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19106732 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtca 19106688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 51333187 - 51333527
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51333187 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 51333286  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333287 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 51333386  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51333387 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 51333486  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333487 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 51333527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 17044709 - 17045053
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17044709 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagacagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctt 17044808  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17044809 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 17044908  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17044909 tcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 17045008  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17045009 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 17045053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21837615 - 21837275
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21837615 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 21837516  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837515 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 21837416  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21837415 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgacgct 21837316  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21837315 ttgtatggtcggagatgcacaactccgttgtgttggtttga 21837275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 33390723 - 33391063
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33390723 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 33390822  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33390823 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 33390922  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  33390923 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 33391022  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391023 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 33391063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21830968 - 21830624
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830968 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 21830869  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21830868 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgt 21830769  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21830768 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 21830669  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21830668 ttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtca 21830624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 16078350 - 16078690
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16078350 atcaaggagattgtgaggttacatggt----cttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 16078445  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16078446 tggcttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgagagtttgtgt 16078545  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16078546 tcttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttaaggct 16078645  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078646 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 16078690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 56 - 357
Target Start/End: Original strand, 41354202 - 41354503
Alignment:
Q  56 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41354202 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtctgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccac 41354301  T
Q  156 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354302 agacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 41354401  T
Q  256 gatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41354402 gatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 41354501  T
Q  356 ga 357  Q
    ||    
T  41354502 ga 41354503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 50619959 - 50620282
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  50619959 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttga 50620058  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50620059 gttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgtacttgagcaaggaggaaattg 50620158  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50620159 ggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaattgcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcaga 50620258  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  50620259 actccgttgtgttggtttgagtca 50620282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16369953 - 16369620
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |    
T  16369953 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgagatttacttctagattttggaagggtttgcaagaggctttaggctata 16369854  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16369853 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 16369754  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  16369753 aggaggaacgtgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacactttttgaggctttgtatggt 16369654  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16369653 aggaggtgcagaacttcgttgtgttggtttgagt 16369620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21749597 - 21749350
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21749597 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 21749498  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21749497 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 21749398  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  21749397 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcacgtataa 21749350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 19760569 - 19760904
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  19760569 attgtgaagctacatggtgttccatcgaacattgtatcggatagaaatccgaggtttacctctagattttagaagagtttgcaagaagctttaggttcta 19760668  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  19760669 agttgaagttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgctgagagtttgtgtacttgagca 19760768  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  19760769 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcatgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacacctttcgaagctctgtatggt 19760868  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19760869 cggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtca 19760904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20250378 - 20250171
Alignment:
Q  154 gcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccg 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20250378 gcagacagatggtcagttggagaggacgattcagtcgttggaggatttgttgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttcca 20250279  T
Q  254 ttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 353  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20250278 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 20250179  T
Q  354 ttgagtca 361  Q
    ||||||||    
T  20250178 ttgagtca 20250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 22361947 - 22362167
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |    
T  22361947 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagacccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaagatcta 22362046  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | | || |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22362047 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacatatggtcagtcggagaggacgatttagttgttggaagatttgttcagagtttgtgtacttgagca 22362146  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtca 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22362147 aggaggaacttgggatagtca 22362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20137316 - 20137101
Alignment:
Q  144 catatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatag 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20137316 catatcatccgtagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatag 20137217  T
Q  244 tcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccg 343  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20137216 tcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtataggaatggcgccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaacttcg 20137117  T
Q  344 ttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||| ||||||||||    
T  20137116 ttgtgttggtttgagt 20137101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19854966 - 19854635
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  19854966 gtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaaagt 19854867  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||| | || || ||||| |||||    
T  19854866 tgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcactggaggatttactgagagtgtgcgtgcttgaacaagg 19854767  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  19854766 tggagcttgggatagtcacctaccgttgat-gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcacggttcgaagctttgtatagtcgg 19854668  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  19854667 aggtgcaggactcctttacgctggtttgagtca 19854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37677733 - 37677402
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  37677733 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 37677634  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | || || |||||||||||    
T  37677633 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgcgtgcttgagcaagg 37677534  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  37677533 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 37677434  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  37677433 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 37677402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 361
Target Start/End: Original strand, 22432817 - 22433154
Alignment:
Q  24 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 123  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  22432817 aaattgtgaagctgcatgaagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttataggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttc 22432916  T
Q  124 gaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgag 223  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||||||  | |||||  |||||    
T  22432917 gaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtggttgag 22433016  T
Q  224 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatg 323  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22433017 caaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatataacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccattcgaagctttgtatg 22433116  T
Q  324 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  22433117 gttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 22433154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 20835591 - 20835926
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||| ||||    
T  20835591 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagaattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagctgacaagatgcattgggttcga 20835690  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |  ||  | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  20835691 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagacggtcaatcggagagaacgataccatccttggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 20835790  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  20835791 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaagctttgtatggt 20835890  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  20835891 cggaggtgtagaactcctttatgctggtttgagtca 20835926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 20939770 - 20940101
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 129  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  20939770 tgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagacgttttgggttagaagtt 20939869  T
Q  130 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 229  Q
    |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||     
T  20939870 gaggccgagttcgacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttattgagagtgtgtgtacttgagcaaggt 20939969  T
Q  230 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgga 329  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20939970 ggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgga 20940069  T
Q  330 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | |  || ||||| || |||| ||||||||||    
T  20940070 ggtataggactcctttatgctagtttgagtca 20940101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Original strand, 24099306 - 24099577
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  24099306 attgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 24099405  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24099406 ggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 24099505  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattgg 297  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  24099506 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgg 24099577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20295065 - 20294734
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||| | || || || ||||| |||||||    
T  20295065 gtgaagcttcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtctacaggacgccttgggttcgaagt 20294966  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||| ||    
T  20294965 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaggg 20294866  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  20294865 tggagcttcggatagtcaccttccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggttgg 20294766  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  20294765 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 20294734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41308411 - 41308148
Alignment:
Q  96 ggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctaga 195  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||    
T  41308411 ggaagagtttgcaagatgccttgggttctaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattaga 41308312  T
Q  196 ggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtatt 295  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||    
T  41308311 ggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacaattagcattcgagtatt 41308212  T
Q  296 ggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| || || ||||||||||    
T  41308211 ggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcatgactcctttatgttggtttgagt 41308148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 20856476 - 20856798
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  20856476 catggtgttccgtcaagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattga 20856575  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||    
T  20856576 gttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtacttgagcagggtggagcttg 20856675  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||     
T  20856676 ggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 20856775  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| || |||||||| |||||    
T  20856776 actcctttatgctggttcgagtc 20856798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Original strand, 19662844 - 19663143
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19662844 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttacaagatgctttgggttcga 19662943  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||        ||||| | ||||| ||||| ||    
T  19662944 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattgga-----aactgagagtgtgtgtgcttgaaca 19663038  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19663039 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19663138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 276
Target Start/End: Original strand, 31539703 - 31539950
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||      
T  31539703 gtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaaaa 31539802  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  31539803 tgaagttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaagg 31539902  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaa 276  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31539903 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaa 31539950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20139486 - 20139361
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||      
T  20139486 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttacaagaagctttaggttctg 20139387  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcat 151  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20139386 agttgaggttgagtttggcgtatcat 20139361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20250446 - 20250376
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250446 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagaaatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 20250376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21747935 - 21747857
Alignment:
Q  281 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21747935 tatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgctcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 21747857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 20831107 - 20831426
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  20831107 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 20831206  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  20831207 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 20831306  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  20831307 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 20831406  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  20831407 acaccgttgtgttggtttga 20831426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20914609 - 20914532
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  20914609 tcatactagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 20914532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 360
Target Start/End: Original strand, 31550136 - 31550218
Alignment:
Q  278 agctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  31550136 agctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 31550218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 22135272 - 22135421
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||  || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||  | |||||||| ||||    
T  22135272 catggtattccttatagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctatgttttgggaaagtttgcaagctgctttaggaactaagttgaggttga 22135371  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 187  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  22135372 gttctgcttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcag 22135421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 41353357 - 41353402
Alignment:
Q  18 tcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatc 63  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353357 tcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatc 41353402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20914854 - 20914664
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||    
T  20914854 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttctgggagagtttgcaagctgctttgggaactaacttgagattga 20914755  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||    | |||||||||||||||  ||||||  | ||||||||    
T  20914754 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagactgagaggactatttagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaagg 20914664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20184792 - 20184683
Alignment:
Q  71 gatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagt 170  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| | |||     
T  20184792 gatccgagatttacttctatgttttgggagagtttacaagtagctttgggaaccaagttgagattgagttctgcttatcattcccagactgataggcaga 20184693  T
Q  171 cggagaggac 180  Q
    | ||||||||    
T  20184692 cagagaggac 20184683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 361
Target Start/End: Original strand, 22135520 - 22135596
Alignment:
Q  285 attctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||    
T  22135520 attctagtatcgatatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacgccattgtgttggtttgagtca 22135596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8387064 - 8386722
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387064 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 8386965  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386964 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 8386865  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  8386864 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcgccgttcgaag 8386765  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8386764 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 8386722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12524328 - 12523982
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524328 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 12524229  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12524228 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgt 12524129  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524128 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 12524029  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524028 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 12523982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 29038764 - 29039106
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038764 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 29038863  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038864 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 29038963  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29038964 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 29039063  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29039064 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 29039106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 14303340 - 14303684
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303340 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 14303439  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14303440 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 14303539  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303540 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcatgctagtattggaatggcacctttcgaggct 14303639  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303640 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 14303684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12477252 - 12476910
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477252 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 12477153  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12477152 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgcaagaggatttgttgagaatttgt 12477053  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12477052 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 12476953  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12476952 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 12476910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18297855 - 18297515
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18297855 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttcggaaaagtttgcaagaggcct 18297756  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297755 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 18297656  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18297655 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 18297556  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18297555 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 18297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27711986 - 27711646
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27711986 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27711887  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711886 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27711787  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27711786 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagact 27711687  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27711686 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 27711646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14681219 - 14680873
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681219 acattaaggagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 14681120  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14681119 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgt 14681020  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681019 gtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcatatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 14680920  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14680919 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 14680873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40473690 - 40473346
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473690 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 40473591  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473590 tgggtttgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 40473491  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473490 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcacctttcgaggct 40473391  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40473390 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtca 40473346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 19778157 - 19778495
Alignment:
Q  19 caaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttg 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19778157 caaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttg 19778256  T
Q  119 ggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778257 ggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 19778356  T
Q  219 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19778357 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcttt 19778456  T
Q  319 gtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778457 gtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 19778495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Original strand, 8052985 - 8053325
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8052985 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 8053084  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053085 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 8053184  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8053185 tcttcagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 8053284  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8053285 ttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttga 8053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 18226808 - 18227152
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18226808 atcaaggagattgtgaggttacatggtgtgccttcgagcattgtatcagatcgagatccaagatttacttctagattttggaggagtttgcaagaggctt 18226907  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18226908 taggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 18227007  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18227008 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 18227107  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18227108 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttttagtca 18227152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 15147249 - 15147590
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15147249 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 15147348  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15147349 gttctaagttgagattgagttcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 15147448  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15147449 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 15147548  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15147549 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 15147590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 16251810 - 16252151
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251810 aaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 16251909  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  16251910 gttcgaagttgagattgagttcggcttatcattcgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcactagaggatttgttgtaagtttgtgttct 16252009  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16252010 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacgtacaataatagttatcattctattattggaatgacaccttttgaggctttg 16252109  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252110 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 16252151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23956397 - 23956057
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23956397 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 23956298  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956297 tgggttcgaagttgagattaagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 23956198  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23956197 tcttgaacaaggaggaacttaggaccgtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 23956098  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23956097 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 23956057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16354816 - 16355151
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  16354816 attgtgaagtttcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagatatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 16354915  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16354916 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagca 16355015  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16355016 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtatttgaatggcaccttttgaggctttatatggt 16355115  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16355116 cggagatggagaattccgttgtgttggtttgagtca 16355151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 1639793 - 1640131
Alignment:
Q  23 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 122  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1639793 gaaattgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggtt 1639892  T
Q  123 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 222  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  1639893 cgaagttgaggtggagtttggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggaaagaacgattcagtcgctggaggacttgttgagagtttgtgtacttga 1639992  T
Q  223 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtat 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1639993 gcaaggagggacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacttacaataatatttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggctttgtat 1640092  T
Q  323 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1640093 ggtcgaagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 1640131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7091076 - 7090742
Alignment:
Q  23 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 122  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  7091076 gaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaaatttacttctagattttagaaaagtttgcaagaggctttaggtt 7090977  T
Q  123 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 222  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||  |||| |||||| |    
T  7090976 ctaagttgaggttgagttcagcatatcatccgcagacagatagtcagtcggagaggacgatttagtcgttagaagatttgttgagggtttgggttcttta 7090877  T
Q  223 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||    
T  7090876 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattagaatggaaccttatgaggctttatat 7090777  T
Q  323 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7090776 ggtcggagatgcagaactcagttgtgttggtttga 7090742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8706559 - 8706225
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |    
T  8706559 attgtgaagctgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgagttcta 8706460  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8706459 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 8706360  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  8706359 aggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtatatgaatgacaccattcgaagctttgtatggt 8706260  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  8706259 cggaggtgcagaacttcgttatgttggtttgagtc 8706225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 124 - 361
Target Start/End: Original strand, 14266368 - 14266605
Alignment:
Q  124 gaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgag 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14266368 gaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 14266467  T
Q  224 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14266468 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagctatcattccagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 14266567  T
Q  324 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266568 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 14266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14850737 - 14851072
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  14850737 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 14850836  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14850837 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaatgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 14850936  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  14850937 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgga 14851036  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     | || ||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  14851037 agaaggtgcagaactccgttgtgttggctcgagtca 14851072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 15414657 - 15414991
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15414657 attgtgaagctgcatggtgttccgtcaagtattgtgtcggatagagatccaagatttacatctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaa 15414756  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15414757 agttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatagccagtcggagagaacgattcaatcgttagatgatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15414856  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  15414857 aggtggagtttgggatagtcatctgccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggt 15414956  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  15414957 cggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtc 15414991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15078276 - 15077942
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  15078276 attgtgaagttgcatggggttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggtttacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 15078177  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15078176 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcgaagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15078077  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15078076 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15077977  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15077976 cagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtc 15077942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 1648908 - 1649243
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  1648908 attgtgaagcttcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttccagattttagaagagtttgcaggacgctttgggttcga 1649007  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  1649008 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagtgtgtgtgtgcttgagca 1649107  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  1649108 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatgtcaccgttcgaagctttgtatggt 1649207  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1649208 cggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtca 1649243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15246565 - 15246230
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15246565 attgtgaagttacatggagtttcgtcgagtattgtatcggatagagattcgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 15246466  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15246465 agttgaggttgagttcgacttatcatccccagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattagaggatttggtgagagtgtgtgtacttgagca 15246366  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |||  |||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15246365 aggtggaggttgggatagtcaactaccgttgatagagttgacgtacaacaacagtcaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15246266  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||| || | || ||||||||||    
T  15246265 cggaggtgcagaactcctttattctagtttgagtca 15246230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 15358721 - 15359056
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| |||| ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  15358721 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagatttgggaagagtctgcaagatgcattgggttcga 15358820  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | | ||| ||||| ||    
T  15358821 agttgaggttgagttcgacttatcatcctcagagagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtctgtgcttgaaca 15358920  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15358921 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcatgtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15359020  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15359021 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 15359056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20891623 - 20891288
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | || ||||| || || || ||||| || |||| |||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  20891623 attgtgaagttgcacggtgtaccgtcaagtattgtgtcggataaagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggttcga 20891524  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  20891523 agttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtacttgagca 20891424  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  20891423 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgattgagttcacatataacaatagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggc 20891324  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  20891323 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 20891288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14691543 - 14691353
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  14691543 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 14691444  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  14691443 agttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgt 14691353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 3264428 - 3264759
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3264428 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 3264527  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  3264528 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 3264627  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  3264628 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 3264727  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  3264728 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 3264759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 29453171 - 29453502
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29453171 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 29453270  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  29453271 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 29453370  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  29453371 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 29453470  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  29453471 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 29453502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 15002995 - 15003329
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  15002995 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggaaagagacccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 15003094  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  15003095 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctaagcgtatgtgtacttgagca 15003194  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15003195 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 15003294  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||  || || ||||| || || |||||||||||    
T  15003295 cggaagtggaggactcctttatgttggtttgagtc 15003329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27901027 - 27900693
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  27901027 attgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccggggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcattgggttcaa 27900928  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  27900927 aattgaggttgagttcagcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtgcttgagca 27900828  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27900827 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttcatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 27900728  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  27900727 cggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtc 27900693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 11206865 - 11207196
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||| || | ||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  11206865 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttctaggttcttgaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 11206964  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  11206965 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaagg 11207064  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||| | |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  11207065 tggagcttgggatagtcacttgcctttggttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 11207164  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  11207165 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 11207196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33223564 - 33223224
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  33223564 attgtgaagctacatggtgtcccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggttcga 33223465  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggag-----aggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 220  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     ||||| || || ||  | || |||||  ||||| | ||||| |||    
T  33223464 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggagaggacgatccaatcattggaagatttactgagagtgtgtgtactt 33223365  T
Q  221 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgt 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |  || || |  |||||||| ||| |||| ||| | || ||||    
T  33223364 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacataaaacaaaaaataacaatagagtattggtatgacaccattcaaagcattgt 33223265  T
Q  321 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33223264 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 33223224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 44661500 - 44661831
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||    
T  44661500 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcaaagt 44661599  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  44661600 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 44661699  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatctt-ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcg 327  Q
     ||| ||||||| |||| ||||  | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44661700 tggagcttgggacagtc-tcttgtctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcg 44661798  T
Q  328 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  44661799 gaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 44661831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 204 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14159955 - 14159798
Alignment:
Q  204 tgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggc 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14159955 tgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcaccttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggc 14159856  T
Q  304 acctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14159855 accttttgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 14159798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14160111 - 14159970
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  14160111 attgtgaagttgcatggtgttccttcaaacattgtattagacagagacccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 14160012  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtc 167  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14160011 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtc 14159970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15319792 - 15319641
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  15319792 attgtgaagttgcatggtgtcccatcgagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttgggttcaa 15319693  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 177  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319692 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 15319641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16146459 - 16146218
Alignment:
Q  122 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt--ct 219  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||  | ||| | |||||   ||    
T  16146459 tcgaagttggggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatctttggaggatttactaagagtgtgtgtgtgct 16146360  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  16146359 tgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttg 16146260  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  16146259 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 16146218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15070862 - 15070720
Alignment:
Q  218 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 317  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15070862 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 15070763  T
Q  318 tgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15070762 tgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtc 15070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14652754 - 14652614
Alignment:
Q  221 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgt 320  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  14652754 gagcaaagatgaacttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgt 14652655  T
Q  321 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14652654 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtca 14652614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14997945 - 14997623
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| | ||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | |||||||||||||    
T  14997945 catggtataccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggcaacaaagttgagattga 14997846  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  14997845 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 14997746  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  14997745 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 14997646  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  14997645 acaccgttgtgttggtttgagtc 14997623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Original strand, 51605998 - 51606147
Alignment:
Q  212 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcg 311  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  51605998 tgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcg 51606097  T
Q  312 aggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51606098 aagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtca 51606147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13248232 - 13247955
Alignment:
Q  80 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    ||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13248232 tttacttctaagttctgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagagga 13248133  T
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttggga-tagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaata 278  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||||| || |  | | |||||||| ||||| || || ||||| |    
T  13248132 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttagagcaaggtgtcagttgggactaatgtt-taccgttgattgagtttacttacaacaaca 13248034  T
Q  279 gctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    | | ||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  13248033 gttttcattctagtattaggatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtttga 13247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 15293013 - 15293122
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |    
T  15293013 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 15293112  T
Q  351 ggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||    
T  15293113 ggtttgagtc 15293122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9291464 - 9291142
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||  || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  9291464 catggtattccttatagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 9291365  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    || | || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  9291364 gtactgcttaccatcctcagaccgatggacagacggagaggactatttagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 9291265  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | |  ||||||| ||||| || || ||||  || | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  9291264 ggacgaatgtttatcgttgattgagtttacttacaacagcagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 9291165  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||| |||||||||||    
T  9291164 acaccattgtgttggtttgagtc 9291142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 361
Target Start/End: Original strand, 12342548 - 12342829
Alignment:
Q  80 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||| || |||||||  || |||||||| || || ||||| ||| |||||||||    
T  12342548 tttacttctaaattttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttaaggttgagttatgcttatcatccccatactgatgggcagacggagagga 12342647  T
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatag 279  Q
      ||||||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | ||||| |     | | |||||||| ||||| || || ||||| |     
T  12342648 atattcagagttttgaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgggttgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacaa 12342747  T
Q  280 ctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  12342748 ttttcattctagtattgggatggcaccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtagaacgtcgttgtgttggtatgagtca 12342829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Original strand, 18549694 - 18549834
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  | ||||    
T  18549694 gtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaatgtgctttgggaactaagt 18549793  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcag 169  Q
    | | | ||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  18549794 taaaactgagttctgcatatcacccacaaactgatggtcag 18549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 357
Target Start/End: Original strand, 55375214 - 55375320
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || || || | |||||| |    
T  55375214 ccgttgattgagtttacttacaacaacagtttacattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgtt 55375313  T
Q  351 ggtttga 357  Q
    |||||||    
T  55375314 ggtttga 55375320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 15423974 - 15424013
Alignment:
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatgg 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15423974 agttgagattgagttcggcataccatccacagacagatgg 15424013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16685669 - 16685559
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| || |||||  |||| || |    
T  16685669 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggaaggaggtgtagaacgtcgttatgtt 16685570  T
Q  351 ggtttgagtca 361  Q
    ||| |||||||    
T  16685569 ggtatgagtca 16685559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14697
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041 atcaaggagattgtgaggttacatggggttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 14942  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14941 tgggtttgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 14842  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14841 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtcatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 14742  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14741 ttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtca 14697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 957
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1301 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 1202  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1201 tgggttcgaagttgaggttgaattcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 1102  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1101 tcttgagcaaggaggaacttaggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattaaagtattggaatggcacctttcgaggct 1002  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1001 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43837 - 43491
Alignment:
Q  15 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43837 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 43738  T
Q  115 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43737 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgt 43638  T
Q  215 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637 gttcttgagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 43538  T
Q  315 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537 ctttatatgttcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 43491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15617 - 15284
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15518  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  15517 tgggatcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggat-----------ttgtgt 15429  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15428 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 15329  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15328 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtca 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9155 - 8824
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9155 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 9056  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  9055 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggagg-----------atttgtgt 8967  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8966 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 8867  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8866 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagt 8824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 50148 - 50482
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50148 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcaaatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttccaagatgctttgggctcga 50247  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||  || ||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  50248 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacggatggtcagtcggagagaacgatacaatccttaaaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 50347  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  50348 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 50447  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  50448 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 50482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 357
Target Start/End: Original strand, 106226 - 106538
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||| ||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  106226 ttccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtctgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgc 106325  T
Q  145 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 244  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||| || |||    | |||||||||||||||  ||||||  | || |||||    | ||||||        
T  106326 ttaccatccccagaccgatgggcagacgaagaggactatccagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggaacaaggtatcagttgggacgaa 106425  T
Q  245 catcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgt 344  Q
      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| |||| || || || ||||    
T  106426 tgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggctccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtaggacaccgt 106525  T
Q  345 tgtgctggtttga 357  Q
    |||| ||||||||    
T  106526 tgtgttggtttga 106538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1095 - 755
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1095 atcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 996  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  995 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 896  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  895 tcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgttcgaggct 796  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  795 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19113406 - 19113066
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19113406 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 19113307  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113306 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 19113207  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19113206 tcttgagcagggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 19113107  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19113106 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 19113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 30313209 - 30313553
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313209 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 30313308  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30313309 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggattagttgagagtttgtgt 30313408  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30313409 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcaccttttgaggct 30313508  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30313509 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtggtggtttgagtca 30313553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 36 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15534077 - 15533752
Alignment:
Q  36 tacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagatt 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15534077 tacatggtgttccttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagatt 15533978  T
Q  136 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15533977 gagttcggcttatcatccacagaaagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaact 15533878  T
Q  236 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533877 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgca 15533778  T
Q  336 gaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15533777 gaactccgttgtgttggtttgagtca 15533752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18857293 - 18856949
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18857293 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 18857194  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18857193 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcacccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 18857094  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857093 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataataggtatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 18856994  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18856993 ttatatggtcggagatgcataactctgttgtgctggtttgagtca 18856949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 22133127 - 22133450
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22133127 catggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 22133226  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133227 gttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 22133326  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22133327 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcaga 22133426  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  22133427 actccgttgtgcgggtttgagtca 22133450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 17674090 - 17674428
Alignment:
Q  19 caaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttg 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17674090 caaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttg 17674189  T
Q  119 ggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674190 ggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 17674289  T
Q  219 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17674290 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcttt 17674389  T
Q  319 gtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674390 gtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 17674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Original strand, 22120239 - 22120581
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22120239 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtattccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22120338  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120339 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 22120438  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120439 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 22120538  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120539 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 22120581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32600860 - 32600522
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32600860 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctt 32600761  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||    
T  32600760 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgttataggatttgttgagagtttgtgt 32600661  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32600660 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 32600561  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32600560 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 32600522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22047089 - 22046749
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22047089 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcatcatatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22046990  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046989 taggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 22046890  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22046889 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatggttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 22046790  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046789 ttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgctggtttga 22046749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 16408131 - 16408454
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16408131 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagacccaagatttacttatagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattga 16408230  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408231 gttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 16408330  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16408331 ggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatacaga 16408430  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16408431 actccgttgtgttggtttgagtca 16408454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22040575 - 22040235
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22040575 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaacatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22040476  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22040475 taggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 22040376  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22040375 tcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaatattagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggct 22040276  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040275 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 22040235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 56 - 357
Target Start/End: Original strand, 19484974 - 19485275
Alignment:
Q  56 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19484974 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtctgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccac 19485073  T
Q  156 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485074 agacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 19485173  T
Q  256 gatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19485174 gatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 19485273  T
Q  356 ga 357  Q
    ||    
T  19485274 ga 19485275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 22164278 - 22164600
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22164278 catggtgttccttcgagcattgtattagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 22164377  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164378 gttcagcgtgtcatccgcagacatatggtcagtcagagaggacaattcagtcgct-gaagatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 22164476  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22164477 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtacggtcggtgatgcaga 22164576  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  22164577 actccgttgtgcaggtttgagtca 22164600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 67 - 357
Target Start/End: Original strand, 20017865 - 20018155
Alignment:
Q  67 tagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20017865 tagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggt 20017964  T
Q  167 cagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017965 cagtcggagaggacaattcagtcgttagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 20018064  T
Q  267 catataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20018065 cttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 20018155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 21921809 - 21922144
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21921809 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 21921908  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21921909 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgtagaggacgattcaatagctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 21922008  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21922009 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctactattggaatggcaccttatgaggctttctatggt 21922108  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21922109 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 21922144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 21166606 - 21166942
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166606 aaggagattgtaaagttgcatggtgttccttcgagcatt-tatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 21166704  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21166705 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 21166804  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21166805 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagtttacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 21166904  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21166905 tatggtcgaagatgcagaactcaattgtgttggtttga 21166942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19978683 - 19978339
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19978683 atcaatgaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtaacaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggctt 19978584  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19978583 tgggttctaagttgagattgagctcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagatttagtgt 19978484  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19978483 acttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcacctttggaggct 19978384  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19978383 ttatatggtcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 19978339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23650748 - 23650413
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  23650748 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 23650649  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  23650648 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcaatcggagagaacgattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgcgtacttgagca 23650549  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||    
T  23650548 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcgccttatgaagctttgtatggt 23650449  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23650448 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 23650413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 21788433 - 21788761
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  21788433 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttccagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtttta 21788532  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21788533 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 21788632  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  21788633 aggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggc-ttgtatggt 21788731  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21788732 cggagatgcagaactccgttgtgttggttt 21788761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21251648 - 21251317
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21251648 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 21251549  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21251548 agttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 21251449  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||  ||| ||||||   | ||||||||||||    
T  21251448 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattgagatgacaccttattacgctttgtatggt 21251349  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21251348 cgaagatgcagaactccgttgtgttggtttga 21251317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 21393939 - 21394268
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  21393939 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttccagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtttta 21394038  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21394039 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 21394138  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtat-gg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  21394139 aggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggc-ttgtatggg 21394237  T
Q  325 tcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21394238 tcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 21394268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 22377528 - 22377861
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  22377528 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggcttttggttcta 22377627  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22377628 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 22377727  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  22377728 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatgga 22377826  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
     | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22377827 agaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtc 22377861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 22383703 - 22384036
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  22383703 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggcttttggttcta 22383802  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22383803 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 22383902  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  22383903 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatgga 22384001  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
     | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22384002 agaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtc 22384036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23949624 - 23949291
Alignment:
Q  28 tgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaag 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| || || |||    
T  23949624 tgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtatgcaataggttttaggttctaag 23949525  T
Q  128 ttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaag 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23949524 ttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggaaataacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaag 23949425  T
Q  228 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23949424 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaagctctatatggtcg 23949325  T
Q  328 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23949324 gaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtca 23949291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20388794 - 20388472
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  20388794 catggtgttccgtcgataattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgtaagaggcgttgggttctaagttgaggttga 20388695  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  20388694 gttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaaagattcagtcgttagaggattttttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 20388595  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20388594 ggatagtcatctaccgttgatagagttcatgtacaacaacagttaccattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcaga 20388495  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  20388494 actccgttgtgttggtttgagtc 20388472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22987903 - 22987575
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||     ||||||||||| |||||| |||||||||| || || |    
T  22987903 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatgagatagagattcgagattta-----agattttggaagagtttgtaagaggctttaggttcta 22987809  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22987808 agttgaggttgcgttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 22987709  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  || || || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  22987708 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcatgtacaataacaattatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtacggt 22987609  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22987608 cggagatgcagaactccgttgtgttggttcgagt 22987575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 20396199 - 20396534
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  20396199 attgtgaagttgcatggtgtcctgccgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 20396298  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    || || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20396299 agctgtggttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 20396398  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20396399 aggtgcgacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggt 20396498  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20396499 cggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtca 20396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 20975725 - 20976060
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  20975725 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcagatggagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcatgatgctttgggttcga 20975824  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||    
T  20975825 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactttagca 20975924  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20975925 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 20976024  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20976025 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 20976060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 31416548 - 31416883
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31416548 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 31416647  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  31416648 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 31416747  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31416748 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 31416847  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  31416848 cggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagtca 31416883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19852106 - 19851784
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  19852106 catggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagttcgcaagatgcattgggttcaaaattgaggttga 19852007  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19852006 gttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 19851907  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  19851906 gtatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 19851807  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  19851806 actccattgtgttggtttgagtc 19851784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19858142 - 19857820
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  19858142 catggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagttcgcaagatgcattgggttcaaaattgaggttga 19858043  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19858042 gttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 19857943  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  19857942 gtatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 19857843  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  19857842 actccattgtgttggtttgagtc 19857820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23655634 - 23655300
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||     
T  23655634 attgtgaagttgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagacgccttgggttcgg 23655535  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  23655534 agttgaggttgagttcgggttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 23655435  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23655434 aggtggagcctgggacagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 23655335  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23655334 cggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtc 23655300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1266945 - 1266610
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  1266945 attgttaagctgcatggtgtaccgtcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattatggaagagcttgcaagatgctttgggttcaa 1266846  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| || || ||  ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  1266845 agttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcggtcggagaggacgatccaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 1266746  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1266745 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 1266646  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1266645 cagaggtgcaggactcctttgtgctagtttgagtca 1266610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 22061507 - 22061842
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||| ||||    
T  22061507 attgtgaaactacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctaggttctggaagagtctgcaggacgctttgggttcga 22061606  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||| ||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  22061607 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggagtatttgttgagagtgtgtgtgcttgagga 22061706  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  22061707 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 22061806  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22061807 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 22061842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22051569 - 22051235
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||    
T  22051569 ttgtgaagctaaatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttccaa 22051470  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  22051469 gttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcgttggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 22051370  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22051369 ggtggagcttgggatagtcacctaccatttatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 22051270  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22051269 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtca 22051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14565846 - 14565515
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  14565846 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 14565747  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14565746 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 14565647  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14565646 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 14565547  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  14565546 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 14565515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 803750 - 804081
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  803750 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 803849  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  803850 tgaggttgagtttggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 803949  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  803950 tggagcttgggatagtcacttacctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 804049  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  804050 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 804081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Original strand, 16271301 - 16271628
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  16271301 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttatggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 16271400  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16271401 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 16271500  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16271501 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 16271600  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttg 356  Q
    || || || ||||| || ||||||||||    
T  16271601 aggtgtaggactcctttatgctggtttg 16271628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 29303500 - 29303835
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  29303500 attgtgaagctacatggggttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 29303599  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  29303600 ggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggatgatttgttaagggtgtgtgtacttgagca 29303699  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||    
T  29303700 aggtggagcttgggatagccacctaccgttgatagagttcacttataacaacaactatcattcgagtataggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 29303799  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  29303800 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 29303835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 31570917 - 31571251
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  31570917 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 31571016  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  31571017 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 31571116  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31571117 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaatagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 31571216  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31571217 gaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtca 31571251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6604362 - 6604031
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6604362 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 6604263  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  6604262 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 6604163  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  6604162 tggagcttgggacagtcacttacctttgattgagtttacgtataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 6604063  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6604062 aggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtc 6604031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6679815 - 6679484
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6679815 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 6679716  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  6679715 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 6679616  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  6679615 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 6679516  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  6679515 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 6679484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12305462 - 12305131
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||  || ||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||    
T  12305462 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagggatccgaggttcacttctatgttctggaagagtttacaggacacattgggttcgaagt 12305363  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  12305362 tgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 12305263  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  12305262 tggagcttgggatagtcacatgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagcattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 12305163  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || || || || ||||||||||||||    
T  12305162 aggtgtaggacccctttatgctggtttgagtc 12305131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 20009974 - 20010308
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||   || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  20009974 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagaaatttcaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagatgccttgggttcaa 20010073  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  20010074 agttaagggtgagttcggcttatcatccgcaggcagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 20010173  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  20010174 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaaactttgtatggt 20010273  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  20010274 cggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtc 20010308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21841124 - 21840790
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || |    
T  21841124 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttaaaagatgccttgggttcta 21841025  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21841024 agttgaggttgagttcggctcatcatctgcaaacaaatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21840925  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21840924 aggtggagcttgggatagtcatctatcgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 21840825  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  21840824 cggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtc 21840790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22371647 - 22371371
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  22371647 attgtgaagtttcatgggcttccatcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggtttacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgcgttgggttcaa 22371548  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  22371547 agttgaggttgggttcggcttataatccgcaaacagatggtgagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgtacttgagca 22371448  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatgg 302  Q
    | | ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  22371447 acgtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagatttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgg 22371371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27355252 - 27355035
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  27355252 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 27355153  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  27355152 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacggatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 27355053  T
Q  229 aggaacttgggatagtca 246  Q
     ||| |||||||||||||    
T  27355052 tggagcttgggatagtca 27355035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 22129005 - 22129132
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129005 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtattccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22129104  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||    
T  22129105 taggttcgaagttgaggttgagttcggc 22129132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 21850423 - 21850745
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  21850423 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 21850522  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  21850523 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 21850622  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  21850623 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggtaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 21850722  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  21850723 acaccgttgtgttggtttgagtc 21850745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 16877181 - 16877503
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | ||||| |||||||    
T  16877181 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttaagattga 16877280  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  16877281 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 16877380  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  16877381 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcagg 16877480  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||||| || |||||||||||    
T  16877481 acaccgttatgttggtttgagtc 16877503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 21196588 - 21196907
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| |  |||| || ||||||||||  |||||| | || ||||||   |||||||   | |||||||||||||    
T  21196588 catggtattccttctagtattgtgtcagatcggaatccgaggtttacttctacgttttgggagagcttgcaaactgctttggaaactaagttgagattga 21196687  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |  ||||||| ||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    | |||    
T  21196688 gttctgcttatcatccccagaccgatgggcagacatagaggactatttagagtttagaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtatcagttg 21196787  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  21196788 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 21196887  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  21196888 acaccgttgtgttggtttga 21196907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22315886 - 22315563
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||||   ||||||||  | |||||||| ||||    
T  22315886 catggtattccttccagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttttaggttttgggaaagtttgcaaactgctttgggaactaagttgaggttga 22315787  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    || | || |||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| ||| ||    | || |||||||| |||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  22315786 gtcctgcttatcatccccagagtgatgggcagacggagaggactatttagagtttggaagatttgttaagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 22315687  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    || |     ||| |||||||| ||||| || |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | || || |||    
T  22315686 ggttgaatgtctaccgttgattgagtttacttataacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaga 22315587  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || || ||||| |||| |||||||    
T  22315586 acgccattgtgttggtatgagtca 22315563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22983128 - 22982806
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | |||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  22983128 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtt-gcaagctgctttgggaactaagttgagattga 22983030  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  22983029 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcaaacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtcttggagcaaggtgtcagttg 22982930  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||| |    ||| |||||||| ||||| || || ||||| |  | |||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  22982929 ggacaaatgtctaccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtgtcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 22982830  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  22982829 acaccgttgtgttggtttgagtca 22982806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 23157098 - 23157416
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||| | || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||    
T  23157098 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggattcgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagtagagattga 23157197  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||  | ||||| || ||||| ||||| | | |||||| ||  ||||||    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  23157198 gttctacttatcacccccagactgatgggccgacggagaagattattcagagtttagaggatttgttgagaacttgtgtt-tggagcaaggtgttagttg 23157296  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  23157297 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 23157396  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  23157397 acaccgttgtgttggtttga 23157416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 360
Target Start/End: Original strand, 20652635 - 20652741
Alignment:
Q  254 ttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 353  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| | |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  20652635 ttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 20652734  T
Q  354 ttgagtc 360  Q
    || ||||    
T  20652735 ttaagtc 20652741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 19484130 - 19484175
Alignment:
Q  18 tcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatc 63  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19484130 tcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatc 19484175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23900971 - 23900822
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| |  ||||| |||||| | ||||  || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||  |||    
T  23900971 catggtattccttctaatattgtgtcagatcgggatctgaggtttacttctatgttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggctga 23900872  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 187  Q
    ||||  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  23900871 gttctacttatcatccccagaccgatggtcagacagagaggactattcag 23900822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19863765 - 19863639
Alignment:
Q  24 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 123  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  |    
T  19863765 aaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaaagtgctttgggtac 19863666  T
Q  124 gaagttgagattgagttcggcatatca 150  Q
     ||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19863665 taagttaaaactgagttctgcatatca 19863639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19868402 - 19868276
Alignment:
Q  24 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 123  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  |    
T  19868402 aaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaaagtgctttgggtac 19868303  T
Q  124 gaagttgagattgagttcggcatatca 150  Q
     ||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19868302 taagttaaaactgagttctgcatatca 19868276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19863506 - 19863457
Alignment:
Q  284 cattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  19863506 cattctagtattgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatg 19863457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19868143 - 19868094
Alignment:
Q  284 cattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  19868143 cattctagtattgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatg 19868094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13168 - 12826
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168 atcaaggagattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 13069  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  13068 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatttagtcactagaggatttgctgagagtgtgtgt 12969  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12968 tcttgagcaaggaggaacttgggatagacatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 12869  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12868 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 12826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8471 - 8127
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8471 atcaaggtgattgtgaggttacatggtattccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagtttttggaaaagtttgcaagaggctt 8372  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8371 tgggttcgatgttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 8272  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8271 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 8172  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8171 ttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8078 - 7736
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8078 atcaaggagattgtgaagttgtatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 7979  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7978 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 7879  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7878 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggtt 7779  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7778 ttttatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 7736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4374
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 4129  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4130 tgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 4229  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4230 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagct 4329  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4330 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtca 4374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7620 - 7276
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7620 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 7521  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7520 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgt 7421  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7420 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 7321  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7320 ttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtca 7276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9277 - 8933
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9277 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 9178  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9177 tgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 9078  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9077 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagct 8978  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8977 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtca 8933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 33198 - 33542
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 33297  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33298 tgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagccggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 33397  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33398 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagct 33497  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33498 ttgtatggttggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtca 33542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 66086 - 65742
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66086 atcaaggagatcgtgaggttacatggtgttccttcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 65987  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  65986 tgggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttagaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgt 65887  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65886 tcttgagcaaggaagaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 65787  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  65786 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 65742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 39466 - 39784
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  39466 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttcgaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttaagattga 39565  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39566 gttcggcgtatcatccacagacagatg-tcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttg 39664  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39665 ggatagtcatcttccgttgatagatttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggtaccttttgaggctttatatggtcggagatgcaga 39764  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  39765 actccgtcgtgttggtttga 39784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18122 - 17785
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18122 atcaaggagattgtgaggttacacggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 18023  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18022 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagagtttgtgt 17923  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17922 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccactgatcgagttcacataaaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 17823  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtt 354  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  17822 ttgtatggtcagagatgtagaacttcgttgtgttggtt 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14711 - 14380
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |    
T  14711 attgtgaagttgcatggtgttcattcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagattcta 14612  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  14611 agttgaggttgagttcggcgtatcagccgcaaacagatgctcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagta 14512  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14511 aggaggaacttgggaaagtcatcttccattgatatagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 14412  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14411 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 14380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32082 - 31749
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  32082 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 31983  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  31982 agttggggttgagttcagcttatcatccgcaaacagattgtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 31883  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    | | ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31882 aagtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgatatggcaccgttcgaagctttgtatggt 31783  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||    
T  31782 cggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagt 31749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Original strand, 18489 - 18557
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattt 94  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18489 attgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtatcatatagagatccaagatttacttctagattt 18557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22548 - 22204
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22548 atcaaggagattgtgaggttacatggtgtttcttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22449  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22448 taggttcgaagttgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagtggacaattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgt 22349  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22348 ccttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatcgagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggct 22249  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22248 ttgtatggtcggagatgcagatctccgttgtgttggtttgagtca 22204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8047 - 7714
Alignment:
Q  17 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 116  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8047 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagaggtccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 7948  T
Q  117 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  7947 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcaggcggagaggacaattcagtcgctagaggat-----------ttgtgt 7859  T
Q  217 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7858 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 7759  T
Q  317 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7758 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtca 7714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 278458 - 278795
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  278458 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaagagtttgcaagaggccttcg 278557  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  278558 gttctaaattgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 278657  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  278658 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcgcatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 278757  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278758 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 278795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 260979 - 260645
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  260979 ttgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 260880  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  260879 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatctaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 260780  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  260779 ggtggagcttgggacagtcacctaccactgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 260680  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  260679 ggaggtgcaggactctgttatgctggtttgagtca 260645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 164538 - 164678
Alignment:
Q  221 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgt 320  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  164538 gagcaaagatgaacttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgt 164637  T
Q  321 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  164638 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtca 164678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7044 - 6713
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  7044 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 6945  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6944 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 6845  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6844 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 6745  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6744 cggagatgcagaactctgttgtgttggtttga 6713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3153
Alignment:
Q  31 gaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttg 130  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  3458 gaagttacatggtgttccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcgaagttg 3359  T
Q  131 agattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggag 230  Q
    || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  3358 aggttgagttcgtcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtg 3259  T
Q  231 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggag 330  Q
    || ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3258 gagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaagaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggag 3159  T
Q  331 atgcag 336  Q
     |||||    
T  3158 gtgcag 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6361
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  6695 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaaaagtttgcatgaggctttaggttcta 6596  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6595 agttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcactagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 6496  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6495 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgaggctttgtatggt 6396  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6395 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 1158 - 1493
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || || || || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  1158 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtatcgtgtcggacagggatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgctttgggttcga 1257  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  1258 agttgtggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 1357  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1358 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggt 1457  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  1458 cggaggtgcaagactcctttatgctggtttgagtca 1493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 63659 - 63998
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  63659 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattatatcagaaaaagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctctgg 63758  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  63759 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 63858  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  63859 tgagcaaagaggaacttgggataatcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattaacattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 63958  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  63959 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 63998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 451 - 788
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  451 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgaaagaggctttgg 550  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  551 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagttgctagaggatttgttgagtgtttgtgtact 650  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || || || |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  651 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatggatagagttcacgtacaataacaattatcattccagtattggaatggcaccttttgaggcttta 750  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  751 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6691 - 6355
Alignment:
Q  21 aggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttggg 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6691 aggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagaatttggaagagtttgcaagaggctttggg 6592  T
Q  121 ctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 220  Q
     || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6591 ttctaagttgagattgtgttcggcgtatcatccgtagacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgttctt 6492  T
Q  221 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6491 gatcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcacatacaataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 6392  T
Q  321 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6391 atggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttga 6355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 33
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || |    
T  368 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagagcctttaggttcta 269  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  268 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtctcttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 169  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  168 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggt 69  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  68 cggagatgcagaacttcattatgttggtttgagtca 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1350 - 1013
Alignment:
Q  24 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  1350 aaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaggaggctttaggttc 1251  T
Q  124 gaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgag 223  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||    
T  1250 taagttgagattgagtttggcgtatcatcctcagacatatggtcagtccgaaaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgcgtacttgag 1151  T
Q  224 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatg 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1150 caagaaggaacttgggatagtcatcttctattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatg 1051  T
Q  324 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1050 ttcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5893 - 5562
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  5893 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 5794  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||    
T  5793 agttgaggttgagttcggcgtatcatctgtagacagattgttagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagtttgcgtacttgagca 5694  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5693 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtatcggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 5594  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5593 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6709 - 6390
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||    
T  6709 catggtgttccttcgaccattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagattctaagttgaggttga 6610  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6609 gttcggcatatcatccgcaaatagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 6510  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6509 ggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccctatgaggctttgtatggtcggagatgcaga 6410  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  6409 actccattgtgttggtttga 6390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50165 - 49830
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  50165 attgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 50066  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  50065 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgtaagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagca 49966  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49965 aggaggaactttcgatagttatcctccattgatagtgttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 49866  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49865 cagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 49830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19280 - 19121
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19280 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 19181  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 34704 - 34604
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34704 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 34605  T
Q  120 g 120  Q
    |    
T  34604 g 34604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16327 - 15994
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16327 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagaattgcatcatatagagatccaagatatacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 16228  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16227 agttgaggttgagttcggcgtatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 16128  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||    
T  16127 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcacgtacaataatatttatcattctagtattggaatggcatcttatgaggctttttttggt 16028  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16027 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 15994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8293
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  7963 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtt-gcaagaggctttaggttcta 8061  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8062 agttgaggttgagttcggcgtatcatccaaagaaaaatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtatgtgttcttgagca 8161  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8162 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 8261  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8262 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 229715 - 229380
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |    
T  229715 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttatagagtttggaaaagtttgcaagaggatttaggttcta 229616  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  229615 agttaaggttgagttcggcgtatcattcgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 229516  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  229515 aggaggaacttgggatattcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggttttgtatggt 229416  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  229415 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 229380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Original strand, 219051 - 219379
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  219051 attgtgaagtgacatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 219150  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  219151 agttgaggttgagttcggggtatcatccgcagacagatggtcagtcgaagagaacgattcattcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 219250  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||     
T  219251 aggaggaacttgggataatcatcttccgtttatagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggttttgaatgga 219350  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtt 354  Q
     | || ||||||||||||||||| |||||    
T  219351 agaaggtgcagaactccgttgtgttggtt 219379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Original strand, 32667 - 32791
Alignment:
Q  62 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacag 161  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  32667 tcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaacaaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccg 32766  T
Q  162 atggtcagtcggagaggacaattca 186  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||    
T  32767 atgggcagacagagaggactattca 32791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 32856 - 32965
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||| | ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |    
T  32856 ccgttggttgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccatttaaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgtt 32955  T
Q  351 ggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||    
T  32956 ggtttgagtc 32965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 197106 - 197404
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  197106 aaggagattgtgaagttgtatggcgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttag 197205  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  197206 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtttgtgtact 197305  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  197306 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttt 197404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 328 - 663
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  328 attgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtgtgtgatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 427  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  428 agctgaggttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 527  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    || ||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  528 agaaggaacttgagataatcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggt 627  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  628 cggagatgcaaaactccgttgtgttggtttgagtca 663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9642 - 9311
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  9642 attgtgaagctacatggtgttcattcgagcattgtatcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 9543  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| | || || ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  9542 agtttaggttaagttcggcatatcatccgcagacagattgtcagtcggaaagaacgattcaatcgttggaagacttgttgagggtttgtgtacttgagca 9443  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9442 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggt 9343  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
     | || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9342 agaaggtgcaggactccgttgtgttggtttga 9311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10015 - 9680
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |    
T  10015 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttacgttcta 9916  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||    
T  9915 agttgaggttgagttcagcgtatcatccgcaaacagatgatcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagcttgtgtacttgagca 9816  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||| ||| || |||||| || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9815 aggaggaactagggttaatcatctaccattgataaagttcacgtacaatgatagttatcattctagtattggaagggcaccttacgaggctttgtatggt 9716  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9715 cggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtca 9680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1336
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || |    
T  1659 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatcttagttttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttta 1560  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  1559 gttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagaaaggaggaatttg 1460  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  | || |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1459 ggatagtcatcttccattgatagagttcacgtactataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcaga 1360  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  1359 actccgttgtgttggtttgagtca 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 130820 - 130532
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  130820 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 130721  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  130720 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgctgagggtatgtgttcttgagca 130621  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130620 aggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 130532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 4085 - 4423
Alignment:
Q  23 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  4085 gaaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttatagattttggaagagtttgcaagaggctttaggtt 4184  T
Q  123 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 222  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  4185 ctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcacacagatggtcagttggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtttacttca 4284  T
Q  223 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtat 322  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4285 gcaaggagtaacttgggctagtcatcatccattgatatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtat 4384  T
Q  323 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||| |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  4385 ggttggatttgtagaactcctttgtgttggttcgagtca 4423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 59426 - 59099
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| || ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |    
T  59426 attgtaaaactatatggtgttccgtcaagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttgggagagtttgcaggaggcgttgggttcta 59327  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  59326 agttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatgggcagacagagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 59227  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  || || || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  59226 aggaggaacttgggatagtcatctctcattgatcgagttcatgtacaataacagttaccattctagcattgggatggcaccattcgaagcattgtatggt 59127  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggt 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  59126 cggagatgcagaactccattgtgttggt 59099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 29008 - 29163
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29008 aaggagattgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatccaagattt-cttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 29106  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaga 176  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29107 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaga 29163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 134728 - 134626
Alignment:
Q  212 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcg 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  134728 tgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttg 134629  T
Q  312 agg 314  Q
    |||    
T  134628 agg 134626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14713 - 15048
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |    
T  14713 attgtgaagctacatggtgttccgtcaaacattttatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggatttaggttcta 14812  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14813 agttgaggttgagttcggcgtatcacccgcggacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgccgggggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 14912  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||    
T  14913 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgtatggt 15012  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15013 cggaggtgcagaacttcgttgtgttggttcgagtca 15048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 203102 - 203436
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  203102 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtgtcaaatagagatccaagatttacttgtagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcta 203201  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  203202 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattctgccattagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 203301  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  203302 aggtgggacttgggatagtcatctaccgctgatagagttcacgtacaacaaaagttaccattctagtataggaatggcaccattcaaagctttgtatggt 203401  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  203402 cggaggtgcagaactctgttatgttggtttgagtc 203436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 112693 - 112358
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  112693 attgtgaagctacatggtgttccgccaagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 112594  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  112593 agttgaagttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcgaaaaggacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 112494  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||| |||| || || ||| ||||||||    
T  112493 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatgcaataacagttatcattctagtattgaaatgacaccatttgaagctctgtatggt 112394  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  112393 cggaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtca 112358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 118240 - 117905
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  118240 attgtgaagctacatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 118141  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  118140 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 118041  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  118040 aggtggagcttggtatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 117941  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||    
T  117940 cggaggtgtaagactcctttatgttggtttgagtca 117905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 386491 - 386157
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  386491 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 386392  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  386391 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagataacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 386292  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  386291 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcactgttctaagctttgtatggt 386192  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  386191 cggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtc 386157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 323376 - 323045
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  323376 attgtgaagttgcatggtgtaccgtcgagtattttgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgccttgggttcga 323277  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  323276 agttgaggctgagtttggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 323177  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |    
T  323176 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattccagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgat 323077  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  323076 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 323045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 32387 - 32721
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  32387 attgtgaagttgcatggtgttctttcgagaat-gtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaagctttaggttcta 32485  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32486 agttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatccagtcgttagaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 32585  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  32586 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcatcttttgaggctttgtatgat 32685  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32686 cggagatgaagaactccgttgtgttggtttgagtca 32721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 25353 - 25688
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  25353 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagttccatggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 25452  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  25453 agttgaggttgagttcggcgtatcatccggagacagatggtcagtctgaaagaacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactttagca 25552  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25553 aggtggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggt 25652  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25653 cagaagtgtagaactccgttgtgttggttcgagtca 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 4727 - 4965
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4727 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 4826  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4827 gttctaagttgggattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttct 4926  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4927 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 4965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 32 - 354
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  32 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgagatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 131  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  132 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagaacttgtgttttggagcaaggtgttagttg 231  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || || ||||| |  | ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  232 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacaattttcattcttgtatcggaatggcaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 331  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  332 acaccgttgtgttggtttgagtc 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 180877 - 180554
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  180877 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaacagtttgcaagaggctttgg 180778  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  180777 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtcg------------------ctagaggatttgttgagagtttgggtact 180696  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  180695 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggcttta 180596  T
Q  320 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  180595 tatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtca 180554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 304
Target Start/End: Original strand, 101186 - 101464
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  101186 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 101285  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || || ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  101286 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcagagaggatgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 101385  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggca 304  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||    
T  101386 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggca 101464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 24702 - 25039
Alignment:
Q  23 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 122  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24702 gaaattgtgtagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagattgagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggat 24801  T
Q  123 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 222  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  24802 ctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtaaacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttaa 24901  T
Q  223 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtat 322  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||| ||    
T  24902 gcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattctagtatttggatgacaccattcgaagctttgcat 25001  T
Q  323 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  25002 ggtcggaggtgcagaactccgttctgttggtttgagtc 25039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1580 - 1245
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  1580 attgtgaagctacaaggtgttccatcgaacattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 1481  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  1480 agttgaagttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggttagtcgaaaagaacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgaata 1381  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1380 aggtggaacttgagatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattttagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggt 1281  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1280 tggaggtgcagaactctgttgtgttggtttgagtca 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15549 - 15214
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  15549 attgtaaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 15450  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  15449 agttgaggttgagttcgacatatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttgaaggacttgttgagaggttgtgtacttgagca 15350  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15349 aggaggaacttgggataatcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattccagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggt 15250  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15249 aggaagtgcagaactccattgtgttggttcgagtca 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 113121 - 113353
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  113121 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 113220  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  113221 agttgaggttgagttcggcgtgtcatccgcagacagatggtcagtcagagagaacgattcggtctctagaagatttgttgagagtttgcgtacttgagca 113320  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  113321 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 113353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1937 - 1602
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  1937 attgtgaagttgcatggtgttccttcaaacattgtatcagatatagatccaagatttacttctagattttgtaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 1838  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||  ||||| |   | || ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  1837 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtctgtcgttgaggatgattcatttttttgatgattttttgagagtttgtgtacttgagca 1738  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  1737 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtgttggaatggcaccttatgaggctttatatggt 1638  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1637 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 5225 - 5559
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |    
T  5225 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagggtttgcaggaggcgttgggttcta 5324  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    || |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  5325 agctgagtttgagttcgacgtatcatccgcagaccgatggacagacagagaggacaattcattcgttcgaggatttgttgagagtttgtgtactcgagca 5424  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  5425 aggaggaacttgggatagtaatcttccattgattgagttcacgtataataacagttaccattctagcattggaatgacaccgttcgaagcgttgtttggt 5524  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5525 cggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtc 5559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 26167 - 26500
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  26167 attgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 26266  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||   | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26267 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaaaacgattcagttattggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 26366  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  26367 aggaggaacttgggatagtcatgttctgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatgga 26466  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26467 agaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagt 26500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 195338 - 195672
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||    
T  195338 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaacatgcattgggttcga 195437  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||  |  |||||||  ||||| | ||||| | ||||||    
T  195438 agttgaggttgagttcggcttaccatcctcagacagatggtc-gtcggagaggacgatacaatctttgaaggatttactgagagtgtgtgtacctgagca 195536  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  195537 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccatccgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggt 195636  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  195637 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 195672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 149238 - 148907
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 129  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  149238 tgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtctgcaagatgcattgggttcgaagtt 149139  T
Q  130 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 229  Q
    |   ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||| |||||     
T  149138 ggagttgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggt 149039  T
Q  230 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgga 329  Q
    |||  |||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||    
T  149038 ggaggttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacagcagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaacctttgtatggtcgga 148939  T
Q  330 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  148938 ggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 148907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 180371 - 180262
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || || || || ||||| |    
T  180371 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccattgtgtt 180272  T
Q  351 ggtttgagtc 360  Q
    ||||||||||    
T  180271 ggtttgagtc 180262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 357
Target Start/End: Original strand, 121841 - 121915
Alignment:
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
    |||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  121841 tcattctagtatcggattggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtttga 121915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3812 - 3477
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  3812 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 3713  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||| |  | || ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  3712 agttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgatttagtcgttgaaagacttgttgagagtttctgtacttgagca 3613  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  || || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3612 aggagaaacttgggatagtcatcttccgttaatagagttcatgtacaataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggc 3513  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  3512 cggagatgcagaactccattgtgttagtttgagtca 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 46780 - 46565
Alignment:
Q  146 tatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46780 tatcatccacagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 46681  T
Q  246 atcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgtt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  46680 atcttccgttgatcgagttcacttacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtaggagatgcagaactccgtt 46581  T
Q  346 gtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||||||||    
T  46580 gtgctggtttgagtca 46565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 360
Target Start/End: Original strand, 86154 - 86472
Alignment:
Q  36 tacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagatt 135  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||        
T  86154 tacatggtgttccgtcgagtattgtatcaaatagagacccaagatttacttctagatttttgaagagtttgcaggaggcgttgggttataagttgacg-- 86251  T
Q  136 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 235  Q
    ||| |     |||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  86252 gaggtg----tatcatccacagacgggtggacaggcggagaggacaattcaatcattggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaact 86347  T
Q  236 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgca 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  86348 tgggatagtcatcttccattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagcattgcaatggtaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgca 86447  T
Q  336 gaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||    
T  86448 gaactctgttgtgttggtatgagtc 86472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16050 - 16385
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |    
T  16050 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaataggctttaggttcta 16149  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  16150 agttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacaaatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgcgtacttgagca 16249  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||     
T  16250 aggagggacttgggatagtcatcttccattaatagaattcacgtacaataatagttatcattctagtattgcaatgacaccatttgaggctttgtatgga 16349  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
      ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  16350 acgaggtgcaaaactccgttgtgttggttcgagtca 16385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 3442 - 3689
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 119  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3442 aaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacataaagattttggaaaagtttacaagaggctttgg 3541  T
Q  120 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3542 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 3641  T
Q  220 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcac 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3642 tgagcaaggaggaacttcggatagtcatcttccgttcatagagttcac 3689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 116539 - 116874
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  116539 attgtgaagctacatggtgtttcgtcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 116638  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  116639 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgaaaagaacgattccgtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactagagca 116738  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||||||| |||| || || | | ||||||||    
T  116739 aggaggaacttgggttagtcatcttccgttgatagagttgacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccatttgaagttctgtatggt 116838  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||    
T  116839 cggaggtgtaggactctgttgtgttggttcgagtca 116874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 98612 - 98353
Alignment:
Q  101 agtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||    
T  98612 agtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatt 98513  T
Q  201 tgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaat 300  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||| |  | ||||||      | | |||||||| ||||| || |  ||||| || | |||| ||||||| || ||    
T  98512 tgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgggacgaatgtttaccgttgattgagtttactttcaacaacagttttcatgctagtatcggtat 98413  T
Q  301 ggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||| || |||| ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  98412 ggtaccgtttgaggttttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 98353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4699 - 4376
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||    
T  4699 tgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttataagtt 4600  T
Q  130 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 229  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| || |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  4599 gaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggagaggacgattcagtcgttgaaggacttcttgagagtttgtttacttgagcaagga 4500  T
Q  230 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgga 329  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || || |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |    
T  4499 gaaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggaagaa 4400  T
Q  330 gatgcagaactccgttgtgctggtt 354  Q
    | ||||||||| ||||||| |||||    
T  4399 g-tgcagaacttcgttgtgttggtt 4376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 19636 - 19876
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || |    
T  19636 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattatggaaaagtttgaaagaggctttaggttcta 19735  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19736 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggtgaagacaattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgttcttgagca 19835  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  19836 aggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttca 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 390834 - 391066
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  390834 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagcattgtatcagataaagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 390933  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  390934 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 391033  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  391034 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 391066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 90566 - 90901
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||   ||    
T  90566 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtatcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatggcttgggtgtga 90665  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  90666 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgttcttgagca 90765  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  90766 aggtggagcttgggatagtcatctaccgctgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 90865  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  90866 cggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagtca 90901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 114795 - 114542
Alignment:
Q  83 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaa 182  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  114795 acttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagtggacga 114696  T
Q  183 ttcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagcta 282  Q
    | || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |  ||    
T  114695 tccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaataacactta 114596  T
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 336  Q
     || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  114595 ccactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcag 114542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 448515 - 448396
Alignment:
Q  242 agtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactc 341  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  448515 agtcacctcccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactc 448416  T
Q  342 cgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  448415 cgttgtgttggttcgagtca 448396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 89888 - 89973
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 111  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  89888 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtatcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaaga 89973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27897 - 27562
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  27897 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 27798  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  27797 agttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggactatacaatcattggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 27698  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27697 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 27598  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  27597 cggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtca 27562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 18839 - 19119
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || |    
T  18839 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgaaagaggctttaagttcta 18938  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  18939 agttgaggttgcgttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttattgagagtttgtgtacttgagca 19038  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacc 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19039 aggaggaacttaggatagtcatcttcctttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacc 19119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 41970 - 42302
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41970 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagt 42069  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  42070 tgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 42169  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42170 tggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 42269  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||||    
T  42270 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 42302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2589 - 2352
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |  |||||    
T  2589 tgaagctacatggtgttccttcgagcaatgtatcagatagagatccgaggtttacctctagattttggaagagtgtgcaagaggctttaggttgtaagtt 2490  T
Q  130 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 229  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2489 gaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagga 2390  T
Q  230 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcac 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2389 ggaacttggggtagtcatcttccattgatagagttcac 2352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 47033 - 47368
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  47033 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagacgctttgggttcga 47132  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  47133 agttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 47232  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47233 aggtggagcttaagatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 47332  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  47333 cggaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtca 47368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 341
Target Start/End: Original strand, 28402 - 28717
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |    
T  28402 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttgaaaaactttgcaagaggcgttgggttcta 28501  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  28502 agttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 28601  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28602 aggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 28701  T
Q  326 cggagatgcagaactc 341  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28702 cggaggtgcagaactc 28717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 341
Target Start/End: Original strand, 40393 - 40708
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |    
T  40393 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttgaaaaactttgcaagaggcgttgggttcta 40492  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  40493 agttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 40592  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40593 aggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 40692  T
Q  326 cggagatgcagaactc 341  Q
    ||||| ||||||||||    
T  40693 cggaggtgcagaactc 40708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 361
Target Start/End: Original strand, 12633 - 12946
Alignment:
Q  48 cttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcata 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||| || ||    
T  12633 cttcgagcatcgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgatgttcagttcagcgta 12732  T
Q  148 tcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcat 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12733 tcatccgcagatagatggtcagtcggaaagaacgatacagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcat 12832  T
Q  248 cttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgt 347  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12833 ctcccgttgatagagttcacatataataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccattgt 12932  T
Q  348 gctggtttgagtca 361  Q
    | ||||| ||||||    
T  12933 gttggttcgagtca 12946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 102 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 267 - 12
Alignment:
Q  102 gtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggattt 201  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||  | || |||||    
T  267 gtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggatagtacgtttcagtcttttgatgattt 168  T
Q  202 gttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatg 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  167 gttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatg 68  T
Q  302 gcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 357  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  67 acaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttga 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20655 - 20320
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20655 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagcgatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 20556  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20555 agttgaggttgagttcggtttatcatccgcagacagatgtttagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtttgtgttcttgagca 20456  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  20455 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaaaagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggt 20356  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20355 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 20320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 12995 - 13330
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||  ||||    
T  12995 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaattttggaagagcttacaagatgcattggattcga 13094  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  13095 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 13194  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13195 aggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 13294  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||    
T  13295 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtca 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16765 - 17100
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||  ||||    
T  16765 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaattttggaagagcttacaagatgcattggattcga 16864  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  16865 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 16964  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16965 aggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 17064  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||    
T  17065 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtca 17100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 33311 - 33645
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33311 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 33410  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  33411 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 33510  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  33511 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 33610  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33611 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 33645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40918 - 40599
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  40918 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 40819  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  40818 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 40719  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  40718 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 40619  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  40618 acaccgttgtgttggtttga 40599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10465 - 10133
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  10465 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaagattttggaagagttttcaagatgccttgggttcta 10366  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||| ||    
T  10365 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtctacttgaaca 10266  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10265 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 10166  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgag 358  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  10165 cggaggtgcagaactcctttatgttggtttgag 10133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43455 - 43120
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  43455 attgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 43356  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43355 agctgaatttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 43256  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  43255 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagcgttgtatggt 43156  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || |||||  | |||||||||||||||    
T  43155 cggaggtgtaggactcctctatgctggtttgagtca 43120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19792 - 19457
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  19792 attgtgaagctacatggagttccgtcgagtattgtgtctgatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcga 19693  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19692 agttgaggttgagttcggcttatgatcctcagacagatggtcagtcggagacgacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 19593  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19592 aggtggagcttgggatagtcacctactgttgatagagttcacatacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19493  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  19492 cggaggtgcaggactcctttattctggtttgagtca 19457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4547 - 4213
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  4547 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggaaagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 4448  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  4447 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagagagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgatagtgtgtgtacttgagca 4348  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  4347 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaagcttcgtatggt 4248  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  4247 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtc 4213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25646 - 25464
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  25646 attgtgaagtttcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagatatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 25547  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25546 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgaga 25464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 13535 - 13870
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  13535 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataggaatcagaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 13634  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13635 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 13734  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    | | ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  13735 aagtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 13834  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13835 cggagatgcaggactcctttatgctggtttgagtca 13870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 4587 - 4922
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  4587 attgtaaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacttttagattctggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 4686  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| |||||| |    
T  4687 agttgaggttgagttcggcttatcgtcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagaa 4786  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  4787 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaatctttgtatggt 4886  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4887 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 4922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 68042 - 67897
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  68042 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccgaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcattgggttcaa 67943  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtc 171  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  67942 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 67897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47796 - 47462
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  47796 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagacccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 47697  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  47696 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacaaatggtcagtcagagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 47597  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  47596 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggt 47497  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  47496 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtc 47462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 361
Target Start/End: Original strand, 126911 - 127168
Alignment:
Q  104 ttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt 203  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || |||| ||||    
T  126911 ttgcaagaggctttatgttctaagttgaggttgagttcaacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttataggacttgt 127010  T
Q  204 tgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggc 303  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  127011 tgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcgtccattgatagagttcgcgtacaataacagttatcattctagtattggaatggc 127110  T
Q  304 acctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  127111 accttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaagtca 127168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 80128 - 80319
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  80128 attgtgaagttgcatggtgttccttagagcattgtatcagatagagatccaagatttacttaaagattttggaagagtttgaaagaggctttgggttcta 80227  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  80228 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcggacagatggtcattcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtt 80319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 18171 - 18506
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  18171 attgtgaagtttcatggagttccgtcgagtattgtgtcgtatagagatccaaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 18270  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  ||||||||||| | | | | ||||| | ||||||    
T  18271 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattagaggatttgctaaaagtgtgtgtacatgagca 18370  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18371 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 18470  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| |||| |||||| || || || |||||||||    
T  18471 cggaggtgcaaaactcctttatgttgatttgagtca 18506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 48841 - 49176
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  |||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  48841 attgtaaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggataggaatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 48940  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  48941 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagca 49040  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49041 aggtggagcttgggatagtcacctgccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 49140  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  49141 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 49176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 51814 - 52148
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  51814 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 51913  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| || |||||| | ||||| ||||||||    
T  51914 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggagga-ttattgagagtgtgtgtgcttgagca 52012  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  52013 aggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 52112  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  52113 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 60848 - 61182
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  60848 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 60947  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| || |||||| | ||||| ||||||||    
T  60948 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggagga-ttattgagagtgtgtgtgcttgagca 61046  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  61047 aggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 61146  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  61147 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 61182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 67236 - 67570
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  67236 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 67335  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| || |||||| | ||||| ||||||||    
T  67336 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggagga-ttattgagagtgtgtgtgcttgagca 67434  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  67435 aggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 67534  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  67535 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 67570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 249285 - 248950
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  249285 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcagatagggatccgaggtttacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcga 249186  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  249185 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtctgagaggacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 249086  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  249085 aggtggagcttgggatagtcacctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 248986  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     |||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  248985 aggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 248950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40410 - 40077
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  40410 attgtgaagttacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 40311  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  40310 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaagagatggtcagtcggagaggacgattcagtcattggaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 40211  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| ||   || || ||| ||||||||    
T  40210 aggtggagcttgggatagtcatctacctttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaatgtttgaagctctgtatggt 40111  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  40110 cggaggtgcag-actcctttatgttggtttgagtc 40077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 51497 - 51831
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  51497 attgtgaagttacatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttttagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 51596  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  51597 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggttagtcggagagaacaattcaatcagtagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 51696  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||    
T  51697 gggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatagt 51796  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  51797 cggaggtgcatgactcctttgtgttggtttgagtc 51831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6856 - 6523
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||| | || ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||    
T  6856 attgtgaagttgcatggtatcccctcgagtatagtgtccgatagagacccaaggttcacttctagattttggaagagttcacaagatgcgttgggttcga 6757  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  6756 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctgaggatatgtgtacttgagca 6657  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
     ||||||  |||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6656 gggaggagtttgggatagtcacctaccattgatagaattcacatacaacaatagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 6557  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  6556 cggaggtgcaggactcctttatgcttgtttgagt 6523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 2992 - 3324
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  2992 gtgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcatgacgctttgggttcgaagt 3091  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||  | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  3092 tgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagggcacgatccaatctttggaggatttgttgcgagtgtgtgtgcttgagcaagg 3191  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3192 tggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatagaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 3291  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  3292 aggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5422 - 5087
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  5422 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 5323  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   |||| | ||||| ||||||||    
T  5322 agttgaggttgagttcaacttatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttagaggattttccgagagtgtgtgtacttgagca 5223  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5222 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 5123  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||| ||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  5122 cagaggtgcagaactcctttataatggtttgagtca 5087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 21305 - 21640
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  21305 attgtgaagctacatggtgtgctgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 21404  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || || ||  | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21405 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagacggtcagtcggagacgacgatacaatctttggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21504  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21505 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 21604  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21605 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 21640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26253 - 26147
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    ||||||||||| || || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |    
T  26253 ccgttgatcgaatttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 26154  T
Q  351 ggtttga 357  Q
    |||||||    
T  26153 ggtttga 26147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26424 - 26288
Alignment:
Q  80 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  26424 tttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaacttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagagga 26325  T
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 216  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||    
T  26324 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgt 26288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11164
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11091 attgtgaagctacatggtgtgctgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaa 11164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26814 - 26480
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  26814 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaa 26715  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  26714 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 26615  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||   |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26614 aggtggagctttttatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 26515  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||  ||||||||||    
T  26514 cggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtc 26480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27196 - 26862
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  27196 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaa 27097  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  27096 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 26997  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26996 aggtggagcttcagatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 26897  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||  ||||||||||    
T  26896 cggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtc 26862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11441 - 11108
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  11441 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatggagatccgaggttcacttcgaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcga 11342  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  11341 agttgaggttcagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 11242  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11241 aggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 11142  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  11141 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagt 11108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28161 - 27856
Alignment:
Q  56 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  28161 attgtgtcagatagagatccgaggttcacttatagattttggaagagtttgcaagacgccttgggatcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgc 28062  T
Q  156 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  28061 agacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtt 27962  T
Q  256 gatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  27961 gatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttt 27862  T
Q  356 gagtca 361  Q
    ||||||    
T  27861 gagtca 27856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 787 - 1118
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 129  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  787 tgaagttacatggtgtttcatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaaagtt 886  T
Q  130 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 229  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || ||||||||     
T  887 gaggttgagttcggcttatcgtccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatctgctgagagtgtgtgtactcgagcaaggt 986  T
Q  230 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgga 329  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  987 ggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcatgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcgga 1086  T
Q  330 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | ||||| |||||  | || ||||||||||||    
T  1087 ggtgcaggactcctctatgttggtttgagtca 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34414 - 34290
Alignment:
Q  56 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  34414 attgtgtcagatagagatccgaggttcacttatagattttggaagagtttgcaagacgccttgggatcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgc 34315  T
Q  156 agacagatggtcagtcggagaggac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34314 agacagatggtcagtcggagaggac 34290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1688 - 1477
Alignment:
Q  149 catccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatc 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1688 catcagcagacagatggtcagttggagaggacgatgcactcgttggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatc 1589  T
Q  249 ttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtg 348  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1588 ttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattgaaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtg 1489  T
Q  349 ctggtttgagtc 360  Q
     |||||||||||    
T  1488 ttggtttgagtc 1477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3046 - 2914
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  3046 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 2947  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcaga 158  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2946 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaga 2914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2466 - 2131
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| || |||||| |||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  2466 attgtgaagttacatggacttccatcgagtattgtgtcggatagacatccgaggttcacttcacgattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 2367  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  2366 agttgaggttgagttcggcatatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacgatttaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 2267  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| | | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2266 aggtgtagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaactacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 2167  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  2166 cggaggtgcaggactcctttatgttggttcgagtca 2131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 541 - 207
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  541 attgtgaagttgcatgatgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 442  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||    
T  441 agttgaggttgagttcggcttatcatccacaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgacca 342  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||  |||| | | ||||| ||||||||||||    
T  341 aggtggagcttgggatagtcatctaccgatgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatgg-aacgttcgaagctttgtatggt 243  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  242 cggaggtgcaggactccattatgttggtttgagtca 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 6872 - 7207
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6872 attgtgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctgaaagagtttgcaagacgctttgggttcga 6971  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  6972 agttgaggctgcgttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagtggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 7071  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  7072 aggtggagcttgggatagtcatctaacgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcgccgttcgaagctttatatggt 7171  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  7172 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgtgtca 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 48668 - 49002
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  48668 attgtgaagttacatggggttccgtcgagtattgtgtcggataaagatccgaggttcacttcaagatgttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 48767  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  48768 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaaggacgattcaatcattagagga-ttgcttagagtgtgtgtacttgagca 48866  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||    
T  48867 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtacgaagctttgtatggt 48966  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  48967 cggaggtgcagaactcctttatgttggttcgagtca 49002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 361
Target Start/End: Original strand, 57511 - 57786
Alignment:
Q  86 tctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattc 185  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  57511 tctaggttctggaagagtttgcagaacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaagacgatcc 57610  T
Q  186 agtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatca 285  Q
    | ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  57611 aatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacgaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttacca 57710  T
Q  286 ttctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  57711 ttcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtca 57786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3423 - 3088
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||| ||||    
T  3423 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagtgatctgaggttcacttctagattttggaagagtctgcaaaatgcattgggttcga 3324  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||    
T  3323 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacaatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaaca 3224  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  3223 aggtggtgcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 3124  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  3123 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 3088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 12833 - 12954
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  | ||||    
T  12833 gtgaagttgcatggtgttccttcgtgtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaaagtgctttgggtactaagt 12932  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatca 150  Q
    | | | ||||||| ||||||||    
T  12933 taaaactgagttctgcatatca 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 6670 - 7004
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  6670 attgtgaagttacatggggttccatcgaacattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttgggttcaa 6769  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  6770 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcggagagaacgattcagccgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 6869  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| |||||||| |||  ||| ||||| || |||||||||    
T  6870 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacgtataacaacaattaccattcgagtattggtatgataccgttcgaagcattgtatggt 6969  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  6970 cggaggtgcagaactcaattgtgttggtttgagtc 7004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 866
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  1200 attgtgaagctacatggggtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttctagattcaggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 1101  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  1100 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 1001  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1000 aggtggagcttgcgatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggctcctttcgaagctttgtatggt 901  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  900 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12649 - 12582
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatt 93  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  12649 attgtgaagctacatggggtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagatt 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 770 - 435
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |    
T  770 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtggtggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgccttgggttcaa 671  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  670 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagacggagaggatgatccaatctttggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagca 571  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  570 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattcgtatggcaccgttcgaagctttgtacggt 471  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  470 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 360
Target Start/End: Original strand, 16350 - 16681
Alignment:
Q  29 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  16350 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 16449  T
Q  129 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  16450 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 16549  T
Q  229 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcgg 328  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16550 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 16649  T
Q  329 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || || || ||||| || ||||||||| ||||    
T  16650 aggtgtaggactcctttatgctggtttaagtc 16681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37861 - 37539
Alignment:
Q  39 atggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgag 138  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  37861 atggggttccatcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaaagttgaggttcag 37762  T
Q  139 ttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 238  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  37761 ttcagcctatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcactagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttga 37662  T
Q  239 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaa 338  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  37661 gatagtcatctaccgttgatggagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 37562  T
Q  339 ctccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | || ||||| ||||||||||||    
T  37561 cccctttgtgttggtttgagtca 37539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Original strand, 11302 - 11531
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11302 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatctgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 11401  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  11402 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 11501  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 255  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  11502 aggtggagcttgggatagtcacctaccgtt 11531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 6871 - 7091
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6871 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatctgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 6970  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6971 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 7070  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtca 246  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  7071 aggtggagcttgggatagtca 7091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5885 - 5550
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || | ||| || ||||  || |||||||| ||||    
T  5885 attgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacctctaggttcttgaagagcttgctggacgctttgggttcga 5786  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5785 agttgaggttgagttcggcttatcatcgtcagaaagatggttagtcggaaaggacgatccaatcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 5686  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    |   ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5685 acttggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtaatggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 5586  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5585 cggaagtgcaggactccgttatgctggtttgagtca 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 360
Target Start/End: Original strand, 10425 - 10708
Alignment:
Q  77 agatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaga 176  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10425 agatttacatctagattttcgaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaaagttgagattgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggaga 10524  T
Q  177 ggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaa 276  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  |  ||||||| | ||| || || |||||    
T  10525 gaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggaatagtcacttgtcgttgatagtgtttacgtacaacaa 10624  T
Q  277 tagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
     || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10625 cagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcagaactccgttacgttggtttgagtc 10708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 5086 - 5421
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||   || || |||||||| || ||||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  5086 attgtgaagctacatggagttctttcgagtattgtgtcggatagggatttgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaggatgttttgggttcga 5185  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5186 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 5285  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  5286 aggtggagcttgggatagtcacctaccaatgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttggatggt 5385  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || || ||||||||||||    
T  5386 cggaggtgtaggactcctttctgatggtttgagtca 5421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Original strand, 2509 - 2750
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||    
T  2509 attgtgaagttacatggtgtaccgtcgagtattgtatcggatagagatccaaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagattccttgggttcga 2608  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  2609 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 2708  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcac 267  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  2709 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcac 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 359
Target Start/End: Original strand, 25511 - 25832
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  25511 catggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattatggaagagattgcaagatgctttgggatcgaagttgaggttga 25610  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  || || ||  | ||||||||  ||||| | || || | ||||||||| ||| ||||    
T  25611 gttcggcttatcatcctcagacagatggtcggtcagagaggatgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgggtacatgagcaaggtggagcttg 25710  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||      
T  25711 ggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaag 25810  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    | ||| || |||||||||||||    
T  25811 aatcctttatgctggtttgagt 25832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 321
Target Start/End: Original strand, 4945 - 5227
Alignment:
Q  39 atggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgag 138  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  4945 atggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttaag 5044  T
Q  139 ttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||    
T  5045 ttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtctgagatgacgattcaatctttagagtatttactgagagtgtgtgttcttgagcaagttggagcttgg 5144  T
Q  239 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgta 321  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  5145 gatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgta 5227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 38 - 368
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  38 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttacaagatgctttgggttcga 137  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||        ||||| | ||||| ||||| ||    
T  138 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattgga-----aactgagagtgtgtgtgcttgaaca 232  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  233 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 332  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||    
T  333 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtca 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11560 - 11225
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||  ||||    
T  11560 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaattttggaagagcttacaagatgcattggattcga 11461  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  11460 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 11361  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11360 aggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 11261  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||    
T  11260 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtca 11225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 7456 - 7778
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  7456 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgagatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 7555  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  7556 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 7655  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  7656 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 7755  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  7756 acaccgttgtgttggtttgagtc 7778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44177 - 43842
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  44177 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttggggtcga 44078  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||   | || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  44077 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttgagca 43978  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||| |||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43977 aggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 43878  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||| |||||||    
T  43877 cggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtca 43842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45189 - 44854
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  45189 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttggggtcga 45090  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||   | || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  45089 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttgagca 44990  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||| |||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44989 aggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 44890  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||| |||||||    
T  44889 cggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtca 44854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20737 - 20459
Alignment:
Q  83 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaa 182  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  20737 acttctagtttctggaagagtttacagaacgctttgggtttgaagttgaggttgagttcggcttatcattgtcagacaggtggtcaatcggagaggacga 20638  T
Q  183 ttcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagcta 282  Q
    | || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| || || || ||    
T  20637 tccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccactgatagagttcacatacaataacagtta 20538  T
Q  283 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
     ||||| ||||| || ||| ||   ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  20537 ccattcgagtataggtatgacattgttcgaagctttgtatagtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6306
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||  || || |||||||| || ||||  ||||| || || |||||||| ||||    
T  5969 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttctaggttctggatgagtttacaggacgctttgggttcga 6068  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga--atttgtgttcttgag 223  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||||   | ||||| ||||||    
T  6069 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgtgcttgag 6168  T
Q  224 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatg 323  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||    
T  6169 caaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcatcgttcgaagctttgtatg 6268  T
Q  324 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||    
T  6269 gtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtca 6306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19509 - 19187
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  |||    
T  19509 catggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgcagttcacttctagattctagaagagtttgcaagatgctctgggttcgaaattgaggctga 19410  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19409 gttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 19310  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||| || ||||||   ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  19309 ggatagtcacctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcaga 19210  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  19209 actcctttgtgttggttcgagtc 19187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23671 - 23349
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  |||    
T  23671 catggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgcagttcacttctagattctagaagagtttgcaagatgctctgggttcgaaattgaggctga 23572  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23571 gttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 23472  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||||||| || ||||||   ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  23471 ggatagtcacctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcaga 23372  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23371 actcctttgtgttggttcgagtc 23349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 356
Target Start/End: Original strand, 9782 - 10047
Alignment:
Q  91 attttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcg 190  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
T  9782 attttggaagagtttacaagatgcattgggttcaaaattaaggttgagttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggagaggacaatccaatct 9881  T
Q  191 ctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattcta 290  Q
     ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  9882 ttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcga 9981  T
Q  291 gtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 356  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  9982 gtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 10047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12166 - 12060
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  12166 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 12067  T
Q  126 agttgag 132  Q
    |||||||    
T  12066 agttgag 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26933 - 26598
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || |||||  | || || ||||| || ||||| ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  26933 attgtgaagctgcacggtgtatcgtcaagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 26834  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  26833 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtacttgagca 26734  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggt 325  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||    
T  26733 aggtggagcttgggatagtcacctgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattgggatggtaccgttcgaagccttgtatggt 26634  T
Q  326 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||| || || ||||| || || ||||||||||||    
T  26633 cggaggtgtaggactcctttatgttggtttgagtca 26598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 12420 - 12750
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  12420 ttgtgaagctacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagattttggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 12519  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  12520 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacat 12619  T
Q  227 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtc 326  Q
    || ||| |||| | |    | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12620 ggtggagcttgtgct----acctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 12715  T
Q  327 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||| ||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  12716 ggaggtgcaggactcttttatgctggtttgagtca 12750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2139 - 1988
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  2139 attgtgaagttgcatcgtgttccgtcgagcattgtatcagatagagacccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 2040  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 177  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2039 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggagag 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41589 - 41347
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  41589 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccggggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgctttgggttcga 41490  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  41489 agttgaggttg--ttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 41392  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacata 270  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  41391 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacata 41347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 307
Target Start/End: Original strand, 1618 - 1887
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| | || |||||||  ||||    
T  1618 catggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcgaggttttggaagagtttgcaagatgcattgagttcaaagttgaagttga 1717  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  || ||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  1718 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgatttaaccgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 1817  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacct 307  Q
    ||||||||| ||  |||||||  ||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||    
T  1818 ggatagtcacctgtcgttgataaagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcacct 1887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 359
Target Start/End: Original strand, 4912 - 4969
Alignment:
Q  302 gcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 359  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  4912 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagt 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 361
Target Start/End: Original strand, 628 - 749
Alignment:
Q  240 atagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaac 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  628 atagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcgttctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaac 727  T
Q  340 tccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  728 tccattgtgctggtttgagtca 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 354
Target Start/End: Original strand, 880 - 1196
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  880 catggggttccgtcgagtatagtgtcaaatagagacccaaagtttacttgaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattga 979  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||  ||||||||||  | ||| | ||||| |||||||| || ||| ||||    
T  980 gttcggcttatcatccgcagacagatggtcattcggaaaggacgatccaatctttagaggatttactaagagtatgtgtacttgagcagggtggagcttg 1079  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || ||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  1080 ggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 1179  T
Q  338 actccgttgtgctggtt 354  Q
    ||||| || ||||||||    
T  1180 actcctttatgctggtt 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 361
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14220
Alignment:
Q  135 tgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaac 234  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || || ||  | ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  13994 tgagttcagcttatcatccgtagacagatggtcagtcgaagagaacgatccaatctttggaggatttactgagaatgtgtgtgcttgagcaaggtggagc 14093  T
Q  235 ttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgc 334  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14094 ttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgc 14193  T
Q  335 agaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || ||||| || | |||||||||||||    
T  14194 aggactcctttatcctggtttgagtca 14220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 226
Alignment:
Q  64 agatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagat 163  Q
    |||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  523 agatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaagacgccttaggatcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcacacagat 424  T
Q  164 ggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagt 263  Q
    |||||   ||||||||| || || ||  ||||||||||  | ||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  423 ggtcaaatggagaggacgatacaatctttagaggatttagtaagagtgtgtgtgcttgagcaatgtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagt 324  T
Q  264 tcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||| |||||  | || ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  323 tcacatacaacaaccgttaccattcgagtatttgtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtca 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 180
Target Start/End: Original strand, 844 - 997
Alignment:
Q  27 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  844 ttgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggctcgaa 943  T
Q  127 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 180  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  944 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggac 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 4884
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| | || |||||||| || |||||||| |||||||||||  | | ||| || |    
T  5102 attgtgaagttgcatggggttccatcgagcatcgtgtcggatagagattcgaggtttacttcaaggttttggaagagtttgcaagattcctcgggttcta 5003  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  5002 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 4903  T
Q  226 aggaggaacttgggatagt 244  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4902 aggtggagcttggaatagt 4884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 475 - 339
Alignment:
Q  225 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatgg 324  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  475 aaggtggaacttgtgatagccatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattataattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 376  T
Q  325 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  375 ttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4543 - 4425
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  4543 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctatattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 4444  T
Q  126 agttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4443 agttgaggttgagttcggc 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11673 - 11555
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  11673 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctatattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 11574  T
Q  126 agttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  11573 agttgaggttgagttcggc 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 68225 - 68427
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||||||||||   ||||| || |    
T  68225 attgtgaagttgcatggggttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagagaacttgggttcaa 68324  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  68325 agttgagattgacttcggcttatcacccacaaatagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttaaaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 68424  T
Q  226 agg 228  Q
    |||    
T  68425 agg 68427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46814 - 46492
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || |||| |||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  46814 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttatttctaatttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 46715  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| || || ||||||||  | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  46714 gttctgcttaccatcctcataccgatggtcatacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 46615  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  46614 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 46515  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  46514 acaccgttgtgttggtttgagtc 46492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 32953 - 33193
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||   || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  32953 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtatttcgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgatttgggttcga 33052  T
Q  126 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 225  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  33053 agttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtatgtgtgcttgagca 33152  T
Q  226 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 266  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  33153 aggtggagcttgggataatcacctaccgttgatagagttca 33193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7828 - 7505
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || |||   ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||    
T  7828 catggtattccttctagtattgtgtcggatccggatccgaggtttacttctatgttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaatttgagattga 7729  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||  | ||||||||    | |||    
T  7728 gttctgcttatcatccccagacagatgggcagaccgagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgtcttggagcaaggtatcagttg 7629  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7628 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattggaatggcaccgtttgagactttgtatggtcggagatgcaga 7529  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  7528 actccgttgtgttggtttgagtca 7505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17992 - 17877
Alignment:
Q  65 gatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatg 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17992 gatagagatccgagattcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgagttcaaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatg 17893  T
Q  165 gtcagtcggagaggac 180  Q
    ||||||||||||||||    
T  17892 gtcagtcggagaggac 17877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Original strand, 25959 - 26120
Alignment:
Q  194 gaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagta 293  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||||||||   | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||    
T  25959 gaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttgggatagatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagta 26058  T
Q  294 ttggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 355  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||||    
T  26059 tcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggacaccgttgtgttggttt 26120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 360
Target Start/End: Original strand, 5756 - 5882
Alignment:
Q  234 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatg 333  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5756 cttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 5855  T
Q  334 cagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5856 cagaactccattgtgttggtttgagtc 5882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17324
Alignment:
Q  235 ttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  17450 ttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatggcaccttttgaggctctgtatggtcggaggtgt 17351  T
Q  335 agaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17350 agaactccgttgtgttggttcgagtca 17324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 39645 - 39730
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39645 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 39730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 8721 - 8794
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 99  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtattagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 8794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 361
Target Start/End: Original strand, 16375 - 16434
Alignment:
Q  302 gcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16375 gcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtca 16434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24054 - 23732
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  24054 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 23955  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | ||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  23954 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggagtatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 23855  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  23854 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacatttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 23755  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || ||||| || |||||||||||    
T  23754 acaccgttatgttggtttgagtc 23732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 136390 - 136278
Alignment:
Q  218 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 317  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  136390 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttacaattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 136291  T
Q  318 tgtatggtcggag 330  Q
    |||||||||||||    
T  136290 tgtatggtcggag 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 3521 - 3840
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  3521 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaaattttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 3620  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  3621 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 3720  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  3721 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 3820  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  3821 acaccattgtgttggtttga 3840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24176 - 24097
Alignment:
Q  20 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 99  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24176 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattggatcggatagagatccaagattaacttctagattttggaa 24097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Original strand, 81470 - 81593
Alignment:
Q  30 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 129  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  81470 tgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagattttggaagagcttgcaggacgctttgggttcgaagtt 81569  T
Q  130 gagattgagttcggcatatcatcc 153  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  81570 gaggttgagttcggcttatcatcc 81593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11309 - 11167
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 144  Q
    ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||||||||  | |||||||| |||||||| ||    
T  11309 ttccttctagtattatgtcagatcgagatccaagatttacttctaagttttgggagagtttgtaagctgctttgggaactaagttgaggttgagttctgc 11210  T
Q  145 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 187  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  11209 ttatcatccccagaccgatgggcagatggagaggaccattcag 11167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3818 - 3524
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| | |||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||  ||||    
T  3818 catggtattccttctagtattgtgtaagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgacgttga 3719  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||| |    |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  3718 gttctgcttatcatcc-cagaccgatgggcaaacagagaggactattccgagtttagaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 3620  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatg 333  Q
    ||| |    | | || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  3619 ggacaaatgtttacctttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Original strand, 14383 - 14702
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  || ||| | ||||||||||  |||||||   | ||||||||| |||    
T  14383 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgtgatccgaggtttacttctaagttctgggagagtttgcaagctgctttggaaactaagttgagactga 14482  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || | | | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  14483 gttctgcttaccgttctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttg 14582  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||     | | ||| |||| ||||| || || ||||| || | |||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||| || |||    
T  14583 ggatgaatgtttaccgatgattgagtttacttacaacaacagttttcattctactatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaga 14682  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  14683 acaccgttgtgttggtttga 14702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13568 - 13249
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||| |||||||    
T  13568 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgagatttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttcagattga 13469  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| || || ||||| ||  |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  13468 gttctgcttaccatcctcataccgatgggcaaacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttatttg 13369  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||       | | |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||     
T  13368 ggtcgaatgtttaccgttgattgagtttacctacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtagg 13269  T
Q  338 actccgttgtgctggtttga 357  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  13268 acaccattgtgttggtttga 13249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5835 - 5693
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  5835 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctatgttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 5736  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 180  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  5735 gttctgcttaccatcctcagactgatgggcagacggataggac 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 9507 - 9697
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | |||||||||||||    
T  9507 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggaaacaaagttgagattga 9606  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 228  Q
    |||| || || || || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  9607 gttctgcttaccaaccacagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaagg 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18711 - 18541
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  18711 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccaacgtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttcggaactaagttgagattga 18612  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga 208  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  18611 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagaggttagaagatttgttgaga 18541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 71665 - 71560
Alignment:
Q  252 cgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 351  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || | |||||| ||    
T  71665 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacactgttgtgttg 71566  T
Q  352 gtttga 357  Q
    ||||||    
T  71565 gtttga 71560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 33059 - 33174
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  33059 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggttga 33158  T
Q  138 gttcggcatatcatcc 153  Q
    |||| || ||||||||    
T  33159 gttctgcttatcatcc 33174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24623 - 24529
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgag 132  Q
    |||||| |||| || || ||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  24623 catggtattccatctagtattgtgtcagatcgacacccaagatttacttctatattttgggagagtttgcaagttgctttgggcactaagttgag 24529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14798 - 14478
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttt-gggctcgaagttgagattg 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| |||  | |||||||| |||    
T  14798 catggtattccttctagtattgtgttagatcgggattcaaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgcttttgggaactaagttgaggttg 14699  T
Q  137 agttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 236  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||| |||   |||||| | ||||||    | ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||  |  | ||    
T  14698 agttctgcttatcatcccaagacagatgggcagatcgagagggctattcagagtttggaggatttgttaagagcttgtgttttggagcaagctgtcagtt 14599  T
Q  237 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 336  Q
    ||||   |  | | | |||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||    
T  14598 gggacgattgtttactgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcgccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtag 14499  T
Q  337 aactccgttgtgctggtttga 357  Q
     || |||||||| ||||||||    
T  14498 gacaccgttgtgttggtttga 14478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 361
Target Start/End: Original strand, 38764 - 38856
Alignment:
Q  269 tataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||||    
T  38764 tataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtca 38856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24540 - 24217
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || ||||||   |||||| | ||||||||||  ||||||||    || ||||||||||    
T  24540 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccaaggttcacttctcagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaattaatttgagattga 24441  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  24440 gttctgcttaccatcctcagactgatgggcagacggagaggactatccagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 24341  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    ||||     | | || ||| | ||||| || || |||||||  | |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||| || ||     
T  24340 ggatgaatgtttacctttggtagagtttacttacaacaataattttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtagg 24241  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtca 361  Q
    || |||||||| | ||| ||||||    
T  24240 acaccgttgtgttagttcgagtca 24217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 3590 - 3912
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |  ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||   |||| ||  | |||||||||||||    
T  3590 catggtattccttctagtattgtgttggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctactttcggaactaagttgagattga 3689  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 237  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||| |  | ||||| | ||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| | || |||    
T  3690 gttctgcttaccatcctcagacagatgggcagacaaaaaggactaatcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtaagttg 3789  T
Q  238 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcaga 337  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || || ||||| || | | |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||     
T  3790 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagtttttattctagtatcggcatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 3889  T
Q  338 actccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  3890 acaccgttgtgttggtttgagtc 3912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 165
Target Start/End: Original strand, 700 - 827
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| || |||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  700 catggtatttcttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 799  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatgg 165  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||||    
T  800 gttctgcttaccatcctcagaccgatgg 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 359
Target Start/End: Original strand, 913 - 1021
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||| | |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |    
T  913 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatacaagtatcagaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccaatgtgtt 1012  T
Q  351 ggtttgagt 359  Q
    |||||||||    
T  1013 ggtttgagt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 3565 - 3744
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||  |  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||  |||    
T  3565 catggtattccatctagcattgtgtcagatagagatccgaggtttactttaaagttttgggagagtttgcaagcagctttgggaactaagttgaggctga 3664  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt 217  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||||||  |  ||||||||||| | ||  | || ||||||||||||  |||||||    
T  3665 gttttgcttatcatcctcagactgatggtcaaaccaagaggacaattaaatctttggaagatttgttgagagcttgtgtt 3744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3001 - 2897
Alignment:
Q  253 gttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 352  Q
    |||||| ||||| || || ||||| || | |||||||| |||  ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||    
T  3001 gttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctactatcagaatggctctttttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttgg 2902  T
Q  353 tttga 357  Q
    |||||    
T  2901 tttga 2897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1393
Alignment:
Q  261 agttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 360  Q
    ||||||| || ||||| || | |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| | ||| || || || |||||||| | |||||||||    
T  1293 agttcacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggactgaggtgtaggacaccgttgtgttagtttgagtc 1392  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  1393 a 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1240
Alignment:
Q  80 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||  ||| | |||||||    
T  1112 tttacttctaagttttgggagagtttgaaagctgctttggggactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgagcagacagagagga 1211  T
Q  180 caattcagtcgctagaggatttgttgaga 208  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||    
T  1212 cgattcagagtttggaggatttgttgaga 1240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44198 - 44019
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || |||   ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  44198 catggtattccttctagtattgtgtcggatctggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 44099  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt 217  Q
    |||| || || |||||  | || ||||| |||  ||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  |||||||    
T  44098 gttctgcttaccatccttataccgatgggcagatggagaggactattcagagtttagaagatttgttgagagcttgtgtt 44019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28091
Alignment:
Q  38 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| |  ||||||||||  || ||| | ||||| ||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  27912 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgatgtttacttctaagttctgggagagtttacaagctgctttgggaactaagttgaggttga 28011  T
Q  138 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt 217  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  |||||||    
T  28012 gttctgcttaccatccccagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtt 28091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 17
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggag 330  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || | |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  96 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggccttgtatggtcggag 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9434 - 9324
Alignment:
Q  251 ccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 350  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| || | |||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||| |    
T  9434 ccgttgatttagtttacttataacaacagttttcattctagtatcgcgatgacaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaggttaccgttgtgtt 9335  T
Q  351 ggtttgagtca 361  Q
    |||||||||||    
T  9334 ggtttgagtca 9324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34022 - 33952
Alignment:
Q  236 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacc 306  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34022 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 33952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2260 - 2187
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 99  Q
    ||||||||| | ||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  2260 attgtgaagttgcatggagtcccgtcgagtattgtttcaaatagagatccgaggttcacttctagattttggaa 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 470
Alignment:
Q  26 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  555 attgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccgaggtttacttcaagattttgaaagagtttacaaga 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 357
Target Start/End: Original strand, 8748 - 8856
Alignment:
Q  249 ttccgttgatcgagttcacatataacaatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtg 348  Q
    |||||||||| ||||| || || || || || | |||| ||| ||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  8748 ttccgttgattgagtttacttacaaaaacagttttcatactaatatcggaatgacacagtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtg 8847  T
Q  349 ctggtttga 357  Q
     ||||||||    
T  8848 ttggtttga 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 19
Alignment:
Q  45 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttc 141  Q
    ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  115 ttccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttc 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University