View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7855_low_3 (Length: 640)

Name: NF7855_low_3
Description: NF7855
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7855_low_3
NF7855_low_3
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (22-471)||(2284005-2284455)
chr3 (22-471)||(4119743-4120192)
chr3 (22-471)||(51547482-51547931)
chr3 (22-471)||(40467157-40467606)
chr3 (22-471)||(33940518-33940953)
chr3 (22-466)||(9555713-9556157)
chr3 (22-313)||(4510946-4511237)
chr3 (22-128)||(32426834-32426940)
chr3 (25-363)||(25055896-25056233)
chr3 (131-363)||(8118360-8118592)
chr3 (22-75)||(10286216-10286269)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (22-471)||(44321501-44321950)
chr8 (246-471)||(45116910-45117135)
chr8 (22-252)||(45117812-45118041)
chr8 (25-101)||(43611255-43611331)
chr8 (22-112)||(23222518-23222608)
chr8 (131-363)||(17340778-17341010)
chr8 (165-260)||(17317333-17317428)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (22-471)||(46791988-46792437)
chr7 (22-471)||(1297649-1298098)
chr7 (22-406)||(45168206-45168590)
chr7 (22-471)||(43378257-43378706)
chr7 (22-361)||(25569604-25569943)
chr7 (192-471)||(40444684-40444963)
chr7 (22-196)||(40442477-40442651)
chr7 (114-471)||(8193320-8193677)
chr7 (264-449)||(16793805-16793990)
chr7 (469-626)||(40447292-40447449)
chr7 (355-471)||(47866781-47866897)
chr7 (402-471)||(45172238-45172307)
chr7 (420-471)||(40794586-40794637)
chr7 (414-471)||(16795437-16795494)
chr7 (150-214)||(616847-616911)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (22-471)||(6553452-6553901)
chr5 (22-471)||(11819879-11820328)
chr5 (22-471)||(42344153-42344599)
chr5 (120-471)||(27012716-27013067)
chr5 (93-449)||(25053960-25054315)
chr5 (333-471)||(43295877-43296015)
chr5 (147-214)||(38858285-38858352)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (22-471)||(28863553-28864002)
chr1 (22-471)||(36359469-36359918)
chr1 (22-468)||(7404287-7404732)
chr1 (22-466)||(27283708-27284152)
chr1 (34-471)||(20240339-20240775)
chr1 (192-471)||(45473014-45473293)
chr1 (179-471)||(18886900-18887192)
chr1 (557-623)||(14187608-14187674)
chr1 (266-318)||(25593925-25593977)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (24-471)||(32716956-32717403)
chr4 (22-471)||(17916849-17917298)
chr4 (22-471)||(4618220-4618667)
chr4 (22-471)||(46516383-46516832)
chr4 (22-471)||(1591496-1591945)
chr4 (22-471)||(17497186-17497635)
chr4 (30-409)||(20970494-20970871)
chr4 (532-626)||(38437307-38437401)
chr4 (267-361)||(13896967-13897061)
chr4 (150-214)||(3405689-3405753)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (22-467)||(4503-4948)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (22-409)||(28422422-28422809)
chr2 (100-315)||(9638821-9639036)
chr2 (22-71)||(9638773-9638822)
chr2 (141-363)||(25855445-25855667)
chr2 (22-78)||(24684105-24684161)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (267-471)||(28080-28284)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (22-449)||(1971-2399)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (22-363)||(26683974-26684317)
chr6 (27-104)||(22865078-22865155)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 2284005 - 2284455
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2284005 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 2284104  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2284105 cttcaccacaccatgagctccttcaactatatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 2284204  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2284205 ttcaaaatggtagtttcaacatatttaagaaactttggatgatccttataagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtagtag 2284304  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccac-aacaacat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2284305 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaaacaacat 2284404  T
Q  421 tttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  2284405 tttgtttaactttgcaatcggtgatgattttttatctaacattttttccaa 2284455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 4119743 - 4120192
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4119743 taccaaacgatgattatatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttcgaggtgaacaaatattc 4119842  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4119843 cttcaccacaacatgagctccttcatatttttttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcattaaaaggc 4119942  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4119943 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgattaggag 4120042  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4120043 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 4120142  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4120143 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 4120192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 51547482 - 51547931
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51547482 taccaaacgatgattgtatctccccgaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 51547581  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51547582 cttcaccacaccatgagctccttcaactccatttgtgaacctacacccaagatgtagcacaaggtacgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 51547681  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51547682 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 51547781  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51547782 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacgtactatgactctcctcgtcgacaatcttctttcgcccatctaccacaacaacatt 51547881  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51547882 ttgtttaactttgtaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 51547931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 40467157 - 40467606
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40467157 taccaaacgatgattgtatcttcccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtactcatatcaccttttgaggtggacaaatattc 40467256  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  40467257 cttcaccacaccatgagctccttcaactctattagaggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactattttgtccttaaaaggc 40467356  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  40467357 ttcaaaatggcagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacttgcatataactcttgagtaggag 40467456  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467457 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactaagactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 40467556  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40467557 ttgtttaactttgcaatcagtgatgattcttgatctaacattttttccaa 40467606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 33940953 - 33940518
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33940953 taccaaatgatgattgtatttccacaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaacattc 33940854  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  33940853 ctccaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtaacataaggtccgtccatgccctcactagtttttccttaaaaggc 33940754  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33940753 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcattttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 33940654  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  33940653 attcaaccaatttttcacatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactttcatcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccaca-------- 33940562  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33940561 ------aactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 33940518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 9555713 - 9556157
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9555713 tacctaacgatgactgtatctccccaaactggattgccaacatctcatctattttttcccaataagtacgcaaatcacccttaaaggtggacaaatattc 9555812  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||| || |||||||||||||||     
T  9555813 cttcactaccccatgagctccttcaacttcgtttgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggttcgtctattccctcattattttgtccttaaaaggc 9555912  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||  ||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9555913 ttcaaaatggttttttgaacataaagaagaaactttggataatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtagaag 9556012  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9556013 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactatattactatgcttatcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccactaccacaacatt 9556112  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacattttt 466  Q
    || ||||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  9556113 ttgtttaactttacaattggtgaagatttttgatctaacattttt 9556157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4511237 - 4510946
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4511237 taccaaacgatgattgtatcttcccaagctggattaccaacatctcatctattttttcccaacaagtacccaaatcacccttggaagtggacacatattc 4511138  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||      
T  4511137 cttcactctaccatgtgctctttcaactctatttgtggtcctgcacccaagatgtaacagaaagtctgtccatgctctcactattttgtccttcacagta 4511038  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttg 313  Q
    | |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  4511037 tccaaaatggtagtttgaacataaggaagaaactttggataattcttacaagcatcttgcaattccattagattacttgcatataactcttg 4510946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32426940 - 32426834
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32426940 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 32426841  T
Q  122 cttcacc 128  Q
    |||||||    
T  32426840 cttcacc 32426834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 25055896 - 25056233
Alignment:
Q  25 caaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattcctt 124  Q
    |||| |||| |||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||   |    |||| ||||||| ||||    
T  25055896 caaatgatgtttgtatctccactaactggattaccaacatctcatgtattttcttacaacaagtacccaaatcacacatattagtggtcaaatatgcctt 25055995  T
Q  125 caccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttc 224  Q
     ||   ||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||| || || |    
T  25055996 tactctaccatgagccccttcgactctgttggtgatcctgcactcaagatgtaacgcaaggtttgtccatgccctcgctatttt-tccttaacagtgtcc 25056094  T
Q  225 aaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagatt 324  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||   |  ||||||  |||| |||||| || |  |||||  ||||||  ||||| |||||||||||    
T  25056095 aaaatggtactttgaacatagtcaacaaactttagaatttttttacaaatatctcggaattgcatttcattacttgcatatgactcttaagtaggagatt 25056194  T
Q  325 caaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaacta 363  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25056195 caaccactttttcccatgcactgaatatggtatcaacta 25056233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8118592 - 8118360
Alignment:
Q  131 accatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||| |  |||||||    |||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||    
T  8118592 accatgagccccttcaactttgttggtggtcctgcatccaagatgcaatacaaggtatgcccatgccctcactattttttccttaacagtgtccaaaatg 8118493  T
Q  231 gtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaacca 330  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||||||||   |  ||||||||| ||  ||||| || || |||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  8118492 gtactttgagcatagtcaagaaactttggaaattttttacaagcacctcagaattgcattacattacttgcatgtgactcttgagtaggagattcaacca 8118393  T
Q  331 atttttcccatgcatcaaatatggtatcaacta 363  Q
     |||||  ||||||  |||||||| ||||||||    
T  8118392 ctttttgtcatgcactaaatatggcatcaacta 8118360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Original strand, 10286216 - 10286269
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattt 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10286216 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatgtcatctattt 10286269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 44321950 - 44321501
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44321950 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 44321851  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  44321850 cttcaccacaccatgagttccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactaatttttccttaaaaggc 44321751  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44321750 ttcaaaatggtagtttcaatgtattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttgaaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 44321651  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44321650 attcaaccaatatttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatattcttttgcccatccatcacaacaacatt 44321551  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44321550 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 44321501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45117135 - 45116910
Alignment:
Q  246 tcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcat 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  45117135 tcaagaaactttggataatccttacaagcatcttggaattccactagattatccgcatataactcttgagtaggagattcaatcaatttttctcatgcat 45117036  T
Q  346 caaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgat 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  45117035 caaatatggtatcaactaacttactatgattctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattatgtttaactttgcaatcgatgat 45116936  T
Q  446 gattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  45116935 gattcttgatctaacatttttgccaa 45116910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45118041 - 45117812
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45118041 taccaaacaatgattgtatctctccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtacccaaat-acctttggaggtggacaaatattc 45117943  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  45117942 cttcaccgcaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacaccgaagatgtaacacaaggtccgtccatgccttcactagtttgtccttaaaaggc 45117843  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45117842 ttcaaaatggtagtttcaacatagtcaagaa 45117812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 101
Target Start/End: Original strand, 43611255 - 43611331
Alignment:
Q  25 caaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43611255 caaacgatgattgtatctccccaaattggtttgtcaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacct 43611331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23222608 - 23222518
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtgga 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23222608 taccaaccgatgattatatctccccaaattggtttgctaacatctcatctattttttcccaacaagtaccgaaatcacccttagaggtgga 23222518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17341010 - 17340778
Alignment:
Q  131 accatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatg 230  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||||  | |||| |||   ||| ||||||||||| | | ||||||| || || |||||||    
T  17341010 accatgagcccctttaactctgttggtggttctgcacccaagatacaacacacggtatgtccttgccctcactattctttccttaacagtgtccaaaatg 17340911  T
Q  231 gtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaacca 330  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||   |  | |||| |||||  ||||| || || |||||  ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  17340910 gtactttgaacatagtcaagaaactttggaaatttttcacaaacatctcagaattgcattacattacttgcatatgactcttgagttgaagattcaacca 17340811  T
Q  331 atttttcccatgcatcaaatatggtatcaacta 363  Q
      |||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  17340810 catttttccatgctttaaatatggtctcaacta 17340778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17317428 - 17317333
Alignment:
Q  165 cacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttgga 260  Q
    ||||||||||| | |||| |||   ||||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  17317428 cacccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttttccttaacagtgtccaaaatggtactttgaacatagtcaagaaactttgga 17317333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 46792437 - 46791988
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46792437 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttacgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 46792338  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46792337 tttcaccacaccatgagctctttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctttaaaggg 46792238  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46792237 ttcaaaatggtagttttcacatattcaagaaactttggatgatccttgcaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 46792138  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46792137 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtataaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 46792038  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46792037 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattctttatctaacatttttgccaa 46791988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1298098 - 1297649
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1298098 taccaaacgatgattgtatctctccaaattgctttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 1297999  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1297998 cttcaccacaccatgagctcctacaactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtctatgccctcactagtttgtccttaaaagga 1297899  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1297898 ttcaaaatggtagttttaacatatttaagaaactttggatgatccttacaagcatcatggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 1297799  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1297798 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 1297699  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1297698 ttgtttaactttgcaatcgttgatgattcttgatctaacatttttgccaa 1297649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 406
Target Start/End: Original strand, 45168206 - 45168590
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45168206 taccaaacgatgattgtatctcccaaaattgatttgccaacatctcatctattttatgccaataagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 45168305  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45168306 cttcaccgcaccatgagctccttcaactctatttatggtcttacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 45168405  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45168406 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 45168505  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45168506 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatc 45168590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 43378257 - 43378706
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43378257 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttcccaacaagtacccaaatcacccttggaggtggacaaatattc 43378356  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  43378357 cttcaccacatcatgagctccttcaactctattcgtggtccgacacccaatatgtaacacaaggtccgtccatgctctcactagtttgtccttgaaaggc 43378456  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  43378457 ttcaaaatggtaggttcaacatagtgaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccattagattatccgcatataactcttgagtaggag 43378556  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43378557 attcaaccaatttttcccatgcattaaatatgatatcaactaacttacgatgtttctcctcatcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 43378656  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || || |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43378657 ttgttgaactttgcaatcgaagatgattcttgatctaatatttttgccaa 43378706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Original strand, 25569604 - 25569943
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25569604 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacatttggaggtggacaaatattc 25569703  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25569704 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 25569803  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25569804 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 25569903  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaac 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25569904 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaac 25569943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 192 - 471
Target Start/End: Original strand, 40444684 - 40444963
Alignment:
Q  192 catgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccacta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40444684 catgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccacta 40444783  T
Q  292 gattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40444784 gattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctccttgtcgacaat 40444883  T
Q  392 cttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40444884 cttctttttcccatccaccacaacaacattttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 40444963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Original strand, 40442477 - 40442651
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40442477 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttgtgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggataaatattc 40442576  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40442577 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagaacaaggtccatccatgc 40442651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 471
Target Start/End: Original strand, 8193320 - 8193677
Alignment:
Q  114 aaatattccttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtcct 213  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |   ||| | ||||| ||| ||||||||    
T  8193320 aaatattccttcactctgccatgagctccttcaactctgtttgtggtcctgcaccaaagatgtaacacaagttttgtccctcccctccctattttgtcct 8193419  T
Q  214 taaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttg 313  Q
    | | |  || ||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  8193420 tcacattgtccaaaatggtaggttgaacatagtgaagaaaccttggataattcttacaagcatcttgcaattccattagattacttgcatataactcttg 8193519  T
Q  314 agtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccaca 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |      
T  8193520 agtaggagattcaaccaatttttcccattcatgaaatatggtatcaactatctcaatatgtttcacctcgtcgacaagcttcttttccccatccactatg 8193619  T
Q  414 acaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    ||||| |||| ||| | |||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  8193620 acaaccttttgtttcagtttataatcggtgatgatttttgctctaacattttttccaa 8193677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 264 - 449
Target Start/End: Original strand, 16793805 - 16793990
Alignment:
Q  264 tccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaacta 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16793805 tccttacaagcatcttggaattccattagaatacctgcatataactcttgagtaggagattcaaccaatttttcgcatgcatcaaatatggtatcaacta 16793904  T
Q  364 acttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgatt 449  Q
     |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  16793905 tcttattatgcttcacctcgtcgacaatcttcttttgcccatccactaccacaacattttgtttaactttacagtcggtgatgatt 16793990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 469 - 626
Target Start/End: Original strand, 40447292 - 40447449
Alignment:
Q  469 caagtgtgtagtgtaatgggt----agtggatgaagtcatttttgagcttgatgataaagtagtaagtagtagtagataatttcaataatctttcaagga 564  Q
    ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40447292 caagtgtgtagtggaatgggtggggagtggatgaagtcatttttgagcttgatgataaagtagta----gtagtagataatttcaataatctttcaagga 40447387  T
Q  565 atttttcttattttagttttattttgaatgattgtatttcaagtcttaaatattgatgtcca 626  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40447388 atttttcttattttggttttattttgaatgattgtatttcaagtcttaaatatttatgtcca 40447449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 355 - 471
Target Start/End: Original strand, 47866781 - 47866897
Alignment:
Q  355 tatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttga 454  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47866781 tatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttgtttaactttgcaatcagtgatgattcttga 47866880  T
Q  455 tttaacatttttgccaa 471  Q
    | |||||||||||||||    
T  47866881 tctaacatttttgccaa 47866897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 402 - 471
Target Start/End: Original strand, 45172238 - 45172307
Alignment:
Q  402 ccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45172238 ccatccaccacaacaacattttgtttaactttgcaaccggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 45172307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 40794637 - 40794586
Alignment:
Q  420 ttttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40794637 ttttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 40794586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 471
Target Start/End: Original strand, 16795437 - 16795494
Alignment:
Q  414 acaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||    
T  16795437 acaacattttgtttaactttacaatcggtgatgattttttctctaacatttttcccaa 16795494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 214
Target Start/End: Original strand, 616847 - 616911
Alignment:
Q  150 ctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtcctt 214  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  616847 ctatttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 616911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6553901 - 6553452
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6553901 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatttatgttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 6553802  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6553801 cttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggttcatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 6553702  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6553701 ttcaaaatggtaatttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttaagtaggag 6553602  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6553601 attcagccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgctcatccaccacaacaacatt 6553502  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6553501 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 6553452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11820328 - 11819879
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11820328 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatatattttttgccaacatgtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 11820229  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11820228 attcaccacatcatgagcttcttcaactctatttgtggtactacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 11820129  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11820128 ttcaaaatggtagtttcaacatagtgaagaaactttggataatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 11820029  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11820028 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgcttctcctcgtagacaatcttcttttgccaatccaccacaacaatatt 11819929  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11819928 ttgtttaactttacaatcggtgatgatttttgatctaacatttttgccaa 11819879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 42344599 - 42344153
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42344599 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgccaacaagcacccaaatcaccttttgaggtggacaaatattc 42344500  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||     
T  42344499 cttcaccacaccatgagctccttccactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacaaaaggtccgtccattccctcattattttgtccttaaaaggc 42344400  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42344399 ttcaaaatgttagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaaacatcttggaattcc---agattacccgcatataactctagagtaggag 42344303  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42344302 attcaaccaatttttcccatgcataaaatatggtgtcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 42344203  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42344202 ctgtttaactttgcaatcgatgatgattcttgatctaccatttttgccaa 42344153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 120 - 471
Target Start/End: Original strand, 27012716 - 27013067
Alignment:
Q  120 tccttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27012716 tccttcaccacaccatgagctctttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtaacactaggtccgtccatgccctcactattttgtccttaaaag 27012815  T
Q  220 ggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtagg 319  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27012816 gcttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttataagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtagg 27012915  T
Q  320 agattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27012916 agattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatgatatcaactaacttactatgattctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccatcacaacaaca 27013015  T
Q  420 ttttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27013016 ttttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 27013067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25054315 - 25053960
Alignment:
Q  93 aaatcacctttggaggtggacaaatattccttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatcc 192  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  25054315 aaatcaaccttggaggtggacaaatattccttcactctaccatgagctccttcaactcg-tttgtggtcctgcacccaagatgtaacacaagctctgtcc 25054217  T
Q  193 atgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactag 292  Q
    |||| ||||||| |||||| || | || || |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25054216 atgctctcactattttgtcattcacagtgtccaaaatggtagtttaaacatagtgaagaaaccttggataattcttacaagcatcttgcaattccattag 25054117  T
Q  293 attacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatc 392  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||  || | |||| ||||| |    
T  25054116 attacttgcatataaatcttgagtaggagattcaaccaattattctcatgcatcaaatatggtgtcaactatctcactatgcttcacatcgtagacaagc 25054017  T
Q  393 ttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgatt 449  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  25054016 ttcttttgctcatccactacgacaaccttttgtttcactttacaatcggtgatgatt 25053960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 333 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43296015 - 43295877
Alignment:
Q  333 ttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactt 432  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43296015 ttttctcatgcatcaaatatgatatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttacccatccaccacaacaacattttgtttagctt 43295916  T
Q  433 tgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43295915 tgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 43295877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 214
Target Start/End: Original strand, 38858285 - 38858352
Alignment:
Q  147 actctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtcctt 214  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  38858285 actctgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 38858352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28864002 - 28863553
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28864002 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggttttccaacaactcatctattttatgtcaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 28863903  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28863902 tttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacaccaaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctttaaaggc 28863803  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28863802 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 28863703  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28863702 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcacatccaccacaacaacatt 28863603  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28863602 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaatatttttgccaa 28863553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 36359469 - 36359918
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36359469 taccaaatgatgattgtatctccccaaattgatttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 36359568  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36359569 cttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 36359668  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36359669 ttcaaaatggtagtttcaatatagtgaagaaactttggatgatccttgcaagcatcttggaattccactaggttacccgcatataactcttgagtaagag 36359768  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36359769 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgcttctcctcgtcgacaatcttcttttgtccatccaccacaacaacatt 36359868  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36359869 ttgtttaacattgcaatcggtgatgattcttgatctaacattttttccaa 36359918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7404732 - 7404287
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7404732 taccaaatgatgattgtatctccccaaattgatttgccaacatctcatctattttatgccaacaagtacccaaatcacctttggaagtgga-aaatattc 7404634  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  7404633 cttcaccacaccacgaacttcttcaactctatttgtggtcctacacccaaaatgtaacacaaggtccgtccatgcgctcactagattgtccttaaaaggc 7404534  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7404533 ttcaaaatggtagttttaacatattcaataaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 7404434  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7404433 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatgatatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttggccatccaccacaacaacatt 7404334  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgc 468  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7404333 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttaatctaacatttttgc 7404287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27284152 - 27283708
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27284152 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtacccaaatcacccttggatgtggaaaaatattc 27284053  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  27284052 cttcaccaccccatgagctccttcaactctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactaatttgtccttaaaagtc 27283953  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27283952 ttcaaaatggtagtttcaacataatgaagaaactttggataatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 27283853  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27283852 attcaaccaattttttccatgcatcaaatacggtatcaactaacttactaagcttctcctcgtcgacaatcttcttttttccatccaccacaacaacatt 27283753  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacattttt 466  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27283752 ttgtttaactttgcaatcagtgatgattcttgatctaacattttt 27283708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 34 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20240775 - 20240339
Alignment:
Q  34 attgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattccttcaccacacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20240775 attgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttcccaacaagtacccaaatcacccttggtggtagacaaatattccttcaccacacc 20240676  T
Q  134 atgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggta 233  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  20240675 atgagctccttcaactctgttcgtggtcctgtacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgcccacactaatttgtccttaaaaggcttaaaaatggta 20240576  T
Q  234 gtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatt 333  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20240575 gtttcaacatagtgaagaaactttggataatctttacaagcatcttggaattccaatagattacccgcatataactcttgagtaggagcttctaccaatt 20240476  T
Q  334 tttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaacttt 433  Q
    |||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20240475 ttt-acaagcatcaaatatggtatcagctaacttactatgcttctcctcgtcgacaatcttcttttgtccatccactaccacaacattttgtttaacttt 20240377  T
Q  434 gcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20240376 gcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 20240339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 192 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45473293 - 45473014
Alignment:
Q  192 catgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccacta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45473293 catgccctcactagtttgtccttaaaaggcttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaattttggatgatccttacaagcatcttggaattcaacta 45473194  T
Q  292 gattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaat 391  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45473193 tattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaat 45473094  T
Q  392 cttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45473093 cttcttttgcccatccaccacaacaacattttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 45473014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 179 - 471
Target Start/End: Original strand, 18886900 - 18887192
Alignment:
Q  179 cacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatct 278  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18886900 cacaaggttcgtccatgccctcactagtttgtccttaaaaggcatcaaaatggtagtttcaacatagtgaagaaactttggataatccttacaagcatct 18886999  T
Q  279 tggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactct 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18887000 tggaatttcactagattacccgcatataactcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttaatatgaatct 18887099  T
Q  379 cctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  18887100 cctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgctctaacatttttcccaa 18887192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 14187674 - 14187608
Alignment:
Q  557 ttcaaggaatttttcttattttagttttattttgaatgattgtatttcaagtcttaaatattgatgt 623  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  14187674 ttcaagtaatttttcttattttgattttattttgaacgatagtatttcaggtcttaaacatttatgt 14187608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25593977 - 25593925
Alignment:
Q  266 cttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtag 318  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||||    
T  25593977 cttacaagcatcttggaattcaattacattacttgcatataactcttgagtag 25593925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32717403 - 32716956
Alignment:
Q  24 ccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32717403 ccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgcgaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattcct 32717304  T
Q  124 tcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggtt 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32717303 tcaccactccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacacaagttccatccatgccctcactagtttatccttaaaaggctt 32717204  T
Q  224 caaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagat 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32717203 caaagtggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtatgagat 32717104  T
Q  324 tcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatttt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32717103 tcaaccaatttttccgatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatttt 32717004  T
Q  424 atttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32717003 gtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaatatttttgccaa 32716956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17917298 - 17916849
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917298 taccaaacgttgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 17917199  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17917198 cttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggttcgttcatgccctcactattttgtccttaaaaggc 17917099  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17917098 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacctgcatataactcttgagtaggag 17916999  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17916998 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 17916899  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17916898 ttgcttaactttgcaatcagtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 17916849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 4618667 - 4618220
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4618667 taccaaacgatgattctatctccccaaattggtac-ccaacatctcatctattttatgctaacaagtacctaaatcacctttggaggtggacaaatattc 4618569  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4618568 cttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacaccca-gatgtaacacaaggtccgtgcatgccctcactagtttgtccttcaaaggc 4618470  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4618469 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtaggag 4618370  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4618369 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactacgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 4618270  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4618269 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 4618220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 46516383 - 46516832
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516383 taccaaacgatgattgtatctccccgaattggtttgccaatatctcatctattttttgccaacaagtactcaaatcacctttggaggtggacaaatattc 46516482  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  46516483 cttccccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtaacacaaagttcgtccatgccctcactaatttgtccttaaaaggc 46516582  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  46516583 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaaaaaactttggatgatccttacaaacatcttggaattccactagattacccacatataactcttgagtaggag 46516682  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516683 attcaaccaatttttctcatgcatcaaatatggtatcaactaacttaataagactatccacgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 46516782  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46516783 ttgtttaacttttcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 46516832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1591945 - 1591496
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591945 taccaaacgatgattgtatctccctaaattagtttgccaacaactcatctattttttaccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 1591846  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1591845 cttcaccacaccatgatctccttcaactctattcgtgatcctacacccaagatgtaacacaaggtccattcatgccctcactagtttgtccttaaaaggc 1591746  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  1591745 ttcaaaatggtagtatcaacatagtcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattactcgcatataaatcttgagtaggag 1591646  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1591645 attcaaccaatttttcacatgcatcaaatatggtatcaagtaacttactatgattctcctcgtcgaaaatcttcttttgcccatccagcacaacaacatt 1591546  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1591545 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctaacatttttgccaa 1591496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17497635 - 17497186
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17497635 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttcccaacaagtacccaaatcacccttggaggtggacaaatattc 17497536  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  17497535 cttcaccacagcatgagctccttcaactctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtatgtccatgccctcactaattcgtccttaaaaggc 17497436  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17497435 ttcaaaatagtagtttcaatatagtgaagaaactttgaataatcattacaagcatcttggaattccaatagattacccgcatataactcttgagtaggag 17497336  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  17497335 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactattcttcgcctcgtcgacaatcttcttttgctcatccactaccacaacatt 17497236  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttgccaa 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  17497235 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattttttatctaacatttttgccaa 17497186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 409
Target Start/End: Original strand, 20970494 - 20970871
Alignment:
Q  30 gatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattccttcacca 129  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  20970494 gatgaatgtatctcccctaactggattaccaacatctcatctatttttttc-aacaagtacctaaatcacccttggaggttgtcaaatattccttcacta 20970592  T
Q  130 caccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagggttcaaaat 229  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||   |||||| |||||||| |||||||| || |  |||||||||    
T  20970593 taccatgagccccttcaactctattggtggtcctgcacccaagatgcaacacaaggtatgtccatg-cctcactattttgtcctcaacatcgttcaaaat 20970691  T
Q  230 ggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaacc 329  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| |   |  ||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20970692 ggtactttgaacatagtcaagaaactttgaaatttttttacaagcatcttggaattgcattacattacttgcatataactcttaagtaggagattcaacc 20970791  T
Q  330 aatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccac 409  Q
    | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| || | || |  || |||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  20970792 actttttcccatgcactaaatatgatatcaactatctcactaggcttcacctcattgacaatcttctctttcccatccac 20970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 532 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 38437401 - 38437307
Alignment:
Q  532 tagtagtagataatttcaataatctttcaaggaatttttcttattttagttttattttgaatgattgtatttcaagtcttaaatattgatgtcca 626  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  38437401 tagtagtagataatttcaacaatctttccaagaatttatcttattttggttttattttcagtgattctatttgaagtcttaaacatttatgtcca 38437307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 361
Target Start/End: Original strand, 13896967 - 13897061
Alignment:
Q  267 ttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaac 361  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||   |||||||||||||||    
T  13896967 ttacaaacatcttgaaattccattacattacttgcatatcactcttgagtaggagattcaaccatactttctcatgctctaaatatggtatcaac 13897061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3405753 - 3405689
Alignment:
Q  150 ctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtcctt 214  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  3405753 ctatttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 3405689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4948 - 4503
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttttgccaacaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 4849  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| | | | ||| ||||||||| ||||||||| ||||      
T  4848 cttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcttacacctaagatgtaacacaagtttcgttcattccctcactattttgtcctttaaagtt 4749  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4748 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattactcgcatataactcttgagtaggag 4649  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4648 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttactatgattctccttgtcgacaatcttcttttgccaatccaccacaacaacatt 4549  T
Q  422 ttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacatttttg 467  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4548 ttgtttaactttgcaatcggtgatgattcttgatctgacatttttg 4503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 409
Target Start/End: Original strand, 28422422 - 28422809
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatattc 121  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28422422 taccaaatgatgattgtatctctccaaattggattgccaacatctcatctattttttcccaacaaatacccaaatcacccttcgaggtggacaaatattc 28422521  T
Q  122 cttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaaggg 221  Q
    ||||||   ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |    
T  28422522 cttcactctaccatgatctacttcaactctgtttgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtctatccatgccctcactattttgtccttcacagtg 28422621  T
Q  222 ttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggag 321  Q
    | |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||||   |||| | ||||||||   |||||| |||||||||| |||    
T  28422622 tccaaaatggtagtttgaacatagtgaggaaactttggataattcttacaagcatcttaccattctattagattacttacatataactcttgagtatgag 28422721  T
Q  322 attcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccac 409  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || | ||||  |  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28422722 actcaaccaatttttctcatgcatgaaatatggtatcaattatctcactatgcttgacctcgtcgacaagcttctttttcccatccac 28422809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 315
Target Start/End: Original strand, 9638821 - 9639036
Alignment:
Q  100 ctttggaggtggacaaatattccttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9638821 ctttggaggtggacaaatattccttcaccacaccatgagctccttcaactctattcgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccacgccct 9638920  T
Q  200 cactagtttgtccttaaaagggttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattaccc 299  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  9638921 cactagtctgtccttaaaaggcttcaaaatggtagtttcaacatattcaataaactttggatgatccttacaagcatgttgaaatttcactagattaccc 9639020  T
Q  300 gcatatacctcttgag 315  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9639021 gcatataactcttgag 9639036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 9638773 - 9638822
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatct 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9638773 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggttttccaacatctcatct 9638822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 363
Target Start/End: Original strand, 25855445 - 25855667
Alignment:
Q  141 ccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgt-ccttaaaagggttcaaaatggtagtttca 239  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| | |||| ||||  || ||||| |||||| ||| | |||||| || || |||||||||| ||| |    
T  25855445 ccttcaactctgttggtggttctgcacccaagatgaaacacacggtctgtctatgccttcactatttttttccttaacagtgtccaaaatggtactttga 25855544  T
Q  240 acatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttccc 339  Q
    ||||| |||||||||||||||   |  ||| || |||||  ||||| || || |||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  25855545 acatagtcaagaaactttggaatttttttagaaacatctgagaattgcattatattacttgcatatgactgttgagtaggagattcaa-catattttacc 25855643  T
Q  340 atgcatcaaatatggtatcaacta 363  Q
    ||||   |||||||||||||||||    
T  25855644 atgctctaaatatggtatcaacta 25855667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24684161 - 24684105
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttat 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  24684161 taccaaatgatgattgtatctccattaattggattaccaacatctcatgtattttat 24684105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 267 - 471
Target Start/End: Original strand, 28080 - 28284
Alignment:
Q  267 ttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtaggagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaact 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28080 ttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatataactcttgagtagtagattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaact 28179  T
Q  367 tattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttatttaactttgcaatcggtgatgattcttgatttaacattttt 466  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28180 tactatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacattttgtttaactttgcaatcggcgatgattcttgatctaacattttt 28279  T
Q  467 gccaa 471  Q
    |||||    
T  28280 gccaa 28284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2399
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatg-ccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatatt 120  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  1971 taccaaatgatgactgtatctccccaaattggcttaccaacatctcatctattttttttccaacaagtacccaaatcgtccttggaggtggacaaatatt 2070  T
Q  121 ccttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagg 220  Q
    |||||||   || ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| | ||     
T  2071 ccttcactctactatgagttccttcaactatgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccataccctcactattttgtccttcatagt 2170  T
Q  221 gttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttggatgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtagga 320  Q
    || |||||||||||| | |||||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||    |||||| | |||||||||||    
T  2171 gtccaaaatggtagtctgaacatagtgaagaaaccttggataattcttacaagcatcttgcaattacattagattattttcatataacacttgagtagga 2270  T
Q  321 gattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaactaacttattatgactctcctcgtcgacaatcttcttttgcccatccaccacaacaacat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||  || |||| ||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |    
T  2271 gattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtgtcaactatctcactatgcttcacctcatcgacaagcttcttttgcctatccgctacgacaacct 2370  T
Q  421 tttatttaactttgcaatcggtgatgatt 449  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  2371 tttgtttcactttacaatcgatgatgatt 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 26683974 - 26684317
Alignment:
Q  22 taccaaacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatg-ccaagaagtacccaaatcacctttggaggtggacaaatatt 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | | || |||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26683974 taccaaatgatgattgtatctctccaaactcgattaccaatatctcatctattttttttccaacaagtacccaaatcacccttggaggtggtcaaatatt 26684073  T
Q  121 ccttcaccacaccatgagctccttcaactctatttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccatccatgccctcactagtttgtccttaaaagg 220  Q
    |||||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  26684074 ccttcactctaccatgagccccttcaactctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccatgccctcattattttgtccttaacagt 26684173  T
Q  221 gttcaaaatggtagtttcaacatattcaagaaactttgg-atgatccttacaagcatcttggaattccactagattacccgcatatacctcttgagtagg 319  Q
    || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  26684174 gtccaaaatggtagtttgaacatagtgaagaaactttggaaaaatacttacaagcatcttggaattccataacattacttgcatataactcttgagtagg 26684273  T
Q  320 agattcaaccaatttttcccatgcatcaaatatggtatcaacta 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26684274 agattcaaccactttttcccatgtatcaaatatggtatcaacta 26684317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22865155 - 22865078
Alignment:
Q  27 aacgatgattgtatctccccaaattggtttgccaacatctcatctattttatgccaagaagtacccaaatcacctttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22865155 aacgatgattgtatctccccaacttggtttgccaacatctcatctagtttattccaacaagtacctaaatcacctttg 22865078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University